Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-18-3406-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	309	3	1	2	3	303	12423	10	10	4	24	2987	12	15	0	27	3231	22	57	35	114	3073	38	48	52	138	3132	22	5	14	41	481	0.132686084142395	0.297101449275362	0.153575989782886	1.9345566302088	0.0852390852390852	12	9	12	33	454	0.106796116504854	0.289473684210526	0.147738366417182	1.95936702990958	0.0726872246696035	0.194174757281553	60	87	935	5270	1.05295780392171e-13	3.88601044990411	2.88319689711445	Inf	2.70871985157699	3.76060606060606	1.94767539427667e-13	7.36684065833164	1.98328108672936	0.000379598299245321	2.40190361868801	0.241114976360466	249	243
TCGA-18-3407-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	171	0	0	2	2	169	6929	6	8	2	16	1723	3	6	3	12	1662	6	55	22	83	1770	4	42	12	58	1774	0	4	1	5	239	0.0292397660818713	0.0862068965517241	0.134723788049605	0.639878805367191	0.0209205020920502	0	1	1	2	266	0.0116959064327485	0.0240963855421687	0.150282485875706	0.160340610562551	0.0075187969924812	0.0116959064327485	2	42	505	3039	0.990199679594577	0.28662639735898	0.0492239600795505	Inf	0.318991899189919	0	1	0	0.412813046010483	0.963957200329286	0.37618528554741	0.461538461538461	169	167
TCGA-18-3408-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	107	1	2	4	6	100	4100	3	7	2	12	1002	4	12	1	17	981	5	19	19	43	1090	3	14	11	28	1027	0	0	1	1	137	0.00934579439252336	0.0357142857142857	0.133398247322298	0.267726798748697	0.0072992700729927	0	3	2	5	154	0.0467289719626168	0.116279069767442	0.141284403669725	0.823014195107218	0.0324675324675325	0.0280373831775701	3	35	291	1826	0.908775049989986	0.537975415213578	0.139446234121495	Inf	0.57433532284319	0	1	0	0.727491408934708	0.800472407911935	0.697316416007463	0.181818181818182	104	97
TCGA-18-3409-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	3640	195	1	6	7	3438	140958	42	60	20	122	33855	39	53	22	114	34869	18	102	1414	1534	35625	15	87	1566	1668	36609	2	9	297	308	5065	0.0846153846153846	0.184652278177458	0.13835395667732	1.33463677231956	0.0608094768015795	1	12	255	268	4628	0.0736263736263736	0.17470664928292	0.129908771929825	1.34484105028177	0.0579083837510804	0.152472527472527	555	2458	9693	62541	3.19017426199316e-14	1.45684788478679	1.34365233828875	Inf	1.37270527805693	0.677471089727357	0.838152747484369	0.645222198781055	1.38040418014245	1.3892827106541e-14	1.46687603785707	1.67125198066368e-295	3085	2883
TCGA-18-3410-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	310	4	0	6	6	300	12300	6	13	1	20	3018	5	18	2	25	3188	33	64	27	124	3094	36	59	36	131	3000	21	5	8	34	468	0.109677419354839	0.259541984732824	0.156	1.66373067136426	0.0726495726495727	18	4	9	31	464	0.1	0.25	0.149967679379444	1.66702586206897	0.0668103448275862	0.180645161290323	56	76	932	5162	1.76536522289641e-13	4.07984751266451	2.98292037208829	Inf	2.77396280400572	3.69574547490203	6.63979571224446e-15	7.19653666409748	1.76439130730976	0.0124468120692026	2.04662907880895	0.000174102918678229	254	244
TCGA-18-3411-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	426	5	1	3	4	417	17097	15	27	7	49	4210	14	24	7	45	4400	26	80	61	167	4248	26	81	49	156	4239	6	7	10	23	624	0.0539906103286385	0.147435897435897	0.147204529370134	1.00157174556213	0.0368589743589744	6	9	6	21	631	0.0492957746478873	0.125748502994012	0.148540489642185	0.846560444878864	0.0332805071315372	0.0657276995305164	28	134	1255	7232	0.216431022766189	1.20406686748103	0.825350537349909	Inf	1.16883576803896	1.5605884155685	0.074931296662431	1.72862811489668	0.983643607388627	0.569840917969221	0.980860415946787	0.492738621885636	398	389
TCGA-18-3412-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	205	0	1	1	2	203	8323	8	6	3	17	2148	7	8	2	17	2056	12	51	21	84	2106	11	51	23	85	2013	3	8	4	15	311	0.0731707317073171	0.176470588235294	0.154495777446597	1.14223567240401	0.0482315112540193	4	4	4	12	311	0.0585365853658537	0.142857142857143	0.147673314339981	0.967386311437758	0.0385852090032154	0.0731707317073171	15	52	622	3497	0.0748782932411255	1.62155931693657	0.935392783369936	Inf	1.48257906608437	2.01544806374948	0.0485723447457977	2.4589395836885	1.20403390821397	0.345489309953972	1.24928704636055	1	190	188
TCGA-18-3414-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	400	8	3	4	7	385	15785	10	18	8	36	4003	17	29	5	51	3899	26	63	55	144	3929	34	54	66	154	3954	12	8	17	37	584	0.0925	0.24025974025974	0.147698533131007	1.62669009073119	0.0633561643835616	15	9	15	39	570	0.0975	0.270833333333333	0.145075082718249	1.86684941520468	0.068421052631579	0.1475	59	122	1154	6729	1.66717411921106e-09	2.81942672607392	2.1266337692206	Inf	2.22668690215154	3.07396013864818	2.07971702225316e-08	4.76957859234268	1.80655141297965	0.000571137328884162	2.09632404087315	0.505739187232621	341	326
TCGA-18-3415-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	208	2	0	0	0	206	8446	7	10	2	19	2243	8	13	1	22	2131	17	38	35	90	2047	15	25	35	75	2025	7	3	12	22	308	0.105769230769231	0.293333333333333	0.152098765432099	1.92857142857143	0.0714285714285714	12	8	11	31	326	0.149038461538462	0.344444444444444	0.159257449926722	2.16281526925699	0.0950920245398773	0.201923076923077	42	60	634	3438	9.71213560038634e-10	3.79419456450849	2.64170385024838	Inf	2.64464650213398	3.8134858044164	2.38378574285836e-08	7.91908870390013	2.11031996394772	0.000297312483199155	2.65277855546108	0.551610829467594	166	164
TCGA-18-3416-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	508	1	0	3	3	504	20664	24	13	3	40	5133	20	12	4	36	5233	36	153	41	230	5195	30	117	51	198	5103	8	13	8	29	753	0.0570866141732283	0.146464646464646	0.14756025867137	0.992575153929735	0.0385126162018592	15	21	7	43	755	0.0846456692913386	0.18695652173913	0.145332050048123	1.28640944428448	0.056953642384106	0.0748031496062992	38	120	1508	8790	0.00131599275197373	1.84565959504243	1.32209534849634	Inf	1.64239666924084	2.37977252632425	3.82485354938972e-05	3.11730864864665	1.11340964133318	0.370209243788581	1.13545504582201	0.185273590023067	470	466
TCGA-18-3417-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	328	7	0	2	2	319	13079	13	20	8	41	3130	20	24	4	48	3197	18	47	31	96	3259	19	59	56	134	3493	5	6	11	22	467	0.0670731707317073	0.164179104477612	0.133695963355282	1.22800345169229	0.0471092077087794	7	5	6	18	458	0.0548780487804878	0.1875	0.140533906106168	1.33419759825328	0.0393013100436681	0.0884146341463415	29	95	925	5827	0.00272366688370232	1.92286717273861	1.30763833982723	Inf	1.70713164777681	2.36739225712199	0.00298161856613879	3.02304060216407	1.42633115874495	0.0830320932635547	1.52975343306902	0.352370510885821	299	290
TCGA-18-3419-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	449	5	0	6	6	438	17958	10	21	6	37	4335	14	19	5	38	4552	28	99	50	177	4426	40	88	58	186	4645	23	12	18	53	687	0.11804008908686	0.28494623655914	0.147900968783638	1.92660155577468	0.0771470160116448	14	14	11	39	618	0.0868596881959911	0.220338983050847	0.139629462268414	1.5780264384839	0.0631067961165049	0.146993318485523	66	110	1305	7766	6.69126764366905e-14	3.56990163760448	2.71073559131993	Inf	2.6066091954023	3.78213883254451	2.01682501223198e-14	7.10025071527291	1.86646090534979	0.000572382920700161	2.18429550187033	0.281912941603087	383	372
TCGA-18-3421-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	451	4	0	7	7	440	18040	13	21	14	48	4492	19	23	7	49	4300	37	95	48	180	4576	33	78	52	163	4672	5	5	14	24	648	0.0532150776053215	0.147239263803681	0.138698630136986	1.06157691433765	0.037037037037037	14	11	12	37	660	0.082039911308204	0.205555555555556	0.144230769230769	1.42518518518519	0.0560606060606061	0.0997782705099778	45	125	1308	7940	2.21252641635965e-05	2.18509283571405	1.60176424619502	Inf	1.87155963302752	1.91909130624727	0.00337641354011661	2.26124020156925	1.8382874617737	0.00137371704674351	2.13261210942958	0.260142268834691	406	395
TCGA-18-4083-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	348	8	0	1	1	339	13899	17	19	3	39	3529	20	17	5	42	3402	27	50	53	130	3507	28	56	44	128	3461	7	3	6	16	481	0.0459770114942529	0.125	0.138977174227102	0.899428274428274	0.0332640332640333	11	1	13	25	505	0.0718390804597701	0.192307692307692	0.143997718848018	1.33549124143184	0.0495049504950495	0.10632183908046	37	115	986	5982	0.000669469570118526	1.95182447157939	1.38810691169688	Inf	1.72024127255258	2.31281578462106	0.000409616358551493	2.95084510253622	1.38424541519416	0.0882141109690478	1.47774615651772	1	311	302
TCGA-18-4086-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	192	5	0	5	5	182	7462	11	15	3	29	1814	5	11	4	20	1805	25	29	27	81	1877	11	25	16	52	1966	6	0	3	9	238	0.046875	0.173076923076923	0.121057985757884	1.42970265029089	0.0378151260504202	6	2	3	11	256	0.0572916666666667	0.135802469135802	0.136387852956846	0.995707947530864	0.04296875	0.09375	18	61	494	3349	0.0113585486493916	2.00006340899103	1.21260209266248	Inf	1.77251063393635	2.59311740890688	0.00136748157997426	3.38816546936913	1.08549100837963	0.483314613417159	1.09936069549479	0.110969537027476	174	164
TCGA-18-4721-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	200	4	0	0	0	196	8036	6	12	5	23	1955	5	14	2	21	2043	11	37	34	82	1977	12	31	27	70	2061	3	5	3	11	294	0.055	0.157142857142857	0.142649199417758	1.10160349854227	0.0374149659863946	3	3	3	9	268	0.045	0.109756097560976	0.135558927668184	0.809655988350928	0.0335820895522388	0.06	12	72	562	3476	0.510226651626142	1.03083869036145	0.56789113966577	Inf	1.0264361972547	1.87436175150859	0.0908833882294928	2.18242130945892	0.706726562044221	0.867946003090709	0.674790387295621	1	188	184
TCGA-18-5592-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	323	6	0	10	10	307	12587	18	17	6	41	2938	13	10	5	28	3137	20	52	41	113	3282	25	57	43	125	3230	4	5	11	20	463	0.0619195046439628	0.16	0.143343653250774	1.11619870410367	0.0431965442764579	5	7	5	17	418	0.0526315789473684	0.150442477876106	0.127361365021328	1.18122538849134	0.0406698564593301	0.0773993808049536	25	104	881	5631	0.0415446128265076	1.53632234209817	1.02189957573259	Inf	1.43248070814525	1.4783200908059	0.148097810174963	1.59775695079702	1.40792389600562	0.0993374446425442	1.50379374126071	0.139579518059988	298	282
TCGA-18-5595-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	269	11	0	1	1	257	10537	2	4	1	7	2525	5	3	1	9	2424	23	21	82	126	2731	16	14	85	115	2857	11	3	40	54	364	0.200743494423792	0.469565217391304	0.127406370318516	3.68557095078834	0.148351648351648	19	4	36	59	405	0.219330855018587	0.468253968253968	0.148297326986452	3.15753478346071	0.145679012345679	0.394052044609665	106	100	769	4819	8.65170517551884e-36	6.63907277971323	5.17970598120361	Inf	3.73911396719987	5.58967690307092	1.35145023627663e-18	20.8766120402389	3.30694657499046	2.78082469373156e-22	5.23134361966233	1.18826133840219e-09	163	151
TCGA-21-1070-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	545	15	0	1	1	529	21689	25	26	5	56	5296	22	20	7	49	5328	34	117	38	189	5533	42	130	63	235	5532	9	21	7	37	782	0.0678899082568807	0.157446808510638	0.141359363702097	1.11380530010339	0.0473145780051151	5	19	9	33	771	0.0605504587155963	0.174603174603175	0.139345743719501	1.25302122578387	0.0428015564202335	0.055045871559633	30	147	1553	9512	0.159157407425208	1.24994546083686	0.869862826477879	Inf	1.20761347637705	1.31248517300979	0.174297422691188	1.3829983024344	1.12870012049499	0.342742737629725	1.15288512128066	0.83710147272931	515	499
TCGA-21-1071-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	207	4	0	0	0	203	8323	6	13	5	24	2033	3	11	8	22	2057	13	36	32	81	2166	11	25	40	76	2067	3	2	11	16	288	0.0772946859903382	0.210526315789474	0.13933236574746	1.5109649122807	0.0555555555555556	8	5	10	23	320	0.111111111111111	0.283950617283951	0.147737765466297	1.92199074074074	0.071875	0.154589371980676	32	64	608	3625	3.20583052662184e-06	2.9800430593375	2.0110230552664	Inf	2.32072368421053	3.19099506578947	0.000230587980984024	5.04203492669041	2.03063322368421	0.00103109928244579	2.4544194460012	0.0375273695022627	175	171
TCGA-21-1076-01A-02D-1521-08	0	0	0	0	343	5	0	0	0	338	13858	13	19	4	36	3367	16	21	4	41	3458	23	67	40	130	3520	30	59	42	131	3513	10	8	9	27	466	0.0787172011661808	0.206106870229008	0.132650156561344	1.55376273629722	0.0579399141630901	10	13	9	32	516	0.0932944606413994	0.246153846153846	0.146590909090909	1.67918902802624	0.062015503875969	0.110787172011662	38	97	982	6051	1.65648057026592e-05	2.41344831406789	1.71055127979797	Inf	2.0159462925247	2.70260923029628	1.65498682705677e-05	3.73357928472643	1.57212756445283	0.0335007337406596	1.7328734334563	0.843990741820936	305	300
TCGA-21-1077-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	239	4	0	1	1	234	9594	8	10	6	24	2302	11	18	5	34	2353	22	38	35	95	2465	16	27	38	81	2474	7	4	12	23	312	0.096234309623431	0.283950617283951	0.126111560226354	2.25158277936056	0.0737179487179487	9	6	11	26	319	0.108786610878661	0.273684210526316	0.129411764705882	2.11483253588517	0.0815047021943574	0.163179916317992	39	72	631	4308	2.52600051145571e-09	3.69707012047658	2.58144551845907	Inf	2.75011778815265	3.29568771373759	7.68606078127754e-06	4.96279928430845	2.46612248442351	2.9266044242916e-05	3.13951567553135	0.215414143584744	200	195
