		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	24 (5%)	504	0.8192	0.954	0.92466	1	9.9999e-06	7.08e-05	0.00073999	0.00313	0.00105	0.00422	0.0255	0.0647	0.00085999	0.00351	0.00146	0.00559	0.00211	0.00775	0.0060799	0.0194	0.74972	0.893	0.03911	0.0908
1q gain	51 (10%)	477	0.40949	0.547	0.90059	1	9.9999e-06	7.08e-05	0.01419	0.0401	0.02786	0.0692	0.01596	0.0441	9.9999e-06	7.08e-05	0.00173	0.00647	9.9999e-06	7.08e-05	0.0054499	0.0178	0.42078	0.558	0.75649	0.899
2p gain	77 (15%)	451	0.70366	0.847	0.46137	0.595	9.9999e-06	7.08e-05	0.083409	0.163	0.053299	0.117	0.94245	1	0.23223	0.35	0.01198	0.0348	0.61819	0.763	0.14386	0.246	0.23053	0.35	0.47145	0.605
2q gain	79 (15%)	449	0.56099	0.704	0.26711	0.391	9.9999e-06	7.08e-05	0.16887	0.277	0.04325	0.0983	1	1	0.23058	0.35	0.01793	0.0485	0.70892	0.852	0.02536	0.0647	0.31764	0.447	0.65652	0.804
3p gain	19 (4%)	509	0.053799	0.118	0.4338	0.57	0.00034	0.00156	0.58038	0.724	0.0239	0.0617	0.00205	0.00758	0.0091399	0.0278	0.00017	0.000885	0.00015	0.000789	0.12764	0.223	0.38965	0.527	0.73672	0.879
3q gain	61 (12%)	467	0.01205	0.0349	0.03148	0.0765	9.9999e-06	7.08e-05	0.00382	0.0131	0.00072999	0.0031	9.9999e-06	7.08e-05	4e-05	0.000236	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00046	0.00203	0.00158	0.00598	0.079809	0.159
4p gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.074079	0.149	0.3728	0.509	0.070609	0.146	0.01012	0.0305	0.00029	0.00141	0.00055999	0.00243	0.00034	0.00156	0.04348	0.0986	NA	NA	NA	NA
4q gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.21238	0.33	0.45406	0.588	0.071469	0.146	0.052119	0.114	0.00039	0.00175	0.00434	0.0145	0.00032	0.00149	0.04304	0.0982	NA	NA	NA	NA
5p gain	193 (37%)	335	0.88066	1	0.92315	1	0.00032	0.00149	0.2582	0.382	0.30549	0.434	0.33749	0.469	0.0088899	0.0273	0.02256	0.059	0.069659	0.145	0.15288	0.257	0.082959	0.163	0.90641	1
5q gain	207 (39%)	321	0.33475	0.466	0.62585	0.771	0.02205	0.0579	0.43481	0.57	0.66394	0.811	0.4473	0.583	0.055999	0.122	0.068299	0.143	0.44753	0.583	0.20753	0.325	0.12765	0.223	0.90615	1
6p gain	11 (2%)	517	NA	NA	NA	NA	0.15219	0.256	0.44404	0.581	0.073939	0.149	0.43398	0.57	0.7939	0.934	0.98364	1	0.85904	0.991	0.11273	0.204	0.60415	0.749	0.77998	0.92
6q gain	9 (2%)	519	NA	NA	NA	NA	0.080469	0.16	0.68245	0.826	0.01959	0.0521	0.63147	0.777	1	1	0.91231	1	1	1	0.18663	0.298	0.60492	0.749	0.77984	0.92
7p gain	171 (32%)	357	0.45284	0.587	0.85863	0.991	9.9999e-06	7.08e-05	0.00154	0.00585	0.00032	0.00149	0.0054099	0.0177	0.00012	0.000638	0.0091299	0.0278	0.0041	0.0139	0.02955	0.0729	0.10298	0.191	0.7677	0.911
7q gain	172 (33%)	356	0.45047	0.586	0.85882	0.991	9.9999e-06	7.08e-05	0.00381	0.0131	0.00023	0.00114	0.00243	0.00886	8.9999e-05	0.000495	0.0062899	0.02	0.0053199	0.0175	0.01828	0.0493	0.17179	0.28	0.58586	0.728
8p gain	31 (6%)	497	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	7.08e-05	0.00035	0.00159	0.01017	0.0305	0.063749	0.136	3e-05	0.000186	5e-05	0.000286	9.9999e-06	7.08e-05	0.0051099	0.017	0.0117	0.0342	0.1071	0.196
8q gain	62 (12%)	466	0.22617	0.346	0.10533	0.195	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00037	0.00168	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00011	0.000595	0.00032	0.00149	0.40629	0.545
