Hybridization REF p difference q subclass Composite Element REF p difference q subclass NDRG1|NDRG1_PT346-R-V 0.000564971334011076 0.915659253944444 0.00471628244044029 1 RPS6|S6_PS240_S244-R-V 0.00457929302587443 0.695810894560606 0.0159858956539616 1 ESR1|ER-ALPHA-R-V 0.000269806306196868 0.683969264272727 0.00345352071931991 1 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.0157448089437834 0.681066558212121 0.0397763594369265 1 CDKN1A|P21-R-V 0.00598942135617897 0.677057301717172 0.0191661483397727 1 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473-R-V 0.00207825613812533 0.607629393792929 0.0115517091241152 1 MAPK1 MAPK3|MAPK_PT202_Y204-R-V 0.000695094361904182 0.592557499227273 0.00556075489523346 1 COPS5|JAB1-M-C 0.00768984403521983 0.558162902292929 0.0227146162271109 1 RAD51|RAD51-R-V 0.00353569883513527 0.540646861863636 0.0144437058797015 1 ARHI|ARHI-M-E 0.000143693120885566 0.52786548140404 0.00229908993416906 1 EGFR|EGFR_PY1068-R-C 0.0072413854199213 0.491801120883838 0.0217241562597639 1 MSH2|MSH2-M-V 0.0186494113833445 0.46341188139899 0.0436697481008834 1 SRC|SRC_PY416-R-C 0.0302467138066152 0.450864159227273 0.0626775734972383 1 TP53|P53-R-E 0.0124881586446007 0.443017238914142 0.0324017089157207 1 XBP1|XBP1-G-C 0.0336460637011646 0.43541267590404 0.0665983941301403 1 SCD1|SCD1-M-V 0.000307888081670084 0.426564242459596 0.00354243256262818 1 FOXM1|FOXM1-R-V 0.000258003448538036 0.388093676212121 0.00345352071931991 1 SFRS1|SF2-M-V 0.000517542298816198 0.385389689989899 0.00451673278966864 1 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PT308-R-V 0.00256795357151412 0.382272535424242 0.0123261771432678 1 TSC2|TUBERIN_PT1462-R-V 0.000118078217494759 0.381286449257576 0.00228027710233603 1 FOXO3|FOXO3A-R-C 1.32764100750475e-06 0.380039483974747 0.000127453536720456 1 ACVRL1|ACVRL1-R-C 4.94079056951065e-05 0.370514206833333 0.00118578973668256 1 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 0.000374867347070204 0.370497371863636 0.00354243256262818 1 CDH2|N-CADHERIN-R-V 0.000173495098908891 0.364906171626263 0.00256238915311593 1 BECN1|BECLIN-G-C 0.0238874806817153 0.361060043535354 0.0539576034222275 1 CCND1|CYCLIN_D1-R-V 0.0235198198744273 0.349752145909091 0.0537595882844053 1 GATA3|GATA3-M-V 0.017307317200901 0.345364328378788 0.042602626956064 1 JUN|C-JUN_PS73-R-V 0.00433464917813157 0.332444857368687 0.01541208596669 1 INPP4B|INPP4B-R-V 0.0021659454607716 0.314653771505051 0.0115517091241152 1 ARAF|A-RAF_PS299-R-C 0.00211203156700883 0.312796602994949 0.0115517091241152 1 PECAM1|CD31-M-V 0.000387453561537457 0.310503480191919 0.00354243256262818 1 YWHAB|14-3-3_BETA-R-V 0.000381285128821529 0.309165689934343 0.00354243256262818 1 ANXA1|ANNEXIN_1-M-E 0.0110085588586615 0.308986786030303 0.029769623955817 1 RPS6KB1|P70S6K_PT389-R-V 0.0063800738633826 0.297010285040404 0.019812273046746 1 BAK1|BAK-R-C 0.00473678666449387 0.296850007282828 0.0161290606016338 1 TTF1|TTF1-R-V 0.000339027510507478 0.294222006035353 0.00354243256262818 1 NRAS|N-RAS-M-V 0.00210489843736797 0.288721881873737 0.0115517091241152 1 KIT|C-KIT-R-V 0.00485844042587048 0.287509325671717 0.0161290606016338 1 NOTCH1|NOTCH1-R-V 0.00112866201362262 0.271750619792929 0.0076462130254703 1 SMAD4|SMAD4-M-V 0.0184459725378546 