Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-N5-A4R8-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	59	0	0	3	3	56	2296	0	3	2	5	555	0	2	2	4	499	4	7	12	23	636	4	4	16	24	606	1	1	1	3	72	0.0508474576271186	0.125	0.118811881188119	1.05208333333333	0.0416666666666667	0	0	2	2	85	0.0338983050847458	0.0869565217391304	0.133647798742138	0.650639386189258	0.0235294117647059	0.0677966101694915	4	32	157	1085	0.684432375647938	0.863966137696487	0.275965308211248	Inf	0.878980891719745	0.988853503184713	0.6618671410067	0.987270880012044	0.847588717015469	0.705980666422224	0.829417289085583	0.523809523809524	55	52
TCGA-N5-A4RA-01A-11D-A28R-08	0	0	1	1	54	0	1	4	5	49	2009	2	3	3	8	487	0	1	1	2	396	0	6	10	16	547	3	3	17	23	579	0	0	0	0	59	0	0	0.101899827288428	0	0	0	0	0	0	59	0	0	0.107861060329068	0	0	0	0	30	118	1008	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	54	49
TCGA-N5-A4RD-01A-11D-A28R-08	0	1	0	1	70	1	3	4	7	62	2542	2	4	1	7	621	3	2	1	6	631	3	5	15	23	684	2	2	22	26	606	1	0	7	8	84	0.114285714285714	0.307692307692308	0.138613861386139	2.21978021978022	0.0952380952380952	2	2	0	4	77	0.0571428571428571	0.173913043478261	0.112573099415205	1.54488989271598	0.051948051948052	0.142857142857143	10	32	161	1129	0.0343863508871873	2.18971212481963	1.07701747008364	Inf	1.90771960958296	4.80745341614907	0.0164361056496123	10.4816956694919	1.51586368977673	0.177784212197078	1.63550675417802	0.213756898640463	60	52
TCGA-N5-A4RF-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	86	0	5	4	9	77	3157	0	4	2	6	684	3	3	2	8	768	3	6	19	28	899	3	7	25	35	806	0	1	1	2	91	0.0232558139534884	0.0571428571428571	0.112903225806452	0.506122448979592	0.021978021978022	1	2	0	3	105	0.0348837209302326	0.107142857142857	0.116796440489433	0.91734693877551	0.0285714285714286	0.0232558139534884	2	48	196	1509	0.982620214416592	0.320927545729209	0.0550874831181102	Inf	0.347959183673469	1.44982993197279	0.520533080362526	1.53933073243622	0.197704081632653	0.995145653693479	0.179140646174035	1	84	75
TCGA-N5-A4RJ-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	69	0	0	4	4	65	2665	3	3	3	9	599	0	2	0	2	580	4	4	19	27	719	3	5	19	27	767	0	0	1	1	86	0.0144927536231884	0.037037037037037	0.112125162972621	0.330318690783807	0.0116279069767442	1	0	0	1	90	0.0144927536231884	0.037037037037037	0.125173852573018	0.295884773662551	0.0111111111111111	0.0289855072463768	2	43	176	1310	0.974926220505123	0.346357066112178	0.0592104745586388	Inf	0.375252525252525	1.20616883116883	0.587381766345937	1.24033530541429	0.222188995215311	0.991375261853304	0.201285686600472	1	67	63
TCGA-N5-A4RM-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	69	0	2	7	9	60	2460	0	2	1	3	544	1	1	3	5	549	4	3	18	25	670	5	7	15	27	697	2	1	0	3	78	0.0434782608695652	0.111111111111111	0.111908177905308	0.992877492877493	0.0384615384615385	1	0	1	2	80	0.0289855072463768	0.08	0.119402985074627	0.67	0.025	0.0579710144927536	4	38	158	1209	0.730919553388117	0.805577531617312	0.259503398301081	Inf	0.823990355635925	2.88396624472574	0.0776526851556372	3.82007195564965	0.262178749520522	0.982180062412962	0.23926662906774	0.523809523809524	65	56
TCGA-N5-A4RN-01A-12D-A28R-08	0	0	0	0	88	1	1	6	7	80	3280	3	7	1	11	762	3	4	5	12	806	4	6	20	30	895	2	8	17	27	817	2	1	2	5	106	0.0568181818181818	0.185185185185185	0.129742962056304	1.42732354996506	0.0471698113207547	1	0	2	3	121	0.0340909090909091	0.1	0.135195530726257	0.739669421487603	0.0247933884297521	0.0795454545454545	7	36	227	1485	0.346648277143188	1.27183588541922	0.55481901002799	Inf	1.2277430591128	3.77092511013216	0.0347534871032351	6.52974868873903	0.815335158947494	0.741148667881522	0.793048741357988	1	81	73