TCGA-21-1078-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	84	0	2	1	3	81	3321	2	2	0	4	823	0	3	1	4	774	14	2	17	33	820	10	6	24	40	904	7	3	11	21	136	0.25	0.525	0.150442477876106	3.48970588235294	0.154411764705882	7	1	6	14	113	0.166666666666667	0.424242424242424	0.13780487804878	3.07857334406007	0.123893805309735	0.369047619047619	31	34	249	1475	5.40551109300005e-10	5.39324882020401	3.41320303239491	Inf	3.30206981773247	4.0388219544846	1.05130598506251e-06	8.27632611974712	2.8708002742678	3.23560718235408e-05	4.1911762699807	0.630717557816303	53	50
TCGA-21-1081-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	211	2	0	2	2	207	8487	9	15	5	29	2092	9	17	10	36	2049	9	22	37	68	2175	16	24	34	74	2171	5	6	3	14	285	0.0663507109004739	0.189189189189189	0.131275909719024	1.4411569464201	0.0491228070175439	2	4	3	9	299	0.042654028436019	0.132352941176471	0.137471264367816	0.962768050363958	0.0301003344481605	0.0616113744075829	13	83	584	3762	0.534389852657703	1.00895199385722	0.572023686704154	Inf	1.00774115296804	2.08369863013699	0.0427804669427414	2.50439170222311	0.628882886359251	0.927164536638938	0.594685172113902	1	198	194
TCGA-21-5782-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	438	8	0	1	1	429	17589	13	22	5	40	4222	17	17	8	42	4329	39	71	57	167	4466	49	68	63	180	4572	28	12	19	59	646	0.134703196347032	0.327777777777778	0.141294838145232	2.31981424148607	0.0913312693498452	20	15	22	57	682	0.13013698630137	0.341317365269461	0.152709359605911	2.2350782306355	0.0835777126099707	0.203196347031963	89	119	1328	7710	6.85060827276741e-22	4.34133445280865	3.39177888883246	Inf	2.9120641218721	3.71221248630887	6.72801462519509e-18	6.9644655617015	2.32528865461847	1.05790303067928e-07	3.01259159572409	0.417966919334386	349	340
TCGA-21-5784-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	240	10	0	0	0	230	9430	16	12	1	29	2329	15	10	3	28	2400	19	37	27	83	2410	12	40	38	90	2291	1	4	11	16	338	0.0666666666666667	0.177777777777778	0.147533828022698	1.20499671268902	0.0473372781065089	4	9	6	19	347	0.0791666666666667	0.228915662650602	0.143983402489627	1.58987535155029	0.0547550432276657	0.0916666666666667	22	74	685	4016	0.0204286260158702	1.74274202436185	1.1140950300462	Inf	1.57271897810219	1.1068989875206	0.479698632251373	1.12739206018835	1.79487928130264	0.0109479605103899	2.07602469696855	0.00405185036096857	218	208
TCGA-21-5786-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	421	8	0	7	7	406	16646	23	18	5	46	4004	28	16	4	48	3978	31	79	47	157	4322	22	82	51	155	4342	4	7	3	14	571	0.0332541567695962	0.0903225806451613	0.131506218332566	0.686831252471612	0.0245183887915937	6	9	3	18	550	0.0427553444180523	0.114649681528662	0.127255900046275	0.900938042848871	0.0327272727272727	0.0380047505938242	16	135	1121	7543	0.834823151453818	0.79750814926808	0.486238745974272	Inf	0.818947132113593	1.45826670930604	0.141704754746818	1.56473945861326	0.473192666897267	0.990517533941727	0.438865287347386	0.387032616408581	405	390
TCGA-21-5787-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	467	3	5	9	14	450	18450	23	17	8	48	4637	23	14	6	43	4336	33	104	52	189	4695	27	94	49	170	4782	8	8	9	25	623	0.0535331905781585	0.147058823529412	0.130280217482225	1.12878859408932	0.0401284109149278	14	15	8	37	661	0.0792291220556745	0.195767195767196	0.140788072417465	1.39050980957184	0.0559757942511346	0.0835117773019272	39	122	1284	8193	0.000219117305393834	2.03962012120324	1.46625293459017	Inf	1.78790561328148	2.70630841121495	6.56647264925831e-06	3.69356714182349	1.24231979272694	0.204868053570973	1.29132151813529	0.439388599735995	428	411
TCGA-22-0944-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	139	4	0	1	1	134	5494	9	7	3	19	1318	7	7	4	18	1392	5	18	28	51	1395	10	17	19	46	1389	3	1	5	9	189	0.0647482014388489	0.195652173913043	0.136069114470842	1.43788819875776	0.0476190476190476	2	1	6	9	202	0.0647482014388489	0.176470588235294	0.144802867383513	1.21869539895166	0.0445544554455446	0.115107913669065	16	46	391	2393	0.0112559683480137	2.12805880800857	1.23355512003732	Inf	1.83747215576273	2.37340153452685	0.0492848114518943	3.05836591487209	1.66643086466779	0.0600496942696131	1.86949193052495	0.092215182731215	123	118
TCGA-22-1002-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	251	3	0	0	0	248	10168	8	22	4	34	2421	11	17	1	29	2386	10	47	32	89	2697	11	55	30	96	2664	2	4	2	8	358	0.0318725099601594	0.0833333333333333	0.134384384384384	0.620111731843575	0.0223463687150838	1	8	2	11	361	0.0438247011952191	0.123595505617978	0.133852428624397	0.923371409007439	0.0304709141274238	0.0278884462151394	7	76	719	4642	0.939203757689412	0.594697249215206	0.269813879367409	Inf	0.628835229652965	1.06516987879992	0.548982238262394	1.07603863861644	0.481044461393512	0.973539429580965	0.445302845993652	1	244	241
TCGA-22-1011-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	119	1	0	0	0	118	4838	5	1	2	8	1241	3	3	1	7	1177	27	7	18	52	1222	21	6	24	51	1198	10	3	11	24	176	0.201680672268908	0.470588235294118	0.146911519198664	3.20320855614973	0.136363636363636	20	2	9	31	202	0.260504201680672	0.596153846153846	0.165302782324059	3.60643564356436	0.153465346534653	0.420168067226891	50	40	378	2042	2.68668654359527e-17	6.74475258658827	4.59882624295569	Inf	3.55673133450911	4.00132275132275	5.52578153484173e-13	8.99160539410223	3.04862685815067	1.52250927922385e-06	4.90640343783594	0.084353506877441	69	68
TCGA-22-1012-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	305	8	0	2	2	295	12095	8	16	7	31	3003	13	24	10	47	3026	21	50	34	105	3011	31	40	41	112	3055	10	11	10	31	435	0.101639344262295	0.276785714285714	0.142389525368249	1.94386288998358	0.071264367816092	8	11	6	25	428	0.0819672131147541	0.238095238095238	0.142145466622385	1.67501112594571	0.058411214953271	0.111475409836066	34	93	863	5203	0.000188907475377781	2.20378100118031	1.53374866341134	Inf	1.88177115172307	2.43310455477315	0.000201433315192712	3.190947081239	1.49951332560834	0.0623664190086969	1.63481364224318	0.83739013315881	271	261
TCGA-22-1016-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	374	9	0	2	2	363	14883	18	14	8	40	3600	24	17	3	44	3603	24	69	46	139	3878	25	69	46	140	3802	8	11	6	25	504	0.0668449197860963	0.178571428571429	0.132561809573908	1.34708049886621	0.0496031746031746	8	6	4	18	536	0.0481283422459893	0.129496402877698	0.13821557503868	0.936916138730806	0.0335820895522388	0.0695187165775401	26	115	1040	6640	0.0640523951108406	1.44339742266341	0.971133608940427	Inf	1.36170212765957	2.41130298273155	0.000526492386508367	3.09492630391862	0.802675585284281	0.813932699110304	0.7786349053028	0.240175402058493	348	337
TCGA-22-4591-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	283	5	1	2	3	275	11275	14	21	7	42	2612	15	20	3	38	2706	16	24	44	84	2964	17	44	50	111	2993	2	3	6	11	388	0.03886925795053	0.0990990990990991	0.129635816906114	0.764442277328875	0.0283505154639175	6	3	3	12	349	0.0424028268551237	0.142857142857143	0.11774628879892	1.21326238231682	0.0343839541547278	0.0600706713780919	17	110	737	5220	0.405845720526114	1.09462430542284	0.672414778687881	Inf	1.08194531992863	1.95945890382797	0.0449939459523648	2.26607313067726	0.77388204047461	0.835629824610761	0.749972560347618	1	266	258
TCGA-22-4593-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	216	1	0	6	6	209	8569	9	10	5	24	1942	5	15	1	21	2051	12	28	35	75	2258	9	31	49	89	2318	2	6	10	18	300	0.0833333333333333	0.202247191011236	0.129421915444349	1.56269662921348	0.06	7	4	7	18	278	0.0833333333333333	0.24	0.12311780336581	1.94935251798561	0.0647482014388489	0.12037037037037	26	79	578	3998	0.000612159974203331	2.27593982337553	1.50307424697134	Inf	1.96038886142692	3.39298072170044	0.000599146181788588	5.18472145172578	1.60224089635854	0.0340700044138923	1.75478761308133	0.0849733132129789	190	183
TCGA-22-4595-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	366	10	1	2	3	353	14473	24	11	3	38	3526	13	19	7	39	3552	41	54	45	140	3670	28	59	49	136	3725	7	5	10	22	513	0.0601092896174863	0.161764705882353	0.137718120805369	1.17460726980851	0.0428849902534113	18	7	7	32	514	0.087431693989071	0.228571428571429	0.140054495912807	1.63201778765981	0.0622568093385214	0.114754098360656	42	121	1027	6368	5.38713899308444e-05	2.15199708193656	1.56009785452788	Inf	1.85536526066153	2.60890732822488	3.3421584909708e-06	3.52223730930261	1.30223331745012	0.154248080237303	1.36889352275348	0.166728597233355	324	311
TCGA-22-4599-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	426	8	4	6	10	408	16728	22	27	6	55	4120	20	22	9	51	4105	26	64	43	133	4221	30	80	59	169	4282	6	11	6	23	575	0.0539906103286385	0.136094674556213	0.134283045305932	1.01349112426036	0.04	2	14	3	19	588	0.0446009389671361	0.142857142857143	0.139303482587065	1.02551020408163	0.032312925170068	0.039906103286385	17	141	1163	7340	0.882887849753929	0.760954850704211	0.471425074424467	Inf	0.786654984381292	1.04446628178356	0.506215437313612	1.0518823104179	0.645111526983966	0.948469784758728	0.610797909512534	1	409	391
TCGA-22-4601-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	223	3	0	8	8	212	8692	6	12	7	25	2096	8	15	1	24	2273	11	36	37	84	2163	20	32	27	79	2160	7	8	6	21	320	0.0941704035874439	0.265822784810127	0.148148148148148	1.79430379746835	0.065625	1	6	9	16	293	0.0717488789237668	0.19047619047619	0.135460009246417	1.4061433447099	0.0546075085324232	0.103139013452915	23	72	613	3710	0.00698892543795715	1.9330794021679	1.24368701862375	Inf	1.70737528977419	1.81992317002579	0.0639501955974369	2.10467334343789	1.65285991027732	0.0333296111271667	1.85235686445383	0.130940246571579	200	189
TCGA-22-4604-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	295	3	2	4	6	286	11726	12	17	3	32	2811	13	21	7	41	2915	23	31	52	106	2987	14	38	55	107	3013	7	6	9	22	421	0.0745762711864407	0.205607476635514	0.139727846000664	1.47148533753635	0.0522565320665083	6	5	6	17	423	0.0576271186440678	0.160377358490566	0.141613659189823	1.13249921941211	0.0401891252955083	0.0949152542372881	28	116	844	5156	0.0481999737027064	1.474477397917	1.00409864675208	Inf	1.38230647709321	2.49775842192904	0.001137696285721	3.30810805891354	0.996589449439695	0.548621001619036	0.996033975808265	0.813676710741718	267	258
TCGA-22-4607-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	101	0	2	0	2	99	4059	2	4	1	7	946	6	4	0	10	993	13	5	18	36	1038	15	13	18	46	1082	9	1	6	16	151	0.158415841584158	0.347826086956522	0.139556377079482	2.49236970918514	0.105960264900662	9	1	6	16	159	0.158415841584158	0.444444444444444	0.153179190751445	2.90146750524109	0.10062893081761	0.297029702970297	30	34	310	1810	1.84509742146043e-09	5.14598429400309	3.25291468368573	Inf	3.20564516129032	4.3963133640553	4.05162564005226e-09	10.4903820201394	2.27956989247312	0.00426594692656531	2.91735232877978	0.210129401736766	71	69
TCGA-22-4613-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	714	8	3	5	8	698	28618	40	37	10	87	7066	37	50	15	102	7001	42	119	70	231	7274	51	152	75	278	7277	8	16	8	32	1004	0.0448179271708683	0.115107913669065	0.137968943245843	0.834303075467912	0.0318725099601594	7	14	13	34	1042	0.0476190476190476	0.147186147186147	0.143249931262029	1.02747796029946	0.0326295585412668	0.0504201680672269	36	202	2046	12505	0.34705499999721	1.08927340875905	0.787180163666685	Inf	1.07575346854284	1.14708479172579	0.326023818636042	1.17533764149101	1.03000303367378	0.47859248134481	1.03508712613091	0.328551664255323	678	662
TCGA-22-5471-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	287	3	0	0	0	284	11644	13	17	4	34	2943	12	11	3	26	2807	17	47	61	125	2970	17	43	39	99	2924	10	6	5	21	417	0.0731707317073171	0.212121212121212	0.142612859097127	1.48739190465809	0.0503597122302158	5	3	13	21	427	0.0731707317073171	0.168	0.143771043771044	1.16852459016393	0.0491803278688525	0.114982578397213	33	101	844	5050	0.00126108414198023	1.95478632281597	1.35913419974023	Inf	1.71979557190352	3.08091720100362	2.88147474108432e-05	4.72202549135454	1.25701421800948	0.183058639072592	1.31336493697884	0.655348339710437	254	251
TCGA-22-5472-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	461	5	0	2	2	454	18614	10	11	4	25	4162	9	10	2	21	4271	22	175	25	222	5128	7	154	25	186	5053	2	15	6	23	611	0.0498915401301518	0.123655913978495	0.12091826637641	1.02264048008729	0.0376432078559738	9	19	1	29	581	0.0629067245119306	0.130630630630631	0.113299531981279	1.15296708067792	0.0499139414802065	0.0390455531453362	18	61	1192	8989	0.00417133523038525	2.22501389924903	1.35508176806017	Inf	1.9460750998216	3.23973038648461	0.00026658568808991	4.60752166323028	1.19575503355705	0.369396589973391	1.22759474020872	0.437542137144354	443	436
TCGA-22-5473-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	922	13	2	10	12	897	36777	30	30	14	74	9152	33	29	12	74	9174	109	113	162	384	9057	93	115	157	365	9394	50	15	55	120	1390	0.130151843817787	0.328767123287671	0.14796678731105	2.22189809795999	0.0863309352517986	58	18	63	139	1414	0.150759219088937	0.361979166666667	0.156122336314453	2.31856104137199	0.0983026874115983	0.245119305856833	226	295	2804	15647	2.34651612493974e-51	4.27473721714564	3.66539115999184	Inf	2.8543854269059	3.5181494611658	7.29551565946769e-36	6.41034689064663	2.43407089737455	4.00147786578743e-21	3.27567569703634	0.425264260679198	696	671