0.260803559050505 0.0436697481008834 1 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.0215942098117926 0.242746854631313 0.0499528708899299 1 ETS1|ETS-1-R-V 0.000746188321946482 0.233523081141414 0.00573072631254898 1 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 1.89303095791202e-05 0.218348691313131 0.000707312704602016 1 CDKN1B|P27_PT157-R-C 0.00237792336123639 0.217854630762626 0.0120147706672997 1 CDH3|P-CADHERIN-R-C 0.00416533202631311 0.217315899863636 0.01541208596669 1 MRE11A|MRE11-R-C 0.0155683145197151 0.211812069641414 0.0397763594369265 1 MYC|C-MYC-R-C 0.0303594496627248 0.208385867777778 0.0626775734972383 1 CDC2|CDK1-R-V 0.00380554754365697 0.197113472277778 0.0149115332322885 1 MAPK1|ERK2-R-E 0.0287332655258608 0.184621107712121 0.0606240327578602 1 PGR|PR-R-V 0.000853728638577659 0.176986013914141 0.00630445763872733 1 IRS1|IRS1-R-V 0.0119444989565545 0.171953568353535 0.0314156684884721 1 FOXO3|FOXO3A_PS318_S321-R-C 0.0186506215847523 0.162908418419192 0.0436697481008834 1 CDKN1B|P27_PT198-R-V 0.0261197378270796 0.153936148666667 0.0569885188954464 1 MAPK8|JNK_PT183_PY185-R-V 0.011666325755967 0.137432161787879 0.031110202015912 1 CHEK1|CHK1-M-C 0.0392759832795757 -0.117389881666667 0.0761716039361468 1 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 0.0275901930744718 -0.218500598671717 0.0588590785588732 1 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.00367879955594974 -0.219413556131313 0.014715198223799 1 FRAP1|MTOR-R-V 0.00657274423181056 -0.227162138131313 0.0200312205159941 1 KDR|VEGFR2-R-V 0.0335945634555001 -0.233157612762626 0.0665983941301403 1 EEF2|EEF2-R-C 0.00487232039007688 -0.25204037759596 0.0161290606016338 1 SRC|SRC-M-V 0.0366829526055138 -0.259968190373737 0.071868641839374 1 XRCC1|XRCC1-R-E 0.0175381345570789 -0.263665279792929 0.0426243270247994 1 RPS6KA1|P90RSK-R-C 0.00560160898405062 -0.264837290676768 0.0182289648294529 1 SMAD3|SMAD3-R-V 0.004185160539469 -0.281615914813131 0.01541208596669 1 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.00290706008277373 -0.287879032893939 0.0129221963047951 1 RPTOR|RAPTOR-R-V 0.0026488398955584 -0.288898867727273 0.0124019516882117 1 YWHAZ|14-3-3_ZETA-R-V 0.0250225974867845 -0.315552162414141 0.0552222841087658 1 SMAD1|SMAD1-R-V 3.81519594870216e-07 -0.319030494919192 7.32517622150815e-05 1 MAPK9|JNK2-R-C 0.00892304428938187 -0.323672708818182 0.0251944779935488 1 ERBB2|HER2-M-V 0.0322701009806317 -0.331994722949495 0.0652195725082241 1 PDK1|PDK1-R-V 0.000132339442004399 -0.333902974616162 0.00229908993416906 1 ERBB3|HER3-R-V 0.00115489675905541 -0.339509509489899 0.0076462130254703 1 DVL3|DVL3-R-V 0.000889471861081628 -0.340996665186869 0.00632513323435824 1 TSC2|TUBERIN-R-E 0.00821507536875881 -0.365369993010101 0.0235417085194282 1 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA-M-V 0.00203776682986205 -0.39229679349495 0.0115517091241152 1 NF2|NF2-R-C 1.69059967387901e-05 -0.400773184959596 0.000707312704602016 1 ACACA|ACC1-R-E 0.0441533039655514 -0.407458783707071 0.0847743436138587 1 BAX|BAX-R-V 0.00432297788286447 -0.42232047860101 0.01541208596669 1 BRAF|B-RAF-M-C 0.00971558245463451 -0.435866507616162 0.0266484547327118 1 MSH6|MSH6-R-C 0.000385555790966485 -0.440777633515152 0.00354243256262818 1 TSC1|TSC1-R-C 