Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-05-4244-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	472	0	7	11	18	448	18368	19	19	7	45	4643	24	21	7	52	4517	15	100	57	172	4680	28	91	60	179	4528	5	17	11	33	623	0.0699152542372881	0.184357541899441	0.137588339222615	1.33992126760942	0.0529695024077047	4	12	12	28	649	0.0593220338983051	0.162790697674419	0.138675213675214	1.17389902175082	0.0431432973805855	0.0677966101694915	32	128	1272	7936	0.0202875101454629	1.5596572903609	1.09124661232181	Inf	1.44779874213836	1.51513821851689	0.131597495452986	1.65138510932126	1.42305004569156	0.05107392036396	1.52647713675701	0.0069060106826951	440	416
TCGA-05-4249-01A-01D-1105-08	0	0	1	1	733	0	3	19	22	702	28782	37	35	8	80	7036	37	25	9	71	7307	35	156	72	263	7190	44	164	80	288	7249	18	19	22	59	1028	0.0804911323328786	0.204861111111111	0.141812663815699	1.44458968331172	0.0573929961089494	13	16	5	34	969	0.0463847203274216	0.129277566539924	0.134770514603616	0.959242211993863	0.0350877192982456	0.0791268758526603	58	173	1997	12442	4.55606061835991e-06	2.08867294794567	1.59708779313639	Inf	1.81541142883156	2.83722419071645	2.3804430531675e-08	4.02361502171707	1.28433769074665	0.103296983096117	1.34572195451803	0.635097832598915	675	644
TCGA-05-4250-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	814	5	9	30	39	757	31037	28	46	15	89	7622	34	39	13	86	7864	46	134	107	287	7834	54	158	83	295	7717	18	19	26	63	1101	0.0773955773955774	0.213559322033898	0.14267202280679	1.49685493926939	0.0572207084468665	18	11	27	56	1053	0.0687960687960688	0.195121951219512	0.134414092417667	1.45164802075371	0.0531813865147198	0.109336609336609	89	201	2154	13397	2.57875887646465e-13	2.75370668783698	2.20261051213054	Inf	2.21566772324144	2.59905292479109	2.78379415235197e-08	3.49815656253019	2.01388603821532	3.91208583947493e-07	2.40587096196683	0.0317994236253433	725	668
TCGA-05-4382-01A-01D-1265-08	0	0	1	1	3280	13	16	59	75	3127	128207	164	91	31	286	32132	180	90	26	296	32423	182	831	277	1290	31875	189	789	277	1255	31777	63	114	78	255	4502	0.0777439024390244	0.203187250996016	0.141674796236272	1.43418064746788	0.0566414926699245	61	107	71	239	4518	0.0728658536585366	0.185271317829457	0.141741176470588	1.3071100610478	0.0528995130588756	0.0832317073170732	273	652	9020	54632	1.0346384973407e-32	2.53595877461907	2.24175473875881	Inf	2.08269862767424	2.35859455776621	9.88982520471182e-21	3.04056893932796	1.89793799578954	5.46272749968359e-15	2.22825658281118	0.0876307289535147	3007	2854
TCGA-05-4384-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	330	1	3	14	17	306	12546	13	18	8	39	3153	17	18	6	41	3050	14	53	42	109	3155	12	58	47	117	3188	4	8	10	22	412	0.0666666666666667	0.188034188034188	0.129234629861982	1.45498298896357	0.0533980582524272	6	5	10	21	415	0.0636363636363636	0.192660550458716	0.131537242472266	1.4646844257765	0.0506024096385542	0.0909090909090909	30	85	827	5516	0.000153943637372715	2.35365707365838	1.60064930203753	Inf	2.00084117554282	2.94995814342852	0.00105842270533495	4.16760583303593	1.72357105009307	0.0104064168824233	1.93314611546624	0.0408532599837751	300	276
TCGA-05-4389-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	573	3	7	12	19	544	22304	15	29	8	52	5628	35	30	9	74	5651	49	54	105	208	5529	50	62	98	210	5496	27	13	30	70	800	0.12216404886562	0.333333333333333	0.145560407569141	2.29	0.0875	28	15	38	81	814	0.141361256544503	0.389423076923077	0.147223729426659	2.6451108013608	0.0995085995085995	0.214659685863874	123	179	1614	9411	2.77968981291705e-27	4.00610892983173	3.26127329459419	Inf	2.78210320293459	3.79491945477076	6.98658922636715e-21	7.28673772870345	2.28816818356621	2.35871332070455e-11	2.93663441097556	0.15977128902874	450	421
TCGA-05-4390-01A-02D-1753-08	0	0	0	0	1233	5	11	33	44	1156	47396	58	50	24	132	11862	65	44	15	124	12076	56	277	108	441	11789	55	309	95	459	11669	5	21	9	35	1615	0.0283860502838605	0.0762527233115468	0.138400891250321	0.550955435493771	0.021671826625387	10	32	15	57	1616	0.0462287104622871	0.129251700680272	0.137076936126898	0.942913551559238	0.0352722772277228	0.0316301703163017	39	275	3231	20227	0.778234077833029	0.887856627843935	0.654051111098643	Inf	0.901755880039506	0.981120396162179	0.573466496239327	0.978170097863155	0.858359519006911	0.816441538472511	0.839379228884167	0.148428552240745	1194	1117
TCGA-05-4395-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	687	1	6	14	20	662	27142	19	22	7	48	6819	29	27	10	66	6830	61	116	111	288	6768	51	96	113	260	6725	38	17	40	95	958	0.138282387190684	0.365384615384615	0.142453531598513	2.56493897542958	0.0991649269311065	39	16	34	89	895	0.129548762736536	0.309027777777778	0.132239952718676	2.33687150837989	0.0994413407821229	0.219796215429403	151	185	1853	11640	3.28156546305229e-42	5.12637117840998	4.23205600087898	Inf	3.27243305579112	5.00617242309768	1.06801123293027e-39	13.8151227274332	2.40556337213785	2.90714301920124e-13	3.09861609405223	0.832186604465559	536	511
TCGA-05-4396-01A-21D-1855-08	0	1	21	22	17983	143	2	15	17	17753	727873	23	19	11	53	173471	32	25	7	64	192174	174	7869	59	8102	177169	188	9273	73	9534	185059	9	234	16	259	26576	0.0144024912417283	0.0271659324522761	0.143608254664729	0.189166928570355	0.00974563515954244	5	180	11	196	23709	0.0108991825613079	0.0241915576400889	0.133821379586722	0.180774983151415	0.00826690286389135	0.00227993104598788	41	453	50285	311943	0.999950476549747	0.561466498228942	0.420382397975507	Inf	0.597861340158666	0.278588399712797	0.999999999950885	0.249566470008095	1.47344319198749	0.0239901421184542	1.59517429888687	0.0539163703476215	17942	17712
TCGA-05-4397-01A-01D-1265-08	0	1	1	2	1886	3	11	58	69	1773	72693	81	104	32	217	18772	79	110	26	215	18706	138	307	232	677	17570	170	296	198	664	17645	70	39	47	156	2642	0.0827147401908802	0.234939759036145	0.149730801926891	1.56908101748402	0.0590461771385314	62	58	83	203	2578	0.10763520678685	0.299852289512555	0.146727376209448	2.04360152317129	0.0787432117920869	0.138918345705196	262	476	5220	29995	7.50068037412074e-43	3.16266773239477	2.77015101121862	Inf	2.3949812582417	2.89121510673235	6.13321929092411e-32	4.30965440987584	2.0395393388577	6.57433587410633e-16	2.489918671025	0.938217150967855	1624	1511
TCGA-05-4398-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	1864	3	9	42	51	1780	72980	94	96	28	218	18382	85	81	30	196	18687	114	374	175	663	17837	114	373	216	703	18074	39	46	50	135	2661	0.0724248927038627	0.19203413940256	0.147228062410092	1.304331091906	0.0507328072153326	38	53	58	149	2522	0.0799356223175966	0.22473604826546	0.141391489600269	1.58945951344608	0.0590800951625694	0.0992489270386266	185	434	5183	30728	1.84507573593288e-22	2.52706966705927	2.17196383461504	Inf	2.0707485669099	2.33992624335293	2.43238439620649e-13	3.02307066657262	1.91378562514773	1.45340154430928e-11	2.26244440593613	0.00714826229531848	1679	1595
TCGA-05-4402-01A-01D-1265-08	0	2	0	2	342	2	2	8	10	329	13489	2	10	4	16	3463	7	11	4	22	3612	58	18	58	134	3096	61	27	69	157	3318	40	8	34	82	537	0.239766081871345	0.522292993630573	0.161844484629295	3.22712877628723	0.152700186219739	43	4	30	77	522	0.225146198830409	0.574626865671642	0.168604651162791	3.40813175501801	0.147509578544061	0.429824561403509	147	99	1059	5355	4.68311365646867e-50	7.50593367497568	5.97003860441827	Inf	3.61922199958543	4.22439117289975	6.88806292524871e-37	11.6556207823426	3.05217371907832	4.1884850131377e-18	5.13514466045447	0.0427410253438797	195	182
TCGA-05-4403-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	370	0	6	17	23	342	14022	28	22	5	55	3499	13	23	3	39	3580	18	63	43	124	3487	14	60	50	124	3456	1	6	4	11	499	0.0297297297297297	0.0887096774193548	0.144386574074074	0.614390070463508	0.0220440881763527	5	11	5	21	497	0.0567567567567568	0.169354838709677	0.142529394895325	1.18820990458882	0.0422535211267606	0.0405405405405405	15	110	996	5947	0.806318943983425	0.81423379138434	0.485394113781689	Inf	0.836506024096386	1.3070406626506	0.307507672134078	1.37782267474897	0.674601632335795	0.929640612107475	0.639773517116604	0.55612706705449	355	327
TCGA-05-4405-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	896	6	8	17	25	846	34686	45	32	16	93	8572	49	41	15	105	8723	43	169	91	303	8579	56	195	94	345	8812	15	23	17	55	1237	0.0613839285714286	0.159420289855072	0.140376758965048	1.13566014082692	0.0444624090541633	21	23	10	54	1199	0.0602678571428571	0.178217821782178	0.13975987877375	1.27517155385263	0.0450375312760634	0.0703125	63	221	2436	14955	0.000148272557382427	1.75000803135314	1.36038471623891	Inf	1.58368746964546	2.59605911330049	2.71506742257542e-08	3.50776651105663	1.04193183331114	0.441529918658419	1.04910434478795	0.231832622705178	833	783
TCGA-05-4410-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	2433	10	10	39	49	2342	96022	106	91	34	231	24291	132	78	20	230	24293	152	585	232	969	23707	139	556	217	912	23731	43	63	62	168	3416	0.0690505548705302	0.184210526315789	0.143946736336438	1.2797131147541	0.0491803278688525	50	61	64	175	3324	0.071927661323469	0.180598555211558	0.140211751803265	1.28804150072215	0.052647412755716	0.0900123304562269	219	521	6740	40698	1.37278927587541e-26	2.53806781375746	2.21017529364983	Inf	2.0829501162884	2.2493468750956	1.50882201351743e-14	2.83607537043004	1.97510722806368	2.92576330393839e-14	2.35529356629185	0.00869561561279785	2214	2123
TCGA-05-4415-01A-22D-1855-08	0	1	0	1	500	4	2	14	16	469	19229	20	22	3	45	4628	24	14	6	44	4685	21	121	56	198	4929	17	115	50	182	4987	3	10	4	17	643	0.034	0.0934065934065934	0.128935231602166	0.724445849640251	0.0264385692068429	4	14	11	29	637	0.058	0.146464646464646	0.129235138973423	1.13331906189049	0.0455259026687598	0.044	22	122	1280	8636	0.232489597962484	1.21661714609014	0.795159866427948	Inf	1.18355034722222	1.42705592105263	0.213494764948428	1.52340650595105	1.09625589622642	0.39474253404624	1.11207489005547	0.0857414935811316	478	447
TCGA-05-4417-01A-22D-1855-08	0	0	1	1	925	1	6	14	20	892	36572	30	34	7	71	8767	32	30	15	77	9025	31	261	57	349	9187	35	316	44	395	9593	3	21	8	32	1251	0.0345945945945946	0.0810126582278481	0.130407588866882	0.621226563053355	0.0255795363709033	5	24	9	38	1175	0.0410810810810811	0.108882521489971	0.127898116904321	0.851322319087972	0.0323404255319149	0.027027027027027	25	142	2426	16354	0.246241377452477	1.18679768761885	0.799985887070269	Inf	1.15885294538705	0.938319718204302	0.631569821725659	0.929805732143766	1.30296376711043	0.153686086179843	1.36424950256421	0.0760792938595346	900	867
TCGA-05-4418-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	583	4	6	12	18	553	22673	23	35	7	65	5559	21	30	11	62	5667	29	127	66	222	5647	31	112	61	204	5800	6	13	10	29	769	0.0497427101200686	0.142156862745098	0.132586206896552	1.07218440041816	0.0377113133940182	4	19	7	30	740	0.0514579759862779	0.135135135135135	0.131043031698247	1.03122717311907	0.0405405405405405	0.0463121783876501	27	160	1509	9938	0.338689209466352	1.11130928907106	0.761249226458159	Inf	1.09527859580485	1.26430307046609	0.263219626878115	1.31712675219871	1.01542451328773	0.513011828016222	1.017808357432	0.187991322240526	556	526
TCGA-05-4420-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	768	2	4	18	22	729	29889	29	25	15	69	7602	43	41	19	103	7414	37	148	82	267	7404	34	168	88	290	7469	6	15	12	33	997	0.04296875	0.113793103448276	0.133485071629402	0.852478124027254	0.033099297893681	5	22	9	36	989	0.046875	0.134831460674157	0.133576445164776	1.00939548516831	0.0364004044489383	0.0416666666666667	32	209	1986	12887	0.542616290203013	0.993519534456938	0.705443710436541	Inf	0.99437974535441	1.16025559196063	0.348051321077432	1.18960967895788	0.925102185889461	0.682166202347958	0.914534108033574	0.0684671808136957	736	697
TCGA-05-4422-01A-01D-1265-08	0	2	1	3	167	1	4	6	10	154	6314	5	11	2	18	1693	4	5	5	14	1562	13	18	35	66	1566	13	18	25	56	1493	9	4	12	25	226	0.149700598802395	0.446428571428571	0.151373074346952	2.94919405815424	0.110619469026549	5	1	10	16	226	0.0958083832335329	0.242424242424242	0.144316730523627	1.67980691874497	0.0707964601769911	0.215568862275449	36	50	452	2607	2.42732628800323e-09	4.15017509898582	2.79033316505963	Inf	2.83299032722782	3.64414567733152	4.4860380449828e-06	6.72227886977796	2.48148967551622	3.0798550598683e-05	3.3373712192753	0.118773630965533	131	118
TCGA-05-4424-01A-22D-1855-08	0	0	1	1	1694	6	11	33	44	1622	66502	77	68	21	166	16706	61	77	18	156	17344	107	361	159	627	16219	113	369	191	673	16233	53	47	52	152	2440	0.089728453364817	0.225854383358098	0.150311094683669	1.50257959223443	0.0622950819672131	54	44	36	134	2299	0.0791027154663518	0.213716108452951	0.141747333374437	1.50772577772875	0.0582862113962592	0.115112160566706	195	375	4739	27713	5.86203033156147e-31	3.04074454320851	2.6114203787411	Inf	2.34268833087149	3.33054921444877	1.43564843405429e-32	5.53695787963143	1.72174720405149	1.94118872027218e-07	1.96419839794197	0.112227772763079	1499	1427
TCGA-05-4425-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	101	0	4	3	7	94	3854	0	13	2	15	882	4	5	2	11	969	4	5	29	38	996	2	3	25	30	1007	1	1	2	4	145	0.0396039603960396	0.133333333333333	0.143992055610725	0.925977011494253	0.0275862068965517	0	1	1	2	106	0.0198019801980198	0.0526315789473684	0.106425702811245	0.494538232373386	0.0188679245283019	0.0396039603960396	4	56	251	1752	0.951060208552999	0.498709565138221	0.163750178526637	Inf	0.532005312084993	1.33001328021248	0.553023222338504	1.3957496193767	0.443337760070828	0.971482176413773	0.410720756349516	0.545454545454546	97	90
TCGA-05-4426-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	145	0	4	9	13	132	5412	9	10	5	24	1360	6	7	2	15	1359	4	19	23	46	1307	1	29	17	47	1386	1	5	2	8	198	0.0551724137931034	0.170212765957447	0.142857142857143	1.19148936170213	0.0404040404040404	2	3	3	8	178	0.0551724137931034	0.173913043478261	0.136189747513389	1.27699071812408	0.0449438202247191	0.0551724137931034	8	37	376	2317	0.290740875531636	1.33221898009636	0.617353144123703	Inf	1.27328605200946	4.29734042553191	0.0220905978586447	9.22998394377055	0.895279255319149	0.674119245447808	0.880381912770702	0.685082190087752	137	124
TCGA-05-4427-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	2410	5	11	49	60	2314	94874	109	94	48	251	23701	119	104	61	284	24542	115	574	216	905	23262	136	524	214	874	23369	41	72	43	156	3424	0.0647302904564315	0.178489702517162	0.146518892549959	1.21820264548001	0.0455607476635514	25	62	39	126	3273	0.0522821576763485	0.139226519337017	0.140701573381481	0.98951643532468	0.0384967919340055	0.0614107883817427	148	533	6697	39934	1.83828985643694e-07	1.65573200281863	1.41052088919385	Inf	1.51324425406252	1.83090008191811	5.98656887056533e-07	2.12730078262321	1.32782189873286	0.00451697416232125	1.40505274240854	0.150960070653846	2262	2166
TCGA-05-4430-01A-02D-1265-08	0	1	0	1	674	1	4	15	19	651	26691	35	38	7	80	6866	34	32	6	72	6763	38	156	49	243	6416	36	163	57	256	6646	7	22	8	37	905	0.0548961424332344	0.14453125	0.136172133614204	1.06138639502762	0.0408839779005525	6	21	9	36	935	0.0534124629080119	0.148148148148148	0.145729426433915	1.01659734600911	0.0385026737967914	0.0445103857566766	30	150	1840	11222	0.187919130998516	1.2197498242379	0.849774587601857	Inf	1.18315217391304	1.24710634547591	0.238462544687618	1.29973840438036	1.13850492206727	0.3223202878706	1.16492451484915	0.539397156776534	644	621
TCGA-05-4432-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	1627	4	10	34	44	1544	63304	77	101	30	208	15693	88	94	20	202	16708	84	298	160	542	15419	78	322	192	592	15484	19	39	34	92	2223	0.0565457897971727	0.155405405405405	0.14356755360372	1.08245492456019	0.0413855150697256	19	36	19	74	2115	0.0454824830977259	0.136531365313653	0.137168428562164	0.995355613130599	0.0349881796690307	0.0559311616472034	91	423	4338	26565	0.012273171504581	1.31739666787012	1.07691353373121	Inf	1.26121569767129	1.67101241398152	0.000920285851279355	1.87653973928846	1.07261607255124	0.314161454548378	1.08550953788361	0.0846624438973709	1536	1453
TCGA-05-4433-01A-22D-1855-08	0	0	0	0	119	0	4	6	10	109	4469	1	9	1	11	1084	3	3	4	10	1013	5	13	26	44	1199	6	16	22	44	1173	3	3	1	7	117	0.0588235294117647	0.159090909090909	0.0997442455242967	1.59498834498835	0.0598290598290598	1	0	2	3	148	0.0252100840336134	0.0681818181818182	0.123436196830692	0.552364864864865	0.0202702702702703	0.0588235294117647	7	52	265	2107	0.495936670868539	1.07030999378576	0.476338089772701	Inf	1.06197633514551	3.2548885077187	0.0275490757737395	4.53880559075593	0.559433962264151	0.914658137994109	0.530173073837431	1	112	102
TCGA-05-4434-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	116	1	2	8	10	104	4264	2	7	3	12	1147	6	6	1	13	1057	6	7	29	42	1073	11	5	21	37	987	9	1	7	17	152	0.146551724137931	0.459459459459459	0.154002026342452	2.98346372688478	0.111842105263158	2	3	3	8	171	0.0689655172413793	0.19047619047619	0.159366262814539	1.19521024784183	0.0467836257309941	0.181034482758621	21	46	323	1737	0.00128327119069982	2.45368283930355	1.50242520773885	Inf	1.99898341111779	4.12675286832999	7.92508527815433e-06	9.83986356763398	1.27554179566563	0.255519531427103	1.34421858262202	1	95	83
