(primary solid tumor cohort)
This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.
Testing the association between mutation status of 184 genes and 14 clinical features across 172 patients, 9 significant findings detected with Q value < 0.25.
-
CNBD1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
LRRIQ3 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
U2AF1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
GBA3 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
OR2W5 mutation correlated to 'NUMBERPACKYEARSSMOKED'.
-
AKR1B10 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
DACH1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
PYHIN1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
OR13G1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
Clinical Features |
Time to Death |
AGE | GENDER |
KARNOFSKY PERFORMANCE SCORE |
HISTOLOGICAL TYPE |
PATHOLOGY T |
PATHOLOGY N |
PATHOLOGICSPREAD(M) |
TUMOR STAGE |
RADIATIONS RADIATION REGIMENINDICATION |
NUMBERPACKYEARSSMOKED | TOBACCOSMOKINGHISTORYINDICATOR | YEAROFTOBACCOSMOKINGONSET |
COMPLETENESS OF RESECTION |
||
nMutated (%) | nWild-Type | logrank test | t-test | Fisher's exact test | t-test | Chi-square test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | t-test | Fisher's exact test | t-test | Fisher's exact test | |
CNBD1 | 10 (6%) | 162 |
0.73 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.111 (1.00) |
8.55e-05 (0.201) |
0.607 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.947 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.785 (1.00) |
0.0243 (1.00) |
0.412 (1.00) |
1 (1.00) |
|
LRRIQ3 | 10 (6%) | 162 |
0.597 (1.00) |
0.834 (1.00) |
0.755 (1.00) |
2.48e-05 (0.0586) |
0.568 (1.00) |
0.903 (1.00) |
1 (1.00) |
0.947 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.893 (1.00) |
0.772 (1.00) |
1 (1.00) |
|
U2AF1 | 6 (3%) | 166 |
0.401 (1.00) |
0.894 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1.18e-08 (2.79e-05) |
0.856 (1.00) |
0.0572 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.0979 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.404 (1.00) |
|
GBA3 | 8 (5%) | 164 |
0.426 (1.00) |
0.0276 (1.00) |
0.728 (1.00) |
1.34e-06 (0.00317) |
1 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.087 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0798 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
OR2W5 | 7 (4%) | 165 |
0.666 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.208 (1.00) |
0.881 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.502 (1.00) |
2.56e-05 (0.0603) |
0.862 (1.00) |
1 (1.00) |
||
AKR1B10 | 4 (2%) | 168 |
0.615 (1.00) |
0.00726 (1.00) |
1 (1.00) |
9.3e-06 (0.022) |
1 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.0113 (1.00) |
0.85 (1.00) |
0.326 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.612 (1.00) |
|||
DACH1 | 11 (6%) | 161 |
0.499 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.349 (1.00) |
4.58e-05 (0.108) |
0.507 (1.00) |
1 (1.00) |
0.813 (1.00) |
1 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.0331 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.273 (1.00) |
|
PYHIN1 | 7 (4%) | 165 |
0.653 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.704 (1.00) |
9.21e-05 (0.217) |
0.356 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.255 (1.00) |
1 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.775 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR13G1 | 9 (5%) | 163 |
0.247 (1.00) |
0.213 (1.00) |
1 (1.00) |
1.08e-05 (0.0254) |
1 (1.00) |
0.14 (1.00) |
1 (1.00) |
0.205 (1.00) |
1 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.879 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
CDKN2A | 8 (5%) | 164 |
0.689 (1.00) |
0.117 (1.00) |
0.728 (1.00) |
1 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.726 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.0411 (1.00) |
1 (1.00) |
|
EGFR | 22 (13%) | 150 |
0.0143 (1.00) |
0.149 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.731 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.00101 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.48 (1.00) |
|
KRAS | 47 (27%) | 125 |
0.323 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.0834 (1.00) |
0.406 (1.00) |
1 (1.00) |
0.938 (1.00) |
1 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.0886 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.407 (1.00) |
STK11 | 20 (12%) | 152 |
0.404 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.0941 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.851 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.97 (1.00) |
0.403 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TP53 | 87 (51%) | 85 |
0.721 (1.00) |
0.0626 (1.00) |
0.225 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.825 (1.00) |
0.977 (1.00) |
1 (1.00) |
0.531 (1.00) |
0.00415 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.836 (1.00) |
KEAP1 | 32 (19%) | 140 |
0.59 (1.00) |
0.784 (1.00) |
1 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.52 (1.00) |
1 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.922 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.131 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.216 (1.00) |
1 (1.00) |
NAV3 | 35 (20%) | 137 |
0.872 (1.00) |
0.736 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.774 (1.00) |
0.313 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.69 (1.00) |
0.948 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.0204 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.549 (1.00) |
MAGEC1 | 23 (13%) | 149 |
0.99 (1.00) |
0.569 (1.00) |
0.826 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.0607 (1.00) |
0.0847 (1.00) |
0.103 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.0232 (1.00) |
0.681 (1.00) |
0.745 (1.00) |
|
CDH10 | 34 (20%) | 138 |
0.0594 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.0451 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.0497 (1.00) |
1 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.0254 (1.00) |