9p gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.01498	0.0421	0.90384	1	0.86514	0.995	1	1	0.2492	0.37	0.01772	0.048	1	1	0.86151	0.991	1	1	1	1
9q gain	12 (2%)	516	NA	NA	NA	NA	0.00125	0.00488	0.91003	1	0.68382	0.827	0.23133	0.35	0.24231	0.362	0.0272	0.0683	0.53007	0.67	0.67334	0.819	1	1	1	1
10p gain	17 (3%)	511	NA	NA	NA	NA	0.00024	0.00118	0.25634	0.38	0.098079	0.184	0.17622	0.285	0.00105	0.00422	0.00021	0.00106	0.01934	0.0517	0.069329	0.144	NA	NA	NA	NA
10q gain	12 (2%)	516	NA	NA	NA	NA	0.00019	0.000964	0.11658	0.208	0.057429	0.124	0.21826	0.337	0.01387	0.0394	0.00176	0.00656	0.01524	0.0427	0.21492	0.333	NA	NA	NA	NA
11p gain	31 (6%)	497	0.2317	0.35	0.67041	0.817	9.9999e-06	7.08e-05	0.26954	0.394	0.086769	0.169	0.096639	0.182	0.15194	0.256	0.23812	0.356	0.14729	0.251	0.27902	0.404	0.39133	0.529	0.85544	0.99
11q gain	29 (5%)	499	0.34149	0.474	0.90734	1	0.00018	0.000927	0.52551	0.665	0.33515	0.466	0.52245	0.662	0.42624	0.563	0.57233	0.716	0.36145	0.495	0.18606	0.298	0.75233	0.895	0.6796	0.825
12p gain	121 (23%)	407	0.01335	0.0381	0.03216	0.0778	9.9999e-06	7.08e-05	2e-05	0.00013	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00164	0.00618	0.10188	0.19
12q gain	122 (23%)	406	0.01319	0.0379	0.03327	0.0798	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00312	0.0111	0.12641	0.222
13q gain	22 (4%)	506	NA	NA	NA	NA	0.48854	0.624	0.034	0.081	0.63688	0.782	0.79725	0.937	0.070629	0.146	0.12261	0.216	0.34396	0.477	0.26189	0.385	0.28995	0.418	0.3259	0.457
14q gain	16 (3%)	512	0.77	0.913	0.57145	0.715	0.00123	0.00482	0.34971	0.482	0.0059299	0.019	0.04073	0.0941	0.0068899	0.0217	3e-04	0.00144	0.00378	0.0131	0.11285	0.204	NA	NA	NA	NA
15q gain	26 (5%)	502	1	1	0.11479	0.206	0.00077999	0.00324	0.72178	0.864	0.4988	0.636	0.46568	0.599	0.67276	0.819	0.10568	0.195	0.70501	0.848	0.40877	0.547	0.68499	0.827	0.82587	0.959
16p gain	107 (20%)	421	0.27108	0.395	0.37988	0.516	5.9999e-05	0.000337	0.16718	0.276	0.03775	0.0884	0.41171	0.548	0.0073499	0.023	0.00419	0.0141	0.061629	0.132	0.02515	0.0644	0.13056	0.226	0.39227	0.529
16q gain	99 (19%)	429	0.23214	0.35	0.34693	0.479	4e-05	0.000236	0.087429	0.169	0.052119	0.114	0.30031	0.427	0.0064099	0.0203	0.01667	0.0456	0.01593	0.0441	0.14852	0.252	0.18217	0.292	0.26599	0.39
17p gain	26 (5%)	502	0.01763	0.0479	0.0055399	0.0181	9.9999e-06	7.08e-05	0.81839	0.954	0.095989	0.181	0.14504	0.248	0.1496	0.254	0.00484	0.0161	0.14635	0.25	0.26278	0.386	0.03651	0.0865	0.73679	0.879
17q gain	33 (6%)	495	0.069439	0.144	0.0254	0.0647	9.9999e-06	7.08e-05	0.23303	0.35	0.083719	0.164	0.12649	0.222	0.076909	0.154	0.00153	0.00584	0.077099	0.154	0.22367	0.343	0.00208	0.00767	0.29635	0.424
18p gain	25 (5%)	503	0.3127	0.441	0.076799	0.154	0.073369	0.149	0.44601	0.583	0.81392	0.951	0.080829	0.16	0.19129	0.304	0.42147	0.558	0.83273	0.965	0.45271	0.587	0.2041	0.321	0.04285	0.0981
18q gain	25 (5%)	503	0.31152	0.44	0.076729	0.154	0.066899	0.141	0.55944	0.703	0.42556	0.563	0.21337	0.331	0.1905	0.303	0.418	0.556	0.96452	1	0.45123	0.587	0.19989	0.316	0.04445	0.1
