Hybridization REF p difference q subclass Composite Element REF p difference q subclass PRKCA |PKC-ALPHA_PS657-R-C 0.000635377685663506 1.2477074959073 0.00338868099020537 1 PRKCA |PKC-ALPHA-M-V 0.000102530004259532 0.997794913024522 0.00103609267462264 1 G6PD|G6PD-M-V 0.00565529744231395 0.687831560514952 0.0187209846366255 1 TUBA1B|ACETYL-A-TUBULIN-LYS40-R-C 0.00669742997309875 0.662110178615431 0.0204112151561105 1 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.000127692743177429 0.626846950529306 0.00111440939500302 1 PRKCD|PKC-DELTA_PS664-R-V 0.000296458879607933 0.554128898354665 0.00210815203276752 1 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 0.0233003374996147 0.490122456000598 0.0566185197085006 1 RPS6KB1|P70S6K_PT389-R-V 2.21851692208709e-06 0.464207869074761 7.09925415067869e-05 1 RAD51|RAD51-R-V 0.000726879697220029 0.459580617847488 0.00377191626665529 1 ANXA1|ANNEXIN-1-M-E 0.000314267444656865 0.451218034036483 0.00215497676336136 1 VHL|VHL-M-C 0.000818358224080475 0.438628327299641 0.0040288404877808 1 BIRC2 |CIAP-R-V 0.000224747728560866 0.419337188627392 0.00172606255534745 1 PRDX1|PRDX1-R-V 4.25514371481537e-06 0.402861277392943 0.00011671251332065 1 ESR1|ER-ALPHA-R-V 0.000293122232293332 0.383222389804426 0.00210815203276752 1 ARAF|A-RAF_PS299-R-C 0.00433329717555009 0.378247604127392 0.0148570188876003 1 TP53|P53-R-E 8.3094681221636e-05 0.357262816115431 0.000977178460766342 1 RAB25|RAB25-R-V 0.000125611181712258 0.3532509220939 0.00111440939500302 1 FOXO3|FOXO3A-R-C 4.03486957317506e-05 0.348516450141746 0.00064557913170801 1 INPP4B|INPP4B-R-V 0.000337868046721347 0.343441042038876 0.00223691948174133 1 PECAM1|CD31-M-V 9.8755573528375e-06 0.338733887538876 0.000172373364704073 1 LCK|LCK-R-V 0.000415677581764089 0.332105084026914 0.00251571850033259 1 PREX1|PREX1-R-E 0.0102049533185226 0.307747944258971 0.0296871369266112 1 XBP1|XBP1-G-C 5.07709847935835e-06 0.306755804957536 0.0001218503635046 1 BCL2|BCL-2-M-V 0.000140384191832432 0.295066078203947 0.00115020532381618 1 CDH3|P-CADHERIN-R-C 0.00609074376373943 0.284696660940789 0.0191708656170159 1 ARHI|ARHI-M-E 0.00139435056051447 0.232399641596292 0.00622593738648322 1 NRAS|N-RAS-M-V 8.81368596351743e-06 0.208313731998206 0.000169222770499535 1 MYC|C-MYC-R-C 0.00642161899759188 0.207939798251794 0.0198863039925426 1 SCD1|SCD1-M-V 0.00262391114371737 0.20061617939055 0.00987825371752422 1 BAK1|BAK-R-E 0.00154301326285965 0.183621552462321 0.00673314878338756 1 YWHAB|14-3-3_BETA-R-V 1.23825191914601e-07 0.182417207519737 2.37744368476034e-05 1 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 0.0113631433444876 0.17585211358433 0.0313798016960226 1 SFRS1|SF2-M-V 0.00115386053110238 0.165398710290072 0.00527479099932517 1 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 0.0060115449619484 0.164132842735048 0.0191708656170159 1 SMAD4|SMAD4-M-V 0.000751632038312599 0.162997715680024 0.00379771977252682 1 CDC2|CDK1-R-V 0.0215534255033142 0.161122766328349 0.0530545858543119 1 BRCA2|BRCA2-R-C 4.61461176815664e-05 0.154578523586722 0.000681542661143135 1 