Clinical Features MRNA_CNMF MRNA_CHIERARCHICAL CN_CNMF METHLYATION_CNMF RPPA_CNMF RPPA_CHIERARCHICAL MRNASEQ_CNMF MRNASEQ_CHIERARCHICAL MIRSEQ_CNMF MIRSEQ_CHIERARCHICAL MIRSEQ_MATURE_CNMF MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL nCNV (%) nWild-Type Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q 1p gain 50 (8%) 565 0.20362 0.409 0.45352 0.678 0.04048 0.126 0.64416 0.837 0.01849 0.0693 0.01853 0.0693 0.97762 1 0.62692 0.824 0.38897 0.62 0.31507 0.539 0.19369 0.395 0.58885 0.793 1q gain 117 (19%) 498 0.73789 0.888 0.80643 0.93 0.01043 0.0448 0.30015 0.524 0.16118 0.346 0.0203 0.0743 0.91325 0.989 0.33938 0.569 0.17219 0.362 0.13789 0.307 0.56026 0.77 0.40884 0.639 2p gain 123 (20%) 492 0.02116 0.0765 0.00483 0.025 0.00163 0.0102 0.00116 0.00756 0.62026 0.818 0.56612 0.775 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.03243 0.106 0.00134 0.00856 0.98782 1 0.96936 1 2q gain 121 (20%) 494 0.01256 0.0519 0.00144 0.00908 5.9999e-05 0.000656 0.00036 0.00298 0.64917 0.841 0.8562 0.954 0.00029 0.00253 9.9999e-06 0.000139 0.093189 0.236 0.0082999 0.0378 0.93754 1 0.81696 0.936 3p gain 72 (12%) 543 0.01363 0.0553 0.077789 0.205 9.9999e-06 0.000139 0.21905 0.43 0.12146 0.283 0.02332 0.0817 0.90644 0.988 0.03002 0.0998 0.10667 0.262 0.43688 0.665 0.099699 0.249 0.27153 0.489 3q gain 98 (16%) 517 0.03369 0.108 0.00199 0.0121 9.9999e-06 0.000139 0.0327 0.106 0.12604 0.29 0.02008 0.0737 0.092829 0.236 0.0039 0.0208 0.04432 0.134 0.54785 0.76 0.02064 0.0752 0.050599 0.148 4p gain 20 (3%) 595 0.81465 0.936 0.56919 0.778 0.0070599 0.0334 0.21593 0.426 0.15387 0.334 0.17397 0.364 0.01113 0.0472 0.16198 0.346 0.5787 0.786 0.50772 0.727 0.67483 0.855 0.13168 0.299 4q gain 21 (3%) 594 0.22806 0.442 0.21286 0.421 0.02295 0.0809 0.67805 0.855 0.11468 0.272 0.51519 0.732 0.058449 0.167 0.2214 0.434 0.33079 0.557 0.3643 0.597 0.87903 0.968 1 1 5p gain 105 (17%) 510 0.49752 0.716 0.12909 0.295 4e-04 0.00323 0.91213 0.989 0.16476 0.35 0.13043 0.297 0.01332 0.0544 0.0328 0.106 0.75229 0.901 0.39213 0.624 0.45429 0.678 0.55694 0.769 5q gain 66 (11%) 549 0.78187 0.919 0.5955 0.797 0.00068999 0.00485 0.59715 0.798 0.73712 0.888 0.71447 0.876 0.12645 0.29 0.01313 0.0541 0.65112 0.842 0.00311 0.0175 0.99723 1 1 1 6p gain 124 (20%) 491 0.01484 0.0589 0.00048 0.00375 9.9999e-06 0.000139 0.183 0.378 0.85312 0.952 0.96651 1 0.38196 0.613 0.03534 0.113 0.45947 0.68 0.70995 0.872 0.0251 0.087 0.03357 0.108 6q gain 111 (18%) 504 0.15946 0.343 0.00109 0.0072 9.9999e-06 0.000139 0.19324 0.394 0.8268 0.94 0.74116 0.89 0.43504 0.665 0.1377 0.307 0.35691 0.589 0.89234 0.977 0.0092199 0.0405 0.04783 0.143 7p gain 349 (57%) 266 5e-04 0.00378 