Correlation between gene mutation status and selected clinical features
Skin Cutaneous Melanoma (Metastatic)
02 April 2015  |  analyses__2015_04_02
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doi:10.7908/C1K64H6T
Maintained by TCGA GDAC Team (Broad Institute/MD Anderson Cancer Center/Harvard Medical School)
Cite as Broad Institute TCGA Genome Data Analysis Center (2015): Correlation between gene mutation status and selected clinical features. Broad Institute of MIT and Harvard. doi:10.7908/C1K64H6T
Overview
Introduction

This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.

Summary

Testing the association between mutation status of 255 genes and 14 clinical features across 288 patients, one significant finding detected with Q value < 0.25.

  • NF1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

Results
Overview of the results

Table 1.  Get Full Table Overview of the association between mutation status of 255 genes and 14 clinical features. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by Q value < 0.25, one significant finding detected.

Clinical
Features 		Time
from
Specimen
Diagnosis
to
Death 		Time
to
Death 		YEARS
TO
BIRTH 		PRIMARY
SITE
OF
DISEASE 		NEOPLASM
DISEASESTAGE 		PATHOLOGY
T
STAGE 		PATHOLOGY
N
STAGE 		PATHOLOGY
M
STAGE 		MELANOMA
ULCERATION 		MELANOMA
PRIMARY
KNOWN 		BRESLOW
THICKNESS 		GENDER RACE ETHNICITY
nMutated (%) nWild-Type logrank test logrank test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test
NF1 38 (13%) 250 0.0756
(1.00) 		0.0691
(1.00) 		2.27e-05
(0.0812) 		0.0715
(1.00) 		0.0218
(0.985) 		0.0121
(0.899) 		0.573
(1.00) 		0.256
(1.00) 		1
(1.00) 		0.597
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.151
(1.00) 		1
(1.00) 		0.335
(1.00)
NRAS 87 (30%) 201 0.097
(1.00) 		0.179
(1.00) 		0.451
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.268
(1.00) 		0.0949
(1.00) 		0.29
(1.00) 		0.749
(1.00) 		0.847
(1.00) 		0.686
(1.00) 		0.51
(1.00) 		0.748
(1.00) 		1
(1.00)
CDKN2A 41 (14%) 247 0.26
(1.00) 		0.622
(1.00) 		0.223
(1.00) 		0.787
(1.00) 		0.432
(1.00) 		0.44
(1.00) 		0.253
(1.00) 		0.723
(1.00) 		0.0424
(0.985) 		0.616
(1.00) 		0.103
(1.00) 		0.729
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TP53 48 (17%) 240 0.369
(1.00) 		0.537
(1.00) 		0.192
(1.00) 		0.387
(1.00) 		0.436
(1.00) 		0.78
(1.00) 		0.162
(1.00) 		0.322
(1.00) 		0.419
(1.00) 		0.635
(1.00) 		0.19
(1.00) 		0.87
(1.00) 		0.662
(1.00) 		1
(1.00)
PTEN 25 (9%) 263 0.642
(1.00) 		0.908
(1.00) 		0.0228
(0.985) 		0.588
(1.00) 		0.57
(1.00) 		0.655
(1.00) 		0.691
(1.00) 		0.644
(1.00) 		0.611
(1.00) 		0.519
(1.00) 		0.812
(1.00) 		0.284
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RAC1 20 (7%) 268 0.468
(1.00) 		0.0728
(1.00) 		0.266
(1.00) 		0.924
(1.00) 		0.563
(1.00) 		0.563
(1.00) 		0.197
(1.00) 		0.617
(1.00) 		0.489
(1.00) 		0.0266
(0.985) 		0.269
(1.00) 		0.633
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ARID2 37 (13%) 251 0.712
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.0664
(1.00) 		0.474
(1.00) 		0.273
(1.00) 		0.193
(1.00) 		0.33
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.827
(1.00) 		0.433
(1.00) 		0.596
(1.00) 		0.587
(1.00) 		1
(1.00) 		0.343
(1.00)
PPP6C 20 (7%) 268 0.0257
(0.985) 		0.00679
(0.866) 		0.473
(1.00) 		0.322
(1.00) 		0.682
(1.00) 		1
(1.00) 		0.342
(1.00) 		1
(1.00) 		0.574
(1.00) 		0.486
(1.00) 		0.883
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MAP2K1 14 (5%) 274 0.0447
(0.985) 		0.0218
(0.985) 		0.121
(1.00) 		0.537
(1.00) 		0.949
(1.00) 		0.906
(1.00) 		0.221
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.717
(1.00) 		1
(1.00) 		0.989
(1.00) 		0.779
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
COL3A1 58 (20%) 230 0.919
(1.00) 		0.459
(1.00) 		0.0224
(0.985) 		0.785
(1.00) 		0.476
(1.00) 		0.742
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.756
(1.00) 		0.847
(1.00) 		0.119
(1.00) 		0.951
(1.00) 		0.00129
(0.656) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZFX 14 (5%) 274 0.926
(1.00) 		0.94
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.409
(1.00) 		0.281
(1.00) 		0.873
(1.00) 		0.553
(1.00) 		0.604
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.347
(1.00) 		0.089
(1.00) 		1
(1.00) 		0.141
(1.00)
HSD11B1 14 (5%) 274 0.549
(1.00) 		0.506
(1.00) 		0.29
(1.00) 		0.882
(1.00) 		0.88
(1.00) 		0.814
(1.00) 		0.896
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.767
(1.00) 		0.398
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IL5RA 17 (6%) 271 0.0836
(1.00) 		0.0297
(0.985) 		0.0177
(0.985) 		0.318
(1.00) 		0.551
(1.00) 		0.694
(1.00) 		1
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.365
(1.00) 		1
(1.00) 		0.714
(1.00) 		0.304
(1.00) 		0.31
(1.00) 		1
(1.00)
FAM58A 6 (2%) 282 0.954
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.13
(1.00) 		0.736
(1.00) 		0.54
(1.00) 		1
(1.00) 		0.274
(1.00) 		1
(1.00) 		0.271
(1.00) 		0.556
(1.00) 		0.668
(1.00) 		0.087
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IDH1 14 (5%) 274 0.48
(1.00) 		0.99
(1.00) 		0.0954
(1.00) 		0.0494
(0.985) 		0.0502
(0.985) 		0.608
(1.00) 		0.67
(1.00) 		0.191
(1.00) 		0.475
(1.00) 		1
(1.00) 		0.383
(1.00) 		0.58
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DMC1 11 (4%) 277 0.967
(1.00) 		0.497
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.306
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.465
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.481
(1.00) 		0.475
(1.00) 		0.634
(1.00) 		0.753
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CYP3A5 13 (5%) 275 0.952
(1.00) 		0.438
(1.00) 		0.811
(1.00) 		0.0262
(0.985) 		0.917
(1.00) 		1
(1.00) 		0.343
(1.00) 		1
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.671
(1.00) 		0.648
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.132
(1.00)
SLC38A4 33 (11%) 255 0.633
(1.00) 		0.809
(1.00) 		0.0501
(0.985) 		0.54
(1.00) 		0.912
(1.00) 		0.579
(1.00) 		0.813
(1.00) 		0.7
(1.00) 		0.438
(1.00) 		0.0119
(0.899) 		0.836
(1.00) 		0.0206
(0.985) 		0.523
(1.00) 		1
(1.00)
DDX3X 20 (7%) 268 0.519
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.783
(1.00) 		0.3
(1.00) 		0.546
(1.00) 		0.947
(1.00) 		0.686
(1.00) 		0.119
(1.00) 		0.782
(1.00) 		0.725
(1.00) 		0.693
(1.00) 		0.0324
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DSG3 48 (17%) 240 0.461
(1.00) 		0.487
(1.00) 		0.0249
(0.985) 		0.786
(1.00) 		0.756
(1.00) 		1
(1.00) 		0.969
(1.00) 		0.496
(1.00) 		1
(1.00) 		0.157
(1.00) 		0.924
(1.00) 		0.87
(1.00) 		1
(1.00) 		0.427
(1.00)
S100A8 8 (3%) 280 0.157
(1.00) 		0.0193
(0.985) 		0.543
(1.00) 		0.298
(1.00) 		0.429
(1.00) 		0.858
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0652
(1.00) 		0.947
(1.00) 		0.479
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0824
(1.00)
RPGRIP1 27 (9%) 261 0.41
(1.00) 		0.236
(1.00) 		0.563
(1.00) 		0.302
(1.00) 		0.891
(1.00) 		0.0892
(1.00) 		0.167
(1.00) 		1
(1.00) 		0.221
(1.00) 		0.221
(1.00) 		0.574
(1.00) 		0.0114
(0.899) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OXA1L 8 (3%) 280 0.701
(1.00) 		0.839
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.499
(1.00) 		0.639
(1.00) 		0.218
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.732
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NBPF1 26 (9%) 262 0.599
(1.00) 		0.695
(1.00) 		0.0124
(0.899) 		0.946
(1.00) 		0.201
(1.00) 		0.588
(1.00) 		0.114
(1.00) 		0.381
(1.00) 		0.285
(1.00) 		0.345
