# Non-clustered (scattered) mutations all scattered mutation 
"Sample"	"A_T_coord_clusters"	"G_C_coord_clusters"	"Non_coord_clusters"	"clusters"	"mutations"	"complex"	"insertions"	"deletions"	"indels"	"substitutions"	"bases"	"A_to_T"	"A_to_G"	"A_to_C"	"A"	"a"	"T_to_A"	"T_to_C"	"T_to_G"	"T"	"t"	"G_to_C"	"G_to_T"	"G_to_A"	"G"	"g"	"C_to_G"	"C_to_A"	"C_to_T"	"C"	"c"	"tCw_to_G"	"tCw_to_A"	"tCw_to_T"	"tCw"	"tcw"	"tCw_per_mut"	"tCw_per_C"	"tcw_per_c"	"enrich_tCw"	"freq_tCw"	"wGa_to_C"	"wGa_to_T"	"wGa_to_A"	"wGa"	"wga"	"wGa_per_mut"	"wGa_per_G"	"wga_per_g"	"enrich_wGa"	"freq_wGa"	"[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut"	"tCw_to_G+tCw_to_T"	"[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]"	"tcw+wga"	"c-tcw"	"Fisher_p-value_tCw"	"BH_Fisher_p-value_tCw"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw"	"odds_ratio_tCw"	"95%_confidence_lower_tCw"	"95%_confidence_upper_tCw"	"APOBEC_enrich"	"tCw_to_G_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_G"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"odds_ratio_tCw_to_G"	"tCw_to_T_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_T"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"odds_ratio_tCw_to_T"	"p-value_GvT_skew"	"BH_p-value_GvT_skew"	"bonferroni_p-value_GvT_skew"	"non-APOBEC_mutations"	"non-APOBEC_substitutions"	"APOBEC_MutLoad_MinEstimate"
"TCGA-BA-4074-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	175	0	9	3	12	163	6683	7	10	6	23	1615	7	12	3	22	1691	8	6	40	54	1622	11	13	40	64	1755	7	0	2	9	256	0.0514285714285714	0.140625	0.145868945868946	0.96405029296875	0.03515625	3	0	5	8	216	0.0457142857142857	0.148148148148148	0.133168927250308	1.11248285322359	0.037037037037037	0.0971428571428571	17	82	472	2905	0.220931026050091	0.318891009298716	1	1.27586828214061	0.77359785343298	Inf	1.22857815442561	3.76561106155219	8.39352916973325e-05	0.000200657806713936	0.0256841992593837	6.8320814336121	0.626032838983051	0.941019598468334	1	1	0.590249545917925	0.493508292071659	0.836660120739913	1	158	146	0
"TCGA-BA-4075-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	205	0	6	11	17	181	7421	10	13	7	30	1783	4	10	5	19	1853	9	16	39	64	1797	9	18	41	68	1988	3	6	5	14	296	0.0682926829268293	0.205882352941176	0.148893360160966	1.38275039745628	0.0472972972972973	3	1	3	7	261	0.0341463414634146	0.109375	0.145242070116861	0.75305316091954	0.0268199233716475	0.0682926829268293	14	84	557	3228	0.591871971982644	0.68864191416992	1	0.965892627758644	0.558959210770424	Inf	0.970761733777892	2.26511071214841	0.0392051623946847	0.0593899984790768	1	2.89654025518431	0.679533213644524	0.91605226014785	1	1	0.643990501252776	0.744211505789411	1	1	191	167	0
"TCGA-BA-4076-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	381	1	2	9	11	364	14924	14	23	6	43	3652	20	23	4	47	3781	26	66	47	139	3755	30	69	36	135	3736	9	9	5	23	561	0.0603674540682415	0.17037037037037	0.150160599571734	1.13458770713673	0.0409982174688057	5	8	7	20	526	0.05249343832021	0.143884892086331	0.140079893475366	1.02716306042618	0.0380228136882129	0.068241469816273	26	113	1087	6404	0.105063108531922	0.168321001103498	1	1.35549166947363	0.911546691423869	Inf	1.28904714315025	1.72286108555658	0.0272675971132701	0.0434577328992742	1	1.96368032023469	0.996353398876093	0.553407841500466	0.850968841704234	1	0.995737570716432	0.814687341665291	1	1	355	338	0
"TCGA-BA-4077-01B-01D-1434-08"	0	0	0	0	365	1	2	10	12	347	14227	0	7	1	8	3468	5	11	2	18	3478	60	25	69	154	3679	66	15	86	167	3602	51	3	45	99	565	0.271232876712329	0.592814371257485	0.156857301499167	3.77932277038843	0.175221238938053	44	17	41	102	587	0.279452054794521	0.662337662337662	0.159554226692036	4.15117591097148	0.173764906303237	0.495890410958904	181	100	1152	6129	5.07413084191936e-71	1.72520448625258e-69	1.55268403762732e-68	9.62627538326378	7.73648973266643	Inf	4.07109096975089	4.76531498015873	2.08051230312101e-48	5.30530637295858e-47	6.36636764755029e-46	16.2943422688913	3.50675403225806	8.6755466935218e-29	2.94968587579741e-27	2.65471728821767e-26	6.62851732670902	0.422597738827865	0.777817589386625	1	184	166	137
"TCGA-BA-4078-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	504	1	5	12	17	481	19721	20	28	7	55	4815	23	26	9	58	4800	23	86	77	186	4918	29	80	73	182	5188	3	6	11	20	668	0.0396825396825397	0.10989010989011	0.12875867386276	0.853457919326183	0.029940119760479	7	10	15	32	674	0.0634920634920635	0.172043010752688	0.137047580317202	1.2553524137711	0.0474777448071217	0.0714285714285714	36	166	1342	8764	0.0418927783202369	0.0758531962484763	1	1.41620658527688	1.01699810164336	Inf	1.3420784701421	1.44818296457641	0.145863327973602	0.185204059584739	1	1.55480796536563	1.3052955787382	0.0949984731679354	0.222958635849981	1	1.36925941449744	0.00178733523855346	0.0215924426450742	0.546924582997359	468	445	0
"TCGA-BA-5149-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	141	1	1	7	8	129	5289	5	10	4	19	1286	7	6	5	18	1328	11	9	25	45	1351	14	11	22	47	1324	9	2	4	15	195	0.106382978723404	0.319148936170213	0.147280966767372	2.16693944353519	0.0769230769230769	8	2	2	12	196	0.0851063829787234	0.266666666666667	0.145077720207254	1.83809523809524	0.0612244897959184	0.163120567375887	23	49	391	2284	0.000203260024232443	0.000531603140300236	0.0621975674151276	2.74066973508363	1.7175576669549	Inf	2.18545751633987	4.65217391304348	2.77393253418608e-09	1.24826964038374e-08	8.4882335546094e-07	12.3935913546973	0.873374326603907	0.702023254890775	0.914123897857775	1	0.854890606787689	0.00537282891366783	0.0456690457661766	1	118	106	12
"TCGA-BA-5151-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	104	0	2	3	5	99	4059	1	3	1	5	927	2	7	2	11	911	4	7	35	46	1127	4	6	27	37	1094	3	1	4	8	119	0.0769230769230769	0.216216216216216	0.108775137111517	1.98773563479446	0.0672268907563025	0	3	4	7	144	0.0673076923076923	0.152173913043478	0.127772848269743	1.19097222222222	0.0486111111111111	0.105769230769231	11	59	263	1958	0.208012743215827	0.305645061366309	1	1.38779947865621	0.733916437990988	Inf	1.3270505160239	3.16682509505703	0.059612748800287	0.0844513941337399	1	4.46228628713184	1.08966024776156	0.458501731721139	0.758386648144154	1	1.10293040883019	0.128135932033983	0.407604573217892	1	93	88	0
"TCGA-BA-5152-01A-02D-1870-08"	0	0	0	0	586	0	1	2	3	582	23862	2	2	2	6	5651	2	6	0	8	5917	114	17	151	282	6036	113	23	150	286	6258	78	9	77	164	981	0.279863481228669	0.573426573426573	0.156759348034516	3.65800560295973	0.167176350662589	93	6	93	192	927	0.327645051194539	0.680851063829787	0.153578528827038	4.43324382014735	0.207119741100324	0.581911262798635	341	187	1908	10386	2.87724559196811e-134	2.2010928778556e-132	8.80437151142242e-132	9.92333560914615	8.46768515162537	Inf	4.16136006289308	4.85383592386335	6.92473274803995e-87	5.30776757421118e-85	2.11896822090022e-84	16.6157100234227	3.63912743684573	1.19722623340422e-57	7.32702454843383e-56	3.66351227421691e-55	7.06223641028853	1	1	1	245	241	259
"TCGA-BA-5153-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	55	0	0	2	2	53	2173	2	6	0	8	497	3	1	1	5	492	2	2	22	26	617	1	1	12	14	567	0	0	2	2	63	0.0363636363636364	0.142857142857143	0.111111111111111	1.28571428571429	0.0317460317460317	0	0	1	1	84	0.0181818181818182	0.0384615384615385	0.13614262560778	0.282509157509158	0.0119047619047619	0.0545454545454545	3	34	147	1037	0.85340092193084	0.897390660174698	1	0.622653960385349	0.160283458096294	Inf	0.653061224489796	0	1	1	1	0	0.710684273709484	0.810859202325064	0.973851583194362	1	0.682873249907335	0.1	0.355813953488372	1	52	50	0
"TCGA-BA-5555-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	157	0	3	4	7	149	6109	6	11	2	19	1502	9	9	4	22	1462	7	17	30	54	1547	9	21	24	54	1598	4	4	1	9	219	0.0573248407643312	0.166666666666667	0.137046307884856	1.21613394216134	0.0410958904109589	2	2	2	6	205	0.0382165605095541	0.111111111111111	0.13251454427925	0.838482384823848	0.0292682926829268	0.0573248407643312	9	61	424	2721	0.61414140731828	0.706493498644337	1	0.946844871250357	0.47052809466572	Inf	0.953672506738544	2.78154481132075	0.0147030882796843	0.0239316224126776	1	3.84754912745107	0.41208071278826	0.98180897545558	1	1	0.377577299171438	0.426986506746627	0.777817589386625	1	148	140	0
"TCGA-BA-5556-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	164	0	4	1	5	157	6437	10	13	0	23	1618	7	14	2	23	1582	6	8	32	46	1575	9	12	44	65	1662	4	2	7	13	215	0.0792682926829268	0.2	0.129362214199759	1.54604651162791	0.0604651162790698	2	4	2	8	214	0.0487804878048781	0.173913043478261	0.135873015873016	1.27996749288907	0.0373831775700935	0.0914634146341463	15	76	429	2808	0.225335042223019	0.320709408931367	1	1.29175618253557	0.756904939436858	Inf	1.24375624375624	3.01818181818182	0.00954042659927416	0.0161291190020878	1	4.36084221388077	0.893540669856459	0.69148102586159	0.912039628938132	1	0.87929730280196	0.520396573355145	0.851558029126601	1	149	142	0
"TCGA-BA-5557-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	58	1	0	2	2	55	2255	2	3	1	6	538	1	2	0	3	540	3	0	20	23	582	6	4	13	23	595	3	0	4	7	80	0.120689655172414	0.304347826086957	0.134453781512605	2.26358695652174	0.0875	3	0	3	6	78	0.103448275862069	0.260869565217391	0.134020618556701	1.94648829431438	0.0769230769230769	0.224137931034483	13	29	158	1019	0.00324312299215937	0.00708854025429119	0.992395635600767	2.88762118214742	1.51845956104402	Inf	2.30575647980711	4.9662447257384	0.000376415883586465	0.000828656549478117	0.115183260377458	12.8494392158138	1.58016877637131	0.151319475057285	0.326528159798072	1	1.73541458229607	1	1	1	45	42	7
"TCGA-BA-5558-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	187	0	1	3	4	183	7503	1	4	1	6	1759	2	2	0	4	1808	22	5	62	89	1989	19	8	57	84	1947	13	3	25	41	274	0.219251336898396	0.488095238095238	0.140729327170005	3.46832638164755	0.14963503649635	14	0	29	43	276	0.229946524064171	0.48314606741573	0.138763197586727	3.48180263800684	0.155797101449275	0.433155080213904	81	79	550	3386	1.3788346527614e-26	1.40641134581663e-25	4.21923403744988e-24	6.30771858162585	4.74750567033677	Inf	3.62290909090909	4.71272727272727	6.36824445810441e-14	4.23626696560859e-13	1.94868280417995e-11	11.8602924858075	3.24742551566081	6.09574356062149e-16	9.81735541868514e-15	1.86529752955018e-13	5.11141804231016	5.21586136312384e-05	0.00122773352085838	0.015960535771159	106	102	59
"TCGA-BA-5559-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	92	0	0	2	2	90	3690	1	9	1	11	935	1	3	0	4	877	7	4	35	46	904	6	9	14	29	974	4	4	2	10	154	0.108695652173913	0.344827586206897	0.158110882956879	2.18092252575011	0.0649350649350649	4	0	5	9	121	0.0978260869565217	0.195652173913043	0.133849557522124	1.46173194394538	0.0743801652892562	0.16304347826087	15	47	275	1603	0.0347513849653475	0.0644480230266445	1	1.85956035617184	1.05889639477737	Inf	1.65219941348974	4.20251748251748	0.000148734876190901	0.000339837380086291	0.0455128721144157	9.30808833342857	0.975584415584416	0.591077629168746	0.863503510876077	1	0.971526393547187	1	1	1	77	75	0
"TCGA-BA-6868-01B-12D-1912-08"	0	0	0	0	184	1	4	6	10	173	7093	6	15	4	25	1732	3	18	6	27	1771	19	16	30	65	1800	19	9	28	56	1790	7	1	6	14	262	0.0760869565217391	0.25	0.146368715083799	1.70801526717557	0.0534351145038168	11	2	9	22	270	0.119565217391304	0.338461538461538	0.15	2.25641025641026	0.0814814814814815	0.179347826086957	33	63	532	3058	2.23114393965087e-06	7.7582959719678e-06	0.000682730045533166	3.00968088842755	2.0356636748228	Inf	2.31966635338346	3.19647803719826	2.35426139665973e-06	7.24752141348455e-06	0.000720403987377877	5.16978363131086	1.74520352605652	0.0208021496930079	0.0684457828608647	1	2.00473895524325	0.636530620286469	0.955779514603044	1	151	140	19
"TCGA-BA-6869-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	535	0	5	13	18	511	20951	31	24	8	63	4988	30	23	6	59	5037	46	77	75	198	5388	46	91	54	191	5538	13	13	9	35	757	0.0654205607476635	0.183246073298429	0.136691946551101	1.34057695366803	0.0462351387054161	11	7	12	30	683	0.0560747663551402	0.151515151515152	0.126763177431329	1.19526154665247	0.0439238653001464	0.0841121495327103	45	176	1440	9486	0.00213641537747216	0.00470318780939914	0.653743105506481	1.68420486656219	1.24938964708841	Inf	1.54496606334842	1.97934782608696	0.00072533081039619	0.00149967045933266	0.221951227981234	2.32465997938691	1.23517441860465	0.181588149437164	0.375445768430893	1	1.28087007787016	0.712573901733867	1	1	490	466	16
"TCGA-BA-6870-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	110	0	5	5	10	96	3936	4	13	2	19	1047	0	13	2	15	970	3	5	20	28	945	5	11	18	34	974	1	2	9	12	161	0.109090909090909	0.352941176470588	0.165297741273101	2.13518450858604	0.0745341614906832	3	3	4	10	166	0.0909090909090909	0.357142857142857	0.175661375661376	2.03313253012048	0.0602409638554217	0.154545454545455	17	29	327	1592	0.00116529282937607	0.00274292004453136	0.356579605789077	2.85176848722896	1.61222688939068	Inf	2.1687940433453	2.93425076452599	0.0336430069389729	0.051732462931285	1	4.86271846424622	2.00764525993884	0.00872953046438891	0.0321835701458194	1	2.53003059848123	0.0121573934501515	0.0907356681889356	1	93	79	9
"TCGA-BA-6871-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	162	0	2	3	5	157	6437	5	7	4	16	1552	2	6	1	9	1630	19	7	41	67	1602	26	14	25	65	1653	17	4	9	30	261	0.185185185185185	0.461538461538462	0.157894736842105	2.92307692307692	0.114942528735632	12	1	11	24	226	0.148148148148148	0.358208955223881	0.141073657927591	2.5391625941091	0.106194690265487	0.302469135802469	49	62	487	2768	6.62497214938207e-13	4.13722750553248e-12	2.02724147771091e-10	4.48926983410622	3.1782843469859	Inf	2.95049669792996	4.30732375085558	1.16241678754509e-13	7.25917422426117e-13	3.55699536988798e-11	10.2900078543492	2.0253873436625	0.00135770041227272	0.00649150509617894	0.415456326155452	2.47048392714701	0.121648268711617	0.39600393857186	1	113	108	32
"TCGA-BA-6872-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	192	1	2	11	13	176	7216	5	16	5	26	1757	2	14	4	20	1853	14	16	40	70	1852	16	8	36	60	1754	9	1	9	19	269	0.0989583333333333	0.316666666666667	0.153363740022805	2.06480793060719	0.0706319702602231	7	3	13	23	258	0.119791666666667	0.328571428571429	0.139308855291577	2.35858250276855	0.0891472868217054	0.197916666666667	38	68	527	3079	8.73945513196252e-08	3.71426843108407e-07	2.67427327038053e-05	3.26347366088904	2.25967942960018	Inf	2.45297339873259	3.64933586337761	9.39761550903593e-07	3.05922377209042e-06	0.000287567034576499	6.67150443278481	1.98072505742535	0.00114320823942371	0.00573478231579763	0.349821721263655	2.37949919892574	0.272990530844651	0.618778536581209	1	154	138	23
"TCGA-BA-6873-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	79	0	1	6	7	72	2952	0	3	0	3	681	2	6	2	10	673	3	3	22	28	825	4	4	23	31	773	2	2	5	9	94	0.113924050632911	0.290322580645161	0.121604139715395	2.38743994509266	0.0957446808510638	2	0	1	3	104	0.0379746835443038	0.107142857142857	0.126060606060606	0.849931318681319	0.0288461538461538	0.126582278481013	10	42	198	1400	0.109192532162097	0.172384873035317	1	1.68286265960127	0.84534071641924	Inf	1.55205905205905	4.61183261183261	0.00626720959698606	0.0112809772745749	1	9.40596706148413	1.07609427609428	0.493756599951807	0.786924581173192	1	1.08777105048774	0.680172297752053	0.986411010010086	1	69	62	0
"TCGA-BA-7269-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	111	0	2	4	6	103	4223	2	12	2	16	1013	3	8	2	13	1021	8	9	22	39	1048	7	10	18	35	1141	3	3	3	9	158	0.0810810810810811	0.257142857142857	0.138475021910605	1.85696202531646	0.0569620253164557	4	1	3	8	147	0.0720720720720721	0.205128205128205	0.140267175572519	1.46241060526775	0.054421768707483	0.117117117117117	13	42	305	1884	0.0390570530600941	0.0711396323594571	1	1.91136931365983	1.04315883712631	Inf	1.69639344262295	3.34928961748634	0.002472360625587	0.00469902081633306	0.756542351429622	5.3983476202279	1.07655737704918	0.493038711340827	0.786924581173192	1	1.09005031033484	1	1	1	98	90	0
"TCGA-BB-4217-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	34	0	1	5	6	28	1148	1	2	0	3	282	1	4	1	6	292	0	1	7	8	283	0	3	8	11	291	0	0	1	1	40	0.0294117647058824	0.0909090909090909	0.13745704467354	0.661363636363636	0.025	0	0	2	2	37	0.0588235294117647	0.25	0.130742049469965	1.91216216216216	0.0540540540540541	0.0882352941176471	3	12	77	497	0.333342814789011	0.44157100140882	1	1.61209116230873	0.380664791562411	Inf	1.49090909090909	NA	1	1	1	0	1.49090909090909	0.333342814789011	0.60001706662022	1	1.61209116230873	0.1	0.355813953488372	1	31	25	0
"TCGA-BB-4223-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	340	0	3	1	4	336	13776	2	4	0	6	3352	1	4	1	6	3444	73	10	97	180	3440	69	5	70	144	3540	55	4	35	94	542	0.276470588235294	0.652777777777778	0.153107344632768	4.26353013530135	0.173431734317343	59	4	65	128	577	0.376470588235294	0.711111111111111	0.167732558139535	4.23955324475255	0.221837088388215	0.629411764705882	214	95	1119	5861	9.91539322912918e-91	3.79263791014191e-89	3.03411032811353e-88	11.7924471335665	9.5004592931082	Inf	4.3199689968216	5.00774081486236	4.6565909415886e-62	2.03559546875159e-60	1.42491682812611e-59	21.3056768563246	3.73515703178094	2.10389318478478e-36	8.04739143180178e-35	6.43791314544143e-34	7.81450185018034	0.216895314157379	0.548512116794694	1	126	122	164
"TCGA-BB-4224-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	94	0	0	6	6	87	3567	1	1	1	3	839	2	3	1	6	832	7	9	25	41	970	10	4	23	37	926	7	2	7	16	117	0.170212765957447	0.432432432432432	0.126349892008639	3.42249942249942	0.136752136752137	4	4	6	14	130	0.148936170212766	0.341463414634146	0.134020618556701	2.54784240150094	0.107692307692308	0.25531914893617	24	41	247	1649	1.73767999860218e-06	6.18290790200311e-06	0.000531730079572267	3.90424480258143	2.41869156577322	Inf	2.83425724073497	4.96689688020957	1.28926521746711e-06	4.15279112152564e-06	0.000394515156544936	12.2107275936668	2.07894736842105	0.00799961485403588	0.0305985268166872	1	2.4781147074983	0.792494242590731	1	1	70	63	16
"TCGA-BB-4225-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	93	0	0	0	0	93	3813	1	3	1	5	830	0	3	0	3	824	0	1	36	37	1047	3	3	42	48	1112	0	1	10	11	121	0.118279569892473	0.229166666666667	0.108812949640288	2.10606060606061	0.0909090909090909	0	0	7	7	113	0.0752688172043011	0.189189189189189	0.10792741165234	1.75292992107151	0.0619469026548673	0.182795698924731	17	64	234	1925	0.00671553989194763	0.0141721048754205	1	2.18416464391057	1.30033038827276	Inf	1.93642502901762	0	1	1	1	0	2.01090291474907	0.00454326404140049	0.018536517288914	1	2.29141089283727	4.18726539537102e-09	3.20325802745883e-07	1.28130321098353e-06	76	76	8
"TCGA-BB-4227-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	306	1	2	10	12	292	11972	2	6	0	8	2974	2	6	4	12	2857	59	14	58	131	3052	78	4	59	141	3089	54	1	34	89	445	0.290849673202614	0.631205673758865	0.144059566202655	4.38156028368794	0.2	40	6	28	74	422	0.241830065359477	0.564885496183206	0.13826998689384	4.08538041315437	0.175355450236967	0.509803921568627	156	98	867	5274	1.37622362350969e-63	3.82840389812696e-62	4.21124428793965e-61	9.67700168188537	7.70279474923301	Inf	4.35021660354739	4.85989947718031	5.32962776847675e-46	1.25451238242607e-44	1.63086609715389e-43	13.2885196785051	3.75340845237039	2.05040450031123e-22	5.22853147579364e-21	6.27423777095236e-20	6.85380749603476	0.000567445265824592	0.00913885533380659	0.173638251342325	150	136	120
"TCGA-BB-4228-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	49	0	0	2	2	47	1927	1	2	0	3	450	1	1	0	2	442	1	4	13	18	508	3	3	18	24	527	3	0	3	6	62	0.122448979591837	0.25	0.117647058823529	2.125	0.0967741935483871	0	2	1	3	69	0.0612244897959184	0.166666666666667	0.135826771653543	1.22705314009662	0.0434782608695652	0.142857142857143	7	28	131	904	0.153493160675271	0.232519342409074	1	1.72413197836059	0.734173406670261	Inf	1.58015267175573	5.92557251908397	0.00761598397945605	0.0132414266915543	1	20.5904344478835	1.0194533366166	0.566975526295818	0.857078526644577	1	1.02231638037764	1	1	1	42	40	0
"TCGA-BB-7861-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	31	0	1	12	13	18	738	0	0	0	0	150	1	2	0	3	157	0	0	9	9	238	1	1	4	6	193	0	0	1	1	30	0.032258064516129	0.166666666666667	0.155440414507772	1.07222222222222	0.0333333333333333	0	0	2	2	18	0.0645161290322581	0.222222222222222	0.0756302521008403	2.93827160493827	0.111111111111111	0.0967741935483871	3	11	48	383	0.208757574593329	0.305645061366309	1	2.17116423874692	0.501773364984422	Inf	1.92410714285714	0	1	1	1	0	2.07211538461538	0.178661923719198	0.37198200372901	1	2.38737175366929	0.1	0.355813953488372	1	28	15	0
"TCGA-BB-7862-01A-21D-2229-08"	0	0	0	0	443	0	5	22	27	411	16851	19	19	6	44	4168	26	25	5	56	4060	20	55	70	145	4319	27	69	70	166	4304	6	10	6	22	565	0.0496613995485327	0.132530120481928	0.131273234200743	1.00957458151189	0.0389380530973451	4	9	9	22	616	0.0496613995485327	0.151724137931034	0.142625607779579	1.06379310344828	0.0357142857142857	0.0564334085778781	25	162	1181	7442	0.584061648937997	0.684761933237652	1	0.972445024109535	0.65642505890799	Inf	0.976128269797643	1.55349775703965	0.102209298932435	0.135394136248161	1	1.70296103808579	0.782297084794968	0.875959943288125	1	1	0.756195093884617	0.344577573684652	0.722196832517147	1	418	386	0
"TCGA-BB-7863-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	73	0	1	7	8	65	2665	0	2	0	2	573	1	0	0	1	596	2	1	29	32	698	3	4	23	30	798	1	0	2	3	76	0.0410958904109589	0.1	0.0952380952380952	1.05	0.0394736842105263	2	1	1	4	84	0.0547945205479452	0.125	0.120343839541547	1.03869047619048	0.0476190476190476	0.0821917808219178	6	51	160	1336	0.582017688489681	0.684761933237652	1	0.982363477214791	0.404507559502292	Inf	0.984210526315789	5.61	0.0106642326496846	0.0178319955781611	1	12.4822339316899	0.539423076923077	0.925171843969353	1	1	0.511398156716713	1	1	1	67	59	0
"TCGA-BB-7864-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	97	0	4	12	16	80	3280	4	3	1	8	763	0	5	2	7	717	2	9	21	32	885	2	6	25	33	915	1	0	1	2	106	0.0206185567010309	0.0606060606060606	0.115846994535519	0.523156089193825	0.0188679245283019	1	2	3	6	103	0.0618556701030928	0.1875	0.11638418079096	1.61104368932039	0.058252427184466	0.0618556701030928	6	44	209	1591	0.53347277351914	0.650369197995446	1	1.0380458562034	0.426124540933165	Inf	1.03349282296651	4.30622009569378	0.0696447057556965	0.0960745097357189	1	7.59665525516786	0.748907842729353	0.796317511868169	0.973851583194362	1	0.725106905732851	0.608391608391609	0.935516744561972	1	91	74	0
"TCGA-BB-7866-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	69	0	3	3	6	63	2583	0	2	3	5	559	2	2	0	4	672	5	5	17	27	657	5	2	20	27	695	4	1	5	10	111	0.144927536231884	0.37037037037037	0.159712230215827	2.31898565231899	0.0900900900900901	3	1	8	12	99	0.173913043478261	0.444444444444444	0.150684931506849	2.94949494949495	0.121212121212121	0.289855072463768	20	27	210	1142	1.42575789379981e-05	4.31962292576972e-05	0.00436281915502742	4.02252619642859	2.31694407318072	Inf	2.73961499493414	4.50666666666667	0.000186176844001003	0.000418897899002257	0.0569701142643069	12.650084527337	2.26203346203346	0.00322105156920822	0.014494732061437	0.985641780177715	2.94252871132881	0.129207985627894	0.407604573217892	1	49	43	13
"TCGA-BB-7870-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	76	0	1	6	7	67	2747	4	6	1	11	683	2	5	0	7	678	6	14	8	28	710	2	8	11	21	676	0	2	1	3	104	0.0394736842105263	0.142857142857143	0.153846153846154	0.928571428571428	0.0288461538461538	2	1	1	4	103	0.0526315789473684	0.142857142857143	0.145070422535211	0.984743411927878	0.0388349514563107	0.0526315789473684	4	23	207	1179	0.59080480865686	0.68864191416992	1	0.990554484955014	0.310918858995656	Inf	0.99194847020934	1.67391304347826	0.342645537843405	0.403267440692623	1	1.89739538850277	0.704805491990847	0.799417066526112	0.973851583194362	1	0.670244190731714	1	1	1	72	63	0
"TCGA-BB-7871-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	420	1	8	15	23	391	16031	17	21	4	42	3830	21	15	4	40	3871	32	64	65	161	4067	42	61	45	148	4263	21	5	9	35	587	0.0833333333333333	0.236486486486486	0.137696457893502	1.71744785671532	0.0596252129471891	14	9	11	34	516	0.080952380952381	0.211180124223602	0.126874846324072	1.66447590158409	0.0658914728682171	0.130952380952381	55	129	1103	7227	4.98362496110375e-09	2.38279568452773e-08	1.52498923809775e-06	2.79307714200547	2.09593832514537	Inf	2.2574303283535	3.57195363995001	1.91907773773149e-12	1.04863890668899e-11	5.87237787745836e-10	5.87808153122765	1.37311464600676	0.0884605920315322	0.213141268989361	1	1.45595045669822	0.0145768531359507	0.106202787133355	1	365	336	31
"TCGA-BB-7872-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	75	0	6	12	18	57	2337	3	1	2	6	539	1	2	1	4	562	7	3	14	24	592	3	2	18	23	644	2	0	1	3	70	0.04	0.130434782608696	0.108695652173913	1.2	0.0428571428571429	5	0	3	8	82	0.106666666666667	0.333333333333333	0.138513513513514	2.40650406504065	0.0975609756097561	0.146666666666667	11	31	152	1084	0.0126609696981724	0.0253219393963448	1	2.52792575848572	1.27597773153338	Inf	2.1296992481203	5.69210526315789	4.18554389158485e-05	0.000104128165107721	0.0128077643082496	16.5674791682088	1.01644736842105	0.568584774211925	0.857078526644577	1	1.01878374941762	0.394855918075732	0.755555555555556	1	64	46	6
"TCGA-CN-4723-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	1040	4	3	9	12	1022	41902	6	12	2	20	10296	4	12	4	20	10498	212	42	230	484	10414	219	31	248	498	10694	163	13	135	311	1736	0.299038461538462	0.624497991967871	0.162334019076117	3.84699396665001	0.179147465437788	164	17	118	299	1670	0.2875	0.617768595041322	0.160361052429422	3.85236056811996	0.179041916167665	0.557692307692308	580	329	3406	17702	3.5399454074018e-215	1.08322329466495e-212	1.08322329466495e-212	9.16232543893643	8.12648287472081	Inf	3.95427211540884	4.70189497720006	9.37667733818969e-161	2.86926326548605e-158	2.86926326548605e-158	16.3402404195492	3.28016028814521	6.90534301865711e-74	1.05651748185454e-71	2.11303496370908e-71	5.84340051353551	2.79172492372415e-05	0.000711889855549658	0.0085426782665959	460	442	433