0.416 (1.00) |
1 (1.00) |
|
MUC7 | 15 (9%) | 157 |
0.229 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.0313 (1.00) |
0.742 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.762 (1.00) |
0.534 (1.00) |
0.945 (1.00) |
1 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.0362 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.604 (1.00) |
|
TMTC1 | 22 (13%) | 150 |
0.322 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.0695 (1.00) |
0.132 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.378 (1.00) |
1 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.0407 (1.00) |
0.355 (1.00) |
0.0973 (1.00) |
|
OR4C16 | 14 (8%) | 158 |
0.879 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.00461 (1.00) |
0.868 (1.00) |
0.385 (1.00) |
1 (1.00) |
0.165 (1.00) |
1 (1.00) |
0.511 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.885 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
ZNF676 | 16 (9%) | 156 |
0.967 (1.00) |
0.196 (1.00) |
1 (1.00) |
0.42 (1.00) |
0.825 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.528 (1.00) |
1 (1.00) |
0.568 (1.00) |
0.0592 (1.00) |
0.67 (1.00) |
0.398 (1.00) |
|
EPHA6 | 22 (13%) | 150 |
0.653 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.108 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.307 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.381 (1.00) |
RIMS2 | 32 (19%) | 140 |
0.703 (1.00) |
0.716 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.546 (1.00) |
0.895 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.0367 (1.00) |
0.38 (1.00) |
OR2L3 | 13 (8%) | 159 |
0.927 (1.00) |
0.867 (1.00) |
0.0229 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.744 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.96 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.278 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.343 (1.00) |
0.448 (1.00) |
|
ELTD1 | 15 (9%) | 157 |
0.0881 (1.00) |
0.0391 (1.00) |
0.788 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.033 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.534 (1.00) |
0.0665 (1.00) |
1 (1.00) |
0.909 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.424 (1.00) |
|
CD5L | 12 (7%) | 160 |
0.949 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.914 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
REG1B | 13 (8%) | 159 |
0.493 (1.00) |
0.0662 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.537 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.82 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.141 (1.00) |
0.833 (1.00) |
REG3A | 14 (8%) | 158 |
0.591 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.0283 (1.00) |
0.649 (1.00) |
0.729 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
OR2T4 | 13 (8%) | 159 |
0.00886 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.0822 (1.00) |
0.605 (1.00) |
1 (1.00) |
0.593 (1.00) |
1 (1.00) |
0.427 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.0383 (1.00) |
1 (1.00) |
|
GABRB3 | 11 (6%) | 161 |
0.255 (1.00) |
0.992 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.0746 (1.00) |
1 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.819 (1.00) |
|
TRIM58 | 8 (5%) | 164 |
0.746 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.259 (1.00) |
0.439 (1.00) |
1 (1.00) |
||
BAGE2 | 9 (5%) | 163 |
0.429 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.0389 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.497 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.751 (1.00) |
0.236 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OR4A5 | 12 (7%) | 160 |
0.0375 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.0393 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.94 (1.00) |
0.0467 (1.00) |
0.226 (1.00) |
0.0762 (1.00) |
1 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.0535 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
BRAF | 15 (9%) | 157 |
0.965 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.183 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.499 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.491 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
OR2L8 | 12 (7%) | 160 |
0.166 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.682 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.324 (1.00) |
0.848 (1.00) |
|
CRIPAK | 11 (6%) | 161 |
0.0496 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.00809 (1.00) |
0.448 (1.00) |
1 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.636 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PABPC3 | 9 (5%) | 163 |
0.0778 (1.00) |
0.413 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.976 (1.00) |
0.839 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.0482 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.587 (1.00) |
0.116 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.291 (1.00) |
|
ZNF804A | 30 (17%) | 142 |
0.0284 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.841 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.00705 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.426 (1.00) |
C18ORF34 | 19 (11%) | 153 |
0.987 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.452 (1.00) |
0.566 (1.00) |
SERPINB4 | 10 (6%) | 162 |
0.074 (1.00) |
0.694 (1.00) |
1 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.799 (1.00) |
0.0961 (1.00) |
1 (1.00) |
0.253 (1.00) |
1 (1.00) |
0.301 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.489 (1.00) |
0.551 (1.00) |
|
OR2T34 | 10 (6%) | 162 |
0.805 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.745 (1.00) |
1 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.0302 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.433 (1.00) |
|
ZNF492 | 8 (5%) | 164 |
0.6 (1.00) |
0.942 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.288 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
OR4C15 | 13 (8%) | 159 |
0.429 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.0122 (1.00) |
0.209 (1.00) |