CHEK2|CHK2_PT68-R-E 0.0172653169595374 0.151314536493421 0.044426779762293 1 PGR|PR-R-V 0.00279247386647928 0.140499497794856 0.0101161317427174 1 RAB11A RAB11B|RAB11-R-E 0.0238859380020237 0.11256812119677 0.0566185197085006 1 BECN1|BECLIN-G-C 0.0123441690055965 0.0979161122757177 0.0333814147756976 1 ETS1|ETS-1-R-V 0.0196638692575965 0.095082348694378 0.0496771433876122 1 MRE11A|MRE11-R-C 0.00410727756144656 0.0912863281895933 0.01460365355181 1 CDKN1B|P27_PT157-R-C 0.00047945167111168 0.0906356207781101 0.00270749178980713 1 RAD50|RAD50-M-V 0.0366677942245486 -0.109367595494617 0.0791035560799251 1 TSC2|TUBERIN_PT1462-R-V 0.0158972208077638 -0.122780343267344 0.0418118684258993 1 ADAR|ADAR1-M-V 0.0415022034654697 -0.148283179047249 0.0866132941888063 1 C12ORF5|TIGAR-R-V 0.0349377569849603 -0.151939610918062 0.0771040154150848 1 PIK3CA |PI3K-P110-ALPHA-R-C 0.0111566781143407 -0.16628340718122 0.0313798016960226 1 BAP1|BAP1C-4-M-E 0.0266555087560261 -0.171831723561603 0.0609770568656427 1 AKT1S1|PRAS40_PT246-R-V 0.0266774623787187 -0.177668964968301 0.0609770568656427 1 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 0.0173542108446457 -0.182297893121411 0.044426779762293 1 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.00161061456369357 -0.182457094396531 0.00687195547175923 1 RAF1|C-RAF-R-V 0.0238325774489995 -0.184168169511364 0.0566185197085006 1 PEA15|PEA15_PS116-R-V 0.0486151045586702 -0.202960414499402 0.100366667475964 1 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.00278430207106647 -0.238172297128589 0.0101161317427174 1 FRAP1|MTOR-R-V 0.00742150945089744 -0.244441661461124 0.0222645283526923 1 XRCC5|KU80-R-C 0.000123494864539498 -0.27614081222189 0.00111440939500302 1 BAD|BAD_PS112-R-V 0.00924798747353281 -0.276220961796053 0.0273171322295123 1 EGFR|EGFR-R-V 0.0110950048366294 -0.297999231736244 0.0313798016960226 1 DVL3|DVL3-R-V 0.000409868603640051 -0.30211769264055 0.00251571850033259 1 ACACA ACACB|ACC_PS79-R-V 0.0300397002205625 -0.327055653315191 0.0670653772366046 1 EEF2|EEF2-R-C 9.16104806968446e-05 -0.335113299674043 0.000977178460766342 1 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA-M-V 5.45510478700646e-05 -0.350008292645335 0.000705798398326476 1 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.0297485186050045 -0.366169649085526 0.0670653772366046 1 RPS6KA1|P90RSK-R-C 0.0042987718863594 -0.366730968970694 0.0148570188876003 1 MYH9|MYOSIN-IIA-PS1943-R-V 0.00195944497670939 -0.370588257520933 0.00793822108175232 1 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 0.0355784692172119 -0.381124690226675 0.0776257510193714 1 PEA15|PEA15-R-V 0.00528349884455633 -0.38982834905921 0.0177970487395582 1 EIF4EBP1|4E-BP1_PT37_T46-R-V 0.00602032627451834 -0.435378766630981 0.0191708656170159 1 TSC1|TSC1-R-C 8.8672963544946e-05 -0.450729310049641 0.000977178460766342 1 EEF2K|EEF2K-R-V 0.00256036158472015 -0.455244242092703 0.00983178848532538 1 RPS6|S6-R-E 4.59093925377762e-07 -0.464824637489832 4.40730168362652e-05 1 ACACA|ACC1-R-E 0.0199565409234159 -0.465240180408493 0.0497617643804656 1 FN1|FIBRONECTIN-R-V 