TCGA-05-5420-01A-01D-1625-08	0	1	0	1	192	0	2	7	9	180	7380	9	14	3	26	1892	10	5	7	22	1778	9	22	32	63	1997	7	29	33	69	1713	1	4	6	11	227	0.0572916666666667	0.159420289855072	0.132516053706947	1.20302624018387	0.0484581497797357	2	1	8	11	285	0.0572916666666667	0.174603174603175	0.14271407110666	1.22344750765803	0.0385964912280702	0.0885416666666667	17	64	512	3198	0.0515208445897381	1.65885092635536	0.995554203997058	Inf	1.52078510802469	1.358642578125	0.384332257261324	1.44124117876772	1.56069711538462	0.0600833880961904	1.71431652881367	0.00155461887316213	175	163
TCGA-05-5423-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	313	0	4	5	9	302	12382	13	12	4	29	3165	13	16	2	31	3077	20	62	42	124	3050	16	54	48	118	3090	4	4	10	18	410	0.0575079872204473	0.152542372881356	0.132686084142395	1.14964861513022	0.0439024390243902	6	7	12	25	422	0.0798722044728434	0.201612903225806	0.138360655737705	1.45715486928604	0.0592417061611374	0.10223642172524	32	94	832	5308	0.000328712724424284	2.17150779298776	1.49823963764651	Inf	1.87423687423687	2.04994658119658	0.0189493123644871	2.45328527300114	1.80395299145299	0.00415583223845554	2.06377618226926	0.0135255124610445	281	270
TCGA-05-5425-01A-02D-1625-08	0	0	0	0	84	0	7	23	30	54	2214	2	2	1	5	549	3	1	0	4	560	4	14	6	24	562	0	20	1	21	543	0	6	0	6	79	0.0714285714285714	0.285714285714286	0.14548802946593	1.96383363471971	0.0759493670886076	0	1	0	1	61	0.0119047619047619	0.0416666666666667	0.108540925266904	0.383879781420765	0.0163934426229508	0	0	11	140	965	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	84	54
TCGA-05-5428-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	848	2	4	16	20	813	33333	28	19	5	52	8288	27	17	11	55	8530	62	153	124	339	8170	63	163	141	367	8345	38	22	65	125	1218	0.147405660377358	0.340599455040872	0.145955662073098	2.33358165214785	0.102627257799672	31	16	60	107	1175	0.126179245283019	0.315634218289086	0.143818849449204	2.194665160359	0.091063829787234	0.22877358490566	194	196	2393	14122	8.98207144391718e-59	5.84023039147328	4.89762006547617	Inf	3.43299366742743	3.80956122022566	6.84683540854283e-26	7.2705194880894	3.25536746327733	5.89203371648738e-36	5.26836376763404	1.95200756544587e-07	654	619
TCGA-05-5429-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	94	0	6	5	11	83	3403	1	3	3	7	802	0	4	5	9	910	4	6	25	35	878	4	10	18	32	813	0	1	2	3	112	0.0319148936170213	0.09375	0.137761377613776	0.680524553571429	0.0267857142857143	0	1	2	3	101	0.0319148936170213	0.0857142857142857	0.11503416856492	0.745120226308345	0.0297029702970297	0.0425531914893617	4	47	213	1478	0.897109825063649	0.590699516382139	0.192504758311146	Inf	0.622664089109822	0	1	0	0.738508570804673	0.806711653956937	0.711813074243514	0.0606060606060606	90	79
TCGA-05-5715-01A-01D-1625-08	0	3	1	4	300	2	6	6	12	286	11726	7	8	0	15	2941	2	11	2	15	3124	49	10	52	111	2800	53	18	74	145	2861	36	5	42	83	470	0.276666666666667	0.572413793103448	0.164278224397064	3.48441672780631	0.176595744680851	43	3	19	65	422	0.216666666666667	0.585585585585586	0.150714285714286	3.88540198966739	0.154028436018957	0.466666666666667	140	88	892	4769	7.36233133302168e-52	8.50078868186931	6.68572790759459	Inf	3.89691999055936	4.91535874439462	4.46203183307007e-42	18.3588350687634	3.07246957078796	3.4526285811118e-17	5.01544581363876	0.0476201864789753	160	146
TCGA-17-Z000-01A-01W-0746-08	0	2	0	2	352	1	9	19	28	318	13038	16	17	7	40	3395	11	11	5	27	3356	29	37	48	114	3065	30	57	50	137	3222	15	11	14	40	454	0.113636363636364	0.291970802919708	0.140906269397889	2.07209235023634	0.0881057268722467	13	3	13	29	460	0.0823863636363636	0.254385964912281	0.150081566068515	1.69498474446987	0.0630434782608696	0.15625	55	102	914	5373	2.56709759178068e-10	3.16901759903046	2.350532077769	Inf	2.40968515240631	3.26439936208879	2.35929466608828e-09	5.30755807393335	1.89511231188318	0.000685427803908484	2.23514594730875	1	297	263
TCGA-17-Z001-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	530	3	12	19	31	492	20172	31	27	9	67	5137	29	12	13	54	5256	30	107	55	192	4759	22	96	61	179	5020	2	12	12	26	754	0.0490566037735849	0.145251396648045	0.150199203187251	0.967058370256213	0.0344827586206897	5	13	12	30	719	0.0566037735849057	0.15625	0.151082160117672	1.03420549374131	0.0417246175243394	0.0584905660377358	31	137	1473	8306	0.134964424270289	1.27590537489056	0.89061045977618	Inf	1.2250226295542	0.893688965481226	0.6849638830783	0.877179567191136	1.37355151344898	0.0646900437273242	1.47093094909763	0.000588742622822256	499	461
TCGA-17-Z003-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	614	1	3	11	14	581	23821	43	66	13	122	6270	31	57	7	95	6445	38	67	58	163	5511	47	79	75	201	5595	15	9	16	40	877	0.0651465798045603	0.199004975124378	0.15674709562109	1.26959274323933	0.0456100342075257	9	7	8	24	884	0.0390879478827362	0.147239263803681	0.160406459807657	0.917913555228604	0.0271493212669683	0.0781758957654723	48	170	1761	9345	0.0111102817977091	1.49828254537967	1.119972925838	Inf	1.38861885188253	1.78069946888466	0.00284952625873745	2.08772013621353	1.13804101394884	0.279274962859069	1.16838836234115	1	566	533
TCGA-17-Z004-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	69	0	4	3	7	62	2542	4	8	2	14	726	1	13	2	16	645	6	6	5	17	597	3	4	8	15	574	1	0	0	1	76	0.0144927536231884	0.0666666666666667	0.132404181184669	0.503508771929825	0.0131578947368421	1	2	0	3	98	0.0434782608695652	0.176470588235294	0.164154103852596	1.0750300120048	0.0306122448979592	0.0289855072463768	2	20	174	997	0.858968284884071	0.573211116259164	0.0947670196783615	Inf	0.611807732497388	1.49553001277139	0.397869170594421	1.63629839188747	0	1	0	0.428571428571429	67	60
TCGA-17-Z005-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	302	1	6	5	11	287	11767	13	15	7	35	3003	21	20	4	45	2945	11	55	35	101	2942	14	54	38	106	2877	2	8	5	15	381	0.0496688741721854	0.141509433962264	0.132429614181439	1.06856336354182	0.0393700787401575	4	5	4	13	415	0.043046357615894	0.128712871287129	0.141060503059143	0.912465704401765	0.0313253012048193	0.0496688741721854	15	83	796	5023	0.364201087315551	1.14036010547613	0.673051439733861	Inf	1.11892370013332	1.75447236180905	0.117525775433275	1.9924926415032	0.90127004887451	0.682156984607985	0.887433441114069	0.547152630062323	287	272
TCGA-17-Z007-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	309	4	5	9	14	290	11890	13	29	18	60	3228	9	21	19	49	3289	11	22	55	88	2638	12	30	51	93	2735	4	8	6	18	442	0.058252427184466	0.193548387096774	0.161608775137112	1.1976353816961	0.0407239819004525	0	8	4	12	376	0.0388349514563107	0.136363636363636	0.142532221379833	0.956721470019342	0.0319148936170213	0.0453074433656958	14	115	818	4555	0.937664222027124	0.677943227283812	0.396941139841179	Inf	0.712856086882356	1.14234081003508	0.473239051985238	1.17224614051242	0.619666005443558	0.969345974060662	0.580098215021565	0.125278403507509	295	276
TCGA-17-Z008-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	723	3	7	19	26	676	27716	29	38	9	76	6967	38	34	10	82	7105	38	145	76	259	6819	33	133	93	259	6825	10	16	8	34	949	0.0470262793914246	0.131274131274131	0.139047619047619	0.944094779711218	0.035827186512118	8	14	9	31	933	0.0428769017980636	0.11969111969112	0.13682358117026	0.874784292790724	0.0332261521972133	0.0484094052558783	35	205	1882	11762	0.390653529696523	1.06703931248741	0.767941016430322	Inf	1.05725292242295	1.83796081483588	0.00695549061885642	2.12241536878197	0.729263216142968	0.94000557677455	0.699000157128727	1	688	641
TCGA-17-Z009-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	140	0	11	18	29	108	4428	5	8	3	16	1171	9	6	2	17	1166	6	17	15	38	1024	3	16	18	37	1067	2	4	3	9	186	0.0642857142857143	0.243243243243243	0.174320524835989	1.39537925021796	0.0483870967741935	1	1	2	4	166	0.0285714285714286	0.105263157894737	0.162109375	0.649334178820545	0.0240963855421687	0.0571428571428571	8	34	352	1739	0.41521096067813	1.16231080628991	0.535396717551194	Inf	1.13149350649351	1.98011363636364	0.183505890434631	2.46868836614082	0.900051652892562	0.673543227685213	0.882253934474847	0.672768878718535	132	100
TCGA-17-Z010-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	693	0	9	14	23	655	26855	37	30	5	72	6836	33	31	9	73	6855	44	174	62	280	6678	30	129	71	230	6486	13	13	20	46	937	0.0663780663780664	0.2	0.144465001541782	1.38441835645678	0.0490928495197439	18	25	16	59	949	0.0851370851370851	0.210714285714286	0.142108415693321	1.48277133825079	0.0621707060063224	0.0966810966810967	67	140	1886	11278	6.3786753671194e-11	2.86147551868372	2.20277261812157	Inf	2.25917900010758	2.92399186036514	8.78457290552892e-09	4.31063850569902	1.8892831229718	0.000102327417603701	2.21915707122862	0.55389375498222	626	588
TCGA-17-Z011-01A-01W-0746-08	0	2	0	2	287	2	13	15	28	253	10373	10	10	2	22	2677	12	12	7	31	2579	20	47	38	105	2563	8	50	37	95	2554	0	7	9	16	389	0.0557491289198606	0.168421052631579	0.152310101801096	1.10577729671222	0.0411311053984576	5	8	11	24	371	0.0836236933797909	0.228571428571429	0.14475224346469	1.57905275317674	0.0646900269541779	0.0871080139372822	25	78	760	4357	0.00866623326459416	1.83718056573501	1.20634913687125	Inf	1.63419775166071	1.20230263157895	0.405292931137779	1.24621126371072	1.79543859649123	0.00603268372076778	2.08434349376689	0.000571766951514498	262	228
TCGA-17-Z012-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	590	1	5	3	8	578	23698	21	31	14	66	5899	11	28	7	46	5835	34	66	129	229	5964	49	56	132	237	6000	23	6	29	58	859	0.0983050847457627	0.244725738396624	0.143166666666667	1.70937651965046	0.0675203725261933	9	10	40	59	893	0.1	0.25764192139738	0.149731723675386	1.720690279075	0.0660694288913774	0.171186440677966	101	243	1752	10212	5.34507860397727e-12	2.42238610639334	1.96657898406461	Inf	2.00495778910481	2.63277768608681	9.34548723826481e-08	3.65673418174251	1.8053062509841	7.16755241014772e-07	2.09457450938347	1.64839197111137e-06	489	477
TCGA-17-Z013-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	204	0	8	16	24	176	7216	15	18	3	36	1884	2	13	4	19	1903	5	24	30	59	1672	6	31	25	62	1757	2	6	2	10	230	0.0490196078431373	0.161290322580645	0.130904951622083	1.23211781206171	0.0434782608695652	1	4	2	7	225	0.0343137254901961	0.11864406779661	0.134569377990431	0.88165725047081	0.0311111111111111	0.0343137254901961	7	59	455	2974	0.788619649347718	0.775540835984616	0.348199038887962	Inf	0.799300699300699	2.05534465534466	0.171642715179768	2.45022538179249	0.548091908091908	0.944282179534502	0.512726664956162	1	197	169
TCGA-17-Z014-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	970	2	10	36	46	903	37023	62	49	16	127	9689	69	46	11	126	9819	58	159	104	321	8655	43	187	99	329	8860	15	33	26	74	1364	0.0762886597938144	0.224924012158055	0.153950338600451	1.46101667721434	0.0542521994134897	19	19	27	65	1292	0.0670103092783505	0.202492211838006	0.149277874061236	1.35647840050924	0.0503095975232198	0.0896907216494845	87	217	2656	14859	2.47132147832367e-09	2.24282961857084	1.79622147135731	Inf	1.88724263831642	2.21993170702612	3.29613536368697e-06	2.83877667843262	1.72171753516529	4.31389721821516e-05	1.97670753457326	0.0196307803020908	883	816
TCGA-17-Z015-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	1419	7	26	49	75	1315	53915	59	74	25	158	14063	63	62	20	145	13780	70	277	153	500	13106	79	276	157	512	12966	12	28	18	58	1866	0.0408738548273432	0.11328125	0.143914854234151	0.787140775723473	0.0310825294748124	19	42	11	72	1924	0.0507399577167019	0.144	0.14680299099649	0.980906444906445	0.0374220374220374	0.0422832980972516	60	399	3790	22282	0.82864990783572	0.884107402876205	0.692622499493977	Inf	0.899236035663166	1.43123373058738	0.0241740112550011	1.54448929824992	0.643533917780237	0.997430999634285	0.606756791887353	0.883076620415214	1359	1255
TCGA-17-Z016-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	1463	8	7	22	29	1402	57482	98	71	21	190	15345	99	79	22	200	15338	61	332	108	501	13410	71	292	148	511	13389	16	38	22	76	2122	0.051948051948052	0.148727984344423	0.158488311300321	0.938416108570912	0.0358152686145146	14	50	13	77	2015	0.0526315789473684	0.153692614770459	0.150260999254288	1.02283769929124	0.0382133995037221	0.0444292549555707	65	323	4137	22662	0.257777325992116	1.10238481521909	0.868194134053588	Inf	1.08521227843275	1.47224602808359	0.0176763858901702	1.61110157618454	0.885648001269036	0.805253875328695	0.867546371916205	0.576345717078458	1398	1337
TCGA-17-Z017-01A-01W-0746-08	0	0	2	2	561	0	12	23	35	514	21074	30	35	10	75	5483	39	26	9	74	5483	38	101	59	198	5056	30	93	44	167	5052	11	12	5	28	775	0.0499108734402852	0.167664670658683	0.153404592240697	1.09295731118408	0.0361290322580645	9	7	9	25	762	0.0445632798573975	0.126262626262626	0.150712025316456	0.837774066120523	0.0328083989501312	0.0606060606060606	34	137	1537	8571	0.0608300379564261	1.38388500574321	0.980125513664879	Inf	1.30759777344032	1.93424930154235	0.00224728218720399	2.32326965484397	0.893886084984619	0.715930904405826	0.877217867797022	0.298128799502442	527	480
TCGA-17-Z018-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	628	4	23	34	57	561	23001	33	22	7	62	5906	27	27	9	63	5897	29	141	38	208	5730	23	163	42	228	5468	4	20	10	34	777	0.054140127388535	0.149122807017544	0.142099487929773	1.04942536521484	0.0437580437580438	4	17	4	25	802	0.0398089171974522	0.120192307692308	0.139965095986038	0.858730577402647	0.0311720698254364	0.035031847133758	22	110	1579	9619	0.232658070465377	1.21833051201241	0.794140466480756	Inf	1.18197171205404	1.09105081112681	0.454855450794869	1.10763061499451	1.24107029765674	0.233337958239432	1.29217292442905	0.236882792101412	606	539
TCGA-17-Z020-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	374	2	5	7	12	356	14596	12	21	9	42	3904	12	20	6	38	3795	37	48	51	136	3518	29	54	57	140	3379	13	8	17	38	527	0.101604278074866	0.271428571428571	0.155963302752294	1.74033613445378	0.0721062618595825	16	9	18	43	565	0.114973262032086	0.316176470588235	0.160602615122229	1.9686881832379	0.0761061946902655	0.171122994652406	64	110	1092	5805	3.31033915383486e-11	3.09223237922123	2.33890946435497	Inf	2.32310218517115	2.77518315018315	7.34070610548063e-08	4.16536663020383	2.04683048433048	1.82153467408453e-05	2.54828282296133	0.421757852986232	310	292
TCGA-17-Z021-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	537	4	3	7	10	513	21033	36	32	9	77	5531	29	23	5	57	5631	33	105	66	204	5023	27	102	46	175	4848	10	13	10	33	751	0.0614525139664804	0.188571428571429	0.154909240924092	1.21730264409359	0.0439414114513981	11	19	11	41	764	0.0763500931098696	0.200980392156863	0.152100338443161	1.32136715942922	0.0536649214659686	0.0782122905027933	42	130	1515	8356	0.00142049652922999	1.7818090922369	1.29743244328055	Inf	1.59099700667741	2.28042904290429	0.000149847441435657	2.96944078790603	1.22165841584158	0.192470751395759	1.27277617534702	1	495	471
TCGA-17-Z022-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	4591	17	15	56	71	4432	181712	234	165	57	456	48331	246	174	59	479	47689	341	1021	443	1805	42368	321	937	434	1692	43324	138	147	164	449	6730	0.0978000435634938	0.265366430260047	0.155341150401625	1.70828160840807	0.0667161961367013	137	148	149	434	6662	0.0945327815290786	0.240443213296399	0.157241314199396	1.52913510371387	0.0651456019213449	0.128076671749074	588	951	13392	72300	1.24252582476779e-99	3.33796440573662	3.05295536554376	Inf	2.44474487692748	2.65808915093829	1.26180755084919e-56	3.83626538582749	2.2837027909581	2.93195260714582e-47	2.99606027326921	0.0616808361684528	4003	3844
TCGA-17-Z023-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	998	2	16	36	52	926	37966	58	59	22	139	9757	56	73	22	151	10183	83	138	92	313	8930	69	139	115	323	9096	23	23	20	66	1419	0.0661322645290581	0.204334365325077	0.156002638522427	1.30981352149183	0.0465116279069767	32	15	19	66	1296	0.0661322645290581	0.210862619808307	0.145128779395297	1.45293456395693	0.0509259259259259	0.094188376753507	94	265	2715	15311	5.02592760002619e-08	2.00036031878016	1.621362708856	Inf	1.73845293607678	2.40241833866434	1.56239117971343e-10	3.19731789379188	1.25090346171297	0.0818042458497634	1.3091264034977	0.0535773212258886	904	832
TCGA-17-Z025-01A-01W-0746-08	0	1	0	1	786	0	3	14	17	753	30873	43	38	10	91	7967	37	48	7	92	7947	44	167	84	295	7502	28	176	71	275	7457	9	22	3	34	1062	0.0432569974554707	0.123636363636364	0.142416521389299	0.868132169149118	0.032015065913371	8	27	12	47	1114	0.0597964376590331	0.159322033898305	0.148493735003999	1.07292091409792	0.0421903052064632	0.0407124681933842	32	195	2176	12783	0.604594626071257	0.964025023531351	0.683596296637381	Inf	0.969098211972014	1.62315538194444	0.0277612335002028	1.81567697278324	0.665278107210626	0.971581357613696	0.629432793929436	0.843831456743272	754	721
TCGA-17-Z026-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	2468	13	18	36	54	2377	97457	86	38	28	152	25474	86	51	21	158	25932	255	383	385	1023	22961	275	359	410	1044	23090	181	59	242	482	3828	0.195299837925446	0.461685823754789	0.165786054569078	2.78482906752824	0.125914315569488	168	77	198	443	3804	0.179497568881686	0.433040078201369	0.165672226819389	2.61383628695626	0.116456361724501	0.31969205834684	789	536	7632	38419	1.63698101982414e-261	7.40796959439425	6.73294289242708	Inf	3.59303815118073	3.97328997072901	1.00997597720159e-138	9.70539531875974	3.33953693814854	4.30318130744823e-133	6.23890838269073	2.29148702432224e-05	1679	1588