0.3 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.146 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.342 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TBX22 | 12 (7%) | 160 |
0.99 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.0209 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.841 (1.00) |
0.769 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
FERD3L | 7 (4%) | 165 |
0.0116 (1.00) |
0.166 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.272 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.881 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
LRRTM4 | 18 (10%) | 154 |
0.265 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.0238 (1.00) |
0.0651 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.79 (1.00) |
1 (1.00) |
0.635 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.064 (1.00) |
0.0618 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.465 (1.00) |
|
OR5W2 | 9 (5%) | 163 |
0.483 (1.00) |
0.633 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.407 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.893 (1.00) |
0.115 (1.00) |
1 (1.00) |
|
RIT1 | 8 (5%) | 164 |
0.765 (1.00) |
0.303 (1.00) |
1 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.0218 (1.00) |
|
OR5D14 | 13 (8%) | 159 |
0.399 (1.00) |
0.356 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0049 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.0494 (1.00) |
0.0141 (1.00) |
0.424 (1.00) |
||
OR8H2 | 11 (6%) | 161 |
0.662 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.245 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.874 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.0725 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
NRG3 | 13 (8%) | 159 |
0.909 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.371 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.32 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.806 (1.00) |
0.506 (1.00) |
|
HEATR7B2 | 20 (12%) | 152 |
0.776 (1.00) |
0.711 (1.00) |
1 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.0943 (1.00) |
0.067 (1.00) |
0.895 (1.00) |
0.247 (1.00) |
|
ZNF268 | 5 (3%) | 167 |
0.278 (1.00) |
0.507 (1.00) |
0.181 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.249 (1.00) |
1 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
OR5I1 | 11 (6%) | 161 |
0.666 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.0118 (1.00) |
0.262 (1.00) |
1 (1.00) |
0.176 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0981 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.93 (1.00) |
0.366 (1.00) |
|
KCNT2 | 17 (10%) | 155 |
0.0574 (1.00) |
0.526 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.0988 (1.00) |
0.238 (1.00) |
1 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.143 (1.00) |
|
HGF | 16 (9%) | 156 |
0.311 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.0671 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.961 (1.00) |
0.0342 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.234 (1.00) |
1 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.214 (1.00) |
|
THEMIS | 10 (6%) | 162 |
0.0493 (1.00) |
0.995 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.4 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.383 (1.00) |
0.274 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.812 (1.00) |
0.937 (1.00) |
0.753 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
IL1RAPL1 | 11 (6%) | 161 |
0.738 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.333 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.449 (1.00) |
0.216 (1.00) |
1 (1.00) |
|
ADAMTS2 | 14 (8%) | 158 |
0.78 (1.00) |
0.933 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.915 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.673 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.913 (1.00) |
1 (1.00) |
0.485 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.819 (1.00) |
|
SPANXN2 | 7 (4%) | 165 |
0.396 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.529 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.844 (1.00) |
1 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.914 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
CPXCR1 | 10 (6%) | 162 |
0.117 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.654 (1.00) |
1 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
TBX15 | 11 (6%) | 161 |
0.557 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.0642 (1.00) |
0.0279 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.446 (1.00) |
1 (1.00) |
0.425 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.651 (1.00) |
|
WDR49 | 9 (5%) | 163 |
0.94 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.65 (1.00) |
|
PCK1 | 10 (6%) | 162 |
0.099 (1.00) |
0.319 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.0859 (1.00) |
0.0406 (1.00) |
1 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.00122 (1.00) |
0.148 (1.00) |
|
CXORF59 | 8 (5%) | 164 |
0.174 (1.00) |
0.417 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.663 (1.00) |
0.535 (1.00) |
1 (1.00) |
0.808 (1.00) |
1 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.036 (1.00) |
0.954 (1.00) |
0.177 (1.00) |
|
ZIC4 | 13 (8%) | 159 |
0.243 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.0229 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.24 (1.00) |
1 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.26 (1.00) |
1 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.0163 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
OR52E4 | 6 (3%) | 166 |
0.794 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.85 (1.00) |
1 (1.00) |
0.808 (1.00) |
1 (1.00) |
0.58 (1.00) |
0.489 (1.00) |
1 (1.00) |
||
LRRIQ1 | 21 (12%) | 151 |
0.463 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.805 (1.00) |
0.897 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.72 (1.00) |
0.861 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.507 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.628 (1.00) |
|
ASTN2 | 14 (8%) | 158 |
0.751 (1.00) |
