Hybridization REF p difference q subclass Composite Element REF p difference q subclass PARP1|PARP_CLEAVED-M-C 0.0112839934261144 3.84108942474528 0.192956287586556 1 SNAI2|SNAIL-M-C 0.00600736054129712 3.61400154101258 0.146751236080258 1 MET|C-MET-M-C 0.00895721154381844 3.25531458351887 0.17018701933255 1 CASP8|CASPASE-8-M-C 0.00706529839861687 2.99947851710377 0.151020753270436 1 RAB25|RAB25-R-C 0.000542431805051604 2.69416067540881 0.0927558386638243 1 SETD2|SETD2-R-NA 0.00241118728796612 1.78299538402516 0.092947828594831 1 CASP9|CASPASE-9_CLEAVEDD330-R-C 0.00234005055622729 -0.159518674993711 0.092947828594831 1 BCL2|BCL-2-R-NA 0.00369531164774288 -0.244010317493711 0.105316381960672 1 CHEK1|CHK1-R-C 0.00254415721388289 -0.259974440138365 0.092947828594831 1 PTCH1|PTCH-R-C 0.00271777276593073 -0.589871434616352 0.092947828594831 1 FN1|FIBRONECTIN-R-C 4.41399401032862e-07 1.24678360390898 3.77396487883097e-05 2 HSPA1A|HSP70-R-C 9.80634921991871e-06 1.17784116643499 0.0002395551023723 2 PTCH1|PTCH-R-C 0.000544175219810903 1.06976032658156 0.00357899856106402 2 COL6A1|COLLAGEN_VI-R-V 4.70151284552498e-05 1.0694202507565 0.000803958696584772 2 CAV1|CAVEOLIN-1-R-V 0.00451965099661719 0.927458003875886 0.0175650072823077 2 ANXA1|ANNEXIN_I-R-V 8.37631819679428e-08 0.698612821083924 1.43235041165182e-05 2 PTK2|FAK-R-C 0.000168063786589154 0.691330337997636 0.00169052397098502 2 PXN|PAXILLIN-R-V 0.000370845178716095 0.601579647308511 0.00275715328523705 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.0150745269210231 0.512256729787234 0.0429624017249158 2 KDR|VEGFR2-R-C 0.00252223739551114 0.489645797526005 0.0107825648658101 2 AKT1AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.000791999543709473 0.488152419445626 0.00427491122940874 2 NOTCH3|NOTCH3-R-C 3.85264179374781e-05 0.465201625533097 0.000732001940812084 2 PEA15|PEA-15-R-V 8.4777970212372e-05 0.438542472425532 0.00109331258832233 2 CDKN1A|P21-R-C 1.91887127143811e-06 0.40049235937234 0.000109375662471972 2 MAPK8|JNK_PT183_Y185-R-V 0.018803052984077 0.322045253899527 0.0494664932350333 2 AR|AR-R-V 1.37530349538548e-05 0.321671109426714 0.000293971122138646 2 FOXO3|FOXO3A_PS318_S321-R-C 0.00206185146994911 0.313505265985816 0.00979379448225827 2 DVL3|DVL3-R-V 5.68191918308755e-05 0.289542412771868 0.000883280163916337 2 YAP1|YAP-R-V 0.0246562623986853 0.268784300463357 0.0602317267167884 2 WWTR1|TAZ-R-C 0.00132151197961285 0.261008540838061 0.00664642789746463 2 TGM2|TRANSGLUTAMINASE-M-V 0.00869304983675248 0.237175666406619 0.0280473872091448 2 BAK1|BAK-R-C 8.95109721433486e-05 0.216064996210402 0.00109331258832233 2 ESR1|ER-ALPHA-R-V 0.0107794438658589 0.202210917432624 0.0329158018046763 2 MAPK1|ERK2-R-NA 0.0338630688524704 0.187930259685579 0.0782511455915195 2 MAP2K1|MEK1-R-V 0.0184100142960308 0.183540845496454 0.0491892569472073 2 MRE11A|MRE11-R-C 0.00247683583081049 0.174502003615839 0.0107825648658101 2 SMAD4|SMAD4-M-V 0.00481686911653022 0.159005088440898 0.017906187367971 2 PECAM1|CD31-M-V 0.0162225440992981 0.153157079147754 0.0454763121472127 2 PIK3CA|PI3K-P110-ALPHA-R-C 0.0107435463771126 0.150919237788416 0.0329158018046763 2 IRS1|IRS1-R-V 0.0192516871099433 0.145463467933806 0.0498793711484895 2 PRKCA|PKC-DELTA_PS664-R-V 0.00546403319526067 0.136079370611111 0.0197548875003498 2 STK11|LKB1-M-NA 0.00978991864102158 0.112969194904255 0.0310014090299017 2 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.0445036280163893 0.108180947392435 0.0976252744592929 2 ERRFI1|MIG-6-M-V 0.0180524716017108 0.0941820707009456 0.0489995657760722 2 WWTR1|TAZ_PS89-R-C 0.032215341524045 0.0650437047434989 0.0754633342549547 2 CCNE2|CYCLIN_E2-R-C 0.0278274649505742 -0.0838440423628841 0.0660902292576137 2 ARID1A|ARID1A-M-V 0.0445308269463441 -0.0975018399503547 