TCGA-N5-A4RO-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	66	0	1	3	4	62	2542	1	5	0	6	563	1	3	0	4	595	8	3	15	26	706	6	7	13	26	678	2	1	1	4	79	0.0606060606060606	0.153846153846154	0.116519174041298	1.32035053554041	0.0506329113924051	3	1	0	4	81	0.0606060606060606	0.153846153846154	0.114730878186969	1.34093067426401	0.0493827160493827	0.0909090909090909	6	36	160	1224	0.362489425549889	1.27476161537302	0.516345048623927	Inf	1.23571428571429	3.08928571428571	0.017738775341402	4.24325845294316	0.308928571428571	0.967441797892866	0.283492024511331	0.118881118881119	60	56
TCGA-N5-A4RS-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	38	0	1	7	8	30	1230	0	0	1	1	310	0	1	1	2	241	0	2	11	13	352	2	5	7	14	327	1	1	1	3	45	0.0789473684210526	0.214285714285714	0.137614678899083	1.55714285714286	0.0666666666666667	0	1	0	1	36	0.0263157894736842	0.0769230769230769	0.102272727272727	0.752136752136752	0.0277777777777778	0.0526315789473684	2	18	81	598	0.709330753186007	0.820521110467375	0.133559122861261	Inf	0.838271604938272	4.19135802469136	0.226479226051654	7.34508884463782	0.465706447187929	0.897995480971868	0.434659546204998	1	36	28
TCGA-N5-A4RT-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	114	3	1	6	7	104	4264	4	5	3	12	1036	2	2	7	11	968	10	11	21	42	1118	11	12	16	39	1142	2	1	3	6	142	0.0526315789473684	0.153846153846154	0.124343257443082	1.23726977248104	0.0422535211267606	3	1	3	7	142	0.0614035087719298	0.166666666666667	0.12701252236136	1.31220657276995	0.0492957746478873	0.0964912280701754	11	47	284	1976	0.110066099839289	1.6279967511185	0.851993381148169	Inf	1.50922778047596	1.89470154258887	0.116538135663416	2.17332934963869	1.29044537495242	0.321628412259073	1.34646383046264	1	103	93
TCGA-N5-A4RU-01A-31D-A28R-08	0	0	0	0	81	0	3	4	7	74	3034	2	4	3	9	720	1	5	1	7	682	7	8	12	27	777	8	7	16	31	855	0	3	2	5	107	0.0617283950617284	0.161290322580645	0.125146198830409	1.28881519445282	0.0467289719626168	3	1	1	5	93	0.0617283950617284	0.185185185185185	0.11969111969112	1.54719235364397	0.0537634408602151	0.0740740740740741	6	37	200	1432	0.4380612408179	1.16095265105553	0.472244425381754	Inf	1.13860465116279	1.632	0.278934682505205	1.78921803262524	0.874285714285714	0.684845452097599	0.859299852804819	1	75	68
TCGA-N5-A4RV-01A-21D-A28R-08	0	0	0	0	71	0	2	7	9	62	2542	4	4	5	13	584	3	1	2	6	581	6	6	11	23	666	5	3	12	20	711	1	0	0	1	80	0.0140845070422535	0.05	0.112517580872011	0.444375	0.0125	2	2	0	4	79	0.0563380281690141	0.173913043478261	0.118618618618619	1.46615299944964	0.0506329113924051	0.0422535211267606	3	31	159	1218	0.768568779735792	0.741467986269724	0.190253733099921	Inf	0.764150943396226	2.36192109777015	0.127576734983007	2.86948455069697	0	1	0	0.166666666666667	68	59
TCGA-N5-A59E-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	74	1	2	9	11	62	2542	3	3	2	8	576	1	0	3	4	632	4	6	14	24	652	11	5	10	26	682	4	1	1	6	98	0.0810810810810811	0.230769230769231	0.143695014662757	1.60596546310832	0.0612244897959184	2	2	0	4	84	0.0540540540540541	0.166666666666667	0.128834355828221	1.29365079365079	0.0476190476190476	0.0945945945945946	7	32	182	1152	0.283772568008369	1.38424678346742	0.597846416447569	Inf	1.31558185404339	2.93186813186813	0.011380812531573	4.21320901889275	0.30540293040293	0.969981154849174	0.275367600663978	0.0572755417956657	67	55
TCGA-N5-A59F-01A-11D-A28R-08	0	0	1	1	71	0	3	4	7	64	2624	0	5	0	5	608	3	2	1	6	581	4	5	20	29	719	2	7	15	24	716	1	0	1	2	90	0.028169014084507	0.0833333333333333	0.125698324022346	0.662962962962963	0.0222222222222222	0	0	2	2	81	0.028169014084507	0.0689655172413793	0.112656467315716	0.612175393784589	0.0246913580246914	0.0563380281690141	4	37	171	1264	0.736087505909936	0.799227072570833	0.257373799708647	Inf	0.818713450292398	1.39863547758285	0.534230083321447	1.47789208222273	0.719298245614035	0.80361314438426	0.693134139252497	0.485714285714286	67	60