TCGA-17-Z027-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	153	0	13	29	42	111	4551	6	14	5	25	1172	2	9	7	18	1124	6	14	12	32	1166	6	11	19	36	1089	1	0	3	4	152	0.0261437908496732	0.111111111111111	0.139577594123049	0.796052631578947	0.0263157894736842	0	0	3	3	159	0.0196078431372549	0.09375	0.136363636363636	0.6875	0.0188679245283019	0.0457516339869281	7	36	311	1944	0.38450184677212	1.21531008346212	0.531694522514508	Inf	1.18036341882898	0.604233654876742	0.831609467463903	0.568371323738687	1.40338139197179	0.252754561456626	1.49988233534876	0.0291375291375292	146	104
TCGA-17-Z028-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	1227	5	3	24	27	1169	47929	50	55	14	119	12431	62	54	13	129	12378	72	264	114	450	11615	72	251	148	471	11505	24	38	35	97	1632	0.0790546047269764	0.205944798301486	0.141851368970013	1.4518351130261	0.0594362745098039	34	37	24	95	1689	0.0774246128769356	0.211111111111111	0.145415411106328	1.45177948819157	0.0562462995855536	0.0953545232273839	117	289	3321	19799	9.02055481098934e-14	2.41343431924408	1.99464677219498	Inf	2.00622104743215	2.80404162066312	3.53756777783655e-14	4.02057646997064	1.56772424382429	0.000288423676739606	1.73267517694843	1	1110	1052
TCGA-17-Z030-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	1384	6	12	35	47	1318	54038	85	39	17	141	13750	85	49	15	149	14103	71	300	121	492	12922	56	358	122	536	13263	8	43	20	71	1915	0.0513005780346821	0.132462686567164	0.144386639523486	0.917416507540626	0.0370757180156658	13	44	24	81	1907	0.0585260115606936	0.164634146341463	0.147577774338338	1.11557547929963	0.0424750917671736	0.0469653179190751	65	305	3822	22363	0.0653754677362248	1.24693581567288	0.980841739454773	Inf	1.2035760250046	1.13286319979233	0.303799442359758	1.15915307902768	1.24053293365463	0.0763521945535015	1.29370106395914	0.00193859303311214	1319	1253
TCGA-17-Z031-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	6933	25	109	251	360	6432	263712	387	334	237	958	67276	382	327	239	948	68099	290	1486	508	2284	64292	329	1408	505	2242	64045	84	199	83	366	9339	0.0527909995672869	0.163247100802855	0.145819345772504	1.11951606927067	0.0391904914873113	69	205	74	348	9213	0.0501947209000433	0.152364273204904	0.143299321844086	1.06325885736347	0.0377727124715077	0.0447136881580845	310	1322	18552	109785	3.59857445004918e-07	1.38765158328161	1.24636634468981	Inf	1.3140221523603	1.70986541954118	1.41738834662047e-11	1.94302128316704	1.07213964260219	0.184792026725051	1.08539427020105	0.847322091737693	6623	6122
TCGA-17-Z032-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	919	5	12	18	30	874	35834	30	58	18	106	9613	45	73	15	133	9631	59	158	109	326	8392	42	149	118	309	8198	15	20	23	58	1312	0.0631120783460283	0.187702265372168	0.16003903391071	1.17285302707396	0.0442073170731707	31	28	21	80	1304	0.0870511425462459	0.245398773006135	0.155386081982841	1.57928412811924	0.0613496932515337	0.0979325353645267	90	238	2616	13974	7.77597338124314e-08	2.01993680056591	1.62649723298573	Inf	1.74011244126203	2.8883186483786	2.1246998531541e-12	4.46720439168477	1.22923655175201	0.0846770454929575	1.28433190282273	0.897877795231569	829	784
TCGA-17-Z033-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	418	2	15	14	29	380	15580	11	11	5	27	3895	17	21	6	44	4032	30	73	63	166	3813	24	59	60	143	3840	15	12	20	47	601	0.11244019138756	0.328671328671329	0.156510416666667	2.09999650931431	0.0782029950083195	15	9	18	42	577	0.100478468899522	0.253012048192771	0.151324416469971	1.67198429767597	0.072790294627383	0.162679425837321	68	109	1178	6475	2.09921479360417e-13	3.42832137420257	2.607437698314	Inf	2.49587062242813	3.6092246745897	1.56766188238142e-11	6.86803029458614	2.00708103855232	1.44737476769089e-05	2.4569015703796	0.280181014468084	350	312
TCGA-17-Z035-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	124	2	6	12	18	104	4264	4	6	3	13	1138	4	7	6	17	1101	6	10	24	40	1020	6	5	23	34	1005	1	1	2	4	144	0.032258064516129	0.117647058823529	0.143283582089552	0.821078431372549	0.0277777777777778	4	4	5	13	165	0.104838709677419	0.325	0.161764705882353	2.00909090909091	0.0787878787878788	0.0967741935483871	12	47	309	1716	0.186038136016482	1.41762105678684	0.761822177996302	Inf	1.33289452032253	2.73058252427184	0.0262990484155067	3.96283256510694	0.976038008675893	0.591042352992216	0.971854546860125	0.720681594686528	112	92
TCGA-17-Z036-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	220	1	1	3	4	213	8733	14	19	5	38	2242	8	16	5	29	2345	9	31	29	69	2091	12	36	29	77	2055	3	7	10	20	313	0.0909090909090909	0.25974025974026	0.152311435523114	1.70532343056305	0.0638977635782748	3	7	4	14	303	0.0636363636363636	0.202898550724638	0.144906743185079	1.40020088965418	0.0462046204620462	0.0909090909090909	20	59	616	3530	0.0111682493678056	1.94226546152675	1.20345466714284	Inf	1.70392898241	1.92300556586271	0.0806456469711485	2.29161407482699	1.62460815047022	0.0435279613137615	1.82302904276055	0.0610356763159465	200	193
TCGA-17-Z037-01A-01W-0746-08	0	1	0	1	324	1	4	15	19	303	12423	10	20	6	36	3295	16	14	18	48	3181	12	22	69	103	3007	20	17	79	116	2940	8	5	6	19	427	0.058641975308642	0.163793103448276	0.145238095238095	1.12775579423403	0.0444964871194379	4	3	10	17	461	0.0524691358024691	0.16504854368932	0.153308945793149	1.07657477412969	0.0368763557483731	0.0864197530864197	28	152	888	5059	0.441150735963813	1.04946087528755	0.720791063743649	Inf	1.04176676676677	2.51140202702703	0.00153625510210596	3.41724309718645	0.724007791575359	0.939542748325154	0.690592726918582	0.468664307498008	296	275
TCGA-17-Z038-01A-01W-0746-08	0	1	4	5	64	2	2	2	4	58	2378	1	5	3	9	600	3	3	3	9	643	3	7	6	16	559	2	13	9	24	576	1	3	1	5	91	0.078125	0.208333333333333	0.157986111111111	1.31868131868132	0.0549450549450549	2	1	0	3	76	0.046875	0.1875	0.135957066189624	1.37911184210526	0.0394736842105263	0.0625	4	16	167	968	0.342424135241674	1.44857241224061	0.440204321615083	Inf	1.35928143712575	4.07784431137725	0.0258884941458216	8.66715907132962	0.453093812375249	0.907879060368071	0.414260000339857	0.569230769230769	60	54
TCGA-17-Z039-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	57	0	18	39	57	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	57	0
TCGA-17-Z040-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	515	3	79	132	211	300	12300	9	25	13	47	3185	8	12	12	32	3358	29	23	55	107	2790	26	32	56	114	2967	13	10	11	34	438	0.0660194174757282	0.298245614035088	0.147623862487361	2.02030761836097	0.0776255707762557	14	5	18	37	447	0.0718446601941748	0.345794392523364	0.160215053763441	2.15831399360221	0.0827740492170022	0.10873786407767	56	110	885	4872	6.93920200656386e-09	2.80207080638593	2.08899636884672	Inf	2.1944864202573	3.19340523882897	6.08936347923328e-09	5.30622905186467	1.69952664528936	0.00265087357617871	1.94674092207916	0.863760066168137	459	244
TCGA-17-Z041-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	580	1	91	120	211	366	15006	15	34	10	59	4093	11	34	9	54	4087	40	53	54	147	3450	19	50	37	106	3376	6	7	10	23	549	0.0396551724137931	0.216981132075472	0.162618483412322	1.33429563185208	0.0418943533697632	12	16	4	32	537	0.0551724137931034	0.217687074829932	0.155652173913043	1.39854824611409	0.0595903165735568	0.0551724137931034	32	118	1086	5740	0.050401299799538	1.43325737400325	0.999140645432213	Inf	1.34089625537139	1.91759528045697	0.00390580336823513	2.3200768448926	0.96699249185437	0.598751928520971	0.96099004066426	0.529223317330229	548	334
TCGA-17-Z042-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	1036	6	7	21	28	984	40344	50	38	12	100	10078	58	49	10	117	10497	47	248	94	389	9646	47	243	88	378	10123	10	33	13	56	1549	0.0540540540540541	0.148148148148148	0.153017880075077	0.968175405877149	0.0361523563589413	11	23	12	46	1391	0.0444015444015444	0.118251928020566	0.144204851752022	0.820027388703361	0.0330697340043134	0.0444015444015444	46	230	2940	16829	0.225059847636217	1.14478982579812	0.859296038282846	Inf	1.12069160997732	1.50220364741641	0.0348082874833231	1.64661807441323	0.923646931299993	0.696976455496885	0.911468353545394	0.615552294214648	990	938
TCGA-17-Z043-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	558	2	7	11	18	526	21566	34	34	12	80	5597	35	46	16	97	5783	40	87	51	178	5061	31	81	59	171	5125	14	13	18	45	797	0.0806451612903226	0.263157894736842	0.155512195121951	1.69220101697154	0.0564617314930991	18	15	12	45	785	0.0806451612903226	0.252808988764045	0.155107686228018	1.62989336577686	0.0573248407643312	0.111111111111111	62	119	1582	8604	6.61081712781745e-10	2.83332265107631	2.14836489653333	Inf	2.2055164802928	2.90194262922669	4.35275478138216e-09	4.46174020582665	1.75600505689001	0.00123364380648574	2.03937851214616	0.875442055316994	496	464
TCGA-17-Z044-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	410	0	7	17	24	382	15662	20	26	3	49	3926	23	36	4	63	4237	20	59	55	134	3806	25	71	40	136	3693	4	13	6	23	575	0.0560975609756098	0.169117647058824	0.155699972921744	1.08617647058824	0.04	7	10	5	22	549	0.0536585365853659	0.164179104477612	0.144245927482922	1.13818883723459	0.0400728597449909	0.0536585365853659	22	118	1124	6375	0.442251057011691	1.0574408455737	0.690018660705986	Inf	1.04841128622267	1.63086200079083	0.0657236957480299	1.8347796285112	0.77251357932197	0.859541986315486	0.742750769701747	1	388	360
TCGA-17-Z045-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	1496	10	18	35	53	1416	58056	78	75	20	173	15023	83	69	23	175	15246	77	329	108	514	13655	104	339	111	554	14132	21	46	21	88	2125	0.0588235294117647	0.15884476534296	0.150367959241438	1.05637375238904	0.0414117647058824	13	38	18	69	2004	0.0461229946524064	0.134241245136187	0.146759428780666	0.914702695775764	0.0344311377245509	0.0487967914438503	73	327	4129	23658	0.0370173043264641	1.27909793328515	1.01963817179219	Inf	1.22817328651005	1.26414566688388	0.0875945780519888	1.32522422353371	1.19844268903214	0.13107944979542	1.24141444469068	0.59326461677021	1423	1343
TCGA-17-Z046-01A-01W-0746-08	0	2	0	2	1254	7	11	25	36	1195	48995	66	65	18	149	12758	61	58	15	134	12757	52	294	123	469	11780	50	251	142	443	11700	8	27	25	60	1653	0.0478468899521531	0.135440180586907	0.141282051282051	0.958651005969036	0.0362976406533575	11	43	23	77	1709	0.0614035087719298	0.164179104477612	0.145076400679117	1.13167340593696	0.0450555880631949	0.0534290271132376	67	300	3362	20118	0.0222718651383319	1.33639303162191	1.05391093888725	Inf	1.27499687969565	1.30092965205118	0.13716832885183	1.36979412009964	1.26501520882673	0.0513578669093535	1.32361712837614	6.88406696321993e-05	1187	1128
TCGA-17-Z047-01A-01W-0747-08	0	1	1	2	85	0	12	5	17	67	2747	3	5	4	12	719	2	6	4	12	717	5	2	16	23	656	5	2	13	20	655	2	0	1	3	91	0.0352941176470588	0.15	0.138931297709924	1.07967032967033	0.032967032967033	3	1	5	9	101	0.105882352941176	0.391304347826087	0.153963414634146	2.5415411106328	0.0891089108910891	0.129411764705882	11	28	192	1119	0.0236029543325369	2.28781397904189	1.1491900446126	Inf	1.92588141025641	3.4140625	0.00935126463164696	5.81579403839982	1.41271551724138	0.248939876396895	1.51983147518585	1	74	56
TCGA-17-Z048-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	137	0	17	6	23	114	4674	5	11	4	20	1199	1	9	8	18	1246	8	6	25	39	1161	7	12	18	37	1068	3	2	0	5	138	0.0364963503649635	0.135135135135135	0.129213483146067	1.04582843713278	0.036231884057971	3	0	6	9	163	0.0656934306569343	0.230769230769231	0.140396210163652	1.64369985842378	0.0552147239263804	0.0875912408759124	12	46	301	1928	0.0887657485203554	1.67050190444982	0.896550477773934	Inf	1.53213426509337	2.96212624584718	0.0105678911215667	4.2662619389631	1.0332998532025	0.534319583835766	1.03868874429424	1	125	102
TCGA-17-Z049-01A-01W-0746-08	0	1	0	1	1262	4	8	25	33	1208	49528	60	58	12	130	12510	79	58	17	154	12194	59	310	100	469	12699	72	252	131	455	12125	26	27	24	77	1596	0.0610142630744849	0.169230769230769	0.131628865979381	1.28566608829767	0.0482456140350877	17	39	28	84	1744	0.0665610142630745	0.17910447761194	0.137333648318765	1.30415582637272	0.0481651376146789	0.0752773375594295	95	267	3340	21484	1.15151841995276e-10	2.28855989336955	1.85803036904523	Inf	1.95047474112548	2.43962152031814	1.27939916054244e-08	3.14287290885153	1.67307981439718	0.000130277298254099	1.86849822355799	0.328307828277444	1167	1113
TCGA-17-Z050-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	442	1	7	8	15	422	17302	21	30	12	63	4569	24	30	15	69	4678	28	59	61	148	4007	25	58	59	142	4048	11	8	12	31	636	0.0701357466063348	0.21830985915493	0.157114624505929	1.38949419789175	0.0487421383647799	18	14	12	44	622	0.0995475113122172	0.297297297297297	0.155228350386823	1.91522551490397	0.0707395498392283	0.119909502262443	53	120	1258	6797	7.76582670712008e-07	2.38609486164322	1.77906876589685	Inf	1.96161904849426	3.50353961064283	7.87753420486276e-11	6.52629065454469	1.28060413354531	0.119960269612642	1.35069870103906	0.494639666845577	389	369
TCGA-17-Z051-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	425	2	5	8	13	407	16687	20	26	8	54	4369	16	34	8	58	4344	25	70	51	146	4061	29	73	47	149	3913	4	7	12	23	584	0.0541176470588235	0.154362416107383	0.149246102734475	1.0342810517606	0.0393835616438356	8	8	11	27	603	0.0635294117647059	0.184931506849315	0.148485594681113	1.24545082805152	0.0447761194029851	0.0823529411764706	35	117	1187	6787	0.00553887407493675	1.71030763030524	1.20866832504503	Inf	1.54685629406287	1.49283909014322	0.0981863024711327	1.63352614514456	1.57662087581452	0.0169091275959143	1.75330169026528	0.0352997806006067	390	372
TCGA-17-Z052-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	319	1	0	4	4	310	12710	12	19	5	36	3332	12	20	3	35	3090	15	60	34	109	3048	24	79	27	130	3240	4	12	4	20	419	0.0626959247648903	0.153846153846154	0.129320987654321	1.18964567651918	0.0477326968973747	5	5	3	13	456	0.0407523510971787	0.119266055045872	0.149606299212598	0.797199420569773	0.0285087719298246	0.0501567398119122	16	84	875	5413	0.31624897011585	1.1782880698639	0.707411253452403	Inf	1.14980571428571	1.65837362637363	0.0846514266101816	1.85562868595394	0.824655737704918	0.76215589137816	0.801951991520581	0.774649126350741	303	294
TCGA-17-Z053-01A-01W-0747-08	0	1	0	1	670	2	5	20	25	637	26117	31	44	11	86	6910	28	50	7	85	6972	49	89	86	224	6041	38	101	103	242	6194	7	15	25	47	941	0.0701492537313433	0.194214876033058	0.15192121407814	1.27839207454704	0.0499468650371945	17	14	19	50	915	0.0746268656716418	0.223214285714286	0.151464989240192	1.47370218579235	0.0546448087431694	0.101492537313433	68	208	1856	10379	3.45639333953189e-05	1.82807320382197	1.42829543655584	Inf	1.62414886306847	1.81851961950059	0.0021952407910252	2.13018833737949	1.53467661010764	0.00234488105609177	1.69683342567353	0.004084725079844	602	569
TCGA-17-Z054-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	36	0	5	0	5	31	1271	2	4	0	6	300	0	2	0	2	358	1	1	9	11	328	3	3	6	12	285	0	0	2	2	46	0.0555555555555556	0.166666666666667	0.16140350877193	1.03260869565217	0.0434782608695652	1	0	0	1	36	0.0277777777777778	0.0909090909090909	0.109756097560976	0.828282828282828	0.0277777777777778	0.0833333333333333	3	16	82	531	0.482205359295297	1.21376365171237	0.295230469618075	Inf	1.1803594351733	1.86890243902439	0.439771425444985	2.15504998787734	0.996747967479675	0.618262999791054	0.996253567061822	1	33	28
TCGA-17-Z055-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	1756	4	5	23	28	1695	69495	115	89	24	228	17578	104	93	32	229	18111	99	327	157	583	16777	105	388	162	655	17029	24	43	22	89	2407	0.0506833712984055	0.13587786259542	0.141347113747137	0.961306241020941	0.0369754881595347	28	32	17	77	2384	0.0438496583143508	0.132075471698113	0.142099302616678	0.929458971761428	0.0322986577181208	0.0518223234624146	91	432	4791	29015	0.0231368553804233	1.27570523986368	1.04339837964129	Inf	1.22774258458638	1.79862569114475	1.53139175142808e-05	2.07181263723223	0.862663732743408	0.85924860485507	0.843540694476115	0.139586783093289	1665	1604
TCGA-17-Z056-01A-01W-0747-08	0	2	1	3	1039	9	6	11	17	1004	41164	64	38	14	116	10671	58	37	14	109	10931	88	167	126	381	9734	71	181	146	398	9828	32	25	57	114	1541	0.109720885466795	0.28643216080402	0.156796906796907	1.82677175625043	0.0739779364049319	35	24	45	104	1500	0.10009624639076	0.272965879265092	0.154099034312718	1.7713665791776	0.0693333333333333	0.162656400384986	169	262	3041	16521	1.29017500561814e-31	3.50403140385983	2.95279645584101	Inf	2.52235534317918	2.71065666499145	1.5000634395316e-15	3.95611276957262	2.41228214403157	2.37184410149248e-18	3.25938176933184	0.000807820885683582	870	835
TCGA-17-Z057-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	946	1	17	20	37	898	36818	29	47	11	87	9596	23	43	14	80	9877	120	77	148	345	8538	144	90	152	386	8807	101	21	69	191	1431	0.201902748414376	0.494818652849741	0.162484387419098	3.04533045118635	0.133473095737247	87	16	68	171	1327	0.180761099365751	0.495652173913044	0.155422815647693	3.18905671504866	0.128862094951017	0.343551797040169	325	239	2758	14587	8.69014664268771e-108	7.19090588480979	6.20344432180337	Inf	3.62396754251976	4.47851429450414	4.90317962170242e-87	13.0799401380327	2.87196640077351	4.62825580561205e-33	4.44492039619309	0.000182645085058484	621	573
