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1 OK 222 7 0.032 0.187 0.233 0.185 0.177 5 0 0 2 2 4 0 1 5 1 2 1 0 1 2 0 0 3 1 0 1 2 1 1 2 1 1 0 1 2 3 5 6 6 1 2 1 1 1 0 7 5 4 7 0 0 0 0 5 8 8 4 0 0 0 0 4 7 4 6 0 1 1 0 5 2 0 2 3 1 0 3 4 5 6 5 2 2 0 0 2 5 5 2 1 1 2 0 2 4 4 5 2 4 3 1 CPTAC3-LSCC-C3L-03272-TP mutations/Mb 1 OK 222 7 0.032 0.187 0.233 0.185 0.177 4.29 0.00 0.00 1.85 3.96 4.10 0.00 1.26 4.44 1.06 2.33 0.98 0.00 1.03 2.96 0.00 0.00 2.26 1.06 0.00 2.17 2.15 0.96 0.90 5.91 2.13 3.10 0.00 2.21 1.25 2.72 4.57 5.14 4.93 1.28 1.85 1.98 1.02 1.36 0.00 6.22 5.28 4.67 6.85 0.00 0.00 0.00 0.00 4.66 6.03 8.48 3.90 0.00 0.00 0.00 0.00 11.82 14.91 12.39 16.09 0.00 0.62 0.91 0.00 4.29 1.64 0.00 1.85 5.95 1.02 0.00 3.78 3.56 5.28 7.00 4.89 3.72 2.05 0.00 0.00 1.86 3.77 5.30 1.95 2.17 1.08 1.92 0.00 5.91 8.52 12.39 13.41 4.42 2.50 2.72 0.91 CPTAC3-LSCC-C3L-03678-TP # 1 OK 360 14 0.039 0.238 0.264 0.231 0.100 17 4 2 1 3 0 0 0 3 2 1 3 2 3 0 3 7 5 2 1 0 0 1 0 7 3 4 3 1 8 5 2 13 12 4 4 0 0 0 1 8 19 7 5 0 0 1 0 10 16 10 10 1 0 1 0 5 14 6 7 0 1 0 2 12 3 3 3 3 2 0 1 10 4 2 5 1 1 1 0 14 7 1 5 1 4 2 0 3 2 5 3 3 5 2 2 CPTAC3-LSCC-C3L-03678-TP mutations/Mb 1 OK 360 14 0.039 0.238 0.264 0.231 0.100 14.57 3.28 2.57 0.93 5.95 0.00 0.00 0.00 2.67 2.11 1.17 2.94 3.72 3.08 0.00 4.18 6.52 3.77 2.12 0.98 0.00 0.00 0.96 0.00 20.68 6.39 12.39 8.05 2.21 5.00 4.54 1.83 11.14 9.85 5.13 3.70 0.00 0.00 0.00 1.26 7.11 20.07 8.17 4.89 0.00 0.00 1.48 0.00 9.31 12.06 10.60 9.76 2.17 0.00 0.96 0.00 14.77 29.81 18.58 18.78 0.00 0.62 0.00 1.83 10.29 2.46 3.85 2.78 5.95 2.05 0.00 1.26 8.89 4.22 2.33 4.89 1.86 1.03 1.48 0.00 13.04 5.28 1.06 4.88 2.17 4.30 1.92 0.00 8.86 4.26 15.48 8.05 6.62 3.12 1.82 1.83 CPTAC3-LSCC-C3L-03961-TP # 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1 OK 172 2 0.012 0.111 0.178 0.111 0.111 4 5 1 1 0 0 0 0 1 4 4 2 3 3 0 0 1 0 3 0 0 0 2 0 0 2 0 1 0 2 0 0 6 1 3 6 0 0 0 2 5 5 0 2 2 0 0 1 4 6 3 4 1 1 1 1 3 2 5 4 0 1 2 0 2 3 3 1 2 2 1 2 8 3 1 0 3 3 1 2 2 4 1 3 1 2 0 0 2 2 3 0 0 1 2 2 CPTAC3-LSCC-C3L-03963-TP mutations/Mb 1 OK 172 2 0.012 0.111 0.178 0.111 0.111 3.43 4.10 1.28 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 