"Sample"	"A_T_coord_clusters"	"G_C_coord_clusters"	"Non_coord_clusters"	"clusters"	"mutations"	"complex"	"insertions"	"deletions"	"indels"	"substitutions"	"bases"	"A_to_T"	"A_to_G"	"A_to_C"	"A"	"a"	"T_to_A"	"T_to_C"	"T_to_G"	"T"	"t"	"G_to_C"	"G_to_T"	"G_to_A"	"G"	"g"	"C_to_G"	"C_to_A"	"C_to_T"	"C"	"c"	"tCw_to_G"	"tCw_to_A"	"tCw_to_T"	"tCw"	"tcw"	"tCw_per_mut"	"tCw_per_C"	"tcw_per_c"	"enrich_tCw"	"freq_tCw"	"wGa_to_C"	"wGa_to_T"	"wGa_to_A"	"wGa"	"wga"	"wGa_per_mut"	"wGa_per_G"	"wga_per_g"	"enrich_wGa"	"freq_wGa"	"[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut"	"tCw_to_G+tCw_to_T"	"[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]"	"tcw+wga"	"c-tcw"	"Fisher_p-value_tCw"	"BH_Fisher_p-value_tCw"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw"	"odds_ratio_tCw"	"95%_confidence_lower_tCw"	"95%_confidence_upper_tCw"	"APOBEC_enrich"	"tCw_to_G_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_G"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"odds_ratio_tCw_to_G"	"tCw_to_T_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_T"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"odds_ratio_tCw_to_T"	"p-value_GvT_skew"	"BH_p-value_GvT_skew"	"bonferroni_p-value_GvT_skew"	"non-APOBEC_mutations"	"non-APOBEC_substitutions"	"APOBEC_MutLoad_MinEstimate"
"TCGA-B7-5816-01A-21D-1600-08"	0	0	0	0	1530	2	34	115	149	1379	56539	10	168	32	210	13237	14	176	32	222	13319	10	61	393	464	14972	10	90	383	483	15011	0	7	8	15	1935	0.00980392156862745	0.031055900621118	0.128905469322497	0.240919960839071	0.00775193798449612	1	4	12	17	1854	0.0111111111111111	0.0366379310344828	0.123831151482768	0.295870066584831	0.00916936353829558	0.0137254901960784	21	775	3789	26194	1	1	1	0.187330121003595	0.124756603779933	Inf	0.208764527307957	0.395658485088414	0.932912272636213	1	1	0.36385907480503	0.203947672725987	1	1	1	0.182893521443901	3.57808500464659e-07	7.95435820263742e-06	0.000103406656634286	1509	1358	0
"TCGA-B7-5818-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	461	2	6	8	14	444	18204	15	53	43	111	4656	12	29	58	99	4670	2	9	96	107	4433	6	14	107	127	4445	1	1	20	22	655	0.0477223427331887	0.173228346456693	0.147356580427447	1.17557251908397	0.033587786259542	1	2	19	22	683	0.0477223427331887	0.205607476635514	0.154071734716896	1.33449186519068	0.0322108345534407	0.0889370932754881	41	170	1338	7540	0.053066402726536	0.818497230790799	1	1.3590435768604	0.994537083453	Inf	1.28931913657648	1.65881913303438	0.345357763210374	0.66098273885959	1	1.8782093684112	1.2747575603614	0.0665302688122739	1	1	1.34004711925957	9.63985675834167e-17	6.96479650790186e-15	2.78591860316074e-14	420	403	0
"TCGA-BR-4183-01A-02D-1126-08"	0	0	0	0	70	0	0	4	4	66	2706	2	4	2	8	599	0	2	3	5	706	1	4	18	23	674	1	3	26	30	727	0	2	0	2	98	0.0285714285714286	0.0666666666666667	0.134800550206327	0.494557823129252	0.0204081632653061	0	0	1	1	84	0.0142857142857143	0.0434782608695652	0.124629080118694	0.348861283643892	0.0119047619047619	0.0142857142857143	1	45	182	1219	0.998210211292866	1	1	0.148941032705355	0.00746353438676248	Inf	0.167343526039178	0	1	1	1	0	0.17495004995005	0.997654215225681	1	1	0.155867552397484	1	1	1	69	65	0
"TCGA-BR-4184-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	4604	9	41	265	306	4289	175849	27	210	31	268	40899	40	220	20	280	41429	11	129	1710	1850	46553	14	124	1753	1891	46968	1	15	16	32	5882	0.00695047784535187	0.0169222633527234	0.125234202009879	0.135124934571696	0.00544032641958518	2	12	17	31	5842	0.00673327541268462	0.0167567567567568	0.125491375421563	0.13352915051306	0.00530640191715166	0.00781928757602085	36	3452	11724	81797	1	1	1	0.0727609077923442	0.0539050066831936	Inf	0.0823302353206314	0.957226202661208	0.622479350880384	0.887739152519115	1	0.951389604017125	0.0760142089898447	1	1	1	0.0671253023969955	1.6637707077461e-09	6.01037168173279e-08	4.80829734538623e-07	4568	4253	0
"TCGA-BR-4187-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	37	0	0	2	2	35	1435	0	1	1	2	296	0	1	1	2	380	0	2	16	18	361	0	1	12	13	398	0	1	0	1	63	0.027027027027027	0.0769230769230769	0.158291457286432	0.485958485958486	0.0158730158730159	0	1	1	2	41	0.0540540540540541	0.111111111111111	0.113573407202216	0.978319783197832	0.0487804878048781	0.027027027027027	1	27	104	655	0.983183875688239	1	1	0.233522237853691	0.0114698191475418	Inf	0.260645604395604	NA	1	1	1	0	0.260645604395604	0.983183875688239	1	1	0.233522237853691	1	1	1	36	34	0
"TCGA-BR-4188-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	83	1	2	0	2	80	3280	1	6	0	7	719	0	5	0	5	788	2	5	36	43	839	3	1	21	25	934	1	0	0	1	114	0.0120481927710843	0.04	0.122055674518201	0.327719298245614	0.0087719298245614	1	2	1	4	109	0.0481927710843374	0.0930232558139535	0.129916567342074	0.716023042457862	0.036697247706422	0.036144578313253	3	59	223	1550	0.98749945126425	1	1	0.353561461787483	0.0931136011746082	Inf	0.38470996672935	3.18026905829596	0.123092160232774	0.359329639467391	1	4.62752687437715	0.139485485012981	0.999482676330188	1	1	0.124187689859912	1	1	1	80	77	0
"TCGA-BR-4191-01A-02D-1126-08"	0	1	0	1	223	0	0	17	17	203	8323	10	11	10	31	2015	7	7	7	21	2093	23	18	43	84	2118	20	15	32	67	2097	8	2	7	17	322	0.0762331838565022	0.253731343283582	0.153552694325227	1.65240567349587	0.0527950310559006	3	1	6	10	299	0.0448430493273543	0.119047619047619	0.141170915958451	0.843287147634974	0.0334448160535117	0.10762331838565	24	94	621	3594	0.0640023710838641	0.8200464148518	1	1.47748975778051	0.969568422110856	Inf	1.38049619258168	1.73632176159982	0.0448782748034552	0.192015668093548	1	1.98909966536711	1.17648953301127	0.310765476710241	1	1	1.21341838292757	0.784553146909804	1	1	199	179	0
"TCGA-BR-4201-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1645	3	49	248	297	1345	55145	12	109	7	128	12756	16	104	17	137	12890	8	55	488	551	14627	4	46	479	529	14872	0	7	7	14	1844	0.00851063829787234	0.0264650283553875	0.123991393222162	0.213442462961672	0.00759219088937093	1	1	9	11	1803	0.00668693009118541	0.0199637023593466	0.123265194503316	0.161957334670085	0.00610094287298946	0.0103343465045593	17	962	3647	25852	1	1	1	0.125269834508032	0.0794318203024424	Inf	0.140455179834938	0.674047162051001	0.794788050370822	1	1	0.644423648319762	0.133833562682308	1	1	1	0.119264789870186	1.0592858856819e-05	0.000127555675400862	0.00306133620962069	1628	1328	0
"TCGA-BR-4253-01A-01D-1126-08"	0	1	0	1	99	0	0	4	4	95	3895	1	6	10	17	1003	2	4	7	13	981	4	1	24	29	948	1	5	30	36	963	0	0	5	5	138	0.0505050505050505	0.138888888888889	0.143302180685358	0.969202898550725	0.036231884057971	3	0	2	5	151	0.0505050505050505	0.172413793103448	0.159282700421941	1.08243891299383	0.033112582781457	0.101010101010101	10	49	289	1622	0.405390768768781	1	1	1.14528117000229	0.582600663260195	Inf	1.12075538091608	3.96747404844291	0.0276164397127241	0.147799094018098	1	8.40333309675378	0.857170319108035	0.726858975145446	1	1	0.835970043107581	0.178895407997576	0.390302037298702	1	89	85	0
"TCGA-BR-4255-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	70	0	0	3	3	67	2747	3	4	2	9	695	1	8	1	10	673	1	2	20	23	671	2	2	21	25	708	1	1	1	3	103	0.0428571428571429	0.12	0.145480225988701	0.824854368932039	0.029126213592233	0	1	1	2	101	0.0285714285714286	0.0869565217391304	0.150521609538003	0.577701248385708	0.0198019801980198	0.0428571428571429	3	41	204	1175	0.966407644018449	1	1	0.421636890389391	0.109685002183381	Inf	0.460895721925134	2.25326797385621	0.382494481446411	0.68235126628403	1	2.87684318922711	0.329746532759445	0.987999578190622	1	1	0.295540265114237	1	1	1	67	64	0
"TCGA-BR-4256-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1168	1	29	114	143	1023	41943	9	105	22	136	10167	17	116	22	155	9982	5	47	303	355	10692	9	61	307	377	11102	1	4	8	13	1449	0.0111301369863014	0.0344827586206897	0.130517023959647	0.264201232716975	0.00897170462387854	1	6	14	21	1524	0.0179794520547945	0.0591549295774648	0.142536475869809	0.415016080736387	0.0137795275590551	0.0205479452054795	24	600	2973	18821	1	1	1	0.253234863514967	0.173123798322713	Inf	0.281947786488654	1.04723463552929	0.58801130248147	0.858258921298711	1	1.0551173086977	0.264383826018869	1	1	1	0.236869626698944	4.22279903001701e-07	8.71706371196368e-06	0.000122038891967492	1144	999	0
"TCGA-BR-4257-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1273	0	34	139	173	1100	45100	11	140	20	171	10748	16	121	17	154	10704	5	55	311	371	11732	7	62	335	404	11916	0	9	5	14	1525	0.0109976433621367	0.0346534653465347	0.127979187646861	0.27077422496348	0.00918032786885246	0	4	4	8	1576	0.00628436763550668	0.0215633423180593	0.134333446982612	0.160521022890528	0.0050761421319797	0.00706991358994501	9	649	3101	20547	1	1	1	0.0918889501726726	0.0477010753044335	Inf	0.104305994046435	0	1	1	1	0	0.10624356669126	1	1	1	0.0936199730343626	0.00140329692229863	0.00803061756004509	0.405552810544304	1264	1091	0
"TCGA-BR-4267-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	103	0	0	3	3	100	4100	5	7	8	20	1051	4	3	4	11	999	12	7	14	33	1029	14	3	19	36	1021	4	1	1	6	131	0.058252427184466	0.166666666666667	0.128305582761998	1.29898218829517	0.0458015267175573	3	1	1	5	154	0.0485436893203883	0.151515151515152	0.149659863945578	1.01239669421488	0.0324675324675325	0.087378640776699	9	50	285	1765	0.441151259045527	1	1	1.11471330225841	0.547297181620646	Inf	1.09723461195361	1.93657219973009	0.0616060515717759	0.237388652056576	1	2.28043962887592	0.435938330675173	0.954117629189243	1	1	0.3996728550812	0.0804953560371517	0.213423466924191	1	94	91	0
"TCGA-BR-4279-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	57	0	1	3	4	53	2173	1	8	1	10	494	2	2	2	6	548	1	3	17	21	589	2	1	13	16	542	1	0	0	1	80	0.0175438596491228	0.0625	0.14760147601476	0.4234375	0.0125	0	1	0	1	70	0.0175438596491228	0.0476190476190476	0.118845500848896	0.400680272108844	0.0142857142857143	0.0175438596491228	1	32	150	981	0.990478677885575	1	1	0.204534368724203	0.0101368444164424	Inf	0.228484848484848	2.51333333333333	0.348904607995829	0.663377840202596	1	3.26500766453579	0	1	1	1	0	1	1	1	56	52	0
"TCGA-BR-4280-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	869	12	26	122	148	709	29069	5	106	32	143	6876	7	89	33	129	6748	11	39	165	215	7649	5	50	167	222	7796	1	1	2	4	978	0.0046029919447641	0.018018018018018	0.125448948178553	0.143628290867555	0.00408997955010225	1	2	4	7	991	0.00805523590333717	0.0325581395348837	0.129559419531965	0.251298899396898	0.0070635721493441	0.00920598388952819	8	340	1969	13476	0.999999999999318	1	1	0.161046948687721	0.0794449132083748	Inf	0.180323753816337	0.980510411376333	0.623567640004776	0.887739152519115	1	0.977726593749552	0.141760541403807	0.999999999999923	1	1	0.125972695238268	0.18266253869969	0.390302037298702	1	861	701	0
"TCGA-BR-4292-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1645	15	64	221	285	1345	55145	14	77	22	113	12428	16	83	21	120	12490	9	56	465	530	15044	6	58	518	582	15183	1	2	4	7	1750	0.00425531914893617	0.0120274914089347	0.115260488704472	0.104350515463918	0.004	1	7	6	14	1705	0.00851063829787234	0.0264150943396226	0.113334219622441	0.233072539146794	0.00821114369501466	0.00729483282674772	12	986	3455	26772	1	1	1	0.0943086491798742	0.0541810627328836	Inf	0.105195630044459	1.16650265315967	0.524747911639034	0.802392309331645	1	1.19211031973941	0.0890007110752547	1	1	1	0.0796406206074193	0.0147893763157335	0.0593629132673192	1	1633	1333	0
"TCGA-BR-4294-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	33	1	2	0	2	30	1230	1	0	1	2	295	2	1	0	3	342	2	3	10	15	299	2	2	6	10	294	0	0	1	1	49	0.0303030303030303	0.1	0.166666666666667	0.6	0.0204081632653061	0	0	2	2	30	0.0606060606060606	0.133333333333333	0.100334448160535	1.32888888888889	0.0666666666666667	0.0909090909090909	3	17	79	514	0.514682902236194	1	1	1.14787558735049	0.280420964942041	Inf	1.12594936708861	0	1	1	1	0	1.40743670886076	0.367765350553805	1	1	1.50030679867879	0.1	0.255752212389381	1	30	27	0
"TCGA-BR-4357-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	281	2	2	4	6	272	11152	11	28	19	58	2835	13	17	22	52	2921	16	18	40	74	2718	18	24	46	88	2678	13	4	11	28	434	0.099644128113879	0.318181818181818	0.162061239731143	1.9633431085044	0.0645161290322581	9	4	5	18	425	0.0640569395017794	0.243243243243243	0.156364974245769	1.55561208267091	0.0423529411764706	0.135231316725979	38	82	859	4537	1.7981022883665e-05	0.00259825780668959	0.00519651561337919	2.44711002689644	1.71862772696448	Inf	1.98921226232053	4.06464425118126	2.56280347677405e-10	3.7032510239385e-08	7.406502047877e-08	9.67560897405615	1.16869263881745	0.291310448299256	1	1	1.20718201739259	0.289713385323803	0.561927304419994	1	243	234	19
"TCGA-BR-4361-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	3357	15	72	291	363	2979	122139	56	624	36	716	29207	62	621	30	713	29488	28	84	657	769	31934	15	86	680	781	31510	3	7	32	42	4094	0.0125111706881144	0.0537772087067862	0.12992700729927	0.413903235552231	0.0102589154860772	2	5	24	31	4146	0.00923443550789395	0.0403120936280884	0.129830274942068	0.310498407602358	0.00747708634828751	0.0181709859994042	61	1319	8240	55204	1	1	1	0.309836686350019	0.246171079138779	Inf	0.340340861122837	0.89529239105893	0.672416541661736	0.938784447054308	1	0.881491496626176	0.322492756569918	1	1	1	0.292878114245047	6.60380401202805e-19	6.36166453158702e-17	1.90849935947611e-16	3296	2918	0
"TCGA-BR-4362-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	2061	3	78	250	328	1729	70889	25	229	47	301	16493	30	265	68	363	16929	13	72	450	535	18717	12	57	461	530	18750	2	3	11	16	2473	0.00776322173702086	0.030188679245283	0.131893333333333	0.228887074746889	0.00646987464617873	1	7	2	10	2388	0.00485201358563804	0.0186915887850467	0.127584548805898	0.146503545766214	0.00418760469011725	0.00776322173702086	16	920	4861	32606	1	1	1	0.116658262113053	0.0727986552372742	Inf	0.131755099457218	0.924920798189673	0.646926199285276	0.916478782320808	1	0.914670967773278	0.109988752071586	1	1	1	0.097107034251776	0.00586431228108256	0.0282464374872143	1	2045	1713	0
"TCGA-BR-4363-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	689	4	24	140	164	520	21320	5	43	7	55	4863	6	64	12	82	4768	1	26	164	191	5900	3	18	171	192	5789	0	1	0	1	652	0.00145137880986938	0.00520833333333333	0.11262739678701	0.0462439289366053	0.00153374233128834	0	1	2	3	687	0.00435413642960813	0.0157068062827225	0.116440677966102	0.134891058323236	0.00436681222707424	0.00290275761973875	2	337	1339	10350	1	1	1	0.0458696493376189	0.00812353167145938	Inf	0.0515023539338343	0	1	1	1	0	0.0521173074136413	1	1	1	0.046421701430099	0.428571428571429	0.707755102040817	1	687	518	0
"TCGA-BR-4366-01A-01D-1158-08"	1	1	0	2	164	2	2	0	2	160	6560	4	15	8	27	1584	2	12	11	25	1599	14	7	38	59	1703	11	8	30	49	1674	2	2	1	5	220	0.0304878048780488	0.102040816326531	0.13142174432497	0.776437847866419	0.0227272727272727	6	2	4	12	207	0.0731707317073171	0.203389830508475	0.121550205519671	1.67329894374846	0.0579710144927536	0.0792682926829268	13	80	427	2950	0.397915335950601	1	1	1.12258574661137	0.634339892611879	Inf	1.10551232655939	2.53077283372365	0.00997852636141728	0.0757471022889128	1	3.24951344647163	0.581519493043119	0.941102896078974	1	1	0.548384712717418	0.481265818703551	0.776199461006737	1	151	147	0
"TCGA-BR-4368-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1638	4	48	208	256	1377	56457	16	126	10	152	12744	12	116	14	142	12991	15	46	458	519	15126	9	78	477	564	15596	1	7	14	22	1841	0.0134310134310134	0.0390070921985816	0.118043087971275	0.330447914138554	0.0119500271591526	5	5	6	16	1745	0.00976800976800977	0.0308285163776493	0.115364273436467	0.267227586663796	0.00916905444126074	0.0158730158730159	26	933	3586	27136	1	1	1	0.210881846324855	0.146872248935749	Inf	0.232270438799479	2.14180145008366	0.0534538296117188	0.208758875105226	1	2.52247575234525	0.183255739044591	1	1	1	0.165408302262112	0.00141716780471384	0.00803061756004509	0.4095614955623	1612	1351	0
"TCGA-BR-4369-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	200	0	0	1	1	198	8118	5	11	12	28	1970	7	11	28	46	1949	6	6	52	64	2076	7	8	45	60	2123	4	4	3	11	289	0.055	0.183333333333333	0.136128120584079	1.34677047289504	0.0380622837370242	2	1	7	10	285	0.05	0.15625	0.13728323699422	1.13815789473684	0.0350877192982456	0.08	16	94	574	3625	0.438394111119073	1	1	1.07495095097248	0.646471684523085	Inf	1.06404814697498	3.37630662020906	0.00482470926319537	0.0497978920379808	1	5.40968364954113	0.754157836129171	0.867647136119624	1	1	0.725949252878552	0.340791997944932	0.615555546288033	1	184	182	0
"TCGA-BR-4370-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1332	1	46	166	212	1119	45879	9	46	10	65	10010	7	74	9	90	10269	4	42	422	468	12754	7	43	446	496	12846	0	4	8	12	1461	0.00900900900900901	0.0241935483870968	0.11373190098085	0.212724382327615	0.0082135523613963	1	5	9	15	1295	0.0112612612612613	0.032051282051282	0.101536772777168	0.315661815661816	0.0115830115830116	0.0135135135135135	18	861	2756	22844	1	1	1	0.173291579258496	0.111349607079995	Inf	0.190214833784928	0.844438580287637	0.714385657505071	0.979914413171458	1	0.82886137504015	0.181923979854595	1	1	1	0.165587535929774	4.79676627478597e-06	7.29613396533234e-05	0.00138626545341315	1314	1101	0
"TCGA-BR-4371-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	182	0	0	0	0	182	7462	2	8	6	16	1724	1	7	4	12	1735	5	7	56	68	2025	2	10	74	86	1978	1	4	3	8	243	0.043956043956044	0.0930232558139535	0.122851365015167	0.757201646090535	0.0329218106995885	1	2	7	10	271	0.0549450549450549	0.147058823529412	0.133827160493827	1.09887128283048	0.03690036900369	0.0659340659340659	12	125	514	3489	0.944386776311322	1	1	0.65170118403158	0.364867040312542	Inf	0.682155130790423	2.22512506948305	0.224475902641097	0.510815243017929	1	2.71422497188513	0.599072134091589	0.975629088184032	1	1	0.565726759299404	0.0116425658138673	0.048067164574395	1	170	170	0
"TCGA-BR-6452-01A-12D-1800-08"	0	0	2	2	8736	33	107	351	458	8239	337799	364	1401	157	1922	81617	360	1417	159	1936	83882	43	404	1791	2238	85497	70	439	1634	2143	86803	8	44	87	139	12090	0.0159111721611722	0.0648623425104993	0.139280900429709	0.465694451359708	0.0114971050454921	11	36	92	139	11651	0.0159111721611722	0.0621090259159964	0.136273787384353	0.455766491180152	0.0119303064114668	0.0226648351648352	198	3340	23741	148559	1	1	1	0.370953275507082	0.327353179782698	Inf	0.406156708719396	1.22028543280304	0.208512885908607	0.504675394527314	1	1.26480562260966	0.379296403370067	1	1	1	0.345068429147819	8.54475177311457e-50	1.23471663121506e-47	2.46943326243011e-47	8538	8041	0
"TCGA-BR-6453-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	220	1	0	1	1	218	8938	7	16	30	53	2246	3	22	35	60	2232	2	6	44	52	2228	3	3	47	53	2232	0	0	5	5	313	0.0227272727272727	0.0943396226415094	0.140232974910394	0.672734944842968	0.0159744408945687	0	1	3	4	312	0.0181818181818182	0.0769230769230769	0.140035906642729	0.54930966469428	0.0128205128205128	0.0363636363636364	8	88	625	3835	0.966602097420479	1	1	0.557878214038826	0.268774427667704	Inf	0.594666666666667	0	1	1	1	0	0.627340659340659	0.950204098297454	1	1	0.591480049114978	0.000411353352529823	0.00270184361093452	0.118881118881119	212	210	0
"TCGA-BR-6454-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	175	1	1	7	8	166	6806	4	13	11	28	1594	14	7	7	28	1613	9	10	35	54	1770	10	10	36	56	1829	4	2	3	9	219	0.0514285714285714	0.160714285714286	0.119737561509021	1.34222113502935	0.0410958904109589	4	6	4	14	231	0.08	0.259259259259259	0.130508474576271	1.98653198653199	0.0606060606060606	0.0857142857142857	15	75	450	3149	0.154875676281876	1	1	1.39940845442959	0.819932618161125	Inf	1.33296296296296	3.36748538011696	0.00131051467026302	0.0228634646210723	0.378738739706013	5.08560503824851	0.788513302034429	0.798974112493905	1	1	0.765432878675011	1	1	1	160	151	0
"TCGA-BR-6455-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	113	1	0	1	1	111	4551	2	4	1	7	999	0	6	1	7	1030	2	4	53	59	1205	1	8	29	38	1317	0	1	2	3	157	0.0265486725663717	0.0789473684210526	0.11921032649962	0.662252765672142	0.0191082802547771	1	0	2	3	128	0.0265486725663717	0.0508474576271186	0.106224066390041	0.478681144067797	0.0234375	0.0442477876106195	5	80	285	2237	0.968437106194136	1	1	0.490674456217244	0.187171520413791	Inf	0.520536635706914	2.94970760233918	0.302872561995162	0.633396020065813	1	3.92076469288985	0.431664527171587	0.985909889630364	1	1	0.402619189025356	0.242424242424242	0.48317659352142	1	108	106	0
"TCGA-BR-6456-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	51	0	0	3	3	47	1927	2	3	1	6	472	0	4	2	6	465	1	7	12	20	511	2	4	9	15	479	1	0	1	2	69	0.0392156862745098	0.133333333333333	0.144050104384134	0.9256038647343	0.0289855072463768	0	2	1	3	58	0.0588235294117647	0.15	0.113502935420744	1.32155172413793	0.0517241379310345	0.0588235294117647	3	21	127	863	0.612654948892318	1	1	0.970779478452571	0.242897851200624	Inf	0.974409448818898	2.59842519685039	0.339297316822064	0.65371283041051	1	3.39146302706163	0.742407199100112	0.771461110380946	1	1	0.715502837521843	1	1	1	48	44	0
"TCGA-BR-6457-01A-21D-1800-08"	0	0	0	0	142	0	0	1	1	140	5740	6	7	11	24	1357	2	10	15	27	1435	2	8	35	45	1437	3	8	33	44	1511	1	2	4	7	206	0.0492957746478873	0.159090909090909	0.13633355393779	1.16692409532215	0.0339805825242718	0	5	1	6	194	0.0422535211267606	0.133333333333333	0.13500347947112	0.987628865979381	0.0309278350515464	0.0422535211267606	6	67	400	2548	0.941183638306749	1	1	0.570536316268195	0.239207234924259	Inf	0.605753424657534	1.474	0.518213340822543	0.802392309331645	1	1.59219513256476	0.541911764705882	0.961615367739693	1	1	0.505647052239878	0.160248447204969	0.367553978112984	1	136	134	0
"TCGA-BR-6458-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	342	2	1	3	4	336	13776	11	24	70	105	3382	10	32	61	103	3497	11	7	50	68	3486	4	9	47	60	3411	2	2	2	6	523	0.0175438596491228	0.1	0.153327469950161	0.652198852772467	0.011472275334608	5	1	5	11	506	0.0321637426900585	0.161764705882353	0.145152036718302	1.11445012787724	0.0217391304347826	0.0409356725146199	14	98	1029	5868	0.799317376985331	1	1	0.814683173441464	0.475260825723472	Inf	0.837827988338192	3.12789115646259	0.00355020329740439	0.0446090762152117	1	4.98814762350702	0.483694508731328	0.992952979009377	1	1	0.443574227141739	1	1	1	328	322	0
