Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-18-3406-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	309	3	1	2	3	303	12423	10	10	4	24	2987	12	15	0	27	3231	22	57	35	114	3073	38	48	52	138	3132	22	5	14	41	481	0.132686084142395	0.297101449275362	0.153575989782886	1.9345566302088	0.0852390852390852	12	9	12	33	454	0.106796116504854	0.289473684210526	0.147738366417182	1.95936702990958	0.0726872246696035	0.194174757281553	60	87	935	5270	1.05295780392171e-13	3.88601044990411	2.88319689711445	Inf	2.70871985157699	3.76060606060606	1.94767539427667e-13	7.36684065833164	1.98328108672936	0.000379598299245321	2.40190361868801	0.241114976360466	249	243
TCGA-18-3407-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	171	0	0	2	2	169	6929	6	8	2	16	1723	3	6	3	12	1662	6	55	22	83	1770	4	42	12	58	1774	0	4	1	5	239	0.0292397660818713	0.0862068965517241	0.134723788049605	0.639878805367191	0.0209205020920502	0	1	1	2	266	0.0116959064327485	0.0240963855421687	0.150282485875706	0.160340610562551	0.0075187969924812	0.0116959064327485	2	42	505	3039	0.990199679594577	0.28662639735898	0.0492239600795505	Inf	0.318991899189919	0	1	0	0.412813046010483	0.963957200329286	0.37618528554741	0.461538461538461	169	167
TCGA-18-3408-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	107	1	2	4	6	100	4100	3	7	2	12	1002	4	12	1	17	981	5	19	19	43	1090	3	14	11	28	1027	0	0	1	1	137	0.00934579439252336	0.0357142857142857	0.133398247322298	0.267726798748697	0.0072992700729927	0	3	2	5	154	0.0467289719626168	0.116279069767442	0.141284403669725	0.823014195107218	0.0324675324675325	0.0280373831775701	3	35	291	1826	0.908775049989986	0.537975415213578	0.139446234121495	Inf	0.57433532284319	0	1	0	0.727491408934708	0.800472407911935	0.697316416007463	0.181818181818182	104	97
TCGA-18-3409-01A-01D-0983-08	0	0	3	3	3675	195	1	6	7	3473	142393	42	60	21	123	34159	41	54	23	118	35163	18	102	1429	1549	36056	15	88	1580	1683	37015	2	9	304	315	5108	0.0857142857142857	0.18716577540107	0.137998108874781	1.35629232115712	0.0616679718089272	1	12	255	268	4681	0.0729251700680272	0.173014848289219	0.129825826492123	1.3326689531972	0.0572527237769707	0.152925170068027	562	2480	9789	63282	9.87068505713862e-15	1.46495052328262	1.35174286958757	Inf	1.37906211597246	0.678600284177973	0.8372781724332	0.64646425884882	1.38674415002006	4.2413888635007e-15	1.47497263934763	1.41740141587041e-299	3113	2911
TCGA-18-3410-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	310	4	0	6	6	300	12300	6	13	1	20	3018	5	18	2	25	3188	33	64	27	124	3094	36	59	36	131	3000	21	5	8	34	468	0.109677419354839	0.259541984732824	0.156	1.66373067136426	0.0726495726495727	18	4	9	31	464	0.1	0.25	0.149967679379444	1.66702586206897	0.0668103448275862	0.180645161290323	56	76	932	5162	1.76536522289641e-13	4.07984751266451	2.98292037208829	Inf	2.77396280400572	3.69574547490203	6.63979571224446e-15	7.19653666409748	1.76439130730976	0.0124468120692026	2.04662907880895	0.000174102918678229	254	244
TCGA-18-3411-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	426	5	1	3	4	417	17097	15	27	7	49	4210	14	24	7	45	4400	26	80	61	167	4248	26	81	49	156	4239	6	7	10	23	624	0.0539906103286385	0.147435897435897	0.147204529370134	1.00157174556213	0.0368589743589744	6	9	6	21	631	0.0492957746478873	0.125748502994012	0.148540489642185	0.846560444878864	0.0332805071315372	0.0657276995305164	28	134	1255	7232	0.216431022766189	1.20406686748103	0.825350537349909	Inf	1.16883576803896	1.5605884155685	0.074931296662431	1.72862811489668	0.983643607388627	0.569840917969221	0.980860415946787	0.492738621885636	398	389
TCGA-18-3412-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	208	0	1	1	2	206	8446	8	6	3	17	2175	7	8	2	17	2080	12	51	21	84	2144	14	51	23	88	2047	4	8	4	16	314	0.0769230769230769	0.181818181818182	0.153395212506106	1.18529241459178	0.0509554140127389	4	4	4	12	316	0.0576923076923077	0.142857142857143	0.147388059701493	0.969258589511754	0.0379746835443038	0.0769230769230769	16	54	630	3561	0.0557030822452533	1.67453538903292	0.98333650162881	Inf	1.52054421768707	2.04688644688645	0.0331300455428811	2.51143413739103	1.20952380952381	0.340686040062945	1.25601089983115	1	192	190
TCGA-18-3414-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	400	8	3	4	7	385	15785	10	18	8	36	4003	17	29	5	51	3899	26	63	55	144	3929	34	54	66	154	3954	12	8	17	37	584	0.0925	0.24025974025974	0.147698533131007	1.62669009073119	0.0633561643835616	15	9	15	39	570	0.0975	0.270833333333333	0.145075082718249	1.86684941520468	0.068421052631579	0.1475	59	122	1154	6729	1.66717411921106e-09	2.81942672607392	2.1266337692206	Inf	2.22668690215154	3.07396013864818	2.07971702225316e-08	4.76957859234268	1.80655141297965	0.000571137328884162	2.09632404087315	0.505739187232621	341	326
TCGA-18-3415-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	210	2	0	0	0	208	8528	7	10	2	19	2263	8	13	1	22	2146	17	38	37	92	2082	15	25	35	75	2037	7	3	12	22	308	0.104761904761905	0.293333333333333	0.151202749140893	1.94	0.0714285714285714	12	8	12	32	330	0.152380952380952	0.347826086956522	0.15850144092219	2.19446640316206	0.096969696969697	0.204761904761905	43	61	638	3481	4.54836523676045e-10	3.8443906420563	2.68710396709494	Inf	2.66935435254401	3.83331700626959	2.183737896564e-08	7.96789421213193	2.15203761755486	0.000160907288993563	2.72702872274605	0.431887667001096	167	165
TCGA-18-3416-01A-01D-0983-08	0	0	1	1	512	1	0	3	3	508	20828	24	14	3	41	5178	20	12	4	36	5281	36	154	41	231	5227	30	119	51	200	5142	8	13	8	29	759	0.056640625	0.145	0.147607934655776	0.982332015810277	0.0382081686429512	15	21	7	43	760	0.083984375	0.186147186147186	0.145398890376889	1.28025176577808	0.0565789473684211	0.07421875	38	120	1519	8850	0.00132470149009661	1.84480336533197	1.32151728434406	Inf	1.6417446521279	2.37882777744529	3.84718303482918e-05	3.11586232539355	1.11296762744368	0.370803225320631	1.13492692045577	0.185273590023067	474	470
TCGA-18-3417-01A-01D-1441-08	0	1	0	1	331	7	0	2	2	322	13202	13	20	8	41	3152	20	24	4	48	3224	19	47	33	99	3297	19	59	56	134	3529	5	6	11	22	469	0.0664652567975831	0.164179104477612	0.13289883819779	1.23536899723133	0.046908315565032	7	5	6	18	466	0.054380664652568	0.181818181818182	0.141340612678192	1.28638314475224	0.0386266094420601	0.0876132930513595	29	98	935	5891	0.00391203788476454	1.86417901797253	1.26957048893191	Inf	1.66705124426292	2.30543202927104	0.00381092193615769	2.90730202301138	1.39448416751788	0.0977731789688209	1.48752354558266	0.352370510885821	302	293
TCGA-18-3419-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	452	5	0	6	6	441	18081	10	21	6	37	4354	14	19	5	38	4578	29	99	52	180	4465	40	88	58	186	4684	23	12	18	53	691	0.117256637168142	0.28494623655914	0.147523484201537	1.93153136330392	0.0767004341534009	15	14	11	40	620	0.0884955752212389	0.222222222222222	0.138857782754759	1.60035842293907	0.0645161290322581	0.148230088495575	67	112	1311	7838	4.0220301904143e-14	3.5758426957724	2.72147760397662	Inf	2.61211749314993	3.8433102289435	4.69709004551764e-15	7.32752697099448	1.83982386797032	0.000738820607993182	2.14028821729122	0.221619260305465	385	374
TCGA-18-3421-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	451	4	0	7	7	440	18040	13	21	14	48	4492	19	23	7	49	4300	37	95	48	180	4576	33	78	52	163	4672	5	5	14	24	648	0.0532150776053215	0.147239263803681	0.138698630136986	1.06157691433765	0.037037037037037	14	11	12	37	660	0.082039911308204	0.205555555555556	0.144230769230769	1.42518518518519	0.0560606060606061	0.0997782705099778	45	125	1308	7940	2.21252641635965e-05	2.18509283571405	1.60176424619502	Inf	1.87155963302752	1.91909130624727	0.00337641354011661	2.26124020156925	1.8382874617737	0.00137371704674351	2.13261210942958	0.260142268834691	406	395
TCGA-18-4083-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	348	8	0	1	1	339	13899	17	19	3	39	3529	20	17	5	42	3402	27	50	53	130	3507	28	56	44	128	3461	7	3	6	16	481	0.0459770114942529	0.125	0.138977174227102	0.899428274428274	0.0332640332640333	11	1	13	25	505	0.0718390804597701	0.192307692307692	0.143997718848018	1.33549124143184	0.0495049504950495	0.10632183908046	37	115	986	5982	0.000669469570118526	1.95182447157939	1.38810691169688	Inf	1.72024127255258	2.31281578462106	0.000409616358551493	2.95084510253622	1.38424541519416	0.0882141109690478	1.47774615651772	1	311	302
TCGA-18-4086-01A-01D-1352-08	0	0	1	1	195	5	0	5	5	185	7585	11	15	3	29	1863	5	12	4	21	1835	26	30	27	83	1905	11	25	16	52	1982	6	0	3	9	240	0.0461538461538462	0.173076923076923	0.12108980827447	1.42932692307692	0.0375	7	3	3	13	263	0.0666666666666667	0.156626506024096	0.138057742782152	1.13449997709469	0.0494296577946768	0.0974358974358974	19	61	503	3384	0.00646017114230563	2.09500586940601	1.28519513118707	Inf	1.83531312127237	2.71511471710279	0.000529152267942306	3.64201036375958	1.07827453881363	0.49004159420663	1.09097238015593	0.0665849696120301	176	166
TCGA-18-4721-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	200	4	0	0	0	196	8036	6	12	5	23	1955	5	14	2	21	2043	11	37	34	82	1977	12	31	27	70	2061	3	5	3	11	294	0.055	0.157142857142857	0.142649199417758	1.10160349854227	0.0374149659863946	3	3	3	9	268	0.045	0.109756097560976	0.135558927668184	0.809655988350928	0.0335820895522388	0.06	12	72	562	3476	0.510226651626142	1.03083869036145	0.56789113966577	Inf	1.0264361972547	1.87436175150859	0.0908833882294928	2.18242130945892	0.706726562044221	0.867946003090709	0.674790387295621	1	188	184
TCGA-18-5592-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	323	6	0	10	10	307	12587	18	17	6	41	2938	13	10	5	28	3137	20	52	41	113	3282	25	57	43	125	3230	4	5	11	20	463	0.0619195046439628	0.16	0.143343653250774	1.11619870410367	0.0431965442764579	5	7	5	17	418	0.0526315789473684	0.150442477876106	0.127361365021328	1.18122538849134	0.0406698564593301	0.0773993808049536	25	104	881	5631	0.0415446128265076	1.53632234209817	1.02189957573259	Inf	1.43248070814525	1.4783200908059	0.148097810174963	1.59775695079702	1.40792389600562	0.0993374446425442	1.50379374126071	0.139579518059988	298	282
TCGA-18-5595-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	269	11	0	1	1	257	10537	2	4	1	7	2525	5	3	1	9	2424	23	21	82	126	2731	16	14	85	115	2857	11	3	40	54	364	0.200743494423792	0.469565217391304	0.127406370318516	3.68557095078834	0.148351648351648	19	4	36	59	405	0.219330855018587	0.468253968253968	0.148297326986452	3.15753478346071	0.145679012345679	0.394052044609665	106	100	769	4819	8.65170517551884e-36	6.63907277971323	5.17970598120361	Inf	3.73911396719987	5.58967690307092	1.35145023627663e-18	20.8766120402389	3.30694657499046	2.78082469373156e-22	5.23134361966233	1.18826133840219e-09	163	151
TCGA-21-1070-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	545	15	0	1	1	529	21689	25	26	5	56	5296	22	20	7	49	5328	34	117	38	189	5533	42	130	63	235	5532	9	21	7	37	782	0.0678899082568807	0.157446808510638	0.141359363702097	1.11380530010339	0.0473145780051151	5	19	9	33	771	0.0605504587155963	0.174603174603175	0.139345743719501	1.25302122578387	0.0428015564202335	0.055045871559633	30	147	1553	9512	0.159157407425208	1.24994546083686	0.869862826477879	Inf	1.20761347637705	1.31248517300979	0.174297422691188	1.3829983024344	1.12870012049499	0.342742737629725	1.15288512128066	0.83710147272931	515	499
TCGA-21-1071-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	207	4	0	0	0	203	8323	6	13	5	24	2033	3	11	8	22	2057	13	36	32	81	2166	11	25	40	76	2067	3	2	11	16	288	0.0772946859903382	0.210526315789474	0.13933236574746	1.5109649122807	0.0555555555555556	8	5	10	23	320	0.111111111111111	0.283950617283951	0.147737765466297	1.92199074074074	0.071875	0.154589371980676	32	64	608	3625	3.20583052662184e-06	2.9800430593375	2.0110230552664	Inf	2.32072368421053	3.19099506578947	0.000230587980984024	5.04203492669041	2.03063322368421	0.00103109928244579	2.4544194460012	0.0375273695022627	175	171
TCGA-21-1076-01A-02D-1521-08	0	0	0	0	343	5	0	0	0	338	13858	13	19	4	36	3367	16	21	4	41	3458	23	67	40	130	3520	30	59	42	131	3513	10	8	9	27	466	0.0787172011661808	0.206106870229008	0.132650156561344	1.55376273629722	0.0579399141630901	10	13	9	32	516	0.0932944606413994	0.246153846153846	0.146590909090909	1.67918902802624	0.062015503875969	0.110787172011662	38	97	982	6051	1.65648057026592e-05	2.41344831406789	1.71055127979797	Inf	2.0159462925247	2.70260923029628	1.65498682705677e-05	3.73357928472643	1.57212756445283	0.0335007337406596	1.7328734334563	0.843990741820936	305	300
TCGA-21-1077-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	239	4	0	1	1	234	9594	8	10	6	24	2302	11	18	5	34	2353	22	38	35	95	2465	16	27	38	81	2474	7	4	12	23	312	0.096234309623431	0.283950617283951	0.126111560226354	2.25158277936056	0.0737179487179487	9	6	11	26	319	0.108786610878661	0.273684210526316	0.129411764705882	2.11483253588517	0.0815047021943574	0.163179916317992	39	72	631	4308	2.52600051145571e-09	3.69707012047658	2.58144551845907	Inf	2.75011778815265	3.29568771373759	7.68606078127754e-06	4.96279928430845	2.46612248442351	2.9266044242916e-05	3.13951567553135	0.215414143584744	200	195
