SampleName	CN_cNMF	Methlyation_cNMF	RPPA_cNMF	RPPA_cHierarchical	mRNAseq_cNMF	mRNAseq_cHierarchical	miRseq_cNMF	miRseq_cHierarchical	miRseq_Mature_cNMF	miRseq_Mature_cHierarchical
TCGA-3M-AB46-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1
TCGA-3M-AB47-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	2
TCGA-B7-5816-01	2	3	1	1	1	1	1	1	3	1
TCGA-B7-5818-01	3	3	1	1	1	2	1	2	3	1
TCGA-B7-A5TI-01	4	1	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-B7-A5TJ-01	1	2	NA	NA	NA	NA	1	1	2	1
TCGA-B7-A5TK-01	2	3	NA	NA	NA	NA	2	3	4	1
TCGA-B7-A5TN-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	5	1
TCGA-BR-4183-01	4	NA	2	2	NA	NA	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4184-01	2	NA	1	3	NA	NA	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4187-01	2	NA	2	4	2	3	2	3	NA	NA
TCGA-BR-4188-01	2	NA	2	4	NA	NA	2	3	NA	NA
TCGA-BR-4191-01	4	NA	3	2	3	4	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4201-01	2	NA	1	1	1	1	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4253-01	2	NA	1	3	1	2	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4255-01	4	NA	2	4	2	3	2	3	NA	NA
TCGA-BR-4256-01	2	NA	2	4	2	1	2	3	NA	NA
TCGA-BR-4257-01	5	NA	3	2	1	4	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4267-01	1	NA	1	1	3	4	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4279-01	2	NA	2	4	2	3	2	3	NA	NA
TCGA-BR-4280-01	2	NA	1	3	4	5	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4292-01	2	NA	3	3	3	4	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4294-01	1	NA	3	2	5	6	2	2	NA	NA
TCGA-BR-4357-01	1	NA	1	3	5	6	3	4	NA	NA
TCGA-BR-4361-01	2	NA	1	3	4	7	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4362-01	2	NA	1	3	1	7	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4363-01	2	NA	1	3	3	1	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4366-01	1	NA	3	2	5	6	3	4	NA	NA
TCGA-BR-4367-01	4	NA	1	3	1	7	1	1	NA	NA
TCGA-BR-4368-01	4	NA	2	4	2	1	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4369-01	1	NA	3	2	5	6	1	4	NA	NA
TCGA-BR-4370-01	2	NA	1	1	2	1	1	2	NA	NA
TCGA-BR-4371-01	3	NA	3	2	4	5	1	1	NA	NA
TCGA-BR-6452-01	2	2	1	3	1	4	1	1	3	1
TCGA-BR-6453-01	2	4	2	2	4	3	1	2	2	2
TCGA-BR-6454-01	4	4	1	1	5	4	1	2	3	1
TCGA-BR-6455-01	2	3	3	2	2	2	1	2	3	1
TCGA-BR-6456-01	4	1	2	4	2	6	2	4	6	1
TCGA-BR-6457-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-6458-01	1	2	2	4	5	1	1	1	3	1
TCGA-BR-6563-01	2	4	NA	NA	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-6564-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-6565-01	1	1	3	4	4	5	2	4	3	1
TCGA-BR-6566-01	2	2	1	3	1	5	1	1	3	1
TCGA-BR-6705-01	2	4	2	4	2	3	2	3	5	2
TCGA-BR-6706-01	2	3	2	4	2	2	2	3	3	2
TCGA-BR-6707-01	2	3	3	2	1	2	1	2	3	3
TCGA-BR-6709-01	2	4	1	3	5	1	1	2	3	1
TCGA-BR-6710-01	2	4	1	1	3	4	2	2	3	1