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.0084999 0.0385 0.0078599 0.0361 2e-05 0.000249 9.9999e-06 0.000139 0.0058299 0.0293 0.17896 0.372 0.02788 0.094 0.089019 0.229 7q gain 311 (51%) 304 0.00021 0.00193 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.00049 0.00377 0.11863 0.277 0.02637 0.0898 9.9999e-05 0.001 9.9999e-06 0.000139 0.0106 0.0453 0.19623 0.398 0.077289 0.205 0.43567 0.665 8p gain 170 (28%) 445 0.92425 0.994 0.53109 0.746 9.9999e-06 0.000139 0.86186 0.957 0.23209 0.444 0.42989 0.66 0.00332 0.0185 0.04781 0.143 0.19938 0.403 0.26702 0.483 0.39792 0.63 0.12215 0.283 8q gain 315 (51%) 300 0.32891 0.556 0.10836 0.264 9.9999e-06 0.000139 0.062829 0.176 0.059579 0.168 0.077419 0.205 0.00224 0.0134 0.02099 0.0762 0.29081 0.516 0.0096599 0.0419 0.10889 0.264 0.04404 0.134 9p gain 123 (20%) 492 0.53797 0.75 0.58627 0.79 0.00251 0.0146 0.81081 0.933 0.12805 0.293 0.26082 0.477 0.91987 0.992 0.38163 0.613 0.97802 1 0.92259 0.994 0.63016 0.825 0.78833 0.919 9q gain 101 (16%) 514 0.65712 0.845 0.833 0.94 0.054489 0.158 0.97041 1 0.070709 0.194 0.21157 0.419 0.94844 1 0.76199 0.908 0.6254 0.824 0.30598 0.532 0.93326 0.998 0.83335 0.94 10p gain 49 (8%) 566 0.11122 0.267 0.11065 0.266 0.00388 0.0208 0.7932 0.923 0.10614 0.262 0.04828 0.144 0.51781 0.733 0.81518 0.936 0.50874 0.728 0.30088 0.524 0.54185 0.754 0.4665 0.687 10q gain 29 (5%) 586 0.91158 0.989 0.25838 0.473 0.058399 0.167 0.071779 0.196 0.16941 0.358 0.70943 0.872 0.41976 0.647 0.59987 0.8 0.51915 0.734 0.65943 0.846 0.17876 0.372 0.955 1 11p gain 85 (14%) 530 0.0121 0.0505 0.0052999 0.0272 9.9999e-06 0.000139 5e-05 0.000566 0.65463 0.843 0.63282 0.827 0.00478 0.0249 0.00034 0.00286 0.33339 0.561 0.40603 0.639 0.7856 0.919 0.97213 1 11q gain 77 (13%) 538 0.01702 0.0656 0.00096999 0.00667 9.9999e-06 0.000139 5.9999e-05 0.000656 0.19533 0.397 0.37436 0.607 3e-05 0.000351 3e-05 0.000351 0.29988 0.524 0.060469 0.17 0.2989 0.523 0.17884 0.372 12p gain 127 (21%) 488 0.35483 0.587 0.36376 0.597 0.00469 0.0245 0.00269 0.0156 0.45892 0.68 0.23897 0.451 0.64113 0.834 0.01663 0.0644 0.41373 0.643 0.78639 0.919 0.56439 0.773 0.48472 0.707 12q gain 111 (18%) 504 0.25162 0.465 0.3501 0.581 0.00272 0.0157 0.00137 0.0087 0.42334 0.651 0.25509 0.469 0.4237 0.651 0.0062899 0.0306 0.23563 0.449 0.44433 0.667 0.65215 0.842 0.63885 0.834 13q gain 368 (60%) 247 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.23973 0.451 0.38124 0.613 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.00039 0.0032 0.43736 0.665 0.01441 0.0574 0.070939 0.194 14q gain 43 (7%) 572 0.73606 0.888 0.39957 0.631 0.01644 0.0639 0.79772 0.925 0.78937 0.919 0.82812 0.94 0.59564 0.797 0.60588 0.805 0.88061 0.968 0.89048 0.977 0.78226 0.919 