Hybridization REF p difference q subclass Composite Element REF p difference q subclass MYH11|MYH11-R-V 0.00197278077441858 1.65484184241071 0.0473467385860459 1 CAV1|CAVEOLIN-1-R-V 0.00158394181613409 0.694482593761905 0.043445261242535 1 YAP1|YAP_PS127-R-E 0.0189765254383157 0.657654866077381 0.125637685660573 1 FN1|FIBRONECTIN-R-V 0.0107136594767714 0.620256580690476 0.093501028160914 1 CASP7|CASPASE-7_CLEAVEDD198-R-C 0.0144858658648197 0.513927250964286 0.111251449841815 1 YAP1|YAP-R-E 0.00575915762913222 0.404496990166667 0.0789827331995276 1 HSPA1A|HSP70-R-C 0.0232330800682816 0.360251045029762 0.139147011773848 1 MYH9|MYOSIN-IIA_PS1943-R-V 0.004078811216402 0.307361764232143 0.065260979462432 1 STAT3|STAT3_PY705-R-V 0.0445078337383818 0.298988829315476 0.189235750752241 1 TGM2|TRANSGLUTAMINASE-M-V 0.0133408420924635 0.286708257791667 0.106726736739708 1 PEA15|PEA15-R-V 0.000428664456986965 0.242030783291667 0.0205758939353743 1 BCL2L1|BCL-XL-R-V 0.0283436803750214 0.227061266660714 0.145154456029895 1 BECN1|BECLIN-G-C 0.0015064797768327 0.220601047541667 0.043445261242535 1 WWTR1|TAZ-R-V 0.0495995408239782 0.195190920190476 0.20196524118139 1 STK11|LKB1-M-E 0.0100660774248463 0.184713164767857 0.093501028160914 1 NRAS|N-RAS-M-V 0.0379030669924936 0.183948522613095 0.16539520142179 1 FOXO3|FOXO3A-R-C 0.000753971750749782 0.159172612351191 0.0289525152287916 1 ACVRL1|ACVRL1-R-C 0.0246406166682855 0.140100549071429 0.139147011773848 1 ERRFI1|MIG-6-M-V 0.00333948675461979 0.136564455130952 0.0582892233533636 1 YWHAB|14-3-3_BETA-R-V 0.0294844988810725 0.131919793696429 0.145154456029895 1 MRE11A|MRE11-R-C 0.0453377319510577 0.090495805827381 0.189235750752241 1 EGFR|EGFR_PY1068-R-C 0.025770415413239 -0.160555621339286 0.141369135981197 1 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.0333637062308933 -0.186838122571429 0.156239795032476 1 MYC|C-MYC-R-C 0.00719919350892426 -0.23112664014881 0.0813085384537328 1 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.022132410487491 -0.235319488458333 0.139147011773848 1 SMAD1|SMAD1-R-V 0.0226328091177509 -0.24694104260119 0.139147011773848 1 ERCC1|ERCC1-M-V 0.00675137246134017 -0.314090244380952 0.081016469536082 1 PRKCD|PKC-DELTA_PS664-R-V 0.036261450966356 -0.321320806565476 0.16539520142179 1 TSC2|TUBERIN_PT1462-R-V 3.33613269842869e-05 -0.354338159136905 0.00640537478098308 1 LCK|LCK-R-V 0.0091968809717811 -0.354932995708333 0.0929369024516827 1 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.0103571322869802 -0.363248541220238 0.093501028160914 1 BAP1|BAP1-C-4-M-E 0.0243766246887947 -0.372568451244048 0.139147011773848 1 TP53BP1|53BP1-R-E 0.00251040676811151 -0.37505192689881 0.05255266994161 1 PKC|PKC-PAN_BETAII_PS660-R-V 0.0305957917915971 -0.423142176375 0.146859800599666 1 CHEK1|CHK1_PS345-R-C 0.00273711822612552 -0.431700607482143 0.05255266994161 1 BRAF|B-RAF-M-C 0.00512289509169356 -0.438304494273809 0.0756612198157818 1 RBM15|RBM15-R-V 