TCGA-BR-6801-01	3	1	2	4	2	5	2	2	3	2
TCGA-BR-6802-01	2	4	1	1	1	4	1	2	3	1
TCGA-BR-6803-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-6852-01	2	3	1	1	1	7	1	1	3	1
TCGA-BR-7196-01	2	3	2	4	2	2	2	3	6	2
TCGA-BR-7197-01	1	1	2	4	5	6	3	4	5	1
TCGA-BR-7703-01	2	2	3	3	4	5	1	2	2	1
TCGA-BR-7704-01	1	1	3	3	NA	NA	1	2	4	1
TCGA-BR-7707-01	2	2	NA	NA	1	7	1	1	4	1
TCGA-BR-7715-01	1	1	3	4	5	6	3	3	5	1
TCGA-BR-7716-01	1	1	3	4	5	6	3	4	NA	NA
TCGA-BR-7717-01	1	2	2	4	3	1	2	3	4	1
TCGA-BR-7722-01	2	1	2	4	3	4	2	2	NA	NA
TCGA-BR-7723-01	1	1	3	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-BR-7851-01	2	2	1	4	4	7	2	2	4	1
TCGA-BR-7901-01	1	1	1	4	5	4	2	4	6	1
TCGA-BR-7957-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-7958-01	2	3	1	4	1	2	2	2	4	1
TCGA-BR-7959-01	4	2	2	4	2	6	2	3	6	2
TCGA-BR-8058-01	2	4	2	4	3	4	2	2	4	1
TCGA-BR-8059-01	2	4	2	4	2	1	2	4	5	1
TCGA-BR-8060-01	1	1	1	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-BR-8077-01	1	1	NA	NA	5	6	3	4	1	3
TCGA-BR-8078-01	2	3	NA	NA	1	7	1	2	4	1
TCGA-BR-8080-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8081-01	2	3	2	1	1	7	1	2	NA	NA
TCGA-BR-8284-01	2	2	3	4	2	3	2	2	3	1
TCGA-BR-8285-01	2	3	1	1	NA	NA	2	2	NA	NA
TCGA-BR-8286-01	1	2	1	3	1	7	1	1	4	1
TCGA-BR-8289-01	1	1	1	4	5	1	2	4	6	1
TCGA-BR-8291-01	2	4	2	2	3	3	2	2	5	2
TCGA-BR-8295-01	1	1	3	2	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-BR-8296-01	4	4	2	4	NA	NA	1	2	3	1
TCGA-BR-8297-01	4	2	2	2	2	3	2	4	6	2
TCGA-BR-8360-01	2	2	1	3	NA	NA	1	1	3	3
TCGA-BR-8361-01	4	2	1	3	1	7	1	1	4	3
TCGA-BR-8362-01	3	2	2	4	2	5	2	3	6	1
TCGA-BR-8363-01	2	3	1	4	1	1	1	2	3	1
TCGA-BR-8364-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8365-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8366-01	2	3	1	3	1	1	2	2	NA	NA
TCGA-BR-8367-01	2	2	2	4	2	3	2	3	NA	NA
TCGA-BR-8368-01	2	2	3	2	1	5	1	1	1	3
TCGA-BR-8369-01	5	2	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8370-01	3	2	2	4	NA	NA	2	3	6	1
TCGA-BR-8371-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8372-01	2	2	1	3	1	7	1	2	4	1
TCGA-BR-8373-01	1	1	NA	NA	5	6	3	4	5	1
TCGA-BR-8380-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8381-01	2	3	1	3	1	2	3	4	4	1
TCGA-BR-8382-01	2	3	1	1	1	7	1	2	4	1
TCGA-BR-8384-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8483-01	3	1	2	2	5	6	2	3	6	1
TCGA-BR-8484-01	4	4	1	2	3	4	1	1	NA	NA
TCGA-BR-8485-01	1	1	3	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-BR-8486-01	1	1	2	2	4	5	1	2	4	1
TCGA-BR-8487-01	2	2	NA	NA	1	5	1	1	4	3
TCGA-BR-8588-01	2	4	2	4	4	4	2	3	4	1
TCGA-BR-8589-01	4	3	1	3	1	2	1	2	NA	NA
TCGA-BR-8590-01	2	4	3	4	2	1	2	4	6	2
TCGA-BR-8591-01	2	2	1	4	1	7	2	2	4	1
TCGA-BR-8592-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8676-01	5	3	1	4	NA	NA	3	2	1	3