"TCGA-BR-6563-01A-13D-2053-08"	0	0	0	0	86	0	0	1	1	85	3485	2	5	7	14	841	3	6	5	14	839	3	0	25	28	862	0	3	26	29	943	0	1	1	2	112	0.0232558139534884	0.0689655172413793	0.118769883351007	0.580665024630542	0.0178571428571429	0	0	1	1	108	0.0116279069767442	0.0357142857142857	0.125290023201856	0.28505291005291	0.00925925925925926	0.0232558139534884	2	52	220	1585	0.991980580301433	1	1	0.277218081003226	0.0477460160657604	Inf	0.303872053872054	0	1	1	1	0	0.32174688057041	0.988829360917348	1	1	0.294187311655571	0.4	0.684576117422447	1	84	83	0
"TCGA-BR-6564-01A-12D-1882-08"	0	0	0	0	42	0	1	2	3	39	1599	2	4	0	6	378	1	1	1	3	368	3	2	13	18	443	0	2	10	12	410	0	0	1	1	52	0.0238095238095238	0.0833333333333333	0.126829268292683	0.657051282051282	0.0192307692307692	2	1	1	4	49	0.0952380952380952	0.222222222222222	0.110609480812641	2.00907029478458	0.0816326530612245	0.0952380952380952	4	22	101	752	0.377657707230861	1	1	1.35321338427008	0.419597484624601	Inf	1.2993145468393	5.63036303630363	0.0396690362339125	0.179130491743761	1	14.8005031774211	0.7343951786483	0.77508223943843	1	1	0.709345407120617	1	1	1	38	35	0
"TCGA-BR-6565-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	169	0	2	1	3	164	6724	4	13	7	24	1627	0	9	5	14	1613	22	8	36	66	1736	11	11	38	60	1748	3	3	0	6	241	0.0355029585798817	0.1	0.137871853546911	0.725311203319502	0.024896265560166	7	1	2	10	230	0.0591715976331361	0.151515151515152	0.132488479262673	1.14361001317523	0.0434782608695652	0.0710059171597633	12	95	471	3013	0.794416989804471	1	1	0.80809052159843	0.448892398977611	Inf	0.829573188880291	2.24152351540887	0.0101560164550381	0.0757471022889128	1	2.78018989577231	0.199919664887818	0.999707974761817	1	1	0.177742072062086	0.00914703938353406	0.0406691443360207	1	157	152	0
"TCGA-BR-6566-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	1172	1	33	116	149	1021	41861	11	100	36	147	9357	6	110	25	141	9669	6	54	305	365	11347	11	65	292	368	11488	1	2	6	9	1305	0.00767918088737201	0.0244565217391304	0.113596796657382	0.215292353823088	0.00689655172413793	0	5	2	7	1327	0.00597269624573379	0.0191780821917808	0.116947210716489	0.163989222780812	0.0052750565184627	0.00767918088737201	9	605	2632	20203	1	1	1	0.114192021478498	0.0592481867322227	Inf	0.127171346395652	0.510347756123726	0.875300126551025	1	1	0.479756554203618	0.116260125348119	1	1	1	0.104261404332635	0.0154987022617724	0.0605287155898949	1	1163	1012	0
"TCGA-BR-6705-01A-12D-1882-08"	0	0	0	0	120	0	0	0	0	120	4920	5	10	5	20	1165	3	6	7	16	1272	8	7	27	42	1203	6	3	33	42	1280	3	0	3	6	185	0.05	0.142857142857143	0.14453125	0.988416988416988	0.0324324324324324	2	2	3	7	157	0.0583333333333333	0.166666666666667	0.13050706566916	1.27707006369427	0.0445859872611465	0.0916666666666667	11	63	342	2141	0.445948549319394	1	1	1.09304424355773	0.581086110954959	Inf	1.07922396080291	2.59294068504595	0.0344920283902261	0.168047291034132	1	3.47539557354209	0.726023391812865	0.849987030924985	1	1	0.695669980030803	1	1	1	109	109	0
"TCGA-BR-6706-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	256	0	1	3	4	251	10291	6	40	38	84	2603	7	35	45	87	2596	3	7	32	42	2552	2	2	34	38	2540	0	0	4	4	385	0.015625	0.105263157894737	0.151574803149606	0.694463431305536	0.0103896103896104	1	1	3	5	387	0.01953125	0.119047619047619	0.151645768025078	0.785037529223576	0.0129198966408269	0.03125	8	63	772	4320	0.8612085760257	1	1	0.710627711382841	0.339002297133476	Inf	0.743194920820258	1.31917098445596	0.560759033564025	0.83535752938146	1	1.39885767710319	0.699560370544826	0.889367976852348	1	1	0.663962252979761	0.0152200740436034	0.060254813679471	1	248	243	0
"TCGA-BR-6707-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	80	0	0	2	2	78	3198	0	2	0	2	758	3	8	0	11	804	1	6	24	31	830	2	5	27	34	806	0	0	1	1	105	0.0125	0.0294117647058824	0.130272952853598	0.225770308123249	0.00952380952380952	0	5	4	9	99	0.1125	0.290322580645161	0.119277108433735	2.43401759530792	0.0909090909090909	0.0625	5	49	204	1432	0.818159015427642	1	1	0.716412798276115	0.268358268295334	Inf	0.742556281771968	0	1	1	1	0	0.786236063052672	0.777703706816946	1	1	0.763112399849334	0.0325077399380805	0.111842105263158	1	75	73	0
"TCGA-BR-6710-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	1	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	1	1	1	0	0	Inf	NA	NA	1	1	1	0	NA	1	1	1	0	1	1	1	1	0	0
"TCGA-BR-6801-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	58	0	2	3	5	53	2173	0	3	0	3	496	1	0	0	1	478	3	1	18	22	599	2	2	23	27	600	0	1	3	4	78	0.0689655172413793	0.148148148148148	0.13	1.13960113960114	0.0512820512820513	3	0	2	5	65	0.0862068965517241	0.227272727272727	0.108514190317195	2.09440559440559	0.0769230769230769	0.137931034482759	8	38	143	1056	0.1845455540009	1	1	1.55400935371854	0.713370150199013	Inf	1.45819397993311	5.03076923076923	0.0145307402399462	0.0893485942413713	1	11.0316709082952	1.02251407129456	0.553352550213515	1	1	1.02562315497316	0.637186343068696	0.944342836650529	1	50	45	0
"TCGA-BR-6802-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	582	1	19	47	66	515	21115	8	45	11	64	4738	7	41	7	55	4867	3	26	179	208	5645	3	25	160	188	5865	1	5	3	9	693	0.0154639175257732	0.0478723404255319	0.118158567774936	0.405153357281017	0.012987012987013	1	1	0	2	647	0.00343642611683849	0.00961538461538462	0.114614703277236	0.0838931161574129	0.00309119010819165	0.00859106529209622	5	340	1340	10170	0.999999999999909	1	1	0.111620618665592	0.0436523875597452	Inf	0.124486264330521	2.86318407960199	0.148156563437566	0.411498912689185	1	3.79407900035804	0.0760137366266015	0.999999999999999	1	1	0.0677699986115988	1	1	1	577	510	0
"TCGA-BR-6803-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	20	0	0	2	2	18	738	0	1	1	2	179	0	0	0	0	180	1	3	8	12	179	1	1	2	4	200	0	0	0	0	24	0	0	0.12	0	0	1	0	0	1	20	0.05	0.0833333333333333	0.111731843575419	0.745833333333333	0.05	0.05	1	11	44	335	0.774548090351811	1	1	0.692718988277574	0.0319067947050186	Inf	0.71780303030303	4.30681818181818	0.222544550352259	0.510815243017929	1	7.53974426059931	0	1	1	1	0	1	1	1	19	17	0
"TCGA-BR-6852-01A-11D-1882-08"	0	0	1	1	1373	3	43	148	191	1177	48257	9	97	31	137	10545	15	101	33	149	11020	3	70	363	436	13320	11	67	377	455	13372	2	6	5	13	1531	0.00946831755280408	0.0285714285714286	0.114492970385881	0.249547447979845	0.0084911822338341	0	6	5	11	1462	0.00801165331391114	0.0252293577981651	0.10975975975976	0.229859812497647	0.00752393980848153	0.00873998543335761	12	742	2993	23699	1	1	1	0.128060810220446	0.0735168884429658	Inf	0.141933299715251	1.27402033315832	0.47644194476422	0.773549000207076	1	1.31967194523413	0.120515436920382	1	1	1	0.108471704985195	0.0173369017336625	0.0668048613470462	1	1361	1165	0
"TCGA-BR-7196-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	84	0	0	3	3	81	3321	4	2	3	9	795	4	4	4	12	761	4	2	28	34	844	6	7	13	26	921	1	2	2	5	116	0.0595238095238095	0.192307692307692	0.125950054288817	1.52685676392573	0.0431034482758621	2	0	1	3	108	0.0357142857142857	0.0882352941176471	0.127962085308057	0.689542483660131	0.0277777777777778	0.0714285714285714	6	45	224	1541	0.642588784000446	1	1	0.917286804957496	0.377146193629415	Inf	0.926995798319328	2.36383928571429	0.125410168404824	0.362435386689941	1	2.9457642527519	0.576546167247387	0.905848141905586	1	1	0.543264004984492	1	1	1	78	75	0
"TCGA-BR-7197-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	200	1	4	3	7	192	7872	5	8	16	29	1794	7	14	25	46	2017	3	3	59	65	2036	3	8	41	52	2025	2	0	4	6	302	0.03	0.115384615384615	0.149135802469136	0.773688232297504	0.0198675496688742	2	0	3	5	247	0.025	0.0769230769230769	0.121316306483301	0.634070383058237	0.0202429149797571	0.055	11	95	549	3512	0.861810476752004	1	1	0.740763896665424	0.400874606324683	Inf	0.767622091624566	4.93139040680024	0.00404300259100762	0.0485618281505634	1	12.7799631325928	0.517795992714026	0.985805426288062	1	1	0.481568165943327	0.394855918075732	0.683313534873572	1	189	181	0
"TCGA-BR-7703-01A-11D-2053-08"	0	1	0	1	858	6	24	89	113	739	30299	4	55	10	69	6664	7	60	7	74	6953	9	38	285	332	8255	8	35	221	264	8427	2	8	4	14	991	0.0163170163170163	0.053030303030303	0.117598196273882	0.450944867443354	0.0141271442986882	4	2	3	9	950	0.0104895104895105	0.0271084337349398	0.115081768625076	0.235558021559924	0.00947368421052632	0.0151515151515152	13	510	1941	14741	0.999999999999996	1	1	0.193596448701402	0.113602482537868	Inf	0.213630985979315	3.03336666969725	0.00987321181018842	0.0757471022889128	1	4.14233057020272	0.118896783166657	1	1	1	0.106542949811073	1	1	1	845	726	0
"TCGA-BR-7707-01A-11D-2053-08"	0	0	1	1	1712	9	40	136	176	1526	62566	18	175	32	225	14076	11	159	31	201	14408	6	77	467	550	16906	11	72	467	550	17176	2	2	11	15	1981	0.00876168224299065	0.0272727272727273	0.11533535165347	0.236464595475196	0.00757193336698637	0	6	10	16	2001	0.00934579439252336	0.0290909090909091	0.118360345439489	0.245782563263823	0.0079960019990005	0.0134345794392523	23	928	3982	30100	1	1	1	0.187351122949738	0.127324394177744	Inf	0.207000376563093	1.00694300824298	0.607012932276862	0.881541394110619	1	1.00786889959185	0.192440392902967	1	1	1	0.173870219619068	7.12372401949819e-07	1.37250416108998e-05	0.000205875624163498	1689	1503	0
"TCGA-BR-7715-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	164	0	0	8	8	156	6396	3	15	10	28	1589	0	13	9	22	1498	5	8	36	49	1692	1	9	47	57	1617	0	1	1	2	216	0.0121951219512195	0.0350877192982456	0.133580705009276	0.262670565302144	0.00925925925925926	2	1	3	6	223	0.0365853658536585	0.122448979591837	0.131796690307329	0.929074768921021	0.0269058295964126	0.0365853658536585	6	83	439	2870	0.982427678314409	1	1	0.472678179932047	0.199495486622398	Inf	0.508151826162627	2.5125284738041	0.184296255361951	0.463465148786602	1	3.26710066981776	0.363257128742762	0.996664076867969	1	1	0.33108899243441	0.608391608391609	0.91575611888112	1	158	150	0
"TCGA-BR-7716-01A-21D-2053-08"	0	0	0	0	175	1	0	2	2	171	7011	4	11	6	21	1877	9	7	4	20	1724	23	11	37	71	1733	13	14	32	59	1677	11	6	8	25	265	0.142857142857143	0.423728813559322	0.158020274299344	2.68148385033578	0.0943396226415094	16	7	17	40	309	0.228571428571429	0.563380281690141	0.178303519907675	3.15966999407448	0.129449838187702	0.297142857142857	52	53	574	2836	4.36103622750245e-14	1.26033946974821e-11	1.26033946974821e-11	4.84451053031071	3.41447207248823	Inf	2.94209391073503	4.45557491289199	3.91218788503894e-14	1.13062229877625e-11	1.13062229877625e-11	14.8065548277702	2.15245164874009	0.000103089415917506	0.0297928412001592	0.0297928412001592	2.80602517437006	0.858022939274979	1	1	123	119	34
"TCGA-BR-7717-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	167	0	0	3	3	162	6642	6	8	7	21	1557	6	14	9	29	1626	9	6	46	61	1694	9	3	39	51	1765	2	0	3	5	262	0.029940119760479	0.0980392156862745	0.148441926345609	0.660455021703338	0.0190839694656489	3	0	4	7	247	0.0419161676646707	0.114754098360656	0.145808736717828	0.787017986327736	0.0283400809716599	0.0718562874251497	12	91	509	2950	0.843963375549009	1	1	0.764318776175323	0.424210946756281	Inf	0.791729452381407	1.88768827766863	0.114389617196718	0.34436041010262	1	2.2284449021844	0.559644054085288	0.973788749386169	1	1	0.520204144062681	0.684272652909078	0.993742696938309	1	155	150	0
"TCGA-BR-7722-01A-31D-2201-08"	0	0	0	0	59	2	0	2	2	55	2255	1	3	2	6	516	2	4	1	7	561	1	4	15	20	584	3	0	19	22	594	1	0	1	2	84	0.0338983050847458	0.0909090909090909	0.141414141414141	0.642857142857143	0.0238095238095238	0	0	2	2	79	0.0338983050847458	0.1	0.13527397260274	0.739240506329114	0.0253164556962025	0.0677966101694915	4	34	163	1015	0.789518633339747	1	1	0.732756863268241	0.234850309360895	Inf	0.760736196319018	1.80674846625767	0.450249928444468	0.750198509971299	1	2.0740517366571	0.637675929267412	0.866495517101	1	1	0.602825124416149	0.485714285714286	0.776199461006737	1	55	51	0
"TCGA-BR-7723-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	178	0	0	2	2	176	7216	10	20	18	48	1795	8	16	10	34	1775	4	7	38	49	1889	4	10	31	45	1757	0	2	4	6	221	0.0337078651685393	0.133333333333333	0.125782583949915	1.06003016591252	0.0271493212669683	1	2	1	4	280	0.0224719101123595	0.0816326530612245	0.148226574907358	0.550728862973761	0.0142857142857143	0.0337078651685393	6	71	501	3145	0.961611858290118	1	1	0.530562196388209	0.223106854302335	Inf	0.567073644917956	0.909680638722555	0.693796237192511	0.959872217360424	1	0.896779850128515	0.527351094911626	0.96798406149299	1	1	0.490500082365348	0.140866873065015	0.336936561489096	1	172	170	0
"TCGA-BR-7851-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	1784	12	51	213	264	1507	61787	15	127	11	153	13796	17	114	10	141	13995	5	79	545	629	16974	8	76	500	584	17022	2	5	10	17	1954	0.00952914798206278	0.0291095890410959	0.114792621313594	0.253584147726476	0.00870010235414534	0	3	7	10	1986	0.00560538116591928	0.0158982511923688	0.11700247437257	0.135879615175865	0.00503524672708963	0.0106502242152466	19	1039	3940	30056	1	1	1	0.139503489985506	0.0909295981384321	Inf	0.154952836978112	1.32745021475986	0.454870617107147	0.750212847644909	1	1.38696653835236	0.140366745197095	1	1	1	0.126154591847313	3.36498956716082e-05	0.000360178512929436	0.00972481984909477	1765	1488	0
"TCGA-BR-7901-01A-11D-2201-08"	0	2	1	3	234	1	1	2	3	229	9389	10	21	9	40	2316	15	21	20	56	2360	18	6	41	65	2328	10	10	48	68	2385	4	1	7	12	377	0.0512820512820513	0.176470588235294	0.158071278825996	1.11639881416758	0.0318302387267905	6	2	6	14	333	0.0598290598290598	0.215384615384615	0.143041237113402	1.50575190575191	0.042042042042042	0.0982905982905983	23	94	710	4003	0.11023952500128	1	1	1.3794134679367	0.898759596132116	Inf	1.30491152040448	2.37072434607646	0.00597734528733908	0.0554673507693578	1	3.13117818119463	0.969599620193069	0.593780045080616	1	1	0.964401789480016	0.577085806897022	0.882422212662642	1	211	206	0
"TCGA-BR-7957-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	57	0	2	0	2	55	2255	1	1	1	3	521	3	4	0	7	530	2	3	16	21	563	2	4	18	24	641	0	0	1	1	76	0.0175438596491228	0.0416666666666667	0.118564742589704	0.351425438596491	0.0131578947368421	0	0	0	0	80	0	0	0.142095914742451	0	0	0.0175438596491228	1	37	156	1048	0.99458807069054	1	1	0.181703148969239	0.00904754994701572	Inf	0.203103913630229	0	1	1	1	0	0.226998491704374	0.990701267672908	1	1	0.20372314329088	1	1	1	56	54	0
"TCGA-BR-7958-01A-21D-2340-08"	0	0	0	0	182	0	1	6	7	175	7175	4	8	15	27	1669	3	11	17	31	1677	10	13	39	62	1956	14	8	33	55	1873	3	1	4	8	232	0.043956043956044	0.145454545454545	0.123865456486919	1.1742946708464	0.0344827586206897	1	1	6	8	257	0.043956043956044	0.129032258064516	0.131390593047035	0.98205096021087	0.0311284046692607	0.0769230769230769	14	82	489	3340	0.344085008983235	1	1	1.16607478864468	0.67374269778377	Inf	1.14191376959782	1.30504430811179	0.369376865580028	0.678926759123496	1	1.36592601822214	1.08753692342649	0.442089721062302	1	1	1.10166182405853	0.0731727514850386	0.205309953195885	1	168	161	0
"TCGA-BR-7959-01A-11D-2340-08"	0	1	0	1	110	1	1	1	2	107	4387	3	2	3	8	1058	3	5	4	12	998	10	4	28	42	1228	5	4	36	45	1103	0	1	3	4	153	0.0363636363636364	0.0888888888888889	0.13871260199456	0.64081336238199	0.0261437908496732	3	0	3	6	152	0.0545454545454545	0.142857142857143	0.123778501628664	1.15413533834586	0.0394736842105263	0.0818181818181818	9	70	305	2026	0.720235562813949	1	1	0.854109746344362	0.425522509810076	Inf	0.870678564017431	1.52852459016393	0.313805972953887	0.641811875285219	1	1.66021974920238	0.716495901639344	0.85739198377339	1	1	0.687263038105482	0.369849964277209	0.647797816218869	1	101	98	0
"TCGA-BR-8058-01A-31D-2340-08"	0	0	1	1	56	1	0	3	3	52	2132	1	5	1	7	507	1	3	2	6	520	7	2	9	18	549	4	5	12	21	556	2	1	1	4	66	0.0714285714285714	0.19047619047619	0.118705035971223	1.6046176046176	0.0606060606060606	3	0	2	5	67	0.0892857142857143	0.277777777777778	0.122040072859745	2.27611940298507	0.0746268656716418	0.142857142857143	8	24	133	972	0.0357136245213944	0.689093379545839	1	2.43349117827836	1.07947675605809	Inf	2.07706766917293	3.77648667122351	0.0066951909825451	0.0554673507693578	1	6.07324867862217	1.18689581095596	0.475311399590323	1	1	1.21781302803375	0.637186343068696	0.944342836650529	1	48	44	0
"TCGA-BR-8059-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	810	2	27	83	110	696	28536	15	58	26	99	6605	19	49	31	99	6713	37	43	173	253	7574	33	47	165	245	7644	6	5	3	14	973	0.0172839506172839	0.0571428571428571	0.127289377289377	0.448920863309353	0.0143884892086331	7	4	3	14	929	0.0172839506172839	0.0553359683794466	0.122656456297861	0.451145989780332	0.0150699677072121	0.0234567901234568	19	389	1902	13316	0.999999972039506	1	1	0.341969000194004	0.221317945666051	Inf	0.372597987670357	1.48590956887487	0.0929546118521584	0.312370730526439	1	1.59666335614287	0.142030500438654	0.999999999999912	1	1	0.126533129594988	0.0891234373572265	0.230630925138935	1	791	677	0
"TCGA-BR-8077-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	133	2	1	2	3	125	5125	4	5	7	16	1226	3	5	3	11	1182	7	8	35	50	1326	8	7	33	48	1391	3	2	1	6	178	0.0451127819548872	0.125	0.127965492451474	0.976825842696629	0.0337078651685393	2	0	1	3	170	0.0225563909774436	0.06	0.128205128205128	0.468	0.0176470588235294	0.0526315789473684	7	76	348	2369	0.917668842633626	1	1	0.627093682669033	0.283414540105283	Inf	0.658461431934635	2.60249042145594	0.0348887109413423	0.168047291034132	1	3.40154120991434	0.229631507775524	0.99894015379507	1	1	0.206353523195219	0.334841628959276	0.608611514271892	1	126	118	0
"TCGA-BR-8078-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	1901	24	69	380	449	1427	58507	16	125	17	158	12955	14	137	26	177	12914	14	74	469	557	16250	6	69	460	535	16388	0	7	7	14	1835	0.00736454497632825	0.0261682242990654	0.111972174762021	0.233702920879065	0.00762942779291553	1	5	9	15	1810	0.00789058390320884	0.0269299820466786	0.111384615384615	0.241774700695319	0.00828729281767956	0.00894266175697002	17	932	3645	28993	1	1	1	0.14509119858931	0.0920003173291092	Inf	0.160401606774007	0.447709190672154	0.906363749350278	1	1	0.418648968339246	0.154216298186318	1	1	1	0.139398265209482	2.04501432176877e-05	0.000227311207304298	0.00591009138991175	1884	1410	0
"TCGA-BR-8080-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	168	0	2	2	4	163	6683	6	14	9	29	1578	8	18	13	39	1657	3	8	36	47	1694	4	12	32	48	1754	1	2	1	4	225	0.0238095238095238	0.0833333333333333	0.128278221208666	0.64962962962963	0.0177777777777778	1	3	0	4	217	0.0238095238095238	0.0851063829787234	0.128099173553719	0.664378860672615	0.0184331797235023	0.0178571428571429	3	72	442	3006	0.997406416964503	1	1	0.283435063171025	0.0752869147115592	Inf	0.312036199095023	2.22882999353588	0.224004733980103	0.510815243017929	1	2.71925433556287	0.114719190843758	0.999904103482132	1	1	0.101535852303952	1	1	1	165	160	0
"TCGA-BR-8081-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1103	1	46	144	190	912	37392	10	67	13	90	8336	10	60	11	81	8527	0	52	329	381	10130	4	38	318	360	10399	0	1	4	5	1201	0.00453309156844968	0.0138888888888889	0.115491874218675	0.120258580812286	0.00416319733555371	0	4	5	9	1158	0.00815956482320943	0.0236220472440945	0.11431391905232	0.206641915874505	0.0077720207253886	0.00815956482320943	9	642	2359	18170	1	1	1	0.107982993078718	0.0560140500078187	Inf	0.12030990246199	0	1	1	1	0	0.121053704022806	1	1	1	0.108659997897693	0.000579710144927536	0.00366119387858519	0.167536231884058	1094	903	0
"TCGA-BR-8284-01A-11D-2340-08"	0	1	0	1	378	0	5	16	21	357	14637	2	24	5	31	3228	5	15	4	24	3485	4	18	122	144	3912	2	25	131	158	4012	2	4	6	12	485	0.0317460317460317	0.0759493670886076	0.120887337986042	0.628265692287616	0.0247422680412371	1	1	2	4	443	0.0105820105820106	0.0277777777777778	0.113241308793456	0.245297215951843	0.0090293453724605	0.0291005291005291	11	248	928	6996	0.999990870442821	1	1	0.334411523961872	0.184725541662554	Inf	0.362651444547996	4.26939655172414	0.0245408267629802	0.138121491534246	1	7.53523137823007	0.270001362954886	0.999999698811214	1	1	0.246189917329519	0.135051828924248	0.330762530161929	1	367	346	0
"TCGA-BR-8286-01A-12D-2340-08"	0	0	0	0	163	1	5	5	10	152	6232	4	13	9	26	1463	3	14	9	26	1480	6	9	34	49	1660	4	9	38	51	1629	0	2	4	6	212	0.0368098159509202	0.117647058823529	0.130141190914672	0.903995560488346	0.0283018867924528	0	1	5	6	233	0.0368098159509202	0.122448979591837	0.140361445783133	0.87238328807918	0.0257510729613734	0.0552147239263804	9	73	445	2844	0.794328418195219	1	1	0.787984566958278	0.394295586230048	Inf	0.81120855028775	0	1	1	1	0	0.923876404494382	0.652659846665827	1	1	0.913004657791915	0.000336519046978058	0.00246376811594203	0.0972540045766588	154	143	0
"TCGA-BR-8289-01A-11D-2340-08"	1	0	0	1	225	2	0	5	5	218	8938	2	16	23	41	2256	7	21	16	44	2228	7	13	48	68	2192	14	15	36	65	2262	4	2	4	10	330	0.0444444444444444	0.153846153846154	0.145888594164456	1.05454545454545	0.0303030303030303	2	0	5	7	324	0.0311111111111111	0.102941176470588	0.147810218978102	0.696441539578794	0.0216049382716049	0.0666666666666667	15	90	654	3800	0.588350997112889	1	1	0.968402495418071	0.572584118330676	Inf	0.972913936216689	1.94582787243338	0.0769359248899472	0.271152223087741	1	2.32358517191843	0.729685452162516	0.883826564666155	1	1	0.697297819305274	0.490528929083845	0.778916815962809	1	210	203	0
"TCGA-BR-8291-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	30	0	1	3	4	26	1066	0	4	1	5	273	1	1	2	4	256	0	1	5	6	251	3	2	6	11	286	0	2	1	3	42	0.1	0.272727272727273	0.146853146853147	1.85714285714286	0.0714285714285714	0	0	0	0	37	0	0	0.147410358565737	0	0	0.0333333333333333	1	13	79	458	0.891914525233973	1	1	0.446450967180209	0.0210480223350151	Inf	0.485533453887884	0	1	1	1	0	0.61795166858458	0.826794228408934	1	1	0.580226133867738	1	1	1	29	25	0
"TCGA-BR-8295-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	60	0	3	6	9	51	2091	4	4	1	9	528	3	4	3	10	499	6	1	10	17	535	6	1	8	15	529	2	0	0	2	75	0.0333333333333333	0.133333333333333	0.141776937618147	0.940444444444445	0.0266666666666667	2	0	0	2	80	0.0333333333333333	0.117647058823529	0.149532710280374	0.786764705882353	0.025	0.0666666666666667	4	26	155	909	0.655709006334086	1	1	0.902342593881231	0.284688357077763	Inf	0.915268817204301	2.28817204301075	0.0870496818618171	0.295968918330178	1	2.92818695241053	0	1	1	1	0	0.0285714285714286	0.101940035273369	1	56	47	0