0.753 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000227 (0.534) |
0.441 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.246 (1.00) |
0.443 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.801 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.559 (1.00) |
|
FAM71B | 14 (8%) | 158 |
0.571 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.211 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.497 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.114 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
EPHB1 | 18 (10%) | 154 |
0.245 (1.00) |
0.27 (1.00) |
0.805 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.563 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.894 (1.00) |
0.225 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.876 (1.00) |
|
OR8H3 | 11 (6%) | 161 |
0.69 (1.00) |
0.861 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.00719 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.5 (1.00) |
1 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.889 (1.00) |
0.273 (1.00) |
|
RPL10L | 6 (3%) | 166 |
0.661 (1.00) |
0.87 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.00302 (1.00) |
0.479 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.0968 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
OR4S2 | 6 (3%) | 166 |
0.482 (1.00) |
0.348 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.175 (1.00) |
1 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.183 (1.00) |
||
PJA1 | 8 (5%) | 164 |
0.181 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.231 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.646 (1.00) |
0.81 (1.00) |
0.808 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
INHBA | 9 (5%) | 163 |
0.585 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.0441 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.0994 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.101 (1.00) |
0.419 (1.00) |
1 (1.00) |
|
RBM10 | 12 (7%) | 160 |
0.892 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.0676 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.00496 (1.00) |
0.12 (1.00) |
1 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.0716 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.604 (1.00) |
|
MARCH11 | 8 (5%) | 164 |
0.717 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0653 (1.00) |
0.00266 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
0.42 (1.00) |
1 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.325 (1.00) |
|
OR14I1 | 6 (3%) | 166 |
0.175 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.467 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.215 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PTH | 3 (2%) | 169 |
0.0103 (1.00) |
0.807 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.179 (1.00) |
1 (1.00) |
0.651 (1.00) |
1 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.841 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FLI1 | 6 (3%) | 166 |
0.306 (1.00) |
0.568 (1.00) |
0.688 (1.00) |
1 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.571 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.828 (1.00) |
1 (1.00) |
0.765 (1.00) |
0.367 (1.00) |
|
GPR174 | 6 (3%) | 166 |
0.326 (1.00) |
0.0533 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.00302 (1.00) |
1 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.306 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.137 (1.00) |
||
KRTAP19-6 | 4 (2%) | 168 |
0.148 (1.00) |
0.0534 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.0241 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.815 (1.00) |
1 (1.00) |
0.719 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0381 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
MAGEB18 | 5 (3%) | 167 |
0.494 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.063 (1.00) |
0.989 (1.00) |
1 (1.00) |
0.152 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.983 (1.00) |
0.201 (1.00) |
0.283 (1.00) |
||
NHEDC1 | 9 (5%) | 163 |
0.141 (1.00) |
0.0899 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.000678 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.577 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0323 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.859 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR2T27 | 8 (5%) | 164 |
0.352 (1.00) |
0.665 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.693 (1.00) |
1 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.092 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SYT4 | 11 (6%) | 161 |
0.346 (1.00) |
0.977 (1.00) |
1 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.278 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.446 (1.00) |
1 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.506 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.224 (1.00) |
ZSWIM2 | 13 (8%) | 159 |
0.102 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.514 (1.00) |
1 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.912 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.826 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
MYL10 | 5 (3%) | 167 |
0.657 (1.00) |
0.423 (1.00) |
1 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.0226 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.202 (1.00) |
0.201 (1.00) |
0.26 (1.00) |
||
KRTAP15-1 | 5 (3%) | 167 |
0.532 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.0484 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.393 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NTNG1 | 11 (6%) | 161 |
0.255 (1.00) |
0.432 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.664 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.541 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR2M7 | 9 (5%) | 163 |
0.462 (1.00) |
0.676 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.0994 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.162 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.724 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SATB2 | 15 (9%) | 157 |
