		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1q32.1	82 (9%)	800	0.55104	0.576	0.69463	0.711	9.9999e-06	1.6e-05	0.085239	0.0964	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	5.9999e-05	8.93e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.03041	0.0357	9.9999e-05	0.000146
amp_2q32.1	136 (15%)	746	0.60633	0.624	0.37302	0.396	9.9999e-06	1.6e-05	0.0066499	0.00834	0.0089699	0.011	9.9999e-06	1.6e-05	0.4081	0.431	0.00017	0.000242	0.0090999	0.0111	0.02071	0.0247
amp_3q26.32	193 (22%)	689	0.03362	0.0391	0.11047	0.123	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_5q35.1	376 (43%)	506	0.00090999	0.00122	0.00206	0.00268	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_7q31.2	377 (43%)	505	0.03356	0.0391	0.04459	0.0511	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_8q24.22	125 (14%)	757	0.32415	0.345	0.5988	0.619	9.9999e-06	1.6e-05	0.00211	0.00272	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.00076999	0.00105	9.9999e-06	1.6e-05	0.00028	0.000391	7.9999e-05	0.000118
amp_10p14	34 (4%)	848	0.15059	0.166	0.48009	0.505	9.9999e-06	1.6e-05	0.02274	0.027	0.00113	0.0015	0.00081999	0.00111	0.19886	0.217	0.44474	0.469	0.24012	0.259	0.20417	0.222
amp_17q25.2	245 (28%)	637	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_19p13.2	98 (11%)	784	0.11871	0.132	0.27964	0.3	9.9999e-06	1.6e-05	0.04145	0.0477	9.9999e-05	0.000146	9.9999e-06	1.6e-05	0.00209	0.00271	5.9999e-05	8.93e-05	0.072039	0.0819	0.00091999	0.00123
amp_xp22.2	126 (14%)	756	0.00188	0.00246	0.00206	0.00268	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_xp11.4	134 (15%)	748	0.00151	0.00199	0.00448	0.00565	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_xq11.2	135 (15%)	747	3e-05	4.61e-05	2e-05	3.12e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
amp_xq28	137 (16%)	745	0.00014	0.000201	0.00046	0.000636	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_1p36.31	209 (24%)	673	4e-04	0.000555	0.00357	0.00452	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_1p31.1	166 (19%)	716	0.00169	0.00222	0.01796	0.0215	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	2e-05	3.12e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_1q43	114 (13%)	768	0.0086499	0.0106	0.0078999	0.00978	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_2q37.3	111 (13%)	771	0.00013	0.000187	0.00018	0.000255	3e-05	4.61e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_3p26.3	489 (55%)	393	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_3p21.2	503 (57%)	379	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_3p14.1	408 (46%)	474	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_3p12.2	336 (38%)	546	5.9999e-05	8.93e-05	2e-04	0.000283	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_4q34.3	113 (13%)	769	0.56557	0.59	0.31751	0.339	9.9999e-06	1.6e-05	0.00085999	0.00116	2e-05	3.12e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.00486	0.00611	9.9999e-06	1.6e-05	0.00016	0.000229	9.9999e-06	1.6e-05
del_5p15.33	31 (4%)	851	NA	NA	NA	NA	0.00324	0.00413	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	4e-05	6.05e-05	5.9999e-05	8.93e-05	0.00085999	0.00116	0.00028	0.000391
del_6q22.31	227 (26%)	655	0.00034	0.000474	0.0067199	0.0084	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.77199	0.784	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_6q26	233 (26%)	649	0.00051999	0.000712	0.0079599	0.00982	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.56925	0.592	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_6q26	234 (27%)	648	0.00050999	7e-04	0.0075899	0.00945	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.60502	0.624	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_8p23.2	184 (21%)	698	0.59647	0.619	0.60781	0.624	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_9p23	198 (22%)	684	0.01061	0.0129	0.02162	0.0257	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	4e-05	6.05e-05	0.00025	0.000352
del_9p21.3	209 (24%)	673	0.00348	0.00442	0.0076099	0.00945	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	4e-05	6.05e-05
del_10q23.31	164 (19%)	718	0.20973	0.228	0.17591	0.194	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.19772	0.217	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_11q21	61 (7%)	821	0.54835	0.575	0.3795	0.402	2e-05	3.12e-05	0.053219	0.0607	3e-05	4.61e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.0343	0.0398	0.25524	0.274	8.9999e-05	0.000132	9.9999e-06	1.6e-05
del_11q23.1	71 (8%)	811	0.03953	0.0456	0.090409	0.102	9.9999e-06	1.6e-05	0.090869	0.102	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.0099799	0.0122	0.73897	0.752	2e-05	3.12e-05	2e-05	3.12e-05
del_13q12.13	150 (17%)	732	0.0279	0.0329	0.03734	0.0432	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.00074999	0.00102	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_13q14.2	149 (17%)	733	0.01215	0.0147	0.01724	0.0207	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.00211	0.00272	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_14q31.1	279 (32%)	603	6.9999e-05	0.000104	0.00013	0.000187	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
del_16q23.3	37 (4%)	845	0.86675	0.876	0.91562	0.923	0.01663	0.02	0.01073	0.013	0.02465	0.0291	4e-05	6.05e-05	0.18376	0.202	0.21913	0.237	0.14812	0.164	0.04487	0.0513
del_18q22.2	155 (18%)	727	0.086729	0.0978	0.22831	0.247	9.9999e-06	1.6e-05	0.03198	0.0375	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	7.9999e-05	0.000118	0.00132	0.00175	0.00303	0.00387	3e-05	4.61e-05
del_19p13.3	43 (5%)	839	1	1	0.85335	0.864	9.9999e-06	1.6e-05	0.00048	0.000661	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	0.00266	0.00341	0.70095	0.716	0.00121	0.00161	0.00011	0.000159
del_xp22.2	127 (14%)	755	0.081799	0.0927	0.10667	0.119	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05	9.9999e-06	1.6e-05