0.0976252744592929 2 VASP|VASP-R-C 0.0355324527498271 -0.102240556562648 0.079948018687111 2 XIAP|XIAP-R-C 0.0128866643751996 -0.124401734621749 0.0373494848840531 2 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 0.0226394750008399 -0.12892243248227 0.0561065250020815 2 BIRC2|CIAP-R-V 0.00626305021491279 -0.13945965858156 0.0214196317350017 2 CASP3|CASPASE-3_ACTIVE-R-C 0.0345516650691218 -0.143104365160756 0.0787777963575977 2 SMAD1|SMAD1-R-V 0.0124128038638064 -0.175193030913712 0.0365963700122568 2 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 0.0167873104660005 -0.179714426060284 0.0463004853175175 2 SRC|SRC-M-V 0.0198776787655718 -0.180840158677305 0.0507325831181012 2 BAX|BAX-R-V 0.00554523157904556 -0.194090301510638 0.0197548875003498 2 BCL2L1|BCL-XL-R-V 0.021345493437361 -0.213003026526005 0.0536776379086578 2 CHEK2|CHK2_PT68-R-C 0.00464346159114623 -0.218330743911348 0.0176451540463557 2 ERBB2|HER2_PY1248-R-V 0.00658769674153511 -0.218843700817967 0.0220881596627942 2 NCOA3|AIB1-M-V 0.00275133582884073 -0.222007306039007 0.0112018673031373 2 XRCC5|KU80-R-C 0.0277673360316889 -0.244095940678487 0.0660902292576137 2 MSH2|MSH2-M-C 0.00093959775105816 -0.265894550030733 0.00486882471002865 2 BCL2L11|BIM-R-V 0.0024477578022447 -0.268666339384161 0.0107825648658101 2 EIF4E|EIF4E-R-V 0.000244386639971412 -0.269586456920804 0.00219947975974271 2 YBX1|YB-1_PS102-R-V 0.00074248382293751 -0.286093142026005 0.00427491122940874 2 RB1|RB-M-V 0.000218757577130188 -0.289824517483452 0.00207819698273679 2 CCNE1|CYCLIN_E1-M-V 0.00605027124879129 -0.304417097391253 0.0211142119090472 2 ERBB3|HER3-R-V 0.00778833485340442 -0.318964172985816 0.0256116396140799 2 EGFR|EGFR_PY1068-R-V 0.0121787528591698 -0.336069118347518 0.0365362585775094 2 EIF4EBP1|4E-BP1-R-V 0.000756605889677853 -0.336381840164303 0.00427491122940874 2 ACACAACACB|ACC_PS79-R-V 0.000655759834443822 -0.359766691491726 0.00400481898892477 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PT37-R-V 0.00270996167602791 -0.361372926199764 0.0112018673031373 2 EEF2|EEF2-R-V 0.00305279768455196 -0.362713473377069 0.0121401954432183 2 PCNA|PCNA-M-V 0.000270467124023423 -0.372146050179669 0.00231249391040027 2 EGFR|EGFR_PY992-R-V 0.000157275351792718 -0.382954950656028 0.00168088032228467 2 CTNNA1|ALPHA-CATENIN-M-V 0.000649489273031924 -0.404917590531915 0.00400481898892477 2 CD49|CD49B-M-V 0.00144727233423501 -0.453794595085106 0.00707095911869105 2 DIABLO|SMAC-M-V 0.000426594879499067 -0.488697545388889 0.00291790897577362 2 MSH6|MSH6-R-C 0.000285522232051613 -0.50486275306383 0.00232496674670599 2 ACACA|ACC1-R-C 0.00079998338795953 -0.53551964093026 0.00427491122940874 2 RPS6|S6-R-NA 6.3314418956288e-05 -0.625137192255319 0.000902230470127104 2 CASP7|CASPASE-7_CLEAVEDD198-R-C 0.00226597895716012 -0.642449461002364 0.0104724973425508 2 CHEK2|CHK2-M-C 5.37180245409911e-06 -0.69926611170922 0.00018371564393019 2 RB1|RB_PS807_S811-R-V 3.37286317486237e-06 -0.87417786226714 0.000144189900725366 2 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.000307420996787811 -0.973270094637116 0.00238949956594162 2 CTNNB1|BETA-CATENIN-R-V 0.000420841866435039 -0.975799172399527 0.00291790897577362 2 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.00010625389607282 -1.09279706966076 0.00121129441523015 2 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 9.60354778716906e-06 -1.53507036714657 0.0002395551023723 2 CASP7|CASPASE-7_CLEAVEDD198-R-C 9.06618300591466e-05 0.824120306333333 0.00040797823526616 3 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 0.00107906848296598 0.605048950690476 0.00361805314876829 3 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 8.50122007868036e-06 0.580654845678571 5.59118705174747e-05 3 PTGS2|COX-2-R-C 