This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.
Testing the association between mutation status of 188 genes and 14 clinical features across 136 patients, one significant finding detected with Q value < 0.25.
-
MIPEP mutation correlated to 'Time to Death'.
Clinical Features |
Time to Death |
YEARS TO BIRTH |
NEOPLASM DISEASESTAGE |
PATHOLOGY T STAGE |
PATHOLOGY N STAGE |
PATHOLOGY M STAGE |
GENDER |
HISTOLOGICAL TYPE |
NUMBER PACK YEARS SMOKED |
YEAR OF TOBACCO SMOKING ONSET |
COMPLETENESS OF RESECTION |
NUMBER OF LYMPH NODES |
RACE | ETHNICITY | ||
nMutated (%) | nWild-Type | logrank test | Wilcoxon-test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Wilcoxon-test | Wilcoxon-test | Fisher's exact test | Wilcoxon-test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | |
MIPEP | 3 (2%) | 133 |
7.63e-05 (0.201) |
0.9 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.33 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
KRAS | 114 (84%) | 22 |
0.205 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.816 (1.00) |
0.0228 (1.00) |
0.968 (1.00) |
0.663 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.981 (1.00) |
0.0581 (1.00) |
1 (1.00) |
TP53 | 91 (67%) | 45 |
0.073 (1.00) |
0.431 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.438 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.569 (1.00) |
0.59 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.826 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.413 (1.00) |
1 (1.00) |
JMY | 51 (38%) | 85 |
0.557 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.34 (1.00) |
0.208 (1.00) |
0.835 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.18 (1.00) |
1 (1.00) |
RIOK1 | 50 (37%) | 86 |
0.642 (1.00) |
0.559 (1.00) |
0.946 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.298 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0326 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.841 (1.00) |
1 (1.00) |
LCE2A | 43 (32%) | 93 |
0.304 (1.00) |
0.0718 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.828 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
0.882 (1.00) |
0.536 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.553 (1.00) |
C1QB | 33 (24%) | 103 |
0.288 (1.00) |
0.0972 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.588 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.236 (1.00) |
1 (1.00) |
0.834 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.69 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.0484 (1.00) |
0.57 (1.00) |
CDKN2A | 28 (21%) | 108 |
0.303 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.166 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0238 (1.00) |
1 (1.00) |
0.526 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.83 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.799 (1.00) |
0.0171 (1.00) |
0.543 (1.00) |
1 (1.00) |
AEBP1 | 25 (18%) | 111 |
0.592 (1.00) |
0.987 (1.00) |
0.88 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.464 (1.00) |
0.511 (1.00) |
0.302 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.846 (1.00) |
0.519 (1.00) |
0.717 (1.00) |
1 (1.00) |
RBM47 | 25 (18%) | 111 |
0.979 (1.00) |
0.816 (1.00) |
0.714 (1.00) |
1 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.0476 (1.00) |
1 (1.00) |
0.384 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.846 (1.00) |
0.858 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.502 (1.00) |
ANKRD36 | 23 (17%) | 113 |
0.848 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.0373 (1.00) |
1 (1.00) |
0.423 (1.00) |
0.0594 (1.00) |
0.823 (1.00) |
1 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.717 (1.00) |
1 (1.00) |
RFX1 | 23 (17%) | 113 |
0.281 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.687 (1.00) |
0.567 (1.00) |
1 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.261 (1.00) |
1 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.361 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
TYRO3 | 13 (10%) | 123 |
0.831 (1.00) |
0.0217 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.33 (1.00) |
0.771 (1.00) |
1 (1.00) |
0.542 (1.00) |
0.12 (1.00) |
0.577 (1.00) |
0.299 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
SMAD4 | 28 (21%) | 108 |
0.752 (1.00) |
0.857 (1.00) |
0.421 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
0.494 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.155 (1.00) |
0.0459 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.52 (1.00) |
GPR6 | 12 (9%) | 124 |
0.899 (1.00) |
0.58 (1.00) |
0.891 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.141 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.531 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.21 (1.00) |
LZTS1 | 8 (6%) | 128 |
0.209 (1.00) |
0.595 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.68 (1.00) |
1 (1.00) |
0.727 (1.00) |
1 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.364 (1.00) |
0.362 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NCOA3 | 13 (10%) | 123 |
0.892 (1.00) |
0.839 (1.00) |
0.302 (1.00) |
0.615 (1.00) |
0.185 (1.00) |
1 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.082 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.0421 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.234 (1.00) |