TCGA-21-1078-01A-01D-1521-08	0	1	1	2	88	1	2	2	4	83	3403	2	2	0	4	850	0	3	1	4	794	14	2	19	35	832	10	6	24	40	927	7	3	11	21	144	0.238636363636364	0.525	0.155339805825243	3.3796875	0.145833333333333	7	1	8	16	119	0.181818181818182	0.457142857142857	0.143028846153846	3.19615846338535	0.134453781512605	0.375	33	34	263	1496	1.30217836280303e-10	5.51309696162167	3.51977572735483	Inf	3.29419442710402	3.90145754119138	1.58593249773113e-06	7.94835632726024	2.95525687505527	6.24982509506771e-06	4.49778232094831	0.349677032717578	55	50
TCGA-21-1081-01A-01D-1521-08	0	0	1	1	213	2	0	2	2	209	8569	9	15	5	29	2119	9	17	10	36	2065	10	22	37	69	2203	16	24	35	75	2182	5	6	3	14	285	0.0657276995305164	0.186666666666667	0.130614115490376	1.42914619883041	0.0491228070175439	2	4	3	9	302	0.0422535211267606	0.130434782608696	0.13708579210168	0.951482867837604	0.0298013245033113	0.0610328638497653	13	85	587	3798	0.559728468406678	0.989560046697595	0.561517075882258	Inf	0.99094322567187	2.01120429825711	0.0510223220626265	2.38308850491105	0.6225156161272	0.931226665321303	0.588257915300001	1	200	196
TCGA-21-5782-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	438	8	0	1	1	429	17589	13	22	5	40	4222	17	17	8	42	4329	39	71	57	167	4466	49	68	63	180	4572	28	12	19	59	646	0.134703196347032	0.327777777777778	0.141294838145232	2.31981424148607	0.0913312693498452	20	15	22	57	682	0.13013698630137	0.341317365269461	0.152709359605911	2.2350782306355	0.0835777126099707	0.203196347031963	89	119	1328	7710	6.85060827276741e-22	4.34133445280865	3.39177888883246	Inf	2.9120641218721	3.71221248630887	6.72801462519509e-18	6.9644655617015	2.32528865461847	1.05790303067928e-07	3.01259159572409	0.417966919334386	349	340
TCGA-21-5784-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	240	10	0	0	0	230	9430	16	12	1	29	2329	15	10	3	28	2400	19	37	27	83	2410	12	40	38	90	2291	1	4	11	16	338	0.0666666666666667	0.177777777777778	0.147533828022698	1.20499671268902	0.0473372781065089	4	9	6	19	347	0.0791666666666667	0.228915662650602	0.143983402489627	1.58987535155029	0.0547550432276657	0.0916666666666667	22	74	685	4016	0.0204286260158702	1.74274202436185	1.1140950300462	Inf	1.57271897810219	1.1068989875206	0.479698632251373	1.12739206018835	1.79487928130264	0.0109479605103899	2.07602469696855	0.00405185036096857	218	208
TCGA-21-5786-01A-01D-1632-08	0	0	1	1	424	8	0	7	7	409	16769	23	18	5	46	4042	28	16	4	48	4008	32	79	48	159	4349	22	83	51	156	4370	4	7	3	14	574	0.0330188679245283	0.0897435897435897	0.131350114416476	0.683239524702939	0.024390243902439	6	9	3	18	556	0.0424528301886792	0.113207547169811	0.127845481719936	0.885502918419981	0.0323741007194245	0.0377358490566038	16	137	1130	7589	0.85089093055157	0.78436208415602	0.478377990282201	Inf	0.806894557232923	1.4288757784333	0.156038110246488	1.52625571899956	0.467632072941807	0.991472703358011	0.433315139169348	0.387032616408581	408	393
TCGA-21-5787-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	467	3	5	9	14	450	18450	23	17	8	48	4637	23	14	6	43	4336	33	104	52	189	4695	27	94	49	170	4782	8	8	9	25	623	0.0535331905781585	0.147058823529412	0.130280217482225	1.12878859408932	0.0401284109149278	14	15	8	37	661	0.0792291220556745	0.195767195767196	0.140788072417465	1.39050980957184	0.0559757942511346	0.0835117773019272	39	122	1284	8193	0.000219117305393834	2.03962012120324	1.46625293459017	Inf	1.78790561328148	2.70630841121495	6.56647264925831e-06	3.69356714182349	1.24231979272694	0.204868053570973	1.29132151813529	0.439388599735995	428	411
TCGA-22-0944-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	139	4	0	1	1	134	5494	9	7	3	19	1318	7	7	4	18	1392	5	18	28	51	1395	10	17	19	46	1389	3	1	5	9	189	0.0647482014388489	0.195652173913043	0.136069114470842	1.43788819875776	0.0476190476190476	2	1	6	9	202	0.0647482014388489	0.176470588235294	0.144802867383513	1.21869539895166	0.0445544554455446	0.115107913669065	16	46	391	2393	0.0112559683480137	2.12805880800857	1.23355512003732	Inf	1.83747215576273	2.37340153452685	0.0492848114518943	3.05836591487209	1.66643086466779	0.0600496942696131	1.86949193052495	0.092215182731215	123	118
TCGA-22-1002-01A-01D-1521-08	0	1	0	1	255	3	0	0	0	252	10332	8	22	4	34	2453	11	17	1	29	2432	10	47	32	89	2733	11	55	34	100	2714	2	4	6	12	369	0.0470588235294118	0.12	0.135961680176861	0.88260162601626	0.032520325203252	1	8	2	11	364	0.0431372549019608	0.123595505617978	0.133186974021222	0.927984936411903	0.0302197802197802	0.0431372549019608	11	76	733	4714	0.635257985576253	0.930817049855712	0.500887060214335	Inf	0.939565006037227	1.06158643539271	0.551396864636699	1.07185704582658	0.900740005787755	0.678529296419642	0.887037876688644	0.165321742179371	244	241
TCGA-22-1011-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	119	1	0	0	0	118	4838	5	1	2	8	1241	3	3	1	7	1177	27	7	18	52	1222	21	6	24	51	1198	10	3	11	24	176	0.201680672268908	0.470588235294118	0.146911519198664	3.20320855614973	0.136363636363636	20	2	9	31	202	0.260504201680672	0.596153846153846	0.165302782324059	3.60643564356436	0.153465346534653	0.420168067226891	50	40	378	2042	2.68668654359527e-17	6.74475258658827	4.59882624295569	Inf	3.55673133450911	4.00132275132275	5.52578153484173e-13	8.99160539410223	3.04862685815067	1.52250927922385e-06	4.90640343783594	0.084353506877441	69	68
TCGA-22-1012-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	305	8	0	2	2	295	12095	8	16	7	31	3003	13	24	10	47	3026	21	50	34	105	3011	31	40	41	112	3055	10	11	10	31	435	0.101639344262295	0.276785714285714	0.142389525368249	1.94386288998358	0.071264367816092	8	11	6	25	428	0.0819672131147541	0.238095238095238	0.142145466622385	1.67501112594571	0.058411214953271	0.111475409836066	34	93	863	5203	0.000188907475377781	2.20378100118031	1.53374866341134	Inf	1.88177115172307	2.43310455477315	0.000201433315192712	3.190947081239	1.49951332560834	0.0623664190086969	1.63481364224318	0.83739013315881	271	261
TCGA-22-1016-01A-01D-1521-08	0	0	1	1	380	10	0	2	2	368	15088	18	14	8	40	3634	24	17	3	44	3644	24	70	46	140	3934	25	69	50	144	3876	8	11	8	27	509	0.0710526315789474	0.1875	0.131320949432405	1.42779960707269	0.0530451866404715	8	6	4	18	539	0.0473684210526316	0.128571428571429	0.137010676156584	0.938404452690167	0.0333951762523191	0.0736842105263158	28	117	1048	6762	0.0308897871856923	1.54403464958876	1.052983179859	Inf	1.43906291129245	2.43340084125253	0.000474917852163049	3.12773556396803	0.931536259541985	0.648934049896275	0.921749940983077	0.49497422753308	352	340
TCGA-22-4591-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	283	5	1	2	3	275	11275	14	21	7	42	2612	15	20	3	38	2706	16	24	44	84	2964	17	44	50	111	2993	2	3	6	11	388	0.03886925795053	0.0990990990990991	0.129635816906114	0.764442277328875	0.0283505154639175	6	3	3	12	349	0.0424028268551237	0.142857142857143	0.11774628879892	1.21326238231682	0.0343839541547278	0.0600706713780919	17	110	737	5220	0.405845720526114	1.09462430542284	0.672414778687881	Inf	1.08194531992863	1.95945890382797	0.0449939459523648	2.26607313067726	0.77388204047461	0.835629824610761	0.749972560347618	1	266	258
TCGA-22-4593-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	216	1	0	6	6	209	8569	9	10	5	24	1942	5	15	1	21	2051	12	28	35	75	2258	9	31	49	89	2318	2	6	10	18	300	0.0833333333333333	0.202247191011236	0.129421915444349	1.56269662921348	0.06	7	4	7	18	278	0.0833333333333333	0.24	0.12311780336581	1.94935251798561	0.0647482014388489	0.12037037037037	26	79	578	3998	0.000612159974203331	2.27593982337553	1.50307424697134	Inf	1.96038886142692	3.39298072170044	0.000599146181788588	5.18472145172578	1.60224089635854	0.0340700044138923	1.75478761308133	0.0849733132129789	190	183
TCGA-22-4595-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	366	10	1	2	3	353	14473	24	11	3	38	3526	13	19	7	39	3552	41	54	45	140	3670	28	59	49	136	3725	7	5	10	22	513	0.0601092896174863	0.161764705882353	0.137718120805369	1.17460726980851	0.0428849902534113	18	7	7	32	514	0.087431693989071	0.228571428571429	0.140054495912807	1.63201778765981	0.0622568093385214	0.114754098360656	42	121	1027	6368	5.38713899308444e-05	2.15199708193656	1.56009785452788	Inf	1.85536526066153	2.60890732822488	3.3421584909708e-06	3.52223730930261	1.30223331745012	0.154248080237303	1.36889352275348	0.166728597233355	324	311
TCGA-22-4599-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	426	8	4	6	10	408	16728	22	27	6	55	4120	20	22	9	51	4105	26	64	43	133	4221	30	80	59	169	4282	6	11	6	23	575	0.0539906103286385	0.136094674556213	0.134283045305932	1.01349112426036	0.04	2	14	3	19	588	0.0446009389671361	0.142857142857143	0.139303482587065	1.02551020408163	0.032312925170068	0.039906103286385	17	141	1163	7340	0.882887849753929	0.760954850704211	0.471425074424467	Inf	0.786654984381292	1.04446628178356	0.506215437313612	1.0518823104179	0.645111526983966	0.948469784758728	0.610797909512534	1	409	391
TCGA-22-4601-01A-01D-1441-08	0	2	2	4	235	3	0	8	8	224	9184	6	12	7	25	2217	9	15	1	25	2389	14	36	40	90	2294	20	34	30	84	2284	7	8	8	23	342	0.0978723404255319	0.273809523809524	0.149737302977233	1.8285992759677	0.0672514619883041	3	6	11	20	314	0.0851063829787234	0.222222222222222	0.136878814298169	1.62349610757254	0.0636942675159236	0.123404255319149	29	75	656	3922	0.000297804352143446	2.31121053806879	1.55127649801123	Inf	1.94597209193246	2.05254662840746	0.0183763448049958	2.49044075666391	1.89420731707317	0.00407098723450211	2.22685005912347	0.0671374425582784	206	195
TCGA-22-4604-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	295	3	2	4	6	286	11726	12	17	3	32	2811	13	21	7	41	2915	23	31	52	106	2987	14	38	55	107	3013	7	6	9	22	421	0.0745762711864407	0.205607476635514	0.139727846000664	1.47148533753635	0.0522565320665083	6	5	6	17	423	0.0576271186440678	0.160377358490566	0.141613659189823	1.13249921941211	0.0401891252955083	0.0949152542372881	28	116	844	5156	0.0481999737027064	1.474477397917	1.00409864675208	Inf	1.38230647709321	2.49775842192904	0.001137696285721	3.30810805891354	0.996589449439695	0.548621001619036	0.996033975808265	0.813676710741718	267	258
TCGA-22-4607-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	101	0	2	0	2	99	4059	2	4	1	7	946	6	4	0	10	993	13	5	18	36	1038	15	13	18	46	1082	9	1	6	16	151	0.158415841584158	0.347826086956522	0.139556377079482	2.49236970918514	0.105960264900662	9	1	6	16	159	0.158415841584158	0.444444444444444	0.153179190751445	2.90146750524109	0.10062893081761	0.297029702970297	30	34	310	1810	1.84509742146043e-09	5.14598429400309	3.25291468368573	Inf	3.20564516129032	4.3963133640553	4.05162564005226e-09	10.4903820201394	2.27956989247312	0.00426594692656531	2.91735232877978	0.210129401736766	71	69
TCGA-22-4613-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	714	8	3	5	8	698	28618	40	37	10	87	7066	37	50	15	102	7001	42	119	70	231	7274	51	152	75	278	7277	8	16	8	32	1004	0.0448179271708683	0.115107913669065	0.137968943245843	0.834303075467912	0.0318725099601594	7	14	13	34	1042	0.0476190476190476	0.147186147186147	0.143249931262029	1.02747796029946	0.0326295585412668	0.0504201680672269	36	202	2046	12505	0.34705499999721	1.08927340875905	0.787180163666685	Inf	1.07575346854284	1.14708479172579	0.326023818636042	1.17533764149101	1.03000303367378	0.47859248134481	1.03508712613091	0.328551664255323	678	662
TCGA-22-5471-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	287	3	0	0	0	284	11644	13	17	4	34	2943	12	11	3	26	2807	17	47	61	125	2970	17	43	39	99	2924	10	6	5	21	417	0.0731707317073171	0.212121212121212	0.142612859097127	1.48739190465809	0.0503597122302158	5	3	13	21	427	0.0731707317073171	0.168	0.143771043771044	1.16852459016393	0.0491803278688525	0.114982578397213	33	101	844	5050	0.00126108414198023	1.95478632281597	1.35913419974023	Inf	1.71979557190352	3.08091720100362	2.88147474108432e-05	4.72202549135454	1.25701421800948	0.183058639072592	1.31336493697884	0.655348339710437	254	251
TCGA-22-5472-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	461	5	0	2	2	454	18614	10	11	4	25	4162	9	10	2	21	4271	22	175	25	222	5128	7	154	25	186	5053	2	15	6	23	611	0.0498915401301518	0.123655913978495	0.12091826637641	1.02264048008729	0.0376432078559738	9	19	1	29	581	0.0629067245119306	0.130630630630631	0.113299531981279	1.15296708067792	0.0499139414802065	0.0390455531453362	18	61	1192	8989	0.00417133523038525	2.22501389924903	1.35508176806017	Inf	1.9460750998216	3.23973038648461	0.00026658568808991	4.60752166323028	1.19575503355705	0.369396589973391	1.22759474020872	0.437542137144354	443	436
TCGA-22-5473-01A-01D-1632-08	0	0	1	1	925	13	2	10	12	900	36900	30	30	14	74	9183	33	29	12	74	9199	109	115	162	386	9092	93	116	157	366	9426	50	15	55	120	1393	0.12972972972973	0.327868852459016	0.147782728622958	2.21858708060207	0.0861450107681263	58	18	63	139	1419	0.15027027027027	0.360103626943005	0.156071271447426	2.30730244972925	0.0979563072586328	0.244324324324324	226	295	2812	15706	2.03289342041517e-51	4.27865353828268	3.66881828294637	Inf	2.85660031179781	3.52087939946199	6.77666164967072e-36	6.41621479876929	2.43595963559666	3.7464382022405e-21	3.27867378098526	0.425264260679198	699	674
TCGA-22-5474-01A-01D-1632-08	0	1	0	1	110	0	0	2	2	108	4428	1	4	0	5	1063	1	8	3	12	1149	14	7	26	47	1127	11	11	22	44	1089	9	4	7	20	172	0.181818181818182	0.454545454545455	0.157943067033976	2.87790697674419	0.116279069767442	8	0	8	16	163	0.145454545454545	0.340425531914894	0.144631765749778	2.3537397206631	0.098159509202454	0.290909090909091	32	41	335	1881	9.42577154341732e-09	4.378463078819	2.84283777324265	Inf	2.89969331425066	4.49814925373134	4.90651303515561e-09	11.9068143704938	2.06716417910448	0.00419570946553333	2.55082712434905	0.812758198329393	78	76