0.0404452996739336 -0.483703640006579 0.0853351377735742 1 TP53BP1|53BP1-R-E 0.00198455527043808 -0.488877775001794 0.00793822108175232 1 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9-R-V 0.0246128877622211 -0.509761448195574 0.0576301762237372 1 GSK3A GSK3B|GSK3_PS9-R-V 0.0130447158880583 -0.527097172257775 0.0347859090348221 1 TSC2|TUBERIN-R-E 0.000143775665477023 -0.537573370867823 0.00115020532381618 1 SRC|SRC_PY527-R-V 0.0114405527016749 -0.541681940676435 0.0313798016960226 1 PTEN|PTEN-R-V 6.68139501765314e-06 -0.566093710798445 0.000142536427043267 1 SERPINE1|PAI-1-M-E 0.0396555020794949 -0.570090703006579 0.0845984044362558 1 MSH6|MSH6-R-C 0.00101502593281982 -0.584388633958732 0.00475329217320501 1 PDCD4|PDCD4-R-C 0.00241096494214102 -0.630833412798445 0.00944704630389951 1 MAPK1|ERK2-R-E 1.83926980484963e-06 -0.635770469138158 7.06279605062258e-05 1 AKT1 AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.000998178859454096 -0.663348325097488 0.00475329217320501 1 ATM|ATM-R-E 0.000586038641169847 -0.684769635430024 0.00321484054584602 1 YAP1|YAP_PS127-R-E 0.000473260803438392 -0.686514007126196 0.00270749178980713 1 RBM15|RBM15-R-V 1.17538702950105e-06 -0.774999363781699 5.64185774160504e-05 1 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.00165478037651287 -0.838568011224282 0.00690690939761894 1 CTNNB2|BETA-CATENIN-R-V 8.85055326411745e-07 -0.965507821119019 5.64185774160504e-05 1 TFRC|TFRC-R-V 0.000419286416722098 -1.02484091137022 0.00251571850033259 1 FASN|FASN-R-V 5.51404998692559e-05 -1.09702625059031 0.000705798398326476 1 FASN|FASN-R-V 5.51404998692559e-05 1.09702625059031 0.000705798398326476 2 TFRC|TFRC-R-V 0.000419286416722098 1.02484091137022 0.00251571850033259 2 CTNNB2|BETA-CATENIN-R-V 8.85055326411745e-07 0.965507821119019 5.64185774160504e-05 2 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.00165478037651287 0.838568011224282 0.00690690939761894 2 RBM15|RBM15-R-V 1.17538702950105e-06 0.774999363781699 5.64185774160504e-05 2 YAP1|YAP_PS127-R-E 0.000473260803438392 0.686514007126196 0.00270749178980713 2 ATM|ATM-R-E 0.000586038641169847 0.684769635430024 0.00321484054584602 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.000998178859454096 0.663348325097488 0.00475329217320501 2 MAPK1|ERK2-R-E 1.83926980484963e-06 0.635770469138158 7.06279605062258e-05 2 PDCD4|PDCD4-R-C 0.00241096494214102 0.630833412798445 0.00944704630389951 2 MSH6|MSH6-R-C 0.00101502593281982 0.584388633958732 0.00475329217320501 2 SERPINE1|PAI-1-M-E 0.0396555020794949 0.570090703006579 0.0845984044362558 2 PTEN|PTEN-R-V 6.68139501765314e-06 0.566093710798445 0.000142536427043267 2 SRC|SRC_PY527-R-V 0.0114405527016749 0.541681940676435 0.0313798016960226 2 TSC2|TUBERIN-R-E 0.000143775665477023 0.537573370867823 0.00115020532381618 2 GSK3A GSK3B|GSK3_PS9-R-V 0.0130447158880583 0.527097172257775 0.0347859090348221 2 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9-R-V 0.0246128877622211 0.509761448195574 0.0576301762237372 2 TP53BP1|53BP1-R-E 0.00198455527043808 0.488877775001794 0.00793822108175232 2 FN1|FIBRONECTIN-R-V 