(primary solid tumor cohort)
This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.
Testing the association between mutation status of 209 genes and 11 clinical features across 224 patients, 29 significant findings detected with Q value < 0.25.
-
PIK3CA mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
-
BRAF mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
KRTAP5-5 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
-
NRXN1 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
-
CNTN6 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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CDH2 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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CNBD1 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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ERBB4 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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ACVR2A mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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CDH9 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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GRIK3 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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GGT1 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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PCDHA10 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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FAM5C mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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IFT80 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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DACH2 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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PCDH11X mutation correlated to 'Time to Death'.
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BTNL8 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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NXF5 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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SPATA17 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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ZCWPW2 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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CDH12 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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ZNF167 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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ZFPM2 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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DPY19L1 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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TMPRSS13 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
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B2M mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
-
RNASE11 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
-
COL6A6 mutation correlated to 'NUMBER.OF.LYMPH.NODES'.
Clinical Features |
Time to Death |
AGE |
PRIMARY SITE OF DISEASE |
GENDER |
HISTOLOGICAL TYPE |
PATHOLOGY T |
PATHOLOGY N |
PATHOLOGICSPREAD(M) |
TUMOR STAGE |
COMPLETENESS OF RESECTION |
NUMBER OF LYMPH NODES |
||
nMutated (%) | nWild-Type | logrank test | t-test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | t-test | |
PIK3CA | 33 (15%) | 191 |
0.767 (1.00) |
0.0855 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.0168 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.0235 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.0358 (1.00) |
0.303 (1.00) |
1.26e-05 (0.0285) |
BRAF | 22 (10%) | 202 |
0.912 (1.00) |
0.0839 (1.00) |
0.0261 (1.00) |
0.0702 (1.00) |
2e-06 (0.00451) |
0.191 (1.00) |
0.904 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.589 (1.00) |
KRTAP5-5 | 4 (2%) | 220 |
0.882 (1.00) |
0.588 (1.00) |
1 (1.00) |
0.305 (1.00) |
1 (1.00) |
0.478 (1.00) |
1 (1.00) |
0.151 (1.00) |
1 (1.00) |
3.21e-11 (7.29e-08) |
|
NRXN1 | 20 (9%) | 204 |
0.682 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.819 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.192 (1.00) |
0.0571 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.604 (1.00) |
2.98e-05 (0.0671) |
CNTN6 | 17 (8%) | 207 |
0.45 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.0753 (1.00) |
9.11e-05 (0.205) |
CDH2 | 16 (7%) | 208 |
0.592 (1.00) |
0.302 (1.00) |
0.781 (1.00) |
0.445 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.03 (1.00) |
0.0244 (1.00) |
0.00766 (1.00) |
0.376 (1.00) |
8.45e-06 (0.0191) |
CNBD1 | 7 (3%) | 217 |
0.525 (1.00) |
0.617 (1.00) |
0.679 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.796 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.436 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.637 (1.00) |
5.88e-05 (0.132) |
ERBB4 | 18 (8%) | 206 |
0.0646 (1.00) |
0.686 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.624 (1.00) |
0.615 (1.00) |
0.0896 (1.00) |
0.0133 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.0527 (1.00) |
0.389 (1.00) |
5.02e-08 (0.000114) |
ACVR2A | 9 (4%) | 215 |
0.271 (1.00) |
0.454 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.0902 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.9 (1.00) |
0.352 (1.00) |
1 (1.00) |
0.682 (1.00) |
1 (1.00) |
3.99e-08 (9.03e-05) |
CDH9 | 15 (7%) | 209 |
0.0266 (1.00) |
0.218 (1.00) |
0.766 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.0166 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.00616 (1.00) |
0.366 (1.00) |
1.74e-10 (3.95e-07) |
GRIK3 | 17 (8%) | 207 |
0.754 (1.00) |
0.0446 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.617 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.135 (1.00) |
1 (1.00) |
0.159 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000109 (0.246) |
GGT1 | 3 (1%) | 221 |
0.966 (1.00) |
0.555 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.778 (1.00) |
1 (1.00) |
0.748 (1.00) |
1 (1.00) |
3.24e-11 (7.36e-08) |
||
PCDHA10 | 10 (4%) | 214 |
0.096 (1.00) |
0.474 (1.00) |
0.727 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.0532 (1.00) |
0.139 (1.00) |
1 (1.00) |
0.595 (1.00) |
1 (1.00) |
3.1e-07 (7e-04) |
FAM5C | 13 (6%) | 211 |
0.0736 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.0974 (1.00) |
0.0339 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.458 (1.00) |
2.7e-10 (6.12e-07) |
IFT80 | 10 (4%) | 214 |
0.945 (1.00) |
0.689 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.383 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.246 (1.00) |
0.653 (1.00) |
8.54e-10 (1.94e-06) |
DACH2 | 12 (5%) | 212 |
0.365 (1.00) |
0.551 (1.00) |
1 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.94 (1.00) |