(1.00) 		0.714
(1.00) 		0.834
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PDE1A 40 (14%) 248 0.218
(1.00) 		0.757
(1.00) 		0.0348
(0.985) 		0.191
(1.00) 		0.485
(1.00) 		0.00189
(0.843) 		0.0593
(0.992) 		0.715
(1.00) 		0.119
(1.00) 		1
(1.00) 		0.699
(1.00) 		0.598
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GML 11 (4%) 277 0.499
(1.00) 		0.668
(1.00) 		0.0694
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.907
(1.00) 		0.504
(1.00) 		0.523
(1.00) 		0.515
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.147
(1.00) 		0.595
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RQCD1 9 (3%) 279 0.646
(1.00) 		0.557
(1.00) 		0.759
(1.00) 		0.0542
(0.99) 		0.00094
(0.576) 		0.484
(1.00) 		0.398
(1.00) 		0.446
(1.00) 		0.689
(1.00) 		1
(1.00) 		0.564
(1.00) 		0.303
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TRERF1 26 (9%) 262 0.207
(1.00) 		0.614
(1.00) 		0.0961
(1.00) 		0.142
(1.00) 		0.899
(1.00) 		0.451
(1.00) 		0.665
(1.00) 		1
(1.00) 		0.595
(1.00) 		1
(1.00) 		0.936
(1.00) 		0.138
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
C1QTNF9 16 (6%) 272 0.412
(1.00) 		0.263
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.948
(1.00) 		0.438
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.427
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0699
(1.00) 		0.426
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KRTAP5-10 10 (3%) 278 0.69
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.821
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.875
(1.00) 		0.568
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.997
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KEL 35 (12%) 253 0.448
(1.00) 		0.643
(1.00) 		0.593
(1.00) 		0.841
(1.00) 		0.0955
(1.00) 		0.815
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.248
(1.00) 		0.412
(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.0251
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GAGE2D 4 (1%) 284 0.334
(1.00) 		0.217
(1.00) 		1
(1.00) 		0.097
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.534
(1.00) 		1
(1.00) 		0.514
(1.00) 		1
(1.00) 		0.597
(1.00) 		0.632
(1.00) 		1
(1.00) 		0.000446
(0.576)
BRAF 144 (50%) 144 0.00411
(0.866) 		0.0462
(0.985) 		0.000591
(0.576) 		0.0379
(0.985) 		0.525
(1.00) 		0.00333
(0.866) 		0.111
(1.00) 		0.806
(1.00) 		0.76
(1.00) 		0.482
(1.00) 		0.0209
(0.985) 		0.394
(1.00) 		0.216
(1.00) 		1
(1.00)
PARM1 19 (7%) 269 0.63
(1.00) 		0.202
(1.00) 		0.217
(1.00) 		0.179
(1.00) 		0.931
(1.00) 		0.504
(1.00) 		0.45
(1.00) 		0.61
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.717
(1.00) 		0.226
(1.00) 		0.338
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KYNU 16 (6%) 272 0.178
(1.00) 		0.0771
(1.00) 		0.564
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.183
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.759
(1.00) 		1
(1.00) 		0.475
(1.00) 		0.434
(1.00) 		0.247
(1.00) 		0.426
(1.00) 		1
(1.00) 		0.16
(1.00)
PTGIS 16 (6%) 272 0.609
(1.00) 		0.616
(1.00) 		0.0269
(0.985) 		0.202
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.831
(1.00) 		0.302
(1.00) 		0.0684
(1.00) 		0.0113
(0.899) 		0.434
(1.00) 		0.747
(1.00) 		0.0352
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KIAA1257 13 (5%) 275 0.9
(1.00) 		0.507
(1.00) 		0.914
(1.00) 		0.674
(1.00) 		0.483
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.874
(1.00) 		0.576
(1.00) 		0.702
(1.00) 		0.214
(1.00) 		0.445
(1.00) 		0.773
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CCK 6 (2%) 282 0.227
(1.00) 		0.149
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		0.776
(1.00) 		0.274
(1.00) 		0.0305
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.556
(1.00) 		0.479
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZNF780B 10 (3%) 278 0.492
(1.00) 		0.355
(1.00) 		0.929
(1.00) 		0.276
(1.00) 		0.813
(1.00) 		1
(1.00) 		0.343
(1.00) 		1
(1.00) 		0.445
(1.00) 		0.364
(1.00) 		0.997
(1.00) 		0.33
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RICTOR 12 (4%) 276 0.267
(1.00) 		0.816
(1.00) 		0.00689
(0.866) 		0.0766
(1.00) 		0.835
(1.00) 		0.757
(1.00) 		0.535
(1.00) 		1
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.652
(1.00) 		0.423
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
STK19 14 (5%) 274 0.398
(1.00) 		0.987
(1.00) 		0.386
(1.00) 		0.231
(1.00) 		0.0943
(1.00) 		0.946
(1.00) 		0.899
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.396
(1.00) 		0.75
(1.00) 		0.779
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ALPK2 47 (16%) 241 0.3
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.0395
(0.985) 		0.0419
(0.985) 		0.0362
(0.985) 		0.0803
(1.00) 		0.318
(1.00) 		0.743
(1.00) 		0.833
(1.00) 		0.0561
(0.99) 		0.548
(1.00) 		0.0324
(0.985) 		0.658
(1.00) 		1
(1.00)
PKDREJ 30 (10%) 258 0.95
(1.00) 		0.948
(1.00) 		0.654
(1.00) 		0.501
(1.00) 		0.915
(1.00) 		0.932
(1.00) 		0.918
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.595
(1.00) 		0.23
(1.00) 		0.604
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MMP1 14 (5%) 274 0.64
(1.00) 		0.991
(1.00) 		0.622
(1.00) 		0.223
(1.00) 		0.0295
(0.985) 		0.791
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.0847
(1.00) 		1
(1.00) 		0.976
(1.00) 		0.264
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SLC27A5 9 (3%) 279 0.855
(1.00) 		0.512
(1.00) 		0.836
(1.00) 		0.608
(1.00) 		0.245
(1.00) 		0.476
(1.00) 		0.438
(1.00) 		1
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.0895
(1.00) 		0.895
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NGF 9 (3%) 279 0.353
(1.00) 		0.679
(1.00) 		0.568
(1.00) 		0.412
(1.00) 		0.159
(1.00) 		0.244
(1.00) 		0.292
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.922
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0924
(1.00)
ATP5F1 6 (2%) 282 0.691
(1.00) 		0.533
(1.00) 		0.383
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.815
(1.00) 		0.659
(1.00) 		1
(1.00) 		0.65
(1.00) 		1
(1.00) 		0.266
(1.00) 		0.416
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
POTEG 27 (9%) 261 0.418
(1.00) 		0.148
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.148
(1.00) 		0.87
(1.00) 		0.305
(1.00) 		0.964
(1.00) 		0.231
(1.00) 		0.803
(1.00) 		0.759
(1.00) 		0.339
(1.00) 		0.412
(1.00) 		1
(1.00) 		0.26
(1.00)
XIRP2 97 (34%) 191 0.542
(1.00) 		0.38
(1.00) 		0.0134
(0.899) 		0.126
(1.00) 		0.577
(1.00) 		0.792
(1.00) 		0.386
(1.00) 		0.795
(1.00) 		0.752
(1.00) 		0.457
(1.00) 		0.342
(1.00) 		0.521
(1.00) 		0.228
(1.00) 		1
(1.00)
USH2A 91 (32%) 197 0.906
(1.00) 		0.222
(1.00) 		0.0118
(0.899) 		0.893
(1.00) 		0.301
(1.00) 		0.872
(1.00) 		0.538
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0368
(0.985) 		0.174
(1.00) 		0.193
(1.00) 		0.226
(1.00) 		1
(1.00)
THSD7B 91 (32%) 197 0.0592
(0.992) 		0.205
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.475
(1.00) 		0.585
(1.00) 		0.205
(1.00) 		0.0338
(0.985) 		1
(1.00) 		0.14
(1.00) 		0.341
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.0678
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.554
(1.00)
SAG 11 (4%) 277 0.776
(1.00) 		0.915
(1.00) 		0.606
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.25
(1.00) 		0.466
(1.00) 		0.402
(1.00) 		1
(1.00) 		0.313
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.205
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		0.112
(1.00)
ZNF597 10 (3%) 278 0.899
(1.00) 		0.474
(1.00) 		0.923
(1.00) 		0.108
(1.00) 		0.666
(1.00) 		0.0389
(0.985) 		0.424
