Correlation between copy number variations of arm-level result and selected clinical features
Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma (Primary solid tumor)
17 October 2014  |  analyses__2014_10_17
Maintainer Information
Citation Information
Maintained by TCGA GDAC Team (Broad Institute/MD Anderson Cancer Center/Harvard Medical School)
Cite as Broad Institute TCGA Genome Data Analysis Center (2014): Correlation between copy number variations of arm-level result and selected clinical features. Broad Institute of MIT and Harvard. doi:10.7908/C18914PN
Overview
Introduction

This pipeline computes the correlation between significant arm-level copy number variations (cnvs) and selected clinical features.

Summary

Testing the association between copy number variation 80 arm-level events and 44 clinical features across 238 patients, no significant finding detected with Q value < 0.25.

  • No arm-level cnvs related to clinical features.

Results
Overview of the results

Table 1.  Get Full Table Overview of the association between significant copy number variation of 80 arm-level events and 44 clinical features. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by Q value < 0.25, no significant finding detected.

Clinical
Features
Time
to
Death
AGE PATHOLOGY
T
STAGE
PATHOLOGY
N
STAGE
PATHOLOGY
M
STAGE
HISTOLOGICAL
TYPE
RADIATIONS
RADIATION
REGIMENINDICATION
NUMBERPACKYEARSSMOKED NUMBER
OF
LYMPH
NODES
RACE ETHNICITY WEIGHT
KG
AT
DIAGNOSIS
TUMOR
STATUS
TUMOR
SAMPLE
PROCUREMENT
COUNTRY
NEOPLASMHISTOLOGICGRADE TOBACCO
SMOKING
YEAR
STOPPED
TOBACCO
SMOKING
PACK
YEARS
SMOKED
TOBACCO
SMOKING
HISTORY
PATIENT
AGEBEGANSMOKINGINYEARS
RADIATION
TOTAL
DOSE
RADIATION
THERAPY
TYPE
RADIATION
THERAPY
STATUS
RADIATION
THERAPY
SITE
RADIATION
ADJUVANT
UNITS
PREGNANCIES
COUNT
TOTAL
PREGNANCIES
COUNT
STILLBIRTH
PATIENT
PATIENTPREGNANCYSPONTANEOUSABORTIONCOUNT
PREGNANCIES
COUNT
LIVE
BIRTH
PATIENT
PATIENTPREGNANCYTHERAPEUTICABORTIONCOUNT
PREGNANCIES
COUNT
ECTOPIC
POS
LYMPH
NODE
LOCATION
MENOPAUSE
STATUS
LYMPHOVASCULAR
INVOLVEMENT
LYMPH
NODES
EXAMINED
HE
COUNT
LYMPH
NODES
EXAMINED
KERATINIZATION
SQUAMOUS
CELL
INITIAL
PATHOLOGIC
DX
YEAR
HISTORY
HORMONAL
CONTRACEPTIVES
USE
HEIGHT
CM
AT
DIAGNOSIS
CORPUS
INVOLVEMENT
CERVIX
SUV
RESULTS
AJCC
TUMOR
PATHOLOGIC
PT
AGE
AT
DIAGNOSIS
STAGE
EVENT
CLINICAL
STAGE
nCNV (%) nWild-Type logrank test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test
1p gain 74 (31%) 164 0.559
(1.00)
0.0306
(1.00)
0.175
(1.00)
0.707
(1.00)
0.733
(1.00)
0.161
(1.00)
0.676
(1.00)
0.151
(1.00)
0.338
(1.00)
0.21
(1.00)
0.396
(1.00)
0.404
(1.00)
0.297
(1.00)
0.281
(1.00)
0.185
(1.00)
0.932
(1.00)
0.151
(1.00)
0.537
(1.00)
1
(1.00)
0.0716
(1.00)
0.288
(1.00)
1
(1.00)
0.575
(1.00)
1
(1.00)
0.126
(1.00)
0.296
(1.00)
0.821
(1.00)
0.158
(1.00)
0.506
(1.00)
0.995
(1.00)
0.548
(1.00)
0.0788
(1.00)
0.711
(1.00)
0.338
(1.00)
0.838
(1.00)
0.845
(1.00)
0.455
(1.00)
0.0547
(1.00)
0.074
(1.00)
0.553
(1.00)
0.52
(1.00)
0.235
(1.00)
0.0283
(1.00)
0.608
(1.00)
1q gain 117 (49%) 121 0.55
(1.00)
0.483
(1.00)
0.0534
(1.00)
1
(1.00)
0.777
(1.00)
0.481
(1.00)
0.437
(1.00)
0.521
(1.00)
0.93
(1.00)
0.0284
(1.00)
0.293
(1.00)
0.0746
(1.00)
0.817
(1.00)
0.409
(1.00)
0.337
(1.00)
0.819
(1.00)
0.521
(1.00)
0.874
(1.00)
0.854
(1.00)
0.299
(1.00)
0.0829
(1.00)
1
(1.00)
0.729
(1.00)
1
(1.00)
0.618
(1.00)
0.263
(1.00)
0.375
(1.00)
0.432
(1.00)
0.887
(1.00)
0.302
(1.00)
0.106
(1.00)
0.476
(1.00)
0.311
(1.00)
0.93
(1.00)
0.653
(1.00)
0.583
(1.00)
0.843
(1.00)
0.786
(1.00)
0.0521
(1.00)
1
(1.00)
0.51
(1.00)
0.0123
(1.00)
0.433
(1.00)
0.863
(1.00)
2p gain 52 (22%) 186 0.543
(1.00)
0.617
(1.00)
0.901
(1.00)
0.825
(1.00)
0.773
(1.00)
0.462
(1.00)
0.637
(1.00)
0.178
(1.00)
0.889
(1.00)
0.35
(1.00)
1
(1.00)
0.00386
(1.00)
0.408
(1.00)
0.408
(1.00)
0.671
(1.00)
0.2
(1.00)
0.178
(1.00)
0.783
(1.00)
0.705
(1.00)
0.127
(1.00)
0.403
(1.00)
1
(1.00)
0.929
(1.00)
1
(1.00)
0.73
(1.00)
0.236
(1.00)
0.323
(1.00)
0.468
(1.00)
0.502
(1.00)
0.0545
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.527
(1.00)
0.889
(1.00)
0.908
(1.00)
1
(1.00)
0.724
(1.00)
0.226
(1.00)
0.738
(1.00)
0.0852
(1.00)
0.378
(1.00)
0.538
(1.00)
0.493
(1.00)
2q gain 31 (13%) 207 0.382
(1.00)
0.717
(1.00)
1
(1.00)
0.174
(1.00)
0.49
(1.00)
0.454
(1.00)
0.776
(1.00)
0.425
(1.00)
0.0336
(1.00)
0.973
(1.00)
0.697
(1.00)
0.0759
(1.00)
0.148
(1.00)
0.481
(1.00)
0.496
(1.00)
0.033
(1.00)
0.425
(1.00)
0.433
(1.00)
0.642
(1.00)
0.996
(1.00)
0.741
(1.00)
1
(1.00)
0.84
(1.00)
0.362
(1.00)
0.266
(1.00)
0.392
(1.00)
0.605
(1.00)
0.254
(1.00)
0.996
(1.00)
0.03
(1.00)
0.739
(1.00)
0.651
(1.00)
0.0361
(1.00)
0.0336
(1.00)
0.651
(1.00)
0.775
(1.00)
0.56
(1.00)
0.748
(1.00)
0.852
(1.00)
0.062
(1.00)
0.499
(1.00)
0.879
(1.00)
0.939
(1.00)
3p gain 61 (26%) 177 0.0477
(1.00)
0.63
(1.00)
0.0664
(1.00)
0.686
(1.00)
0.639
(1.00)
0.771
(1.00)
0.655
(1.00)
0.359
(1.00)
0.848
(1.00)
0.463
(1.00)
0.758
(1.00)
0.242
(1.00)
0.11
(1.00)
0.102
(1.00)
0.148
(1.00)
0.597
(1.00)
0.359
(1.00)
0.737
(1.00)
0.563
(1.00)
0.316
(1.00)
0.537
(1.00)
0.536
(1.00)
0.542
(1.00)
0.53
(1.00)
0.953
(1.00)
0.62
(1.00)
0.979
(1.00)
0.394
(1.00)
0.596
(1.00)
0.258
(1.00)
0.28
(1.00)
0.472
(1.00)
0.836
(1.00)
0.848
(1.00)
0.677
(1.00)
0.834
(1.00)
0.316
(1.00)
0.896
(1.00)
0.693
(1.00)
0.748
(1.00)
0.284
(1.00)
0.71
(1.00)
0.665
(1.00)
0.722
(1.00)
3q gain 147 (62%) 91 0.36
(1.00)
0.805
(1.00)
0.284
(1.00)
0.0325
(1.00)
0.564
(1.00)
0.161
(1.00)
0.228
(1.00)
0.41
(1.00)
0.0386
(1.00)
0.472
(1.00)
0.795
(1.00)
0.00655
(1.00)
0.327
(1.00)
0.106
(1.00)
0.434
(1.00)
0.145
(1.00)
0.41
(1.00)
0.783
(1.00)
0.405
(1.00)
0.463
(1.00)
0.74
(1.00)
1
(1.00)
0.339
(1.00)
1
(1.00)
0.538
(1.00)
0.552
(1.00)
0.625
(1.00)
0.513
(1.00)
0.664
(1.00)
0.922
(1.00)
0.835
(1.00)
0.359
(1.00)
0.385
(1.00)
0.0386
(1.00)
0.986
(1.00)
0.852
(1.00)
0.848
(1.00)
0.574
(1.00)
0.253
(1.00)
1
(1.00)
0.468
(1.00)
0.675
(1.00)
0.281
(1.00)
4p gain 9 (4%) 229 0.764
(1.00)
0.944
(1.00)
0.256
(1.00)
0.67
(1.00)
1
(1.00)
0.376
(1.00)
1
(1.00)
0.459
(1.00)
0.201
(1.00)
1
(1.00)
0.71
(1.00)
1
(1.00)
0.79
(1.00)
0.59
(1.00)
0.826
(1.00)
0.674
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.454
(1.00)