0.000412374151481178 -0.500729640011905 0.0205758939353743 1 MSH6|MSH6-R-C 0.0177619143999206 -0.539428970553571 0.125637685660573 1 NFKB1|NF-KB-P65_PS536-R-C 0.0165878389400109 -0.55147727527381 0.122494810633927 1 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.0378015805456466 -0.551679579988095 0.16539520142179 1 TSC2|TUBERIN-R-E 0.00620360772954251 -0.563174998988095 0.0794061789381441 1 RB1|RB_PS807_S811-R-V 0.0276714266557306 -0.630523341309524 0.145154456029895 1 BCL2|BCL-2-M-V 0.000255481913890638 -0.683408107946429 0.0205758939353743 1 PDCD4|PDCD4-R-C 0.0293992339768721 -0.685554756125 0.145154456029895 1 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 0.012868423597452 -0.687364592297619 0.106726736739708 1 EIF4G1|EIF4G-R-C 0.00829450775299509 -0.803241871857143 0.0884747493652809 1 SYK|SYK-M-V 0.0186914775821962 -0.934994546357143 0.125637685660573 1 PDCD4|PDCD4-R-C 2.40883556671835e-06 1.09053005754318 0.000115624107202481 2 SRC|SRC_PY416-R-C 0.00078124548559765 0.891473255602273 0.00631783746578421 2 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.00011867470773424 0.858169163770454 0.00207141308045219 2 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 2.18083518763746e-05 0.829271915006818 0.00052340044503299 2 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9-R-V 1.12327677965906e-05 0.794035062265909 0.000359448569490899 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473-R-V 0.000202112821069934 0.745907714170455 0.00258704410969516 2 GSK3A GSK3B|GSK3_PS9-R-V 6.08378055537396e-05 0.694173634243182 0.00129787318514644 2 SRC|SRC_PY527-R-V 0.00213722784595719 0.655022299552273 0.0132370240781865 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PT37_T46-R-V 0.000197634360151944 0.600468326429545 0.00258704410969516 2 PKC|PKC-PAN_BETAII_PS660-R-V 1.24013114374362e-06 0.579926452252273 0.000112442456635342 2 RB1|RB_PS807_S811-R-V 0.0171861252595632 0.550908297065909 0.0622591707516252 2 RPS6|S6_PS240_S244-R-V 0.00183918452797381 0.508526790470455 0.0117707809790324 2 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 3.7577292093298e-10 0.499350216556818 7.21484008191322e-08 2 TSC2|TUBERIN_PT1462-R-V 0.000185487424085957 0.419324100752273 0.00258704410969516 2 PRKCA |PKC-ALPHA_PS657-R-C 0.00639997996973888 0.406132042675 0.0307199038547466 2 ATM|ATM-R-E 0.0164830843907925 0.366837118225 0.06086061928908 2 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 0.0470124703149114 0.357051149302273 0.136763550007015 2 PRKCD|PKC-DELTA_PS664-R-V 0.000789729683223026 0.347260606052273 0.00631783746578421 2 BAD|BAD_PS112-R-V 0.000380255053275441 0.307247122493182 0.00384257738046761 2 EGFR|EGFR_PY1068-R-C 0.00689182447360527 0.301962313261364 0.0322739097300539 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PT308-R-V 0.0338964138026724 0.269529097561364 0.107772896698405 2 CHEK1|CHK1_PS345-R-C 0.00729946093789732 0.222201768902273 0.0333689642875306 2 PRKCA |PKC-ALPHA-M-V 