0.444 (1.00) |
0.647 (1.00) |
1 (1.00) |
0.185 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.865 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.87 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.0673 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.368 (1.00) |
|
OR5F1 | 12 (7%) | 160 |
0.182 (1.00) |
0.283 (1.00) |
1 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.525 (1.00) |
1 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
CMKLR1 | 7 (4%) | 165 |
0.147 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.24 (1.00) |
1 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.0554 (1.00) |
||
OR10K2 | 9 (5%) | 163 |
0.515 (1.00) |
0.00113 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.0646 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.0901 (1.00) |
0.013 (1.00) |
0.581 (1.00) |
||
ADAMTS16 | 22 (13%) | 150 |
0.369 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.657 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.324 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0128 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.418 (1.00) |
ARHGAP36 | 13 (8%) | 159 |
0.935 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.323 (1.00) |
|
FABP12 | 3 (2%) | 169 |
0.594 (1.00) |
1 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.397 (1.00) |
1 (1.00) |
0.651 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||||||
C7 | 14 (8%) | 158 |
0.142 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.0539 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.932 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PI15 | 7 (4%) | 165 |
0.263 (1.00) |
0.68 (1.00) |
1 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.481 (1.00) |
0.881 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.774 (1.00) |
1 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.564 (1.00) |
1 (1.00) |
|
NRXN1 | 25 (15%) | 147 |
0.208 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.317 (1.00) |
0.485 (1.00) |
0.905 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.0703 (1.00) |
0.741 (1.00) |
0.828 (1.00) |
OR5D16 | 7 (4%) | 165 |
0.688 (1.00) |
0.886 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.506 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.968 (1.00) |
1 (1.00) |
|
LIPI | 7 (4%) | 165 |
0.0963 (1.00) |
0.867 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
1 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.317 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.0728 (1.00) |
0.617 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SEMA3A | 10 (6%) | 162 |
0.364 (1.00) |
0.305 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.174 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.48 (1.00) |
1 (1.00) |
|
C1ORF49 | 6 (3%) | 166 |
0.761 (1.00) |
0.757 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.952 (1.00) |
0.298 (1.00) |
SLC35F1 | 9 (5%) | 163 |
0.507 (1.00) |
0.364 (1.00) |
0.0122 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.101 (1.00) |
1 (1.00) |
0.793 (1.00) |
1 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.776 (1.00) |
1 (1.00) |
|
ANKRD7 | 6 (3%) | 166 |
0.996 (1.00) |
0.00346 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.192 (1.00) |
0.527 (1.00) |
1 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.462 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
OLAH | 7 (4%) | 165 |
0.567 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.0696 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0215 (1.00) |
1 (1.00) |
0.715 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TMEM195 | 11 (6%) | 161 |
0.443 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.319 (1.00) |
1 (1.00) |
0.564 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0924 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
KRTAP11-1 | 6 (3%) | 166 |
0.195 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.899 (1.00) |
1 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.579 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OR6N2 | 7 (4%) | 165 |
0.675 (1.00) |
0.899 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.3 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.774 (1.00) |
1 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.945 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PRIM2 | 10 (6%) | 162 |
0.347 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.0452 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.184 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.354 (1.00) |
1 (1.00) |
0.479 (1.00) |
0.0379 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
C14ORF177 | 5 (3%) | 167 |
0.391 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.401 (1.00) |
1 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FAM48B1 | 10 (6%) | 162 |
0.911 (1.00) |
0.81 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.985 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.383 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00258 (1.00) |
0.408 (1.00) |
0.0797 (1.00) |
1 (1.00) |
|
KCNS2 | 7 (4%) | 165 |
0.53 (1.00) |
0.000819 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.945 (1.00) |
0.00249 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.133 (1.00) |
||
C7ORF58 | 17 (10%) | 155 |
0.404 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.0764 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.314 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.00581 (1.00) |
0.195 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR14A16 | 12 (7%) | 160 |
0.43 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.774 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.766 (1.00) |
1 (1.00) |
0.629 (1.00) |
0.892 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.0634 (1.00) |
|
EPHA7 | 11 (6%) | 161 |
0.348 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.686 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
0.398 (1.00) |
1 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.687 (1.00) |