TCGA-N6-A4V9-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	47	0	0	4	4	43	1763	3	6	0	9	402	1	3	0	4	449	2	4	8	14	442	4	3	9	16	470	0	1	2	3	58	0.0638297872340425	0.1875	0.123404255319149	1.51939655172414	0.0517241379310345	0	1	0	1	63	0.0212765957446809	0.0714285714285714	0.142533936651584	0.501133786848073	0.0158730158730159	0.0425531914893617	2	21	121	791	0.828616543797724	0.6228573913286	0.102923026441871	Inf	0.655407833273446	0	1	0	0.886728245017015	0.681201018494884	0.871771009943451	0.428571428571429	45	41
TCGA-N6-A4VC-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	56	0	0	1	1	55	2255	1	6	2	9	530	2	8	1	11	534	1	2	16	19	573	4	4	8	16	618	0	0	0	0	70	0	0	0.113268608414239	0	0	0	0	0	0	60	0	0	0.104712041884817	0	0	0	0	29	130	1061	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	56	55
TCGA-N6-A4VD-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	105	1	3	8	11	93	3813	0	5	2	7	846	2	2	0	4	851	1	2	35	38	1046	1	5	38	44	1070	0	0	0	0	135	0	0	0.126168224299065	0	0	1	1	2	4	128	0.0380952380952381	0.105263157894737	0.122370936902486	0.860197368421053	0.03125	0.0285714285714286	3	72	263	1853	0.996500041585421	0.293673435170645	0.0777968853557141	Inf	0.321825095057034	4.02281368821293	0.233806725803926	7.0341502494281	0.220428147299339	0.999216375019178	0.198551035512436	1	102	90
TCGA-N6-A4VE-01A-11D-A28R-08	0	0	1	1	79	0	1	6	7	72	2952	3	3	5	11	732	4	6	2	12	708	9	9	11	29	778	4	7	9	20	734	0	1	1	2	87	0.0253164556962025	0.1	0.118528610354223	0.84367816091954	0.0229885057471264	2	1	1	4	90	0.0506329113924051	0.137931034482759	0.115681233933162	1.19233716475096	0.0444444444444444	0.0506329113924051	4	29	177	1335	0.552597882395479	1.04030826630955	0.331035083678582	Inf	1.03543913713405	1.3142112125163	0.462287247880199	1.3710171192771	0.854237288135593	0.698095903785326	0.838155453743851	1	75	68
TCGA-N6-A4VF-01A-31D-A28R-08	0	0	0	0	55	0	2	4	6	49	2009	1	1	2	4	422	1	1	1	3	472	2	1	17	20	560	3	2	17	22	555	0	1	1	2	68	0.0363636363636364	0.0909090909090909	0.122522522522523	0.741978609625669	0.0294117647058824	0	0	2	2	58	0.0363636363636364	0.1	0.103571428571429	0.96551724137931	0.0344827586206897	0.0545454545454545	3	36	126	989	0.831421095017527	0.65430730125815	0.16854399933007	Inf	0.680708180708181	0	1	0	0.780812324929972	0.755331638491007	0.759765244060018	0.142857142857143	52	46
TCGA-N6-A4VG-01A-31D-A28R-08	0	0	0	0	60	1	0	4	4	55	2255	2	1	3	6	536	0	3	1	4	523	5	5	15	25	648	4	3	13	20	548	2	0	2	4	69	0.0666666666666667	0.2	0.125912408759124	1.58840579710145	0.0579710144927536	0	0	1	1	90	0.0166666666666667	0.04	0.138888888888889	0.288	0.0111111111111111	0.0833333333333333	5	32	159	1037	0.55969487190359	1.01905045313697	0.372997304412364	Inf	1.01648818629951	1.67155835080363	0.343285490777379	1.86219422685252	0.805929919137466	0.739092824625476	0.7827855967229	1	55	50
TCGA-N7-A4Y0-01A-12D-A28R-08	0	0	0	0	854	2	31	126	157	695	28495	9	64	7	80	6244	6	87	7	100	6406	6	32	201	239	7992	9	47	220	276	7853	0	5	4	9	869	0.0105386416861827	0.0326086956521739	0.110658347128486	0.294679041376895	0.0103567318757192	0	2	6	8	893	0.00936768149882904	0.0334728033472803	0.111736736736737	0.299568470718325	0.00895856662933931	0.0117096018735363	10	426	1762	14083	0.999999999999014	0.18763068715657	0.100948477295058	Inf	0.206252798633746	0	1	0	0.21360147316939	0.999999999995927	0.194478418339253	0.000296625880608082	844	685
TCGA-N7-A4Y5-01A-12D-A28R-08	0	0	0	0	66	0	1	3	4	62	2542	0	4	2	6	578	0	3	4	7	595	8	2	16	26	670	6	2	15	23	699	2	0	2	4	80	0.0606060606060606	0.173913043478261	0.11444921316166	1.5195652173913	0.05	1	1	2	4	82	0.0606060606060606	0.153846153846154	0.122388059701493	1.25703564727955	0.0487804878048781	0.106060606060606	7	38	162	1207	0.286418729658101	1.3721354260922	0.597937589590498	Inf	1.31454046639232	1.81084656084656	0.228218862247775	2.03067345287228	1.09040223018718	0.511113845128242	1.10367756306883	1	59	55