0.0348729369234956 0.219959083643182 0.107993611117922 2 ARAF|A-RAF_PS299-R-C 0.000700655195923008 0.218535404484091 0.0061148089826008 2 FRAP1|MTOR-R-V 0.0125307726509261 0.174515201120455 0.0501230906037044 2 FOXO3|FOXO3A_PS318_S321-R-C 0.00248175779649094 0.172172094438636 0.0142118050309303 2 INPP4B|INPP4B-R-V 0.0022799391722701 0.164000603356818 0.0136796350336206 2 YBX1|YB-1_PS102-R-V 0.00759905410415518 0.142424984547727 0.0339306601859952 2 AKT1S1|PRAS40_PT246-R-V 0.00309908605640333 0.141318843884091 0.016230042979957 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.0241095486230941 0.126479576106818 0.0841642424660739 2 JUN|C-JUN_PS73-R-V 0.0120561394488041 0.106739145770455 0.0492506122163912 2 SHC1|SHC_PY317-R-E 0.042120747946058 0.094999035225 0.124418209317587 2 MAP2K1|MEK1_PS217_S221-R-V 0.0479701459532857 -0.0762582781886364 0.137466686910908 2 PGR|PR-R-V 0.0164163428248385 -0.0764369258840909 0.06086061928908 2 MET|C-MET_PY1235-R-V 0.0275406076026903 -0.0774559656840909 0.0927683624511673 2 MRE11A|MRE11-R-C 0.0331977376410883 -0.0843202116931818 0.107772896698405 2 C12ORF5|TIGAR-R-V 0.0285789861514162 -0.117501545297727 0.0946062989839985 2 NRAS|N-RAS-M-V 0.0039024797702385 -0.133229015625 0.0197177925233103 2 NOTCH1|NOTCH1-R-V 0.023048341464562 -0.134426994679545 0.0819496585406649 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PT70-R-V 0.00478357433143031 -0.135464004865909 0.0235499044008877 2 IRS1|IRS1-R-V 0.0012803873693002 -0.137030638179545 0.00910497684835698 2 ERBB2|HER2_PY1248-R-C 0.000687052330242879 -0.138328951138636 0.0061148089826008 2 RAB11A RAB11B|RAB11-R-E 0.000940915402331905 -0.140807942884091 0.00722623028990903 2 ERRFI1|MIG-6-M-V 0.000241006659146267 -0.158367747175 0.00264406160746994 2 WWTR1|TAZ-R-V 0.000469188217542623 -0.159518647456818 0.00450420688840918 2 STK11|LKB1-M-E 1.72423203349169e-05 -0.162721758852273 0.000472932214900578 2 BID|BID-R-C 0.00166091265380377 -0.163059051370455 0.0113891153403687 2 NRG1|HEREGULIN-R-V 0.00312766453259588 -0.165016525652273 0.016230042979957 2 BAX|BAX-R-V 0.0368414777126679 -0.173784366425 0.112278789219559 2 YAP1|YAP-R-E 0.00820905007610271 -0.177803546888636 0.0358213094229936 2 XBP1|XBP1-G-C 0.0498904522585362 -0.188399021652273 0.14086715931822 2 COL6A1|COLLAGEN_VI-R-V 0.00985464651618036 -0.190756694788636 0.0411324376327528 2 EEF2|EEF2-R-C 0.00251667380756057 -0.232519504120455 0.0142118050309303 2 PCNA|PCNA-M-C 0.00022391607241523 -0.239224971193182 0.00264406160746994 2 STMN1|STATHMIN-R-V 3.79390114445912e-06 -0.267271009443182 0.00014568580394723 2 EIF4EBP1|4E-BP1-R-V 0.00117111477830321 -0.268268352343182 0.00864823220900832 2 TUBA1B|ACETYL-A-TUBULIN(LYS40)-R-C 0.0389937212411064 -0.290339058706818 0.116981163723319 2 BCL2L1|BCL-XL-R-V 0.000247880775700307 -0.292235309588636 0.00264406160746994 2 CHEK1|CHK1-M-C 0.0274665720136039 -0.361559392815909 0.0927683624511673 2 SQSTM1|P62-LCK-LIGAND-M-C 0.00896188063513115 -0.375343106379545 