TCGA-22-5474-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	107	0	0	2	2	105	4305	1	4	0	5	1037	1	8	3	12	1112	12	7	25	44	1089	11	11	22	44	1067	9	4	7	20	170	0.186915887850467	0.454545454545455	0.159325210871603	2.85294117647059	0.117647058823529	7	0	7	14	158	0.130841121495327	0.318181818181818	0.145087235996327	2.19303797468354	0.0886075949367089	0.280373831775701	30	40	328	1828	5.63263794880902e-08	4.17610608479439	2.68143376337634	Inf	2.81707317073171	4.57264050901379	9.21541869831756e-09	12.7189801264008	1.95796574987026	0.00927862868889271	2.36317892857479	0.807308133677986	77	75
TCGA-22-5477-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	201	4	0	1	1	196	8036	4	3	3	10	1944	5	9	0	14	1941	38	9	47	94	2097	21	20	37	78	2054	14	6	16	36	299	0.17910447761194	0.461538461538462	0.145569620253165	3.17056856187291	0.120401337792642	22	1	23	46	336	0.228855721393035	0.48936170212766	0.160228898426323	3.05414133738602	0.136904761904762	0.373134328358209	75	68	635	3516	8.23363489195232e-24	6.10306155705617	4.52706667977524	Inf	3.42850063322504	3.98868277058588	3.12541460475662e-15	8.65940235411827	3.03503937007874	2.91658473743483e-11	4.79624003134572	0.754024952740554	126	121
TCGA-22-5478-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	212	3	1	3	4	205	8405	13	15	3	31	2020	9	14	2	25	2124	9	37	30	76	2084	15	38	20	73	2177	1	5	2	8	301	0.0377358490566038	0.10958904109589	0.138263665594855	0.792609111181905	0.026578073089701	2	5	2	9	293	0.0424528301886792	0.118421052631579	0.140595009596929	0.842284893120173	0.0307167235494881	0.0330188679245283	7	67	594	3667	0.904652234173444	0.645039232063701	0.291270330916598	Inf	0.678564928564929	0.896675084175084	0.669908870057227	0.881967276504166	0.573872053872054	0.930944851900187	0.536880890630837	1	205	198
TCGA-22-5480-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	178	4	0	3	3	171	7011	9	13	3	25	1733	10	11	4	25	1744	10	25	24	59	1737	19	21	22	62	1797	7	3	0	10	277	0.0561797752808989	0.161290322580645	0.154145798553144	1.04634913240946	0.036101083032491	1	2	5	8	245	0.0449438202247191	0.135593220338983	0.14104778353483	0.961328260117606	0.0326530612244898	0.0730337078651685	13	62	522	3012	0.31461424394147	1.20977456801589	0.677417562031907	Inf	1.17348659003831	1.86761791518034	0.055452364097149	2.19751977680499	0.735882058970515	0.828615249034741	0.703734704222936	0.488676307007786	165	158
TCGA-22-5482-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	184	6	0	4	4	174	7134	7	15	3	25	1753	8	9	6	23	1699	12	23	22	57	1820	7	31	31	69	1862	3	5	6	14	234	0.0760869565217391	0.202898550724638	0.125671321160043	1.61451752756101	0.0598290598290598	3	2	4	9	256	0.0489130434782609	0.157894736842105	0.140659340659341	1.12253289473684	0.03515625	0.0869565217391304	16	56	490	3192	0.0272422493174106	1.86078728275575	1.0932675399558	Inf	1.66984126984127	2.37293233082707	0.0327696355545713	3.00531591389715	1.4177897574124	0.162971053498602	1.51475022539356	0.353412512653542	168	158
TCGA-22-5485-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	238	1	1	3	4	233	9553	12	16	2	30	2277	17	21	2	40	2382	13	43	39	95	2511	5	43	20	68	2383	1	5	2	8	329	0.0336134453781513	0.117647058823529	0.138061267310113	0.852136599320579	0.0243161094224924	2	2	5	9	333	0.0378151260504202	0.0947368421052632	0.132616487455197	0.714366998577525	0.027027027027027	0.0420168067226891	10	67	662	4232	0.605740082712911	0.95414474427271	0.49508547024575	Inf	0.960097304508181	1.23212487411883	0.44819681706442	1.27847867250772	0.877105842593067	0.701956787242471	0.860604647054776	0.258731924360401	228	223
TCGA-22-5489-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	273	3	0	0	0	270	11070	12	21	2	35	2711	15	21	5	41	2802	21	41	44	106	2783	20	44	24	88	2774	8	8	6	22	411	0.0805860805860806	0.25	0.14816149963951	1.68734793187348	0.0535279805352798	9	5	8	22	386	0.0805860805860806	0.207547169811321	0.138699245418613	1.49638283312152	0.0569948186528497	0.113553113553114	31	78	797	4760	0.000126481389022118	2.37313443725101	1.61470102071736	Inf	1.9829751476293	2.89099366526915	2.3941633506051e-05	4.22912013602623	1.43549339434645	0.103096502801712	1.54825481839831	0.655735745502893	242	239
TCGA-22-5491-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	399	7	0	5	5	387	15867	12	12	10	34	3712	5	14	4	23	3965	40	34	70	144	4056	49	51	86	186	4134	30	8	37	75	616	0.18796992481203	0.403225806451613	0.149008224479923	2.70606409719313	0.121753246753247	24	6	30	60	565	0.150375939849624	0.416666666666667	0.139299802761341	2.99115044247788	0.106194690265487	0.303258145363409	121	124	1181	7009	7.98781814515347e-37	5.7893585106124	4.62283961699623	Inf	3.42494254263941	4.20763207717703	2.96164964894811e-23	9.15227624056118	2.97840812870449	1.80670003810591e-17	4.46680383600504	0.141819920368211	278	266
TCGA-22-5492-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	251	7	1	0	1	243	9963	12	18	6	36	2480	11	28	6	45	2510	16	34	25	75	2461	18	40	29	87	2512	5	4	5	14	332	0.0557768924302789	0.160919540229885	0.132165605095541	1.21755989475142	0.0421686746987952	5	3	1	9	364	0.0358565737051793	0.12	0.147907354733848	0.811318681318681	0.0247252747252747	0.0637450199203187	16	72	696	4277	0.166272130545145	1.36548518722067	0.813787882709947	Inf	1.2991118077325	2.10150439486139	0.0157173990279488	2.55976101295999	0.793901660280971	0.784934461695885	0.768176514769208	0.353412512653542	235	227
TCGA-33-4532-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	433	18	1	0	1	414	16974	16	17	4	37	4003	18	31	4	53	4136	30	69	54	153	4423	28	65	78	171	4412	11	10	17	38	596	0.0877598152424942	0.222222222222222	0.135086128739801	1.64504101416853	0.063758389261745	12	12	9	33	580	0.0762124711316397	0.215686274509804	0.131132715351571	1.6447937795808	0.0568965517241379	0.113163972286374	49	141	1176	7659	4.23898277746109e-06	2.26303064145363	1.68269453663723	Inf	1.9375	2.97919598874032	6.1748518758898e-07	4.27905398937554	1.47978509585652	0.0265929936567686	1.59736189310582	0.724257599176881	384	365
TCGA-33-4533-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	323	7	1	8	9	307	12587	13	18	5	36	2955	19	17	5	41	3019	14	52	49	115	3307	16	52	47	115	3306	7	4	11	22	455	0.0681114551083591	0.191304347826087	0.137628554143981	1.39000477783086	0.0483516483516484	3	7	10	20	404	0.0619195046439628	0.173913043478261	0.122165104324161	1.42359018510547	0.0495049504950495	0.0959752321981424	31	95	859	5754	0.000345920364013772	2.18549514737149	1.50160065099568	Inf	1.89407210303601	2.56616220411331	0.00353983172843097	3.3483916798758	1.68404394644936	0.011496166427871	1.87528631879198	0.0230129339073326	292	276
TCGA-33-4538-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	222	5	0	4	4	213	8733	7	21	4	32	2160	14	14	3	31	2165	13	28	30	71	2211	15	24	40	79	2197	5	3	7	15	297	0.0675675675675676	0.189873417721519	0.135184342284934	1.40455184758982	0.0505050505050505	4	5	6	15	299	0.0675675675675676	0.211267605633803	0.135232926277702	1.56224975269678	0.0501672240802676	0.0990990990990991	22	76	596	3812	0.0117098237923268	1.85110745481783	1.18388441958838	Inf	1.66032050404054	2.37727708533078	0.00950624733993944	3.02859290774429	1.37353787152445	0.147694309120336	1.45858628491463	0.421975381019902	200	191
TCGA-33-4547-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	243	0	0	1	1	242	9922	5	6	4	15	2406	5	4	3	12	2388	43	16	56	115	2591	37	22	41	100	2537	27	1	15	43	379	0.176954732510288	0.43	0.149389042175798	2.87839050131926	0.113456464379947	30	4	21	55	345	0.226337448559671	0.478260869565217	0.133153222693941	3.59180844360429	0.159420289855072	0.382716049382716	93	84	724	4404	8.99949900467949e-32	6.73072568280999	5.14886396644007	Inf	3.72150950463527	5.04654696132597	3.99831904277299e-30	15.0607937505445	2.62869510736458	2.40305051622877e-08	3.58866667114998	0.0041073743565389	150	149
TCGA-33-4566-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	1423	29	6	21	27	1367	56047	77	45	8	130	13162	60	39	14	113	13609	75	352	121	548	14736	102	373	101	576	14540	19	38	19	76	1944	0.0534082923401265	0.131944444444444	0.133700137551582	0.986868427069044	0.0390946502057613	14	39	29	82	1864	0.0576247364722417	0.14963503649635	0.126492942453855	1.18295166191535	0.0439914163090129	0.0569219957835559	81	318	3808	25468	3.57649633420433e-05	1.70351199942315	1.37034538706138	Inf	1.56072692234789	1.43336063238855	0.0211656415927555	1.53264027300006	1.66227572109925	0.000276216612598601	1.84490147126517	0.0708815874253105	1342	1286
TCGA-33-4582-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	239	2	0	0	0	237	9717	9	6	6	21	2372	11	12	4	27	2423	16	31	47	94	2406	15	36	44	95	2516	4	4	9	17	373	0.0711297071129707	0.178947368421053	0.148251192368839	1.20705517144067	0.0455764075067024	2	6	10	18	350	0.0753138075313808	0.191489361702128	0.14546965918537	1.31635258358663	0.0514285714285714	0.104602510460251	25	97	723	4199	0.0535687904190926	1.4967014736744	0.991756519919526	Inf	1.39502981656577	1.31762816222728	0.300847808755804	1.39375145092975	1.42139741309866	0.071487164806366	1.53244511141983	0.0024089945773894	214	212
TCGA-33-4583-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	616	7	1	7	8	601	24641	25	29	9	63	5842	34	40	4	78	5905	38	126	67	231	6404	34	123	72	229	6490	8	8	12	28	839	0.0454545454545455	0.122270742358079	0.129275808936826	0.945813012996341	0.033373063170441	12	16	10	38	815	0.0616883116883117	0.164502164502165	0.127264209868832	1.29260351100842	0.0466257668711656	0.0681818181818182	42	169	1654	11240	0.00269705968130782	1.68877278973747	1.24080810704384	Inf	1.55174014452971	2.16545747682386	0.000582662310019883	2.61357129527802	1.23384339686655	0.176456496857918	1.27778627088727	0.851914527340792	574	559
TCGA-33-4586-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	414	4	0	7	7	403	16523	21	21	6	48	3877	19	27	7	53	4082	16	87	49	152	4264	24	72	54	150	4300	5	10	6	21	619	0.0507246376811594	0.14	0.143953488372093	0.972536348949919	0.0339256865912763	3	12	6	21	548	0.0507246376811594	0.138157894736842	0.128517823639775	1.07500960430273	0.0383211678832117	0.0483091787439614	20	123	1167	7397	0.48791753355742	1.03064693207569	0.660292961815381	Inf	1.02636010091023	1.46769494430163	0.171033167655995	1.58450983175655	0.854967928719395	0.76101308302538	0.835861266379614	0.442764571536631	394	383
TCGA-33-6737-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	509	9	0	2	2	498	20418	20	10	4	34	4868	9	6	4	19	4972	55	73	93	221	5262	68	72	84	224	5316	43	9	32	84	768	0.165029469548134	0.375	0.144469525959368	2.595703125	0.109375	40	11	35	86	765	0.168958742632613	0.389140271493213	0.145381984036488	2.67667465176116	0.112418300653595	0.294695481335953	150	150	1533	9045	6.85446795810847e-46	5.89870925725945	4.81830556838779	Inf	3.45009784735812	4.65622961513373	9.23340178623925e-40	12.2381191079798	2.61193848331067	3.31855095275827e-14	3.59317441502669	0.101199996258093	359	348
TCGA-34-2596-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	305	4	4	4	8	293	12013	16	19	5	40	2911	14	22	2	38	2896	29	35	40	104	3002	22	42	47	111	3204	8	5	13	26	429	0.0852459016393443	0.234234234234234	0.133895131086142	1.74938574938575	0.0606060606060606	15	8	11	34	438	0.111475409836066	0.326923076923077	0.145902731512325	2.24069195644538	0.0776255707762557	0.154098360655738	47	91	867	5339	3.61839836936256e-09	3.17969784371932	2.30484305163112	Inf	2.43787506477442	3.22812492932582	9.35168911905145e-08	5.05641916195485	1.97462514417532	0.000734529335266937	2.34535897961666	1	258	246
TCGA-34-2600-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	570	7	0	3	3	560	22960	17	15	8	40	5606	14	14	5	33	5786	79	52	112	243	5690	64	68	112	244	5878	40	16	52	108	884	0.189473684210526	0.442622950819672	0.15039128955427	2.94314220013352	0.122171945701357	56	10	48	114	868	0.2	0.469135802469136	0.152548330404218	3.07532570973431	0.131336405529954	0.343859649122807	196	171	1752	9816	4.93356264709343e-62	6.42030734555372	5.34733454371752	Inf	3.52625881825986	4.43260848740301	9.30542940859201e-44	11.4400377131263	2.94765166340509	3.31363829571561e-25	4.51770390027699	0.774366934292522	374	364
TCGA-34-2608-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	183	2	0	0	0	181	7421	6	11	2	19	1770	5	13	1	19	1868	8	27	32	67	1902	12	25	39	76	1881	3	0	7	10	271	0.0546448087431694	0.131578947368421	0.144072301967039	0.913284132841328	0.03690036900369	5	8	9	22	258	0.120218579234973	0.328358208955224	0.135646687697161	2.42068726136758	0.0852713178294574	0.131147540983607	24	67	529	3254	0.00155744557278769	2.20285051149399	1.42158001532621	Inf	1.88603834728598	2.86049149338374	0.00395288934870782	4.09887855798436	1.61154450331478	0.0359793636831328	1.78911862653057	0.0696786155660074	159	157
TCGA-34-5231-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	735	9	2	11	13	713	29233	38	47	10	95	6946	41	46	13	100	7143	58	115	88	261	7581	48	115	94	257	7563	16	13	16	45	1021	0.0612244897959184	0.175097276264591	0.134999338886685	1.29702321291783	0.0440744368266405	21	16	14	51	990	0.0693877551020408	0.195402298850575	0.130589631974674	1.49630790665273	0.0515151515151515	0.091156462585034	67	221	2011	13133	3.70351705990123e-06	1.97980942602936	1.5477078575459	Inf	1.75190618266203	2.62859930758188	1.5222559734803e-08	3.50156454987909	1.24130469232409	0.125452334347353	1.2889057851935	0.363693767244747	668	646