0.0578 (1.00) |
0.199 (1.00) |
1 (1.00) |
0.893 (1.00) |
1 (1.00) |
5.01e-05 (0.113) |
PCDH11X | 14 (6%) | 210 |
6.96e-05 (0.157) |
0.546 (1.00) |
0.559 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.0393 (1.00) |
0.0862 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.113 (1.00) |
0.011 (1.00) |
BTNL8 | 3 (1%) | 221 |
0.0123 (1.00) |
0.555 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.778 (1.00) |
1 (1.00) |
0.748 (1.00) |
1 (1.00) |
3.24e-11 (7.36e-08) |
||
NXF5 | 7 (3%) | 217 |
0.261 (1.00) |
0.171 (1.00) |
0.44 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.268 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.15 (1.00) |
0.637 (1.00) |
3.11e-11 (7.07e-08) |
SPATA17 | 9 (4%) | 215 |
0.525 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.0298 (1.00) |
0.0106 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.653 (1.00) |
1.4e-06 (0.00317) |
ZCWPW2 | 7 (3%) | 217 |
0.441 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.44 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.555 (1.00) |
0.0501 (1.00) |
0.143 (1.00) |
1 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.593 (1.00) |
3.11e-11 (7.07e-08) |
CDH12 | 13 (6%) | 211 |
0.398 (1.00) |
0.0595 (1.00) |
0.543 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.0339 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.469 (1.00) |
1.32e-08 (2.98e-05) |
ZNF167 | 7 (3%) | 217 |
0.376 (1.00) |
0.538 (1.00) |
0.679 (1.00) |
1 (1.00) |
0.796 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.436 (1.00) |
1 (1.00) |
0.183 (1.00) |
1 (1.00) |
1.5e-08 (3.4e-05) |
ZFPM2 | 6 (3%) | 218 |
0.376 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.666 (1.00) |
1 (1.00) |
1.03e-07 (0.000233) |
DPY19L1 | 5 (2%) | 219 |
0.405 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.0723 (1.00) |
0.217 (1.00) |
1 (1.00) |
0.273 (1.00) |
1 (1.00) |
3.18e-11 (7.22e-08) |
TMPRSS13 | 4 (2%) | 220 |
0.26 (1.00) |
1 (1.00) |
0.351 (1.00) |
1 (1.00) |
0.237 (1.00) |
0.478 (1.00) |
1 (1.00) |
0.458 (1.00) |
1 (1.00) |
3.21e-11 (7.29e-08) |
|
B2M | 5 (2%) | 219 |
0.375 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.692 (1.00) |
1 (1.00) |
0.86 (1.00) |
1 (1.00) |
1.67e-06 (0.00378) |
RNASE11 | 5 (2%) | 219 |
0.365 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.056 (1.00) |
0.217 (1.00) |
1 (1.00) |
0.367 (1.00) |
1 (1.00) |
3.18e-11 (7.22e-08) |
COL6A6 | 16 (7%) | 208 |
0.671 (1.00) |
0.845 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.201 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.03 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.0553 (1.00) |
0.376 (1.00) |
1.98e-07 (0.000447) |
FBXW7 | 38 (17%) | 186 |
0.696 (1.00) |
0.0555 (1.00) |
0.341 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.0135 (1.00) |
0.103 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.0041 (1.00) |
0.00151 (1.00) |
0.0342 (1.00) |
0.855 (1.00) |
NRAS | 20 (9%) | 204 |
0.0691 (1.00) |
0.0434 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.0365 (1.00) |
1 (1.00) |
0.277 (1.00) |
0.0375 (1.00) |
0.377 (1.00) |
0.765 (1.00) |
0.469 (1.00) |
0.0251 (1.00) |
APC | 160 (71%) | 64 |
0.368 (1.00) |
0.404 (1.00) |
0.0159 (1.00) |
0.0753 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.91 (1.00) |
0.915 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.899 (1.00) |
KRAS | 96 (43%) | 128 |
0.0237 (1.00) |
0.113 (1.00) |
0.027 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.0636 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.317 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.0373 (1.00) |
0.194 (1.00) |
SMAD4 | 26 (12%) | 198 |
0.795 (1.00) |
0.987 (1.00) |
1 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.00552 (1.00) |
0.81 (1.00) |
1 (1.00) |
0.788 (1.00) |
0.793 (1.00) |
0.83 (1.00) |
0.318 (1.00) |
TP53 | 120 (54%) | 104 |
0.496 (1.00) |
0.0605 (1.00) |
0.0135 (1.00) |
0.284 (1.00) |
0.000245 (0.55) |
0.874 (1.00) |
0.279 (1.00) |
0.919 (1.00) |
0.241 (1.00) |
0.559 (1.00) |
0.467 (1.00) |
FAM123B | 25 (11%) | 199 |
0.634 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.5 (1.00) |
1 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.332 (1.00) |
0.782 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.645 (1.00) |
0.498 (1.00) |
TTN | 85 (38%) | 139 |
0.592 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.00419 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.0035 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.0598 (1.00) |
0.0671 (1.00) |
0.284 (1.00) |
0.905 (1.00) |
0.371 (1.00) |
SMAD2 | 15 (7%) | 209 |
0.885 (1.00) |
0.713 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.333 (1.00) |
0.269 (1.00) |
1 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.746 (1.00) |
0.0341 (1.00) |
TCF7L2 | 18 (8%) | 206 |
0.282 (1.00) |
0.404 (1.00) |
0.785 (1.00) |
0.624 (1.00) |
0.44 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.885 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.108 (1.00) |
FAT4 | 39 (17%) | 185 |
0.58 (1.00) |
0.152 (1.00) |
0.567 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.464 (1.00) |
0.473 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.0388 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.0414 (1.00) |
0.971 (1.00) |
ACVR1B | 14 (6%) | 210 |
0.605 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.0692 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0288 (1.00) |
0.034 (1.00) |
1 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.391 (1.00) |
1 (1.00) |
0.477 (1.00) |
WBSCR17 | 19 (8%) | 205 |
0.39 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.0659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.841 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.172 (1.00) |
PCDH9 | 22 (10%) | 202 |
0.128 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.812 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.932 (1.00) |
0.464 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.387 (1.00) |
0.0429 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.985 (1.00) |
LRP1B | 39 (17%) | 185 |
0.816 (1.00) |
0.213 (1.00) |
0.341 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.0115 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.83 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.806 (1.00) |
TNFRSF10C | 6 (3%) | 218 |
0.838 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.0674 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.064 (1.00) |
0.0117 (1.00) |
0.0793 (1.00) |
0.184 (1.00) |
|
MAP2K4 | 11 (5%) | 213 |
0.0342 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.104 (1.00) |
KIAA1804 | 15 (7%) | 209 |
0.284 (1.00) |
0.799 (1.00) |
0.0177 (1.00) |
0.425 (1.00) |
0.00911 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.344 (1.00) |
1 (1.00) |
0.881 (1.00) |
0.746 (1.00) |
0.0129 (1.00) |
KLHL4 | 16 (7%) | 208 |