SIK3 | 12 (9%) | 124 |
0.837 (1.00) |
0.768 (1.00) |
0.676 (1.00) |
1 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
0.546 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.32 (1.00) |
0.444 (1.00) |
0.00455 (1.00) |
1 (1.00) |
ZMIZ2 | 12 (9%) | 124 |
0.529 (1.00) |
0.839 (1.00) |
0.367 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.731 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.38 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.0207 (1.00) |
1 (1.00) |
0.678 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
IRS4 | 14 (10%) | 122 |
0.351 (1.00) |
0.841 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0432 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
0.164 (1.00) |
1 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.857 (1.00) |
0.0983 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.303 (1.00) |
|
ESPN | 5 (4%) | 131 |
0.303 (1.00) |
0.247 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
1 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.856 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ATP2C1 | 8 (6%) | 128 |
0.182 (1.00) |
1 (1.00) |
0.345 (1.00) |
1 (1.00) |
0.198 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.727 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.616 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
FNDC1 | 13 (10%) | 123 |
0.222 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.735 (1.00) |
1 (1.00) |
0.732 (1.00) |
1 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.674 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.577 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
TMEM91 | 6 (4%) | 130 |
0.544 (1.00) |
0.105 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.411 (1.00) |
1 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.0347 (1.00) |
1 (1.00) |
0.974 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
SHROOM4 | 11 (8%) | 125 |
0.749 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.687 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.72 (1.00) |
1 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.662 (1.00) |
1 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.209 (1.00) |
0.257 (1.00) |
||
PABPC1 | 9 (7%) | 127 |
0.249 (1.00) |
0.739 (1.00) |
0.224 (1.00) |
0.715 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.256 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.946 (1.00) |
0.152 (1.00) |
0.134 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OGFOD1 | 4 (3%) | 132 |
0.356 (1.00) |
0.519 (1.00) |
0.0253 (1.00) |
0.182 (1.00) |
0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.197 (1.00) |
1 (1.00) |
||
DCP1B | 7 (5%) | 129 |
0.906 (1.00) |
0.894 (1.00) |
0.845 (1.00) |
1 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0469 (1.00) |
1 (1.00) |
0.765 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.0465 (1.00) |
0.185 (1.00) |
||
RBMX | 5 (4%) | 131 |
0.736 (1.00) |
0.298 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.513 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.682 (1.00) |
0.747 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ZNF880 | 3 (2%) | 133 |
0.0229 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.619 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.869 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
UBAC1 | 5 (4%) | 131 |
0.184 (1.00) |
0.945 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0648 (1.00) |
0.615 (1.00) |
0.196 (1.00) |
1 (1.00) |
||
CASQ2 | 7 (5%) | 129 |
0.515 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.744 (1.00) |
1 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.0551 (1.00) |
0.153 (1.00) |
1 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.322 (1.00) |
1 (1.00) |
|
ZNF678 | 5 (4%) | 131 |
0.0902 (1.00) |
0.48 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.115 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
RBM12 | 5 (4%) | 131 |
0.369 (1.00) |
0.51 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.594 (1.00) |
1 (1.00) |
0.135 (1.00) |
||
VWA3A | 5 (4%) | 131 |
0.196 (1.00) |
0.603 (1.00) |
0.0279 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00847 (1.00) |
0.659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.819 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NBPF16 | 6 (4%) | 130 |
0.754 (1.00) |
0.074 (1.00) |
1 (1.00) |
0.294 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.688 (1.00) |
1 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.957 (1.00) |
0.105 (1.00) |
1 (1.00) |
||
PARP10 | 5 (4%) | 131 |
0.965 (1.00) |
0.894 (1.00) |
0.315 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.018 (1.00) |
1 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TGFBR2 | 8 (6%) | 128 |
0.422 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.652 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.75 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
HACL1 | 4 (3%) | 132 |
0.761 (1.00) |
0.432 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.984 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
PRKRA | 3 (2%) | 133 |
0.621 (1.00) |
0.495 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.263 (1.00) |
1 (1.00) |