0.134 (1.00) |
|
SERPINB13 | 9 (5%) | 163 |
0.0422 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.0709 (1.00) |
0.474 (1.00) |
0.239 (1.00) |
1 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.891 (1.00) |
0.433 (1.00) |
0.296 (1.00) |
1 (1.00) |
|
CDH18 | 22 (13%) | 150 |
0.12 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.73 (1.00) |
0.867 (1.00) |
1 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.919 (1.00) |
0.175 (1.00) |
CTNNA2 | 20 (12%) | 152 |
0.35 (1.00) |
0.84 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0052 (1.00) |
1 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.743 (1.00) |
1 (1.00) |
0.873 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.273 (1.00) |
|
OR5T2 | 8 (5%) | 164 |
0.181 (1.00) |
0.304 (1.00) |
0.0712 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.0734 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.423 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.322 (1.00) |
1 (1.00) |
|
APCS | 4 (2%) | 168 |
0.203 (1.00) |
0.0168 (1.00) |
0.626 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.522 (1.00) |
1 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.0295 (1.00) |
1 (1.00) |
|
IFNA7 | 5 (3%) | 167 |
0.5 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.0571 (1.00) |
0.0727 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0307 (1.00) |
1 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.38 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
UGT2B10 | 11 (6%) | 161 |
0.859 (1.00) |
0.0284 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.314 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.218 (1.00) |
1 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.456 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.694 (1.00) |
|
PPP3CA | 3 (2%) | 169 |
0.239 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
1 (1.00) |
0.711 (1.00) |
0.397 (1.00) |
1 (1.00) |
0.651 (1.00) |
0.0231 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.553 (1.00) |
||||
TBX5 | 11 (6%) | 161 |
0.675 (1.00) |
0.0523 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.0587 (1.00) |
0.478 (1.00) |
1 (1.00) |
0.687 (1.00) |
1 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.448 (1.00) |
|
VN1R2 | 7 (4%) | 165 |
0.58 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.393 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.116 (1.00) |
|
ADAMTS18 | 17 (10%) | 155 |
0.315 (1.00) |
0.713 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.975 (1.00) |
1 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.869 (1.00) |
0.871 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PSG6 | 11 (6%) | 161 |
0.124 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.959 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.464 (1.00) |
1 (1.00) |
0.533 (1.00) |
1 (1.00) |
0.72 (1.00) |
0.56 (1.00) |
|
CCDC73 | 11 (6%) | 161 |
0.476 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.813 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.675 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.26 (1.00) |
|
OR10G8 | 8 (5%) | 164 |
0.29 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.0375 (1.00) |
0.109 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.0364 (1.00) |
|
OR51I1 | 6 (3%) | 166 |
0.132 (1.00) |
0.296 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.85 (1.00) |
1 (1.00) |
0.624 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.642 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.116 (1.00) |
|
GPR101 | 9 (5%) | 163 |
0.337 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.793 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.571 (1.00) |
0.0169 (1.00) |
0.67 (1.00) |
0.302 (1.00) |
|
IRX1 | 7 (4%) | 165 |
0.926 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.25 (1.00) |
1 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.177 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
STAC3 | 3 (2%) | 169 |
0.00472 (1.00) |
0.958 (1.00) |
1 (1.00) |
0.969 (1.00) |
0.00698 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.0471 (1.00) |
0.184 (1.00) |
1 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.126 (1.00) |
|||
BCHE | 9 (5%) | 163 |
0.99 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.734 (1.00) |
1 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.173 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.589 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
CNGA2 | 11 (6%) | 161 |
0.432 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.0678 (1.00) |
1 (1.00) |
0.587 (1.00) |
1 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.675 (1.00) |
0.966 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
FTSJD1 | 6 (3%) | 166 |
0.581 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.688 (1.00) |
1 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.234 (1.00) |
1 (1.00) |
|
MAGEC2 | 8 (5%) | 164 |
0.974 (1.00) |
0.371 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.897 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR10T2 | 7 (4%) | 165 |
0.885 (1.00) |
0.93 (1.00) |
1 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.0689 (1.00) |
0.069 (1.00) |
0.944 (1.00) |
0.433 (1.00) |
|
OR4L1 | 7 (4%) | 165 |
0.141 (1.00) |
0.527 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.32 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.789 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
RIT2 | 3 (2%) | 169 |
0.729 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.000384 (0.904) |
0.179 (1.00) |
0.0188 (1.00) |
0.46 (1.00) |
0.081 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00146 (1.00) |
0.649 (1.00) |
|||
OR2T8 | 8 (5%) | 164 |
0.772 (1.00) |
0.901 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.663 (1.00) |
0.29 (1.00) |
1 (1.00) |
0.32 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.0871 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.367 (1.00) |
||
NPFFR2 | 10 (6%) | 162 |