0.158
(1.00)
0.469
(1.00)
0.681
(1.00)
0.137
(1.00)
0.266
(1.00)
0.696
(1.00)
0.584
(1.00)
0.721
(1.00)
0.678
(1.00)
0.459
(1.00)
0.387
(1.00)
1
(1.00)
0.674
(1.00)
1
(1.00)
0.57
(1.00)
1
(1.00)
0.376
(1.00)
0.968
(1.00)
0.34
(1.00)
4q gain 12 (5%) 226 0.591
(1.00)
0.386
(1.00)
0.425
(1.00)
0.724
(1.00)
0.713
(1.00)
0.368
(1.00)
0.372
(1.00)
0.56
(1.00)
0.473
(1.00)
1
(1.00)
0.92
(1.00)
1
(1.00)
0.954
(1.00)
0.597
(1.00)
0.724
(1.00)
0.959
(1.00)
0.833
(1.00)
1
(1.00)
0.23
(1.00)
0.561
(1.00)
0.681
(1.00)
0.137
(1.00)
0.547
(1.00)
0.696
(1.00)
0.584
(1.00)
1
(1.00)
0.361
(1.00)
0.719
(1.00)
0.56
(1.00)
0.979
(1.00)
0.309
(1.00)
0.927
(1.00)
0.388
(1.00)
0.502
(1.00)
1
(1.00)
0.456
(1.00)
0.369
(1.00)
0.325
(1.00)
5p gain 87 (37%) 151 0.722
(1.00)
0.779
(1.00)
0.0578
(1.00)
0.707
(1.00)
0.497
(1.00)
0.267
(1.00)
0.544
(1.00)
0.159
(1.00)
0.708
(1.00)
0.575
(1.00)
0.412
(1.00)
0.86
(1.00)
1
(1.00)
0.418
(1.00)
0.23
(1.00)
0.45
(1.00)
0.159
(1.00)
0.703
(1.00)
0.875
(1.00)
0.154
(1.00)
0.196
(1.00)
0.53
(1.00)
0.35
(1.00)
0.584
(1.00)
0.205
(1.00)
0.386
(1.00)
0.519
(1.00)
0.0851
(1.00)
0.122
(1.00)
0.715
(1.00)
0.963
(1.00)
0.557
(1.00)
0.709
(1.00)
0.708
(1.00)
0.0542
(1.00)
0.254
(1.00)
0.315
(1.00)
0.516
(1.00)
0.683
(1.00)
0.76
(1.00)
0.714
(1.00)
0.0798
(1.00)
0.643
(1.00)
0.0279
(1.00)
5q gain 36 (15%) 202 0.918
(1.00)
0.647
(1.00)
0.508
(1.00)
0.795
(1.00)
0.347
(1.00)
0.836
(1.00)
1
(1.00)
0.279
(1.00)
0.378
(1.00)
0.554
(1.00)
1
(1.00)
0.939
(1.00)
1
(1.00)
0.0992
(1.00)
0.626
(1.00)
0.235
(1.00)
0.279
(1.00)
0.907
(1.00)
0.975
(1.00)
0.135
(1.00)
0.404
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.861
(1.00)
0.84
(1.00)
0.411
(1.00)
0.721
(1.00)
0.527
(1.00)
0.198
(1.00)
0.838
(1.00)
0.0345
(1.00)
0.446
(1.00)
0.378
(1.00)
0.669
(1.00)
0.426
(1.00)
0.372
(1.00)
1
(1.00)
0.696
(1.00)
0.121
(1.00)
0.272
(1.00)
0.548
(1.00)
0.653
(1.00)
0.839
(1.00)
6p gain 44 (18%) 194 0.281
(1.00)
0.813
(1.00)
0.75
(1.00)
0.488
(1.00)
0.712
(1.00)
0.0939
(1.00)
0.127
(1.00)
0.736
(1.00)
0.457
(1.00)
0.774
(1.00)
1
(1.00)
0.791
(1.00)
0.0218
(1.00)
0.367
(1.00)
0.0406
(1.00)
0.734
(1.00)
0.736
(1.00)
0.556
(1.00)
0.513
(1.00)
0.835
(1.00)
0.0756
(1.00)
0.53
(1.00)
0.683
(1.00)
0.421
(1.00)
0.933
(1.00)
0.774
(1.00)
0.332
(1.00)
0.528
(1.00)
0.747
(1.00)
0.481
(1.00)
0.877
(1.00)
1
(1.00)
0.499
(1.00)
0.457
(1.00)
0.892
(1.00)
0.804
(1.00)
0.219
(1.00)
0.294
(1.00)
0.582
(1.00)
0.239
(1.00)
0.272
(1.00)
0.427
(1.00)
0.894
(1.00)
0.179
(1.00)
6q gain 29 (12%) 209 0.109
(1.00)
0.87
(1.00)
0.78
(1.00)
0.795
(1.00)
0.613
(1.00)
0.0271
(1.00)
0.0674
(1.00)
0.422
(1.00)
0.959
(1.00)
1
(1.00)
0.126
(1.00)
0.572
(1.00)
0.00773
(1.00)
0.262
(1.00)
0.107
(1.00)
0.884
(1.00)
0.422
(1.00)
0.357
(1.00)
0.412
(1.00)
0.222
(1.00)
0.0457
(1.00)
0.551
(1.00)
0.498
(1.00)
0.23
(1.00)
0.547
(1.00)
0.908
(1.00)
0.598
(1.00)
0.664
(1.00)
0.862
(1.00)
0.322
(1.00)
0.879
(1.00)
0.668
(1.00)
0.79
(1.00)
0.959
(1.00)
0.536
(1.00)
1
(1.00)
0.449
(1.00)
0.641
(1.00)
0.794
(1.00)
0.177
(1.00)
0.826
(1.00)
0.589
(1.00)
0.797
(1.00)
0.506
(1.00)
7p gain 32 (13%) 206 0.507
(1.00)
0.287
(1.00)
0.123
(1.00)
1
(1.00)
0.442
(1.00)
0.908
(1.00)
1
(1.00)
0.0231
(1.00)
0.25
(1.00)
0.824
(1.00)
0.433
(1.00)
0.635
(1.00)
0.184
(1.00)
0.722
(1.00)
0.529
(1.00)
0.212
(1.00)
0.0231
(1.00)
0.393
(1.00)
0.249
(1.00)
0.864
(1.00)
0.737
(1.00)
0.382
(1.00)
1
(1.00)
0.141
(1.00)
0.412
(1.00)
0.713
(1.00)
0.509
(1.00)
0.124
(1.00)
0.488
(1.00)
0.882
(1.00)
0.154
(1.00)
0.706
(1.00)
0.129
(1.00)
0.25
(1.00)
0.873
(1.00)
0.793
(1.00)
0.242
(1.00)
0.747
(1.00)
0.213
(1.00)
0.647
(1.00)
0.0281
(1.00)
0.29
(1.00)
0.227
(1.00)
7q gain 30 (13%) 208 0.536
(1.00)
0.102
(1.00)
0.184
(1.00)
1
(1.00)
0.388
(1.00)
0.736
(1.00)
0.234
(1.00)
0.226
(1.00)
0.553
(1.00)
0.486
(1.00)
0.688
(1.00)
0.898
(1.00)
1
(1.00)
0.476
(1.00)
0.401
(1.00)
0.0359
(1.00)
0.226
(1.00)
0.0827
(1.00)
0.625
(1.00)
0.881
(1.00)
0.69
(1.00)
0.53
(1.00)
0.894
(1.00)
0.53
(1.00)
0.934
(1.00)
0.778
(1.00)
0.401
(1.00)
0.596
(1.00)
0.181
(1.00)
0.217
(1.00)
0.828
(1.00)
0.814
(1.00)
0.366
(1.00)
0.553
(1.00)
0.688
(1.00)
1
(1.00)
0.05
(1.00)
0.899
(1.00)
0.729
(1.00)
1
(1.00)
0.199
(1.00)
0.106
(1.00)
0.929
(1.00)
8p gain 39 (16%) 199 0.746
(1.00)
0.0671
(1.00)
0.0534
(1.00)
1
(1.00)
0.258
(1.00)
0.856
(1.00)
1
(1.00)
0.59
(1.00)
0.815
(1.00)
0.733
(1.00)
0.475
(1.00)
0.746
(1.00)
1
(1.00)
0.16
(1.00)
0.964
(1.00)
0.856
(1.00)
0.59
(1.00)
0.481
(1.00)
0.417
(1.00)
0.00588
(1.00)
0.207
(1.00)
1
(1.00)
0.602
(1.00)
0.298
(1.00)
0.0617
(1.00)
0.394
(1.00)
0.852
(1.00)
0.349
(1.00)
0.0632
(1.00)
0.955
(1.00)
0.294
(1.00)
0.338
(1.00)
0.649
(1.00)
0.815
(1.00)
0.185
(1.00)
0.815
(1.00)
0.814
(1.00)
0.299
(1.00)
0.989
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
0.0767
(1.00)
0.0609
(1.00)
0.72
(1.00)
8q gain 66 (28%) 172 0.997
(1.00)
0.0551
(1.00)
0.0214
(1.00)
0.436
(1.00)
0.781
(1.00)
0.163
(1.00)
0.387
(1.00)
0.955
(1.00)
0.61
(1.00)
0.84
(1.00)
0.56
(1.00)
0.932
(1.00)
0.797
(1.00)
0.735
(1.00)
0.919
(1.00)
0.306
(1.00)
0.955
(1.00)
0.845
(1.00)
0.159
(1.00)
0.00921
(1.00)
0.576
(1.00)
0.53
(1.00)
0.639
(1.00)
0.141
(1.00)
0.796
(1.00)
0.66
(1.00)
0.417
(1.00)
0.773
(1.00)
0.226
(1.00)
0.768
(1.00)
0.129
(1.00)
0.676
(1.00)
0.427
(1.00)
0.61
(1.00)
0.218
(1.00)
0.693
(1.00)
0.456
(1.00)
0.136
(1.00)
0.971
(1.00)
0.748
(1.00)
0.721
(1.00)
0.0736
(1.00)
0.0489
(1.00)
0.324
(1.00)
9p gain 39 (16%) 199 0.963
(1.00)
0.0728
(1.00)
0.172
(1.00)
0.224
(1.00)
0.886
(1.00)
0.973
(1.00)
0.185
(1.00)
0.378
(1.00)
0.115
(1.00)
0.0997
(1.00)
0.109
(1.00)
0.81
(1.00)
0.0184
(1.00)
0.254
(1.00)
0.845
(1.00)
0.0319
(1.00)
0.378
(1.00)
0.0277
(1.00)
0.231
(1.00)
0.814
(1.00)
0.0187
(1.00)
1
(1.00)
0.837
(1.00)
0.278
(1.00)
0.922
(1.00)
0.861
(1.00)
0.193
(1.00)
0.0404
(1.00)
0.403
(1.00)
0.11
(1.00)
0.78
(1.00)
0.455
(1.00)
0.817
(1.00)
0.115
(1.00)
0.733
(1.00)
0.0591
(1.00)
0.475
(1.00)
0.74
(1.00)
0.457
(1.00)
0.206
(1.00)
0.933
(1.00)
0.0726
(1.00)
0.0604
(1.00)
0.398
(1.00)
9q gain 37 (16%) 201 0.908
(1.00)
0.105
(1.00)
0.186
(1.00)
0.141
(1.00)
0.824
(1.00)
0.454
(1.00)
0.186
(1.00)
0.254
(1.00)
0.0754
(1.00)
0.128
(1.00)
0.109
(1.00)