TCGA-N7-A4Y8-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	74	1	1	9	10	63	2583	1	5	1	7	578	0	4	2	6	597	3	3	18	24	722	2	4	20	26	686	0	0	2	2	70	0.027027027027027	0.0769230769230769	0.102040816326531	0.753846153846154	0.0285714285714286	0	1	1	2	75	0.027027027027027	0.0833333333333333	0.10387811634349	0.802222222222222	0.0266666666666667	0.0405405405405405	3	40	145	1263	0.832432989028961	0.653439612971041	0.169338797693588	Inf	0.677465918203689	0	1	0	0.766606170598911	0.764682299783166	0.746736292150922	0.142857142857143	71	60
TCGA-N7-A59B-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	53	0	0	10	10	43	1763	2	3	0	5	417	4	4	1	9	438	6	3	9	18	460	0	3	8	11	448	0	0	0	0	58	0	0	0.129464285714286	0	0	1	0	0	1	63	0.0188679245283019	0.0555555555555556	0.13695652173913	0.405643738977072	0.0158730158730159	0.0188679245283019	1	22	121	787	0.962080639187503	0.295892673755303	0.0144330683828984	Inf	0.326266618756737	1.25068870523416	0.577748456932376	1.30041362073937	0	1	0	1	52	42
TCGA-N8-A4PI-01A-21D-A28R-08	0	0	0	0	64	0	4	2	6	58	2378	2	3	3	8	596	2	3	2	7	591	1	2	13	16	568	5	4	18	27	623	1	1	3	5	92	0.078125	0.185185185185185	0.147672552166934	1.25402576489533	0.0543478260869565	1	0	1	2	76	0.03125	0.125	0.133802816901408	0.93421052631579	0.0263157894736842	0.09375	6	31	168	1023	0.429857627034249	1.1783803682643	0.473267588857071	Inf	1.1496138996139	2.36309523809524	0.204649173602829	3.0406267672859	0.914746543778802	0.655413323419251	0.90215955987426	0.592074592074592	58	52
TCGA-N8-A4PL-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	65	0	1	3	4	61	2501	1	3	2	6	541	1	2	0	3	596	2	3	14	19	666	6	6	21	33	698	1	0	1	2	96	0.0307692307692308	0.0606060606060606	0.137535816618911	0.440656565656566	0.0208333333333333	0	1	1	2	74	0.0307692307692308	0.105263157894737	0.111111111111111	0.947368421052632	0.027027027027027	0.0461538461538462	3	40	170	1194	0.915432956472137	0.526956805342228	0.136757481554569	Inf	0.559781121751026	1.00294117647059	0.656248760664876	1.00335895436684	0.458487394957983	0.942315605927476	0.425858116079641	1	62	58
TCGA-N8-A4PM-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	70	0	4	7	11	59	2419	3	4	1	8	534	0	7	0	7	587	0	7	19	26	627	1	4	13	18	671	0	0	0	0	79	0	0	0.117734724292101	0	0	0	1	1	2	76	0.0285714285714286	0.0769230769230769	0.121212121212121	0.634615384615385	0.0263157894736842	0.0142857142857143	1	32	155	1143	0.984508424707942	0.230592797332326	0.011427613319071	Inf	0.253763440860215	0	1	0	0.261693548387097	0.982451670881933	0.238029629936599	1	69	58
TCGA-N8-A4PN-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	58	0	2	1	3	55	2255	1	1	3	5	559	3	5	0	8	544	2	3	13	18	529	3	2	19	24	623	0	0	3	3	80	0.0517241379310345	0.125	0.128410914927769	0.9734375	0.0375	1	2	2	5	94	0.0862068965517241	0.277777777777778	0.177693761814745	1.56323877068558	0.0531914893617021	0.103448275862069	6	31	174	978	0.498035983443012	1.08781814556927	0.437016808905894	Inf	1.07362534948742	1.32413793103448	0.560235848267584	1.40470635723743	1.03448275862069	0.544961207178559	1.04083890937886	0.118881118881119	52	49
TCGA-N8-A4PO-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	89	0	0	3	3	86	3526	4	4	6	14	878	3	5	2	10	756	4	6	17	27	995	7	8	20	35	897	0	2	0	2	115	0.0224719101123595	0.0571428571428571	0.128205128205128	0.445714285714286	0.0173913043478261	0	1	1	2	129	0.0224719101123595	0.0740740740740741	0.12964824120603	0.571346540338788	0.0155038759689922	0.0112359550561798	1	47	244	1648	0.998592295889482	0.143776956185334	0.00716226871683674	Inf	0.161543715846995	0	1	0	0.209570225963669	0.993759056158139	0.187703329392298	1	88	85