TCGA-17-Z058-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	302	1	7	14	21	276	11316	15	23	6	44	2990	18	22	4	44	2952	10	47	35	92	2646	12	45	39	96	2728	4	7	8	19	382	0.0629139072847682	0.197916666666667	0.140029325513196	1.41339441535777	0.049738219895288	2	2	6	10	392	0.033112582781457	0.108695652173913	0.148148148148148	0.733695652173913	0.0255102040816327	0.0662251655629139	20	76	774	4600	0.0567974459196728	1.56383455935033	0.982741452467404	Inf	1.44649009474591	1.89358703312192	0.0863137987424535	2.22825484157662	1.31356938333683	0.174306270779919	1.38663992909854	0.0518267291519976	282	256
TCGA-17-Z059-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	349	0	4	10	14	329	13489	18	11	5	34	3386	17	15	4	36	3533	32	65	39	136	3279	20	55	48	123	3291	6	10	15	31	480	0.0888252148997135	0.252032520325203	0.145852324521422	1.72799796747967	0.0645833333333333	17	5	13	35	505	0.100286532951289	0.257352941176471	0.154010369014944	1.67101048340128	0.0693069306930693	0.146131805157593	51	88	985	5585	4.74550339993182e-10	3.28523695226896	2.40028680916537	Inf	2.44728481174451	2.95021475985943	5.15738336975517e-07	4.49564061317048	2.14668300367583	5.12136468145472e-05	2.69018751258221	0.474780981820481	298	278
TCGA-17-Z060-01A-01W-0747-08	0	1	0	1	526	5	10	11	21	494	20254	29	19	7	55	5131	24	23	15	62	5198	26	112	57	195	4866	21	100	61	182	5059	3	10	11	24	710	0.0456273764258555	0.131868131868132	0.140343941490413	0.939606872001238	0.0338028169014084	4	18	12	34	690	0.064638783269962	0.174358974358974	0.141800246609125	1.22960981047938	0.0492753623188406	0.0570342205323194	30	135	1400	8525	0.0874269685720808	1.35312743298817	0.938928847175823	Inf	1.28896103896104	1.05585106382979	0.501734460641846	1.06563447404686	1.38180992736077	0.0667597218733141	1.47417877714524	0.00123306560542436	496	464
TCGA-17-Z061-01A-01W-0747-08	0	0	1	1	449	0	3	27	30	412	16892	21	43	11	75	4604	29	38	10	77	4485	27	62	48	137	3914	21	50	52	123	3889	4	7	7	18	571	0.0400890868596882	0.146341463414634	0.146824376446387	0.99671094784503	0.031523642732049	10	7	11	28	616	0.0623608017817372	0.204379562043796	0.157383750638733	1.29860650298607	0.0454545454545455	0.0712694877505568	32	116	1187	6616	0.0248651656982285	1.53747716944594	1.07163783898886	Inf	1.42134383751907	1.91733361415333	0.0105002260069801	2.29474501665196	1.18326874473463	0.257981493128529	1.22344638578463	0.511727811186231	417	380
TCGA-17-Z062-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	1015	5	2	35	37	955	39155	58	38	14	110	9900	52	50	7	109	10251	43	236	72	351	9468	47	252	86	385	9536	13	28	16	57	1396	0.0561576354679803	0.148051948051948	0.146392617449664	1.01133479700815	0.0408309455587393	11	34	10	55	1376	0.0541871921182266	0.156695156695157	0.145331643430503	1.07819022063208	0.0399709302325581	0.0492610837438424	50	198	2772	16232	0.0108984868342325	1.47867385480243	1.11715515256959	Inf	1.38219755155239	1.82818662818663	0.00208309914330495	2.12925359146902	1.12815314081137	0.28512019502742	1.15335891835711	0.872651499446626	965	905
TCGA-35-3615-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	214	1	3	9	12	200	8200	10	10	1	21	2065	7	8	2	17	2046	12	30	33	75	2081	16	33	38	87	2008	9	5	15	29	267	0.135514018691589	0.333333333333333	0.13296812749004	2.50686641697878	0.108614232209738	7	8	10	25	279	0.116822429906542	0.333333333333333	0.134070158577607	2.48626045400239	0.0896057347670251	0.191588785046729	41	58	546	3543	1.17632477688691e-11	4.58467703807568	3.17237002231973	Inf	3.1015096015096	4.27943485086342	7.38300133587095e-08	8.64311628332016	2.63697570035598	3.35712843300634e-06	3.52514765891792	0.112175324104726	173	159
TCGA-35-4122-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	773	2	4	16	20	733	30053	26	78	18	122	7716	28	69	11	108	8028	57	106	74	237	7152	56	120	90	266	7157	21	23	18	62	1062	0.0802069857697283	0.233082706766917	0.14838619533324	1.57078430539626	0.0583804143126177	31	17	15	63	1133	0.0815006468305304	0.265822784810127	0.158417225950783	1.67799166545633	0.0556045895851721	0.109961190168176	85	192	2195	12114	1.70830821528164e-10	2.44306036538167	1.94394440641791	Inf	2.00038650362244	2.99985082750418	1.70377251781326e-14	4.70407926120722	1.31173120728929	0.0609045029549891	1.39022125507692	0.0160037301011006	688	648
TCGA-35-4123-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	736	2	5	9	14	705	28905	38	34	14	86	7098	34	29	7	70	7212	43	157	71	271	7321	36	176	66	278	7274	7	29	7	43	1019	0.0584239130434783	0.154676258992806	0.140087984602695	1.10413651414492	0.042198233562316	10	23	7	40	970	0.0543478260869565	0.14760147601476	0.132495560715749	1.11401072773614	0.0412371134020619	0.0421195652173913	31	185	1989	12606	0.408937577402874	1.06203001115315	0.748115814526809	Inf	1.05311854086364	1.57903278156443	0.0363358675295199	1.73771662324809	0.749854124693111	0.904545085451998	0.721397029028086	0.690868679162786	705	674
TCGA-35-5375-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	933	1	11	19	30	880	36080	49	41	23	113	9412	53	66	28	147	9482	62	153	105	320	8636	72	128	100	300	8550	23	17	20	60	1258	0.0643086816720257	0.2	0.147134502923977	1.35930047694754	0.0476947535771065	20	22	15	57	1281	0.0610932475884244	0.178125	0.148332561371005	1.20084894613583	0.0444964871194379	0.0836012861736334	78	261	2539	14647	4.59750935334316e-05	1.72394373314233	1.37430206964588	Inf	1.55742453129411	2.17207973523481	4.00829944864326e-07	2.72591743785338	1.15564991018165	0.203180419613355	1.18766176009071	0.331708376448022	855	802
TCGA-38-4625-01A-01D-1553-08	0	1	0	1	1440	2	9	27	36	1376	56416	58	47	15	120	14736	65	39	11	115	14380	122	318	146	586	13631	84	300	171	555	13669	38	39	50	127	1963	0.0881944444444445	0.228828828828829	0.143609627624552	1.59340869142194	0.064696892511462	70	40	55	165	2021	0.114583333333333	0.281569965870307	0.148264984227129	1.89909955704016	0.0816427511133102	0.147916666666667	213	310	3984	23316	1.20061904060998e-46	4.02104357708126	3.44858727063435	Inf	2.79075191780506	3.59252544157211	1.33887792921615e-36	6.44889741690469	2.26972559005739	1.65760726448902e-16	2.89844470456404	0.863515032084781	1227	1163
TCGA-38-4626-01A-01D-1553-08	0	0	0	0	693	1	8	13	21	662	27142	27	22	11	60	6968	38	23	11	72	7208	34	184	53	271	6462	29	183	47	259	6504	9	25	10	44	952	0.0634920634920635	0.16988416988417	0.146371463714637	1.16063722786412	0.046218487394958	12	30	6	48	981	0.0692640692640693	0.177121771217712	0.151810584958217	1.1667287315075	0.0489296636085627	0.0533910533910534	37	126	1933	11033	0.00563564835527488	1.67598997331563	1.19917631785877	Inf	1.52260861561704	2.23590274185204	0.000213103351019601	2.85353723046737	1.07323331608898	0.422323019341144	1.08719941089507	0.462239688348873	656	625
TCGA-38-4627-01A-01D-1553-08	0	0	0	0	103	0	2	5	7	95	3895	3	5	1	9	1002	4	4	2	10	932	1	9	25	35	958	3	24	14	41	1003	2	1	3	6	131	0.058252427184466	0.146341463414634	0.130608175473579	1.12046173896853	0.0458015267175573	1	2	1	4	141	0.0388349514563107	0.114285714285714	0.147181628392484	0.776494427558257	0.0283687943262411	0.0679611650485437	7	36	272	1689	0.390770027201271	1.20727709045642	0.527569710401045	Inf	1.17364911080711	5.40716911764706	0.00973198486719878	18.5801971569671	0.739441930618401	0.808099719608439	0.709772563394126	1	96	88
TCGA-38-4628-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	319	0	2	12	14	303	12423	10	13	12	35	3109	8	14	13	35	3096	16	40	57	113	3148	21	48	51	120	3070	10	12	12	34	399	0.106583072100313	0.283333333333333	0.129967426710098	2.18003341687552	0.0852130325814536	4	10	12	26	419	0.0815047021943574	0.230088495575221	0.133100381194409	1.72868397152935	0.0620525059665871	0.119122257053292	38	107	818	5400	2.57979101335726e-05	2.34403127801086	1.66664117031608	Inf	1.99210859118118	2.87623075398137	0.000152746648073407	4.01733646593432	1.6892148872589	0.00702187537087838	1.88581242131691	0.0766688473938544	281	265
TCGA-38-4629-01A-02D-1265-08	0	1	0	1	662	1	7	24	31	623	25543	28	20	10	58	6348	41	33	15	89	6511	41	112	86	239	6145	37	105	95	237	6539	10	20	26	56	949	0.0845921450151057	0.236286919831224	0.145129224652087	1.62811398185076	0.0590094836670179	13	24	19	56	891	0.0845921450151057	0.234309623430962	0.144995931651749	1.61597377775899	0.0628507295173962	0.102719033232628	68	191	1840	10844	7.82468206390141e-07	2.09806970992799	1.63501802891005	Inf	1.80987074030552	2.03269230769231	0.000544851135473323	2.46441867537527	1.71384818640404	0.00018905109728116	1.9500114679579	0.00215191398653387	594	555
TCGA-38-4630-01A-01D-1265-08	0	1	1	2	315	1	6	11	17	296	12136	9	7	6	22	3099	7	7	7	21	3135	29	21	55	105	2849	38	34	76	148	3053	25	11	31	67	467	0.212698412698413	0.452702702702703	0.152964297412381	2.95953180160889	0.143468950749465	17	8	20	45	397	0.142857142857143	0.428571428571429	0.139347139347139	3.07556675062972	0.113350125944584	0.295238095238095	93	105	864	5038	4.27790864355742e-26	5.16258956162004	4.00833222085251	Inf	3.20850869809203	4.28213101160862	6.45059919640223e-19	9.78977807060054	2.65940415606446	1.80203644935306e-11	3.71615636527784	0.277995526195647	222	203
TCGA-38-4631-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	1727	9	8	38	46	1642	67322	104	57	24	185	16802	93	57	20	170	16935	101	431	142	674	16597	87	383	143	613	16988	11	43	18	72	2258	0.04169079328315	0.117455138662316	0.132917353425948	0.883670458633938	0.0318866253321523	25	53	23	101	2277	0.0584829183555298	0.149851632047478	0.137193468699162	1.09226505801141	0.0443566095740009	0.0445859872611465	77	396	4535	29050	0.048656198138529	1.24554289405462	1.00174132934197	Inf	1.20558447219302	1.41811912078632	0.0191379219578326	1.51711999522056	1.06538617768235	0.357419286041156	1.07639255699358	0.605351355892205	1650	1565
TCGA-38-4632-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	1122	8	8	24	32	1061	43501	58	73	17	148	10993	82	58	19	159	10977	46	207	137	390	10807	48	235	81	364	10724	14	30	12	56	1490	0.0499108734402852	0.153846153846154	0.138940693770981	1.10727929788332	0.0375838926174497	11	26	17	54	1481	0.0481283422459893	0.138461538461538	0.137040806884427	1.01036721549888	0.0364618501012829	0.0481283422459893	54	258	2971	18560	0.0477735259666709	1.30750389072261	1.00352062628141	Inf	1.25429795717578	1.92740820842613	0.000798968188612631	2.26331404140108	0.964057757095347	0.613529484996949	0.958539907359464	0.638617524887616	1068	1007
TCGA-38-6178-01A-11D-1753-08	0	2	2	4	174	1	0	4	4	169	6929	7	7	6	20	1713	1	10	7	18	1912	15	20	36	71	1659	12	19	29	60	1645	4	4	7	15	266	0.0862068965517241	0.25	0.161702127659574	1.54605263157895	0.056390977443609	3	4	11	18	238	0.103448275862069	0.253521126760563	0.143459915611814	1.76719138359569	0.0756302521008403	0.14367816091954	25	67	504	2800	0.00272865703520092	2.07244238171527	1.34634512540919	Inf	1.78140096618357	1.69958847736626	0.10730764203005	1.9440665172439	1.81538461538462	0.00792617488333049	2.12707498220016	0.0104652634270756	149	144
TCGA-44-2655-01A-01D-1553-08	0	0	1	1	439	2	4	8	12	417	17097	19	15	8	42	4343	21	12	2	35	4407	20	98	39	157	4131	20	122	41	183	4216	7	14	6	27	572	0.061503416856492	0.147540983606557	0.135673624288425	1.08746990714204	0.0472027972027972	6	17	10	33	592	0.0751708428246014	0.210191082802548	0.143306705398209	1.46672189705629	0.0557432432432432	0.0660592255125285	29	91	1164	7183	0.00207377632983981	1.96644891401236	1.3362447148623	Inf	1.73298253150057	2.33056271477663	0.00232158025271056	2.97065958845225	1.43419243986254	0.086377650160602	1.54264317466203	0.67022909761254	410	388
TCGA-44-2656-01A-02D-0969-08	0	0	0	0	1897	7	17	57	74	1792	73472	95	49	14	158	18120	99	74	10	183	18254	79	427	161	667	18468	98	502	184	784	18630	7	64	31	102	2440	0.0537691091196626	0.130102040816327	0.130971551261406	0.993361073937772	0.0418032786885246	19	49	22	90	2437	0.0474433315761729	0.134932533733133	0.131957981373186	1.02254166310361	0.0369306524415265	0.0416447021613073	79	443	4877	32221	0.103854626918448	1.1781532973244	0.951711630538112	Inf	1.15120940657414	1.11737209940815	0.303352348045971	1.13755209284565	1.16856941633756	0.129813169763032	1.19915006947016	0.00095024265862649	1818	1713
TCGA-44-2657-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	996	3	6	20	26	946	38786	47	37	13	97	9611	46	39	6	91	9755	65	217	102	384	9650	50	221	103	374	9770	13	26	22	61	1374	0.0612449799196787	0.163101604278075	0.140634595701126	1.15975449330189	0.0443959243085881	17	34	14	65	1216	0.0652610441767068	0.169270833333333	0.126010362694301	1.34330883360746	0.0534539473684211	0.0662650602409639	66	254	2590	16830	0.000227831969386238	1.6884161328903	1.32370730888554	Inf	1.54647683397683	1.95601812993117	0.000205328353571102	2.29330738268892	1.31673415575855	0.0518942183547252	1.38417514504504	0.47392388385727	930	880
TCGA-44-2659-01A-01D-0969-08	0	0	0	0	902	4	11	39	50	827	33907	44	24	7	75	8658	52	31	3	86	8690	37	224	73	334	8245	46	214	72	332	8314	8	23	17	48	1189	0.0532150776053215	0.144578313253012	0.143011787346644	1.01095382370525	0.0403700588730025	5	35	10	50	1173	0.0554323725055432	0.149700598802395	0.142268041237113	1.05224333940814	0.0426257459505541	0.0443458980044346	40	188	2362	14197	0.0975035606113353	1.27882623199699	0.937029079620481	Inf	1.22992706151492	1.09804331636453	0.404579006367152	1.11620671507202	1.30541913632515	0.0881415209276195	1.37527121821377	0.020465344528566	862	787
TCGA-44-2661-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	138	1	5	8	13	124	5084	1	6	2	9	1147	3	13	3	19	1243	11	16	24	51	1351	6	18	21	45	1343	1	2	1	4	181	0.0289855072463768	0.0888888888888889	0.134772896500372	0.659545733578883	0.0220994475138122	3	4	4	11	155	0.0797101449275362	0.215686274509804	0.114729829755736	1.87994939911448	0.0709677419354839	0.0652173913043478	9	53	336	2358	0.371033318007778	1.19161916038419	0.587686009903102	Inf	1.16388248847926	1.88655462184874	0.155010871090869	2.15854152826081	0.890873015873016	0.676381238218997	0.877242906366309	1	129	115
TCGA-44-2662-01A-01D-0969-08	0	1	1	2	532	0	5	20	25	506	20746	10	15	4	29	5494	11	16	7	34	5449	75	45	105	225	4985	82	31	105	218	4818	59	9	66	134	782	0.25187969924812	0.614678899082569	0.16230801162308	3.78711372861869	0.171355498721228	62	11	63	136	839	0.255639097744361	0.604444444444444	0.168304914744233	3.5913653820686	0.162097735399285	0.469924812030075	250	117	1621	8182	1.97869721805313e-101	10.7793858370403	8.87501933831437	Inf	4.11955145930372	4.66081329052995	4.35101681542597e-61	16.9664787467408	3.71489380452983	6.7603407719949e-47	8.03494321591439	0.545802467475058	282	256
TCGA-44-2665-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	102	1	3	6	9	92	3772	2	14	5	21	939	2	6	2	10	897	8	3	19	30	902	4	6	21	31	1034	1	3	5	9	130	0.0882352941176471	0.290322580645161	0.125725338491296	2.30918114143921	0.0692307692307692	4	1	8	13	127	0.127450980392157	0.433333333333333	0.14079822616408	3.07769028871391	0.102362204724409	0.176470588235294	18	34	257	1679	0.000101093788488699	3.45560528504339	2.00051614098443	Inf	2.6076025142173	3.13878080415045	0.0150139940352681	4.66082911775348	2.44824902723735	0.00166085877053248	3.14295400031358	0.0305355360502663	84	74
TCGA-44-2666-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	88	0	2	0	2	86	3526	4	9	4	17	895	3	9	1	13	901	6	5	19	30	856	4	5	17	26	874	3	1	3	7	112	0.0795454545454545	0.269230769230769	0.128146453089245	2.10096153846154	0.0625	1	1	1	3	109	0.0340909090909091	0.1	0.127336448598131	0.785321100917431	0.0275229357798165	0.0909090909090909	8	38	221	1509	0.233777776627047	1.43714810865915	0.663847820826954	Inf	1.36140074759001	3.13122171945701	0.0303378694283706	4.54593405986159	0.869783810960282	0.692451121456009	0.853595431074905	1	80	78
TCGA-44-2668-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	807	3	5	20	25	772	31652	39	29	8	76	8198	51	30	12	93	8178	41	165	89	295	7523	71	151	86	308	7753	25	25	30	80	1173	0.0991325898389095	0.25974025974026	0.15129627241068	1.71676575768647	0.0682011935208866	21	26	32	79	1116	0.0978934324659232	0.267796610169492	0.148345075103017	1.80522750744183	0.0707885304659498	0.133828996282528	108	179	2289	12987	1.55764210855368e-20	3.42283737035202	2.76700854565402	Inf	2.51134116658523	2.74096611121513	2.918470303077e-11	3.95393987676966	2.36438120202209	2.72900692755731e-11	3.11266064019246	0.0754659536468923	699	664
TCGA-44-3396-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	384	2	3	8	11	369	15129	14	14	6	34	3929	9	16	5	30	3970	39	46	60	145	3556	55	35	70	160	3674	34	7	28	69	570	0.1796875	0.43125	0.155144256940664	2.77967105263158	0.121052631578947	23	8	27	58	502	0.151041666666667	0.4	0.141169853768279	2.83346613545817	0.115537848605578	0.291666666666667	112	112	1072	6158	1.0344332276466e-33	5.74235657513766	4.53640236673383	Inf	3.37220149253731	4.08969117180057	8.9645673683188e-24	8.84505506667633	2.85340126291619	8.17136007685859e-14	4.2115652077363	0.89946964891088	272	257