0.065 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SORBS2 | 5 (4%) | 131 |
0.568 (1.00) |
0.373 (1.00) |
0.593 (1.00) |
1 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.404 (1.00) |
0.669 (1.00) |
1 (1.00) |
0.695 (1.00) |
0.0847 (1.00) |
1 (1.00) |
|
CD86 | 6 (4%) | 130 |
0.19 (1.00) |
0.289 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.837 (1.00) |
1 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.106 (1.00) |
1 (1.00) |
|
RNF32 | 4 (3%) | 132 |
0.126 (1.00) |
0.685 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.625 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.218 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SDCBP | 6 (4%) | 130 |
0.728 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.819 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.335 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.242 (1.00) |
1 (1.00) |
||
CDC27 | 7 (5%) | 129 |
0.615 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
0.454 (1.00) |
1 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.944 (1.00) |
0.00118 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NLRP2 | 5 (4%) | 131 |
0.156 (1.00) |
0.203 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.508 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.963 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
PLIN4 | 6 (4%) | 130 |
0.423 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.0406 (1.00) |
1 (1.00) |
0.134 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.966 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.285 (1.00) |
1 (1.00) |
CBX3 | 3 (2%) | 133 |
0.158 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.619 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.599 (1.00) |
0.869 (1.00) |
0.0482 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SUZ12 | 4 (3%) | 132 |
0.907 (1.00) |
0.867 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.84 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
MTBP | 3 (2%) | 133 |
0.135 (1.00) |
0.257 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SYT14 | 4 (3%) | 132 |
0.00742 (1.00) |
0.985 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.335 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.303 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
RNF43 | 7 (5%) | 129 |
0.036 (1.00) |
0.657 (1.00) |
0.742 (1.00) |
1 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.514 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.186 (1.00) |
1 (1.00) |
0.16 (1.00) |
AAK1 | 4 (3%) | 132 |
0.0563 (1.00) |
0.579 (1.00) |
0.0532 (1.00) |
0.0841 (1.00) |
0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.372 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
HSPE1 | 4 (3%) | 132 |
0.932 (1.00) |
0.273 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.344 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
TMCC1 | 7 (5%) | 129 |
0.499 (1.00) |
0.859 (1.00) |
0.59 (1.00) |
0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.514 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.284 (1.00) |
1 (1.00) |
CFTR | 7 (5%) | 129 |
0.397 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.0529 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.508 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.324 (1.00) |
0.185 (1.00) |
||
NAA20 | 3 (2%) | 133 |
0.67 (1.00) |
0.192 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
TRPC4 | 6 (4%) | 130 |
0.428 (1.00) |
0.0125 (1.00) |
0.155 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.626 (1.00) |
1 (1.00) |
0.411 (1.00) |
0.462 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.643 (1.00) |
1 (1.00) |
0.629 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
CHRNA9 | 4 (3%) | 132 |
0.179 (1.00) |
0.16 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.625 (1.00) |
1 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.0989 (1.00) |
0.0482 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SP140 | 5 (4%) | 131 |
0.223 (1.00) |
0.435 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.494 (1.00) |
0.0686 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.472 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
KCNA7 | 5 (4%) | 131 |
0.602 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.791 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.054 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.0844 (1.00) |
1 (1.00) |
AQP7 | 7 (5%) | 129 |
0.456 (1.00) |
0.146 (1.00) |
0.545 (1.00) |
0.345 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
1 (1.00) |
0.481 (1.00) |
0.0964 (1.00) |
0.508 (1.00) |
0.83 (1.00) |
1 (1.00) |
0.185 (1.00) |
SKA3 | 6 (4%) | 130 |
0.272 (1.00) |
0.73 (1.00) |
0.193 (1.00) |
1 (1.00) |
0.335 (1.00) |
1 (1.00) |
0.411 (1.00) |
1 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.476 (1.00) |
0.0654 (1.00) |
0.0355 (1.00) |
0.104 (1.00) |
1 (1.00) |
DAAM1 | 6 (4%) | 130 |
0.314 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.294 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.411 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0278 (1.00) |
0.987 (1.00) |
0.0329 (1.00) |
1 (1.00) |
||
MSH2 | 4 (3%) | 132 |