TCGA-BR-8677-01	2	4	2	2	2	7	2	2	5	2
TCGA-BR-8678-01	1	1	3	3	5	6	3	4	1	1
TCGA-BR-8679-01	5	2	3	4	4	5	3	3	5	1
TCGA-BR-8680-01	2	2	1	3	1	5	1	1	1	1
TCGA-BR-8682-01	3	2	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-8683-01	3	1	2	4	4	5	2	3	6	1
TCGA-BR-8686-01	2	3	3	4	2	2	2	3	NA	NA
TCGA-BR-8687-01	4	1	3	4	5	4	2	4	6	1
TCGA-BR-8690-01	1	1	1	1	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-BR-A44T-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A44U-01	3	2	3	2	NA	NA	3	1	NA	NA
TCGA-BR-A452-01	1	1	2	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-BR-A453-01	2	4	2	2	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A4CQ-01	1	2	2	2	NA	NA	1	2	5	1
TCGA-BR-A4CR-01	1	1	1	3	5	6	1	2	1	1
TCGA-BR-A4CS-01	4	2	2	4	5	6	3	2	1	1
TCGA-BR-A4IU-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A4IV-01	2	4	3	2	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A4IY-01	2	3	2	4	1	1	3	2	5	1
TCGA-BR-A4IZ-01	2	4	2	2	2	3	2	2	5	2
TCGA-BR-A4J1-01	4	1	3	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-BR-A4J2-01	2	4	3	2	2	3	2	3	NA	NA
TCGA-BR-A4J4-01	2	3	3	2	1	2	2	2	NA	NA
TCGA-BR-A4J5-01	2	4	2	4	2	3	2	3	5	2
TCGA-BR-A4J6-01	4	4	3	4	3	1	2	2	6	2
TCGA-BR-A4J7-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A4J8-01	3	2	1	3	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A4J9-01	2	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-BR-A4PD-01	4	1	3	2	3	4	3	4	1	3
TCGA-BR-A4PE-01	1	2	3	2	1	4	3	1	NA	NA
TCGA-BR-A4PF-01	4	2	1	1	4	5	3	1	NA	NA
TCGA-BR-A4QI-01	1	2	2	4	4	5	2	3	1	1
TCGA-BR-A4QL-01	2	2	1	3	NA	NA	1	1	1	3
TCGA-BR-A4QM-01	2	2	1	3	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-CD-5798-01	2	4	2	4	2	1	2	3	6	2
TCGA-CD-5799-01	4	1	3	2	4	5	1	1	3	1
TCGA-CD-5800-01	1	1	3	2	5	6	3	4	3	1
TCGA-CD-5801-01	3	3	3	3	1	2	1	2	3	1
TCGA-CD-5802-01	1	4	3	2	NA	NA	1	4	3	1
TCGA-CD-5803-01	2	4	2	4	2	3	2	3	3	2
TCGA-CD-5804-01	1	4	1	4	3	4	2	3	4	1
TCGA-CD-5813-01	NA	4	2	2	2	3	1	2	3	1
TCGA-CD-8524-01	4	2	2	2	5	1	3	4	5	2
TCGA-CD-8525-01	1	1	2	4	NA	NA	3	4	4	1
TCGA-CD-8526-01	4	4	1	3	5	6	3	4	1	1
TCGA-CD-8527-01	4	1	3	4	NA	NA	3	4	4	1
TCGA-CD-8528-01	1	2	1	1	1	5	3	1	NA	NA
TCGA-CD-8529-01	2	4	1	2	3	4	2	4	4	1
TCGA-CD-8530-01	4	4	2	4	5	1	2	4	5	1
TCGA-CD-8531-01	2	3	1	3	1	1	1	2	4	1
TCGA-CD-8532-01	4	4	3	4	3	4	2	2	4	1
TCGA-CD-8533-01	4	1	3	2	5	6	3	2	1	1
TCGA-CD-8534-01	4	2	2	2	2	3	2	2	6	1
TCGA-CD-8535-01	1	1	1	3	5	6	3	4	1	1
TCGA-CD-8536-01	2	2	3	3	1	4	1	1	4	3
TCGA-CD-A486-01	1	1	3	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-CD-A487-01	1	1	1	1	2	1	3	4	1	1
TCGA-CD-A489-01	1	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-CD-A48A-01	1	1	3	4	NA	NA	3	3	NA	NA
TCGA-CD-A48C-01	4	2	3	4	1	1	1	1	5	1
TCGA-CD-A4MG-01	3	2	1	3	1	5	1	1	2	3