0.129 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.781 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.0111 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.0753 (1.00) |
0.837 (1.00) |
SOX9 | 10 (4%) | 214 |
0.573 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.158 (1.00) |
0.902 (1.00) |
1 (1.00) |
0.64 (1.00) |
1 (1.00) |
0.203 (1.00) |
PRDM9 | 16 (7%) | 208 |
0.249 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.813 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.0124 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.389 (1.00) |
0.135 (1.00) |
PCBP1 | 6 (3%) | 218 |
0.557 (1.00) |
0.767 (1.00) |
1 (1.00) |
0.685 (1.00) |
1 (1.00) |
0.498 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.0311 (1.00) |
0.378 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0129 (1.00) |
DMD | 33 (15%) | 191 |
0.364 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.132 (1.00) |
0.0182 (1.00) |
0.423 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.375 (1.00) |
0.0188 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.107 (1.00) |
CSMD1 | 26 (12%) | 198 |
0.00687 (1.00) |
0.854 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.362 (1.00) |
1 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.377 (1.00) |
0.000554 (1.00) |
LIFR | 18 (8%) | 206 |
0.0294 (1.00) |
0.692 (1.00) |
1 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.741 (1.00) |
0.317 (1.00) |
0.943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.929 (1.00) |
1 (1.00) |
0.852 (1.00) |
OR6N1 | 10 (4%) | 214 |
0.847 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.727 (1.00) |
0.751 (1.00) |
0.926 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.54 (1.00) |
1 (1.00) |
0.963 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.749 (1.00) |
CCDC160 | 7 (3%) | 217 |
0.535 (1.00) |
0.631 (1.00) |
1 (1.00) |
0.263 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0671 (1.00) |
0.436 (1.00) |
1 (1.00) |
0.865 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0598 (1.00) |
CPXCR1 | 9 (4%) | 215 |
0.243 (1.00) |
0.311 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0902 (1.00) |
0.434 (1.00) |
0.209 (1.00) |
0.0702 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.0466 (1.00) |
0.000567 (1.00) |
SLITRK1 | 15 (7%) | 209 |
0.898 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.112 (1.00) |
0.813 (1.00) |
0.0487 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.276 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.0034 (1.00) |
CTNNB1 | 11 (5%) | 213 |
0.586 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.543 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.31 (1.00) |
1 (1.00) |
0.753 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00374 (1.00) |
DKK2 | 6 (3%) | 218 |
0.678 (1.00) |
0.452 (1.00) |
0.669 (1.00) |
1 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.0876 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.593 (1.00) |
0.167 (1.00) |
FLG | 32 (14%) | 192 |
0.222 (1.00) |
0.892 (1.00) |
0.207 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0293 (1.00) |
0.44 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.0167 (1.00) |
ARID1A | 21 (9%) | 203 |
0.142 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.0894 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.0963 (1.00) |
0.387 (1.00) |
0.114 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.0682 (1.00) |
KIAA1486 | 13 (6%) | 211 |
0.18 (1.00) |
0.404 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.316 (1.00) |
1 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.52 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.771 (1.00) |
ROBO1 | 18 (8%) | 206 |
0.767 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.0293 (1.00) |
0.0847 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.226 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0279 (1.00) |
ZFHX4 | 24 (11%) | 200 |
0.00119 (1.00) |
0.949 (1.00) |
1 (1.00) |
0.289 (1.00) |
0.544 (1.00) |
0.0374 (1.00) |
0.151 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.27 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.406 (1.00) |
EPHA3 | 16 (7%) | 208 |
0.495 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.3 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.543 (1.00) |
1 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.746 (1.00) |
0.306 (1.00) |
PRIM2 | 8 (4%) | 216 |
0.0794 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.752 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.636 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000806 (1.00) |
UBE2NL | 7 (3%) | 217 |
0.399 (1.00) |
0.212 (1.00) |
1 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.13 (1.00) |
0.436 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0598 (1.00) |
ADAM29 | 11 (5%) | 213 |
0.272 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.932 (1.00) |
0.221 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.0511 (1.00) |
0.317 (1.00) |
1 (1.00) |
0.968 (1.00) |
ATP10A | 19 (8%) | 205 |
0.686 (1.00) |
0.52 (1.00) |
1 (1.00) |
0.811 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.0309 (1.00) |
0.289 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.0565 (1.00) |
0.604 (1.00) |
0.16 (1.00) |
DNAH5 | 34 (15%) | 190 |
0.722 (1.00) |
0.664 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.251 (1.00) |
1 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.37 (1.00) |
GABRA5 | 9 (4%) | 215 |
0.153 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.308 (1.00) |
0.803 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.13 (1.00) |
NALCN | 20 (9%) | 204 |
0.582 (1.00) |
0.61 (1.00) |
1 (1.00) |
0.819 (1.00) |
0.846 (1.00) |
0.828 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.102 (1.00) |
1 (1.00) |
0.293 (1.00) |
OTOL1 | 8 (4%) | 216 |
0.365 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.44 (1.00) |
1 (1.00) |
0.682 (1.00) |
0.0185 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.444 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.166 (1.00) |
PTEN | 7 (3%) | 217 |
0.513 (1.00) |
0.0301 (1.00) |
0.44 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.262 (1.00) |
0.167 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.593 (1.00) |
0.14 (1.00) |
SDK1 | 27 (12%) | 197 |
0.729 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.00362 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.00901 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.314 (1.00) |
0.796 (1.00) |
0.886 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.816 (1.00) |
TLL1 | 15 (7%) | 209 |
0.292 (1.00) |
0.212 (1.00) |
1 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.144 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.931 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.278 (1.00) |
0.0849 (1.00) |