"TCGA-CN-4725-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	73	0	2	4	6	67	2747	1	2	2	5	588	1	3	2	6	686	2	5	21	28	741	4	5	19	28	732	0	2	1	3	90	0.0410958904109589	0.107142857142857	0.122950819672131	0.871428571428571	0.0333333333333333	0	1	1	2	81	0.0273972602739726	0.0714285714285714	0.109311740890688	0.653439153439153	0.0246913580246914	0.0273972602739726	2	44	171	1302	0.975005748681093	0.994505863654715	1	0.346256190208219	0.0592199727231655	Inf	0.374523264683448	0	1	1	1	0	0.430701754385965	0.954098210957419	1	1	0.400911098558135	0.444444444444444	0.789149902990866	1	71	65	0
"TCGA-CN-4726-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	97	2	2	2	4	91	3731	4	9	3	16	932	1	5	0	6	882	5	10	23	38	941	3	9	19	31	976	0	0	2	2	127	0.0206185567010309	0.0645161290322581	0.130122950819672	0.495808991617983	0.015748031496063	2	4	3	9	146	0.0927835051546392	0.236842105263158	0.155154091392136	1.52649603460707	0.0616438356164384	0.0721649484536082	7	43	273	1644	0.582319904258414	0.684761933237652	1	0.98033041041899	0.432505136656777	Inf	0.983076923076923	1.75549450549451	0.320166287793166	0.379732108777941	1	2.00646886011772	0.835949764521193	0.732734536779949	0.926515571300266	1	0.813860894276366	0.361455108359133	0.74141876430206	1	90	84	0
"TCGA-CN-4727-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	483	0	4	19	23	459	18819	15	16	3	34	4336	26	16	10	52	4534	36	83	77	196	5002	36	86	55	177	4947	3	8	10	21	654	0.0434782608695652	0.11864406779661	0.132201334141904	0.897449852278028	0.0321100917431193	6	10	8	24	601	0.0496894409937888	0.122448979591837	0.12015193922431	1.01911779686916	0.0399334442595674	0.0559006211180124	27	177	1255	8694	0.427537500063867	0.540605268675799	1	1.05674350700526	0.725180977656121	Inf	1.04922662292008	0.99093625498008	0.565162488485145	0.628871714459834	1	0.989642226609601	1.08102136906918	0.401420595087964	0.690082596050095	1	1.09383569913979	0.0647029094472603	0.300943509949406	1	456	432	0
"TCGA-CN-4728-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	155	0	6	4	10	144	5904	3	5	0	8	1395	3	10	3	16	1406	15	10	42	67	1557	13	7	33	53	1546	8	1	9	18	204	0.116129032258065	0.339622641509434	0.131953428201811	2.57380688124306	0.0882352941176471	8	1	9	18	199	0.116129032258065	0.26865671641791	0.127809890815671	2.10200255006375	0.0904522613065327	0.219354838709677	34	69	403	2700	2.50484848995758e-07	1.02197818390269e-06	7.6648363792702e-05	3.29959177409227	2.24732840890874	Inf	2.54166566286829	4.39985820630982	5.27914730515594e-08	1.99434453750335e-07	1.61541907537772e-05	8.92032875352135	1.84794044665012	0.0074467242706113	0.0288442737570514	1	2.11508150470736	0.813605446300754	1	1	121	110	21
"TCGA-CN-4729-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	174	0	2	8	10	160	6560	5	5	0	10	1622	7	8	0	15	1588	13	13	34	60	1692	19	13	43	75	1658	13	3	8	24	241	0.137931034482759	0.32	0.145355850422195	2.20149377593361	0.0995850622406639	7	1	6	14	228	0.0804597701149425	0.233333333333333	0.134751773049645	1.73157894736842	0.0614035087719298	0.195402298850575	34	75	469	2881	5.33114043637726e-06	1.71718839319099e-05	0.00163132897353144	2.78364021231075	1.90766733399852	Inf	2.22804718217562	4.46428571428571	4.64814032397164e-10	2.22239209239894e-09	1.42233093913532e-07	10.2258036537985	1.2987012987013	0.187571866516628	0.383575695481268	1	1.36493940362571	0.248582376642584	0.589660521338223	1	140	126	19
"TCGA-CN-4730-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	167	1	2	3	5	159	6519	6	8	2	16	1627	6	6	3	15	1644	23	10	32	65	1590	16	8	39	63	1658	14	2	9	25	261	0.149700598802395	0.396825396825397	0.157418576598311	2.52082953232379	0.0957854406130268	15	3	7	25	257	0.149700598802395	0.384615384615385	0.161635220125786	2.37952708769829	0.0972762645914397	0.269461077844311	45	65	518	2730	8.56107359454689e-10	4.36614753321891e-09	2.61968851993135e-07	3.64668968880078	2.56798520510444	Inf	2.56511056511057	4.66250866250866	1.65347167874e-15	1.29733931716523e-14	5.0596233369444e-13	15.2635656239412	1.41301865245527	0.0951399237283228	0.222958635849981	1	1.53294065942812	0.01542453034627	0.109765262464154	1	122	114	27
"TCGA-CN-4731-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	141	0	3	10	13	128	5248	4	9	1	14	1284	9	5	2	16	1238	8	8	24	40	1341	11	14	33	58	1385	6	2	9	17	173	0.120567375886525	0.293103448275862	0.124909747292419	2.34652182579231	0.0982658959537572	5	3	2	10	176	0.0709219858156028	0.25	0.131245339299031	1.90482954545455	0.0568181818181818	0.156028368794326	22	54	349	2377	0.000200294750174836	0.000528363737530171	0.0612901935534998	2.77340675154527	1.73334061398436	Inf	2.26104659930629	4.52209319861258	4.83204255885407e-06	1.36907872500865e-05	0.00147860502300935	9.3494966935789	1.50736439953753	0.109652804856611	0.250401181239724	1	1.62834582359686	1	1	1	119	106	12
"TCGA-CN-4733-01A-02D-1870-08"	0	0	0	0	48	0	0	2	2	46	1886	1	2	0	3	439	2	3	1	6	453	1	0	15	16	496	7	2	12	21	498	4	0	1	5	81	0.104166666666667	0.238095238095238	0.162650602409639	1.46384479717813	0.0617283950617284	1	0	3	4	71	0.0833333333333333	0.25	0.143145161290323	1.74647887323944	0.0563380281690141	0.1875	9	26	152	842	0.0817726215822405	0.135991425022639	1	1.91613676110872	0.894003043477361	Inf	1.68157894736842	4.08717105263158	0.00333709048197299	0.00622652248465692	1	9.20017845372855	0.968810916179337	0.611073462376735	0.870891327309468	1	0.963415623966147	1	1	1	39	37	0
"TCGA-CN-4734-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	189	0	2	4	6	183	7503	2	6	0	8	1769	0	4	2	6	1813	14	9	60	83	1893	25	12	49	86	2028	17	2	10	29	303	0.153439153439153	0.337209302325581	0.149408284023669	2.25696523140686	0.0957095709570957	11	1	11	23	221	0.121693121693122	0.27710843373494	0.116745905969361	2.37360300932236	0.104072398190045	0.259259259259259	49	99	524	3397	1.65027313579842e-09	8.14489644442446e-09	5.04983579554317e-07	3.20738256097522	2.33570997661829	Inf	2.4774216009903	5.37228420434527	2.20796107158231e-16	1.82604348082213e-15	6.75636087904187e-14	16.4801698187899	1.4416450731844	0.0558284128163534	0.156729305704625	1	1.54683881663201	0.238411233672273	0.578998710346949	1	140	134	29
"TCGA-CN-4735-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	172	1	0	2	2	165	6765	5	5	1	11	1652	3	7	1	11	1604	11	13	48	72	1775	16	9	46	71	1734	7	4	19	30	234	0.174418604651163	0.422535211267606	0.134948096885813	3.13109425785482	0.128205128205128	7	2	16	25	242	0.145348837209302	0.347222222222222	0.136338028169014	2.54677456382002	0.103305785123967	0.284883720930233	49	72	476	3033	8.48015662791569e-13	5.08809397674941e-12	2.5949279281422e-10	4.33400961228671	3.09805951835591	Inf	2.98529411764706	3.82244008714597	2.86064132566356e-06	8.66689352131732e-06	0.000875356245653049	6.85601540514988	2.74483729662078	1.48436181882093e-08	1.26170754599779e-07	4.54214716559205e-06	3.7780424963433	0.000104127437989409	0.00212419973498394	0.0318629960247592	123	116	33
"TCGA-CN-4736-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	104	0	0	2	2	102	4182	4	3	0	7	963	8	4	4	16	1021	1	8	25	34	1088	3	10	32	45	1110	1	3	7	11	180	0.105769230769231	0.244444444444444	0.162162162162162	1.50740740740741	0.0611111111111111	0	0	2	2	142	0.0192307692307692	0.0588235294117647	0.130514705882353	0.450704225352113	0.0140845070422535	0.0961538461538462	10	51	322	1876	0.406960624236726	0.521045820152461	1	1.14226536556224	0.582879296723485	Inf	1.11903064861012	1.70652173913043	0.470050840959515	0.528540940735988	1	1.94140576390771	1.07780320366133	0.462836947523625	0.761441429796931	1	1.09237229291131	0.0036074841836048	0.0334512169752445	1	94	92	0
"TCGA-CN-4737-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	58	0	0	3	3	55	2255	0	1	0	1	496	4	3	0	7	539	0	3	9	12	616	3	6	26	35	604	0	1	0	1	71	0.0172413793103448	0.0285714285714286	0.117549668874172	0.243058350100604	0.0140845070422535	0	1	1	2	76	0.0344827586206897	0.166666666666667	0.123376623376623	1.35087719298246	0.0263157894736842	0.0172413793103448	1	37	147	1073	0.992032044676536	1	1	0.197421435975695	0.00982369509654931	Inf	0.218403150733978	0	1	1	1	0	0.23712342079689	0.988397324046135	1	1	0.214837244485472	1	1	1	57	54	0
"TCGA-CN-4738-01A-02D-1512-08"	0	0	0	0	130	0	2	3	5	124	5084	2	7	3	12	1254	6	8	1	15	1263	7	13	40	60	1327	8	10	19	37	1240	4	1	3	8	173	0.0615384615384615	0.216216216216216	0.139516129032258	1.54975785033589	0.046242774566474	5	2	10	17	204	0.130769230769231	0.283333333333333	0.153730218538056	1.84305555555556	0.0833333333333333	0.169230769230769	22	52	377	2190	0.000878318037699334	0.00215012255628797	0.268765319535996	2.45670186476554	1.53259473517528	Inf	2.02430281740627	4.08541114058355	7.39732548333573e-05	0.000178234771488247	0.0226358159790073	8.70129442599592	1.50029222676797	0.0876971871918323	0.212978883180164	1	1.64130999530687	0.393063750550864	0.755555555555556	1	108	102	11
"TCGA-CN-4739-01A-02D-1512-08"	0	0	0	0	242	1	3	5	8	230	9430	12	16	3	31	2214	16	16	3	35	2286	17	26	47	90	2448	12	29	33	74	2482	5	5	3	13	313	0.0537190082644628	0.175675675675676	0.12610797743755	1.39305759433555	0.0415335463258786	5	3	6	14	325	0.0578512396694215	0.155555555555556	0.132761437908497	1.17169230769231	0.0430769230769231	0.0785123966942149	19	90	638	4292	0.111315412954621	0.173887000966374	1	1.42008648066675	0.887971137030681	Inf	1.34695579649708	2.66457680250784	0.00262386282949787	0.00495618534460709	0.802902025826348	3.53910947509385	0.869318181818182	0.722187976332388	0.923225978655291	1	0.852795152449004	1	1	1	223	211	0
"TCGA-CN-4740-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	176	0	3	3	6	170	6970	4	6	0	10	1631	3	5	2	10	1687	17	8	40	65	1824	18	10	57	85	1828	12	3	14	29	245	0.164772727272727	0.341176470588235	0.134026258205689	2.54559423769508	0.118367346938776	12	4	11	27	242	0.153409090909091	0.415384615384615	0.132675438596491	3.13083280356008	0.111570247933884	0.278409090909091	49	83	487	3165	1.82179788493403e-11	1.05183047696191e-10	5.57470152789813e-09	3.83430861137502	2.76524527967132	Inf	2.78370978781656	5.14215312408331	1.4597336135606e-13	8.7584016813636e-13	4.46678485749544e-11	14.1614189903285	1.93272507885434	0.000929070601261798	0.00490164834458811	0.28429560398611	2.25595131487884	1	1	1	127	121	31
"TCGA-CN-4741-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	200	1	0	1	1	198	8118	2	6	0	8	1987	2	9	2	13	2032	21	13	46	80	2067	19	15	63	97	2032	15	4	22	41	308	0.205	0.422680412371134	0.151574803149606	2.78859285044852	0.133116883116883	13	5	16	34	279	0.17	0.425	0.134978229317852	3.14865591397849	0.121863799283154	0.33	66	83	587	3512	8.05402337547992e-18	6.16132788224214e-17	2.46453115289686e-15	4.75505540750843	3.53494333730927	Inf	3.09312509289642	4.88807495741056	3.61484816420653e-15	2.765358845618e-14	1.1061435382472e-12	13.9442963952149	2.43442789490959	1.11535162334451e-07	8.98151570377421e-07	3.4129759674342e-05	3.2009086523583	0.138501943245908	0.423815946332478	1	134	132	45
"TCGA-CN-4742-01A-02D-1512-08"	0	0	0	0	100	0	2	5	7	93	3813	3	6	2	11	877	6	3	3	12	975	4	5	20	29	953	4	7	30	41	1008	2	0	4	6	148	0.06	0.146341463414634	0.146825396825397	0.996704021094265	0.0405405405405405	1	2	1	4	99	0.04	0.137931034482759	0.103882476390346	1.32776036224312	0.0404040404040404	0.08	8	50	247	1714	0.453253125765273	0.566103904017035	1	1.11026122329166	0.520845409856857	Inf	1.09507189724976	2.97722672064777	0.069635070178974	0.0960745097357189	1	4.15920034570478	0.793927125506073	0.770735105306619	0.962632417240104	1	0.771121330955002	0.649916646820672	0.956127374649642	1	92	85	0
"TCGA-CN-5355-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	126	0	5	4	9	117	4797	10	7	4	21	1242	5	7	2	14	1176	6	12	17	35	1199	7	19	21	47	1180	2	2	0	4	174	0.0317460317460317	0.0851063829787234	0.147457627118644	0.57715822939594	0.0229885057471264	1	2	1	4	162	0.0317460317460317	0.114285714285714	0.13511259382819	0.845855379188712	0.0246913580246914	0.0317460317460317	4	47	336	2043	0.941019407173807	0.969535146785135	1	0.517590489671842	0.169216378285415	Inf	0.555322128851541	1.63392857142857	0.276580771216842	0.334520616570568	1	1.8235436271208	0.186325187969925	0.996828998726877	1	1	0.164399124307235	0.569230769230769	0.893254437869822	1	122	113	0
"TCGA-CN-5356-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	412	1	7	11	18	389	15949	18	32	5	55	3929	23	34	7	64	4027	25	51	65	141	3917	26	41	62	129	4076	9	6	8	23	615	0.0558252427184466	0.178294573643411	0.150883218842002	1.18167265393584	0.0373983739837398	8	6	5	19	525	0.0461165048543689	0.134751773049645	0.134031146285423	1.00537656197231	0.0361904761904762	0.0728155339805825	30	148	1140	6853	0.190901270369865	0.286351905554798	1	1.2184793485434	0.847139161283906	Inf	1.18169722057954	2.33713450292398	0.000500704277247942	0.00107898245660472	0.15321550883787	3.0051231726718	0.717702721370355	0.927136789851814	1	1	0.685539902825606	0.49488719560106	0.836660120739913	1	382	359	0
"TCGA-CN-5358-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	63	0	0	2	2	61	2501	1	7	0	8	544	2	1	2	5	667	8	4	9	21	634	10	4	13	27	656	9	3	3	15	107	0.238095238095238	0.555555555555556	0.163109756097561	3.40602284527518	0.14018691588785	6	0	0	6	76	0.0952380952380952	0.285714285714286	0.1198738170347	2.38345864661654	0.0789473684210526	0.285714285714286	18	22	183	1107	4.30954835325488e-06	1.41798042590967e-05	0.00131872179609599	4.94032888698541	2.72151139376434	Inf	3.17213114754098	5.87431693989071	1.68230978711204e-10	8.43912778452925e-10	5.14786794856284e-08	30.1122663400528	0.961251862891207	0.623284969545011	0.870891327309468	1	0.955160230765176	0.000432977372123849	0.00736061532610543	0.132491075869898	45	43	12
"TCGA-CN-5359-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	176	0	2	7	9	166	6806	8	5	7	20	1583	7	10	5	22	1722	10	16	35	61	1795	7	16	40	63	1706	2	4	7	13	242	0.0738636363636364	0.206349206349206	0.141852286049238	1.45467663649482	0.0537190082644628	3	3	6	12	256	0.0681818181818182	0.19672131147541	0.142618384401114	1.37935450819672	0.046875	0.102272727272727	18	74	498	3003	0.101423580338825	0.16420960626286	1	1.46660504348212	0.897406026638595	Inf	1.37545835515977	2.06768249468462	0.0832650706743584	0.11175048958927	1	2.51165020613777	1.21855421686747	0.267990312543075	0.500030705110859	1	1.2642894616941	0.0377584473117958	0.206322944239456	1	158	148	0
"TCGA-CN-5360-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	576	0	2	17	19	549	22509	17	26	8	51	5419	30	34	6	70	5680	28	110	72	210	5537	32	110	76	218	5873	5	10	10	25	834	0.0434027777777778	0.114678899082569	0.142005789204836	0.807564957208545	0.0299760191846523	5	11	9	25	728	0.0434027777777778	0.119047619047619	0.131479140328698	0.905448717948718	0.0343406593406593	0.0503472222222222	29	179	1562	9848	0.489191047160971	0.608505936712427	1	1.02143819624766	0.710463511826322	Inf	1.01844898059687	1.21745625266752	0.303306773131119	0.361135690965457	1	1.26091486451178	0.937770356784441	0.653963419062856	0.885454894837318	1	0.928597046349074	0.0769383155180886	0.322508555459385	1	547	520	0
"TCGA-CN-5361-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	134	1	4	6	10	120	4920	2	9	2	13	1185	5	3	1	9	1174	10	11	34	55	1252	9	10	24	43	1309	3	2	8	13	183	0.0970149253731343	0.302325581395349	0.139801375095493	2.16253653577329	0.0710382513661202	6	3	7	16	185	0.119402985074627	0.290909090909091	0.14776357827476	1.96874692874693	0.0864864864864865	0.17910447761194	24	53	368	2193	0.000179230650019676	0.000485350255805494	0.0548445789060209	2.69734350661007	1.7108467738298	Inf	2.16911349520045	3.29648169336384	0.000656154611081348	0.00137522815747187	0.200783310990892	5.35786767304403	1.79980322338831	0.0164977675449737	0.0554760095468346	1	2.07809626451475	0.182057327024131	0.501887766390848	1	110	96	13
"TCGA-CN-5363-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	230	0	3	13	16	214	8774	12	13	4	29	2157	10	8	1	19	2178	18	23	31	72	2285	18	35	41	94	2154	5	4	7	16	304	0.0695652173913043	0.170212765957447	0.141132776230269	1.2060470324748	0.0526315789473684	8	1	2	11	328	0.0478260869565217	0.152777777777778	0.143544857768053	1.06432079945799	0.0335365853658537	0.0956521739130435	22	86	632	3807	0.0535875677095717	0.0942402052823502	1	1.54078195462488	0.99112057566183	Inf	1.43076066572902	2.53634845288326	0.000966547374276442	0.00197175664352394	0.295763496528591	3.40338649441122	0.877966772151899	0.712966667024907	0.923225978655291	1	0.860568818064409	0.40641912406288	0.762970870940131	1	208	192	0
"TCGA-CN-5364-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	157	0	4	3	7	150	6150	10	8	2	20	1483	4	13	1	18	1515	13	14	27	54	1578	10	11	37	58	1574	5	2	13	20	234	0.127388535031847	0.344827586206897	0.14866581956798	2.31948128499853	0.0854700854700855	7	2	7	16	207	0.101910828025478	0.296296296296296	0.131178707224335	2.25872249060655	0.0772946859903382	0.203821656050955	32	55	441	2711	1.70488388689385e-07	7.14649958067833e-07	5.21694469389518e-05	3.57468189614804	2.38201171993977	Inf	2.62892589986186	3.72907423839101	1.87323054138349e-05	4.89921833900297e-05	0.00573208545663348	6.69960151360432	2.23356009070295	0.000380430723945515	0.00211657820958777	0.116411801527328	2.79304255130418	0.096194465788964	0.355813953488372	1	125	118	20
"TCGA-CN-5365-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	98	0	3	4	7	91	3731	4	5	4	13	954	5	8	3	16	1015	5	10	22	37	864	9	7	9	25	898	1	3	2	6	149	0.0612244897959184	0.24	0.165924276169265	1.44644295302013	0.0402684563758389	2	3	7	12	144	0.122448979591837	0.324324324324324	0.166666666666667	1.94594594594595	0.0833333333333333	0.122448979591837	12	33	293	1469	0.0634693257125995	0.110980649531745	1	1.82240692762486	0.955999267681879	Inf	1.60364050056883	1.28863968795709	0.420715725633718	0.487647772893628	1	1.36709183387142	1.7458989320709	0.0629284450983759	0.170408001770823	1	2.05007134606483	0.0750357540123947	0.318901954552678	1	86	79	0
"TCGA-CN-5366-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	118	1	5	4	9	107	4387	4	2	1	7	1049	4	10	0	14	1097	11	6	40	57	1157	4	4	21	29	1084	3	1	4	8	154	0.0677966101694915	0.275862068965517	0.142066420664207	1.94178235557546	0.051948051948052	7	3	7	17	148	0.144067796610169	0.298245614035088	0.127917026793431	2.33155523944998	0.114864864864865	0.177966101694915	21	55	302	1939	0.00108824679211665	0.00260158998740387	0.333003518387695	2.45021084269677	1.51682703472113	Inf	2.05040955036598	4.94701986754967	3.53557015583782e-06	1.02064572423243e-05	0.00108188446768637	12.8153467859606	1.33812832482901	0.197819391726745	0.400879032240954	1	1.41227518374135	1	1	1	97	86	11
"TCGA-CN-5367-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	127	0	3	6	9	118	4838	3	17	5	25	1243	2	12	1	15	1168	12	10	24	46	1204	9	4	19	32	1223	2	0	1	3	186	0.0236220472440945	0.09375	0.152085036794767	0.616431451612903	0.0161290322580645	7	4	2	13	182	0.102362204724409	0.282608695652174	0.151162790697674	1.8695652173913	0.0714285714285714	0.094488188976378	12	52	368	2059	0.262452157488969	0.361758379241552	1	1.29103408483412	0.698738615726529	Inf	1.23658288043478	2.8264751552795	0.00232356855069621	0.00447177343718893	0.71101197651304	4.19282761629899	0.460123862487361	0.967465371228038	1	1	0.419740189928772	0.065892860021602	0.300943509949406	1	115	106	0
"TCGA-CN-5369-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	621	1	11	75	86	533	21853	4	20	3	27	5123	6	33	4	43	5302	47	21	166	234	5782	55	31	143	229	5646	37	7	28	72	785	0.115942028985507	0.314410480349345	0.139036486007793	2.26135232108586	0.0917197452229299	37	6	42	85	792	0.136876006441224	0.363247863247863	0.136976824628156	2.65189286022619	0.107323232323232	0.231884057971014	144	267	1577	9851	2.93885019144493e-26	2.90092954381338e-25	8.99288158582149e-24	3.36852246445674	2.80674408093595	Inf	2.53897958333526	5.25738868787845	1.32204184421813e-40	2.52840502706717e-39	4.04544804330748e-38	16.501612296891	1.64164065562198	2.3174562521779e-05	0.000150881194290731	0.00709141613166437	1.82942838724157	0.734095871492593	1	1	477	389	87
"TCGA-CN-5370-01A-01D-2012-08"	0	0	0	0	122	0	4	6	10	111	4551	1	6	1	8	1098	3	8	2	13	1051	11	5	32	48	1156	12	7	23	42	1246	7	2	2	11	157	0.0901639344262295	0.261904761904762	0.126003210272873	2.07855626326964	0.0700636942675159	6	1	11	18	171	0.147540983606557	0.375	0.147923875432526	2.53508771929825	0.105263157894737	0.213114754098361	26	52	328	2074	1.21591250721343e-05	3.83576522894134e-05	0.0037206922720731	3.15952304179608	2.02601159172485	Inf	2.44105691056911	4.13918345705196	2.04784208790909e-06	6.39428243775695e-06	0.000626639678900182	8.20687445364299	1.73093126385809	0.0337533926884278	0.103285381626589	1	1.95657989648072	1	1	1	96	85	15
"TCGA-CN-5373-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	179	0	4	6	10	168	6888	5	11	0	16	1591	6	14	0	20	1610	5	7	51	63	1829	8	10	51	69	1858	2	1	8	11	245	0.0614525139664804	0.159420289855072	0.131862217438106	1.20899142265602	0.0448979591836735	2	1	12	15	222	0.0837988826815642	0.238095238095238	0.121377802077638	1.96160446160446	0.0675675675675676	0.134078212290503	24	91	467	3220	0.0103230657136519	0.0212003899891106	1	1.81811355703036	1.18897361570278	Inf	1.64766781491481	2.4292538296821	0.0725326555976293	0.0995291148559398	1	3.0631370766126	1.54805391107192	0.032776395041331	0.102521850326435	1	1.68144528856346	1.69700778754334e-05	0.000472076711807511	0.00519284382988262	155	144	9
"TCGA-CN-5374-01A-01D-1434-08"	0	0	0	0	212	0	1	2	3	209	8569	0	7	2	9	2094	2	3	1	6	2106	24	13	62	99	2145	19	9	67	95	2224	14	0	30	44	332	0.207547169811321	0.463157894736842	0.149280575539568	3.10259987317692	0.132530120481928	13	5	19	37	324	0.174528301886792	0.373737373737374	0.151048951048951	2.47427983539095	0.114197530864198	0.358490566037736	76	96	656	3713	5.53714396629761e-19	4.4588580360186e-18	1.69436605368707e-16	4.47891875889048	3.40057107001088	Inf	2.94281764038571	4.18189875212706	1.8784351084039e-12	1.04509298758472e-11	5.74801143171593e-10	9.54327471517119	2.52979060313859	3.46110139900607e-10	3.65205871757192e-09	1.05909702809586e-07	3.46544571400332	0.000888448274276814	0.0129459605680336	0.271865171928705	136	133	50
"TCGA-CN-6010-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	188	0	1	4	5	176	7216	9	13	3	25	1731	14	12	3	29	1827	19	18	26	63	1802	12	23	24	59	1856	2	4	1	7	266	0.0372340425531915	0.11864406779661	0.143318965517241	0.827832292595897	0.0263157894736842	2	2	3	7	256	0.0372340425531915	0.111111111111111	0.142064372918979	0.782118055555555	0.02734375	0.0425531914893617	8	73	522	3136	0.905474724413555	0.942432876430435	1	0.658439051930688	0.315207036280976	Inf	0.692114847925831	0.904214559386973	0.664054236534526	0.728317549747545	1	0.890080138261726	0.560613026819923	0.938685504941451	1	1	0.522479872629594	1	1	1	180	168	0
"TCGA-CN-6011-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	407	2	3	3	6	397	16277	1	12	0	13	4150	5	11	6	22	4158	69	22	100	191	3911	70	8	93	171	4058	52	1	50	103	646	0.253071253071253	0.60233918128655	0.159191720059142	3.78373436170405	0.159442724458204	54	9	45	108	686	0.265356265356265	0.565445026178011	0.17540271030427	3.22369606032391	0.157434402332362	0.493857493857494	201	131	1332	6637	5.76541208284507e-68	1.76421609735059e-66	1.76421609735059e-65	7.64410168897627	6.27557224013025	Inf	3.62207614240747	4.56237172424223	2.24451842730981e-52	6.24384217051638e-51	6.86822638756802e-50	16.0020539556084	2.94486844357311	1.29626431122394e-24	3.60597162940478e-23	3.96656879234526e-22	4.82896509328574	0.329725502285222	0.708333333333333	1	206	196	146
"TCGA-CN-6012-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	139	0	3	4	7	132	5412	0	9	1	10	1288	1	9	2	12	1326	11	16	34	61	1466	15	8	26	49	1332	11	1	5	17	195	0.122302158273381	0.346938775510204	0.146396396396396	2.36985871271586	0.0871794871794872	7	5	9	21	221	0.151079136690647	0.344262295081967	0.15075034106412	2.28365848230843	0.0950226244343891	0.23021582733813	32	54	416	2382	5.15178724527394e-07	1.97055862131728e-06	0.000157644689705383	3.39114699474705	2.25527872698119	Inf	2.50268336314848	4.6564349112426	7.86706334406968e-10	3.7035713589005e-09	2.40732138328532e-07	12.8589724374474	1.56939102564103	0.0570734035395125	0.158767831664462	1	1.74227651545936	0.486131842360621	0.831041026605307	1	107	100	19
"TCGA-CN-6013-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	218	0	0	0	0	215	8815	2	3	4	9	2105	2	2	3	7	2252	21	2	73	96	2161	16	12	75	103	2297	9	5	32	46	371	0.211009174311927	0.446601941747573	0.161515019590771	2.76507994661503	0.123989218328841	19	1	35	55	309	0.252293577981651	0.572916666666667	0.142989356779269	4.00670846817691	0.177993527508091	0.435779816513761	95	90	680	3778	1.1441913346552e-28	1.20731913242928e-27	3.50122548404491e-26	5.86117459026407	4.50679909678936	Inf	3.36653418124006	4.96120826709062	6.30416235977107e-16	5.07650968971039e-15	1.92907368208995e-13	17.2697676482025	2.96786565977742	2.37438744923518e-17	4.03645866369981e-16	7.26562559465965e-15	4.59355472912537	5.8820859584445e-08	2.57131186183431e-06	1.79991830328402e-05	123	120	67
"TCGA-CN-6016-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	140	0	1	1	2	138	5658	5	12	0	17	1429	3	13	0	16	1381	9	4	32	45	1438	15	4	41	60	1410	13	1	11	25	213	0.178571428571429	0.416666666666667	0.151063829787234	2.75821596244131	0.117370892018779	5	3	7	15	221	0.107142857142857	0.333333333333333	0.153685674547983	2.16892911010558	0.0678733031674208	0.257142857142857	36	61	434	2414	2.14744459071067e-07	8.87997357780358e-07	6.57118044757465e-05	3.28078199122232	2.23596873182776	Inf	2.43546011687016	4.92165898617511	1.39077522703844e-10	7.09295365789604e-10	4.25577219473763e-08	16.6598117793625	1.61807966668771	0.025846834296817	0.0832540136297474	1	1.81989931125796	1	1	1	104	102	21
"TCGA-CN-6017-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	9	0	0	2	2	7	287	0	0	0	0	76	0	1	1	2	85	0	1	2	3	68	2	0	0	2	58	1	0	0	1	10	0.111111111111111	0.5	0.172413793103448	2.9	0.1	0	0	0	0	9	0	0	0.132352941176471	0	0	0.111111111111111	1	3	19	107	0.4917469856183	0.609208816191092	1	1.86611713417664	0.0691235764159693	Inf	1.65789473684211	3.31578947368421	0.289124015748032	0.346948818897638	1	5.51465037561497	0	1	1	1	0	1	1	1	8	6	0