TCGA-34-5232-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	225	5	0	0	0	220	9020	8	11	2	21	2053	8	13	4	25	2251	14	36	36	86	2301	14	24	50	88	2415	2	6	10	18	326	0.08	0.204545454545455	0.134989648033126	1.51526770775237	0.0552147239263804	4	2	1	7	297	0.0311111111111111	0.0813953488372093	0.129074315514993	0.630608409678177	0.0235690235690236	0.0755555555555556	17	97	623	4093	0.338244872634343	1.15135130614218	0.703778334144492	Inf	1.12883331925319	1.62210502178399	0.15731511442968	1.79149736682073	0.968233230057113	0.594215924209651	0.963577869849002	0.232095470796428	208	203
TCGA-34-5234-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	210	3	0	0	0	207	8487	4	16	4	24	2074	15	22	2	39	2109	9	43	23	75	2187	15	32	22	69	2117	3	3	0	6	296	0.0285714285714286	0.0869565217391304	0.13982050070855	0.621915393654524	0.0202702702702703	2	5	3	10	304	0.0476190476190476	0.133333333333333	0.139003200731596	0.959210526315789	0.0328947368421053	0.0380952380952381	8	61	600	3704	0.762598280502928	0.80965409543571	0.385445748628211	Inf	0.831690821256039	1.49444444444444	0.23735608578849	1.62433865754385	0.478222222222222	0.959692677837113	0.44101293677661	0.685082190087752	202	199
TCGA-34-5236-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	249	6	0	0	0	243	9963	12	18	0	30	2578	4	14	13	31	2549	21	37	35	93	2461	21	37	31	89	2375	6	7	5	18	346	0.072289156626506	0.202247191011236	0.145684210526316	1.38825745275054	0.0520231213872832	8	7	7	22	401	0.0883534136546185	0.236559139784946	0.162941893539212	1.45180060601185	0.0548628428927681	0.104417670682731	26	82	747	4089	0.0136868789935625	1.73539239256655	1.14987697953774	Inf	1.55853041796817	2.15796519410977	0.00331807251952168	2.73602008477184	1.17707192405988	0.31937333637761	1.21634852399654	0.811646693938239	223	217
TCGA-34-5239-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	272	5	1	3	4	263	10783	15	12	4	31	2593	5	16	4	25	2673	16	44	40	100	2719	16	54	37	107	2798	5	4	5	14	415	0.0514705882352941	0.130841121495327	0.148320228734811	0.882152910708254	0.0337349397590361	3	6	8	17	397	0.0625	0.17	0.146009562339095	1.16430730478589	0.0428211586901763	0.0772058823529412	21	88	812	4705	0.119393148954818	1.38264800765528	0.883306734549094	Inf	1.30900031635558	1.69858374384236	0.0888887819435228	1.93127141428026	1.14709551532212	0.343883779551201	1.17691443189854	0.283069973260209	251	242
TCGA-34-5240-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	198	7	0	6	6	185	7585	6	11	1	18	1782	3	7	4	14	1851	9	35	33	77	1910	12	25	39	76	2042	4	3	12	19	301	0.095959595959596	0.25	0.147404505386876	1.69601328903654	0.0631229235880399	2	5	7	14	242	0.0707070707070707	0.181818181818182	0.126701570680628	1.43501126972201	0.0578512396694215	0.126262626262626	25	68	543	3409	0.000729358302665887	2.30749620119661	1.50139970946902	Inf	1.9564743856314	2.07945277558537	0.0590708811814162	2.51042102465009	1.92060568856149	0.00363317521826426	2.25004475091805	0.00201808652901636	173	160
TCGA-34-5241-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	2	0	0	1	1	1	41	0	0	0	0	12	0	0	0	0	13	0	0	0	0	7	0	1	0	1	9	0	0	0	0	3	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	0	NaN	NaN	0	0	0	3	13	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	2	1
TCGA-34-5927-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	311	5	1	5	6	300	12300	10	17	1	28	2940	9	21	4	34	2949	25	48	48	121	3132	24	47	46	117	3279	7	5	11	23	432	0.0739549839228296	0.196581196581197	0.131747483989021	1.49210588793922	0.0532407407407407	6	6	8	20	434	0.0643086816720257	0.165289256198347	0.138569604086845	1.19282477053738	0.0460829493087558	0.102893890675241	32	111	866	5545	0.00289811143991756	1.84565761952322	1.28244929428006	Inf	1.6566159014196	1.96406183720601	0.0117818081475435	2.31179839354263	1.49635153063732	0.0470946218109546	1.62194431233206	0.264566003832409	279	268
TCGA-34-5928-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	450	9	1	1	2	439	17999	12	20	3	35	4455	13	9	2	24	4458	76	36	85	197	4566	71	32	80	183	4520	45	6	35	86	741	0.191111111111111	0.469945355191257	0.163938053097345	2.86660324624087	0.116059379217274	46	7	36	89	679	0.197777777777778	0.451776649746193	0.148707840560666	3.03801499667322	0.131075110456554	0.36	162	150	1420	7666	1.32640382960157e-47	5.82886117622433	4.776752926455	Inf	3.32234561213434	3.96103286384977	4.42789631287173e-36	8.77019341906065	2.75333333333333	1.22475411073869e-16	4.07683035237329	0.0415128350348492	288	277
TCGA-34-5929-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	233	3	0	1	1	229	9389	7	6	2	15	2226	10	13	1	24	2237	25	29	30	84	2486	22	49	35	106	2440	10	10	11	31	358	0.133047210300429	0.292452830188679	0.14672131147541	1.99325392642563	0.0865921787709497	13	3	11	27	324	0.11587982832618	0.321428571428571	0.130329847144006	2.46626984126984	0.0833333333333333	0.1931330472103	45	67	682	4244	1.30306727999169e-11	4.17807739430491	2.95556280938865	Inf	2.90204754922497	3.53459786610095	1.21335334649249e-08	5.96011658649921	2.44466501240695	4.24466264122183e-05	3.18274596673928	1	188	184
TCGA-37-3783-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	440	4	0	1	1	435	17835	8	18	5	31	4326	6	16	3	25	4529	70	42	77	189	4413	59	37	94	190	4567	35	7	45	87	708	0.197727272727273	0.457894736842105	0.155025180643749	2.95367975022302	0.122881355932203	51	11	32	94	686	0.213636363636364	0.497354497354497	0.155449807387265	3.19945393123236	0.137026239067055	0.370454545454545	163	137	1394	7586	1.09184046816453e-51	6.47266696710008	5.28163558765456	Inf	3.5000956480153	4.29459588713534	4.36091567658565e-38	10.8792378761205	2.9007358185037	1.94572485721845e-19	4.45684587357302	0.398072403848058	277	272
TCGA-37-3789-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	491	1	1	8	9	481	19721	12	13	2	27	4833	9	19	3	31	5113	43	124	52	219	4799	48	108	48	204	4976	30	13	15	58	805	0.118126272912424	0.284313725490196	0.16177652733119	1.75744732675679	0.0720496894409938	24	11	21	56	711	0.114052953156823	0.255707762557078	0.148155865805376	1.72593748595136	0.0787623066104079	0.183299389002037	90	101	1516	8259	3.89140171879541e-24	4.85356298160782	3.76453920871426	Inf	3.03827238945144	3.82621995418829	3.47644089545104e-21	7.94826887484171	2.3212401055409	5.12709685088175e-07	3.06395661023574	0.0210190047193119	401	391
TCGA-37-4133-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	333	0	1	5	6	327	13407	15	23	5	43	3222	14	22	7	43	3303	19	42	53	114	3378	16	44	67	127	3504	7	11	9	27	514	0.0810810810810811	0.21259842519685	0.146689497716895	1.44930910873495	0.0525291828793774	7	5	6	18	441	0.0540540540540541	0.157894736842105	0.130550621669627	1.2094522019334	0.0408163265306122	0.0870870870870871	29	126	955	5927	0.0589846063946913	1.42834512093255	0.981822638637652	Inf	1.3482722513089	2.88251308900524	0.000134022945475575	4.13659287061231	0.900785340314136	0.706888528764714	0.88665287329776	1	304	298
TCGA-37-4135-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	333	3	1	11	12	318	13038	14	23	2	39	3105	12	17	5	34	3105	29	49	39	117	3416	24	58	46	128	3412	5	5	5	15	476	0.045045045045045	0.1171875	0.139507620164127	0.840007878151261	0.0315126050420168	7	2	4	13	424	0.039039039039039	0.111111111111111	0.124121779859485	0.895178197064989	0.0306603773584906	0.0630630630630631	21	117	900	5928	0.27684390990362	1.18217539779657	0.763284527606324	Inf	1.15449275362319	1.7177358490566	0.0413241789315187	1.92767703667819	0.803294117647059	0.803773021130246	0.780025935089905	0.581504130634261	312	297
TCGA-37-4141-01A-02D-1352-08	0	0	0	0	372	5	0	9	9	358	14678	15	12	5	32	3497	16	17	11	44	3503	27	62	50	139	3839	30	76	37	143	3839	5	11	3	19	498	0.0510752688172043	0.132867132867133	0.129721281583746	1.02425084955205	0.0381526104417671	6	11	5	22	502	0.0591397849462366	0.158273381294964	0.130763219588434	1.21038149560033	0.0438247011952191	0.0510752688172043	19	125	1000	6678	0.513947878974278	1.0150552038842	0.642976735035003	Inf	1.01306944444444	1.48171929824561	0.117345353055488	1.59678990770202	0.706022988505747	0.892855682782906	0.676283340489945	0.601458808712604	353	339
TCGA-37-5819-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	832	19	5	18	23	790	32390	37	28	8	73	7830	35	36	13	84	7818	45	181	98	324	8432	36	188	85	309	8310	5	20	14	39	1142	0.046875	0.12621359223301	0.137424789410349	0.918419397072076	0.0341506129597198	12	25	13	50	1099	0.0600961538461538	0.154320987654321	0.130336812144213	1.18401689526955	0.0454959053685168	0.0528846153846154	44	220	2241	14501	0.0750894753847854	1.29413142705419	0.96421189987647	Inf	1.24512866279935	1.56793979759918	0.0387619270575313	1.71872731317957	1.1022450457568	0.325470185155571	1.11989962083947	0.117291770695331	788	746
TCGA-39-5016-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	404	8	0	4	4	392	16072	13	10	7	30	3728	14	28	5	47	3850	24	60	72	156	4315	21	68	70	159	4179	2	6	8	16	510	0.0396039603960396	0.10062893081761	0.122038765254846	0.82456529781724	0.0313725490196078	6	5	8	19	515	0.047029702970297	0.121794871794872	0.119351100811124	1.02047547921334	0.0368932038834951	0.0594059405940594	24	163	1025	7469	0.408634460244428	1.07291986009484	0.718381336635531	Inf	1.06355028042259	1.47321409214092	0.170429602493819	1.57542045051094	0.933727241497767	0.652949447121008	0.925308926577951	0.0769180628973113	380	368
TCGA-39-5019-01A-01D-1817-08	0	0	0	0	216	3	0	4	4	209	8569	9	11	1	21	1990	8	18	4	30	2134	11	38	27	76	2226	14	32	36	82	2219	7	5	5	17	302	0.0787037037037037	0.207317073170732	0.13609734114466	1.52329995154256	0.0562913907284768	3	5	4	12	294	0.0555555555555556	0.157894736842105	0.132075471698113	1.19548872180451	0.0408163265306122	0.087962962962963	19	69	596	3849	0.0244807715157076	1.77802802148183	1.09880554942607	Inf	1.61026159243441	2.98322147651007	0.000935176949738197	4.30350382186576	1.06543624161074	0.475483242743467	1.0763456906196	1	197	190
TCGA-39-5021-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	166	3	0	2	2	161	6601	8	9	0	17	1601	2	11	5	18	1642	15	29	22	66	1749	7	25	28	60	1609	2	4	6	12	253	0.072289156626506	0.2	0.157240522063393	1.27193675889328	0.0474308300395257	4	5	5	14	239	0.0843373493975904	0.212121212121212	0.136649514008005	1.55230125523013	0.0585774058577406	0.102409638554217	17	55	492	2866	0.0309859925961887	1.80014266727044	1.07141686024261	Inf	1.61150632339657	1.86141906873614	0.0926675594297632	2.18380854312802	1.50154471544715	0.108466026191262	1.64271830058538	0.236706211941847	149	144
TCGA-39-5022-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	324	2	0	0	0	322	13202	9	13	2	24	3230	2	9	2	13	3386	73	18	63	154	3278	67	23	41	131	3308	52	6	22	80	567	0.246913580246914	0.610687022900763	0.171402660217654	3.56287949163267	0.141093474426808	51	4	33	88	501	0.271604938271605	0.571428571428571	0.152837095790116	3.73880809808953	0.17564870259481	0.487654320987654	158	86	1068	5518	2.1177738913119e-61	9.48492060715812	7.50121729758573	Inf	3.9931693989071	4.53690476190476	2.12325734546497e-49	14.373818496445	3.26121794871795	2.19073062572605e-17	5.79706674397952	2.32823823614267e-07	166	164
TCGA-39-5024-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	255	1	0	0	0	254	10414	10	12	6	28	2588	9	16	6	31	2592	32	18	39	89	2615	30	24	52	106	2619	17	4	16	37	380	0.145098039215686	0.349056603773585	0.145093547155403	2.40573485600794	0.0973684210526316	16	6	15	37	407	0.145098039215686	0.415730337078652	0.155640535372849	2.67109295199183	0.0909090909090909	0.250980392156863	64	89	787	4447	4.75866673365071e-15	4.06191300272792	3.03160519799115	Inf	2.78193852721097	3.53982046972988	4.59788971858267e-12	6.42638545877922	2.26557940153874	6.52023304562388e-06	2.91865614619906	0.868299936992599	191	190
TCGA-39-5027-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	373	7	0	5	5	361	14801	29	16	2	47	3589	23	22	4	49	3696	13	73	39	125	3783	26	68	46	140	3733	8	11	6	25	516	0.0670241286863271	0.178571428571429	0.138226627377444	1.29187430786268	0.0484496124031008	3	11	8	22	542	0.0589812332439678	0.176	0.143272535025112	1.22842804428044	0.040590405904059	0.0670241286863271	25	99	1058	6458	0.0407676719938527	1.54130069551044	1.02416165108172	Inf	1.43225196658333	2.00368377684068	0.0164753464002199	2.39761297513509	1.1700656065829	0.307825896218067	1.20355373414367	0.641138038196785	348	336
TCGA-39-5028-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	216	0	0	0	0	216	8856	4	9	1	14	2168	4	8	1	13	2186	34	16	38	88	2230	25	29	47	101	2272	20	7	14	41	340	0.189814814814815	0.405940594059406	0.149647887323944	2.7126383226558	0.120588235294118	23	1	16	40	343	0.185185185185185	0.454545454545455	0.153811659192825	2.95520805724887	0.116618075801749	0.337962962962963	73	71	683	3819	2.17579608844905e-22	5.7457394981413	4.26910660616834	Inf	3.34152838783146	4.80398044519443	1.39389757273311e-22	15.0123102905534	2.32641460683834	5.00635424363203e-06	3.04888927893907	0.0577638637365599	143	143
TCGA-39-5029-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	170	1	0	0	0	169	6929	0	12	2	14	1722	7	16	2	25	1631	13	22	35	70	1795	10	19	31	60	1781	5	2	5	12	247	0.0705882352941176	0.2	0.138686131386861	1.44210526315789	0.048582995951417	7	8	8	23	251	0.135294117647059	0.328571428571429	0.13983286908078	2.34974388161639	0.0916334661354582	0.147058823529412	25	64	498	3078	0.0004472399689092	2.41344881299585	1.56416508011569	Inf	2.017056992013	3.74646411733892	1.76276318041984e-05	6.73667445815198	1.41438481197517	0.12523610448711	1.51582244308555	1	145	144