0.0344 (1.00) |
TMEM132D | 19 (8%) | 205 |
0.807 (1.00) |
0.879 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.811 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.844 (1.00) |
1 (1.00) |
0.158 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.325 (1.00) |
0.609 (1.00) |
TRPC4 | 17 (8%) | 207 |
0.571 (1.00) |
0.369 (1.00) |
1 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.0666 (1.00) |
0.0127 (1.00) |
0.0451 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.65 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000999 (1.00) |
ATM | 25 (11%) | 199 |
0.827 (1.00) |
0.709 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.0934 (1.00) |
0.262 (1.00) |
0.76 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.848 (1.00) |
GPC6 | 10 (4%) | 214 |
0.463 (1.00) |
0.995 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.0354 (1.00) |
1 (1.00) |
0.652 (1.00) |
0.884 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.518 (1.00) |
CDH8 | 14 (6%) | 210 |
0.458 (1.00) |
0.31 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.895 (1.00) |
1 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.325 (1.00) |
MGC26647 | 7 (3%) | 217 |
0.67 (1.00) |
0.976 (1.00) |
0.103 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.174 (1.00) |
0.13 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.0751 (1.00) |
DKK4 | 7 (3%) | 217 |
0.574 (1.00) |
0.256 (1.00) |
0.44 (1.00) |
1 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.436 (1.00) |
1 (1.00) |
0.755 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000217 (0.487) |
PTPRM | 20 (9%) | 204 |
0.245 (1.00) |
0.672 (1.00) |
1 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.258 (1.00) |
0.774 (1.00) |
0.839 (1.00) |
AFF2 | 17 (8%) | 207 |
0.855 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.0776 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.687 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.0486 (1.00) |
NCAM2 | 12 (5%) | 212 |
0.684 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.52 (1.00) |
1 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.0395 (1.00) |
0.653 (1.00) |
1 (1.00) |
0.718 (1.00) |
1 (1.00) |
0.865 (1.00) |
OR2M4 | 8 (4%) | 216 |
0.636 (1.00) |
0.444 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.484 (1.00) |
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0.781 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.586 (1.00) |
RYR2 | 29 (13%) | 195 |
0.817 (1.00) |
0.927 (1.00) |
0.519 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.799 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.82 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.934 (1.00) |
ELF3 | 6 (3%) | 218 |
0.678 (1.00) |
0.202 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.841 (1.00) |
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1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.593 (1.00) |
0.626 (1.00) |
TRPS1 | 17 (8%) | 207 |
0.536 (1.00) |
0.246 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.622 (1.00) |
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0.0966 (1.00) |
0.0646 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.0488 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.0103 (1.00) |
FAM133A | 7 (3%) | 217 |
0.4 (1.00) |
0.791 (1.00) |
1 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.32 (1.00) |
0.639 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.89 (1.00) |
0.593 (1.00) |
0.773 (1.00) |
IL1RAPL2 | 10 (4%) | 214 |
0.47 (1.00) |
0.817 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.0261 (1.00) |
0.768 (1.00) |
1 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.533 (1.00) |
CCBP2 | 10 (4%) | 214 |
0.459 (1.00) |
0.901 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.144 (1.00) |
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0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
0.408 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000112 (0.251) |
OPCML | 10 (4%) | 214 |
0.3 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.0717 (1.00) |
1 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.723 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.891 (1.00) |
CDH18 | 13 (6%) | 211 |
0.59 (1.00) |
0.405 (1.00) |
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0.395 (1.00) |
0.898 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.488 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.746 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00222 (1.00) |
OR2L13 | 10 (4%) | 214 |
0.661 (1.00) |
0.871 (1.00) |
1 (1.00) |
0.751 (1.00) |
1 (1.00) |
0.917 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.107 (1.00) |
LRRN3 | 10 (4%) | 214 |
0.868 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.0795 (1.00) |
0.0511 (1.00) |
0.276 (1.00) |
1 (1.00) |
0.304 (1.00) |
BAI3 | 18 (8%) | 206 |
0.85 (1.00) |
0.0982 (1.00) |
0.794 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0773 (1.00) |
0.0799 (1.00) |
0.118 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0963 (1.00) |
1 (1.00) |
0.606 (1.00) |
MGC42105 | 11 (5%) | 213 |
0.555 (1.00) |
0.641 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.454 (1.00) |
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0.46 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.702 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0238 (1.00) |
TXNDC3 | 11 (5%) | 213 |
0.378 (1.00) |
0.541 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.454 (1.00) |
0.563 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.225 (1.00) |
LPPR4 | 13 (6%) | 211 |
0.623 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.0443 (1.00) |
1 (1.00) |
0.952 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0149 (1.00) |
UNC13C | 17 (8%) | 207 |
0.71 (1.00) |
0.901 (1.00) |
1 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.091 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.535 (1.00) |
SCN7A | 15 (7%) | 209 |
0.709 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.00602 (1.00) |
0.099 (1.00) |
1 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.972 (1.00) |
ACOT4 | 3 (1%) | 221 |
0.0265 (1.00) |
0.555 (1.00) |
1 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.0608 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.489 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.653 (1.00) |
|
GRIA1 | 15 (7%) | 209 |
0.458 (1.00) |
0.554 (1.00) |
0.0419 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.231 (1.00) |
0.454 (1.00) |
0.931 (1.00) |
0.0694 (1.00) |
0.582 (1.00) |
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0.211 (1.00) |
ING1 | 6 (3%) | 218 |
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0.606 (1.00) |
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0.355 (1.00) |
0.434 (1.00) |
0.0109 (1.00) |
1 (1.00) |
0.118 (1.00) |
1 (1.00) |
0.547 (1.00) |
ZNF208 | 11 (5%) | 213 |