TCGA-CD-A4MH-01	1	1	2	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-CD-A4MI-01	2	2	3	2	2	1	2	3	6	2
TCGA-CD-A4MJ-01	2	2	3	3	1	7	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4300-01	1	NA	1	1	NA	NA	1	4	NA	NA
TCGA-CG-4301-01	1	NA	2	2	3	4	1	2	NA	NA
TCGA-CG-4304-01	3	NA	3	2	4	4	1	2	NA	NA
TCGA-CG-4305-01	5	NA	3	2	1	4	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4306-01	2	NA	1	2	3	4	1	4	NA	NA
TCGA-CG-4436-01	1	NA	1	1	4	5	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4437-01	2	2	1	1	3	4	1	2	3	1
TCGA-CG-4438-01	1	NA	3	2	5	5	3	4	NA	NA
TCGA-CG-4440-01	3	NA	NA	NA	5	5	1	4	NA	NA
TCGA-CG-4441-01	5	1	NA	NA	4	5	1	2	3	1
TCGA-CG-4442-01	2	NA	3	3	1	7	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4443-01	1	NA	3	2	5	6	1	2	NA	NA
TCGA-CG-4444-01	1	NA	3	2	4	5	1	2	NA	NA
TCGA-CG-4449-01	1	NA	3	2	5	1	3	4	3	1
TCGA-CG-4455-01	5	NA	2	1	NA	NA	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4460-01	1	NA	3	2	5	4	3	4	NA	NA
TCGA-CG-4462-01	2	NA	NA	NA	3	3	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4465-01	2	NA	3	2	4	5	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4466-01	1	NA	3	2	5	5	3	4	NA	NA
TCGA-CG-4469-01	3	NA	1	3	4	5	1	1	NA	NA
TCGA-CG-4472-01	4	NA	2	4	2	1	2	3	NA	NA
TCGA-CG-4474-01	2	NA	3	2	4	4	1	2	NA	NA
TCGA-CG-4475-01	1	NA	2	4	5	1	1	2	NA	NA
TCGA-CG-4476-01	3	NA	2	4	3	4	2	4	NA	NA
TCGA-CG-4477-01	2	NA	2	4	1	1	1	2	NA	NA
TCGA-CG-5716-01	2	4	2	2	3	4	2	2	3	1
TCGA-CG-5717-01	2	4	2	4	1	1	2	2	2	1
TCGA-CG-5718-01	3	1	2	1	5	4	1	4	3	3
TCGA-CG-5719-01	4	4	2	4	3	1	2	3	3	2
TCGA-CG-5720-01	2	2	3	2	4	5	1	2	3	1
TCGA-CG-5721-01	2	4	3	2	1	1	1	2	3	1
TCGA-CG-5722-01	2	3	NA	NA	3	4	1	2	3	1
TCGA-CG-5723-01	2	4	1	1	1	1	1	2	3	1
TCGA-CG-5724-01	3	2	3	3	1	1	1	2	3	1
TCGA-CG-5725-01	1	1	3	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-CG-5726-01	3	2	3	2	3	4	1	2	3	1
TCGA-CG-5727-01	3	1	3	2	NA	NA	1	4	3	3
TCGA-CG-5728-01	2	2	2	4	NA	NA	2	3	3	2
TCGA-CG-5730-01	1	1	3	2	NA	NA	1	1	1	3
TCGA-CG-5732-01	1	1	3	2	3	4	2	2	3	1
TCGA-CG-5733-01	2	2	1	1	NA	NA	1	1	3	1
TCGA-CG-5734-01	2	4	1	3	3	4	1	2	3	1
TCGA-D7-5577-01	2	3	3	3	1	2	1	2	3	1
TCGA-D7-5578-01	3	1	3	2	4	5	2	2	3	1
TCGA-D7-5579-01	1	4	2	4	NA	NA	2	3	3	2
TCGA-D7-6518-01	3	4	2	4	2	3	2	3	6	2
TCGA-D7-6519-01	4	1	3	2	5	1	1	2	3	1
TCGA-D7-6520-01	4	1	3	4	5	6	2	4	3	2
TCGA-D7-6521-01	3	4	2	4	3	4	2	2	2	1
TCGA-D7-6522-01	2	4	3	2	4	3	2	3	6	2
TCGA-D7-6524-01	2	4	2	4	1	3	1	2	3	2
TCGA-D7-6525-01	4	2	1	3	1	1	1	2	3	1
TCGA-D7-6526-01	1	1	NA	NA	5	5	3	4	3	1
TCGA-D7-6527-01	1	1	3	4	3	4	1	4	3	3
TCGA-D7-6528-01	1	2	1	3	4	5	1	1	3	3
TCGA-D7-6815-01	1	1	1	1	4	5	1	4	3	3
TCGA-D7-6817-01	5	1	3	2	3	4	1	2	3	1
TCGA-D7-6818-01	1	4	3	2	5	6	2	4	5	1
TCGA-D7-6820-01	1	1	1	1	5	4	3	4	3	3
TCGA-D7-6822-01	1	2	1	1	5	6	3	4	1	1
TCGA-D7-8570-01	2	3	1	3	1	2	1	2	3	1
TCGA-D7-8572-01	2	1	2	4	5	6	3	4	5	1