"TCGA-BR-8296-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	87	1	1	0	1	85	3485	1	1	0	2	813	1	3	0	4	799	5	5	29	39	911	6	6	28	40	962	2	0	3	5	107	0.0574712643678161	0.125	0.111226611226611	1.12383177570093	0.0467289719626168	1	1	3	5	106	0.0574712643678161	0.128205128205128	0.11635565312843	1.10183841315917	0.0471698113207547	0.103448275862069	9	59	213	1660	0.373396115649584	1	1	1.18870455149777	0.586232896297071	Inf	1.16383595691798	2.39820742637644	0.122656366180636	0.359329639467391	1	2.92011266242478	0.92562391895231	0.64245416261359	1	1	0.916900197214173	0.369849964277209	0.647797816218869	1	78	76	0
"TCGA-BR-8297-01A-12D-2340-08"	0	0	0	0	300	1	2	1	3	295	12095	10	31	40	81	3000	4	29	36	69	2975	13	9	61	83	3041	7	12	43	62	3079	4	2	3	9	435	0.03	0.145161290322581	0.141279636245534	1.02747497219132	0.0206896551724138	4	1	4	9	431	0.03	0.108433734939759	0.141729694179546	0.765074217985632	0.0208816705336427	0.05	15	109	866	5254	0.779000576238208	1	1	0.834927681995727	0.497352728544769	Inf	0.854875959174551	2.82678983833718	0.0042008501860349	0.0485618281505634	1	4.04354151371189	0.475661751643276	0.993839966489948	1	1	0.437864679284076	1	1	1	285	280	0
"TCGA-BR-8360-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1083	10	40	157	197	875	35875	13	60	17	90	7889	11	50	20	81	7870	7	51	292	350	10126	8	39	307	354	9990	0	4	0	4	1066	0.00369344413665743	0.0112994350282486	0.106706706706707	0.105892453970172	0.00375234521575985	3	3	9	15	1145	0.0138504155124654	0.0428571428571429	0.11307525182698	0.379014348097318	0.0131004366812227	0.0110803324099723	12	602	2211	17905	1	1	1	0.161432162779635	0.0925429843906059	Inf	0.177813921214184	1.81962912709181	0.223658696683239	0.510815243017929	1	2.02447315738486	0.136700017895044	1	1	1	0.12353695107037	0.0788907451866292	0.213423466924191	1	1071	863	0
"TCGA-BR-8361-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1921	19	62	289	351	1550	63550	19	143	26	188	14179	20	112	19	151	14136	22	70	548	640	17443	12	55	504	571	17792	0	0	13	13	2022	0.00676730869338886	0.0227670753064799	0.113646582733813	0.200332247207166	0.00642927794263106	4	8	5	17	2027	0.00884955752212389	0.0265625	0.116207074471135	0.228579026887025	0.00838677849037987	0.0114523685580427	22	1064	4049	31186	1	1	1	0.159259093027136	0.107295553776326	Inf	0.176286621483512	1.02378219749248	0.5593849610192	0.83535752938146	1	1.02695658399698	0.148896080053564	1	1	1	0.134083576620331	0.000368176733900806	0.00256580725741329	0.106403076097333	1899	1528	0
"TCGA-BR-8363-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1416	2	48	170	218	1195	48995	12	132	30	174	11038	20	125	40	185	11114	9	69	339	417	13442	4	61	354	419	13401	0	3	12	15	1540	0.0105932203389831	0.035799522673031	0.114916797253936	0.311525586585252	0.00974025974025974	1	4	9	14	1624	0.00988700564971751	0.0335731414868106	0.120815354857908	0.277888034400066	0.00862068965517241	0.0155367231638418	22	684	3164	23679	1	1	1	0.240716885871165	0.16175668199684	Inf	0.264370234543716	0.652606243314208	0.804170429349922	1	1	0.623666284306201	0.257087307972264	1	1	1	0.233878423654848	4.48378079204698e-08	1.43979183211286e-06	1.29581264890158e-05	1394	1173	0
"TCGA-BR-8364-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	24	0	0	3	3	21	861	0	2	0	2	212	1	2	0	3	207	1	0	8	9	222	3	0	4	7	220	0	0	0	0	26	0	0	0.118181818181818	0	0	1	0	1	2	35	0.0833333333333333	0.222222222222222	0.157657657657658	1.40952380952381	0.0571428571428571	0.0833333333333333	2	14	61	381	0.672124835464547	1	1	0.892508914204659	0.141723366728218	Inf	0.905737704918033	1.81147540983607	0.451676611539813	0.750198509971299	1	2.07762300334118	0.603825136612022	0.832277585813107	1	1	0.568391442642623	1	1	1	22	19	0
"TCGA-BR-8365-01A-21D-2340-08"	0	0	0	0	26	0	2	0	2	24	984	1	0	2	3	223	0	1	1	2	265	0	1	11	12	273	1	1	5	7	223	0	0	1	1	37	0.0384615384615385	0.142857142857143	0.165919282511211	0.861003861003861	0.027027027027027	0	0	1	1	28	0.0384615384615385	0.0833333333333333	0.102564102564103	0.8125	0.0357142857142857	0.0769230769230769	2	15	65	431	0.675550951764202	1	1	0.884330328606617	0.141429805736025	Inf	0.897737556561086	0	1	1	1	0	0.953846153846154	0.642746904942258	1	1	0.947342873526498	0.333333333333333	0.608611514271892	1	24	22	0
"TCGA-BR-8366-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	189	0	1	2	3	185	7585	5	26	21	52	1880	5	18	22	45	1886	1	9	38	48	1905	0	5	35	40	1914	0	1	1	2	288	0.0105820105820106	0.05	0.150470219435737	0.332291666666667	0.00694444444444444	1	4	5	10	279	0.0529100529100529	0.208333333333333	0.146456692913386	1.42249103942652	0.03584229390681	0.037037037037037	7	67	567	3252	0.935241066688165	1	1	0.599294174400848	0.270550425355192	Inf	0.637137137137137	6.73544973544974	0.14869109947644	0.411498912689185	1	Inf	0.553598608393129	0.968287047510256	1	1	0.5136946005803	0.068649885583524	0.200402191248873	1	182	178	0
"TCGA-BR-8367-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	74	0	5	3	8	66	2706	3	3	1	7	589	1	2	3	6	638	1	5	22	28	734	3	1	21	25	745	0	0	0	0	85	0	0	0.114093959731544	0	0	0	0	2	2	71	0.027027027027027	0.0714285714285714	0.0967302452316076	0.738430583501006	0.028169014084507	0.027027027027027	2	45	156	1323	0.964244258950581	1	1	0.377090324741973	0.0645086069720618	Inf	0.403436988543372	0	1	1	1	0	0.440966010733453	0.948613346893018	1	1	0.413868037525796	0.333333333333333	0.608611514271892	1	72	64	0
"TCGA-BR-8368-01A-11D-2340-08"	0	0	2	2	1214	13	44	193	237	962	39442	8	62	15	85	8469	9	65	10	84	8650	10	33	335	378	11268	8	58	349	415	11055	1	4	5	10	1206	0.00823723228995058	0.0240963855421687	0.109090909090909	0.220883534136546	0.00829187396351575	0	2	5	7	1179	0.0057660626029654	0.0185185185185185	0.104632587859425	0.176986146451795	0.00593723494486853	0.00906095551894563	11	691	2385	19938	1	1	1	0.133084134933475	0.0742231338388557	Inf	0.146662724650146	0.519986023759609	0.869163655260562	1	1	0.491762036298234	0.13683842730516	1	1	1	0.124037208331987	0.00239772586824867	0.0119472892400666	0.692942775923866	1203	951	0
"TCGA-BR-8369-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	227	3	0	3	3	221	9061	5	18	16	39	2118	6	19	16	41	2321	4	14	50	68	2342	6	15	52	73	2280	1	1	0	2	334	0.00881057268722467	0.0273972602739726	0.146491228070175	0.18702321384628	0.00598802395209581	1	4	3	8	310	0.0352422907488987	0.117647058823529	0.132365499573015	0.888804554079696	0.0258064516129032	0.0220264317180617	5	107	644	3978	0.999698346406715	1	1	0.288694025266595	0.11126320291284	Inf	0.320402617568767	1.43540372670807	0.416524364958399	0.721450358161065	1	1.54408041893691	0.211088783339423	0.999961485100666	1	1	0.187219167367702	1	1	1	222	216	0
"TCGA-BR-8370-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	121	0	2	3	5	116	4756	1	5	0	6	1106	0	4	3	7	1154	6	10	29	45	1235	0	24	34	58	1261	0	1	2	3	166	0.0247933884297521	0.0517241379310345	0.131641554321967	0.392916493560449	0.0180722891566265	2	3	2	7	163	0.0578512396694215	0.155555555555556	0.131983805668016	1.1785957736878	0.0429447852760736	0.0495867768595041	6	63	329	2167	0.904430533618915	1	1	0.627395677635057	0.262177548291512	Inf	0.659706620853707	2.52887537993921	0.182596665432593	0.463465148786602	1	3.29103156973838	0.481690548559849	0.972698931332763	1	1	0.446654953957734	0.628482972136223	0.941096263976002	1	115	110	0
"TCGA-BR-8371-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	23	0	0	1	1	22	902	0	4	1	5	206	1	2	1	4	219	1	0	1	2	219	0	1	10	11	258	0	0	0	0	35	0	0	0.135658914728682	0	0	0	0	1	1	29	0.0434782608695652	0.5	0.132420091324201	3.77586206896552	0.0344827586206897	0.0434782608695652	1	11	64	413	0.823175134514321	1	1	0.587178699255513	0.0272549671254313	Inf	0.62109375	0	1	1	1	0	0.677556818181818	0.796067549003545	1	1	0.645809339839059	1	1	1	22	21	0
"TCGA-BR-8372-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	1535	16	49	209	258	1260	51660	24	211	29	264	11678	12	222	15	249	11743	12	65	305	382	13978	5	69	291	365	14261	1	6	2	9	1634	0.00586319218241042	0.0246575342465753	0.114578220321156	0.215202629063899	0.00550795593635251	0	6	3	9	1596	0.00586319218241042	0.0235602094240838	0.114179424810416	0.206343738928473	0.0056390977443609	0.00390879478827362	6	607	3230	25009	1	1	1	0.0765371343733397	0.0331890613817117	Inf	0.0855731594604013	0.514277909306137	0.87317412202237	1	1	0.483930095171669	0.0733450038439961	1	1	1	0.065507704868194	0.17741935483871	0.390302037298702	1	1529	1254	0
"TCGA-BR-8373-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	108	1	2	5	7	100	4100	1	7	7	15	948	2	6	4	12	979	3	6	30	39	1055	5	4	25	34	1118	1	2	3	6	151	0.0555555555555556	0.176470588235294	0.135062611806798	1.30658356057655	0.0397350993377483	0	3	2	5	122	0.0462962962962963	0.128205128205128	0.11563981042654	1.10865910046238	0.040983606557377	0.0555555555555556	6	57	273	1900	0.81769784527022	1	1	0.732692524975799	0.304719101854921	Inf	0.758067329495901	0.99496336996337	0.658997827266179	0.924516369320028	1	0.994246409566023	0.723609723609724	0.835580034599725	1	1	0.696070737114436	0.148606811145511	0.349815991558379	1	102	94	0
"TCGA-BR-8380-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	81	0	1	0	1	80	3280	3	2	4	9	705	1	2	4	7	757	4	5	26	35	898	1	1	27	29	920	0	0	0	0	94	0	0	0.102173913043478	0	0	1	0	2	3	102	0.037037037037037	0.0857142857142857	0.11358574610245	0.754621848739496	0.0294117647058824	0.037037037037037	3	55	196	1622	0.955685139696441	1	1	0.451533234679971	0.118575114695465	Inf	0.479767769176636	1.85510204081633	0.435868660438761	0.73829750322735	1	2.06780553804766	0.350019252984213	0.981790759083136	1	1	0.324658161555586	1	1	1	78	77	0
"TCGA-BR-8381-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	138	0	0	2	2	136	5576	3	8	3	14	1313	2	6	5	13	1307	2	8	49	59	1499	4	8	38	50	1457	0	3	4	7	163	0.0507246376811594	0.14	0.111873713109128	1.25141104294479	0.0429447852760736	0	2	4	6	189	0.0434782608695652	0.101694915254237	0.126084056037358	0.806564433683078	0.0317460317460317	0.0579710144927536	8	85	352	2604	0.875291821756371	1	1	0.696329841689133	0.33407154654497	Inf	0.72238514173998	0	1	1	1	0	0.772204806687565	0.825687409411341	1	1	0.749201380705052	0.00164759725400458	0.00881769641495044	0.476155606407324	130	128	0
"TCGA-BR-8382-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	1018	3	27	101	128	886	36326	5	79	26	110	8019	10	69	19	98	8021	3	49	298	350	10239	4	39	285	328	10047	0	4	3	7	1124	0.0068762278978389	0.0213414634146341	0.111874191300886	0.190763063102161	0.00622775800711744	0	8	3	11	1157	0.0108055009823183	0.0314285714285714	0.112999316339486	0.278130633411532	0.00950734658599827	0.00589390962671906	6	584	2281	18005	1	1	1	0.0811013533942729	0.0351549792129946	Inf	0.0904420451927864	0	1	1	1	0	0.0915279702637118	1	1	1	0.0820852469580101	0.0190615835777126	0.0715428266747914	1	1012	880	0
"TCGA-BR-8384-01A-21D-2394-08"	0	0	0	0	46	0	0	0	0	46	1886	0	3	5	8	453	3	1	3	7	460	2	2	10	14	464	4	2	11	17	509	1	0	0	1	71	0.0217391304347826	0.0588235294117647	0.139489194499018	0.421706710853355	0.0140845070422535	0	0	1	1	60	0.0217391304347826	0.0714285714285714	0.129310344827586	0.552380952380952	0.0166666666666667	0.0434782608695652	2	25	131	842	0.894201247877788	1	1	0.51447066452687	0.085909294456374	Inf	0.550183771557817	1.23791348600509	0.581627534405717	0.853250545397219	1	1.28513416759572	0.353689567430025	0.951440213858981	1	1	0.32161806082269	1	1	1	44	44	0
"TCGA-BR-8483-01A-31D-2394-08"	0	0	0	0	138	2	1	5	6	128	5248	6	9	3	18	1228	6	7	6	19	1270	0	12	36	48	1360	3	10	30	43	1390	0	5	1	6	189	0.0434782608695652	0.13953488372093	0.135971223021583	1.02620893318568	0.0317460317460317	0	1	1	2	176	0.0144927536231884	0.0416666666666667	0.129411764705882	0.321969696969697	0.0113636363636364	0.0144927536231884	2	67	365	2385	0.999323015595613	1	1	0.195115530583259	0.0338335668274646	Inf	0.218383958705579	0	1	1	1	0	0.228310502283105	0.999011988962711	1	1	0.204260715427042	0.466666666666667	0.76195856873823	1	136	126	0
"TCGA-BR-8484-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	95	0	0	0	0	95	3895	4	7	4	15	929	5	7	5	17	991	1	1	32	34	984	4	5	20	29	991	2	1	2	5	132	0.0526315789473684	0.172413793103448	0.133198789101917	1.29440961337513	0.0378787878787879	0	0	3	3	140	0.0315789473684211	0.0882352941176471	0.142276422764228	0.620168067226891	0.0214285714285714	0.0736842105263158	7	50	272	1703	0.685513686409283	1	1	0.876614740243932	0.389462455669502	Inf	0.891705366357069	2.90441176470588	0.143597397051205	0.406859291645081	1	4.16974816449237	0.698175904977376	0.859222126807692	1	1	0.666184048810995	0.314685314685315	0.594405594405595	1	88	88	0
"TCGA-BR-8485-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	345	1	2	5	7	337	13817	5	37	59	101	3451	17	49	73	139	3697	9	6	31	46	3322	5	6	40	51	3347	1	2	6	9	544	0.0260869565217391	0.176470588235294	0.162533612190021	1.08574826989619	0.0165441176470588	3	1	3	7	466	0.0202898550724638	0.152173913043478	0.140276941601445	1.08481059899235	0.0150214592274678	0.0376811594202899	13	72	1010	5659	0.531640694549444	1	1	1.01164627941037	0.57187491326139	Inf	1.00986604542807	1.88656294200849	0.150930397041708	0.411498912689185	1	2.24084150159506	0.836996234834751	0.766276906528188	1	1	0.813358013810242	0.148883622704777	0.349815991558379	1	332	324	0
"TCGA-BR-8486-01A-31D-2394-08"	0	0	0	0	62	1	1	2	3	58	2378	1	4	2	7	550	1	5	2	8	521	4	4	18	26	637	0	2	15	17	670	0	0	2	2	71	0.032258064516129	0.117647058823529	0.105970149253731	1.11019055509528	0.028169014084507	2	0	0	2	77	0.032258064516129	0.0769230769230769	0.120879120879121	0.636363636363636	0.025974025974026	0.0645161290322581	4	33	148	1159	0.617959847924534	1	1	0.949252947341543	0.303515951090235	Inf	0.954711468224982	4.41554054054054	0.0668077190885622	0.250745854760967	1	7.80802338380916	0.535217035217035	0.900268261832131	1	1	0.505431611814207	1	1	1	58	54	0
"TCGA-BR-8487-01A-11D-2394-08"	0	0	2	2	3644	44	73	444	517	3083	126403	29	314	16	359	28025	26	338	26	390	28231	25	159	994	1178	34989	14	177	965	1156	35158	1	12	16	29	3927	0.0079582875960483	0.0250865051903114	0.111695773365948	0.224596727649852	0.00738477209065444	1	5	19	25	3839	0.00686059275521405	0.0212224108658744	0.109720197776444	0.193423009582203	0.00651211252930451	0.0101536772777168	37	1961	7766	62381	1	1	1	0.151560058529346	0.112642459814111	Inf	0.16726996117931	0.463209123265781	0.939690404977385	1	1	0.434196868947227	0.161378369897343	1	1	1	0.146124709666946	4.73808707392363e-12	2.73861432872786e-10	1.36930716436393e-09	3607	3046	0
"TCGA-BR-8588-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	139	0	0	3	3	135	5535	3	6	4	13	1228	6	15	4	25	1220	0	9	36	45	1552	1	10	41	52	1535	0	2	2	4	165	0.0287769784172662	0.0769230769230769	0.107491856677524	0.715617715617716	0.0242424242424242	0	1	1	2	182	0.0143884892086331	0.0444444444444444	0.117268041237113	0.378998778998779	0.010989010989011	0.0215827338129496	3	75	347	2740	0.994307093018668	1	1	0.31592498770661	0.0839058896660295	Inf	0.342163600088672	0	1	1	1	0	0.346607283206707	0.993746988822234	1	1	0.320193726167436	0.181818181818182	0.390302037298702	1	136	132	0
"TCGA-BR-8589-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	1227	3	2	6	8	1215	49815	72	163	310	545	12778	77	175	291	543	12857	5	9	42	56	11997	3	3	65	71	12183	1	3	9	13	1943	0.0105949470252649	0.183098591549296	0.159484527620455	1.14806492066138	0.00669068450849202	1	2	7	10	1930	0.00814995925020375	0.178571428571429	0.160873551721264	1.11001110288675	0.00518134715025907	0.0146699266503667	18	97	3873	20307	0.581748994025311	1	1	0.972967163761411	0.605815337749062	Inf	0.977200013471188	1.56080557707204	0.375056554916082	0.681706568369482	1	1.74768907336794	0.933565952641219	0.657877907099963	1	1	0.921865159701838	4.56766386263899e-05	0.000471448162965239	0.0132005485630267	1209	1197	0
"TCGA-BR-8590-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	138	0	2	2	4	133	5453	6	12	10	28	1372	5	14	21	40	1308	3	3	28	34	1356	5	4	22	31	1417	2	2	3	7	180	0.0507246376811594	0.225806451612903	0.127028934368384	1.77759856630824	0.0388888888888889	1	0	3	4	172	0.0289855072463768	0.117647058823529	0.126843657817109	0.92749658002736	0.0232558139534884	0.0652173913043478	9	49	352	2421	0.316662008261342	1	1	1.26315892505068	0.620848069016158	Inf	1.22242358934169	2.95419034090909	0.0706906847271509	0.257655923737957	1	4.12380752063075	0.945340909090909	0.622944666664904	1	1	0.937899311074272	0.386996904024768	0.673747622067217	1	129	124	0
"TCGA-BR-8591-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	1764	3	80	233	313	1446	59286	15	156	22	193	13037	13	163	25	201	13230	6	80	422	508	16536	13	94	437	544	16483	1	8	8	17	1803	0.00963718820861678	0.03125	0.109385427410059	0.285687049362174	0.00942872989462008	0	4	9	13	1858	0.00736961451247166	0.0255905511811024	0.112360909530721	0.227753150877669	0.0069967707212056	0.0102040816326531	18	860	3661	29358	1	1	1	0.167846653554798	0.107885074101414	Inf	0.18490224175403	0.474690550467948	0.892769340723696	1	1	0.445514377374855	0.178492488709135	1	1	1	0.161910707565636	7.95496460062332e-06	9.99558595469626e-05	0.00229898476958014	1746	1428	0
"TCGA-BR-8592-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	42	0	0	4	4	38	1558	0	1	2	3	341	0	4	0	4	355	0	3	15	18	389	0	1	12	13	473	0	0	0	0	49	0	0	0.103594080338266	0	0	0	1	0	1	43	0.0238095238095238	0.0555555555555556	0.110539845758355	0.502583979328165	0.0232558139534884	0	0	27	92	770	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	42	38	0
"TCGA-BR-8676-01A-11D-2394-08"	0	1	0	1	93	1	1	3	4	88	3608	2	3	6	11	852	3	4	3	10	843	3	5	25	33	968	2	8	24	34	945	1	2	3	6	132	0.0645161290322581	0.176470588235294	0.13968253968254	1.26336898395722	0.0454545454545455	0	1	4	5	131	0.0537634408602151	0.151515151515152	0.135330578512397	1.11959287531807	0.0381679389312977	0.0860215053763441	8	46	263	1650	0.471898049747813	1	1	1.09106571330538	0.510096811965097	Inf	1.07759470497113	1.45475285171103	0.523489486606857	0.802392309331645	1	1.56800429589783	1.03910917979359	0.521130445404498	1	1	1.04561159683541	0.0237358101135191	0.0868310015545192	1	85	80	0
"TCGA-BR-8677-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	80	0	3	5	8	72	2952	1	4	3	8	703	0	2	0	2	661	2	2	26	30	774	3	6	23	32	814	1	0	3	4	110	0.05	0.125	0.135135135135135	0.925	0.0363636363636364	0	0	3	3	103	0.0375	0.1	0.133074935400517	0.751456310679612	0.029126213592233	0.0875	7	47	213	1375	0.600429775268989	1	1	0.961460151121575	0.424916232915268	Inf	0.966440619022779	1.49107981220657	0.514355454100472	0.802392309331645	1	1.6132673843513	0.912906007473412	0.658403354674351	1	1	0.900780074081903	0.0291375291375292	0.102692023423731	1	73	65	0
"TCGA-BR-8678-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	126	0	1	7	8	118	4838	0	4	3	7	1161	4	8	4	16	1228	6	7	30	43	1202	5	13	34	52	1247	2	3	3	8	181	0.0634920634920635	0.153846153846154	0.145148356054531	1.05992350191245	0.0441988950276243	4	2	4	10	160	0.0793650793650794	0.232558139534884	0.133111480865225	1.74709302325581	0.0625	0.103174603174603	13	62	341	2108	0.245149612827494	1	1	1.29604120782793	0.723296151180352	Inf	1.24484848484848	3.91735537190083	0.00186593254204794	0.0283818160343081	0.539254504651855	7.40743336275512	0.785511363636364	0.804023362266436	1	1	0.759246976442503	1	1	1	113	105	0
"TCGA-BR-8679-01A-11D-2394-08"	0	0	1	1	175	0	1	5	6	169	6929	5	9	6	20	1634	6	9	9	24	1632	2	8	52	62	1754	4	4	55	63	1909	1	0	5	6	231	0.0342857142857143	0.0952380952380952	0.121005762179151	0.787054215625644	0.025974025974026	0	2	6	8	216	0.0457142857142857	0.129032258064516	0.123147092360319	1.04778972520908	0.037037037037037	0.0685714285714286	12	101	447	3216	0.73663949617258	1	1	0.854857684499545	0.475599840221896	Inf	0.870226287343351	1.36577181208054	0.542479181351246	0.823862399537877	1	1.43875709234464	0.842438687825378	0.768608780664193	1	1	0.824425062407883	0.000341005967604433	0.00246376811594203	0.0985507246376811	163	157	0
"TCGA-BR-8680-01A-11D-2394-08"	0	0	2	2	6686	21	8	9	17	6643	272363	11	473	545	1029	72714	19	461	533	1013	73121	6	627	1662	2295	63279	8	673	1625	2306	63249	2	574	127	703	10283	0.105145079270117	0.304856895056375	0.162579645527993	1.87512338378106	0.0683652630555285	2	527	123	652	10395	0.097517200119653	0.284095860566449	0.164272507466932	1.72941817804563	0.0627224627224627	0.037989829494466	254	3047	20678	105850	1	1	1	0.426718998802528	0.381705166729597	Inf	0.470832360676783	1.74827629088196	0.184142393559755	0.463465148786602	1	2.04762578910433	0.465391467758355	1	1	1	0.421382033602447	5.46957320269073e-74	1.58070665557762e-71	1.58070665557762e-71	6432	6389	0
"TCGA-BR-8682-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	81	0	2	5	7	74	3034	3	1	3	7	650	0	1	0	1	709	2	3	27	32	796	0	3	31	34	879	0	1	2	3	107	0.037037037037037	0.0882352941176471	0.121729237770193	0.724848818031886	0.0280373831775701	2	1	1	4	88	0.0493827160493827	0.125	0.110552763819095	1.13068181818182	0.0454545454545455	0.0617283950617284	5	55	195	1480	0.840534643357771	1	1	0.690106417831567	0.259489733927936	Inf	0.715811965811966	8.58974358974359	0.0137377377206428	0.0893485942413713	1	Inf	0.444297082228117	0.970347955261441	1	1	0.414138063714383	1	1	1	76	69	0
"TCGA-BR-8683-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	167	0	1	4	5	162	6642	2	11	3	16	1523	9	6	3	18	1606	7	17	35	59	1717	6	13	50	69	1796	1	3	3	7	226	0.0419161676646707	0.101449275362319	0.125835189309577	0.806207515711171	0.0309734513274336	1	3	3	7	206	0.0419161676646707	0.11864406779661	0.119976703552708	0.988892545663979	0.0339805825242718	0.0479041916167665	8	90	432	3081	0.92447240872025	1	1	0.63401940492543	0.305075410835381	Inf	0.663832199546485	1.25106837606838	0.488133434561687	0.788103701610768	1	1.2966099193855	0.574019607843137	0.957053550126807	1	1	0.541741590840417	0.208695652173913	0.427752081406105	1	159	154	0
"TCGA-BR-8686-01A-11D-2394-08"	0	0	1	1	124	0	0	5	5	119	4879	1	3	1	5	1101	2	6	3	11	1111	1	9	35	45	1276	2	12	44	58	1391	1	2	7	10	169	0.0806451612903226	0.172413793103448	0.121495327102804	1.41909814323607	0.0591715976331361	0	0	4	4	162	0.032258064516129	0.0888888888888889	0.126959247648903	0.700137174211248	0.0246913580246914	0.0967741935483871	12	70	331	2336	0.321811891206907	1	1	1.20974010923456	0.663150876611211	Inf	1.17913197258861	2.68580060422961	0.328678745820804	0.641811875285219	1	3.52585007366154	1.12191670809591	0.394693645645379	1	1	1.14155416642962	0.000341005967604433	0.00246376811594203	0.0985507246376811	112	107	0