0.00528056430099634 0.566064512345238 0.0138919460841596 3 SRC|SRC_PY527-R-V 0.00149560570585813 0.432424154404762 0.00456693885181679 3 CHEK1|CHK1-R-C 1.21719172081349e-05 0.39966992352381 7.1772339399692e-05 3 MAPK1MAPK3|MAPK_PT202_Y204-R-V 0.0161470002770137 0.394245212559524 0.0349511018654347 3 BAX|BAX-R-V 1.98926988772081e-06 0.357107672166667 1.6198340514298e-05 3 MAP2K1|MEK1_PS217_S221-R-V 0.000477184802038194 0.344624843988095 0.00181330224774514 3 BCL2L11|BIM-R-V 4.23523003579157e-05 0.337844827107143 0.000211925455004021 3 PECAM1|CD31-M-V 2.7368003329756e-07 0.326767350511905 2.59996031632682e-06 3 CD49|CD49B-M-V 0.00095978066972852 0.322063801785714 0.00334943866374647 3 MAPT|TAU-M-C 0.00803662684879788 0.318889430833333 0.0202097528109476 3 YAP1|YAP-R-V 0.00022057645271905 0.317482107666667 0.000898061271784703 3 VASP|VASP-R-C 4.54401865534902e-07 0.317264519 4.08961678981412e-06 3 ANXA1|ANNEXIN_I-R-V 0.0156680368489236 0.299351155630952 0.0343491577072556 3 CDKN1B|P27-R-V 0.000185823038710116 0.296920737666667 0.000775018039498289 3 AKT1AKT2 AKT3|AKT_PT308-R-V 0.00472291233921038 0.279569655178571 0.0126190314063277 3 CDH3|P-CADHERIN-R-C 0.00112017944616675 0.266623464892857 0.0036836670248945 3 CCNE1|CYCLIN_E1-M-V 0.0196253433264079 0.262714009988095 0.0404329362507922 3 EGFR|EGFR_PY992-R-V 0.011447205273258 0.237986178011905 0.026317523618962 3 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 1.66989666385609e-07 0.233220049714286 1.7847020594962e-06 3 SRC|SRC_PY416-R-C 0.00397906880813775 0.232746440333333 0.0109745284869606 3 EIF4EBP1|4E-BP1-R-V 0.00301207812766462 0.218455487011905 0.00888043723845948 3 EIF4E|EIF4E-R-V 0.000842648304338938 0.216546100297619 0.00306580553280763 3 BCL2L1|BCL-XL-R-V 0.00325236565903309 0.216517087940476 0.0094263479270281 3 KRAS|K-RAS-M-C 0.00980188608744939 0.206296889892857 0.0236073594500542 3 PARK7|DJ-1-R-C 0.00236506589540172 0.199285736845238 0.00709519768620516 3 BCL2L1|BCL-X-R-C 0.0354968856012619 0.190754240035714 0.0667029388770965 3 PCNA|PCNA-M-V 0.0156354039569747 0.190413945714286 0.0343491577072556 3 BCL2|BCL-2-R-NA 0.000409082181229642 0.188148767130953 0.0015898421134152 3 STMN1|STATHMIN-R-V 2.57632516746498e-07 0.186125414095238 2.59148002139124e-06 3 RAF1|C-RAF_PS338-R-C 0.00115765223301942 0.184120300511905 0.00373506663860983 3 RPS6KB1|P70S6K_PT389-R-V 0.00893983969128548 0.17537814877381 0.0218387512458545 3 MAPK8|JNK_PT183_Y185-R-V 0.0292206313618064 0.175370111226191 0.0555191995874322 3 SHC1|SHC_PY317-R-NA 0.00102841468519024 0.174604566261905 0.00351717822335062 3 RAB11ARAB11B|RAB11-R-V 0.000886003229768079 0.17417748825 0.00315638650604878 3 MET|C-MET_PY1235-R-C 5.6156639312729e-07 0.168534505821428 4.80139266123833e-06 3 SMAD4|SMAD4-M-V 1.7647323535861e-05 0.143559007821429 9.43028851447572e-05 3 CASP3|CASPASE-3_ACTIVE-R-C 0.00611959486004732 0.1375289115 0.0158553139555771 3 CHEK2|CHK2_PT68-R-C 0.0402076952396205 0.125840576940476 0.0739302783438183 3 RAD51|RAD51-M-C 0.0191567836525566 0.11034037777381 0.0399489024949656 3 XRCC1|XRCC1-R-C 0.00387477911749018 0.104776268928571 0.0108620857228003 3 FOXO3|FOXO3A-R-C 0.0360883875089498 0.0987585173690482 0.0670773289568523 3 CD20|CD20-R-C 0.0167849583246903 0.0903218905119045 0.0358778484190255 3 CDC2|CDK1-R-V 0.0491680039859793 0.0893841995 0.0884593836536037 3 BID|BID-R-C 0.00125114574977116 0.0867236881547622 0.00388992587656124 3 MRE11A|MRE11-R-C 0.0187016067345779 0.069100223797619 0.0394811697729978 3 PRKCA|PKC-DELTA_PS664-R-V 0.0214007544876557 -0.0873202644166666 0.0430532825575191 3 AKT1S1|PRAS40_PT246-R-V 0.0259620619654207 -0.105534675 0.0504490067737152 3 RB1|RB-M-V 0.0496614083669354 -0.121367345178572 0.0884593836536037 3 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.021871205045728 -0.129979407428571 0.043488093753715 3 PTEN|PTEN-R-V 0.0259044534722883 -0.155196791690476 0.0504490067737152 3 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 0.00342622328426317 -0.169037562845238 0.00976473636015003 3 NF2|NF2-R-C 0.0416983267253078 -0.170880468857143 0.0758554667024216 3 CDKN1A|P21-R-C 0.000152087823471174 -0.19568633875 0.000650175445339269 3 NOTCH3|NOTCH3-R-C 0.0205969183979695 -0.219440069178571 0.0419294410244379 3 NCOA3|AIB1-M-V 0.000151372213295357 -0.229285096011905 0.000650175445339269 3 ARID1A|ARID1A-M-V 4.91558104825016e-05 -0.232196519547619 0.000233490099791883 3 ACACAACACB|ACC_PS79-R-V 0.0115427735170886 -0.241222854833333 0.026317523618962 3 RAF1|C-RAF-R-V 1.28136038959665e-05 -0.248513584369048 7.3037542207009e-05 3 RAD50|RAD50-M-C 0.00460932799750463 -0.280951347559524 0.012511033136084 3 MAPK1|ERK2-R-NA 0.0135863306085891 -0.292668724928571 0.0305692438693255 3 IRS1|IRS1-R-V 1.53052924591434e-12 -0.300969197666667 6.5430125262838e-11 3 NOTCH1|NOTCH1-R-V 8.77365765860357e-08 -0.312822707738095 1.07163961401515e-06 3 PRKCA|PKC-ALPHA-M-V 0.00824319137894634 -0.320740997666667 0.0204287786347801 3 IGF1R|IGF-1R-BETA-R-C 2.3418385751083e-05 -0.322827321285714 0.000121349817073794 3 EGFR|EGFR_PY1068-R-V 0.00631729936633577 -0.323304596357143 0.0161232565916928 3 SYK|SYK-M-V 0.0115276933349756 -0.369832421678571 0.026317523618962 3 DVL3|DVL3-R-V 9.96915109907431e-06 -0.391655248559524 6.20210785889809e-05 3 KDR|VEGFR2-R-C 0.000280692936307383 -0.398687740583334 0.00111624400252471 3 MYC|C-MYC-R-C 5.11869159971588e-09 -0.411488384404762 9.72551403946017e-08 3 RPS6KB1|P70S6K-R-V 5.73693028257197e-08 -0.428659529511905 8.17512565266506e-07 3 IGFBP2|IGFBP2-R-V 0.0269844219090535 -0.473637908119048 0.0518464735555972 3 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 0.00122360751186439 -0.497184705440477 0.0038747571209039 3 PTCH1|PTCH-R-C 0.000587542816826499 -0.513324167666667 0.00218412655820286 3 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.0107061629774499 -0.537048548011905 0.0254271370714435 3 FRAP1|MTOR-R-V 2.38346526601401e-06 -0.548176925083333 1.85260254767453e-05 3 INPP4B|INPP4B-G-C 4.3376555117782e-05 -0.549216890357143 0.000211925455004021 3 YBX1|YB-1-R-V 5.95864270700959e-06 -0.561886459559524 4.24553292874433e-05 3 MSH6|MSH6-R-C 7.03293606842877e-08 -0.646982818380952 9.25101590539477e-07 3 BRAF|B-RAF-M-NA 3.81810387431417e-08 -0.66234089427381 6.52895762507723e-07 3 PTK2|FAK-R-C 5.48879524001994e-05 -0.66303857997619 0.0002536713475793 3 ERBB3|HER3-R-V 1.07860074875652e-07 -0.671893474833333 1.22960485358243e-06 3 ATM|ATM-R-C 1.01554982484881e-05 -0.699601218880952 6.20210785889809e-05 3 EEF2K|EEF2K-R-V 3.0600799061883e-06 -0.743259209190476 2.27510288677478e-05 3 XRCC5|KU80-R-C 2.73713608785647e-10 -0.7582377525 6.68643244319223e-09 3 CTNNB1|BETA-CATENIN-R-V 1.37744333782943e-05 -0.802929468595238 7.59815518609137e-05 3 GAB2|GAB2-R-V 8.98036256040612e-11 -0.821986883797619 2.55940332971574e-09 3 ERBB2|HER2-M-V 6.92893042944057e-06 -0.858975994357143 4.73938841373735e-05 3 NFKB1|NF-KB-P65_PS536-R-C 6.06225632694495e-12 -0.924378013059524 2.07329166381517e-10 3 TSC2|TUBERIN-R-C 1.97529177972626e-09 -0.944292695214286 4.22218617916488e-08 3 PXN|PAXILLIN-R-V 1.76666820205406e-13 -1.02366378315476 3.02100262551244e-11 3 TP53BP1|53BP1-R-C 3.63745180102761e-13 -1.0236907504881 3.11002128987861e-11 3 AKT1AKT2 AKT3|AKT-R-V 4.78686246261231e-08 -1.16075589410714 7.44139528278823e-07 3 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 5.85275729757563e-13 -1.42576523288095 3.33607165961811e-11 3 ERBB2|HER2-M-V 4.29154588301501e-18 1.2192221409356 7.33854345995567e-16 4 YBX1|YB-1-R-V 1.73760584788412e-15 1.04957230922451 9.90435333293948e-14 4 EEF2|EEF2-R-V 8.51875399301134e-17 