(1.00) 		1
(1.00) 		0.243
(1.00) 		1
(1.00) 		0.217
(1.00) 		0.0962
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PLCXD2 12 (4%) 276 0.365
(1.00) 		0.686
(1.00) 		0.978
(1.00) 		0.242
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.5
(1.00) 		0.663
(1.00) 		1
(1.00) 		0.475
(1.00) 		0.373
(1.00) 		0.922
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MPP7 32 (11%) 256 0.451
(1.00) 		0.906
(1.00) 		0.00509
(0.866) 		0.268
(1.00) 		0.783
(1.00) 		0.203
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.423
(1.00) 		0.0675
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.809
(1.00) 		0.00639
(0.866) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MMP27 13 (5%) 275 0.695
(1.00) 		0.808
(1.00) 		0.0312
(0.985) 		1
(1.00) 		0.38
(1.00) 		0.01
(0.899) 		0.831
(1.00) 		1
(1.00) 		0.445
(1.00) 		0.671
(1.00) 		0.08
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.245
(1.00) 		1
(1.00)
CHRNA3 14 (5%) 274 0.0384
(0.985) 		0.0485
(0.985) 		0.412
(1.00) 		0.162
(1.00) 		0.349
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.49
(1.00) 		0.547
(1.00) 		0.0496
(0.985) 		0.691
(1.00) 		0.878
(1.00) 		0.398
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CD300E 12 (4%) 276 0.371
(1.00) 		0.422
(1.00) 		0.529
(1.00) 		0.803
(1.00) 		0.441
(1.00) 		0.296
(1.00) 		0.0703
(1.00) 		0.145
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.0495
(0.985) 		0.437
(1.00) 		0.768
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IFNGR2 4 (1%) 284 0.12
(1.00) 		0.723
(1.00) 		0.691
(1.00) 		0.489
(1.00) 		1
(1.00) 		0.745
(1.00) 		0.458
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		1
(1.00) 		0.397
(1.00) 		0.301
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MYPOP 7 (2%) 281 0.953
(1.00) 		0.884
(1.00) 		0.522
(1.00) 		0.672
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.00826
(0.894) 		0.455
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.715
(1.00) 		0.139
(1.00) 		1
(1.00)
KHDC1 11 (4%) 277 0.377
(1.00) 		0.69
(1.00) 		0.00618
(0.866) 		0.78
(1.00) 		0.241
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.829
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.147
(1.00) 		0.463
(1.00) 		0.00806
(0.894) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RB1 9 (3%) 279 0.882
(1.00) 		0.843
(1.00) 		0.859
(1.00) 		0.302
(1.00) 		0.131
(1.00) 		0.571
(1.00) 		0.784
(1.00) 		1
(1.00) 		0.403
(1.00) 		1
(1.00) 		0.527
(1.00) 		0.732
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GLRB 29 (10%) 259 0.486
(1.00) 		0.894
(1.00) 		0.0147
(0.928) 		0.0245
(0.985) 		0.92
(1.00) 		0.365
(1.00) 		0.565
(1.00) 		1
(1.00) 		0.345
(1.00) 		1
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.156
(1.00) 		1
(1.00) 		0.277
(1.00)
CASP8 9 (3%) 279 0.594
(1.00) 		0.801
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.415
(1.00) 		0.107
(1.00) 		0.0612
(1.00) 		0.198
(1.00) 		0.102
(1.00) 		0.271
(1.00) 		0.0895
(1.00) 		0.0756
(1.00) 		0.303
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RNMT 6 (2%) 282 0.847
(1.00) 		0.742
(1.00) 		0.0563
(0.99) 		1
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.58
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.984
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ACSBG1 13 (5%) 275 0.165
(1.00) 		0.294
(1.00) 		0.0987
(1.00) 		0.875
(1.00) 		0.397
(1.00) 		0.0972
(1.00) 		0.293
(1.00) 		0.515
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.671
(1.00) 		0.239
(1.00) 		0.564
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GZMA 11 (4%) 277 0.704
(1.00) 		0.78
(1.00) 		0.264
(1.00) 		0.381
(1.00) 		0.569
(1.00) 		0.968
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.617
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AK7 19 (7%) 269 0.776
(1.00) 		0.571
(1.00) 		0.457
(1.00) 		0.812
(1.00) 		0.128
(1.00) 		0.525
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.312
(1.00) 		0.717
(1.00) 		0.275
(1.00) 		0.936
(1.00) 		0.147
(1.00) 		1
(1.00) 		0.188
(1.00)
ASNSD1 8 (3%) 280 0.4
(1.00) 		0.4
(1.00) 		0.163
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.504
(1.00) 		0.657
(1.00) 		0.407
(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.619
(1.00) 		0.479
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IL31RA 20 (7%) 268 0.281
(1.00) 		0.206
(1.00) 		0.599
(1.00) 		0.441
(1.00) 		0.458
(1.00) 		0.291
(1.00) 		0.527
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.029
(0.985) 		0.725
(1.00) 		0.083
(1.00) 		0.338
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ACMSD 12 (4%) 276 0.701
(1.00) 		0.933
(1.00) 		0.72
(1.00) 		0.165
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(1.00) 		0.872
(1.00) 		0.471
(1.00) 		0.515
(1.00) 		0.274
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.696
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
C6ORF165 19 (7%) 269 0.74
(1.00) 		0.879
(1.00) 		0.475
(1.00) 		0.203
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.259
(1.00) 		0.222
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.717
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.634
(1.00) 		1
(1.00) 		0.179
(1.00)
CTNNB1 16 (6%) 272 0.222
(1.00) 		0.954
(1.00) 		0.0358
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(0.985) 		0.0336
(0.985) 		0.609
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0371
(0.985) 		0.604
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MME 21 (7%) 267 0.203
(1.00) 		0.221
(1.00) 		0.904
(1.00) 		0.394
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.396
(1.00) 		0.865
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.531
(1.00) 		1
(1.00) 		0.539
(1.00) 		0.0996
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZMYND8 17 (6%) 271 0.529
(1.00) 		0.221
(1.00) 		0.234
(1.00) 		0.0661
(1.00) 		0.231
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.0113
(0.899) 		0.362
(1.00) 		0.304
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GCOM1 24 (8%) 264 0.956
(1.00) 		0.473
(1.00) 		0.288
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(1.00) 		0.607
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.405
(1.00) 		0.201
(1.00) 		0.907
(1.00) 		0.51
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
HTR2C 21 (7%) 267 0.539
(1.00) 		0.132
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.962
(1.00) 		0.877
(1.00) 		0.494
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(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.359
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(1.00) 		0.96
(1.00) 		0.243
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
INPP5D 26 (9%) 262 0.22
(1.00) 		0.232
(1.00) 		0.959
(1.00) 		0.849
(1.00) 		0.0876
(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.868
(1.00) 		0.378
(1.00) 		0.76
(1.00) 		0.549
(1.00) 		0.113
(1.00) 		0.138
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MAP3K5 19 (7%) 269 0.593
(1.00) 		0.875
(1.00) 		0.603
(1.00) 		0.406
(1.00) 		0.546
(1.00) 		0.497
(1.00) 		0.563
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.0496
(0.985) 		0.0731
(1.00) 		0.851
(1.00) 		0.0128
(0.899) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ITGB3 20 (7%) 268 0.163
(1.00) 		0.564
(1.00) 		0.51
(1.00) 		1
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.348
(1.00) 		0.61
(1.00) 		1
(1.00) 		0.313
(1.00) 		0.0886
(1.00) 		0.778
(1.00) 		0.149
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
HEPACAM2 15 (5%) 273 0.528
(1.00) 		0.263
(1.00) 		0.87
(1.00) 		0.0552