19p gain	51 (10%)	477	0.22837	0.348	0.48458	0.62	9.9999e-06	7.08e-05	5e-05	0.000286	0.00383	0.0131	0.13151	0.227	0.00145	0.00559	0.00077999	0.00324	5e-05	0.000286	0.35678	0.49	0.92179	1	0.62555	0.771
19q gain	57 (11%)	471	0.10239	0.19	0.22423	0.344	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00022	0.0011	0.01324	0.038	0.00065999	0.00285	8.9999e-05	0.000495	4e-05	0.000236	0.16875	0.277	0.57879	0.723	0.28769	0.416
20p gain	112 (21%)	416	0.11519	0.207	0.11647	0.208	9.9999e-06	7.08e-05	5.9999e-05	0.000337	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.051669	0.114
20q gain	115 (22%)	413	0.04088	0.0942	0.072629	0.148	9.9999e-06	7.08e-05	3e-05	0.000186	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.03226	0.0778
21q gain	50 (9%)	478	0.26675	0.391	0.20904	0.326	9.9999e-06	7.08e-05	0.00121	0.00476	0.00184	0.00683	0.51925	0.659	3e-04	0.00144	0.00262	0.00951	0.00294	0.0105	0.03244	0.078	0.35549	0.489	0.4779	0.612
22q gain	40 (8%)	488	0.32826	0.459	0.21775	0.337	3e-05	0.000186	0.20847	0.326	0.41848	0.556	0.97454	1	0.055399	0.121	0.01642	0.0451	0.063189	0.135	0.41074	0.548	0.90678	1	0.30648	0.434
xp gain	32 (6%)	496	1	1	0.52519	0.665	0.0058199	0.0188	0.22507	0.344	0.00032	0.00149	0.00067999	0.00292	0.01543	0.0431	0.00095999	0.00389	0.12557	0.221	0.14063	0.241	0.55938	0.703	0.90141	1
xq gain	31 (6%)	497	0.38794	0.526	0.70274	0.847	0.22376	0.343	0.29083	0.418	0.03	0.0735	0.0080199	0.0249	0.15346	0.257	0.10183	0.19	0.32038	0.45	0.60496	0.749	0.92033	1	0.81208	0.95
1p loss	57 (11%)	471	0.00091999	0.00374	0.00276	0.00998	9.9999e-06	7.08e-05	0.67732	0.823	0.00131	0.00509	0.15534	0.26	0.1155	0.207	3e-05	0.000186	0.0078399	0.0244	0.02182	0.0576	0.0367	0.0866	0.82243	0.957
1q loss	36 (7%)	492	0.01066	0.0315	0.0114	0.0334	9.9999e-06	7.08e-05	0.36974	0.506	0.02826	0.07	0.10597	0.195	0.00416	0.0141	9.9999e-06	7.08e-05	0.0058499	0.0189	0.04182	0.0959	0.22294	0.343	0.70997	0.852
2p loss	14 (3%)	514	4e-05	0.000236	0.00046	0.00203	9.9999e-06	7.08e-05	0.66329	0.811	0.00019	0.000964	4e-05	0.000236	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	2e-05	0.00013	5e-05	0.000286	0.13273	0.228	0.096689	0.182
2q loss	14 (3%)	514	0.00032	0.00149	0.00077999	0.00324	3e-05	0.000186	1	1	0.00035	0.00159	2e-05	0.00013	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.13187	0.228	0.098519	0.184
3p loss	380 (72%)	148	0.00381	0.0131	0.01041	0.031	9.9999e-06	7.08e-05	0.00052999	0.00232	0.03378	0.0809	0.04451	0.1	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.02263	0.0591	0.0085599	0.0264	0.092769	0.176	0.73256	0.876
3q loss	99 (19%)	429	0.92229	1	0.5146	0.654	0.00133	0.00515	0.40466	0.543	0.25359	0.376	0.20923	0.326	0.12973	0.225	0.0189	0.0507	0.64864	0.795	0.02779	0.0692	0.80162	0.94	0.8604	0.991
4p loss	72 (14%)	456	0.53303	0.672	0.81827	0.954	9.9999e-06	7.08e-05	0.00016	0.000837	0.20404	0.321	0.28854	0.417	0.00081999	0.00338	0.00116	0.0046	0.56955	0.714	0.072339	0.147	0.080369	0.16	0.0072299	0.0227
4q loss	65 (12%)	463	0.38761	0.526	0.78328	0.923	9.9999e-06	7.08e-05	3e-05	0.000186	0.1789	0.288	0.090509	0.173	0.00049	0.00215	4e-05	0.000236	0.19926	0.316	0.065259	0.138	0.43282	0.57	0.056789	0.123