"TCGA-CN-6018-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	127	0	2	5	7	119	4879	3	4	2	9	1045	0	6	0	6	1241	7	5	38	50	1279	11	5	38	54	1314	7	3	6	16	190	0.125984251968504	0.296296296296296	0.144596651445967	2.04912280701754	0.0842105263157895	4	0	7	11	152	0.0866141732283465	0.22	0.118842845973417	1.85118421052632	0.0723684210526316	0.188976377952756	24	70	342	2251	0.00122438444025256	0.00283834574785821	0.374661638717283	2.25575704042824	1.45276322941359	Inf	1.9357969391564	4.63336582196231	3.12175729328165e-06	9.36527187984495e-06	0.000955257731744185	10.3257686175172	1.29689904586026	0.20233318314558	0.40732864501676	1	1.35798863678936	0.784553146909804	1	1	103	95	12
"TCGA-CN-6019-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	149	0	2	3	5	142	5822	7	10	3	20	1373	11	7	3	21	1468	6	20	26	52	1425	5	14	30	49	1556	0	5	6	11	220	0.0738255033557047	0.224489795918367	0.141388174807198	1.58775510204082	0.05	1	2	4	7	167	0.0469798657718121	0.134615384615385	0.11719298245614	1.14866421004146	0.0419161676646707	0.0738255033557047	11	56	387	2594	0.252224670656018	0.352423512423477	1	1.31649709902045	0.697045677330004	Inf	1.26464576343091	0.700258397932817	0.783588284923455	0.853302545147962	1	0.670362023781211	1.37550756736803	0.188027301706504	0.383575695481268	1	1.45692909689484	0.00272789872344933	0.0260855315429842	0.834737009375495	138	131	0
"TCGA-CN-6020-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	182	0	0	4	4	177	7257	13	8	2	23	1844	7	7	2	16	1825	13	10	54	77	1804	13	14	34	61	1784	6	6	7	19	256	0.104395604395604	0.311475409836066	0.143497757847534	2.17059426229508	0.07421875	11	2	14	27	294	0.148351648351648	0.350649350649351	0.162971175166297	2.15160349854227	0.0918367346938776	0.208791208791209	38	76	550	3038	2.26238421985683e-06	7.77853450872124e-06	0.00069228957127619	2.76102132518353	1.92456542195746	Inf	2.17454545454545	4.26545454545455	1.32498460858644e-08	5.42718286419885e-08	4.05445290227451e-06	10.4197467638559	1.55677685950413	0.0253888571204559	0.0826488327538245	1	1.73097905910474	0.525568846780552	0.855447165504515	1	144	139	21
"TCGA-CN-6021-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	320	1	4	12	16	303	12423	15	13	3	31	2928	23	12	5	40	3098	18	58	45	121	3154	20	36	55	111	3243	5	8	15	28	466	0.0875	0.252252252252252	0.143694110391613	1.7554808026911	0.0600858369098712	8	7	6	21	420	0.065625	0.173553719008264	0.133164235890932	1.30330578512397	0.05	0.10625	34	104	886	5511	0.000591807559368949	0.00148436978005654	0.181093113166898	2.03324983147479	1.42213533722058	Inf	1.77886282592338	2.47003088986575	0.00130066412525288	0.00258443650861936	0.398003222327381	3.23360457676836	1.51621896162528	0.0335856488647416	0.103285381626589	1	1.65328413971817	0.136861604150065	0.423026776463837	1	286	269	15
"TCGA-CN-6022-01A-21D-1683-08"	0	0	0	0	94	0	1	1	2	92	3772	1	2	1	4	931	2	4	4	10	893	6	7	23	36	972	11	6	25	42	976	4	2	6	12	126	0.127659574468085	0.285714285714286	0.129098360655738	2.21315192743764	0.0952380952380952	4	0	7	11	147	0.117021276595745	0.305555555555556	0.151234567901235	2.02040816326531	0.0748299319727891	0.223404255319149	21	44	273	1675	0.000190929271795555	0.000512494361135437	0.0584243571694398	2.92617111756087	1.78261697569081	Inf	2.30532544378698	3.35789700495583	0.001193308704395	0.00238661740879	0.36515246354487	5.44633437968407	1.93253968253968	0.0141861023436367	0.0493289467858276	1	2.27769255136404	0.236188971321661	0.578190601795426	1	73	71	12
"TCGA-CN-6023-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	123	2	2	5	7	113	4633	3	7	2	12	1173	6	8	2	16	1157	13	7	18	38	1100	12	10	25	47	1203	6	0	5	11	170	0.0894308943089431	0.234042553191489	0.141313383208645	1.65619524405507	0.0647058823529412	4	1	10	15	176	0.121951219512195	0.394736842105263	0.16	2.46710526315789	0.0852272727272727	0.203252032520325	25	43	346	1957	1.30759356767617e-05	4.00123631708908e-05	0.00400123631708908	3.28610999943803	2.06623060954337	Inf	2.4470843250595	2.66242774566474	0.00234242573763344	0.00447988922322395	0.716782275715833	3.76762289105106	2.32188466191692	0.001166462413852	0.00575705642965665	0.356937498638712	3.02805734209626	0.266831211274679	0.613912410902645	1	98	88	15
"TCGA-CN-6024-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	201	0	1	7	8	191	7831	13	15	5	33	1917	14	19	4	37	1907	5	17	32	54	2053	7	16	44	67	1954	3	4	5	12	268	0.0597014925373134	0.17910447761194	0.137154554759468	1.30585876587213	0.0447761194029851	0	1	2	3	274	0.0149253731343284	0.0555555555555556	0.13346322454944	0.416261151662611	0.0109489051094891	0.0497512437810945	10	78	542	3465	0.766895532426044	0.81766561993857	1	0.819651359166998	0.427181976833373	Inf	0.840112378396511	1.84824723247232	0.215606077749049	0.267107124660765	1	2.13048893118976	0.680933190910856	0.902142494599026	1	1	0.64862410260674	0.245077461269365	0.585888305847076	1	191	181	0
"TCGA-CN-6988-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	177	0	5	4	9	165	6765	8	9	5	22	1652	1	9	3	13	1616	13	19	30	62	1756	12	28	28	68	1741	2	3	5	10	234	0.0564971751412429	0.147058823529412	0.134405514072372	1.09414278531926	0.0427350427350427	3	3	2	8	222	0.0451977401129944	0.129032258064516	0.126423690205011	1.02063353676257	0.036036036036036	0.0677966101694915	12	71	456	3041	0.400945321148129	0.515501127190452	1	1.12705941639233	0.619790186091833	Inf	1.10875079264426	1.53377192982456	0.221881927780427	0.273773668954882	1	1.66691880562796	0.92555202661827	0.645656000379399	0.884745108707078	1	0.915338892702924	0.724671857619577	1	1	165	153	0
"TCGA-CN-6989-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	121	0	1	5	6	111	4551	3	9	0	12	1092	2	8	5	15	1178	5	9	23	37	1064	8	7	32	47	1217	4	5	13	22	189	0.181818181818182	0.468085106382979	0.155299917830731	3.01407182258246	0.116402116402116	2	3	5	10	150	0.0826446280991736	0.27027027027027	0.140977443609023	1.91711711711712	0.0666666666666667	0.198347107438017	24	44	339	1942	3.4647612450522e-05	9.90856954192498e-05	0.0106021694098597	3.1226013299387	1.95314389413422	Inf	2.37480478917231	3.10551395507148	0.00745679772938102	0.0131208463155196	1	4.9051435696132	2.20209171359614	0.000838598635163103	0.00450195056771771	0.256611182359909	2.78530566868362	0.00403716783635735	0.03529638165501	1	97	87	14
"TCGA-CN-6992-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	387	0	3	10	13	370	15170	16	12	4	32	3377	12	17	2	31	3766	18	58	78	154	4016	28	57	68	153	4011	10	5	6	21	524	0.0542635658914729	0.137254901960784	0.130640737970581	1.05062864840593	0.0400763358778626	6	12	10	28	507	0.0723514211886305	0.181818181818182	0.126245019920319	1.44020082481621	0.0552268244575937	0.082687338501292	32	160	1031	6996	0.0767967190305287	0.1284141859199	1	1.35707025764862	0.955110840442194	Inf	1.29760750080828	2.70805043646945	0.000125444587200882	0.000290803361238408	0.0383860436834699	3.61782409845832	0.853221370394483	0.785158595818631	0.968784396453633	1	0.835180596358932	1	1	1	355	338	0
"TCGA-CN-6994-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	134	1	0	6	6	127	5207	1	5	2	8	1247	2	4	2	8	1235	18	12	28	58	1396	16	10	27	53	1329	10	1	4	15	192	0.111940298507463	0.283018867924528	0.144469525959368	1.95902122641509	0.078125	9	2	8	19	205	0.141791044776119	0.327586206896552	0.146848137535817	2.23078216989066	0.0926829268292683	0.23134328358209	31	58	397	2328	2.52257253124201e-06	8.48249664351709e-06	0.000771907194560055	3.13243166505301	2.08285488880389	Inf	2.39082444174002	3.83575344495481	3.45702341591842e-08	1.35621687855261e-07	1.05784916527104e-05	7.42045744543728	1.49759560338905	0.0989888226013726	0.229474088757727	1	1.63611319109464	0.143512991237813	0.434801735829414	1	103	96	18
"TCGA-CN-6995-01A-31D-2012-08"	0	0	0	0	261	0	3	6	9	251	10291	12	24	3	39	2419	15	13	3	31	2513	14	41	55	110	2614	14	31	26	71	2745	1	3	8	12	388	0.0459770114942529	0.169014084507042	0.141347905282332	1.19573108755627	0.0309278350515464	4	7	6	17	347	0.0651340996168582	0.154545454545455	0.1327467482785	1.16421273251244	0.0489913544668588	0.0727969348659004	19	90	735	4624	0.164358960021941	0.247752915106965	1	1.32805520308375	0.831099857464738	Inf	1.27093553017537	1.30199222546161	0.338339653135827	0.399737196368969	1	1.36755106434809	1.2601998824221	0.217964504995247	0.428799088376839	1	1.3144956189339	0.0239048728733545	0.140670982677817	1	242	232	0
"TCGA-CN-6996-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	65	0	0	1	1	64	2624	0	4	2	6	674	2	4	1	7	620	6	2	15	23	685	7	3	18	28	645	7	0	2	9	93	0.138461538461538	0.321428571428571	0.144186046511628	2.22926267281106	0.0967741935483871	4	0	6	10	98	0.153846153846154	0.434782608695652	0.143065693430657	3.03904170363798	0.102040816326531	0.292307692307692	19	27	191	1139	1.28087583164007e-05	3.99946943348838e-05	0.00391948004481861	4.19025936035312	2.3873686375329	Inf	2.87616662872752	5.89206604913411	4.14213137945524e-08	1.60442050900418e-07	1.2674922021133e-05	32.6579271361194	1.68808503887038	0.0954496120795671	0.222958635849981	1	1.90705103154412	0.517123712399623	0.850751913947767	1	46	45	12
"TCGA-CN-6997-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	161	0	3	7	10	149	6109	2	10	0	12	1444	10	15	3	28	1495	11	9	31	51	1532	12	16	30	58	1638	4	0	10	14	220	0.0869565217391304	0.241379310344828	0.134310134310134	1.79717868338558	0.0636363636363636	9	2	5	16	212	0.0993788819875776	0.313725490196078	0.138381201044386	2.26711061783204	0.0754716981132075	0.173913043478261	28	56	432	2738	5.06987946647531e-06	1.65040757100154e-05	0.00155138311674144	3.167395919935	2.07165375332611	Inf	2.44598765432099	4.14754428341385	1.91463600444003e-06	6.03998574596545e-06	0.000585878617358649	8.22889072121869	1.80441712204007	0.0163649959496146	0.0554760095468346	1	2.06616259223695	0.79610715858958	1	1	133	121	17
"TCGA-CN-6998-01A-23D-2012-08"	0	0	0	0	102	0	3	2	5	97	3977	1	7	0	8	921	1	5	0	6	942	7	2	25	34	1034	8	3	38	49	1080	8	0	10	18	137	0.176470588235294	0.36734693877551	0.126851851851852	2.89587367793833	0.131386861313869	5	0	1	6	125	0.0588235294117647	0.176470588235294	0.120889748549323	1.45976470588235	0.048	0.235294117647059	24	54	262	1852	2.44007323899362e-05	7.17944626088507e-05	0.00746662411132048	3.13932126262456	1.98522969936022	Inf	2.4826776277158	6.99287531806616	1.78240415545365e-10	8.79702696078737e-10	5.45415671568817e-08	45.7502648191604	1.40882103477523	0.157125096441147	0.336225730846091	1	1.49497971413005	0.773240215173934	1	1	78	73	14
"TCGA-CQ-5323-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	82	1	3	4	7	74	3034	1	8	0	9	764	1	3	2	6	737	5	6	25	36	749	2	3	18	23	784	0	0	1	1	116	0.0121951219512195	0.0434782608695652	0.147959183673469	0.293853073463268	0.00862068965517241	0	1	6	7	107	0.0853658536585366	0.194444444444444	0.142857142857143	1.36111111111111	0.0654205607476635	0.0853658536585366	7	43	223	1310	0.606060598950976	0.702479330602268	1	0.956323003114773	0.421020781027905	Inf	0.962421524663677	0	1	1	1	0	1.11909479612055	0.441432027804663	0.738132243214355	1	1.14211738700299	0.0013986013986014	0.0186074794770447	0.427972027972028	75	67	0
"TCGA-CQ-5324-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	78	1	2	3	5	72	2952	3	5	1	9	707	2	0	0	2	720	3	1	29	33	763	4	4	20	28	762	1	1	2	4	104	0.0512820512820513	0.142857142857143	0.136482939632546	1.0467032967033	0.0384615384615385	1	1	5	7	100	0.0897435897435897	0.212121212121212	0.131061598951507	1.61848484848485	0.07	0.115384615384615	9	47	204	1321	0.337615029136566	0.445302581533574	1	1.23979135237303	0.60458622083419	Inf	1.20141806722689	2.13585434173669	0.240171845965763	0.293970339462094	1	2.5878513484235	1.06792717086835	0.491790861240128	0.786924581173192	1	1.07921599741778	0.0804953560371517	0.328421052631579	1	69	63	0
"TCGA-CQ-5325-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	63	0	0	1	1	62	2542	2	5	4	11	626	6	5	2	13	648	3	6	9	18	603	3	4	13	20	665	1	1	2	4	108	0.0634920634920635	0.2	0.162406015037594	1.23148148148148	0.037037037037037	1	2	0	3	84	0.0476190476190476	0.166666666666667	0.139303482587065	1.19642857142857	0.0357142857142857	0.0634920634920635	4	24	192	1076	0.631987909140389	0.718915614115089	1	0.934058978865378	0.293861523520068	Inf	0.943452380952381	2.20138888888889	0.228652293297011	0.280994384533676	1	2.79910470517016	0.600378787878788	0.866555462631284	0.999264062822247	1	0.56062494047306	1	1	1	59	58	0
"TCGA-CQ-5326-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	259	0	2	1	3	256	10496	3	8	2	13	2499	4	12	1	17	2431	33	10	62	105	2770	47	14	60	121	2796	36	7	26	69	376	0.266409266409266	0.570247933884298	0.13447782546495	4.24046069984174	0.183510638297872	25	7	20	52	404	0.200772200772201	0.495238095238095	0.145848375451264	3.3955681282414	0.128712871287129	0.413127413127413	107	95	780	4786	6.7682556175638e-37	1.09004537840764e-35	2.07108621897452e-34	6.90787828435559	5.37553074840554	Inf	3.77990606752983	5.44112179487179	3.73221121520512e-35	6.3447590658487e-34	1.14205663185277e-32	19.6816392223807	2.69058427910887	1.38261071320508e-10	1.51099599371698e-09	4.23078878240755e-08	3.71267650557757	0.069744034783704	0.304881066340192	1	152	149	79
"TCGA-CQ-5327-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	272	0	5	8	13	259	10619	2	3	2	7	2543	2	6	0	8	2537	30	7	95	132	2756	33	8	71	112	2783	25	3	35	63	411	0.231617647058824	0.5625	0.147682357168523	3.8088503649635	0.153284671532847	27	4	35	66	380	0.242647058823529	0.5	0.137880986937591	3.62631578947368	0.173684210526316	0.448529411764706	122	107	791	4748	4.3707317557012e-41	7.86731716026216e-40	1.33744391724457e-38	6.8403753180548	5.40374906557222	Inf	3.73060467375883	5.77986474825919	5.06074965437375e-33	8.15047049599141e-32	1.54858939423837e-30	28.3437653757439	2.95287344066532	1.17445494574473e-17	2.2461450837368e-16	3.59383213397887e-15	4.37540054482329	0.0338135320141552	0.191610014746879	1	150	137	89
"TCGA-CQ-5329-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	37	0	0	3	3	34	1394	0	2	0	2	337	1	2	0	3	319	0	1	12	13	343	0	5	11	16	395	0	0	0	0	52	0	0	0.131645569620253	0	0	0	1	1	2	36	0.0540540540540541	0.153846153846154	0.104956268221574	1.46581196581197	0.0555555555555556	0.027027027027027	1	22	88	650	0.945284268979558	0.970661027878338	1	0.336067496658527	0.0163376215953216	Inf	0.364624505928854	NA	1	1	1	0	0.364624505928854	0.945284268979558	1	1	0.336067496658527	1	1	1	36	33	0
"TCGA-CQ-5330-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	78	0	0	2	2	76	3116	2	8	1	11	738	1	4	1	6	730	0	4	24	28	827	1	3	27	31	821	0	0	4	4	104	0.0512820512820513	0.129032258064516	0.126674786845311	1.01861042183623	0.0384615384615385	0	0	2	2	118	0.0256410256410256	0.0714285714285714	0.142684401451028	0.500605326876513	0.0169491525423729	0.0769230769230769	6	46	222	1426	0.718195111784147	0.783484050636314	1	0.837920109873573	0.344805933919393	Inf	0.856548856548857	0	1	1	1	0	0.873343932167462	0.700412737462876	0.914123897857775	1	0.856535251116313	0.00216450216450216	0.0228392297357814	0.662337662337661	72	70	0
"TCGA-CQ-5331-01A-02D-1870-08"	0	0	0	0	170	0	2	0	2	168	6888	3	1	0	4	1742	2	4	1	7	1645	24	5	40	69	1816	38	12	38	88	1685	28	2	22	52	273	0.305882352941176	0.590909090909091	0.162017804154303	3.64718614718615	0.19047619047619	19	2	18	39	289	0.229411764705882	0.565217391304348	0.159140969162996	3.551677448473	0.134948096885813	0.511764705882353	87	53	562	2939	7.93310885444274e-33	1.01147137894145e-31	2.42753130945948e-30	8.57666121760145	6.29117889466416	Inf	3.87121250635486	4.72239122947997	1.38353719797414e-24	1.56800882437069e-23	4.23362382580087e-22	16.3680240463009	3.19463454694771	1.54957337479451e-12	2.15531569403236e-11	4.7416945268712e-10	5.50090766563352	0.373327412468951	0.74180641698376	1	83	81	65
"TCGA-CQ-5332-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	161	1	1	3	4	155	6355	6	6	1	13	1502	6	9	7	22	1514	7	13	42	62	1671	13	10	35	58	1668	4	1	4	9	225	0.0559006211180124	0.155172413793103	0.134892086330935	1.15034482758621	0.04	2	2	7	11	220	0.0683229813664596	0.17741935483871	0.131657690005984	1.34758064516129	0.05	0.105590062111801	17	80	445	2894	0.148488266686774	0.226056764209716	1	1.3818183500117	0.83663939795154	Inf	1.31502374609058	2.25101123595506	0.0419774331369852	0.0620535968111955	1	2.78596746748871	1.07191011235955	0.454372538254446	0.755641286444894	1	1.08389304589892	0.200287272812301	0.528344012763484	1	144	138	0
"TCGA-CQ-5334-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	215	0	4	8	12	200	8200	0	5	1	6	1997	2	4	2	8	1829	29	8	54	91	2249	22	11	62	95	2125	16	5	15	36	243	0.167441860465116	0.378947368421053	0.114352941176471	3.31384015594542	0.148148148148148	23	2	15	40	312	0.186046511627907	0.43956043956044	0.138728323699422	3.16849816849817	0.128205128205128	0.32093023255814	69	98	555	3819	2.60066828448395e-19	2.21056804181136e-18	7.95804495052089e-17	4.84231480940895	3.64610924629255	Inf	3.25625505745266	6.02670906200318	1.0473107930436e-24	1.23260424104362e-23	3.20477102671342e-22	22.3344765855037	2.03821062441752	0.000121681854506721	0.000702540518472767	0.0372346474790566	2.39974869861032	0.192303629768391	0.513620535270123	1	146	131	48
"TCGA-CQ-6218-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	161	0	2	4	6	155	6355	5	9	5	19	1569	3	8	2	13	1641	19	6	38	63	1542	10	10	40	60	1603	7	2	12	21	228	0.130434782608696	0.35	0.142233312538989	2.46074561403509	0.0921052631578947	14	0	14	28	235	0.173913043478261	0.444444444444444	0.152399481193256	2.91631205673759	0.119148936170213	0.291925465838509	47	60	463	2682	1.35941102918054e-12	7.99961105633164e-12	4.15979774929245e-10	4.53464671068767	3.18747870553297	Inf	2.98369027674048	4.91882028748045	6.21899597702678e-12	3.33861889293017e-11	1.90301276897019e-09	15.1835792310001	2.264218862491	4.0285256509337e-05	0.000246545769837142	0.0123272884918571	2.89502086757117	0.4188003995846	0.777817589386625	1	114	108	31
"TCGA-CQ-6219-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	91	0	3	0	3	88	3608	5	6	0	11	884	2	4	2	8	892	9	3	25	37	900	10	5	17	32	932	8	2	7	17	133	0.186813186813187	0.53125	0.142703862660944	3.72274436090226	0.12781954887218	6	2	7	15	136	0.164835164835165	0.405405405405405	0.151111111111111	2.68282988871224	0.110294117647059	0.307692307692308	28	33	269	1563	1.30560968819598e-08	6.14640868596877e-08	3.9951656458797e-06	4.92389064110723	3.06759994253455	Inf	3.12608934121519	5.01819604774017	1.61187430496531e-08	6.48991496472875e-08	4.93233537319385e-06	16.2278797292595	2.27013630731103	0.00225858863172598	0.0103153450941515	0.69112812130815	2.90293670797132	1	1	1	63	60	19
"TCGA-CQ-6220-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	133	1	2	0	2	129	5289	2	4	0	6	1197	4	10	2	16	1282	15	5	32	52	1387	18	5	32	55	1423	11	1	6	18	192	0.135338345864662	0.327272727272727	0.134926212227688	2.42556818181818	0.09375	12	1	3	16	168	0.120300751879699	0.307692307692308	0.1211247296323	2.54029304029304	0.0952380952380952	0.240601503759398	32	65	360	2450	4.30543592005526e-07	1.66767517916065e-06	0.000131746339153691	3.34846529070055	2.25031357845593	Inf	2.57502863688431	5.44023569023569	1.32504300776981e-13	8.10926320755124e-13	4.05463160377562e-11	15.625111966586	1.09765625	0.439810920806845	0.738132243214355	1	1.1135568704275	0.00139679468554593	0.0186074794770447	0.427419173777055	101	97	20
"TCGA-CQ-6221-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	128	0	2	9	11	117	4797	4	3	1	8	1154	3	5	1	9	1183	28	3	14	45	1211	22	9	24	55	1249	8	2	6	16	172	0.125	0.290909090909091	0.137710168134508	2.11247357293869	0.0930232558139535	17	1	3	21	174	0.1640625	0.466666666666667	0.143682906688687	3.24789272030651	0.120689655172414	0.265625	34	54	346	2114	2.41717108619998e-08	1.08772698878999e-07	7.39654352377194e-06	3.84410901203526	2.57219169263387	Inf	2.74697845507094	3.55491329479769	2.97815486372379e-09	1.32074693956446e-08	9.1131538829948e-07	6.10275792117743	1.68390629753575	0.0795308698822097	0.199479067081608	1	1.89546273776122	0.000389388001031656	0.00700898401856981	0.119152728315687	94	83	22
"TCGA-CQ-6222-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	77	0	2	1	3	74	3034	2	8	0	10	681	1	5	0	6	730	3	8	32	43	813	2	1	12	15	810	0	0	1	1	110	0.012987012987013	0.0666666666666667	0.135802469135802	0.490909090909091	0.00909090909090909	2	0	3	5	107	0.0649350649350649	0.116279069767442	0.131611316113161	0.883503586176918	0.0467289719626168	0.0779220779220779	6	43	217	1406	0.65524541558113	0.737151092528771	1	0.904109226242124	0.37081995301216	Inf	0.915828082385028	2.99170506912442	0.136760728149459	0.175099509680897	1	4.31376188288979	0.679932970255551	0.855820221453766	0.995745200626815	1	0.648072205686808	0.567099567099567	0.893254437869822	1	71	68	0
"TCGA-CQ-6223-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	105	0	1	2	3	102	4182	0	0	3	3	933	1	11	3	15	1042	5	7	27	39	1103	4	15	26	45	1104	2	3	1	6	143	0.0571428571428571	0.133333333333333	0.129528985507246	1.02937062937063	0.041958041958042	1	3	1	5	142	0.0476190476190476	0.128205128205128	0.128739800543971	0.995846876128566	0.0352112676056338	0.0476190476190476	5	57	285	1922	0.914220917632826	0.948310511171677	1	0.591681465834685	0.223506346860012	Inf	0.62450481041313	2.5812865497076	0.100458468863354	0.133653441183419	1	3.36924125478231	0.292221118834823	0.99390326440582	1	1	0.264561413005432	1	1	1	100	97	0
"TCGA-CQ-6224-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	86	0	1	0	1	85	3485	1	3	1	5	759	1	5	1	7	793	3	2	26	31	976	3	4	35	42	957	0	0	0	0	95	0	0	0.0992685475444096	0	0	0	0	3	3	115	0.0348837209302326	0.0967741935483871	0.117827868852459	0.821318373071529	0.0260869565217391	0.0348837209302326	3	64	210	1723	0.980138645566768	0.994598777233992	1	0.384726908065097	0.101485092344047	Inf	0.412153518123667	0	1	1	1	0	0.452693208430913	0.966883019388913	1	1	0.424516396292347	0.1	0.355813953488372	1	83	82	0
"TCGA-CQ-6225-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	179	0	2	17	19	158	6478	7	11	3	21	1524	6	17	5	28	1661	12	9	26	47	1575	16	11	35	62	1718	6	6	4	16	245	0.0893854748603352	0.258064516129032	0.142607683352736	1.80961158657011	0.0653061224489796	5	1	2	8	189	0.0446927374301676	0.170212765957447	0.12	1.41843971631206	0.0423280423280423	0.0949720670391061	17	72	434	2859	0.0763152822045484	0.128310309640614	1	1.55515454610385	0.937255300574198	Inf	1.44930875576037	2.98082620144832	0.000554484876177649	0.0011782803618775	0.169672372110361	4.25997512808838	0.746317141346227	0.83045756697283	0.977384674975715	1	0.718706137680159	0.227018416057892	0.56487213930667	1	162	141	0
"TCGA-CQ-6227-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	50	0	0	1	1	49	2009	2	2	1	5	437	0	2	0	2	430	3	4	9	16	581	5	2	19	26	561	3	0	2	5	56	0.1	0.192307692307692	0.0998217468805704	1.92651098901099	0.0892857142857143	1	0	0	1	56	0.02	0.0625	0.0963855421686747	0.6484375	0.0178571428571429	0.12	6	30	112	1030	0.143018101633929	0.218817695499911	1	1.83803603601273	0.732372148235188	Inf	1.69940476190476	5.09821428571429	0.00499946570646308	0.00910616967962918	1	9.16061924430252	0.728316326530612	0.775620335479937	0.964796027060409	1	0.707601022981717	0.567099567099567	0.893254437869822	1	44	43	0
"TCGA-CQ-6228-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	122	0	1	2	3	119	4879	4	5	6	15	1159	6	14	2	22	1180	2	13	26	41	1247	9	6	26	41	1293	3	0	3	6	167	0.0491803278688525	0.146341463414634	0.129156999226605	1.13305097122828	0.0359281437125748	1	2	1	4	158	0.0327868852459016	0.0975609756097561	0.126704089815557	0.769990737882062	0.0253164556962025	0.0655737704918033	8	55	325	2215	0.567158915604725	0.675294273054653	1	0.991331767578909	0.468235435970243	Inf	0.992429792429792	2.84195804195804	0.0427536418272529	0.0628971846112471	1	3.89150129318273	0.601183431952663	0.912321789479254	1	1	0.568050815809934	1	1	1	114	111	0
"TCGA-CQ-6229-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	35	0	1	3	4	31	1271	0	1	1	2	259	0	0	3	3	303	1	2	11	14	331	1	2	9	12	378	0	1	1	2	45	0.0571428571428571	0.166666666666667	0.119047619047619	1.4	0.0444444444444444	0	0	1	1	34	0.0285714285714286	0.0714285714285714	0.102719033232628	0.695378151260504	0.0294117647058824	0.0571428571428571	2	20	79	630	0.722034321174642	0.783484050636314	1	0.797696102846271	0.130679453061309	Inf	0.815880322209436	0	1	1	1	0	0.89746835443038	0.672006222658953	0.897964646871789	1	0.886194713635889	0.4	0.755555555555556	1	33	29	0
"TCGA-CQ-7065-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	39	0	1	3	4	35	1435	1	1	1	3	330	1	5	2	8	341	0	1	11	12	369	1	1	10	12	395	0	0	2	2	65	0.0512820512820513	0.166666666666667	0.164556962025316	1.01282051282051	0.0307692307692308	0	1	0	1	41	0.0256410256410256	0.0833333333333333	0.111111111111111	0.75	0.024390243902439	0.0512820512820513	2	20	106	658	0.829657315852544	0.875431512589236	1	0.621075320400695	0.102153753364352	Inf	0.655231560891938	0	1	1	1	0	0.686433063791554	0.809554901983196	0.973851583194362	1	0.653732782193875	0.4	0.755555555555556	1	37	33	0
"TCGA-CQ-7067-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	66	0	2	6	8	58	2378	0	7	3	10	561	4	5	2	11	611	2	3	16	21	636	3	2	11	16	570	2	0	1	3	85	0.0454545454545455	0.1875	0.149122807017544	1.25735294117647	0.0352941176470588	0	1	1	2	74	0.0303030303030303	0.0952380952380952	0.116352201257862	0.818532818532818	0.027027027027027	0.0606060606060606	4	28	159	1047	0.625729387602458	0.715659462786617	1	0.940736318209757	0.298305048927782	Inf	0.94811320754717	3.03396226415094	0.133937664859201	0.172205569104687	1	4.38179527073009	0.561844863731656	0.887099455055713	1	1	0.527011488580496	1	1	1	62	54	0
"TCGA-CQ-7068-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	126	0	2	3	5	121	4961	2	7	0	9	1131	0	2	1	3	1147	9	4	36	49	1290	11	7	42	60	1393	7	1	12	20	180	0.158730158730159	0.333333333333333	0.12921751615219	2.57962962962963	0.111111111111111	6	0	5	11	145	0.0873015873015873	0.224489795918367	0.112403100775194	1.99718508092892	0.0758620689655172	0.238095238095238	30	68	325	2358	1.77207700322702e-06	6.23282256307435e-06	0.000542255562987468	3.19901369142004	2.13262659139379	Inf	2.52715855572998	5.366	5.02367647424315e-08	1.921556251398e-07	1.5372450011184e-05	13.4498128718092	1.79925049309665	0.0125653755587786	0.0441954588619109	1	2.02136687038262	0.446153376527516	0.789149902990866	1	96	91	18
"TCGA-CR-5243-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	88	0	0	2	2	86	3526	1	1	0	2	788	0	3	3	6	834	6	3	26	35	944	9	10	24	43	960	6	2	4	12	127	0.136363636363636	0.27906976744186	0.132291666666667	2.10950375389123	0.094488188976378	1	1	4	6	111	0.0681818181818182	0.171428571428571	0.117584745762712	1.45791505791506	0.0540540540540541	0.170454545454545	15	50	238	1666	0.0147637820043699	0.0291465631828206	1	2.0989993325707	1.19766187604449	Inf	1.84615384615385	3.73333333333333	0.00131846563735378	0.00260290635503391	0.403450485030257	6.11513882163983	1.28	0.288586301708248	0.530632327877998	1	1.33311393884766	1	1	1	73	71	7