TCGA-39-5030-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	325	1	0	0	0	324	13284	4	10	1	15	3036	2	15	2	19	3315	24	32	95	151	3401	24	29	86	139	3532	14	4	7	25	520	0.0769230769230769	0.179856115107914	0.14722536806342	1.22163807415606	0.0480769230769231	16	7	14	37	436	0.113846153846154	0.245033112582781	0.128197588944428	1.91137067865605	0.0848623853211009	0.156923076923077	51	178	956	5977	0.000422443401104881	1.79115184586749	1.34659337033221	Inf	1.61509473607279	4.53255753138075	1.20230345124039e-14	10.4138122538621	0.841402945051897	0.829345239362905	0.820608701424933	0.143959362630222	274	273
TCGA-39-5031-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	733	7	0	3	3	723	29643	8	12	5	25	7354	17	10	5	32	7392	121	57	148	326	7434	110	68	162	340	7463	76	24	83	183	1190	0.249658935879945	0.538235294117647	0.159453302961276	3.37550420168067	0.153781512605042	84	9	86	179	1127	0.244201909959072	0.549079754601227	0.151600753295669	3.62188012041306	0.158828748890861	0.448840381991814	329	212	2317	12580	5.51935974691485e-120	8.42397371563999	7.2290197478615	Inf	3.90995191851277	4.45328804413828	6.88448017199579e-73	12.2277357789127	3.50507887006279	1.39169938532429e-54	6.50638644952239	0.550457208267219	404	394
TCGA-39-5035-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	182	4	0	0	0	178	7298	3	8	6	17	1778	4	6	6	16	1816	21	14	32	67	1776	24	12	42	78	1928	12	0	10	22	281	0.120879120879121	0.282051282051282	0.145746887966805	1.93521306688566	0.0782918149466192	11	3	10	24	276	0.131868131868132	0.358208955223881	0.155405405405405	2.30499675535367	0.0869565217391304	0.236263736263736	43	76	557	3147	2.37993467971907e-08	3.19531545501766	2.26202580094511	Inf	2.40290873979753	3.39884300817874	2.16019796131441e-08	5.90236503602577	1.79727303605221	0.00605482567426804	2.09206911870637	0.676261718124988	139	135
TCGA-39-5036-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	334	3	2	3	5	326	13366	20	27	10	57	3325	17	18	7	42	3460	22	45	47	114	3349	23	38	52	113	3232	8	2	9	19	479	0.0568862275449102	0.168141592920354	0.148205445544554	1.13451696934986	0.0396659707724426	11	8	8	27	467	0.0808383233532934	0.236842105263158	0.139444610331442	1.69846726022766	0.0578158458244111	0.107784431137725	36	108	946	5635	0.000623614802968812	1.98536336335202	1.40270734351298	Inf	1.73916490486258	2.93725628376791	6.00997994563593e-06	4.35176346176609	1.19457791445106	0.254078663338659	1.2348615595845	0.831028064785003	298	290
TCGA-39-5037-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	277	2	1	4	5	270	11070	15	16	4	35	2627	10	22	5	37	2801	15	38	47	100	2850	13	40	45	98	2792	4	7	9	20	397	0.0722021660649819	0.204081632653061	0.142191977077364	1.43525420243664	0.0503778337531486	3	6	9	18	372	0.0649819494584837	0.18	0.130526315789474	1.37903225806452	0.0483870967741935	0.0902527075812274	25	95	769	4873	0.0205274093597701	1.6673982387462	1.10440344757034	Inf	1.52850021673169	1.83420026007802	0.0780171361677064	2.11192396083128	1.43546107310454	0.0730346462839309	1.54124400209062	0.0137944750894916	252	245
TCGA-39-5039-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	193	5	1	0	1	187	7667	7	12	1	20	1867	10	12	2	24	1850	7	37	29	73	1997	15	23	32	70	1953	3	3	3	9	260	0.0466321243523316	0.128571428571429	0.133128520225294	0.965769230769231	0.0346153846153846	1	2	1	4	254	0.0207253886010363	0.0547945205479452	0.127190786179269	0.430805738323805	0.015748031496063	0.0414507772020725	8	75	514	3436	0.860055150446155	0.713101596200156	0.341658566846792	Inf	0.74070601472036	1.39724089140432	0.320793714541176	1.48534044589279	0.503922944440901	0.964598877367981	0.469178932283571	1	185	179
TCGA-43-2578-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	349	3	0	1	1	345	14145	25	19	7	51	3342	20	16	5	41	3334	28	73	43	144	3770	16	55	38	109	3699	4	8	6	18	470	0.0515759312320917	0.165137614678899	0.12706136793728	1.29966816318563	0.0382978723404255	6	8	7	21	488	0.0601719197707736	0.145833333333333	0.129442970822281	1.12662226775956	0.0430327868852459	0.0659025787965616	23	102	958	6511	0.0486997705945265	1.53242715961948	1.00325654849052	Inf	1.43454697286013	1.77192066805846	0.0495536541340765	1.99877412727347	1.25128224954251	0.236965319590753	1.29927019203539	0.620030839539336	326	322
TCGA-43-3394-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	176	1	3	6	9	166	6806	10	18	3	31	1752	8	10	1	19	1641	5	35	23	63	1648	10	27	16	53	1765	5	2	3	10	229	0.0568181818181818	0.188679245283019	0.129745042492918	1.45423086429925	0.0436681222707424	1	5	3	9	233	0.0511363636363636	0.142857142857143	0.141383495145631	1.01042305334151	0.0386266094420601	0.0681818181818182	12	42	462	2951	0.0566449035283965	1.82459170187726	0.977446338762649	Inf	1.64165464165464	2.95497835497835	0.010550131434085	4.25584600029607	1.13653013653014	0.437974909977997	1.16127938101795	1	164	154
TCGA-43-3920-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	347	1	2	3	5	341	13981	14	15	3	32	3425	12	16	5	33	3646	37	59	48	144	3453	31	62	39	132	3457	16	13	15	44	534	0.126801152737752	0.333333333333333	0.154469192941857	2.15792759051186	0.0823970037453183	13	4	14	31	507	0.0893371757925072	0.215277777777778	0.146828844483058	1.46618178829717	0.0611439842209073	0.167146974063401	58	97	1041	5869	1.63609331253988e-11	3.3702731405464	2.50880383783959	Inf	2.48383998016795	2.83084703622083	5.44499209539491e-08	4.19113571672883	2.21261607428754	1.98480298873248e-05	2.81838778569673	1	289	283
TCGA-43-5668-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	708	13	1	5	6	689	28249	30	34	13	77	6703	42	21	6	69	7051	38	124	86	248	7260	40	178	77	295	7235	7	19	11	37	977	0.0522598870056497	0.125423728813559	0.13503800967519	0.928803150425897	0.037871033776868	5	19	14	38	989	0.0536723163841808	0.153225806451613	0.136225895316804	1.12479206758211	0.038422649140546	0.0522598870056497	37	204	1966	12529	0.235686038631082	1.15582166809792	0.83880489731787	Inf	1.13192952389797	1.13428280773143	0.367450281515092	1.15866472394605	1.13080341261569	0.287200011532685	1.15446433490149	0.0222660649853544	671	652
TCGA-43-6143-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	366	9	1	13	14	343	14063	14	19	3	36	3435	17	31	6	54	3411	28	61	54	143	3659	24	45	41	110	3558	6	6	9	21	511	0.0573770491803279	0.190909090909091	0.143620011242271	1.32926525529265	0.0410958904109589	10	4	9	23	500	0.0628415300546448	0.160839160839161	0.136649357748019	1.17702097902098	0.046	0.092896174863388	34	113	1011	6206	0.00222718961817231	1.84674799998042	1.29687322969523	Inf	1.6510762564175	2.19645438636537	0.00156783263604888	2.7277345820657	1.3525534905513	0.112490281548718	1.43488467531339	0.826908622506718	332	309
TCGA-43-6647-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	194	5	0	0	0	189	7749	7	14	3	24	1906	9	15	4	28	1956	12	31	35	78	1906	19	20	20	59	1981	6	6	2	14	279	0.0721649484536082	0.23728813559322	0.140837960625947	1.68483081222283	0.0501792114695341	5	6	5	16	277	0.0824742268041237	0.205128205128205	0.145330535152151	1.41145977969083	0.0577617328519856	0.0927835051546392	18	68	556	3331	0.062745287482393	1.58563323122943	0.967297706658115	Inf	1.46323406391166	2.48067997215131	0.00285046880017032	3.2936209356326	0.889764551994768	0.688459411986822	0.873734164110199	0.398508976829821	176	171
TCGA-43-6770-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	252	6	0	3	3	243	9963	10	19	4	33	2307	9	19	5	33	2454	23	37	31	91	2563	25	30	31	86	2639	8	4	6	18	346	0.0714285714285714	0.209302325581395	0.131110269041304	1.59638392257024	0.0520231213872832	5	2	6	13	301	0.0515873015873016	0.142857142857143	0.117440499414748	1.21642145230185	0.0431893687707641	0.0992063492063492	25	85	647	4555	0.00218250500486758	2.07029653303732	1.36361903046466	Inf	1.82731487986511	2.17755023183926	0.00502218047601882	2.61429551067571	1.55616492994964	0.0800458825319555	1.68943614264025	1	227	218
TCGA-43-6771-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	216	8	0	0	0	208	8528	15	13	2	30	2056	7	5	2	14	1999	12	54	17	83	2205	7	38	36	81	2268	1	5	2	8	297	0.037037037037037	0.0987654320987654	0.130952380952381	0.754208754208754	0.0269360269360269	4	5	4	13	293	0.0601851851851852	0.156626506024096	0.132879818594104	1.17870800608578	0.0443686006825939	0.0509259259259259	11	61	590	3883	0.352020830488545	1.1867398536409	0.632496920599638	Inf	1.15826271186441	1.99509366636931	0.0959029412070184	2.34988086203655	0.858266709306044	0.716110235991691	0.840213503267142	1	205	197
TCGA-46-3765-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	375	5	1	1	2	368	15088	10	11	4	25	3701	11	13	4	28	3835	20	110	45	175	3872	18	76	46	140	3680	4	7	13	24	547	0.064	0.171428571428571	0.148641304347826	1.15330373465657	0.0438756855575868	9	13	15	37	566	0.0986666666666667	0.211428571428571	0.146177685950413	1.44638061585058	0.0653710247349823	0.109333333333333	41	88	1113	6439	1.05286319369895e-06	2.6947511515049	1.92105178083458	Inf	2.15655710872911	2.32127488532652	0.0022877370906255	3.0077267528845	2.08777386135877	8.99022850522454e-05	2.57077196770663	0.00691925076705544	334	327
TCGA-46-3767-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	237	4	0	2	2	231	9471	15	9	3	27	2488	8	9	4	21	2243	16	66	13	95	2425	14	51	23	88	2315	3	7	3	13	312	0.0548523206751055	0.147727272727273	0.134773218142549	1.09611742424242	0.0416666666666667	6	6	3	15	391	0.0632911392405063	0.157894736842105	0.161237113402062	0.979270426706152	0.0383631713554987	0.0632911392405063	15	51	703	4037	0.0589380144841905	1.68875682289726	0.973740081168313	Inf	1.5323936376568	2.02275960170697	0.0265792273202671	2.4603399541058	1.12375533428165	0.448988320772106	1.14844185113553	0.547152630062323	222	216
TCGA-46-3768-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	401	8	2	13	15	378	15498	18	26	5	49	3833	26	15	3	44	3950	26	91	36	153	3913	22	75	35	132	3802	9	11	7	27	596	0.0673316708229426	0.204545454545455	0.156759600210416	1.30483526540574	0.0453020134228188	7	12	6	25	564	0.0623441396508728	0.163398692810458	0.144134934832609	1.13365085987114	0.0443262411347518	0.0723192019950125	29	90	1160	6555	0.00545185803782546	1.82066279196993	1.23655541698387	Inf	1.62079831932773	2.21695402298851	0.00128861924715298	2.8249243555804	1.21776347741622	0.265894371966959	1.26653004618671	0.662311513260241	372	349
TCGA-46-3769-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	1000	20	3	5	8	972	39852	42	33	12	87	9759	45	31	7	83	9799	112	167	121	400	10161	95	185	122	402	10133	47	37	45	129	1491	0.129	0.32089552238806	0.147142998124938	2.1808412665045	0.0865191146881288	58	20	41	119	1458	0.119	0.2975	0.143489813994686	2.07331790123457	0.0816186556927298	0.191	191	259	2949	17345	3.81907304984756e-45	4.33725016198025	3.67554234745186	Inf	2.92088014769602	3.49069446287368	4.93297786672647e-34	6.05381550018507	2.43548276810023	8.71504803168011e-16	3.22154219836635	0.0966111677820429	809	781
TCGA-46-6025-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	217	3	0	3	3	211	8651	7	21	4	32	2075	8	8	8	24	2042	18	11	34	63	2241	33	23	36	92	2293	14	5	6	25	301	0.115207373271889	0.271739130434783	0.131269079808112	2.07009244547162	0.0830564784053156	6	1	10	17	291	0.0783410138248848	0.26984126984127	0.129852744310576	2.0780559646539	0.0584192439862543	0.165898617511521	36	85	592	3942	1.7793536189859e-06	2.81931946390609	1.96451931702461	Inf	2.27864641501005	3.00344462109168	3.22949548455424e-06	4.29417869275691	1.75057915057915	0.0178810480480604	1.972670730141	0.50862847882284	181	175
TCGA-46-6026-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	238	2	2	4	6	230	9430	5	12	1	18	2208	7	11	2	20	2301	13	33	50	96	2439	14	35	47	96	2482	5	4	14	23	327	0.0966386554621849	0.239583333333333	0.131748589846898	1.81848878695209	0.0703363914373089	9	3	12	24	327	0.100840336134454	0.25	0.134071340713407	1.86467889908257	0.073394495412844	0.168067226890756	40	84	654	4267	7.26861489777223e-08	3.1059034076287	2.19481022372141	Inf	2.42724671993687	3.90157435723185	2.1492358460468e-06	7.02081444403212	2.01686686213311	0.000354524410582855	2.38857414495088	0.0212085990021263	198	190
TCGA-51-4079-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	421	9	2	4	6	406	16646	28	18	6	52	4051	32	17	10	59	4063	24	53	57	134	4285	19	77	65	161	4247	9	11	20	40	599	0.0950118764845606	0.248447204968944	0.141040734636214	1.76152801252605	0.0667779632721202	8	6	16	30	614	0.0712589073634204	0.223880597014925	0.143290548424737	1.56242403617094	0.0488599348534202	0.125890736342043	53	112	1213	7319	6.50804305067371e-09	2.8548059667397	2.12199618668103	Inf	2.25934197706663	2.78080484671869	4.29739822051947e-05	3.94442596855279	2.07554768694336	1.24668366581405e-05	2.52539254222701	0.00158969451516888	368	353
TCGA-51-4080-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	317	6	2	7	9	302	12382	16	12	6	34	2998	17	17	2	36	3041	24	50	48	122	3165	13	63	34	110	3178	1	6	6	13	455	0.0410094637223975	0.118181818181818	0.143171806167401	0.825454545454545	0.0285714285714286	3	7	4	14	415	0.0441640378548896	0.114754098360656	0.131121642969984	0.87517282243729	0.0337349397590361	0.0441640378548896	14	105	870	5473	0.768602919826596	0.838795601948353	0.490045034432191	Inf	0.857741717376606	0.788195091643368	0.765933655948201	0.762551529703194	0.889122511914774	0.702731482224004	0.873762915555668	0.118849833020996	303	288