0.506 (1.00) |
0.102 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.823 (1.00) |
0.0272 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.581 (1.00) |
CRTC1 | 6 (3%) | 218 |
0.0365 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.746 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000473 (1.00) |
|
GUCY1A3 | 12 (5%) | 212 |
0.209 (1.00) |
0.0494 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.771 (1.00) |
0.146 (1.00) |
0.207 (1.00) |
0.917 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.834 (1.00) |
FAM22F | 9 (4%) | 215 |
0.199 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.00356 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.00563 (1.00) |
1 (1.00) |
0.12 (1.00) |
0.0653 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.602 (1.00) |
CHRDL1 | 11 (5%) | 213 |
0.934 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.248 (1.00) |
1 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.612 (1.00) |
1 (1.00) |
0.37 (1.00) |
EDNRB | 10 (4%) | 214 |
0.413 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.0983 (1.00) |
0.182 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.388 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00275 (1.00) |
ANK2 | 30 (13%) | 194 |
0.142 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.33 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.071 (1.00) |
0.926 (1.00) |
0.804 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.288 (1.00) |
0.125 (1.00) |
CASP14 | 8 (4%) | 216 |
0.455 (1.00) |
0.766 (1.00) |
0.253 (1.00) |
1 (1.00) |
0.707 (1.00) |
0.695 (1.00) |
0.0674 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.0347 (1.00) |
0.288 (1.00) |
0.478 (1.00) |
LASS3 | 9 (4%) | 215 |
0.61 (1.00) |
0.532 (1.00) |
1 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.0408 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.0879 (1.00) |
0.00303 (1.00) |
P2RY10 | 7 (3%) | 217 |
0.0115 (1.00) |
0.541 (1.00) |
0.679 (1.00) |
1 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.436 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.00237 (1.00) |
CNTN1 | 14 (6%) | 210 |
0.823 (1.00) |
0.642 (1.00) |
1 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.898 (1.00) |
0.0101 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.746 (1.00) |
0.575 (1.00) |
ISL1 | 8 (4%) | 216 |
0.607 (1.00) |
0.858 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.781 (1.00) |
0.115 (1.00) |
1 (1.00) |
0.328 (1.00) |
1 (1.00) |
0.737 (1.00) |
ARID2 | 15 (7%) | 209 |
0.901 (1.00) |
0.831 (1.00) |
1 (1.00) |
0.791 (1.00) |
1 (1.00) |
0.284 (1.00) |
0.606 (1.00) |
1 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.746 (1.00) |
0.048 (1.00) |
EIF4A2 | 5 (2%) | 219 |
0.0793 (1.00) |
1 (1.00) |
0.672 (1.00) |
1 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.546 (1.00) |
0.456 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.044 (1.00) |
|
OR51V1 | 9 (4%) | 215 |
0.453 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.06 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.00253 (1.00) |
0.0338 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.0206 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.244 (1.00) |
ZC3H13 | 21 (9%) | 203 |
0.578 (1.00) |
0.114 (1.00) |
0.321 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0754 (1.00) |
0.0664 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.294 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.115 (1.00) |
CDH11 | 14 (6%) | 210 |
0.418 (1.00) |
0.736 (1.00) |
0.0692 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.895 (1.00) |
0.589 (1.00) |
1 (1.00) |
0.775 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.234 (1.00) |
CHST9 | 8 (4%) | 216 |
0.131 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.0593 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.89 (1.00) |
1 (1.00) |
0.865 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.307 (1.00) |
HTR3B | 6 (3%) | 218 |
0.552 (1.00) |
0.604 (1.00) |
1 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.655 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.705 (1.00) |
1 (1.00) |
0.945 (1.00) |
LRRIQ3 | 10 (4%) | 214 |
0.504 (1.00) |
0.883 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0509 (1.00) |
1 (1.00) |
0.17 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.91 (1.00) |
1 (1.00) |
0.888 (1.00) |
HCN1 | 10 (4%) | 214 |
0.295 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.727 (1.00) |
1 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.308 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
0.487 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0453 (1.00) |
CHRM2 | 10 (4%) | 214 |
0.428 (1.00) |
0.835 (1.00) |
0.727 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.0154 (1.00) |
0.902 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.0321 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.598 (1.00) |
CSMD3 | 28 (12%) | 196 |
0.348 (1.00) |
0.967 (1.00) |
0.83 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.0114 (1.00) |
0.0282 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.0408 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00368 (1.00) |
DCAF4L2 | 11 (5%) | 213 |
0.938 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.51 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0596 (1.00) |
0.0145 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.224 (1.00) |
DOCK2 | 21 (9%) | 203 |
0.626 (1.00) |
0.914 (1.00) |
0.621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.457 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.981 (1.00) |
KCNA4 | 12 (5%) | 212 |
0.934 (1.00) |
0.629 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.146 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.599 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.575 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.281 (1.00) |
DPP10 | 13 (6%) | 211 |
0.848 (1.00) |
0.409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.41 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.52 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.431 (1.00) |
EVC2 | 17 (8%) | 207 |
0.324 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.595 (1.00) |
1 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.731 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.389 (1.00) |
0.663 (1.00) |
C15ORF2 | 12 (5%) | 212 |
0.503 (1.00) |
0.637 (1.00) |
1 (1.00) |
0.38 (1.00) |
0.27 (1.00) |
0.307 (1.00) |
0.07 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.0716 (1.00) |
NLRP5 | 12 (5%) | 212 |
0.702 (1.00) |
0.485 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.38 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.444 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.469 (1.00) |
0.605 (1.00) |
KLK2 | 3 (1%) | 221 |
0.179 (1.00) |
0.555 (1.00) |
1 (1.00) |