"TCGA-CR-5247-01A-01D-2012-08"	0	0	0	0	88	1	2	9	11	76	3116	2	6	0	8	734	2	7	5	14	727	5	2	15	22	818	2	7	23	32	837	0	0	1	1	113	0.0113636363636364	0.03125	0.135005973715651	0.231471238938053	0.00884955752212389	2	0	2	4	110	0.0454545454545455	0.181818181818182	0.134474327628362	1.35206611570248	0.0363636363636364	0.0568181818181818	5	40	223	1432	0.742530311935031	0.797243071761823	1	0.802787057823876	0.298380131836398	Inf	0.824613851519681	2.12043561819347	0.242700008384981	0.295881285122726	1	2.56652374222106	0.585909841869247	0.900947487810174	1	1	0.550574935677706	1	1	1	83	71	0
"TCGA-CR-5248-01A-01D-2012-08"	0	0	0	0	388	1	2	17	19	367	15047	2	6	4	12	3619	0	10	3	13	3598	59	18	108	185	3893	59	13	85	157	3937	44	3	31	78	552	0.201030927835052	0.496815286624204	0.140208280416561	3.54340902797009	0.141304347826087	49	12	45	106	553	0.27319587628866	0.572972972972973	0.14204983303365	4.03360539563071	0.191681735985533	0.435567010309278	169	142	1105	6725	1.27252785146295e-58	2.99533478882818e-57	3.89393522547663e-56	7.23973814213134	5.92027231926444	Inf	3.85057688670323	5.5847074162129	1.00495236048131e-54	3.07515422307281e-53	3.07515422307281e-52	22.6120941357377	2.79033127798748	1.829803137901e-17	3.2936456482218e-16	5.59919760197706e-15	3.95249248257159	0.094055642870221	0.355813953488372	1	219	198	125
"TCGA-CR-5249-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	55	0	0	4	4	51	2091	1	4	0	5	508	1	4	0	5	458	2	4	18	24	547	3	1	13	17	578	2	0	0	2	71	0.0363636363636364	0.117647058823529	0.122837370242215	0.957746478873239	0.028169014084507	2	1	3	6	82	0.109090909090909	0.25	0.149908592321755	1.66768292682927	0.0731707317073171	0.127272727272727	7	29	153	972	0.217497429279623	0.315422812130638	1	1.53281386018102	0.655956594948469	Inf	1.4297385620915	5.88235294117647	0.00160643639608778	0.00315108677694141	0.491569537202861	25.2772392578545	0.71157495256167	0.812093266715124	0.973851583194362	1	0.680871324260203	1	1	1	48	44	0
"TCGA-CR-5250-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	41	0	0	4	4	37	1517	0	3	0	3	369	0	3	0	3	361	5	5	7	17	385	1	1	12	14	402	0	0	1	1	54	0.024390243902439	0.0714285714285714	0.134328358208955	0.531746031746032	0.0185185185185185	1	0	2	3	51	0.0731707317073171	0.176470588235294	0.132467532467532	1.33217993079585	0.0588235294117647	0.0975609756097561	4	21	105	682	0.438286224661531	0.551915986610817	1	1.23682668872436	0.382336006320688	Inf	1.1992380952381	1.24920634920635	0.57847101775712	0.639032965464544	1	1.29857557419911	1.18345864661654	0.479191451247233	0.779960553625815	1	1.21752615359281	0.485714285714286	0.831041026605307	1	37	33	0
"TCGA-CR-6467-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	57	0	1	2	3	54	2214	1	0	1	2	473	1	2	0	3	497	3	1	25	29	607	2	1	17	20	637	1	0	0	1	70	0.0175438596491228	0.05	0.10989010989011	0.455	0.0142857142857143	0	0	3	3	59	0.0526315789473684	0.103448275862069	0.0971993410214168	1.06428988895383	0.0508474576271186	0.0701754385964912	4	43	129	1115	0.732001656494291	0.790810990199963	1	0.804170853707922	0.259728382618372	Inf	0.820715817252185	1.92868217054264	0.4233221717792	0.488817300243152	1	2.15906661279288	0.688815060908084	0.824006780118022	0.975092147977395	1	0.665059408515757	0.485714285714286	0.831041026605307	1	53	50	0
"TCGA-CR-6470-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	48	0	0	2	2	46	1886	1	2	2	5	430	0	5	0	5	499	1	0	20	21	453	1	1	13	15	504	1	1	3	5	73	0.104166666666667	0.333333333333333	0.14484126984127	2.3013698630137	0.0684931506849315	1	0	2	3	57	0.0625	0.142857142857143	0.125827814569536	1.13533834586466	0.0526315789473684	0.145833333333333	7	28	130	827	0.197577048279667	0.294919886700381	1	1.58951258041779	0.676623702213998	Inf	1.47230769230769	7.36153846153846	0.0188217981065001	0.0301542943486337	1	Inf	1.11538461538462	0.47605052217947	0.778991763566406	1	1.13580282054603	0.314685314685315	0.687812187812188	1	41	39	0
"TCGA-CR-6471-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	160	0	4	5	9	149	6109	4	14	3	21	1440	3	6	5	14	1456	7	13	44	64	1574	4	8	38	50	1639	2	1	3	6	228	0.0375	0.12	0.139109212934716	0.862631578947368	0.0263157894736842	1	1	5	7	209	0.04375	0.109375	0.132782719186785	0.823714114832536	0.0334928229665072	0.06875	11	82	437	2776	0.733955298094083	0.790810990199963	1	0.852192073185199	0.458440480417341	Inf	0.869639034472577	2.00520074890784	0.181058243995272	0.225218791311192	1	2.38128641333255	0.717307584975163	0.882663775915557	1	1	0.686815919267585	0.110701305693902	0.376384439359267	1	149	138	0
"TCGA-CR-6472-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	542	3	3	9	12	526	21566	1	4	2	7	5124	0	3	4	7	5123	119	28	134	281	5676	106	24	101	231	5643	73	17	51	141	809	0.260147601476015	0.61038961038961	0.143363459152933	4.25763729472011	0.174289245982695	82	15	83	180	846	0.33210332103321	0.640569395017794	0.149048625792812	4.29772090558037	0.212765957446809	0.533210332103321	289	171	1655	9664	2.81650198028278e-116	1.43641600994422e-114	8.61849605966531e-114	9.86536510841828	8.33082053274695	Inf	4.29684881124393	4.71150050352467	2.311743278473e-73	1.17898907202123e-71	7.07393443212738e-71	12.9250781706767	3.89984187182619	1.48834514822422e-49	6.50619450509445e-48	4.55433615356611e-47	7.74459303090966	0.112535199649168	0.378415066952147	1	253	237	222
"TCGA-CR-6473-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	103	0	2	3	5	98	4018	1	4	0	5	916	2	3	0	5	966	8	5	26	39	1070	7	3	39	49	1066	5	1	7	13	138	0.12621359223301	0.26530612244898	0.129455909943715	2.04939367051168	0.0942028985507246	4	1	5	10	148	0.0970873786407767	0.256410256410256	0.138317757009346	1.85377685377685	0.0675675675675676	0.203883495145631	21	59	286	1850	0.00202641766254734	0.00452615915868238	0.620083804739486	2.30130783517425	1.42940309494654	Inf	1.96048951048951	4.48111888111888	3.58997943904741e-05	9.00437465859432e-05	0.0109853370834851	9.6841501020135	1.37880580957504	0.159511215222987	0.338961332348847	1	1.46428066748614	0.554443566604302	0.888270844926264	1	82	77	10
"TCGA-CR-6474-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	127	0	3	1	4	123	5043	8	11	1	20	1222	3	7	8	18	1261	9	6	23	38	1306	15	11	21	47	1254	8	4	5	17	196	0.133858267716535	0.361702127659574	0.156299840510367	2.31415544941381	0.086734693877551	5	0	8	13	179	0.102362204724409	0.342105263157895	0.137059724349158	2.4960305792414	0.0726256983240224	0.204724409448819	26	42	375	2185	2.37271274967066e-06	8.06722334888024e-06	0.000726050101399222	3.60448860514032	2.27866468079451	Inf	2.61019607843137	3.69777777777778	8.38979516896584e-06	2.29221189437817e-05	0.00256727732170355	6.87772208747821	2.0169696969697	0.00928720837945217	0.0332717986395615	1	2.44223341754987	1	1	1	101	97	16
"TCGA-CR-6477-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	105	0	2	8	10	95	3895	0	13	5	18	988	3	9	4	16	968	1	4	26	31	926	5	6	19	30	1013	3	0	5	8	143	0.0761904761904762	0.266666666666667	0.141164856860809	1.88904428904429	0.0559440559440559	0	0	4	4	144	0.0380952380952381	0.129032258064516	0.155507559395248	0.829749103942652	0.0277777777777778	0.114285714285714	12	39	287	1652	0.0695192026526177	0.119510539391579	1	1.77049520368567	0.939905323064959	Inf	1.5896700143472	3.3780487804878	0.0463305364378613	0.066873321462196	1	5.74791772295168	1.35121951219512	0.218603456819565	0.428799088376839	1	1.43872415554415	0.0391257013278818	0.210043238707576	1	93	83	0
"TCGA-CR-6478-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	147	0	1	3	4	141	5781	2	14	2	18	1432	6	6	2	14	1478	2	4	44	50	1424	4	4	51	59	1447	4	0	19	23	220	0.156462585034014	0.389830508474576	0.152038700760193	2.56402157164869	0.104545454545455	0	0	18	18	224	0.122448979591837	0.36	0.157303370786517	2.28857142857143	0.0803571428571429	0.27891156462585	41	60	444	2427	2.60797329346897e-09	1.26672988539921e-08	7.98039827801505e-07	3.73292693291201	2.58304663345207	Inf	2.62489965212737	4.31081081081081	0.00670243134860935	0.0119927026848753	1	10.9158246992101	2.51842105263158	5.10705572172958e-08	4.22367311040338e-07	1.56275905084925e-05	3.48502066647882	4.88243832263364e-14	7.47013063362947e-12	1.49402612672589e-11	106	100	25
"TCGA-CR-6480-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	118	1	0	3	3	112	4592	3	6	0	9	1044	2	4	1	7	1111	13	4	43	60	1204	8	5	23	36	1233	7	2	13	22	184	0.186440677966102	0.611111111111111	0.149229521492295	4.09510869565217	0.119565217391304	7	0	17	24	173	0.203389830508475	0.4	0.143687707641196	2.78381502890173	0.138728323699422	0.372881355932203	44	43	357	2080	1.6291384866828e-14	1.1078141709443e-13	4.98516376924937e-12	5.95529119995138	4.03499016745258	Inf	3.45239705077433	4.55088702147526	1.07592646957778e-07	3.87333529048001e-07	3.29233499690801e-05	11.6331536223645	3.10287751464222	4.28997888899227e-09	3.86098100009304e-08	1.31273354003163e-06	4.85077190626279	0.00159596395974806	0.0203485404867878	0.488364971682906	74	68	31
"TCGA-CR-6481-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	543	4	1	2	3	536	21976	2	1	0	3	5383	2	1	0	3	5537	72	14	161	247	5529	84	20	179	283	5527	60	6	105	171	873	0.314917127071823	0.604240282685512	0.157951872625294	3.8254708389494	0.195876288659794	56	7	87	150	872	0.276243093922652	0.607287449392713	0.15771387230964	3.85056457304164	0.172018348623853	0.567219152854512	308	188	1745	9311	6.8596690158638e-113	2.99865531264903e-111	2.09905871885432e-110	8.73905454749189	7.43235678289102	Inf	3.93433773916258	4.7112482550878	4.77067352601251e-58	1.82478262369979e-56	1.45982609895983e-55	15.4677340164711	3.57787291420866	3.44971119367388e-63	2.63902906316052e-61	1.05561162526421e-60	6.92033253665063	2.65167999298016e-09	2.70471359283976e-07	8.11414077851929e-07	235	228	230
"TCGA-CR-6482-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	1	3	1	5	575	1	4	1	6	515	4	4	19	27	637	3	2	14	19	610	3	2	2	7	79	0.12280701754386	0.368421052631579	0.129508196721311	2.84477015323118	0.0886075949367089	3	1	2	6	82	0.105263157894737	0.222222222222222	0.1287284144427	1.72628726287263	0.0731707317073171	0.175438596491228	10	30	161	1086	0.030923467528135	0.057698665022008	1	2.24660771154653	1.09953454134483	Inf	1.93633540372671	6.63886424134871	3.2098054226312e-05	8.11735916797642e-05	0.00982200459325147	40.2478722605391	0.938829286655374	0.633216957971183	0.877498186879577	1	0.930430318171362	0.688167990308251	0.993299080350589	1	47	47	0
"TCGA-CR-6484-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	316	0	0	2	2	313	12833	1	7	0	8	3136	2	6	1	9	3035	84	9	72	165	3301	59	7	65	131	3361	40	4	25	69	467	0.218354430379747	0.526717557251908	0.138946742041059	3.79078738741684	0.147751605995717	66	4	28	98	524	0.310126582278481	0.593939393939394	0.158739775825507	3.74159148739301	0.187022900763359	0.503164556962025	159	121	991	5671	1.57376233470035e-55	3.21047516278871e-54	4.81571274418307e-53	7.51523659292479	6.07070050446767	Inf	3.81742107539282	4.98311375808853	7.88293799336352e-55	2.6801989177436e-53	2.41217902596924e-52	16.38285629067	2.60067615841847	1.68399038271683e-11	2.0612042284454e-10	5.1530105711135e-09	3.60967447688551	9.24833933652178e-09	5.65998367395133e-07	2.82999183697566e-06	157	154	117
"TCGA-CR-6487-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	149	0	1	4	5	144	5904	2	11	1	14	1416	2	9	1	12	1500	10	2	40	52	1493	11	6	49	66	1495	10	0	9	19	223	0.12751677852349	0.287878787878788	0.149163879598662	1.92994972142954	0.0852017937219731	8	1	10	19	221	0.12751677852349	0.365384615384615	0.148024112525117	2.46841280891055	0.085972850678733	0.248322147651007	37	73	444	2544	1.25356694270526e-06	4.62158415021457e-06	0.00038359148446781	2.90275548076493	2.00771724548089	Inf	2.26363636363636	5.76833976833977	1.42831764663051e-12	8.09379999757289e-12	4.37065199868936e-10	34.2947933977623	1.43668387488612	0.0667498881258206	0.177612745795662	1	1.5549516952282	1	1	1	112	107	21
"TCGA-CR-6488-01A-12D-2078-08"	0	0	0	0	44	0	1	0	1	43	1763	1	0	2	3	406	2	0	1	3	402	1	4	14	19	467	0	3	15	18	488	0	0	1	1	53	0.0227272727272727	0.0555555555555556	0.108606557377049	0.511530398322851	0.0188679245283019	0	0	0	0	67	0	0	0.143468950749465	0	0	0.0227272727272727	1	29	120	835	0.981597486028319	0.994598777233992	1	0.240151489975757	0.011839924973345	Inf	0.265277777777778	0	1	1	1	0	0.274425287356322	0.979020282104044	1	1	0.248725621821282	1	1	1	43	42	0
"TCGA-CR-6491-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	167	0	4	3	7	158	6478	8	11	2	21	1580	10	12	1	23	1560	11	10	40	61	1684	4	11	38	53	1654	2	1	4	7	225	0.0419161676646707	0.132075471698113	0.136033857315599	0.970901467505241	0.0311111111111111	4	0	8	12	218	0.0718562874251497	0.19672131147541	0.129453681710214	1.51962701158069	0.055045871559633	0.107784431137725	18	75	443	2895	0.0663831856692367	0.114764151495969	1	1.56815289352019	0.959250944763056	Inf	1.45838491225515	3.01399548532731	0.00959667315165811	0.0161350658483922	1	4.35397095581643	1.1592290328182	0.341655923814481	0.607829724925763	1	1.18809936350823	0.103139735513871	0.358644989400506	1	149	140	0
"TCGA-CR-6492-01A-12D-2078-08"	0	0	0	0	77	0	0	1	1	76	3116	3	6	0	9	761	5	9	1	15	766	4	5	22	31	781	9	0	12	21	808	3	0	5	8	119	0.103896103896104	0.380952380952381	0.147277227722772	2.58663465386154	0.0672268907563025	2	3	6	11	111	0.142857142857143	0.354838709677419	0.142125480153649	2.49665794827085	0.0990990990990991	0.207792207792208	16	31	230	1359	0.000790493675135594	0.00196659402106904	0.241891064591492	3.04677236132542	1.70365125474929	Inf	2.35189639222942	2.65719063545151	0.0307248342128544	0.0477248693864642	1	3.68856360345145	2.23516624040921	0.00741918228674693	0.0288442737570514	1	2.82342396231206	0.0991480719971313	0.355813953488372	1	61	60	9
"TCGA-CR-6493-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	42	0	1	2	3	39	1599	2	2	1	5	379	0	5	0	5	370	1	3	10	14	425	3	1	11	15	425	1	0	0	1	50	0.0238095238095238	0.0666666666666667	0.117647058823529	0.566666666666667	0.02	1	0	2	3	53	0.0714285714285714	0.214285714285714	0.124705882352941	1.71832884097035	0.0566037735849057	0.0952380952380952	4	21	103	747	0.365879303111352	0.476381139948662	1	1.38084005305883	0.42681052861382	Inf	1.32038834951456	4.12621359223301	0.0760967153841929	0.103491532922502	1	7.2216469569804	0.785945446139621	0.742335316154793	0.934792620343073	1	0.76362819960993	1	1	1	38	35	0
"TCGA-CR-7364-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	519	0	4	15	19	495	20295	17	29	3	49	4841	26	24	4	54	4825	33	93	86	212	5364	36	73	71	180	5265	7	10	10	27	666	0.0520231213872832	0.15	0.126495726495726	1.18581081081081	0.0405405405405405	5	8	10	23	693	0.0443159922928709	0.108490566037736	0.129194630872483	0.839745160499877	0.0331890331890332	0.0616570327552987	32	194	1359	9270	0.29866362578341	0.404385263228865	1	1.12510045792092	0.796640128847284	Inf	1.10742542343082	1.36020731356176	0.167029652531275	0.20982765753461	1	1.43598016564413	0.996330197831864	0.543408796483741	0.839813594565781	1	0.9957948046535	0.132839090607782	0.414783282918177	1	487	463	0
"TCGA-CR-7365-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	184	0	6	5	11	171	7011	0	11	2	13	1691	3	8	0	11	1733	20	11	30	61	1778	34	12	40	86	1809	26	3	23	52	307	0.282608695652174	0.604651162790698	0.169707020453289	3.56291190061359	0.169381107491857	15	4	13	32	257	0.173913043478261	0.524590163934426	0.144544431946007	3.62926580340626	0.124513618677043	0.418478260869565	77	47	564	3023	5.54569926653174e-30	6.52686144445659e-29	1.69698397555871e-27	8.77305587107541	6.31522851647213	Inf	3.94931079844429	4.82883504071447	4.40942966823698e-22	4.49761826160172e-21	1.34928547848052e-19	16.8864581340716	3.27082066869301	9.04564831284646e-12	1.15332015988792e-10	2.76796838373102e-09	5.67116844601212	0.535811588712662	0.867504476963358	1	107	94	58
"TCGA-CR-7367-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	202	0	7	3	10	190	7790	10	9	5	24	1899	5	17	3	25	1864	7	24	53	84	2047	5	12	40	57	1980	2	1	4	7	253	0.0346534653465347	0.12280701754386	0.127777777777778	0.961098398169336	0.0276679841897233	2	2	8	12	283	0.0594059405940594	0.142857142857143	0.138251099169516	1.03331650681474	0.0424028268551237	0.0792079207920792	16	89	536	3491	0.324473109981285	0.433575422071062	1	1.1708184390366	0.702524189249361	Inf	1.14484719260839	2.50435323383085	0.064830080003011	0.0905844953466729	1	3.25515626942411	0.969427058257102	0.592600448640445	0.863503510876077	1	0.964902395997433	0.0201131343656855	0.123092382317995	1	186	174	0
"TCGA-CR-7368-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	236	0	4	6	10	225	9225	9	9	1	19	2277	6	7	4	17	2378	27	8	53	88	2214	29	10	62	101	2356	19	1	20	40	354	0.169491525423729	0.396039603960396	0.15025466893039	2.63578900262908	0.112994350282486	23	3	25	51	363	0.216101694915254	0.579545454545455	0.163956639566396	3.5347483095417	0.140495867768595	0.36864406779661	87	84	717	3853	2.36822415559482e-25	2.19598967155156e-24	7.24676591612015e-23	5.56273587807542	4.23533587314268	Inf	3.24280016638528	4.78033472803347	2.32094472216632e-22	2.4489968447686e-21	7.10209084982894e-20	16.1057337818402	2.49408768419138	2.13751770629551e-09	2.04400130664508e-08	6.54080418126426e-07	3.45329744979432	0.766729062619274	1	1	149	138	60
"TCGA-CR-7369-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	87	0	2	3	5	82	3362	3	10	1	14	796	2	6	4	12	818	1	5	23	29	865	3	9	15	27	883	2	1	4	7	98	0.0804597701149425	0.259259259259259	0.110985277463194	2.33597883597884	0.0714285714285714	1	0	7	8	124	0.0919540229885057	0.275862068965517	0.143352601156069	1.92436040044494	0.0645161290322581	0.160919540229885	14	28	222	1526	0.000562834221191949	0.00142822031036154	0.172227271684736	3.43354591378908	1.84397196063053	Inf	2.62462462462462	5.90540540540541	0.00757689036897063	0.0132414266915543	1	20.5555174533738	2.27927927927928	0.00696692965987614	0.0276867594275597	1	2.79821159665949	0.00922057031339852	0.0723460132282038	1	73	68	9
"TCGA-CR-7370-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	611	1	2	17	19	578	23698	19	27	7	53	5607	21	17	8	46	5688	36	108	99	243	6218	36	105	95	236	6185	13	19	17	49	823	0.0801963993453355	0.207627118644068	0.133063864187551	1.56035690013798	0.0595382746051033	15	16	25	56	848	0.0916530278232406	0.230452674897119	0.136378256674172	1.68980510909232	0.0660377358490566	0.114566284779051	70	196	1671	10732	3.05882453136501e-08	1.35652218347492e-07	9.36000306597693e-06	2.29355387946039	1.79313179202822	Inf	1.9532898673974	2.88652835959838	8.04554830941018e-08	3.00236314960916e-07	2.46193778267951e-05	4.08673424213757	1.60693331359085	0.00130525424096743	0.00633980631327037	0.399407797736034	1.77453767657703	0.0566540492422985	0.287725576017237	1	541	508	34
"TCGA-CR-7371-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	337	0	1	6	7	327	13407	13	10	0	23	3200	19	9	4	32	3216	40	33	56	129	3527	46	43	54	143	3464	35	6	11	52	448	0.154302670623145	0.363636363636364	0.12933025404157	2.81168831168831	0.116071428571429	20	4	22	46	492	0.136498516320475	0.356589147286822	0.139495321803232	2.55628033024516	0.0934959349593496	0.261127596439169	88	108	940	6051	8.61522869825572e-26	8.23831244270703e-25	2.63625998166625e-23	5.2433083982556	4.06418922562615	Inf	3.3391663048198	4.7563706086096	1.08327359675504e-26	1.32592688242817e-25	3.31481720607042e-24	11.4140472976599	2.23117021276596	6.19078206040207e-06	4.30540752382508e-05	0.00189437931048303	2.75826894234991	0.00247228071220959	0.0244038031592301	0.756517897936134	249	239	62
"TCGA-CR-7372-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	55	0	2	2	4	50	2050	1	4	1	6	467	1	4	1	6	536	0	7	12	19	574	0	6	13	19	473	0	1	1	2	72	0.0363636363636364	0.105263157894737	0.152219873150106	0.691520467836257	0.0277777777777778	0	2	0	2	63	0.0363636363636364	0.105263157894737	0.109756097560976	0.95906432748538	0.0317460317460317	0.0181818181818182	1	24	135	912	0.967709613684232	0.990365022700251	1	0.281692291296597	0.0138031270850284	Inf	0.310222222222222	NA	1	1	1	0	0.310222222222222	0.967709613684232	1	1	0.281692291296597	1	1	1	54	49	0
"TCGA-CR-7373-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	136	0	1	4	5	131	5371	0	3	1	4	1308	3	4	3	10	1197	21	4	40	65	1480	13	6	33	52	1386	11	1	8	20	168	0.147058823529412	0.384615384615385	0.121212121212121	3.17307692307692	0.119047619047619	16	1	11	28	188	0.205882352941176	0.430769230769231	0.127027027027027	3.3911620294599	0.148936170212766	0.338235294117647	46	61	356	2510	1.87433049486451e-14	1.24683724223596e-13	5.7354513142854e-12	5.31204634662469	3.71854026072847	Inf	3.46098918408065	6.39309319233311	1.78046333390606e-18	1.55663365764358e-17	5.44821780175254e-16	27.1192873633058	2.09535170078498	0.00143721394933707	0.00676596105380221	0.439787468497143	2.47965876866151	0.152334743122051	0.456407358683308	1	90	85	33
"TCGA-CR-7374-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	416	1	3	9	12	401	16441	12	13	4	29	4175	8	21	5	34	4042	50	54	70	174	4070	43	50	71	164	4154	27	9	24	60	621	0.144230769230769	0.365853658536585	0.149494463168031	2.44727229880994	0.0966183574879227	28	9	21	58	621	0.139423076923077	0.333333333333333	0.152579852579853	2.18464841653247	0.0933977455716586	0.240384615384615	100	134	1242	6982	2.62343216926707e-23	2.36108895234036e-22	8.02770243795723e-21	4.19433021092193	3.32181553490081	Inf	2.82973423070041	3.91598704829186	6.14392539909868e-22	6.06464894233612e-21	1.8800411721242e-19	8.13309610623746	2.11326960633159	5.65106040634283e-07	4.32306121085227e-06	0.000172922448434091	2.6346403146384	0.235722088022494	0.578190601795426	1	316	301	65
"TCGA-CR-7376-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	72	0	1	1	2	70	2870	2	4	2	8	673	3	2	4	9	703	8	2	17	27	756	8	3	15	26	738	7	0	3	10	93	0.138888888888889	0.384615384615385	0.126016260162602	3.05210918114144	0.10752688172043	7	1	4	12	104	0.166666666666667	0.444444444444444	0.137566137566138	3.23076923076923	0.115384615384615	0.291666666666667	21	27	197	1297	3.80000267715076e-07	1.49077028103607e-06	0.000116280081920813	5.11222529077365	2.96816107010389	Inf	3.31789340101523	6.63578680203046	6.82924632813224e-11	3.54194809560757e-10	2.08974937640847e-08	45.9429145343743	1.65894670050761	0.124203259860665	0.276009015596176	1	1.84250767591303	0.0689935471511018	0.304881066340192	1	51	49	15
"TCGA-CR-7377-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	149	0	0	1	1	146	5986	2	18	6	26	1466	6	12	0	18	1489	6	5	39	50	1554	7	9	36	52	1477	4	2	3	9	217	0.0604026845637584	0.173076923076923	0.146919431279621	1.17803970223325	0.0414746543778802	2	1	9	12	207	0.0805369127516778	0.24	0.133204633204633	1.80173913043478	0.0579710144927536	0.120805369127517	18	70	424	2607	0.0643469899905104	0.111876016688046	1	1.58078756542273	0.963610502449894	Inf	1.46221054888508	3.29934687953556	0.00546466893654145	0.00989460766024665	1	5.26570248150675	1.14377358490566	0.359007585597974	0.631358167775747	1	1.1710720381139	0.117971798543708	0.388165272627684	1	131	128	0
"TCGA-CR-7379-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	170	1	1	4	5	164	6724	5	13	6	24	1624	6	6	4	16	1716	7	9	38	54	1720	12	11	47	70	1664	4	3	5	12	236	0.0705882352941176	0.171428571428571	0.141826923076923	1.20871670702179	0.0508474576271186	3	2	3	8	238	0.0470588235294118	0.148148148148148	0.138372093023256	1.07065048241519	0.0336134453781513	0.0882352941176471	15	89	474	2910	0.496149704669232	0.610401578765943	1	1.03469813637397	0.610288728421865	Inf	1.02969814995131	2.63024650233178	0.0116855844968331	0.0194336350871246	1	3.57930041035307	0.67192851824274	0.920687322874238	1	1	0.637915368303375	1	1	1	155	149	0
"TCGA-CR-7380-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	113	0	6	4	10	103	4223	3	4	2	9	929	1	6	0	7	1038	3	9	32	44	1163	1	3	39	43	1093	1	1	3	5	163	0.0442477876106195	0.116279069767442	0.149130832570906	0.779711799115423	0.0306748466257669	2	1	3	6	134	0.0530973451327434	0.136363636363636	0.115219260533104	1.18351424694708	0.0447761194029851	0.079646017699115	9	66	297	1959	0.668206170719748	0.746244847592127	1	0.899459525957307	0.447072222533824	Inf	0.911515151515152	5.6969696969697	0.00835974165385013	0.0142909550060231	1	19.7404822833747	0.641912078531797	0.917106139570818	1	1	0.60896829604462	0.386996904024768	0.754274220583306	1	104	94	0
"TCGA-CR-7382-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	99	1	1	2	3	94	3854	0	4	2	6	933	0	1	0	1	947	8	1	35	44	957	7	8	28	43	1017	4	2	2	8	142	0.0808080808080808	0.186046511627907	0.139626352015733	1.33245987553226	0.0563380281690141	5	0	6	11	137	0.111111111111111	0.25	0.143155694879833	1.7463503649635	0.0802919708029197	0.171717171717172	17	61	279	1695	0.0476396654301268	0.0852499276118059	1	1.69259096463182	1.00724967612845	Inf	1.54204576785222	4.24516129032258	5.58340309228723e-05	0.000137783979535475	0.0170852134623989	9.09548355282034	0.898446833930705	0.682210244307625	0.903707076875036	1	0.883743399604545	1	1	1	82	77	0
"TCGA-CR-7383-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	122	0	0	5	5	117	4797	7	9	1	17	1070	4	5	3	12	1215	5	11	28	44	1278	4	8	32	44	1234	2	2	2	6	158	0.0491803278688525	0.136363636363636	0.128038897893031	1.06501726121979	0.0379746835443038	1	3	4	8	171	0.0655737704918033	0.181818181818182	0.133802816901408	1.35885167464115	0.0467836257309941	0.0737704918032787	9	60	329	2183	0.560453229101504	0.671737246966706	1	0.995290503297218	0.493326410795845	Inf	0.995903264173384	2.5450861195542	0.103724138297785	0.136792206060659	1	3.31533633855829	0.763525835866261	0.813431512118718	0.973851583194362	1	0.73732990917364	0.419710144927536	0.777817589386625	1	113	108	0
"TCGA-CR-7385-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	56	1	0	2	2	53	2173	1	3	1	5	502	0	2	1	3	534	5	0	20	25	551	7	2	11	20	586	6	0	4	10	85	0.178571428571429	0.5	0.145051194539249	3.44705882352941	0.117647058823529	4	0	8	12	73	0.214285714285714	0.48	0.132486388384755	3.62301369863014	0.164383561643836	0.392857142857143	22	21	158	979	1.89984373043217e-08	8.67689823152603e-08	5.81352181512244e-06	6.47480260364244	3.66178873935043	Inf	3.68177803944657	5.99683544303798	1.78175743943035e-07	6.19565655074644e-07	5.45217776465687e-05	30.8224357845493	2.78562678644345	0.000702774012376888	0.00384015799620228	0.215048847787328	3.90684613177355	0.763492917774079	1	1	34	31	16