"TCGA-BR-8687-01A-11D-2394-08"	0	0	1	1	201	0	0	3	3	198	8118	7	31	17	55	2016	1	24	40	65	1925	1	9	29	39	2088	2	3	34	39	2089	2	1	3	6	265	0.0298507462686567	0.153846153846154	0.126854954523696	1.21277213352685	0.0226415094339623	0	1	4	5	304	0.0248756218905473	0.128205128205128	0.145593869731801	0.880566801619433	0.0164473684210526	0.0447761194029851	9	57	569	3608	0.553752009298396	1	1	1.00120220286602	0.496972857877988	Inf	1.00103850455344	4.89396602226128	0.0508213638801956	0.206074786590962	1	12.6683026536726	0.815661003710213	0.771486509851536	1	1	0.792658961496277	0.0804953560371517	0.213423466924191	1	192	189	0
"TCGA-BR-8690-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	178	1	3	3	6	170	6970	8	12	8	28	1628	8	6	10	24	1696	7	11	26	44	1777	8	20	46	74	1869	3	4	1	8	239	0.0449438202247191	0.108108108108108	0.127875869448903	0.845414452109013	0.0334728033472803	4	4	1	9	221	0.050561797752809	0.204545454545455	0.124366910523354	1.64469354175237	0.0407239819004525	0.050561797752809	9	78	460	3186	0.782614432704628	1	1	0.799208430617801	0.400891113809162	Inf	0.819940029985007	3.69884057971014	0.00134490968359249	0.0228634646210723	0.38867889855823	6.05524740275109	0.220169082125604	0.999264432547364	1	1	0.197936304520173	0.117538005190953	0.292831754311943	1	169	161	0
"TCGA-BR-A44T-01A-32D-A24D-08"	0	0	0	0	29	0	0	0	0	29	1189	2	3	0	5	266	0	1	0	1	306	0	1	9	10	315	0	2	11	13	302	0	1	0	1	39	0.0344827586206897	0.0769230769230769	0.129139072847682	0.595660749506903	0.0256410256410256	0	1	0	1	37	0.0344827586206897	0.1	0.117460317460317	0.851351351351351	0.027027027027027	0	0	20	76	541	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	29	29	0
"TCGA-BR-A44U-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	102	0	1	4	5	97	3977	1	5	4	10	887	1	4	3	8	909	4	4	31	39	1097	4	2	34	40	1084	1	0	1	2	111	0.0196078431372549	0.05	0.10239852398524	0.488288288288288	0.018018018018018	0	0	1	1	107	0.00980392156862745	0.0256410256410256	0.097538742023701	0.262880421758926	0.00934579439252336	0.0294117647058824	3	70	218	1963	0.980056020369673	1	1	0.38602459794527	0.102074790371018	Inf	0.411147417368355	1.25057339449541	0.570320463992592	0.845244174840303	1	1.28620500474491	0.307833450952717	0.990799130783908	1	1	0.285959575924151	1	1	1	99	94	0
"TCGA-BR-A452-01A-91D-A25D-08"	0	0	0	0	124	2	1	6	7	115	4715	0	5	12	17	1108	1	10	9	20	1168	2	5	27	34	1157	16	4	24	44	1282	9	1	3	13	171	0.104838709677419	0.295454545454545	0.133385335413417	2.2150451887294	0.0760233918128655	1	2	3	6	179	0.0483870967741935	0.176470588235294	0.154710458081245	1.14065067367729	0.0335195530726257	0.129032258064516	16	53	350	2089	0.0357660923639709	0.689093379545839	1	1.80132067286563	1.05191122618506	Inf	1.61590062111801	3.87142857142857	5.90144243384346e-05	0.00155046987580069	0.0170551686338076	7.44936648958512	0.819831932773109	0.75833622772896	1	1	0.7958774450802	0.324544005242366	0.608611514271892	1	108	99	0
"TCGA-BR-A453-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	76	0	0	2	2	74	3034	2	2	0	4	679	4	4	1	9	740	0	10	17	27	783	0	9	25	34	832	0	2	1	3	108	0.0394736842105263	0.0882352941176471	0.129807692307692	0.679738562091503	0.0277777777777778	0	1	0	1	93	0.0131578947368421	0.037037037037037	0.118773946360153	0.311827956989247	0.010752688172043	0.0131578947368421	1	41	201	1414	0.996048154461255	1	1	0.171678642298408	0.00858496827251528	Inf	0.191305377872542	NA	1	1	1	0	0.191305377872542	0.996048154461255	1	1	0.171678642298408	1	1	1	75	73	0
"TCGA-BR-A4CQ-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	191	0	1	4	5	186	7626	7	11	2	20	1758	3	10	6	19	1699	8	15	50	73	2007	9	12	53	74	2162	2	3	4	9	252	0.0471204188481675	0.121621621621622	0.116558741905643	1.04343629343629	0.0357142857142857	3	3	0	6	265	0.031413612565445	0.0821917808219178	0.132037867463876	0.622486430602223	0.0226415094339623	0.0471204188481675	9	111	517	3652	0.967505763198865	1	1	0.572805041453575	0.290286614143519	Inf	0.604787234042553	2.37171464330413	0.0510330327249443	0.206074786590962	1	2.94217007533998	0.313158438339186	0.999189592587784	1	1	0.285460157802379	1	1	1	182	177	0
"TCGA-BR-A4CR-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	77	0	1	4	5	72	2952	6	4	2	12	650	4	3	0	7	693	2	8	21	31	811	0	5	17	22	798	0	1	1	2	99	0.025974025974026	0.0909090909090909	0.12406015037594	0.732782369146006	0.0202020202020202	0	1	1	2	102	0.025974025974026	0.0645161290322581	0.12577065351418	0.512966476913346	0.0196078431372549	0.025974025974026	2	38	201	1408	0.966945878752337	1	1	0.368837579873497	0.0628861662290742	Inf	0.400248756218905	0	1	1	1	0	0.421314480230427	0.958842060041335	1	1	0.389322768043925	0.428571428571429	0.707755102040817	1	75	70	0
"TCGA-BR-A4CS-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	180	2	2	4	6	172	7052	3	7	7	17	1638	3	7	5	15	1658	12	15	39	66	1944	11	11	52	74	1812	2	6	3	11	238	0.0611111111111111	0.148648648648649	0.131346578366446	1.13172836702248	0.046218487394958	2	4	5	11	254	0.0611111111111111	0.166666666666667	0.130658436213992	1.2755905511811	0.0433070866141732	0.0666666666666667	12	102	492	3264	0.827111803555888	1	1	0.78053408353985	0.43461651185337	Inf	0.803594351732991	1.32767762460233	0.356833706019801	0.674019222481846	1	1.3965194020416	0.671133744304476	0.920274288090279	1	1	0.639500243243546	0.310154563132442	0.593607077783283	1	168	160	0
"TCGA-BR-A4IU-01A-22D-A25D-08"	0	0	0	0	26	0	0	1	1	25	1025	1	2	1	4	211	0	2	0	2	256	0	1	10	11	269	0	1	7	8	289	0	0	0	0	50	0	0	0.173010380622837	0	0	0	0	0	0	27	0	0	0.100371747211896	0	0	0	0	17	77	481	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	26	25	0
"TCGA-BR-A4IV-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	28	0	0	1	1	27	1107	2	0	3	5	287	2	0	0	2	238	1	3	8	12	292	1	1	6	8	290	0	0	0	0	28	0	0	0.096551724137931	0	0	0	0	1	1	41	0.0357142857142857	0.0833333333333333	0.14041095890411	0.593495934959349	0.024390243902439	0.0357142857142857	1	15	69	513	0.8672139285355	1	1	0.496103159701833	0.0235668543880741	Inf	0.527173913043478	0	1	1	1	0	0.602484472049689	0.82963377526718	1	1	0.572343726905525	1	1	1	27	26	0
"TCGA-BR-A4IY-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	158	0	1	11	12	143	5863	5	8	5	18	1294	5	9	3	17	1417	13	4	38	55	1576	12	13	28	53	1576	2	2	3	7	220	0.0443037974683544	0.132075471698113	0.139593908629442	0.946140651801029	0.0318181818181818	4	0	2	6	190	0.0379746835443038	0.109090909090909	0.120558375634518	0.90488038277512	0.0315789473684211	0.069620253164557	11	80	410	2742	0.64946064248437	1	1	0.919578596814599	0.494085617338372	Inf	0.929295095148754	1.84507317073171	0.0983487595710521	0.315808794622601	1	2.11130848930548	0.582409460458241	0.940917393519226	1	1	0.548264463476491	1	1	1	147	132	0
"TCGA-BR-A4IZ-01A-32D-A25D-08"	0	0	0	0	10	0	0	0	0	10	410	0	0	2	2	88	0	0	0	0	99	0	0	4	4	116	0	0	4	4	107	0	0	0	0	9	0	0	0.0841121495327103	0	0	0	0	0	0	12	0	0	0.103448275862069	0	0	0	0	8	21	202	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	10	10	0
"TCGA-BR-A4J1-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	77	1	0	2	2	74	3034	0	5	5	10	711	2	3	2	7	732	8	5	17	30	819	5	5	17	27	772	0	1	3	4	95	0.051948051948052	0.148148148148148	0.123056994818653	1.20389863547758	0.0421052631578947	2	0	2	4	107	0.051948051948052	0.133333333333333	0.130647130647131	1.02056074766355	0.0373831775700935	0.0909090909090909	7	40	202	1389	0.392584342495677	1	1	1.20318385236368	0.527280416552625	Inf	1.17305666736886	1.21172886519421	0.506934038876864	0.802392309331645	1	1.25003549669348	1.15827023878858	0.440224280870612	1	1	1.18541262305343	0.314685314685315	0.594405594405595	1	70	67	0
"TCGA-BR-A4J2-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	49	0	1	0	1	47	1927	2	1	2	5	412	0	2	1	3	461	0	0	21	21	527	0	2	16	18	527	0	0	0	0	70	0	0	0.132827324478178	0	0	0	0	0	0	70	0	0	0.132827324478178	0	0	0	0	37	140	914	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	49	47	0
"TCGA-BR-A4J4-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	89	1	2	1	3	85	3485	0	3	2	5	786	0	4	1	5	825	1	7	27	35	962	4	7	29	40	912	1	2	2	5	116	0.0561797752808989	0.125	0.12719298245614	0.982758620689655	0.0431034482758621	0	1	0	1	100	0.0112359550561798	0.0285714285714286	0.103950103950104	0.274857142857143	0.01	0.0337078651685393	3	58	216	1658	0.976220671862348	1	1	0.397165208129622	0.104525256013238	Inf	0.426684881602914	1.73518518518519	0.458973042022357	0.750212847644909	1	1.91823761004727	0.309854497354497	0.990826162449824	1	1	0.284410440781707	1	1	1	86	82	0
"TCGA-BR-A4J6-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	39	1	1	0	1	37	1517	0	4	1	5	355	2	1	2	5	372	2	5	6	13	385	0	4	10	14	405	0	0	2	2	62	0.0512820512820513	0.142857142857143	0.153086419753086	0.933179723502304	0.032258064516129	0	2	0	2	40	0.0512820512820513	0.153846153846154	0.103896103896104	1.48076923076923	0.05	0.0512820512820513	2	16	102	688	0.696836695497657	1	1	0.843313259308188	0.136585855184206	Inf	0.860566448801743	0	1	1	1	0	0.968137254901961	0.633042399914012	1	1	0.963625800138966	0.428571428571429	0.707755102040817	1	37	35	0
"TCGA-BR-A4J7-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	0	2	0	2	473	1	5	2	8	561	1	5	20	26	668	0	1	20	21	635	0	0	1	1	74	0.0175438596491228	0.0476190476190476	0.116535433070866	0.408622908622909	0.0135135135135135	0	0	0	0	57	0	0	0.0853293413173653	0	0	0.0175438596491228	1	40	131	1172	0.986518045441636	1	1	0.223807407836229	0.0111452040811173	Inf	0.242599143548687	0	1	1	1	0	0.248664122137405	0.985049713757061	1	1	0.229544880407285	1	1	1	56	56	0
"TCGA-BR-A4J8-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	110	1	0	2	2	107	4387	3	6	6	15	1015	5	7	1	13	1039	0	5	29	34	1122	4	4	37	45	1211	0	1	4	5	162	0.0454545454545455	0.111111111111111	0.133773740710157	0.830589849108368	0.0308641975308642	0	0	3	3	139	0.0272727272727273	0.0882352941176471	0.123885918003565	0.712230215827338	0.0215827338129496	0.0636363636363636	7	63	301	2032	0.813170261581086	1	1	0.75017394091528	0.336644730984804	Inf	0.775083056478405	0	1	1	1	0	0.822057787174066	0.762870996622199	1	1	0.801014830885943	0.0013986013986014	0.00803061756004509	0.404195804195805	103	100	0
"TCGA-BR-A4PD-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	173	0	2	5	7	166	6806	10	23	17	50	1620	1	18	27	46	1621	4	4	18	26	1767	4	9	31	44	1798	2	2	5	9	234	0.0520231213872832	0.204545454545455	0.130144605116796	1.57167832167832	0.0384615384615385	2	0	6	8	237	0.046242774566474	0.307692307692308	0.134125636672326	2.29406037000974	0.0337552742616034	0.0867052023121387	15	42	471	3094	0.00656358083676848	0.237109357728261	1	2.34533499465765	1.33292760706597	Inf	1.9918426639848	3.78450106157113	0.01388713011136	0.0893485942413713	1	6.56312300228425	1.69916374192989	0.0537286700308397	1	1	1.9010323397854	0.0366365204494528	0.121700625401056	1	158	151	0
"TCGA-BR-A4PE-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	238	0	5	8	13	224	9184	4	8	14	26	2088	4	6	11	21	2026	7	15	77	99	2605	5	16	57	78	2465	2	2	4	8	295	0.0336134453781513	0.102564102564103	0.119675456389452	0.857018687527162	0.0271186440677966	1	3	5	9	295	0.0378151260504202	0.0909090909090909	0.113243761996161	0.802773497688752	0.0305084745762712	0.0504201680672269	12	134	590	4480	0.925674276341322	1	1	0.680034136559278	0.381656721003381	Inf	0.706292082656141	2.14830508474576	0.156658738381992	0.419207179559219	1	2.53057790585649	0.577156589931697	0.977940036460652	1	1	0.546763567449507	0.0707291515532555	0.202383413850404	1	226	212	0
"TCGA-BR-A4PF-01A-11D-A25D-08"	0	0	1	1	109	1	2	5	7	101	4141	3	8	2	13	980	2	5	2	9	1035	4	10	33	47	1041	4	7	21	32	1085	2	2	2	6	147	0.055045871559633	0.1875	0.135483870967742	1.38392857142857	0.0408163265306122	1	3	2	6	138	0.055045871559633	0.127659574468085	0.132564841498559	0.962997224791859	0.0434782608695652	0.0642201834862385	7	55	285	1841	0.74116691843755	1	1	0.822206191574348	0.366920739040146	Inf	0.842218449349179	2.79736842105263	0.0810665686445937	0.278907599265328	1	3.87245357995298	0.552566601689409	0.941593994394109	1	1	0.516897447442481	1	1	1	102	94	0
"TCGA-BR-A4QI-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	149	1	1	4	5	143	5863	5	10	4	19	1339	10	6	7	23	1410	5	10	40	55	1522	4	8	34	46	1592	1	1	5	7	202	0.0469798657718121	0.152173913043478	0.126884422110553	1.19931123547137	0.0346534653465347	1	2	4	7	185	0.0469798657718121	0.127272727272727	0.121550591327201	1.04707616707617	0.0378378378378378	0.0738255033557047	11	72	387	2727	0.461551927462831	1	1	1.07654701561227	0.576023297729908	Inf	1.06640515550574	1.78811369509044	0.311223920798678	0.641811875285219	1	2.0127539415196	0.978629792583281	0.581371396893838	1	1	0.975676834636887	0.0183066361556064	0.0696133927496086	1	138	132	0
"TCGA-BR-A4QL-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	2148	51	44	315	359	1737	71217	21	118	24	163	15667	17	107	18	142	15652	15	64	643	722	19709	8	67	635	710	20189	2	8	6	16	2189	0.0074487895716946	0.0225352112676056	0.108425380157512	0.207840740192641	0.00730927364093193	3	8	10	21	2222	0.00977653631284916	0.0290858725761773	0.112740372418692	0.257989857157461	0.00945094509450945	0.00977653631284916	21	1280	4411	35487	1	1	1	0.131993300030864	0.0880908834173967	Inf	0.146001079336457	1.96632923619804	0.102691429195322	0.32612992348844	1	2.23469328007424	0.11324086994067	1	1	1	0.102000813060658	0.00899632254826935	0.0406240190070288	1	2127	1716	0
"TCGA-BR-A4QM-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	115	1	0	4	4	110	4510	3	6	6	15	1016	4	11	5	20	1050	1	8	31	40	1182	2	4	29	35	1262	0	0	4	4	148	0.0347826086956522	0.114285714285714	0.117274167987322	0.974517374517375	0.027027027027027	1	0	0	1	130	0.00869565217391304	0.025	0.109983079526227	0.227307692307692	0.00769230769230769	0.0434782608695652	5	58	278	2166	0.856143871139234	1	1	0.671762095988109	0.253886523646116	Inf	0.697727532259906	2.93045563549161	0.304643760516083	0.633396020065813	1	3.89186287074978	0.586091127098321	0.920060968300407	1	1	0.556631737600026	0.206349206349206	0.425963718820861	1	110	105	0
"TCGA-CD-5798-01A-11D-1600-08"	0	1	0	1	100	0	0	5	5	95	3895	6	3	5	14	911	3	4	7	14	990	3	2	24	29	992	2	5	31	38	1002	2	2	3	7	159	0.07	0.184210526315789	0.158682634730539	1.16087388282026	0.0440251572327044	0	1	3	4	123	0.04	0.137931034482759	0.123991935483871	1.11241940005607	0.032520325203252	0.08	8	52	282	1712	0.628172852458672	1	1	0.934002999339963	0.439460201697486	Inf	0.942789598108747	2.82836879432624	0.150175293327851	0.411498912689185	1	4.04327132304044	0.77137330754352	0.807153136351993	1	1	0.74347620102762	0.18266253869969	0.390302037298702	1	92	87	0
"TCGA-CD-5799-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	55	0	1	1	2	53	2173	2	4	2	8	480	3	4	0	7	499	2	7	15	24	630	2	1	11	14	564	0	0	0	0	66	0	0	0.117021276595745	0	0	1	2	0	3	93	0.0545454545454545	0.125	0.147619047619048	0.846774193548387	0.032258064516129	0.0181818181818182	1	29	159	1035	0.985835944486613	1	1	0.224624476528087	0.0111000734477352	Inf	0.250314465408805	1.87735849056604	0.43684731159819	0.73829750322735	1	2.16798797323601	0	1	1	1	0	1	1	1	54	52	0
"TCGA-CD-5800-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	177	0	3	1	4	173	7093	2	7	2	11	1626	3	8	5	16	1834	8	6	55	69	1830	6	8	63	77	1803	1	1	13	15	282	0.0847457627118644	0.194805194805195	0.156405990016639	1.2455098093396	0.0531914893617021	2	1	10	13	235	0.0734463276836158	0.188405797101449	0.128415300546448	1.46716003700278	0.0553191489361702	0.146892655367232	26	106	517	3116	0.0557535167654005	0.818497230790799	1	1.47816269843732	0.987174869272878	Inf	1.3841216810269	1.50580270793037	0.321584059208075	0.641811875285219	1	1.64347668409068	1.36968494902141	0.0748570634796135	1	1	1.45901807873629	9.92400503067198e-08	2.8680374538642e-06	2.8680374538642e-05	151	147	0
"TCGA-CD-5801-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	594	0	1	3	4	589	24149	27	65	95	187	6030	26	78	99	203	6529	4	16	67	87	5640	3	15	94	112	5950	1	4	17	22	1033	0.037037037037037	0.196428571428571	0.173613445378151	1.13141335914811	0.021297192642788	1	1	12	14	882	0.0235690235690236	0.160919540229885	0.156382978723404	1.02900930487137	0.0158730158730159	0.0521885521885522	31	137	1915	9675	0.281333476991843	1	1	1.14315104858579	0.798572499757119	Inf	1.11677856521199	1.72920552032824	0.32636232552739	0.641811875285219	1	2.02080250128476	1.09015130629389	0.338090918472984	1	1	1.10997626935012	4.78822115159594e-11	2.30632652135204e-09	1.38379591281123e-08	563	558	0
"TCGA-CD-5802-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	62	0	1	6	7	54	2214	1	4	0	5	528	0	1	0	1	502	3	1	21	25	565	2	4	17	23	619	1	1	6	8	75	0.129032258064516	0.347826086956522	0.121163166397415	2.87072463768116	0.106666666666667	1	0	3	4	80	0.0645161290322581	0.16	0.141592920353982	1.13	0.05	0.17741935483871	11	32	155	1029	0.0229524617920768	0.603023768900927	1	2.28006227654907	1.15386116473025	Inf	1.95408852213053	3.05548387096774	0.132365700013568	0.378749379246744	1	4.417344692972	1.80916808149406	0.0574912019522023	1	1	2.05876951751058	0.0122781377997423	0.0499772087905004	1	51	43	0
"TCGA-CD-5803-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	45	0	0	1	1	43	1763	2	3	0	5	418	2	2	1	5	448	2	3	12	17	437	2	4	10	16	460	0	1	1	2	57	0.0444444444444444	0.125	0.123913043478261	1.00877192982456	0.0350877192982456	1	0	2	3	52	0.0666666666666667	0.176470588235294	0.118993135011442	1.48303167420814	0.0576923076923077	0.0888888888888889	4	22	109	788	0.396365564284716	1	1	1.31399803415922	0.407961514672309	Inf	1.26605504587156	2.05733944954128	0.406523582159958	0.716373873440414	1	2.40656841759223	1.12218515429525	0.514449445095774	1	1	1.1412807703119	0.523809523809524	0.822722567287785	1	41	39	0
"TCGA-CD-5804-01A-12D-2053-08"	0	0	0	0	103	0	2	11	13	90	3690	1	7	3	11	869	2	6	0	8	865	3	7	28	38	1003	1	5	27	33	953	1	1	1	3	139	0.029126213592233	0.0909090909090909	0.14585519412382	0.623283191628515	0.0215827338129496	2	1	3	6	137	0.058252427184466	0.157894736842105	0.136590229312064	1.15597387629658	0.0437956204379562	0.0679611650485437	7	52	276	1680	0.743756470053609	1	1	0.819474055958897	0.364736168385451	Inf	0.840825350036846	5.31521739130435	0.0102219272985038	0.0757471022889128	1	18.2140964390395	0.515415019762846	0.960070963599455	1	1	0.477546426682812	1	1	1	96	83	0
"TCGA-CD-5813-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	197	2	2	4	6	189	7749	10	10	7	27	1943	9	21	7	37	1941	10	13	45	68	1879	7	7	43	57	1986	3	1	2	6	287	0.0304568527918782	0.105263157894737	0.144511581067472	0.728406381808179	0.0209059233449477	5	3	5	13	282	0.065989847715736	0.191176470588235	0.150079829696647	1.2738318731748	0.0460992907801418	0.0761421319796954	15	90	569	3296	0.592680202309926	1	1	0.965440110239319	0.570338631008025	Inf	0.970374089881998	3.19652641372894	0.00159226980678242	0.0255647763422289	0.460165974160119	5.14571552256962	0.540321936411567	0.980301353394037	1	1	0.500668240894667	1	1	1	182	174	0
"TCGA-CD-8524-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	170	0	2	6	8	161	6601	1	4	2	7	1551	4	9	7	20	1520	2	8	55	65	1777	7	15	47	69	1753	1	3	1	5	218	0.0294117647058824	0.072463768115942	0.124358243011979	0.582701768381864	0.0229357798165138	0	2	3	5	217	0.0294117647058824	0.0769230769230769	0.122115925717501	0.629918468628146	0.0230414746543779	0.0294117647058824	5	106	435	3095	0.998438630522259	1	1	0.335677829570545	0.129143004255547	Inf	0.365537951744848	0.901660280970626	0.694163645080722	0.959872217360424	1	0.889376555101185	0.318233040342574	0.999022917259939	1	1	0.290468768601834	0.303405572755418	0.584561403508772	1	165	156	0
"TCGA-CD-8525-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	92	0	2	5	7	85	3485	0	8	4	12	824	2	6	3	11	869	10	5	17	32	850	6	4	20	30	942	3	0	3	6	113	0.0652173913043478	0.2	0.119957537154989	1.66725663716814	0.0530973451327434	7	1	2	10	113	0.108695652173913	0.3125	0.132941176470588	2.35066371681416	0.0884955752212389	0.16304347826087	15	38	226	1566	0.00219768992927445	0.127026477912063	0.635132389560316	2.7331518719905	1.53080110717564	Inf	2.24411420938387	4.95575221238938	4.69744422197871e-06	0.000216459837283589	0.00135756138015185	11.518891220472	1.07151399186797	0.509954197512718	1	1	1.08266492235489	0.155613477924309	0.359778360961002	1	77	70	0
"TCGA-CD-8526-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	49	0	2	3	5	44	1804	0	2	0	2	420	0	1	0	1	417	5	3	13	21	491	3	3	14	20	476	2	0	0	2	63	0.0408163265306122	0.1	0.132352941176471	0.755555555555556	0.0317460317460317	0	1	1	2	50	0.0408163265306122	0.0952380952380952	0.10183299389002	0.935238095238095	0.04	0.0612244897959184	3	32	113	854	0.79223628051605	1	1	0.708733492604177	0.18133857835815	Inf	0.733501896333755	2.13938053097345	0.24136402349531	0.53527889481757	1	2.51567548429058	0.316945263847919	0.964408291670458	1	1	0.29090391925633	1	1	1	46	41	0
"TCGA-CD-8527-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	300	3	2	12	14	282	11562	8	16	6	30	2577	7	23	10	40	2631	11	21	75	107	3117	6	15	84	105	3237	1	0	3	4	385	0.0133333333333333	0.0380952380952381	0.118937287611986	0.320296846011132	0.0103896103896104	3	5	2	10	342	0.0333333333333333	0.0934579439252336	0.109720885466795	0.851778980160682	0.0292397660818713	0.03	9	167	727	5627	0.998692446169765	1	1	0.417167013272905	0.21339509823751	Inf	0.44693322495936	2.05647706125091	0.122006309616735	0.359329639467391	1	2.38108987794014	0.274843632399886	0.999959048311373	1	1	0.25133158200726	1	1	1	291	273	0
"TCGA-CD-8528-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	116	0	0	1	1	115	4715	1	6	3	10	1039	3	7	2	12	1102	2	7	28	37	1310	4	4	48	56	1264	0	0	0	0	147	0	0	0.11629746835443	0	0	1	2	0	3	141	0.0258620689655172	0.0810810810810811	0.10763358778626	0.753306497987349	0.0212765957446809	0.00862068965517241	1	81	288	2286	0.99993242619079	1	1	0.0980318685379314	0.00492131149584401	Inf	0.108993902439024	1.48958333333333	0.510093385375224	0.802392309331645	1	1.58714936243155	0	1	1	1	0	1	1	1	115	114	0
"TCGA-CD-8529-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	451	2	2	22	24	421	17261	18	17	16	51	4115	21	19	11	51	4346	52	31	82	165	4276	53	38	63	154	4524	17	7	9	33	618	0.0731707317073171	0.214285714285714	0.136604774535809	1.56865464632455	0.0533980582524272	18	6	13	37	620	0.082039911308204	0.224242424242424	0.144995322731525	1.54654936461388	0.0596774193548387	0.126385809312639	57	193	1238	7562	0.000173786606305714	0.0167414430741171	0.0502243292223513	1.80384363378923	1.37850070582187	Inf	1.62067851373183	2.36941303177167	5.89982998404827e-07	4.26262716347488e-05	0.000170505086538995	3.05358052242181	1.07849144894435	0.387955725561421	1	1	1.09254666646622	0.0385597000321053	0.126633560332709	1	394	364	22