TCGA-22-5477-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	201	4	0	1	1	196	8036	4	3	3	10	1944	5	9	0	14	1941	38	9	47	94	2097	21	20	37	78	2054	14	6	16	36	299	0.17910447761194	0.461538461538462	0.145569620253165	3.17056856187291	0.120401337792642	22	1	23	46	336	0.228855721393035	0.48936170212766	0.160228898426323	3.05414133738602	0.136904761904762	0.373134328358209	75	68	635	3516	8.23363489195232e-24	6.10306155705617	4.52706667977524	Inf	3.42850063322504	3.98868277058588	3.12541460475662e-15	8.65940235411827	3.03503937007874	2.91658473743483e-11	4.79624003134572	0.754024952740554	126	121
TCGA-22-5478-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	212	3	1	3	4	205	8405	13	15	3	31	2020	9	14	2	25	2124	9	37	30	76	2084	15	38	20	73	2177	1	5	2	8	301	0.0377358490566038	0.10958904109589	0.138263665594855	0.792609111181905	0.026578073089701	2	5	2	9	293	0.0424528301886792	0.118421052631579	0.140595009596929	0.842284893120173	0.0307167235494881	0.0330188679245283	7	67	594	3667	0.904652234173444	0.645039232063701	0.291270330916598	Inf	0.678564928564929	0.896675084175084	0.669908870057227	0.881967276504166	0.573872053872054	0.930944851900187	0.536880890630837	1	205	198
TCGA-22-5480-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	178	4	0	3	3	171	7011	9	13	3	25	1733	10	11	4	25	1744	10	25	24	59	1737	19	21	22	62	1797	7	3	0	10	277	0.0561797752808989	0.161290322580645	0.154145798553144	1.04634913240946	0.036101083032491	1	2	5	8	245	0.0449438202247191	0.135593220338983	0.14104778353483	0.961328260117606	0.0326530612244898	0.0730337078651685	13	62	522	3012	0.31461424394147	1.20977456801589	0.677417562031907	Inf	1.17348659003831	1.86761791518034	0.055452364097149	2.19751977680499	0.735882058970515	0.828615249034741	0.703734704222936	0.488676307007786	165	158
TCGA-22-5482-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	184	6	0	4	4	174	7134	7	15	3	25	1753	8	9	6	23	1699	12	23	22	57	1820	7	31	31	69	1862	3	5	6	14	234	0.0760869565217391	0.202898550724638	0.125671321160043	1.61451752756101	0.0598290598290598	3	2	4	9	256	0.0489130434782609	0.157894736842105	0.140659340659341	1.12253289473684	0.03515625	0.0869565217391304	16	56	490	3192	0.0272422493174106	1.86078728275575	1.0932675399558	Inf	1.66984126984127	2.37293233082707	0.0327696355545713	3.00531591389715	1.4177897574124	0.162971053498602	1.51475022539356	0.353412512653542	168	158
TCGA-22-5485-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	238	1	1	3	4	233	9553	12	16	2	30	2277	17	21	2	40	2382	13	43	39	95	2511	5	43	20	68	2383	1	5	2	8	329	0.0336134453781513	0.117647058823529	0.138061267310113	0.852136599320579	0.0243161094224924	2	2	5	9	333	0.0378151260504202	0.0947368421052632	0.132616487455197	0.714366998577525	0.027027027027027	0.0420168067226891	10	67	662	4232	0.605740082712911	0.95414474427271	0.49508547024575	Inf	0.960097304508181	1.23212487411883	0.44819681706442	1.27847867250772	0.877105842593067	0.701956787242471	0.860604647054776	0.258731924360401	228	223
TCGA-22-5489-01A-01D-1632-08	0	1	0	1	276	3	0	0	0	273	11193	12	21	2	35	2754	15	21	5	41	2837	22	43	44	109	2807	20	44	24	88	2795	8	8	6	22	414	0.0797101449275362	0.25	0.148121645796064	1.68780193236715	0.0531400966183575	9	7	8	24	392	0.0869565217391304	0.220183486238532	0.139650872817955	1.57667103538663	0.0612244897959184	0.11231884057971	31	79	806	4796	0.000160279343669506	2.33450406677882	1.58947479883836	Inf	1.95874125874126	2.81324589389106	3.61970391617113e-05	4.04497271307404	1.43095898408991	0.1050996557824	1.54254785908985	0.659490074109026	245	242
TCGA-22-5491-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	399	7	0	5	5	387	15867	12	12	10	34	3712	5	14	4	23	3965	40	34	70	144	4056	49	51	86	186	4134	30	8	37	75	616	0.18796992481203	0.403225806451613	0.149008224479923	2.70606409719313	0.121753246753247	24	6	30	60	565	0.150375939849624	0.416666666666667	0.139299802761341	2.99115044247788	0.106194690265487	0.303258145363409	121	124	1181	7009	7.98781814515347e-37	5.7893585106124	4.62283961699623	Inf	3.42494254263941	4.20763207717703	2.96164964894811e-23	9.15227624056118	2.97840812870449	1.80670003810591e-17	4.46680383600504	0.141819920368211	278	266
TCGA-22-5492-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	251	7	1	0	1	243	9963	12	18	6	36	2480	11	28	6	45	2510	16	34	25	75	2461	18	40	29	87	2512	5	4	5	14	332	0.0557768924302789	0.160919540229885	0.132165605095541	1.21755989475142	0.0421686746987952	5	3	1	9	364	0.0358565737051793	0.12	0.147907354733848	0.811318681318681	0.0247252747252747	0.0637450199203187	16	72	696	4277	0.166272130545145	1.36548518722067	0.813787882709947	Inf	1.2991118077325	2.10150439486139	0.0157173990279488	2.55976101295999	0.793901660280971	0.784934461695885	0.768176514769208	0.353412512653542	235	227
TCGA-33-4532-01A-01D-1267-08	0	1	0	1	436	18	1	0	1	417	17097	16	17	4	37	4026	18	31	4	53	4171	31	69	56	156	4457	28	65	78	171	4443	11	10	17	38	598	0.0871559633027523	0.222222222222222	0.134593742966464	1.65105908584169	0.0635451505016722	13	12	9	34	585	0.0779816513761468	0.217948717948718	0.131254206865605	1.66050843743151	0.0581196581196581	0.114678899082569	50	143	1183	7717	2.86541029012944e-06	2.28058463408341	1.70070709187424	Inf	1.94902745719804	3.06030345143774	1.97186575602077e-07	4.47217450199332	1.45973429555519	0.0310023266896857	1.57031363221356	0.861164665319828	386	367
TCGA-33-4533-01A-01D-1267-08	0	0	2	2	330	7	1	8	9	314	12874	14	18	5	37	3020	21	17	5	43	3095	14	52	50	116	3377	16	52	50	118	3382	7	4	14	25	467	0.0757575757575758	0.211864406779661	0.138083973979894	1.53431568250281	0.0535331905781585	3	7	10	20	413	0.0606060606060606	0.172413793103448	0.122297897542197	1.40978542205895	0.0484261501210654	0.103030303030303	34	96	880	5879	5.43874872977342e-05	2.36563522382076	1.64907425604908	Inf	2.00879370629371	2.56022727272727	0.00359818287727123	3.33951000404773	1.84336363636364	0.00217649240437797	2.1094055402772	0.00436882490944224	296	280
TCGA-33-4538-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	222	5	0	4	4	213	8733	7	21	4	32	2160	14	14	3	31	2165	13	28	30	71	2211	15	24	40	79	2197	5	3	7	15	297	0.0675675675675676	0.189873417721519	0.135184342284934	1.40455184758982	0.0505050505050505	4	5	6	15	299	0.0675675675675676	0.211267605633803	0.135232926277702	1.56224975269678	0.0501672240802676	0.0990990990990991	22	76	596	3812	0.0117098237923268	1.85110745481783	1.18388441958838	Inf	1.66032050404054	2.37727708533078	0.00950624733993944	3.02859290774429	1.37353787152445	0.147694309120336	1.45858628491463	0.421975381019902	200	191
TCGA-33-4547-01A-01D-1267-08	0	1	0	1	246	0	0	1	1	245	10045	5	6	4	15	2429	5	4	3	12	2438	44	17	57	118	2614	37	22	41	100	2564	27	1	15	43	385	0.17479674796748	0.43	0.15015600624025	2.86368831168831	0.111688311688312	31	5	22	58	350	0.235772357723577	0.491525423728814	0.13389441469013	3.67099273607748	0.165714285714286	0.386178861788618	95	84	735	4443	1.10555245657137e-32	6.83255753714541	5.23484741239721	Inf	3.73891232470642	5.04449483497103	1.09015389321308e-30	15.229572501956	2.65980841316118	1.05441079944652e-08	3.66532744324841	0.00468912102292458	151	150
TCGA-33-4566-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	1423	29	6	21	27	1367	56047	77	45	8	130	13162	60	39	14	113	13609	75	352	121	548	14736	102	373	101	576	14540	19	38	19	76	1944	0.0534082923401265	0.131944444444444	0.133700137551582	0.986868427069044	0.0390946502057613	14	39	29	82	1864	0.0576247364722417	0.14963503649635	0.126492942453855	1.18295166191535	0.0439914163090129	0.0569219957835559	81	318	3808	25468	3.57649633420433e-05	1.70351199942315	1.37034538706138	Inf	1.56072692234789	1.43336063238855	0.0211656415927555	1.53264027300006	1.66227572109925	0.000276216612598601	1.84490147126517	0.0708815874253105	1342	1286
TCGA-33-4582-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	239	2	0	0	0	237	9717	9	6	6	21	2372	11	12	4	27	2423	16	31	47	94	2406	15	36	44	95	2516	4	4	9	17	373	0.0711297071129707	0.178947368421053	0.148251192368839	1.20705517144067	0.0455764075067024	2	6	10	18	350	0.0753138075313808	0.191489361702128	0.14546965918537	1.31635258358663	0.0514285714285714	0.104602510460251	25	97	723	4199	0.0535687904190926	1.4967014736744	0.991756519919526	Inf	1.39502981656577	1.31762816222728	0.300847808755804	1.39375145092975	1.42139741309866	0.071487164806366	1.53244511141983	0.0024089945773894	214	212
TCGA-33-4583-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	616	7	1	7	8	601	24641	25	29	9	63	5842	34	40	4	78	5905	38	126	67	231	6404	34	123	72	229	6490	8	8	12	28	839	0.0454545454545455	0.122270742358079	0.129275808936826	0.945813012996341	0.033373063170441	12	16	10	38	815	0.0616883116883117	0.164502164502165	0.127264209868832	1.29260351100842	0.0466257668711656	0.0681818181818182	42	169	1654	11240	0.00269705968130782	1.68877278973747	1.24080810704384	Inf	1.55174014452971	2.16545747682386	0.000582662310019883	2.61357129527802	1.23384339686655	0.176456496857918	1.27778627088727	0.851914527340792	574	559
TCGA-33-4586-01A-01D-1441-08	0	1	0	1	417	4	0	7	7	406	16646	21	21	6	48	3923	19	27	7	53	4116	16	87	49	152	4288	26	72	55	153	4319	6	10	7	23	623	0.0551558752997602	0.150326797385621	0.144246353322528	1.04215319086436	0.0369181380417336	3	12	6	21	557	0.0503597122302158	0.138157894736842	0.129897388059701	1.06359255409619	0.0377019748653501	0.052757793764988	22	124	1180	7427	0.353314102966598	1.11663785071757	0.729941897234535	Inf	1.09910610633852	1.56301452784504	0.113741317843853	1.7164300930201	0.911758474576271	0.682191452167515	0.899137684153411	0.46072997099277	395	384
TCGA-33-6737-01A-11D-1817-08	0	1	0	1	512	9	0	2	2	501	20541	20	10	4	34	4890	9	6	4	19	4993	56	75	93	224	5305	68	72	84	224	5353	43	9	32	84	772	0.1640625	0.375	0.144218195404446	2.60022668393782	0.10880829015544	40	12	35	87	766	0.169921875	0.388392857142857	0.144392082940622	2.68984870384185	0.113577023498695	0.29296875	150	151	1538	9120	6.77522113716358e-46	5.88903511784368	4.81201138708335	Inf	3.45337820615288	4.63848106044717	1.7110471965082e-39	11.9995596083933	2.62313665851168	2.69519689123638e-14	3.61119686959879	0.101988854641122	362	351
TCGA-34-2596-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	305	4	4	4	8	293	12013	16	19	5	40	2911	14	22	2	38	2896	29	35	40	104	3002	22	42	47	111	3204	8	5	13	26	429	0.0852459016393443	0.234234234234234	0.133895131086142	1.74938574938575	0.0606060606060606	15	8	11	34	438	0.111475409836066	0.326923076923077	0.145902731512325	2.24069195644538	0.0776255707762557	0.154098360655738	47	91	867	5339	3.61839836936256e-09	3.17969784371932	2.30484305163112	Inf	2.43787506477442	3.22812492932582	9.35168911905145e-08	5.05641916195485	1.97462514417532	0.000734529335266937	2.34535897961666	1	258	246
TCGA-34-2600-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	570	7	0	3	3	560	22960	17	15	8	40	5606	14	14	5	33	5786	79	52	112	243	5690	64	68	112	244	5878	40	16	52	108	884	0.189473684210526	0.442622950819672	0.15039128955427	2.94314220013352	0.122171945701357	56	10	48	114	868	0.2	0.469135802469136	0.152548330404218	3.07532570973431	0.131336405529954	0.343859649122807	196	171	1752	9816	4.93356264709343e-62	6.42030734555372	5.34733454371752	Inf	3.52625881825986	4.43260848740301	9.30542940859201e-44	11.4400377131263	2.94765166340509	3.31363829571561e-25	4.51770390027699	0.774366934292522	374	364
TCGA-34-2608-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	183	2	0	0	0	181	7421	6	11	2	19	1770	5	13	1	19	1868	8	27	32	67	1902	12	25	39	76	1881	3	0	7	10	271	0.0546448087431694	0.131578947368421	0.144072301967039	0.913284132841328	0.03690036900369	5	8	9	22	258	0.120218579234973	0.328358208955224	0.135646687697161	2.42068726136758	0.0852713178294574	0.131147540983607	24	67	529	3254	0.00155744557278769	2.20285051149399	1.42158001532621	Inf	1.88603834728598	2.86049149338374	0.00395288934870782	4.09887855798436	1.61154450331478	0.0359793636831328	1.78911862653057	0.0696786155660074	159	157
TCGA-34-5231-01A-21D-1817-08	0	0	2	2	742	9	2	11	13	720	29520	38	48	10	96	7010	41	46	13	100	7216	58	115	90	263	7665	50	117	94	261	7629	17	13	16	46	1027	0.0619946091644205	0.176245210727969	0.134617905361122	1.30922562087992	0.0447906523855891	21	16	15	52	1003	0.0700808625336927	0.197718631178707	0.13085453359426	1.51098036688414	0.0518444666001994	0.0929919137466307	69	223	2030	13264	1.48827270651868e-06	2.02165145151838	1.58549110486185	Inf	1.78029219245563	2.65084838533114	7.55296460819051e-09	3.54669581723065	1.26931355750696	0.0978397031570998	1.32385176413508	0.369607885378369	673	651
TCGA-34-5232-01A-21D-1817-08	0	1	0	1	227	5	0	0	0	222	9102	8	11	2	21	2066	8	13	4	25	2266	14	36	36	86	2332	14	24	52	90	2438	2	6	10	18	327	0.079295154185022	0.2	0.134126333059885	1.49113149847095	0.055045871559633	4	2	1	7	301	0.0308370044052863	0.0813953488372093	0.129073756432247	0.630611141157382	0.0232558139534884	0.0748898678414097	17	99	628	4142	0.360102545272827	1.13250627881753	0.692769346047457	Inf	1.11313968811772	1.62761601455869	0.155501317192223	1.79851126505874	0.949442675159236	0.620876752423026	0.942222859997043	0.232095470796428	210	205