0.599 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.358 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.943 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NUP210L | 5 (4%) | 131 |
0.19 (1.00) |
0.639 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.907 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
GPR98 | 8 (6%) | 128 |
0.685 (1.00) |
0.687 (1.00) |
0.651 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.045 (1.00) |
1 (1.00) |
CD2AP | 3 (2%) | 133 |
0.0416 (1.00) |
0.563 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.0959 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
RREB1 | 9 (7%) | 127 |
0.914 (1.00) |
0.793 (1.00) |
0.285 (1.00) |
1 (1.00) |
0.214 (1.00) |
1 (1.00) |
0.509 (1.00) |
1 (1.00) |
0.302 (1.00) |
0.874 (1.00) |
0.225 (1.00) |
0.0763 (1.00) |
0.0732 (1.00) |
1 (1.00) |
KIAA0586 | 6 (4%) | 130 |
0.0776 (1.00) |
0.886 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.58 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.411 (1.00) |
1 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.916 (1.00) |
0.343 (1.00) |
0.523 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
GNAS | 8 (6%) | 128 |
0.176 (1.00) |
0.442 (1.00) |
1 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.68 (1.00) |
1 (1.00) |
0.727 (1.00) |
0.00045 (0.592) |
0.522 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.271 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
FAR1 | 4 (3%) | 132 |
0.479 (1.00) |
0.257 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.423 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OR2T4 | 4 (3%) | 132 |
0.314 (1.00) |
0.757 (1.00) |
0.722 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.09 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.246 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
GPR50 | 5 (4%) | 131 |
0.837 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.132 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0848 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TAX1BP1 | 5 (4%) | 131 |
0.735 (1.00) |
0.922 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0796 (1.00) |
0.447 (1.00) |
0.241 (1.00) |
1 (1.00) |
||
CCDC33 | 3 (2%) | 133 |
0.0425 (1.00) |
0.917 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.0908 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
||
JAK2 | 4 (3%) | 132 |
0.891 (1.00) |
0.742 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.506 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
COL28A1 | 5 (4%) | 131 |
0.641 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.394 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0751 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
||
KLHL20 | 3 (2%) | 133 |
0.244 (1.00) |
0.711 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.747 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
WRN | 4 (3%) | 132 |
0.205 (1.00) |
0.154 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.125 (1.00) |
1 (1.00) |
0.256 (1.00) |
0.206 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
P2RY1 | 5 (4%) | 131 |
0.535 (1.00) |
0.559 (1.00) |
0.184 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0848 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.636 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.242 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
RBL2 | 4 (3%) | 132 |
0.777 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.0462 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.134 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.733 (1.00) |
1 (1.00) |
0.705 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
BCLAF1 | 6 (4%) | 130 |
0.259 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.582 (1.00) |
0.626 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.0923 (1.00) |
1 (1.00) |
0.808 (1.00) |
0.225 (1.00) |
1 (1.00) |
0.516 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
MORF4L1 | 3 (2%) | 133 |
0.829 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.31 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.73 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
SEPHS2 | 5 (4%) | 131 |
0.473 (1.00) |
0.452 (1.00) |
0.0822 (1.00) |
0.0721 (1.00) |
0.0848 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.342 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.508 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
HELZ | 5 (4%) | 131 |
0.171 (1.00) |
0.599 (1.00) |
0.211 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.177 (1.00) |
1 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.616 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.0659 (1.00) |
1 (1.00) |
DOCK8 | 4 (3%) | 132 |
0.69 (1.00) |
0.299 (1.00) |
1 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.337 (1.00) |
0.798 (1.00) |
0.413 (1.00) |
1 (1.00) |
0.835 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
KLK13 | 5 (4%) | 131 |
0.757 (1.00) |
0.337 (1.00) |
0.79 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.00942 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.717 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
OXR1 | 4 (3%) | 132 |
0.211 (1.00) |
0.443 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.625 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0982 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.0825 (1.00) |