0.34405 0.574 15q gain 15 (2%) 600 0.29837 0.523 0.15176 0.331 0.060849 0.171 0.54467 0.757 0.17351 0.364 0.20903 0.417 0.92739 0.995 0.92889 0.996 1 1 0.72816 0.885 NA NA NA NA 16p gain 147 (24%) 468 0.0060799 0.0301 0.00392 0.0208 9.9999e-06 0.000139 0.01173 0.0491 0.14261 0.314 0.66698 0.85 0.00054999 0.00407 2e-05 0.000249 0.49144 0.71 0.44242 0.666 0.22352 0.436 0.18285 0.378 16q gain 145 (24%) 470 0.0086099 0.0386 0.00381 0.0206 9.9999e-06 0.000139 0.0099099 0.0428 0.23066 0.443 0.47451 0.694 0.00106 0.00705 4e-05 0.000463 0.78559 0.919 0.4787 0.699 0.10738 0.263 0.12303 0.285 17p gain 38 (6%) 577 0.44195 0.666 0.16204 0.346 0.7562 0.904 0.96639 1 0.19986 0.403 1 1 0.19273 0.394 0.077769 0.205 0.16876 0.357 0.72027 0.879 0.074689 0.202 0.93903 1 17q gain 110 (18%) 505 0.01908 0.0706 0.0069999 0.0333 9.9999e-06 0.000139 0.00275 0.0157 0.24266 0.455 0.84051 0.943 2e-05 0.000249 2e-05 0.000249 0.0046 0.0242 0.04236 0.13 0.86398 0.958 0.27964 0.499 18p gain 33 (5%) 582 0.30926 0.534 0.37009 0.604 0.00168 0.0103 0.00061999 0.00449 0.60451 0.805 0.058279 0.167 0.0271 0.092 0.00060999 0.00445 0.39586 0.628 0.078489 0.207 0.75952 0.906 0.97687 1 18q gain 19 (3%) 596 0.03567 0.113 0.70325 0.868 0.01218 0.0506 0.0085999 0.0386 0.39564 0.628 0.0071299 0.0336 0.00297 0.0168 8.9999e-05 0.000922 0.092839 0.236 0.01545 0.0608 0.67164 0.853 0.83005 0.94 19p gain 104 (17%) 511 0.32827 0.556 0.01936 0.0713 9.9999e-06 0.000139 0.080039 0.21 0.15904 0.342 0.77174 0.914 0.25649 0.471 5.9999e-05 0.000656 0.04223 0.13 0.72854 0.885 0.51466 0.732 0.088389 0.228 19q gain 114 (19%) 501 0.04979 0.147 0.00377 0.0205 0.00021 0.00193 0.11582 0.274 0.03103 0.102 0.49372 0.712 0.40184 0.634 0.00098999 0.00676 0.2176 0.428 1 1 0.16559 0.351 0.085509 0.222 20p gain 352 (57%) 263 0.00024 0.00219 3e-05 0.000351 9.9999e-06 0.000139 0.00034 0.00286 0.02183 0.078 0.085649 0.222 0.0060099 0.03 9.9999e-06 0.000139 0.36965 0.604 0.10838 0.264 0.66698 0.85 0.10289 0.255 20q gain 465 (76%) 150 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.00325 0.0182 0.0053299 0.0272 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.01579 0.0617 5e-04 0.00378 0.00053999 0.00406 0.01905 0.0706 21q gain 34 (6%) 581 0.31276 0.536 0.2643 0.481 0.00054999 0.00407 0.48759 0.709 0.48611 0.708 0.2546 0.469 0.67935 0.855 0.10713 0.263 0.40704 0.639 0.96823 1 0.46147 0.681 0.74195 0.89 22q gain 23 (4%) 592 0.11737 0.277 0.13558 0.305 0.0096299 0.0419 0.31077 0.535 0.86052 0.957 0.69163 0.863 0.10967 0.264 0.27963 0.499 0.68828 0.861 0.91784 0.992 0.84159 0.943 1 1 xp gain 99 (16%) 516 0.03696 0.116 0.1094 0.264 6.9999e-05 0.000749 0.04989 0.147 0.31805 0.541 0.099489 0.249 0.30718 0.532 0.27887 0.499 0.22967 