SampleName	CN_cNMF	Methlyation_cNMF	RPPA_cNMF	RPPA_cHierarchical	mRNAseq_cNMF	mRNAseq_cHierarchical	miRseq_cNMF	miRseq_cHierarchical	miRseq_Mature_cNMF	miRseq_Mature_cHierarchical
TCGA-OR-A5J1-01	1	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1
TCGA-OR-A5J2-01	1	2	1	1	2	1	2	2	2	2
TCGA-OR-A5J3-01	2	2	2	2	3	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5J4-01	3	1	NA	NA	NA	NA	1	1	2	1
TCGA-OR-A5J5-01	3	3	NA	NA	3	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5J6-01	1	4	3	3	4	3	1	3	1	1
TCGA-OR-A5J7-01	3	1	1	4	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5J8-01	1	4	4	5	1	3	2	4	3	3
TCGA-OR-A5J9-01	3	1	1	1	2	2	2	2	2	2
TCGA-OR-A5JA-01	3	3	2	2	3	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5JB-01	1	4	NA	NA	1	3	2	2	2	3
TCGA-OR-A5JC-01	3	3	NA	NA	3	2	3	1	3	3
TCGA-OR-A5JD-01	4	5	NA	NA	4	4	3	2	3	3
TCGA-OR-A5JE-01	1	1	NA	NA	1	1	1	4	1	1
TCGA-OR-A5JF-01	2	2	NA	NA	2	2	2	2	3	2
TCGA-OR-A5JG-01	3	3	NA	NA	3	2	1	4	1	1
TCGA-OR-A5JH-01	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5JI-01	4	3	NA	NA	4	4	3	3	3	3
TCGA-OR-A5JJ-01	2	3	NA	NA	2	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5JK-01	2	4	NA	NA	4	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5JL-01	4	5	NA	NA	3	4	1	3	1	1
TCGA-OR-A5JM-01	1	1	NA	NA	1	1	2	2	2	2
TCGA-OR-A5JO-01	1	4	NA	NA	4	3	3	3	3	3
TCGA-OR-A5JP-01	1	1	2	4	1	1	1	4	1	1
TCGA-OR-A5JQ-01	4	5	NA	NA	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5JR-01	2	4	3	6	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5JS-01	1	5	1	7	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5JT-01	2	4	4	3	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5JU-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5JV-01	1	4	3	7	3	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5JW-01	4	3	2	8	3	2	3	2	3	2
TCGA-OR-A5JX-01	2	3	NA	NA	2	2	3	1	3	3
TCGA-OR-A5JY-01	1	1	4	5	1	1	2	2	2	2
TCGA-OR-A5JZ-01	2	4	4	3	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5K0-01	1	1	1	1	1	1	2	2	2	2
TCGA-OR-A5K1-01	2	4	3	6	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5K2-01	1	1	NA	NA	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5K3-01	2	3	3	7	3	4	3	1	3	3
TCGA-OR-A5K4-01	2	4	1	7	3	4	1	1	1	1
TCGA-OR-A5K5-01	1	1	1	2	1	1	2	4	2	1
TCGA-OR-A5K6-01	1	2	2	8	1	1	1	5	2	1
TCGA-OR-A5K8-01	3	3	2	2	3	2	2	2	2	2
TCGA-OR-A5K9-01	1	1	NA	NA	1	1	1	4	1	1
TCGA-OR-A5KB-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5KO-01	4	2	2	2	3	2	1	3	1	1
TCGA-OR-A5KP-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5KQ-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5KS-01	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5KT-01	1	4	NA	NA	1	3	1	4	1	1
TCGA-OR-A5KU-01	2	3	4	5	2	2	2	2	2	2
TCGA-OR-A5KV-01	1	1	NA	NA	1	1	1	4	1	1
TCGA-OR-A5KW-01	2	2	2	2	3	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5KX-01	3	1	4	4	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5KY-01	3	3	1	2	2	2	2	2	2	2
TCGA-OR-A5KZ-01	4	1	1	1	1	1	1	1	1	1
TCGA-OR-A5L1-01	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5L2-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5L3-01	1	2	NA	NA	1	1	2	4	1	1
TCGA-OR-A5L4-01	2	4	NA	NA	3	4	1	3	1	1
TCGA-OR-A5L5-01	2	5	NA	NA	4	4	3	3	3	3
TCGA-OR-A5L6-01	2	3	NA	NA	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5L8-01	2	5	NA	NA	2	2	1	4	1	1
TCGA-OR-A5L9-01	2	4	NA	NA	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5LA-01	2	5	NA	NA	4	4	3	3	1	3
TCGA-OR-A5LB-01	3	3	NA	NA	2	2	1	5	2	1
TCGA-OR-A5LC-01	2	1	NA	NA	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5LD-01	1	1	1	1	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5LE-01	1	1	NA	NA	1	1	1	4	2	1
TCGA-OR-A5LF-01	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5LG-01	1	2	2	8	1	1	1	1	1	1
TCGA-OR-A5LH-01	4	5	3	7	3	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5LI-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-OR-A5LJ-01	3	2	1	1	2	1	2	4	1	1
TCGA-OR-A5LK-01	4	4	4	3	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5LL-01	1	2	2	8	4	1	3	5	3	1
TCGA-OR-A5LM-01	3	3	1	7	3	2	1	1	NA	NA
TCGA-OR-A5LN-01	4	5	3	6	4	4	3	3	3	3
TCGA-OR-A5LO-01	3	3	1	1	2	2	1	1	1	1
TCGA-OR-A5LP-01	2	5	3	3	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5LR-01	2	5	NA	NA	4	4	3	2	3	2
TCGA-OR-A5LS-01	3	3	1	1	2	2	1	4	1	1
TCGA-OR-A5LT-01	4	2	2	6	4	4	3	3	3	3
TCGA-OU-A5PI-01	3	3	4	8	2	2	1	5	1	1
TCGA-P6-A5OF-01	NA	3	NA	NA	2	2	1	1	1	1
TCGA-P6-A5OG-01	1	4	4	5	1	3	2	2	2	3
TCGA-P6-A5OH-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-PA-A5YG-01	2	4	3	3	4	4	3	2	3	2
TCGA-PK-A5H8-01	NA	3	3	7	3	4	1	3	NA	NA
TCGA-PK-A5H9-01	1	4	2	8	4	3	1	3	1	3
TCGA-PK-A5HA-01	1	3	3	3	4	4	3	2	3	2
TCGA-PK-A5HB-01	1	3	NA	NA	3	2	2	4	2	1
TCGA-PK-A5HC-01	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