4.22 4.67 1.96 5.59 3.08 0.00 0.00 0.93 0.00 3.18 0.00 0.00 0.00 1.92 0.00 0.00 4.26 0.00 2.68 0.00 1.25 0.00 0.00 5.14 0.82 3.85 5.56 0.00 0.00 0.00 2.52 4.44 5.28 0.00 1.96 3.72 0.00 0.00 1.39 3.72 4.52 3.18 3.90 2.17 1.08 0.96 0.90 8.86 4.26 15.48 10.73 0.00 0.62 1.82 0.00 1.71 2.46 3.85 0.93 3.96 2.05 1.36 2.52 7.11 3.17 1.17 0.00 5.59 3.08 1.48 2.79 1.86 3.02 1.06 2.93 2.17 2.15 0.00 0.00 5.91 4.26 9.29 0.00 0.00 0.62 1.82 1.83 CPTAC3-LSCC-C3L-03965-TP # 1 OK 360 5 0.014 0.212 0.170 0.198 0.242 12 3 3 3 5 2 1 0 9 5 3 3 5 1 2 1 9 1 3 1 2 0 2 3 2 2 2 2 1 10 5 3 9 6 4 5 1 2 0 0 10 7 8 8 1 2 0 0 5 19 7 8 0 3 1 0 3 5 5 10 1 1 2 0 14 7 5 3 3 2 2 0 10 4 9 1 2 1 0 0 7 9 7 3 1 3 0 1 4 11 2 1 1 6 0 2 CPTAC3-LSCC-C3L-03965-TP mutations/Mb 1 OK 360 5 0.014 0.212 0.170 0.198 0.242 10.29 2.46 3.85 2.78 9.91 2.05 1.36 0.00 8.00 5.28 3.50 2.94 9.31 1.03 2.96 1.39 8.38 0.75 3.18 0.98 4.33 0.00 1.92 2.70 5.91 4.26 6.19 5.36 2.21 6.25 4.54 2.74 7.72 4.93 5.13 4.63 1.98 2.05 0.00 0.00 8.89 7.39 9.34 7.83 1.86 2.05 0.00 0.00 4.66 14.33 7.42 7.81 0.00 3.23 0.96 0.00 8.86 10.65 15.48 26.82 2.21 0.62 1.82 0.00 12.00 5.75 6.42 2.78 5.95 2.05 2.73 0.00 8.89 4.22 10.51 0.98 3.72 1.03 0.00 0.00 6.52 6.79 7.42 2.93 2.17 3.23 0.00 0.90 11.82 23.42 6.19 2.68 2.21 3.75 0.00 1.83 CPTAC3-LSCC-C3L-04013-TP # 1 OK 142 1 0.007 0.299 0.895 0.273 0.243 5 3 1 2 0 4 1 0 3 0 1 1 1 2 1 1 5 1 3 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 1 1 0 3 1 1 1 1 0 0 1 6 2 3 2 1 0 2 1 2 4 4 2 0 1 0 0 7 1 1 3 0 0 2 1 1 2 1 6 1 2 1 2 2 2 0 2 3 2 0 0 2 3 3 1 0 0 2 0 1 3 0 1 3 1 2 0 CPTAC3-LSCC-C3L-04013-TP mutations/Mb 1 OK 142 1 0.007 0.299 0.895 0.273 0.243 4.29 2.46 1.28 1.85 0.00 4.10 1.36 0.00 2.67 0.00 1.17 0.98 1.86 2.05 1.48 1.39 4.66 0.75 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 3.10 2.68 0.00 0.62 0.91 0.00 2.57 0.82 1.28 0.93 1.98 0.00 0.00 1.26 5.33 2.11 3.50 1.96 1.86 0.00 2.96 1.39 1.86 3.02 4.24 1.95 0.00 1.08 0.00 0.00 20.68 2.13 3.10 8.05 0.00 0.00 1.82 0.91 0.86 1.64 1.28 5.56 1.98 2.05 1.36 2.52 1.78 2.11 0.00 1.96 5.59 2.05 0.00 0.00 1.86 2.26 3.18 0.98 0.00 0.00 1.92 0.00 2.95 6.39 0.00 2.68 6.62 0.62 