TCGA-51-4081-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	228	5	1	3	4	219	8979	7	16	2	25	2097	12	13	6	31	2170	11	34	37	82	2284	17	36	28	81	2428	6	3	1	10	306	0.043859649122807	0.123456790123457	0.126029654036244	0.979585249737755	0.0326797385620915	4	6	6	16	308	0.0701754385964912	0.195121951219512	0.134851138353765	1.44694330060184	0.051948051948052	0.0745614035087719	17	76	614	4098	0.0955847296547581	1.49278004822783	0.904041930707594	Inf	1.4028230184582	2.74080967892043	0.00205313608002369	3.70599086570396	0.826459533951391	0.758661040265026	0.805548943048837	0.555135522297396	211	202
TCGA-56-1622-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	244	7	1	2	3	234	9594	9	18	6	33	2329	6	16	4	26	2353	15	38	26	79	2299	14	43	39	96	2613	2	3	5	10	374	0.040983606557377	0.104166666666667	0.143130501339457	0.727774064171123	0.0267379679144385	3	5	3	11	336	0.0450819672131148	0.139240506329114	0.146150500217486	0.952720012055455	0.0327380952380952	0.0532786885245902	13	81	710	4202	0.613123541100205	0.949853196148095	0.538591931730005	Inf	0.956787533712916	1.19281204468188	0.412255276499295	1.23291366614414	0.85148429035753	0.739928642280159	0.83066926815388	0.505475577859527	231	221
TCGA-56-5897-01A-11D-1632-08	0	0	0	0	127	1	0	0	0	126	5166	3	9	1	13	1214	4	9	3	16	1354	14	20	21	55	1300	13	12	17	42	1298	9	1	6	16	204	0.125984251968504	0.380952380952381	0.157164869029276	2.42390289449113	0.0784313725490196	11	2	7	20	183	0.15748031496063	0.363636363636364	0.140769230769231	2.58320914058619	0.109289617486339	0.259842519685039	33	32	387	2211	2.91152943062935e-11	5.88563454602147	3.75372486741581	Inf	3.408228980322	4.97272466264714	1.31657313367962e-11	16.2943909505532	2.29661362709098	0.00267995555916927	2.96915530962882	0.155401359597851	94	93
TCGA-56-5898-01A-11D-1632-08	0	0	0	0	169	3	0	2	2	164	6724	4	16	3	23	1725	4	13	3	20	1640	14	28	14	56	1673	9	26	30	65	1686	2	5	4	11	215	0.0650887573964497	0.169230769230769	0.127520759193357	1.32708407871199	0.0511627906976744	6	1	3	10	232	0.0591715976331361	0.178571428571429	0.138673042438733	1.28771551724138	0.0431034482758621	0.0887573964497041	15	52	447	2912	0.03001033130076	1.87868738751878	1.0815245365292	Inf	1.68236001202043	2.6137535259216	0.00778536999733087	3.47259547097197	1.19549522066301	0.370720053078961	1.23239232297428	1	154	149
TCGA-56-6545-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	322	10	0	0	0	312	12792	12	14	5	31	3010	13	15	3	31	3175	35	46	43	124	3320	26	62	38	126	3287	12	8	12	32	465	0.0993788819875776	0.253968253968254	0.141466382719805	1.7952551629971	0.0688172043010753	14	8	15	37	447	0.114906832298137	0.298387096774194	0.134638554216867	2.21620841451974	0.0827740492170022	0.164596273291925	53	89	912	5695	5.02542926975532e-12	3.71770493364442	2.72779129304089	Inf	2.70393964665184	3.08782714984182	4.53243292453347e-08	4.63733326642306	2.41483918128655	7.74352957969663e-06	3.12150546619396	1	269	259
TCGA-56-6546-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	366	9	0	0	0	357	14637	23	20	8	51	3511	23	19	2	44	3429	17	67	52	136	3879	27	61	38	126	3818	5	8	4	17	489	0.046448087431694	0.134920634920635	0.12807752750131	1.05342941539261	0.0347648261758691	2	11	3	16	512	0.0437158469945355	0.117647058823529	0.131992781644754	0.891314338235294	0.03125	0.0382513661202186	14	120	1001	6696	0.842581144633513	0.780442507135408	0.457906893221294	Inf	0.803360818286191	1.22329942784488	0.346750757627573	1.26550256659731	0.598057498057498	0.956375274582435	0.564193357298472	1	352	343
TCGA-60-2698-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	1369	13	0	7	7	1349	55309	29	38	10	77	13687	28	26	12	66	13781	236	126	249	611	14163	233	116	246	595	13678	162	25	118	305	2144	0.222790357925493	0.512605042016807	0.156748062582249	3.27024802458297	0.142257462686567	174	28	122	324	2168	0.236669101533966	0.530278232405892	0.153074913507025	3.46417463356303	0.149446494464945	0.420745069393718	576	388	4312	23529	9.67509716227145e-205	8.0995644482987	7.22955821558213	Inf	3.85790498772123	4.62564727383491	1.71212172544964e-158	13.7828055783718	3.13048855905999	1.19844624466402e-64	5.13532406305328	7.19128522653182e-08	793	773
TCGA-60-2707-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	140	4	0	1	1	135	5535	3	7	0	10	1405	4	13	0	17	1399	18	19	20	57	1382	12	16	23	51	1349	10	4	11	25	204	0.178571428571429	0.490196078431373	0.151223128243143	3.24154171472511	0.122549019607843	12	3	4	19	206	0.135714285714286	0.333333333333333	0.149059334298119	2.23624595469256	0.0922330097087379	0.264285714285714	37	36	410	2321	2.67067183566282e-12	5.81260507042349	3.80614719609779	Inf	3.37611092549282	4.88471544715447	2.03176382303062e-12	15.5419134738526	2.32359614293817	0.00113317502495416	3.03098418021974	0.194796051606385	103	98
TCGA-60-2708-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	232	2	0	5	5	225	9225	17	14	5	36	2280	9	13	3	25	2148	21	22	36	79	2433	19	30	36	85	2364	10	0	7	17	318	0.0732758620689655	0.2	0.134517766497462	1.48679245283019	0.0534591194968553	7	4	5	16	324	0.0689655172413793	0.20253164556962	0.133168927250308	1.52086263478669	0.0493827160493827	0.125	29	83	642	4155	0.000363125042077952	2.2607987026054	1.52501718030326	Inf	1.93470460614152	3.17558411214953	6.53173732744415e-06	4.78134028300404	1.24532710280374	0.254199004167292	1.29431593682091	0.321257069400288	203	196
TCGA-60-2709-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	218	5	0	0	0	213	8733	9	13	2	24	2201	9	20	2	31	2204	14	38	29	81	2162	18	28	31	77	2166	2	8	6	16	309	0.073394495412844	0.207792207792208	0.142659279778393	1.45656285462111	0.0517799352750809	6	7	6	19	365	0.0871559633027523	0.234567901234568	0.168825161887142	1.38941315744969	0.0520547945205479	0.0917431192660551	20	72	674	3654	0.0757317944452119	1.50577251789936	0.943090789067154	Inf	1.39594890981809	1.6053412462908	0.114818595317648	1.80682320885762	1.28427299703264	0.21884041963354	1.35523577382379	0.427864573711048	198	193
TCGA-60-2710-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	227	3	1	2	3	221	9061	11	15	9	35	2185	11	13	2	26	2232	11	33	43	87	2298	8	33	32	73	2346	1	8	5	14	321	0.0616740088105727	0.191780821917808	0.136828644501279	1.40161310971707	0.043613707165109	1	8	5	14	295	0.0616740088105727	0.160919540229885	0.128372497824195	1.25353594389246	0.0474576271186441	0.052863436123348	12	82	616	4028	0.602848121193793	0.956924751542332	0.529964687950242	Inf	0.962420558165239	0.793574846206425	0.738668697383261	0.769329122436255	1.00519480519481	0.545147045611805	1.00599291883631	0.0200300915227592	215	209
TCGA-60-2711-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	148	2	1	0	1	145	5945	10	10	1	21	1379	5	8	1	14	1453	14	14	23	51	1521	13	25	21	59	1592	3	3	1	7	229	0.0472972972972973	0.11864406779661	0.143844221105528	0.824809414551107	0.0305676855895196	5	1	4	10	193	0.0675675675675676	0.196078431372549	0.126890203813281	1.54526059128315	0.0518134715025907	0.0878378378378378	13	58	422	2691	0.16295453173619	1.42909304211263	0.796591322666104	Inf	1.35067752486483	2.18571177812884	0.0238896628217834	2.68386497458935	0.838270142180095	0.729470169183062	0.817584328953735	0.481265818703551	135	132
TCGA-60-2712-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	100	1	2	3	5	94	3854	2	5	2	9	960	1	3	3	7	889	9	10	19	38	1019	7	11	22	40	986	0	0	5	5	137	0.05	0.125	0.13894523326572	0.89963503649635	0.0364963503649635	5	1	5	11	156	0.11	0.289473684210526	0.153091265947007	1.89085695006748	0.0705128205128205	0.15	15	42	293	1712	0.0166187938883474	2.08587412897096	1.18009485625365	Inf	1.80079037183402	2.1384385665529	0.0736259160788388	2.65404707299239	1.66902522267543	0.0702152363762465	1.88404421036734	0.155613477924309	85	79
TCGA-60-2713-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	284	6	0	4	4	274	11234	10	19	6	35	2821	12	18	9	39	2811	29	30	40	99	2778	28	32	41	101	2824	9	2	7	18	426	0.0633802816901408	0.178217821782178	0.150849858356941	1.181425184772	0.0422535211267606	8	5	6	19	416	0.0669014084507042	0.191919191919192	0.149748020158387	1.28161421911422	0.0456730769230769	0.105633802816901	30	108	842	4760	0.0239161123253433	1.57018862074294	1.07862859027481	Inf	1.44634927191986	1.98428970287953	0.00358486093050704	2.40207860638226	1.06779859828158	0.446925162054759	1.08076553647463	0.477849621897703	254	244
TCGA-60-2715-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	190	2	0	0	0	188	7708	11	11	5	27	1825	10	14	4	28	1919	9	20	29	58	1891	10	31	34	75	2073	2	10	5	17	277	0.0894736842105263	0.226666666666667	0.133622768933912	1.69631768953069	0.0613718411552347	2	2	2	6	237	0.0315789473684211	0.103448275862069	0.125330512956108	0.825403753819293	0.0253164556962025	0.0578947368421053	11	71	514	3450	0.502663787739509	1.03989390170993	0.557210891487084	Inf	1.03454493688906	1.62359205406512	0.22737451655375	1.7895592453855	0.856895806312149	0.724218439261107	0.83905146455538	0.49076968674246	179	177
TCGA-60-2719-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	223	3	1	3	4	216	8856	7	19	5	31	2172	12	19	1	32	2118	10	26	35	71	2362	14	34	34	82	2204	3	4	9	16	315	0.0717488789237668	0.195121951219512	0.142921960072595	1.36523422377081	0.0507936507936508	3	2	4	9	314	0.0403587443946188	0.126760563380282	0.132938187976291	0.953530097784157	0.0286624203821656	0.0852017937219731	19	74	629	3937	0.0512441909769453	1.60687777187108	0.996583125828949	Inf	1.48305041284168	1.8147853736089	0.10332688485581	2.08597534408415	1.36766433953135	0.150722888986912	1.45287776191638	0.0792068906018774	204	197
TCGA-60-2720-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	457	8	0	0	0	449	18409	17	17	5	39	4488	14	30	4	48	4646	61	54	51	166	4501	59	64	73	196	4774	36	1	27	64	701	0.140043763676149	0.326530612244898	0.146837033933808	2.22376197269207	0.0912981455064194	25	6	11	42	647	0.0919037199124726	0.253012048192771	0.143745834259054	1.76013482058062	0.0649149922720247	0.216630196936543	99	145	1348	7927	2.11850138459772e-22	4.01431554077252	3.19012066780292	Inf	2.79170416403172	3.49761993076162	1.96450580743529e-20	6.07805907382761	2.10855987364794	4.54905228033954e-06	2.59797163389072	0.00237705491878434	358	350
TCGA-60-2721-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	95	0	0	0	0	95	3895	2	5	1	8	1022	1	10	0	11	891	11	5	15	31	945	14	11	20	45	1037	7	2	6	15	135	0.157894736842105	0.333333333333333	0.130183220829315	2.56049382716049	0.111111111111111	3	2	4	9	146	0.0947368421052632	0.290322580645161	0.154497354497354	1.8791427308882	0.0616438356164384	0.210526315789474	20	40	281	1701	0.000192417186833382	3.02441423037709	1.81336937865604	Inf	2.35112692763938	2.82135231316726	0.00152772146978082	4.03163576252064	2.01525165226233	0.021797647589007	2.41986274044842	1	75	75
TCGA-60-2722-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	357	7	1	6	7	343	14063	13	13	4	30	3483	17	27	7	51	3523	22	48	49	119	3493	27	59	57	143	3564	10	14	10	34	545	0.0952380952380952	0.237762237762238	0.152918069584736	1.55483415666902	0.0623853211009174	9	4	13	26	499	0.0728291316526611	0.218487394957983	0.142857142857143	1.52941176470588	0.0521042084168337	0.117647058823529	42	113	1044	6013	6.61890712032123e-05	2.14045409544038	1.54753828465701	Inf	1.83162773451984	2.6210610681054	3.84550414522898e-05	3.64680017576421	1.46670100484349	0.0372772738186555	1.59589910473728	0.566129834184731	315	301
TCGA-60-2723-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	304	5	0	3	3	296	12136	19	22	3	44	2890	12	15	4	31	2990	20	56	37	113	3121	23	56	29	108	3135	6	8	2	16	425	0.0526315789473684	0.148148148148148	0.135566188197767	1.09281045751634	0.0376470588235294	2	5	5	12	422	0.0394736842105263	0.106194690265487	0.135213072733098	0.785387744830768	0.028436018957346	0.0493421052631579	15	94	847	5409	0.516143547554511	1.01905218597148	0.604227601756498	Inf	1.0164314417859	1.37415227478652	0.221261318284484	1.4595679790216	0.783370899073378	0.806453551399202	0.757699657402369	1	289	281
TCGA-60-2724-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	350	6	1	1	2	342	14022	20	22	4	46	3423	15	19	6	40	3494	27	69	34	130	3575	25	56	45	126	3530	5	7	3	15	484	0.0428571428571429	0.119047619047619	0.137110481586402	0.868260527351436	0.0309917355371901	9	5	3	17	520	0.0485714285714286	0.130769230769231	0.145454545454545	0.899038461538462	0.0326923076923077	0.0571428571428571	20	111	1004	6101	0.393374254021948	1.09491348174067	0.698857941075438	Inf	1.08041117970865	1.90526356114006	0.0117076708014187	2.23845514877953	0.537470371677846	0.974244104158506	0.499493529183847	0.0576766630978577	330	322
TCGA-60-2725-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	186	4	0	1	1	181	7421	4	9	4	17	1821	12	15	5	32	1813	16	24	22	62	1928	16	32	22	70	1859	8	6	0	14	262	0.0752688172043011	0.2	0.140935987089833	1.41908396946565	0.0534351145038168	6	4	2	12	260	0.0645161290322581	0.193548387096774	0.134854771784232	1.43523573200993	0.0461538461538462	0.0860215053763441	16	60	522	3265	0.0555942798047088	1.66767642313531	0.983729529280404	Inf	1.52732405726961	3.17397030651341	4.01796571564348e-05	4.86181577531673	0.329763148728666	0.988011278009246	0.297907550767459	0.000645543108221572	170	165
TCGA-60-2726-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	327	7	0	1	1	319	13079	26	24	5	55	3254	13	14	9	36	3146	14	44	54	112	3278	19	49	48	116	3401	9	4	10	23	491	0.0703363914373089	0.198275862068966	0.144369303146133	1.37339349673432	0.0468431771894094	7	5	14	26	451	0.0795107033639144	0.232142857142857	0.13758389261745	1.68728222996516	0.057649667405765	0.122324159021407	40	95	942	5737	3.3952507027324e-06	2.563778552417	1.82713852355365	Inf	2.10080993945113	3.43768899182912	2.8027973793512e-06	5.72961408217806	1.66829024603472	0.00779808157725422	1.87363882039664	0.149841432488483	287	279