0.107 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.981 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.0838 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.153 (1.00) |
1 (1.00) |
0.741 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.83 (1.00) |
0.177 (1.00) |
|
CHM | 6 (3%) | 166 |
0.073 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.419 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0417 (1.00) |
0.065 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.5 (1.00) |
||
OR4D10 | 5 (3%) | 167 |
0.613 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.783 (1.00) |
1 (1.00) |
0.285 (1.00) |
1 (1.00) |
0.508 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
OR5D13 | 4 (2%) | 168 |
0.518 (1.00) |
0.000299 (0.704) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.283 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.326 (1.00) |
1 (1.00) |
||||
FOXI1 | 8 (5%) | 164 |
0.86 (1.00) |
0.0985 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0126 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.29 (1.00) |
1 (1.00) |
0.152 (1.00) |
0.0671 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FAM47B | 14 (8%) | 158 |
0.788 (1.00) |
0.0773 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.0214 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.487 (1.00) |
1 (1.00) |
0.182 (1.00) |
0.0321 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.453 (1.00) |
|
OR5K3 | 7 (4%) | 165 |
0.354 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.339 (1.00) |
1 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.404 (1.00) |
|
HOXB3 | 10 (6%) | 162 |
0.178 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.000301 (0.709) |
0.00888 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.754 (1.00) |
1 (1.00) |
0.947 (1.00) |
1 (1.00) |
0.511 (1.00) |
0.433 (1.00) |
0.451 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PTN | 4 (2%) | 168 |
0.718 (1.00) |
0.985 (1.00) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.522 (1.00) |
1 (1.00) |
0.754 (1.00) |
||||
SAMD7 | 6 (3%) | 166 |
0.923 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.645 (1.00) |
1 (1.00) |
|
BIRC8 | 6 (3%) | 166 |
0.88 (1.00) |
0.312 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00205 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.85 (1.00) |
1 (1.00) |
0.899 (1.00) |
1 (1.00) |
0.641 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.274 (1.00) |
0.197 (1.00) |
|
OR51A7 | 7 (4%) | 165 |
0.151 (1.00) |
0.185 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.481 (1.00) |
1 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.917 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.201 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TYR | 10 (6%) | 162 |
0.616 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.636 (1.00) |
0.713 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.869 (1.00) |
1 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.024 (1.00) |
|
TGFB2 | 6 (3%) | 166 |
0.562 (1.00) |
0.749 (1.00) |
1 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.109 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.664 (1.00) |
1 (1.00) |
|
GPR158 | 18 (10%) | 154 |
0.651 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.976 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.885 (1.00) |
1 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.0307 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
|
MTTP | 6 (3%) | 166 |
0.945 (1.00) |
0.144 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.419 (1.00) |
1 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.341 (1.00) |
0.0978 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.554 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
COL25A1 | 11 (6%) | 161 |
0.205 (1.00) |
0.99 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0427 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.952 (1.00) |
0.323 (1.00) |
|
RB1 | 7 (4%) | 165 |
0.1 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.481 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.0102 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.961 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
CYLC1 | 6 (3%) | 166 |
0.0186 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.313 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.579 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
CYP4V2 | 6 (3%) | 166 |
0.468 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.243 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.195 (1.00) |
1 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
FGF14 | 7 (4%) | 165 |
0.0078 (1.00) |
0.911 (1.00) |
0.049 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.0415 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.116 (1.00) |
0.65 (1.00) |
|
GC | 5 (3%) | 167 |
0.661 (1.00) |
0.743 (1.00) |
0.0191 (1.00) |
0.0651 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.99 (1.00) |
1 (1.00) |
|
LCE1F | 4 (2%) | 168 |
0.639 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.143 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.412 (1.00) |
0.258 (1.00) |
0.0161 (1.00) |
||
RBM19 | 14 (8%) | 158 |
0.814 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.868 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.526 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.241 (1.00) |
0.56 (1.00) |
|
C2ORF51 | 5 (3%) | 167 |
0.784 (1.00) |
0.499 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
CNKSR2 | 8 (5%) | 164 |
0.566 (1.00) |
0.058 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0117 (1.00) |
0.35 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0181 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.0115 (1.00) |
|
DIO2 | 6 (3%) | 166 |
0.358 (1.00) |
0.931 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.856 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.131 (1.00) |
1 (1.00) |
0.633 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
FRG1 | 6 (3%) | 166 |
0.0821 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.733 (1.00) |