"TCGA-CR-7386-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	219	0	0	4	4	215	8815	0	2	0	2	2167	0	5	0	5	2106	49	4	63	116	2296	29	14	49	92	2246	20	9	20	49	330	0.223744292237443	0.532608695652174	0.146927871772039	3.62496706192358	0.148484848484848	40	1	33	74	368	0.337899543378995	0.637931034482759	0.160278745644599	3.98013493253373	0.201086956521739	0.515981735159817	113	77	698	3844	2.96037129180087e-41	5.66171009556916e-40	9.05873615291066e-39	8.07622282853727	6.21086620264591	Inf	3.87004976624943	5.00551024906326	1.19374314632497e-32	1.73945429893067e-31	3.65285402775441e-30	18.3455279504739	3.07928264428981	5.00876079102842e-15	7.66340401027348e-14	1.5326808020547e-12	4.94470128479804	0.442775085150155	0.789149902990866	1	106	102	84
"TCGA-CR-7388-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	826	1	2	16	18	806	33046	21	24	6	51	7862	26	34	14	74	8324	105	95	115	315	8191	131	112	123	366	8669	78	17	48	143	1237	0.173123486682809	0.390710382513661	0.142692352059061	2.73813120938636	0.115602263540825	48	9	43	100	1186	0.121065375302663	0.317460317460317	0.144793065559761	2.19251050616987	0.0843170320404722	0.26271186440678	217	257	2423	14437	5.14694160440367e-58	1.12497437924823e-56	1.57496413094752e-55	5.03034703590143	4.28405855461708	Inf	3.18555823150504	3.71503319179893	7.9413825195041e-44	1.73575932212018e-42	2.43006305096825e-41	6.82373427312018	2.66053264062538	2.41059746626569e-19	5.67417557444078e-18	7.37642824677301e-17	3.68813530921712	0.00188879599276166	0.0215924426450742	0.577971573785068	609	589	149
"TCGA-CR-7389-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	132	0	1	4	5	127	5207	7	16	1	24	1267	10	22	3	35	1312	3	4	31	38	1272	4	4	22	30	1356	2	0	2	4	202	0.0303030303030303	0.133333333333333	0.148967551622419	0.895049504950495	0.0198019801980198	1	1	3	5	182	0.0378787878787879	0.131578947368421	0.143081761006289	0.919606709080393	0.0274725274725275	0.0606060606060606	8	52	384	2244	0.665631201171524	0.746092115598851	1	0.899099609495133	0.424083162529074	Inf	0.9125	2.93303571428571	0.0697011149063059	0.0960745097357189	1	4.37934958442206	0.64563679245283	0.901947998330648	1	1	0.608820672999513	0.637186343068696	0.955779514603044	1	124	119	0
"TCGA-CR-7390-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	161	0	1	5	6	154	6314	6	9	2	17	1527	5	5	1	11	1593	13	12	37	62	1611	21	9	34	64	1583	14	2	8	24	218	0.149068322981366	0.375	0.137713202779533	2.7230504587156	0.110091743119266	5	1	7	13	219	0.0807453416149068	0.209677419354839	0.135940409683426	1.54242156429518	0.0593607305936073	0.211180124223602	34	71	437	2757	1.31181557717392e-06	4.77875674541928e-06	0.000401415566615219	3.01976599596787	2.06180283496394	Inf	2.36669935708837	4.0843989769821	1.18931878273833e-08	4.98536366462916e-08	3.63931547517929e-06	7.9821033239119	1.54413897573082	0.0580106123645819	0.159921147599658	1	1.68956246095825	0.484367169012616	0.831041026605307	1	127	120	20
"TCGA-CR-7391-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	13	0	0	1	1	12	492	0	4	1	5	122	1	1	0	2	128	1	0	2	3	131	1	0	1	2	111	1	0	0	1	18	0.0769230769230769	0.5	0.162162162162162	3.08333333333333	0.0555555555555556	1	0	0	1	22	0.0769230769230769	0.333333333333333	0.16793893129771	1.98484848484848	0.0454545454545455	0.153846153846154	2	3	40	202	0.201492475291728	0.297858441735598	1	3.34388408987207	0.403673961170834	Inf	2.42	6.05	0.0290427039060919	0.0455747045910981	1	Inf	0	1	1	1	0	0.333333333333333	0.708333333333333	1	11	10	0
"TCGA-CR-7392-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	39	0	0	2	2	37	1517	1	0	0	1	314	2	1	0	3	370	2	1	14	17	400	5	2	9	16	433	0	0	1	1	46	0.0256410256410256	0.0625	0.106235565819861	0.588315217391304	0.0217391304347826	0	0	1	1	36	0.0256410256410256	0.0588235294117647	0.09	0.65359477124183	0.0277777777777778	0.0512820512820513	2	28	82	751	0.808971308337638	0.856557855886911	1	0.654455831881257	0.109195779667833	Inf	0.677235772357724	0	1	1	1	0	0.883351007423118	0.67828700178354	0.902416619764188	1	0.872354385731471	0.333333333333333	0.708333333333333	1	37	35	0
"TCGA-CR-7393-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	4	0	0	1	1	3	123	0	2	1	3	31	0	0	0	0	31	0	0	0	0	30	0	0	0	0	31	0	0	0	0	6	0	NA	0.193548387096774	NA	0	0	0	0	0	2	0	NA	0.0666666666666667	NA	0	0	0	0	8	53	1	1	1	0	0	Inf	NA	NA	1	1	1	0	NA	1	1	1	0	1	1	1	4	3	0
"TCGA-CR-7394-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	208	2	0	0	0	206	8446	0	10	0	10	1988	1	8	3	12	1990	14	5	71	90	2164	21	8	65	94	2304	14	3	23	40	341	0.192307692307692	0.425531914893617	0.148003472222222	2.87514818743371	0.117302052785924	11	0	25	36	301	0.173076923076923	0.4	0.13909426987061	2.87574750830565	0.119601328903654	0.350961538461538	73	98	642	3826	2.30509158195803e-18	1.80861031815169e-17	7.05358024079157e-16	4.43732398545623	3.36113143788671	Inf	2.97101528483722	4.971072541166	5.20647195981669e-14	3.54040093267535e-13	1.59318041970391e-11	14.8830578908818	2.45629466739967	2.00949760506909e-09	1.98356860371336e-08	6.14906267151141e-07	3.24947301294271	0.000323798603749976	0.00619264829671829	0.0990823727474927	135	133	48
"TCGA-CR-7395-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	205	1	3	4	7	196	8036	4	6	10	20	1948	2	8	12	22	1969	11	3	68	82	2074	14	5	53	72	2045	11	2	16	29	299	0.141463414634146	0.402777777777778	0.146210268948655	2.75478446674099	0.096989966555184	6	0	31	37	281	0.180487804878049	0.451219512195122	0.135486981677917	3.33035326794549	0.131672597864769	0.31219512195122	64	82	580	3539	1.97785238227253e-17	1.4761532414034e-16	6.05222828975394e-15	4.75982652808766	3.52616675414936	Inf	3.1130845536136	4.8291724137931	1.41129320708622e-09	6.54326850558157e-09	4.31855721368383e-07	12.9523541593693	2.7585209461385	3.97320893402776e-11	4.67616128389421e-10	1.21580193381249e-08	3.87376716790747	2.8218731586946e-07	9.59436873956164e-06	8.63493186560548e-05	141	132	43
"TCGA-CR-7397-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	55	0	0	0	0	55	2255	1	3	0	4	490	0	0	0	0	525	7	2	22	31	619	2	3	15	20	621	1	2	7	10	79	0.181818181818182	0.5	0.127214170692432	3.93037974683544	0.126582278481013	6	0	2	8	68	0.145454545454545	0.258064516129032	0.109854604200323	2.34914611005693	0.117647058823529	0.290909090909091	16	30	147	1093	7.00175291179858e-05	0.000194776035546397	0.0214253639101037	3.9594422912274	2.19081462354347	Inf	2.93404318249039	6.56084656084656	1.11006509484588e-05	2.97964841248105e-05	0.00339679919022839	25.9037496078451	2.05184776613348	0.0289073155292186	0.0921420682493843	1	2.3877463455506	0.737986306385978	1	1	39	39	11
"TCGA-CR-7398-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	393	0	5	12	17	375	15375	17	13	1	31	3734	20	20	4	44	3769	30	70	49	149	3825	18	69	64	151	4047	7	10	15	32	582	0.0814249363867685	0.211920529801325	0.143810229799852	1.47361234382467	0.0549828178694158	3	7	7	17	547	0.0432569974554707	0.114093959731544	0.143006535947712	0.797823393003938	0.0310786106032907	0.0814249363867685	32	129	1129	6743	0.0351499392685948	0.0647944663625904	1	1.48147430084617	1.03624632066369	Inf	1.38584687157876	1.45261293179805	0.142570781858034	0.181777746868993	1	1.57161166385834	1.35748606723783	0.0836410341867268	0.206404487589826	1	1.4438324645035	0.0171129639434273	0.112149533737531	1	361	343	0
"TCGA-CR-7399-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	323	0	1	11	12	310	12710	11	10	3	24	3052	14	15	4	33	3195	22	58	51	131	3209	15	54	53	122	3254	6	8	7	21	474	0.065015479876161	0.172131147540984	0.145666871542717	1.18167669641004	0.0443037974683544	9	5	13	27	474	0.0835913312693498	0.206106870229008	0.147709566843253	1.3953522079428	0.0569620253164557	0.108359133126935	35	106	948	5515	0.00119881067617748	0.00280027531992602	0.366836066910309	1.9207479504819	1.35054446537626	Inf	1.6922898524703	2.76385562777968	0.00012365052649667	0.00028883252754184	0.037837061107981	3.96536583382541	1.31105972086985	0.124174339821937	0.276009015596176	1	1.38504245499144	0.396522476231877	0.755555555555556	1	288	275	14
"TCGA-CR-7401-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	107	0	2	1	3	104	4264	4	12	1	17	980	0	7	2	9	1047	4	3	23	30	1115	7	4	37	48	1122	2	0	3	5	153	0.0467289719626168	0.104166666666667	0.136363636363636	0.763888888888889	0.0326797385620915	1	0	2	3	135	0.0280373831775701	0.1	0.121076233183857	0.825925925925926	0.0222222222222222	0.0747663551401869	8	63	288	1949	0.708684769788697	0.777267166865022	1	0.85941315345016	0.407629593701149	Inf	0.875195618153365	2.11837121212121	0.161269679594658	0.203919512214733	1	2.53622051727675	0.647280092592593	0.898117742461688	1	1	0.615325185730316	0.619269619269619	0.942768674111957	1	99	96	0
"TCGA-CR-7402-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	1070	2	9	29	38	1017	41697	66	55	11	132	9933	69	62	22	153	9887	65	195	93	353	11056	76	197	106	379	10821	7	13	17	37	1371	0.0345794392523364	0.0976253298153034	0.126698087052953	0.770535152393434	0.0269876002917578	12	18	11	41	1447	0.0383177570093458	0.11614730878187	0.130879160636758	0.887439285343712	0.0283344851416724	0.0439252336448598	47	293	2818	19059	0.326807891963788	0.434796586699648	1	1.08492129666332	0.820631324526377	Inf	1.07316306934413	1.04611942477186	0.45443499243484	0.518869804795004	1	1.05331206003668	1.09232464665414	0.33951746924852	0.607557576549983	1	1.10740029695709	0.162352923495433	0.464299014856098	1	1023	970	0
"TCGA-CR-7404-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	151	0	1	3	4	145	5945	2	1	2	5	1438	0	6	1	7	1444	19	2	46	67	1527	19	4	43	66	1536	12	1	18	31	221	0.205298013245033	0.46969696969697	0.143880208333333	3.26450020567668	0.14027149321267	12	1	18	31	232	0.205298013245033	0.462686567164179	0.151931892599869	3.04535512094699	0.133620689655172	0.397350993377483	60	67	453	2610	3.5334995027006e-17	2.57440678053901e-16	1.08125084782638e-14	5.15571671752366	3.73785661607065	Inf	3.19445168691662	4.27047751829906	2.13981126941249e-11	1.12893491110383e-10	6.54782248440222e-09	9.86485744981556	2.73502492744996	7.39104740423017e-09	6.46188715912695e-08	2.26166050569443e-06	3.91116572468157	0.047643599092298	0.251361057280055	1	91	85	41
"TCGA-CV-5430-01A-02D-1683-08"	0	0	0	0	175	0	6	6	12	163	6683	2	11	3	16	1615	2	13	0	15	1595	20	11	40	71	1660	20	5	36	61	1813	11	2	11	24	232	0.137142857142857	0.39344262295082	0.127964699393271	3.07461842849067	0.103448275862069	12	1	10	23	251	0.131428571428571	0.323943661971831	0.151204819277108	2.14241625049099	0.0916334661354582	0.251428571428571	44	72	483	2990	2.95539537069123e-10	1.58658067268687e-09	9.04350983431516e-08	3.78115908588358	2.67159089634807	Inf	2.72742200328407	4.13452380952381	2.25645160363297e-10	1.09599077890744e-09	6.90474190711689e-08	8.36625314052203	1.98684210526316	0.00148717780328702	0.00689509708796709	0.455076407805828	2.36286955270472	0.836390330665317	1	1	131	119	28
"TCGA-CV-5431-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	106	0	3	1	4	102	4182	3	6	3	12	1006	5	3	2	10	1005	5	2	29	36	1060	6	5	33	44	1111	3	0	6	9	149	0.0849056603773585	0.204545454545455	0.134113411341134	1.5251677852349	0.0604026845637584	1	0	6	7	158	0.0660377358490566	0.194444444444444	0.149056603773585	1.30450070323488	0.0443037974683544	0.150943396226415	16	57	307	1864	0.0508023900371822	0.0903809962289404	1	1.70384216691417	0.997534720775618	Inf	1.54995314800767	2.57151317737637	0.0587739224407306	0.084041216200297	1	3.46665565175551	1.36870862666807	0.164230277804839	0.346582517298488	1	1.45691716334356	0.0121137107800173	0.0907356681889356	1	90	86	0
"TCGA-CV-5432-01A-02D-1683-08"	0	0	0	0	305	2	1	4	5	298	12218	22	20	6	48	3007	14	16	7	37	3011	16	48	48	112	3111	21	42	38	101	3089	3	4	5	12	450	0.039344262295082	0.118811881188119	0.14567821301392	0.815577557755776	0.0266666666666667	3	9	7	19	460	0.0622950819672131	0.169642857142857	0.147862423657988	1.14730201863354	0.041304347826087	0.059016393442623	18	105	910	5290	0.545029299684632	0.661821292474196	1	0.996546809340798	0.620053704770452	Inf	0.997051728759046	1.1048411048411	0.465737060131337	0.525887602952727	1	1.12507517552409	0.950677229746997	0.621651328048569	0.870891327309468	1	0.942676657453957	0.160936246562223	0.464299014856098	1	287	280	0
"TCGA-CV-5434-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	168	0	4	5	9	156	6396	7	7	1	15	1501	8	11	3	22	1569	9	10	41	60	1691	7	12	40	59	1635	3	2	2	7	194	0.0416666666666667	0.11864406779661	0.118654434250765	0.999912633234318	0.0360824742268041	2	0	7	9	232	0.0535714285714286	0.15	0.137196924896511	1.09331896551724	0.0387931034482759	0.0833333333333333	14	83	426	2900	0.363342660544537	0.475140402250548	1	1.1481802118655	0.663000238023856	Inf	1.12685736411597	2.43984741784038	0.0453073902322566	0.0657064521851683	1	3.09281264636424	0.867501304121022	0.724098806788464	0.923225978655291	1	0.850989361923137	0.285163190900305	0.639094482160175	1	154	142	0
"TCGA-CV-5435-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	136	0	3	5	8	126	5166	1	9	3	13	1192	2	13	3	18	1288	9	10	22	41	1313	10	15	29	54	1373	3	4	3	10	189	0.0735294117647059	0.185185185185185	0.137654770575382	1.34528708602783	0.0529100529100529	0	2	6	8	161	0.0588235294117647	0.195121951219512	0.122619954303123	1.59127404938646	0.0496894409937888	0.0882352941176471	12	58	350	2336	0.200290013887081	0.297518175968188	1	1.3807030597475	0.751101017173041	Inf	1.31559183673469	1.21172932330827	0.459814347817728	0.52306018748039	1	1.25131450122657	1.35428571428571	0.21769408026388	0.428799088376839	1	1.42998820761375	0.0750357540123947	0.318901954552678	1	124	114	0
"TCGA-CV-5436-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	129	0	7	8	15	113	4633	2	9	1	12	1078	4	11	2	17	1148	11	5	28	44	1186	12	5	23	40	1221	5	1	6	12	171	0.0930232558139535	0.3	0.14004914004914	2.14210526315789	0.0701754385964912	5	0	5	10	157	0.0775193798449612	0.227272727272727	0.132377740303541	1.71685002895194	0.0636942675159236	0.162790697674419	21	53	328	2079	0.000849890219988734	0.00209730973642381	0.260066407316553	2.51017142727535	1.55203751756697	Inf	2.08252307185234	3.1906150583245	0.000504776481288878	0.00108015107184893	0.154461603274397	4.87082581719686	1.58279531324725	0.0828168860462819	0.20603225309075	1	1.74258654820202	1	1	1	108	92	11
"TCGA-CV-5439-01A-01D-1683-08"	0	0	0	0	127	3	2	7	9	115	4715	7	12	0	19	1066	5	7	0	12	1138	5	18	23	46	1206	3	11	24	38	1305	2	1	3	6	181	0.047244094488189	0.157894736842105	0.138697318007663	1.13841232916546	0.0331491712707182	2	3	2	7	138	0.0551181102362205	0.152173913043478	0.114427860696517	1.32986767485822	0.0507246376811594	0.0708661417322835	9	46	319	2192	0.264045514835398	0.36232254502077	1	1.34424414179501	0.658086645755028	Inf	1.28805927614705	3.93573667711599	0.0121723352563354	0.0201337004780467	1	6.86191582664048	0.837390782365104	0.729007135765114	0.925627317610477	1	0.81809246400661	1	1	1	118	106	0
"TCGA-CV-5440-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	132	0	1	5	6	124	5084	4	6	0	10	1166	3	7	0	10	1252	14	7	31	52	1364	16	10	26	52	1302	10	2	10	22	187	0.166666666666667	0.423076923076923	0.143625192012289	2.94570135746606	0.117647058823529	7	0	11	18	199	0.136363636363636	0.346153846153846	0.145894428152493	2.37263239273289	0.0904522613065327	0.287878787878788	38	49	386	2280	1.33335145553452e-10	7.28581331059934e-10	4.08005545393563e-08	4.57713326477894	3.08790899389836	Inf	3.01673515573819	3.91381692573402	1.24356417041254e-07	4.37391535800273e-07	3.80530636146237e-05	7.71411967621077	2.54458685574039	3.23196252266416e-05	0.000201832761619435	0.00988980531935233	3.44337153979917	0.502088678425209	0.839558118022481	1	94	86	25
"TCGA-CV-5441-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	427	1	6	16	22	395	16195	16	16	4	36	3757	16	21	4	41	3808	19	61	71	151	4402	22	87	58	167	4228	3	12	8	23	549	0.053864168618267	0.137724550898204	0.129848628192999	1.06065464699017	0.0418943533697632	3	6	12	21	570	0.0491803278688525	0.139072847682119	0.129486597001363	1.07403276402928	0.0368421052631579	0.0608899297423888	26	144	1119	7511	0.21497971596034	0.31325615754221	1	1.21189465022441	0.821314735061387	Inf	1.17951952899122	1.12862093768391	0.443719674849839	0.510444437985153	1	1.15063025965313	1.19569660064703	0.231447468078551	0.445427202717211	1	1.2315669820266	0.0020432952162021	0.022330297719923	0.625248336157843	401	369	0
"TCGA-CV-5442-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	308	0	3	4	7	301	12341	4	4	0	8	3175	4	2	4	10	2992	35	12	108	155	3131	21	9	98	128	3043	17	2	47	66	474	0.214285714285714	0.515625	0.155767334866908	3.31022547468354	0.139240506329114	24	4	39	67	499	0.217532467532468	0.432258064516129	0.159374001916321	2.7122244488978	0.134268537074148	0.412337662337662	127	135	973	5201	3.07017665207195e-33	4.08466980666964e-32	9.39474055534017e-31	5.02682479433092	4.03556678056649	Inf	3.07578669888517	4.64568345323741	3.16232644905688e-21	3.02397466691064e-20	9.67671893411405e-19	14.6003297148266	2.64901864915834	2.87791161249746e-18	6.29029252445873e-17	8.80640953424223e-16	3.82970016438813	5.00321186336728e-08	2.55163805031731e-06	1.53098283019039e-05	181	174	86
"TCGA-CV-5443-01A-01D-1512-08"	0	0	0	0	74	0	1	7	8	66	2706	2	6	0	8	602	0	0	1	1	644	2	5	18	25	723	2	6	24	32	737	0	1	2	3	82	0.0405405405405405	0.09375	0.111261872455902	0.842606707317073	0.0365853658536585	0	1	2	3	85	0.0405405405405405	0.12	0.117565698478562	1.02070588235294	0.0352941176470588	0.0540540540540541	4	42	167	1293	0.786207604658912	0.835345579950094	1	0.737516226269658	0.238760508115894	Inf	0.760218693048685	0	1	1	1	0	0.832620473339036	0.723166715010835	0.923225978655291	1	0.815110864790018	0.0606060606060606	0.294372294372294	1	70	62	0
"TCGA-CV-5444-01A-02D-1512-08"	0	0	0	0	158	0	1	4	5	152	6232	3	1	1	5	1472	3	4	1	8	1483	21	8	45	74	1583	17	8	40	65	1694	12	1	11	24	233	0.151898734177215	0.369230769230769	0.13754427390791	2.68445031363486	0.103004291845494	14	1	15	30	216	0.189873417721519	0.405405405405405	0.136449778900821	2.9710960960961	0.138888888888889	0.329113924050633	52	71	449	2828	3.92592786619314e-14	2.55602963203213e-13	1.2013339270551e-11	4.60997087324989	3.31039790458735	Inf	3.08551976388361	4.99367014418005	3.15683904673033e-14	2.24649476348717e-13	9.65992748299481e-12	13.6278252097272	2.23246429975108	6.08246758743188e-05	0.000357929823414261	0.0186123508175416	2.77442866042727	1	1	1	106	100	35
"TCGA-CV-5966-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	126	0	1	2	3	122	5002	7	6	5	18	1204	3	9	4	16	1140	9	10	28	47	1358	8	2	31	41	1300	7	0	7	14	164	0.111111111111111	0.341463414634146	0.126153846153846	2.70672218917311	0.0853658536585366	5	3	9	17	184	0.134920634920635	0.361702127659574	0.135493372606775	2.66951896392229	0.0923913043478261	0.222222222222222	28	48	348	2310	2.57127216238677e-07	1.0352753706452e-06	7.86809281690352e-05	3.86957524331191	2.49815400818618	Inf	2.81397459165154	5.39148073022312	9.78809036969639e-08	3.56566149181797e-07	2.9951556531271e-05	15.9000267871332	2.07130333138515	0.003516673600733	0.0153728874546328	1	2.46880239954219	0.444257105378429	0.789149902990866	1	98	94	18
"TCGA-CV-5970-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	227	0	1	3	4	223	9143	2	4	6	12	2127	2	5	3	10	2170	20	7	76	103	2391	23	9	66	98	2455	13	1	17	31	339	0.136563876651982	0.316326530612245	0.138085539714868	2.29080127626272	0.0914454277286136	15	1	23	39	347	0.171806167400881	0.378640776699029	0.14512756168967	2.60902045270138	0.112391930835735	0.299559471365639	68	117	686	4160	7.94862757879808e-14	5.06725008148378e-13	2.43228003911221e-11	3.52323454613656	2.67826446028733	Inf	2.59654873532425	4.59990507831039	4.28911560882891e-14	2.98288494614011e-13	1.31246937630165e-11	11.3101666608762	1.98989857512421	1.53737725763835e-05	0.000102269008877682	0.00470437440837335	2.37755411492849	0.0624904865013034	0.298782638584357	1	159	155	42
"TCGA-CV-5971-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	33	0	0	0	0	33	1353	1	0	0	1	315	0	0	0	0	302	2	0	15	17	360	6	0	9	15	376	3	0	3	6	47	0.181818181818182	0.4	0.125	3.2	0.127659574468085	1	0	1	2	48	0.0606060606060606	0.117647058823529	0.133333333333333	0.882352941176471	0.0416666666666667	0.242424242424242	8	24	95	641	0.0524543683539126	0.0927805590537414	1	2.24605925746397	0.988775999876596	Inf	1.93684210526316	3.87368421052632	0.01352342333488	0.0222482125831897	1	6.71911212513296	1.29122807017544	0.382705310726487	0.669187571898886	1	1.34888202731441	1	1	1	25	25	0
"TCGA-CV-5973-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	73	0	2	6	8	65	2665	4	2	0	6	578	0	3	1	4	657	2	3	22	27	712	0	3	25	28	718	0	0	2	2	107	0.0273972602739726	0.0714285714285714	0.149025069637883	0.479305740987984	0.0186915887850467	2	0	1	3	75	0.0410958904109589	0.111111111111111	0.105337078651685	1.05481481481481	0.04	0.0684931506849315	5	44	182	1248	0.76327104792262	0.816646645679447	1	0.779341612080997	0.290283134313025	Inf	0.801749271137026	7.85714285714286	0.0164318424042257	0.0264639146089109	1	Inf	0.501519756838906	0.947226497876051	1	1	0.467717706485492	1	1	1	68	60	0
"TCGA-CV-5976-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	92	0	1	3	4	88	3608	6	8	3	17	882	1	4	1	6	820	4	3	25	32	963	5	5	23	33	943	2	0	4	6	112	0.0652173913043478	0.181818181818182	0.118769883351007	1.53084415584416	0.0535714285714286	3	1	5	9	116	0.0978260869565217	0.28125	0.120456905503634	2.3348599137931	0.0775862068965517	0.152173913043478	14	43	228	1678	0.00730333424762798	0.0152028590460827	1	2.39472434592021	1.33021326769008	Inf	2.05324715297014	4.64424951267056	0.00213104236834962	0.00412720863743661	0.652098964714984	9.17930574032423	1.56743421052632	0.118247767326202	0.268028272606058	1	1.69782174361576	0.2723034767446	0.618778536581209	1	78	74	7
"TCGA-CV-5977-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	107	0	0	3	3	104	4264	1	6	0	7	936	0	5	1	6	1057	6	5	27	38	1139	11	6	36	53	1132	9	3	5	17	161	0.158878504672897	0.320754716981132	0.142226148409894	2.25524434548225	0.105590062111801	4	0	8	12	138	0.11214953271028	0.315789473684211	0.121158911325724	2.60640732265446	0.0869565217391304	0.242990654205607	26	54	299	1972	1.09761551957716e-05	3.4986494686522e-05	0.00335870348990611	3.17332161214742	2.03766691352997	Inf	2.46847826086957	5.80818414322251	6.40396819798345e-09	2.79944895511848e-08	1.95961426858294e-06	21.3851253581917	1.56728778467909	0.0686342196212834	0.181052337966489	1	1.71430431925249	1	1	1	81	78	15
"TCGA-CV-5978-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	199	0	2	4	6	193	7913	7	8	4	19	1903	11	14	2	27	1934	13	26	37	76	2049	9	29	33	71	2027	3	1	6	10	294	0.050251256281407	0.140845070422535	0.145041933892452	0.971064482130881	0.0340136054421769	3	3	3	9	251	0.0452261306532663	0.118421052631579	0.122498779892631	0.966712098972531	0.0358565737051793	0.0753768844221105	15	77	545	3531	0.247750464351052	0.34775982610744	1	1.26204583180586	0.741189803365999	Inf	1.21938571998404	2.03969974979149	0.0646382539167436	0.0905844953466729	1	2.42887513522987	0.961572739187418	0.603718020513727	0.867313212569016	1	0.955908086090874	0.507678201004119	0.839727186525732	1	184	178	0
"TCGA-CV-5979-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	43	0	0	1	1	42	1722	0	5	1	6	412	4	1	1	6	364	0	5	11	16	485	1	5	8	14	461	0	1	1	2	47	0.0465116279069767	0.142857142857143	0.101952277657267	1.40121580547112	0.0425531914893617	0	2	0	2	50	0.0465116279069767	0.125	0.103092783505155	1.2125	0.04	0.0232558139534884	1	19	97	849	0.884901832715709	0.927328632914407	1	0.460936579100381	0.0222782162077483	Inf	0.487628865979381	0	1	1	1	0	0.513293543136191	0.871906878344902	0.999264062822247	1	0.486530505767553	1	1	1	42	41	0
"TCGA-CV-6003-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	114	0	2	6	8	106	4346	2	3	1	6	1052	1	5	1	7	1018	6	7	36	49	1129	7	4	33	44	1147	5	1	6	12	155	0.105263157894737	0.272727272727273	0.135135135135135	2.01818181818182	0.0774193548387097	4	0	9	13	141	0.114035087719298	0.26530612244898	0.12488928255093	2.12433058329715	0.0921985815602837	0.210526315789474	24	58	296	1980	0.000120120862248142	0.000331143998630013	0.0367569838479314	2.76630091461459	1.76005524829876	Inf	2.25049439683586	5.32328482328482	5.19723711633762e-06	1.45904087853148e-05	0.00159035455759931	15.0182642436041	1.67156286721504	0.0328337952025837	0.102521850326435	1	1.85743909804889	0.156361771924298	0.456407358683308	1	90	82	13
"TCGA-CV-6433-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	71	0	0	4	4	65	2665	0	4	0	4	657	2	3	2	7	690	3	6	20	29	695	4	4	17	25	623	2	0	3	5	89	0.0704225352112676	0.2	0.142857142857143	1.4	0.0561797752808989	1	2	2	5	91	0.0704225352112676	0.172413793103448	0.130935251798561	1.31678666161425	0.0549450549450549	0.112676056338028	8	36	180	1138	0.253389171610851	0.352441302331456	1	1.404542888925	0.644878529585889	Inf	1.33131313131313	3.13809523809524	0.0593737767230688	0.0844513941337399	1	4.73305975543729	0.989489489489489	0.584404954962728	0.863503510876077	1	0.987855594833807	0.649916646820672	0.956127374649642	1	63	57	0
"TCGA-CV-6436-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	86	0	1	2	3	83	3403	0	6	0	6	749	0	2	1	3	791	7	5	25	37	885	2	5	30	37	978	1	1	4	6	118	0.0697674418604651	0.162162162162162	0.120654396728016	1.34402198808978	0.0508474576271186	2	0	2	4	106	0.0465116279069767	0.108108108108108	0.119774011299435	0.902600713921469	0.0377358490566038	0.104651162790698	9	55	224	1639	0.367405062182628	0.476381139948662	1	1.19719049729151	0.588937695297609	Inf	1.16957310267857	2.77232142857143	0.0849256531147758	0.113481440406644	1	3.65463886471667	0.907305194805195	0.66248330395575	0.893039167446958	1	0.895980884068981	0.369849964277209	0.74141876430206	1	77	74	0
"TCGA-CV-6441-01A-11D-1683-08"	0	0	0	0	259	1	4	9	13	241	9881	7	10	3	20	2464	3	12	8	23	2462	34	12	57	103	2459	37	15	43	95	2496	26	3	21	50	410	0.193050193050193	0.526315789473684	0.164262820512821	3.20410783055199	0.121951219512195	27	2	21	50	363	0.193050193050193	0.485436893203884	0.147620984139894	3.28840033164835	0.137741046831956	0.366795366795367	95	76	773	4182	1.29602175236688e-31	1.58633062489706e-30	3.96582656224265e-29	6.75873075224969	5.14479191425041	Inf	3.56116142015236	4.78499717581036	1.02569775411957e-27	1.30776463650245e-26	3.13863512760588e-25	15.9155051770909	2.69223803363519	4.45375363350449e-10	4.54282870617458e-09	1.36284861185237e-07	3.91616968352678	0.156610368175645	0.456407358683308	1	164	146	68