TCGA-44-3398-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	432	2	5	10	15	409	16769	17	11	7	35	4055	26	19	4	49	4320	40	57	55	152	4188	41	70	62	173	4206	23	11	21	55	663	0.127314814814815	0.317919075144509	0.157631954350927	2.01684408756833	0.0829562594268477	21	2	23	46	590	0.106481481481481	0.302631578947368	0.140878701050621	2.14817127564674	0.0779661016949153	0.203703703703704	88	110	1253	7141	1.60336640761932e-22	4.55830813940266	3.54325496401202	Inf	2.97738760308593	3.63902929266058	3.42721062825527e-16	6.77488168346791	2.51932797184194	2.20911368307778e-09	3.43438680385746	1	344	321
TCGA-44-3918-01A-01D-1105-08	0	0	1	1	2109	13	10	45	55	1989	81549	107	53	12	172	20011	93	65	15	173	20561	125	515	193	833	20617	130	501	180	811	20360	48	62	36	146	2808	0.0692271218587008	0.180024660912454	0.137917485265226	1.30530701430825	0.051994301994302	41	72	45	158	2791	0.0749170222854433	0.189675870348139	0.135373720715914	1.40112770296223	0.056610533858832	0.0806069227121859	170	458	5599	35378	1.5821920322134e-18	2.34521880803103	2.00876000366797	Inf	1.9811573495267	2.55434478846012	1.28591752198478e-17	3.38758434778388	1.58929998510841	1.62287271954213e-05	1.75273790573282	0.527102044051781	1939	1819
TCGA-44-3919-01A-02D-1105-08	0	0	1	1	84	0	3	6	9	75	3075	1	10	3	14	780	1	4	2	7	755	4	8	13	25	830	11	7	11	29	710	3	1	1	5	106	0.0595238095238095	0.172413793103448	0.149295774647887	1.15484710474951	0.0471698113207547	0	1	2	3	111	0.0357142857142857	0.12	0.133734939759036	0.897297297297297	0.027027027027027	0.0714285714285714	6	33	217	1323	0.479848683413681	1.10846278284654	0.44826740009694	Inf	1.09181141439206	1.41935483870968	0.358445666095334	1.52371156682046	0.887096774193548	0.677905370346759	0.871057841687909	1	78	69
TCGA-44-4112-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	1006	7	7	33	40	946	38786	68	36	10	114	9810	65	24	13	102	9802	55	227	88	370	9593	51	227	82	360	9581	20	23	13	56	1298	0.0556660039761431	0.155555555555556	0.135476463834673	1.14821092278719	0.0431432973805855	17	28	15	60	1332	0.0596421471172962	0.162162162162162	0.13885124569999	1.16788410031653	0.045045045045045	0.0646123260437376	65	211	2630	16544	9.03221393221983e-06	1.93784086022877	1.50955423465998	Inf	1.71696423651292	2.54479517899419	3.46820282477536e-08	3.37288095260118	1.20078729590696	0.175918086887961	1.24035687227042	0.242070657059696	941	881
TCGA-44-5643-01A-01D-1625-08	0	1	1	2	299	1	3	14	17	279	11439	7	15	7	29	2861	10	16	6	32	2889	21	38	54	113	2820	16	39	50	105	2869	8	4	12	24	394	0.0802675585284281	0.228571428571429	0.137330080167306	1.66439448875997	0.0609137055837563	10	6	11	27	409	0.0903010033444816	0.238938053097345	0.145035460992908	1.64744574507216	0.0660146699266504	0.137123745819398	41	100	803	4886	4.65734885581353e-06	2.49418752657351	1.7855730829112	Inf	2.06008496506893	3.44660226852008	6.56784906140293e-07	5.76162542613915	1.56680477057189	0.0190015850970494	1.72755028748425	0.419391938013124	258	238
TCGA-44-5645-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	95	0	3	4	7	88	3608	4	12	4	20	910	5	6	2	13	900	3	8	25	36	966	2	3	14	19	832	1	0	1	2	109	0.0210526315789474	0.105263157894737	0.131009615384615	0.803476581361661	0.018348623853211	1	1	1	3	125	0.0315789473684211	0.0833333333333333	0.129399585921325	0.644	0.024	0.0421052631578947	4	40	234	1564	0.840573786123901	0.668503574662706	0.216663497005784	Inf	0.698523698523699	3.07350427350427	0.130499656782775	4.45025561090743	0.394039009423625	0.969596535095452	0.361422315875579	1	91	84
TCGA-44-6144-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	512	3	2	5	7	494	20254	24	28	6	58	5117	19	24	11	54	5189	32	97	62	191	4996	29	110	52	191	4952	6	19	10	35	704	0.068359375	0.183246073298429	0.1421647819063	1.28896953831509	0.0497159090909091	8	11	15	34	727	0.06640625	0.178010471204188	0.145516413130504	1.22330167006345	0.046767537826685	0.076171875	39	136	1431	8517	0.00354495288049763	1.70664941078316	1.23224940456542	Inf	1.54925426774483	1.59549094408358	0.0493545374580744	1.7727453551527	1.5245135900548	0.0200188387591646	1.6717421034199	0.0579274670578625	473	455
TCGA-44-6145-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	649	3	2	20	22	612	25092	35	34	6	75	6329	30	22	7	59	6399	41	152	49	242	6123	27	159	50	236	6241	4	20	6	30	885	0.0462249614791988	0.127118644067797	0.141804198045185	0.896437805228383	0.0338983050847458	9	14	9	32	883	0.049306625577812	0.132231404958678	0.144210354401437	0.916934193161929	0.0362400906002265	0.0431432973805855	28	139	1768	10596	0.211176378028125	1.20723055960602	0.829389361836873	Inf	1.17251469910857	1.33693771626298	0.167819787751149	1.41652932146919	1.05957767722474	0.448052356730915	1.0702284361685	0.830252223160419	621	584
TCGA-44-6146-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	98	0	3	8	11	86	3526	4	6	1	11	882	3	7	1	11	866	7	4	23	34	877	0	14	16	30	901	0	5	1	6	122	0.0612244897959184	0.2	0.135405105438402	1.47704918032787	0.0491803278688525	1	2	1	4	102	0.0408163265306122	0.117647058823529	0.11630558722919	1.01153402537486	0.0392156862745098	0.0306122448979592	3	43	224	1554	0.939351303030262	0.484161123614563	0.126287435625016	Inf	0.517663043478261	1.13392857142857	0.61125412234348	1.15613432227985	0.407051282051282	0.964581457512693	0.375141023055903	1	95	83
TCGA-44-6147-01A-11D-1753-08	0	1	1	2	431	3	6	11	17	404	16564	28	17	7	52	4185	21	17	12	50	4353	22	74	54	150	4026	24	81	47	152	4000	11	7	9	27	595	0.0626450116009281	0.177631578947368	0.14875	1.19416187527643	0.0453781512605042	9	11	9	29	521	0.0672853828306264	0.193333333333333	0.129408842523597	1.49397312859885	0.0556621880998081	0.0881670533642691	38	109	1116	6910	0.000109352204951381	2.15834022412869	1.53836234560866	Inf	1.8590934581718	3.12685055321801	1.15138900820855e-06	4.7616315046096	1.2816991376557	0.161792795956558	1.34273441070688	0.841989200099773	393	366
TCGA-44-6148-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	26	0	1	1	2	24	984	2	2	2	6	262	1	4	0	5	261	1	2	2	5	229	0	4	4	8	232	0	0	0	0	31	0	0	0.133620689655172	0	0	0	0	0	0	36	0	0	0.157205240174672	0	0	0	0	7	67	394	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	26	24
TCGA-44-6774-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	794	2	5	14	19	758	31078	39	35	10	84	7838	43	32	6	81	7664	41	209	51	301	7699	27	211	54	292	7877	5	22	5	32	1021	0.0403022670025189	0.10958904109589	0.129617874825441	0.845477842029705	0.0313418217433888	10	19	6	35	1095	0.044080604534005	0.116279069767442	0.142226263151059	0.817563980036105	0.0319634703196347	0.0327455919395466	26	147	2116	13460	0.322536404088976	1.12504359354592	0.764386336104176	Inf	1.10628626375428	1.62376292672078	0.0379080080278878	1.80021418459252	0.771158520118823	0.859420136290254	0.744392234043355	0.512816255344969	768	732
TCGA-44-6775-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	258	0	6	6	12	246	10086	3	9	3	15	2448	4	16	6	26	2542	4	49	43	96	2522	7	65	37	109	2574	0	2	9	11	362	0.0426356589147287	0.100917431192661	0.140637140637141	0.717573115717979	0.0303867403314917	2	6	13	21	363	0.0813953488372093	0.21875	0.143933386201427	1.51980027548209	0.0578512396694215	0.0930232558139535	24	67	725	4371	0.00188986304987929	2.15922712933127	1.39643686786395	Inf	1.85379310344828	1.27799373040752	0.478329561272312	1.33968292731227	1.93296551724138	0.00159994001323962	2.28637346475938	2.62567471592132e-07	234	222
TCGA-44-6776-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	530	3	5	15	20	501	20541	20	26	4	50	5216	18	28	7	53	4999	21	131	54	206	5290	31	99	62	192	5036	7	9	9	25	697	0.0471698113207547	0.130208333333333	0.138403494837172	0.940787900526064	0.0358680057388809	2	18	5	25	723	0.0471698113207547	0.121359223300971	0.136672967863894	0.887953376572802	0.0345781466113416	0.0433962264150943	23	145	1420	8906	0.543608606482252	0.994842563175749	0.659417376926235	Inf	0.995548289738431	1.25858613217768	0.282818878118291	1.31266908217951	0.877634774162215	0.739100611982308	0.860867192201575	0.342057680012223	507	478
TCGA-44-6777-01A-11D-1855-08	0	1	0	1	1048	6	7	20	27	1004	41164	39	46	13	98	10119	53	34	17	104	10558	49	201	109	359	10156	84	244	115	443	10331	43	26	38	107	1498	0.102099236641221	0.241534988713318	0.145000483980254	1.66575298290874	0.0714285714285714	30	21	27	78	1382	0.0744274809160305	0.217270194986072	0.136077195746357	1.59666866879779	0.0564399421128799	0.131679389312977	138	219	2880	17607	7.5783339950755e-30	3.85216435625137	3.18922650649883	Inf	2.74977240896359	3.90442512531328	5.94307514596603e-28	7.43628851350463	2.06419735863095	6.77733046604142e-09	2.4990846938475	0.451800256150755	910	866
TCGA-44-6778-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	959	2	8	25	33	909	37269	41	42	15	98	9394	59	60	14	133	9304	47	214	89	350	9447	41	203	84	328	9124	4	25	16	45	1226	0.0469238790406674	0.13719512195122	0.134370889960544	1.02101818326503	0.0367047308319739	13	18	10	41	1283	0.0427528675703858	0.117142857142857	0.135810310151371	0.862547600489923	0.0319563522992985	0.0448383733055266	43	218	2509	16062	0.0992403883908472	1.26270703745378	0.937970439660398	Inf	1.21944600969078	1.42988423493605	0.0805716534123756	1.5327676274074	1.11240228817874	0.311970274854694	1.13224530747457	0.158471088850323	916	866
TCGA-44-6779-01A-11D-1855-08	0	0	1	1	336	2	18	41	59	272	11152	16	10	9	35	2737	9	15	7	31	2891	7	47	49	103	2686	10	51	42	103	2838	2	4	9	15	394	0.0446428571428571	0.145631067961165	0.138830162085976	1.04898723572027	0.0380710659898477	1	7	8	16	362	0.0476190476190476	0.155339805825243	0.134772896500372	1.15260419460387	0.0441988950276243	0.0595238095238095	20	88	756	4768	0.0995715930460527	1.4332741416632	0.906171092969459	Inf	1.35312561238487	1.28944911297852	0.417832748079706	1.3513895489197	1.36502122216408	0.114031026074344	1.4487647555438	0.000280750678537643	316	252
TCGA-49-4486-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	634	1	1	8	9	619	25379	7	16	5	28	6519	10	16	5	31	6446	102	64	86	252	6120	114	85	109	308	6294	88	5	52	145	983	0.228706624605678	0.470779220779221	0.156180489354941	3.01432799143888	0.147507629704985	79	9	41	129	976	0.203470031545741	0.511904761904762	0.159477124183007	3.20989461358314	0.132172131147541	0.410094637223975	260	151	1959	10455	1.08056807882397e-99	9.18733497008436	7.69079447583678	Inf	4.00874869123603	4.89936759117464	5.70437968508084e-87	18.1916705537296	3.02221698668866	6.15778707277426e-25	4.86525353201939	3.33351893597429e-10	374	359
TCGA-49-4487-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	894	4	2	17	19	854	35014	29	41	14	84	8548	38	27	17	82	8956	71	181	87	339	8820	68	197	84	349	8690	27	28	23	78	1232	0.087248322147651	0.223495702005731	0.141772151898734	1.57644289807614	0.0633116883116883	32	19	20	71	1231	0.0794183445190157	0.209439528023599	0.139569160997732	1.50061465245178	0.057676685621446	0.114093959731544	102	208	2463	15047	8.18667962979014e-17	2.99560872545812	2.42539275578364	Inf	2.3391615260697	3.01758106304238	5.37142484819784e-16	4.5052081340486	1.78769769192232	9.59937817501025e-05	2.05224369850616	0.0667902750539894	792	752
TCGA-49-4488-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	643	4	5	16	21	612	25092	35	29	10	74	6330	29	17	16	62	6267	36	145	61	242	6248	26	151	57	234	6247	5	23	11	39	853	0.0606531881804044	0.166666666666667	0.136545541860093	1.22059398202423	0.0457209847596717	13	17	17	47	877	0.073094867807154	0.194214876033058	0.140364916773367	1.38364258318648	0.0535917901938426	0.0715396578538103	46	134	1730	10765	2.61459917565462e-05	2.13594336152073	1.57581630406695	Inf	1.84576107899807	2.09686742494872	0.00148057227860709	2.54528297666695	1.71382384637994	0.00284002267844669	1.93587495101569	0.120525509369564	597	566
TCGA-49-4490-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	205	1	4	6	10	194	7954	1	15	0	16	1962	5	14	6	25	1988	13	28	34	75	1892	9	29	40	78	2112	5	2	7	14	279	0.0682926829268293	0.179487179487179	0.132102272727273	1.35869864902123	0.0501792114695341	8	1	10	19	256	0.0926829268292683	0.253333333333333	0.135306553911205	1.87229166666667	0.07421875	0.146341463414634	30	66	535	3469	6.52080570572758e-06	2.94623644775582	1.97115054054222	Inf	2.33878504672897	4.42242990654206	7.38342143395346e-07	9.35603697261093	1.71932306137914	0.0177398168141737	1.93355919553554	0.458647672059954	175	164
TCGA-49-4494-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	471	3	2	14	16	446	18286	28	18	1	47	4484	19	14	6	39	4511	22	96	58	176	4590	23	99	62	184	4701	6	11	8	25	626	0.0530785562632696	0.135869565217391	0.133163156775154	1.0203240033338	0.0399361022364217	9	9	9	27	615	0.0573248407643312	0.153409090909091	0.133986928104575	1.144955654102	0.0439024390243902	0.0679405520169851	32	133	1241	8050	0.0198394316299473	1.56061971871424	1.09321498216931	Inf	1.45196688887261	2.4955680902498	0.00052032474910189	3.24277403282593	1.06061643835616	0.438152381785037	1.07063220013264	0.831980703389964	439	414
TCGA-49-4501-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	184	0	5	5	10	174	7134	3	11	3	17	1832	4	15	2	21	1749	9	14	50	73	1756	5	24	34	63	1797	1	2	9	12	256	0.0652173913043478	0.19047619047619	0.142459654980523	1.33705357142857	0.046875	3	0	11	14	254	0.0760869565217391	0.191780821917808	0.144646924829157	1.32585481609319	0.0551181102362205	0.130434782608696	24	74	510	3043	0.0061119838299953	1.93479363609666	1.25443687454966	Inf	1.70612244897959	1.99047619047619	0.130795589400649	2.38587140675096	1.65873015873016	0.0154809676980941	1.86413073949303	1.69700778754334e-05	160	150
TCGA-49-4505-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	464	2	3	10	13	444	18204	19	21	8	48	4656	22	26	10	58	4761	23	99	45	167	4301	18	104	49	171	4486	5	16	12	33	643	0.0711206896551724	0.192982456140351	0.143334819438252	1.3463752694333	0.0513219284603421	4	16	13	33	613	0.0711206896551724	0.197604790419162	0.142524994187398	1.386457102109	0.0538336052202284	0.0732758620689655	34	101	1256	7531	0.00065415341361533	2.01831057026322	1.41231166171635	Inf	1.76196036801132	1.53571151157371	0.122915114359538	1.68625583604394	1.86064337986177	0.00138491674040313	2.17223366566794	0.00251842117439062	430	410
TCGA-49-4506-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	314	1	5	5	10	294	12054	14	15	8	37	3047	13	20	4	37	3136	17	59	37	113	2941	12	62	33	107	2930	1	11	5	17	409	0.054140127388535	0.158878504672897	0.139590443686007	1.13817608482051	0.0415647921760391	3	5	5	13	385	0.0414012738853503	0.115044247787611	0.130907854471268	0.878818526606137	0.0337662337662338	0.0445859872611465	14	85	794	5077	0.474090746147262	1.05316561359218	0.610909455039869	Inf	1.0456453705824	1.01989055849909	0.565057610505962	1.0230716949915	1.05631522130263	0.479382742699413	1.06570618257722	0.125278403507509	300	280
TCGA-49-4507-01A-01D-1265-08	0	0	1	1	483	0	5	12	17	458	18778	17	25	10	52	4721	25	26	8	59	4826	25	80	64	169	4612	37	67	74	178	4619	17	12	20	49	657	0.101449275362319	0.275280898876405	0.142238579779173	1.93534622817369	0.0745814307458143	15	17	14	46	663	0.0952380952380952	0.272189349112426	0.143755420641804	1.89341972565084	0.0693815987933635	0.136645962732919	66	134	1320	7911	3.77565196198129e-11	2.95139671286412	2.26131620675652	Inf	2.30775	3.60938416422287	6.17550007111389e-12	6.39065651800627	1.72295783926219	0.000990230014164222	1.95921573042581	0.878972262976966	417	392
TCGA-49-4510-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	493	1	7	7	14	477	19557	8	13	5	26	4724	4	16	2	22	4845	6	178	22	206	4996	10	198	15	223	4992	3	2	3	8	636	0.0162271805273834	0.0358744394618834	0.127403846153846	0.281580505964972	0.0125786163522013	3	7	3	13	642	0.026369168356998	0.0631067961165049	0.128502802241793	0.491092762302271	0.0202492211838006	0.0243407707910751	12	41	1278	8710	0.0336814846746013	1.99461299885897	1.07152251824066	Inf	1.76951014261671	2.93075117370892	0.0112668672690993	4.08872594482973	1.26735185890115	0.334691434164831	1.31905472798597	1	481	465
TCGA-49-4512-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	164	0	4	6	10	154	6314	1	9	3	13	1555	5	8	3	16	1587	4	19	28	51	1564	10	32	32	74	1608	4	3	7	14	222	0.0853658536585366	0.189189189189189	0.138059701492537	1.37034331628926	0.0630630630630631	1	1	2	4	194	0.024390243902439	0.0784313725490196	0.124040920716113	0.632302405498282	0.0206185567010309	0.0853658536585366	14	60	416	2756	0.103325766668648	1.54558730451732	0.880304466485305	Inf	1.44256756756757	2.72321428571429	0.0283932824802019	3.67795846677226	1.14375	0.390381312270259	1.16903875010987	0.305266721477971	150	140
TCGA-49-4514-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	762	7	5	15	20	724	29684	25	23	3	51	7429	26	28	2	56	7567	78	113	108	299	7329	64	133	121	318	7359	36	21	53	110	1092	0.144356955380577	0.345911949685535	0.148389726865063	2.33110443016103	0.100732600732601	54	17	41	112	1046	0.146981627296588	0.374581939799331	0.142720698594624	2.62458034109875	0.107074569789675	0.241469816272966	184	187	2138	12550	3.50078005961043e-55	5.77478161137848	4.81972231308938	Inf	3.40720980133586	4.35420756531707	1.22049247026051e-39	10.1568193837571	2.81998848043921	5.25291734154474e-22	4.08687854503235	0.772614963231777	578	540