0.442 0.93265 0.998 0.86206 0.957 0.55882 0.769 xq gain 107 (17%) 508 0.14075 0.312 0.26482 0.481 0.00025 0.00226 0.30823 0.533 0.086809 0.225 0.055959 0.161 0.6871 0.86 0.37473 0.607 0.33895 0.569 0.9249 0.994 0.69836 0.868 0.87783 0.967 1p loss 138 (22%) 477 0.075159 0.202 0.02627 0.0898 9.9999e-06 0.000139 0.00134 0.00856 0.95066 1 0.89446 0.978 0.00146 0.00915 0.00016 0.00151 0.34668 0.576 0.067289 0.187 0.76519 0.909 0.31654 0.541 1q loss 79 (13%) 536 0.31087 0.535 0.29871 0.523 0.00015 0.00143 0.41497 0.644 0.86767 0.961 0.81682 0.936 7.9999e-05 0.000837 0.00066999 0.00478 0.7184 0.878 0.0067399 0.0324 0.16453 0.35 0.15533 0.336 2p loss 17 (3%) 598 1 1 0.61618 0.817 0.00049 0.00377 0.03134 0.103 0.34672 0.576 0.80623 0.93 0.058909 0.168 0.0077299 0.0357 0.096069 0.242 0.2293 0.442 NA NA NA NA 2q loss 14 (2%) 601 0.67737 0.855 0.2446 0.458 0.01541 0.0608 0.18569 0.381 0.25478 0.469 0.37293 0.607 0.11204 0.267 0.0055699 0.0283 0.091299 0.233 0.02164 0.0777 NA NA NA NA 3p loss 70 (11%) 545 0.36059 0.594 0.83682 0.94 0.48934 0.709 0.6677 0.85 0.53483 0.749 0.62776 0.824 0.43296 0.663 0.76524 0.909 0.77341 0.915 0.3978 0.63 0.38442 0.615 0.35308 0.585 3q loss 45 (7%) 570 0.24834 0.462 0.24645 0.46 0.90441 0.987 0.61742 0.817 0.32072 0.545 0.95691 1 0.70474 0.869 0.23204 0.444 0.57589 0.785 0.34123 0.571 0.65413 0.843 0.78617 0.919 4p loss 198 (32%) 417 0.02234 0.0791 0.0076699 0.0356 9.9999e-06 0.000139 0.00115 0.00754 0.474 0.694 0.2962 0.523 0.00066999 0.00478 8.9999e-05 0.000922 0.081089 0.212 0.44161 0.666 0.19939 0.403 0.91846 0.992 4q loss 191 (31%) 424 0.04214 0.13 0.074329 0.202 9.9999e-06 0.000139 0.00014 0.00135 0.75697 0.904 0.59092 0.794 0.00354 0.0195 7.9999e-05 0.000837 0.10503 0.26 0.13553 0.305 0.03951 0.123 0.50189 0.721 5p loss 86 (14%) 529 0.37713 0.609 0.6963 0.866 0.00036 0.00298 0.071889 0.196 0.74614 0.894 0.64056 0.834 0.73601 0.888 0.00339 0.0187 0.95613 1 0.26407 0.481 0.45382 0.678 0.94303 1 5q loss 121 (20%) 494 0.0090299 0.0398 0.02844 0.0955 9.9999e-06 0.000139 0.1096 0.264 0.14386 0.316 0.10101 0.251 0.03111 0.102 0.00082999 0.00575 0.53675 0.749 0.6629 0.849 0.68975 0.861 0.67515 0.855 6p loss 46 (7%) 569 0.55624 0.769 0.02188 0.078 0.52142 0.736 0.66979 0.852 0.068519 0.189 0.075999 0.203 0.5928 0.796 0.03329 0.107 0.45808 0.68 0.93838 1 0.53178 0.746 0.77069 0.914 6q loss 69 (11%) 546 0.44169 0.666 0.31194 0.536 0.31744 0.541 0.5802 0.786 0.22876 0.442 0.1546 0.335 0.10054 0.25 0.059519 0.168 0.51446 0.732 0.51351 0.732 0.13546 0.305 0.53064 0.746 7p loss 3 (0%) 612 NA NA NA NA 0.61849 0.817 NA NA NA NA NA NA 0.62936 0.825 0.15299 0.333 NA NA NA NA NA NA NA NA 7q loss 5 (1%) 610 NA NA NA NA 0.62723 0.824 1 1 1 1 