Correlation between gene mutation status and molecular subtypes
Lung Adenocarcinoma (Primary solid tumor)
23 May 2013  |  analyses__2013_05_23
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Citation Information
doi:10.7908/C17P8WFR
Maintained by TCGA GDAC Team (Broad Institute/MD Anderson Cancer Center/Harvard Medical School)
Cite as Broad Institute TCGA Genome Data Analysis Center (2013): Correlation between gene mutation status and molecular subtypes. Broad Institute of MIT and Harvard. doi:10.7908/C17P8WFR
Overview
Introduction

This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and molecular subtypes.

Summary

Testing the association between mutation status of 158 genes and 12 molecular subtypes across 172 patients, 7 significant findings detected with P value < 0.05 and Q value < 0.25.

  • TP53 mutation correlated to 'MRNASEQ_CNMF' and 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'.

  • STK11 mutation correlated to 'MRNASEQ_CNMF'.

  • KEAP1 mutation correlated to 'MRNASEQ_CNMF' and 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'.

  • MUC7 mutation correlated to 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'.

  • CSMD3 mutation correlated to 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'.

Results
Overview of the results

Table 1.  Get Full Table Overview of the association between mutation status of 158 genes and 12 molecular subtypes. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by P value < 0.05 and Q value < 0.25, 7 significant findings detected.