||
OR52D1 | 4 (3%) | 132 |
0.372 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.356 (1.00) |
0.184 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.625 (1.00) |
0.0457 (1.00) |
1 (1.00) |
0.368 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
CSTF2T | 3 (2%) | 133 |
0.851 (1.00) |
0.37 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.553 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
AP3B1 | 4 (3%) | 132 |
0.739 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.358 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.682 (1.00) |
0.523 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OMA1 | 3 (2%) | 133 |
0.0193 (1.00) |
0.635 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
IYD | 6 (4%) | 130 |
0.945 (1.00) |
0.97 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.142 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.065 (1.00) |
0.282 (1.00) |
1 (1.00) |
||
PRSS3 | 3 (2%) | 133 |
0.439 (1.00) |
0.812 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
COBL | 6 (4%) | 130 |
0.735 (1.00) |
0.0706 (1.00) |
0.395 (1.00) |
0.292 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.853 (1.00) |
1 (1.00) |
0.923 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
SORT1 | 5 (4%) | 131 |
0.592 (1.00) |
0.75 (1.00) |
0.133 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0848 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SSBP3 | 3 (2%) | 133 |
0.00322 (1.00) |
0.0693 (1.00) |
0.619 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
GPSM2 | 3 (2%) | 133 |
0.196 (1.00) |
0.0379 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.277 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
EEF2 | 5 (4%) | 131 |
0.0566 (1.00) |
0.0767 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
1 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.911 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ZACN | 3 (2%) | 133 |
0.749 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.138 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.0612 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.104 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ZMYM2 | 3 (2%) | 133 |
0.0668 (1.00) |
0.818 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.264 (1.00) |
1 (1.00) |
0.33 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
GSN | 4 (3%) | 132 |
0.509 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.725 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.662 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TGFBR1 | 8 (6%) | 128 |
0.365 (1.00) |
0.302 (1.00) |
0.78 (1.00) |
1 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.468 (1.00) |
1 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.384 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
MLPH | 3 (2%) | 133 |
0.854 (1.00) |
0.269 (1.00) |
1 (1.00) |
0.35 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.574 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
UBXN4 | 3 (2%) | 133 |
0.244 (1.00) |
0.711 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.747 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
KCNE1 | 4 (3%) | 132 |
0.907 (1.00) |
0.867 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.383 (1.00) |
0.84 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
RTTN | 5 (4%) | 131 |
0.356 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.791 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.0724 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.73 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FAM8A1 | 4 (3%) | 132 |
0.256 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.0164 (1.00) |
0.183 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.134 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.218 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ACTRT2 | 3 (2%) | 133 |
0.539 (1.00) |
0.177 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.13 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.264 (1.00) |
1 (1.00) |
0.68 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
DNAH7 | 7 (5%) | 129 |
0.398 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.845 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.279 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.679 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
OR1N2 | 4 (3%) | 132 |
0.712 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.425 (1.00) |
1 (1.00) |
0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.109 (1.00) |
||
BRD8 | 3 (2%) | 133 |
0.543 (1.00) |
0.538 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0598 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SIGLEC14 | 3 (2%) | 133 |
0.00241 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.615 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.266 (1.00) |
1 (1.00) |
0.658 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ARID1A | 7 (5%) | 129 |
0.415 (1.00) |
0.554 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
0.454 (1.00) |
1 (1.00) |
0.454 (1.00) |
0.916 (1.00) |
1 (1.00) |
0.917 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
POM121 | 4 (3%) | 132 |