0.974
(1.00)
0.175
(1.00)
0.264
(1.00)
0.733
(1.00)
0.0136
(1.00)
0.254
(1.00)
0.00733
(1.00)
0.486
(1.00)
0.902
(1.00)
0.00472
(1.00)
1
(1.00)
0.358
(1.00)
0.205
(1.00)
0.351
(1.00)
0.955
(1.00)
0.0679
(1.00)
0.000992
(1.00)
0.59
(1.00)
0.163
(1.00)
0.891
(1.00)
0.68
(1.00)
1
(1.00)
0.0754
(1.00)
0.738
(1.00)
0.137
(1.00)
0.998
(1.00)
0.448
(1.00)
0.147
(1.00)
0.349
(1.00)
0.8
(1.00)
0.106
(1.00)
0.143
(1.00)
0.337
(1.00)
10p gain 20 (8%) 218 0.73
(1.00)
0.663
(1.00)
0.0656
(1.00)
0.53
(1.00)
0.628
(1.00)
0.804
(1.00)
1
(1.00)
0.409
(1.00)
0.157
(1.00)
1
(1.00)
0.366
(1.00)
0.293
(1.00)
1
(1.00)
0.692
(1.00)
0.598
(1.00)
0.376
(1.00)
0.409
(1.00)
0.385
(1.00)
0.0627
(1.00)
0.408
(1.00)
0.64
(1.00)
1
(1.00)
0.163
(1.00)
1
(1.00)
0.662
(1.00)
0.508
(1.00)
1
(1.00)
0.368
(1.00)
0.459
(1.00)
0.384
(1.00)
1
(1.00)
0.582
(1.00)
0.532
(1.00)
0.157
(1.00)
0.564
(1.00)
0.0358
(1.00)
0.143
(1.00)
0.867
(1.00)
0.768
(1.00)
0.349
(1.00)
0.814
(1.00)
0.703
(1.00)
0.845
(1.00)
10q gain 12 (5%) 226 0.765
(1.00)
0.921
(1.00)
0.0651
(1.00)
1
(1.00)
0.0908
(1.00)
0.365
(1.00)
1
(1.00)
0.0326
(1.00)
0.881
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.233
(1.00)
0.649
(1.00)
0.29
(1.00)
0.245
(1.00)
0.0326
(1.00)
0.748
(1.00)
0.659
(1.00)
0.883
(1.00)
0.668
(1.00)
1
(1.00)
0.456
(1.00)
1
(1.00)
0.455
(1.00)
0.583
(1.00)
0.449
(1.00)
0.311
(1.00)
0.653
(1.00)
0.469
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.678
(1.00)
0.881
(1.00)
0.898
(1.00)
0.0914
(1.00)
0.203
(1.00)
1
(1.00)
0.214
(1.00)
1
(1.00)
0.215
(1.00)
0.892
(1.00)
0.906
(1.00)
11p gain 8 (3%) 230 0.838
(1.00)
0.035
(1.00)
0.0335
(1.00)
0.634
(1.00)
0.183
(1.00)
0.587
(1.00)
0.266
(1.00)
0.203
(1.00)
1
(1.00)
0.338
(1.00)
0.134
(1.00)
0.455
(1.00)
0.687
(1.00)
0.782
(1.00)
0.101
(1.00)
0.773
(1.00)
0.0914
(1.00)
1
(1.00)
0.65
(1.00)
0.23
(1.00)
0.437
(1.00)
0.618
(1.00)
0.777
(1.00)
0.607
(1.00)
0.15
(1.00)
0.678
(1.00)
0.203
(1.00)
0.69
(1.00)
0.531
(1.00)
0.926
(1.00)
0.0622
(1.00)
0.528
(1.00)
1
(1.00)
0.00378
(1.00)
0.0319
(1.00)
0.518
(1.00)
11q gain 7 (3%) 231 0.646
(1.00)
0.0758
(1.00)
0.381
(1.00)
0.363
(1.00)
0.181
(1.00)
0.527
(1.00)
0.216
(1.00)
0.0331
(1.00)
0.799
(1.00)
0.403
(1.00)
0.525
(1.00)
1
(1.00)
0.42
(1.00)
0.0391
(1.00)
0.0848
(1.00)
0.762
(1.00)
0.0365
(1.00)
1
(1.00)
0.0811
(1.00)
0.341
(1.00)
0.903
(1.00)
0.624
(1.00)
0.607
(1.00)
0.289
(1.00)
1
(1.00)
0.0331
(1.00)
0.302
(1.00)
1
(1.00)
0.558
(1.00)
0.581
(1.00)
1
(1.00)
0.0235
(1.00)
0.131
(1.00)
0.592
(1.00)
12p gain 44 (18%) 194 0.33
(1.00)
0.0553
(1.00)
0.305
(1.00)
0.666
(1.00)
0.408
(1.00)
0.887
(1.00)
0.456
(1.00)
0.0015
(1.00)
0.957
(1.00)
0.7
(1.00)
0.739
(1.00)
0.226
(1.00)
1
(1.00)
0.782
(1.00)
0.627
(1.00)
0.415
(1.00)
0.0015
(1.00)
0.072
(1.00)
0.198
(1.00)
0.592
(1.00)
0.843
(1.00)
0.551
(1.00)
0.28
(1.00)
1
(1.00)
0.063
(1.00)
0.861
(1.00)
0.679
(1.00)
0.0526
(1.00)
0.465
(1.00)
0.106
(1.00)
0.738
(1.00)
0.516
(1.00)
0.524
(1.00)
0.957
(1.00)
0.483
(1.00)
0.0622
(1.00)
0.843
(1.00)
1
(1.00)
0.808
(1.00)
1
(1.00)
0.817
(1.00)
0.0264
(1.00)
0.0705
(1.00)
0.703
(1.00)
12q gain 41 (17%) 197 0.686
(1.00)
0.0679
(1.00)
0.553
(1.00)
1
(1.00)
0.761
(1.00)
0.671
(1.00)
0.192
(1.00)
0.0108
(1.00)
0.925
(1.00)
0.717
(1.00)
1
(1.00)
0.0967
(1.00)
1
(1.00)
0.615
(1.00)
0.286
(1.00)
0.336
(1.00)
0.0108
(1.00)
0.12
(1.00)
0.169
(1.00)
0.67
(1.00)
0.406
(1.00)
0.536
(1.00)
0.6
(1.00)
0.53
(1.00)
0.098
(1.00)
1
(1.00)
0.827
(1.00)
0.0639
(1.00)
0.782
(1.00)
0.0495
(1.00)
1
(1.00)
0.309
(1.00)
1
(1.00)
0.925
(1.00)
0.648
(1.00)
0.111
(1.00)
0.965
(1.00)
0.925
(1.00)
0.628
(1.00)
1
(1.00)
0.817
(1.00)
0.224
(1.00)
0.0751
(1.00)
0.61
(1.00)
13q gain 21 (9%) 217 0.00503
(1.00)
0.812
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.433
(1.00)
0.0124
(1.00)
1
(1.00)
0.738
(1.00)
0.448
(1.00)
0.892
(1.00)
0.365
(1.00)
0.405
(1.00)
0.0728
(1.00)
0.0558
(1.00)
0.902
(1.00)
0.738
(1.00)
0.423
(1.00)
0.513
(1.00)
0.417
(1.00)
0.808
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.36
(1.00)
0.476
(1.00)
0.167
(1.00)
0.697
(1.00)
0.145
(1.00)
0.785
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.448
(1.00)
0.564
(1.00)
0.725
(1.00)
0.672
(1.00)
0.533
(1.00)
0.664
(1.00)
0.605
(1.00)
0.809
(1.00)
0.852
(1.00)
0.95
(1.00)
14q gain 35 (15%) 203 0.908
(1.00)
0.173
(1.00)
0.943
(1.00)
0.467
(1.00)
0.198
(1.00)
0.687
(1.00)
0.783
(1.00)
0.45
(1.00)
0.548
(1.00)
0.37
(1.00)
0.737
(1.00)
0.0936
(1.00)
0.207
(1.00)
0.217
(1.00)
0.635
(1.00)
0.605
(1.00)
0.45
(1.00)
0.311
(1.00)
0.954
(1.00)
0.983
(1.00)
0.621
(1.00)
1
(1.00)
0.769
(1.00)
0.362
(1.00)
0.376
(1.00)
0.269
(1.00)
0.538
(1.00)
0.484
(1.00)
0.148
(1.00)
0.752
(1.00)
0.83
(1.00)
0.151
(1.00)
0.816
(1.00)
0.548
(1.00)
0.858
(1.00)
0.608
(1.00)
0.296
(1.00)
0.0398
(1.00)
0.996
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.509
(1.00)
0.142
(1.00)
0.74
(1.00)
15q gain 45 (19%) 193 0.44
(1.00)
0.208
(1.00)
0.0129
(1.00)
0.65
(1.00)
0.378
(1.00)
0.107
(1.00)
0.466
(1.00)
0.088
(1.00)
0.636
(1.00)
0.386
(1.00)
0.517
(1.00)
0.978
(1.00)
0.566
(1.00)
0.85
(1.00)
0.903
(1.00)
0.586
(1.00)
0.088
(1.00)
0.677
(1.00)
0.781
(1.00)
0.732
(1.00)
0.804
(1.00)
1
(1.00)
0.673
(1.00)
1
(1.00)
0.224
(1.00)
0.445
(1.00)
0.994
(1.00)
0.274
(1.00)
0.887
(1.00)
0.481
(1.00)
0.779
(1.00)
0.263
(1.00)
1
(1.00)
0.636
(1.00)
0.96
(1.00)
0.461
(1.00)
0.753
(1.00)
0.594
(1.00)
0.43
(1.00)
0.707
(1.00)
0.00407
(1.00)
0.172
(1.00)
0.19
(1.00)
16p gain 33 (14%) 205 0.788
(1.00)
0.878
(1.00)
0.451
(1.00)
0.159
(1.00)
0.208
(1.00)
0.786
(1.00)
1
(1.00)
0.368
(1.00)
0.16
(1.00)
0.594
(1.00)
0.702
(1.00)
0.583
(1.00)
0.116
(1.00)
0.114
(1.00)
0.977
(1.00)
0.273
(1.00)
0.368
(1.00)
0.561
(1.00)
0.7
(1.00)
0.333
(1.00)
0.658
(1.00)
1
(1.00)
0.455
(1.00)
1
(1.00)
0.049
(1.00)
0.955
(1.00)
0.433
(1.00)
0.284
(1.00)
0.937
(1.00)
0.0202
(1.00)
1
(1.00)
0.549
(1.00)
0.816
(1.00)
0.16
(1.00)
0.525
(1.00)
0.21
(1.00)
0.526
(1.00)
0.433
(1.00)
0.785
(1.00)
0.109
(1.00)
0.325
(1.00)
0.869
(1.00)
0.612
(1.00)
16q gain 29 (12%) 209 0.466
(1.00)
0.535
(1.00)
0.209
(1.00)
0.461
(1.00)
0.0462
(1.00)
0.657
(1.00)
0.77
(1.00)
0.673
(1.00)
0.524
(1.00)
0.484
(1.00)
0.697
(1.00)
0.433
(1.00)
0.184