Clinical
Features 		MRNA
CNMF 		MRNA
CHIERARCHICAL 		CN
CNMF 		METHLYATION
CNMF 		RPPA
CNMF 		RPPA
CHIERARCHICAL 		MRNASEQ
CNMF 		MRNASEQ
CHIERARCHICAL 		MIRSEQ
CNMF 		MIRSEQ
CHIERARCHICAL 		MIRSEQ
MATURE
CNMF 		MIRSEQ
MATURE
CHIERARCHICAL
nMutated (%) nWild-Type Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Chi-square test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test
TP53 87 (51%) 85 0.00576
(1.00) 		0.0644
(1.00) 		0.000824
(1.00) 		0.0947
(1.00) 		0.000199
(0.319) 		0.00627
(1.00) 		7.51e-05
(0.121) 		4.12e-06
(0.00662) 		0.00819
(1.00) 		0.187
(1.00) 		0.614
(1.00) 		0.54
(1.00)
KEAP1 32 (19%) 140 0.375
(1.00) 		0.242
(1.00) 		0.0316
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.0162
(1.00) 		1.71e-05
(0.0275) 		4.63e-05
(0.0743) 		0.899
(1.00) 		0.241
(1.00) 		0.551
(1.00) 		0.0833
(1.00)
STK11 20 (12%) 152 0.554
(1.00) 		0.418
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.492
(1.00) 		0.123
(1.00) 		0.0712
(1.00) 		5.82e-07
(0.000937) 		0.000403
(0.644) 		0.69
(1.00) 		0.185
(1.00) 		0.268
(1.00) 		0.451
(1.00)
MUC7 15 (9%) 157 0.0389
(1.00) 		0.0341
(1.00) 		0.242
(1.00) 		0.294
(1.00) 		0.117
(1.00) 		9.61e-05
(0.154) 		0.182
(1.00) 		0.0896
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.0332
(1.00)
CSMD3 78 (45%) 94 0.0252
(1.00) 		0.0301
(1.00) 		0.0503
(1.00) 		0.000831
(1.00) 		0.183
(1.00) 		0.357
(1.00) 		0.00561
(1.00) 		1.11e-05
(0.0179) 		0.0454
(1.00) 		0.122
(1.00) 		0.524
(1.00) 		0.835
(1.00)
CDKN2A 8 (5%) 164 0.903
(1.00) 		0.89
(1.00) 		0.347
(1.00) 		0.449
(1.00) 		0.886
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.811
(1.00) 		0.534
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.187
(1.00)
KRAS 47 (27%) 125 0.816
(1.00) 		0.882
(1.00) 		0.0443
(1.00) 		0.569
(1.00) 		0.112
(1.00) 		0.0311
(1.00) 		0.00703
(1.00) 		0.711
(1.00) 		0.016
(1.00) 		0.0329
(1.00) 		0.0987
(1.00) 		0.0545
(1.00)
EGFR 22 (13%) 150 0.187
(1.00) 		0.552
(1.00) 		0.151
(1.00) 		0.326
(1.00) 		0.00829
(1.00) 		0.0405
(1.00) 		0.613
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.139
(1.00) 		0.208
(1.00)
CRIPAK 11 (6%) 161 0.782
(1.00) 		0.418
(1.00) 		0.419
(1.00) 		0.628
(1.00) 		0.0892
(1.00) 		0.68
(1.00) 		0.924
(1.00) 		0.415
(1.00) 		0.199
(1.00) 		0.55
(1.00)
RBM10 12 (7%) 160 0.252
(1.00) 		0.236
(1.00) 		0.799
(1.00) 		0.485
(1.00) 		0.189
(1.00) 		0.678
(1.00) 		0.945
(1.00) 		1
(1.00) 		0.864
(1.00) 		1
(1.00) 		0.791
(1.00) 		0.279
(1.00)
NF1 21 (12%) 151 0.912
(1.00) 		0.821
(1.00) 		0.0406
(1.00) 		0.041
(1.00) 		0.558
(1.00) 		0.551
(1.00) 		0.154
(1.00) 		0.553
(1.00) 		0.151
(1.00) 		0.306
(1.00) 		0.133
(1.00) 		0.524
(1.00)
FLG 44 (26%) 128 0.151
(1.00) 		0.896
(1.00) 		0.296
(1.00) 		0.0241
(1.00) 		0.206
(1.00) 		0.0428
(1.00) 		0.303
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.173
(1.00) 		0.435
(1.00) 		0.876
(1.00) 		0.528
(1.00)
GPR112 35 (20%) 137 0.493
(1.00) 		0.523
(1.00) 		0.549
(1.00) 		0.284
(1.00) 		0.465
(1.00) 		0.749
(1.00) 		0.39
(1.00) 		0.336
(1.00) 		0.939
(1.00) 		0.434
(1.00) 		0.617
(1.00) 		0.217
(1.00)
SMARCA4 14 (8%) 158 0.12
(1.00) 		0.157
(1.00) 		0.586
(1.00) 		0.00814
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.965
(1.00) 		0.0316
(1.00) 		0.00028
(0.448) 		0.0781
(1.00) 		0.0404
(1.00) 		0.0324
(1.00) 		0.108
(1.00)
COL11A1 34 (20%) 138 0.142
(1.00) 		0.0022
(1.00) 		0.462
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.385
(1.00) 		0.213
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.111
(1.00) 		0.0702
(1.00) 		0.0884
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.173
(1.00)
HRNR 25 (15%) 147 0.247
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.96
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.76
(1.00) 		0.0895
(1.00) 		1
(1.00) 		0.707
(1.00) 		0.502
(1.00) 		0.082
(1.00)
BRAF 15 (9%) 157 0.247
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.684
(1.00) 		0.325
(1.00) 		0.904
(1.00) 		0.428
(1.00) 		0.289
(1.00) 		0.252
(1.00) 		0.542
(1.00) 		0.242
(1.00) 		0.904
(1.00) 		0.0424
(1.00)
U2AF1 6 (3%) 166 0.871
(1.00) 		0.0382
(1.00) 		0.203
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.804
(1.00) 		0.776
(1.00) 		0.197
(1.00) 		0.0357
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.753
(1.00)
PCK1 10 (6%) 162 0.42
(1.00) 		0.412
(1.00) 		0.302
(1.00) 		0.0302
(1.00) 		0.655
(1.00) 		1
(1.00) 		0.705
(1.00) 		0.3
(1.00) 		1
(1.00) 		0.73
(1.00) 		0.0878
(1.00) 		0.526
(1.00)
RB1 7 (4%) 165 0.367
(1.00) 		0.339
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.431
(1.00) 		0.0968
(1.00) 		0.0962
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.149
(1.00) 		0.87
(1.00) 		0.625
(1.00)
RIMS2 32 (19%) 140 0.151
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.0617
(1.00) 		0.0873
(1.00) 		0.298
(1.00) 		0.493
(1.00) 		0.152
(1.00) 		0.163
(1.00) 		0.143