0.399 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.863 (1.00) |
1 (1.00) |
0.561 (1.00) |
|
LUZP2 | 6 (3%) | 218 |
0.819 (1.00) |
1 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.247 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.364 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0463 (1.00) |
|
PCDHB5 | 14 (6%) | 210 |
0.0851 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.709 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.504 (1.00) |
1 (1.00) |
0.164 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00149 (1.00) |
LOXL2 | 9 (4%) | 215 |
0.405 (1.00) |
0.54 (1.00) |
1 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.916 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.789 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.393 (1.00) |
UBQLNL | 5 (2%) | 219 |
0.199 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.577 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.566 (1.00) |
1 (1.00) |
0.897 (1.00) |
1 (1.00) |
0.414 (1.00) |
|
MYO1B | 13 (6%) | 211 |
0.343 (1.00) |
0.632 (1.00) |
1 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.673 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.575 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.123 (1.00) |
RIMS1 | 15 (7%) | 209 |
0.803 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.276 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.0211 (1.00) |
COL12A1 | 21 (9%) | 203 |
0.339 (1.00) |
0.846 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.259 (1.00) |
0.0963 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.149 (1.00) |
0.315 (1.00) |
0.447 (1.00) |
JAKMIP2 | 13 (6%) | 211 |
0.258 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.469 (1.00) |
0.000711 (1.00) |
CDH10 | 14 (6%) | 210 |
0.803 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.431 (1.00) |
0.454 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.647 (1.00) |
1 (1.00) |
0.009 (1.00) |
EPHA5 | 13 (6%) | 211 |
0.931 (1.00) |
0.192 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.624 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.926 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.184 (1.00) |
ODZ1 | 22 (10%) | 202 |
0.00351 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.00017 (0.381) |
0.0346 (1.00) |
0.921 (1.00) |
0.951 (1.00) |
0.77 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.604 (1.00) |
0.177 (1.00) |
POSTN | 11 (5%) | 213 |
0.0234 (1.00) |
0.794 (1.00) |
0.02 (1.00) |
1 (1.00) |
0.024 (1.00) |
1 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.365 (1.00) |
SYNE1 | 47 (21%) | 177 |
0.351 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.626 (1.00) |
0.0767 (1.00) |
0.0304 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.322 (1.00) |
0.456 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.0549 (1.00) |
ZEB2 | 15 (7%) | 209 |
0.354 (1.00) |
0.987 (1.00) |
1 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.959 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.969 (1.00) |
TUSC3 | 7 (3%) | 217 |
0.405 (1.00) |
0.509 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.498 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.631 (1.00) |
CACNG7 | 6 (3%) | 218 |
0.33 (1.00) |
0.869 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.437 (1.00) |
1 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.666 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0129 (1.00) |
RWDD2B | 8 (4%) | 216 |
0.796 (1.00) |
0.247 (1.00) |
0.703 (1.00) |
1 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.334 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000806 (1.00) |
SLC25A13 | 7 (3%) | 217 |
0.651 (1.00) |
0.178 (1.00) |
1 (1.00) |
0.122 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.0501 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.0751 (1.00) |
DPF2 | 4 (2%) | 220 |
0.527 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.305 (1.00) |
0.742 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.565 (1.00) |
1 (1.00) |
0.791 (1.00) |
|
PCDH10 | 17 (8%) | 207 |
0.209 (1.00) |
0.976 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.357 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.563 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.216 (1.00) |
MCF2 | 12 (5%) | 212 |
0.479 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.27 (1.00) |
0.0208 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
1 (1.00) |
0.864 (1.00) |
NCKAP5 | 15 (7%) | 209 |
0.796 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.158 (1.00) |
1 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.213 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.739 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.796 (1.00) |
RIMS2 | 13 (6%) | 211 |
0.208 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.0705 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.1 (1.00) |
0.214 (1.00) |
0.926 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.583 (1.00) |
ATP7A | 6 (3%) | 218 |
0.178 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.0227 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.593 (1.00) |
0.917 (1.00) |
|
TPTE | 12 (5%) | 212 |
0.657 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.0724 (1.00) |
0.444 (1.00) |
0.411 (1.00) |
1 (1.00) |
0.944 (1.00) |
1 (1.00) |
0.803 (1.00) |
OR8B4 | 6 (3%) | 218 |
0.705 (1.00) |
0.839 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.666 (1.00) |
1 (1.00) |
0.061 (1.00) |
SFMBT2 | 13 (6%) | 211 |
0.398 (1.00) |
0.657 (1.00) |
0.0705 (1.00) |
0.575 (1.00) |
0.207 (1.00) |
0.258 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.538 (1.00) |
FLRT2 | 13 (6%) | 211 |
0.744 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.797 (1.00) |
0.0547 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.47 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.0458 (1.00) |
BCHE | 9 (4%) | 215 |
0.427 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.175 (1.00) |
1 (1.00) |
0.228 (1.00) |
0.315 (1.00) |
1 (1.00) |
0.733 (1.00) |
1 (1.00) |
0.718 (1.00) |
C8B | 10 (4%) | 214 |
0.263 (1.00) |
0.122 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.182 (1.00) |
0.414 (1.00) |
1 (1.00) |
0.652 (1.00) |
0.526 (1.00) |
1 (1.00) |
0.839 (1.00) |
FREM2 | 23 (10%) | 201 |
0.612 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.473 (1.00) |
0.0138 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.715 (1.00) |
0.387 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.0471 (1.00) |
GABRG1 | 8 (4%) | 216 |
0.514 (1.00) |
0.0941 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0293 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.303 (1.00) |
1 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.221 (1.00) |
SAT1 | 4 (2%) | 220 |
0.211 (1.00) |
0.315 (1.00) |
0.0505 (1.00) |
0.397 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.897 (1.00) |