(1.00)
0.0758
(1.00)
0.296
(1.00)
0.273
(1.00)
0.673
(1.00)
0.587
(1.00)
0.366
(1.00)
0.978
(1.00)
0.961
(1.00)
1
(1.00)
0.46
(1.00)
1
(1.00)
0.0442
(1.00)
0.778
(1.00)
0.366
(1.00)
0.086
(1.00)
0.853
(1.00)
0.0835
(1.00)
0.878
(1.00)
0.581
(1.00)
0.802
(1.00)
0.524
(1.00)
0.464
(1.00)
0.213
(1.00)
0.339
(1.00)
1
(1.00)
0.554
(1.00)
0.647
(1.00)
0.0555
(1.00)
0.542
(1.00)
0.149
(1.00)
17p gain 18 (8%) 220 0.826
(1.00)
0.532
(1.00)
0.0258
(1.00)
0.164
(1.00)
0.0332
(1.00)
0.679
(1.00)
0.257
(1.00)
0.0438
(1.00)
0.754
(1.00)
1
(1.00)
0.822
(1.00)
0.372
(1.00)
0.467
(1.00)
0.584
(1.00)
0.197
(1.00)
0.348
(1.00)
0.306
(1.00)
1
(1.00)
0.771
(1.00)
0.298
(1.00)
0.0578
(1.00)
0.508
(1.00)
0.691
(1.00)
0.513
(1.00)
0.129
(1.00)
0.0634
(1.00)
0.539
(1.00)
0.343
(1.00)
0.493
(1.00)
0.0438
(1.00)
0.221
(1.00)
0.678
(1.00)
0.529
(1.00)
0.537
(1.00)
0.604
(1.00)
0.351
(1.00)
0.03
(1.00)
0.581
(1.00)
0.188
(1.00)
17q gain 36 (15%) 202 0.489
(1.00)
0.672
(1.00)
0.0234
(1.00)
0.302
(1.00)
0.817
(1.00)
0.457
(1.00)
1
(1.00)
0.0208
(1.00)
0.135
(1.00)
0.619
(1.00)
0.256
(1.00)
0.135
(1.00)
0.348
(1.00)
0.752
(1.00)
0.0635
(1.00)
0.0208
(1.00)
0.0759
(1.00)
0.568
(1.00)
0.029
(1.00)
0.707
(1.00)
1
(1.00)
0.898
(1.00)
0.53
(1.00)
0.0615
(1.00)
0.369
(1.00)
0.14
(1.00)
0.161
(1.00)
0.282
(1.00)
0.337
(1.00)
0.666
(1.00)
0.61
(1.00)
0.47
(1.00)
0.135
(1.00)
0.546
(1.00)
0.776
(1.00)
0.433
(1.00)
0.39
(1.00)
0.019
(1.00)
0.261
(1.00)
0.396
(1.00)
0.00433
(1.00)
0.733
(1.00)
0.0844
(1.00)
18p gain 34 (14%) 204 0.462
(1.00)
0.0566
(1.00)
0.127
(1.00)
0.312
(1.00)
0.222
(1.00)
0.207
(1.00)
0.779
(1.00)
0.757
(1.00)
0.283
(1.00)
0.977
(1.00)
0.451
(1.00)
0.275
(1.00)
0.503
(1.00)
0.69
(1.00)
0.335
(1.00)
0.098
(1.00)
0.757
(1.00)
0.164
(1.00)
0.313
(1.00)
0.0223
(1.00)
0.53
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.53
(1.00)
0.282
(1.00)
0.126
(1.00)
0.169
(1.00)
0.144
(1.00)
1
(1.00)
0.217
(1.00)
0.423
(1.00)
0.509
(1.00)
0.62
(1.00)
0.283
(1.00)
0.834
(1.00)
1
(1.00)
0.288
(1.00)
0.272
(1.00)
0.265
(1.00)
1
(1.00)
0.316
(1.00)
0.184
(1.00)
0.0682
(1.00)
0.764
(1.00)
18q gain 21 (9%) 217 0.751
(1.00)
0.0956
(1.00)
0.0119
(1.00)
0.756
(1.00)
0.367
(1.00)
0.655
(1.00)
0.315
(1.00)
0.928
(1.00)
0.843
(1.00)
0.495
(1.00)
0.629
(1.00)
0.412
(1.00)
0.649
(1.00)
0.64
(1.00)
0.367
(1.00)
0.321
(1.00)
0.928
(1.00)
0.0327
(1.00)
0.0708
(1.00)
0.188
(1.00)
0.0451
(1.00)
1
(1.00)
0.84
(1.00)
0.421
(1.00)
0.179
(1.00)
0.499
(1.00)
0.506
(1.00)
0.165
(1.00)
0.92
(1.00)
0.317
(1.00)
0.351
(1.00)
0.499
(1.00)
0.362
(1.00)
0.843
(1.00)
0.826
(1.00)
0.368
(1.00)
0.159
(1.00)
0.813
(1.00)
0.936
(1.00)
1
(1.00)
0.316
(1.00)
0.0436
(1.00)
0.108
(1.00)
0.664
(1.00)
19p gain 39 (16%) 199 0.261
(1.00)
0.691
(1.00)
0.0069
(1.00)
0.054
(1.00)
1
(1.00)
0.769
(1.00)
0.292
(1.00)
0.232
(1.00)
0.0611
(1.00)
0.573
(1.00)
0.472
(1.00)
0.607
(1.00)
1
(1.00)
0.241
(1.00)
0.833
(1.00)
0.876
(1.00)
0.232
(1.00)
0.00158
(1.00)
0.869
(1.00)
0.422
(1.00)
0.789
(1.00)
0.53
(1.00)
0.331
(1.00)
1
(1.00)
0.383
(1.00)
0.899
(1.00)
0.24
(1.00)
0.0607
(1.00)
0.815
(1.00)
0.18
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.103
(1.00)
0.0611
(1.00)
0.117
(1.00)
0.0478
(1.00)
0.709
(1.00)
0.714
(1.00)
0.779
(1.00)
0.21
(1.00)
0.353
(1.00)
0.0563
(1.00)
0.584
(1.00)
0.136
(1.00)
19q gain 58 (24%) 180 0.916
(1.00)
0.335
(1.00)
0.0721
(1.00)
0.679
(1.00)
0.346
(1.00)
0.531
(1.00)
0.0412
(1.00)
0.0193
(1.00)
0.629
(1.00)
0.624
(1.00)
0.123
(1.00)
0.654
(1.00)
0.197
(1.00)
0.104
(1.00)
0.501
(1.00)
0.459
(1.00)
0.0193
(1.00)
0.0351
(1.00)
0.398
(1.00)
0.348
(1.00)
0.377
(1.00)
0.543
(1.00)
0.13
(1.00)
0.538
(1.00)
0.085
(1.00)
0.571
(1.00)
0.159
(1.00)
0.0157
(1.00)
0.513
(1.00)
0.311
(1.00)
0.884
(1.00)
1
(1.00)
0.159
(1.00)
0.629
(1.00)
0.583
(1.00)
0.298
(1.00)
0.48
(1.00)
0.695
(1.00)
0.369
(1.00)
1
(1.00)
0.447
(1.00)
0.616
(1.00)
0.37
(1.00)
0.426
(1.00)
20p gain 81 (34%) 157 0.634
(1.00)
0.202
(1.00)
0.0629
(1.00)
0.0153
(1.00)
0.713
(1.00)
0.855
(1.00)
1
(1.00)
0.99
(1.00)
0.0129
(1.00)
0.262
(1.00)
0.582
(1.00)
0.132
(1.00)
0.625
(1.00)
0.634
(1.00)
0.124
(1.00)
0.845
(1.00)
0.99
(1.00)
0.461
(1.00)
0.437
(1.00)
0.786
(1.00)
0.749
(1.00)
0.53
(1.00)
0.28
(1.00)
0.537
(1.00)
0.547
(1.00)
0.359
(1.00)
0.5
(1.00)
0.856
(1.00)
0.818
(1.00)
0.857
(1.00)
0.415
(1.00)
0.698
(1.00)
0.591
(1.00)
0.0129
(1.00)
0.989
(1.00)
0.428
(1.00)
0.561
(1.00)
0.735
(1.00)
0.495
(1.00)
1
(1.00)
0.673
(1.00)
0.245
(1.00)
0.189
(1.00)
0.86
(1.00)
20q gain 94 (39%) 144 0.494
(1.00)
0.338
(1.00)
0.166
(1.00)
0.211
(1.00)
0.572
(1.00)
0.731
(1.00)
1
(1.00)
0.689
(1.00)
0.124
(1.00)
0.147
(1.00)
0.601
(1.00)
0.0687
(1.00)
1
(1.00)
0.23
(1.00)
0.212
(1.00)
0.876
(1.00)
0.689
(1.00)
0.234
(1.00)
0.537
(1.00)
0.573
(1.00)
0.759
(1.00)
0.543
(1.00)
0.896
(1.00)
1
(1.00)
0.778
(1.00)
0.485
(1.00)
0.539
(1.00)
0.461
(1.00)
0.635
(1.00)
0.0973
(1.00)
0.468
(1.00)
0.787
(1.00)
0.728
(1.00)
0.124
(1.00)
0.824
(1.00)
0.128
(1.00)
0.863
(1.00)
0.489
(1.00)
0.826
(1.00)
1
(1.00)
0.213
(1.00)
0.143
(1.00)
0.229
(1.00)
0.395
(1.00)
21q gain 31 (13%) 207 0.107
(1.00)
0.219
(1.00)
0.181
(1.00)
1
(1.00)
0.409
(1.00)
0.581
(1.00)
0.561
(1.00)
0.227
(1.00)
0.821
(1.00)
0.838
(1.00)
0.416
(1.00)
0.663
(1.00)
0.0597
(1.00)
0.467
(1.00)
0.491
(1.00)
0.667
(1.00)
0.227
(1.00)
0.224
(1.00)
0.213
(1.00)
0.278
(1.00)
0.783
(1.00)
0.382
(1.00)
0.77
(1.00)
0.23
(1.00)
0.759
(1.00)
0.269
(1.00)
0.749
(1.00)
0.951
(1.00)
0.596
(1.00)
0.752
(1.00)
0.406
(1.00)
0.0479
(1.00)
0.62
(1.00)
0.821
(1.00)
0.683
(1.00)
0.0366
(1.00)
0.7
(1.00)
0.258
(1.00)
0.335
(1.00)
1
(1.00)
0.942
(1.00)
0.0999
(1.00)
0.239
(1.00)
0.291
(1.00)
22q gain 26 (11%) 212 0.194
(1.00)
0.422
(1.00)
0.69
(1.00)
0.77
(1.00)
1
(1.00)
0.906
(1.00)
0.753
(1.00)
0.389
(1.00)
0.415
(1.00)
0.297
(1.00)
1
(1.00)
0.534
(1.00)
0.692
(1.00)
0.195
(1.00)
0.497
(1.00)
0.542
(1.00)
0.389
(1.00)
0.913
(1.00)
0.832
(1.00)
1
(1.00)
0.563
(1.00)
1
(1.00)
0.649
(1.00)
1
(1.00)
0.934
(1.00)
0.574
(1.00)
0.201
(1.00)
0.852
(1.00)
0.822
(1.00)
0.974
(1.00)
0.287
(1.00)
0.652
(1.00)
1
(1.00)
0.415
(1.00)
0.836
(1.00)
1
(1.00)
0.873
(1.00)
0.22
(1.00)
0.959
(1.00)
0.592
(1.00)
0.487
(1.00)
0.508