"TCGA-CD-8530-01A-11D-2340-08"	0	2	0	2	100	1	2	2	4	95	3895	4	6	9	19	945	1	7	6	14	967	5	4	18	27	967	7	7	21	35	1016	3	3	3	9	141	0.09	0.257142857142857	0.138779527559055	1.85288753799392	0.0638297872340425	0	0	3	3	126	0.03	0.111111111111111	0.130299896587384	0.852733686067019	0.0238095238095238	0.09	9	42	267	1716	0.24774732341675	1	1	1.37696278710204	0.669621249542393	Inf	1.31064111037674	1.85674157303371	0.214518263596021	0.504675394527314	1	2.14127230335445	1.14261019878997	0.433957392316509	1	1	1.16842317613688	0.400323058285099	0.684576117422447	1	91	86	0
"TCGA-CD-8531-01A-11D-2340-08"	1	0	1	2	266	1	2	11	13	251	10291	12	17	12	41	2407	8	20	9	37	2445	13	10	63	86	2670	7	11	69	87	2769	0	1	5	6	328	0.0225563909774436	0.0689655172413793	0.118454315637414	0.582211942809083	0.0182926829268293	2	1	2	5	334	0.018796992481203	0.0581395348837209	0.125093632958801	0.46476813814232	0.0149700598802395	0.0338345864661654	9	143	662	4777	0.996285369275728	1	1	0.454201646611809	0.231643089301726	Inf	0.486474399745588	0.821601208459214	0.718829950146537	0.979914413171458	1	0.801818576926945	0.435697610546553	0.997352808192411	1	1	0.404143114499997	0.0804953560371517	0.213423466924191	1	257	242	0
"TCGA-CD-8532-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	54	2	3	3	6	46	1886	1	1	0	2	489	2	9	1	12	443	1	1	13	15	483	1	2	14	17	471	0	0	4	4	61	0.0740740740740741	0.235294117647059	0.129511677282378	1.81677917068467	0.0655737704918033	0	0	1	1	70	0.0185185185185185	0.0666666666666667	0.144927536231884	0.46	0.0142857142857143	0.0925925925925926	5	24	131	823	0.372960795567528	1	1	1.30844867974201	0.468700616124161	Inf	1.25559357725717	0	1	1	1	0	1.34860050890585	0.315716849485176	1	1	1.42724084480611	0.00793650793650794	0.0369943676395289	1	49	41	0
"TCGA-CD-8534-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	84	0	4	0	4	80	3280	0	6	0	6	782	3	4	3	10	799	3	4	28	35	838	1	2	26	29	861	1	0	3	4	121	0.0476190476190476	0.137931034482759	0.140534262485482	0.981476204046737	0.0330578512396694	1	1	8	10	115	0.119047619047619	0.285714285714286	0.137231503579952	2.08198757763975	0.0869565217391304	0.154761904761905	13	45	236	1463	0.0566434069751418	0.818497230790799	1	1.79014874598439	0.978244918936161	Inf	1.61360315604909	3.59957627118644	0.0962821621522805	0.315808794622601	1	6.18821364842572	1.46649403640929	0.12721682006213	1	1	1.5853378058491	0.00183814181660459	0.00948612473212012	0.531222984998727	71	67	0
"TCGA-CD-8535-01A-11D-2340-08"	0	1	0	1	296	5	2	8	10	281	11521	11	20	30	61	2878	11	24	32	67	2904	9	9	63	81	2913	5	10	57	72	2826	1	3	9	13	393	0.0439189189189189	0.180555555555556	0.139065817409766	1.29834605597964	0.0330788804071247	2	1	8	11	429	0.0371621621621622	0.135802469135802	0.147270854788877	0.922127255460589	0.0256410256410256	0.0675675675675676	20	114	822	4917	0.460081725737355	1	1	1.04943065821017	0.669777205392814	Inf	1.04205251116679	1.49608967674661	0.324973629374715	0.641811875285219	1	1.63121556114582	0.989081508515815	0.559805191579381	1	1	0.987280991762902	8.82777082593548e-05	0.000879733023688053	0.0255122576869535	276	261	0
"TCGA-CD-8536-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1058	4	36	154	190	864	35424	7	69	6	82	7640	8	65	6	79	7826	3	46	333	382	9942	11	44	266	321	10016	1	6	0	7	1066	0.00661625708884688	0.0218068535825545	0.106429712460064	0.20489441414903	0.00656660412757974	0	6	3	9	1064	0.00850661625708885	0.0235602094240838	0.107020720177027	0.220146242569775	0.00845864661654135	0.00378071833648393	4	609	2130	17828	1	1	1	0.0549779495725292	0.0186779505954421	Inf	0.0611416186077859	0.669282360831657	0.794064873047745	1	1	0.643854687303398	0.046927978555809	1	1	1	0.0421121175512616	0.599555061179088	0.907180171103437	1	1054	860	0
"TCGA-CD-A486-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	105	1	2	6	8	96	3936	0	7	1	8	905	4	5	1	10	977	3	7	31	41	1015	1	6	30	37	1039	0	1	2	3	122	0.0285714285714286	0.0810810810810811	0.117420596727623	0.690518387239699	0.0245901639344262	1	2	1	4	109	0.0380952380952381	0.0975609756097561	0.107389162561576	0.908480644439472	0.036697247706422	0.0380952380952381	4	61	231	1823	0.942083455836011	1	1	0.517620616474229	0.170238199861795	Inf	0.547186147186147	2.22294372294372	0.380472561213857	0.68235126628403	1	2.62883390451534	0.437300404513519	0.972701607534565	1	1	0.4083188926815	0.559440559440559	0.869238288593127	1	101	92	0
"TCGA-CD-A487-01A-21D-A24D-08"	0	1	0	1	202	1	1	2	3	198	8118	4	14	20	38	2054	5	12	21	38	1914	11	11	46	68	2046	5	5	44	54	2104	3	1	6	10	285	0.0495049504950495	0.185185185185185	0.135456273764259	1.36712150747238	0.0350877192982456	3	1	7	11	293	0.0544554455445545	0.161764705882353	0.143206256109482	1.129592451315	0.037542662116041	0.0940594059405941	19	87	578	3572	0.151887412302963	1	1	1.34953285134647	0.842166788437647	Inf	1.28696872755762	2.69247404844291	0.0170126870823828	0.10243055347518	1	3.70632872760216	1.03710111495579	0.491212654698879	1	1	1.04336198414986	0.0616035933380409	0.184061354411994	1	183	179	0
"TCGA-CD-A489-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	87	0	1	0	1	86	3526	3	6	4	13	875	3	7	6	16	893	1	5	24	30	874	3	5	19	27	884	0	1	3	4	122	0.0459770114942529	0.148148148148148	0.138009049773756	1.07346690953248	0.0327868852459016	0	0	5	5	117	0.0574712643678161	0.166666666666667	0.133867276887872	1.24501424501424	0.0427350427350427	0.0919540229885057	8	39	239	1519	0.309216153891094	1	1	1.30351174985927	0.603527596198159	Inf	1.25202528264934	0	1	1	1	0	1.36849275080276	0.228237157210337	1	1	1.45237411603238	0.000411353352529823	0.00270184361093452	0.118881118881119	79	78	0
"TCGA-CD-A48A-01A-12D-A24D-08"	0	0	1	1	262	1	3	6	9	252	10332	10	23	19	52	2444	8	20	31	59	2522	4	12	49	65	2628	8	14	54	76	2738	2	2	7	11	376	0.0419847328244275	0.144736842105263	0.137326515704894	1.05396136618141	0.0292553191489362	2	3	4	9	355	0.0343511450381679	0.138461538461538	0.135083713850837	1.02500541711809	0.0253521126760563	0.0572519083969466	15	100	731	4635	0.613011518085485	1	1	0.95109579642678	0.564689630567774	Inf	0.957473383691191	2.4468764249886	0.0694450338449443	0.257302753604986	1	3.169337986041	0.783950699268192	0.844139857996848	1	1	0.758154051736236	0.0483720650572709	0.150317492489799	1	247	237	0
"TCGA-CD-A48C-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	243	0	0	3	3	239	9799	13	13	26	52	2377	9	16	21	46	2415	12	18	49	79	2521	6	12	44	62	2486	3	2	6	11	336	0.0452674897119342	0.17741935483871	0.13515687851971	1.31269201228879	0.0327380952380952	2	3	6	11	327	0.0452674897119342	0.139240506329114	0.129710432368108	1.07347191576666	0.0336391437308868	0.0699588477366255	17	94	663	4344	0.301504669849642	1	1	1.1848840948804	0.723752531700656	Inf	1.15661815661816	2.09778783308195	0.0799100249669394	0.278240930306572	1	2.51933038067991	0.974456283754196	0.584979663777483	1	1	0.97067526124051	0.0617783784704615	0.184061354411994	1	226	222	0
"TCGA-CD-A4MG-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	2999	9	93	329	422	2567	105247	22	248	37	307	23284	15	257	40	312	23479	15	192	763	970	29008	17	193	768	978	29476	1	10	11	22	3273	0.00733577859286429	0.0224948875255624	0.111039489754376	0.202584572167271	0.00672166208371525	2	6	13	21	3352	0.00700233411137046	0.0216494845360825	0.115554329840044	0.187353295770489	0.00626491646778043	0.00900300100033345	27	1536	6625	51859	1	1	1	0.137599800428605	0.0967944207428945	Inf	0.152495129105856	0.827603773584906	0.718697649552841	0.979914413171458	1	0.809796289246052	0.138384432421774	1	1	1	0.124664667124529	1.30226622804899e-06	2.35221837441349e-05	0.000376354939906158	2972	2540	0
"TCGA-CD-A4MH-01A-11D-A25D-08"	0	1	0	1	97	0	1	7	8	89	3649	3	4	1	8	852	2	4	1	7	822	1	5	29	35	984	4	5	30	39	991	1	0	3	4	109	0.0412371134020619	0.102564102564103	0.109989909182644	0.932486473770877	0.036697247706422	0	2	3	5	119	0.0515463917525773	0.142857142857143	0.120934959349594	1.1812725090036	0.0420168067226891	0.0721649484536082	7	57	228	1747	0.61960017708789	1	1	0.941001708698708	0.419666306511287	Inf	0.947436951754386	1.73245614035088	0.459472920529927	0.750212847644909	1	1.91487708963712	0.880909901873327	0.689710963025351	1	1	0.8675141700074	0.0497737556561086	0.153027823240589	1	90	82	0
"TCGA-CD-A4MI-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	1165	1	25	97	122	1041	42681	8	94	13	115	9448	6	81	11	98	9570	8	80	319	407	11650	4	76	341	421	12013	0	4	2	6	1370	0.00515021459227468	0.0142517814726841	0.114043119953384	0.124968358271061	0.00437956204379562	2	3	4	9	1358	0.00772532188841202	0.0221130221130221	0.11656652360515	0.189703024754571	0.00662739322533137	0.00686695278969957	8	664	2728	20935	1	1	1	0.0924632218775743	0.0457938166154155	Inf	0.103263336126239	1.44568670576735	0.410613473556391	0.719195720350285	1	1.53478288109075	0.078855638496401	1	1	1	0.0704078610396533	0.214759287023155	0.437080520772477	1	1157	1033	0
"TCGA-CD-A4MJ-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	791	10	34	123	157	624	25584	6	60	9	75	5542	4	61	13	78	5756	8	35	198	241	7005	3	37	190	230	7281	0	1	3	4	787	0.00505689001264223	0.0173913043478261	0.108089548138992	0.160897188000663	0.00508259212198221	0	1	1	2	772	0.00252844500632111	0.00829875518672199	0.110206995003569	0.0753015286049062	0.00259067357512953	0.00505689001264223	4	395	1559	12727	1	1	1	0.0826749060156954	0.0280754107465205	Inf	0.0918653272051199	0	1	1	1	0	0.0944697565846465	0.999999999999999	1	1	0.0850431800943431	0.0606060606060606	0.184061354411994	1	787	620	0
"TCGA-CG-4300-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	158	1	1	3	4	152	6232	2	12	10	24	1556	6	11	8	25	1531	6	12	38	56	1558	2	6	39	47	1587	2	1	2	5	207	0.0316455696202532	0.106382978723404	0.130434782608696	0.815602836879433	0.0241545893719807	1	2	2	5	205	0.0316455696202532	0.0892857142857143	0.131578947368421	0.678571428571429	0.024390243902439	0.0443037974683544	7	78	412	2733	0.938340619262129	1	1	0.595394532207662	0.269612600052435	Inf	0.628640776699029	2.86256067961165	0.0763165025913723	0.271152223087741	1	3.97767373327297	0.396545202370445	0.992994425274629	1	1	0.363557769393032	1	1	1	151	145	0
"TCGA-CG-4301-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	56	1	0	1	1	54	2214	1	4	1	6	519	4	2	1	7	529	3	1	18	22	605	5	5	9	19	561	4	2	1	7	68	0.125	0.368421052631579	0.121212121212121	3.03947368421053	0.102941176470588	1	1	1	3	71	0.0535714285714286	0.136363636363636	0.117355371900826	1.16197183098592	0.0422535211267606	0.125	7	28	139	1027	0.122052935785981	1	1	1.84590085167808	0.786989863812921	Inf	1.67769784172662	5.24280575539568	0.00106975542289746	0.0206106211478244	0.309159317217366	12.2642180960806	0.621369571009859	0.848364468664115	1	1	0.591294637323772	0.34984520123839	0.627983000980712	1	49	47	0
"TCGA-CG-4304-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	84	0	1	6	7	76	3116	1	2	4	7	731	3	3	3	9	743	6	4	20	30	836	6	2	22	30	806	3	1	1	5	94	0.0595238095238095	0.166666666666667	0.116625310173697	1.4290780141844	0.0531914893617021	2	1	3	6	113	0.0714285714285714	0.2	0.135167464114833	1.47964601769912	0.0530973451327434	0.107142857142857	9	45	207	1435	0.242029351383675	1	1	1.38617152378821	0.674674193844309	Inf	1.32206119162641	3.30515297906602	0.0122173976145956	0.0861177539175153	1	4.9439916326313	0.755463538072234	0.792259515187355	1	1	0.729845325731384	1	1	1	75	67	0
"TCGA-CG-4305-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1386	3	49	173	222	1161	47601	11	125	21	157	10856	15	93	27	135	11208	8	58	358	424	12789	15	70	360	445	12748	2	5	7	14	1572	0.0101010101010101	0.0314606741573034	0.123313460935049	0.255127655316351	0.0089058524173028	1	4	8	13	1436	0.00937950937950938	0.0306603773584906	0.112283994057393	0.273060979134914	0.00905292479108635	0.012987012987013	18	723	3008	22529	1	1	1	0.186471864406208	0.119754693059043	Inf	0.206227388233267	1.1073514107308	0.519633624782115	0.802392309331645	1	1.12342404074384	0.177361298376104	1	1	1	0.159814311521032	0.0011484298950943	0.00691450499338026	0.331896239682253	1368	1143	0
"TCGA-CG-4306-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1322	4	66	152	218	1099	45059	7	58	13	78	9964	14	85	13	112	10173	5	46	401	452	12526	6	56	395	457	12396	2	3	8	13	1459	0.00983358547655068	0.0284463894967177	0.117699257825105	0.241687076217487	0.00891021247429746	0	5	7	12	1435	0.00907715582450832	0.0265486725663717	0.114561711639789	0.23174123523789	0.00836236933797909	0.0128593040847201	17	790	2894	22028	1	1	1	0.163800140571711	0.103762119013691	Inf	0.18140938522551	1.56574731419237	0.371177951354714	0.678926759123496	1	1.6914191054693	0.162279087212149	1	1	1	0.146195190990575	0.000209758131372125	0.0017073480803458	0.0606200999665441	1305	1082	0
"TCGA-CG-4436-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	207	0	1	6	7	199	8159	3	12	17	32	1988	9	13	24	46	2117	8	6	51	65	1965	11	8	37	56	2089	4	0	3	7	306	0.0338164251207729	0.125	0.146481570129248	0.853349673202614	0.0228758169934641	2	1	0	3	285	0.0144927536231884	0.0461538461538462	0.145038167938931	0.318218623481781	0.0105263157894737	0.0434782608695652	9	98	591	3463	0.979551064194838	1	1	0.5381901587117	0.272072565701382	Inf	0.576972342141468	2.16617686347849	0.0483269198887015	0.202412751417895	1	2.70329153713414	0.233848638670974	0.999866587653094	1	1	0.206853246995272	0.369849964277209	0.647797816218869	1	198	190	0
"TCGA-CG-4437-01A-01D-1800-08"	0	0	0	0	604	1	1	30	31	569	23329	25	22	27	74	5410	30	39	15	84	5683	66	36	112	214	6081	55	44	98	197	6155	13	7	8	28	837	0.0463576158940397	0.142131979695431	0.135987002437043	1.04518797494072	0.033452807646356	18	3	10	31	802	0.0513245033112583	0.144859813084112	0.13188620292715	1.09836972988091	0.0386533665835411	0.0811258278145695	49	282	1639	10597	0.251243101192506	1	1	1.12339650124239	0.852250871995791	Inf	1.10516876217722	1.91265587260928	0.000257445160292673	0.00531440366604161	0.0744016513245825	2.22682768168253	0.639902379499695	0.987782511136393	1	1	0.606164774336351	0.0245141327320167	0.0885573044944103	1	555	520	0
"TCGA-CG-4438-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	156	0	1	3	4	151	6191	4	9	6	19	1473	1	9	9	19	1562	23	6	36	65	1572	9	9	30	48	1584	3	2	5	10	222	0.0641025641025641	0.208333333333333	0.140151515151515	1.48648648648649	0.045045045045045	11	0	5	16	214	0.102564102564103	0.246153846153846	0.136132315521628	1.80819554277498	0.0747663551401869	0.153846153846154	24	74	436	2720	0.00387266803741901	0.186533510469016	1	2.02279702953517	1.30975016626222	Inf	1.77270174124696	3.16685779816514	4.21185799696421e-05	0.00121722696112266	0.0121722696112266	4.84857054600502	1.09674728940784	0.431633105702027	1	1	1.11402188720041	0.404330407061853	0.68736169200515	1	132	127	0
"TCGA-CG-4440-01A-01D-1158-08"	0	1	0	1	137	1	2	3	5	130	5330	3	6	7	16	1251	2	7	11	20	1323	7	9	33	49	1380	6	9	30	45	1376	2	1	5	8	192	0.0583941605839416	0.177777777777778	0.13953488372093	1.27407407407407	0.0416666666666667	3	3	5	11	190	0.0802919708029197	0.224489795918367	0.13768115942029	1.63050483351235	0.0578947368421053	0.109489051094891	15	61	382	2374	0.102223702960146	1	1	1.52792728171475	0.885710974919366	Inf	1.42394599063103	2.77486910994764	0.0255516996198583	0.139329079059227	1	3.88151524057033	1.14518407712125	0.37776842424847	1	1	1.17248458969728	0.183671546964095	0.390302037298702	1	122	115	0
"TCGA-CG-4441-01A-01D-1800-08"	0	0	0	0	136	1	2	3	5	130	5330	1	8	12	21	1209	3	3	7	13	1327	4	9	38	51	1362	4	5	36	45	1432	2	0	0	2	201	0.0147058823529412	0.0444444444444444	0.14036312849162	0.316639027086788	0.00995024875621891	2	2	1	5	168	0.0367647058823529	0.0980392156862745	0.123348017621145	0.794817927170868	0.0297619047619048	0.0367647058823529	5	77	369	2425	0.987218112267039	1	1	0.426833212034773	0.162927569459357	Inf	0.461696080375438	3.78590785907859	0.0139233457182421	0.0893485942413713	1	6.56431827597181	0.102321834029151	0.999968430574252	1	1	0.0900580867209366	0.265734265734266	0.52242995100138	1	131	125	0
"TCGA-CG-4442-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	1844	24	61	256	317	1500	61500	13	237	11	261	14335	19	265	26	310	14547	7	84	404	495	16261	7	64	363	434	16357	1	3	8	12	2028	0.00650759219088937	0.0276497695852535	0.123983615577429	0.223011479835301	0.00591715976331361	0	8	9	17	1936	0.00921908893709327	0.0343434343434343	0.119057868519771	0.288460013356708	0.00878099173553719	0.00976138828633406	18	763	3964	28654	1	1	1	0.170534265395336	0.109563597764643	Inf	0.189646640507202	0.587754072365576	0.837005782463271	1	1	0.556051377276322	0.182380012024781	1	1	1	0.163851896933165	6.84300078170197e-06	8.98921466323577e-05	0.00197762722591187	1826	1482	0
"TCGA-CG-4443-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	114	0	0	6	6	106	4346	4	7	2	13	992	5	8	1	14	1046	10	5	22	37	1128	15	9	18	42	1180	6	1	4	11	151	0.0964912280701754	0.261904761904762	0.127966101694915	2.04667297382529	0.0728476821192053	2	0	3	5	149	0.043859649122807	0.135135135135135	0.13209219858156	1.02303645927807	0.0335570469798658	0.131578947368421	15	50	300	2008	0.0198789729291425	0.574502317652218	1	2.00729797838974	1.14861339952936	Inf	1.77538461538462	2.46186666666667	0.0119151127815368	0.0860866898466034	1	3.14757174136135	1.34633333333333	0.262142800142445	1	1	1.41955439284537	1	1	1	99	91	0
"TCGA-CG-4444-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	202	1	1	2	3	196	8036	5	17	26	48	1995	8	10	31	49	2003	9	9	33	51	2047	5	11	32	48	1991	1	1	2	4	283	0.0198019801980198	0.0833333333333333	0.142139628327474	0.586277974087161	0.0141342756183746	4	3	3	10	284	0.0495049504950495	0.196078431372549	0.138739618954568	1.41328362330848	0.0352112676056338	0.0495049504950495	10	69	567	3471	0.686302413794023	1	1	0.887251446697481	0.460506548076721	Inf	0.901480141986471	2.54346182917612	0.0368266080890471	0.171659511898945	1	3.39946281194818	0.547822547822548	0.959657996095313	1	1	0.51020872701588	1	1	1	192	186	0
"TCGA-CG-4449-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	114	1	3	7	10	103	4223	1	7	1	9	947	4	9	4	17	1105	8	2	30	40	1070	9	5	23	37	1101	3	1	5	9	196	0.0789473684210526	0.243243243243243	0.178019981834696	1.36638168781026	0.0459183673469388	5	0	2	7	142	0.0614035087719298	0.175	0.132710280373832	1.31866197183099	0.0492957746478873	0.131578947368421	15	55	338	1833	0.125206565829932	1	1	1.47872646668194	0.85149130444658	Inf	1.37637362637363	3.02262443438914	0.00235978983344443	0.034098963093272	0.68197926186544	4.81545498958614	0.84833091436865	0.737633578841757	1	1	0.825318202514561	1	1	1	99	88	0
"TCGA-CG-4455-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	57	0	1	1	2	55	2255	0	5	2	7	546	3	3	1	7	550	1	3	20	24	553	1	3	13	17	606	0	2	1	3	78	0.0526315789473684	0.176470588235294	0.128712871287129	1.3710407239819	0.0384615384615385	0	0	2	2	82	0.0350877192982456	0.0833333333333333	0.148282097649186	0.561991869918699	0.024390243902439	0.0526315789473684	3	32	160	999	0.877993388716909	1	1	0.585571316031964	0.150442331858631	Inf	0.620892857142857	0	1	1	1	0	0.658522727272727	0.851646711538268	1	1	0.624585919887497	0.166666666666667	0.376302083333334	1	54	52	0
"TCGA-CG-4462-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	85	0	1	0	1	84	3444	0	5	4	9	853	1	3	3	7	776	4	4	21	29	927	3	2	34	39	888	0	0	1	1	98	0.0117647058823529	0.0256410256410256	0.11036036036036	0.232339089481947	0.0102040816326531	2	2	0	4	128	0.0470588235294118	0.137931034482759	0.138079827400216	0.998922413793104	0.03125	0.0352941176470588	3	59	226	1589	0.98664645787547	1	1	0.357641915793931	0.0941991675499019	Inf	0.38859548958036	2.29456384323641	0.214792641961452	0.504675394527314	1	2.81011603905492	0.146017699115044	0.999275372669744	1	1	0.130272813835605	1	1	1	82	81	0
"TCGA-CG-4465-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	748	5	22	107	129	614	25174	9	60	17	86	5737	3	58	16	77	5694	8	34	176	218	6830	4	45	184	233	6913	0	2	4	6	784	0.00802139037433155	0.0257510729613734	0.113409518298857	0.227062713497416	0.0076530612244898	0	1	6	7	780	0.00935828877005348	0.0321100917431193	0.114202049780381	0.281169136673724	0.00897435897435897	0.0133689839572193	10	362	1564	12179	0.999999999824695	1	1	0.215126126258558	0.115570323779193	Inf	0.236211946209059	0	1	1	1	0	0.244085677749361	0.999999999458042	1	1	0.222501731298492	0.000107686095032979	0.00103434541680568	0.0311212814645309	738	604	0
"TCGA-CG-4466-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	224	0	4	6	10	214	8774	6	15	22	43	2190	4	17	31	52	2303	7	11	43	61	2239	14	10	34	58	2042	5	1	4	10	339	0.0446428571428571	0.172413793103448	0.166013712047013	1.03855152069983	0.0294985250737463	1	5	2	8	351	0.0357142857142857	0.131147540983607	0.15676641357749	0.836579328382607	0.0227920227920228	0.0535714285714286	12	86	690	3591	0.882372292760328	1	1	0.726237459593823	0.403034136951794	Inf	0.759716060337178	1.77267080745342	0.110008535779271	0.334936469576037	1	2.08133162206965	0.483455674760023	0.989453581915022	1	1	0.439863645176256	1	1	1	212	202	0
"TCGA-CG-4469-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	342	3	2	5	7	330	13530	7	25	44	76	3326	11	21	46	78	3422	11	10	64	85	3355	15	19	57	91	3427	3	7	2	12	495	0.0350877192982456	0.131868131868132	0.144441202217683	0.912953712953713	0.0242424242424242	2	0	7	9	494	0.0263157894736842	0.105882352941176	0.147242921013413	0.719099785663253	0.0182186234817814	0.0409356725146199	14	133	989	5793	0.972779079937263	1	1	0.616610035470818	0.362595894128805	Inf	0.653088738023015	1.31873687485417	0.327581692683534	0.641811875285219	1	1.39454725586835	0.510056906968388	0.99427235760349	1	1	0.47072822403863	0.326423631912115	0.608611514271892	1	328	316	0
"TCGA-CG-4474-01A-02D-1158-08"	0	0	0	0	114	0	2	7	9	105	4305	0	7	1	8	937	4	4	4	12	1046	4	5	36	45	1151	3	7	30	40	1171	2	1	2	5	154	0.043859649122807	0.125	0.131511528608027	0.950487012987013	0.0324675324675325	1	0	2	3	132	0.0263157894736842	0.0666666666666667	0.114682884448306	0.581313131313131	0.0227272727272727	0.0614035087719298	7	66	286	2036	0.808639397738621	1	1	0.755113426235265	0.339271134709021	Inf	0.778522847015998	3.47952047952048	0.0451801571984819	0.192015668093548	1	5.33275656883512	0.49205340114431	0.968274361205677	1	1	0.459394372966448	1	1	1	107	98	0