0.0404452996739336 0.483703640006579 0.0853351377735742 2 ACACA|ACC1-R-E 0.0199565409234159 0.465240180408493 0.0497617643804656 2 RPS6|S6-R-E 4.59093925377762e-07 0.464824637489832 4.40730168362652e-05 2 EEF2K|EEF2K-R-V 0.00256036158472015 0.455244242092703 0.00983178848532538 2 TSC1|TSC1-R-C 8.8672963544946e-05 0.450729310049641 0.000977178460766342 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PT37_T46-R-V 0.00602032627451834 0.435378766630981 0.0191708656170159 2 PEA15|PEA15-R-V 0.00528349884455633 0.38982834905921 0.0177970487395582 2 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 0.0355784692172119 0.381124690226675 0.0776257510193714 2 MYH9|MYOSIN-IIA-PS1943-R-V 0.00195944497670939 0.370588257520933 0.00793822108175232 2 RPS6KA1|P90RSK-R-C 0.0042987718863594 0.366730968970694 0.0148570188876003 2 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.0297485186050045 0.366169649085526 0.0670653772366046 2 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA-M-V 5.45510478700646e-05 0.350008292645335 0.000705798398326476 2 EEF2|EEF2-R-C 9.16104806968446e-05 0.335113299674043 0.000977178460766342 2 ACACA ACACB|ACC_PS79-R-V 0.0300397002205625 0.327055653315191 0.0670653772366046 2 DVL3|DVL3-R-V 0.000409868603640051 0.30211769264055 0.00251571850033259 2 EGFR|EGFR-R-V 0.0110950048366294 0.297999231736244 0.0313798016960226 2 BAD|BAD_PS112-R-V 0.00924798747353281 0.276220961796053 0.0273171322295123 2 XRCC5|KU80-R-C 0.000123494864539498 0.27614081222189 0.00111440939500302 2 FRAP1|MTOR-R-V 0.00742150945089744 0.244441661461124 0.0222645283526923 2 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.00278430207106647 0.238172297128589 0.0101161317427174 2 PEA15|PEA15_PS116-R-V 0.0486151045586702 0.202960414499402 0.100366667475964 2 RAF1|C-RAF-R-V 0.0238325774489995 0.184168169511364 0.0566185197085006 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.00161061456369357 0.182457094396531 0.00687195547175923 2 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 0.0173542108446457 0.182297893121411 0.044426779762293 2 AKT1S1|PRAS40_PT246-R-V 0.0266774623787187 0.177668964968301 0.0609770568656427 2 BAP1|BAP1C-4-M-E 0.0266555087560261 0.171831723561603 0.0609770568656427 2 PIK3CA |PI3K-P110-ALPHA-R-C 0.0111566781143407 0.16628340718122 0.0313798016960226 2 C12ORF5|TIGAR-R-V 0.0349377569849603 0.151939610918062 0.0771040154150848 2 ADAR|ADAR1-M-V 0.0415022034654697 0.148283179047249 0.0866132941888063 2 TSC2|TUBERIN_PT1462-R-V 0.0158972208077638 0.122780343267344 0.0418118684258993 2 RAD50|RAD50-M-V 0.0366677942245486 0.109367595494617 0.0791035560799251 2 CDKN1B|P27_PT157-R-C 0.00047945167111168 -0.0906356207781101 0.00270749178980713 2 MRE11A|MRE11-R-C 0.00410727756144656 -0.0912863281895933 0.01460365355181 2 ETS1|ETS-1-R-V 0.0196638692575965 -0.095082348694378 0.0496771433876122 2 BECN1|BECLIN-G-C 0.0123441690055965 -0.0979161122757177 0.0333814147756976 2 RAB11A RAB11B|RAB11-R-E 0.0238859380020237 -0.11256812119677 0.0566185197085006 2 PGR|PR-R-V 0.00279247386647928 -0.140499497794856 0.0101161317427174 2 CHEK2|CHK2_PT68-R-E 