0.0892 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.437 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.907 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
LCP2 | 3 (2%) | 133 |
0.33 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
L1CAM | 5 (4%) | 131 |
0.328 (1.00) |
0.325 (1.00) |
0.789 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.402 (1.00) |
1 (1.00) |
0.429 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ABCG5 | 3 (2%) | 133 |
0.0973 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.169 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0909 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.599 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
KRT2 | 5 (4%) | 131 |
0.75 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
1 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.579 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.562 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
ZNF780A | 5 (4%) | 131 |
0.229 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.151 (1.00) |
0.514 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.402 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.635 (1.00) |
1 (1.00) |
0.851 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
DDX4 | 5 (4%) | 131 |
0.766 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.79 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.279 (1.00) |
0.0782 (1.00) |
0.911 (1.00) |
0.241 (1.00) |
1 (1.00) |
BTN2A1 | 3 (2%) | 133 |
0.257 (1.00) |
0.801 (1.00) |
0.307 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.262 (1.00) |
1 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TDRD5 | 4 (3%) | 132 |
0.133 (1.00) |
0.447 (1.00) |
0.224 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.1 (1.00) |
0.423 (1.00) |
0.197 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OR2A14 | 3 (2%) | 133 |
0.367 (1.00) |
0.366 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0604 (1.00) |
0.476 (1.00) |
0.153 (1.00) |
1 (1.00) |
||
PBRM1 | 5 (4%) | 131 |
0.938 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
1 (1.00) |
0.983 (1.00) |
0.413 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
SEPT2 | 3 (2%) | 133 |
0.391 (1.00) |
0.818 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0911 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
WDHD1 | 3 (2%) | 133 |
0.0609 (1.00) |
0.13 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ANKRD49 | 3 (2%) | 133 |
0.0193 (1.00) |
0.635 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
PAPSS2 | 4 (3%) | 132 |
0.965 (1.00) |
0.661 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.683 (1.00) |
0.506 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
GPRC6A | 5 (4%) | 131 |
0.188 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.308 (1.00) |
1 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.654 (1.00) |
1 (1.00) |
0.686 (1.00) |
1 (1.00) |
0.109 (1.00) |
PDXDC1 | 3 (2%) | 133 |
0.912 (1.00) |
0.378 (1.00) |
1 (1.00) |
0.35 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.574 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TGM5 | 4 (3%) | 132 |
0.449 (1.00) |
0.877 (1.00) |
0.0207 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.54 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NUP54 | 3 (2%) | 133 |
0.147 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.0667 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.428 (1.00) |
1 (1.00) |
0.73 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
NLRP6 | 3 (2%) | 133 |
0.155 (1.00) |
0.635 (1.00) |
0.617 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
DHX35 | 4 (3%) | 132 |
0.952 (1.00) |
0.37 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.436 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.154 (1.00) |
1 (1.00) |
0.715 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
CEACAM4 | 3 (2%) | 133 |
0.066 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.617 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
MMP13 | 3 (2%) | 133 |
0.0411 (1.00) |
0.463 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.311 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SYCP2 | 5 (4%) | 131 |
0.923 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.514 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.205 (1.00) |
1 (1.00) |
0.142 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
LACTB | 3 (2%) | 133 |
0.693 (1.00) |
0.276 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.654 (1.00) |
1 (1.00) |
0.311 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TEKT4 | 6 (4%) | 130 |
0.273 (1.00) |
0.718 (1.00) |
0.269 (1.00) |
1 (1.00) |
0.142 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0923 (1.00) |
0.464 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.0449 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.284 (1.00) |
0.135 (1.00) |
MC3R | 4 (3%) | 132 |
0.36 (1.00) |
0.638 (1.00) |
0.108 (1.00) |
0.435 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.575 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
CSRNP3 | 4 (3%) | 132 |
0.626 (1.00) |
0.357 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.348 (1.00) |
0.984 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0825 (1.00) |
||