"TCGA-CG-4475-01A-01D-1158-08"	0	1	0	1	61	0	0	6	6	55	2255	2	5	2	9	572	2	1	3	6	543	5	3	18	26	611	2	2	10	14	529	0	0	2	2	70	0.0327868852459016	0.142857142857143	0.132325141776938	1.07959183673469	0.0285714285714286	2	0	1	3	82	0.0491803278688525	0.115384615384615	0.134206219312602	0.859756097560976	0.0365853658536585	0.0819672131147541	5	30	152	988	0.511713707128919	1	1	1.08328075453321	0.394758450568745	Inf	1.07142857142857	2.14285714285714	0.239558978570137	0.53527889481757	1	2.59686630902093	0.803571428571429	0.74099313728982	1	1	0.780152424268964	1	1	1	56	50	0
"TCGA-CG-4476-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	140	0	1	3	4	135	5535	7	5	2	14	1378	2	10	1	13	1352	12	12	26	50	1412	8	9	41	58	1393	2	0	11	13	180	0.0928571428571429	0.224137931034483	0.12921751615219	1.7345785440613	0.0722222222222222	4	3	0	7	190	0.05	0.14	0.134560906515581	1.04042105263158	0.0368421052631579	0.121428571428571	17	70	370	2435	0.0652632094864754	0.8200464148518	1	1.59795225746184	0.960453186102088	Inf	1.48136067101584	2.27432432432432	0.0403370633904384	0.179344789535949	1	2.81900701368931	1.24465510286406	0.269238595011655	1	1	1.29258465697663	0.200287272812301	0.41944218726634	1	123	118	0
"TCGA-CG-4477-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	145	1	41	38	79	65	2665	0	4	1	5	625	3	1	3	7	662	4	2	19	25	730	5	6	17	28	648	2	1	1	4	89	0.0275862068965517	0.142857142857143	0.137345679012346	1.04012841091493	0.0449438202247191	0	0	1	1	84	0.00689655172413793	0.04	0.115068493150685	0.347619047619048	0.0119047619047619	0.0275862068965517	4	41	173	1205	0.8318054694779	1	1	0.679704898652775	0.219883525346895	Inf	0.708028259473346	1.77007064868337	0.316933902115974	0.641811875285219	1	1.98888858912237	0.442517662170841	0.949739752525384	1	1	0.409910866843521	1	1	1	141	61	0
"TCGA-CG-5717-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	201	0	0	5	5	194	7954	8	25	4	37	2005	6	17	3	26	2015	21	11	35	67	2024	26	10	28	64	1910	12	1	4	17	320	0.0845771144278607	0.265625	0.167539267015707	1.58544921875	0.053125	9	2	4	15	320	0.0746268656716418	0.223880597014925	0.158102766798419	1.4160447761194	0.046875	0.144278606965174	29	81	640	3294	0.00543290611956511	0.224301409793474	1	1.84233406373283	1.24095242221025	Inf	1.62053977272727	2.74647606382979	5.24297183731876e-06	0.000216459837283589	0.00151521886098512	4.15498209606728	0.780555555555556	0.824157719680788	1	1	0.748686866218472	0.0023068798379325	0.0116962854940788	0.666688273162492	172	165	0
"TCGA-CG-5718-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	99	1	2	2	4	94	3854	2	5	1	8	896	3	6	2	11	931	0	5	31	36	1008	6	10	23	39	1019	2	0	2	4	149	0.0404040404040404	0.102564102564103	0.146221786064769	0.701428325589399	0.0268456375838926	0	2	6	8	141	0.0808080808080808	0.222222222222222	0.139880952380952	1.5886524822695	0.0567375886524823	0.101010101010101	10	50	290	1737	0.357982003841415	1	1	1.19779921984827	0.610002994367598	Inf	1.16494252873563	2.32988505747126	0.208489597557724	0.504675394527314	1	2.99254843488737	1.03550446998723	0.518544791534975	1	1	1.0416652277195	0.0360748418360478	0.121228247565323	1	89	84	0
"TCGA-CG-5719-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	109	0	2	0	2	107	4387	5	4	1	10	1054	1	5	2	8	1022	6	2	35	43	1149	7	2	37	46	1162	4	1	3	8	150	0.073394495412844	0.173913043478261	0.129087779690189	1.34724637681159	0.0533333333333333	2	1	5	8	164	0.073394495412844	0.186046511627907	0.142732811140122	1.3034600113443	0.0487804878048781	0.128440366972477	14	71	314	1997	0.267000183082969	1	1	1.25393086889889	0.717577338269483	Inf	1.21221431247658	3.3968642822146	0.00476536127589084	0.0497978920379808	1	5.44491697826458	0.817763623496108	0.777638683118399	1	1	0.795055239683699	0.722393472194293	1	1	95	93	0
"TCGA-CG-5720-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	110	0	0	1	1	109	4469	0	8	6	14	1110	5	7	1	13	1096	8	6	23	37	1151	5	9	31	45	1112	3	2	1	6	171	0.0545454545454545	0.133333333333333	0.153776978417266	0.867056530214425	0.0350877192982456	7	0	3	10	152	0.0909090909090909	0.27027027027027	0.132059079061685	2.04658605974395	0.0657894736842105	0.127272727272727	14	53	323	1940	0.0936877017206775	1	1	1.58616939899377	0.895493903142567	Inf	1.46398040755972	5.38937842343415	7.54703121199185e-07	4.36218404053129e-05	0.000218109202026564	19.984938439884	0.518977181515881	0.958823654773132	1	1	0.480615304527238	0.0731727514850386	0.205309953195885	1	96	95	0
"TCGA-CG-5721-01A-11D-1600-08"	0	0	1	1	5048	10	86	455	541	4493	184213	68	1145	48	1261	44542	97	1181	51	1329	45386	20	93	838	951	47152	23	105	824	952	47133	4	5	22	31	6451	0.00614104595879556	0.032563025210084	0.136868011796406	0.237915527395271	0.00480545651836924	0	3	12	15	6098	0.00297147385103011	0.0157728706624606	0.129326433661351	0.1219616919443	0.00245982289275172	0.00752773375594295	38	1667	12549	81736	1	1	1	0.148476093216546	0.110778252731625	Inf	0.167452910105583	0.698916062986581	0.841738399292311	1	1	0.668038696793115	0.153702660061128	1	1	1	0.136029516373092	1.27282801835688e-10	5.2549613900734e-09	3.67847297305138e-08	5010	4455	0
"TCGA-CG-5722-01A-21D-1600-08"	0	0	0	0	104	0	1	3	4	100	4100	1	8	2	11	906	2	4	2	8	1065	4	6	31	41	1025	2	6	32	40	1104	2	0	2	4	159	0.0384615384615385	0.1	0.144021739130435	0.69433962264151	0.0251572327044025	1	0	5	6	129	0.0576923076923077	0.146341463414634	0.125853658536585	1.16279069767442	0.0465116279069767	0.0961538461538462	10	59	288	1841	0.463013033319568	1	1	1.0834332489399	0.55602730213241	Inf	1.07135668276973	3.69618055555556	0.0365190945870034	0.171659511898945	1	6.38306696312769	0.821373456790123	0.764528442324841	1	1	0.79912120212822	0.178895407997576	0.390302037298702	1	94	90	0
"TCGA-CG-5723-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	2075	6	45	358	403	1666	68306	16	136	32	184	15427	18	190	42	250	15387	8	53	573	634	18543	8	74	516	598	18949	1	6	8	15	2175	0.0072289156626506	0.0250836120401338	0.114781782679825	0.218533041171722	0.00689655172413793	3	8	12	23	2053	0.0110843373493976	0.0362776025236593	0.110715633931942	0.327664677835467	0.0112031173891866	0.011566265060241	24	1081	4228	33264	1	1	1	0.174676865544333	0.119847824578804	Inf	0.192598363848851	2.21688741721854	0.0975226878132217	0.315808794622601	1	2.62242091652648	0.162856743230012	1	1	1	0.14719822557587	0.000145320594766212	0.00126359226491108	0.0419976518874353	2051	1642	0
"TCGA-CG-5724-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	131	1	2	5	7	123	5043	5	12	10	27	1186	0	6	9	15	1300	6	1	31	38	1239	1	7	35	43	1318	0	3	2	5	193	0.0381679389312977	0.116279069767442	0.146433990895296	0.794071574888541	0.0259067357512953	2	0	1	3	152	0.0229007633587786	0.0789473684210526	0.122679580306699	0.643524930747922	0.0197368421052632	0.0381679389312977	5	68	345	2212	0.974687616915243	1	1	0.471546123359862	0.179323163586836	Inf	0.507643438554695	2.1175983436853	0.24263506996921	0.53527889481757	1	2.5632629477607	0.336890645586298	0.995282983904644	1	1	0.30540404639879	1	1	1	126	118	0
"TCGA-CG-5726-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1676	14	41	261	302	1359	55719	23	112	19	154	12605	28	132	16	176	13073	9	69	433	511	14863	9	75	434	518	15178	0	5	12	17	1858	0.0101431980906921	0.0328185328185328	0.122414020292529	0.268094559267864	0.00914962325080732	1	6	8	15	1760	0.00894988066825776	0.0293542074363992	0.118414855681895	0.247892946095001	0.00852272727272727	0.0125298329355609	21	864	3618	26423	1	1	1	0.177513770649588	0.118267228454276	Inf	0.197025231657157	0.461289232848105	0.900719968617682	1	1	0.429608712186259	0.191538781805442	1	1	1	0.172453967707866	3.57808500464659e-07	7.95435820263742e-06	0.000103406656634286	1655	1338	0
"TCGA-CG-5727-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	181	0	1	1	2	178	7298	3	9	2	14	1765	2	10	5	17	1742	8	13	60	81	1877	8	13	45	66	1914	2	3	3	8	236	0.0441988950276243	0.121212121212121	0.123301985370951	0.983050847457627	0.0338983050847458	4	3	3	10	267	0.0552486187845304	0.123456790123457	0.142248268513586	0.867896610718084	0.0374531835205993	0.0662983425414365	12	109	503	3288	0.890338178116874	1	1	0.719700245305569	0.401534291467198	Inf	0.747449189162545	2.82629224652087	0.0135793537110829	0.0893485942413713	1	3.92019264119518	0.430673104231752	0.995997421096628	1	1	0.396234974372032	1	1	1	169	166	0
"TCGA-CG-5728-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1707	2	70	246	316	1389	56949	17	122	17	156	13001	14	144	24	182	13151	15	77	435	527	15487	14	51	459	524	15310	2	6	6	14	1877	0.00820152314001172	0.0267175572519084	0.122599608099282	0.217925307153286	0.00745871070857752	3	5	6	14	1872	0.00820152314001172	0.0265654648956357	0.120875573061277	0.2197752963882	0.00747863247863248	0.00995899238429994	17	906	3749	27048	1	1	1	0.13537981056384	0.0858318093418431	Inf	0.151300440680895	1.41633171144489	0.274226262110708	0.582730806985254	1	1.5030371953559	0.110264750689669	1	1	1	0.0981627173941239	0.0796535700394924	0.213423466924191	1	1690	1372	0
"TCGA-CG-5730-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	194	1	3	2	5	188	7708	5	4	2	11	1802	6	6	1	13	1866	5	12	56	73	1945	8	4	79	91	2095	2	1	13	16	305	0.0824742268041237	0.175824175824176	0.145584725536993	1.20771032246442	0.0524590163934426	3	4	11	18	252	0.0927835051546392	0.246575342465753	0.129562982005141	1.90313111545988	0.0714285714285714	0.149484536082474	29	119	557	3483	0.0341682191241828	0.689093379545839	1	1.52369501691808	1.04160869154058	Inf	1.42122373720219	2.78966993509184	0.0248523098954352	0.138121491534246	1	3.90581977218572	1.28944743666467	0.118595535217108	1	1	1.35192071276458	5.67688262780821e-06	8.20309539718286e-05	0.00164061907943657	165	159	0
"TCGA-CG-5732-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	81	0	2	1	3	78	3198	1	8	5	14	796	0	3	2	5	824	3	6	21	30	709	7	5	17	29	869	0	0	1	1	122	0.0123456790123457	0.0344827586206897	0.140391254315305	0.245618993781798	0.00819672131147541	2	2	1	5	102	0.0617283950617284	0.166666666666667	0.143864598025388	1.15849673202614	0.0490196078431373	0.0493827160493827	4	44	224	1354	0.922374614776083	1	1	0.5496798928751	0.178736979897115	Inf	0.587053571428571	1.40892857142857	0.42748707779943	0.735379556452591	1	1.510703160257	0.370770676691729	0.977680653210442	1	1	0.335967049323156	1	1	1	77	74	0
"TCGA-CG-5733-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1403	2	61	190	251	1150	47150	8	123	12	143	10789	9	95	22	126	11000	4	68	384	456	12620	7	54	364	425	12741	0	9	4	13	1515	0.00926585887384177	0.0305882352941176	0.1189074640923	0.257244030285382	0.00858085808580858	0	3	11	14	1495	0.00997861724875267	0.0307017543859649	0.118462757527734	0.259167986856774	0.00936454849498328	0.0106913756236636	15	744	3010	22351	1	1	1	0.149714816012106	0.0917592312051409	Inf	0.166513466311242	0	1	1	1	0	0.168962193756995	1	1	1	0.151961541997857	4.01737967240367e-06	6.45012625180367e-05	0.00116102272532466	1388	1135	0
"TCGA-CG-5734-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	119	0	0	1	1	117	4797	4	6	7	17	1115	3	10	3	16	1157	2	6	28	36	1293	0	6	42	48	1232	0	0	2	2	169	0.0168067226890756	0.0416666666666667	0.137175324675325	0.303747534516765	0.0118343195266272	1	1	0	2	172	0.0168067226890756	0.0555555555555556	0.133023975251353	0.417635658914729	0.0116279069767442	0.0252100840336134	3	69	341	2184	0.997660393260229	1	1	0.278551674381411	0.0738301068248895	Inf	0.308528836754643	3.70234604105572	0.252406550818853	0.548462354786831	1	6.39679022449872	0.21156263091747	0.99949121372066	1	1	0.188440710865613	1	1	1	116	114	0
"TCGA-D7-5577-01A-01D-1600-08"	0	0	0	0	133	1	0	4	4	128	5248	5	7	7	19	1326	3	3	7	13	1211	1	13	39	53	1375	3	6	34	43	1336	0	1	2	3	174	0.0225563909774436	0.0697674418604651	0.130239520958084	0.535685645549318	0.0172413793103448	0	3	4	7	199	0.0526315789473684	0.132075471698113	0.144727272727273	0.912581776808571	0.0351758793969849	0.0451127819548872	6	71	373	2338	0.961622142991023	1	1	0.529797003061662	0.222414499771956	Inf	0.566345182967167	0	1	1	1	0	0.597377795732491	0.946025352255346	1	1	0.56141903388598	0.0108359133126935	0.0453852021357742	1	127	122	0
"TCGA-D7-5578-01A-01D-1600-08"	0	0	0	0	288	0	1	4	5	282	11562	9	15	19	43	2834	6	23	20	49	2832	15	14	80	109	2958	9	14	58	81	2938	4	5	7	16	409	0.0555555555555556	0.197530864197531	0.139210347174949	1.41893809049473	0.039119804400978	7	3	8	18	415	0.0625	0.165137614678899	0.140297498309669	1.17705316679562	0.0433734939759036	0.0902777777777778	26	136	824	5072	0.257663518397391	1	1	1.1766991899641	0.794938327835627	Inf	1.14838787007072	3.27953074433657	0.000177064501995394	0.00393628008282068	0.0511716410766689	5.20614530891401	0.777754326720135	0.880994241669767	1	1	0.750684190369722	0.454459191072131	0.746242648976397	1	262	256	0
"TCGA-D7-5579-01A-01D-1600-08"	1	0	0	1	171	1	2	3	5	164	6724	5	13	10	28	1598	6	12	18	36	1772	4	10	30	44	1642	9	9	38	56	1712	4	1	3	8	253	0.0467836257309941	0.142857142857143	0.147780373831776	0.966685488424619	0.0316205533596838	1	2	4	7	239	0.0409356725146199	0.159090909090909	0.145554202192448	1.0930011411183	0.0292887029288703	0.0701754385964912	12	69	492	2862	0.534436135202292	1	1	1.01166207671936	0.555912106263729	Inf	1.00993676603433	2.6219512195122	0.031803844217075	0.158470878943701	1	3.63366617949529	0.701757532281205	0.886343021722369	1	1	0.667603012658971	0.710381651279623	1	1	159	152	0
"TCGA-D7-6518-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	113	0	1	4	5	108	4428	2	4	1	7	1047	3	4	5	12	1100	7	8	35	50	1150	5	6	28	39	1131	2	3	2	7	160	0.0619469026548673	0.179487179487179	0.141467727674624	1.26875	0.04375	3	2	3	8	164	0.0707964601769911	0.16	0.142608695652174	1.1219512195122	0.0487804878048781	0.0884955752212389	10	65	324	1957	0.635898060028057	1	1	0.929259759393199	0.479301145406858	Inf	0.938683127572016	2.93338477366255	0.0196793053785213	0.116067739885564	1	4.31047103594524	0.558739956888105	0.954119071584857	1	1	0.520818233067813	1	1	1	103	98	0
"TCGA-D7-6519-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	64	0	0	5	5	59	2419	1	2	0	3	535	1	2	2	5	545	2	8	18	28	659	1	5	17	23	680	1	2	2	5	78	0.078125	0.217391304347826	0.114705882352941	1.89520624303233	0.0641025641025641	0	0	1	1	85	0.015625	0.0357142857142857	0.128983308042489	0.276890756302521	0.0117647058823529	0.0625	4	34	163	1176	0.696177254134312	1	1	0.848901695285937	0.272125752677609	Inf	0.864707781724249	2.73824130879346	0.323850108025173	0.641811875285219	1	3.60231902702968	0.704119193689746	0.815494563552389	1	1	0.676548032649634	0.545454545454546	0.852088452088453	1	60	55	0
"TCGA-D7-6520-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	72	2	0	0	0	70	2870	0	10	2	12	720	4	1	2	7	663	2	3	17	22	751	6	4	19	29	736	4	2	2	8	112	0.111111111111111	0.275862068965517	0.152173913043478	1.8128078817734	0.0714285714285714	1	0	2	3	105	0.0416666666666667	0.136363636363636	0.139813581890812	0.975324675324675	0.0285714285714286	0.125	9	35	217	1270	0.189898107982859	1	1	1.50447551448261	0.721751518664512	Inf	1.40165479681609	4.28283410138249	0.00264241351773506	0.0363646431726396	0.763657506625432	9.72922983718668	0.761392729134665	0.790354965783346	1	1	0.731702706438603	1	1	1	63	61	0
"TCGA-D7-6521-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	93	0	0	1	1	92	3772	0	4	1	5	868	0	2	2	4	899	2	1	28	31	971	1	8	43	52	1034	0	1	8	9	143	0.0967741935483871	0.173076923076923	0.138297872340426	1.25147928994083	0.0629370629370629	0	0	4	4	104	0.043010752688172	0.129032258064516	0.107106076210093	1.20471464019851	0.0384615384615385	0.129032258064516	12	62	247	1758	0.202596781733502	1	1	1.37732313137765	0.748769747749148	Inf	1.31633657949447	0	1	1	1	0	1.37195643496607	0.165847124070283	1	1	1.44731148926026	2.69215237582447e-06	4.5766590389016e-05	0.000778032036613272	81	80	0
"TCGA-D7-6522-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	84	0	0	0	0	84	3444	0	3	4	7	834	2	8	3	13	803	2	10	27	39	899	1	4	20	25	908	1	0	0	1	107	0.0119047619047619	0.04	0.11784140969163	0.339439252336449	0.00934579439252336	0	1	2	3	125	0.0357142857142857	0.0769230769230769	0.139043381535039	0.553230769230769	0.024	0.0357142857142857	3	47	232	1575	0.962673114230612	1	1	0.433470526439732	0.113432386115002	Inf	0.467327586206897	2.59626436781609	0.338769470984684	0.65371283041051	1	3.39104557122346	0.331438004402054	0.987081790387047	1	1	0.30185054233658	1	1	1	81	81	0
"TCGA-D7-6524-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	120	0	0	2	2	117	4797	2	7	1	10	1127	2	4	0	6	1121	3	14	39	56	1261	2	10	33	45	1288	0	2	0	2	144	0.0166666666666667	0.0444444444444444	0.111801242236025	0.397530864197531	0.0138888888888889	0	5	2	7	159	0.0583333333333333	0.125	0.12609040444092	0.991352201257862	0.0440251572327044	0.0166666666666667	2	75	303	2246	0.999266199321608	1	1	0.197735947746611	0.0343287131852535	Inf	0.218507565042219	0	1	1	1	0	0.233681701503484	0.998719560956121	1	1	0.211858513225617	0.470588235294118	0.764044943820225	1	118	115	0
"TCGA-D7-6525-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	186	0	1	7	8	178	7298	3	16	9	28	1831	4	14	13	31	1748	4	15	51	70	1841	6	14	29	49	1878	1	4	3	8	281	0.043010752688172	0.163265306122449	0.149627263045793	1.0911467789963	0.0284697508896797	1	7	8	16	256	0.0860215053763441	0.228571428571429	0.139054861488322	1.64375	0.0625	0.0698924731182796	13	77	537	3182	0.546254529100528	1	1	1.00044122059405	0.565326050566454	Inf	1.00035174839644	1.38510242085661	0.435630337877485	0.73829750322735	1	1.48119484406976	0.95225791433892	0.618235149970722	1	1	0.944650132473438	0.00784054833607701	0.0369943676395289	1	173	165	0
"TCGA-D7-6526-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	244	2	2	6	8	233	9553	11	16	21	48	2398	7	20	14	41	2365	10	14	44	68	2345	8	15	53	76	2445	1	2	10	13	362	0.0532786885245902	0.171052631578947	0.148057259713701	1.15531404478046	0.0359116022099447	3	0	8	11	347	0.0450819672131148	0.161764705882353	0.147974413646055	1.09319376165452	0.031700288184438	0.0901639344262295	22	93	709	4081	0.125445881986494	1	1	1.36153631772574	0.879153197459525	Inf	1.29245109462194	1.50133207961135	0.272335292253865	0.582730806985254	1	1.64436236298619	1.253689674727	0.18601830190509	1	1	1.31141144665834	0.000110950546439364	0.00103434541680568	0.0320647079209762	222	211	0
"TCGA-D7-6527-01A-11D-1800-08"	0	1	0	1	249	2	1	6	7	240	9840	5	24	37	66	2584	3	21	40	64	2516	13	8	44	65	2426	6	3	36	45	2314	3	2	6	11	368	0.0441767068273092	0.244444444444444	0.159031979256698	1.53707729468599	0.0298913043478261	5	0	3	8	368	0.0321285140562249	0.123076923076923	0.151690024732069	0.811371237458194	0.0217391304347826	0.0682730923694779	17	82	736	4004	0.369050928215672	1	1	1.12785867404369	0.685726913954616	Inf	1.10589591567852	2.7116704805492	0.00520937165553576	0.0501836136149945	1	3.95489912295669	0.724524456521739	0.889923452215408	1	1	0.689653469031526	1	1	1	232	223	0
"TCGA-D7-6528-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	389	4	3	4	7	377	15457	16	28	44	88	3934	17	29	58	104	3890	24	16	77	117	3930	6	10	52	68	3703	3	2	6	11	529	0.0282776349614396	0.161764705882353	0.142857142857143	1.13235294117647	0.0207939508506616	11	4	12	27	601	0.0694087403598972	0.230769230769231	0.152926208651399	1.50902342250096	0.0449251247920133	0.0822622107969152	32	127	1130	6503	0.0438362676202469	0.786850199719479	1	1.44996395688615	1.01364994682996	Inf	1.35947013970056	3.15227138643068	3.49965790581401e-05	0.00112377903864472	0.0101140113478025	5.03399760275477	0.942539617205186	0.644430529609759	1	1	0.933214338074428	0.486131842360621	0.776199461006737	1	357	345	0
"TCGA-D7-6815-01A-11D-1882-08"	0	0	1	1	168	2	5	7	12	152	6232	2	6	2	10	1434	4	7	3	14	1410	7	8	52	67	1702	1	8	52	61	1686	0	1	1	2	185	0.0119047619047619	0.0327868852459016	0.109727164887307	0.298803721754541	0.0108108108108108	1	2	4	7	199	0.0416666666666667	0.104477611940299	0.116921269095182	0.893572339308483	0.0351758793969849	0.0357142857142857	6	106	384	3004	0.989708796396661	1	1	0.442882199875511	0.187795729849793	Inf	0.47265625	1.10286458333333	0.618507484836241	0.887739152519115	1	1.11749550060643	0.424178685897436	0.993246564099842	1	1	0.395170865961486	0.131221719457014	0.324128862590402	1	162	146	0
"TCGA-D7-6817-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	102	0	1	1	2	99	4059	3	7	4	14	978	4	6	4	14	968	11	7	19	37	1120	4	4	26	34	993	0	0	1	1	127	0.00980392156862745	0.0294117647058824	0.127895266868077	0.229967577582214	0.0078740157480315	2	0	0	2	123	0.0196078431372549	0.0540540540540541	0.109821428571429	0.492199516589761	0.016260162601626	0.0294117647058824	3	57	250	1863	0.977750191075481	1	1	0.392329840727733	0.103315144862968	Inf	0.4226	1.12693333333333	0.545557429457882	0.823862399537877	1	1.14636693153288	0.187822222222222	0.996395440795607	1	1	0.169437101609543	1	1	1	99	96	0
"TCGA-D7-6818-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	175	0	1	4	5	170	6970	4	22	23	49	1709	4	19	28	51	1815	3	6	19	28	1718	4	6	32	42	1728	1	1	4	6	256	0.0342857142857143	0.142857142857143	0.148148148148148	0.964285714285714	0.0234375	1	0	0	1	259	0.00571428571428571	0.0357142857142857	0.150756693830035	0.236900165471594	0.00386100386100386	0.0342857142857143	6	52	515	2931	0.881684360453083	1	1	0.656753818949871	0.273244276157094	Inf	0.69219953130231	1.91178918169209	0.28260565413539	0.596153533176115	1	2.27580034943348	0.524804873405673	0.957164901727557	1	1	0.484443039100237	0.592074592074592	0.90057661636609	1	169	164	0
"TCGA-D7-6820-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	111	0	1	1	2	109	4469	3	9	4	16	1097	6	6	3	15	1094	9	5	24	38	1141	7	5	28	40	1137	3	1	3	7	159	0.0630630630630631	0.175	0.139841688654354	1.25141509433962	0.0440251572327044	2	0	4	6	143	0.0540540540540541	0.157894736842105	0.12532865907099	1.25984541774015	0.041958041958042	0.108108108108108	12	56	302	1976	0.189834250269646	1	1	1.40185180890336	0.760270719100668	Inf	1.33112582781457	2.35720198675497	0.0518112222683171	0.206074786590962	1	2.97209852533832	1.01541008660214	0.545809849396213	1	1	1.01780099290996	0.695097590523624	1	1	99	97	0