5p loss	7 (1%)	521	NA	NA	NA	NA	0.01597	0.0441	0.2894	0.418	0.46493	0.599	0.12784	0.223	0.02717	0.0683	0.011	0.0323	0.0411	0.0945	0.066189	0.139	NA	NA	NA	NA
5q loss	6 (1%)	522	NA	NA	NA	NA	0.04516	0.101	0.54155	0.682	0.34616	0.479	0.39543	0.533	0.04546	0.102	0.01577	0.044	0.072329	0.147	0.092909	0.176	NA	NA	NA	NA
6p loss	100 (19%)	428	0.01088	0.0321	0.01421	0.0401	9.9999e-06	7.08e-05	5e-05	0.000286	7.9999e-05	0.000445	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.081529	0.161	0.02462	0.0634
6q loss	128 (24%)	400	0.04953	0.11	0.051739	0.114	9.9999e-06	7.08e-05	0.0057599	0.0187	6.9999e-05	0.000391	3e-05	0.000186	0.00022	0.0011	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	2e-05	0.00013	0.16855	0.277	0.02592	0.0656
7p loss	3 (1%)	525	NA	NA	NA	NA	0.16504	0.273	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.10621	0.195	0.16914	0.277	0.059079	0.127	0.35769	0.491	NA	NA	NA	NA
7q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.12015	0.213	0.34662	0.479	0.085789	0.167	0.17674	0.285	0.04995	0.111	0.079349	0.158	0.01949	0.052	0.77331	0.916	NA	NA	NA	NA
8p loss	137 (26%)	391	0.37918	0.516	0.16329	0.271	2e-05	0.00013	0.27701	0.403	0.12112	0.214	0.090749	0.173	0.081609	0.161	0.00113	0.0045	0.04312	0.0982	0.02288	0.0596	0.27788	0.403	0.24406	0.363
8q loss	64 (12%)	464	0.64912	0.795	0.12717	0.223	0.1202	0.213	0.045	0.101	0.16102	0.268	0.93298	1	0.72082	0.864	0.19042	0.303	0.58608	0.728	0.40919	0.547	0.68275	0.826	0.089279	0.171
9p loss	149 (28%)	379	0.00388	0.0133	0.03618	0.086	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-05	0.000544	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.01614	0.0445	0.096769	0.182
9q loss	150 (28%)	378	0.01042	0.031	0.058909	0.127	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00012	0.000638	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00372	0.013	0.03655	0.0865
10p loss	67 (13%)	461	0.17205	0.28	0.40417	0.543	9.9999e-06	7.08e-05	0.081739	0.161	0.80764	0.946	0.067969	0.143	0.15328	0.257	0.00069999	0.00299	0.01739	0.0474	0.10797	0.196	0.77547	0.917	0.29765	0.426
10q loss	89 (17%)	439	0.3282	0.459	0.39835	0.536	9.9999e-06	7.08e-05	0.00425	0.0143	0.98543	1	0.02095	0.0554	0.12185	0.215	0.00214	0.00783	0.03874	0.0905	0.00054999	0.00239	0.80184	0.94	0.43485	0.57
11p loss	18 (3%)	510	NA	NA	NA	NA	2e-05	0.00013	0.02197	0.0578	0.29927	0.426	0.26201	0.385	0.17242	0.28	0.02775	0.0692	0.1686	0.277	0.15064	0.255	0.29828	0.426	0.30619	0.434
11q loss	23 (4%)	505	0.18831	0.3	0.37269	0.509	9.9999e-06	7.08e-05	0.0059399	0.019	0.18254	0.293	0.069809	0.145	0.01415	0.0401	0.00032	0.00149	0.023	0.0597	0.03703	0.087	0.29943	0.426	0.30988	0.438
12p loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.087089	0.169	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.20484	0.321	0.47071	0.605	0.293	0.42	0.14269	0.245	NA	NA	NA	NA
12q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.486	0.621	NA	NA	0.37782	0.515	0.25953	0.383	1	1	1	1	0.23353	0.35	0.61315	0.758	NA	NA	NA	NA
13q loss	71 (13%)	457	0.00339	0.012	0.04665	0.104	9.9999e-06	7.08e-05	0.00027	0.00132	4e-05	0.000236	2e-05	0.00013	2e-05	0.00013	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.10759	0.196	0.10572	0.195