1 (1.00) |
0.851 (1.00) |
|
CHD4 | 17 (8%) | 207 |
0.715 (1.00) |
0.514 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.0527 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.00928 (1.00) |
PCDHB2 | 14 (6%) | 210 |
0.321 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.0692 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.684 (1.00) |
1 (1.00) |
0.975 (1.00) |
1 (1.00) |
0.314 (1.00) |
TMTC1 | 13 (6%) | 211 |
0.857 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.673 (1.00) |
0.926 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.818 (1.00) |
SH3GL3 | 8 (4%) | 216 |
0.468 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.789 (1.00) |
0.0986 (1.00) |
0.0133 (1.00) |
CACNG3 | 8 (4%) | 216 |
0.468 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.335 (1.00) |
0.89 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.849 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.87 (1.00) |
POTEB | 8 (4%) | 216 |
0.634 (1.00) |
0.529 (1.00) |
0.703 (1.00) |
1 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.325 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.000806 (1.00) |
GRIN2A | 19 (8%) | 205 |
0.457 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.348 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.073 (1.00) |
1 (1.00) |
0.697 (1.00) |
1 (1.00) |
0.158 (1.00) |
NRXN3 | 17 (8%) | 207 |
0.879 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.0804 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.0203 (1.00) |
OR7C1 | 6 (3%) | 218 |
0.12 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.315 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.838 (1.00) |
1 (1.00) |
0.64 (1.00) |
|
SPATA8 | 3 (1%) | 221 |
0.706 (1.00) |
0.0279 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.0616 (1.00) |
1 (1.00) |
0.778 (1.00) |
1 (1.00) |
0.863 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
|
OR2M2 | 6 (3%) | 218 |
0.106 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.0347 (1.00) |
0.0365 (1.00) |
1 (1.00) |
0.166 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.189 (1.00) |
SORCS1 | 15 (7%) | 209 |
0.0276 (1.00) |
0.116 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.0128 (1.00) |
0.429 (1.00) |
1 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.00977 (1.00) |
IL18R1 | 10 (4%) | 214 |
0.443 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.727 (1.00) |
1 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.0217 (1.00) |
0.604 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.766 (1.00) |
C16ORF45 | 3 (1%) | 221 |
0.795 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.132 (1.00) |
0.0161 (1.00) |
0.213 (1.00) |
0.827 (1.00) |
||
INHBA | 9 (4%) | 215 |
0.911 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.00297 (1.00) |
0.137 (1.00) |
1 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.945 (1.00) |
MIER3 | 11 (5%) | 213 |
0.442 (1.00) |
0.905 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.214 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.00059 (1.00) |
ZNF585A | 10 (4%) | 214 |
0.479 (1.00) |
0.504 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.3 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.479 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.0925 (1.00) |
FSTL5 | 11 (5%) | 213 |
0.383 (1.00) |
0.437 (1.00) |
1 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.823 (1.00) |
0.0547 (1.00) |
0.694 (1.00) |
1 (1.00) |
0.79 (1.00) |
1 (1.00) |
0.281 (1.00) |
DOK5 | 6 (3%) | 218 |
0.704 (1.00) |
0.0225 (1.00) |
1 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.0676 (1.00) |
1 (1.00) |
0.445 (1.00) |
1 (1.00) |
0.89 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.96 (1.00) |
ZNF99 | 11 (5%) | 213 |
0.112 (1.00) |
0.731 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.00681 (1.00) |
GML | 6 (3%) | 218 |
0.164 (1.00) |
0.85 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.826 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.546 (1.00) |
0.741 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.36 (1.00) |
PPP2R2B | 3 (1%) | 221 |
0.532 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.00532 (1.00) |
0.778 (1.00) |
1 (1.00) |
0.367 (1.00) |
1 (1.00) |
||
LRTM1 | 7 (3%) | 217 |
0.603 (1.00) |
0.713 (1.00) |
1 (1.00) |
0.449 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.167 (1.00) |
1 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.906 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.14 (1.00) |
OR10G9 | 6 (3%) | 218 |
0.295 (1.00) |
0.944 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.00497 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.629 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.746 (1.00) |
1 (1.00) |
0.061 (1.00) |
ERBB3 | 14 (6%) | 210 |
0.354 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.559 (1.00) |
1 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.78 (1.00) |
1 (1.00) |
0.626 (1.00) |
PSG8 | 8 (4%) | 216 |
0.176 (1.00) |
0.991 (1.00) |
0.11 (1.00) |
1 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.89 (1.00) |
1 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.0345 (1.00) |
0.195 (1.00) |
SYT16 | 9 (4%) | 215 |
0.458 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.244 (1.00) |
LPHN3 | 13 (6%) | 211 |
0.401 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.225 (1.00) |
1 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.00229 (1.00) |
0.281 (1.00) |
1 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.351 (1.00) |
LRP2 | 35 (16%) | 189 |
0.601 (1.00) |
0.494 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.0823 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.308 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.943 (1.00) |
SOHLH2 | 9 (4%) | 215 |
0.122 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.282 (1.00) |
1 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.0621 (1.00) |
0.562 (1.00) |
1 (1.00) |
0.918 (1.00) |
1 (1.00) |
0.825 (1.00) |
ZIM3 | 9 (4%) | 215 |
0.585 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.789 (1.00) |
0.0879 (1.00) |
0.00743 (1.00) |
DSEL | 14 (6%) | 210 |
0.914 (1.00) |
0.846 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.0727 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.647 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000545 (1.00) |
MDGA2 | 10 (4%) | 214 |
0.733 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.727 (1.00) |
1 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.902 (1.00) |
1 (1.00) |
0.814 (1.00) |
1 (1.00) |
0.237 (1.00) |
RBMS3 | 6 (3%) | 218 |
0.425 (1.00) |
0.682 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.17 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.89 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.543 (1.00) |
TMBIM4 | 4 (2%) | 220 |
0.426 (1.00) |