1.82 0.00 CPTAC3-LSCC-C3L-04014-TP # 1 OK 256 5 0.020 0.211 0.294 0.202 0.121 8 2 3 3 0 1 2 1 8 3 1 4 0 2 0 1 5 7 3 4 0 3 1 1 4 0 1 3 0 6 3 4 2 3 5 3 0 1 0 0 7 9 2 1 0 5 1 0 5 9 7 5 1 1 1 1 2 5 2 8 0 0 0 1 4 7 3 0 3 3 2 1 5 4 2 3 1 0 3 1 6 2 0 8 1 0 2 1 2 4 1 4 1 5 3 3 CPTAC3-LSCC-C3L-04014-TP mutations/Mb 1 OK 256 5 0.020 0.211 0.294 0.202 0.121 6.86 1.64 3.85 2.78 0.00 1.02 2.73 1.26 7.11 3.17 1.17 3.91 0.00 2.05 0.00 1.39 4.66 5.28 3.18 3.90 0.00 3.23 0.96 0.90 11.82 0.00 3.10 8.05 0.00 3.75 2.72 3.66 1.71 2.46 6.42 2.78 0.00 1.02 0.00 0.00 6.22 9.50 2.33 0.98 0.00 5.13 1.48 0.00 4.66 6.79 7.42 4.88 2.17 1.08 0.96 0.90 5.91 10.65 6.19 21.46 0.00 0.00 0.00 0.91 3.43 5.75 3.85 0.00 5.95 3.07 2.73 1.26 4.44 4.22 2.33 2.94 1.86 0.00 4.44 1.39 5.59 1.51 0.00 7.81 2.17 0.00 1.92 0.90 5.91 8.52 3.10 10.73 2.21 3.12 2.72 2.74 CPTAC3-LSCC-C3L-04071-TP # 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1 OK 191 7 0.037 0.176 0.264 0.169 0.130 6 0 2 2 2 2 1 0 0 2 1 4 0 3 1 1 5 1 0 0 0 1 1 0 1 0 1 0 1 3 2 2 1 4 2 2 1 0 0 0 6 7 0 4 0 1 0 0 7 7 2 7 0 0 1 1 3 7 1 9 0 2 0 1 2 4 0 1 1 0 0 0 1 4 3 5 2 1 1 1 9 7 4 1 2 2 0 1 2 4 3 2 1 3 1 2 CPTAC3-LSCC-C3N-04124-TP mutations/Mb 1 OK 191 7 0.037 0.176 0.264 0.169 0.130 5.14 0.00 2.57 1.85 3.96 2.05 1.36 0.00 0.00 2.11 1.17 3.91 0.00 3.08 1.48 1.39 4.66 0.75 0.00 0.00 0.00 1.08 0.96 0.00 2.95 0.00 3.10 0.00 2.21 1.87 1.82 1.83 0.86 3.28 2.57 1.85 1.98 0.00 0.00 0.00 5.33 7.39 0.00 3.91 0.00 1.03 0.00 0.00 6.52 5.28 2.12 6.83 0.00 0.00 0.96 0.90 8.86 14.91 3.10 24.14 0.00 1.25 0.00 0.91 1.71 3.28 0.00 0.93 1.98 0.00 0.00 0.00 0.89 4.22 3.50 4.89 3.72 1.03 1.48 1.39 8.38 5.28 4.24 0.98 4.33 2.15 0.00 0.90 5.91 8.52 9.29 5.36 2.21 1.87 0.91 1.83 CPTAC3-LSCC-C3N-04127-TP # 1 OK 58 1 0.017 0.091 0.060 0.094 0.075 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 2 0 3 1 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 1 3 0 0 2 3 2 0 0 2 0 2 1 2 1 2 2 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 2 0 CPTAC3-LSCC-C3N-04127-TP mutations/Mb 1 OK 58 1 0.017 0.091 0.060 0.094 0.075 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 1.36 0.00 0.89 1.06 0.00 0.00 1.86 