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.106
(1.00) 		0.139
(1.00)
RIT1 8 (5%) 164 0.903
(1.00) 		0.716
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.0563
(1.00) 		0.905
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.868
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.7
(1.00)
FTSJD1 6 (3%) 166 0.871
(1.00) 		0.225
(1.00) 		0.0197
(1.00) 		0.935
(1.00) 		0.324
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
LRP1B 61 (35%) 111 0.363
(1.00) 		0.478
(1.00) 		0.584
(1.00) 		0.0157
(1.00) 		0.971
(1.00) 		0.934
(1.00) 		0.00308
(1.00) 		0.00805
(1.00) 		0.334
(1.00) 		0.633
(1.00) 		0.963
(1.00) 		0.688
(1.00)
OR10J3 9 (5%) 163 0.495
(1.00) 		0.574
(1.00) 		1
(1.00) 		0.828
(1.00) 		0.608
(1.00) 		0.268
(1.00) 		0.415
(1.00) 		0.397
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.373
(1.00)
SETD2 15 (9%) 157 0.196
(1.00) 		0.368
(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.24
(1.00) 		0.545
(1.00) 		0.305
(1.00) 		0.00883
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.483
(1.00) 		1
(1.00)
LTBP1 20 (12%) 152 0.71
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.334
(1.00) 		0.23
(1.00) 		0.118
(1.00) 		0.486
(1.00) 		0.335
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.231
(1.00) 		0.181
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.378
(1.00)
ZCCHC5 10 (6%) 162 0.703
(1.00) 		0.763
(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.376
(1.00) 		0.332
(1.00) 		0.715
(1.00) 		0.306
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.313
(1.00) 		0.372
(1.00)
MYL10 5 (3%) 167 0.348
(1.00) 		0.49
(1.00) 		1
(1.00) 		0.217
(1.00) 		0.528
(1.00) 		0.619
(1.00) 		1
(1.00)
GBA3 8 (5%) 164 0.807
(1.00) 		0.625
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0767
(1.00) 		0.657
(1.00) 		0.152
(1.00) 		0.484
(1.00) 		1
(1.00) 		0.473
(1.00) 		1
(1.00)
ADAMTS5 14 (8%) 158 1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.941
(1.00) 		0.728
(1.00) 		1
(1.00) 		0.725
(1.00) 		0.504
(1.00) 		0.149
(1.00) 		0.397
(1.00) 		0.367
(1.00) 		0.625
(1.00)
ZNF268 5 (3%) 167 0.308
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.842
(1.00) 		0.0903
(1.00) 		0.22
(1.00) 		0.422
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.298
(1.00) 		0.828
(1.00)
OR4Q3 11 (6%) 161 0.566
(1.00) 		0.648
(1.00) 		0.189
(1.00) 		0.632
(1.00) 		0.33
(1.00) 		0.0473
(1.00) 		0.00903
(1.00) 		0.0199
(1.00) 		0.611
(1.00) 		0.0461
(1.00)
SMAD4 7 (4%) 165 1
(1.00) 		0.406
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.665
(1.00) 		0.286
(1.00) 		0.199
(1.00) 		0.252
(1.00) 		0.551
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.575
(1.00)
ARID1A 11 (6%) 161 0.0598
(1.00) 		0.132
(1.00) 		0.0509
(1.00) 		0.111
(1.00) 		0.443
(1.00) 		0.258
(1.00) 		0.0202
(1.00) 		0.0501
(1.00) 		0.0695
(1.00) 		0.0617
(1.00)
CCDC73 11 (6%) 161 0.18
(1.00) 		0.872
(1.00) 		1
(1.00) 		0.957
(1.00) 		0.236
(1.00) 		1
(1.00) 		0.489
(1.00) 		0.415
(1.00) 		0.547
(1.00) 		0.462
(1.00)
MGA 16 (9%) 156 0.887
(1.00) 		0.201
(1.00) 		0.17
(1.00) 		0.526
(1.00) 		0.62
(1.00) 		0.305
(1.00) 		0.194
(1.00) 		0.207
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.151
(1.00)
IFNA7 5 (3%) 167 0.348
(1.00) 		1
(1.00) 		0.415
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.633
(1.00) 		0.234
(1.00) 		0.2
(1.00) 		0.319
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.375
(1.00)
FANCD2 7 (4%) 165 0.525
(1.00) 		0.236
(1.00) 		0.212
(1.00) 		0.851
(1.00) 		0.665
(1.00) 		0.687
(1.00) 		0.199
(1.00) 		0.79
(1.00) 		0.655
(1.00)
MBD1 6 (3%) 166 0.2
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.456
(1.00) 		0.0808
(1.00) 		0.0805
(1.00) 		0.432
(1.00) 		1
(1.00) 		0.791
(1.00) 		1
(1.00)
SVOP 7 (4%) 165 0.881
(1.00) 		0.544
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.297
(1.00) 		0.439
(1.00) 		0.0836
(1.00) 		0.893
(1.00) 		0.868
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.847
(1.00)
FAM48B1 10 (6%) 162 0.53
(1.00) 		1
(1.00) 		0.206
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.347
(1.00) 		0.568
(1.00) 		0.964
(1.00) 		0.92
(1.00) 		1
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.464
(1.00) 		0.652
(1.00)
FGB 11 (6%) 161 0.282
(1.00) 		0.468
(1.00) 		0.813
(1.00) 		0.874
(1.00) 		0.238
(1.00) 		1
(1.00) 		0.855
(1.00) 		0.821
(1.00) 		0.0691
(1.00) 		0.587
(1.00)
FLI1 6 (3%) 166 0.641
(1.00) 		0.591
(1.00) 		0.746
(1.00) 		0.851
(1.00) 		1
(1.00) 		0.804
(1.00) 		1
(1.00) 		0.493
(1.00) 		1
(1.00)
LAX1 6 (3%) 166 0.653
(1.00) 		0.0516
(1.00) 		0.374
(1.00) 		0.493
(1.00) 		1
(1.00)
COL19A1 14 (8%) 158 0.586
(1.00) 		0.748
(1.00) 		0.0133
(1.00) 		0.0273
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(1.00) 		0.0401
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(1.00) 		0.378
(1.00)
MLL3 34 (20%) 138 0.505
(1.00) 		0.504
