SampleName	mRNA_cNMF	mRNA_cHierarchical	CN_cNMF	Methlyation_cNMF	RPPA_cNMF	RPPA_cHierarchical	mRNAseq_cNMF	mRNAseq_cHierarchical	miRseq_cNMF	miRseq_cHierarchical	miRseq_Mature_cNMF	miRseq_Mature_cHierarchical
TCGA-AF-2687-01	NA	NA	1	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1
TCGA-AF-2689-01	1	1	1	NA	1	1	NA	NA	5	3	NA	NA
TCGA-AF-2690-01	NA	NA	1	2	1	2	1	1	1	2	NA	NA
TCGA-AF-2691-01	2	2	1	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AF-2692-01	1	3	1	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AF-2693-01	NA	NA	2	2	NA	NA	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-AF-3400-01	2	2	1	NA	1	2	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AF-3911-01	NA	NA	2	1	NA	NA	1	1	1	2	2	2
TCGA-AF-3913-01	3	4	3	NA	2	1	4	4	1	3	NA	NA
TCGA-AF-3914-01	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-AF-4110-01	NA	NA	2	2	NA	NA	2	2	1	2	2	2
TCGA-AF-5654-01	NA	NA	1	NA	3	3	3	1	3	2	NA	NA
TCGA-AF-6136-01	NA	NA	2	3	3	3	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-AF-6655-01	NA	NA	4	2	2	2	1	1	2	2	3	3
TCGA-AF-6672-01	NA	NA	4	2	3	3	2	2	2	2	4	3
TCGA-AF-A56K-01	NA	NA	3	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-AF-A56L-01	NA	NA	4	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-AF-A56N-01	NA	NA	3	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-3574-01	1	1	4	NA	1	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3575-01	2	2	1	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3578-01	2	5	4	NA	3	4	4	3	5	1	NA	NA
TCGA-AG-3580-01	1	1	1	NA	3	4	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3581-01	2	6	3	NA	1	2	2	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3582-01	2	7	4	NA	1	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3583-01	1	6	1	NA	3	3	2	3	4	1	NA	NA
TCGA-AG-3584-01	3	5	4	NA	3	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3586-01	1	8	1	NA	3	3	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3587-01	2	2	1	NA	3	3	4	4	4	1	NA	NA
TCGA-AG-3591-01	NA	NA	4	3	3	3	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-AG-3592-01	NA	NA	3	3	NA	NA	3	1	2	2	NA	NA
TCGA-AG-3593-01	1	1	3	NA	3	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3594-01	2	2	4	NA	1	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3598-01	2	6	1	NA	3	3	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3599-01	1	3	1	NA	1	1	2	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3600-01	2	6	4	NA	1	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3601-01	3	4	4	NA	1	1	4	4	5	1	NA	NA
TCGA-AG-3602-01	2	6	1	NA	1	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3605-01	2	6	4	NA	3	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3608-01	2	6	3	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3609-01	3	7	2	NA	1	1	3	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3611-01	2	2	2	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3612-01	2	7	3	NA	3	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3725-01	NA	NA	2	3	3	1	2	2	2	2	4	3
TCGA-AG-3726-01	1	1	1	NA	NA	NA	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3727-01	1	3	1	NA	3	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3728-01	2	5	2	NA	NA	NA	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3731-01	NA	NA	1	3	1	1	1	2	2	1	1	1
TCGA-AG-3732-01	NA	NA	4	2	NA	NA	2	2	3	2	4	2
TCGA-AG-3742-01	NA	NA	3	3	1	1	3	1	3	2	NA	NA