TCGA-49-6742-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	689	2	7	11	18	664	27224	14	25	23	62	6857	12	24	21	57	6916	80	56	131	267	6628	62	80	136	278	6823	35	7	62	104	1010	0.150943396226415	0.37410071942446	0.148028726366701	2.52721703825059	0.102970297029703	60	10	62	132	1007	0.191582002902758	0.49438202247191	0.1519312009656	3.25398614195017	0.131082423038729	0.317851959361393	219	190	2017	11434	3.0502947098567e-70	6.53267582255121	5.49592480915399	Inf	3.57083252015569	4.46153121006655	1.33354809704472e-43	11.4549001890326	3.0971275989297	2.9761475844202e-33	4.91489814896499	0.00968225741166729	470	445
TCGA-49-6743-01A-11D-1855-08	0	1	0	1	1732	7	7	34	41	1659	68019	95	94	20	209	17120	79	79	27	185	17509	112	235	234	581	16401	134	298	252	684	16989	68	34	92	194	2469	0.112009237875289	0.283625730994152	0.145329330743422	1.95160694364506	0.0785743215876873	59	25	86	170	2401	0.0981524249422633	0.292598967297762	0.146393512590696	1.99871539468996	0.0708038317367763	0.176096997690531	305	427	4870	28520	1.84927082496348e-68	4.18305077464523	3.67606144717397	Inf	2.85677618069815	3.53961536535283	7.59044245865449e-42	6.2494283558911	2.51114153167541	1.15941848016562e-32	3.38430178430804	0.000168420829367209	1427	1354
TCGA-49-6744-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	579	1	1	8	9	561	23001	33	14	5	52	5744	26	24	6	56	5871	36	139	57	232	5786	30	147	44	221	5600	6	16	6	28	785	0.0483592400690846	0.126696832579186	0.140178571428571	0.903824538144508	0.0356687898089172	7	24	10	41	837	0.0708117443868739	0.176724137931034	0.144659522986519	1.22165574918634	0.0489844683393071	0.0500863557858377	29	138	1622	9764	0.151109871589615	1.26498663680351	0.873841344328044	Inf	1.21899480939477	1.38267384075029	0.139627977904943	1.47647531832111	1.11203623444959	0.365521224326444	1.13308038033135	0.676530067276772	550	532
TCGA-49-6745-01A-11D-1855-08	0	1	0	1	367	2	2	1	3	361	14801	1	13	3	17	3764	7	12	3	22	3773	39	34	81	154	3571	47	42	79	168	3693	36	7	36	79	549	0.215258855585831	0.470238095238095	0.148659626320065	3.16318631277648	0.143897996357013	27	4	36	67	555	0.182561307901907	0.435064935064935	0.155418650238029	2.7993096993097	0.120720720720721	0.367847411444142	135	111	1104	6160	1.06438662985622e-44	6.78343812224082	5.41394865103832	Inf	3.61081654294804	4.82002022244692	1.21499256621146e-32	15.27407691856	2.96086956521739	1.08138651584542e-18	4.56403992829924	0.347751926043222	232	226
TCGA-49-6767-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	1090	3	9	21	30	1041	42681	51	38	9	98	10497	55	48	20	123	10822	57	265	106	428	10704	66	239	87	392	10658	17	29	18	64	1483	0.0587155963302752	0.163265306122449	0.139144304747607	1.17335241581461	0.043155765340526	13	24	22	59	1479	0.0541284403669725	0.13785046728972	0.13817264573991	0.997668290648518	0.0398918187964841	0.0642201834862385	70	246	2962	18400	5.02397760565648e-05	1.76758853824638	1.39336880307514	Inf	1.59759912477884	1.75902900149866	0.00130771993632337	2.00385231730223	1.49471894427865	0.005944001244024	1.62400674238658	0.203286476161633	1020	971
TCGA-50-5044-01A-21D-1855-08	0	1	0	1	366	2	0	3	3	359	14719	3	8	2	13	3590	11	9	3	23	3668	52	38	67	157	3683	43	63	60	166	3778	33	6	31	70	546	0.191256830601093	0.421686746987952	0.144520910534674	2.91782514674081	0.128205128205128	40	3	36	79	536	0.215846994535519	0.503184713375796	0.145533532446375	3.45751734955794	0.147388059701493	0.382513661202186	140	82	1082	6379	8.1905662830916e-59	10.0604113289933	7.88579690830704	Inf	4.34855372933007	5.29869637124234	2.72973827901008e-41	19.5560582216078	3.63781710742719	2.23673777864661e-23	6.58075297964976	0.561759003350276	226	219
TCGA-50-5045-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	632	5	4	16	20	595	24395	33	18	4	55	6081	34	18	9	61	6183	28	153	48	229	6043	33	169	48	250	6088	9	22	10	41	881	0.064873417721519	0.164	0.144710906701708	1.13329398410897	0.0465380249716232	6	13	7	26	861	0.0411392405063291	0.11353711790393	0.142478901208009	0.796869690468583	0.0301974448315912	0.0506329113924051	32	125	1742	10389	0.0255144019840432	1.52667641026122	1.06843642851189	Inf	1.4193803154731	1.71241836216145	0.0239605396156921	1.94469536608956	1.23317905663988	0.212239404003768	1.28332709827389	0.839686230932621	600	563
TCGA-50-5049-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	1698	6	11	31	42	1620	66420	97	55	14	166	16393	88	70	11	169	16717	105	411	118	634	16499	108	414	129	651	16811	22	44	18	84	2306	0.049469964664311	0.129032258064516	0.137172089703171	0.940659709593487	0.0364267129228101	15	45	21	81	2276	0.0477031802120141	0.127760252365931	0.137947754409358	0.926149562295909	0.0355887521968366	0.0447585394581861	76	384	4582	28728	0.0530206394638678	1.24087034846681	0.99623919291178	Inf	1.20108932875334	1.26282063104657	0.0799955623710344	1.31805881283411	1.14785545268671	0.200853953227806	1.17555468575858	0.896044762659435	1622	1544
TCGA-50-5051-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	437	2	2	9	11	417	17097	13	9	11	33	4112	12	11	5	28	4260	13	98	25	136	4252	24	150	46	220	4473	2	13	6	21	557	0.0480549199084668	0.0954545454545455	0.124524927341829	0.766549698057777	0.0377019748653501	3	9	3	15	583	0.034324942791762	0.110294117647059	0.137111947318909	0.804409242256079	0.0257289879931389	0.0320366132723112	14	94	1140	7585	0.556091224297543	0.990948922513718	0.577559881189547	Inf	0.992121507472385	1.03425794215268	0.541036959381353	1.03961350501748	0.970163083765752	0.592058382011387	0.965832970277651	0.372321981438772	423	403
TCGA-50-5055-01A-01D-1625-08	0	1	0	1	47	0	0	0	0	46	1886	0	1	5	6	500	1	5	3	9	501	3	6	12	21	418	2	1	7	10	467	1	0	3	4	66	0.0851063829787234	0.4	0.141327623126338	2.83030303030303	0.0606060606060606	2	2	2	6	73	0.127659574468085	0.285714285714286	0.174641148325359	1.63600782778865	0.0821917808219178	0.170212765957447	8	16	139	746	0.0283011174837985	2.67951771573352	1.1396375083183	Inf	2.12230215827338	3.82014388489209	0.0311023415280159	8.02163337385939	1.67550170390004	0.17174032042813	1.91496103074945	0.649916646820672	39	38
TCGA-50-5066-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	577	1	2	9	11	557	22837	32	22	6	60	5746	34	29	12	75	5941	37	105	53	195	5439	38	125	64	227	5711	7	18	17	42	848	0.072790294627383	0.185022026431718	0.148485379092978	1.24606225583908	0.0495283018867925	13	11	11	35	790	0.0606585788561525	0.179487179487179	0.145247288104431	1.23573515092502	0.0443037974683544	0.0831889081455806	48	144	1638	9512	0.000142665530160717	1.93565280206186	1.43869120889988	Inf	1.70177045177045	1.81522181522182	0.00513652271435121	2.11150726524117	1.62904521878881	0.0057706181723905	1.82682621842187	0.223108814196269	529	509
TCGA-50-5068-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	208	0	2	7	9	197	8077	6	12	5	23	2071	10	13	7	30	2128	14	27	31	72	1951	4	32	36	72	1927	2	3	10	15	283	0.0721153846153846	0.208333333333333	0.146860404774261	1.41858068315665	0.0530035335689046	3	3	6	12	279	0.0576923076923077	0.166666666666667	0.143003587903639	1.16547192353644	0.043010752688172	0.100961538461538	21	64	562	3316	0.00969043797962854	1.93574956218551	1.21580925918895	Inf	1.70479380364245	1.91676551996837	0.108661829511426	2.26874601694169	1.64784617836086	0.0292997807795338	1.85070005804019	0.00467046608242834	187	176
TCGA-50-5072-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	398	0	3	11	14	378	15498	23	19	5	47	3916	26	16	7	49	3933	13	78	47	138	3783	17	63	64	144	3866	5	8	13	26	568	0.0653266331658292	0.180555555555556	0.14692188308329	1.22892214397496	0.0457746478873239	2	8	14	24	514	0.0603015075376884	0.173913043478261	0.135871001850383	1.27998646591101	0.0466926070038911	0.085427135678392	34	107	1082	6567	0.00124373983449791	1.92846590941044	1.35173872283244	Inf	1.70465777847695	1.64950708564387	0.122249889820201	1.84698299921542	1.71956337113454	0.00320783353881036	1.95072889262449	4.25551385925874e-05	364	344
TCGA-50-5930-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	51	0	17	34	51	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	51	0
TCGA-50-5931-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	719	2	6	16	22	681	27921	36	58	10	104	7139	41	48	11	100	7331	41	133	70	244	6668	32	130	71	233	6783	9	20	6	35	1006	0.0486787204450626	0.150214592274678	0.148311956361492	1.01282860775263	0.0347912524850895	11	19	16	46	976	0.0639777468706537	0.188524590163934	0.146370725854829	1.2879938188659	0.0471311475409836	0.0584144645340751	42	172	1982	11469	0.0320166350145074	1.41295890102353	1.03920978097912	Inf	1.33194545300225	1.85933677066199	0.00379518592730977	2.18346002621326	1.0588988842848	0.42214439938493	1.06979923255826	0.857877482438165	677	639
TCGA-50-5932-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	195	0	8	12	20	170	6970	6	5	1	12	1768	12	8	4	24	1764	6	39	20	65	1723	9	42	18	69	1715	4	3	2	9	213	0.0461538461538462	0.130434782608696	0.124198250728863	1.05021432945499	0.0422535211267606	2	1	3	6	227	0.0307692307692308	0.0923076923076923	0.131746952988973	0.700643849542528	0.026431718061674	0.0564102564102564	11	42	440	2998	0.0720587720969315	1.78415938107266	0.931152214838132	Inf	1.62169811320755	3.12545454545455	0.00804005933656938	4.53948351504997	1.02811004784689	0.546976557209645	1.03236469968157	1	184	159
TCGA-50-5933-01A-11D-1753-08	0	0	2	2	1125	5	8	23	31	1071	43911	53	39	15	107	11089	73	41	16	130	11317	48	243	132	423	10732	57	239	115	411	10773	18	34	24	76	1566	0.0675555555555555	0.184914841849148	0.145363408521303	1.272086584445	0.0485312899106003	12	35	26	73	1526	0.0648888888888889	0.1725768321513	0.142191576593366	1.21369237395004	0.0478374836173001	0.0711111111111111	80	272	3092	18413	2.19674632369328e-05	1.75142677215885	1.40166907869553	Inf	1.58069210866753	1.98715579375347	0.000134606801712633	2.38185317249236	1.40790390245691	0.00773507387836225	1.51139525366738	0.0127288328642878	1045	991
TCGA-50-5935-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	255	0	2	10	12	243	9963	5	13	4	22	2427	5	10	4	19	2761	33	15	55	103	2479	22	19	58	99	2296	19	2	22	43	434	0.168627450980392	0.434343434343434	0.189024390243902	2.29781687846204	0.0990783410138249	22	5	20	47	370	0.184313725490196	0.456310679611651	0.149253731343284	3.05728155339806	0.127027027027027	0.325490196078431	83	85	804	3971	2.356598949162e-21	4.82074048872975	3.66398059850145	Inf	2.9341758469557	4.42729534147445	1.42809558502514e-20	14.4521677024625	2.20743626997755	2.74609871655797e-07	2.92103692361212	1	172	160
TCGA-50-5936-01A-11D-1625-08	0	0	0	0	277	2	5	7	12	260	10660	11	12	9	32	2766	8	8	13	29	2703	34	23	56	113	2578	17	31	38	86	2613	11	10	16	37	396	0.133574007220217	0.430232558139535	0.151549942594719	2.8388830162086	0.0934343434343434	27	1	27	55	403	0.1985559566787	0.486725663716814	0.156322730799069	3.11359494060036	0.136476426799007	0.292418772563177	81	64	799	4392	5.06344548997538e-28	6.95302650172858	5.17265819289029	Inf	3.62928660826033	4.84080590934747	1.49031956824397e-20	16.0538431509627	2.97197294490454	6.05669396826745e-12	4.63281157145208	0.55262353013613	196	179
TCGA-50-5939-01A-11D-1625-08	1	0	0	1	194	1	2	8	10	181	7421	6	12	3	21	1889	5	8	6	19	1925	12	13	46	71	1790	15	17	38	70	1817	4	0	12	16	258	0.0824742268041237	0.228571428571429	0.141992294991745	1.60974529346622	0.062015503875969	4	2	14	20	249	0.103092783505155	0.28169014084507	0.139106145251397	2.02500141410713	0.0803212851405622	0.175257731958763	34	77	507	3100	8.69520300807707e-06	2.69901162689229	1.8536699067664	Inf	2.17918510226203	2.1079699028417	0.0289120965119483	2.57351316530517	2.2020757020757	7.26896577319985e-05	2.73991660941535	4.30695309606814e-05	160	147
TCGA-50-5941-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	901	4	5	24	29	855	35055	46	40	11	97	8966	53	32	17	102	8895	59	191	85	335	8498	53	181	87	321	8696	12	19	17	48	1204	0.0532741398446171	0.149532710280374	0.138454461821527	1.08001366162635	0.0398671096345515	16	20	21	57	1265	0.0632630410654828	0.170149253731343	0.148858554954107	1.14302637012566	0.0450592885375494	0.0732519422863485	66	218	2469	14725	5.16986808299906e-05	1.80552430557984	1.40974819181335	Inf	1.61838344770934	1.74098825435399	0.00212310997622144	1.98795431547651	1.53854775966167	0.00431107088933991	1.69120432575416	0.180738554809002	835	789
TCGA-50-5942-01A-21D-1753-08	0	0	0	0	145	0	2	4	6	136	5576	9	13	7	29	1529	7	9	2	18	1393	7	18	26	51	1330	4	27	7	38	1324	1	4	2	7	193	0.0482758620689655	0.184210526315789	0.145770392749245	1.26370329970003	0.0362694300518135	1	2	2	5	192	0.0344827586206897	0.0980392156862745	0.144360902255639	0.679125816993464	0.0260416666666667	0.0413793103448276	6	38	385	2269	0.630656073508814	0.930562214394289	0.381109984600329	Inf	0.940023612750886	1.25336481700118	0.489692432787289	1.30952101515284	0.835576544667454	0.725192777278717	0.812956070408123	0.64040536122916	139	130
TCGA-50-5944-01A-11D-1753-08	0	1	1	2	210	2	4	8	12	194	7954	3	9	2	14	1900	9	9	10	28	2071	17	29	46	92	2011	11	18	31	60	1972	7	2	5	14	291	0.0666666666666667	0.233333333333333	0.147565922920892	1.58121420389462	0.0481099656357388	6	4	7	17	263	0.080952380952381	0.184782608695652	0.13078070611636	1.41291949082493	0.064638783269962	0.119047619047619	25	80	554	3429	0.00507447891492654	1.93393086447479	1.26863759892056	Inf	1.71179302045728	3.3379963898917	3.8249221997534e-05	5.36073138269716	1.12044634066295	0.385876785609621	1.14261328455069	1	185	169
TCGA-50-5946-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	42	0	6	36	42	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	42	0
TCGA-50-6590-01A-12D-1855-08	0	1	0	1	1965	11	8	37	45	1878	76998	103	69	27	199	19530	86	83	18	187	20156	164	374	183	721	18735	167	405	199	771	18577	89	61	71	221	2931	0.112468193384224	0.286640726329442	0.157775744199817	1.81676041385945	0.0754008870692596	77	50	57	184	2766	0.0936386768447837	0.255201109570042	0.147638110488391	1.72855849161053	0.0665220535068691	0.149618320610687	294	419	5697	31615	7.2114287063184e-61	3.89371636485774	3.41676564219898	Inf	2.70059904563338	3.28459935716418	3.99306450492959e-49	5.58271592253342	2.19456736208182	1.23368659371861e-18	2.79659827383869	0.00681083270604272	1671	1584
TCGA-50-6591-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	156	0	6	20	26	127	5207	3	6	6	15	1282	1	6	5	12	1383	7	14	26	47	1257	5	25	23	53	1285	1	5	3	9	198	0.0576923076923077	0.169811320754717	0.15408560311284	1.10205831903945	0.0454545454545455	1	4	4	9	171	0.0576923076923077	0.191489361702128	0.136038186157518	1.40761478163494	0.0526315789473684	0.0576923076923077	9	52	369	2173	0.535830130011091	1.01922487020734	0.502498507286357	Inf	1.01639344262295	1.14814814814815	0.538320018441413	1.17767775677067	0.984126984126984	0.581024538602046	0.981487271024747	0.121205379714835	147	118
TCGA-50-6592-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	656	1	1	10	11	634	25994	33	39	13	85	6723	37	44	14	95	6881	46	90	84	220	6224	58	84	92	234	6166	23	13	30	66	946	0.100609756097561	0.282051282051282	0.153421991566656	1.83840190816935	0.0697674418604651	23	13	26	62	887	0.0945121951219512	0.281818181818182	0.142512853470437	1.97749308188993	0.0698985343855693	0.155487804878049	102	178	1833	10557	1.19787390881177e-18	3.29990384066445	2.65403568784503	Inf	2.46235679214403	2.98973939317638	8.49915178162632e-13	4.56719657618182	2.15072161880673	1.32770877824751e-08	2.68727640357986	0.250522765657933	554	532
TCGA-50-6593-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	643	3	4	12	16	617	25297	25	39	10	74	6416	29	31	12	72	6533	41	131	57	229	6109	34	130	78	242	6239	7	13	12	32	904	0.0497667185069984	0.132231404958678	0.144895015226799	0.912601477364148	0.0353982300884956	8	11	9	28	859	0.0435458786936236	0.122270742358079	0.140612211491242	0.869559912765427	0.0325960419091967	0.0559875583203732	36	174	1763	10585	0.141542966269689	1.24216427925473	0.893993826430023	Inf	1.20068065796937	1.40079410096427	0.109452634224779	1.5009314761095	1.08950652297221	0.372822360545716	1.10601879379747	0.319281913492165	607	581
TCGA-50-6594-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	1160	8	12	32	44	1093	44813	55	42	12	109	11305	54	33	10	97	11409	59	277	111	447	11109	82	269	89	440	10990	29	39	18	86	1512	0.0741379310344828	0.195454545454545	0.137579617834395	1.42066498316498	0.0568783068783069	11	32	30	73	1490	0.0629310344827586	0.16331096196868	0.13412548384193	1.2175983063826	0.048993288590604	0.0758620689655172	88	253	3002	19097	2.11382808942028e-09	2.21257011126751	1.78216919998896	Inf	1.89972276546818	2.08834772090474	3.59575099989783e-06	2.51919814096636	1.76674217188541	5.66752898600549e-05	2.00884284405537	0.380323658418387	1072	1005
TCGA-50-6595-01A-12D-1855-08	0	0	0	0	245	0	0	5	5	239	9799	6	10	5	21	2291	6	7	1	14	2447	27	36	30	93	2488	22	34	55	111	2573	10	2	14	26	355	0.106122448979592	0.234234234234234	0.137971239797901	1.69770333713996	0.0732394366197183	11	3	10	24	349	0.0979591836734694	0.258064516129032	0.140273311897106	1.83972640724651	0.0687679083094556	0.183673469387755	45	89	704	4357	1.19388181349755e-08	3.12826614057492	2.25035056271141	Inf	2.41418970488467	3.08096590909091	9.01162085209665e-07	4.63973361379645	2.0298128342246	0.000491091806268996	2.43451375168873	0.687907002816452	200	194