TCGA-34-5234-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	210	3	0	0	0	207	8487	4	16	4	24	2074	15	22	2	39	2109	9	43	23	75	2187	15	32	22	69	2117	3	3	0	6	296	0.0285714285714286	0.0869565217391304	0.13982050070855	0.621915393654524	0.0202702702702703	2	5	3	10	304	0.0476190476190476	0.133333333333333	0.139003200731596	0.959210526315789	0.0328947368421053	0.0380952380952381	8	61	600	3704	0.762598280502928	0.80965409543571	0.385445748628211	Inf	0.831690821256039	1.49444444444444	0.23735608578849	1.62433865754385	0.478222222222222	0.959692677837113	0.44101293677661	0.685082190087752	202	199
TCGA-34-5236-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	249	6	0	0	0	243	9963	12	18	0	30	2578	4	14	13	31	2549	21	37	35	93	2461	21	37	31	89	2375	6	7	5	18	346	0.072289156626506	0.202247191011236	0.145684210526316	1.38825745275054	0.0520231213872832	8	7	7	22	401	0.0883534136546185	0.236559139784946	0.162941893539212	1.45180060601185	0.0548628428927681	0.104417670682731	26	82	747	4089	0.0136868789935625	1.73539239256655	1.14987697953774	Inf	1.55853041796817	2.15796519410977	0.00331807251952168	2.73602008477184	1.17707192405988	0.31937333637761	1.21634852399654	0.811646693938239	223	217
TCGA-34-5239-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	272	5	1	3	4	263	10783	15	12	4	31	2593	5	16	4	25	2673	16	44	40	100	2719	16	54	37	107	2798	5	4	5	14	415	0.0514705882352941	0.130841121495327	0.148320228734811	0.882152910708254	0.0337349397590361	3	6	8	17	397	0.0625	0.17	0.146009562339095	1.16430730478589	0.0428211586901763	0.0772058823529412	21	88	812	4705	0.119393148954818	1.38264800765528	0.883306734549094	Inf	1.30900031635558	1.69858374384236	0.0888887819435228	1.93127141428026	1.14709551532212	0.343883779551201	1.17691443189854	0.283069973260209	251	242
TCGA-34-5240-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	198	7	0	6	6	185	7585	6	11	1	18	1782	3	7	4	14	1851	9	35	33	77	1910	12	25	39	76	2042	4	3	12	19	301	0.095959595959596	0.25	0.147404505386876	1.69601328903654	0.0631229235880399	2	5	7	14	242	0.0707070707070707	0.181818181818182	0.126701570680628	1.43501126972201	0.0578512396694215	0.126262626262626	25	68	543	3409	0.000729358302665887	2.30749620119661	1.50139970946902	Inf	1.9564743856314	2.07945277558537	0.0590708811814162	2.51042102465009	1.92060568856149	0.00363317521826426	2.25004475091805	0.00201808652901636	173	160
TCGA-34-5241-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	2	0	0	1	1	1	41	0	0	0	0	12	0	0	0	0	13	0	0	0	0	7	0	1	0	1	9	0	0	0	0	3	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	0	NaN	NaN	0	0	0	3	13	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	2	1
TCGA-34-5927-01A-11D-1817-08	0	1	0	1	318	5	1	5	6	307	12587	10	17	1	28	3036	9	21	4	34	3027	28	50	50	128	3200	24	47	46	117	3324	7	5	11	23	443	0.0723270440251572	0.196581196581197	0.133273164861613	1.4750245991781	0.0519187358916479	9	8	10	27	455	0.0849056603773585	0.2109375	0.1421875	1.48351648351648	0.0593406593406593	0.116352201257862	37	111	898	5626	0.000231156160183918	2.08807060118145	1.48221184937242	Inf	1.8162583518931	2.23539489463766	0.00130809625446986	2.78385666929565	1.58922605790646	0.0208982924057325	1.75402621262972	0.407587685187313	281	270
TCGA-34-5928-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	450	9	1	1	2	439	17999	12	20	3	35	4455	13	9	2	24	4458	76	36	85	197	4566	71	32	80	183	4520	45	6	35	86	741	0.191111111111111	0.469945355191257	0.163938053097345	2.86660324624087	0.116059379217274	46	7	36	89	679	0.197777777777778	0.451776649746193	0.148707840560666	3.03801499667322	0.131075110456554	0.36	162	150	1420	7666	1.32640382960157e-47	5.82886117622433	4.776752926455	Inf	3.32234561213434	3.96103286384977	4.42789631287173e-36	8.77019341906065	2.75333333333333	1.22475411073869e-16	4.07683035237329	0.0415128350348492	288	277
TCGA-34-5929-01A-11D-1817-08	0	1	0	1	235	3	0	1	1	231	9471	7	6	2	15	2253	10	13	1	24	2250	25	30	31	86	2509	22	49	35	106	2459	10	10	11	31	359	0.131914893617021	0.292452830188679	0.145994306628711	2.00317969201661	0.0863509749303621	13	4	11	28	329	0.119148936170213	0.325581395348837	0.131127939418095	2.48292924294904	0.0851063829787234	0.191489361702128	45	68	688	4280	1.86662560699293e-11	4.11541089704548	2.91426425120186	Inf	2.875591685532	3.53364670954973	1.21710989652781e-08	5.95828520684493	2.40697674418605	5.53630291321493e-05	3.10947168718214	1	190	186
TCGA-37-3783-01A-01D-1267-08	0	1	0	1	445	4	0	1	1	440	18040	8	18	5	31	4379	6	16	3	25	4582	70	42	77	189	4464	61	39	95	195	4615	37	9	45	91	720	0.204494382022472	0.466666666666667	0.156013001083424	2.9912037037037	0.126388888888889	51	11	32	94	693	0.21123595505618	0.497354497354497	0.155241935483871	3.20373806088092	0.135642135642136	0.370786516853933	165	138	1413	7666	2.49497077830548e-52	6.48483762924178	5.29695418389024	Inf	3.49894543594487	4.31625635457016	3.06190433113244e-39	11.0964101147055	2.87645863164305	3.40324947984758e-19	4.39650977821493	0.295607870092274	280	275
TCGA-37-3789-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	491	1	1	8	9	481	19721	12	13	2	27	4833	9	19	3	31	5113	43	124	52	219	4799	48	108	48	204	4976	30	13	15	58	805	0.118126272912424	0.284313725490196	0.16177652733119	1.75744732675679	0.0720496894409938	24	11	21	56	711	0.114052953156823	0.255707762557078	0.148155865805376	1.72593748595136	0.0787623066104079	0.183299389002037	90	101	1516	8259	3.89140171879541e-24	4.85356298160782	3.76453920871426	Inf	3.03827238945144	3.82621995418829	3.47644089545104e-21	7.94826887484171	2.3212401055409	5.12709685088175e-07	3.06395661023574	0.0210190047193119	401	391
TCGA-37-4133-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	333	0	1	5	6	327	13407	15	23	5	43	3222	14	22	7	43	3303	19	42	53	114	3378	16	44	67	127	3504	7	11	9	27	514	0.0810810810810811	0.21259842519685	0.146689497716895	1.44930910873495	0.0525291828793774	7	5	6	18	441	0.0540540540540541	0.157894736842105	0.130550621669627	1.2094522019334	0.0408163265306122	0.0870870870870871	29	126	955	5927	0.0589846063946913	1.42834512093255	0.981822638637652	Inf	1.3482722513089	2.88251308900524	0.000134022945475575	4.13659287061231	0.900785340314136	0.706888528764714	0.88665287329776	1	304	298
TCGA-37-4135-01A-01D-1352-08	0	1	0	1	336	3	1	11	12	321	13161	14	23	2	39	3128	12	17	5	34	3132	31	50	39	120	3448	24	58	46	128	3453	5	5	5	15	477	0.0446428571428571	0.1171875	0.138140747176368	0.848319575471698	0.0314465408805031	8	2	4	14	427	0.0416666666666667	0.116666666666667	0.123839907192575	0.942076502732241	0.0327868852459016	0.0654761904761905	22	118	904	5997	0.214194954173444	1.23677119921505	0.806354692415745	Inf	1.19960493046776	1.80436444086887	0.0238955736883492	2.05309171175673	0.808289953149401	0.797792569829047	0.78561259486981	0.417274449673559	314	299
TCGA-37-4141-01A-02D-1352-08	0	0	0	0	372	5	0	9	9	358	14678	15	12	5	32	3497	16	17	11	44	3503	27	62	50	139	3839	30	76	37	143	3839	5	11	3	19	498	0.0510752688172043	0.132867132867133	0.129721281583746	1.02425084955205	0.0381526104417671	6	11	5	22	502	0.0591397849462366	0.158273381294964	0.130763219588434	1.21038149560033	0.0438247011952191	0.0510752688172043	19	125	1000	6678	0.513947878974278	1.0150552038842	0.642976735035003	Inf	1.01306944444444	1.48171929824561	0.117345353055488	1.59678990770202	0.706022988505747	0.892855682782906	0.676283340489945	0.601458808712604	353	339
TCGA-37-5819-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	832	19	5	18	23	790	32390	37	28	8	73	7830	35	36	13	84	7818	45	181	98	324	8432	36	188	85	309	8310	5	20	14	39	1142	0.046875	0.12621359223301	0.137424789410349	0.918419397072076	0.0341506129597198	12	25	13	50	1099	0.0600961538461538	0.154320987654321	0.130336812144213	1.18401689526955	0.0454959053685168	0.0528846153846154	44	220	2241	14501	0.0750894753847854	1.29413142705419	0.96421189987647	Inf	1.24512866279935	1.56793979759918	0.0387619270575313	1.71872731317957	1.1022450457568	0.325470185155571	1.11989962083947	0.117291770695331	788	746
TCGA-39-5016-01A-01D-1441-08	0	0	1	1	407	8	0	4	4	395	16195	13	10	7	30	3766	14	28	5	47	3874	24	61	72	157	4353	21	68	72	161	4202	2	6	9	17	513	0.0417690417690418	0.105590062111801	0.122084721561161	0.864891697843643	0.0331384015594542	6	5	8	19	519	0.0466830466830467	0.121019108280255	0.119228118538939	1.01502153823497	0.0366088631984586	0.0614250614250614	25	164	1032	7523	0.345970606907113	1.11119050951249	0.749948477902751	Inf	1.09652495795907	1.47372954349699	0.170188874985243	1.57604793196288	0.978648524978467	0.576353540905684	0.975791939838702	0.0466149783764657	382	370
TCGA-39-5019-01A-01D-1817-08	0	0	0	0	216	3	0	4	4	209	8569	9	11	1	21	1990	8	18	4	30	2134	11	38	27	76	2226	14	32	36	82	2219	7	5	5	17	302	0.0787037037037037	0.207317073170732	0.13609734114466	1.52329995154256	0.0562913907284768	3	5	4	12	294	0.0555555555555556	0.157894736842105	0.132075471698113	1.19548872180451	0.0408163265306122	0.087962962962963	19	69	596	3849	0.0244807715157076	1.77802802148183	1.09880554942607	Inf	1.61026159243441	2.98322147651007	0.000935176949738197	4.30350382186576	1.06543624161074	0.475483242743467	1.0763456906196	1	197	190
TCGA-39-5021-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	166	3	0	2	2	161	6601	8	9	0	17	1601	2	11	5	18	1642	15	29	22	66	1749	7	25	28	60	1609	2	4	6	12	253	0.072289156626506	0.2	0.157240522063393	1.27193675889328	0.0474308300395257	4	5	5	14	239	0.0843373493975904	0.212121212121212	0.136649514008005	1.55230125523013	0.0585774058577406	0.102409638554217	17	55	492	2866	0.0309859925961887	1.80014266727044	1.07141686024261	Inf	1.61150632339657	1.86141906873614	0.0926675594297632	2.18380854312802	1.50154471544715	0.108466026191262	1.64271830058538	0.236706211941847	149	144
TCGA-39-5022-01A-21D-1817-08	0	1	0	1	328	2	0	0	0	326	13366	9	13	2	24	3266	2	9	2	13	3419	74	18	66	158	3334	67	23	41	131	3347	52	6	22	80	570	0.24390243902439	0.610687022900763	0.170301762772632	3.58591134324361	0.140350877192982	51	4	34	89	507	0.271341463414634	0.563291139240506	0.152069586082783	3.70416697875315	0.175542406311637	0.484756097560976	159	89	1077	5604	2.98351324002945e-61	9.29339801842917	7.36506708117657	Inf	3.97714304969	4.53151978506095	3.62149636268611e-49	14.0950252481649	3.2466092208367	1.61552141153625e-17	5.71131186909407	4.55870371343383e-07	169	167
TCGA-39-5024-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	255	1	0	0	0	254	10414	10	12	6	28	2588	9	16	6	31	2592	32	18	39	89	2615	30	24	52	106	2619	17	4	16	37	380	0.145098039215686	0.349056603773585	0.145093547155403	2.40573485600794	0.0973684210526316	16	6	15	37	407	0.145098039215686	0.415730337078652	0.155640535372849	2.67109295199183	0.0909090909090909	0.250980392156863	64	89	787	4447	4.75866673365071e-15	4.06191300272792	3.03160519799115	Inf	2.78193852721097	3.53982046972988	4.59788971858267e-12	6.42638545877922	2.26557940153874	6.52023304562388e-06	2.91865614619906	0.868299936992599	191	190
TCGA-39-5027-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	373	7	0	5	5	361	14801	29	16	2	47	3589	23	22	4	49	3696	13	73	39	125	3783	26	68	46	140	3733	8	11	6	25	516	0.0670241286863271	0.178571428571429	0.138226627377444	1.29187430786268	0.0484496124031008	3	11	8	22	542	0.0589812332439678	0.176	0.143272535025112	1.22842804428044	0.040590405904059	0.0670241286863271	25	99	1058	6458	0.0407676719938527	1.54130069551044	1.02416165108172	Inf	1.43225196658333	2.00368377684068	0.0164753464002199	2.39761297513509	1.1700656065829	0.307825896218067	1.20355373414367	0.641138038196785	348	336
TCGA-39-5028-01A-01D-1441-08	1	2	1	4	227	0	0	0	0	227	9307	4	9	1	14	2293	5	10	1	16	2320	38	16	40	94	2318	25	29	49	103	2376	20	7	16	43	363	0.18942731277533	0.41747572815534	0.152777777777778	2.73256840247131	0.118457300275482	24	1	18	43	362	0.18942731277533	0.457446808510638	0.156169111302847	2.92917597272834	0.11878453038674	0.343612334801762	78	74	725	3969	9.53057116350272e-24	5.76726556492031	4.32106349004728	Inf	3.32243194192377	4.52186097427477	1.44910020465828e-21	12.6713076724397	2.47339790778768	2.23714382260078e-07	3.38301652465998	0.167876259928872	149	149
TCGA-39-5029-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	170	1	0	0	0	169	6929	0	12	2	14	1722	7	16	2	25	1631	13	22	35	70	1795	10	19	31	60	1781	5	2	5	12	247	0.0705882352941176	0.2	0.138686131386861	1.44210526315789	0.048582995951417	7	8	8	23	251	0.135294117647059	0.328571428571429	0.13983286908078	2.34974388161639	0.0916334661354582	0.147058823529412	25	64	498	3078	0.0004472399689092	2.41344881299585	1.56416508011569	Inf	2.017056992013	3.74646411733892	1.76276318041984e-05	6.73667445815198	1.41438481197517	0.12523610448711	1.51582244308555	1	145	144
TCGA-39-5030-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	325	1	0	0	0	324	13284	4	10	1	15	3036	2	15	2	19	3315	24	32	95	151	3401	24	29	86	139	3532	14	4	7	25	520	0.0769230769230769	0.179856115107914	0.14722536806342	1.22163807415606	0.0480769230769231	16	7	14	37	436	0.113846153846154	0.245033112582781	0.128197588944428	1.91137067865605	0.0848623853211009	0.156923076923077	51	178	956	5977	0.000422443401104881	1.79115184586749	1.34659337033221	Inf	1.61509473607279	4.53255753138075	1.20230345124039e-14	10.4138122538621	0.841402945051897	0.829345239362905	0.820608701424933	0.143959362630222	274	273