(1.00)
0.37
(1.00)
0.714
(1.00)
xq gain 33 (14%) 205 0.141
(1.00)
0.551
(1.00)
0.00529
(1.00)
0.593
(1.00)
0.811
(1.00)
0.842
(1.00)
1
(1.00)
0.315
(1.00)
0.249
(1.00)
0.149
(1.00)
0.227
(1.00)
0.291
(1.00)
0.34
(1.00)
0.388
(1.00)
0.428
(1.00)
0.129
(1.00)
0.315
(1.00)
0.76
(1.00)
0.53
(1.00)
0.596
(1.00)
0.973
(1.00)
0.382
(1.00)
0.579
(1.00)
1
(1.00)
0.192
(1.00)
0.778
(1.00)
0.401
(1.00)
0.0244
(1.00)
0.464
(1.00)
0.746
(1.00)
0.643
(1.00)
0.535
(1.00)
0.606
(1.00)
0.249
(1.00)
0.214
(1.00)
0.117
(1.00)
0.276
(1.00)
0.529
(1.00)
0.269
(1.00)
0.21
(1.00)
0.0415
(1.00)
0.607
(1.00)
0.565
(1.00)
1p loss 11 (5%) 227 0.667
(1.00)
0.438
(1.00)
0.192
(1.00)
1
(1.00)
0.0373
(1.00)
0.642
(1.00)
0.148
(1.00)
0.864
(1.00)
0.905
(1.00)
0.139
(1.00)
0.554
(1.00)
1
(1.00)
0.529
(1.00)
0.506
(1.00)
0.137
(1.00)
0.792
(1.00)
0.125
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.23
(1.00)
0.0104
(1.00)
0.583
(1.00)
0.107
(1.00)
0.0371
(1.00)
0.224
(1.00)
0.433
(1.00)
0.772
(1.00)
0.362
(1.00)
0.864
(1.00)
0.727
(1.00)
0.0294
(1.00)
0.108
(1.00)
0.282
(1.00)
0.212
(1.00)
1
(1.00)
0.0816
(1.00)
0.466
(1.00)
0.453
(1.00)
1q loss 9 (4%) 229 0.587
(1.00)
0.639
(1.00)
0.507
(1.00)
0.363
(1.00)
0.348
(1.00)
0.558
(1.00)
0.0166
(1.00)
0.427
(1.00)
0.259
(1.00)
0.222
(1.00)
0.566
(1.00)
0.595
(1.00)
0.649
(1.00)
1
(1.00)
0.934
(1.00)
0.427
(1.00)
0.102
(1.00)
0.616
(1.00)
0.826
(1.00)
0.00458
(1.00)
1
(1.00)
0.312
(1.00)
0.23
(1.00)
0.0222
(1.00)
0.544
(1.00)
0.332
(1.00)
0.128
(1.00)
0.0609
(1.00)
0.56
(1.00)
1
(1.00)
0.365
(1.00)
0.678
(1.00)
0.259
(1.00)
0.0998
(1.00)
0.178
(1.00)
0.0663
(1.00)
0.2
(1.00)
0.27
(1.00)
1
(1.00)
0.326
(1.00)
0.604
(1.00)
0.704
(1.00)
2p loss 15 (6%) 223 0.82
(1.00)
0.325
(1.00)
0.773
(1.00)
0.734
(1.00)
0.876
(1.00)
0.534
(1.00)
1
(1.00)
0.909
(1.00)
0.794
(1.00)
0.6
(1.00)
0.123
(1.00)
1
(1.00)
0.63
(1.00)
0.967
(1.00)
0.377
(1.00)
0.671
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.144
(1.00)
0.341
(1.00)
0.162
(1.00)
0.677
(1.00)
0.094
(1.00)
0.677
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.322
(1.00)
0.909
(1.00)
0.019
(1.00)
0.517
(1.00)
0.273
(1.00)
0.713
(1.00)
0.32
(1.00)
1
(1.00)
0.685
(1.00)
0.359
(1.00)
0.451
(1.00)
2q loss 27 (11%) 211 0.885
(1.00)
0.448
(1.00)
0.928
(1.00)
0.806
(1.00)
0.347
(1.00)
0.788
(1.00)
0.353
(1.00)
0.28
(1.00)
0.593
(1.00)
0.947
(1.00)
0.227
(1.00)
0.277
(1.00)
0.723
(1.00)
0.458
(1.00)
0.477
(1.00)
0.28
(1.00)
0.115
(1.00)
0.268
(1.00)
0.521
(1.00)
1
(1.00)
0.339
(1.00)
1
(1.00)
0.17
(1.00)
0.778
(1.00)
0.406
(1.00)
0.757
(1.00)
0.0666
(1.00)
0.811
(1.00)
1
(1.00)
0.307
(1.00)
0.203
(1.00)
0.593
(1.00)
0.00348
(1.00)
0.795
(1.00)
0.885
(1.00)
1
(1.00)
0.109
(1.00)
0.209
(1.00)
0.916
(1.00)
0.497
(1.00)
0.415
(1.00)
3p loss 67 (28%) 171 0.911
(1.00)
0.531
(1.00)
0.51
(1.00)
0.00143
(1.00)
0.722
(1.00)
0.00343
(1.00)
0.132
(1.00)
0.73
(1.00)
0.00123
(1.00)
0.784
(1.00)
1
(1.00)
0.938
(1.00)
1
(1.00)
0.938
(1.00)
0.817
(1.00)
0.469
(1.00)
0.73
(1.00)
0.0114
(1.00)
0.745
(1.00)
0.685
(1.00)
0.478
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.618
(1.00)
0.495
(1.00)
0.932
(1.00)
0.633
(1.00)
0.823
(1.00)
0.0398
(1.00)
0.135
(1.00)
0.665
(1.00)
0.00411
(1.00)
0.00123
(1.00)
0.744
(1.00)
0.329
(1.00)
0.155
(1.00)
0.248
(1.00)
0.0848
(1.00)
0.35
(1.00)
0.0142
(1.00)
0.575
(1.00)
0.448
(1.00)
0.464
(1.00)
3q loss 10 (4%) 228 0.302
(1.00)
0.762
(1.00)
0.503
(1.00)
1
(1.00)
0.587
(1.00)
0.222
(1.00)
0.619
(1.00)
0.0794
(1.00)
0.789
(1.00)
0.656
(1.00)
1
(1.00)
0.178
(1.00)
1
(1.00)
0.743
(1.00)
0.381
(1.00)
0.0794
(1.00)
0.503
(1.00)
0.976
(1.00)
0.318
(1.00)
0.831
(1.00)
1
(1.00)
0.67
(1.00)
0.681
(1.00)
0.635
(1.00)
0.522
(1.00)
0.304
(1.00)
0.3
(1.00)
0.827
(1.00)
0.366
(1.00)
0.789
(1.00)
0.74
(1.00)
0.461
(1.00)
0.834
(1.00)
0.695
(1.00)
0.16
(1.00)
0.394
(1.00)
0.205
(1.00)
0.791
(1.00)
0.248
(1.00)
4p loss 104 (44%) 134 0.476
(1.00)
0.635
(1.00)
0.738
(1.00)
0.00455
(1.00)
0.848
(1.00)
0.0005
(1.00)
0.325
(1.00)
0.553
(1.00)
0.00531
(1.00)
0.391
(1.00)
0.0604
(1.00)
0.0587
(1.00)
0.349
(1.00)
0.513
(1.00)
0.101
(1.00)
0.859
(1.00)
0.553
(1.00)
0.374
(1.00)
0.94
(1.00)
0.0056
(1.00)
0.351
(1.00)
0.583
(1.00)
0.0226
(1.00)
1
(1.00)
0.59
(1.00)
0.255
(1.00)
0.919
(1.00)
0.196
(1.00)
0.25
(1.00)
0.985
(1.00)
0.782
(1.00)
0.524
(1.00)
0.171
(1.00)
0.00531
(1.00)
0.429
(1.00)
0.462
(1.00)
0.0903
(1.00)
0.921
(1.00)
0.247
(1.00)
1
(1.00)
0.52
(1.00)
0.525
(1.00)
0.637
(1.00)
0.489
(1.00)
4q loss 76 (32%) 162 0.0999
(1.00)
0.661
(1.00)
0.171
(1.00)
0.00534
(1.00)
0.154
(1.00)
0.118
(1.00)
0.537
(1.00)
0.432
(1.00)
0.00792
(1.00)
0.345
(1.00)
0.398
(1.00)
0.0664
(1.00)
0.603
(1.00)
0.0826
(1.00)
0.00045
(1.00)
0.768
(1.00)
0.432
(1.00)
0.154
(1.00)
0.837
(1.00)
0.0229
(1.00)
0.156
(1.00)
0.543
(1.00)
0.0275
(1.00)
0.604
(1.00)
0.223
(1.00)
0.698
(1.00)
0.286
(1.00)
0.145
(1.00)
0.165
(1.00)
0.71
(1.00)
0.604
(1.00)
0.861
(1.00)
0.343
(1.00)
0.00792
(1.00)
0.524
(1.00)
0.7
(1.00)
0.196
(1.00)
0.434
(1.00)
0.806
(1.00)
1
(1.00)
0.0372
(1.00)
0.129
(1.00)
0.701
(1.00)
0.578
(1.00)
5p loss 17 (7%) 221 0.0203
(1.00)
0.573
(1.00)
0.0148
(1.00)
0.185
(1.00)
0.336
(1.00)
0.358
(1.00)
0.0468
(1.00)
0.577
(1.00)
0.0371
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.429
(1.00)
0.0122
(1.00)
0.762
(1.00)
0.836
(1.00)
0.577
(1.00)
0.0515
(1.00)
0.791
(1.00)
0.471
(1.00)
0.0111
(1.00)
0.459
(1.00)
0.311
(1.00)
0.298
(1.00)
0.131
(1.00)
0.476
(1.00)
0.443
(1.00)
0.767
(1.00)
0.0171
(1.00)
0.785
(1.00)
0.861
(1.00)
0.301
(1.00)
0.166
(1.00)
0.0371
(1.00)
0.808
(1.00)
0.286
(1.00)
0.235
(1.00)
0.818
(1.00)
0.578
(1.00)
1
(1.00)
0.234
(1.00)
0.614
(1.00)
0.305
(1.00)
5q loss 45 (19%) 193 0.214
(1.00)
0.505
(1.00)
0.53
(1.00)
0.66
(1.00)
0.72
(1.00)
0.501
(1.00)
0.316
(1.00)
0.217
(1.00)
0.147
(1.00)
0.845
(1.00)
0.739
(1.00)
0.311
(1.00)
0.0119
(1.00)
0.48
(1.00)
0.216
(1.00)
0.147
(1.00)
0.217
(1.00)
0.561
(1.00)
0.611
(1.00)
0.751
(1.00)
0.244
(1.00)
1
(1.00)
0.0921
(1.00)
0.53
(1.00)
0.924
(1.00)
0.222
(1.00)
0.682
(1.00)
0.543
(1.00)
0.0346
(1.00)
0.994
(1.00)
1
(1.00)
0.227
(1.00)
0.128
(1.00)
0.147
(1.00)
0.503
(1.00)
0.378
(1.00)
0.231
(1.00)
1
(1.00)
0.704
(1.00)
0.469