TCGA-50-6597-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	194	2	2	8	10	182	7462	3	6	6	15	1844	5	9	3	17	1866	8	27	44	79	1811	10	38	23	71	1941	3	4	6	13	263	0.0670103092783505	0.183098591549296	0.135497166409068	1.3513093771756	0.0494296577946768	6	1	9	16	261	0.0824742268041237	0.20253164556962	0.144119271120928	1.4053057859256	0.0613026819923372	0.123711340206186	24	61	524	3228	0.000544273330381765	2.42280927540357	1.55549299927784	Inf	2.02173327346206	3.58015267175573	0.00031199911900935	6.15544584160367	1.6030534351145	0.0430496196079255	1.77668491824294	0.182057327024131	170	158
TCGA-55-1592-01A-01D-0969-08	0	2	1	3	1189	2	7	31	38	1138	46658	72	101	24	197	12096	59	70	19	148	12384	81	168	129	378	11069	72	194	149	415	11109	22	29	33	84	1628	0.0706476030277544	0.202409638554217	0.146547844090377	1.38118468961842	0.0515970515970516	22	26	27	75	1635	0.0630782169890664	0.198412698412698	0.147709820218629	1.34326003592059	0.0458715596330275	0.0874684608915055	104	327	3263	18915	2.41080240742802e-07	1.84354092523699	1.51487552693345	Inf	1.64006618537451	1.95463896049788	6.76476369932828e-06	2.33988110701712	1.46693800338215	0.00144181333941398	1.59540683107199	0.0727166079454313	1085	1034
TCGA-55-1594-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	362	1	4	12	16	343	14063	13	14	8	35	3553	14	15	7	36	3603	46	32	55	133	3391	35	38	66	139	3516	18	6	19	43	498	0.11878453038674	0.309352517985612	0.141638225255973	2.18410331975384	0.0863453815261044	25	7	25	57	511	0.157458563535912	0.428571428571429	0.150693010911236	2.84400335476656	0.111545988258317	0.240331491712707	87	115	1009	5898	1.17736890959722e-21	4.42102763809052	3.43651370129919	Inf	2.94826266571157	3.63397325306807	1.1269149947517e-15	6.61164197847216	2.48923326425804	4.07147616091494e-09	3.33941650074117	1	275	256
TCGA-55-1595-01A-01D-0969-08	0	0	0	0	521	2	2	9	11	504	20664	27	26	5	58	5174	29	31	7	67	5331	35	110	50	195	4987	22	114	48	184	5172	6	18	9	33	753	0.0633397312859885	0.179347826086957	0.145591647331787	1.23185518794388	0.0438247011952191	7	12	7	26	716	0.0499040307101727	0.133333333333333	0.143573290555444	0.928677839851024	0.0363128491620112	0.0556621880998081	29	126	1469	8690	0.0876011180677443	1.36147697521265	0.937503747791168	Inf	1.29388436285382	1.57723955907468	0.061333670111744	1.74766884938135	1.12907572831719	0.342077413548942	1.15421727300296	0.669383531196162	492	475
TCGA-55-1596-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	384	2	4	7	11	364	14924	18	26	9	53	3866	25	34	9	68	3784	32	59	36	127	3617	17	55	44	116	3657	3	3	6	12	482	0.03125	0.103448275862069	0.131802023516544	0.784876234082129	0.024896265560166	6	8	3	17	509	0.0442708333333333	0.133858267716535	0.140724357202101	0.951208947604536	0.0333988212180747	0.046875	18	111	991	6283	0.496303687052375	1.02811764548073	0.641072137930551	Inf	1.02419449463779	1.34817438579872	0.218496091064522	1.42643117023134	0.825756811301715	0.777731530537867	0.80369200202313	1	366	346
TCGA-55-5899-01A-11D-1625-08	0	0	0	0	1002	6	5	25	30	946	38786	42	42	6	90	9831	43	42	8	93	9969	69	190	141	400	9581	75	167	121	363	9405	39	22	44	105	1366	0.104790419161677	0.289256198347107	0.145241892610314	1.99154798349527	0.0768667642752562	30	27	49	106	1360	0.105788423153693	0.265	0.141947604634172	1.86688602941176	0.0779411764705882	0.161676646706587	162	244	2726	16260	2.1562623821957e-35	3.95998475709766	3.32039054333188	Inf	2.77905157053587	3.33729212521399	1.62943274431432e-21	5.48689035778395	2.47223233437691	2.50695002518029e-17	3.28211466677614	0.0211895209712392	840	784
TCGA-55-6543-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	67	0	1	3	4	63	2583	4	5	2	11	620	6	5	3	14	675	1	5	11	17	649	2	11	8	21	639	1	0	0	1	90	0.0149253731343284	0.0476190476190476	0.140845070422535	0.338095238095238	0.0111111111111111	1	0	1	2	85	0.0298507462686567	0.117647058823529	0.130970724191063	0.898269896193772	0.0235294117647059	0.0447761194029851	3	19	175	1113	0.592473341403	1.00420739239901	0.250342539350674	Inf	1.00363636363636	4.90666666666667	0.0510375046587471	12.675714615682	0.387368421052632	0.937249055320782	0.353525909644257	1	64	60
TCGA-55-6642-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	383	1	2	7	9	366	15006	18	18	5	41	3632	8	8	4	20	3612	11	109	22	142	3854	15	122	26	163	3908	3	7	3	13	472	0.0339425587467363	0.0797546012269939	0.120777891504606	0.660341062701466	0.0275423728813559	2	12	4	18	474	0.0469973890339426	0.126760563380282	0.122989102231448	1.03066500267427	0.0379746835443038	0.031331592689295	12	62	946	6816	0.187674004249929	1.39445931071897	0.765359036346135	Inf	1.33055253985487	1.57789884534071	0.204540941593409	1.7153439338731	1.19657329105004	0.368845378215758	1.23009859297439	0.749041072526961	371	354
TCGA-55-6712-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	522	1	1	14	15	504	20664	9	18	11	38	5023	8	11	4	23	5314	47	83	68	198	5018	68	118	59	245	5309	52	8	28	88	744	0.168582375478927	0.359183673469388	0.14013938594839	2.56304586350669	0.118279569892473	34	6	22	62	712	0.118773946360153	0.313131313131313	0.141889198884018	2.20687209170355	0.0870786516853933	0.260536398467433	136	106	1456	8871	7.0796013736464e-51	7.81452574734183	6.23265290054929	Inf	3.98599128144583	5.30412087912088	8.16444984504273e-48	18.0592881680318	2.79240936229125	3.27735132640617e-12	3.95575855424419	4.55016475049077e-05	386	368
TCGA-64-1676-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	1179	3	10	24	34	1128	46248	56	37	22	115	11684	57	41	10	108	11675	56	276	105	437	11209	64	298	106	468	11680	13	42	19	74	1688	0.0627650551314674	0.158119658119658	0.144520547945205	1.09409810831612	0.0438388625592417	6	28	11	45	1583	0.0381679389312977	0.102974828375286	0.141225800695869	0.729150253479837	0.0284270372710044	0.0415606446140797	49	282	3271	19618	0.419488755482968	1.04213358852224	0.792066844590396	Inf	1.03589171895103	1.10794609191888	0.352890141429228	1.12821340672727	0.99491292863756	0.54217270310351	0.994069910639679	0.108313782261071	1130	1079
TCGA-64-1677-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	465	2	4	11	15	444	18204	10	18	4	32	4639	26	20	9	55	4770	67	50	75	192	4413	56	42	67	165	4382	33	10	25	68	723	0.146236559139785	0.412121212121212	0.164993153811045	2.49780795506937	0.0940525587828492	43	7	26	76	705	0.163440860215054	0.395833333333333	0.159755268524813	2.47774822695035	0.107801418439716	0.273118279569892	127	138	1428	7367	6.60283528027473e-32	4.74672092830939	3.82484719029439	Inf	2.9516542466043	3.80553847555282	2.49859039487055e-29	8.3376875418817	2.21202213279678	1.45994808431077e-08	2.89096184306517	0.00430923332651964	338	317
TCGA-64-1678-01A-01W-0928-08	0	1	0	1	897	14	5	24	29	844	34604	49	20	9	78	8737	49	30	9	88	9044	39	191	94	324	8399	30	191	133	354	8424	9	29	44	82	1272	0.0914158305462653	0.231638418079096	0.150997150997151	1.53405820275024	0.0644654088050314	8	19	22	49	1216	0.0546265328874025	0.151234567901235	0.144779140373854	1.04458810510071	0.0402960526315789	0.0925306577480491	83	213	2488	14335	4.96127206387238e-09	2.24501773812668	1.78950020722175	Inf	1.89600487746589	1.66591523370148	0.0216436924713956	1.88346839145922	1.96594402028415	3.64128873561048e-08	2.36185746872866	6.91847533501168e-11	814	761
TCGA-64-1680-01A-02W-0928-08	0	0	0	0	107	0	1	5	6	101	4141	1	4	4	9	1103	2	7	3	12	1033	8	3	28	39	1043	11	10	20	41	962	6	2	7	15	152	0.14018691588785	0.365853658536585	0.158004158004158	2.31546854942234	0.0986842105263158	5	0	8	13	164	0.121495327102804	0.333333333333333	0.157238734419942	2.11991869918699	0.0792682926829268	0.242990654205607	26	41	316	1689	7.19642344434223e-06	3.38670804354593	2.13227602834559	Inf	2.46221424522955	3.67338441039307	3.71458737977957e-05	7.33786707672297	1.98279272151899	0.00625439083482543	2.42813015223893	0.42183405682963	81	75
TCGA-64-5774-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	328	1	4	10	14	308	12628	13	12	7	32	3061	14	21	2	37	3072	12	75	35	122	3181	13	67	37	117	3314	3	5	6	14	412	0.0426829268292683	0.11965811965812	0.124321062160531	0.962492739191768	0.0339805825242718	2	5	4	11	394	0.0335365853658537	0.0901639344262295	0.123860421251179	0.727947907131564	0.0279187817258883	0.0457317073170732	15	82	806	5689	0.221750826661696	1.29109815040678	0.761730941696515	Inf	1.24613082295157	1.61166253101737	0.192239729915172	1.76438601999904	1.11921009098428	0.40473309809444	1.13839028057824	0.216534219430637	313	293
TCGA-64-5775-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	1054	5	9	44	53	974	39934	54	36	16	106	10097	55	49	11	115	10032	40	224	98	362	10069	47	251	93	391	9736	11	31	12	54	1347	0.0512333965844402	0.138107416879795	0.138352506162695	0.998228515769627	0.0400890868596882	3	29	20	52	1423	0.0493358633776091	0.143646408839779	0.141324858476512	1.01642704891619	0.0365425158116655	0.0436432637571157	46	232	2770	17035	0.129389943641364	1.21933510692741	0.915317325120583	Inf	1.18306365737735	1.15054566579526	0.329838623476074	1.17938999264329	1.19787551741735	0.160319309829413	1.23767580216566	0.00428696498906395	1008	928
TCGA-64-5778-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	1081	0	7	33	40	1023	41943	45	44	12	101	10510	54	44	10	108	10704	55	249	107	411	10308	52	240	111	403	10421	9	29	24	62	1433	0.0573543015726179	0.153846153846154	0.137510795509068	1.11879327929572	0.0432658757850663	12	41	29	82	1482	0.0758556891766883	0.199513381995134	0.143771827706636	1.38770846262202	0.0553306342780027	0.0684551341350601	74	251	2915	17814	1.93635589419229e-05	1.80162997949892	1.42837862238112	Inf	1.61915397809737	1.39564611019381	0.0699555827975426	1.49221957805639	1.72885738115096	4.32458465650939e-05	1.96297647041743	2.35595682827156e-05	1007	949
TCGA-64-5779-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	789	3	7	14	21	745	30545	37	33	8	78	7695	35	28	12	75	7706	44	172	75	291	7467	44	192	65	301	7677	8	19	10	37	1043	0.0468948035487959	0.122923588039867	0.13586036212062	0.904778892983758	0.0354745925215724	7	27	17	51	1051	0.064638783269962	0.175257731958763	0.140752644971207	1.2451469881409	0.0485252140818268	0.0532319391634981	42	186	2094	13050	0.0326024844155169	1.40720802744183	1.0374123955011	Inf	1.33222741667923	1.23274290179734	0.231188141831874	1.28054281249952	1.39476054031928	0.0456961377172532	1.48903450238207	0.0509725809322808	747	703
TCGA-64-5781-01A-01D-1625-08	0	1	1	2	2296	10	17	51	68	2196	90036	117	74	19	210	22639	106	70	22	198	22486	151	481	226	858	22296	145	512	273	930	22615	44	67	77	188	3123	0.0818815331010453	0.202150537634409	0.13809418527526	1.46385988107658	0.0601985270573167	43	53	74	170	3179	0.0740418118466899	0.198135198135198	0.142581628991747	1.38962641636438	0.053475935828877	0.103658536585366	238	557	6302	38609	3.13599801175875e-30	2.6175700330182	2.29152893366364	Inf	2.13345828118856	2.09460370796058	8.53420338957461e-12	2.55013857657422	2.15650628454624	1.89159657369688e-20	2.65804168829543	5.18057012981215e-07	2058	1958
TCGA-64-5815-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	357	0	5	8	13	338	13858	24	12	2	38	3398	21	13	4	38	3477	12	76	42	130	3470	13	71	48	132	3513	3	13	4	20	477	0.0560224089635854	0.151515151515152	0.135781383432963	1.11587573851725	0.0419287211740042	5	9	6	20	455	0.0560224089635854	0.153846153846154	0.131123919308357	1.17328825021133	0.043956043956044	0.0504201680672269	18	97	932	6051	0.273061013970828	1.20474604943292	0.747769480010387	Inf	1.17273745101698	2.3975965665236	0.0133960441925228	3.05459286123857	0.832498807820696	0.776772130036515	0.811583614238385	0.789510612340418	339	320
TCGA-67-3770-01A-01D-0969-08	0	0	0	0	511	1	8	17	25	477	19557	14	30	6	50	4764	23	38	8	69	5003	30	104	60	194	4924	24	98	42	164	4866	7	19	8	34	688	0.0665362035225049	0.207317073170732	0.141389231401562	1.46628615995462	0.0494186046511628	3	8	5	16	632	0.0313111545988258	0.0824742268041237	0.128350934199838	0.642568184784027	0.0253164556962025	0.0450097847358121	23	133	1320	8470	0.35815219213799	1.10967374185452	0.733579689932466	Inf	1.09348290598291	1.37345679012346	0.186046335206501	1.45826467127345	0.945261437908497	0.629967739183753	0.937262086718553	0.635255856723194	488	454
TCGA-67-3771-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	1502	5	9	58	67	1411	57851	58	73	20	151	13941	68	66	16	150	14382	135	238	173	546	14579	137	240	187	564	14949	55	23	58	136	2011	0.0905459387483356	0.24113475177305	0.134524048431333	1.79250293597977	0.0676280457483839	61	27	45	133	1893	0.0885486018641811	0.243589743589744	0.129844296590987	1.87601419534859	0.0702588483888009	0.145805592543276	219	413	3904	25624	1.12768650028829e-41	3.48028288999387	3.01163718373966	Inf	2.6209048817182	3.22562078109932	1.80300092236719e-32	4.88030187888651	2.16400842440801	2.12092326878186e-14	2.63055500924302	0.292303263227205	1283	1192
TCGA-67-3772-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	171	0	8	13	21	150	6150	7	7	7	21	1504	1	12	5	18	1572	10	8	32	50	1533	16	12	33	61	1541	8	1	5	14	230	0.0818713450292398	0.229508196721311	0.149253731343284	1.53770491803279	0.0608695652173913	4	0	5	9	223	0.0526315789473684	0.18	0.145466405740378	1.23739910313901	0.0403587443946188	0.128654970760234	22	69	453	2621	0.0131488147788794	1.8442934717612	1.1713389703583	Inf	1.64054047497756	3.13194090677534	0.000146161518938845	4.95550485450518	1.04398030225845	0.496201494412323	1.05196932905864	0.768310654634237	149	128
TCGA-67-3773-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	236	0	3	8	11	218	8938	12	14	3	29	2327	11	11	5	27	2296	4	44	44	92	2141	8	40	22	70	2174	1	5	1	7	319	0.0296610169491525	0.1	0.146734130634775	0.681504702194357	0.0219435736677116	1	5	5	11	290	0.0466101694915254	0.119565217391304	0.135450723960766	0.882721139430285	0.0379310344827586	0.0338983050847458	8	70	609	3706	0.87522775890486	0.695524267629997	0.332736303529341	Inf	0.726706243947623	1.18089764641489	0.52176951095231	1.21700787760746	0.644125988953575	0.917651175116841	0.608597863154467	0.228476084538376	228	210
TCGA-67-3774-01A-01D-1040-01	0	2	1	3	271	0	3	10	13	254	10414	10	15	5	30	2483	12	18	2	32	2700	22	44	45	111	2676	9	42	30	81	2555	2	7	4	13	367	0.0479704797047971	0.160493827160494	0.143639921722114	1.11733440979581	0.0354223433242507	5	7	10	22	335	0.0811808118081181	0.198198198198198	0.125186846038864	1.58321903993546	0.0656716417910448	0.0774907749077491	21	85	702	4529	0.0442471056256975	1.59374549959293	1.01597956564709	Inf	1.47625383002741	1.68261189228931	0.113893992449944	1.88135826438541	1.3909591642925	0.126829965579553	1.48055718645896	0.116544063810229	250	233
TCGA-67-4679-01B-01D-1753-08	0	0	0	0	654	1	6	19	25	618	25338	38	23	9	70	6118	48	29	12	89	6435	26	129	60	215	6366	37	135	72	244	6419	8	18	9	35	910	0.0535168195718654	0.14344262295082	0.141766630316249	1.01182219419924	0.0384615384615385	8	12	13	33	799	0.0504587155963303	0.153488372093023	0.125510524662268	1.22291236138196	0.0413016270337922	0.0581039755351682	38	157	1709	11076	0.0112186825831801	1.56857637785629	1.13443719589039	Inf	1.4578325906588	1.89993219835233	0.00774019142083008	2.20611667341307	1.24683050516871	0.163244031182386	1.29616647021324	0.339405867999411	616	580
TCGA-67-6215-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	268	1	1	1	2	265	10865	10	28	55	93	3015	4	35	64	103	3011	3	10	26	39	2407	3	8	19	30	2432	0	1	5	6	426	0.0223880597014925	0.2	0.175164473684211	1.14178403755869	0.0140845070422535	1	3	5	9	382	0.0335820895522388	0.230769230769231	0.158703780639801	1.45408779701973	0.0235602094240838	0.041044776119403	11	40	808	4031	0.224482835318216	1.37183717898519	0.715892171879205	Inf	1.29171520093186	0.998143564356436	0.666055327229937	0.997772712941193	1.33085808580858	0.210517427977877	1.4252710152528	0.0016991504247876	257	254
TCGA-67-6216-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	105	0	0	6	6	99	4059	1	6	0	7	1096	7	5	0	12	1096	9	6	24	39	932	12	8	21	41	935	7	2	4	13	163	0.123809523809524	0.317073170731707	0.174331550802139	1.81879395481071	0.0797546012269939	7	1	9	17	155	0.161904761904762	0.435897435897436	0.166309012875536	2.62100909842845	0.109677419354839	0.257142857142857	27	39	318	1549	6.66797168449591e-06	3.36940287256788	2.12450507624287	Inf	2.40180102915952	3.91404612159329	7.48476824272219e-07	9.7241416974526	1.69608665269043	0.0359972356996757	1.97809123335704	1	78	72
TCGA-67-6217-01A-11D-1753-08	0	0	2	2	373	5	6	15	21	338	13858	18	16	6	40	3396	10	15	8	33	3596	13	68	48	129	3266	22	68	46	136	3600	2	12	7	21	501	0.0563002680965147	0.154411764705882	0.139166666666667	1.10954561465305	0.0419161676646707	6	9	7	22	437	0.0589812332439678	0.170542635658915	0.133802816901408	1.27458180334557	0.0503432494279176	0.0589812332439678	22	107	938	5928	0.162868479629072	1.29934947252345	0.844561475834545	Inf	1.248343002595	1.67310386841304	0.0967421167270238	1.87227674575734	1.09018736106701	0.40966810747581	1.10598830930074	0.21612447397462	351	316