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 0.00 1.17 0.00 0.00 1.03 1.48 0.00 1.86 0.00 3.18 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 2.13 3.10 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.86 2.46 0.00 0.00 3.96 3.07 2.73 0.00 0.00 2.11 0.00 1.96 1.86 2.05 1.48 2.79 1.86 0.75 1.06 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 2.95 0.00 3.10 2.68 0.00 0.62 1.82 0.00 CPTAC3-LSCC-C3N-04155-TP # 1 OK 276 7 0.025 0.271 0.324 0.267 0.227 13 4 2 0 1 1 0 0 10 2 5 3 1 3 2 0 14 4 3 0 2 0 1 2 0 4 2 1 0 4 2 2 6 5 1 3 0 2 0 0 7 5 1 5 0 1 0 1 7 8 1 3 0 0 0 1 2 7 6 2 0 2 0 2 5 7 3 7 2 1 1 1 10 5 1 7 2 1 3 1 12 8 1 1 0 3 1 0 5 4 3 5 0 3 3 4 CPTAC3-LSCC-C3N-04155-TP mutations/Mb 1 OK 276 7 0.025 0.271 0.324 0.267 0.227 11.14 3.28 2.57 0.00 1.98 1.02 0.00 0.00 8.89 2.11 5.84 2.94 1.86 3.08 2.96 0.00 13.04 3.02 3.18 0.00 4.33 0.00 0.96 1.80 0.00 8.52 6.19 2.68 0.00 2.50 1.82 1.83 5.14 4.10 1.28 2.78 0.00 2.05 0.00 0.00 6.22 5.28 1.17 4.89 0.00 1.03 0.00 1.39 6.52 6.03 1.06 2.93 0.00 0.00 0.00 0.90 5.91 14.91 18.58 5.36 0.00 1.25 0.00 1.83 4.29 5.75 3.85 6.48 3.96 1.02 1.36 1.26 8.89 5.28 1.17 6.85 3.72 1.03 4.44 1.39 11.17 6.03 1.06 0.98 0.00 3.23 0.96 0.00 14.77 8.52 9.29 13.41 0.00 1.87 2.72 3.66 CPTAC3-LSCC-C3N-04162-TP # 1 OK 213 6 0.028 0.194 0.202 0.171 0.134 4 1 3 0 0 4 0 0 3 3 2 0 2 1 0 1 10 3 0 0 0 1 0 0 0 3 1 3 1 5 1 1 1 2 4 4 0 0 0 0 7 3 3 5 0 1 0 0 6 4 5 2 0 0 0 0 4 6 5 8 0 1 0 0 4 1 0 4 1 0 1 0 8 2 2 2 1 1 2 0 6 4 5 1 1 1 3 2 5 6 7 8 1 3 5 2 CPTAC3-LSCC-C3N-04162-TP mutations/Mb 1 OK 213 6 0.028 0.194 0.202 0.171 0.134 3.43 0.82 3.85 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 2.67 3.17 2.33 0.00 3.72 1.03 0.00 1.39 9.31 2.26 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 6.39 3.10 8.05 2.21 3.12 0.91 0.91 0.86 1.64 5.13 3.70 0.00 0.00 0.00 0.00 6.22 3.17 3.50 4.89 0.00 1.03 0.00 0.00 5.59 3.02 5.30 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 11.82 12.78 15.48 21.46 0.00 0.62 0.00 0.00 3.43 0.82 0.00 3.70 1.98 0.00 1.36 0.00 7.11 2.11 2.33 1.96 1.86 1.03 2.96 0.00 5.59 3.02 5.30 0.98 2.17 1.08 2.88 1.80 14.77 12.78 21.68 21.46 2.21 1.87 4.54 1.83