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(1.00) 		0.686
(1.00) 		0.567
(1.00) 		0.743
(1.00) 		1
(1.00)
OVCH1 14 (8%) 158 0.912
(1.00) 		1
(1.00) 		0.235
(1.00) 		1
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.87
(1.00)
LRRC32 11 (6%) 161 0.375
(1.00) 		0.242
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(1.00) 		0.87
(1.00) 		0.068
(1.00)
ANP32C 8 (5%) 164 0.713
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.249
(1.00) 		0.716
(1.00) 		0.284
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(1.00) 		0.716
(1.00) 		1
(1.00)
OR10G9 10 (6%) 162 0.434
(1.00) 		0.104
(1.00) 		1
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(1.00) 		0.87
(1.00)
MTTP 6 (3%) 166 0.116
(1.00) 		0.477
(1.00) 		0.49
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0166
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(1.00) 		0.197
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(1.00)
RUFY2 7 (4%) 165 0.881
(1.00) 		0.486
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.117
(1.00) 		0.847
(1.00)
PJA1 8 (5%) 164 0.903
(1.00) 		0.841
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(1.00) 		0.0605
(1.00) 		0.427
(1.00) 		0.34
(1.00) 		0.2
(1.00) 		0.807
(1.00)
KIAA1755 12 (7%) 160 0.388
(1.00) 		0.702
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(1.00) 		0.902
(1.00) 		0.932
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.692
(1.00) 		0.758
(1.00)
CNGA2 11 (6%) 161 0.12
(1.00) 		0.102
(1.00) 		0.361
(1.00) 		0.245
(1.00) 		0.912
(1.00) 		1
(1.00) 		0.295
(1.00) 		0.859
(1.00) 		0.489
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(1.00) 		0.762
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(1.00)
ASTN2 14 (8%) 158 0.817
(1.00) 		0.677
(1.00) 		0.92
(1.00) 		0.526
(1.00) 		0.605
(1.00) 		0.3
(1.00) 		0.0326
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(1.00)
STXBP5L 12 (7%) 160 0.582
(1.00) 		0.403
(1.00) 		1
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(1.00) 		0.496
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(1.00) 		0.177
(1.00) 		0.575
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(1.00) 		0.587
(1.00)
TEX15 24 (14%) 148 0.278
(1.00) 		0.000778
(1.00) 		0.488
(1.00) 		1
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(1.00) 		0.83
(1.00)
ELTD1 15 (9%) 157 0.236
(1.00) 		1
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(1.00)
DACT1 10 (6%) 162 0.192
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KRT28 7 (4%) 165 0.881
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OR10R2 10 (6%) 162 0.771
(1.00) 		0.91
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(1.00) 		0.164
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(1.00)
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(1.00) 		0.904
(1.00) 		0.156
(1.00) 		0.11
(1.00) 		0.776
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(1.00) 		0.464
(1.00) 		0.265
(1.00)
PABPC3 9 (5%) 163 0.447
(1.00) 		0.406
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.828
(1.00) 		0.948
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(1.00) 		0.33
(1.00) 		0.203
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.7
(1.00)
TLR4 23 (13%) 149 0.917
(1.00) 		0.0465
(1.00) 		1
(1.00) 		0.612
(1.00) 		0.272
(1.00) 		0.479
(1.00) 		0.199
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(1.00) 		0.185
(1.00) 		0.132
(1.00)
THEMIS 10 (6%) 162 0.53
(1.00) 		1
(1.00) 		0.13
(1.00) 		0.43
(1.00) 		1
(1.00) 		0.947
(1.00) 		0.686
(1.00) 		1
(1.00) 		0.762
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.753
(1.00)
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(1.00) 		0.235
(1.00) 		0.761
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.0199
(1.00) 		0.00806
(1.00) 		0.354
(1.00) 		0.354
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		0.121
(1.00) 		0.456
(1.00) 		0.804
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.497
(1.00)
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(1.00) 		0.218
(1.00) 		0.626
(1.00) 		0.897
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(1.00) 		0.0319
(1.00) 		0.0165
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(1.00) 		0.0706
(1.00) 		0.134
(1.00)
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(1.00) 		0.486
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(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.0596
(1.00) 		0.00772
(1.00) 		0.134
(1.00)
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(1.00)
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(1.00) 		0.674
(1.00) 		1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00) 		0.889
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(1.00) 		0.354
(1.00)
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(1.00) 		0.328
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(1.00) 		0.0495
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(1.00)