0.0172653169595374 -0.151314536493421 0.044426779762293 2 BRCA2|BRCA2-R-C 4.61461176815664e-05 -0.154578523586722 0.000681542661143135 2 CDC2|CDK1-R-V 0.0215534255033142 -0.161122766328349 0.0530545858543119 2 SMAD4|SMAD4-M-V 0.000751632038312599 -0.162997715680024 0.00379771977252682 2 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 0.0060115449619484 -0.164132842735048 0.0191708656170159 2 SFRS1|SF2-M-V 0.00115386053110238 -0.165398710290072 0.00527479099932517 2 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 0.0113631433444876 -0.17585211358433 0.0313798016960226 2 YWHAB|14-3-3_BETA-R-V 1.23825191914601e-07 -0.182417207519737 2.37744368476034e-05 2 BAK1|BAK-R-E 0.00154301326285965 -0.183621552462321 0.00673314878338756 2 SCD1|SCD1-M-V 0.00262391114371737 -0.20061617939055 0.00987825371752422 2 MYC|C-MYC-R-C 0.00642161899759188 -0.207939798251794 0.0198863039925426 2 NRAS|N-RAS-M-V 8.81368596351743e-06 -0.208313731998206 0.000169222770499535 2 ARHI|ARHI-M-E 0.00139435056051447 -0.232399641596292 0.00622593738648322 2 CDH3|P-CADHERIN-R-C 0.00609074376373943 -0.284696660940789 0.0191708656170159 2 BCL2|BCL-2-M-V 0.000140384191832432 -0.295066078203947 0.00115020532381618 2 XBP1|XBP1-G-C 5.07709847935835e-06 -0.306755804957536 0.0001218503635046 2 PREX1|PREX1-R-E 0.0102049533185226 -0.307747944258971 0.0296871369266112 2 LCK|LCK-R-V 0.000415677581764089 -0.332105084026914 0.00251571850033259 2 PECAM1|CD31-M-V 9.8755573528375e-06 -0.338733887538876 0.000172373364704073 2 INPP4B|INPP4B-R-V 0.000337868046721347 -0.343441042038876 0.00223691948174133 2 FOXO3|FOXO3A-R-C 4.03486957317506e-05 -0.348516450141746 0.00064557913170801 2 RAB25|RAB25-R-V 0.000125611181712258 -0.3532509220939 0.00111440939500302 2 TP53|P53-R-E 8.3094681221636e-05 -0.357262816115431 0.000977178460766342 2 ARAF|A-RAF_PS299-R-C 0.00433329717555009 -0.378247604127392 0.0148570188876003 2 ESR1|ER-ALPHA-R-V 0.000293122232293332 -0.383222389804426 0.00210815203276752 2 PRDX1|PRDX1-R-V 4.25514371481537e-06 -0.402861277392943 0.00011671251332065 2 BIRC2 |CIAP-R-V 0.000224747728560866 -0.419337188627392 0.00172606255534745 2 VHL|VHL-M-C 0.000818358224080475 -0.438628327299641 0.0040288404877808 2 ANXA1|ANNEXIN-1-M-E 0.000314267444656865 -0.451218034036483 0.00215497676336136 2 RAD51|RAD51-R-V 0.000726879697220029 -0.459580617847488 0.00377191626665529 2 RPS6KB1|P70S6K_PT389-R-V 2.21851692208709e-06 -0.464207869074761 7.09925415067869e-05 2 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 0.0233003374996147 -0.490122456000598 0.0566185197085006 2 PRKCD|PKC-DELTA_PS664-R-V 0.000296458879607933 -0.554128898354665 0.00210815203276752 2 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.000127692743177429 -0.626846950529306 0.00111440939500302 2 TUBA1B|ACETYL-A-TUBULIN-LYS40-R-C 0.00669742997309875 -0.662110178615431 0.0204112151561105 2 G6PD|G6PD-M-V 0.00565529744231395 -0.687831560514952 0.0187209846366255 2 PRKCA |PKC-ALPHA-M-V 0.000102530004259532 -0.997794913024522 0.00103609267462264 2 PRKCA |PKC-ALPHA_PS657-R-C 0.000635377685663506 -1.2477074959073 0.00338868099020537 2