"TCGA-CV-6933-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	138	0	2	2	4	133	5453	7	10	2	19	1274	7	15	1	23	1442	11	7	24	42	1340	15	7	27	49	1397	9	1	6	16	206	0.115942028985507	0.326530612244898	0.147458840372226	2.21438478303943	0.0776699029126214	4	2	5	11	197	0.0797101449275362	0.261904761904762	0.147014925373134	1.78148416727097	0.0558375634517767	0.173913043478261	24	53	403	2334	0.000253662928222211	0.000657803864711835	0.0776208560359966	2.62131696302012	1.66426822795318	Inf	2.11685089104444	3.39578163771712	2.71869804708512e-05	6.99093783536174e-05	0.00831921602408047	5.78577420642642	1.46484698097601	0.124474654092393	0.276009015596176	1	1.59236326735299	0.784553146909804	1	1	114	109	13
"TCGA-CV-6934-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	108	0	2	4	6	101	4141	5	6	2	13	1065	5	7	5	17	1040	7	12	24	43	1026	6	4	18	28	1010	1	1	0	2	146	0.0185185185185185	0.0714285714285714	0.144554455445545	0.49412915851272	0.0136986301369863	4	1	3	8	150	0.0740740740740741	0.186046511627907	0.146198830409357	1.27255813953488	0.0533333333333333	0.0740740740740741	8	47	296	1740	0.559264719379316	0.671737246966706	1	1.00059260035204	0.468750120109199	Inf	1.0004914004914	2.64553014553015	0.0310272306787015	0.047951174685266	1	3.67060823679922	0.491312741312741	0.95407619524658	1	1	0.452311670945043	0.649916646820672	0.956127374649642	1	100	93	0
"TCGA-CV-6935-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	253	0	1	7	8	244	10004	7	17	3	27	2429	7	7	3	17	2535	20	43	38	101	2539	19	35	45	99	2501	7	6	21	34	398	0.134387351778656	0.343434343434343	0.159136345461815	2.15811380132988	0.085427135678392	11	7	7	25	344	0.0988142292490119	0.247524752475248	0.135486411973218	1.82693414690306	0.0726744186046512	0.181818181818182	46	76	742	4298	7.2652611373364e-10	3.76808458987278e-09	2.22316990802494e-07	3.50476085784893	2.50643016443522	Inf	2.56108877203835	3.13497822931785	3.24534913845573e-06	9.54881573430244e-06	0.000993076836367453	4.96268227363487	2.2914298704251	1.46448474041719e-05	9.95849623483689e-05	0.0044813233056766	2.94802472148479	0.0888577695486736	0.353123084180443	1	207	198	28
"TCGA-CV-6936-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	322	0	2	6	8	312	12792	8	7	2	17	3105	11	14	5	30	3171	36	12	76	124	3148	47	15	79	141	3368	32	2	36	70	515	0.217391304347826	0.49645390070922	0.15290973871734	3.24671211182263	0.135922330097087	29	2	28	59	457	0.183229813664596	0.475806451612903	0.145171537484117	3.27754641067269	0.12910284463895	0.388198757763975	125	113	972	5544	1.22677465924458e-39	2.08551692071579e-38	3.75393045728842e-37	6.306741647396	5.01234411356592	Inf	3.52085278555867	4.92681838464971	3.42765681400588e-32	4.76755902311727e-31	1.0488629850858e-29	15.8036486629601	2.76798088410992	5.42678702038763e-15	7.9076039439934e-14	1.66059682823861e-12	4.01029151695088	0.803305989452984	1	1	197	187	89
"TCGA-CV-6937-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	149	0	2	6	8	141	5781	4	16	6	26	1418	5	11	4	20	1401	9	7	34	50	1484	4	12	29	45	1478	3	0	4	7	213	0.0469798657718121	0.155555555555556	0.144113667117727	1.07939488784559	0.0328638497652582	4	3	7	14	187	0.0939597315436242	0.28	0.126010781671159	2.2220320855615	0.0748663101604278	0.120805369127517	18	58	400	2562	0.0125678703193796	0.0253011073534879	1	1.98725031700094	1.19938648451206	Inf	1.75381578947368	3.98730769230769	0.000695816552614033	0.00144843445646186	0.212919865099894	7.46386465360358	1.29293650793651	0.229011339274598	0.443528289987513	1	1.35475048620965	0.349886699961308	0.723414393163245	1	131	123	8
"TCGA-CV-6938-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	175	0	4	8	12	163	6683	6	11	2	19	1557	5	9	0	14	1557	14	8	32	54	1743	11	5	60	76	1826	5	2	5	12	225	0.0685714285714286	0.157894736842105	0.123220153340635	1.28140350877193	0.0533333333333333	6	0	4	10	221	0.0571428571428571	0.185185185185185	0.12679288582903	1.46053293112117	0.0452488687782805	0.114285714285714	20	97	446	3123	0.0949801388332755	0.156257647757969	1	1.44359390115176	0.912695148325462	Inf	1.36790464144724	3.5209865470852	0.000104178267964182	0.000247120542612711	0.0318785499970397	5.49742441665058	0.782828036654319	0.825323092569102	0.975092147977395	1	0.759331413060766	0.762554397606516	1	1	155	143	0
"TCGA-CV-6939-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	55	0	1	7	8	46	1886	1	2	1	4	439	0	4	3	7	456	5	3	11	19	478	4	3	9	16	513	0	1	3	4	62	0.0727272727272727	0.25	0.120857699805068	2.06854838709677	0.0645161290322581	1	0	2	3	53	0.0545454545454545	0.157894736842105	0.110878661087866	1.4240317775571	0.0566037735849057	0.109090909090909	6	23	115	876	0.118418103346252	0.183009796080571	1	1.98549102910619	0.776058771807869	Inf	1.78290854572714	0.957487922705314	0.67189993777026	0.734290646277498	1	0.952216029080575	2.15434782608696	0.0776507500066402	0.199042646481417	1	2.53602766434722	0.102564102564103	0.358644989400506	1	49	40	0
"TCGA-CV-6940-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	148	0	1	4	5	143	5863	0	4	3	7	1405	3	10	2	15	1396	14	6	38	58	1492	14	15	34	63	1570	8	3	12	23	199	0.155405405405405	0.365079365079365	0.126751592356688	2.88027438781208	0.115577889447236	13	1	14	28	212	0.189189189189189	0.482758620689655	0.142091152815013	3.3975276512687	0.132075471698113	0.317567567567568	47	53	411	2651	2.34828972526567e-15	1.6711085021658e-14	7.18576655931295e-13	5.71489841683637	3.97520375994134	Inf	3.50155717761557	5.58759124087591	3.37785514678668e-13	1.98773783637832e-12	1.03362367491672e-10	19.3172089149017	2.69032170856988	1.52984630529638e-06	1.11460230814451e-05	0.000468132969420692	3.64363418847364	0.427037107898539	0.777817589386625	1	101	96	34
"TCGA-CV-6941-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	169	0	2	6	8	160	6560	4	6	7	17	1549	8	14	2	24	1557	5	10	44	59	1678	11	11	38	60	1776	1	2	7	10	222	0.0591715976331361	0.166666666666667	0.125	1.33333333333333	0.045045045045045	1	1	3	5	232	0.029585798816568	0.0847457627118644	0.138259833134684	0.612945645821157	0.021551724137931	0.0710059171597633	12	86	454	3000	0.648549879697592	0.732310934271082	1	0.922040127817688	0.510507985730334	Inf	0.931583205969613	0.950991189427313	0.641581272825852	0.706200969369463	1	0.943998439893684	0.92779628236811	0.649382274726303	0.884745108707078	1	0.917771800536761	0.00777505983850181	0.0639097744360902	1	157	148	0
"TCGA-CV-6942-01A-21D-2012-08"	0	0	0	0	262	1	2	6	8	252	10332	4	4	2	10	2489	5	7	1	13	2535	36	15	47	98	2585	44	17	70	131	2723	34	7	26	67	369	0.255725190839695	0.511450381679389	0.135512302607418	3.77419888702704	0.181571815718157	27	3	16	46	371	0.175572519083969	0.469387755102041	0.143520309477756	3.27053193244953	0.123989218328841	0.393129770992366	103	94	740	4568	4.18781397093322e-35	6.40735537552783e-34	1.28147107510557e-32	6.76022324649965	5.24336754187149	Inf	3.75033612292496	5.46939189189189	3.0490179773201e-35	5.48823235917618e-34	9.32999501059951e-33	19.799436603723	2.57491337491338	3.95790066129371e-09	3.67005334047235e-08	1.21111760235588e-06	3.45575601191071	0.0160180819476465	0.111398478999542	1	159	149	76
"TCGA-CV-6943-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	72	0	0	2	2	69	2829	1	2	0	3	640	1	1	1	3	733	5	8	13	26	722	17	4	16	37	734	10	1	7	18	135	0.25	0.486486486486487	0.183923705722071	2.64504504504505	0.133333333333333	3	0	4	7	93	0.0972222222222222	0.269230769230769	0.128808864265928	2.09015715467328	0.0752688172043011	0.333333333333333	24	27	228	1228	2.6753021873224e-07	1.06317203807877e-06	8.18642469320654e-05	4.78035949560352	2.84283977687522	Inf	3.00515995872033	3.77352472089314	5.34279408334217e-06	1.48626817227519e-05	0.0016348949895027	7.76262333481894	2.42226255293406	0.00346354336235008	0.0153600618678134	1	3.28774553986112	0.777511985060768	1	1	48	45	16
"TCGA-CV-6945-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	151	0	2	6	8	142	5822	9	7	1	17	1409	8	5	2	15	1406	10	22	26	58	1474	8	16	28	52	1533	3	2	3	8	213	0.0529801324503311	0.153846153846154	0.13894324853229	1.10725893824485	0.0375586854460094	2	2	4	8	177	0.0529801324503311	0.137931034482759	0.120081411126187	1.14864601597506	0.0451977401129944	0.0794701986754967	12	60	390	2617	0.222972868960312	0.319810228042666	1	1.34190695392255	0.731843061787508	Inf	1.28504273504274	2.14173789173789	0.0748287487036932	0.102221415639867	1	2.57958401111109	0.999477682811016	0.56254045588859	0.856404873143824	1	0.999400085864154	0.715987167706469	1	1	139	130	0
"TCGA-CV-6948-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	234	0	4	9	13	221	9061	5	5	5	15	2197	7	12	2	21	2134	18	25	54	97	2416	22	14	52	88	2314	12	2	13	27	309	0.115384615384615	0.306818181818182	0.133535004321521	2.29766107678729	0.087378640776699	9	6	12	27	330	0.115384615384615	0.278350515463918	0.13658940397351	2.03786316776007	0.0818181818181818	0.196581196581197	46	100	639	4091	3.24971818853082e-08	1.42059109384347e-07	9.94413765690431e-06	2.94410195933963	2.13382308446202	Inf	2.33219714022338	3.88615023474178	6.7037894428432e-09	2.8892388302958e-08	2.05135956951002e-06	7.07022544662972	1.74579974606549	0.0038971229724017	0.0165627726327072	1	1.97569871943243	0.559600662518471	0.891863555888813	1	188	175	26
"TCGA-CV-6950-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	69	0	0	3	3	66	2706	2	9	2	13	697	3	6	1	10	602	2	4	9	15	710	2	7	19	28	697	0	1	3	4	84	0.0579710144927536	0.142857142857143	0.12051649928264	1.18537414965986	0.0476190476190476	1	1	1	3	80	0.0434782608695652	0.2	0.112676056338028	1.775	0.0375	0.072463768115942	5	27	164	1243	0.319902335448015	0.429342608101283	1	1.403190177709	0.508586402240044	Inf	1.34051067073171	2.14481707317073	0.392258171143667	0.458133589198329	1	2.52428151042162	1.22560975609756	0.418865573293484	0.712071474598923	1	1.26298659498368	0.265734265734266	0.613912410902645	1	64	61	0
"TCGA-CV-6951-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	152	0	2	6	8	144	5904	4	8	3	15	1422	6	6	3	15	1481	14	19	24	57	1514	13	7	37	57	1487	8	2	10	20	213	0.131578947368421	0.350877192982456	0.143241425689307	2.44955110781649	0.0938967136150235	9	7	4	20	218	0.131578947368421	0.350877192982456	0.143989431968296	2.43682600997908	0.0917431192660551	0.203947368421053	31	57	431	2570	1.36654986547298e-06	4.91957951570273e-06	0.000418164258834732	3.24123632694787	2.15468726030701	Inf	2.45283168107994	4.38403368565782	1.18599301564453e-08	4.98536366462916e-08	3.62913862787226e-06	10.1236647482745	1.59803735118482	0.0504995318884212	0.147170064360542	1	1.77577202562606	0.646614689782289	0.956127374649642	1	121	113	18
"TCGA-CV-6952-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	194	1	7	6	13	176	7216	7	21	3	31	1970	6	17	4	27	1756	18	8	36	62	1732	13	8	35	56	1758	12	4	10	26	270	0.134020618556701	0.464285714285714	0.15358361774744	3.02301587301587	0.0962962962962963	8	3	7	18	285	0.0927835051546392	0.290322580645161	0.164549653579677	1.76434634974533	0.0631578947368421	0.190721649484536	37	65	555	2935	7.32089477231409e-07	2.76567135842977e-06	0.000224019380032811	3.00900608325321	2.07130333852834	Inf	2.28104575163399	4.05696018599244	1.92693387045546e-09	8.80062334864733e-09	5.89641764359371e-07	9.60390017435973	1.50564649156198	0.0532892993168886	0.152397435429607	1	1.66454778549926	0.66610724847994	0.975257502559147	1	157	139	21
"TCGA-CV-6953-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	122	0	0	2	2	118	4838	2	2	3	7	1147	2	4	0	6	1195	8	11	31	50	1291	6	9	40	55	1205	4	1	6	11	181	0.0901639344262295	0.2	0.150207468879668	1.33149171270718	0.0607734806629834	6	4	7	17	177	0.139344262295082	0.34	0.13710302091402	2.47988700564972	0.096045197740113	0.188524590163934	23	62	358	2138	0.00199010110305127	0.00447772748186536	0.608970937533689	2.21457557734461	1.40685848755168	Inf	1.88655931646402	4.98004788507582	2.36847105015835e-06	7.24752141348455e-06	0.000724752141348455	14.9022508351607	1.2765756550476	0.216961902850105	0.428799088376839	1	1.33839765723009	0.587482643053771	0.912536491240883	1	99	95	11
"TCGA-CV-6954-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	186	0	3	5	8	176	7216	11	10	0	21	1760	13	16	9	38	1741	11	19	33	63	1803	15	11	28	54	1912	9	3	4	16	270	0.0860215053763441	0.296296296296296	0.141213389121339	2.09821673525377	0.0592592592592593	2	2	2	6	243	0.032258064516129	0.0952380952380952	0.13477537437604	0.706643151087596	0.0246913580246914	0.0913978494623656	17	70	513	3202	0.0894296641019879	0.147921498460585	1	1.5156500182414	0.913464885400615	Inf	1.41504783670543	3.06380266906583	0.000385488860571148	0.000842568509534081	0.117959591334771	4.5745887037121	0.712299875371489	0.862817371894277	0.999264062822247	1	0.680975799098774	0.215152332169602	0.548512116794694	1	169	159	0
"TCGA-CV-6955-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	157	0	4	5	9	148	6068	3	6	0	9	1394	2	3	6	11	1490	15	9	38	62	1584	21	8	37	66	1600	16	1	11	28	223	0.178343949044586	0.424242424242424	0.139375	3.0438918331295	0.125560538116592	9	1	7	17	195	0.10828025477707	0.274193548387097	0.123106060606061	2.2272952853598	0.0871794871794872	0.273885350318471	43	68	418	2766	3.8795244713022e-11	2.19839720040458e-10	1.18713448821847e-08	4.18198097528588	2.93223775746497	Inf	2.95081684555369	5.28973950026582	2.19166107046755e-14	1.59678163705493e-13	6.7064828756307e-12	15.0163812239316	1.82813397129187	0.00826511853158606	0.0310797327069112	1	2.08906260764527	0.205232571980756	0.532213279882299	1	114	105	28
"TCGA-CV-6956-01A-21D-2012-08"	0	0	0	0	221	0	2	6	8	208	8528	7	11	2	20	2040	14	10	8	32	2111	12	21	37	70	2179	21	18	47	86	2198	12	3	6	21	315	0.0950226244343891	0.244186046511628	0.143312101910828	1.70387596899225	0.0666666666666667	5	3	7	15	309	0.0678733031674208	0.214285714285714	0.14180816888481	1.51109570041609	0.0485436893203883	0.135746606334842	30	87	624	3753	0.000999552052219076	0.00240836951164596	0.305862927979037	2.07353928934069	1.4088237296903	Inf	1.79857001972387	3.61349067599068	5.6247269158302e-07	1.89139168818027e-06	0.000172116643624404	6.38595225878876	1.08556547619048	0.422966303341988	0.715070103992532	1	1.10123818037334	0.473625930815391	0.828299256567221	1	191	178	13
"TCGA-CV-6959-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	77	0	1	6	7	70	2870	0	1	0	1	664	0	1	0	1	618	8	9	21	38	813	5	8	17	30	775	0	1	1	2	81	0.025974025974026	0.0666666666666667	0.104516129032258	0.637860082304527	0.0246913580246914	3	0	1	4	100	0.051948051948052	0.105263157894737	0.1230012300123	0.85578947368421	0.04	0.0649350649350649	5	46	181	1407	0.704952841301861	0.777267166865022	1	0.845043844260711	0.315345270884929	Inf	0.860145163037591	2.02464938376541	0.180626426299503	0.225218791311192	1	2.33053032200802	0.461762140157022	0.939806182793896	1	1	0.432022681432227	1	1	1	72	65	0
"TCGA-CV-6960-01A-41D-2012-08"	0	0	0	0	201	2	1	13	14	183	7503	5	10	2	17	1753	5	8	2	15	1802	13	27	28	68	1889	15	39	29	83	2059	5	5	3	13	275	0.0646766169154229	0.156626506024096	0.133559980573094	1.17270536692223	0.0472727272727273	4	3	2	9	247	0.0447761194029851	0.132352941176471	0.130757014293277	1.01220528697309	0.0364372469635627	0.0696517412935323	14	71	522	3426	0.232573612949273	0.32947928501147	1	1.29406378975434	0.743823088121691	Inf	1.24570655848546	2.43103448275862	0.00826760434542583	0.0142128479196646	1	3.10761993507364	0.663440209719702	0.887106959482352	1	1	0.631141011297171	0.331888880262254	0.708333333333333	1	187	169	0
"TCGA-CV-6961-01A-21D-1912-08"	0	0	0	0	631	4	3	3	6	616	25256	2	6	2	10	5849	2	7	0	9	6296	100	21	175	296	6426	122	30	149	301	6685	89	10	92	191	1043	0.302694136291601	0.634551495016611	0.156020942408377	4.06709179691855	0.183125599232982	79	6	102	187	968	0.29635499207607	0.631756756756757	0.150638032990974	4.19387285012285	0.193181818181818	0.573692551505547	362	184	2011	11100	1.82834331997448e-149	1.86491018637397e-147	5.59473055912191e-147	10.8563959617778	9.27230520383684	Inf	4.32254650703184	4.933783111804	6.93825826694272e-87	5.30776757421118e-85	2.12310702968447e-84	17.1663111429667	3.90373624079906	4.81227376211145e-72	4.90851923735368e-70	1.4725557712061e-69	8.23487295802498	0.0686707431724078	0.304881066340192	1	269	254	278
"TCGA-CV-6962-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	168	1	4	13	17	149	6109	9	13	7	29	1468	4	8	2	14	1437	10	12	32	54	1606	5	21	26	52	1598	0	1	2	3	185	0.0178571428571429	0.0576923076923077	0.115769712140175	0.498336798336798	0.0162162162162162	1	3	5	9	193	0.0535714285714286	0.166666666666667	0.120174346201743	1.38687392055268	0.0466321243523316	0.0476190476190476	8	65	378	2826	0.642168452240174	0.727790912538864	1	0.920156715979796	0.437963418552713	Inf	0.928897586431833	0.565079365079365	0.847922877538535	0.920086526690751	1	0.534096094954395	1.02298850574713	0.536203446095538	0.832884540635709	1	1.02613922471021	0.0271907389958272	0.156988040240059	1	160	141	0
"TCGA-CV-7089-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	183	0	3	4	7	175	7175	2	11	2	15	1711	2	17	1	20	1802	26	9	38	73	1819	28	8	31	67	1843	22	2	16	40	268	0.218579234972678	0.597014925373134	0.145415084102008	4.10559144575629	0.149253731343284	19	3	17	39	263	0.213114754098361	0.534246575342466	0.14458493677845	3.69503619980207	0.14828897338403	0.404371584699454	74	49	531	3131	7.66683821754692e-30	8.68908331321984e-29	2.34605249456936e-27	8.89608709077507	6.4083672781284	Inf	4.14906680140248	5.23617214201018	2.10738848831893e-23	2.30307456223426e-22	6.44860877425593e-21	18.5717139954692	3.29828870875297	8.74773176228378e-11	9.91409599725495e-10	2.67680591925884e-08	5.40130380775362	0.264363348625935	0.613912410902645	1	109	101	56
"TCGA-CV-7090-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	59	0	2	0	2	57	2337	3	3	1	7	613	0	2	1	3	561	6	2	17	25	589	4	4	14	22	574	2	1	3	6	78	0.101694915254237	0.272727272727273	0.13588850174216	2.00699300699301	0.0769230769230769	5	0	2	7	96	0.11864406779661	0.28	0.162988115449915	1.71791666666667	0.0729166666666667	0.203389830508475	12	29	174	989	0.0165329255009077	0.0322234089380749	1	2.34983903625474	1.21143246594658	Inf	1.95626576955425	4.67873563218391	0.000148817676246938	0.000339837380086291	0.045538208931563	13.2134181132125	1.078049684835	0.506753932661248	0.803454421732341	1	1.09300005262587	0.695097590523624	0.99859090469591	1	47	45	6
"TCGA-CV-7091-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	159	0	4	6	10	147	6027	5	11	5	21	1424	6	8	2	16	1448	20	10	31	61	1642	10	10	29	49	1513	3	0	8	11	223	0.0691823899371069	0.224489795918367	0.14738929279577	1.52310789786767	0.0493273542600897	5	1	5	11	200	0.0691823899371069	0.180327868852459	0.121802679658953	1.48049180327869	0.055	0.132075471698113	21	69	423	2732	0.00825188650011885	0.0170613328988944	1	1.9652237172714	1.23628534296462	Inf	1.74034672970843	1.98896769109535	0.0410075421712966	0.0615113132569449	1	2.3477315375775	1.61603624901497	0.054689598080737	0.154953861228755	1	1.78603490368867	0.227056448152681	0.56487213930667	1	138	126	9
"TCGA-CV-7095-01A-21D-2012-08"	0	0	0	0	276	0	2	4	6	270	11070	8	12	4	24	2545	5	14	2	21	2643	31	8	75	114	2975	37	10	64	111	2907	18	2	20	40	386	0.144927536231884	0.36036036036036	0.132782937736498	2.71390561546002	0.103626943005181	23	1	21	45	396	0.16304347826087	0.394736842105263	0.133109243697479	2.96551036682616	0.113636363636364	0.297101449275362	82	125	782	5100	3.49831007608454e-20	3.05852252366248e-19	1.07048288328187e-17	4.27699205072415	3.31662074645208	Inf	2.9796261289645	4.53516624040921	4.03159858395219e-19	3.62843872555697e-18	1.23366916668937e-16	9.89585144288101	2.21864247732249	6.90419323005325e-07	5.15288567901535e-06	0.000211268312839629	2.72785753997338	1	1	1	194	188	54
"TCGA-CV-7097-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	109	0	2	7	9	98	4018	3	10	1	14	962	2	10	3	15	970	4	4	19	27	1056	5	9	28	42	1030	2	4	4	10	119	0.0917431192660551	0.238095238095238	0.115533980582524	2.06082432973189	0.0840336134453782	0	0	2	2	134	0.018348623853211	0.0740740740740741	0.126893939393939	0.583747927031509	0.0149253731343284	0.073394495412844	8	48	253	1833	0.372398379203772	0.480818160490946	1	1.20738816390729	0.565517506317667	Inf	1.17786561264822	1.83223539745279	0.301162967722244	0.359983859855495	1	2.06910338015159	1.05256076023884	0.515043690198375	0.81238850103455	1	1.06023839645401	0.193027325346615	0.513620535270123	1	101	90	0
"TCGA-CV-7099-01A-41D-2012-08"	0	0	0	0	341	3	4	6	10	326	13366	3	8	1	12	3142	3	5	1	9	3146	57	11	78	146	3591	51	9	99	159	3487	35	5	42	82	475	0.240469208211144	0.515723270440252	0.136220246630341	3.78595167163191	0.172631578947368	42	3	41	86	508	0.252199413489736	0.589041095890411	0.14146477304372	4.16387121130407	0.169291338582677	0.469208211143695	160	125	983	6095	6.20007149969787e-59	1.58101823242296e-57	1.89722187890755e-56	7.93223769388263	6.42078776053534	Inf	4.04233370812586	5.13362345051053	1.03143795102509e-40	2.10413342009118e-39	3.15620013013678e-38	15.3901002556899	3.37646200090809	3.88503308313412e-25	1.18882012343904e-23	1.18882012343904e-22	5.47284923221929	0.585021008384481	0.912536491240883	1	181	166	120
"TCGA-CV-7100-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	21	0	4	3	7	14	574	0	2	0	2	134	0	0	2	2	150	0	1	4	5	153	1	1	3	5	137	0	0	0	0	18	0	0	0.131386861313869	0	0	0	0	1	1	22	0.0476190476190476	0.2	0.143790849673203	1.39090909090909	0.0454545454545455	0.0476190476190476	1	7	40	250	0.69862685782106	0.774564559758132	1	0.893211642374253	0.039245084603746	Inf	0.90625	0	1	1	1	0	1.03571428571429	0.650547874049322	0.884745108707078	1	1.04152863962181	1	1	1	20	13	0
"TCGA-CV-7101-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	228	1	2	9	11	213	8733	4	13	1	18	2048	4	11	9	24	2049	12	20	46	78	2287	17	18	58	93	2349	8	4	9	21	294	0.0921052631578947	0.225806451612903	0.125159642401022	1.80414746543779	0.0714285714285714	6	3	10	19	306	0.0833333333333333	0.243589743589744	0.133799737647573	1.82055471761354	0.0620915032679739	0.144736842105263	33	100	600	4036	0.000195869396802454	0.000521182916709139	0.0599360354215509	2.21931926427023	1.53896517829744	Inf	1.91714285714286	3.73011494252874	4.6859256455781e-06	1.34008714724009e-05	0.0014338932475469	6.27403797979142	1.41160256410256	0.0782707015546944	0.199042646481417	1	1.50345376084101	0.36379331305743	0.74141876430206	1	195	180	16
"TCGA-CV-7102-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	167	0	2	1	3	162	6642	4	6	1	11	1541	4	5	4	13	1623	22	14	35	71	1691	18	8	41	67	1787	12	3	13	28	254	0.167664670658683	0.417910447761194	0.142137660884163	2.94018098483958	0.110236220472441	18	2	9	29	247	0.173652694610778	0.408450704225352	0.146067415730337	2.79631635969664	0.117408906882591	0.311377245508982	52	64	501	2977	1.43027059315322e-14	9.94688185238376e-14	4.37662801504885e-12	4.82490890911878	3.44504160513898	Inf	3.11198293069034	5.2065868263473	2.15364181651678e-17	1.83059554403926e-16	6.59014395854135e-15	17.8014887919984	2.00955982771299	0.000950633057478911	0.00493040195912791	0.290893715588547	2.42001461366695	0.187851395737532	0.508694930050308	1	115	110	35
"TCGA-CV-7103-01A-21D-2012-08"	0	0	0	0	53	0	4	2	6	44	1804	1	3	2	6	431	0	2	3	5	424	3	4	10	17	464	7	2	7	16	485	5	0	2	7	62	0.132075471698113	0.4375	0.127835051546392	3.42237903225806	0.112903225806452	1	1	1	3	53	0.0566037735849057	0.176470588235294	0.114224137931034	1.5449500554939	0.0566037735849057	0.169811320754717	9	18	115	834	0.00409390318223743	0.00882207305468066	1	3.61918521456028	1.62036740488055	Inf	2.75072463768116	4.95130434782609	0.000490849326111057	0.00106524747368783	0.150199893789983	10.8249249288929	1.45626598465473	0.344951086838987	0.610144696952197	1	1.55320074907194	0.369849964277209	0.74141876430206	1	44	35	6
"TCGA-CV-7104-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	125	1	3	8	11	110	4510	3	5	1	9	1091	2	4	4	10	1041	12	13	25	50	1272	4	10	27	41	1106	2	2	6	10	145	0.08	0.24390243902439	0.131103074141049	1.86038687973087	0.0689655172413793	8	2	6	16	173	0.128	0.32	0.136006289308176	2.3528323699422	0.092485549132948	0.176	22	46	318	2060	6.40647465808743e-05	0.000179851490401354	0.0196038124537475	3.09614908183986	1.91240977722506	Inf	2.41934887162412	4.67374213836478	7.63666884935306e-06	2.10524384495679e-05	0.00233682066790204	10.7772206541162	1.72568940493469	0.041416622795181	0.124249868385543	1	1.94281622401423	0.779349116641924	1	1	103	88	13
"TCGA-CV-7177-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	139	0	2	13	15	124	5084	3	4	2	9	1159	4	8	3	15	1218	11	14	23	48	1319	16	5	31	52	1388	9	2	7	18	197	0.129496402877698	0.346153846153846	0.14193083573487	2.4388910581804	0.0913705583756345	4	3	5	12	163	0.0863309352517986	0.25	0.12357846853677	2.02300613496933	0.0736196319018405	0.179856115107914	25	56	360	2347	4.59920333553014e-05	0.000130310761173354	0.0140735622067222	2.90891571215323	1.86434046579449	Inf	2.32081618655693	3.62047325102881	1.5208644728201e-05	4.0468219885474e-05	0.00465384528682951	6.04716755078265	1.67098765432099	0.0512020890336845	0.14780980419158	1	1.8621215980204	1	1	1	114	99	14
"TCGA-CV-7178-01A-21D-2012-08"	0	0	0	0	140	0	2	4	6	133	5453	4	7	1	12	1270	8	9	3	20	1265	7	7	29	43	1389	10	11	37	58	1529	5	1	3	9	199	0.0642857142857143	0.155172413793103	0.130150425114454	1.1922543753249	0.0452261306532663	5	0	7	12	193	0.0857142857142857	0.27906976744186	0.138948884089273	2.00843475117484	0.0621761658031088	0.142857142857143	20	63	392	2526	0.00697488855539522	0.0146186020407598	1	2.04508841571139	1.26725297440741	Inf	1.79370543398082	4.37875150060024	1.65530431620715e-05	4.3665786272361e-05	0.00506523120759388	9.1926534291794	1.12786023500309	0.39659222869197	0.685634022484423	1	1.15060908826387	1	1	1	120	113	9
"TCGA-CV-7180-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	77	0	0	2	2	75	3075	1	2	0	3	686	3	11	1	15	748	2	8	19	29	813	4	6	18	28	828	2	1	4	7	96	0.0909090909090909	0.25	0.115942028985507	2.15625	0.0729166666666667	1	1	2	4	104	0.051948051948052	0.137931034482759	0.127921279212792	1.07824933687003	0.0384615384615385	0.116883116883117	9	34	200	1441	0.0757451728740776	0.128055375135181	1	1.9063928627087	0.912089961058825	Inf	1.71732558139535	4.1025	0.0277939904532406	0.0438790624319225	1	7.18904479059891	1.33054054054054	0.297544312044448	0.541955711223816	1	1.39420130926851	0.386996904024768	0.754274220583306	1	68	66	0