"TCGA-D7-6822-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	275	2	0	7	7	266	10906	11	18	33	62	2754	11	29	41	81	2786	12	9	48	69	2678	6	8	40	54	2688	0	3	6	9	382	0.0327272727272727	0.166666666666667	0.142113095238095	1.17277486910995	0.0235602094240838	3	3	8	14	414	0.0509090909090909	0.202898550724638	0.154592979835698	1.31246936918014	0.0338164251207729	0.0618181818181818	17	89	796	4570	0.406418189828277	1	1	1.09664284320648	0.66911322778454	Inf	1.08113681615625	1.12353433835846	0.512861934860191	0.802392309331645	1	1.14818140696228	1.0724645957058	0.434897759376619	1	1	1.08618018777985	0.00180263699192212	0.00947203801209987	0.520962090665493	258	249	0
"TCGA-D7-8570-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	146	0	3	9	12	134	5494	7	7	1	15	1253	8	1	3	12	1259	18	5	30	53	1480	10	5	39	54	1502	3	0	3	6	183	0.0410958904109589	0.111111111111111	0.121837549933422	0.911961141469338	0.0327868852459016	6	0	1	7	183	0.0479452054794521	0.132075471698113	0.123648648648649	1.06815135580988	0.0382513661202186	0.089041095890411	13	84	366	2616	0.416163031582173	1	1	1.1061654533656	0.625302123797016	Inf	1.09193848233902	2.61885245901639	0.00515583904775352	0.0501836136149945	1	3.38345471442268	0.47232121644096	0.975397553885965	1	1	0.439935452946749	0.115238543930158	0.289599471267962	1	133	121	0
"TCGA-D7-8572-01A-11D-2340-08"	1	0	0	1	195	1	1	3	4	190	7790	4	9	7	20	2051	8	8	8	24	1915	15	11	40	66	1914	8	22	50	80	1910	3	4	3	10	282	0.0512820512820513	0.125	0.147643979057592	0.846631205673759	0.0354609929078014	4	2	5	11	304	0.0564102564102564	0.166666666666667	0.158829676071055	1.04934210526316	0.0361842105263158	0.0769230769230769	15	98	586	3238	0.762993883941766	1	1	0.845789109545255	0.50114796653459	Inf	0.866229726056359	1.98605134292922	0.0520534928067137	0.206074786590962	1	2.41667580243919	0.580053090633295	0.973381803880951	1	1	0.539154676154139	1	1	1	180	175	0
"TCGA-D7-8573-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	96	0	1	3	4	91	3731	2	7	5	14	831	2	7	2	11	887	3	1	27	31	986	3	6	26	35	1027	1	1	1	3	126	0.03125	0.0857142857142857	0.122687439143135	0.698639455782313	0.0238095238095238	1	0	1	2	113	0.0208333333333333	0.0645161290322581	0.114604462474645	0.562946046246075	0.0176991150442478	0.0416666666666667	4	55	239	1774	0.929486254242755	1	1	0.539954388304023	0.177083515716639	Inf	0.571023331678604	2.80753138075314	0.154046148715335	0.41606856989469	1	3.70754232698334	0.317833741217336	0.989526240059706	1	1	0.291192744825729	1	1	1	92	87	0
"TCGA-D7-8574-01A-13D-2340-08"	0	0	0	0	35	0	2	0	2	33	1353	0	2	0	2	314	0	1	1	2	350	0	2	14	16	340	0	4	9	13	349	0	0	0	0	62	0	0	0.177650429799427	0	0	0	1	0	1	50	0.0285714285714286	0.0625	0.147058823529412	0.425	0.02	0	0	23	112	577	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	35	33	0
"TCGA-D7-8575-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	58	1	4	4	8	49	2009	1	1	1	3	475	1	2	1	4	459	3	5	10	18	521	3	2	19	24	554	0	0	0	0	62	0	0	0.111913357400722	0	0	3	2	0	5	72	0.0862068965517241	0.277777777777778	0.138195777351248	2.01003086419753	0.0694444444444444	0.0517241379310345	3	32	134	941	0.828138121833935	1	1	0.658563409212636	0.168875954061516	Inf	0.687633262260128	4.01119402985075	0.0298315400952434	0.153557749402555	1	7.00023135673264	0	1	1	1	0	0.166666666666667	0.376302083333334	1	55	46	0
"TCGA-D7-8576-01A-11D-2340-08"	0	1	0	1	69	0	2	2	4	65	2665	0	4	1	5	628	1	4	2	7	590	3	1	24	28	732	3	4	18	25	715	0	0	1	1	85	0.0144927536231884	0.04	0.118881118881119	0.336470588235294	0.0117647058823529	0	0	1	1	93	0.0144927536231884	0.0357142857142857	0.127049180327869	0.28110599078341	0.010752688172043	0.0289855072463768	2	46	178	1269	0.985119067271448	1	1	0.310124864395665	0.0531034323140781	Inf	0.338717228464419	0	1	1	1	0	0.387105403959337	0.971332016468354	1	1	0.356630103049051	0.333333333333333	0.608611514271892	1	67	63	0
"TCGA-D7-8578-01A-21D-2340-08"	0	0	0	0	59	0	2	0	2	57	2337	2	2	3	7	527	2	2	0	4	505	0	6	20	26	635	1	1	18	20	670	0	0	0	0	77	0	0	0.114925373134328	0	0	0	0	0	0	82	0	0	0.129133858267717	0	0	0	0	39	159	1146	1	1	1	0	0	Inf	0	0	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	59	57	0
"TCGA-D7-8579-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	120	0	1	0	1	119	4879	5	10	15	30	1197	2	12	15	29	1202	2	2	28	32	1194	3	3	22	28	1286	1	0	1	2	195	0.0166666666666667	0.0714285714285714	0.151632970451011	0.471062271062271	0.0102564102564103	0	1	0	1	168	0.00833333333333333	0.03125	0.14070351758794	0.222098214285714	0.00595238095238095	0.0166666666666667	2	53	363	2117	0.998164774384966	1	1	0.22015114293365	0.0380187453971216	Inf	0.248434760831455	1.366391184573	0.547341109727586	0.823862399537877	1	1.45773324308143	0.1366391184573	0.999610012466625	1	1	0.119067859010103	1	1	1	118	117	0
"TCGA-D7-A4YT-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	328	4	5	17	22	302	12382	11	15	15	41	2921	12	14	12	38	2863	27	30	54	111	3296	30	25	57	112	3302	8	6	6	20	436	0.0609756097560976	0.178571428571429	0.132041187159297	1.35239187418087	0.0458715596330275	8	2	9	19	456	0.0579268292682927	0.171171171171171	0.138349514563107	1.23723723723724	0.0416666666666667	0.0945121951219512	31	137	892	5706	0.0462853058658517	0.786850199719479	1	1.44737141477713	1.00812228105555	Inf	1.36489696775571	2.07631185587287	0.00308492734768975	0.0405247274310154	0.891544003482338	2.49584832309147	0.999575808992849	0.543356395956961	1	1	0.999509601502399	1	1	1	297	271	0
"TCGA-D7-A4YU-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	241	0	2	4	6	234	9594	8	13	16	37	2191	4	19	18	41	2277	5	12	61	78	2493	11	16	51	78	2633	3	0	2	5	339	0.020746887966805	0.0641025641025641	0.128750474743638	0.497882157174193	0.0147492625368732	2	3	4	9	294	0.037344398340249	0.115384615384615	0.117930204572804	0.978414442700157	0.0306122448979592	0.045643153526971	11	117	633	4493	0.927472435115728	1	1	0.667373397546437	0.363420498565415	Inf	0.695917259083728	2.53060821484992	0.0392873254776129	0.179130491743761	1	3.22529312061505	0.433818551117129	0.995617544400558	1	1	0.4018199114695	1	1	1	230	223	0
"TCGA-D7-A4YV-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	1062	2	36	129	165	894	36654	10	49	14	73	8001	9	42	13	64	8161	8	48	334	390	10179	10	43	314	367	10313	2	3	2	7	1151	0.00659133709981168	0.0190735694822888	0.111606709977698	0.170899845413419	0.00608166811468288	0	6	4	10	1149	0.00941619585687382	0.0256410256410256	0.112879457707044	0.227154046997389	0.00870322019147084	0.00753295668549906	8	658	2300	18192	1	1	1	0.0961696223686205	0.0476285864616483	Inf	0.107021804413109	0.989951690821256	0.615837417497457	0.887739152519115	1	0.988696018326514	0.0824959742351047	1	1	1	0.0739248852592231	0.224503095470837	0.450565240215777	1	1054	886	0
"TCGA-D7-A4YX-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	91	0	0	4	4	87	3567	2	2	0	4	785	1	3	0	4	815	4	3	26	33	1014	3	5	38	46	953	2	1	2	5	106	0.0549450549450549	0.108695652173913	0.111227701993704	0.977235438884331	0.0471698113207547	2	0	1	3	117	0.032967032967033	0.0909090909090909	0.115384615384615	0.787878787878788	0.0256410256410256	0.0769230769230769	7	64	223	1744	0.707212756919455	1	1	0.855464795392318	0.383030171724156	Inf	0.869639360828649	5.04035874439462	0.00450171756345334	0.0497978920379808	1	10.4035887954452	0.413466928251121	0.980045717554288	1	1	0.384747935037802	1	1	1	84	80	0
"TCGA-D7-A4YY-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	561	12	27	66	93	456	18696	4	27	18	49	3983	5	30	13	48	4319	3	32	137	172	5216	9	30	148	187	5178	0	3	2	5	625	0.0089126559714795	0.0267379679144385	0.120702974121282	0.22151871657754	0.008	0	3	1	4	539	0.0071301247771836	0.0232558139534884	0.103335889570552	0.225050696811494	0.00742115027829314	0.0053475935828877	3	294	1164	9230	0.999999999999454	1	1	0.0809217587100533	0.0219022397903446	Inf	0.0901975077232809	0	1	1	1	0	0.0939952975221559	0.99999999999798	1	1	0.0843652029576058	0.205882352941176	0.425963718820861	1	558	453	0
"TCGA-D7-A4Z0-01A-22D-A25D-08"	0	0	0	0	332	2	1	5	6	323	13243	15	36	67	118	3362	12	34	79	125	3478	4	3	34	41	3220	6	4	29	39	3183	2	1	0	3	501	0.00903614457831325	0.0769230769230769	0.157398680490104	0.488714877936435	0.00598802395209581	1	1	3	5	533	0.0150602409638554	0.121951219512195	0.165527950310559	0.73674095089919	0.00938086303939963	0.0180722891566265	6	67	1034	5369	0.983942340511431	1	1	0.465041747528171	0.195709736664291	Inf	0.508969025727988	1.85773694390716	0.210931179651338	0.504675394527314	1	2.2249908095248	0.294878879985263	0.998661657241563	1	1	0.25965615479302	1	1	1	326	317	0
"TCGA-EQ-5647-01A-01D-1600-08"	0	0	1	1	100	1	0	0	0	99	4059	3	7	5	15	951	2	8	5	15	1022	2	8	33	43	1027	1	9	16	26	1059	0	1	3	4	155	0.04	0.153846153846154	0.146364494806421	1.05111662531017	0.0258064516129032	1	0	8	9	142	0.09	0.209302325581395	0.138266796494645	1.51375696036685	0.0633802816901408	0.12	12	40	297	1789	0.0619374153864338	0.8200464148518	1	1.80646367153517	0.961040606050889	Inf	1.62082362082362	2.34118967452301	0.369960796170625	0.678926759123496	1	3.00953426778741	1.57671957671958	0.084249050002023	1	1	1.7431177131669	0.000212680037690134	0.0017073480803458	0.0614645308924487	88	87	0
"TCGA-EQ-8122-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	210	1	3	6	9	199	8159	6	8	4	18	1894	3	11	6	20	1914	7	7	68	82	2185	8	11	60	79	2166	2	3	13	18	251	0.0857142857142857	0.227848101265823	0.115881809787627	1.9662111049473	0.0717131474103586	4	1	3	8	279	0.0380952380952381	0.0975609756097561	0.127688787185355	0.764052801818341	0.028673835125448	0.104761904761905	22	121	530	3821	0.154045519323833	1	1	1.31071753540279	0.852475506666409	Inf	1.26298984034833	3.28377358490566	0.00627180526572837	0.0554673507693578	1	4.80359377938662	1.02617924528302	0.49820016948318	1	1	1.02991662033564	0.0107461311413052	0.0453852021357742	1	188	177	0
"TCGA-EQ-A4SO-01A-11D-A25D-08"	0	0	1	1	196	3	1	19	20	173	7093	7	15	7	29	1666	5	7	3	15	1706	25	16	19	60	1847	18	14	37	69	1874	7	2	2	11	224	0.0561224489795918	0.159420289855072	0.119530416221985	1.3337215320911	0.0491071428571429	13	2	3	18	236	0.0918367346938776	0.3	0.12777476989713	2.3478813559322	0.076271186440678	0.127551020408163	25	74	460	3261	0.000427416343022423	0.0308808307833701	0.12352332313348	2.3942384248659	1.5626602529589	Inf	2.04270970575318	3.7623862487361	5.01287858473617e-08	4.82907303662918e-06	1.44872191098875e-05	6.15937824019602	0.722243788819876	0.836973588096057	1	1	0.695071823121251	0.00014865791351895	0.00126359226491108	0.0429621370069765	171	148	13
"TCGA-F1-6177-01A-11D-1800-08"	0	1	0	1	1540	44	51	195	246	1250	51250	4	87	10	101	11360	5	86	11	102	11198	10	55	463	528	14214	11	55	453	519	14478	0	3	7	10	1521	0.00649350649350649	0.0192678227360308	0.105055946953999	0.183405350146124	0.00657462195923734	0	0	8	8	1575	0.00519480519480519	0.0151515151515152	0.110806247361756	0.136738816738817	0.00507936507936508	0.00974025974025974	15	922	3096	25596	1	1	1	0.134507283208416	0.0825117295143369	Inf	0.148358194137649	0	1	1	1	0	0.15175941911242	1	1	1	0.137642284263822	2.93108577675973e-07	7.70076172257784e-06	8.47083789483562e-05	1525	1235	0
"TCGA-F1-6874-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	1107	9	48	162	210	888	36408	8	72	10	90	8140	12	59	10	81	8189	7	55	311	373	9838	9	56	279	344	10241	2	7	5	14	1196	0.012646793134598	0.0406976744186047	0.116785470168929	0.348482344248269	0.0117056856187291	2	5	9	16	1130	0.014453477868112	0.0428954423592493	0.114860744053669	0.373456072504686	0.0141592920353982	0.016260162601626	18	588	2326	17753	0.999999999999996	1	1	0.233654942412873	0.149810162522378	Inf	0.256408400943276	2.15810404127257	0.105397805038771	0.331086583219618	1	2.54406850312863	0.204836993747905	1	1	1	0.185518298807787	0.0101229709088794	0.0436647551144201	1	1089	870	0
"TCGA-F1-6875-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	98	0	0	1	1	97	3977	2	4	5	11	928	0	11	2	13	860	5	5	27	37	1081	2	3	31	36	1108	1	1	6	8	130	0.0816326530612245	0.222222222222222	0.117328519855596	1.89401709401709	0.0615384615384615	1	0	1	2	135	0.0204081632653061	0.0540540540540541	0.124884366327475	0.432832832832833	0.0148148148148148	0.0918367346938776	9	56	265	1924	0.392099211173962	1	1	1.16674413605029	0.575538833147698	Inf	1.14374455732946	2.36010781671159	0.205283504764273	0.504675394527314	1	2.90211497274291	0.996942094990241	0.565134806333981	1	1	0.996523895449478	0.0697785186949274	0.20165991902834	1	89	88	0
"TCGA-F1-A448-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	682	3	13	39	52	627	25707	7	59	14	80	5745	4	56	9	69	5924	2	18	218	238	7015	3	23	214	240	7023	0	1	3	4	796	0.00586510263929619	0.0166666666666667	0.113341876690873	0.147047738693467	0.0050251256281407	0	0	1	1	800	0.00146627565982405	0.00420168067226891	0.114041339985745	0.036843487394958	0.00125	0.00586510263929619	4	433	1596	12442	1	1	1	0.072021372930446	0.0244883704543946	Inf	0.0805101999850886	0	1	1	1	0	0.0814420310034345	1	1	1	0.0728627386222172	0.0476190476190476	0.149585921325052	1	678	623	0
"TCGA-FP-7735-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	72	0	0	5	5	67	2747	1	2	2	5	657	2	5	1	8	656	4	4	21	29	713	4	2	19	25	721	1	0	3	4	83	0.0555555555555556	0.16	0.115117891816921	1.38987951807229	0.0481927710843374	2	1	6	9	99	0.125	0.310344827586207	0.138849929873773	2.23510971786834	0.0909090909090909	0.166666666666667	12	36	182	1252	0.0169669648807299	0.544828094503438	1	2.29121065912172	1.20275137463003	Inf	1.96978021978022	2.95467032967033	0.0713234390970123	0.257655923737957	1	4.12151452638645	1.7728021978022	0.0639114033813203	1	1	1.99602733582883	0.0471799703863238	0.149585921325052	1	60	55	0
"TCGA-FP-7829-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	281	2	1	5	6	273	11193	4	14	11	29	2562	11	8	7	26	2592	6	34	70	110	3009	2	26	80	108	3030	1	7	2	10	379	0.0355871886120996	0.0925925925925926	0.125082508250825	0.7402521254764	0.0263852242744063	1	8	8	17	357	0.0604982206405694	0.154545454545455	0.11864406779661	1.3025974025974	0.0476190476190476	0.0427046263345196	12	146	736	5303	0.975424916095831	1	1	0.592247555705236	0.333332665619168	Inf	0.623176940011007	2.05129076086957	0.254387535015899	0.548641773280558	1	2.40123809837455	0.547010869565217	0.99009623623717	1	1	0.51469898073724	0.0194196861290052	0.0719524268113141	1	269	261	0
"TCGA-FP-7916-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	108	0	1	4	5	103	4223	2	5	3	10	989	4	3	5	12	932	2	8	32	42	1155	3	7	29	39	1147	1	0	2	3	126	0.0277777777777778	0.0769230769230769	0.109851787271142	0.7002442002442	0.0238095238095238	0	1	0	1	130	0.00925925925925926	0.0238095238095238	0.112554112554113	0.211538461538462	0.00769230769230769	0.0277777777777778	3	63	256	2046	0.981353312543309	1	1	0.380688481435429	0.10052780412057	Inf	0.408735795454545	1.7984375	0.446273888117734	0.749843916662937	1	1.99731271813099	0.294825819672131	0.993170050056678	1	1	0.271014021119259	1	1	1	105	100	0
"TCGA-FP-7998-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	80	0	0	0	0	80	3280	2	3	1	6	719	2	4	2	8	785	5	6	21	32	891	3	5	26	34	885	1	2	1	4	113	0.05	0.117647058823529	0.127683615819209	0.921395106715252	0.0353982300884956	2	0	3	5	103	0.0625	0.15625	0.115600448933782	1.35163834951456	0.0485436893203883	0.0875	7	48	216	1560	0.512959687208373	1	1	1.05322247688857	0.466066591684869	Inf	1.04646464646465	3.08333333333333	0.0639416301504807	0.243146462019591	1	4.32793252761935	0.699763593380615	0.838197888005998	1	1	0.671962188447522	1	1	1	73	73	0
"TCGA-FP-8099-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	155	1	3	1	4	150	6150	1	5	1	7	1388	0	7	4	11	1439	4	11	59	74	1659	3	7	48	58	1664	1	1	1	3	206	0.0193548387096774	0.0517241379310345	0.123798076923077	0.417810512219618	0.0145631067961165	1	2	6	9	207	0.0580645161290323	0.121621621621622	0.124773960216998	0.974735605170388	0.0434782608695652	0.0580645161290323	9	105	413	2910	0.951862040955535	1	1	0.604018572040519	0.305271837190742	Inf	0.635210908627501	2.29885852646143	0.213495653787195	0.504675394527314	1	2.81715016784399	0.52637414858229	0.982937749876849	1	1	0.493300723776822	0.0893794588773726	0.230630925138935	1	146	141	0
"TCGA-FP-8209-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	2	0	1	0	1	1	41	0	0	0	0	4	0	0	0	0	9	0	0	1	1	12	0	0	0	0	16	0	0	0	0	0	0	NA	0	NA	NA	0	0	0	0	0	0	0	0	NA	NA	0	0	1	0	28	1	1	1	0	0	Inf	NA	NA	1	1	1	0	NA	1	1	1	0	1	1	1	2	1	0
"TCGA-FP-8210-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	6	0	0	0	0	6	246	0	2	0	2	58	1	0	0	1	62	0	0	3	3	54	0	0	0	0	72	0	0	0	0	11	0	NA	0.152777777777778	NA	0	0	0	0	0	4	0	0	0.0740740740740741	0	0	0	0	3	15	111	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	6	6	0
"TCGA-FP-8211-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	115	1	2	11	13	99	4059	2	9	3	14	881	6	6	5	17	977	17	10	14	41	1070	8	8	11	27	1131	2	3	0	5	132	0.0434782608695652	0.185185185185185	0.116710875331565	1.58670033670034	0.0378787878787879	6	3	3	12	126	0.104347826086957	0.292682926829268	0.117757009345794	2.48548199767712	0.0952380952380952	0.0956521739130435	11	39	258	1943	0.0300701264674991	0.689093379545839	1	2.12321189275019	1.09787893491088	Inf	1.87682170542636	2.72992248062015	0.00652511292229127	0.0554673507693578	1	3.54111529339896	1.02372093023256	0.575712562851477	1	1	1.02694717935994	0.141070325052528	0.336936561489096	1	104	88	0
"TCGA-FP-8631-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	106	2	2	3	5	97	3977	3	5	5	13	931	3	6	2	11	1031	5	4	28	37	1003	6	7	23	36	1012	3	3	2	8	129	0.0754716981132075	0.222222222222222	0.127470355731225	1.74332472006891	0.062015503875969	0	2	4	6	147	0.0566037735849057	0.162162162162162	0.146560319042871	1.10645339216768	0.0408163265306122	0.0849056603773585	9	53	276	1739	0.483849226201226	1	1	1.06991581810882	0.526596501146763	Inf	1.05978260869565	1.99110671936759	0.184423848133077	0.463465148786602	1	2.36141638768747	0.858908780903666	0.716073108284959	1	1	0.840163527230805	0.419710144927536	0.707755102040817	1	97	88	0
"TCGA-FP-A4BE-01A-12D-A24D-08"	0	0	0	0	1777	21	60	196	256	1500	61500	9	134	22	165	13444	11	99	15	125	13569	1	63	545	609	17016	5	83	513	601	17471	0	8	2	10	1899	0.0056274620146314	0.0166389351081531	0.108694407875909	0.153079955384172	0.00526592943654555	0	3	3	6	1863	0.00337647720877884	0.00985221674876847	0.109485190409027	0.0899867526554183	0.00322061191626409	0.0028137310073157	5	1059	3762	30725	1	1	1	0.0385367819311989	0.0151606823255995	Inf	0.0430789393739532	0	1	1	1	0	0.0433232433779643	1	1	1	0.0387568127140678	0.0433815350389322	0.140868130632038	1	1772	1495	0
"TCGA-FP-A4BF-01A-12D-A24D-08"	0	1	0	1	123	0	1	3	4	119	4879	3	12	5	20	1127	4	6	3	13	1104	1	8	37	46	1344	3	4	33	40	1304	0	1	1	2	166	0.016260162601626	0.05	0.127300613496933	0.392771084337349	0.0120481927710843	0	3	3	6	163	0.0487804878048781	0.130434782608696	0.121279761904762	1.07548679647906	0.0368098159509202	0.032520325203252	4	70	329	2319	0.98565721060125	1	1	0.402874921286686	0.133358928196567	Inf	0.435061201018648	0	1	1	1	0	0.459921841076856	0.979206626111168	1	1	0.427287036984103	0.076923076923077	0.213423466924191	1	119	115	0
"TCGA-HF-7132-01A-11D-2053-08"	0	0	1	1	1485	5	64	154	218	1261	51701	7	106	19	132	11665	5	76	13	94	11579	6	71	444	521	14040	10	75	429	514	14417	0	5	5	10	1615	0.00673400673400673	0.0194552529182879	0.112020531317195	0.173675777908952	0.00619195046439629	1	7	9	17	1660	0.0114478114478114	0.0326295585412668	0.118233618233618	0.275975302361076	0.0102409638554217	0.0101010101010101	15	874	3275	25182	1	1	1	0.131969421191856	0.0809189620194515	Inf	0.146611253745954	0.543072519083969	0.858612289832838	1	1	0.512620412611314	0.139345067897834	1	1	1	0.125322340517434	0.000129174207928057	0.00116660456535026	0.0373313460912085	1470	1246	0
"TCGA-HF-7133-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	87	0	1	4	5	82	3362	2	4	1	7	724	1	6	1	8	789	2	3	31	36	899	3	7	21	31	950	3	1	1	5	107	0.0574712643678161	0.161290322580645	0.112631578947368	1.43201688272535	0.0467289719626168	2	0	0	2	95	0.0229885057471264	0.0555555555555556	0.10567296996663	0.525730994152047	0.0210526315789474	0.0689655172413793	6	51	202	1647	0.602755963941171	1	1	0.959248661051903	0.396175017657154	Inf	0.963522668056279	9.15346534653465	1.66154976594997e-05	0.000600234852949427	0.00480187882359541	Inf	0.176028179741051	0.997413188349887	1	1	0.159951388125676	0.102564102564103	0.260008996851103	1	81	76	0
"TCGA-HF-7136-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	91	2	0	7	7	81	3321	3	2	2	7	788	4	2	4	10	797	0	5	17	22	848	6	14	22	42	888	3	1	1	5	143	0.0549450549450549	0.119047619047619	0.161036036036036	0.739260739260739	0.034965034965035	0	0	2	2	102	0.021978021978022	0.0909090909090909	0.120283018867925	0.755793226381462	0.0196078431372549	0.0659340659340659	6	39	245	1491	0.625551864537816	1	1	0.936283955234584	0.382635265131762	Inf	0.944761904761905	3.54285714285714	0.040961306539597	0.179360872574902	1	6.07543666906732	0.545054945054945	0.926289827864455	1	1	0.507297725819084	1	1	1	85	75	0
"TCGA-HJ-7597-01A-21D-2201-08"	0	0	0	0	944	2	33	114	147	795	32595	10	66	9	85	7104	6	60	7	73	7173	4	33	316	353	9079	2	22	260	284	9239	1	1	3	5	1036	0.00529661016949153	0.0176056338028169	0.11213334776491	0.15700622654848	0.00482625482625483	0	3	2	5	979	0.00529661016949153	0.0141643059490085	0.107831258949223	0.131356214209447	0.00510725229826353	0.00635593220338983	6	576	2015	16303	1	1	1	0.0842840291956242	0.036528456271451	Inf	0.0937197820470185	1.5151364764268	0.503134822994644	0.802392309331645	1	1.61810224699004	0.0789133581472291	1	1	1	0.0708517907754452	0.140866873065015	0.336936561489096	1	938	789	0
"TCGA-HU-8243-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	142	2	3	6	9	131	5371	1	6	0	7	1232	4	8	2	14	1256	8	10	38	56	1485	7	3	44	54	1398	3	0	3	6	168	0.0422535211267606	0.111111111111111	0.120171673819742	0.924603174603175	0.0357142857142857	2	2	0	4	188	0.028169014084507	0.0714285714285714	0.126599326599327	0.564209726443769	0.0212765957446809	0.0563380281690141	8	89	356	2527	0.921201294859633	1	1	0.638133752370612	0.306549765549076	Inf	0.667902235607552	2.69943820224719	0.0302864765257635	0.153557749402555	1	3.54644228518014	0.296279802685667	0.99827687941155	1	1	0.269630324457703	0.649916646820672	0.958295463934562	1	134	123	0