0.0382373573765596 2 YBX1|YB-1-R-V 1.75691338492722e-06 -0.431999834852273 0.000112442456635342 2 GAPDH|GAPDH-M-C 0.00178431434313884 -0.465068163525 0.0117707809790324 2 CAV1|CAVEOLIN-1-R-V 0.0149894779055293 -0.482019330020455 0.0587342807726862 2 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.0342403473885556 -0.499116627956818 0.107772896698405 2 TFRC|TFRC-R-V 0.00303367644557451 -0.654291962306818 0.016230042979957 2 MYH11|MYH11-R-V 0.015299593484961 -0.811040840488636 0.0587504389822502 2 SERPINE1|PAI-1-M-E 7.74697241021256e-05 -1.10264785251591 0.00148741870276081 2 FN1|FIBRONECTIN-R-V 0.000168973516469562 -1.142177032775 0.00258704410969516 2 SERPINE1|PAI-1-M-E 0.00306854539711963 0.944908028143162 0.0420829083033549 3 MS4A1|CD20-R-C 0.00105088524369705 0.896463435228632 0.0201769966789834 3 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.000678105721564122 0.865332596532051 0.0176799960708522 3 MSH6|MSH6-R-C 1.33635191426192e-05 0.669355455767094 0.00128289783769144 3 FN1|FIBRONECTIN-R-V 0.0147247419738418 0.628529237839744 0.0883781600870946 3 CHEK1|CHK1-M-C 0.000655156246979074 0.597424895040598 0.0176799960708522 3 PARP1|PARP1-R-V 0.00697831373246015 0.554222174151709 0.0553965115388383 3 BCL2L11|BIM-R-V 0.0239436145072211 0.527973269933761 0.114929349634661 3 EIF4G1|EIF4G-R-C 0.000670080020276696 0.514820102758547 0.0176799960708522 3 GAPDH|GAPDH-M-C 0.00443903207035397 0.502639102403846 0.0448575872372612 3 SQSTM1|P62-LCK-LIGAND-M-C 0.000477558306916505 0.49200964942094 0.0176799960708522 3 TFRC|TFRC-R-V 0.0354787804998738 0.410721948963675 0.117868131684546 3 SYK|SYK-M-V 0.0411823709585227 0.39808606749359 0.12753250361349 3 ASNS|ASNS-R-V 0.00807707653512754 0.388163717745726 0.0553965115388383 3 BRAF|B-RAF-M-C 0.00498348565949555 0.312643431151709 0.0478414623311573 3 PCNA|PCNA-M-C 0.000109636298967165 0.289292198378205 0.00701672313389856 3 TSC2|TUBERIN-R-E 0.0133495219486595 0.280865767344017 0.0854369404714208 3 YBX1|YB-1-R-V 0.00606474967358854 0.277823048450855 0.0553965115388383 3 CCNE2|CYCLIN_E2-R-C 0.00353582447608805 0.274721370891026 0.0448575872372612 3 RBM15|RBM15-R-V 0.00807865793274725 0.272174613403846 0.0553965115388383 3 SMAD1|SMAD1-R-V 0.0331854385913779 0.262545341643162 0.117868131684546 3 FOXM1|FOXM1-R-V 0.0266622725750256 0.259790320519231 0.117868131684546 3 EIF4EBP1|4E-BP1-R-V 0.00689380268565733 0.251025733151709 0.0553965115388383 3 TP53BP1|53BP1-R-E 0.0296241785394565 0.246409706775641 0.117868131684546 3 XRCC5|KU80-R-C 0.0304611325459054 0.236792573779915 0.117868131684546 3 EEF2|EEF2-R-C 0.0293300590086294 0.215762901168803 0.117868131684546 3 TSC1|TSC1-R-C 0.0166076843060055 0.214711338856838 0.088574316298696 3 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.0455880844560594 0.199273795912393 0.138935114532752 3 BAP1|BAP1-C-4-M-E 0.0156593864319832 0.197596821198718 0.0884294763217875 3 MSH2|MSH2-M-V 0.0151969416299976 0.189044088698718 0.0884185694836224 