"TCGA-CV-7183-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	80	0	3	6	9	71	2911	2	2	4	8	638	2	5	0	7	677	3	7	11	21	777	0	10	25	35	819	0	1	4	5	103	0.0625	0.142857142857143	0.125763125763126	1.13592233009709	0.0485436893203883	0	1	0	1	89	0.0125	0.0476190476190476	0.114543114543115	0.415730337078652	0.0112359550561798	0.05	4	35	192	1404	0.706519364027341	0.777267166865022	1	0.835812859968496	0.268790280287064	Inf	0.852564102564103	0	1	1	1	0	0.923611111111111	0.644784936642905	0.884745108707078	1	0.914096269992657	0.0606060606060606	0.294372294372294	1	76	67	0
"TCGA-CV-7235-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	158	1	0	5	5	152	6232	3	15	3	21	1521	3	12	5	20	1601	17	13	26	56	1587	15	13	27	55	1523	8	4	4	16	219	0.10126582278481	0.290909090909091	0.143795141168746	2.0230801162308	0.0730593607305936	7	2	6	15	243	0.0949367088607595	0.267857142857143	0.153119092627599	1.74933862433862	0.0617283950617284	0.158227848101266	25	60	462	2648	0.00056475378285538	0.00142822031036154	0.172814657553746	2.38728323796561	1.5402389403137	Inf	1.9798828622358	3.15543831168831	1.96438332851713e-05	5.09407880106985e-05	0.00601101298526242	5.05339598760878	1.27011353426448	0.259269077034197	0.489730478842372	1	1.33279576323406	0.300431196256591	0.66617352213418	1	133	127	12
"TCGA-CV-7236-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	66	0	1	6	7	59	2419	0	0	0	0	501	1	1	0	2	539	2	2	24	28	692	1	3	25	29	687	0	0	4	4	71	0.0606060606060606	0.137931034482759	0.10334788937409	1.33462846041768	0.0563380281690141	0	0	1	1	70	0.0151515151515152	0.0357142857142857	0.101156069364162	0.353061224489796	0.0142857142857143	0.0757575757575758	5	47	141	1238	0.626786719041874	0.715659462786617	1	0.934093537876964	0.347825093742363	Inf	0.940398254228041	0	1	1	1	0	0.997973657548126	0.573750678801692	0.860626018202538	1	0.997744959037498	0.00793650793650794	0.0639097744360902	1	61	54	0
"TCGA-CV-7238-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	80	0	1	2	3	77	3157	1	4	1	6	734	2	5	1	8	843	4	3	22	29	757	7	1	26	34	823	3	1	6	10	145	0.125	0.294117647058824	0.176184690157959	1.66937119675456	0.0689655172413793	3	0	2	5	103	0.0625	0.172413793103448	0.136063408190225	1.26715768329428	0.0485436893203883	0.175	14	45	248	1332	0.0752809066368329	0.127977541282616	1	1.6703530340907	0.931031348295192	Inf	1.51175505740842	3.47507331378299	0.00355684828167448	0.00651733876761911	1	6.43337045431274	1.06182795698925	0.490094888190779	0.786924581173192	1	1.0741613428512	0.715249186552235	1	1	66	63	0
"TCGA-CV-7242-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	340	0	2	13	15	320	13120	17	15	3	35	3076	23	21	4	48	3200	25	51	45	121	3403	24	51	41	116	3441	3	10	4	17	436	0.05	0.146551724137931	0.126707352513804	1.15661578614363	0.0389908256880734	6	8	4	18	437	0.0529411764705882	0.148760330578512	0.128416103438143	1.15842426763999	0.0411899313501144	0.05	17	118	873	5971	0.561976258900251	0.671737246966706	1	0.985372435819436	0.607026072430594	Inf	0.987213100844258	1.43993267410057	0.167313556988382	0.20982765753461	1	1.53879866231166	0.729268227709848	0.871269036405053	0.999264062822247	1	0.701532895644631	1	1	1	323	303	0
"TCGA-CV-7243-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	86	0	2	6	8	77	3157	3	3	0	6	724	0	5	3	8	753	1	4	20	25	809	4	2	32	38	871	3	0	8	11	103	0.127906976744186	0.289473684210526	0.118254879448909	2.447879407256	0.106796116504854	0	1	2	3	105	0.0348837209302326	0.12	0.129789864029666	0.924571428571429	0.0285714285714286	0.151162790697674	13	44	208	1472	0.0227514708555521	0.0435121880112434	1	2.08978654457598	1.13863592563468	Inf	1.84210526315789	4.84615384615385	0.0159720656528076	0.0258595348664504	1	10.5858242367417	1.55325443786982	0.108503880349502	0.249640506668779	1	1.68437051800093	0.0213009078536068	0.127805447121641	1	73	64	6
"TCGA-CV-7245-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	564	2	5	13	18	542	22222	30	26	7	63	5369	33	41	12	86	5397	31	92	53	176	5665	43	91	83	217	5791	9	13	12	34	783	0.0602836879432624	0.15668202764977	0.13520980832326	1.15880666937397	0.0434227330779055	6	14	4	24	788	0.0425531914893617	0.136363636363636	0.13909973521624	0.980329949238579	0.0304568527918782	0.0549645390070922	31	179	1571	9885	0.36051252929908	0.473462806718963	1	1.08972377622937	0.766487976077878	Inf	1.07646327786366	1.47814268756344	0.0767688733284797	0.103943695745641	1	1.59961916826177	0.857902422585839	0.779684830420219	0.965925336472012	1	0.83897114102743	1	1	1	533	511	0
"TCGA-CV-7247-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	88	1	1	11	12	75	3075	3	1	5	9	767	1	3	5	9	729	3	6	21	30	784	6	8	13	27	795	5	1	3	9	112	0.102272727272727	0.333333333333333	0.140880503144654	2.36607142857143	0.0803571428571429	2	1	6	9	131	0.102272727272727	0.3	0.167091836734694	1.79541984732824	0.0687022900763359	0.181818181818182	16	27	243	1336	0.000505255937295087	0.00129922955304451	0.154608316812297	3.25474716827616	1.79765931670478	Inf	2.41783902765815	5.05395518975766	6.01942330325712e-05	0.000147355482463734	0.0184194353079668	19.1765291534283	1.72004357298475	0.0704717019132578	0.184310605003905	1	1.97829818511746	0.737986306385978	1	1	72	59	9
"TCGA-CV-7248-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	340	0	3	10	13	322	13202	18	18	2	38	3202	15	20	7	42	3280	23	65	38	126	3366	20	47	49	116	3354	2	3	12	17	457	0.05	0.146551724137931	0.136255217650567	1.07556779597072	0.037199124726477	4	10	9	23	490	0.0676470588235294	0.182539682539683	0.145573380867499	1.25393586005831	0.0469387755102041	0.0794117647058823	27	103	947	5773	0.0251350927852554	0.0477722881508581	1	1.59786973711599	1.07739096653572	Inf	1.47380391519779	0.990152501166474	0.577212389565932	0.639032965464544	1	0.98855689919982	1.71285001638568	0.00899781176756892	0.0327777428675725	1	1.93952625489819	0.000763930976759237	0.0116881439444163	0.233762878888327	313	295	9
"TCGA-CV-7250-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	247	0	3	13	16	229	9389	12	10	3	25	2262	9	13	3	25	2277	21	24	61	106	2493	10	16	47	73	2357	2	3	5	10	307	0.0404858299595142	0.136986301369863	0.130250318201103	1.051715675338	0.0325732899022801	5	3	7	15	341	0.0607287449392713	0.141509433962264	0.13678299237866	1.03455430753057	0.0439882697947214	0.0769230769230769	19	120	648	4202	0.496699323897777	0.610401578765943	1	1.02672099091867	0.648172638912714	Inf	1.02307043254285	1.69006371963361	0.111988826773183	0.145205851663534	1	1.8909444990912	0.83161865569273	0.791965735875626	0.973259097100167	1	0.810603159685557	0.243634231565828	0.585888305847076	1	228	210	0
"TCGA-CV-7252-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	263	1	7	8	15	246	10086	3	8	2	13	2350	1	7	0	8	2428	11	12	84	107	2586	16	24	78	118	2722	13	4	20	37	396	0.140684410646388	0.313559322033898	0.145481263776635	2.15532443074816	0.0934343434343434	8	2	15	25	327	0.0950570342205323	0.233644859813084	0.126450116009281	1.84772357026494	0.0764525993883792	0.212927756653992	56	133	723	4585	1.79946960143696e-08	8.34299542484409e-08	5.5063769803971e-06	2.66962638766287	2.00351391997008	Inf	2.17529839659854	5.71015829107115	1.08527529167151e-13	6.91862998440588e-13	3.32094239251482e-11	22.1876664582886	1.5861550808531	0.00413646547275819	0.017339156639233	1	1.74747694190818	0.0186083829647211	0.116207452800095	1	207	190	30
"TCGA-CV-7253-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	220	0	5	9	14	205	8405	9	14	11	34	1988	15	13	1	29	2068	10	21	32	63	2223	9	23	47	79	2126	1	4	4	9	307	0.0409090909090909	0.113924050632911	0.144402634054563	0.788933327835732	0.0293159609120521	4	3	4	11	281	0.05	0.174603174603175	0.126405757984705	1.38129130655821	0.0391459074733096	0.0590909090909091	13	85	588	3761	0.574792683090007	0.681730856688148	1	0.978254636640938	0.555123038885443	Inf	0.981136332083854	1.94638381668457	0.104158771281482	0.136792206060659	1	2.28380760077341	0.748988202876087	0.852765915561574	0.995745200626815	1	0.720753303715498	0.50060341606504	0.839558118022481	1	207	192	0
"TCGA-CV-7254-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	294	0	3	9	12	278	11398	15	15	4	34	2717	18	20	5	43	2751	22	46	36	104	2876	22	38	37	97	3054	3	4	7	14	393	0.0476190476190476	0.144329896907216	0.128683693516699	1.12158652711104	0.0356234096692112	6	7	7	20	375	0.0680272108843537	0.192307692307692	0.13038942976356	1.4748717948718	0.0533333333333333	0.0782312925170068	23	94	768	5162	0.0278282344629509	0.0525644428744628	1	1.64441962297983	1.0720855701117	Inf	1.51787304131054	1.57936789772727	0.109589323037844	0.143309114741796	1	1.72815195108817	1.48080764840183	0.0860656960592599	0.210688823953068	1	1.59474266427716	0.305281192964379	0.67205787803669	1	271	255	0
"TCGA-CV-7255-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	127	1	3	12	15	108	4428	5	7	3	15	994	1	9	2	12	1017	6	6	24	36	1189	2	7	36	45	1228	2	2	2	6	145	0.047244094488189	0.133333333333333	0.118078175895765	1.12919540229885	0.0413793103448276	3	1	5	9	144	0.0708661417322835	0.25	0.121110176619008	2.06423611111111	0.0625	0.094488188976378	12	56	289	2128	0.112474534834938	0.174706637865437	1	1.57750597059908	0.855216126089782	Inf	1.47588031752493	5.22707612456747	0.00104026395913137	0.00210808457943178	0.318320771494199	12.2480858139253	0.975720876585929	0.588194710869994	0.863503510876077	1	0.972523315680476	0.710381651279623	1	1	115	96	0
"TCGA-CV-7261-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	136	2	4	2	6	126	5166	3	11	3	17	1254	4	8	2	14	1230	4	6	23	33	1334	13	15	34	62	1348	6	2	11	19	201	0.139705882352941	0.306451612903226	0.149109792284866	2.0552078318087	0.0945273631840796	1	0	2	3	184	0.0220588235294118	0.0909090909090909	0.137931034482759	0.659090909090909	0.016304347826087	0.147058823529412	20	54	385	2297	0.0037453966851653	0.00812830769972044	1	2.20890592922144	1.35658197733266	Inf	1.88276588276588	2.86844919786096	0.0067409962803874	0.0119927026848753	1	4.17334324457434	1.58879015721121	0.0605452872084081	0.165418373980115	1	1.76230961366161	0.129207985627894	0.407604573217892	1	116	106	9
"TCGA-CV-7263-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	128	1	2	5	7	119	4879	6	12	4	22	1244	4	11	2	17	1161	3	4	38	45	1273	1	5	29	35	1201	0	0	4	4	171	0.03125	0.114285714285714	0.142381348875937	0.802673350041771	0.0233918128654971	1	1	5	7	193	0.0546875	0.155555555555556	0.151610369206599	1.02602187679908	0.0362694300518135	0.078125	10	61	364	2110	0.611110136948051	0.705659252475863	1	0.950288166974311	0.489368296709151	Inf	0.957282154465253	1.69917582417582	0.471541427519362	0.528540940735988	1	1.93148222331119	0.912989995079547	0.668251973165269	0.896864490300756	1	0.899549508183124	0.00190521552750655	0.0215924426450742	0.582995951417004	118	109	0
"TCGA-CV-7406-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	222	1	0	11	11	207	8487	0	4	4	8	2089	1	3	2	6	2056	17	9	83	109	2203	20	7	57	84	2139	13	2	32	47	316	0.211711711711712	0.55952380952381	0.147732585320243	3.7874095840868	0.14873417721519	14	2	32	48	323	0.216216216216216	0.440366972477064	0.146618247843849	3.00349362342716	0.148606811145511	0.40990990990991	91	86	639	3703	1.06950554336597e-28	1.16881677239281e-27	3.27268696269987e-26	6.12810663895586	4.68254313018599	Inf	3.49347055338939	4.95850780357823	3.96764032842851e-15	2.96121448902225e-14	1.21409794049912e-12	15.6297688321076	3.10628213726805	1.16230582360499e-17	2.2461450837368e-16	3.55665582023127e-15	4.87752792125085	1.20811710524783e-07	4.62104792757295e-06	3.69683834205836e-05	131	116	65
"TCGA-CV-7407-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	149	0	0	5	5	144	5904	3	7	5	15	1394	1	16	7	24	1555	10	7	40	57	1458	11	8	29	48	1497	5	2	1	8	231	0.0536912751677852	0.166666666666667	0.154308617234469	1.08008658008658	0.0346320346320346	2	2	4	8	207	0.0536912751677852	0.140350877192982	0.141975308641975	0.988558352402746	0.0386473429951691	0.0805369127516778	12	78	438	2517	0.697914351178903	0.774564559758132	1	0.88413437917439	0.487665675978933	Inf	0.899543378995434	2.24885844748858	0.0278187519993234	0.0438790624319225	1	2.87188000948199	0.488882271193171	0.981344820086541	1	1	0.449038880998631	0.715987167706469	1	1	137	132	0
"TCGA-CV-7409-01A-31D-2229-08"	0	0	0	0	287	1	5	21	26	253	10373	16	14	6	36	2620	11	16	1	28	2442	12	42	34	88	2624	14	52	35	101	2687	1	4	7	12	331	0.0418118466898955	0.118811881188119	0.123185708969111	0.964494032484819	0.0362537764350453	3	4	4	11	363	0.0383275261324042	0.125	0.138338414634146	0.903581267217631	0.0303030303030303	0.0522648083623693	15	80	694	4617	0.258544146370877	0.357984202667368	1	1.24732693089992	0.734686730121161	Inf	1.20832701349917	1.17734426956329	0.447909925803202	0.513334971145243	1	1.20953679468291	1.22000167063442	0.289593459985705	0.530632327877998	1	1.26166292758882	0.0573570592714099	0.287725576017237	1	272	238	0
"TCGA-CV-7410-01A-21D-2078-08"	0	0	0	0	49	0	2	1	3	46	1886	0	1	0	1	446	1	4	0	5	475	5	3	10	18	458	8	2	12	22	507	7	1	4	12	85	0.244897959183673	0.545454545454545	0.167652859960552	3.25347593582888	0.141176470588235	4	0	5	9	64	0.183673469387755	0.5	0.139737991266376	3.578125	0.140625	0.408163265306122	20	15	149	816	4.17758958070766e-08	1.80048226999513e-07	1.27834241169654e-05	7.27942303173796	3.85547308044512	Inf	3.70086289549377	5.48012390294269	9.62247444927815e-08	3.54756286925194e-07	2.94447718147911e-05	29.9571531928085	2.64948139109213	0.00419693793980716	0.0173549055348783	1	3.78411534762027	0.7578617967687	1	1	29	26	15
"TCGA-CV-7411-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	135	0	0	5	5	129	5289	6	2	4	12	1308	3	9	0	12	1272	13	9	35	57	1341	5	14	29	48	1368	3	4	3	10	191	0.0740740740740741	0.208333333333333	0.139619883040936	1.49214659685864	0.0523560209424084	7	2	10	19	207	0.140740740740741	0.333333333333333	0.154362416107383	2.15942028985507	0.0917874396135266	0.17037037037037	23	59	398	2311	0.00160768521006451	0.00367128115134134	0.49195167427974	2.26271547577628	1.43505545333589	Inf	1.90914940556441	3.78140703517588	7.16254284999348e-05	0.000173947469214127	0.02191738112098	7.24954952407296	1.38257694723618	0.14230256868863	0.311032757276577	1	1.47985520083604	0.591905343761772	0.914762803995466	1	112	106	11
"TCGA-CV-7413-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	82	0	1	2	3	79	3239	0	3	1	4	736	1	2	0	3	716	4	5	32	41	904	3	1	27	31	883	2	0	1	3	103	0.0365853658536585	0.0967741935483871	0.116647791619479	0.829627309740056	0.029126213592233	1	1	11	13	110	0.158536585365854	0.317073170731707	0.121681415929204	2.60576496674058	0.118181818181818	0.182926829268293	15	51	213	1574	0.0114910574465836	0.0233614089402463	1	2.17225504827706	1.23894358119431	Inf	1.90674349125053	3.59557344064386	0.0416785789553344	0.0620535968111955	1	5.53322544946579	1.70637383623777	0.0474949958076648	0.139744891511014	1	1.88581141150543	0.00384759516110648	0.0346283564499583	1	67	64	7
"TCGA-CV-7414-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	314	0	1	1	2	311	12751	5	11	4	20	3019	5	12	4	21	3319	59	13	62	134	3111	62	5	69	136	3302	45	0	27	72	520	0.229299363057325	0.529411764705882	0.15748031496063	3.36176470588235	0.138461538461538	33	5	18	56	477	0.178343949044586	0.417910447761194	0.153326904532305	2.7256171970337	0.117400419287212	0.39171974522293	123	129	997	5416	2.84894271041941e-33	3.96262031540154e-32	8.71776469388339e-31	5.17782781628825	4.1408218235502	Inf	3.13957348235182	4.14643931795386	6.27751347393018e-33	9.60459561511318e-32	1.92091912302263e-30	9.85074718241634	2.20956763420031	1.31480539306192e-07	1.03161653917166e-06	4.02330450276947e-05	2.84195243465832	5.74160839668256e-05	0.00125495154956062	0.0175693216938486	191	188	84
"TCGA-CV-7415-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	98	0	1	1	2	96	3936	2	4	1	7	972	4	5	0	9	986	11	5	24	40	999	9	5	26	40	979	5	1	11	17	147	0.173469387755102	0.425	0.150153217568948	2.83044217687075	0.115646258503401	8	2	3	13	152	0.13265306122449	0.325	0.152152152152152	2.13601973684211	0.0855263157894737	0.275510204081633	27	43	299	1679	2.60778168610735e-06	8.67370865161793e-06	0.000797981195948849	3.52289671493801	2.23793700939794	Inf	2.55164835164835	4.3	7.16403632813794e-07	2.38282077870675e-06	0.000219219511641021	10.4108480564486	1.85230769230769	0.0154988743898495	0.0532882647561118	1	2.18270144335162	1	1	1	71	69	16
"TCGA-CV-7416-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	91	0	1	5	6	84	3444	1	2	3	6	748	1	2	1	4	798	5	2	19	26	919	6	6	36	48	979	3	0	3	6	107	0.0659340659340659	0.125	0.10929519918284	1.14369158878505	0.0560747663551402	0	0	5	5	101	0.0549450549450549	0.192307692307692	0.109902067464635	1.74980959634425	0.0495049504950495	0.120879120879121	11	55	208	1690	0.109289756107358	0.172384873035317	1	1.62451559223653	0.853893351906206	Inf	1.52083333333333	2.48863636363636	0.112714331252168	0.145529896047103	1	3.04416241532751	1.32727272727273	0.257479368876913	0.489370725939971	1	1.38271627669633	0.0861089375021264	0.346701774679614	1	80	73	0
"TCGA-CV-7418-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	175	0	4	9	13	160	6560	6	12	5	23	1540	5	12	7	24	1600	14	12	33	59	1698	13	14	27	54	1722	8	3	1	12	234	0.0685714285714286	0.222222222222222	0.13588850174216	1.63532763532764	0.0512820512820513	5	3	4	12	207	0.0685714285714286	0.203389830508475	0.121908127208481	1.6683861459101	0.0579710144927536	0.102857142857143	18	69	441	2979	0.0298464651735216	0.0560307873809669	1	1.76185295513491	1.07373409839443	Inf	1.60450387051372	3.73393801965231	1.05269094555925e-05	2.85064981717815e-05	0.00322123429341131	6.26694283924587	0.646258503401361	0.899427745943329	1	1	0.614173212231302	0.0355122090947849	0.197577017872803	1	157	142	0
"TCGA-CV-7421-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	83	0	3	3	6	76	3116	2	8	2	12	677	4	3	0	7	861	6	6	14	26	760	12	2	17	31	818	7	1	3	11	116	0.132530120481928	0.354838709677419	0.141809290953545	2.50222469410456	0.0948275862068965	3	0	2	5	92	0.0602409638554217	0.192307692307692	0.121052631578947	1.58862876254181	0.0543478260869565	0.180722891566265	15	34	208	1370	0.00147536523476722	0.0033944493371336	0.451461761838769	2.90317575043818	1.61005135721614	Inf	2.32240973312402	4.21474358974359	2.99573032597046e-05	7.63911233122467e-05	0.00916693479746961	8.21584020727325	1.22363523573201	0.392538530875579	0.682481763908677	1	1.26643884790407	0.155613477924309	0.456407358683308	1	68	61	9
"TCGA-CV-7422-01A-21D-2078-08"	0	0	0	0	160	0	2	1	3	156	6396	2	11	4	17	1557	2	10	3	15	1568	13	16	39	68	1599	14	13	29	56	1672	4	5	6	15	250	0.09375	0.267857142857143	0.149521531100478	1.79142857142857	0.06	6	2	6	14	226	0.0875	0.205882352941176	0.141338336460288	1.45666319625195	0.0619469026548673	0.1375	22	73	476	2795	0.018506463026492	0.035841630924725	1	1.76923634459608	1.12726762005034	Inf	1.59137549756745	2.54512916277622	0.00349814200813131	0.0064483822559529	1	3.45216785924334	1.21267918932279	0.284636419721802	0.52787117839316	1	1.2581590584538	0.787081048919185	1	1	138	134	8
"TCGA-CV-7423-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	102	2	3	5	8	92	3772	1	6	0	7	795	1	6	1	8	903	8	2	28	38	1037	5	5	29	39	1037	5	1	8	14	118	0.137254901960784	0.358974358974359	0.113789778206365	3.15471534115602	0.11864406779661	2	0	2	4	100	0.0392156862745098	0.105263157894737	0.0964320154291225	1.09157894736842	0.04	0.166666666666667	17	53	218	1856	0.000996826965267817	0.00240836951164596	0.305029051371952	2.72902304011321	1.60708861894091	Inf	2.31048492791612	5.1227946365561	0.000150225221927845	0.000340510503036449	0.0459689179099206	9.91184922503498	1.66908095927893	0.0762265302627318	0.197672188647423	1	1.81080200412777	0.505085245395735	0.839727186525732	1	85	75	10
"TCGA-CV-7424-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	210	0	1	2	3	204	8364	4	4	3	11	2093	3	8	7	18	2035	12	14	67	93	2102	21	9	52	82	2134	11	1	12	24	328	0.114285714285714	0.292682926829268	0.153701968134958	1.90422367638311	0.0731707317073171	7	3	13	23	291	0.10952380952381	0.247311827956989	0.138439581351094	1.78642426929757	0.0790378006872852	0.204761904761905	43	109	619	3617	1.57824373192553e-05	4.73473119577659e-05	0.00482942581969212	2.30458993264014	1.66253987811776	Inf	1.93593231868038	3.7327067117051	1.22925319974986e-07	4.37385440841229e-07	3.76151479123457e-05	7.00674168411722	1.43766715086681	0.039789714292277	0.120551015578582	1	1.55388264502851	0.213962240805109	0.548512116794694	1	167	161	21
"TCGA-CV-7425-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	136	0	1	3	4	132	5412	5	4	1	10	1293	2	3	1	6	1286	9	11	35	55	1432	9	8	44	61	1401	4	1	10	15	211	0.110294117647059	0.245901639344262	0.150606709493219	1.63274026882138	0.0710900473933649	5	2	6	13	182	0.0955882352941176	0.236363636363636	0.127094972067039	1.85974025974026	0.0714285714285714	0.183823529411765	25	72	393	2440	0.00168951247419146	0.00382956160816731	0.516990817102587	2.155069252158	1.40209263747447	Inf	1.85789984522966	3.60432569974555	0.00030155443724122	0.000673544947414696	0.0922756577958133	6.20212611385654	1.45998003027668	0.078706405961606	0.199042646481417	1	1.57650622101414	0.105960551184913	0.364313805197566	1	111	107	12
"TCGA-CV-7427-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	498	3	2	4	6	488	20008	1	3	0	4	4890	0	5	1	6	5029	107	16	120	243	5133	88	17	130	235	4956	72	5	76	153	801	0.307228915662651	0.651063829787234	0.161622276029056	4.02830504422663	0.191011235955056	85	7	71	163	808	0.327309236947791	0.670781893004115	0.157412819014222	4.26129140691847	0.201732673267327	0.610441767068273	304	141	1609	8480	2.57348824934901e-126	1.57497480860159e-124	7.87487404300797e-124	11.3589855520875	9.50760709740688	Inf	4.2835678521798	5.0484390687001	1.16988926494002e-85	7.15972230143292e-84	3.57986115071646e-83	21.7599508157293	3.68696830329397	1.4068731167764e-51	7.17505289555964e-50	4.30503173733578e-49	7.51946185467413	0.473700555226352	0.828299256567221	1	194	184	233
"TCGA-CV-7429-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	62	0	3	1	4	58	2378	1	2	0	3	573	0	5	2	7	514	3	5	17	25	663	1	9	13	23	628	1	2	3	6	81	0.0967741935483871	0.260869565217391	0.128980891719745	2.02254428341385	0.0740740740740741	1	1	2	4	80	0.0645161290322581	0.16	0.120663650075415	1.326	0.05	0.112903225806452	7	27	161	1130	0.128555227719738	0.197677887850451	1	1.81862499233619	0.774991389987276	Inf	1.65089514066496	4.00931677018634	0.0795794395186545	0.107274486752019	1	6.99887187260554	1.33643892339545	0.322038414876003	0.583099141728147	1	1.40331694873493	0.34984520123839	0.723414393163245	1	55	51	0
"TCGA-CV-7430-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	119	1	1	5	6	111	4551	9	8	1	18	1094	4	9	2	15	1052	7	9	18	34	1207	7	10	27	44	1198	2	0	5	7	159	0.0588235294117647	0.159090909090909	0.132721202003339	1.19868496283591	0.0440251572327044	1	0	5	6	157	0.0504201680672269	0.176470588235294	0.130074565037283	1.35668789808917	0.0382165605095541	0.109243697478992	13	46	316	2089	0.0431462866033408	0.0776633158860134	1	1.86760233811958	1.02560830916077	Inf	1.67694700708003	1.63087703435805	0.278025222055643	0.334943771452861	1	1.80239213083706	1.69127988748242	0.066610301220707	0.177612745795662	1	1.88809044240569	0.0169317154779532	0.112149533737531	1	106	98	0
"TCGA-CV-7432-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	185	0	4	8	12	172	7052	6	11	4	21	1710	15	11	5	31	1769	5	18	42	65	1847	8	18	29	55	1726	5	4	1	10	260	0.0540540540540541	0.181818181818182	0.15063731170336	1.20699300699301	0.0384615384615385	2	4	9	15	262	0.0810810810810811	0.230769230769231	0.141851651326475	1.626834997064	0.0572519083969466	0.0918918918918919	17	67	522	3051	0.102904731671836	0.165730778376746	1	1.48283053816066	0.891934514016486	Inf	1.38526272577997	3.68567639257294	0.00111676458181121	0.00224822343443573	0.34172996203423	6.81301274275336	0.964060223409422	0.601549515922142	0.867313212569016	1	0.958173244883413	0.55122462579012	0.887761765746193	1	168	155	0
"TCGA-CV-7433-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	133	1	0	4	4	127	5207	3	10	1	14	1356	4	6	2	12	1300	16	11	17	44	1232	14	11	32	57	1319	9	3	9	21	204	0.157894736842105	0.368421052631579	0.154662623199393	2.38209494324045	0.102941176470588	14	2	5	21	205	0.157894736842105	0.477272727272727	0.166396103896104	2.86829268292683	0.102439024390244	0.278195488721804	37	42	409	2142	3.45708562820417e-10	1.82391069350082e-09	1.05786820223048e-07	4.60994455600356	3.06203223030906	Inf	2.92120330537588	4.78182559087205	5.39307120246267e-13	3.11373544896901e-12	1.65027978795358e-10	17.1856476085586	1.78204680405169	0.020412211574814	0.0678927906727509	1	2.09415070623127	0.0780686982529082	0.322824617099864	1	96	90	24
"TCGA-CV-7434-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	110	0	0	6	6	102	4182	2	10	2	14	980	3	6	2	11	996	4	12	25	41	1092	6	11	19	36	1114	3	2	3	8	125	0.0727272727272727	0.222222222222222	0.112208258527828	1.98044444444444	0.064	2	1	2	5	133	0.0454545454545455	0.121951219512195	0.121794871794872	1.0012836970475	0.037593984962406	0.0909090909090909	10	44	258	1948	0.0981798814415209	0.160657987813398	1	1.71549679893089	0.867007579793608	Inf	1.58340511053689	4.27519379844961	0.00345014572726867	0.00639845207602553	1	7.53779121734177	0.971634954193094	0.598263238526806	0.867313212569016	1	0.968010197707154	1	1	1	100	92	0
"TCGA-CV-7435-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	99	0	4	6	10	88	3608	7	5	1	13	844	4	10	4	18	971	2	7	20	29	888	7	4	17	28	905	3	1	5	9	155	0.0909090909090909	0.321428571428571	0.171270718232044	1.87672811059908	0.0580645161290323	1	1	7	9	121	0.0909090909090909	0.310344827586207	0.136261261261261	2.27757195782274	0.0743801652892562	0.161616161616162	16	30	276	1517	0.00114464527092965	0.00271520506127498	0.350261452904473	2.92907184778944	1.63669791749358	Inf	2.2596093257719	2.88727858293076	0.03775297111101	0.057474672437657	1	4.39188410343645	2.1069330199765	0.00832855582342066	0.0310797327069112	1	2.63634770964266	0.0175920837235342	0.112149533737531	1	83	72	9