TCGA-AG-3878-01	2	6	1	NA	1	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3881-01	2	2	4	NA	1	2	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3882-01	2	7	3	NA	2	5	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3883-01	2	7	1	NA	NA	NA	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3885-01	1	2	2	NA	1	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3887-01	1	2	4	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3890-01	3	7	1	NA	NA	NA	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3891-01	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-3892-01	2	2	1	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3893-01	3	5	2	NA	2	2	4	3	3	1	NA	NA
TCGA-AG-3894-01	1	1	1	NA	NA	NA	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3896-01	3	5	2	NA	3	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3898-01	3	4	1	NA	2	5	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3901-01	3	2	1	NA	2	2	1	3	1	2	NA	NA
TCGA-AG-3902-01	2	2	4	NA	2	5	2	2	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3909-01	3	5	3	NA	NA	NA	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-3999-01	3	4	2	NA	NA	NA	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-4001-01	3	4	3	NA	1	1	4	4	4	1	NA	NA
TCGA-AG-4005-01	3	4	2	NA	2	5	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-4007-01	3	7	4	NA	1	1	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-4008-01	3	4	1	NA	1	1	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-4015-01	3	4	3	NA	3	3	4	4	5	1	NA	NA
TCGA-AG-4021-01	NA	NA	1	3	1	1	1	1	3	1	2	1
TCGA-AG-4022-01	NA	NA	2	1	2	5	1	2	2	2	2	2
TCGA-AG-A002-01	1	3	1	NA	3	5	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A008-01	1	3	1	NA	3	3	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A00C-01	1	3	2	NA	3	3	4	3	3	2	NA	NA
TCGA-AG-A00H-01	1	3	2	NA	2	5	4	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-A00Y-01	1	3	2	NA	3	3	4	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-A011-01	1	6	1	NA	3	2	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A014-01	3	3	4	NA	2	2	4	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-A015-01	1	3	2	NA	3	3	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A016-01	1	3	3	NA	3	3	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A01J-01	3	3	4	NA	2	3	4	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-A01L-01	1	3	2	NA	NA	NA	4	3	4	3	NA	NA
TCGA-AG-A01N-01	3	5	3	NA	2	5	4	3	4	3	NA	NA
TCGA-AG-A01W-01	NA	NA	1	3	2	5	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A01Y-01	NA	NA	4	1	2	5	4	4	4	1	NA	NA
TCGA-AG-A020-01	NA	NA	1	3	3	3	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A023-01	3	8	1	NA	3	3	4	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-A025-01	1	8	1	NA	NA	NA	4	3	3	2	NA	NA
TCGA-AG-A026-01	3	4	3	3	3	3	4	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A02G-01	1	7	2	NA	3	3	3	4	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A02N-01	NA	NA	1	3	2	3	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A02X-01	1	2	4	NA	2	2	4	3	5	3	NA	NA
TCGA-AG-A032-01	3	5	2	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-AG-A036-01	NA	NA	NA	3	2	2	4	4	4	1	NA	NA
TCGA-AH-6544-01	NA	NA	4	2	3	3	2	2	2	2	3	3
TCGA-AH-6547-01	NA	NA	1	2	2	5	2	2	2	2	3	2
TCGA-AH-6549-01	NA	NA	NA	1	3	3	3	1	4	1	3	1
TCGA-AH-6643-01	NA	NA	4	3	2	5	1	1	2	1	4	3
TCGA-AH-6644-01	NA	NA	4	3	2	5	1	1	1	2	NA	NA
TCGA-AH-6897-01	NA	NA	1	1	3	3	3	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-AH-6903-01	NA	NA	1	2	NA	NA	2	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-BM-6198-01	NA	NA	1	2	2	5	1	1	2	2	3	3