TCGA-N8-A4PP-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	129	0	2	5	7	122	5002	3	8	8	19	1242	4	12	8	24	1157	10	13	23	46	1307	13	9	11	33	1296	5	3	1	9	181	0.0697674418604651	0.272727272727273	0.139660493827161	1.95278754394776	0.0497237569060773	2	5	1	8	187	0.062015503875969	0.173913043478261	0.143075745983168	1.21553127179726	0.0427807486631016	0.0697674418604651	9	48	368	2235	0.418912584608978	1.13866622675748	0.559233330891044	Inf	1.11684782608696	2.15276465028355	0.0359665772096451	2.65556906065909	0.416080562659847	0.962504654758255	0.379683182381565	0.117538005190953	120	113
TCGA-N8-A4PQ-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	80	1	3	1	4	75	3075	2	2	0	4	701	2	0	3	5	733	9	4	22	35	799	4	11	16	31	842	2	3	0	5	108	0.0625	0.161290322580645	0.128266033254157	1.25746714456392	0.0462962962962963	3	2	1	6	111	0.075	0.171428571428571	0.13892365456821	1.23397683397683	0.0540540540540541	0.075	6	45	219	1422	0.691536417591261	0.865835691296886	0.355894545398294	Inf	0.881547139403707	2.88198103266596	0.0223174609453725	4.05334518427657	0.19718817591925	0.995488632410193	0.175589036295138	0.148606811145511	74	69
TCGA-N8-A56S-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	59	1	1	6	7	51	2091	1	4	1	6	491	0	3	0	3	452	0	3	18	21	581	2	5	14	21	567	1	0	2	3	69	0.0508474576271186	0.142857142857143	0.121693121693122	1.17391304347826	0.0434782608695652	0	0	3	3	70	0.0508474576271186	0.142857142857143	0.120481927710843	1.18571428571429	0.0428571428571429	0.101694915254237	6	28	139	1009	0.230393615286147	1.55481470269076	0.618747618082878	Inf	1.45746931866272	4.1294964028777	0.228750898702085	7.23574475248298	1.29046762589928	0.350464583389919	1.34388121273151	0.0800865800865801	53	45
TCGA-N9-A4PZ-01A-22D-A28R-08	0	0	0	0	83	0	0	2	2	81	3321	1	7	6	14	740	1	7	1	9	722	5	11	21	37	917	4	5	12	21	942	1	2	1	4	114	0.0481927710843374	0.19047619047619	0.121019108280255	1.57393483709273	0.0350877192982456	0	0	0	0	94	0	0	0.102508178844057	0	0	0.0240963855421687	2	40	208	1651	0.956103140614144	0.397011208042427	0.0678163920982763	Inf	0.425595238095238	0.993055555555556	0.657099748263905	0.99219156348803	0.270833333333333	0.979716538311754	0.248155749586757	1	81	79
TCGA-N9-A4Q1-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	48	0	4	5	9	39	1599	1	1	1	3	376	0	3	2	5	451	0	4	6	10	350	6	5	10	21	422	0	1	0	1	76	0.0208333333333333	0.0476190476190476	0.180094786729858	0.264411027568922	0.0131578947368421	0	1	0	1	53	0.0208333333333333	0.1	0.151428571428571	0.660377358490566	0.0188679245283019	0	0	22	129	643	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	48	39
TCGA-N9-A4Q3-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	47	0	4	1	5	42	1722	0	1	1	2	391	2	3	1	6	395	2	2	12	16	467	3	5	10	18	469	0	1	1	2	63	0.0425531914893617	0.111111111111111	0.134328358208955	0.827160493827161	0.0317460317460317	2	0	3	5	64	0.106382978723404	0.3125	0.137044967880086	2.2802734375	0.078125	0.127659574468085	6	21	127	809	0.15680462131766	1.81863305116604	0.706370106035344	Inf	1.63779527559055	2.94803149606299	0.14108430304682	4.23696219136066	1.34001431639227	0.354009867736806	1.41499198211772	0.592074592074592	41	36
TCGA-N9-A4Q4-01A-11D-A28R-08	0	0	1	1	49	1	1	5	6	42	1722	0	1	1	2	338	2	2	0	4	401	2	5	8	15	508	3	8	10	21	475	1	2	0	3	53	0.0612244897959184	0.142857142857143	0.111578947368421	1.28032345013477	0.0566037735849057	1	0	0	1	51	0.0204081632653061	0.0666666666666667	0.100393700787402	0.664052287581699	0.0196078431372549	0.0408163265306122	2	21	104	879	0.716943222652006	0.805121451648355	0.132838676201168	Inf	0.82190635451505	3.78076923076923	0.0918943987343711	5.61704226677791	0	1	0	0.428571428571429	47	40