TCGA-39-5031-01A-01D-1441-08	0	0	2	2	742	7	0	3	3	732	30012	8	12	5	25	7414	17	10	5	32	7480	124	57	149	330	7537	111	69	165	345	7581	77	24	86	187	1206	0.252021563342318	0.542028985507246	0.159081915314602	3.40723195616122	0.155058043117745	86	9	87	182	1137	0.245283018867925	0.551515151515152	0.150855778161072	3.65591002372005	0.160070360598065	0.452830188679245	336	213	2343	12775	4.93246994939416e-124	8.59905589327474	7.38389391313453	Inf	3.94901683657167	4.47550240190336	1.38709081223114e-74	12.3358841384574	3.55499101538395	6.26532718771629e-57	6.68855924810074	0.505915671412437	406	396
TCGA-39-5035-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	182	4	0	0	0	178	7298	3	8	6	17	1778	4	6	6	16	1816	21	14	32	67	1776	24	12	42	78	1928	12	0	10	22	281	0.120879120879121	0.282051282051282	0.145746887966805	1.93521306688566	0.0782918149466192	11	3	10	24	276	0.131868131868132	0.358208955223881	0.155405405405405	2.30499675535367	0.0869565217391304	0.236263736263736	43	76	557	3147	2.37993467971907e-08	3.19531545501766	2.26202580094511	Inf	2.40290873979753	3.39884300817874	2.16019796131441e-08	5.90236503602577	1.79727303605221	0.00605482567426804	2.09206911870637	0.676261718124988	139	135
TCGA-39-5036-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	334	3	2	3	5	326	13366	20	27	10	57	3325	17	18	7	42	3460	22	45	47	114	3349	23	38	52	113	3232	8	2	9	19	479	0.0568862275449102	0.168141592920354	0.148205445544554	1.13451696934986	0.0396659707724426	11	8	8	27	467	0.0808383233532934	0.236842105263158	0.139444610331442	1.69846726022766	0.0578158458244111	0.107784431137725	36	108	946	5635	0.000623614802968812	1.98536336335202	1.40270734351298	Inf	1.73916490486258	2.93725628376791	6.00997994563593e-06	4.35176346176609	1.19457791445106	0.254078663338659	1.2348615595845	0.831028064785003	298	290
TCGA-39-5037-01A-01D-1441-08	0	0	1	1	280	2	1	4	5	273	11193	16	16	4	36	2658	10	22	5	37	2815	16	39	47	102	2897	13	40	45	98	2823	4	7	9	20	398	0.0714285714285714	0.204081632653061	0.140984767977329	1.44754384165727	0.050251256281407	3	6	9	18	379	0.0642857142857143	0.176470588235294	0.130824991370383	1.34890578922862	0.0474934036939314	0.0892857142857143	25	96	777	4943	0.0217355210306117	1.6565036742719	1.09771479287984	Inf	1.52100152100152	1.77694936315626	0.0899159687289862	2.02389040268826	1.44032230988753	0.071158848909093	1.5472874773911	0.0137944750894916	255	248
TCGA-39-5039-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	193	5	1	0	1	187	7667	7	12	1	20	1867	10	12	2	24	1850	7	37	29	73	1997	15	23	32	70	1953	3	3	3	9	260	0.0466321243523316	0.128571428571429	0.133128520225294	0.965769230769231	0.0346153846153846	1	2	1	4	254	0.0207253886010363	0.0547945205479452	0.127190786179269	0.430805738323805	0.015748031496063	0.0414507772020725	8	75	514	3436	0.860055150446155	0.713101596200156	0.341658566846792	Inf	0.74070601472036	1.39724089140432	0.320793714541176	1.48534044589279	0.503922944440901	0.964598877367981	0.469178932283571	1	185	179
TCGA-43-2578-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	352	3	0	1	1	348	14268	25	19	7	51	3365	20	16	5	41	3358	28	74	43	145	3803	16	56	39	111	3742	4	8	6	18	476	0.0511363636363636	0.162162162162162	0.127204703367183	1.2748126277538	0.0378151260504202	6	8	7	21	493	0.0596590909090909	0.144827586206897	0.129634499079674	1.11719941246415	0.0425963488843813	0.0653409090909091	23	103	969	6576	0.0531463670498328	1.51530407631641	0.992419427350066	Inf	1.42132291513096	1.76963129749507	0.0499132874398467	1.99581652958315	1.23442573435022	0.252259725589156	1.27854646408885	0.620030839539336	329	325
TCGA-43-3394-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	176	1	3	6	9	166	6806	10	18	3	31	1752	8	10	1	19	1641	5	35	23	63	1648	10	27	16	53	1765	5	2	3	10	229	0.0568181818181818	0.188679245283019	0.129745042492918	1.45423086429925	0.0436681222707424	1	5	3	9	233	0.0511363636363636	0.142857142857143	0.141383495145631	1.01042305334151	0.0386266094420601	0.0681818181818182	12	42	462	2951	0.0566449035283965	1.82459170187726	0.977446338762649	Inf	1.64165464165464	2.95497835497835	0.010550131434085	4.25584600029607	1.13653013653014	0.437974909977997	1.16127938101795	1	164	154
TCGA-43-3920-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	350	1	2	3	5	344	14104	14	15	3	32	3466	12	16	5	33	3677	37	61	49	147	3475	31	62	39	132	3486	16	13	15	44	536	0.125714285714286	0.333333333333333	0.153757888697648	2.16791044776119	0.082089552238806	13	6	14	33	512	0.0942857142857143	0.224489795918367	0.147338129496403	1.52363679846939	0.064453125	0.165714285714286	58	98	1048	5913	2.14176308558612e-11	3.33845565945584	2.48655104042158	Inf	2.46952681542376	2.83269252357432	5.35928646392014e-08	4.19436377441828	2.18889876821652	2.49566107854422e-05	2.77288459475074	1	292	286
TCGA-43-5668-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	708	13	1	5	6	689	28249	30	34	13	77	6703	42	21	6	69	7051	38	124	86	248	7260	40	178	77	295	7235	7	19	11	37	977	0.0522598870056497	0.125423728813559	0.13503800967519	0.928803150425897	0.037871033776868	5	19	14	38	989	0.0536723163841808	0.153225806451613	0.136225895316804	1.12479206758211	0.038422649140546	0.0522598870056497	37	204	1966	12529	0.235686038631082	1.15582166809792	0.83880489731787	Inf	1.13192952389797	1.13428280773143	0.367450281515092	1.15866472394605	1.13080341261569	0.287200011532685	1.15446433490149	0.0222660649853544	671	652
TCGA-43-6143-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	366	9	1	13	14	343	14063	14	19	3	36	3435	17	31	6	54	3411	28	61	54	143	3659	24	45	41	110	3558	6	6	9	21	511	0.0573770491803279	0.190909090909091	0.143620011242271	1.32926525529265	0.0410958904109589	10	4	9	23	500	0.0628415300546448	0.160839160839161	0.136649357748019	1.17702097902098	0.046	0.092896174863388	34	113	1011	6206	0.00222718961817231	1.84674799998042	1.29687322969523	Inf	1.6510762564175	2.19645438636537	0.00156783263604888	2.7277345820657	1.3525534905513	0.112490281548718	1.43488467531339	0.826908622506718	332	309
TCGA-43-6647-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	194	5	0	0	0	189	7749	7	14	3	24	1906	9	15	4	28	1956	12	31	35	78	1906	19	20	20	59	1981	6	6	2	14	279	0.0721649484536082	0.23728813559322	0.140837960625947	1.68483081222283	0.0501792114695341	5	6	5	16	277	0.0824742268041237	0.205128205128205	0.145330535152151	1.41145977969083	0.0577617328519856	0.0927835051546392	18	68	556	3331	0.062745287482393	1.58563323122943	0.967297706658115	Inf	1.46323406391166	2.48067997215131	0.00285046880017032	3.2936209356326	0.889764551994768	0.688459411986822	0.873734164110199	0.398508976829821	176	171
TCGA-43-6770-01A-11D-1817-08	0	0	1	1	255	7	0	3	3	245	10045	10	19	4	33	2326	9	19	5	33	2468	23	37	31	91	2576	25	32	31	88	2675	8	4	6	18	346	0.0705882352941176	0.204545454545455	0.129345794392523	1.58138465580662	0.0520231213872832	5	2	6	13	301	0.0509803921568627	0.142857142857143	0.116847826086957	1.22259136212625	0.0431893687707641	0.0980392156862745	25	85	647	4604	0.00192120202214887	2.09255819350979	1.37821758572695	Inf	1.84452718842209	2.19806156620299	0.00463592359674666	2.64237951599163	1.57082315401107	0.075737921744497	1.70760758538646	1	230	220
TCGA-43-6771-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	216	8	0	0	0	208	8528	15	13	2	30	2056	7	5	2	14	1999	12	54	17	83	2205	7	38	36	81	2268	1	5	2	8	297	0.037037037037037	0.0987654320987654	0.130952380952381	0.754208754208754	0.0269360269360269	4	5	4	13	293	0.0601851851851852	0.156626506024096	0.132879818594104	1.17870800608578	0.0443686006825939	0.0509259259259259	11	61	590	3883	0.352020830488545	1.1867398536409	0.632496920599638	Inf	1.15826271186441	1.99509366636931	0.0959029412070184	2.34988086203655	0.858266709306044	0.716110235991691	0.840213503267142	1	205	197
TCGA-46-3765-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	375	5	1	1	2	368	15088	10	11	4	25	3701	11	13	4	28	3835	20	110	45	175	3872	18	76	46	140	3680	4	7	13	24	547	0.064	0.171428571428571	0.148641304347826	1.15330373465657	0.0438756855575868	9	13	15	37	566	0.0986666666666667	0.211428571428571	0.146177685950413	1.44638061585058	0.0653710247349823	0.109333333333333	41	88	1113	6439	1.05286319369895e-06	2.6947511515049	1.92105178083458	Inf	2.15655710872911	2.32127488532652	0.0022877370906255	3.0077267528845	2.08777386135877	8.99022850522454e-05	2.57077196770663	0.00691925076705544	334	327
TCGA-46-3767-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	237	4	0	2	2	231	9471	15	9	3	27	2488	8	9	4	21	2243	16	66	13	95	2425	14	51	23	88	2315	3	7	3	13	312	0.0548523206751055	0.147727272727273	0.134773218142549	1.09611742424242	0.0416666666666667	6	6	3	15	391	0.0632911392405063	0.157894736842105	0.161237113402062	0.979270426706152	0.0383631713554987	0.0632911392405063	15	51	703	4037	0.0589380144841905	1.68875682289726	0.973740081168313	Inf	1.5323936376568	2.02275960170697	0.0265792273202671	2.4603399541058	1.12375533428165	0.448988320772106	1.14844185113553	0.547152630062323	222	216
TCGA-46-3768-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	401	8	2	13	15	378	15498	18	26	5	49	3833	26	15	3	44	3950	26	91	36	153	3913	22	75	35	132	3802	9	11	7	27	596	0.0673316708229426	0.204545454545455	0.156759600210416	1.30483526540574	0.0453020134228188	7	12	6	25	564	0.0623441396508728	0.163398692810458	0.144134934832609	1.13365085987114	0.0443262411347518	0.0723192019950125	29	90	1160	6555	0.00545185803782546	1.82066279196993	1.23655541698387	Inf	1.62079831932773	2.21695402298851	0.00128861924715298	2.8249243555804	1.21776347741622	0.265894371966959	1.26653004618671	0.662311513260241	372	349
TCGA-46-3769-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	1003	20	3	5	8	975	39975	42	33	12	87	9789	45	31	7	83	9813	113	167	123	403	10201	95	185	122	402	10172	47	37	45	129	1494	0.128614157527418	0.32089552238806	0.146873771136453	2.18483885791924	0.0863453815261044	59	20	42	121	1464	0.120638085742772	0.300248138957816	0.143515341633173	2.09209785895402	0.0826502732240437	0.192422731804586	193	260	2958	17415	6.23048025079458e-46	4.37008086626992	3.70584494603964	Inf	2.93437708492851	3.50993719769075	1.33269277913284e-34	6.11745894003253	2.44573829531813	4.52331090443449e-16	3.24155180369088	0.0981071225514733	810	782
TCGA-46-6025-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	217	3	0	3	3	211	8651	7	21	4	32	2075	8	8	8	24	2042	18	11	34	63	2241	33	23	36	92	2293	14	5	6	25	301	0.115207373271889	0.271739130434783	0.131269079808112	2.07009244547162	0.0830564784053156	6	1	10	17	291	0.0783410138248848	0.26984126984127	0.129852744310576	2.0780559646539	0.0584192439862543	0.165898617511521	36	85	592	3942	1.7793536189859e-06	2.81931946390609	1.96451931702461	Inf	2.27864641501005	3.00344462109168	3.22949548455424e-06	4.29417869275691	1.75057915057915	0.0178810480480604	1.972670730141	0.50862847882284	181	175
TCGA-46-6026-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	238	2	2	4	6	230	9430	5	12	1	18	2208	7	11	2	20	2301	13	33	50	96	2439	14	35	47	96	2482	5	4	14	23	327	0.0966386554621849	0.239583333333333	0.131748589846898	1.81848878695209	0.0703363914373089	9	3	12	24	327	0.100840336134454	0.25	0.134071340713407	1.86467889908257	0.073394495412844	0.168067226890756	40	84	654	4267	7.26861489777223e-08	3.1059034076287	2.19481022372141	Inf	2.42724671993687	3.90157435723185	2.1492358460468e-06	7.02081444403212	2.01686686213311	0.000354524410582855	2.38857414495088	0.0212085990021263	198	190
TCGA-51-4079-01A-01D-1458-08	0	0	1	1	424	9	2	4	6	409	16769	28	18	6	52	4074	32	18	10	60	4084	25	53	57	135	4328	19	78	65	162	4283	9	11	20	40	603	0.0943396226415094	0.246913580246914	0.140789166472099	1.75378252769076	0.066334991708126	8	6	16	30	618	0.0707547169811321	0.222222222222222	0.14279112754159	1.55627472132326	0.0485436893203883	0.125	53	113	1221	7390	7.47428426955472e-09	2.83827921987984	2.11062014729119	Inf	2.25167500468705	2.72479711116075	5.86337821870427e-05	3.810031028243	2.08104080235228	1.17438866566132e-05	2.53318039092193	0.00158969451516888	371	356
TCGA-51-4080-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	317	6	2	7	9	302	12382	16	12	6	34	2998	17	17	2	36	3041	24	50	48	122	3165	13	63	34	110	3178	1	6	6	13	455	0.0410094637223975	0.118181818181818	0.143171806167401	0.825454545454545	0.0285714285714286	3	7	4	14	415	0.0441640378548896	0.114754098360656	0.131121642969984	0.87517282243729	0.0337349397590361	0.0441640378548896	14	105	870	5473	0.768602919826596	0.838795601948353	0.490045034432191	Inf	0.857741717376606	0.788195091643368	0.765933655948201	0.762551529703194	0.889122511914774	0.702731482224004	0.873762915555668	0.118849833020996	303	288
TCGA-51-4081-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	228	5	1	3	4	219	8979	7	16	2	25	2097	12	13	6	31	2170	11	34	37	82	2284	17	36	28	81	2428	6	3	1	10	306	0.043859649122807	0.123456790123457	0.126029654036244	0.979585249737755	0.0326797385620915	4	6	6	16	308	0.0701754385964912	0.195121951219512	0.134851138353765	1.44694330060184	0.051948051948052	0.0745614035087719	17	76	614	4098	0.0955847296547581	1.49278004822783	0.904041930707594	Inf	1.4028230184582	2.74080967892043	0.00205313608002369	3.70599086570396	0.826459533951391	0.758661040265026	0.805548943048837	0.555135522297396	211	202