TCGA-CI-6619-01	NA	NA	1	1	NA	NA	2	2	2	1	3	1
TCGA-CI-6620-01	NA	NA	1	3	NA	NA	2	2	3	2	1	1
TCGA-CI-6621-01	NA	NA	1	2	2	5	2	2	2	2	3	3
TCGA-CI-6622-01	NA	NA	1	2	NA	NA	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-CI-6623-01	NA	NA	2	2	NA	NA	3	1	2	2	NA	NA
TCGA-CI-6624-01	NA	NA	1	1	NA	NA	2	2	2	1	3	1
TCGA-CL-4957-01	NA	NA	1	2	NA	NA	3	2	2	2	NA	NA
TCGA-CL-5917-01	NA	NA	4	2	NA	NA	3	1	2	2	NA	NA
TCGA-CL-5918-01	NA	NA	3	3	2	5	3	1	3	2	4	4
TCGA-DC-4745-01	NA	NA	3	2	3	6	1	2	2	2	NA	NA
TCGA-DC-4749-01	NA	NA	3	2	2	5	3	1	2	2	4	3
TCGA-DC-5337-01	NA	NA	1	1	1	2	3	1	3	2	1	4
TCGA-DC-5869-01	NA	NA	3	1	3	3	3	1	2	2	1	4
TCGA-DC-6154-01	NA	NA	3	1	NA	NA	3	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-DC-6155-01	NA	NA	1	2	3	6	3	1	2	2	NA	NA
TCGA-DC-6156-01	NA	NA	2	1	1	2	1	1	3	2	1	5
TCGA-DC-6157-01	NA	NA	3	1	3	6	3	1	3	2	1	4
TCGA-DC-6158-01	NA	NA	4	1	2	5	1	1	2	2	1	4
TCGA-DC-6160-01	NA	NA	1	2	2	5	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-DC-6681-01	NA	NA	1	2	1	2	1	2	1	2	2	2
TCGA-DC-6682-01	NA	NA	4	2	2	5	3	1	2	2	3	1
TCGA-DC-6683-01	NA	NA	3	3	1	2	3	1	2	2	3	2
TCGA-DT-5265-01	NA	NA	1	3	1	2	1	1	1	2	NA	NA
TCGA-DY-A0XA-01	NA	NA	3	1	3	6	3	1	3	2	NA	NA
TCGA-DY-A1DC-01	NA	NA	4	2	2	5	3	1	2	2	3	3
TCGA-DY-A1DD-01	NA	NA	4	1	3	6	3	1	1	1	4	2
TCGA-DY-A1DE-01	NA	NA	2	1	3	6	1	1	1	1	2	2
TCGA-DY-A1DF-01	NA	NA	2	3	3	4	1	1	2	2	NA	NA
TCGA-DY-A1DG-01	NA	NA	3	1	3	6	3	1	2	2	4	3
TCGA-DY-A1H8-01	NA	NA	1	2	3	3	3	1	2	2	3	3
TCGA-EF-5830-01	NA	NA	4	1	3	6	3	1	3	1	NA	NA
TCGA-EF-5831-01	NA	NA	3	3	3	6	1	1	3	2	NA	NA
TCGA-EI-6506-01	NA	NA	1	2	2	5	2	2	2	2	4	3
TCGA-EI-6507-01	NA	NA	1	2	2	5	1	1	4	2	4	3
TCGA-EI-6508-01	NA	NA	1	3	3	4	2	2	3	1	NA	NA
TCGA-EI-6509-01	NA	NA	4	2	3	4	3	1	2	2	4	5
TCGA-EI-6510-01	NA	NA	1	3	3	3	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-EI-6511-01	NA	NA	3	2	2	5	3	1	2	2	4	3
TCGA-EI-6512-01	NA	NA	1	3	3	3	2	2	2	2	NA	NA
TCGA-EI-6513-01	NA	NA	3	1	2	5	3	1	2	1	4	3
TCGA-EI-6514-01	NA	NA	3	3	3	6	3	1	1	2	2	2
TCGA-EI-6881-01	NA	NA	2	2	2	5	2	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-6882-01	NA	NA	1	3	3	5	2	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-6883-01	NA	NA	4	3	NA	NA	3	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-6884-01	NA	NA	1	2	3	6	2	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-6885-01	NA	NA	1	1	3	3	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-6917-01	NA	NA	1	2	2	2	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-7002-01	NA	NA	2	1	NA	NA	3	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-EI-7004-01	NA	NA	1	3	NA	NA	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-F5-6464-01	NA	NA	1	2	1	2	1	1	1	2	2	2
TCGA-F5-6465-01	NA	NA	1	1	2	5	1	2	3	2	2	5
TCGA-F5-6571-01	NA	NA	2	2	2	2	1	1	1	2	2	2
TCGA-F5-6702-01	NA	NA	4	1	1	2	1	1	1	1	2	1
TCGA-F5-6810-01	NA	NA	2	1	3	6	1	1	4	1	2	1
TCGA-F5-6811-01	NA	NA	3	3	1	3	1	1	2	2	1	5
TCGA-F5-6812-01	NA	NA	2	2	1	6	1	1	1	2	2	2
TCGA-F5-6813-01	NA	NA	4	2	1	6	1	1	1	2	NA	NA
TCGA-F5-6814-01	NA	NA	1	3	NA	NA	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-F5-6861-01	NA	NA	1	2	2	2	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-F5-6863-01	NA	NA	2	2	1	2	3	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-F5-6864-01	NA	NA	4	1	2	4	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-G5-6233-01	NA	NA	2	3	2	5	2	2	2	2	3	3
TCGA-G5-6235-01	NA	NA	1	2	2	2	2	2	2	2	3	3
TCGA-G5-6572-01	NA	NA	3	2	1	2	3	1	1	2	2	5
TCGA-G5-6641-01	NA	NA	4	1	3	3	2	2	2	1	3	3