(1.00)
0.151
(1.00)
0.806
(1.00)
0.544
(1.00)
0.389
(1.00)
6p loss 39 (16%) 199 0.608
(1.00)
0.343
(1.00)
0.483
(1.00)
0.443
(1.00)
0.414
(1.00)
0.316
(1.00)
0.185
(1.00)
0.859
(1.00)
0.3
(1.00)
0.248
(1.00)
0.698
(1.00)
0.559
(1.00)
1
(1.00)
0.0157
(1.00)
0.828
(1.00)
0.143
(1.00)
0.859
(1.00)
0.932
(1.00)
0.584
(1.00)
0.899
(1.00)
0.0843
(1.00)
1
(1.00)
0.918
(1.00)
0.562
(1.00)
0.109
(1.00)
0.0222
(1.00)
0.427
(1.00)
0.266
(1.00)
0.551
(1.00)
0.752
(1.00)
0.686
(1.00)
0.323
(1.00)
1
(1.00)
0.3
(1.00)
0.697
(1.00)
0.295
(1.00)
0.0278
(1.00)
0.175
(1.00)
0.742
(1.00)
0.456
(1.00)
0.655
(1.00)
0.355
(1.00)
0.675
(1.00)
6q loss 59 (25%) 179 0.197
(1.00)
0.452
(1.00)
0.663
(1.00)
0.394
(1.00)
0.875
(1.00)
0.513
(1.00)
0.367
(1.00)
0.552
(1.00)
0.549
(1.00)
0.418
(1.00)
0.528
(1.00)
0.856
(1.00)
0.416
(1.00)
0.108
(1.00)
0.849
(1.00)
0.0173
(1.00)
0.552
(1.00)
0.931
(1.00)
0.841
(1.00)
0.492
(1.00)
0.911
(1.00)
1
(1.00)
0.641
(1.00)
0.54
(1.00)
0.132
(1.00)
0.445
(1.00)
0.886
(1.00)
0.101
(1.00)
0.846
(1.00)
0.932
(1.00)
0.907
(1.00)
0.329
(1.00)
0.836
(1.00)
0.549
(1.00)
0.947
(1.00)
0.658
(1.00)
0.0379
(1.00)
0.625
(1.00)
0.453
(1.00)
1
(1.00)
0.339
(1.00)
0.488
(1.00)
0.418
(1.00)
7p loss 21 (9%) 217 0.384
(1.00)
0.237
(1.00)
1
(1.00)
0.53
(1.00)
0.893
(1.00)
0.671
(1.00)
0.00162
(1.00)
0.393
(1.00)
0.44
(1.00)
0.0838
(1.00)
0.221
(1.00)
0.0248
(1.00)
0.0938
(1.00)
0.462
(1.00)
0.451
(1.00)
0.605
(1.00)
0.393
(1.00)
0.261
(1.00)
0.811
(1.00)
0.284
(1.00)
0.0405
(1.00)
1
(1.00)
0.312
(1.00)
1
(1.00)
0.502
(1.00)
0.369
(1.00)
0.513
(1.00)
0.152
(1.00)
0.274
(1.00)
0.882
(1.00)
0.258
(1.00)
0.666
(1.00)
0.779
(1.00)
0.44
(1.00)
0.57
(1.00)
0.368
(1.00)
0.639
(1.00)
0.564
(1.00)
0.88
(1.00)
0.686
(1.00)
0.376
(1.00)
0.264
(1.00)
0.595
(1.00)
7q loss 32 (13%) 206 0.127
(1.00)
0.0868
(1.00)
0.492
(1.00)
0.174
(1.00)
0.321
(1.00)
0.424
(1.00)
0.000451
(1.00)
0.5
(1.00)
0.0884
(1.00)
0.541
(1.00)
0.475
(1.00)
0.81
(1.00)
0.0719
(1.00)
0.705
(1.00)
0.293
(1.00)
0.1
(1.00)
0.5
(1.00)
0.804
(1.00)
0.742
(1.00)
0.29
(1.00)
0.00498
(1.00)
0.543
(1.00)
0.0215
(1.00)
0.362
(1.00)
0.595
(1.00)
0.287
(1.00)
0.406
(1.00)
0.286
(1.00)
0.178
(1.00)
0.63
(1.00)
0.259
(1.00)
0.754
(1.00)
0.345
(1.00)
0.0884
(1.00)
0.968
(1.00)
0.306
(1.00)
0.819
(1.00)
0.803
(1.00)
0.441
(1.00)
0.458
(1.00)
0.7
(1.00)
0.24
(1.00)
0.075
(1.00)
0.858
(1.00)
8p loss 68 (29%) 170 0.21
(1.00)
0.224
(1.00)
0.748
(1.00)
1
(1.00)
0.197
(1.00)
0.306
(1.00)
0.193
(1.00)
0.106
(1.00)
0.638
(1.00)
0.094
(1.00)
1
(1.00)
0.774
(1.00)
0.203
(1.00)
0.657
(1.00)
0.177
(1.00)
0.00274
(1.00)
0.106
(1.00)
0.398
(1.00)
0.326
(1.00)
0.283
(1.00)
0.0839
(1.00)
0.543
(1.00)
0.254
(1.00)
1
(1.00)
0.515
(1.00)
0.615
(1.00)
0.91
(1.00)
0.149
(1.00)
0.73
(1.00)
0.768
(1.00)
0.838
(1.00)
0.599
(1.00)
0.172
(1.00)
0.638
(1.00)
0.448
(1.00)
0.843
(1.00)
0.458
(1.00)
0.953
(1.00)
0.955
(1.00)
1
(1.00)
0.341
(1.00)
0.841
(1.00)
0.202
(1.00)
0.274
(1.00)
8q loss 20 (8%) 218 0.541
(1.00)
0.17
(1.00)
0.411
(1.00)
0.233
(1.00)
0.00209
(1.00)
0.21
(1.00)
0.0261
(1.00)
0.992
(1.00)
0.365
(1.00)
0.107
(1.00)
1
(1.00)
0.895
(1.00)
0.425
(1.00)
0.0938
(1.00)
0.38
(1.00)
0.992
(1.00)
0.974
(1.00)
0.72
(1.00)
0.802
(1.00)
0.127
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.438
(1.00)
0.446
(1.00)
0.272
(1.00)
0.839
(1.00)
0.608
(1.00)
0.317
(1.00)
0.89
(1.00)
0.585
(1.00)
0.395
(1.00)
0.365
(1.00)
0.603
(1.00)
0.0271
(1.00)
0.191
(1.00)
0.0303
(1.00)
0.272
(1.00)
1
(1.00)
0.55
(1.00)
0.147
(1.00)
0.356
(1.00)
9p loss 45 (19%) 193 0.057
(1.00)
0.0617
(1.00)
0.132
(1.00)
1
(1.00)
0.292
(1.00)
0.941
(1.00)
0.807
(1.00)
0.627
(1.00)
0.73
(1.00)
0.608
(1.00)
0.309
(1.00)
0.135
(1.00)
0.368
(1.00)
0.107
(1.00)
0.577
(1.00)
0.377
(1.00)
0.627
(1.00)
0.505
(1.00)
0.923
(1.00)
0.899
(1.00)
0.877
(1.00)
1
(1.00)
0.542
(1.00)
1
(1.00)
0.0762
(1.00)
0.325
(1.00)
0.527
(1.00)
0.416
(1.00)
0.0194
(1.00)
0.147
(1.00)
0.669
(1.00)
0.204
(1.00)
0.802
(1.00)
0.73
(1.00)
0.104
(1.00)
0.646
(1.00)
0.909
(1.00)
0.782
(1.00)
0.997
(1.00)
0.707
(1.00)
0.299
(1.00)
0.043
(1.00)
0.113
(1.00)
9q loss 39 (16%) 199 0.0483
(1.00)
0.0622
(1.00)
0.398
(1.00)
0.616
(1.00)
0.101
(1.00)
0.557
(1.00)
0.795
(1.00)
0.477
(1.00)
0.741
(1.00)
0.37
(1.00)
1
(1.00)
0.73
(1.00)
0.527
(1.00)
0.0756
(1.00)
0.8
(1.00)
0.573
(1.00)
0.477
(1.00)
0.42
(1.00)
0.965
(1.00)
0.457
(1.00)
0.875
(1.00)
1
(1.00)
0.39
(1.00)
1
(1.00)
0.0348
(1.00)
0.305
(1.00)
0.75
(1.00)
0.359
(1.00)
0.0416
(1.00)
0.186
(1.00)
0.739
(1.00)
0.165
(1.00)
0.81
(1.00)
0.741
(1.00)
0.547
(1.00)
0.608
(1.00)
0.173
(1.00)
0.82
(1.00)
0.381
(1.00)
1
(1.00)
0.604
(1.00)
0.0654
(1.00)
0.369
(1.00)
10p loss 50 (21%) 188 0.378
(1.00)
0.416
(1.00)
0.235
(1.00)
0.0289
(1.00)
0.902
(1.00)
0.932
(1.00)
0.0316
(1.00)
0.388
(1.00)
0.0061
(1.00)
0.162
(1.00)
0.742
(1.00)
0.634
(1.00)
1
(1.00)
0.26
(1.00)
0.0494
(1.00)
0.338
(1.00)
0.388
(1.00)
0.0465
(1.00)
0.689
(1.00)
0.61
(1.00)
0.377
(1.00)
1
(1.00)
0.433
(1.00)
1
(1.00)
0.921
(1.00)
0.571
(1.00)
0.489
(1.00)
0.826
(1.00)
0.31
(1.00)
0.165
(1.00)
0.0912
(1.00)
0.389
(1.00)
0.0564
(1.00)
0.0061
(1.00)
0.269
(1.00)
0.259
(1.00)
0.064
(1.00)
0.51
(1.00)
0.14
(1.00)
0.5
(1.00)
0.225
(1.00)
0.28
(1.00)
0.437
(1.00)
0.585
(1.00)
10q loss 59 (25%) 179 0.271
(1.00)
0.101
(1.00)
0.54
(1.00)
0.0227
(1.00)
0.459
(1.00)
0.5
(1.00)
0.117
(1.00)
0.453
(1.00)
0.00831
(1.00)
0.0215
(1.00)
0.763
(1.00)
0.851
(1.00)
0.619
(1.00)
0.253
(1.00)
0.00428
(1.00)
0.338
(1.00)
0.453
(1.00)
0.132
(1.00)
0.734
(1.00)
0.945
(1.00)
0.412
(1.00)
1
(1.00)
0.0613
(1.00)
1
(1.00)
0.618
(1.00)
0.705
(1.00)
0.316
(1.00)
0.425
(1.00)
0.673
(1.00)
0.296
(1.00)
0.0159
(1.00)
0.211
(1.00)
0.0759
(1.00)
0.00831
(1.00)
0.473
(1.00)
0.835
(1.00)
0.151
(1.00)
0.886
(1.00)
0.171
(1.00)
0.748
(1.00)
0.52
(1.00)
0.35
(1.00)
0.114
(1.00)
0.949
(1.00)
11p loss 81 (34%) 157 0.33
(1.00)
0.00772
(1.00)
0.134
(1.00)
0.343
(1.00)
0.966
(1.00)
0.0267
(1.00)
0.416
(1.00)
0.689
(1.00)
0.76
(1.00)
0.197
(1.00)
1
(1.00)
0.799
(1.00)
0.0239
(1.00)
0.0113
(1.00)
0.283
(1.00)
0.223
(1.00)
0.689
(1.00)
0.361
(1.00)
0.597
(1.00)
0.214
(1.00)
0.522
(1.00)
0.551
(1.00)
0.884
(1.00)
0.544
(1.00)
0.032
(1.00)
0.0372