0.905702499977639 7.2835346640247e-15 4 CTNNB1|BETA-CATENIN-R-V 4.177488479278e-08 0.851488789071556 4.46469081222836e-07 4 CAV1|CAVEOLIN-1-R-V 0.000115456080764616 0.625845915687835 0.000459139297924403 4 PTCH1|PTCH-R-C 5.67826748627988e-05 0.586032703255814 0.000242745935038465 4 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 7.32500439310728e-05 0.562708734137746 0.000305506280785694 4 NFKB1|NF-KB-P65_PS536-R-C 0.000298145053184112 0.532890595365832 0.00107466901466737 4 MAPK1|ERK2-R-NA 1.31439889896511e-09 0.477407433085868 2.41784769844802e-08 4 AKT1AKT2 AKT3|AKT-R-V 1.58401820141822e-05 0.474200625186941 8.20809431643987e-05 4 IGF1R|IGF-1R-BETA-R-C 3.79149972381248e-08 0.438855430429338 4.32230968514623e-07 4 RAD50|RAD50-M-C 5.62308180200955e-07 0.424255863364043 4.0064457839318e-06 4 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 4.92600891568699e-06 0.421793370281753 2.80782508194158e-05 4 MSH6|MSH6-R-C 0.000404316815527111 0.398448184296959 0.0014109831725538 4 NF2|NF2-R-C 3.52062081909863e-08 0.396889083881932 4.30018685761333e-07 4 KDR|VEGFR2-R-C 0.00026236245798743 0.386796651963327 0.000975303919909794 4 TSC2|TUBERIN-R-C 0.000461357240232233 0.376293099057245 0.00157784176159424 4 PXN|PAXILLIN-R-V 0.000996560785448254 0.360271732768336 0.00334140969238532 4 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 3.54202005279133e-06 0.343110408448122 2.08857044492178e-05 4 MAP2K1|MEK1-R-V 5.24949352925173e-05 0.331646442370304 0.00023017010089796 4 TP53BP1|53BP1-R-C 0.00261359515045394 0.331012875426655 0.0077765530711917 4 RPS6KB1|P70S6K-R-V 1.12767128429567e-06 0.324741400855993 7.71327158458238e-06 4 LCK|LCK-R-V 3.0223753362697e-05 0.322102230353309 0.000136006890132136 4 XRCC5|KU80-R-C 0.00118502578929701 0.314234198921288 0.00389691173018824 4 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.0408354484586967 0.300779853358676 0.0838431647104001 4 PTEN|PTEN-R-V 7.59726671974763e-06 0.29520482111449 4.05978940336514e-05 4 BCL2L1|BCL-XL-R-V 2.59389424972982e-05 0.285487406943649 0.000123209976862166 4 CASP9|CASPASE-9_CLEAVEDD330-R-C 3.37163120550204e-07 0.271922709753131 2.74547112448023e-06 4 PCNA|PCNA-M-V 0.00025766491007686 0.257174380847943 0.000975303919909794 4 FRAP1|MTOR-R-V 0.000301661477801367 0.244567539002683 0.00107466901466737 4 BCL2L1|BCL-X-R-C 0.00543586987488822 0.239851134067084 0.0145329008767242 4 GSK3AGSK3B|GSK3_PS9-R-V 0.0265962960725715 0.216350068423971 0.0583072644667914 4 GSK3AGSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9-R-V 0.0326947290065996 0.215694832493739 0.0698849832516066 4 AKT1S1|PRAS40_PT246-R-V 5.499221645886e-06 0.211396549570662 3.03344161756937e-05 4 MAPK9|JNK2-R-C 2.69561278343866e-05 0.211202089655635 0.000124581023234598 4 PRKCA|PKC-ALPHA-M-V 0.0356286748366396 0.170434449309481 0.0742988219154314 4 MYC|C-MYC-R-C 0.0224986538541306 0.166278996713775 0.0519901325548153 4 PARK7|DJ-1-R-C 0.0245936869248668 0.145203263118963 0.0553357955809503 4 SMAD3|SMAD3-R-V 0.00293989557956227 0.118191290740608 0.00837870240175247 4 PDK1|PDK1_PS241-R-V 0.0276902268102333 0.115987457069767 0.0599370732221506 4 RAB11ARAB11B|RAB11-R-V 0.0333079747582354 0.112061524272809 0.0703168356007192 4 CDH2|N-CADHERIN-R-V 0.0263685293015145 0.095241359857782 0.0583072644667914 4 CDKN1B|P27_PT157-R-C 0.0105983330030896 0.0735683526153846 0.0262654339641786 4 WWTR1|TAZ_PS89-R-C 0.0231629340258181 -0.0760717760921288 0.0528114895788653 4 BID|BID-R-C 0.00314937347922565 -0.0935868389042933 0.0088285715565178 4 ESR1|ER-ALPHA_PS118-R-V 0.00243722965816724 -0.109045077775492 0.00744225484904639 4 EGFR|EGFR-R-C 0.0126824635448927 -0.119583273847943 0.0305450882560092 4 SRC|SRC-M-V 0.0411861159980913 -0.127657098508945 0.0838431647104001 4 ERBB3|HER3_PY1298-R-C 