TCGA-N9-A4Q7-01A-11D-A28R-08	0	1	0	1	363	1	4	3	7	355	14555	1	7	1	9	3454	0	2	1	3	3691	79	17	77	173	3629	64	18	88	170	3781	45	8	39	92	605	0.253443526170799	0.541176470588235	0.160010579211849	3.38212931453573	0.152066115702479	65	7	35	107	533	0.294765840220386	0.61849710982659	0.146872416643704	4.21111822056415	0.200750469043152	0.506887052341598	184	124	1138	6272	1.38541321872648e-66	8.17462401635087	6.66114721445673	Inf	3.88994134161094	5.00878734622144	1.8772010763307e-58	18.3663387780692	2.92027480428183	8.2743444284825e-19	4.48073262005053	0.000419564795537087	179	171
TCGA-N9-A4Q8-01A-31D-A28R-08	0	0	0	0	55	0	1	2	3	52	2132	1	2	0	3	493	6	3	1	10	543	5	3	13	21	553	2	6	10	18	543	0	2	1	3	78	0.0545454545454545	0.166666666666667	0.143646408839779	1.16025641025641	0.0384615384615385	3	0	1	4	81	0.0727272727272727	0.19047619047619	0.146473779385172	1.30041152263374	0.0493827160493827	0.0909090909090909	5	25	159	937	0.449018655926138	1.17840931427968	0.424500237956056	Inf	1.14884696016771	2.95417789757412	0.0693490701214749	4.41099638425967	0.599398414000547	0.866119443496816	0.561484787880248	1	50	47
TCGA-NA-A4QV-01A-11D-A28R-08	0	1	0	1	54	0	2	3	5	49	2009	1	3	1	5	492	1	3	1	5	482	7	5	11	23	511	3	4	9	16	524	0	0	2	2	56	0.037037037037037	0.125	0.106870229007634	1.16964285714286	0.0357142857142857	5	0	1	6	68	0.111111111111111	0.260869565217391	0.13307240704501	1.96035805626598	0.0882352941176471	0.148148148148148	8	22	124	911	0.0244628044942895	2.66814430777016	1.17275363578595	Inf	2.2258064516129	4.17338709677419	0.00400668986507609	7.32314709609481	1.25201612903226	0.439759862425636	1.29613720695219	0.619269619269619	46	41
TCGA-NA-A4QW-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	65	0	1	3	4	61	2501	0	2	0	2	615	1	2	0	3	590	5	3	27	35	701	3	4	14	21	595	2	1	1	4	83	0.0615384615384615	0.19047619047619	0.139495798319328	1.36546184738956	0.0481927710843374	2	1	6	9	96	0.138461538461538	0.257142857142857	0.136947218259629	1.87767857142857	0.09375	0.169230769230769	11	38	179	1117	0.0732185964399502	1.8054145330323	0.926996486536651	Inf	1.6253562877665	3.62011173184358	0.0166040904672292	6.22580000350223	1.23613571331244	0.341077348177209	1.28448903801019	0.428307982231794	54	50
TCGA-NA-A4QX-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	41	1	1	4	5	35	1435	2	1	0	3	328	0	4	0	4	334	2	3	9	14	384	0	2	12	14	389	0	0	1	1	39	0.024390243902439	0.0714285714285714	0.10025706940874	0.712454212454212	0.0256410256410256	0	0	0	0	48	0	0	0.125	0	0	0.024390243902439	1	22	87	686	0.935098304221622	0.358727978983708	0.0174362108466908	Inf	0.386306846576712	0	1	0	0.423097974822113	0.917949058402111	0.394579875343395	1	40	34
TCGA-NA-A4QY-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	55	0	2	4	6	49	2009	2	3	2	7	485	2	1	1	4	466	3	3	10	16	502	5	2	15	22	556	2	1	1	4	88	0.0727272727272727	0.181818181818182	0.158273381294964	1.14876033057851	0.0454545454545455	1	0	0	1	75	0.0181818181818182	0.0625	0.149402390438247	0.418333333333333	0.0133333333333333	0.0727272727272727	4	29	163	895	0.76954076181178	0.757528543644574	0.240698500277529	Inf	0.786763338910578	2.4340490797546	0.114262614631367	3.28927679304448	0.259631901840491	0.984319917224887	0.228970714858623	0.523809523809524	51	45
TCGA-NA-A4R0-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	69	0	0	4	4	65	2665	1	5	1	7	636	2	6	1	9	576	3	3	14	20	720	6	12	11	29	733	2	3	1	6	89	0.0869565217391304	0.206896551724138	0.121418826739427	1.70399070127857	0.0674157303370786	0	0	3	3	91	0.0434782608695652	0.15	0.126388888888889	1.18681318681319	0.032967032967033	0.0869565217391304	6	28	180	1273	0.244997073881931	1.51498044543743	0.605069775236601	Inf	1.42450980392157	1.79382716049383	0.310963293733576	2.01942676898385	1.29155555555556	0.379293058103596	1.34678502252084	0.619909502262444	63	59