(0.99) 		0.374
(1.00) 		0.521
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.103
(1.00) 		0.583
(1.00) 		0.056
(0.99) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NMS 13 (5%) 275 0.826
(1.00) 		0.979
(1.00) 		0.0597
(0.992) 		0.634
(1.00) 		0.104
(1.00) 		0.0505
(0.985) 		0.606
(1.00) 		0.576
(1.00) 		1
(1.00) 		0.214
(1.00) 		0.435
(1.00) 		0.247
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CD86 21 (7%) 267 0.816
(1.00) 		0.747
(1.00) 		0.013
(0.899) 		0.507
(1.00) 		0.282
(1.00) 		0.377
(1.00) 		0.484
(1.00) 		0.623
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.564
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.207
(1.00)
BTK 15 (5%) 273 0.657
(1.00) 		0.169
(1.00) 		0.278
(1.00) 		0.473
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.302
(1.00) 		0.81
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.717
(1.00) 		0.0277
(0.985) 		0.19
(1.00) 		0.0973
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PDK4 7 (2%) 281 0.244
(1.00) 		0.0992
(1.00) 		0.258
(1.00) 		0.875
(1.00) 		0.293
(1.00) 		0.659
(1.00) 		0.0345
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.21
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MAN1A1 15 (5%) 273 0.929
(1.00) 		0.919
(1.00) 		0.0166
(0.973) 		0.718
(1.00) 		0.495
(1.00) 		0.938
(1.00) 		0.203
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.702
(1.00) 		0.0277
(0.985) 		0.784
(1.00) 		0.056
(0.99) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CSN3 4 (1%) 284 0.252
(1.00) 		0.0899
(1.00) 		0.251
(1.00) 		0.493
(1.00) 		0.617
(1.00) 		0.261
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.514
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0319
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZNF589 3 (1%) 285 0.5
(1.00) 		0.272
(1.00) 		0.748
(1.00) 		0.129
(1.00) 		1
(1.00) 		0.514
(1.00) 		0.332
(1.00) 		0.294
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
THEMIS 33 (11%) 255 0.769
(1.00) 		0.871
(1.00) 		0.0924
(1.00) 		0.98
(1.00) 		0.67
(1.00) 		0.898
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.274
(1.00) 		0.909
(1.00) 		0.252
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TCHHL1 38 (13%) 250 0.399
(1.00) 		0.239
(1.00) 		0.127
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(1.00) 		0.0474
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(1.00) 		0.36
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(1.00) 		0.0129
(0.899) 		0.289
(1.00) 		0.0769
(1.00) 		0.475
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ELOVL3 5 (2%) 283 0.124
(1.00) 		0.618
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.236
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(1.00) 		0.763
(1.00) 		0.638
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.331
(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ACO1 8 (3%) 280 0.683
(1.00) 		0.976
(1.00) 		0.942
(1.00) 		0.892
(1.00) 		0.978
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.306
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.758
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.0824
(1.00)
RPL5 7 (2%) 281 0.179
(1.00) 		0.158
(1.00) 		0.957
(1.00) 		0.265
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.541
(1.00) 		0.318
(1.00) 		1
(1.00) 		0.399
(1.00) 		1
(1.00) 		0.906
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
USP9X 16 (6%) 272 0.655
(1.00) 		0.405
(1.00) 		0.463
(1.00) 		0.418
(1.00) 		0.815
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(1.00) 		0.862
(1.00) 		1
(1.00) 		0.475
(1.00) 		0.434
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.604
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
COL4A3 36 (12%) 252 0.176
(1.00) 		0.0661
(1.00) 		0.352
(1.00) 		0.57
(1.00) 		0.325
(1.00) 		0.576
(1.00) 		0.312
(1.00) 		0.704
(1.00) 		0.595
(1.00) 		0.1
(1.00) 		0.813
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
UBE2V2 3 (1%) 285 0.697
(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.503
(1.00) 		0.258
(1.00) 		0.27
(1.00) 		0.831
(1.00) 		1
(1.00) 		0.514
(1.00) 		1
(1.00) 		0.32
(1.00) 		0.294
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CCDC38 13 (5%) 275 0.0689
(1.00) 		0.991
(1.00) 		0.373
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(1.00) 		0.906
(1.00) 		0.331
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(1.00) 		0.717
(1.00) 		0.671
(1.00) 		0.947
(1.00) 		0.383
(1.00) 		1
(1.00) 		0.132
(1.00)
C10ORF118 7 (2%) 281 0.825
(1.00) 		0.111
(1.00) 		0.779
(1.00) 		0.207
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(1.00) 		0.862
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.898
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
POLR2B 10 (3%) 278 0.453
(1.00) 		0.55
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.16
(1.00) 		1
(1.00) 		0.184
(1.00) 		0.0152
(0.928) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DGKI 32 (11%) 256 0.193
(1.00) 		0.235
(1.00) 		0.369
(1.00) 		0.809
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(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.335
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.445
(1.00) 		0.51
(1.00) 		1
(1.00)
SNRK 10 (3%) 278 0.382
(1.00) 		0.386
(1.00) 		0.595
(1.00) 		1
(1.00) 		0.921
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(1.00) 		0.446
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(1.00) 		0.117
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PTPRT 85 (30%) 203 0.012
(0.899) 		0.0256
(0.985) 		0.904
(1.00) 		0.386
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.31
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(1.00) 		1
(1.00)
MYH1 69 (24%) 219 0.0971
(1.00) 		0.152
(1.00) 		0.55
(1.00) 		0.819
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(1.00) 		0.264
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(0.866) 		0.498
(1.00) 		0.555
(1.00)
ZNF595 8 (3%) 280 0.163
(1.00) 		0.0547
(0.99) 		0.531
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.896
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.804
(1.00) 		0.714
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OR51S1 30 (10%) 258 0.28
(1.00) 		0.701
(1.00) 		0.24
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(1.00) 		1
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CABP7 5 (2%) 283 0.00587
(0.866) 		0.00352
(0.866) 		0.125
(1.00) 		0.236
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(1.00) 		0.0147
(0.928) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.284
(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DSP 59 (20%) 229 0.383
(1.00) 		0.38
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.401
(1.00) 		0.98
(1.00) 		0.494
(1.00) 		1
(1.00) 		0.457
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.787
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.672
(1.00) 		0.497
(1.00)
AMPD3 22 (8%) 266 0.783
(1.00) 		0.965
(1.00) 		0.0663
(1.00) 		1
(1.00) 		0.162
(1.00) 		0.0795
(1.00) 		0.701
(1.00) 		1
(1.00) 		0.564
(1.00) 		0.498
(1.00) 		0.376
(1.00) 		0.365
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NUDT4 5 (2%) 283 0.999
(1.00) 		0.509
(1.00) 		0.45
(1.00) 		0.289
(1.00) 		0.049
(0.985) 		0.363
(1.00) 		0.274
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		1
(1.00) 		0.209
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
UPB1 13 (5%) 275 0.107
(1.00) 		0.0585
(0.992) 		0.608
(1.00) 		0.116
(1.00) 		0.887
(1.00) 		0.497
(1.00) 		0.394
(1.00) 		0.168
(1.00) 		0.0847
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0635