2.25169993612714e-05 -0.135660898454383 0.000110011625450783 4 CASP3|CASPASE-3_ACTIVE-R-C 0.00560128268887392 -0.137773656305903 0.0147356821507299 4 MRE11A|MRE11-R-C 5.55775358521653e-07 -0.143536911879249 4.0064457839318e-06 4 RPS6KB1|P70S6K_PT389-R-V 0.00215453029890853 -0.156260316353309 0.00669863056569743 4 BAK1|BAK-R-C 0.000111789913535554 -0.163523777844365 0.000455144647966184 4 CDKN1B|P27-R-V 0.00543921436321842 -0.16997479552415 0.0145329008767242 4 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 0.0125727982291107 -0.170078069237925 0.0305450882560092 4 YAP1|YAP_PS127-R-C 0.041683955062049 -0.182154342236136 0.0838583095954162 4 MET|C-MET_PY1235-R-C 3.13516332975327e-11 -0.183330934750447 1.07222585877562e-09 4 CDH3|P-CADHERIN-R-C 0.000205389914338138 -0.184627214977639 0.000798219894359582 4 BECN1|BECLIN-G-V 2.10716586225697e-05 -0.18877986407424 0.000105978047778218 4 SHC1|SHC_PY317-R-NA 1.34567773971966e-06 -0.190898332753131 8.85041898046392e-06 4 PIK3CA|PI3K-P110-ALPHA-R-C 2.80911750030831e-06 -0.19782030818873 1.71556818768829e-05 4 SMAD4|SMAD4-M-V 8.43521733944929e-10 -0.199690159169052 1.80302770630729e-08 4 FOXO3|FOXO3A-R-C 1.4810741871921e-06 -0.212514629843471 9.3801365188833e-06 4 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 3.89684977763282e-07 -0.219058344486583 3.02891505443278e-06 4 EGFR|EGFR_PY992-R-V 0.00837724420088364 -0.225134993848837 0.0217046781568349 4 RB1|RB-M-V 0.00268313819415386 -0.24017206892576 0.0077765530711917 4 AR|AR-R-V 3.19660093869553e-10 -0.255413120326476 7.80883943595622e-09 4 STMN1|STATHMIN-R-V 1.94745350784005e-10 -0.259533781717352 5.55024249734414e-09 4 RAF1|C-RAF_PS338-R-C 3.33218992614091e-08 -0.26131405358229 4.30018685761333e-07 4 MAPT|TAU-M-C 0.00151675672496898 -0.26512078444186 0.004860297092888 4 PGR|PR-R-V 7.17552469383026e-09 -0.277538392478533 1.05569790297968e-07 4 MSH2|MSH2-M-C 2.93631969267638e-07 -0.278595233751342 2.64268772340874e-06 4 PECAM1|CD31-M-V 7.40840633669954e-09 -0.284511255360465 1.05569790297968e-07 4 SRC|SRC_PY527-R-V 0.0167486560275975 -0.286730259307692 0.0397780580655441 4 MET|C-MET-M-C 0.0086588398290428 -0.302426392349732 0.022099427026363 4 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.0192553750763371 -0.319970355502683 0.0451050566856664 4 RPS6|S6_PS240_S244-R-V 0.00266976160115506 -0.325924448036672 0.0077765530711917 4 SETD2|SETD2-R-NA 3.17058043439176e-07 -0.344714897767442 2.71084627140496e-06 4 HSPA1A|HSP70-R-C 0.00906730264890446 -0.350122302694097 0.0228015993082745 4 ESR1|ER-ALPHA-R-V 1.41394602248422e-09 -0.367667314887298 2.41784769844802e-08 4 RAB25|RAB25-R-C 0.00473528285602704 -0.367752872797853 0.0130602156190423 4 YAP1|YAP-R-V 1.12112462664874e-07 -0.376171771928444 1.12771947739373e-06 4 SNAI2|SNAIL-M-C 0.001534830660912 -0.406266891894455 0.004860297092888 4 KRAS|K-RAS-M-C 2.2351141550252e-11 -0.723109637260286 9.55511301273273e-10 4 PARP1|PARP_CLEAVED-M-C 2.40350621667243e-07 -0.775330097593023 2.28333090583881e-06 4 CDH1|E-CADHERIN-R-V 9.18543379461019e-09 0.800120921251131 1.30892431573195e-07 5 ERBB3|HER3-R-V 2.27462890008899e-09 0.737708827859729 4.86201927394022e-08 5 TP53BP1|53BP1-R-C 1.31817680180085e-09 0.68239893662368 3.75680388513242e-08 5 RPS6|S6-R-NA 6.57586214114488e-11 0.636231262594269 5.62236213067887e-09 5 IGFBP2|IGFBP2-R-V 0.0160869955890395 0.630425375042232 0.0331430872979007 5 MSH6|MSH6-R-C 2.27346737106249e-08 0.598631431031674 2.99048400347451e-07 5 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 1.4642361778409e-05 0.597030741355958 7.8245120753373e-05 5 TSC2|TUBERIN-R-C 1.04266534985297e-07 0.54517975939819 9.90532082360321e-07 5 EEF2K|EEF2K-R-V 3.02813062928892e-08 0.540667416232277 3.45206891738937e-07 5 CTNNB1|BETA-CATENIN-R-V 0.00113115187876054 0.537119730966818 