(1.00)
0.523
(1.00)
0.0715
(1.00)
0.362
(1.00)
0.149
(1.00)
0.527
(1.00)
0.0225
(1.00)
0.339
(1.00)
0.76
(1.00)
0.473
(1.00)
0.557
(1.00)
0.0949
(1.00)
0.106
(1.00)
0.0199
(1.00)
0.553
(1.00)
0.554
(1.00)
0.207
(1.00)
0.00769
(1.00)
0.00554
(1.00)
11q loss 93 (39%) 145 0.2
(1.00)
0.00065
(1.00)
0.815
(1.00)
0.716
(1.00)
1
(1.00)
0.183
(1.00)
0.843
(1.00)
0.968
(1.00)
0.919
(1.00)
0.175
(1.00)
0.173
(1.00)
0.724
(1.00)
0.151
(1.00)
0.0693
(1.00)
0.88
(1.00)
0.497
(1.00)
0.968
(1.00)
0.629
(1.00)
0.0505
(1.00)
0.304
(1.00)
0.796
(1.00)
1
(1.00)
0.573
(1.00)
0.568
(1.00)
0.0611
(1.00)
0.0523
(1.00)
0.661
(1.00)
0.0963
(1.00)
0.0727
(1.00)
0.0486
(1.00)
0.476
(1.00)
0.00089
(1.00)
0.29
(1.00)
0.919
(1.00)
0.176
(1.00)
0.454
(1.00)
0.308
(1.00)
0.364
(1.00)
0.243
(1.00)
0.262
(1.00)
0.554
(1.00)
0.427
(1.00)
0.00101
(1.00)
0.293
(1.00)
12p loss 29 (12%) 209 0.758
(1.00)
0.519
(1.00)
0.923
(1.00)
0.798
(1.00)
0.639
(1.00)
0.827
(1.00)
0.77
(1.00)
0.414
(1.00)
0.812
(1.00)
0.7
(1.00)
0.223
(1.00)
0.84
(1.00)
1
(1.00)
0.822
(1.00)
0.122
(1.00)
0.558
(1.00)
0.414
(1.00)
0.271
(1.00)
0.644
(1.00)
0.806
(1.00)
0.441
(1.00)
1
(1.00)
0.73
(1.00)
1
(1.00)
0.0257
(1.00)
0.269
(1.00)
0.319
(1.00)
0.0321
(1.00)
0.971
(1.00)
0.578
(1.00)
0.925
(1.00)
0.458
(1.00)
0.8
(1.00)
0.812
(1.00)
0.439
(1.00)
0.265
(1.00)
0.0773
(1.00)
0.426
(1.00)
0.0706
(1.00)
0.119
(1.00)
0.66
(1.00)
0.53
(1.00)
0.338
(1.00)
12q loss 10 (4%) 228 0.241
(1.00)
0.204
(1.00)
0.193
(1.00)
0.156
(1.00)
1
(1.00)
0.187
(1.00)
0.118
(1.00)
0.358
(1.00)
0.0809
(1.00)
0.657
(1.00)
1
(1.00)
0.0798
(1.00)
1
(1.00)
0.879
(1.00)
0.754
(1.00)
0.358
(1.00)
0.583
(1.00)
0.721
(1.00)
0.116
(1.00)
1
(1.00)
0.012
(1.00)
0.544
(1.00)
0.769
(1.00)
0.00863
(1.00)
0.571
(1.00)
0.423
(1.00)
1
(1.00)
0.107
(1.00)
0.678
(1.00)
0.0809
(1.00)
0.813
(1.00)
0.0914
(1.00)
0.0378
(1.00)
0.275
(1.00)
0.527
(1.00)
1
(1.00)
0.264
(1.00)
0.215
(1.00)
0.183
(1.00)
13q loss 66 (28%) 172 0.39
(1.00)
0.192
(1.00)
0.056
(1.00)
0.112
(1.00)
0.33
(1.00)
0.00104
(1.00)
0.514
(1.00)
0.782
(1.00)
0.0217
(1.00)
0.915
(1.00)
0.244
(1.00)
0.823
(1.00)
1
(1.00)
0.34
(1.00)
0.165
(1.00)
0.178
(1.00)
0.782
(1.00)
0.0423
(1.00)
0.293
(1.00)
1
(1.00)
0.419
(1.00)
0.53
(1.00)
0.946
(1.00)
1
(1.00)
0.348
(1.00)
0.777
(1.00)
0.926
(1.00)
0.0743
(1.00)
0.554
(1.00)
0.594
(1.00)
0.927
(1.00)
0.659
(1.00)
0.0296
(1.00)
0.0217
(1.00)
0.874
(1.00)
0.686
(1.00)
0.0997
(1.00)
0.638
(1.00)
0.487
(1.00)
0.017
(1.00)
0.14
(1.00)
0.129
(1.00)
0.0226
(1.00)
14q loss 28 (12%) 210 0.752
(1.00)
0.023
(1.00)
0.921
(1.00)
0.589
(1.00)
0.511
(1.00)
0.632
(1.00)
0.22
(1.00)
0.00935
(1.00)
0.662
(1.00)
0.566
(1.00)
1
(1.00)
0.36
(1.00)
0.0324
(1.00)
0.413
(1.00)
0.185
(1.00)
0.394
(1.00)
0.00935
(1.00)
0.587
(1.00)
0.895
(1.00)
0.0541
(1.00)
0.186
(1.00)
1
(1.00)
0.648
(1.00)
1
(1.00)
0.647
(1.00)
0.476
(1.00)
0.382
(1.00)
0.999
(1.00)
0.106
(1.00)
0.785
(1.00)
1
(1.00)
0.12
(1.00)
1
(1.00)
0.662
(1.00)
0.495
(1.00)
0.775
(1.00)
0.854
(1.00)
0.535
(1.00)
0.266
(1.00)
0.673
(1.00)
0.181
(1.00)
0.024
(1.00)
0.869
(1.00)
15q loss 34 (14%) 204 0.933
(1.00)
0.166
(1.00)
0.871
(1.00)
0.616
(1.00)
0.0928
(1.00)
0.377
(1.00)
1
(1.00)
0.319
(1.00)
0.718
(1.00)
0.155
(1.00)
0.702
(1.00)
0.286
(1.00)
1
(1.00)
0.3
(1.00)
0.00076
(1.00)
0.232
(1.00)
0.319
(1.00)
0.544
(1.00)
0.19
(1.00)
0.604
(1.00)
0.893
(1.00)
1
(1.00)
0.301
(1.00)
0.53
(1.00)
0.167
(1.00)
0.713
(1.00)
0.255
(1.00)
0.49
(1.00)
0.606
(1.00)
0.389
(1.00)
1
(1.00)
0.702
(1.00)
1
(1.00)
0.718
(1.00)
0.86
(1.00)
0.791
(1.00)
0.978
(1.00)
0.846
(1.00)
0.611
(1.00)
1
(1.00)
0.714
(1.00)
0.531
(1.00)
0.168
(1.00)
0.437
(1.00)
16p loss 29 (12%) 209 0.222
(1.00)
0.165
(1.00)
0.1
(1.00)
0.189
(1.00)
0.00213
(1.00)
0.386
(1.00)
0.77
(1.00)
0.608
(1.00)
0.396
(1.00)
0.952
(1.00)
0.221
(1.00)
0.373
(1.00)
1
(1.00)
0.911
(1.00)
0.144
(1.00)
0.33
(1.00)
0.608
(1.00)
0.6
(1.00)
0.504
(1.00)
0.386
(1.00)
0.927
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.208
(1.00)
0.574
(1.00)
0.788
(1.00)
0.721
(1.00)
0.46
(1.00)
0.974
(1.00)
0.636
(1.00)
0.687
(1.00)
0.586
(1.00)
0.396
(1.00)
0.556
(1.00)
0.0366
(1.00)
0.0889
(1.00)
0.91
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.487
(1.00)
0.0891
(1.00)
0.824
(1.00)
16q loss 35 (15%) 203 0.413
(1.00)
0.232
(1.00)
0.691
(1.00)
0.0682
(1.00)
0.399
(1.00)
0.00062
(1.00)
0.783
(1.00)
0.547
(1.00)
0.116
(1.00)
0.322
(1.00)
0.698
(1.00)
0.57
(1.00)
0.503
(1.00)
0.876
(1.00)
0.412
(1.00)
0.0208
(1.00)
0.547
(1.00)
0.62
(1.00)
0.466
(1.00)
0.0209
(1.00)
0.807
(1.00)
1
(1.00)
0.58
(1.00)
1
(1.00)
0.122
(1.00)
0.955
(1.00)
0.873
(1.00)
0.426
(1.00)
0.252
(1.00)
0.63
(1.00)
0.939
(1.00)
0.292
(1.00)
0.816
(1.00)
0.116
(1.00)
0.571
(1.00)
0.0366
(1.00)
0.117
(1.00)
0.739
(1.00)
0.245
(1.00)
0.456
(1.00)
0.446
(1.00)
0.183
(1.00)
0.815
(1.00)
17p loss 78 (33%) 160 0.182
(1.00)
0.0481
(1.00)
0.891
(1.00)
0.436
(1.00)
0.605
(1.00)
0.157
(1.00)
0.679
(1.00)
0.56
(1.00)
0.343
(1.00)
0.429
(1.00)
0.585
(1.00)
0.249
(1.00)
0.63
(1.00)
0.185
(1.00)
0.213
(1.00)
0.594
(1.00)
0.56
(1.00)
0.51
(1.00)
0.389
(1.00)
0.749
(1.00)
0.955
(1.00)
1
(1.00)
0.256
(1.00)
1
(1.00)
0.822
(1.00)
0.521
(1.00)
0.459
(1.00)
0.398
(1.00)
0.242
(1.00)
0.994
(1.00)
0.934
(1.00)
0.874
(1.00)
1
(1.00)
0.343
(1.00)
0.344
(1.00)
0.261
(1.00)
0.261
(1.00)
0.51
(1.00)
0.211
(1.00)
0.773
(1.00)
0.316
(1.00)
0.826
(1.00)
0.0586
(1.00)
0.546
(1.00)
17q loss 30 (13%) 208 0.216
(1.00)
0.0254
(1.00)
0.451
(1.00)
0.593
(1.00)
0.677
(1.00)
0.0965
(1.00)
0.554
(1.00)
0.231
(1.00)
0.516
(1.00)
0.151
(1.00)
0.696
(1.00)
0.619
(1.00)
1
(1.00)
0.494
(1.00)
0.664
(1.00)
0.927
(1.00)
0.231
(1.00)
0.183
(1.00)
0.749
(1.00)
0.553
(1.00)
0.648
(1.00)
1
(1.00)
0.734
(1.00)
1
(1.00)
0.811
(1.00)
0.325
(1.00)
0.318
(1.00)
0.776
(1.00)
0.463
(1.00)
0.685
(1.00)
0.69
(1.00)
0.421
(1.00)
0.423
(1.00)
0.516
(1.00)
0.832
(1.00)
0.306
(1.00)
0.0392
(1.00)
1
(1.00)
0.331
(1.00)
0.354
(1.00)
0.8
(1.00)
0.673
(1.00)
0.0276
(1.00)
0.465
(1.00)
18p loss 45 (19%) 193 0.654
(1.00)
0.786
(1.00)
0.891
(1.00)
1
(1.00)
0.56
(1.00)
0.00125
(1.00)
0.131
(1.00)
0.355
(1.00)
0.834
(1.00)
0.883
(1.00)
1
(1.00)
0.96
(1.00)
0.408
(1.00)
0.957
(1.00)
0.53