(1.00) 		0.383
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CEBPZ 3 (1%) 285 0.242
(1.00) 		0.482
(1.00) 		0.0551
(0.99) 		0.764
(1.00) 		0.453
(1.00) 		1
(1.00) 		0.514
(1.00) 		1
(1.00) 		0.558
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PTPRF 27 (9%) 261 0.952
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.84
(1.00) 		0.685
(1.00) 		0.495
(1.00) 		0.5
(1.00) 		0.384
(1.00) 		1
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.759
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.412
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GTPBP4 8 (3%) 280 0.182
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.873
(1.00) 		0.576
(1.00) 		0.107
(1.00) 		0.248
(1.00) 		0.1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0804
(1.00) 		0.264
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.027
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DDX4 13 (5%) 275 0.0831
(1.00) 		0.00654
(0.866) 		0.0626
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.0958
(1.00) 		0.0476
(0.985) 		0.969
(1.00) 		0.191
(1.00) 		0.227
(1.00) 		1
(1.00) 		0.207
(1.00) 		0.383
(1.00) 		0.245
(1.00) 		0.132
(1.00)
UGT1A3 14 (5%) 274 0.713
(1.00) 		0.254
(1.00) 		0.486
(1.00) 		0.22
(1.00) 		0.463
(1.00) 		0.755
(1.00) 		0.549
(1.00) 		0.547
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.0203
(0.985) 		0.573
(1.00) 		0.0204
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MIOX 6 (2%) 282 0.756
(1.00) 		0.211
(1.00) 		0.385
(1.00) 		0.882
(1.00) 		0.797
(1.00) 		0.613
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		1
(1.00) 		0.865
(1.00) 		0.416
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PEX6 6 (2%) 282 0.312
(1.00) 		0.526
(1.00) 		0.0447
(0.985) 		0.117
(1.00) 		0.271
(1.00) 		0.511
(1.00) 		0.912
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		0.556
(1.00) 		0.287
(1.00) 		0.087
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MYH7 43 (15%) 245 0.453
(1.00) 		0.564
(1.00) 		0.123
(1.00) 		0.0463
(0.985) 		0.956
(1.00) 		0.649
(1.00) 		0.814
(1.00) 		1
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.803
(1.00) 		0.55
(1.00) 		0.175
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ASB5 12 (4%) 276 0.245
(1.00) 		0.373
(1.00) 		0.363
(1.00) 		0.166
(1.00) 		0.44
(1.00) 		0.261
(1.00) 		0.144
(1.00) 		1
(1.00) 		0.274
(1.00) 		0.373
(1.00) 		0.987
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GSDMC 15 (5%) 273 0.198
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.261
(1.00) 		0.0366
(0.985) 		0.95
(1.00) 		0.0438
(0.985) 		0.166
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.76
(1.00) 		0.229
(1.00) 		0.0348
(0.985) 		0.792
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
HLA-DRA 13 (5%) 275 0.73
(1.00) 		0.241
(1.00) 		0.483
(1.00) 		0.715
(1.00) 		0.823
(1.00) 		0.375
(1.00) 		0.968
(1.00) 		1
(1.00) 		0.702
(1.00) 		1
(1.00) 		0.555
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.132
(1.00)
OR11H12 15 (5%) 273 0.387
(1.00) 		0.832
(1.00) 		0.0978
(1.00) 		1
(1.00) 		0.93
(1.00) 		0.101
(1.00) 		0.67
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.577
(1.00) 		0.792
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TPTE 64 (22%) 224 0.449
(1.00) 		0.306
(1.00) 		0.0805
(1.00) 		0.768
(1.00) 		0.588
(1.00) 		0.739
(1.00) 		0.269
(1.00) 		0.378
(1.00) 		0.858
(1.00) 		1
(1.00) 		0.832
(1.00) 		0.384
(1.00) 		0.679
(1.00) 		0.53
(1.00)
ASTN1 45 (16%) 243 0.205
(1.00) 		0.777
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.755
(1.00) 		0.0597
(0.992) 		0.477
(1.00) 		0.546
(1.00) 		0.299
(1.00) 		0.0174
(0.985) 		0.0472
(0.985) 		0.877
(1.00) 		0.0644
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KRAS 6 (2%) 282 0.324
(1.00) 		0.0998
(1.00) 		0.254
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.624
(1.00) 		0.337
(1.00) 		0.861
(1.00) 		1
(1.00) 		0.306
(1.00) 		1
(1.00) 		0.109
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZZZ3 3 (1%) 285 0.023
(0.985) 		0.258
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.0101
(0.899) 		0.238
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.0191
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.236
(1.00) 		0.558
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DHX37 13 (5%) 275 0.338
(1.00) 		0.255
(1.00) 		0.76
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.502
(1.00) 		0.637
(1.00) 		0.941
(1.00) 		1
(1.00) 		0.313
(1.00) 		1
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.383
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NTN4 15 (5%) 273 0.894
(1.00) 		0.909
(1.00) 		0.292
(1.00) 		0.759
(1.00) 		0.291
(1.00) 		0.325
(1.00) 		0.47
(1.00) 		1
(1.00) 		0.702
(1.00) 		1
(1.00) 		0.484
(1.00) 		0.426
(1.00) 		1
(1.00) 		0.151
(1.00)
ACD 10 (3%) 278 0.762
(1.00) 		0.64
(1.00) 		0.631
(1.00) 		0.038
(0.985) 		0.237
(1.00) 		0.194
(1.00) 		0.437
(1.00) 		1
(1.00) 		0.243
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0153
(0.928) 		0.33
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
UBL7 10 (3%) 278 0.526
(1.00) 		0.983
(1.00) 		0.647
(1.00) 		0.909
(1.00) 		0.533
(1.00) 		1
(1.00) 		0.312
(1.00) 		0.481
(1.00) 		0.689
(1.00) 		1
(1.00) 		0.927
(1.00) 		0.748
(1.00) 		1
(1.00) 		0.102
(1.00)
GNA11 8 (3%) 280 0.788
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.0689
(1.00) 		0.0732
(1.00) 		0.0991
(1.00) 		0.241
(1.00) 		0.613
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		1
(1.00) 		0.675
(1.00) 		0.479
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SF3B1 14 (5%) 274 0.42
(1.00) 		0.745
(1.00) 		0.158
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.727
(1.00) 		0.678
(1.00) 		0.29
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.691
(1.00) 		0.464
(1.00) 		0.779
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OR4M1 33 (11%) 255 0.6
(1.00) 		0.915
(1.00) 		0.0848
(1.00) 		0.787
(1.00) 		0.825
(1.00) 		0.522
(1.00) 		0.66
(1.00) 		0.703
(1.00) 		1
(1.00) 		0.156
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.0206
(0.985) 		1
(1.00) 		0.311
(1.00)
DPYD 55 (19%) 233 0.79
(1.00) 		0.768
(1.00) 		0.239
(1.00) 		0.89
(1.00) 		0.0671
(1.00) 		0.22
(1.00) 		0.0363
(0.985) 		0.539
(1.00) 		0.304
(1.00) 		0.366
(1.00) 		0.137
(1.00) 		0.09
(1.00) 		0.666
(1.00) 		0.477
(1.00)
CAMK1D 14 (5%) 274 0.592
(1.00) 		0.0153
(0.928) 		0.531
(1.00) 		0.741
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.536
(1.00) 		0.659
(1.00) 		0.576
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.0831
(1.00) 		0.616
(1.00) 		0.089
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RUNX1T1 36 (12%) 252 0.227
(1.00) 		0.438
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.103
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.681
(1.00) 		0.496
(1.00) 		1
(1.00) 		0.289
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.536
(1.00) 		0.00551
(0.866) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NFATC4 17 (6%) 271 0.267
(1.00) 		0.178
(1.00) 		0.163
(1.00) 		0.0523
(0.99) 		0.628
(1.00) 		0.0539
(0.99) 		0.197
(1.00) 		1
(1.00) 		0.74
(1.00) 		1
(1.00) 		0.293
(1.00) 		0.609
(1.00) 		1
(1.00) 		0.17
(1.00)
C2ORF16 28 (10%) 260 0.598
(1.00) 		0.66
(1.00) 		0.0395
(0.985) 		0.5
(1.00) 		0.179
(1.00) 		0.583
(1.00) 		0.0699
(1.00) 		0.67
(1.00) 		0.126
(1.00) 		0.0634
(1.00) 		0.552
(1.00) 		0.00717
(0.866) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ALDH5A1 10 (3%) 278 0.493
(1.00) 		0.549