3 NOTCH1|NOTCH1-R-V 0.0249301464027151 0.163187037532051 0.116746051446861 3 SMAD3|SMAD3-R-V 0.0181410412099682 0.15185599426282 0.0916599976924709 3 AR|AR-R-V 0.0333300596816702 0.136201821523504 0.117868131684546 3 EIF4E|EIF4E-R-V 0.0316376923231381 0.119830301202991 0.117868131684546 3 ADAR|ADAR1-M-V 0.00764350028138306 0.11038034833547 0.0553965115388383 3 PGR|PR-R-V 0.00254147642444214 0.108122692416667 0.0375356518071455 3 EGFR|EGFR_PY1173-R-V 0.0469791281704923 0.100063264519231 0.139506131932261 3 ARHI|ARHI-M-E 0.004185181053409 -0.0800627987542735 0.0448575872372612 3 COPS5|JAB1-M-C 0.00377953544121679 -0.102153380801282 0.0448575872372612 3 CTNNB1|ALPHA-CATENIN-M-V 0.0326300484302519 -0.110925026254274 0.117868131684546 3 YWHAE|14-3-3_EPSILON-M-C 0.0472286384145675 -0.126838980057692 0.139506131932261 3 PEA15|PEA15-R-V 0.0330490008055482 -0.135488997215812 0.117868131684546 3 TGM2|TRANSGLUTAMINASE-M-V 0.0279203928848054 -0.14760430332265 0.117868131684546 3 MAPK1|ERK2-R-E 0.00646651632172394 -0.148449124284188 0.0553965115388383 3 ARAF|A-RAF_PS299-R-C 0.00423137642372552 -0.149400950741453 0.0448575872372612 3 AKT1 AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.0147296933478491 -0.166442338275641 0.0883781600870946 3 EGFR|EGFR_PY1068-R-C 0.0300146516244619 -0.168625489455128 0.117868131684546 3 ESR1|ER-ALPHA-R-V 0.002531042315822 -0.181171096485043 0.0375356518071455 3 ANXA1|ANNEXIN_1-M-E 0.035116036269249 -0.184241644976496 0.117868131684546 3 GATA3|GATA3-M-V 0.0100009947057988 -0.186979227318376 0.0662134821901162 3 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.0319360548334459 -0.208680738108974 0.117868131684546 3 INPP4B|INPP4B-R-V 8.40157078309095e-06 -0.218190297856838 0.00128289783769144 3 MYH9|MYOSIN-IIA_PS1943-R-V 0.0226320097643094 -0.221280885130342 0.111419124993523 3 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PT308-R-V 0.000933192567104589 -0.342879420779915 0.0199081080982312 3 RPS6|S6_PS240_S244-R-V 0.0313502685578377 -0.370329562502137 0.117868131684546 3 YAP1|YAP_PS127-R-E 0.0162360604312011 -0.371895585143162 0.088574316298696 3 EIF4EBP1|4E-BP1_PT37_T46-R-V 0.0362198946322302 -0.406833197865385 0.117868131684546 3 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 0.0374582638487198 -0.45397480867735 0.119866444315903 3 CDH1|E-CADHERIN-R-V 0.00789279078326348 -0.475032244288461 0.0553965115388383 3 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9-R-V 0.0180773888330845 -0.47507660125 0.0916599976924709 3 SRC|SRC_PY416-R-C 0.0382551696265301 -0.493024961942308 0.120409714234324 3 PDCD4|PDCD4-R-C 0.0360741420975138 -0.533091511241453 0.117868131684546 3 CDKN1A|P21-R-V 0.0354880317481387 -0.565533284805556 0.117868131684546 3 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473-R-V 0.000736666502952174 -0.612684541668803 0.0176799960708522 3 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.00171971847714186 -0.677999712826923 0.0300169043282943 3