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(1.00) 		0.253
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(1.00)
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(1.00) 		0.841
(1.00) 		1
(1.00) 		1
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(1.00)
F8 15 (9%) 157 1
(1.00) 		0.418
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(1.00)
TSHZ3 25 (15%) 147 0.0514
(1.00) 		0.0219
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(1.00)
TBX21 7 (4%) 165 1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.79
(1.00) 		0.552
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(1.00) 		0.655
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00) 		0.0126
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(1.00)
EPHA6 22 (13%) 150 0.841
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(1.00)
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(1.00) 		0.0903
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(1.00) 		0.145
(1.00)
SPTA1 51 (30%) 121 0.46
(1.00) 		0.486
(1.00) 		0.159
(1.00) 		0.0459
(1.00) 		0.936
(1.00) 		0.981
(1.00) 		0.123
(1.00) 		0.108
(1.00) 		0.284
(1.00) 		0.19
(1.00) 		0.331
(1.00) 		0.101
(1.00)
CTRC 4 (2%) 168 0.841
(1.00) 		0.477
(1.00) 		0.664
(1.00) 		1
(1.00) 		0.718
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.354
(1.00) 		1
(1.00) 		0.265
(1.00)
TMTC1 22 (13%) 150 0.236
(1.00) 		0.308
(1.00) 		0.0862
(1.00) 		0.64
(1.00) 		0.378
(1.00) 		0.557
(1.00) 		0.366
(1.00) 		0.684
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.327
(1.00) 		0.811
(1.00) 		0.402
(1.00)
ITGAX 17 (10%) 155 0.192
(1.00) 		0.308
(1.00) 		1
(1.00) 		0.96
(1.00) 		0.751
(1.00) 		0.918
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.159
(1.00) 		1
(1.00) 		0.707
(1.00) 		1
(1.00) 		0.318
(1.00)
CDH6 17 (10%) 155 0.247
(1.00) 		0.651
(1.00) 		0.45
(1.00) 		0.125
(1.00) 		0.547
(1.00) 		0.104
(1.00) 		0.295
(1.00) 		0.211
(1.00) 		0.221
(1.00) 		0.678
(1.00) 		1
(1.00) 		0.392
(1.00)
NALCN 24 (14%) 148 0.658
(1.00) 		0.505
(1.00) 		0.409
(1.00) 		0.116
(1.00) 		0.941
(1.00) 		0.8
(1.00) 		0.0991
(1.00) 		0.385
(1.00) 		0.882
(1.00) 		0.777
(1.00) 		0.562
(1.00) 		0.929
(1.00)
COL5A1 13 (8%) 159 0.489
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.433
(1.00) 		0.522
(1.00) 		0.429
(1.00) 		0.586
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.599
(1.00) 		0.363
(1.00) 		0.645
(1.00)
SVEP1 21 (12%) 151 0.641
(1.00) 		0.591
(1.00) 		0.954
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.529
(1.00) 		0.389
(1.00) 		0.275
(1.00) 		0.957
(1.00) 		0.562
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.712
(1.00) 		1
(1.00)
OR5I1 11 (6%) 161 0.469
(1.00) 		0.967
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.398
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.846
(1.00) 		0.238
(1.00) 		0.612
(1.00) 		0.135
(1.00) 		0.408
(1.00)
EPS8L3 4 (2%) 168 0.531
(1.00) 		1
(1.00) 		0.29
(1.00) 		0.651
(1.00) 		0.688
(1.00) 		0.555
(1.00) 		0.354
(1.00)
CYP1A1 4 (2%) 168 1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.557
(1.00) 		0.688
(1.00) 		0.249
(1.00) 		0.536
(1.00)
DEFB112 4 (2%) 168 0.149
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.929
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.249
(1.00) 		0.536
(1.00)
FBXL7 17 (10%) 155 0.236
(1.00) 		0.308
(1.00) 		0.226
(1.00) 		0.0516
(1.00) 		0.0204
(1.00) 		0.854
(1.00) 		0.473
(1.00) 		0.0954
(1.00) 		0.596
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.526
(1.00)
TARS2 8 (5%) 164 1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.196
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.27
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.495
(1.00) 		0.0468
(1.00) 		1
(1.00) 		0.77
(1.00) 		0.812
(1.00) 		0.807
(1.00)
GPR174 6 (3%) 166 1
(1.00) 		0.674
(1.00) 		0.755
(1.00) 		0.632
(1.00) 		0.32
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.716
(1.00) 		0.847
(1.00)
HOXA5 6 (3%) 166 0.441
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.00748
(1.00) 		0.0863
(1.00) 		0.807
(1.00) 		0.198
(1.00) 		0.0272
(1.00) 		0.172
(1.00) 		0.0958
(1.00) 		0.279
(1.00)
SH2D2A 6 (3%) 166 0.0309
(1.00) 		0.904
(1.00) 		0.401
(1.00) 		0.123
(1.00) 		0.27
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.608
(1.00) 		0.152
(1.00) 		1
(1.00)
ABCB5 19 (11%) 153 0.12
(1.00) 		0.102
(1.00) 		0.484
(1.00) 		0.596
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.616
(1.00) 		0.253
(1.00) 		0.0341
(1.00) 		0.479
(1.00) 		0.605
(1.00) 		1
(1.00) 		0.684
(1.00)
ANKRD56 11 (6%) 161 0.517
(1.00) 		0.924
(1.00) 		1
(1.00) 		0.632
(1.00) 		0.571
(1.00) 		0.258
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.721
(1.00) 		0.0617
(1.00)
GTF2I 3 (2%) 169 0.609
(1.00) 		0.283
(1.00) 		0.775
(1.00) 		0.794
(1.00) 		0.237
(1.00)
MUC16 79 (46%) 93 0.172