(1.00) 		0.24
(1.00) 		1
(1.00) 		0.195
(1.00) 		0.552
(1.00) 		0.528
(1.00) 		1
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.619
(1.00) 		0.275
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KCNB2 58 (20%) 230 0.598
(1.00) 		0.448
(1.00) 		0.341
(1.00) 		0.886
(1.00) 		0.0125
(0.899) 		0.26
(1.00) 		0.423
(1.00) 		0.211
(1.00) 		0.861
(1.00) 		0.381
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.29
(1.00) 		1
(1.00) 		0.484
(1.00)
NAP1L2 25 (9%) 263 0.014
(0.928) 		0.158
(1.00) 		0.0516
(0.99) 		0.483
(1.00) 		0.973
(1.00) 		0.889
(1.00) 		0.301
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.219
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.83
(1.00) 		1
(1.00) 		0.242
(1.00)
C3 36 (12%) 252 0.765
(1.00) 		0.59
(1.00) 		0.17
(1.00) 		0.418
(1.00) 		0.254
(1.00) 		0.813
(1.00) 		0.171
(1.00) 		1
(1.00) 		0.616
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.994
(1.00) 		0.0447
(0.985) 		0.556
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00) 		1
(1.00)
PLS1 13 (5%) 275 0.156
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(1.00) 		1
(1.00)
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(0.985) 		0.0528
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(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		0.246
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(1.00) 		1
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		0.673
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(1.00) 		1
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(1.00) 		1
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(1.00)
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(1.00) 		0.408
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(1.00) 		0.406
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00) 		0.302
(1.00)
ANO7 11 (4%) 277 0.34
(1.00) 		0.49
(1.00) 		0.945
(1.00) 		0.0714
(1.00) 		0.908
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.828
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0804
(1.00) 		0.634
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.00806
(0.894) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
LUZP1 6 (2%) 282 0.777
(1.00) 		0.775
(1.00) 		0.589
(1.00) 		0.118
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.63
(1.00) 		0.864
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.678
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
HTR7 11 (4%) 277 0.708
(1.00) 		0.425
(1.00) 		0.957
(1.00) 		0.3
(1.00) 		0.182
(1.00) 		0.332
(1.00) 		0.799
(1.00) 		1
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.634
(1.00) 		0.197
(1.00) 		0.108
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ADAM33 16 (6%) 272 0.164
(1.00) 		0.284
(1.00) 		0.946
(1.00) 		0.0333
(0.985) 		0.0952
(1.00) 		0.337
(1.00) 		0.122
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.126
(1.00) 		0.442
(1.00) 		0.792
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MYL2 9 (3%) 279 0.823
(1.00) 		0.629
(1.00) 		0.934
(1.00) 		0.323
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.358
(1.00) 		1
(1.00) 		0.446
(1.00) 		0.514
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0722
(1.00) 		0.491
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RNF133 9 (3%) 279 0.208
(1.00) 		0.614
(1.00) 		0.301
(1.00) 		0.678
(1.00) 		0.962
(1.00) 		0.61
(1.00) 		0.54
(1.00) 		0.367
(1.00) 		1
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.417
(1.00) 		0.491
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ART3 12 (4%) 276 0.392
(1.00) 		0.375
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.933
(1.00) 		0.0395
(0.985) 		0.214
(1.00) 		0.475
(1.00) 		1
(1.00) 		0.702
(1.00) 		0.652
(1.00) 		0.519
(1.00) 		0.768
(1.00) 		1
(1.00) 		0.122
(1.00)
SPRYD3 8 (3%) 280 0.681
(1.00) 		0.465
(1.00) 		0.574
(1.00) 		0.196
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.407
(1.00) 		0.65
(1.00) 		1
(1.00) 		0.741
(1.00) 		0.266
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
HFE2 12 (4%) 276 0.283
(1.00) 		0.219
(1.00) 		0.428
(1.00) 		0.218
(1.00) 		0.839
(1.00) 		0.184
(1.00) 		0.618
(1.00) 		0.515
(1.00) 		0.0826
(1.00) 		1
(1.00) 		0.907
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ANKRD11 28 (10%) 260 0.603
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.786
(1.00) 		0.372
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.146
(1.00) 		1
(1.00) 		0.391
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.652
(1.00) 		0.0244
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TTBK2 15 (5%) 273 0.449
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.815
(1.00) 		0.298
(1.00) 		0.651
(1.00) 		0.755
(1.00) 		0.672
(1.00) 		1
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.0277
(0.985) 		0.475
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MIIP 10 (3%) 278 0.582
(1.00) 		0.33
(1.00) 		0.142
(1.00) 		0.46
(1.00) 		0.753
(1.00) 		0.538
(1.00) 		0.363
(1.00) 		0.367
(1.00) 		0.568
(1.00) 		0.00375
(0.866) 		0.49
(1.00) 		0.51
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DDR1 16 (6%) 272 0.155
(1.00) 		0.417
(1.00) 		0.499
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.909
(1.00) 		0.752
(1.00) 		0.315
(1.00) 		0.609
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.805
(1.00) 		0.604
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
FAM26F 5 (2%) 283 0.296
(1.00) 		0.419
(1.00) 		0.207
(1.00) 		0.365
(1.00) 		0.435
(1.00) 		0.553
(1.00) 		0.0839
(1.00) 		0.278
(1.00) 		1
(1.00) 		0.12
(1.00) 		0.16
(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CRIPT 3 (1%) 285 0.983
(1.00) 		0.0462
(0.985) 		0.0275
(0.985) 		0.737
(1.00) 		1
(1.00) 		0.28
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.315
(1.00) 		0.558
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PRKRIR 10 (3%) 278 0.0871
(1.00) 		0.0431
(0.985) 		0.917
(1.00) 		0.0296
(0.985) 		0.513
(1.00) 		0.153
(1.00) 		0.579
(1.00) 		1
(1.00) 		0.227
(1.00) 		1
(1.00) 		0.132
(1.00) 		0.51
(1.00) 		1
(1.00) 		0.102
(1.00)
PTPRB 62 (22%) 226 0.366
(1.00) 		0.29
(1.00) 		0.00356
(0.866) 		0.74
(1.00) 		0.88
(1.00) 		0.365
(1.00) 		0.338
(1.00) 		0.132
(1.00) 		0.599
(1.00) 		0.665
(1.00) 		0.239
(1.00) 		0.658
(1.00) 		1
(1.00) 		0.517
(1.00)
ITPR2 16 (6%) 272 0.0573
(0.992) 		0.126
(1.00) 		0.498
(1.00) 		0.387
(1.00) 		0.616
(1.00) 		0.393
(1.00) 		0.0978
(1.00) 		0.609
(1.00) 		1
(1.00) 		0.126
(1.00) 		0.797
(1.00) 		0.792
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TIGIT 5 (2%) 283 0.777
(1.00) 		0.378
(1.00) 		0.853
(1.00) 		1
(1.00) 		0.722
(1.00) 		0.799
(1.00) 		0.429
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.532
(1.00) 		0.161
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PARP9 13 (5%) 275 0.44
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.153
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.025
(0.985) 		0.104
(1.00) 		0.3
(1.00) 		1
(1.00) 		0.529
(1.00) 		1
(1.00) 		0.136
(1.00) 		0.0358
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PRKD3 7 (2%) 281 0.208
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.698
(1.00) 		0.0876
(1.00) 		0.799
(1.00) 		0.383
(1.00) 		0.7
(1.00) 		1
(1.00) 		0.568
(1.00) 		1
(1.00) 		0.136
(1.00) 		0.0479
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SCN10A 67 (23%) 221 0.623
(1.00) 		0.981
(1.00) 		0.738
(1.00) 		0.671
(1.00) 		0.0848
(1.00) 		0.589
(1.00) 		0.907
(1.00) 		0.132
(1.00) 		0.0431
(0.985) 		0.834
(1.00) 		0.183
(1.00) 		0.00383