TCGA-NA-A4R1-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	153	0	6	14	20	133	5453	0	11	0	11	1179	2	11	0	13	1263	1	3	45	49	1419	0	8	52	60	1592	0	0	1	1	200	0.0065359477124183	0.0166666666666667	0.125628140703518	0.132666666666667	0.005	0	0	1	1	158	0.0065359477124183	0.0204081632653061	0.111346018322763	0.183285972616895	0.00632911392405063	0.0130718954248366	2	96	358	2653	0.999932579609592	0.154435664296492	0.0269596411209884	Inf	0.171645194390605	0	1	0	0.173414732477106	0.999924474116035	0.156061198756536	0.333333333333333	151	131
TCGA-NA-A5I1-01A-21D-A28R-08	0	0	0	0	59	0	0	3	3	56	2296	3	3	1	7	537	4	4	4	12	551	7	3	14	24	568	4	5	4	13	640	0	0	0	0	87	0	0	0.1359375	0	0	0	0	0	0	66	0	0	0.116197183098592	0	0	0	0	29	153	1055	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	59	56
TCGA-ND-A4W6-01A-11D-A28R-08	0	1	0	1	95	0	1	2	3	92	3772	2	1	0	3	851	1	4	1	6	920	5	4	20	29	964	14	5	35	54	1037	8	1	9	18	137	0.189473684210526	0.333333333333333	0.132111861137898	2.52311435523114	0.131386861313869	4	1	4	9	125	0.0947368421052632	0.310344827586207	0.129668049792531	2.39337931034483	0.072	0.263157894736842	25	49	262	1739	7.1788922817676e-06	3.38361268727339	2.14055066710439	Inf	2.58020425005158	4.82362394535958	6.45002320276005e-07	11.3532943341825	1.80520471894518	0.0254045544278138	2.05354738033051	1	70	67
TCGA-ND-A4WA-01A-12D-A28R-08	0	0	0	0	68	0	1	5	6	62	2542	1	4	2	7	627	2	3	2	7	586	2	7	19	28	697	1	4	15	20	632	1	0	0	1	78	0.0147058823529412	0.05	0.123417721518987	0.405128205128205	0.0128205128205128	1	0	1	2	89	0.0294117647058824	0.0714285714285714	0.127690100430416	0.559390048154093	0.0224719101123595	0.0441176470588235	3	34	167	1162	0.859332907359656	0.614133636126201	0.158307241385711	Inf	0.645250040459621	5.30538922155689	0.0440218461967049	13.865026475196	0.234061289186333	0.989233611030144	0.210988955518214	1	65	59
TCGA-ND-A4WC-01A-21D-A28R-08	0	0	3	3	4552	12	12	3	15	4525	185525	17	279	366	662	50278	26	284	356	666	50657	5	664	901	1570	41900	6	728	893	1627	42690	0	584	86	670	7533	0.147188049209139	0.41180086047941	0.176458186929023	2.33370220813302	0.0889419885835656	0	531	82	613	7241	0.134666080843585	0.390445859872611	0.172816229116945	2.25931246080133	0.0846568153569949	0.0369068541300527	168	1637	14774	69816	1	0.484982225113534	0.422015682340382	Inf	0.532908939752286	0	1	0	0.536176497353889	1	0.488263068259163	1.53420512269447e-53	4384	4357
TCGA-ND-A4WF-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	77	0	1	1	2	75	3075	0	7	1	8	754	2	9	0	11	737	3	2	16	21	799	8	6	21	35	785	1	0	0	1	115	0.012987012987013	0.0285714285714286	0.146496815286624	0.195031055900621	0.00869565217391304	0	1	3	4	115	0.051948051948052	0.19047619047619	0.143929912390488	1.32339544513458	0.0347826086956522	0.051948051948052	4	44	230	1354	0.930591315867159	0.535345986946774	0.174106826038017	Inf	0.573913043478261	0.626086956521739	0.822154790439462	0.588858924826386	0.558401880141011	0.919039371718983	0.519606865247189	0.523809523809524	73	71
TCGA-NF-A4WU-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	44	0	1	1	2	42	1722	1	2	1	4	392	2	0	1	3	397	0	2	16	18	479	2	5	10	17	454	0	0	1	1	67	0.0227272727272727	0.0588235294117647	0.147577092511013	0.398595258999122	0.0149253731343284	0	0	0	0	55	0	0	0.11482254697286	0	0	0.0227272727272727	1	27	122	811	0.979630580532853	0.246423598341814	0.0121206769719717	Inf	0.273126463700234	0	1	0	0.294136191677175	0.973208082588956	0.266130630245405	1	43	41
TCGA-NF-A4WX-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	44	0	2	5	7	37	1517	0	0	1	1	335	2	4	0	6	388	0	3	11	14	381	2	1	13	16	413	0	0	2	2	59	0.0454545454545455	0.125	0.142857142857143	0.875	0.0338983050847458	0	0	0	0	40	0	0	0.10498687664042	0	0	0.0454545454545455	2	24	99	695	0.851802835345093	0.585333868720788	0.0971888667716184	Inf	0.616938616938617	0	1	0	0.668350168350168	0.818940072822726	0.638499438614093	0.333333333333333	42	35