(1.00) 		0.419
(1.00) 		0.474
(1.00) 		0.119
(1.00) 		0.145
(1.00) 		0.0327
(1.00) 		0.00576
(1.00) 		0.0207
(1.00) 		0.766
(1.00) 		0.539
(1.00) 		0.905
(1.00) 		0.862
(1.00)
VPS13C 19 (11%) 153 0.0352
(1.00) 		0.14
(1.00) 		0.631
(1.00) 		0.648
(1.00) 		0.135
(1.00) 		0.374
(1.00) 		0.553
(1.00) 		0.651
(1.00) 		0.31
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.822
(1.00) 		0.576
(1.00)
OR2T27 8 (5%) 164 0.173
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.019
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.349
(1.00) 		0.542
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.397
(1.00) 		0.27
(1.00) 		0.526
(1.00)
FERD3L 7 (4%) 165 1
(1.00) 		0.931
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.917
(1.00) 		0.773
(1.00) 		1
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.0886
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.29
(1.00)
OR4C16 14 (8%) 158 0.414
(1.00) 		0.0865
(1.00) 		0.105
(1.00) 		0.0955
(1.00) 		0.367
(1.00) 		0.201
(1.00) 		0.556
(1.00) 		0.79
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.265
(1.00)
C1ORF173 25 (15%) 147 0.59
(1.00) 		0.651
(1.00) 		0.783
(1.00) 		0.293
(1.00) 		0.206
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.256
(1.00) 		0.485
(1.00) 		0.226
(1.00) 		0.059
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.929
(1.00)
HCK 6 (3%) 166 0.0409
(1.00) 		0.235
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.456
(1.00) 		0.741
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.497
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KDM5C 8 (5%) 164 0.368
(1.00) 		0.485
(1.00) 		1
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.00435
(1.00) 		0.437
(1.00) 		0.654
(1.00) 		0.237
(1.00) 		1
(1.00) 		0.279
(1.00)
KIF9 7 (4%) 165 1
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.533
(1.00) 		0.0138
(1.00) 		0.00589
(1.00) 		0.629
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.105
(1.00) 		1
(1.00) 		0.265
(1.00)
BRS3 7 (4%) 165 0.0718
(1.00) 		0.187
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.58
(1.00) 		0.626
(1.00) 		0.123
(1.00) 		0.0605
(1.00) 		0.34
(1.00) 		0.599
(1.00) 		0.373
(1.00)
SIRPB1 6 (3%) 166 1
(1.00) 		0.0982
(1.00) 		1
(1.00) 		0.234
(1.00) 		0.761
(1.00) 		1
(1.00) 		0.134
(1.00) 		0.497
(1.00) 		0.716
(1.00) 		0.373
(1.00)
RP1L1 32 (19%) 140 0.641
(1.00) 		0.591
(1.00) 		0.0875
(1.00) 		0.0112
(1.00) 		0.298
(1.00) 		0.179
(1.00) 		0.235
(1.00) 		0.153
(1.00) 		0.873
(1.00) 		0.608
(1.00) 		0.911
(1.00) 		0.507
(1.00)
COL3A1 22 (13%) 150 0.856
(1.00) 		0.453
(1.00) 		0.637
(1.00) 		0.033
(1.00) 		0.627
(1.00) 		0.233
(1.00) 		0.373
(1.00) 		0.684
(1.00) 		0.199
(1.00) 		0.202
(1.00) 		0.139
(1.00) 		0.921
(1.00)
LPPR4 14 (8%) 158 0.656
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.817
(1.00) 		0.382
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.493
(1.00) 		0.441
(1.00) 		0.734
(1.00) 		0.933
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00)
HOXA3 6 (3%) 166 0.505
(1.00) 		0.716
(1.00) 		0.49
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.755
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.573
(1.00) 		0.722
(1.00) 		0.716
(1.00) 		0.373
(1.00)
OR56A4 6 (3%) 166 1
(1.00) 		0.311
(1.00) 		0.868
(1.00) 		0.0768
(1.00) 		0.444
(1.00) 		0.134
(1.00) 		0.112
(1.00)
KDR 20 (12%) 152 0.28
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.574
(1.00) 		1
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.222
(1.00) 		0.578
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.681
(1.00) 		0.378
(1.00)
ANKRD44 9 (5%) 163 0.67
(1.00) 		0.96
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.894
(1.00) 		0.371
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.709
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MFSD8 5 (3%) 167 0.0235
(1.00) 		0.0127
(1.00) 		0.842
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.58
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.445
(1.00) 		0.028
(1.00) 		0.163
(1.00)
ZNF260 4 (2%) 168 0.326
(1.00) 		0.841
(1.00) 		0.761
(1.00) 		0.449
(1.00) 		0.644
(1.00) 		0.0729
(1.00) 		0.823
(1.00) 		0.447
(1.00) 		0.362
(1.00) 		0.807
(1.00)
C1ORF49 6 (3%) 166 0.0409
(1.00) 		0.459
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.137
(1.00) 		0.404
(1.00) 		0.0976
(1.00) 		0.432
(1.00) 		1
(1.00) 		0.599
(1.00) 		0.847
(1.00)
C9ORF64 3 (2%) 169 0.0502
(1.00) 		0.591
(1.00) 		1
(1.00) 		0.582
(1.00) 		1
(1.00) 		0.717
(1.00) 		0.0638
(1.00) 		0.173
(1.00) 		0.536
(1.00)
LELP1 3 (2%) 169 0.417
(1.00) 		0.758
(1.00) 		0.0638
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TBX15 11 (6%) 161 0.361
(1.00) 		0.0769
(1.00) 		0.655
(1.00) 		1
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.859
(1.00) 		0.0922
(1.00) 		0.0501
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.101
(1.00)
AOAH 8 (5%) 164 0.514