(0.866) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CALU 7 (2%) 281 0.0031
(0.866) 		0.149
(1.00) 		1
(1.00) 		0.604
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.76
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.962
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SCAI 5 (2%) 283 0.0132
(0.899) 		0.572
(1.00) 		0.291
(1.00) 		0.696
(1.00) 		0.463
(1.00) 		0.783
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.775
(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IGFL3 4 (1%) 284 0.101
(1.00) 		0.47
(1.00) 		0.791
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.139
(1.00) 		0.694
(1.00) 		0.229
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.343
(1.00) 		0.301
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZMYM1 13 (5%) 275 0.577
(1.00) 		0.0744
(1.00) 		0.311
(1.00) 		0.816
(1.00) 		0.873
(1.00) 		1
(1.00) 		0.946
(1.00) 		0.576
(1.00) 		0.76
(1.00) 		1
(1.00) 		0.827
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MYO5B 44 (15%) 244 0.845
(1.00) 		0.672
(1.00) 		0.447
(1.00) 		0.0253
(0.985) 		0.747
(1.00) 		0.848
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.738
(1.00) 		0.832
(1.00) 		0.806
(1.00) 		0.222
(1.00) 		0.0287
(0.985) 		1
(1.00) 		0.398
(1.00)
STK31 37 (13%) 251 0.617
(1.00) 		0.891
(1.00) 		0.97
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.273
(1.00) 		0.305
(1.00) 		0.149
(1.00) 		1
(1.00) 		0.246
(1.00) 		0.105
(1.00) 		0.432
(1.00) 		0.203
(1.00) 		0.564
(1.00) 		0.343
(1.00)
PCDH18 50 (17%) 238 0.713
(1.00) 		0.819
(1.00) 		0.907
(1.00) 		0.777
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.451
(1.00) 		0.415
(1.00) 		0.745
(1.00) 		0.838
(1.00) 		0.238
(1.00) 		0.974
(1.00) 		0.0363
(0.985) 		0.66
(1.00) 		0.442
(1.00)
SPATA8 13 (5%) 275 0.47
(1.00) 		0.48
(1.00) 		0.0271
(0.985) 		1
(1.00) 		0.517
(1.00) 		0.694
(1.00) 		0.434
(1.00) 		0.547
(1.00) 		1
(1.00) 		0.671
(1.00) 		0.615
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IBTK 5 (2%) 283 0.246
(1.00) 		0.34
(1.00) 		1
(1.00) 		0.815
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.912
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.246
(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AHNAK 41 (14%) 247 0.949
(1.00) 		0.805
(1.00) 		0.134
(1.00) 		0.228
(1.00) 		0.582
(1.00) 		0.0132
(0.899) 		0.512
(1.00) 		0.483
(1.00) 		0.843
(1.00) 		0.443
(1.00) 		0.768
(1.00) 		0.487
(1.00) 		1
(1.00) 		0.367
(1.00)
PPP1R13L 14 (5%) 274 0.161
(1.00) 		0.428
(1.00) 		0.633
(1.00) 		0.0259
(0.985) 		0.424
(1.00) 		0.919
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		0.74
(1.00) 		1
(1.00) 		0.704
(1.00) 		0.264
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PRM2 5 (2%) 283 0.547
(1.00) 		0.423
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.389
(1.00) 		0.695
(1.00) 		0.229
(1.00) 		0.000968
(0.576) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AFP 17 (6%) 271 0.831
(1.00) 		0.816
(1.00) 		0.228
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.722
(1.00) 		0.378
(1.00) 		0.621
(1.00) 		0.61
(1.00) 		1
(1.00) 		0.705
(1.00) 		0.128
(1.00) 		0.12
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SNCAIP 52 (18%) 236 0.815
(1.00) 		0.901
(1.00) 		0.589
(1.00) 		0.433
(1.00) 		0.845
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.879
(1.00) 		0.33
(1.00) 		0.436
(1.00) 		0.252
(1.00) 		0.184
(1.00) 		0.343
(1.00) 		0.663
(1.00) 		1
(1.00)
DDHD1 6 (2%) 282 0.0743
(1.00) 		0.0107
(0.899) 		0.498
(1.00) 		0.058
(0.992) 		0.736
(1.00) 		0.667
(1.00) 		0.613
(1.00) 		1
(1.00) 		0.646
(1.00) 		0.556
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.416
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PLXNC1 17 (6%) 271 0.597
(1.00) 		0.439
(1.00) 		0.108
(1.00) 		0.786
(1.00) 		0.259
(1.00) 		0.833
(1.00) 		0.846
(1.00) 		1
(1.00) 		0.742
(1.00) 		1
(1.00) 		0.742
(1.00) 		0.304
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TEC 13 (5%) 275 0.142
(1.00) 		0.301
(1.00) 		0.105
(1.00) 		0.634
(1.00) 		0.649
(1.00) 		0.842
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.168
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0652
(1.00) 		0.687
(1.00) 		0.383
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SYNE1 74 (26%) 214 0.301
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.779
(1.00) 		0.405
(1.00) 		0.43
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(1.00) 		0.013
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(1.00) 		0.211
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(1.00) 		0.163
(1.00)
ACBD5 5 (2%) 283 0.726
(1.00) 		0.44
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.0712
(1.00) 		0.829
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.37
(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0521
(0.99)
NOMO1 16 (6%) 272 0.334
(1.00) 		0.364
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(1.00) 		0.0311
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.102
(1.00) 		0.426
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CD2 21 (7%) 267 0.251
(1.00) 		0.125
(1.00) 		0.43
(1.00) 		0.627
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(1.00) 		0.735
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
POLN 10 (3%) 278 0.88
(1.00) 		0.657
(1.00) 		0.0158
(0.938) 		0.176
(1.00) 		0.792
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(1.00) 		0.481
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.619
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
LIPH 12 (4%) 276 0.734
(1.00) 		0.624
(1.00) 		0.0737
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.706
(1.00) 		0.221
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CLCN6 12 (4%) 276 0.158
(1.00) 		0.211
(1.00) 		0.178
(1.00) 		0.573
(1.00) 		0.189
(1.00) 		0.066
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.162
(1.00) 		0.652
(1.00) 		0.951
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NEK5 17 (6%) 271 0.849
(1.00) 		0.738
(1.00) 		0.165
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(1.00) 		0.834
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.705
(1.00) 		0.559
(1.00) 		0.799
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
BRF1 4 (1%) 284 0.0558
(0.99) 		0.676
(1.00) 		1
(1.00) 		0.457
(1.00) 		1
(1.00) 		0.271
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(1.00) 		0.15
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GRIN1 10 (3%) 278 0.559
(1.00) 		0.143
(1.00) 		0.00617
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(0.866) 		0.74
(1.00) 		0.255
(1.00) 		0.958
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.619
(1.00) 		0.293
(1.00) 		0.0962
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
POLA2 8 (3%) 280 0.277
(1.00) 		0.891
(1.00) 		0.337
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.0766
(1.00) 		0.952
(1.00) 		0.567
(1.00) 		1
(1.00) 		0.689
(1.00) 		1
(1.00) 		0.765
(1.00) 		0.714
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
UBR5 21 (7%) 267 0.133
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.751
(1.00) 		0.477
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.0769
(1.00) 		1
(1.00) 		0.693
(1.00) 		0.0327
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AP2B1 8 (3%) 280 0.495
(1.00) 		0.388
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(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.264
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.714
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MMP11 7 (2%) 281 0.932