0.73853 0.888 0.87456 0.965 0.70134 0.868 1 1 0.22209 0.434 NA NA NA NA 8p loss 218 (35%) 397 0.0088899 0.0396 0.0058099 0.0293 9.9999e-06 0.000139 0.00055999 0.00411 0.44185 0.666 0.02612 0.0896 0.0063999 0.0309 9.9999e-06 0.000139 0.66317 0.849 0.23952 0.451 0.00247 0.0146 0.47134 0.692 8q loss 37 (6%) 578 0.91029 0.989 0.78068 0.919 0.00429 0.0227 0.68074 0.855 0.95559 1 0.22689 0.44 0.57999 0.786 0.6455 0.838 0.27045 0.488 0.58392 0.789 0.051419 0.15 0.03899 0.122 9p loss 77 (13%) 538 0.48927 0.709 0.20197 0.406 0.00082999 0.00575 0.00207 0.0125 0.84281 0.943 0.47071 0.692 0.00029 0.00253 0.01733 0.0664 0.21089 0.418 0.11232 0.267 0.67578 0.855 0.71663 0.877 9q loss 78 (13%) 537 0.04857 0.144 0.01322 0.0542 0.00043 0.00338 0.00026 0.0023 0.90174 0.985 0.20813 0.416 0.00012 0.00118 0.00106 0.00705 0.43861 0.666 0.01092 0.0465 0.79824 0.925 0.32721 0.555 10p loss 102 (17%) 513 0.01135 0.0477 0.1849 0.381 9.9999e-06 0.000139 0.02485 0.0864 0.0175 0.0667 0.40878 0.639 0.01124 0.0475 0.00034 0.00286 0.20958 0.417 0.36146 0.595 0.056969 0.164 0.2471 0.46 10q loss 112 (18%) 503 0.02301 0.0809 0.25149 0.465 9.9999e-06 0.000139 0.0063999 0.0309 0.0184 0.0693 0.45998 0.68 0.0025 0.0146 2e-05 0.000249 0.55489 0.768 0.44486 0.667 0.04665 0.141 0.26647 0.483 11p loss 75 (12%) 540 0.95464 1 1 1 0.02152 0.0776 0.18769 0.385 0.49766 0.716 0.60638 0.805 0.53052 0.746 0.12455 0.288 0.91291 0.989 0.23333 0.446 0.65844 0.846 0.85256 0.952 11q loss 93 (15%) 522 0.84553 0.945 0.68497 0.859 0.02746 0.0929 0.053279 0.155 0.95702 1 0.70193 0.868 0.81079 0.933 0.17069 0.36 0.80525 0.93 0.41628 0.645 0.27762 0.498 0.28585 0.509 12p loss 71 (12%) 544 0.066669 0.185 0.01431 0.0572 9.9999e-06 0.000139 0.090439 0.232 0.87449 0.965 0.57914 0.786 0.094929 0.24 0.00042 0.00333 0.82047 0.937 0.82013 0.937 0.28032 0.5 0.26122 0.477 12q loss 71 (12%) 544 0.12495 0.288 0.02583 0.0892 9.9999e-06 0.000139 0.13975 0.31 0.618 0.817 0.83603 0.94 0.065579 0.183 3e-05 0.000351 0.22306 0.435 0.87221 0.964 0.41793 0.646 0.41121 0.64 13q loss 20 (3%) 595 0.29821 0.523 0.01575 0.0617 0.01395 0.0563 0.67939 0.855 0.29633 0.523 0.0068299 0.0326 0.7013 0.868 0.14107 0.312 0.73336 0.888 0.78711 0.919 0.01417 0.0569 0.40893 0.639 14q loss 207 (34%) 408 0.00026 0.0023 6.9999e-05 0.000749 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.00277 0.0158 0.1818 0.377 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.13498 0.305 0.11858 0.277 0.03649 0.115 0.04441 0.134 15q loss 229 (37%) 386 0.00013 0.00127 0.00165 0.0102 9.9999e-06 0.000139 0.00068999 0.00485 0.239 0.451 0.77836 0.918 2e-05 0.000249 9.9999e-06 0.000139 0.81947 0.937 0.68202 0.856 0.080759 0.211 0.20932 0.417 16p loss 41 (7%) 574 