(1.00) 		0.525
(1.00) 		0.599
(1.00) 		0.378
(1.00) 		0.747
(1.00) 		0.737
(1.00) 		0.811
(1.00) 		0.678
(1.00) 		0.762
(1.00) 		0.625
(1.00)
STAC3 3 (2%) 169 0.609
(1.00) 		1
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.775
(1.00) 		0.249
(1.00) 		0.536
(1.00)
CD5L 12 (7%) 160 0.679
(1.00) 		0.301
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.738
(1.00) 		0.352
(1.00) 		0.312
(1.00) 		0.928
(1.00) 		1
(1.00) 		0.904
(1.00) 		1
(1.00)
GRK5 7 (4%) 165 0.881
(1.00) 		0.406
(1.00) 		1
(1.00) 		0.234
(1.00) 		0.868
(1.00) 		0.344
(1.00) 		0.0304
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.7
(1.00)
C8ORF37 6 (3%) 166 0.505
(1.00) 		0.245
(1.00) 		0.49
(1.00) 		1
(1.00) 		0.765
(1.00) 		0.874
(1.00) 		0.662
(1.00) 		1
(1.00) 		0.762
(1.00) 		0.625
(1.00)
PTH 3 (2%) 169 0.803
(1.00) 		0.93
(1.00) 		1
(1.00) 		0.606
(1.00) 		0.71
(1.00)
NAALAD2 9 (5%) 163 1
(1.00) 		0.573
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.456
(1.00) 		0.372
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.0292
(1.00) 		0.0525
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.101
(1.00)
TAAR5 7 (4%) 165 0.062
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0369
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.862
(1.00) 		0.344
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.0958
(1.00) 		0.06
(1.00)
TRPC1 7 (4%) 165 0.212
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.49
(1.00) 		0.665
(1.00) 		0.216
(1.00) 		0.451
(1.00) 		0.79
(1.00) 		0.655
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00)
IL18RAP 5 (3%) 167 0.527
(1.00) 		1
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.752
(1.00) 		0.554
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.849
(1.00) 		0.828
(1.00) 		0.457
(1.00) 		0.543
(1.00)
C2ORF39 8 (5%) 164 0.42
(1.00) 		0.412
(1.00) 		0.368
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.752
(1.00) 		0.723
(1.00) 		0.542
(1.00) 		0.127
(1.00) 		0.397
(1.00)
ARID2 12 (7%) 160 0.53
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.103
(1.00) 		0.941
(1.00) 		0.213
(1.00) 		0.137
(1.00) 		0.173
(1.00) 		0.392
(1.00) 		0.743
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.87
(1.00) 		0.306
(1.00)
SPEG 16 (9%) 156 0.335
(1.00) 		1
(1.00) 		0.244
(1.00) 		0.131
(1.00) 		0.612
(1.00) 		0.779
(1.00) 		0.533
(1.00) 		0.946
(1.00) 		1
(1.00) 		0.261
(1.00) 		0.438
(1.00) 		0.201
(1.00)
OR13G1 9 (5%) 163 0.826
(1.00) 		0.931
(1.00) 		0.127
(1.00) 		0.0234
(1.00) 		0.389
(1.00) 		0.173
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.117
(1.00) 		0.847
(1.00)
NHEDC1 9 (5%) 163 0.826
(1.00) 		0.339
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.802
(1.00) 		0.297
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.0525
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.101
(1.00)
HAX1 4 (2%) 168 0.685
(1.00) 		0.43
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.58
(1.00) 		0.499
(1.00) 		0.55
(1.00) 		0.555
(1.00) 		1
(1.00) 		0.791
(1.00) 		1
(1.00)
ATM 15 (9%) 157 0.139
(1.00) 		0.0791
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.0373
(1.00) 		0.00288
(1.00) 		0.325
(1.00) 		0.782
(1.00) 		0.19
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.0617
(1.00)
IL1RAPL1 11 (6%) 161 0.901
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.617
(1.00) 		0.544
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.449
(1.00) 		0.505
(1.00) 		0.123
(1.00) 		0.786
(1.00) 		0.267
(1.00) 		0.0247
(1.00) 		0.101
(1.00)
AQP10 6 (3%) 166 0.0516
(1.00) 		0.377
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.0119
(1.00) 		1
(1.00) 		0.234
(1.00) 		0.324
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OR4A15 14 (8%) 158 0.00159
(1.00) 		0.293
(1.00) 		0.912
(1.00) 		0.924
(1.00) 		0.0484
(1.00) 		0.0321
(1.00) 		0.248
(1.00) 		0.0404
(1.00) 		0.241
(1.00) 		0.0461
(1.00)
OR2G2 12 (7%) 160 0.728
(1.00) 		1
(1.00) 		0.503
(1.00) 		0.64
(1.00) 		0.307
(1.00) 		0.611
(1.00) 		0.885
(1.00) 		0.362
(1.00) 		0.786
(1.00) 		0.146
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.134
(1.00)
CXCL6 4 (2%) 168 1
(1.00) 		0.485
(1.00) 		0.311
(1.00) 		0.58
(1.00) 		0.583
(1.00) 		0.838
(1.00) 		0.354
(1.00) 		0.354
(1.00) 		0.457
(1.00) 		0.279
(1.00)
BTK 7 (4%) 165 0.79
(1.00) 		0.272
(1.00) 		0.299
(1.00) 		0.252
(1.00) 		0.655
(1.00)
OLAH 7 (4%) 165 0.0718
(1.00) 		0.0733
(1.00) 		0.121
(1.00) 		0.0272
(1.00) 		0.12
(1.00) 		0.00451
(1.00) 		0.00906
(1.00) 		0.0588
(1.00) 		0.2
(1.00) 		0.157
(1.00)
DYDC2 3 (2%) 169 0.319
(1.00) 		0.358
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DGKB 11 (6%) 161 0.721
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.263
(1.00) 		0.0458
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.489
(1.00) 		0.612
(1.00) 		0.897
(1.00) 		0.481
(1.00)
'TP53 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CNMF'