TCGA-D7-8573-01	3	3	1	3	1	2	3	2	NA	NA
TCGA-D7-8574-01	2	4	2	2	2	3	2	2	5	2
TCGA-D7-8575-01	4	2	3	2	3	4	1	2	4	3
TCGA-D7-8576-01	3	1	NA	NA	3	4	3	2	4	1
TCGA-D7-8578-01	3	4	3	2	5	4	2	4	5	1
TCGA-D7-8579-01	2	4	NA	NA	2	3	2	3	6	2
TCGA-D7-A4YT-01	1	1	3	2	5	6	3	2	1	1
TCGA-D7-A4YU-01	4	2	1	1	2	1	2	3	6	1
TCGA-D7-A4YV-01	2	2	3	4	2	3	3	4	2	1
TCGA-D7-A4YX-01	2	3	1	3	1	2	1	2	NA	NA
TCGA-D7-A4YY-01	2	2	3	3	1	7	1	1	3	1
TCGA-D7-A4Z0-01	2	2	2	4	4	3	2	2	2	1
TCGA-D7-A6ET-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-D7-A6EV-01	5	2	NA	NA	NA	NA	3	1	1	3
TCGA-D7-A6EX-01	4	1	NA	NA	NA	NA	2	3	1	1
TCGA-D7-A6EY-01	2	2	NA	NA	NA	NA	2	3	2	1
TCGA-D7-A6EZ-01	2	3	NA	NA	NA	NA	1	2	1	3
TCGA-D7-A6F0-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-D7-A6F2-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	1	2	1
TCGA-D7-A747-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-D7-A748-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	5	2
TCGA-D7-A74A-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	2	1	3
TCGA-D7-A74B-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-EQ-5647-01	1	1	NA	NA	NA	NA	2	3	3	2
TCGA-EQ-8122-01	1	1	1	2	5	5	3	4	5	1
TCGA-EQ-A4SO-01	1	1	3	2	3	4	3	2	NA	NA
TCGA-F1-6177-01	2	2	3	3	4	5	1	1	3	3
TCGA-F1-6874-01	2	2	1	1	4	5	1	1	3	3
TCGA-F1-6875-01	1	1	3	3	5	6	3	2	4	1
TCGA-F1-A448-01	2	2	2	1	4	7	1	2	2	3
TCGA-F1-A72C-01	4	4	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA
TCGA-FP-7735-01	1	1	NA	NA	5	4	2	3	4	1
TCGA-FP-7829-01	1	2	NA	NA	4	5	1	1	4	1
TCGA-FP-7916-01	4	3	2	4	2	3	2	3	NA	NA
TCGA-FP-7998-01	2	3	3	4	2	2	2	3	4	1
TCGA-FP-8099-01	4	1	NA	NA	1	6	1	4	4	1
TCGA-FP-8209-01	2	4	NA	NA	2	3	2	3	6	2
TCGA-FP-8210-01	2	4	NA	NA	2	3	2	3	6	2
TCGA-FP-8211-01	1	1	NA	NA	3	4	1	2	2	1
TCGA-FP-8631-01	1	1	NA	NA	5	6	3	4	1	1
TCGA-FP-A4BE-01	NA	2	NA	NA	1	5	1	1	1	3
TCGA-FP-A4BF-01	1	2	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA
TCGA-FP-A8CX-01	2	4	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA
TCGA-FP-A9TM-01	4	2	NA	NA	NA	NA	2	2	2	1
TCGA-HF-7131-01	4	1	3	2	3	4	1	2	4	1
TCGA-HF-7132-01	2	2	1	2	3	4	1	2	4	1
TCGA-HF-7133-01	4	1	1	2	3	4	3	2	NA	NA
TCGA-HF-7134-01	5	2	3	3	4	5	1	1	4	1
TCGA-HF-7136-01	1	1	3	2	5	6	3	4	1	1
TCGA-HF-A5NB-01	2	2	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA
TCGA-HJ-7597-01	2	4	1	2	NA	NA	1	2	NA	NA
TCGA-HU-8238-01	4	2	NA	NA	4	4	1	2	4	1
TCGA-HU-8243-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-HU-8244-01	2	2	NA	NA	4	5	1	1	NA	NA
TCGA-HU-8245-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA
TCGA-HU-8249-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA
TCGA-HU-8602-01	2	2	1	3	1	7	3	1	4	3
TCGA-HU-8604-01	2	3	NA	NA	1	5	1	2	4	1
TCGA-HU-8608-01	2	3	3	3	1	2	3	2	4	3
TCGA-HU-8610-01	2	4	2	1	1	4	3	2	NA	NA