TCGA-63-5128-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	340	6	1	11	12	322	13202	14	24	7	45	3202	21	18	5	44	3307	19	65	41	125	3277	17	55	36	108	3416	4	5	5	14	502	0.0411764705882353	0.12962962962963	0.146955503512881	0.882101224730707	0.0278884462151394	3	6	7	16	431	0.0470588235294118	0.128	0.131522734208117	0.973215777262181	0.037122969837587	0.0558823529411765	19	94	933	5760	0.22618355407706	1.24780713609551	0.783026534343941	Inf	1.20618615371482	1.39487316898892	0.230172604218955	1.49008099739478	1.11796884787238	0.38783877150811	1.13969519350629	0.266835660720813	321	303
TCGA-63-5131-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	314	3	1	3	4	307	12587	14	23	8	45	3039	14	12	5	31	3181	25	45	46	116	3121	30	44	41	115	3246	14	4	13	31	508	0.0987261146496815	0.269565217391304	0.156500308071473	1.72245806230743	0.0610236220472441	5	3	9	17	440	0.054140127388535	0.146551724137931	0.140980454982377	1.03951802507837	0.0386363636363636	0.130573248407643	41	101	948	5419	1.94879045982377e-05	2.32006783489549	1.66330067314336	Inf	1.93919742081179	2.32015726889145	0.000254199447128945	3.01618381028264	1.69836073524419	0.00817626251043859	1.93458728318545	0.680114602059056	273	266
TCGA-63-6202-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	386	8	0	3	3	375	15375	18	18	0	36	3685	20	13	8	41	3662	24	79	44	147	4011	20	81	50	151	4017	5	9	3	17	494	0.0440414507772021	0.112582781456954	0.122977346278317	0.915475775531544	0.034412955465587	4	7	11	22	558	0.0569948186528497	0.149659863945578	0.139117427075542	1.0757808499744	0.039426523297491	0.0595854922279793	23	115	1052	6976	0.136535604581258	1.32618300131844	0.872155361384264	Inf	1.27186311787072	1.5609229173868	0.115366856748856	1.70501907243907	1.1365585308632	0.348586352932173	1.16041414104429	0.320691739653879	363	352
TCGA-66-2727-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	266	1	0	3	3	262	10742	12	15	2	29	2794	12	15	4	31	2766	15	60	36	111	2542	19	46	26	91	2640	5	7	6	18	426	0.0676691729323308	0.197802197802198	0.161363636363636	1.22581643708404	0.0422535211267606	7	8	6	21	381	0.0789473684210526	0.189189189189189	0.149881982690795	1.26225438036462	0.0551181102362205	0.0902255639097744	24	72	807	4375	0.0119680152394445	1.80685893259438	1.17348699448102	Inf	1.60532837670384	2.26634594358189	0.00399093217554896	2.95623404573077	1.24283487228684	0.25378207830212	1.30104290793227	1	242	238
TCGA-66-2734-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	326	8	0	0	0	318	13038	8	8	6	22	3149	9	15	4	28	3210	15	121	23	159	3377	11	79	19	109	3302	1	9	1	11	481	0.0337423312883436	0.100917431192661	0.145669291338583	0.692784527646913	0.0228690228690229	1	13	3	17	497	0.0521472392638037	0.106918238993711	0.147172046194848	0.726484694329499	0.03420523138833	0.0184049079754601	6	62	978	5701	0.944859713388061	0.564161154791655	0.236783013518308	Inf	0.60258029592205	0.525326411829479	0.91083749171022	0.485812335734916	0.650404128931736	0.881232397805392	0.613643413673785	0.669458177782262	320	312
TCGA-66-2742-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	250	7	1	4	5	238	9758	15	27	3	45	2344	13	14	4	31	2273	11	32	29	72	2561	18	40	32	90	2580	3	5	4	12	337	0.048	0.133333333333333	0.13062015503876	1.02077151335312	0.0356083086053412	4	2	5	11	323	0.044	0.152777777777778	0.126122608356111	1.21134330925353	0.0340557275541796	0.064	16	74	660	4481	0.112722970181125	1.4678488436119	0.875627004695319	Inf	1.38478114478114	1.88019853709509	0.0707412869625955	2.1598463368966	1.14925484351714	0.383792158185152	1.17503447599184	0.757529692245078	234	222
TCGA-66-2744-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	288	5	2	5	7	276	11316	11	13	6	30	2812	8	10	2	20	2900	15	66	34	115	2808	20	75	16	111	2796	7	8	2	17	404	0.0590277777777778	0.153153153153153	0.144492131616595	1.05994112924806	0.0420792079207921	6	3	5	14	391	0.0486111111111111	0.121739130434783	0.139245014245014	0.874279995552096	0.0358056265984655	0.0694444444444444	20	65	795	4809	0.0151220004591536	1.86094875262244	1.16089307374148	Inf	1.65860155382908	2.61822102425876	0.000677131702573983	3.57330402024312	0.986867924528302	0.57703277952123	0.984732094692123	0.173664823538192	268	256
TCGA-66-2754-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	347	4	0	6	6	337	13817	13	14	9	36	3387	17	19	6	42	3338	29	42	42	113	3601	29	52	65	146	3491	5	2	11	18	499	0.0518731988472622	0.123287671232877	0.142938985963907	0.86251955966728	0.0360721442885772	12	2	8	22	500	0.0634005763688761	0.194690265486726	0.138850319355735	1.4021592920354	0.044	0.103746397694524	36	129	999	6093	0.00515040388654326	1.70192154095302	1.21095163075371	Inf	1.54889434889435	2.08077042559801	0.00217621386644588	2.52842652059472	1.26058769049423	0.171909585211676	1.31679396165922	0.822384163766055	311	301
TCGA-66-2755-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	228	10	1	0	1	217	8897	7	18	4	29	2254	17	14	7	38	2217	11	44	21	76	2192	18	28	28	74	2234	2	3	3	8	341	0.0350877192982456	0.108108108108108	0.152641002685765	0.708250772766902	0.0234604105571848	4	6	3	13	333	0.0570175438596491	0.171052631578947	0.151916058394161	1.12596807333649	0.039039039039039	0.0526315789473684	12	66	674	3752	0.533899311145562	1.0121371147685	0.556149356934466	Inf	1.01027162748231	1.35864115420035	0.275323351326401	1.45205861744532	0.804093744322655	0.776376654809914	0.776798812790787	1	216	205
TCGA-66-2756-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	542	10	1	5	6	526	21566	32	23	9	64	5127	24	28	11	63	5128	36	105	61	202	5730	27	115	55	197	5581	6	7	4	17	695	0.0313653136531365	0.0862944162436548	0.124529654183838	0.692962787130701	0.0244604316546763	7	14	12	33	723	0.0608856088560886	0.163366336633663	0.126178010471204	1.29472905796804	0.045643153526971	0.0535055350553506	29	150	1418	9893	0.0911561392269573	1.34879210917896	0.933665959405831	Inf	1.29231902671951	1.64599144782502	0.0474761193845383	1.81382952698849	1.10023831525704	0.383043658794651	1.11623298889349	0.65982489317682	513	497
TCGA-66-2757-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	284	4	1	6	7	273	11193	8	18	1	27	2650	9	13	5	27	2720	27	47	37	111	2877	17	59	32	108	2946	3	7	4	14	399	0.0492957746478873	0.12962962962963	0.135437881873727	0.957115009746589	0.0350877192982456	6	5	5	16	380	0.0563380281690141	0.144144144144144	0.132082029892249	1.09132290184922	0.0421052631578947	0.0633802816901408	18	95	779	5044	0.252241374837181	1.22678047238741	0.76026351043789	Inf	1.19070285253388	1.52897070836737	0.127241879531885	1.66481268260579	0.974995814031367	0.586317532004848	0.971247774393592	1	266	255
TCGA-66-2758-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	381	5	2	3	5	371	15211	17	18	11	46	3688	15	21	3	39	3797	52	42	51	145	3863	49	44	48	141	3863	27	5	10	42	564	0.110236220472441	0.297872340425532	0.146000517732332	2.04021427493587	0.074468085106383	20	9	11	40	538	0.10498687664042	0.275862068965517	0.139269997411338	1.98077169593642	0.0743494423791822	0.178477690288714	68	132	1102	6624	4.37468061941964e-12	3.09590372771186	2.37457248851648	Inf	2.38370235934664	3.2624930369625	1.49327512942187e-14	5.23005458849199	1.48715833470824	0.0397718060640043	1.61819231324787	6.41212716169862e-05	313	303
TCGA-66-2759-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	490	4	2	4	6	480	19680	13	30	9	52	4740	16	23	9	48	4956	38	63	71	172	4934	44	76	88	208	5050	25	11	18	54	754	0.110204081632653	0.259615384615385	0.149306930693069	1.73880330544787	0.0716180371352785	21	13	13	47	679	0.0959183673469388	0.273255813953488	0.137616538305634	1.98563208548824	0.069219440353461	0.157142857142857	77	164	1433	8551	7.35837678307355e-12	2.80128881333194	2.19449449442492	Inf	2.22603538987645	3.90843020781918	2.70626661300478e-18	7.62167789087752	1.35838523219529	0.047026543464302	1.44511869703983	0.0422151968819432	413	403
TCGA-66-2763-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	443	8	1	6	7	428	17548	23	25	8	56	4256	29	23	6	58	4408	28	79	56	163	4435	32	77	42	151	4449	14	9	7	30	639	0.0677200902934537	0.198675496688742	0.143627781523938	1.38326648633523	0.0469483568075117	10	7	6	23	577	0.0519187358916479	0.141104294478528	0.130101465614431	1.08457113693634	0.0398613518197574	0.0835214446952596	37	121	1216	7668	0.000751648286022678	1.92818038799561	1.37535805690724	Inf	1.71088024650233	2.92236842105263	4.9253715985197e-07	4.20326050865307	0.969152792696026	0.59304288280387	0.96443534795405	0.0408808358183998	406	391
TCGA-66-2765-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	112	1	0	1	1	110	4510	4	6	1	11	1050	5	5	1	11	1154	8	16	21	45	1130	13	12	18	43	1176	2	1	4	7	172	0.0625	0.162790697674419	0.146258503401361	1.11303407247161	0.0406976744186047	2	1	0	3	154	0.0267857142857143	0.0666666666666667	0.136283185840708	0.489177489177489	0.0194805194805195	0.0714285714285714	8	52	326	1980	0.62762305752515	0.934414700408799	0.440223980660399	Inf	0.943149284253579	1.34735612036226	0.346846748096671	1.42883544084895	0.72549944942583	0.82038002660906	0.694223961042806	1	104	102
TCGA-66-2766-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	429	6	4	3	7	416	17056	12	21	6	39	4099	20	26	7	53	4211	39	62	62	163	4307	28	56	77	161	4439	10	8	31	49	634	0.114219114219114	0.304347826086957	0.142824960576706	2.13091482649842	0.0772870662460568	22	5	19	46	588	0.107226107226107	0.282208588957055	0.136521941026236	2.06712991945244	0.0782312925170068	0.191142191142191	82	124	1222	7524	2.49625798873937e-19	4.07103928963483	3.16564856314287	Inf	2.84895047113597	3.41832572000879	4.77339373027698e-11	5.62763124364534	2.57450340872964	1.16833724474317e-10	3.45838803653997	0.0125532399105061	347	334
TCGA-66-2767-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	387	0	2	2	4	383	15703	18	19	7	44	3758	10	18	6	34	3834	27	57	68	152	4008	29	64	60	153	4103	8	8	11	27	518	0.0697674418604651	0.176470588235294	0.126249086034609	1.39779695662049	0.0521235521235521	8	6	8	22	535	0.0568475452196382	0.144736842105263	0.133483033932136	1.08430890309887	0.0411214953271028	0.0904392764857881	35	149	1053	7058	0.0139690415141976	1.57436298465442	1.12118931193279	Inf	1.46519777860358	2.20078686745353	0.00165025335605745	2.68065118774315	1.14337755223172	0.304134280999933	1.1683286939242	0.673609287557202	352	348
TCGA-66-2768-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	293	2	2	3	5	286	11726	8	14	5	27	2772	8	18	3	29	2936	34	31	53	118	2922	34	29	49	112	3096	22	3	14	39	458	0.133105802047782	0.348214285714286	0.147932816537468	2.35386774797255	0.0851528384279476	18	5	15	38	419	0.129692832764505	0.322033898305085	0.143394934976044	2.24578293758343	0.0906921241050119	0.235494880546075	69	101	877	5141	5.12003802206189e-16	4.00359537420804	3.03135741158269	Inf	2.78517673888255	4.03648802736602	8.79245270907193e-17	8.36931339980823	1.95096921322691	0.000264581640485789	2.32833245605075	0.104831096973288	224	217
TCGA-66-2770-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	270	4	2	0	2	264	10824	14	15	3	32	2578	15	11	5	31	2564	5	47	45	97	2834	17	41	46	104	2848	2	7	10	19	366	0.0703703703703704	0.182692307692308	0.128511235955056	1.42160571668768	0.0519125683060109	1	6	3	10	358	0.037037037037037	0.103092783505155	0.126323218066337	0.816103207970973	0.0279329608938547	0.0592592592592593	16	97	724	4958	0.368708412431448	1.12952320748682	0.680991039566451	Inf	1.11123062631399	1.07019085886489	0.544926658607239	1.08128436375226	1.12115232833465	0.37661101048518	1.14129182863265	0.00704802465559796	254	248
TCGA-66-2771-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	298	3	0	3	3	292	11972	12	16	4	32	2989	11	17	8	36	3064	28	34	41	103	2994	32	41	48	121	2925	17	5	20	42	445	0.140939597315436	0.347107438016529	0.152136752136752	2.28154889033336	0.0943820224719101	15	6	17	38	434	0.12751677852349	0.368932038834951	0.144956579826319	2.54512102366784	0.0875576036866359	0.231543624161074	69	80	879	5040	3.02523476133169e-19	4.94355146514928	3.69299847338541	Inf	3.11833153904299	3.59135381114903	6.08398750164126e-12	6.54960723335702	2.79944011964566	1.51764217204505e-09	4.07855216466215	0.523283977259357	229	223
TCGA-66-2773-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	672	10	0	1	1	661	27101	5	14	3	22	6819	10	9	1	20	6645	94	59	148	301	6822	91	58	169	318	6815	66	11	72	149	1045	0.22172619047619	0.468553459119497	0.153338224504769	3.05568595588457	0.142583732057416	71	12	77	160	1062	0.238095238095238	0.53156146179402	0.155672823218997	3.41460667830396	0.150659133709981	0.425595238095238	286	216	2107	11530	8.12396625089221e-96	7.24406671727235	6.19005644193735	Inf	3.68736917541037	4.79295270590952	4.39202396589544e-69	15.6135176052106	3.04215481218531	1.06534961497713e-38	4.85268860226661	0.374861379852703	386	375
TCGA-66-2777-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	222	1	0	0	0	221	9061	14	10	2	26	2163	10	12	6	28	2237	10	31	47	88	2400	13	28	38	79	2261	3	3	7	13	318	0.0585585585585586	0.164556962025316	0.140645731977001	1.17001034949447	0.0408805031446541	4	2	7	13	326	0.0585585585585586	0.147727272727273	0.135833333333333	1.08756274400446	0.0398773006134969	0.0945945945945946	21	87	644	4017	0.0676654632907015	1.50546957412788	0.960074316509989	Inf	1.40730676328502	2.20274102079395	0.0317709403246838	2.72813037294591	1.1920716112532	0.284682961764508	1.22987528256156	0.0888790871291686	201	200