0.00297209767376132 -0.459832746116162 0.0129221963047951 1 MAPK14|P38-R-V 0.00315222023953941 -0.467089693282828 0.0131570931737297 1 PXN|PAXILLIN-R-C 0.0308132751212852 -0.467829436626263 0.0629377534392208 1 MAP2K1|MEK1-R-V 0.00393469373197601 -0.480069451030303 0.0151092239307879 1 PDK1|PDK1_PS241-R-V 5.4280713919208e-06 -0.497595159782828 0.000347396569082931 1 ATM|ATM-R-E 0.00955935051794033 -0.499863328757576 0.0265999318760079 1 RPS6|S6-R-E 0.00639771317134505 -0.525546789459596 0.019812273046746 1 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.00784846875240048 -0.535077422454545 0.0228319090978923 1 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 0.0269420620145298 -0.580031294631313 0.0581222011998845 1 PTEN|PTEN-R-V 0.0024811404505989 -0.600193607808081 0.0122148452952561 1 CTNNB2|BETA-CATENIN-R-V 0.0243174930207238 -0.611935303424243 0.0542902169764996 1 XRCC5|KU80-R-C 0.000118764432413335 -0.676070341176768 0.00228027710233603 1 RBM15|RBM15-R-V 0.00132063720891211 -0.679961683873737 0.00817943045519758 1 BCL2L1|BCL-XL-R-V 2.73482035582932e-05 -0.726687876686869 0.000750122154741756 1 SYK|SYK-M-V 0.00271292693179632 -0.760464287439394 0.0124019516882117 1 TP53BP1|53BP1-R-E 2.2103522018813e-05 -0.804208061868687 0.000707312704602016 1 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 0.0162724257376412 -0.818336393479798 0.0405753992419105 1 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.00302863975893634 -0.829710684813131 0.0129221963047951 1 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 0.00131718005582153 -0.903838065378788 0.00817943045519758 1 SQSTM1|P62-LCK-LIGAND-M-C 0.00232933142696262 -1.05225375777273 0.0120147706672997 1 SQSTM1|P62-LCK-LIGAND-M-C 0.00232933142696262 1.05225375777273 0.0120147706672997 2 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 0.00131718005582153 0.903838065378788 0.00817943045519758 2 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.00302863975893634 0.829710684813131 0.0129221963047951 2 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 0.0162724257376412 0.818336393479798 0.0405753992419105 2 TP53BP1|53BP1-R-E 2.2103522018813e-05 0.804208061868687 0.000707312704602016 2 SYK|SYK-M-V 0.00271292693179632 0.760464287439394 0.0124019516882117 2 BCL2L1|BCL-XL-R-V 2.73482035582932e-05 0.726687876686869 0.000750122154741756 2 RBM15|RBM15-R-V 0.00132063720891211 0.679961683873737 0.00817943045519758 2 XRCC5|KU80-R-C 0.000118764432413335 0.676070341176768 0.00228027710233603 2 CTNNB2|BETA-CATENIN-R-V 0.0243174930207238 0.611935303424243 0.0542902169764996 2 PTEN|PTEN-R-V 0.0024811404505989 0.600193607808081 0.0122148452952561 2 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 0.0269420620145298 0.580031294631313 0.0581222011998845 2 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.00784846875240048 0.535077422454545 0.0228319090978923 2 RPS6|S6-R-E 0.00639771317134505 0.525546789459596 0.019812273046746 2 ATM|ATM-R-E 0.00955935051794033 0.499863328757576 0.0265999318760079 2 PDK1|PDK1_PS241-R-V 5.4280713919208e-06 0.497595159782828 0.000347396569082931 2 MAP2K1|MEK1-R-V 0.00393469373197601 0.480069451030303 0.0151092239307879 2 PXN|PAXILLIN-R-C 0.0308132751212852 0.467829436626263 0.0629377534392208 2 MAPK14|P38-R-V 0.00315222023953941 