TCGA-HU-A4G2-01	4	3	NA	NA	3	2	1	2	NA	NA
TCGA-HU-A4G3-01	2	2	NA	NA	3	4	1	2	2	3
TCGA-HU-A4G6-01	3	3	NA	NA	1	2	1	2	NA	NA
TCGA-HU-A4G8-01	2	2	NA	NA	1	4	1	2	2	3
TCGA-HU-A4G9-01	5	2	NA	NA	3	4	1	1	NA	NA
TCGA-HU-A4GC-01	5	2	NA	NA	3	4	1	2	2	1
TCGA-HU-A4GD-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-HU-A4GF-01	1	1	1	1	5	5	3	4	1	3
TCGA-HU-A4GH-01	1	1	NA	NA	5	4	3	4	1	3
TCGA-HU-A4GJ-01	2	4	NA	NA	3	4	2	2	2	1
TCGA-HU-A4GN-01	2	2	NA	NA	1	7	1	1	3	3
TCGA-HU-A4GP-01	5	2	NA	NA	3	4	1	2	NA	NA
TCGA-HU-A4GQ-01	3	3	1	3	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-HU-A4GT-01	2	2	1	3	4	5	1	1	1	3
TCGA-HU-A4GU-01	4	2	1	3	5	5	1	1	NA	NA
TCGA-HU-A4GX-01	2	1	1	3	3	4	1	2	2	3
TCGA-HU-A4GY-01	2	4	3	2	2	3	2	2	2	2
TCGA-HU-A4H0-01	1	3	NA	NA	1	2	3	2	NA	NA
TCGA-HU-A4H2-01	1	1	3	2	3	4	3	4	1	3
TCGA-HU-A4H3-01	5	2	2	1	1	7	3	1	NA	NA
TCGA-HU-A4H4-01	4	2	2	1	1	4	1	1	2	3
TCGA-HU-A4H5-01	1	1	2	1	5	6	3	4	1	3
TCGA-HU-A4H6-01	4	2	NA	NA	3	4	1	2	2	1
TCGA-HU-A4H8-01	2	2	NA	NA	4	4	1	1	2	3
TCGA-HU-A4HB-01	2	4	NA	NA	3	4	3	2	2	1
TCGA-HU-A4HD-01	1	1	3	2	5	6	3	4	NA	NA
TCGA-IN-7806-01	4	1	3	2	4	1	2	2	4	1
TCGA-IN-7808-01	4	4	3	2	5	3	1	1	4	1
TCGA-IN-8462-01	4	2	2	4	1	1	1	2	4	1
TCGA-IN-8663-01	4	2	3	4	1	1	1	2	4	1
TCGA-IN-A6RI-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-IN-A6RJ-01	2	4	NA	NA	NA	NA	3	2	2	1
TCGA-IN-A6RL-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	2	2	1
TCGA-IN-A6RN-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	2	4	1
TCGA-IN-A6RO-01	1	2	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA
TCGA-IN-A6RP-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	1	2	1
TCGA-IN-A6RR-01	1	2	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA
TCGA-IN-A6RS-01	5	2	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA
TCGA-IN-A7NR-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	2	1
TCGA-IN-A7NT-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-IN-A7NU-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-IN-AB1V-01	4	4	NA	NA	NA	NA	2	2	2	1
TCGA-IN-AB1X-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	4	3
TCGA-IP-7968-01	1	1	1	3	5	6	3	1	4	1
TCGA-KB-A6F5-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	5	1
TCGA-KB-A6F7-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-KB-A93G-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	4	1	3
TCGA-KB-A93H-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	2	5	2
TCGA-KB-A93J-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	2	3
TCGA-MX-A5UG-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	2	2
TCGA-MX-A5UJ-01	2	2	NA	NA	NA	NA	3	4	2	1
TCGA-MX-A663-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	4	5	1
TCGA-MX-A666-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-R5-A7O7-01	1	4	NA	NA	NA	NA	3	4	4	1