PHF15 | 4 (3%) | 132 |
0.385 (1.00) |
0.862 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.639 (1.00) |
1 (1.00) |
0.485 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
ZBTB4 | 3 (2%) | 133 |
0.366 (1.00) |
0.865 (1.00) |
0.167 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.0909 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
RSPO1 | 3 (2%) | 133 |
0.459 (1.00) |
0.35 (1.00) |
1 (1.00) |
0.348 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.262 (1.00) |
0.348 (1.00) |
0.793 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
WWP2 | 5 (4%) | 131 |
0.874 (1.00) |
0.322 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.512 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.0737 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.967 (1.00) |
1 (1.00) |
0.135 (1.00) |
||
CPNE2 | 3 (2%) | 133 |
0.166 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.138 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.184 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0825 (1.00) |
|||
WDR36 | 3 (2%) | 133 |
0.525 (1.00) |
0.459 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.233 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
CYTH4 | 3 (2%) | 133 |
0.00491 (1.00) |
0.35 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0895 (1.00) |
0.747 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
||
BOC | 4 (3%) | 132 |
0.656 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.439 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.489 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
C5ORF51 | 3 (2%) | 133 |
0.893 (1.00) |
0.118 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
LILRB2 | 4 (3%) | 132 |
0.462 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.199 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FLVCR1 | 3 (2%) | 133 |
0.454 (1.00) |
0.402 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.262 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.793 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ZNF483 | 4 (3%) | 132 |
0.861 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.437 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.679 (1.00) |
0.442 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NDUFV2 | 3 (2%) | 133 |
0.0741 (1.00) |
0.343 (1.00) |
0.617 (1.00) |
1 (1.00) |
0.556 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.213 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
PSMB4 | 4 (3%) | 132 |
0.419 (1.00) |
0.357 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.625 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0327 (1.00) |
0.681 (1.00) |
0.84 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
KIAA1045 | 5 (4%) | 131 |
0.38 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.395 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.476 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0416 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
KLK15 | 5 (4%) | 131 |
0.721 (1.00) |
0.917 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.238 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.178 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ZNF660 | 3 (2%) | 133 |
0.67 (1.00) |
0.101 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.534 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
CCDC87 | 3 (2%) | 133 |
0.764 (1.00) |
0.335 (1.00) |
0.383 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0598 (1.00) |
0.345 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
KIF4B | 4 (3%) | 132 |
0.807 (1.00) |
0.787 (1.00) |
1 (1.00) |
0.182 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.654 (1.00) |
1 (1.00) |
0.372 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
ENPP7 | 5 (4%) | 131 |
0.449 (1.00) |
0.772 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0743 (1.00) |
0.681 (1.00) |
0.574 (1.00) |
1 (1.00) |
0.109 (1.00) |
||
TNRC6C | 6 (4%) | 130 |
0.715 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.626 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0923 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.552 (1.00) |
0.105 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NAA40 | 3 (2%) | 133 |
0.874 (1.00) |
0.362 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0922 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.5 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
AKAP13 | 6 (4%) | 130 |
0.191 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.296 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.411 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.579 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
ASH1L | 6 (4%) | 130 |
0.221 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.294 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.411 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.279 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.784 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
ATP2C2 | 4 (3%) | 132 |
0.903 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.357 (1.00) |
0.044 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.523 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ANKRD30A | 8 (6%) | 128 |
0.935 (1.00) |
0.937 (1.00) |