TCGA-56-1622-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	244	7	1	2	3	234	9594	9	18	6	33	2329	6	16	4	26	2353	15	38	26	79	2299	14	43	39	96	2613	2	3	5	10	374	0.040983606557377	0.104166666666667	0.143130501339457	0.727774064171123	0.0267379679144385	3	5	3	11	336	0.0450819672131148	0.139240506329114	0.146150500217486	0.952720012055455	0.0327380952380952	0.0532786885245902	13	81	710	4202	0.613123541100205	0.949853196148095	0.538591931730005	Inf	0.956787533712916	1.19281204468188	0.412255276499295	1.23291366614414	0.85148429035753	0.739928642280159	0.83066926815388	0.505475577859527	231	221
TCGA-56-5897-01A-11D-1632-08	0	0	0	0	127	1	0	0	0	126	5166	3	9	1	13	1214	4	9	3	16	1354	14	20	21	55	1300	13	12	17	42	1298	9	1	6	16	204	0.125984251968504	0.380952380952381	0.157164869029276	2.42390289449113	0.0784313725490196	11	2	7	20	183	0.15748031496063	0.363636363636364	0.140769230769231	2.58320914058619	0.109289617486339	0.259842519685039	33	32	387	2211	2.91152943062935e-11	5.88563454602147	3.75372486741581	Inf	3.408228980322	4.97272466264714	1.31657313367962e-11	16.2943909505532	2.29661362709098	0.00267995555916927	2.96915530962882	0.155401359597851	94	93
TCGA-56-5898-01A-11D-1632-08	0	0	0	0	169	3	0	2	2	164	6724	4	16	3	23	1725	4	13	3	20	1640	14	28	14	56	1673	9	26	30	65	1686	2	5	4	11	215	0.0650887573964497	0.169230769230769	0.127520759193357	1.32708407871199	0.0511627906976744	6	1	3	10	232	0.0591715976331361	0.178571428571429	0.138673042438733	1.28771551724138	0.0431034482758621	0.0887573964497041	15	52	447	2912	0.03001033130076	1.87868738751878	1.0815245365292	Inf	1.68236001202043	2.6137535259216	0.00778536999733087	3.47259547097197	1.19549522066301	0.370720053078961	1.23239232297428	1	154	149
TCGA-56-6545-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	322	10	0	0	0	312	12792	12	14	5	31	3010	13	15	3	31	3175	35	46	43	124	3320	26	62	38	126	3287	12	8	12	32	465	0.0993788819875776	0.253968253968254	0.141466382719805	1.7952551629971	0.0688172043010753	14	8	15	37	447	0.114906832298137	0.298387096774194	0.134638554216867	2.21620841451974	0.0827740492170022	0.164596273291925	53	89	912	5695	5.02542926975532e-12	3.71770493364442	2.72779129304089	Inf	2.70393964665184	3.08782714984182	4.53243292453347e-08	4.63733326642306	2.41483918128655	7.74352957969663e-06	3.12150546619396	1	269	259
TCGA-56-6546-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	366	9	0	0	0	357	14637	23	20	8	51	3511	23	19	2	44	3429	17	67	52	136	3879	27	61	38	126	3818	5	8	4	17	489	0.046448087431694	0.134920634920635	0.12807752750131	1.05342941539261	0.0347648261758691	2	11	3	16	512	0.0437158469945355	0.117647058823529	0.131992781644754	0.891314338235294	0.03125	0.0382513661202186	14	120	1001	6696	0.842581144633513	0.780442507135408	0.457906893221294	Inf	0.803360818286191	1.22329942784488	0.346750757627573	1.26550256659731	0.598057498057498	0.956375274582435	0.564193357298472	1	352	343
TCGA-60-2698-01A-01D-1522-08	0	2	0	2	1378	13	0	7	7	1358	55678	29	38	10	77	13731	28	26	12	66	13862	236	126	249	611	14290	235	117	252	604	13795	163	25	118	306	2155	0.222060957910015	0.506622516556291	0.156216020297209	3.24308938092531	0.14199535962877	174	28	122	324	2172	0.235123367198839	0.530278232405892	0.151994401679496	3.48880107784539	0.149171270718232	0.418722786647315	577	395	4327	23758	2.94386457877483e-204	8.01950634271824	7.16400077654944	Inf	3.85298289713075	4.6440461487809	2.20168601536454e-159	13.8061632540992	3.10928870246565	7.90176141560027e-64	5.04856311596338	5.3630284839837e-08	801	781
TCGA-60-2707-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	142	4	0	1	1	137	5617	3	8	0	11	1436	4	13	0	17	1422	18	19	20	57	1393	13	16	23	52	1366	10	4	11	25	206	0.176056338028169	0.480769230769231	0.150805270863836	3.18801344286781	0.121359223300971	12	3	4	19	206	0.133802816901408	0.333333333333333	0.147882268485284	2.25404530744337	0.0922330097087379	0.26056338028169	37	37	412	2347	3.82842573512581e-12	5.69123577908887	3.73697616436984	Inf	3.34830097087379	4.75242718446602	5.32835082014059e-12	13.9027645891407	2.33602393316776	0.00107139762553372	3.05006208732506	0.194796051606385	105	100
TCGA-60-2708-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	232	2	0	5	5	225	9225	17	14	5	36	2280	9	13	3	25	2148	21	22	36	79	2433	19	30	36	85	2364	10	0	7	17	318	0.0732758620689655	0.2	0.134517766497462	1.48679245283019	0.0534591194968553	7	4	5	16	324	0.0689655172413793	0.20253164556962	0.133168927250308	1.52086263478669	0.0493827160493827	0.125	29	83	642	4155	0.000363125042077952	2.2607987026054	1.52501718030326	Inf	1.93470460614152	3.17558411214953	6.53173732744415e-06	4.78134028300404	1.24532710280374	0.254199004167292	1.29431593682091	0.321257069400288	203	196
TCGA-60-2709-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	218	5	0	0	0	213	8733	9	13	2	24	2201	9	20	2	31	2204	14	38	29	81	2162	18	28	31	77	2166	2	8	6	16	309	0.073394495412844	0.207792207792208	0.142659279778393	1.45656285462111	0.0517799352750809	6	7	6	19	365	0.0871559633027523	0.234567901234568	0.168825161887142	1.38941315744969	0.0520547945205479	0.0917431192660551	20	72	674	3654	0.0757317944452119	1.50577251789936	0.943090789067154	Inf	1.39594890981809	1.6053412462908	0.114818595317648	1.80682320885762	1.28427299703264	0.21884041963354	1.35523577382379	0.427864573711048	198	193
TCGA-60-2710-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	227	3	1	2	3	221	9061	11	15	9	35	2185	11	13	2	26	2232	11	33	43	87	2298	8	33	32	73	2346	1	8	5	14	321	0.0616740088105727	0.191780821917808	0.136828644501279	1.40161310971707	0.043613707165109	1	8	5	14	295	0.0616740088105727	0.160919540229885	0.128372497824195	1.25353594389246	0.0474576271186441	0.052863436123348	12	82	616	4028	0.602848121193793	0.956924751542332	0.529964687950242	Inf	0.962420558165239	0.793574846206425	0.738668697383261	0.769329122436255	1.00519480519481	0.545147045611805	1.00599291883631	0.0200300915227592	215	209
TCGA-60-2711-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	148	2	1	0	1	145	5945	10	10	1	21	1379	5	8	1	14	1453	14	14	23	51	1521	13	25	21	59	1592	3	3	1	7	229	0.0472972972972973	0.11864406779661	0.143844221105528	0.824809414551107	0.0305676855895196	5	1	4	10	193	0.0675675675675676	0.196078431372549	0.126890203813281	1.54526059128315	0.0518134715025907	0.0878378378378378	13	58	422	2691	0.16295453173619	1.42909304211263	0.796591322666104	Inf	1.35067752486483	2.18571177812884	0.0238896628217834	2.68386497458935	0.838270142180095	0.729470169183062	0.817584328953735	0.481265818703551	135	132
TCGA-60-2712-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	100	1	2	3	5	94	3854	2	5	2	9	960	1	3	3	7	889	9	10	19	38	1019	7	11	22	40	986	0	0	5	5	137	0.05	0.125	0.13894523326572	0.89963503649635	0.0364963503649635	5	1	5	11	156	0.11	0.289473684210526	0.153091265947007	1.89085695006748	0.0705128205128205	0.15	15	42	293	1712	0.0166187938883474	2.08587412897096	1.18009485625365	Inf	1.80079037183402	2.1384385665529	0.0736259160788388	2.65404707299239	1.66902522267543	0.0702152363762465	1.88404421036734	0.155613477924309	85	79
TCGA-60-2713-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	284	6	0	4	4	274	11234	10	19	6	35	2821	12	18	9	39	2811	29	30	40	99	2778	28	32	41	101	2824	9	2	7	18	426	0.0633802816901408	0.178217821782178	0.150849858356941	1.181425184772	0.0422535211267606	8	5	6	19	416	0.0669014084507042	0.191919191919192	0.149748020158387	1.28161421911422	0.0456730769230769	0.105633802816901	30	108	842	4760	0.0239161123253433	1.57018862074294	1.07862859027481	Inf	1.44634927191986	1.98428970287953	0.00358486093050704	2.40207860638226	1.06779859828158	0.446925162054759	1.08076553647463	0.477849621897703	254	244
TCGA-60-2715-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	190	2	0	0	0	188	7708	11	11	5	27	1825	10	14	4	28	1919	9	20	29	58	1891	10	31	34	75	2073	2	10	5	17	277	0.0894736842105263	0.226666666666667	0.133622768933912	1.69631768953069	0.0613718411552347	2	2	2	6	237	0.0315789473684211	0.103448275862069	0.125330512956108	0.825403753819293	0.0253164556962025	0.0578947368421053	11	71	514	3450	0.502663787739509	1.03989390170993	0.557210891487084	Inf	1.03454493688906	1.62359205406512	0.22737451655375	1.7895592453855	0.856895806312149	0.724218439261107	0.83905146455538	0.49076968674246	179	177
TCGA-60-2719-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	223	3	1	3	4	216	8856	7	19	5	31	2172	12	19	1	32	2118	10	26	35	71	2362	14	34	34	82	2204	3	4	9	16	315	0.0717488789237668	0.195121951219512	0.142921960072595	1.36523422377081	0.0507936507936508	3	2	4	9	314	0.0403587443946188	0.126760563380282	0.132938187976291	0.953530097784157	0.0286624203821656	0.0852017937219731	19	74	629	3937	0.0512441909769453	1.60687777187108	0.996583125828949	Inf	1.48305041284168	1.8147853736089	0.10332688485581	2.08597534408415	1.36766433953135	0.150722888986912	1.45287776191638	0.0792068906018774	204	197
TCGA-60-2720-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	457	8	0	0	0	449	18409	17	17	5	39	4488	14	30	4	48	4646	61	54	51	166	4501	59	64	73	196	4774	36	1	27	64	701	0.140043763676149	0.326530612244898	0.146837033933808	2.22376197269207	0.0912981455064194	25	6	11	42	647	0.0919037199124726	0.253012048192771	0.143745834259054	1.76013482058062	0.0649149922720247	0.216630196936543	99	145	1348	7927	2.11850138459772e-22	4.01431554077252	3.19012066780292	Inf	2.79170416403172	3.49761993076162	1.96450580743529e-20	6.07805907382761	2.10855987364794	4.54905228033954e-06	2.59797163389072	0.00237705491878434	358	350
TCGA-60-2721-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	95	0	0	0	0	95	3895	2	5	1	8	1022	1	10	0	11	891	11	5	15	31	945	14	11	20	45	1037	7	2	6	15	135	0.157894736842105	0.333333333333333	0.130183220829315	2.56049382716049	0.111111111111111	3	2	4	9	146	0.0947368421052632	0.290322580645161	0.154497354497354	1.8791427308882	0.0616438356164384	0.210526315789474	20	40	281	1701	0.000192417186833382	3.02441423037709	1.81336937865604	Inf	2.35112692763938	2.82135231316726	0.00152772146978082	4.03163576252064	2.01525165226233	0.021797647589007	2.41986274044842	1	75	75
TCGA-60-2722-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	357	7	1	6	7	343	14063	13	13	4	30	3483	17	27	7	51	3523	22	48	49	119	3493	27	59	57	143	3564	10	14	10	34	545	0.0952380952380952	0.237762237762238	0.152918069584736	1.55483415666902	0.0623853211009174	9	4	13	26	499	0.0728291316526611	0.218487394957983	0.142857142857143	1.52941176470588	0.0521042084168337	0.117647058823529	42	113	1044	6013	6.61890712032123e-05	2.14045409544038	1.54753828465701	Inf	1.83162773451984	2.6210610681054	3.84550414522898e-05	3.64680017576421	1.46670100484349	0.0372772738186555	1.59589910473728	0.566129834184731	315	301
TCGA-60-2723-01A-01D-1522-08	0	1	1	2	310	5	0	3	3	302	12382	19	22	3	44	2947	12	15	4	31	3063	20	58	40	118	3172	23	57	29	109	3200	6	8	2	16	441	0.0516129032258065	0.146788990825688	0.1378125	1.06513553433606	0.036281179138322	2	6	6	14	430	0.0451612903225806	0.11864406779661	0.135561160151324	0.875206937327552	0.0325581395348837	0.0516129032258065	16	96	871	5501	0.467295408262661	1.0526241590382	0.634903260855841	Inf	1.04510414958176	1.36106586922276	0.229025745681031	1.4434969150642	0.848200469225778	0.742770730616584	0.828315176792875	1	294	286
TCGA-60-2724-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	350	6	1	1	2	342	14022	20	22	4	46	3423	15	19	6	40	3494	27	69	34	130	3575	25	56	45	126	3530	5	7	3	15	484	0.0428571428571429	0.119047619047619	0.137110481586402	0.868260527351436	0.0309917355371901	9	5	3	17	520	0.0485714285714286	0.130769230769231	0.145454545454545	0.899038461538462	0.0326923076923077	0.0571428571428571	20	111	1004	6101	0.393374254021948	1.09491348174067	0.698857941075438	Inf	1.08041117970865	1.90526356114006	0.0117076708014187	2.23845514877953	0.537470371677846	0.974244104158506	0.499493529183847	0.0576766630978577	330	322
TCGA-60-2725-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	186	4	0	1	1	181	7421	4	9	4	17	1821	12	15	5	32	1813	16	24	22	62	1928	16	32	22	70	1859	8	6	0	14	262	0.0752688172043011	0.2	0.140935987089833	1.41908396946565	0.0534351145038168	6	4	2	12	260	0.0645161290322581	0.193548387096774	0.134854771784232	1.43523573200993	0.0461538461538462	0.0860215053763441	16	60	522	3265	0.0555942798047088	1.66767642313531	0.983729529280404	Inf	1.52732405726961	3.17397030651341	4.01796571564348e-05	4.86181577531673	0.329763148728666	0.988011278009246	0.297907550767459	0.000645543108221572	170	165
TCGA-60-2726-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	327	7	0	1	1	319	13079	26	24	5	55	3254	13	14	9	36	3146	14	44	54	112	3278	19	49	48	116	3401	9	4	10	23	491	0.0703363914373089	0.198275862068966	0.144369303146133	1.37339349673432	0.0468431771894094	7	5	14	26	451	0.0795107033639144	0.232142857142857	0.13758389261745	1.68728222996516	0.057649667405765	0.122324159021407	40	95	942	5737	3.3952507027324e-06	2.563778552417	1.82713852355365	Inf	2.10080993945113	3.43768899182912	2.8027973793512e-06	5.72961408217806	1.66829024603472	0.00779808157725422	1.87363882039664	0.149841432488483	287	279