"TCGA-CV-7437-01A-21D-2129-08"	0	0	0	0	162	0	2	9	11	151	6191	5	10	1	16	1472	1	5	1	7	1436	8	17	40	65	1666	9	7	47	63	1617	4	2	9	15	203	0.0925925925925926	0.238095238095238	0.125541125541126	1.89655172413793	0.0738916256157636	4	4	5	13	217	0.0802469135802469	0.2	0.130252100840336	1.53548387096774	0.0599078341013825	0.135802469135802	22	82	420	2863	0.0130725486689764	0.0259753239786154	1	1.82843095944301	1.17000600747838	Inf	1.65352564102564	3.67843137254902	0.000626149033592524	0.00132139037434009	0.191601604279312	6.05366477384087	1.25785440613027	0.223078689406594	0.434790311837056	1	1.30719011680456	0.170713361620252	0.474893533234519	1	140	129	9
"TCGA-CV-7438-01A-21D-2129-08"	0	0	0	0	122	2	2	5	7	112	4592	2	3	4	9	1093	2	8	1	11	1108	10	7	25	42	1154	10	7	33	50	1237	6	1	10	17	169	0.139344262295082	0.34	0.136620856911884	2.48863905325444	0.100591715976331	6	1	3	10	151	0.0819672131147541	0.238095238095238	0.130849220103986	1.81961526332387	0.0662251655629139	0.204918032786885	25	53	320	2071	2.64617534344132e-05	7.71171100088613e-05	0.00809729655093044	3.05083834977681	1.94560945536981	Inf	2.39483173076923	4.483125	1.72358609595891e-06	5.49393068086903e-06	0.000527417345363427	9.69107707587404	1.67473060344828	0.043274290893862	0.128562456441959	1	1.86899281949336	1	1	1	97	87	15
"TCGA-CV-7440-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	243	0	2	18	20	222	9102	7	13	2	22	2176	12	14	3	29	2172	15	31	37	83	2356	18	34	36	88	2398	7	2	6	15	315	0.0617283950617284	0.170454545454545	0.131359466221852	1.29761904761905	0.0476190476190476	5	3	5	13	330	0.0534979423868313	0.156626506024096	0.140067911714771	1.11821832785688	0.0393939393939394	0.0946502057613169	23	83	645	4109	0.015597020265037	0.0305941551352649	1	1.76507891501649	1.14356482966979	Inf	1.5992686850958	2.68019732205779	0.000906732630170771	0.00186214889149165	0.277460184832256	3.63896348212863	1.11062971222258	0.405862929519125	0.69382154431761	1	1.13019583187926	1	1	1	220	199	9
"TCGA-CX-7082-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	111	0	1	5	6	104	4264	6	11	2	19	1090	7	13	5	25	1072	7	5	17	29	1078	7	5	19	31	1024	3	1	5	9	146	0.0810810810810811	0.290322580645161	0.142578125	2.0362350861688	0.0616438356164384	4	4	3	11	157	0.0990990990990991	0.379310344827586	0.145640074211503	2.60443663518559	0.0700636942675159	0.135135135135135	15	35	303	1799	0.00412937569292551	0.00883628644779864	1	2.54305697317326	1.42043888859847	Inf	2.08118811881188	3.46864686468647	0.00184214988467739	0.00359043225930752	0.563697864711281	5.92928996132983	1.54162082874954	0.140975947499223	0.310349927588218	1	1.69586642338064	1	1	1	96	89	8
"TCGA-CX-7085-01A-21D-2012-08"	0	0	0	0	176	1	0	2	2	173	7093	2	5	0	7	1677	1	1	0	2	1820	37	4	47	88	1787	32	4	40	76	1809	22	1	17	40	281	0.227272727272727	0.526315789473684	0.155334438916528	3.38827495785728	0.142348754448399	31	2	24	57	273	0.323863636363636	0.647727272727273	0.152770005595971	4.23988511488511	0.208791208791209	0.534090909090909	94	62	554	3042	4.64859790721888e-35	6.77367123623322e-34	1.42247095960898e-32	8.31754165977599	6.20990196825195	Inf	3.9112283624919	4.98582116883796	8.08448294814091e-29	1.07558773136136e-27	2.47385178213112e-26	18.17156323869	3.0589651022864	7.25708198187219e-12	9.65507428892561e-11	2.22066708645289e-09	4.89111713981617	0.113817752576172	0.378567742264224	1	82	79	70
"TCGA-CX-7086-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	256	1	4	6	10	241	9881	7	18	2	27	2538	9	10	2	21	2360	20	15	68	103	2508	25	17	48	90	2475	16	6	17	39	350	0.15234375	0.433333333333333	0.141414141414141	3.06428571428571	0.111428571428571	13	4	16	33	395	0.12890625	0.320388349514563	0.157496012759171	2.03426324198107	0.0835443037974684	0.2421875	62	99	745	4238	8.02504820646938e-13	4.91132950235926e-12	2.45566475117963e-10	3.56132387790691	2.66453009962725	Inf	2.57573054316562	4.31042505592841	9.27414739526299e-14	6.03806192117122e-13	2.83788910295047e-11	10.3035286162639	1.90278870631798	0.000176644546489136	0.00100098576343844	0.0540532312256756	2.26126563122717	0.613810115307984	0.939129476421216	1	194	179	38
"TCGA-CX-7219-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	144	0	2	5	7	137	5617	2	7	2	11	1366	2	8	4	14	1371	12	12	33	57	1480	12	8	35	55	1400	5	2	10	17	192	0.118055555555556	0.309090909090909	0.137142857142857	2.25378787878788	0.0885416666666667	8	3	8	19	197	0.131944444444444	0.333333333333333	0.133108108108108	2.50423011844332	0.0964467005076142	0.215277777777778	31	61	389	2491	1.13581899436852e-06	4.2385440521557e-06	0.000347560612276767	3.25246391254805	2.1694207497369	Inf	2.49469095786297	4.01028277634961	3.33980548663555e-06	9.73314741819503e-06	0.00102198047891048	7.55888846253592	1.9597761983971	0.00379466116162905	0.0163544551473027	1	2.30444114480265	0.341196849074924	0.720043005633978	1	113	106	19
"TCGA-D6-6515-01A-21D-1870-08"	0	0	0	0	65	0	1	1	2	62	2542	1	2	3	6	606	1	5	2	8	627	0	1	23	24	644	3	1	20	24	665	2	0	4	6	100	0.0923076923076923	0.25	0.150375939849624	1.6625	0.06	0	0	1	1	75	0.0153846153846154	0.0416666666666667	0.116459627329193	0.357777777777778	0.0133333333333333	0.107692307692308	7	39	175	1134	0.424349265612828	0.538800312354877	1	1.1629147645157	0.507943996760521	Inf	1.13826086956522	4.98666666666667	0.049494978328825	0.0711054618245092	1	12.914805831081	0.869767441860465	0.698465984489371	0.914123897857775	1	0.85272883989432	0.286130536130536	0.639094482160175	1	58	55	0
"TCGA-D6-6516-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	2116	6	1	8	9	1964	80524	18	30	24	72	18705	29	31	25	85	18777	20	41	847	908	21517	13	33	853	899	21525	4	3	108	115	2720	0.0543478260869565	0.127919911012236	0.126364692218351	1.01230738402146	0.0422794117647059	3	6	120	129	2676	0.0609640831758034	0.142070484581498	0.124366779755542	1.14235075363979	0.0482062780269058	0.111058601134216	235	1498	5396	37646	0.111378601926174	0.173887000966374	1	1.09449422083298	0.969271745597672	Inf	1.08165758910984	1.69201653300986	0.111355630313385	0.144999246280408	1	1.87823157707898	1.06980944490472	0.151526139514138	0.326528159798072	1	1.08064304377908	4.13645992511681e-108	1.26575673708574e-105	1.26575673708574e-105	1881	1729	0
"TCGA-D6-6517-01A-11D-1870-08"	0	0	0	0	81	0	4	2	6	75	3075	1	8	0	9	706	2	4	5	11	715	5	5	9	19	805	6	9	21	36	849	2	1	2	5	107	0.0617283950617284	0.138888888888889	0.12603062426384	1.10202492211838	0.0467289719626168	2	2	1	5	107	0.0617283950617284	0.263157894736842	0.132919254658385	1.97983275946877	0.0467289719626168	0.0864197530864197	7	34	214	1440	0.280740954009005	0.381807697452247	1	1.38507526718785	0.601770096663066	Inf	1.31958057898336	2.81053525913339	0.0446954482400629	0.0651276531498059	1	3.84059507417619	0.772897196261682	0.764058469295975	0.958204473789214	1	0.747780231394563	1	1	1	74	68	0
"TCGA-D6-6823-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	118	0	3	2	5	113	4633	9	11	6	26	1191	2	8	6	16	1159	6	10	20	36	1131	5	12	18	35	1152	3	3	4	10	169	0.0847457627118644	0.285714285714286	0.146701388888889	1.94759087066779	0.0591715976331361	2	1	0	3	159	0.0254237288135593	0.0833333333333333	0.140583554376658	0.592767295597484	0.0188679245283019	0.076271186440678	9	40	328	1955	0.269843487208874	0.368625478062123	1	1.34089432968295	0.651471808106069	Inf	1.27843454454953	3.16380266075388	0.0136318538288712	0.0223066699017892	1	4.96168129357656	0.732670089858793	0.814725507509009	0.973851583194362	1	0.701315207045054	1	1	1	109	104	0
"TCGA-D6-6824-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	74	1	0	3	3	69	2829	3	8	1	12	656	3	7	3	13	731	7	9	4	20	714	7	4	13	24	728	3	0	7	10	108	0.135135135135135	0.416666666666667	0.148351648351648	2.80864197530864	0.0925925925925926	2	0	1	3	89	0.0405405405405405	0.15	0.124649859943978	1.20337078651685	0.0337078651685393	0.175675675675676	13	18	197	1245	0.000135003629956312	0.000368849203273495	0.0413111107666315	4.55725870909292	2.28576606090558	Inf	3.06959227116424	2.61421319796954	0.0339649436777452	0.0519663638269502	1	3.50659248306819	3.44461033144222	0.00103649458808945	0.00528612239925619	0.317167343955372	5.60688565602546	0.433752668115301	0.785374653510545	1	61	56	9
"TCGA-D6-6825-01A-21D-1912-08"	0	0	0	0	85	0	0	4	4	81	3321	1	6	1	8	792	0	4	2	6	813	5	5	21	31	803	5	8	23	36	913	1	0	5	6	126	0.0705882352941176	0.166666666666667	0.138006571741512	1.20767195767196	0.0476190476190476	3	1	1	5	120	0.0588235294117647	0.161290322580645	0.149439601494396	1.07930107526882	0.0416666666666667	0.117647058823529	10	44	246	1470	0.245567765615769	0.346284498978918	1	1.35783163666921	0.685616980972257	Inf	1.29177958446251	2.79024390243902	0.0441481274600253	0.0646379282429079	1	3.97914026472858	0.951219512195122	0.619032496048792	0.870891327309468	1	0.943536626759301	0.66992140985949	0.976171197223828	1	75	71	0
"TCGA-D6-6826-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	117	1	1	4	5	111	4551	1	4	2	7	1096	3	4	1	8	1032	12	8	26	46	1161	13	7	30	50	1262	7	1	7	15	169	0.128205128205128	0.3	0.13391442155309	2.24023668639053	0.0887573964497041	9	2	3	14	165	0.11965811965812	0.304347826086957	0.142118863049096	2.14150197628459	0.0848484848484849	0.222222222222222	26	55	334	2089	2.98305670077828e-05	8.61146557017126e-05	0.00912815350438154	2.95489813222092	1.90214622713964	Inf	2.32860205514896	4.64287425149701	1.33019187848011e-08	5.42718286419885e-08	4.07038714814914e-06	11.0998911757591	1.29544482463644	0.241761590585449	0.462369041994671	1	1.35948266353842	0.186373291330376	0.508694930050308	1	91	85	15
"TCGA-D6-6827-01A-11D-1912-08"	0	0	0	0	17	0	1	2	3	14	574	2	1	1	4	128	0	2	0	2	127	0	0	4	4	167	0	1	3	4	152	0	0	0	0	19	0	0	0.125	0	0	0	0	0	0	21	0	0	0.125748502994012	0	0	0	0	7	40	279	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	17	14	0
"TCGA-DQ-5624-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	119	0	1	0	1	118	4838	3	4	2	9	1173	1	7	2	10	1182	8	2	23	33	1200	17	4	45	66	1283	8	1	15	24	178	0.201680672268908	0.363636363636364	0.138737334372564	2.62104187946885	0.134831460674157	6	0	8	14	160	0.117647058823529	0.424242424242424	0.133333333333333	3.18181818181818	0.0875	0.310924369747899	37	56	338	2145	1.04582668834321e-09	5.24627814152496e-09	3.20022966633022e-07	4.18980279887644	2.84055971382858	Inf	2.92266335814723	4.11384615384615	9.27167149952899e-07	3.05067900952244e-06	0.000283713147885587	8.06469711552348	2.48472850678733	2.63489828663021e-05	0.000167974765772676	0.00806278875708844	3.24146979584804	0.0656753010422444	0.300943509949406	1	82	81	24
"TCGA-DQ-5625-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	218	2	2	8	10	205	8405	8	9	2	19	1985	11	8	3	22	2126	24	7	46	77	2084	34	7	46	87	2210	24	3	17	44	337	0.201834862385321	0.505747126436782	0.152488687782805	3.31662062144002	0.130563798219585	16	2	12	30	295	0.137614678899083	0.38961038961039	0.141554702495202	2.75236627779001	0.101694915254237	0.31651376146789	69	81	632	3662	4.99174968666607e-19	4.12831190302653e-18	1.52747540411982e-16	4.9333404977411	3.67819779212151	Inf	3.12537974683544	4.68572675687473	3.6022638265143e-20	3.34028100276781e-19	1.10229273091338e-17	12.85896645975	2.1416827187672	4.51273345174347e-05	0.000270764007104608	0.013808964362335	2.66627778933523	0.0990777395017588	0.355813953488372	1	149	136	47
"TCGA-DQ-5629-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	383	0	5	9	14	366	15006	19	10	5	34	3542	20	18	4	42	3692	36	45	61	142	3889	22	58	68	148	3883	7	9	14	30	498	0.0783289817232376	0.202702702702703	0.128251352047386	1.58051123412569	0.0602409638554217	11	5	14	30	517	0.0783289817232376	0.211267605633803	0.132939058884032	1.58920641839431	0.058027079303675	0.120104438642298	46	141	1015	6757	1.87696651878415e-05	5.57623062862087e-05	0.0057435175474795	2.17156397944902	1.60129296596551	Inf	1.88357524828113	2.37635467980296	0.000314586846678787	0.000697562138287745	0.0962635750837088	2.99511628394669	1.66201550387597	0.00483642668773838	0.019472981137473	1	1.84533261009364	0.0905627452608152	0.355284616023198	1	337	320	22
"TCGA-DQ-5630-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	94	0	0	5	5	89	3649	2	8	3	13	864	1	8	1	10	908	10	4	20	34	919	10	5	17	32	958	7	2	3	12	129	0.127659574468085	0.375	0.134655532359081	2.78488372093023	0.0930232558139535	5	1	2	8	136	0.0851063829787234	0.235294117647059	0.147986942328618	1.58996539792388	0.0588235294117647	0.180851063829787	17	40	265	1612	0.0020931170634506	0.00464125957547742	0.640493821415884	2.58351001213027	1.49729834128116	Inf	2.11247931148626	4.24981132075472	3.17165324054604e-06	9.42258147191348e-06	0.000970525891607088	9.10625530717194	0.957164711881693	0.614670087357518	0.870891327309468	1	0.950488601470282	0.0535509925943741	0.277739046336923	1	77	72	9
"TCGA-DQ-5631-01A-01D-1870-08"	0	0	0	0	114	0	0	6	6	108	4428	1	5	1	7	1029	1	5	2	8	1014	8	2	37	47	1207	5	8	33	46	1178	2	1	4	7	138	0.0614035087719298	0.152173913043478	0.117147707979626	1.2989918084436	0.0507246376811594	2	1	4	7	150	0.0614035087719298	0.148936170212766	0.124275062137531	1.19843971631206	0.0466666666666667	0.105263157894737	12	71	288	2097	0.304087479287294	0.409915280448951	1	1.23051489748851	0.673966625014911	Inf	1.19728915662651	2.54807692307692	0.0631353608430728	0.0890295871796326	1	3.23366338744892	0.946428571428571	0.621462035917828	0.870891327309468	1	0.939530909638735	0.251859828599632	0.592839288857595	1	102	96	0
"TCGA-DQ-7588-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	121	2	2	5	7	112	4592	5	6	1	12	1141	6	6	2	14	1167	14	8	26	48	1118	11	10	17	38	1166	6	1	4	11	178	0.0909090909090909	0.289473684210526	0.152658662092624	1.89621525724423	0.0617977528089888	6	0	9	15	165	0.12396694214876	0.3125	0.147584973166369	2.11742424242424	0.0909090909090909	0.206611570247934	25	43	343	1941	1.30220792393302e-05	4.00123631708908e-05	0.00398475624723504	3.28773040498267	2.06703647183291	Inf	2.44812210598525	3.19626822157434	0.000113386502514068	0.000266894382840806	0.0346962697693048	5.21791780874137	2.01315343413113	0.00935089765687022	0.0332717986395615	1	2.45087329712007	1	1	1	96	87	15
"TCGA-DQ-7589-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	213	1	5	15	20	188	7708	11	10	4	25	1827	12	12	3	27	1832	9	31	25	65	1992	12	32	27	71	2057	1	4	3	8	267	0.0375586854460094	0.112676056338028	0.12980068060282	0.868069842274622	0.0299625468164794	2	2	0	4	262	0.0187793427230047	0.0615384615384615	0.131526104417671	0.467880211391662	0.0152671755725191	0.028169014084507	6	67	529	3520	0.926505465470905	0.957806325790868	1	0.595949505889142	0.250246013368215	Inf	0.629101173058498	1.0934377531731	0.530402065388929	0.59234683214968	1	1.10894557987509	0.441580631089138	0.972870460989766	1	1	0.407455134766607	1	1	1	207	182	0
"TCGA-DQ-7590-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	33	0	3	3	6	27	1107	1	3	0	4	265	4	0	0	4	247	2	2	8	12	308	0	2	5	7	287	0	1	0	1	29	0.0303030303030303	0.142857142857143	0.101045296167247	1.41379310344828	0.0344827586206897	0	1	0	1	50	0.0303030303030303	0.0833333333333333	0.162337662337662	0.513333333333333	0.02	0	0	15	79	516	1	1	1	0	0	Inf	0	0	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	33	27	0
"TCGA-DQ-7591-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	44	0	0	2	2	42	1722	0	1	0	1	420	4	4	0	8	408	3	4	12	19	482	0	0	14	14	412	0	0	4	4	47	0.0909090909090909	0.285714285714286	0.114077669902913	2.50455927051672	0.0851063829787234	2	2	2	6	62	0.136363636363636	0.315789473684211	0.128630705394191	2.45500848896435	0.0967741935483871	0.181818181818182	8	21	109	785	0.0224318586100234	0.043170746758913	1	2.73939762189979	1.19545693372548	Inf	2.26257513445112	5.46788990825688	0.0418756272571247	0.0620535968111955	1	14.322619532298	1.89273112208892	0.0941243921677249	0.222958635849981	1	2.15820978159593	0.169802333889021	0.474893533234519	1	36	34	4
"TCGA-DQ-7592-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	91	1	2	4	6	84	3444	2	5	4	11	799	2	7	2	11	847	3	7	16	26	855	8	4	24	36	943	4	0	3	7	117	0.0769230769230769	0.194444444444444	0.12407211028632	1.56718898385565	0.0598290598290598	1	1	2	4	110	0.043956043956044	0.153846153846154	0.128654970760234	1.1958041958042	0.0363636363636364	0.10989010989011	10	41	227	1571	0.107792248888346	0.171793896665801	1	1.6874009749531	0.847948424532235	Inf	1.55307938153235	3.60032038446135	0.0079814599333769	0.0137984561560075	1	5.75786143974273	0.990088105726872	0.582329929394129	0.863503510876077	1	0.988677890466041	1	1	1	81	74	0
"TCGA-DQ-7594-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	49	0	1	1	2	47	1927	0	1	0	1	435	0	0	0	0	498	4	0	21	25	476	8	1	12	21	518	7	0	5	12	73	0.244897959183673	0.571428571428571	0.140926640926641	4.05479452054795	0.164383561643836	3	0	11	14	67	0.285714285714286	0.56	0.140756302521008	3.97850746268657	0.208955223880597	0.530612244897959	26	19	140	854	5.37841797894392e-11	2.9923561846488e-10	1.64579590155684e-08	8.31822049892756	4.74290926576666	Inf	4.10222222222222	5.91666666666667	2.09944179323318e-07	7.21830549134105e-07	6.42429188729353e-05	30.3246855571166	3.44242424242424	4.39545747204954e-06	3.12793020103991e-05	0.00134500998644716	5.72585866454618	0.164979955136029	0.467443206218749	1	23	21	20
"TCGA-DQ-7595-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	370	0	8	19	27	342	14022	13	16	5	34	3174	8	16	5	29	3413	24	67	58	149	3673	18	62	50	130	3762	5	7	5	17	524	0.0459459459459459	0.130769230769231	0.139287612971823	0.938843217850852	0.0324427480916031	7	7	9	23	468	0.0621621621621622	0.154362416107383	0.127416280969235	1.21148109906499	0.0491452991452991	0.0702702702702703	26	124	992	6443	0.0997936733813779	0.162430127950541	1	1.36178207843309	0.918286020598229	Inf	1.29912634408602	2.14141705069124	0.00746087339509939	0.0131208463155196	1	2.5973672833413	0.971568847072879	0.589118479616467	0.863503510876077	1	0.967335775207731	0.811646693938239	1	1	344	316	0
"TCGA-F7-7848-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	366	3	2	11	13	347	14227	22	19	7	48	3475	18	25	9	52	3551	23	65	40	128	3550	27	48	44	119	3651	4	7	10	21	515	0.0573770491803279	0.176470588235294	0.141057244590523	1.2510565391205	0.0407766990291262	4	8	4	16	478	0.0437158469945355	0.125	0.134647887323944	0.928347280334728	0.0334728033472803	0.0601092896174863	22	112	993	6208	0.223658133337028	0.319810228042666	1	1.22797566300491	0.799616636022274	Inf	1.19058784626715	1.16028197381672	0.385232198630411	0.451651543221861	1	1.19076718970175	1.20862705605908	0.266186154287514	0.499711430748339	1	1.25030273109245	0.203017926031731	0.530969960390681	1	344	325	0
"TCGA-H7-7774-01A-21D-2078-08"	0	0	0	0	175	0	4	5	9	166	6806	5	4	1	10	1575	3	8	3	14	1703	8	11	59	78	1753	10	8	46	64	1775	8	1	6	15	240	0.0857142857142857	0.234375	0.135211267605634	1.7333984375	0.0625	4	0	8	12	227	0.0685714285714286	0.153846153846154	0.129492298916144	1.18807184005422	0.052863436123348	0.148571428571429	26	97	467	3061	0.0115280155228013	0.0233614089402463	1	1.75657539085162	1.16824516966075	Inf	1.59690813182222	5.03640256959315	2.78713872647953e-07	9.4762716700304e-07	8.52864450302736e-05	13.0921674779453	1.00728051391863	0.533290753483609	0.832884540635709	1	1.00839861479913	0.785696101037603	1	1	149	140	10
"TCGA-HD-7229-01A-11D-2012-08"	0	0	0	0	189	0	2	6	8	181	7421	3	8	5	16	1675	6	7	3	16	1721	20	11	44	75	1973	24	13	37	74	2052	4	1	5	10	262	0.0529100529100529	0.135135135135135	0.127680311890838	1.05838663090572	0.0381679389312977	9	1	4	14	250	0.0740740740740741	0.186666666666667	0.126710593005575	1.47317333333333	0.056	0.116402116402116	22	103	512	3513	0.0750805147154034	0.127977541282616	1	1.46536814684008	0.947719611668284	Inf	1.38359375	2.32266512784091	0.00271825842405353	0.0051029882071189	0.83178707776038	2.87627125714474	0.873480902777778	0.716486896492117	0.923225978655291	1	0.857715522556319	0.385159207411408	0.754274220583306	1	167	159	0
"TCGA-HD-7753-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	107	1	6	6	12	93	3813	5	12	2	19	936	3	10	2	15	1005	4	11	11	26	911	8	9	16	33	961	3	3	2	8	158	0.0747663551401869	0.242424242424242	0.164412070759625	1.47449175297277	0.0506329113924051	2	2	0	4	137	0.0373831775700935	0.153846153846154	0.150384193194292	1.02302077484559	0.0291970802919708	0.0654205607476635	7	32	295	1577	0.421872447755823	0.537887370888674	1	1.16925377077071	0.50753070600251	Inf	1.13898305084746	2.64406779661017	0.0299236449231658	0.0467175272780038	1	3.81449645110366	0.470056497175141	0.940410803689163	1	1	0.427801308023789	0.37070938215103	0.74141876430206	1	100	86	0
"TCGA-HD-7754-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	76	0	1	2	3	73	2993	0	4	2	6	745	1	7	0	8	700	0	5	27	32	794	0	2	25	27	754	0	1	2	3	92	0.0394736842105263	0.111111111111111	0.122015915119363	0.910628019323671	0.0326086956521739	0	1	5	6	116	0.0789473684210526	0.1875	0.146095717884131	1.28340517241379	0.0517241379310345	0.0921052631578947	7	45	208	1340	0.561423294086637	0.671737246966706	1	1.00213543699611	0.441872951577263	Inf	1.00184911242604	NA	1	1	1	0	1.00184911242604	0.561423294086637	0.856404873143824	1	1.00213543699611	0.00226244343891403	0.0230769230769231	0.692307692307693	69	66	0
"TCGA-HD-7831-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	46	0	2	4	6	40	1640	2	4	0	6	389	2	1	0	3	386	2	1	14	17	436	2	1	11	14	429	1	0	1	2	47	0.0434782608695652	0.142857142857143	0.10955710955711	1.30395136778115	0.0425531914893617	0	0	1	1	61	0.0217391304347826	0.0588235294117647	0.139908256880734	0.420443587270974	0.0163934426229508	0.0652173913043478	3	26	108	757	0.720602853465983	0.783484050636314	1	0.8089390858288	0.204633898435243	Inf	0.828544061302682	2.00231481481481	0.415554576567213	0.48349695980824	1	2.33335131485405	0.640740740740741	0.836752968522852	0.981020721716447	1	0.609785653406733	1	1	1	43	37	0
"TCGA-HD-7832-01A-11D-2129-08"	0	0	0	0	117	0	2	5	7	110	4510	5	8	2	15	1102	2	7	3	12	1067	5	7	29	41	1179	2	4	36	42	1162	1	0	6	7	149	0.0598290598290598	0.166666666666667	0.128227194492255	1.29977628635347	0.0469798657718121	3	2	6	11	172	0.094017094017094	0.268292682926829	0.145886344359627	1.83905275099263	0.063953488372093	0.136752136752137	16	56	321	2020	0.0357308578941943	0.0654709132672063	1	1.79742224210181	1.0519256076872	Inf	1.62062997577016	4.16733422340899	0.00894263853906601	0.0152024855164122	1	8.37681503528987	1.34636951833214	0.178697237085505	0.37198200372901	1	1.4245535139614	0.0175920837235342	0.112149533737531	1	101	94	0
"TCGA-HD-7917-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	76	0	3	7	10	66	2706	4	5	2	11	685	2	5	1	8	657	8	4	15	27	679	2	5	13	20	685	0	2	2	4	94	0.0526315789473684	0.2	0.137226277372263	1.45744680851064	0.0425531914893617	2	3	2	7	113	0.0921052631578947	0.259259259259259	0.166421207658321	1.55784988528351	0.0619469026548673	0.0789473684210526	6	32	207	1157	0.529426798157495	0.648018400944774	1	1.04797976559432	0.42275138748314	Inf	1.04042715484363	1.31787439613527	0.463934308367038	0.52579221614931	1	1.39695992225495	0.941338854382333	0.633748690524139	0.877498186879577	1	0.931590397318787	0.635117204776648	0.955779514603044	1	70	60	0
"TCGA-HL-7533-01A-11D-2229-08"	0	0	0	0	755	5	2	5	7	742	30422	1	4	4	9	7392	1	3	0	4	7388	133	25	217	375	7759	126	11	217	354	7883	85	8	138	231	1243	0.305960264900662	0.652542372881356	0.15768108588101	4.13836808159592	0.185840707964602	108	10	134	252	1228	0.333774834437086	0.672	0.158267818017786	4.2459674267101	0.205211726384365	0.615894039735099	465	228	2471	13171	5.51575439098765e-189	8.4391042182111e-187	1.68782084364222e-186	10.871557420867	9.44158703443733	Inf	4.24755737989247	4.71712170052923	2.3632292088444e-95	3.61574068953193e-93	7.23148137906386e-93	15.5824988878165	3.96733351112537	1.68405163981939e-103	5.15319801784733e-101	5.15319801784733e-101	8.94832955780918	4.81951455487568e-07	1.47477145379196e-05	0.000147477145379196	290	277	356
"TCGA-IQ-7630-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	149	2	1	3	4	142	5822	0	3	1	4	1379	0	4	0	4	1263	9	11	55	75	1635	8	6	45	59	1545	6	1	5	12	173	0.0805369127516778	0.203389830508475	0.111974110032362	1.8164005094543	0.069364161849711	6	1	7	14	205	0.0939597315436242	0.186666666666667	0.125382262996942	1.48878048780488	0.0682926829268293	0.161073825503356	24	93	378	2802	0.00622030696287214	0.0132181522961033	1	1.91257037113835	1.2492254633621	Inf	1.72568172568173	5.93837535014006	3.23927343535218e-08	1.28729567690619e-07	9.91217671217767e-06	17.7573108444199	1.00952380952381	0.53381486370103	0.832884540635709	1	1.010819814449	1	1	1	125	118	10
"TCGA-IQ-7631-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	37	0	0	3	3	34	1394	0	1	3	4	323	1	0	0	1	328	0	1	11	12	359	3	0	14	17	384	2	0	1	3	42	0.0810810810810811	0.176470588235294	0.109375	1.61344537815126	0.0714285714285714	0	1	1	2	47	0.0540540540540541	0.166666666666667	0.13091922005571	1.27304964539007	0.0425531914893617	0.108108108108108	4	24	89	654	0.443020289586198	0.555591018907281	1	1.2243651422714	0.381011288820508	Inf	1.19261637239165	5.56554307116105	0.0406833123704573	0.0613255841643347	1	14.5954194525746	0.667865168539326	0.818444385895931	0.974490202662081	1	0.63930187206654	1	1	1	33	30	0
"TCGA-IQ-7632-01A-11D-2078-08"	0	0	0	0	61	0	1	2	3	58	2378	1	5	1	7	576	3	4	2	9	564	1	2	16	19	599	6	4	13	23	639	2	0	0	2	85	0.0327868852459016	0.0869565217391304	0.13302034428795	0.653708439897698	0.0235294117647059	0	1	1	2	91	0.0327868852459016	0.105263157894737	0.151919866444073	0.692886061307114	0.021978021978022	0.0491803278688525	3	33	176	1062	0.901450084284244	0.941446163109142	1	0.548766042355374	0.141316052721972	Inf	0.586174242424242	2.00974025974026	0.263672524185731	0.320173779368388	1	2.41134281911946	0.242554858934169	0.987925342213233	1	1	0.215655718929681	1	1	1	58	55	0
"Totals"	0	0	0	0	56069	122	662	1707	2369	53089	2176649	1489	2440	685	4614	520833	1578	2545	777	4900	529855	4787	4487	12526	21800	559651	5019	4461	12295	21775	566310	2828	773	3184	6785	79188	0.121011610693966	0.311595866819747	0.139831541028765	2.22836610772707	0.0856821740667778	2746	768	3175	6689	77454	0.119299434625194	0.306834862385321	0.138396965251559	2.21706351600701	0.086360936814109	0.212827052381887	11933	22694	156642	969319	0	NA	NA	3.25385298869555	3.19204981195225	Inf	2.47713629249354	4.08592324449356	0	NA	NA	8.14992773851047	1.84155493592803	0	NA	NA	2.13142644903428	6.7318167269633e-22	NA	NA	44136	41156	NA