0.467089693282828 0.0131570931737297 2 TSC1|TSC1-R-C 0.00297209767376132 0.459832746116162 0.0129221963047951 2 MSH6|MSH6-R-C 0.000385555790966485 0.440777633515152 0.00354243256262818 2 BRAF|B-RAF-M-C 0.00971558245463451 0.435866507616162 0.0266484547327118 2 BAX|BAX-R-V 0.00432297788286447 0.42232047860101 0.01541208596669 2 ACACA|ACC1-R-E 0.0441533039655514 0.407458783707071 0.0847743436138587 2 NF2|NF2-R-C 1.69059967387901e-05 0.400773184959596 0.000707312704602016 2 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA-M-V 0.00203776682986205 0.39229679349495 0.0115517091241152 2 TSC2|TUBERIN-R-E 0.00821507536875881 0.365369993010101 0.0235417085194282 2 DVL3|DVL3-R-V 0.000889471861081628 0.340996665186869 0.00632513323435824 2 ERBB3|HER3-R-V 0.00115489675905541 0.339509509489899 0.0076462130254703 2 PDK1|PDK1-R-V 0.000132339442004399 0.333902974616162 0.00229908993416906 2 ERBB2|HER2-M-V 0.0322701009806317 0.331994722949495 0.0652195725082241 2 MAPK9|JNK2-R-C 0.00892304428938187 0.323672708818182 0.0251944779935488 2 SMAD1|SMAD1-R-V 3.81519594870216e-07 0.319030494919192 7.32517622150815e-05 2 YWHAZ|14-3-3_ZETA-R-V 0.0250225974867845 0.315552162414141 0.0552222841087658 2 RPTOR|RAPTOR-R-V 0.0026488398955584 0.288898867727273 0.0124019516882117 2 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.00290706008277373 0.287879032893939 0.0129221963047951 2 SMAD3|SMAD3-R-V 0.004185160539469 0.281615914813131 0.01541208596669 2 RPS6KA1|P90RSK-R-C 0.00560160898405062 0.264837290676768 0.0182289648294529 2 XRCC1|XRCC1-R-E 0.0175381345570789 0.263665279792929 0.0426243270247994 2 SRC|SRC-M-V 0.0366829526055138 0.259968190373737 0.071868641839374 2 EEF2|EEF2-R-C 0.00487232039007688 0.25204037759596 0.0161290606016338 2 KDR|VEGFR2-R-V 0.0335945634555001 0.233157612762626 0.0665983941301403 2 FRAP1|MTOR-R-V 0.00657274423181056 0.227162138131313 0.0200312205159941 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.00367879955594974 0.219413556131313 0.014715198223799 2 PRKAA1|AMPK_ALPHA-R-C 0.0275901930744718 0.218500598671717 0.0588590785588732 2 CHEK1|CHK1-M-C 0.0392759832795757 0.117389881666667 0.0761716039361468 2 MAPK8|JNK_PT183_PY185-R-V 0.011666325755967 -0.137432161787879 0.031110202015912 2 CDKN1B|P27_PT198-R-V 0.0261197378270796 -0.153936148666667 0.0569885188954464 2 FOXO3|FOXO3A_PS318_S321-R-C 0.0186506215847523 -0.162908418419192 0.0436697481008834 2 IRS1|IRS1-R-V 0.0119444989565545 -0.171953568353535 0.0314156684884721 2 PGR|PR-R-V 0.000853728638577659 -0.176986013914141 0.00630445763872733 2 MAPK1|ERK2-R-E 0.0287332655258608 -0.184621107712121 0.0606240327578602 2 CDC2|CDK1-R-V 0.00380554754365697 -0.197113472277778 0.0149115332322885 2 MYC|C-MYC-R-C 0.0303594496627248 -0.208385867777778 0.0626775734972383 2 MRE11A|MRE11-R-C 0.0155683145197151 -0.211812069641414 0.0397763594369265 2 CDH3|P-CADHERIN-R-C 0.00416533202631311 -0.217315899863636 0.01541208596669 2 CDKN1B|P27_PT157-R-C 0.00237792336123639 -0.217854630762626 0.0120147706672997 2 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 1.89303095791202e-05 -0.218348691313131 0.000707312704602016 2 ETS1|ETS-1-R-V 0.000746188321946482 -0.233523081141414 0.00573072631254898 2 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.0215942098117926 -0.242746854631313 