0.00339345563628162 5 ATM|ATM-R-C 5.53407360965059e-06 0.530714919769231 3.15442195750084e-05 5 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.00067718975343578 0.522114464736802 0.00231598895675037 5 XRCC5|KU80-R-C 4.47389692157755e-08 0.508357599102564 4.781477334936e-07 5 BRAF|B-RAF-M-NA 2.82498577482603e-08 0.484861061677979 3.45051833925179e-07 5 RB1|RB_PS807_S811-R-V 0.0041796984024084 0.467618396671192 0.00952971235749115 5 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 0.0116600289453284 0.46383836849623 0.02461561666236 5 ACACAACACB|ACC_PS79-R-V 4.34767952841864e-05 0.423356294918552 0.000185863299839897 5 RB1|RB-M-V 6.90746700496763e-10 0.412300647922323 2.36235371569893e-08 5 ACACA|ACC1-R-C 0.00145126252257646 0.396267483074661 0.00393914113270753 5 MSH2|MSH2-M-C 1.96454175441461e-11 0.384632711024133 3.35936640004898e-09 5 NCOA3|AIB1-M-V 3.23973983872311e-09 0.379500964714178 6.15550569357391e-08 5 GAB2|GAB2-R-V 0.000169330175041038 0.363654399982655 0.00062946652026125 5 SYK|SYK-M-V 0.00166101726516707 0.356832527187783 0.00443803050536827 5 CHEK2|CHK2-M-C 0.000225563057254487 0.350704049030166 0.00080356839146911 5 FRAP1|MTOR-R-V 1.91049575623185e-05 0.339805289394419 9.33413640901847e-05 5 NFKB1|NF-KB-P65_PS536-R-C 0.0192244804451774 0.332361465923831 0.0386751312485334 5 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 0.00175360292400911 0.327805317788084 0.00461332461547012 5 KRAS|K-RAS-M-C 1.73486365413242e-06 0.315136093727753 1.17928516650464e-05 5 INPP4B|INPP4B-G-C 0.0071316499310732 0.309792064559578 0.0156347710027374 5 ARID1A|ARID1A-M-V 4.19280322775261e-10 0.295934318770739 2.20914940605386e-08 5 AKT1AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.0271972564198788 0.26505094809276 0.0505514222586878 5 CTNNA1|ALPHA-CATENIN-M-V 2.20975263025894e-07 0.265013800357466 1.88933849887139e-06 5 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.00012022825863666 0.248357708187783 0.000472174733517755 5 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 4.65580494599718e-05 0.233964540669684 0.000194181133113541 5 EGFR|EGFR_PY1068-R-V 0.0389192050463827 0.211697409802413 0.0674225888144182 5 MYC|C-MYC-R-C 0.00573338816799345 0.197734588046757 0.0127325893081413 5 PXN|PAXILLIN-R-V 0.0281584073536866 0.195753802871041 0.0512243367817065 5 CDKN1B|P27_PT198-R-V 0.00925254068034782 0.190622987315988 0.0200276513460693 5 NOTCH1|NOTCH1-R-V 0.0010179928532473 0.17668455192006 0.00310851389116586 5 RAF1|C-RAF-R-V 0.00014954828222349 0.173954412483409 0.000568283472449262 5 SMAD1|SMAD1-R-V 0.000184482957863053 0.168138243202866 0.000671203953076214 5 JUN|C-JUN_PS73-R-C 0.00122042848054535 0.160305755422323 0.00359815983057336 5 IRS1|IRS1-R-V 0.00278379383499397 0.136259373188537 0.00661151035811068 5 FOXO3|FOXO3A-R-C 0.00339273180272757 0.134254294587481 0.00794735805844403 5 CASP3|CASPASE-3_ACTIVE-R-C 0.0278015662811763 0.107695471953243 0.0511190089686145 5 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.0311840456061755 0.1058532799819 0.0555465812360001 5 PIK3CA|PI3K-P110-ALPHA-R-C 0.0101603888824307 0.100941208404977 0.0217178312361956 5 XIAP|XIAP-R-C 0.0332537809086684 0.0873773449215687 0.0586226446946628 5 XBP1|XBP1-G-C 0.0390341303662421 0.0849086460527904 0.0674225888144182 5 BECN1|BECLIN-G-V 0.0468808406133362 0.0714402116930617 0.0785943504400048 5 BIRC2|CIAP-R-V 0.0302564224274363 0.070723833321267 0.0544615603693853 5 STK11|LKB1-M-NA 0.0412188454058189 -0.0572444544728506 0.0704842256439503 5 MRE11A|MRE11-R-C 0.0208240452921925 -0.0595528934819005 0.040930020057068 5 CD20|CD20-R-C 0.0189011106673175 -0.0843139680128204 0.0384772610013249 5 CCND1|CYCLIN_D1-R-V 0.00234780440398094 -0.0915849571561085 0.00581847178377885 5 SMAD3|SMAD3-R-V 0.00144326461469526 -0.115942102720965 0.00393914113270753 5 PECAM1|CD31-M-V 0.00431056688948429 -0.125094952628205 0.00969877550133965 5 MAPK9|JNK2-R-C 0.0242273758809685 -0.125138652598039 0.0455261678642375 5 CDKN1A|P21-R-C 0.00257030375898781 -0.132505341371795 0.0062650852680135 5 CDC2|CDK1-R-V 0.0013996143505661 -0.141684993410256 0.00392350908109513 5 BCL2|BCL-2-R-NA 0.000921272307683838 -0.153239632398944 0.00291488224698543 5 RAD51|RAD51-M-C 1.77769584378965e-05 -0.157656430038462 8.94076439082442e-05 5 SRC|SRC_PY416-R-C 0.0435390027836272 -0.158157121951734 0.0737145492673292 5 NF2|NF2-R-C 0.00126110018619321 -0.191527830941176 0.00365505308201761 5 FOXO3|FOXO3A_PS318_S321-R-C 2.86117362063286e-05 -0.197416448180995 0.000135905746980061 5 CDH2|N-CADHERIN-R-V 1.71251040052394e-05 -0.198253030560332 8.87391752998769e-05 5 KDR|VEGFR2-R-C 0.0139062886560835 -0.202133899285822 0.0289996995145156 5 WWTR1|TAZ-R-C 2.29048677463627e-06 -0.216954963398944 1.39883299451001e-05 5 BCL2L1|BCL-X-R-C 0.00260129271361964 -0.240061611545249 0.0062650852680135 5 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.00093753522563859 -0.243044849822021 0.00291488224698543 5 MAPK1|ERK2-R-NA 0.00194781929245104 -0.250202857027149 0.00497129998521086 5 TGM2|TRANSGLUTAMINASE-M-V 1.02128587025498e-05 -0.252078033372549 5.63354463914844e-05 5 BCL2L1|BCL-XL-R-V 0.000121495253068896 -0.252629640567873 0.000472174733517755 5 NOTCH3|NOTCH3-R-C 0.00194181381331169 -0.253980622569382 0.00497129998521086 5 GSK3AGSK3B|GSK3_PS9-R-V 0.022942489575556 -0.263850247419306 0.0445814286070463 5 MAPK8|JNK_PT183_Y185-R-V 9.26463678992497e-05 -0.264795216670437 0.000377203069304088 5 AKT1AKT2 AKT3|AKT_PT308-R-V 0.00208869796451959 -0.277881656938914 0.00525246105783603 5 ERCC1|ERCC1-M-C 6.85770950436587e-07 -0.279830376812971 5.11026476959309e-06 5 CHEK1|CHK1-R-C 4.97254946154138e-09 -0.28038215599095 7.7300541629416e-08 5 AKT1AKT2 AKT3|AKT_PS473-R-V 0.0241911262971433 -0.281186106677225 0.0455261678642375 5 MAP2K1|MEK1-R-V 0.000750743990449073 -0.286275500921569 0.00246879273782291 5 RAB11ARAB11B|RAB11-R-V 1.5681812979917e-09 -0.286613960726245 3.83084288509401e-08 5 CASP9|CASPASE-9_CLEAVEDD330-R-C 1.4528994885807e-07 -0.296370880621418 1.30760953972263e-06 5 MAP2K1|MEK1_PS217_S221-R-V 0.000727221866694378 -0.306541905050528 0.00243833214126938 5 PARK7|DJ-1-R-C 3.03699905540486e-06 -0.3090919921727 1.79078220163528e-05 5 ERBB2|HER2-M-V 0.0204331789356413 -0.310025840647059 0.0406287627673798 5 SNAI2|SNAIL-M-C 0.0238938365788017 -0.311079808514329 0.0455261678642375 5 PEA15|PEA-15-R-V 1.79306516544565e-06 -0.333379918950226 1.17928516650464e-05 5 YBX1|YB-1-R-V 0.001298488338582 -0.346082090391403 0.0037006917649587 5 LCK|LCK-R-V 6.55935629740037e-08 -0.356201224148567 6.59794074620861e-07 5 EEF2|EEF2-R-V 4.2781853390857e-05 -0.36003035135822 0.000185863299839897 5 MET|C-MET-M-C 0.00361020696918033 -0.360219068852941 0.00834250529364644 5 CASP8|CASPASE-8-M-C 0.00058678476960963 -0.408174496297888 0.00204775909394381 5 HSPA1A|HSP70-R-C 0.000883727238993865 -0.506190675453997 0.00285127090316889 5 PTGS2|COX-2-R-C 6.87345553804918e-07 -0.56771197634917 5.11026476959309e-06 5 PTCH1|PTCH-R-C 2.00950779478802e-06 -0.579904570998492 1.27268827003241e-05 5 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 4.00714889778406e-05 -0.588904072424585 0.000180321700400283 5 ANXA1|ANNEXIN_I-R-V 4.60988332270091e-09 -0.68236980581825 7.7300541629416e-08 5 FN1|FIBRONECTIN-R-C 3.88723753358473e-05 -0.695764994404977 0.000179653410335943 5 MAPK1MAPK3|MAPK_PT202_Y204-R-V 8.73039039546094e-07 -0.729146800966063 6.22040315676592e-06 5 COL6A1|COLLAGEN_VI-R-V 5.16760094983359e-10 -0.769874248769231 2.20914940605386e-08 5 CAV1|CAVEOLIN-1-R-V 4.41339362039704e-07 -0.892922150033937 3.59376337660902e-06 5