TCGA-71-6725-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	334	1	1	3	4	329	13489	6	13	5	24	3185	3	12	4	19	3337	6	76	44	126	3468	7	113	40	160	3499	3	4	7	14	489	0.0419161676646707	0.0875	0.13975421549014	0.62609918200409	0.0286298568507157	2	4	4	10	458	0.029940119760479	0.0793650793650794	0.132064590542099	0.600956539821169	0.0218340611353712	0.0479041916167665	16	81	947	6020	0.242799571064138	1.25563566594371	0.753019006744278	Inf	1.21351201297641	2.82958329948826	0.0233413373605308	3.97224598139227	0.963405742444813	0.60125465479043	0.957892515387157	0.124581370450959	318	313
TCGA-73-4658-01A-01D-1753-08	0	2	0	2	611	1	0	11	11	594	24354	11	15	4	30	6202	23	13	2	38	6282	62	94	111	267	5944	64	76	119	259	5926	40	11	58	109	891	0.178396072013093	0.420849420849421	0.150354370570368	2.79905013238347	0.122334455667789	36	13	55	104	920	0.170212765957447	0.389513108614232	0.154777927321669	2.51659338869891	0.11304347826087	0.309328968903437	189	167	1811	10059	5.06598166849312e-59	6.28465669343552	5.22113295288662	Inf	3.47971820150268	3.95344149071372	2.98122979020749e-30	8.44019657996893	3.22020022567402	1.5678205487569e-32	5.36344086651829	0.000433124328276574	422	405
TCGA-73-4659-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	532	2	4	19	23	498	20418	29	28	3	60	5147	27	28	5	60	5234	23	103	63	189	5032	23	122	44	189	5005	2	22	7	31	722	0.0582706766917293	0.164021164021164	0.144255744255744	1.13701651790294	0.0429362880886427	6	9	9	24	684	0.0451127819548872	0.126984126984127	0.135930047694754	0.934187320152232	0.0350877192982456	0.0451127819548872	24	129	1406	8631	0.309685788304609	1.1420367445595	0.760743142514149	Inf	1.11979471731794	1.24151153441771	0.313250396012627	1.29231866264869	1.0674678613685	0.43156685312077	1.07934403192486	0.104903275447173	508	474
TCGA-73-4662-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	525	0	3	19	22	497	20377	26	22	12	60	5089	26	27	11	64	5141	27	114	59	200	5051	22	100	51	173	5096	9	23	9	41	736	0.0780952380952381	0.236994219653179	0.144427001569859	1.6409273686856	0.0557065217391304	10	15	10	35	688	0.0666666666666667	0.175	0.136210651356167	1.28477470930233	0.0508720930232558	0.0723809523809524	38	121	1424	8723	0.000677079380346397	1.92372746234146	1.37818606846612	Inf	1.70299802134125	2.76302740197202	1.77235878937691e-05	3.87902743268821	1.2308031154239	0.199235736699512	1.27895818965309	1	487	459
TCGA-73-4666-01A-01D-1265-08	0	0	1	1	944	3	2	24	26	897	36777	37	44	13	94	9270	54	42	15	111	9460	46	195	92	333	9055	55	224	80	359	8992	14	30	10	54	1212	0.0572033898305085	0.15041782729805	0.134786476868327	1.11597120714857	0.0445544554455446	15	25	16	56	1295	0.0593220338983051	0.168168168168168	0.143014908890116	1.17587858128399	0.0432432432432432	0.0582627118644068	55	218	2507	15540	0.00301656825664832	1.56382841469719	1.19750147016533	Inf	1.45027622291284	2.06693732795697	8.59153414609158e-05	2.49649135751922	1.08816708564856	0.35416776234865	1.10389555836166	0.755694024726483	889	842
TCGA-73-4668-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	1206	6	6	18	24	1156	47396	66	61	12	139	12138	72	52	11	135	12228	69	254	109	432	11427	55	287	108	450	11603	8	44	13	65	1696	0.0538971807628524	0.144444444444444	0.146169094199776	0.988200995807128	0.0383254716981132	9	40	15	64	1651	0.0530679933665008	0.148148148148148	0.14448236632537	1.02537182852143	0.0387643852210781	0.0373134328358209	45	296	3347	19683	0.778141588347677	0.894070080613582	0.672744056454224	Inf	0.908021977925695	0.943333943733917	0.641022013236169	0.934320997340987	0.887843711749569	0.778226874297313	0.871248587491682	0.100142484568072	1161	1111
TCGA-73-4670-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	913	1	10	36	46	854	35014	39	56	17	112	8882	41	60	22	123	9097	47	179	96	322	8568	36	167	94	297	8467	8	23	23	54	1276	0.0591456736035049	0.181818181818182	0.150702728239046	1.20646907950983	0.0423197492163009	14	25	18	57	1197	0.0624315443592552	0.177018633540373	0.139705882352941	1.26708074534161	0.0476190476190476	0.0690032858707558	63	210	2473	14562	0.000125994937876662	1.76644564320318	1.37127921536214	Inf	1.58962953746617	1.82583954905753	0.00319039441508397	2.1235807536054	1.48644305871837	0.00583949904714182	1.6202362608603	0.00710476525364173	850	791
TCGA-73-4675-01A-01D-1265-08	0	1	2	3	192	2	2	11	13	176	7216	10	11	6	27	1761	6	16	4	26	1864	10	24	23	57	1803	11	30	25	66	1788	4	2	3	9	267	0.046875	0.136363636363636	0.149328859060403	0.91317671092952	0.0337078651685393	3	5	2	10	235	0.0520833333333333	0.175438596491228	0.130338325013866	1.34602463605823	0.0425531914893617	0.0625	12	57	502	3089	0.255517295425883	1.29534838942344	0.706000070038464	Inf	1.24406720942318	2.38446215139442	0.020645605913767	3.07533208356837	0.745144422310757	0.818975087668252	0.715569230938441	0.728106304302077	180	164
TCGA-73-4676-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	220	0	3	10	13	204	8364	16	20	2	38	2153	10	19	7	36	2159	7	21	31	59	2031	10	30	31	71	2021	1	2	5	8	270	0.0363636363636364	0.112676056338028	0.133597229094508	0.8434011476265	0.0296296296296296	0	4	2	6	291	0.0272727272727273	0.101694915254237	0.14327917282127	0.709767604403285	0.0206185567010309	0.0363636363636364	8	71	561	3491	0.870306874686364	0.701216475473738	0.33550441539683	Inf	0.731424445497416	0.424871552899235	0.92051515410525	0.388989221080585	0.81547927088724	0.772020826172898	0.792036519298759	0.0328502415458937	212	196
TCGA-73-4677-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	595	1	2	16	18	564	23124	33	33	6	72	5789	25	12	5	42	5896	20	140	56	216	5586	25	135	74	234	5853	8	11	10	29	777	0.0487394957983193	0.123931623931624	0.132752434648898	0.933554433554434	0.0373230373230373	3	14	10	27	804	0.0453781512605042	0.125	0.143931256713212	0.868470149253731	0.0335820895522388	0.0521008403361345	31	144	1581	9858	0.0886257483804124	1.34228044089983	0.938625556906496	Inf	1.28168067226891	1.76862745098039	0.0399255250544273	2.01719553386039	1.1131221719457	0.340528191419765	1.13364609779354	0.0902358835111679	564	533
TCGA-75-5122-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	304	1	3	11	14	289	11849	8	17	2	27	2932	8	10	7	25	2981	32	44	48	124	2952	23	47	43	113	2984	12	4	8	24	415	0.0789473684210526	0.212389380530973	0.139075067024129	1.52715641326367	0.0578313253012048	13	6	11	30	418	0.0986842105263158	0.241935483870968	0.14159891598916	1.70859700571076	0.0717703349282297	0.144736842105263	44	102	833	5103	6.42183674817277e-07	2.64186318330831	1.91028586451229	Inf	2.14757683895476	3.23911382734912	2.41028737420375e-08	5.10295994247071	1.48785668113399	0.0490051871049581	1.61643815744856	0.327534369986378	260	245
TCGA-75-5125-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	389	0	6	13	19	363	14883	17	16	9	42	3858	24	16	3	43	3766	43	51	63	157	3614	25	39	57	121	3645	13	7	12	32	520	0.0822622107969152	0.264462809917355	0.142661179698217	1.85378258105531	0.0615384615384615	21	8	20	49	540	0.125964010282776	0.312101910828025	0.149418926397344	2.08877093654164	0.0907407407407407	0.169665809768638	66	122	1060	6199	5.06639279807414e-12	3.16305214114428	2.41046552916769	Inf	2.40412484945805	3.42405660377359	8.60263540136858e-12	5.84590528975734	1.82616352201258	0.000472635223900094	2.12632507799439	0.873034934501061	323	297
TCGA-75-5126-01A-01D-1753-08	0	2	1	3	1434	8	8	25	33	1378	56498	54	49	11	114	14353	62	55	11	128	14403	134	271	160	565	13833	131	280	160	571	13909	78	37	56	171	1934	0.119246861924686	0.299474605954466	0.139046660435689	2.15377057612237	0.0884177869700103	78	44	65	187	2058	0.130404463040446	0.330973451327434	0.148774669269139	2.22466265899533	0.0908649173955296	0.193165969316597	277	308	3992	23750	4.4577764559255e-78	5.35017539901839	4.63842033461631	Inf	3.29057002894678	4.09096683933906	7.58604909201608e-62	8.51342615983106	2.62774142034068	1.03219795402952e-24	3.61728024031654	0.009025524148148	1157	1101
TCGA-75-5146-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	437	0	3	11	14	419	17179	26	17	4	47	4313	16	21	7	44	4344	21	100	36	157	4260	23	107	41	171	4262	5	10	6	21	572	0.0480549199084668	0.12280701754386	0.134209291412482	0.915041099251626	0.0367132867132867	5	8	8	21	579	0.0480549199084668	0.133757961783439	0.135915492957746	0.984125936437741	0.0362694300518135	0.0549199084668192	24	97	1151	7371	0.0345472061165541	1.5843865236364	1.04448303410505	Inf	1.46856129416749	1.68272648290024	0.0660742181213713	1.88328640516057	1.3461811863202	0.15228259845863	1.42304025136348	0.469196705136096	413	395
TCGA-75-5147-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	115	0	4	8	12	103	4223	3	5	4	12	1087	4	7	3	14	1089	7	12	23	42	1053	8	9	18	35	994	5	2	5	12	151	0.104347826086957	0.342857142857143	0.151911468812877	2.25695364238411	0.0794701986754967	2	3	3	8	148	0.0695652173913043	0.19047619047619	0.140550807217474	1.35521235521236	0.0540540540540541	0.130434782608696	15	41	299	1748	0.0140766578236264	2.13786989714243	1.20782439145129	Inf	1.83379120879121	3.1948717948718	0.00326168678690409	5.10918211196272	1.33583489681051	0.246878855599692	1.41698089777963	1	100	88
TCGA-75-6203-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	47	0	0	3	3	44	1804	4	1	1	6	455	3	0	0	3	444	0	6	16	22	447	0	6	7	13	458	0	1	0	1	66	0.0212765957446809	0.0769230769230769	0.14410480349345	0.533799533799534	0.0151515151515152	0	0	0	0	46	0	0	0.102908277404922	0	0	0	0	23	112	793	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	47	44
TCGA-75-6205-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	91	0	0	2	2	89	3649	4	11	5	20	939	4	3	1	8	941	6	10	16	32	921	11	5	13	29	848	2	0	4	6	132	0.0659340659340659	0.206896551724138	0.155660377358491	1.32915360501567	0.0454545454545455	0	3	0	3	138	0.032967032967033	0.09375	0.149837133550489	0.625679347826087	0.0217391304347826	0.0659340659340659	6	40	270	1499	0.722979655332302	0.832857185625909	0.341065685542047	Inf	0.854589371980676	0.770806100217865	0.757028612878263	0.740360104403707	0.903703703703704	0.6662528484754	0.888370214378277	0.619909502262444	85	83
TCGA-75-6206-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	220	1	1	2	3	212	8692	10	8	4	22	2189	11	12	1	24	2282	21	39	22	82	2097	20	30	34	84	2124	10	2	7	19	292	0.0863636363636364	0.226190476190476	0.137476459510358	1.64530332681018	0.0650684931506849	6	5	2	13	272	0.0590909090909091	0.158536585365854	0.129709108249881	1.22224713055954	0.0477941176470588	0.113636363636364	25	72	564	3657	0.000932416796033989	2.25085320565876	1.46938071142349	Inf	1.92887694669884	2.92060197197717	4.28632203769423e-05	4.14802266444868	1.20279255319149	0.332409920849252	1.24155070309939	0.123489567291339	195	187
TCGA-75-6207-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	169	0	3	7	10	157	6437	5	14	3	22	1612	6	8	4	18	1681	11	21	27	59	1540	9	17	32	58	1604	8	3	4	15	201	0.0887573964497041	0.258620689655172	0.125311720698254	2.06381883685023	0.0746268656716418	7	3	5	15	232	0.0887573964497041	0.254237288135593	0.150649350649351	1.68760958503799	0.0646551724137931	0.142011834319527	24	55	433	2711	0.000138310552571252	2.73089666809493	1.73936277004438	Inf	2.20586429678136	5.44572748267898	1.16977287604617e-09	18.7523018819189	1.10760558969742	0.428502995020805	1.126896620663	0.187187106633885	145	133
TCGA-75-6211-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	768	1	7	18	25	730	29930	39	30	8	77	7629	44	35	8	87	7633	32	179	69	280	7312	42	164	80	286	7356	16	19	14	49	1069	0.0638020833333333	0.171328671328671	0.145323545405111	1.17894640439074	0.0458372310570627	8	32	8	48	1038	0.0625	0.171428571428571	0.141958424507659	1.20759702725021	0.046242774566474	0.0598958333333333	46	177	2107	12561	0.00728857581283125	1.54927367662437	1.15417562646137	Inf	1.43601618350959	2.25780217806796	7.02759995368056e-05	2.86126344405271	1.02788085735309	0.480559458447164	1.03271296917827	0.866094906211194	722	684
TCGA-75-6212-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	67	0	1	6	7	60	2460	1	3	7	11	629	3	1	1	5	563	2	6	13	21	648	1	9	13	23	620	0	0	0	0	82	0	0	0.132258064516129	0	0	0	1	2	3	88	0.0447761194029851	0.142857142857143	0.135802469135802	1.05194805194805	0.0340909090909091	0.0298507462686567	2	27	170	1098	0.914670483175352	0.47864203678394	0.0803772869189425	Inf	0.514401622718053	0	1	0	0.573755656108597	0.880289545994584	0.538443170577891	0.4	65	58
TCGA-80-5611-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	471	2	9	18	27	438	17958	27	48	16	91	4626	26	35	16	77	4824	23	45	57	125	4185	28	59	58	145	4323	11	11	10	32	663	0.0679405520169851	0.220689655172414	0.153365718251214	1.43897643938212	0.0482654600301659	5	7	10	22	592	0.0467091295116773	0.176	0.141457586618877	1.24418918918919	0.0371621621621622	0.0764331210191083	36	130	1255	7253	0.0112612734053005	1.60030880454921	1.14012588105172	Inf	1.47020592329477	2.12683384110616	0.00213733336385113	2.6414597081931	1.17900571626537	0.249151198132684	1.21664443594915	0.540618245849576	435	402
TCGA-86-6562-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	158	0	1	1	2	155	6355	4	7	0	11	1649	7	8	8	23	1745	13	16	32	61	1449	14	14	32	60	1512	9	3	7	19	241	0.120253164556962	0.316666666666667	0.159391534391534	1.98672199170124	0.0788381742738589	10	5	5	20	224	0.126582278481013	0.327868852459016	0.154589371980676	2.12090163934426	0.0892857142857143	0.19620253164557	31	60	465	2496	1.83182778179581e-05	2.77188500704866	1.85008996087042	Inf	2.16923076923077	4.48100358422939	4.32775780176232e-10	12.7305464385361	1.19395161290323	0.302691493162473	1.23861528274077	0.164612279344476	127	124
TCGA-91-6828-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	804	1	7	27	34	763	31283	27	29	10	66	7658	36	24	19	79	7721	44	186	85	315	7959	43	195	65	303	7945	12	15	13	40	1085	0.0497512437810945	0.132013201320132	0.136563876651982	0.966677312892579	0.0368663594470046	18	17	14	49	1054	0.0609452736318408	0.155555555555556	0.132428697072497	1.17463630613536	0.0464895635673624	0.0708955223880597	57	180	2139	13765	9.21138211152045e-06	2.03775010894755	1.55749718922628	Inf	1.78822471165397	2.56387935064726	5.78913190218676e-07	3.38663376951714	1.33834502103787	0.070323009816173	1.41257773521044	0.748154437439176	747	706
TCGA-91-6829-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	1531	6	10	32	42	1449	59409	90	89	24	203	14769	83	80	23	186	15143	93	280	132	505	14808	98	303	154	555	14689	24	33	25	82	1990	0.0535597648595689	0.147747747747748	0.135475525903737	1.09058626465662	0.0412060301507538	28	34	27	89	2019	0.0581319399085565	0.176237623762376	0.136345218800648	1.29258382004619	0.0440812283308569	0.0679294578706728	104	373	4009	25488	8.35322477486819e-07	1.77261111754858	1.46146774994699	Inf	1.6041934996363	2.00314214483381	5.73988872224048e-07	2.37831984759912	1.33776276106034	0.0178922735826655	1.41279892341691	1	1427	1345
TCGA-91-6831-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	618	1	5	17	22	591	24231	28	40	7	75	5966	30	40	11	81	6235	39	109	68	216	5933	43	104	72	219	6097	10	14	7	31	876	0.0501618122977346	0.141552511415525	0.143677218304084	0.985211943037051	0.0353881278538813	12	13	6	31	777	0.0501618122977346	0.143518518518519	0.130962413618743	1.0958756375423	0.0398970398970399	0.0566343042071197	35	187	1653	10377	0.218077463722267	1.17492929003226	0.843424278273797	Inf	1.1473815012835	1.95254747465805	0.00135858481432268	2.30160606705758	0.675784288306974	0.95642911667919	0.642617780268388	0.109757172186384	583	556
TCGA-91-6835-01A-11D-1855-08	0	1	0	1	233	0	0	7	7	221	9061	5	21	5	31	2215	10	11	8	29	2468	13	36	33	82	2147	15	36	28	79	2231	5	3	8	16	333	0.0686695278969957	0.20253164556962	0.149260421335724	1.35690120500247	0.048048048048048	5	5	10	20	299	0.0858369098712446	0.24390243902439	0.139264089427108	1.75136634309487	0.0668896321070234	0.120171673819742	28	61	632	3746	4.41422519618335e-05	2.72001485292716	1.79415843810824	Inf	2.1793485990613	2.47400542495479	0.00440457744614983	3.29162564328157	2.04409628553642	0.00206058178243306	2.48047971435701	0.0897941024044526	205	193
TCGA-91-6836-01A-21D-1855-08	0	0	1	1	1979	2	10	28	38	1925	78925	56	42	13	111	18478	57	41	12	110	19820	55	590	92	737	19623	56	788	123	967	21004	14	36	21	71	2839	0.0358767054067711	0.0734229576008273	0.135164730527519	0.543210919847755	0.0250088059175766	8	49	9	66	2519	0.0333501768569985	0.0895522388059701	0.12836977016766	0.697611584791406	0.0262008733624454	0.0262758969176352	52	274	5358	35269	0.0854778170862915	1.24922177372789	0.956659651345183	Inf	1.20947748564729	1.50283654315009	0.0324183834316369	1.62710197387157	1.05802234433188	0.400211923529085	1.06744806495109	0.280772444031236	1927	1873
Totals	1	64	74	139	174401	717	1643	4317	5960	165422	6782302	7176	6969	2428	16573	1706535	7438	6942	2452	16832	1747082	9664	38114	16955	64733	1654763	9703	40303	17278	67284	1673922	3554	4191	4278	12023	241290	0.0689388248920591	0.178690327566732	0.144146501449888	1.23964387459555	0.0498280077914543	3608	4097	4055	11760	234804	0.0674308060160206	0.181669318585575	0.141895848529366	1.28030044901544	0.0500843256503296	0.0888469676205985	15495	38105	476094	2852591	0	2.43628902957526	2.39780656972044	Inf	2.02118832778319	2.58554413056444	0	3.51598742709494	1.70190930367007	0	1.92784660445333	2.32970294197227e-30	158906	149927