0.0499528708899299 2 SMAD4|SMAD4-M-V 0.0184459725378546 -0.260803559050505 0.0436697481008834 2 NOTCH1|NOTCH1-R-V 0.00112866201362262 -0.271750619792929 0.0076462130254703 2 KIT|C-KIT-R-V 0.00485844042587048 -0.287509325671717 0.0161290606016338 2 NRAS|N-RAS-M-V 0.00210489843736797 -0.288721881873737 0.0115517091241152 2 TTF1|TTF1-R-V 0.000339027510507478 -0.294222006035353 0.00354243256262818 2 BAK1|BAK-R-C 0.00473678666449387 -0.296850007282828 0.0161290606016338 2 RPS6KB1|P70S6K_PT389-R-V 0.0063800738633826 -0.297010285040404 0.019812273046746 2 ANXA1|ANNEXIN_1-M-E 0.0110085588586615 -0.308986786030303 0.029769623955817 2 YWHAB|14-3-3_BETA-R-V 0.000381285128821529 -0.309165689934343 0.00354243256262818 2 PECAM1|CD31-M-V 0.000387453561537457 -0.310503480191919 0.00354243256262818 2 ARAF|A-RAF_PS299-R-C 0.00211203156700883 -0.312796602994949 0.0115517091241152 2 INPP4B|INPP4B-R-V 0.0021659454607716 -0.314653771505051 0.0115517091241152 2 JUN|C-JUN_PS73-R-V 0.00433464917813157 -0.332444857368687 0.01541208596669 2 GATA3|GATA3-M-V 0.017307317200901 -0.345364328378788 0.042602626956064 2 CCND1|CYCLIN_D1-R-V 0.0235198198744273 -0.349752145909091 0.0537595882844053 2 BECN1|BECLIN-G-C 0.0238874806817153 -0.361060043535354 0.0539576034222275 2 CDH2|N-CADHERIN-R-V 0.000173495098908891 -0.364906171626263 0.00256238915311593 2 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363-R-C 0.000374867347070204 -0.370497371863636 0.00354243256262818 2 ACVRL1|ACVRL1-R-C 4.94079056951065e-05 -0.370514206833333 0.00118578973668256 2 FOXO3|FOXO3A-R-C 1.32764100750475e-06 -0.380039483974747 0.000127453536720456 2 TSC2|TUBERIN_PT1462-R-V 0.000118078217494759 -0.381286449257576 0.00228027710233603 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PT308-R-V 0.00256795357151412 -0.382272535424242 0.0123261771432678 2 SFRS1|SF2-M-V 0.000517542298816198 -0.385389689989899 0.00451673278966864 2 FOXM1|FOXM1-R-V 0.000258003448538036 -0.388093676212121 0.00345352071931991 2 SCD1|SCD1-M-V 0.000307888081670084 -0.426564242459596 0.00354243256262818 2 XBP1|XBP1-G-C 0.0336460637011646 -0.43541267590404 0.0665983941301403 2 TP53|P53-R-E 0.0124881586446007 -0.443017238914142 0.0324017089157207 2 SRC|SRC_PY416-R-C 0.0302467138066152 -0.450864159227273 0.0626775734972383 2 MSH2|MSH2-M-V 0.0186494113833445 -0.46341188139899 0.0436697481008834 2 EGFR|EGFR_PY1068-R-C 0.0072413854199213 -0.491801120883838 0.0217241562597639 2 ARHI|ARHI-M-E 0.000143693120885566 -0.52786548140404 0.00229908993416906 2 RAD51|RAD51-R-V 0.00353569883513527 -0.540646861863636 0.0144437058797015 2 COPS5|JAB1-M-C 0.00768984403521983 -0.558162902292929 0.0227146162271109 2 MAPK1 MAPK3|MAPK_PT202_Y204-R-V 0.000695094361904182 -0.592557499227273 0.00556075489523346 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473-R-V 0.00207825613812533 -0.607629393792929 0.0115517091241152 2 CDKN1A|P21-R-V 0.00598942135617897 -0.677057301717172 0.0191661483397727 2 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.0157448089437834 -0.681066558212121 0.0397763594369265 2 ESR1|ER-ALPHA-R-V 0.000269806306196868 -0.683969264272727 0.00345352071931991 2 RPS6|S6_PS240_S244-R-V 0.00457929302587443 -0.695810894560606 0.0159858956539616 2 NDRG1|NDRG1_PT346-R-V 0.000564971334011076 -0.915659253944444 0.00471628244044029 2