TCGA-R5-A7ZE-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-R5-A7ZF-01	3	4	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-R5-A7ZI-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-R5-A7ZR-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-R5-A804-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-R5-A805-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-RD-A7BS-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	6	1
TCGA-RD-A7BT-01	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-RD-A7BW-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-RD-A7C1-01	4	2	NA	NA	NA	NA	3	4	2	3
TCGA-RD-A8MV-01	4	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-RD-A8MW-01	2	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-RD-A8N0-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	6	2
TCGA-RD-A8N1-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	2	2
TCGA-RD-A8N2-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA
TCGA-RD-A8N4-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA
TCGA-RD-A8N5-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	5	2
TCGA-RD-A8N6-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	6	1
TCGA-RD-A8N9-01	1	4	NA	NA	NA	NA	2	3	5	2
TCGA-RD-A8NB-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-SW-A7EA-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	1	5	1
TCGA-SW-A7EB-01	2	4	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A8DL-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	2	4	1
TCGA-VQ-A8DT-01	3	2	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA
TCGA-VQ-A8DU-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A8DV-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A8DZ-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA
TCGA-VQ-A8E0-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-VQ-A8E2-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A8E3-01	3	2	NA	NA	NA	NA	1	1	4	3
TCGA-VQ-A8E7-01	3	2	NA	NA	NA	NA	1	1	5	1
TCGA-VQ-A8P2-01	2	2	NA	NA	NA	NA	3	1	1	3
TCGA-VQ-A8P3-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	1	5	1
TCGA-VQ-A8P5-01	4	2	NA	NA	NA	NA	3	1	1	1
TCGA-VQ-A8P8-01	2	2	NA	NA	NA	NA	2	2	6	1
TCGA-VQ-A8PB-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	1	1	3
TCGA-VQ-A8PC-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-A8PD-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-A8PE-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A8PF-01	2	3	NA	NA	NA	NA	1	2	4	1
TCGA-VQ-A8PH-01	4	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A8PJ-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-VQ-A8PK-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-VQ-A8PM-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-A8PO-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	1	4	3