1 (1.00) |
0.899 (1.00) |
1 (1.00) |
0.655 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.801 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PIP | 5 (3%) | 167 |
0.62 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.0276 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.699 (1.00) |
1 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.5 (1.00) |
||
SLITRK2 | 19 (11%) | 153 |
0.487 (1.00) |
0.743 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.00116 (1.00) |
0.0117 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.788 (1.00) |
0.864 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0641 (1.00) |
0.0744 (1.00) |
0.0113 (1.00) |
0.385 (1.00) |
|
GABRA5 | 11 (6%) | 161 |
0.786 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.937 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.383 (1.00) |
1 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.804 (1.00) |
0.927 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR4A16 | 8 (5%) | 164 |
0.925 (1.00) |
0.412 (1.00) |
0.472 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.708 (1.00) |
1 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.036 (1.00) |
0.404 (1.00) |
0.433 (1.00) |
|
MBD1 | 6 (3%) | 166 |
0.474 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.185 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.96 (1.00) |
1 (1.00) |
|
NELL1 | 14 (8%) | 158 |
0.0396 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.358 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.1 (1.00) |
0.373 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.958 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.284 (1.00) |
1 (1.00) |
|
STXBP5L | 12 (7%) | 160 |
0.184 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.286 (1.00) |
0.347 (1.00) |
|
SLC10A2 | 7 (4%) | 165 |
0.274 (1.00) |
0.918 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.00511 (1.00) |
0.773 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.844 (1.00) |
1 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.013 (1.00) |
0.192 (1.00) |
0.367 (1.00) |
|
DYTN | 10 (6%) | 162 |
0.264 (1.00) |
0.00187 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0616 (1.00) |
0.532 (1.00) |
0.0961 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.0193 (1.00) |
0.151 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SLITRK4 | 15 (9%) | 157 |
0.324 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.357 (1.00) |
0.642 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.00625 (1.00) |
0.0345 (1.00) |
0.0664 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.708 (1.00) |
P value = 8.55e-05 (Chi-square test), Q value = 0.2
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
CNBD1 MUTATED | 0 | 4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CNBD1 WILD-TYPE | 2 | 35 | 110 | 1 | 2 | 0 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 2.48e-05 (Chi-square test), Q value = 0.059
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
LRRIQ3 MUTATED | 2 | 5 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
LRRIQ3 WILD-TYPE | 0 | 34 | 111 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 1.18e-08 (Chi-square test), Q value = 2.8e-05
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
U2AF1 MUTATED | 0 | 2 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
U2AF1 WILD-TYPE | 2 | 37 | 112 | 1 | 2 | 0 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 1.34e-06 (Chi-square test), Q value = 0.0032
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
GBA3 MUTATED | 0 | 0 | 5 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
GBA3 WILD-TYPE | 2 | 39 | 109 | 1 | 0 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | 2 |
P value = 2.56e-05 (t-test), Q value = 0.06
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 114 | 40.0 (25.7) |
OR2W5 MUTATED | 4 | 55.0 (3.5) |
OR2W5 WILD-TYPE | 110 | 39.4 (26.0) |
P value = 9.3e-06 (Chi-square test), Q value = 0.022
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
AKR1B10 MUTATED | 0 | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
AKR1B10 WILD-TYPE | 2 | 39 | 112 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 4.58e-05 (Chi-square test), Q value = 0.11
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
DACH1 MUTATED | 0 | 3 | 5 | 0 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
DACH1 WILD-TYPE | 2 | 36 | 109 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 9.21e-05 (Chi-square test), Q value = 0.22
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
PYHIN1 MUTATED | 0 | 2 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
PYHIN1 WILD-TYPE | 2 | 37 | 111 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 5 | 0 | 2 |
P value = 1.08e-05 (Chi-square test), Q value = 0.025
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
OR13G1 MUTATED | 0 | 3 | 3 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
OR13G1 WILD-TYPE | 2 | 36 | 111 | 1 | 0 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | 2 |
-
Mutation data file = LUAD-TP.mutsig.cluster.txt
-
Clinical data file = LUAD-TP.clin.merged.picked.txt
-
Number of patients = 172
-
Number of significantly mutated genes = 184
-
Number of selected clinical features = 14
-
Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3
For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R
For continuous numerical clinical features, two-tailed Student's t test with unequal variance (Lehmann and Romano 2005) was applied to compare the clinical values between tumors with and without gene mutations using 't.test' function in R
For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R
For multi-class clinical features (nominal or ordinal), Chi-square tests (Greenwood and Nikulin 1996) were used to estimate the P values using the 'chisq.test' function in R
For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.
This is an experimental feature. The full results of the analysis summarized in this report can be downloaded from the TCGA Data Coordination Center.