TCGA-63-5128-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	340	6	1	11	12	322	13202	14	24	7	45	3202	21	18	5	44	3307	19	65	41	125	3277	17	55	36	108	3416	4	5	5	14	502	0.0411764705882353	0.12962962962963	0.146955503512881	0.882101224730707	0.0278884462151394	3	6	7	16	431	0.0470588235294118	0.128	0.131522734208117	0.973215777262181	0.037122969837587	0.0558823529411765	19	94	933	5760	0.22618355407706	1.24780713609551	0.783026534343941	Inf	1.20618615371482	1.39487316898892	0.230172604218955	1.49008099739478	1.11796884787238	0.38783877150811	1.13969519350629	0.266835660720813	321	303
TCGA-63-5131-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	314	3	1	3	4	307	12587	14	23	8	45	3039	14	12	5	31	3181	25	45	46	116	3121	30	44	41	115	3246	14	4	13	31	508	0.0987261146496815	0.269565217391304	0.156500308071473	1.72245806230743	0.0610236220472441	5	3	9	17	440	0.054140127388535	0.146551724137931	0.140980454982377	1.03951802507837	0.0386363636363636	0.130573248407643	41	101	948	5419	1.94879045982377e-05	2.32006783489549	1.66330067314336	Inf	1.93919742081179	2.32015726889145	0.000254199447128945	3.01618381028264	1.69836073524419	0.00817626251043859	1.93458728318545	0.680114602059056	273	266
TCGA-63-6202-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	386	8	0	3	3	375	15375	18	18	0	36	3685	20	13	8	41	3662	24	79	44	147	4011	20	81	50	151	4017	5	9	3	17	494	0.0440414507772021	0.112582781456954	0.122977346278317	0.915475775531544	0.034412955465587	4	7	11	22	558	0.0569948186528497	0.149659863945578	0.139117427075542	1.0757808499744	0.039426523297491	0.0595854922279793	23	115	1052	6976	0.136535604581258	1.32618300131844	0.872155361384264	Inf	1.27186311787072	1.5609229173868	0.115366856748856	1.70501907243907	1.1365585308632	0.348586352932173	1.16041414104429	0.320691739653879	363	352
TCGA-66-2727-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	266	1	0	3	3	262	10742	12	15	2	29	2794	12	15	4	31	2766	15	60	36	111	2542	19	46	26	91	2640	5	7	6	18	426	0.0676691729323308	0.197802197802198	0.161363636363636	1.22581643708404	0.0422535211267606	7	8	6	21	381	0.0789473684210526	0.189189189189189	0.149881982690795	1.26225438036462	0.0551181102362205	0.0902255639097744	24	72	807	4375	0.0119680152394445	1.80685893259438	1.17348699448102	Inf	1.60532837670384	2.26634594358189	0.00399093217554896	2.95623404573077	1.24283487228684	0.25378207830212	1.30104290793227	1	242	238
TCGA-66-2734-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	326	8	0	0	0	318	13038	8	8	6	22	3149	9	15	4	28	3210	15	121	23	159	3377	11	79	19	109	3302	1	9	1	11	481	0.0337423312883436	0.100917431192661	0.145669291338583	0.692784527646913	0.0228690228690229	1	13	3	17	497	0.0521472392638037	0.106918238993711	0.147172046194848	0.726484694329499	0.03420523138833	0.0184049079754601	6	62	978	5701	0.944859713388061	0.564161154791655	0.236783013518308	Inf	0.60258029592205	0.525326411829479	0.91083749171022	0.485812335734916	0.650404128931736	0.881232397805392	0.613643413673785	0.669458177782262	320	312
TCGA-66-2742-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	250	7	1	4	5	238	9758	15	27	3	45	2344	13	14	4	31	2273	11	32	29	72	2561	18	40	32	90	2580	3	5	4	12	337	0.048	0.133333333333333	0.13062015503876	1.02077151335312	0.0356083086053412	4	2	5	11	323	0.044	0.152777777777778	0.126122608356111	1.21134330925353	0.0340557275541796	0.064	16	74	660	4481	0.112722970181125	1.4678488436119	0.875627004695319	Inf	1.38478114478114	1.88019853709509	0.0707412869625955	2.1598463368966	1.14925484351714	0.383792158185152	1.17503447599184	0.757529692245078	234	222
TCGA-66-2744-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	288	5	2	5	7	276	11316	11	13	6	30	2812	8	10	2	20	2900	15	66	34	115	2808	20	75	16	111	2796	7	8	2	17	404	0.0590277777777778	0.153153153153153	0.144492131616595	1.05994112924806	0.0420792079207921	6	3	5	14	391	0.0486111111111111	0.121739130434783	0.139245014245014	0.874279995552096	0.0358056265984655	0.0694444444444444	20	65	795	4809	0.0151220004591536	1.86094875262244	1.16089307374148	Inf	1.65860155382908	2.61822102425876	0.000677131702573983	3.57330402024312	0.986867924528302	0.57703277952123	0.984732094692123	0.173664823538192	268	256
TCGA-66-2754-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	347	4	0	6	6	337	13817	13	14	9	36	3387	17	19	6	42	3338	29	42	42	113	3601	29	52	65	146	3491	5	2	11	18	499	0.0518731988472622	0.123287671232877	0.142938985963907	0.86251955966728	0.0360721442885772	12	2	8	22	500	0.0634005763688761	0.194690265486726	0.138850319355735	1.4021592920354	0.044	0.103746397694524	36	129	999	6093	0.00515040388654326	1.70192154095302	1.21095163075371	Inf	1.54889434889435	2.08077042559801	0.00217621386644588	2.52842652059472	1.26058769049423	0.171909585211676	1.31679396165922	0.822384163766055	311	301
TCGA-66-2755-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	228	10	1	0	1	217	8897	7	18	4	29	2254	17	14	7	38	2217	11	44	21	76	2192	18	28	28	74	2234	2	3	3	8	341	0.0350877192982456	0.108108108108108	0.152641002685765	0.708250772766902	0.0234604105571848	4	6	3	13	333	0.0570175438596491	0.171052631578947	0.151916058394161	1.12596807333649	0.039039039039039	0.0526315789473684	12	66	674	3752	0.533899311145562	1.0121371147685	0.556149356934466	Inf	1.01027162748231	1.35864115420035	0.275323351326401	1.45205861744532	0.804093744322655	0.776376654809914	0.776798812790787	1	216	205
TCGA-66-2756-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	542	10	1	5	6	526	21566	32	23	9	64	5127	24	28	11	63	5128	36	105	61	202	5730	27	115	55	197	5581	6	7	4	17	695	0.0313653136531365	0.0862944162436548	0.124529654183838	0.692962787130701	0.0244604316546763	7	14	12	33	723	0.0608856088560886	0.163366336633663	0.126178010471204	1.29472905796804	0.045643153526971	0.0535055350553506	29	150	1418	9893	0.0911561392269573	1.34879210917896	0.933665959405831	Inf	1.29231902671951	1.64599144782502	0.0474761193845383	1.81382952698849	1.10023831525704	0.383043658794651	1.11623298889349	0.65982489317682	513	497
TCGA-66-2757-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	284	4	1	6	7	273	11193	8	18	1	27	2650	9	13	5	27	2720	27	47	37	111	2877	17	59	32	108	2946	3	7	4	14	399	0.0492957746478873	0.12962962962963	0.135437881873727	0.957115009746589	0.0350877192982456	6	5	5	16	380	0.0563380281690141	0.144144144144144	0.132082029892249	1.09132290184922	0.0421052631578947	0.0633802816901408	18	95	779	5044	0.252241374837181	1.22678047238741	0.76026351043789	Inf	1.19070285253388	1.52897070836737	0.127241879531885	1.66481268260579	0.974995814031367	0.586317532004848	0.971247774393592	1	266	255
TCGA-66-2758-01A-02D-1522-08	0	1	0	1	385	5	2	3	5	375	15375	17	18	11	46	3716	15	21	3	39	3813	52	42	51	145	3918	50	45	50	145	3928	27	5	10	42	566	0.109090909090909	0.289655172413793	0.144093686354379	2.01018642622152	0.0742049469964664	20	9	11	40	542	0.103896103896104	0.275862068965517	0.138335885655947	1.9941468380201	0.0738007380073801	0.176623376623377	68	135	1108	6738	5.94931241390409e-12	3.0625435408734	2.35139909508188	Inf	2.37203677686685	3.26291852481065	1.6226212158545e-14	5.1950837770775	1.47233441755728	0.0438732651356768	1.5962043525504	6.41212716169862e-05	317	307
TCGA-66-2759-01A-01D-1522-08	0	1	1	2	497	4	2	4	6	487	19967	13	30	9	52	4806	16	23	9	48	5020	39	64	74	177	5020	44	77	89	210	5121	25	11	19	55	766	0.110663983903421	0.261904761904762	0.149580160124976	1.75093248787766	0.0718015665796345	22	13	13	48	691	0.096579476861167	0.271186440677966	0.137649402390438	1.97012435919449	0.0694645441389291	0.158953722334004	79	167	1457	8684	3.16038480249782e-12	2.81910773446564	2.21472491769266	Inf	2.23518366618121	3.94131364166343	7.23925412725815e-19	7.77859434761379	1.36641809584363	0.0412268613501248	1.45586087960795	0.0445280976784953	418	408
TCGA-66-2763-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	443	8	1	6	7	428	17548	23	25	8	56	4256	29	23	6	58	4408	28	79	56	163	4435	32	77	42	151	4449	14	9	7	30	639	0.0677200902934537	0.198675496688742	0.143627781523938	1.38326648633523	0.0469483568075117	10	7	6	23	577	0.0519187358916479	0.141104294478528	0.130101465614431	1.08457113693634	0.0398613518197574	0.0835214446952596	37	121	1216	7668	0.000751648286022678	1.92818038799561	1.37535805690724	Inf	1.71088024650233	2.92236842105263	4.9253715985197e-07	4.20326050865307	0.969152792696026	0.59304288280387	0.96443534795405	0.0408808358183998	406	391
TCGA-66-2765-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	112	1	0	1	1	110	4510	4	6	1	11	1050	5	5	1	11	1154	8	16	21	45	1130	13	12	18	43	1176	2	1	4	7	172	0.0625	0.162790697674419	0.146258503401361	1.11303407247161	0.0406976744186047	2	1	0	3	154	0.0267857142857143	0.0666666666666667	0.136283185840708	0.489177489177489	0.0194805194805195	0.0714285714285714	8	52	326	1980	0.62762305752515	0.934414700408799	0.440223980660399	Inf	0.943149284253579	1.34735612036226	0.346846748096671	1.42883544084895	0.72549944942583	0.82038002660906	0.694223961042806	1	104	102
TCGA-66-2766-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	432	6	4	3	7	419	17179	12	21	6	39	4121	21	26	7	54	4260	39	62	62	163	4334	28	56	79	163	4464	10	8	33	51	645	0.118055555555556	0.312883435582822	0.144489247311828	2.16544442859181	0.0790697674418605	22	5	19	46	589	0.106481481481481	0.282208588957055	0.135902168897093	2.07655691772475	0.0780984719864177	0.194444444444444	84	124	1234	7564	4.08894662533785e-20	4.15169316844134	3.23440891282224	Inf	2.87928562523376	3.40521057596942	5.27003236622085e-11	5.60255497769032	2.62937802452958	2.02339940672243e-11	3.58068477293688	0.00575327010154435	348	335
TCGA-66-2767-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	387	0	2	2	4	383	15703	18	19	7	44	3758	10	18	6	34	3834	27	57	68	152	4008	29	64	60	153	4103	8	8	11	27	518	0.0697674418604651	0.176470588235294	0.126249086034609	1.39779695662049	0.0521235521235521	8	6	8	22	535	0.0568475452196382	0.144736842105263	0.133483033932136	1.08430890309887	0.0411214953271028	0.0904392764857881	35	149	1053	7058	0.0139690415141976	1.57436298465442	1.12118931193279	Inf	1.46519777860358	2.20078686745353	0.00165025335605745	2.68065118774315	1.14337755223172	0.304134280999933	1.1683286939242	0.673609287557202	352	348
TCGA-66-2768-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	293	2	2	3	5	286	11726	8	14	5	27	2772	8	18	3	29	2936	34	31	53	118	2922	34	29	49	112	3096	22	3	14	39	458	0.133105802047782	0.348214285714286	0.147932816537468	2.35386774797255	0.0851528384279476	18	5	15	38	419	0.129692832764505	0.322033898305085	0.143394934976044	2.24578293758343	0.0906921241050119	0.235494880546075	69	101	877	5141	5.12003802206189e-16	4.00359537420804	3.03135741158269	Inf	2.78517673888255	4.03648802736602	8.79245270907193e-17	8.36931339980823	1.95096921322691	0.000264581640485789	2.32833245605075	0.104831096973288	224	217
TCGA-66-2770-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	270	4	2	0	2	264	10824	14	15	3	32	2578	15	11	5	31	2564	5	47	45	97	2834	17	41	46	104	2848	2	7	10	19	366	0.0703703703703704	0.182692307692308	0.128511235955056	1.42160571668768	0.0519125683060109	1	6	3	10	358	0.037037037037037	0.103092783505155	0.126323218066337	0.816103207970973	0.0279329608938547	0.0592592592592593	16	97	724	4958	0.368708412431448	1.12952320748682	0.680991039566451	Inf	1.11123062631399	1.07019085886489	0.544926658607239	1.08128436375226	1.12115232833465	0.37661101048518	1.14129182863265	0.00704802465559796	254	248
TCGA-66-2771-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	298	3	0	3	3	292	11972	12	16	4	32	2989	11	17	8	36	3064	28	34	41	103	2994	32	41	48	121	2925	17	5	20	42	445	0.140939597315436	0.347107438016529	0.152136752136752	2.28154889033336	0.0943820224719101	15	6	17	38	434	0.12751677852349	0.368932038834951	0.144956579826319	2.54512102366784	0.0875576036866359	0.231543624161074	69	80	879	5040	3.02523476133169e-19	4.94355146514928	3.69299847338541	Inf	3.11833153904299	3.59135381114903	6.08398750164126e-12	6.54960723335702	2.79944011964566	1.51764217204505e-09	4.07855216466215	0.523283977259357	229	223
TCGA-66-2773-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	672	10	0	1	1	661	27101	5	14	3	22	6819	10	9	1	20	6645	94	59	148	301	6822	91	58	169	318	6815	66	11	72	149	1045	0.22172619047619	0.468553459119497	0.153338224504769	3.05568595588457	0.142583732057416	71	12	77	160	1062	0.238095238095238	0.53156146179402	0.155672823218997	3.41460667830396	0.150659133709981	0.425595238095238	286	216	2107	11530	8.12396625089221e-96	7.24406671727235	6.19005644193735	Inf	3.68736917541037	4.79295270590952	4.39202396589544e-69	15.6135176052106	3.04215481218531	1.06534961497713e-38	4.85268860226661	0.374861379852703	386	375
TCGA-66-2777-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	222	1	0	0	0	221	9061	14	10	2	26	2163	10	12	6	28	2237	10	31	47	88	2400	13	28	38	79	2261	3	3	7	13	318	0.0585585585585586	0.164556962025316	0.140645731977001	1.17001034949447	0.0408805031446541	4	2	7	13	326	0.0585585585585586	0.147727272727273	0.135833333333333	1.08756274400446	0.0398773006134969	0.0945945945945946	21	87	644	4017	0.0676654632907015	1.50546957412788	0.960074316509989	Inf	1.40730676328502	2.20274102079395	0.0317709403246838	2.72813037294591	1.1920716112532	0.284682961764508	1.22987528256156	0.0888790871291686	201	200