1 (1.00) |
0.623 (1.00) |
1 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.489 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.131 (1.00) |
|
FAM135B | 15 (7%) | 209 |
0.877 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.562 (1.00) |
1 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.704 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.675 (1.00) |
CYP7B1 | 7 (3%) | 217 |
0.935 (1.00) |
0.797 (1.00) |
1 (1.00) |
0.449 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.0196 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.273 (1.00) |
1 (1.00) |
0.957 (1.00) |
SLC16A7 | 9 (4%) | 215 |
0.246 (1.00) |
0.586 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.166 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.839 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.0533 (1.00) |
P value = 1.26e-05 (t-test), Q value = 0.028
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
PIK3CA MUTATED | 33 | 0.5 (1.4) |
PIK3CA WILD-TYPE | 189 | 2.6 (5.1) |
P value = 2e-06 (Fisher's exact test), Q value = 0.0045
nPatients | COLON ADENOCARCINOMA | COLON MUCINOUS ADENOCARCINOMA | RECTAL ADENOCARCINOMA | RECTAL MUCINOUS ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|
ALL | 128 | 24 | 57 | 8 |
BRAF MUTATED | 9 | 11 | 1 | 1 |
BRAF WILD-TYPE | 119 | 13 | 56 | 7 |
P value = 3.21e-11 (t-test), Q value = 7.3e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
KRTAP5-5 MUTATED | 4 | 0.0 (0.0) |
KRTAP5-5 WILD-TYPE | 218 | 2.3 (4.8) |
P value = 2.98e-05 (t-test), Q value = 0.067
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
NRXN1 MUTATED | 20 | 0.5 (1.3) |
NRXN1 WILD-TYPE | 202 | 2.4 (5.0) |
P value = 9.11e-05 (t-test), Q value = 0.2
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
CNTN6 MUTATED | 17 | 0.5 (1.3) |
CNTN6 WILD-TYPE | 205 | 2.4 (5.0) |
P value = 8.45e-06 (t-test), Q value = 0.019
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
CDH2 MUTATED | 16 | 0.4 (1.0) |
CDH2 WILD-TYPE | 206 | 2.4 (5.0) |
P value = 5.88e-05 (t-test), Q value = 0.13
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
CNBD1 MUTATED | 7 | 0.3 (0.8) |
CNBD1 WILD-TYPE | 215 | 2.3 (4.9) |
P value = 5.02e-08 (t-test), Q value = 0.00011
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
ERBB4 MUTATED | 18 | 0.2 (0.7) |
ERBB4 WILD-TYPE | 204 | 2.4 (5.0) |
P value = 3.99e-08 (t-test), Q value = 9e-05
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
ACVR2A MUTATED | 9 | 0.2 (0.4) |
ACVR2A WILD-TYPE | 213 | 2.3 (4.9) |
P value = 1.74e-10 (t-test), Q value = 3.9e-07
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
CDH9 MUTATED | 15 | 0.1 (0.3) |
CDH9 WILD-TYPE | 207 | 2.4 (4.9) |
P value = 0.000109 (t-test), Q value = 0.25
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
GRIK3 MUTATED | 17 | 0.5 (1.2) |
GRIK3 WILD-TYPE | 205 | 2.4 (5.0) |
P value = 3.24e-11 (t-test), Q value = 7.4e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
GGT1 MUTATED | 3 | 0.0 (0.0) |
GGT1 WILD-TYPE | 219 | 2.3 (4.8) |
P value = 3.1e-07 (t-test), Q value = 7e-04
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
PCDHA10 MUTATED | 10 | 0.2 (0.6) |
PCDHA10 WILD-TYPE | 212 | 2.3 (4.9) |
P value = 2.7e-10 (t-test), Q value = 6.1e-07
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
FAM5C MUTATED | 13 | 0.1 (0.3) |
FAM5C WILD-TYPE | 209 | 2.4 (4.9) |
P value = 8.54e-10 (t-test), Q value = 1.9e-06
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
IFT80 MUTATED | 10 | 0.1 (0.3) |
IFT80 WILD-TYPE | 212 | 2.4 (4.9) |
P value = 5.01e-05 (t-test), Q value = 0.11
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
DACH2 MUTATED | 12 | 0.5 (0.9) |
DACH2 WILD-TYPE | 210 | 2.4 (4.9) |
P value = 6.96e-05 (logrank test), Q value = 0.16
nPatients | nDeath | Duration Range (Median), Month | |
---|---|---|---|
ALL | 120 | 14 | 0.9 - 72.1 (10.9) |
PCDH11X MUTATED | 11 | 4 | 1.0 - 21.0 (1.0) |
PCDH11X WILD-TYPE | 109 | 10 | 0.9 - 72.1 (12.0) |
P value = 3.24e-11 (t-test), Q value = 7.4e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
BTNL8 MUTATED | 3 | 0.0 (0.0) |
BTNL8 WILD-TYPE | 219 | 2.3 (4.8) |
P value = 3.11e-11 (t-test), Q value = 7.1e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
NXF5 MUTATED | 7 | 0.0 (0.0) |
NXF5 WILD-TYPE | 215 | 2.3 (4.9) |
P value = 1.4e-06 (t-test), Q value = 0.0032
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
SPATA17 MUTATED | 9 | 0.2 (0.7) |
SPATA17 WILD-TYPE | 213 | 2.3 (4.9) |
P value = 3.11e-11 (t-test), Q value = 7.1e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
ZCWPW2 MUTATED | 7 | 0.0 (0.0) |
ZCWPW2 WILD-TYPE | 215 | 2.3 (4.9) |
P value = 1.32e-08 (t-test), Q value = 3e-05
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
CDH12 MUTATED | 13 | 0.2 (0.6) |
CDH12 WILD-TYPE | 209 | 2.4 (4.9) |
P value = 1.5e-08 (t-test), Q value = 3.4e-05
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
ZNF167 MUTATED | 7 | 0.1 (0.4) |
ZNF167 WILD-TYPE | 215 | 2.3 (4.9) |
P value = 1.03e-07 (t-test), Q value = 0.00023
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
ZFPM2 MUTATED | 6 | 0.2 (0.4) |
ZFPM2 WILD-TYPE | 216 | 2.3 (4.9) |
P value = 3.18e-11 (t-test), Q value = 7.2e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
DPY19L1 MUTATED | 5 | 0.0 (0.0) |
DPY19L1 WILD-TYPE | 217 | 2.3 (4.8) |
P value = 3.21e-11 (t-test), Q value = 7.3e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
TMPRSS13 MUTATED | 4 | 0.0 (0.0) |
TMPRSS13 WILD-TYPE | 218 | 2.3 (4.8) |
P value = 1.67e-06 (t-test), Q value = 0.0038
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
B2M MUTATED | 5 | 0.2 (0.4) |
B2M WILD-TYPE | 217 | 2.3 (4.9) |
P value = 3.18e-11 (t-test), Q value = 7.2e-08
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
RNASE11 MUTATED | 5 | 0.0 (0.0) |
RNASE11 WILD-TYPE | 217 | 2.3 (4.8) |
P value = 1.98e-07 (t-test), Q value = 0.00045
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 222 | 2.3 (4.8) |
COL6A6 MUTATED | 16 | 0.2 (0.8) |
COL6A6 WILD-TYPE | 206 | 2.4 (5.0) |
-
Mutation data file = COADREAD-TP.mutsig.cluster.txt
-
Clinical data file = COADREAD-TP.clin.merged.picked.txt
-
Number of patients = 224
-
Number of significantly mutated genes = 209
-
Number of selected clinical features = 11
-
Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3
For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R
For continuous numerical clinical features, two-tailed Student's t test with unequal variance (Lehmann and Romano 2005) was applied to compare the clinical values between tumors with and without gene mutations using 't.test' function in R
For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R
For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.
This is an experimental feature. The full results of the analysis summarized in this report can be downloaded from the TCGA Data Coordination Center.