0.785 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.727 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.305 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.603 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
MKI67 | 6 (4%) | 130 |
0.169 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.674 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.626 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.116 (1.00) |
0.283 (1.00) |
1 (1.00) |
|
FCGBP | 12 (9%) | 124 |
0.184 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.438 (1.00) |
0.731 (1.00) |
1 (1.00) |
0.546 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.966 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.0509 (1.00) |
0.458 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
SRFBP1 | 3 (2%) | 133 |
0.0227 (1.00) |
0.807 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.881 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.27 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
|
NFKBIZ | 4 (3%) | 132 |
0.561 (1.00) |
0.923 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.779 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NBPF10 | 5 (4%) | 131 |
0.123 (1.00) |
0.894 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.426 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ZNF358 | 4 (3%) | 132 |
0.346 (1.00) |
0.0672 (1.00) |
0.358 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
||
HIST1H2BK | 3 (2%) | 133 |
0.266 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.574 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0825 (1.00) |
||||
DDB1 | 5 (4%) | 131 |
0.187 (1.00) |
0.0533 (1.00) |
0.789 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.55 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
BVES | 4 (3%) | 132 |
0.802 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.423 (1.00) |
1 (1.00) |
0.235 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.579 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SLC26A3 | 3 (2%) | 133 |
0.217 (1.00) |
0.558 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
1 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.311 (1.00) |
0.0555 (1.00) |
|||
CMYA5 | 7 (5%) | 129 |
0.297 (1.00) |
0.104 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.0379 (1.00) |
0.772 (1.00) |
1 (1.00) |
0.411 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
CHSY3 | 5 (4%) | 131 |
0.953 (1.00) |
0.473 (1.00) |
0.589 (1.00) |
0.512 (1.00) |
0.336 (1.00) |
1 (1.00) |
0.177 (1.00) |
1 (1.00) |
0.279 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.241 (1.00) |
1 (1.00) |
||
AGAP6 | 7 (5%) | 129 |
0.55 (1.00) |
0.886 (1.00) |
1 (1.00) |
0.64 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.0462 (1.00) |
1 (1.00) |
0.362 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
NGF | 4 (3%) | 132 |
0.274 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.356 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.106 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
SARS2 | 3 (2%) | 133 |
0.218 (1.00) |
0.241 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.0248 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.0377 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
ADORA3 | 5 (4%) | 131 |
0.639 (1.00) |
0.15 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
1 (1.00) |
0.577 (1.00) |
0.547 (1.00) |
1 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.244 (1.00) |
1 (1.00) |
ATP11B | 4 (3%) | 132 |
0.608 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.189 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.00743 (1.00) |
0.347 (1.00) |
0.259 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
RAG1 | 3 (2%) | 133 |
0.859 (1.00) |
0.436 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.202 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
HK2 | 4 (3%) | 132 |
0.806 (1.00) |
0.602 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.331 (1.00) |
1 (1.00) |
0.643 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
P value = 7.63e-05 (logrank test), Q value = 0.2
nPatients | nDeath | Duration Range (Median), Month | |
---|---|---|---|
ALL | 134 | 72 | 0.1 - 75.1 (13.7) |
MIPEP MUTATED | 3 | 3 | 3.6 - 11.0 (4.0) |
MIPEP WILD-TYPE | 131 | 69 | 0.1 - 75.1 (13.8) |
-
Mutation data file = sample_sig_gene_table.txt from Mutsig_2CV pipeline
-
Processed Mutation data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/GDAC_Correlate_Genomic_Events_Preprocess/PAAD-TP/15182489/transformed.cor.cli.txt
-
Clinical data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/Append_Data/PAAD-TP/15087151/PAAD-TP.merged_data.txt
-
Number of patients = 136
-
Number of significantly mutated genes = 188
-
Number of selected clinical features = 14
-
Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3
For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R
For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R
For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.
In addition to the links below, the full results of the analysis summarized in this report can also be downloaded programmatically using firehose_get, or interactively from either the Broad GDAC website or TCGA Data Coordination Center Portal.