TCGA-66-2778-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	171	0	0	0	0	171	7011	1	8	1	10	1670	5	7	1	13	1754	24	11	43	78	1776	24	20	26	70	1811	11	3	13	27	242	0.157894736842105	0.385714285714286	0.133627829928216	2.88648170011806	0.111570247933884	15	2	9	26	242	0.152046783625731	0.333333333333333	0.136261261261261	2.44628099173554	0.107438016528926	0.280701754385965	48	69	484	3103	6.46144807216887e-13	4.45741906203419	3.17193964009413	Inf	3.04047467683831	4.01437672176309	4.97528055345439e-11	7.56960996206533	2.36297760210804	8.41488368561154e-05	2.99969706066	0.558523904562372	123	123
TCGA-66-2780-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	144	3	1	1	2	139	5699	6	5	2	13	1407	8	12	4	24	1390	10	15	23	48	1436	23	14	17	54	1466	8	1	1	10	183	0.0694444444444444	0.185185185185185	0.124829467939973	1.48350536328678	0.0546448087431694	4	2	5	11	208	0.0763888888888889	0.229166666666667	0.144846796657382	1.58213141025641	0.0528846153846154	0.125	18	55	391	2511	0.00810157501751028	2.10108989798216	1.26412998582853	Inf	1.83008093052587	2.69890723087654	0.000884122184073339	3.66743106901405	1.11329923273657	0.458680908487038	1.13321267321072	0.117971798543708	126	121
TCGA-66-2781-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	165	2	1	1	2	161	6601	1	14	2	17	1648	8	5	4	17	1665	9	27	31	67	1623	14	24	22	60	1665	5	2	6	13	250	0.0787878787878788	0.216666666666667	0.15015015015015	1.443	0.052	2	2	5	9	227	0.0545454545454545	0.134328358208955	0.139864448552064	0.960418173449931	0.039647577092511	0.109090909090909	18	58	477	2811	0.024128701717056	1.8284704799833	1.10516739649481	Inf	1.63257199602781	2.09789444900191	0.0404203586023296	2.57718569794094	1.43063961077489	0.140512899296925	1.5431901252758	0.357976754661922	147	143
TCGA-66-2782-01A-01D-1522-08	0	1	0	1	391	18	0	0	0	373	15293	21	19	1	41	3787	17	20	3	40	3828	37	61	51	149	3809	35	60	48	143	3869	14	11	8	33	542	0.0843989769820972	0.230769230769231	0.140087878004652	1.64731762702242	0.0608856088560886	23	7	14	44	535	0.112531969309463	0.295302013422819	0.140456812811762	2.10243994229442	0.0822429906542056	0.150895140664962	59	112	1077	6601	2.63484087659636e-11	3.22802544683168	2.42481640354017	Inf	2.45973491450694	3.66354585783555	1.04211594755674e-13	6.47673536338735	1.58423604663159	0.0187528933412904	1.7510051276925	0.0199420163025206	332	314
TCGA-66-2783-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	272	0	0	1	1	271	11111	17	18	4	39	2580	15	16	3	34	2718	22	42	34	98	2869	16	31	53	100	2944	5	3	8	16	371	0.0588235294117647	0.16	0.12601902173913	1.26964959568733	0.0431266846361186	7	5	5	17	361	0.0625	0.173469387755102	0.125827814569536	1.37862513426423	0.0470914127423823	0.0919117647058824	25	100	732	5081	0.0135921764199799	1.73511576291443	1.15135417968367	Inf	1.58825136612022	2.50776531492666	0.00188719479305581	3.20274915579223	1.18662458388292	0.300840990387883	1.21936109858849	1	247	246
TCGA-66-2785-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	1316	17	0	7	7	1292	52972	28	32	16	76	13235	24	50	5	79	13444	293	87	183	563	13158	305	97	172	574	13135	216	21	89	326	2074	0.247720364741641	0.56794425087108	0.157898743814237	3.59688897550224	0.15718418514947	213	21	85	319	2139	0.242401215805471	0.566607460035524	0.162562699498404	3.48547029413157	0.149135109864423	0.458206686930091	603	350	4213	22080	1.72811791744632e-224	9.02942783953094	8.03889997456246	Inf	3.94887233813094	4.47718242706323	6.1696845810766e-195	13.3015884089097	3.05893027283091	1.94621549973584e-46	5.03791452472566	7.76588048548739e-47	713	689
TCGA-66-2786-01A-01D-1522-08	0	1	0	1	265	2	0	3	3	260	10660	14	23	2	39	2586	6	15	4	25	2642	32	24	42	98	2677	23	35	40	98	2755	10	2	14	26	379	0.0981132075471698	0.26530612244898	0.137568058076225	1.92854450487319	0.0686015831134565	17	4	11	32	403	0.120754716981132	0.326530612244898	0.15054165110198	2.16903833493695	0.0794044665012407	0.19622641509434	52	85	782	4650	2.03056419273437e-11	3.6365614057544	2.6535451593217	Inf	2.6365486213527	3.40999767495931	1.46701226947222e-09	5.73105467270925	2.11777181710436	0.000174193292452105	2.60733049575696	0.852011098744621	213	208
TCGA-66-2787-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	581	4	1	4	5	572	23452	35	25	7	67	5797	31	27	10	68	5852	30	126	55	211	5855	40	136	50	226	5948	9	11	10	30	826	0.0516351118760757	0.132743362831858	0.138870208473436	0.955880777389702	0.036319612590799	5	22	7	34	821	0.0585197934595525	0.161137440758294	0.140222032450897	1.14915921515202	0.0414129110840439	0.0533562822719449	31	144	1647	10156	0.097238535725642	1.32744446107711	0.928372510568049	Inf	1.26947003209298	1.43327261687917	0.103577252390691	1.54152005711601	1.16026830890219	0.294289497496258	1.19119506350112	0.680305629507485	550	541
TCGA-66-2788-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	221	2	0	3	3	216	8856	13	9	5	27	2200	8	15	4	27	2224	22	30	25	77	2140	15	34	36	85	2292	6	5	10	21	337	0.0950226244343891	0.247058823529412	0.147033158813264	1.6802932448944	0.0623145400593472	10	5	5	20	320	0.0904977375565611	0.25974025974026	0.149532710280374	1.73701298701299	0.0625	0.14027149321267	31	67	657	3775	2.69642563291984e-05	2.65762556391824	1.79109436220603	Inf	2.13388003603268	2.91710888971163	3.395694635871e-05	4.3758561449147	1.65880679691594	0.0317145567765282	1.87325325990672	1	190	185
TCGA-66-2789-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	396	8	1	4	5	383	15703	15	23	4	42	3846	15	30	4	49	3846	29	57	49	135	3979	38	70	49	157	4032	15	12	4	31	597	0.0782828282828283	0.197452229299363	0.148065476190476	1.33354671446404	0.0519262981574539	8	6	9	23	545	0.0580808080808081	0.17037037037037	0.13696908771048	1.24386000679579	0.0422018348623853	0.0909090909090909	36	129	1142	6869	0.00613493380737901	1.6784420119078	1.19499638111295	Inf	1.53052061773603	2.40809525054238	3.34326991771212e-05	3.14351405245395	0.930546123878623	0.653739439298305	0.919914344265514	0.0654561846789502	360	347
TCGA-66-2791-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	382	3	0	6	6	373	15293	7	26	3	36	3795	8	19	7	34	3884	31	60	54	145	3718	32	66	60	158	3896	17	11	12	40	592	0.104712041884817	0.253164556962025	0.151950718685832	1.66609647622306	0.0675675675675676	15	7	16	38	575	0.0994764397905759	0.262068965517241	0.154653039268424	1.69456071964018	0.0660869565217391	0.157068062827225	60	117	1167	6447	1.32264193380527e-09	2.83257419964019	2.13617265381013	Inf	2.21166833689164	3.31399192067573	7.07977945612186e-11	5.70067211848743	1.60248951427412	0.00721063284061027	1.79848212507666	0.621694325475763	322	313
TCGA-66-2792-01A-01D-0983-08	0	0	1	1	194	1	0	5	5	188	7708	8	5	3	16	1793	5	10	4	19	1921	12	33	32	77	2004	9	37	30	76	1990	2	4	4	10	255	0.0515463917525773	0.131578947368421	0.128140703517588	1.02683178534572	0.0392156862745098	2	4	3	9	294	0.0463917525773196	0.116883116883117	0.146706586826347	0.796713490591042	0.0306122448979592	0.0567010309278351	11	72	549	3445	0.600563036212858	0.958692042639463	0.514150648005335	Inf	0.964162661575263	1.38572295949345	0.326246256958711	1.47631220054063	0.821376109054586	0.765341480587231	0.798683369258557	0.475633586868292	183	177
TCGA-66-2793-01A-01D-1267-08	0	0	2	2	349	6	1	8	9	334	13694	22	31	10	63	3239	18	24	13	55	3148	28	34	39	101	3662	25	51	39	115	3645	7	4	3	14	438	0.0401146131805158	0.121739130434783	0.120164609053498	1.01310303752233	0.0319634703196347	4	5	5	14	461	0.0401146131805158	0.138613861386139	0.125887493173129	1.10109318957926	0.0303687635574837	0.0544412607449857	19	112	899	6408	0.259564746622554	1.20916185048113	0.763159069474056	Inf	1.17885861304758	1.68692677398367	0.0563134239823374	1.8665822803765	0.83363281138587	0.758053795224889	0.814648868959427	0.573113236010386	330	315
TCGA-66-2794-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	176	1	0	1	1	174	7134	3	3	1	7	1656	6	6	2	14	1675	22	16	38	76	1958	19	22	36	77	1845	10	1	10	21	225	0.119318181818182	0.272727272727273	0.121951219512195	2.23636363636364	0.0933333333333333	14	0	4	18	248	0.102272727272727	0.236842105263158	0.126659856996936	1.86990662139219	0.0725806451612903	0.215909090909091	38	77	473	3330	1.51938767974578e-08	3.472533475277	2.41987009982388	Inf	2.65675153966357	4.70644046821018	5.1297043596423e-12	9.925463338472	1.52111307925261	0.0736549781819832	1.64244910274548	0.0407960537129673	138	136
TCGA-66-2795-01A-02D-0983-08	0	0	0	0	417	1	0	6	6	410	16810	17	12	2	31	4248	19	17	4	40	4157	17	106	52	175	4159	24	92	48	164	4246	8	11	8	27	591	0.0647482014388489	0.164634146341463	0.139189825718323	1.18280302092361	0.0456852791878173	2	12	7	21	581	0.0503597122302158	0.12	0.139697042558307	0.859001721170396	0.036144578313253	0.0599520383693046	25	116	1172	7233	0.124096973215758	1.33001419011994	0.889174464280087	Inf	1.27154285575969	1.74914675767918	0.0521684307731009	1.99066803668144	1.0757252559727	0.424267272212991	1.08910369936321	0.352448989171022	392	385
TCGA-66-2800-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	266	2	1	1	2	262	10742	11	9	7	27	2568	4	15	3	22	2598	19	37	59	115	2758	10	50	38	98	2818	2	8	4	14	362	0.0526315789473684	0.142857142857143	0.128459900638751	1.11207576953433	0.0386740331491713	3	5	9	17	342	0.0639097744360902	0.147826086956522	0.124002900652647	1.19211797609967	0.0497076023391813	0.0676691729323308	18	108	704	4872	0.328143791972267	1.15335638868784	0.71745944174129	Inf	1.13149350649351	1.36559561128527	0.30164217552401	1.4416486429382	1.06150421743205	0.455741025150488	1.07102946627967	0.0485513975824021	248	244
TCGA-70-6722-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	313	6	0	4	4	303	12423	13	9	2	24	2868	12	8	4	24	2931	19	70	30	119	3243	18	81	37	136	3381	6	5	7	18	447	0.0575079872204473	0.132352941176471	0.132209405501331	1.001085669167	0.0402684563758389	4	8	8	20	414	0.0638977635782748	0.168067226890756	0.127659574468085	1.31652661064426	0.0483091787439614	0.0798722044728434	25	79	861	5763	0.00171265486852328	2.11786409514549	1.39254727941612	Inf	1.84937014205307	2.0792918353894	0.0174946750028073	2.47854175735559	1.72239846065838	0.0241784798087691	1.93064159694766	0.328892249805994	288	278
TCGA-70-6723-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	131	1	0	4	4	126	5166	6	8	1	15	1231	12	7	4	23	1286	11	13	21	45	1300	5	22	16	43	1349	0	3	0	3	188	0.0229007633587786	0.0697674418604651	0.139362490733877	0.500618505690252	0.0159574468085106	2	1	1	4	175	0.0305343511450382	0.0888888888888889	0.134615384615385	0.66031746031746	0.0228571428571429	0.0229007633587786	3	50	363	2286	0.981571518083367	0.377946372676743	0.0993603609634682	Inf	0.413067207235303	0.912190082644628	0.665565779445162	0.899656814167569	0.197230288139379	0.995605270374619	0.174992286774308	1	128	123
TCGA-85-6175-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	62	1	0	1	1	60	2460	0	3	1	4	559	1	2	0	3	598	1	7	11	19	626	2	12	20	34	677	0	2	4	6	86	0.0967741935483871	0.176470588235294	0.127031019202363	1.38919288645691	0.0697674418604651	0	1	0	1	76	0.0161290322580645	0.0526315789473684	0.121405750798722	0.433518005540166	0.0131578947368421	0.0645161290322581	4	30	162	1141	0.626295698340858	0.939128872307221	0.299065982753423	Inf	0.946259985475672	0	1	0	1.03783353245719	0.55165718415764	1.04341328584292	0.06993006993007	58	56
TCGA-85-6560-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	490	3	2	6	8	479	19639	24	31	11	66	4629	21	37	10	68	4838	36	73	68	177	5159	35	72	61	168	5013	12	9	8	29	698	0.0591836734693878	0.172619047619048	0.139237981248753	1.23974109701187	0.0415472779369628	12	6	4	22	724	0.0448979591836735	0.124293785310734	0.140337274665633	0.885679058588507	0.0303867403314917	0.073469387755102	36	164	1422	8750	0.0680103023791994	1.35068000840074	0.969803479232205	Inf	1.28759493670886	2.41801866048612	2.15924390039034e-05	3.14161551796215	0.66542373990122	0.95710722922793	0.631133335129693	0.0220175508521949	454	443
TCGA-85-6561-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	969	6	0	2	2	961	39401	17	12	11	40	10170	13	15	3	31	10702	34	344	40	418	9098	25	410	37	472	9431	9	71	15	95	1580	0.0980392156862745	0.201271186440678	0.167532605238045	1.20138516412787	0.060126582278481	11	57	10	78	1501	0.0804953560371517	0.186602870813397	0.164981314574632	1.13105457605615	0.0519653564290473	0.0464396284829721	45	91	3081	15448	2.30394877033659e-06	2.47925733942916	1.79623114502855	Inf	1.98991207972965	2.03862932461946	0.00096558981778583	2.57118676006172	1.95258328169721	0.00050650514436286	2.41040842699131	0.52299287009324	924	916
Totals	1	31	32	64	62828	1088	123	573	696	61044	2502804	2362	2865	815	6042	607860	2336	2947	828	6111	617848	4987	9641	9652	24280	636252	4907	9806	9898	24611	640844	2137	1287	2372	5796	90859	0.0922518622270325	0.235504449230019	0.141780214841678	1.66105298608132	0.0637911489230566	2255	1291	2255	5801	88936	0.0923314445788502	0.238920922570016	0.139781093026034	1.7092506389653	0.0652266798596744	0.143550646208697	9019	20425	179795	1097301	0	2.69505058068829	2.63812340322076	Inf	2.17574258663674	3.15308994775078	0	4.87195953868795	1.68111983518598	1.26001542548269e-274	1.89221814547765	0.00162182111590419	53809	52025