TCGA-NF-A4X2-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	117	0	5	6	11	106	4346	4	3	3	10	1063	1	6	4	11	939	6	8	19	33	1133	9	17	26	52	1211	0	0	1	1	124	0.00854700854700855	0.0192307692307692	0.102394715111478	0.18781017369727	0.00806451612903226	2	1	1	4	130	0.0341880341880342	0.121212121212121	0.114739629302736	1.05641025641026	0.0307692307692308	0.0341880341880342	4	56	254	2090	0.900249100006515	0.587846073430236	0.193021045113389	Inf	0.615223097112861	1.23044619422572	0.496093947033905	1.26575995593154	0.410148731408574	0.962254864616933	0.382820569131667	1	113	102
TCGA-NF-A5CP-01A-12D-A28R-08	0	0	0	0	77	0	1	3	4	73	2993	1	5	2	8	696	3	1	1	5	655	6	3	22	31	819	4	3	22	29	823	1	0	0	1	116	0.012987012987013	0.0344827586206897	0.140947752126367	0.244649227110583	0.00862068965517241	1	0	0	1	98	0.012987012987013	0.032258064516129	0.11965811965812	0.269585253456221	0.0102040816326531	0.025974025974026	2	52	214	1428	0.994836221931063	0.256776850313608	0.044190018567656	Inf	0.284181377639322	1.53457943925234	0.383455323297041	1.66759869744549	0	1	0	0.333333333333333	75	71
TCGA-NG-A4VU-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	43	0	0	2	2	41	1681	0	4	0	4	378	0	1	0	1	383	4	1	9	14	446	4	3	15	22	474	1	0	4	5	61	0.116279069767442	0.227272727272727	0.128691983122363	1.76602086438152	0.0819672131147541	1	0	2	3	49	0.0697674418604651	0.214285714285714	0.109865470852018	1.95043731778426	0.0612244897959184	0.186046511627907	8	24	110	810	0.0351902145306062	2.45138040365468	1.08326505320497	Inf	2.09090909090909	2.09090909090909	0.249925587757892	2.45124451956189	2.09090909090909	0.0631851423419805	2.45133646140774	0.131934731934732	35	33
TCGA-NG-A4VW-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	61	1	3	2	5	55	2255	0	3	2	5	571	0	1	2	3	485	1	2	24	27	609	1	3	16	20	590	0	1	0	1	74	0.0163934426229508	0.05	0.125423728813559	0.398648648648649	0.0135135135135135	0	0	3	3	84	0.0491803278688525	0.111111111111111	0.137931034482759	0.805555555555555	0.0357142857142857	0.0491803278688525	3	39	158	1041	0.92637182446199	0.507036573988307	0.131348250715716	Inf	0.542043399638336	0	1	0	0.569145569620253	0.910543778417116	0.534430072098014	0.142857142857143	58	52
TCGA-QM-A5NM-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	60	0	0	2	2	58	2378	3	2	3	8	510	1	5	0	6	561	5	7	11	23	630	1	2	18	21	677	0	0	2	2	101	0.0333333333333333	0.0952380952380952	0.149187592319055	0.638378123526638	0.0198019801980198	1	1	0	2	65	0.0333333333333333	0.0869565217391304	0.103174603174603	0.842809364548495	0.0307692307692308	0.05	3	32	166	1141	0.838114777650804	0.644571260972992	0.165688363520278	Inf	0.67487091222031	1.31224899598394	0.558638782991905	1.37432109393433	0.542999584545077	0.897601973445405	0.509350322755176	1	57	55
TCGA-QN-A5NN-01A-11D-A28R-08	0	0	0	0	84	0	0	9	9	75	3075	3	8	4	15	693	2	3	3	8	727	5	5	15	25	800	4	2	21	27	855	1	0	2	3	117	0.0357142857142857	0.111111111111111	0.136842105263158	0.811965811965812	0.0256410256410256	0	0	0	0	99	0	0	0.12375	0	0	0.0357142857142857	3	42	216	1439	0.943214668957866	0.476020876016252	0.124019753054803	Inf	0.510802469135803	0.851337448559671	0.716585113190836	0.832852347713245	0.425668724279835	0.957549134872662	0.392038478193021	1	81	72
Totals	0	4	7	11	9536	29	134	369	503	9004	369164	108	544	475	1127	92688	121	559	446	1126	93398	295	955	2052	3302	90889	304	1074	2071	3449	92189	97	635	201	933	13814	0.0978397651006711	0.270513192229632	0.149844341515799	1.80529467775138	0.0675401766324019	120	575	183	878	13300	0.0920721476510067	0.265899454875833	0.146332339447018	1.81709289881275	0.066015037593985	0.0630243288590604	601	4121	27114	155964	0.999977369421176	0.838886468909633	0.779038554888642	Inf	0.859391506087667	2.44610716171121	3.80956891618142e-38	3.26756183460554	0.628869391676194	1	0.590757478278471	9.03334471322622e-14	8935	8403