(1.00)
0.807
(1.00)
0.355
(1.00)
0.423
(1.00)
0.881
(1.00)
0.0632
(1.00)
0.184
(1.00)
0.536
(1.00)
0.288
(1.00)
1
(1.00)
0.933
(1.00)
0.207
(1.00)
0.473
(1.00)
0.792
(1.00)
0.331
(1.00)
0.994
(1.00)
0.781
(1.00)
0.951
(1.00)
0.0405
(1.00)
0.834
(1.00)
0.424
(1.00)
1
(1.00)
0.196
(1.00)
0.0704
(1.00)
0.195
(1.00)
0.0682
(1.00)
0.963
(1.00)
0.708
(1.00)
0.632
(1.00)
18q loss 59 (25%) 179 0.201
(1.00)
0.819
(1.00)
0.864
(1.00)
0.193
(1.00)
0.422
(1.00)
0.00032
(1.00)
0.5
(1.00)
0.653
(1.00)
0.105
(1.00)
0.979
(1.00)
1
(1.00)
0.605
(1.00)
0.438
(1.00)
0.898
(1.00)
0.518
(1.00)
1
(1.00)
0.653
(1.00)
0.385
(1.00)
0.549
(1.00)
0.363
(1.00)
0.551
(1.00)
1
(1.00)
0.431
(1.00)
1
(1.00)
0.205
(1.00)
0.158
(1.00)
0.57
(1.00)
0.221
(1.00)
0.831
(1.00)
0.652
(1.00)
0.64
(1.00)
0.507
(1.00)
0.0607
(1.00)
0.105
(1.00)
0.232
(1.00)
0.815
(1.00)
0.0486
(1.00)
0.182
(1.00)
0.988
(1.00)
0.02
(1.00)
0.885
(1.00)
0.909
(1.00)
0.296
(1.00)
19p loss 49 (21%) 189 0.0013
(1.00)
0.983
(1.00)
0.898
(1.00)
0.172
(1.00)
0.758
(1.00)
0.853
(1.00)
0.468
(1.00)
0.883
(1.00)
0.224
(1.00)
0.13
(1.00)
0.74
(1.00)
0.856
(1.00)
0.408
(1.00)
0.362
(1.00)
0.272
(1.00)
0.23
(1.00)
0.883
(1.00)
0.912
(1.00)
0.412
(1.00)
0.355
(1.00)
0.839
(1.00)
0.551
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.794
(1.00)
0.207
(1.00)
0.796
(1.00)
0.516
(1.00)
0.852
(1.00)
0.994
(1.00)
0.635
(1.00)
0.348
(1.00)
0.657
(1.00)
0.224
(1.00)
0.947
(1.00)
1
(1.00)
0.165
(1.00)
0.878
(1.00)
0.033
(1.00)
0.305
(1.00)
0.076
(1.00)
0.998
(1.00)
0.89
(1.00)
0.809
(1.00)
19q loss 25 (11%) 213 0.264
(1.00)
0.374
(1.00)
0.331
(1.00)
0.347
(1.00)
0.608
(1.00)
0.289
(1.00)
0.334
(1.00)
0.282
(1.00)
0.711
(1.00)
0.23
(1.00)
1
(1.00)
0.957
(1.00)
0.504
(1.00)
0.687
(1.00)
0.391
(1.00)
0.282
(1.00)
0.182
(1.00)
0.188
(1.00)
0.876
(1.00)
0.642
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.726
(1.00)
0.369
(1.00)
0.684
(1.00)
0.948
(1.00)
0.463
(1.00)
0.882
(1.00)
0.623
(1.00)
0.03
(1.00)
0.154
(1.00)
0.711
(1.00)
0.71
(1.00)
0.706
(1.00)
0.21
(1.00)
0.899
(1.00)
0.453
(1.00)
0.687
(1.00)
0.933
(1.00)
0.905
(1.00)
0.413
(1.00)
0.593
(1.00)
20p loss 19 (8%) 219 0.852
(1.00)
0.0511
(1.00)
0.904
(1.00)
1
(1.00)
0.817
(1.00)
0.603
(1.00)
0.481
(1.00)
0.0271
(1.00)
0.811
(1.00)
0.348
(1.00)
0.328
(1.00)
0.0547
(1.00)
1
(1.00)
0.756
(1.00)
0.827
(1.00)
0.464
(1.00)
0.0271
(1.00)
0.0505
(1.00)
0.737
(1.00)
0.495
(1.00)
0.0715
(1.00)
0.107
(1.00)
0.454
(1.00)
0.23
(1.00)
0.533
(1.00)
0.37
(1.00)
0.0654
(1.00)
0.927
(1.00)
0.893
(1.00)
0.785
(1.00)
1
(1.00)
0.665
(1.00)
0.762
(1.00)
0.811
(1.00)
0.729
(1.00)
1
(1.00)
0.714
(1.00)
0.188
(1.00)
0.983
(1.00)
1
(1.00)
0.646
(1.00)
0.135
(1.00)
0.96
(1.00)
20q loss 8 (3%) 230 0.0124
(1.00)
0.158
(1.00)
0.484
(1.00)
0.319
(1.00)
0.348
(1.00)
1
(1.00)
0.601
(1.00)
0.0894
(1.00)
0.179
(1.00)
0.42
(1.00)
1
(1.00)
0.149
(1.00)
1
(1.00)
0.284
(1.00)
0.154
(1.00)
0.0894
(1.00)
0.285
(1.00)
0.193
(1.00)
0.196
(1.00)
1
(1.00)
0.612
(1.00)
0.681
(1.00)
0.137
(1.00)
0.245
(1.00)
0.696
(1.00)
0.584
(1.00)
0.207
(1.00)
1
(1.00)
0.179
(1.00)
0.827
(1.00)
0.0914
(1.00)
0.613
(1.00)
0.369
(1.00)
0.634
(1.00)
0.283
(1.00)
0.808
(1.00)
0.145
(1.00)
0.97
(1.00)
21q loss 42 (18%) 196 0.0738
(1.00)
0.412
(1.00)
0.0618
(1.00)
0.821
(1.00)
0.811
(1.00)
0.746
(1.00)
0.616
(1.00)
0.96
(1.00)
0.573
(1.00)
0.312
(1.00)
0.313
(1.00)
0.0278
(1.00)
0.764
(1.00)
0.0653
(1.00)
0.0401
(1.00)
0.96
(1.00)
0.124
(1.00)
0.0697
(1.00)
0.524
(1.00)
0.00934
(1.00)
0.382
(1.00)
0.126
(1.00)
0.538
(1.00)
0.0332
(1.00)
0.369
(1.00)
0.831
(1.00)
0.0462
(1.00)
0.0407
(1.00)
0.389
(1.00)
0.56
(1.00)
0.919
(1.00)
0.822
(1.00)
0.573
(1.00)
0.289
(1.00)
0.235
(1.00)
0.538
(1.00)
0.0686
(1.00)
0.149
(1.00)
0.483
(1.00)
0.142
(1.00)
0.429
(1.00)
0.492
(1.00)
22q loss 58 (24%) 180 0.337
(1.00)
0.773
(1.00)
0.701
(1.00)
0.686
(1.00)
0.126
(1.00)
0.248
(1.00)
0.256
(1.00)
0.902
(1.00)
0.245
(1.00)
0.682
(1.00)
0.753
(1.00)
0.583
(1.00)
0.797
(1.00)
0.195
(1.00)
0.808
(1.00)
0.0455
(1.00)
0.902
(1.00)
0.313
(1.00)
0.44
(1.00)
0.801
(1.00)
0.973
(1.00)
0.53
(1.00)
0.355
(1.00)
0.544
(1.00)
0.415
(1.00)
0.194
(1.00)
0.203
(1.00)
0.627
(1.00)
0.217
(1.00)
0.373
(1.00)
0.953
(1.00)
0.295
(1.00)
0.697
(1.00)
0.245
(1.00)
0.437
(1.00)
0.828
(1.00)
0.17
(1.00)
0.202
(1.00)
0.16
(1.00)
0.346
(1.00)
0.617
(1.00)
0.814
(1.00)
0.272
(1.00)
xq loss 44 (18%) 194 0.0518
(1.00)
0.838
(1.00)
0.253
(1.00)
0.666
(1.00)
0.367
(1.00)
0.26
(1.00)
0.216
(1.00)
0.497
(1.00)
0.764
(1.00)
0.493
(1.00)
0.748
(1.00)
0.639
(1.00)
0.775
(1.00)
0.335
(1.00)
0.38
(1.00)
0.803
(1.00)
0.497
(1.00)
0.991
(1.00)
0.766
(1.00)
0.763
(1.00)
0.0849
(1.00)
0.145
(1.00)
0.181
(1.00)
1
(1.00)
0.107
(1.00)
0.571
(1.00)
0.0333
(1.00)
0.011
(1.00)
0.572
(1.00)
0.71
(1.00)
0.0312
(1.00)
0.493
(1.00)
0.827
(1.00)
0.764
(1.00)
0.875
(1.00)
0.0412
(1.00)
0.236
(1.00)
0.66
(1.00)
0.225
(1.00)
0.731
(1.00)
0.817
(1.00)
0.355
(1.00)
0.764
(1.00)
0.717
(1.00)
Methods & Data
Input
  • Copy number data file = transformed.cor.cli.txt

  • Clinical data file = CESC-TP.merged_data.txt

  • Number of patients = 238

  • Number of significantly arm-level cnvs = 80

  • Number of selected clinical features = 44

  • Exclude regions that fewer than K tumors have mutations, K = 3

Survival analysis

For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R

Fisher's exact test

For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R

Q value calculation

For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.

Download Results

In addition to the links below, the full results of the analysis summarized in this report can also be downloaded programmatically using firehose_get, or interactively from either the Broad GDAC website or TCGA Data Coordination Center Portal.

References
[1] Bland and Altman, Statistics notes: The logrank test, BMJ 328(7447):1073 (2004)
[2] Fisher, R.A., On the interpretation of chi-square from contingency tables, and the calculation of P, Journal of the Royal Statistical Society 85(1):87-94 (1922)
[3] Benjamini and Hochberg, Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing, Journal of the Royal Statistical Society Series B 59:289-300 (1995)