TCGA-66-2778-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	171	0	0	0	0	171	7011	1	8	1	10	1670	5	7	1	13	1754	24	11	43	78	1776	24	20	26	70	1811	11	3	13	27	242	0.157894736842105	0.385714285714286	0.133627829928216	2.88648170011806	0.111570247933884	15	2	9	26	242	0.152046783625731	0.333333333333333	0.136261261261261	2.44628099173554	0.107438016528926	0.280701754385965	48	69	484	3103	6.46144807216887e-13	4.45741906203419	3.17193964009413	Inf	3.04047467683831	4.01437672176309	4.97528055345439e-11	7.56960996206533	2.36297760210804	8.41488368561154e-05	2.99969706066	0.558523904562372	123	123
TCGA-66-2780-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	144	3	1	1	2	139	5699	6	5	2	13	1407	8	12	4	24	1390	10	15	23	48	1436	23	14	17	54	1466	8	1	1	10	183	0.0694444444444444	0.185185185185185	0.124829467939973	1.48350536328678	0.0546448087431694	4	2	5	11	208	0.0763888888888889	0.229166666666667	0.144846796657382	1.58213141025641	0.0528846153846154	0.125	18	55	391	2511	0.00810157501751028	2.10108989798216	1.26412998582853	Inf	1.83008093052587	2.69890723087654	0.000884122184073339	3.66743106901405	1.11329923273657	0.458680908487038	1.13321267321072	0.117971798543708	126	121
TCGA-66-2781-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	165	2	1	1	2	161	6601	1	14	2	17	1648	8	5	4	17	1665	9	27	31	67	1623	14	24	22	60	1665	5	2	6	13	250	0.0787878787878788	0.216666666666667	0.15015015015015	1.443	0.052	2	2	5	9	227	0.0545454545454545	0.134328358208955	0.139864448552064	0.960418173449931	0.039647577092511	0.109090909090909	18	58	477	2811	0.024128701717056	1.8284704799833	1.10516739649481	Inf	1.63257199602781	2.09789444900191	0.0404203586023296	2.57718569794094	1.43063961077489	0.140512899296925	1.5431901252758	0.357976754661922	147	143
TCGA-66-2782-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	388	18	0	0	0	370	15170	21	19	1	41	3745	17	20	3	40	3799	36	61	49	146	3780	35	60	48	143	3846	14	11	8	33	538	0.0850515463917526	0.230769230769231	0.139885595423817	1.64969974263655	0.0613382899628253	22	7	13	42	527	0.108247422680412	0.287671232876712	0.139417989417989	2.06337241038704	0.079696394686907	0.146907216494845	57	111	1065	6561	9.84746206694227e-11	3.16287618304381	2.3663646885339	Inf	2.429476861167	3.63070819281889	3.28879358561283e-13	6.33409516306368	1.55022506171047	0.0266443996862796	1.70211607383249	0.0181523950059209	331	313
TCGA-66-2783-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	272	0	0	1	1	271	11111	17	18	4	39	2580	15	16	3	34	2718	22	42	34	98	2869	16	31	53	100	2944	5	3	8	16	371	0.0588235294117647	0.16	0.12601902173913	1.26964959568733	0.0431266846361186	7	5	5	17	361	0.0625	0.173469387755102	0.125827814569536	1.37862513426423	0.0470914127423823	0.0919117647058824	25	100	732	5081	0.0135921764199799	1.73511576291443	1.15135417968367	Inf	1.58825136612022	2.50776531492666	0.00188719479305581	3.20274915579223	1.18662458388292	0.300840990387883	1.21936109858849	1	247	246
TCGA-66-2785-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	1305	16	0	7	7	1282	52562	28	32	16	76	13153	24	50	5	79	13322	286	86	181	553	13034	305	97	172	574	13053	216	21	89	326	2054	0.249808429118774	0.56794425087108	0.157358461656324	3.609238708189	0.1587147030185	208	20	83	311	2115	0.238314176245211	0.562386980108499	0.162267914684671	3.4657928599216	0.147044917257683	0.456704980842912	596	348	4169	21918	8.66962085943345e-222	9.00378996812959	8.0114783580603	Inf	3.95063137524342	4.4892172058774	3.77153774302137e-193	13.3457467630791	3.04891968712818	1.22834518485452e-45	4.99564946892885	2.50797280540995e-46	709	686
TCGA-66-2786-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	260	2	0	3	3	255	10455	14	23	2	39	2529	6	15	4	25	2588	31	22	40	93	2616	23	35	40	98	2722	10	2	14	26	374	0.1	0.26530612244898	0.1373989713446	1.93091782167412	0.0695187165775401	16	3	10	29	391	0.111538461538462	0.311827956989247	0.149464831804281	2.08629651018893	0.0741687979539642	0.192307692307692	50	84	765	4573	8.33432931065717e-11	3.5570488539095	2.58255185151463	Inf	2.60364842454395	3.359670781893	4.49201958347949e-09	5.5480457056688	2.09333333333333	0.000283336810917954	2.5612669676008	0.848266319715959	210	205
TCGA-66-2787-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	581	4	1	4	5	572	23452	35	25	7	67	5797	31	27	10	68	5852	30	126	55	211	5855	40	136	50	226	5948	9	11	10	30	826	0.0516351118760757	0.132743362831858	0.138870208473436	0.955880777389702	0.036319612590799	5	22	7	34	821	0.0585197934595525	0.161137440758294	0.140222032450897	1.14915921515202	0.0414129110840439	0.0533562822719449	31	144	1647	10156	0.097238535725642	1.32744446107711	0.928372510568049	Inf	1.26947003209298	1.43327261687917	0.103577252390691	1.54152005711601	1.16026830890219	0.294289497496258	1.19119506350112	0.680305629507485	550	541
TCGA-66-2788-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	221	2	0	3	3	216	8856	13	9	5	27	2200	8	15	4	27	2224	22	30	25	77	2140	15	34	36	85	2292	6	5	10	21	337	0.0950226244343891	0.247058823529412	0.147033158813264	1.6802932448944	0.0623145400593472	10	5	5	20	320	0.0904977375565611	0.25974025974026	0.149532710280374	1.73701298701299	0.0625	0.14027149321267	31	67	657	3775	2.69642563291984e-05	2.65762556391824	1.79109436220603	Inf	2.13388003603268	2.91710888971163	3.395694635871e-05	4.3758561449147	1.65880679691594	0.0317145567765282	1.87325325990672	1	190	185
TCGA-66-2789-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	396	8	1	4	5	383	15703	15	23	4	42	3846	15	30	4	49	3846	29	57	49	135	3979	38	70	49	157	4032	15	12	4	31	597	0.0782828282828283	0.197452229299363	0.148065476190476	1.33354671446404	0.0519262981574539	8	6	9	23	545	0.0580808080808081	0.17037037037037	0.13696908771048	1.24386000679579	0.0422018348623853	0.0909090909090909	36	129	1142	6869	0.00613493380737901	1.6784420119078	1.19499638111295	Inf	1.53052061773603	2.40809525054238	3.34326991771212e-05	3.14351405245395	0.930546123878623	0.653739439298305	0.919914344265514	0.0654561846789502	360	347
TCGA-66-2791-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	382	3	0	6	6	373	15293	7	26	3	36	3795	8	19	7	34	3884	31	60	54	145	3718	32	66	60	158	3896	17	11	12	40	592	0.104712041884817	0.253164556962025	0.151950718685832	1.66609647622306	0.0675675675675676	15	7	16	38	575	0.0994764397905759	0.262068965517241	0.154653039268424	1.69456071964018	0.0660869565217391	0.157068062827225	60	117	1167	6447	1.32264193380527e-09	2.83257419964019	2.13617265381013	Inf	2.21166833689164	3.31399192067573	7.07977945612186e-11	5.70067211848743	1.60248951427412	0.00721063284061027	1.79848212507666	0.621694325475763	322	313
TCGA-66-2792-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	191	1	0	5	5	185	7585	8	5	3	16	1768	5	10	4	19	1893	12	33	31	76	1977	8	37	29	74	1947	2	4	4	10	252	0.0523560209424084	0.135135135135135	0.129429892141757	1.04407979407979	0.0396825396825397	2	4	3	9	292	0.0471204188481675	0.118421052631579	0.147698533131007	0.801775414563807	0.0308219178082192	0.0575916230366492	11	69	544	3380	0.561640089940227	0.990517824851003	0.530322914254452	Inf	0.991819852941176	1.44264705882353	0.298889521202098	1.55310110153363	0.841544117647059	0.742955188919447	0.820654214446792	0.475633586868292	180	174
TCGA-66-2793-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	342	6	1	8	9	327	13407	22	28	9	59	3174	18	23	13	54	3079	28	33	39	100	3590	25	51	38	114	3564	7	4	3	14	426	0.0409356725146199	0.12280701754386	0.11952861952862	1.02742772424018	0.0328638497652582	4	5	5	14	452	0.0409356725146199	0.14	0.125905292479109	1.11194690265487	0.0309734513274336	0.0555555555555556	19	111	878	6276	0.245460974922436	1.22350245369347	0.771947647369883	Inf	1.19087086034694	1.69110757725534	0.0555147861439178	1.87184474537596	0.846552081176227	0.742682817906191	0.828796268256023	0.573113236010386	323	308
TCGA-66-2794-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	176	1	0	1	1	174	7134	3	3	1	7	1656	6	6	2	14	1675	22	16	38	76	1958	19	22	36	77	1845	10	1	10	21	225	0.119318181818182	0.272727272727273	0.121951219512195	2.23636363636364	0.0933333333333333	14	0	4	18	248	0.102272727272727	0.236842105263158	0.126659856996936	1.86990662139219	0.0725806451612903	0.215909090909091	38	77	473	3330	1.51938767974578e-08	3.472533475277	2.41987009982388	Inf	2.65675153966357	4.70644046821018	5.1297043596423e-12	9.925463338472	1.52111307925261	0.0736549781819832	1.64244910274548	0.0407960537129673	138	136
TCGA-66-2795-01A-02D-0983-08	0	0	0	0	417	1	0	6	6	410	16810	17	12	2	31	4248	19	17	4	40	4157	17	106	52	175	4159	24	92	48	164	4246	8	11	8	27	591	0.0647482014388489	0.164634146341463	0.139189825718323	1.18280302092361	0.0456852791878173	2	12	7	21	581	0.0503597122302158	0.12	0.139697042558307	0.859001721170396	0.036144578313253	0.0599520383693046	25	116	1172	7233	0.124096973215758	1.33001419011994	0.889174464280087	Inf	1.27154285575969	1.74914675767918	0.0521684307731009	1.99066803668144	1.0757252559727	0.424267272212991	1.08910369936321	0.352448989171022	392	385
TCGA-66-2800-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	266	2	1	1	2	262	10742	11	9	7	27	2568	4	15	3	22	2598	19	37	59	115	2758	10	50	38	98	2818	2	8	4	14	362	0.0526315789473684	0.142857142857143	0.128459900638751	1.11207576953433	0.0386740331491713	3	5	9	17	342	0.0639097744360902	0.147826086956522	0.124002900652647	1.19211797609967	0.0497076023391813	0.0676691729323308	18	108	704	4872	0.328143791972267	1.15335638868784	0.71745944174129	Inf	1.13149350649351	1.36559561128527	0.30164217552401	1.4416486429382	1.06150421743205	0.455741025150488	1.07102946627967	0.0485513975824021	248	244
TCGA-70-6722-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	313	6	0	4	4	303	12423	13	9	2	24	2868	12	8	4	24	2931	19	70	30	119	3243	18	81	37	136	3381	6	5	7	18	447	0.0575079872204473	0.132352941176471	0.132209405501331	1.001085669167	0.0402684563758389	4	8	8	20	414	0.0638977635782748	0.168067226890756	0.127659574468085	1.31652661064426	0.0483091787439614	0.0798722044728434	25	79	861	5763	0.00171265486852328	2.11786409514549	1.39254727941612	Inf	1.84937014205307	2.0792918353894	0.0174946750028073	2.47854175735559	1.72239846065838	0.0241784798087691	1.93064159694766	0.328892249805994	288	278
TCGA-70-6723-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	131	1	0	4	4	126	5166	6	8	1	15	1231	12	7	4	23	1286	11	13	21	45	1300	5	22	16	43	1349	0	3	0	3	188	0.0229007633587786	0.0697674418604651	0.139362490733877	0.500618505690252	0.0159574468085106	2	1	1	4	175	0.0305343511450382	0.0888888888888889	0.134615384615385	0.66031746031746	0.0228571428571429	0.0229007633587786	3	50	363	2286	0.981571518083367	0.377946372676743	0.0993603609634682	Inf	0.413067207235303	0.912190082644628	0.665565779445162	0.899656814167569	0.197230288139379	0.995605270374619	0.174992286774308	1	128	123
TCGA-85-6175-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	62	1	0	1	1	60	2460	0	3	1	4	559	1	2	0	3	598	1	7	11	19	626	2	12	20	34	677	0	2	4	6	86	0.0967741935483871	0.176470588235294	0.127031019202363	1.38919288645691	0.0697674418604651	0	1	0	1	76	0.0161290322580645	0.0526315789473684	0.121405750798722	0.433518005540166	0.0131578947368421	0.0645161290322581	4	30	162	1141	0.626295698340858	0.939128872307221	0.299065982753423	Inf	0.946259985475672	0	1	0	1.03783353245719	0.55165718415764	1.04341328584292	0.06993006993007	58	56
TCGA-85-6560-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	490	3	2	6	8	479	19639	24	31	11	66	4629	21	37	10	68	4838	36	73	68	177	5159	35	72	61	168	5013	12	9	8	29	698	0.0591836734693878	0.172619047619048	0.139237981248753	1.23974109701187	0.0415472779369628	12	6	4	22	724	0.0448979591836735	0.124293785310734	0.140337274665633	0.885679058588507	0.0303867403314917	0.073469387755102	36	164	1422	8750	0.0680103023791994	1.35068000840074	0.969803479232205	Inf	1.28759493670886	2.41801866048612	2.15924390039034e-05	3.14161551796215	0.66542373990122	0.95710722922793	0.631133335129693	0.0220175508521949	454	443
TCGA-85-6561-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	969	6	0	2	2	961	39401	17	12	11	40	10170	13	15	3	31	10702	34	344	40	418	9098	25	410	37	472	9431	9	71	15	95	1580	0.0980392156862745	0.201271186440678	0.167532605238045	1.20138516412787	0.060126582278481	11	57	10	78	1501	0.0804953560371517	0.186602870813397	0.164981314574632	1.13105457605615	0.0519653564290473	0.0464396284829721	45	91	3081	15448	2.30394877033659e-06	2.47925733942916	1.79623114502855	Inf	1.98991207972965	2.03862932461946	0.00096558981778583	2.57118676006172	1.95258328169721	0.00050650514436286	2.41040842699131	0.52299287009324	924	916
Totals	0	0	0	0	62585	1084	123	572	695	60806	2493046	2360	2859	813	6032	605595	2329	2941	827	6097	615538	4947	9615	9593	24155	633588	4892	9786	9844	24522	638325	2130	1285	2344	5759	90523	0.092018854358073	0.234850338471577	0.141813339599734	1.65605252040773	0.0636191907029153	2232	1278	2235	5745	88562	0.0917951585843253	0.237838956737735	0.13977853115905	1.70154139384328	0.0648698087215736	0.142861708077015	8941	20335	179085	1092828	0	2.68325485939641	2.62641407596599	Inf	2.1690649235632	3.14871168334688	0	4.8601486929627	1.67316820753133	3.31645693698022e-267	1.88055275010408	0.00348291346563955	53644	51865