0.075129 0.202 0.37165 0.605 0.33015 0.557 0.91211 0.989 0.34358 0.574 0.23969 0.451 0.72862 0.885 0.29054 0.516 0.83361 0.94 0.23616 0.449 0.307 0.532 0.95261 1 16q loss 44 (7%) 571 0.02611 0.0896 0.58571 0.79 0.0086399 0.0386 0.73702 0.888 0.24009 0.451 0.23863 0.451 0.78437 0.919 0.56406 0.773 0.57577 0.785 0.55308 0.767 0.27486 0.494 0.8685 0.961 17p loss 341 (55%) 274 2e-05 0.000249 5e-05 0.000566 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.12029 0.28 0.0079899 0.0366 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.03564 0.113 0.02361 0.0824 0.02859 0.0957 0.38318 0.614 17q loss 96 (16%) 519 0.89154 0.977 0.59994 0.8 0.00131 0.00848 0.51191 0.731 0.83613 0.94 0.01831 0.0693 0.83002 0.94 0.02905 0.0969 0.73168 0.888 0.51713 0.733 0.71508 0.876 0.9611 1 18p loss 379 (62%) 236 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.03067 0.102 0.04862 0.144 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.0073399 0.0344 0.0090199 0.0398 0.00011 0.00109 0.00105 0.00705 18q loss 409 (67%) 206 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.04269 0.131 0.097009 0.244 9.9999e-06 0.000139 9.9999e-06 0.000139 0.00102 0.00692 0.0060499 0.0301 9.9999e-05 0.001 4e-04 0.00323 19p loss 64 (10%) 551 0.37526 0.607 0.47463 0.694 0.00042 0.00333 0.45923 0.68 0.69424 0.865 0.24862 0.462 0.04971 0.147 0.04389 0.134 0.15593 0.336 0.0062299 0.0305 0.29179 0.516 0.0095499 0.0418 19q loss 55 (9%) 560 0.66484 0.85 0.14689 0.321 0.00179 0.0109 0.70775 0.872 0.11868 0.277 0.43351 0.663 0.1114 0.267 0.091309 0.233 0.22586 0.439 0.075579 0.203 0.72145 0.88 0.052429 0.153 20p loss 68 (11%) 547 0.11176 0.267 0.01888 0.0704 3e-05 0.000351 0.00222 0.0133 0.83121 0.94 0.94882 1 0.1424 0.314 0.00021 0.00193 0.83578 0.94 0.38706 0.618 0.074549 0.202 0.00231 0.0137 20q loss 6 (1%) 609 NA NA NA NA 0.58149 0.787 0.82517 0.94 0.04133 0.128 1 1 0.207 0.415 0.64621 0.838 0.40813 0.639 0.53221 0.746 NA NA NA NA 21q loss 194 (32%) 421 0.01707 0.0656 0.022 0.0782 9.9999e-06 0.000139 0.01366 0.0553 0.70318 0.868 0.53666 0.749 2e-05 0.000249 0.00367 0.0201 0.1374 0.307 0.14592 0.32 0.80598 0.93 0.18501 0.381 22q loss 203 (33%) 412 0.0051299 0.0264 0.00034 0.00286 9.9999e-06 0.000139 0.11754 0.277 0.77722 0.918 0.79831 0.925 0.0178 0.0676 9.9999e-06 0.000139 0.97731 1 0.069299 0.191 0.46047 0.68 0.41844 0.646 xp loss 91 (15%) 524 0.92451 0.994 0.36673 0.6 0.076229 0.203 0.41108 0.64 0.0062299 0.0305 0.13744 0.307 0.88896 0.976 0.95158 1 0.099169 0.249 0.55881 0.769 0.5037 0.723 0.03373 0.108 xq loss 80 (13%) 535 0.9558 1 0.77071 0.914 0.13151 0.299 0.03272 0.106 0.066539 0.185 0.49149 0.71 0.44208 0.666 0.37746 0.609 0.04867 0.144 0.82909 0.94 0.45674 0.68 0.0076599 0.0356