P value = 7.51e-05 (Chi-square test), Q value = 0.12

Table S1.  Gene #3: 'TP53 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'MRNASEQ_CNMF'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3 CLUS_4 CLUS_5 CLUS_6 CLUS_7 CLUS_8 CLUS_9
ALL 39 23 27 14 11 17 23 8 8
TP53 MUTATED 28 8 22 3 3 8 10 3 1
TP53 WILD-TYPE 11 15 5 11 8 9 13 5 7

Figure S1.  Get High-res Image Gene #3: 'TP53 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'MRNASEQ_CNMF'

'TP53 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

P value = 4.12e-06 (Fisher's exact test), Q value = 0.0066

Table S2.  Gene #3: 'TP53 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3
ALL 61 57 52
TP53 MUTATED 16 40 30
TP53 WILD-TYPE 45 17 22

Figure S2.  Get High-res Image Gene #3: 'TP53 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

'STK11 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CNMF'

P value = 5.82e-07 (Chi-square test), Q value = 0.00094

Table S3.  Gene #5: 'STK11 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'MRNASEQ_CNMF'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3 CLUS_4 CLUS_5 CLUS_6 CLUS_7 CLUS_8 CLUS_9
ALL 39 23 27 14 11 17 23 8 8
STK11 MUTATED 0 0 4 8 0 2 5 0 0
STK11 WILD-TYPE 39 23 23 6 11 15 18 8 8

Figure S3.  Get High-res Image Gene #5: 'STK11 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'MRNASEQ_CNMF'

'KEAP1 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CNMF'

P value = 1.71e-05 (Chi-square test), Q value = 0.028

Table S4.  Gene #6: 'KEAP1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'MRNASEQ_CNMF'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3 CLUS_4 CLUS_5 CLUS_6 CLUS_7 CLUS_8 CLUS_9
ALL 39 23 27 14 11 17 23 8 8
KEAP1 MUTATED 2 0 6 8 3 2 10 1 0
KEAP1 WILD-TYPE 37 23 21 6 8 15 13 7 8

Figure S4.  Get High-res Image Gene #6: 'KEAP1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'MRNASEQ_CNMF'

'KEAP1 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

P value = 4.63e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.074

Table S5.  Gene #6: 'KEAP1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3
ALL 61 57 52
KEAP1 MUTATED 9 3 20
KEAP1 WILD-TYPE 52 54 32

Figure S5.  Get High-res Image Gene #6: 'KEAP1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

'MUC7 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

P value = 9.61e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.15

Table S6.  Gene #13: 'MUC7 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3
ALL 61 57 52
MUC7 MUTATED 1 2 12
MUC7 WILD-TYPE 60 55 40

Figure S6.  Get High-res Image Gene #13: 'MUC7 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

'CSMD3 MUTATION STATUS' versus 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

P value = 1.11e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.018

Table S7.  Gene #19: 'CSMD3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

nPatients CLUS_1 CLUS_2 CLUS_3
ALL 61 57 52
CSMD3 MUTATED 13 33 31
CSMD3 WILD-TYPE 48 24 21

Figure S7.  Get High-res Image Gene #19: 'CSMD3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'MRNASEQ_CHIERARCHICAL'

Methods & Data
Input

  • Mutation data file = LUAD-TP.mutsig.cluster.txt

  • Molecular subtypes file = LUAD-TP.transferedmergedcluster.txt

  • Number of patients = 172

  • Number of significantly mutated genes = 158

  • Number of Molecular subtypes = 12

  • Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3

Fisher's exact test

For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R

Chi-square test

For multi-class clinical features (nominal or ordinal), Chi-square tests (Greenwood and Nikulin 1996) were used to estimate the P values using the 'chisq.test' function in R

Q value calculation

For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.

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This is an experimental feature. The full results of the analysis summarized in this report can be downloaded from the TCGA Data Coordination Center.

References
[1] Fisher, R.A., On the interpretation of chi-square from contingency tables, and the calculation of P, Journal of the Royal Statistical Society 85(1):87-94 (1922)
[2] Greenwood and Nikulin, A guide to chi-squared testing, Wiley, New York. ISBN 047155779X (1996)
[3] Benjamini and Hochberg, Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing, Journal of the Royal Statistical Society Series B 59:289-300 (1995)
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