14q loss	216 (41%)	312	2e-05	0.00013	5.9999e-05	0.000337	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.04987	0.111	0.87883	1
15q loss	36 (7%)	492	0.11888	0.212	0.3327	0.464	9.9999e-06	7.08e-05	0.00074999	0.00315	0.02991	0.0735	0.10732	0.196	9.9999e-06	7.08e-05	2e-05	0.00013	0.00082999	0.0034	0.01645	0.0451	0.071079	0.146	0.13268	0.228
16p loss	10 (2%)	518	NA	NA	NA	NA	0.20047	0.317	0.87806	1	0.12961	0.225	0.02552	0.0647	0.29254	0.42	0.063119	0.135	0.088839	0.171	0.11411	0.206	0.11603	0.208	0.11376	0.205
16q loss	16 (3%)	512	NA	NA	NA	NA	0.03685	0.0867	0.91003	1	0.18164	0.292	0.16072	0.268	0.10492	0.194	0.090699	0.173	0.065069	0.138	0.0082099	0.0254	0.071329	0.146	0.02842	0.0703
17p loss	46 (9%)	482	0.00018	0.000927	0.00024	0.00118	9.9999e-06	7.08e-05	0.087289	0.169	0.0093999	0.0285	0.00039	0.00175	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00015	0.000789	0.20342	0.321	0.087079	0.169
17q loss	28 (5%)	500	0.00072999	0.0031	0.00042	0.00187	9.9999e-06	7.08e-05	0.58185	0.725	0.27793	0.403	0.0077499	0.0242	4e-05	0.000236	9.9999e-06	7.08e-05	2e-05	0.00013	0.0051199	0.017	0.45781	0.591	0.15062	0.255
18p loss	93 (18%)	435	0.057419	0.124	0.45719	0.591	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00025	0.00122	0.00403	0.0137
18q loss	95 (18%)	433	0.04521	0.101	0.2216	0.342	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	2e-05	0.00013	9.9999e-05	0.000544	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	9.9999e-06	7.08e-05	0.00299	0.0107	0.03117	0.0759
19p loss	11 (2%)	517	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	7.08e-05	0.03175	0.0769	0.0051699	0.0171	0.00041	0.00183	0.16953	0.277	0.01063	0.0315	0.24382	0.363	0.0095999	0.029	0.034	0.081	0.03902	0.0908
19q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.01178	0.0343	NA	NA	0.91939	1	0.1694	0.277	0.43383	0.57	0.51179	0.651	0.83145	0.965	0.084769	0.166	NA	NA	NA	NA
20p loss	8 (2%)	520	NA	NA	NA	NA	0.17238	0.28	1	1	0.03008	0.0735	1	1	0.089269	0.171	0.23311	0.35	0.02009	0.0533	0.23215	0.35	NA	NA	NA	NA
20q loss	3 (1%)	525	NA	NA	NA	NA	0.16441	0.272	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.10597	0.195	0.15373	0.257	0.058829	0.127	0.03011	0.0735	NA	NA	NA	NA
21q loss	55 (10%)	473	0.02649	0.0668	0.089249	0.171	9.9999e-06	7.08e-05	0.01327	0.038	0.074079	0.149	0.00109	0.00436	0.00294	0.0105	0.00012	0.000638	0.0067799	0.0215	0.0090599	0.0277	0.88471	1	1	1
22q loss	39 (7%)	489	0.01034	0.0309	0.00146	0.00559	9.9999e-06	7.08e-05	0.00378	0.0131	0.0012	0.00474	0.068149	0.143	9.9999e-06	7.08e-05	3e-05	0.000186	9.9999e-06	7.08e-05	0.00343	0.0121	0.02502	0.0643	0.25971	0.383
xp loss	46 (9%)	482	0.04072	0.0941	0.065569	0.138	0.00019	0.000964	0.071359	0.146	0.23743	0.356	0.00277	0.00998	0.21048	0.328	0.01269	0.0366	0.03887	0.0906	0.00081999	0.00338	0.10992	0.2	0.15937	0.266
xq loss	46 (9%)	482	0.02347	0.0608	0.064119	0.136	9.9999e-06	7.08e-05	0.0090399	0.0277	0.32991	0.461	0.00169	0.00635	0.091559	0.174	0.0276	0.0691	0.01857	0.0499	0.00328	0.0116	0.22853	0.348	0.17658	0.285
