Index of /runs/CPTAC3_LSCC_DWG/CPTAC3-LSCC-Broad/MutSig2CV_noMSI

[ICO]NameLast modifiedSizeDescription

[PARENTDIR]Parent Directory  -  
[IMG]CDKN2A.stick_fig.jpg2020-09-25 15:39 31K 
[   ]CDKN2A.stick_fig.pdf2020-09-25 15:39 3.8K 
[TXT]CDKN2A.stick_fig.txt2020-09-25 15:07 781  
[IMG]KEAP1.stick_fig.jpg2020-09-25 15:39 38K 
[   ]KEAP1.stick_fig.pdf2020-09-25 15:39 4.6K 
[TXT]KEAP1.stick_fig.txt2020-09-25 15:08 1.3K 
[IMG]KMT2D.stick_fig.jpg2020-09-25 15:39 69K 
[   ]KMT2D.stick_fig.pdf2020-09-25 15:39 5.8K 
[TXT]KMT2D.stick_fig.txt2020-09-25 15:07 2.7K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf2020-09-25 15:39 97M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_CCG_histogram.ai2020-09-25 15:32 241K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_CCG_histogram.fig2020-09-25 15:32 48K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_CCG_histogram.png2020-09-25 15:32 17K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_coverage.fig2020-09-25 15:32 10K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_coverage.png2020-09-25 15:32 13K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_histogram.ai2020-09-25 15:31 36K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_histogram.fig2020-09-25 15:31 17K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_histogram.png2020-09-25 15:31 14K 
[TXT]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_legos.html2020-09-25 15:32 7.7K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_legos.ps2020-09-25 15:32 43M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_orientation_alt_counts.ai2020-09-25 15:31 474K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_orientation_alt_counts.fig2020-09-25 15:31 28K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_orientation_alt_counts.png2020-09-25 15:31 34K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_orientation_weighted_mutations.ai2020-09-25 15:31 474K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_orientation_weighted_mutations.fig2020-09-25 15:31 30K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_orientation_weighted_mutations.png2020-09-25 15:31 36K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile.ai2020-09-25 15:39 263K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile.fig2020-09-25 15:30 21K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile.png2020-09-25 15:39 45K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_AF.ai2020-09-25 15:39 846K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_AF.fig2020-09-25 15:31 28K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_AF.png2020-09-25 15:39 47K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_counts.ai2020-09-25 15:30 258K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_counts.fig2020-09-25 15:30 20K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_counts.png2020-09-25 15:30 40K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_normalized.ai2020-09-25 15:31 263K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_normalized.fig2020-09-25 15:31 21K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_normalized.png2020-09-25 15:31 40K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_1-12.ai2020-09-25 15:30 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_1-12.fig2020-09-25 15:30 81K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_1-12.png2020-09-25 15:30 66K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_13-24.ai2020-09-25 15:30 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_13-24.fig2020-09-25 15:30 79K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_13-24.png2020-09-25 15:30 66K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_25-36.ai2020-09-25 15:30 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_25-36.fig2020-09-25 15:30 81K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_25-36.png2020-09-25 15:30 65K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_37-48.ai2020-09-25 15:31 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_37-48.fig2020-09-25 15:31 81K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_37-48.png2020-09-25 15:31 67K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_49-60.ai2020-09-25 15:31 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_49-60.fig2020-09-25 15:31 80K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_49-60.png2020-09-25 15:31 66K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_61-72.ai2020-09-25 15:31 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_61-72.fig2020-09-25 15:31 80K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_61-72.png2020-09-25 15:31 65K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_73-84.ai2020-09-25 15:31 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_73-84.fig2020-09-25 15:31 81K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_73-84.png2020-09-25 15:31 66K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_85-96.ai2020-09-25 15:31 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_85-96.fig2020-09-25 15:31 80K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_85-96.png2020-09-25 15:31 65K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_97-108.ai2020-09-25 15:31 2.6M 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_97-108.fig2020-09-25 15:31 80K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_97-108.png2020-09-25 15:31 65K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_109-112.ai2020-09-25 15:31 890K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_109-112.fig2020-09-25 15:31 27K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_profile_samples_109-112.png2020-09-25 15:31 27K 
[TXT]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI.final_analysis_set.maf.mutation_spectrum.txt2020-09-25 15:32 91K 
[   ]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI_coMut.pdf2020-09-25 15:39 32K 
[IMG]LSCC-WXS-TP_NB-noMSI_coMut.png2020-09-25 15:39 67K 
[TXT]MutSig_version.txt2020-09-25 15:01 25  
[IMG]NFE2L2.stick_fig.jpg2020-09-25 15:39 47K 
[   ]NFE2L2.stick_fig.pdf2020-09-25 15:39 4.5K 
[TXT]NFE2L2.stick_fig.txt2020-09-25 15:08 1.5K 
[IMG]TP53.stick_fig.jpg2020-09-25 15:39 135K 
[   ]TP53.stick_fig.pdf2020-09-25 15:39 12K 
[TXT]TP53.stick_fig.txt2020-09-25 15:06 9.2K 
[IMG]USP13.stick_fig.jpg2020-09-25 15:39 31K 
[   ]USP13.stick_fig.pdf2020-09-25 15:39 4.0K 
[TXT]USP13.stick_fig.txt2020-09-25 15:07 853  
[   ]dcc_archive.properties2020-09-25 15:39 1  
[TXT]dcc_archive_manifest.tsv2020-09-25 15:39 1.5K 
[TXT]discrepant_coding_effect_genes.txt2020-09-25 15:01 411  
[   ]gcs_delocalization.sh2020-09-25 15:06 4.0K 
[   ]gcs_localization.sh2020-09-25 15:06 2.5K 
[   ]gcs_transfer.sh2020-09-25 15:38 13K 
[TXT]generatedStickFigurePaths.txt2020-09-25 15:08 495  
[TXT]mutcateg_discovery.txt2020-09-25 14:53 1.5K 
[TXT]mutcategs.txt2020-09-25 15:39 642  
[   ]nozzle.RData2020-09-25 15:39 64K 
[TXT]nozzle.html2020-09-25 15:39 162K 
[TXT]params.txt2020-09-25 14:52 1.1K 
[TXT]patient_counts_and_rates.txt2020-09-25 15:39 19K 
[   ]results.mat2020-09-25 15:00 14M 
[TXT]sample_sig_gene_table.txt2020-09-25 15:01 4.5K 
[TXT]sample_sig_gene_table_orig.txt2020-09-25 15:00 16K 
[   ]script2020-09-25 15:06 5.8K 
[TXT]sig_genes.txt2020-09-25 15:39 1.1M 
[TXT]sig_genes_orig.txt2020-09-25 15:00 1.2M 
[TXT]stderr2020-09-25 15:06 0  
[TXT]stdout2020-09-25 15:08 11K