"TCGA-HU-8245-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	77	1	3	6	9	67	2747	2	4	6	12	603	2	5	1	8	612	2	2	19	23	772	2	5	17	24	760	1	1	0	2	81	0.025974025974026	0.0833333333333333	0.106578947368421	0.781893004115226	0.0246913580246914	0	0	1	1	85	0.012987012987013	0.0434782608695652	0.110103626943005	0.394884910485933	0.0117647058823529	0.025974025974026	2	38	166	1366	0.939343436655775	1	1	0.43326887439775	0.0737545094630409	Inf	0.46144578313253	2.30722891566265	0.369272670476673	0.678926759123496	1	2.74036315309561	0.256358768406961	0.983473674335355	1	1	0.235238944729579	1	1	1	75	65	0
"TCGA-HU-8249-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	164	2	0	3	3	159	6519	2	9	1	12	1481	6	7	7	20	1586	3	13	51	67	1643	8	6	46	60	1809	5	1	4	10	241	0.0609756097560976	0.166666666666667	0.13322277501382	1.25103734439834	0.04149377593361	2	5	3	10	198	0.0609756097560976	0.149253731343284	0.120511259890444	1.23850444745967	0.0505050505050505	0.0853658536585366	14	94	439	3013	0.514610308234608	1	1	1.02219346190201	0.592871425353752	Inf	1.01932000337467	5.00393456202112	0.00011632419060775	0.00280147425713665	0.0336176910856398	11.9950418997589	0.567456496724045	0.969361493899369	1	1	0.533891042423338	1	1	1	150	145	0
"TCGA-HU-8602-01A-11D-2394-08"	0	0	1	1	1896	2	49	252	301	1592	65272	9	138	21	168	14452	10	159	13	182	14706	15	76	571	662	18104	9	80	491	580	18010	0	2	4	6	2019	0.00316455696202532	0.0103448275862069	0.112104386451971	0.0922785264128708	0.00297176820208024	0	3	4	7	1975	0.00369198312236287	0.0105740181268882	0.109091913389306	0.0969276071742705	0.00354430379746835	0.00421940928270042	8	1078	3994	32120	1	1	1	0.0596830882891541	0.0296105653431889	Inf	0.066608199592206	0	1	1	1	0	0.0681134696394875	1	1	1	0.0610420930982589	0.00164759725400458	0.00881769641495044	0.476155606407324	1888	1584	0
"TCGA-HU-8604-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	235	0	2	3	5	229	9389	3	12	11	26	2206	3	14	18	35	2330	6	17	59	82	2317	4	19	63	86	2536	1	5	1	7	326	0.0297872340425532	0.0813953488372093	0.128548895899054	0.633185903837923	0.0214723926380368	1	5	3	9	281	0.0382978723404255	0.109756097560976	0.121277514026759	0.904999566009895	0.0320284697508897	0.025531914893617	6	126	607	4246	0.999397213086627	1	1	0.333146815817427	0.142039838903461	Inf	0.363411711846638	1.59901153212521	0.36204680270697	0.678926759123496	1	1.74851442901247	0.262133038053312	0.99990323171084	1	1	0.237161308779843	0.653936472623903	0.959328124813746	1	229	223	0
"TCGA-HU-8608-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	109	0	6	3	9	100	4100	1	15	1	17	956	5	5	2	12	988	3	4	23	30	1072	4	8	29	41	1084	2	0	0	2	139	0.018348623853211	0.0487804878048781	0.128228782287823	0.380417617125812	0.0143884892086331	2	1	6	9	134	0.0825688073394495	0.3	0.125	2.4	0.0671641791044776	0.0917431192660551	10	49	273	1883	0.213357322604224	1	1	1.40739176164618	0.715714901816318	Inf	1.33854845719253	4.51282051282051	0.00671749922812292	0.0554673507693578	1	9.17741516641007	0.911242603550296	0.659037399566294	1	1	0.899683756177577	0.66992140985949	0.97781458307774	1	99	90	0
"TCGA-HU-8610-01A-22D-2394-08"	0	0	0	0	74	0	3	2	5	69	2829	2	1	3	6	625	1	4	2	7	644	0	4	25	29	767	4	4	19	27	793	1	2	4	7	105	0.0945945945945946	0.259259259259259	0.132408575031526	1.95802469135802	0.0666666666666667	0	1	0	1	73	0.0135135135135135	0.0344827586206897	0.0951760104302477	0.362305148795465	0.0136986301369863	0.0675675675675676	5	43	178	1382	0.654019616647231	1	1	0.902832969615849	0.335940446759027	Inf	0.912921348314607	2.19101123595506	0.385337911425326	0.683206480993369	1	2.58579574756795	0.796731358529111	0.754548249954561	1	1	0.776516369772703	0.282051282051282	0.550762300762301	1	69	64	0
"TCGA-HU-A4G2-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	56	1	1	2	3	52	2132	0	3	0	3	469	0	5	1	6	509	0	5	16	21	572	0	3	19	22	582	0	2	2	4	79	0.0714285714285714	0.181818181818182	0.13573883161512	1.33947065592635	0.0506329113924051	0	1	1	2	66	0.0357142857142857	0.0952380952380952	0.115384615384615	0.825396825396825	0.0303030303030303	0.0535714285714286	3	32	145	1009	0.832410997838955	1	1	0.652572825582133	0.167498641475153	Inf	0.682167487684729	NA	1	1	1	0	0.682167487684729	0.832410997838955	1	1	0.652572825582133	0.181818181818182	0.390302037298702	1	53	49	0
"TCGA-HU-A4G3-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	118	0	1	4	5	111	4551	1	8	2	11	1039	2	4	7	13	1055	1	5	40	46	1189	1	5	35	41	1268	0	1	3	4	151	0.0338983050847458	0.0975609756097561	0.119085173501577	0.819253755451462	0.0264900662251656	0	0	1	1	141	0.00847457627118644	0.0217391304347826	0.118587047939445	0.18331791551033	0.00709219858156028	0.0338983050847458	4	73	292	2165	0.984888867280721	1	1	0.406370850090249	0.134554764289718	Inf	0.437110834371108	0	1	1	1	0	0.448767123287671	0.981962500556995	1	1	0.417815692107045	0.0476190476190476	0.149585921325052	1	114	107	0
"TCGA-HU-A4G6-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	94	1	2	7	9	84	3444	2	5	4	11	821	3	2	5	10	809	5	3	27	35	896	0	9	19	28	918	0	1	3	4	124	0.0425531914893617	0.142857142857143	0.135076252723312	1.05760368663594	0.032258064516129	1	0	0	1	111	0.0106382978723404	0.0285714285714286	0.123883928571429	0.230630630630631	0.00900900900900901	0.0425531914893617	4	47	235	1579	0.909337084212333	1	1	0.571984288210072	0.186557094590838	Inf	0.605423445974134	1.54382978723404	0.501248170102397	0.802392309331645	1	1.67920471944411	0.503422756706753	0.946836798403792	1	1	0.468924829613516	0.523809523809524	0.822722567287785	1	90	80	0
"TCGA-HU-A4G8-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	1765	6	48	249	297	1462	59942	14	126	10	150	13140	9	141	19	169	13357	16	57	519	592	16411	7	61	483	551	17034	1	5	4	10	1899	0.0056657223796034	0.0181488203266788	0.111482916519901	0.162794631619087	0.00526592943654555	3	4	10	17	1837	0.00963172804532578	0.0287162162162162	0.111937115349461	0.256538826523856	0.00925421883505716	0.0101983002832861	18	1007	3736	29709	1	1	1	0.142146568530895	0.0914468583478545	Inf	0.157207395414425	1.55688483381436	0.251515632631374	0.548462354786831	1	1.67408502862513	0.125079070980095	1	1	1	0.112684700225014	0.00841215477821044	0.0385890909667114	1	1747	1444	0
"TCGA-HU-A4G9-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	929	15	21	142	163	751	30791	5	76	8	89	6674	6	64	13	83	6837	5	29	255	289	8535	6	28	256	290	8745	0	0	4	4	962	0.00430570505920344	0.0137931034482759	0.110005717552887	0.125385332281884	0.00415800415800416	0	5	4	9	898	0.00968783638320775	0.0311418685121107	0.105213825424722	0.29598646742858	0.010022271714922	0.00861141011840689	8	514	1860	15420	1	1	1	0.129039386088604	0.0638035726742905	Inf	0.14238042269188	0	1	1	1	0	0.145445363297772	1	1	1	0.13186129437184	0.00164759725400458	0.00881769641495044	0.476155606407324	921	743	0
"TCGA-HU-A4GC-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	167	0	1	3	4	163	6683	2	7	4	13	1532	4	17	4	25	1575	4	7	46	57	1766	2	6	60	68	1810	1	0	2	3	226	0.0179640718562874	0.0441176470588235	0.124861878453039	0.353331598125976	0.0132743362831858	1	0	2	3	212	0.0179640718562874	0.0526315789473684	0.12004530011325	0.438430983118173	0.0141509433962264	0.0359281437125748	6	106	438	3138	0.995119314207559	1	1	0.405601838888118	0.172113682784578	Inf	0.437377690802348	2.72146118721461	0.161667151070975	0.424743696904653	1	3.58056016487078	0.308089945722409	0.999303633570944	1	1	0.281017209439931	0.567099567099567	0.875040916530278	1	161	157	0
"TCGA-HU-A4GD-01A-11D-A25D-08"	0	1	0	1	95	1	3	1	4	90	3690	3	7	2	12	845	1	6	3	10	853	9	3	24	36	1009	6	4	22	32	983	0	2	3	5	117	0.0526315789473684	0.15625	0.119023397761953	1.31276709401709	0.0427350427350427	1	0	6	7	129	0.0736842105263158	0.194444444444444	0.12784935579782	1.520887166236	0.0542635658914729	0.105263157894737	10	51	246	1746	0.221771992440783	1	1	1.39142392132966	0.708206802006152	Inf	1.32746901239504	0.539837398373984	0.861555973712019	1	1	0.507102432700889	1.58430540827147	0.111616347563018	1	1	1.72587092133848	0.00275945618522009	0.0135166582631967	0.797482837528606	85	80	0
"TCGA-HU-A4GF-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	151	1	1	7	8	141	5781	4	14	7	25	1437	5	13	7	25	1405	3	6	31	40	1467	4	11	36	51	1472	1	2	3	6	197	0.0397350993377483	0.117647058823529	0.13383152173913	0.879068378620484	0.0304568527918782	0	2	3	5	212	0.033112582781457	0.125	0.144512610770279	0.86497641509434	0.0235849056603774	0.0463576158940397	7	67	409	2530	0.903192525681758	1	1	0.646361410243471	0.291290937945318	Inf	0.679739641842331	1.02654558155781	0.650123923116741	0.916516164784089	1	1.03096352064882	0.643506185454147	0.917397707030349	1	1	0.608527243834034	0.0634674922600621	0.187164339419979	1	144	134	0
"TCGA-HU-A4GH-01A-11D-A24D-08"	0	0	0	0	849	3	6	6	12	830	34030	42	100	197	339	8563	32	115	198	345	8641	14	10	45	69	8295	8	12	57	77	8531	2	3	4	9	1267	0.0106007067137809	0.116883116883117	0.1485171726644	0.787000686763907	0.00710339384372534	4	3	7	14	1321	0.016489988221437	0.202898550724638	0.159252561784207	1.27406773524668	0.0105980317940954	0.0200235571260306	17	107	2588	14238	0.732960591221508	1	1	0.874094618005381	0.53847279364605	Inf	0.891340928354191	1.77314879865112	0.110100223563057	0.334936469576037	1	2.06300889255233	0.701147073976422	0.92811699416741	1	1	0.665037303561026	0.22140090065364	0.447446575446867	1	832	813	0
"TCGA-HU-A4GN-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	1394	4	36	153	189	1201	49241	9	86	12	107	10874	8	90	18	116	11185	7	60	431	498	13564	9	65	406	480	13618	1	5	6	12	1591	0.00860832137733142	0.025	0.116830665295932	0.213984915147706	0.00754242614707731	1	1	8	10	1587	0.00717360114777618	0.0200803212851406	0.11700088469478	0.17162537990652	0.00630119722747322	0.0114777618364419	16	837	3178	24004	1	1	1	0.144390711404149	0.0900868301610032	Inf	0.16043475919219	1.0691472624292	0.573556160644136	0.845702706255894	1	1.07904967361529	0.143063910862689	1	1	1	0.128491169469991	0.000372885483776326	0.00256580725741329	0.107763904811358	1378	1185	0
"TCGA-HU-A4GP-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	211	2	4	4	8	200	8200	5	9	5	19	1933	13	10	3	26	1928	6	19	46	71	2203	5	17	62	84	2136	2	3	4	9	282	0.042654028436019	0.107142857142857	0.132022471910112	0.811550151975684	0.0319148936170213	1	4	3	8	283	0.037914691943128	0.112676056338028	0.128461189287335	0.877121385557159	0.0282685512367491	0.0473933649289099	10	109	565	3774	0.954363380776144	1	1	0.612869391724173	0.322528614041564	Inf	0.645348404848665	2.09444891391794	0.164573239017284	0.428483478162118	1	2.50409750109166	0.497754834480498	0.989910985789168	1	1	0.463008158319784	0.258731924360401	0.512147439316136	1	201	190	0
"TCGA-HU-A4GQ-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	2175	11	74	262	336	1826	74866	16	136	11	163	15840	19	127	25	171	16482	8	83	691	782	20974	4	90	616	710	21570	0	7	9	16	2368	0.00735632183908046	0.0225352112676056	0.109782104775151	0.205272173582033	0.00675675675675676	0	9	6	15	2284	0.00689655172413793	0.0191815856777494	0.108896729283875	0.17614473642956	0.00656742556917688	0.00689655172413793	15	1304	4652	37892	1	1	1	0.0936982974974516	0.057567188319861	Inf	0.104002810957257	0	1	1	1	0	0.104957695220063	1	1	1	0.0945685578686429	6.45956611188048e-06	8.88959336349266e-05	0.00186681460633346	2160	1811	0
"TCGA-HU-A4GT-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	1969	40	71	212	283	1646	67486	9	235	43	287	14987	23	194	23	240	15202	5	110	440	555	18697	10	87	467	564	18600	4	5	4	13	2126	0.00660233621127476	0.0230496453900709	0.114301075268817	0.201657292688297	0.00611476952022578	1	9	8	18	2127	0.00914169629253428	0.0324324324324324	0.113761566026635	0.285091297221057	0.00846262341325811	0.00863382427628238	17	905	4253	33044	1	1	1	0.145951468352398	0.0925498233169098	Inf	0.161694973001066	2.92319147268595	0.0216954016547906	0.12539942156469	1	3.88421131372239	0.116025240371217	1	1	1	0.104175835670916	0.0860130139090089	0.225979645633669	1	1952	1629	0
"TCGA-HU-A4GU-01A-11D-A25D-08"	0	0	1	1	1753	6	38	168	206	1541	63181	16	89	46	151	13765	14	92	47	153	14279	6	104	496	606	17389	10	111	510	631	17748	1	10	15	26	1988	0.0148317170564746	0.0412044374009509	0.11201262114041	0.367855309352151	0.0130784708249497	3	13	9	25	1979	0.0142612664004564	0.0412541254125413	0.113807579504284	0.362490139867953	0.0126326427488631	0.0159726183685111	28	994	3967	31170	1	1	1	0.221338264688304	0.156393253831512	Inf	0.242666381206598	2.21433072851021	0.0978533461074412	0.315808794622601	1	2.61900589411745	0.211307902521849	1	1	1	0.192037089972263	1.31891742305713e-05	0.000152466854105404	0.00381167135263511	1725	1513	0
"TCGA-HU-A4GX-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	1468	3	52	225	277	1187	48667	8	77	13	98	10393	8	87	8	103	10639	3	55	440	498	13721	5	57	426	488	13914	0	2	2	4	1478	0.00272479564032698	0.00819672131147541	0.106223947103637	0.0771645333747421	0.0027063599458728	0	3	3	6	1438	0.00408719346049046	0.0120481927710843	0.104802856934626	0.114960537560534	0.00417246175243394	0.00340599455040872	5	869	2916	24719	1	1	1	0.0487691221004937	0.0191566581271195	Inf	0.0542163805470018	0	1	1	1	0	0.0547172247090988	1	1	1	0.0492230583505502	0.0325077399380805	0.111842105263158	1	1463	1182	0
"TCGA-HU-A4GY-01A-21D-A24D-08"	0	0	0	0	74	0	0	1	1	73	2993	2	2	1	5	653	3	4	3	10	677	0	2	19	21	841	1	8	28	37	822	0	1	1	2	102	0.027027027027027	0.0540540540540541	0.124087591240876	0.435612082670906	0.0196078431372549	0	1	1	2	96	0.027027027027027	0.0952380952380952	0.114149821640904	0.834325396825397	0.0208333333333333	0.027027027027027	2	46	198	1465	0.982282488383425	1	1	0.321835973823076	0.0551819924385692	Inf	0.349957912457912	0	1	1	1	0	0.357403825488932	0.980300016554162	1	1	0.328986223149246	0.428571428571429	0.707755102040817	1	72	71	0
"TCGA-HU-A4H0-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	195	0	3	4	7	188	7708	7	17	2	26	1749	3	15	3	21	1871	7	10	67	84	1955	4	9	44	57	2133	0	3	3	6	277	0.0307692307692308	0.105263157894737	0.129864041256446	0.810564316929508	0.0216606498194946	2	1	3	6	242	0.0307692307692308	0.0714285714285714	0.123785166240409	0.577036599763872	0.0247933884297521	0.041025641025641	8	114	519	3569	0.989838165544529	1	1	0.482640367741957	0.233773111334528	Inf	0.516503995704223	1.43212471536171	0.4168934595602	0.721450358161065	1	1.52796126128499	0.425766807269697	0.996365929784911	1	1	0.393014987448285	0.193027325346615	0.407189029380816	1	187	180	0
"TCGA-HU-A4H2-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	188	0	1	3	4	184	7544	8	11	12	31	1796	6	14	6	26	1807	3	13	41	57	1908	3	11	56	70	2033	0	0	5	5	257	0.0265957446808511	0.0714285714285714	0.126414166256763	0.565036131183991	0.0194552529182879	0	0	2	2	224	0.0106382978723404	0.0350877192982456	0.117400419287212	0.298872180451128	0.00892857142857143	0.0372340425531915	7	96	481	3460	0.973241833589917	1	1	0.524582230615654	0.239044944706794	Inf	0.556829420907091	0	1	1	1	0	0.591272477870416	0.958467255941013	1	1	0.559548705095057	0.000582750582750584	0.00366119387858519	0.168414918414919	181	177	0
"TCGA-HU-A4H3-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	1080	8	37	178	215	857	35137	13	60	12	85	7909	3	74	20	97	7988	4	50	285	339	9690	7	59	270	336	9550	1	5	2	8	1123	0.00740740740740741	0.0238095238095238	0.117591623036649	0.202476360089895	0.00712377560106857	0	7	7	14	1164	0.012962962962963	0.0412979351032448	0.120123839009288	0.343794665936806	0.0120274914089347	0.00925925925925926	10	556	2287	16953	1	1	1	0.13332979989633	0.071868871007185	Inf	0.148635473818062	0.764797074372938	0.751471827921729	1	1	0.74128726018598	0.136423261915173	1	1	1	0.122194659408891	0.00934194808273082	0.0409064090289274	1	1070	847	0
"TCGA-HU-A4H4-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	798	0	16	40	56	742	30422	11	127	26	164	7153	18	125	37	180	7323	7	45	153	205	7957	4	43	146	193	7989	2	3	6	11	1059	0.0137844611528822	0.0569948186528497	0.132557266241081	0.429963745247985	0.0103871576959396	1	2	4	7	991	0.0087719298245614	0.0341463414634146	0.124544426291316	0.274169968743078	0.0070635721493441	0.0162907268170426	13	297	2050	13896	0.99999993028574	1	1	0.296717525433485	0.173347262688755	Inf	0.326196695515342	2.12141906873614	0.159483422209326	0.422850541454084	1	2.54164064514386	0.260151725263072	0.999999996715927	1	1	0.234563676224625	0.0354150113883151	0.120411038720271	1	785	729	0
"TCGA-HU-A4H5-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	301	0	0	18	18	283	11603	17	14	13	44	2683	18	14	9	41	2831	35	21	53	109	2997	16	29	44	89	3092	4	3	3	10	409	0.0332225913621262	0.112359550561798	0.132276843467012	0.849427213538089	0.0244498777506112	5	3	6	14	380	0.0465116279069767	0.128440366972477	0.126793460126793	1.01298889425398	0.0368421052631579	0.0598006644518272	18	130	789	5300	0.649488917515942	1	1	0.930094303234236	0.581983132829703	Inf	0.938598294111602	1.36188772086781	0.210877251320769	0.504675394527314	1	1.43933307985765	0.716044059425346	0.894221112807755	1	1	0.68704015704485	1	1	1	283	265	0
"TCGA-HU-A4H6-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	102	0	1	0	1	101	4141	1	3	3	7	930	3	3	3	9	946	2	4	38	44	1151	2	4	35	41	1114	1	0	2	3	127	0.0294117647058824	0.0731707317073171	0.114003590664273	0.64182830804686	0.0236220472440945	0	0	0	0	127	0	0	0.110338835794961	0	0	0.0294117647058824	3	74	254	2011	0.993516119219067	1	1	0.321075006740672	0.0850940920525022	Inf	0.347428162388792	2.22933070866142	0.379482096749905	0.68235126628403	1	2.63750022262893	0.244310214647827	0.998117210602896	1	1	0.223106149380024	1	1	1	99	98	0
"TCGA-HU-A4H8-01A-11D-A25D-08"	0	0	1	1	1419	16	41	183	224	1179	48339	13	63	10	86	10326	7	49	7	63	10331	15	58	473	546	13735	4	50	430	484	13947	0	2	9	11	1441	0.00775193798449612	0.0227272727272727	0.103319710331971	0.219970348873888	0.00763358778625954	1	3	2	6	1478	0.00422832980972516	0.010989010989011	0.107608299963597	0.10212047762792	0.0040595399188092	0.00845665961945032	12	910	2919	24763	1	1	1	0.111872742863296	0.0642736610053087	Inf	0.123428000704488	0.499125511620779	0.879627250868231	1	1	0.471308435306109	0.115522958946559	1	1	1	0.10461944532364	0.000789927616836744	0.00485721449501742	0.228289081265819	1407	1167	0
"TCGA-HU-A4HD-01A-11D-A25D-08"	1	0	0	1	199	1	3	2	5	193	7913	3	16	8	27	1965	10	6	9	25	1902	12	15	41	68	1959	11	10	52	73	2087	5	2	5	12	265	0.0603015075376884	0.164383561643836	0.126976521322472	1.29459808736108	0.0452830188679245	2	4	8	14	287	0.0703517587939698	0.205882352941176	0.146503318019398	1.40530846484935	0.0487804878048781	0.100502512562814	20	96	552	3494	0.164539075978741	1	1	1.31859176971999	0.834730858644235	Inf	1.26374312843578	2.23078134845621	0.0299544154216959	0.153557749402555	1	2.76828280454006	1.02458313853826	0.509518206747295	1	1	1.02857446904834	0.15336039731111	0.3574286679267	1	179	173	0
"TCGA-IN-7806-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	86	1	0	2	2	83	3403	2	5	2	9	797	3	9	1	13	754	0	4	33	37	901	2	7	15	24	951	0	2	5	7	98	0.0813953488372093	0.291666666666667	0.103049421661409	2.83035714285714	0.0714285714285714	0	0	4	4	113	0.0465116279069767	0.108108108108108	0.125416204217536	0.861994738100933	0.0353982300884956	0.104651162790698	9	41	211	1641	0.115030592638216	1	1	1.70661666420136	0.826774889305704	Inf	1.57990521327014	0	1	1	1	0	1.6457345971564	0.0946313012575317	1	1	1.79406852723421	0.000221141088014153	0.00172729120097541	0.0639097744360902	77	74	0
"TCGA-IN-7808-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	122	0	3	0	3	119	4879	2	7	1	10	1114	4	6	5	15	1190	3	9	30	42	1276	7	7	38	52	1299	1	3	1	5	163	0.040983606557377	0.0961538461538462	0.125481139337952	0.766281264747522	0.0306748466257669	0	1	2	3	151	0.0245901639344262	0.0714285714285714	0.11833855799373	0.603595080416272	0.0198675496688742	0.0327868852459016	4	74	314	2261	0.988622294908238	1	1	0.389321190401454	0.129014818334268	Inf	0.420545484239752	0.820063694267516	0.727979752797657	0.98772839698837	1	0.800142861635361	0.361792806294492	0.991737005536014	1	1	0.332429438965785	0.569230769230769	0.875040916530278	1	118	115	0
"TCGA-IN-8462-01A-11D-2340-08"	1	0	0	1	135	1	5	3	8	126	5166	3	6	1	10	1183	1	7	8	16	1253	3	17	30	50	1302	4	12	34	50	1428	0	2	3	5	188	0.037037037037037	0.1	0.131652661064426	0.759574468085106	0.0265957446808511	2	2	2	6	178	0.0444444444444444	0.12	0.136712749615975	0.877752808988764	0.0337078651685393	0.0518518518518519	7	64	366	2364	0.853691545690221	1	1	0.706533327225743	0.317702684618687	Inf	0.73539598245209	2.13114754098361	0.240218626708824	0.53527889481757	1	2.58225382709958	0.582735655737705	0.940996181415042	1	1	0.547471119085496	0.361455108359133	0.644818063677713	1	128	119	0
"TCGA-IN-8663-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	185	2	1	1	2	181	7421	4	11	13	28	1694	4	20	19	43	1840	6	8	42	56	1937	8	10	36	54	1950	4	1	3	8	252	0.0432432432432432	0.148148148148148	0.129230769230769	1.14638447971781	0.0317460317460317	0	0	1	1	271	0.00540540540540541	0.0178571428571429	0.139907072792979	0.127635740643121	0.003690036900369	0.0432432432432432	8	84	523	3364	0.937986418033187	1	1	0.612647851134031	0.294542828703813	Inf	0.646271510516252	2.1234635345534	0.109022968474521	0.334936469576037	1	2.57189375118333	0.381134480560867	0.995039503754317	1	1	0.347744967744599	1	1	1	177	173	0
"TCGA-IP-7968-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	128	2	1	1	2	123	5043	7	5	2	14	1114	2	2	2	6	1141	4	9	38	51	1344	1	3	48	52	1444	0	0	1	1	166	0.0078125	0.0192307692307692	0.114958448753463	0.167284522706209	0.00602409638554217	3	4	3	10	168	0.078125	0.196078431372549	0.125	1.56862745098039	0.0595238095238095	0.0546875	7	84	334	2454	0.928091940241476	1	1	0.612363847715346	0.277504970646906	Inf	0.642100414555504	5.00838323353293	0.0144485935909969	0.0893485942413713	1	10.9998285611185	0.388246762289375	0.993789581465849	1	1	0.358492712018852	1	1	1	121	116	0
"Totals"	7	22	37	66	146785	788	3321	13002	16323	129535	5310935	2179	12676	4252	19107	1232210	2320	12717	4437	19474	1252417	1951	6592	37342	45885	1405512	1791	6783	36495	45069	1420796	452	1235	1289	2976	177835	0.0202745512143611	0.0660320841376556	0.125165752155834	0.527557123257202	0.0167346135462648	507	1161	1322	2990	174774	0.0203699288074395	0.0651629072681704	0.124348991684169	0.524032454028063	0.0171078077974985	0.0243212862349695	3570	74009	352609	2473699	1	NA	NA	0.338404771757678	0.328862152692688	Inf	0.368850293751303	2.05419145713927	3.64379040854914e-105	NA	NA	2.41744735365579	0.283438553927126	1	NA	NA	0.257170683686126	7.08408253576488e-246	NA	NA	143215	125965	NA