TCGA-VQ-A8PP-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	5	1
TCGA-VQ-A8PQ-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2	6	1
TCGA-VQ-A8PS-01	4	4	NA	NA	NA	NA	1	2	4	3
TCGA-VQ-A8PT-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-VQ-A8PU-01	4	1	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-VQ-A8PX-01	4	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-VQ-A8PY-01	3	2	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA
TCGA-VQ-A8PZ-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-A91A-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	2	5	2
TCGA-VQ-A91D-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	1	1	3
TCGA-VQ-A91E-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-VQ-A91K-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	4	1
TCGA-VQ-A91N-01	5	1	NA	NA	NA	NA	3	4	2	3
TCGA-VQ-A91Q-01	5	1	NA	NA	NA	NA	3	2	1	1
TCGA-VQ-A91S-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	1	1	3
TCGA-VQ-A91U-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	1	1	3
TCGA-VQ-A91V-01	3	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-VQ-A91W-01	2	3	NA	NA	NA	NA	1	2	1	3
TCGA-VQ-A91X-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	1	2	3
TCGA-VQ-A91Y-01	4	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-VQ-A91Z-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A922-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A923-01	3	3	NA	NA	NA	NA	1	2	4	1
TCGA-VQ-A924-01	2	3	NA	NA	NA	NA	1	2	4	1
TCGA-VQ-A925-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	2	2	3
TCGA-VQ-A927-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-A928-01	5	1	NA	NA	NA	NA	2	2	5	2
TCGA-VQ-A92D-01	1	2	NA	NA	NA	NA	1	1	4	1
TCGA-VQ-A94O-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	1
TCGA-VQ-A94P-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-VQ-A94R-01	1	2	NA	NA	NA	NA	2	2	5	2
TCGA-VQ-A94T-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1
TCGA-VQ-A94U-01	4	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-AA64-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	2	5	1
TCGA-VQ-AA68-01	1	2	NA	NA	NA	NA	1	2	4	3
TCGA-VQ-AA69-01	2	3	NA	NA	NA	NA	1	2	1	3
TCGA-VQ-AA6A-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-VQ-AA6B-01	1	1	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1
TCGA-VQ-AA6D-01	1	1	NA	NA	NA	NA	3	4	1	3
TCGA-VQ-AA6F-01	2	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-AA6G-01	1	2	NA	NA	NA	NA	3	2	4	1
TCGA-VQ-AA6I-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	2	2	3
TCGA-VQ-AA6J-01	3	4	NA	NA	NA	NA	1	2	2	1
TCGA-VQ-AA6K-01	4	4	NA	NA	NA	NA	2	2	4	1
TCGA-ZA-A8F6-01	2	1	NA	NA	NA	NA	2	3	6	2
TCGA-ZQ-A9CR-01	5	1	NA	NA	NA	NA	3	4	5	2