(1.00) 		0.555
(1.00) 		0.245
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(1.00) 		0.324
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.325
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
EDN1 9 (3%) 279 0.664
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.187
(1.00) 		0.9
(1.00) 		0.749
(1.00) 		0.695
(1.00) 		0.947
(1.00) 		1
(1.00) 		0.689
(1.00) 		1
(1.00) 		0.406
(1.00) 		0.16
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
WNT8A 7 (2%) 281 0.824
(1.00) 		0.409
(1.00) 		0.513
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(1.00) 		0.605
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.852
(1.00) 		0.0479
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MYF5 14 (5%) 274 0.155
(1.00) 		0.151
(1.00) 		0.0253
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(1.00) 		1
(1.00)
PLOD1 6 (2%) 282 0.133
(1.00) 		0.522
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(1.00)
UGT1A10 15 (5%) 273 0.414
(1.00) 		0.232
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(1.00) 		1
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.462
(1.00) 		0.056
(0.99) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
WDR86 7 (2%) 281 0.453
(1.00) 		0.729
(1.00) 		0.532
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(1.00) 		0.323
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.505
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GLB1L 4 (1%) 284 0.484
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.49
(1.00) 		0.549
(1.00) 		0.563
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.417
(1.00) 		0.301
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TP63 50 (17%) 238 0.0466
(0.985) 		0.0914
(1.00) 		0.753
(1.00) 		0.134
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.48
(1.00) 		0.0436
(0.985) 		0.263
(1.00) 		0.66
(1.00) 		0.442
(1.00)
TLL1 57 (20%) 231 0.703
(1.00) 		0.674
(1.00) 		0.000898
(0.576) 		0.21
(1.00) 		0.287
(1.00) 		0.217
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(1.00) 		0.538
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.143
(1.00) 		0.126
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.491
(1.00)
SOCS5 8 (3%) 280 0.448
(1.00) 		0.144
(1.00) 		0.483
(1.00) 		0.711
(1.00) 		0.851
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(1.00) 		0.654
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.264
(1.00) 		0.821
(1.00) 		0.266
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
VGLL1 6 (2%) 282 0.718
(1.00) 		0.944
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(1.00) 		0.733
(1.00) 		0.921
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.247
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.166
(1.00) 		0.416
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DMGDH 15 (5%) 273 0.0447
(0.985) 		0.158
(1.00) 		0.945
(1.00) 		0.406
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.215
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(0.99) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
EEF1A1 7 (2%) 281 0.64
(1.00) 		0.739
(1.00) 		0.313
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(1.00) 		0.0712
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.928
(1.00) 		0.715
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PDLIM5 10 (3%) 278 0.519
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.665
(1.00) 		0.909
(1.00) 		0.0904
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(1.00) 		1
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.00543
(0.866) 		0.0962
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		0.899
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(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.908
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(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
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(1.00) 		0.5
(1.00) 		0.0347
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0831
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(1.00) 		0.089
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(1.00)
PAPPA2 79 (27%) 209 0.37
(1.00) 		0.323
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(1.00) 		1
(1.00)
GSTM5 7 (2%) 281 0.397
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.426
(1.00) 		0.453
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.625
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(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DNAJC5G 7 (2%) 281 0.538
(1.00) 		0.223
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(1.00) 		1
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(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CHD2 19 (7%) 269 0.506
(1.00) 		0.614
(1.00) 		0.115
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(1.00) 		0.0878
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(1.00) 		0.0502
(0.985) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
VPS33A 10 (3%) 278 0.875
(1.00) 		0.58
(1.00) 		0.81
(1.00) 		0.108
(1.00) 		0.403
(1.00) 		0.056
(0.99) 		0.0642
(1.00) 		0.446
(1.00) 		1
(1.00) 		0.364
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.748
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
VSX1 5 (2%) 283 0.0439
(0.985) 		0.463
(1.00) 		0.204
(1.00) 		0.0382
(0.985) 		0.123
(1.00) 		0.897
(1.00) 		0.611
(1.00) 		0.278
(1.00) 		0.514
(1.00) 		1
(1.00) 		0.771
(1.00) 		0.161
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SPAG1 11 (4%) 277 0.145
(1.00) 		0.362
(1.00) 		0.624
(1.00) 		0.337
(1.00) 		0.296
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.544
(1.00) 		0.481
(1.00) 		0.0804
(1.00) 		0.147
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MIA2 5 (2%) 283 0.479
(1.00) 		0.314
(1.00) 		0.332
(1.00) 		0.288
(1.00) 		0.667
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.278
(1.00) 		1
(1.00) 		0.491
(1.00) 		0.793
(1.00) 		0.161
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
'NF1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 2.27e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.081

Table S1.  Gene #5: 'NF1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 283 55.9 (15.6)
NF1 MUTATED 38 65.9 (12.9)
NF1 WILD-TYPE 245 54.3 (15.4)

Figure S1.  Get High-res Image Gene #5: 'NF1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'YEARS_TO_BIRTH'

Methods & Data
Input

  • Mutation data file = sample_sig_gene_table.txt from Mutsig_2CV pipeline

  • Processed Mutation data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/GDAC_Correlate_Genomic_Events_Preprocess/SKCM-TM/15234032/transformed.cor.cli.txt

  • Clinical data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/Append_Data/SKCM-TM/15087681/SKCM-TM.merged_data.txt

  • Number of patients = 288

  • Number of significantly mutated genes = 255

  • Number of selected clinical features = 14

  • Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3

Survival analysis

For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R

Fisher's exact test

For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R

Q value calculation

For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.

Download Results

In addition to the links below, the full results of the analysis summarized in this report can also be downloaded programmatically using firehose_get, or interactively from either the Broad GDAC website or TCGA Data Coordination Center Portal.

References
[1] Bland and Altman, Statistics notes: The logrank test, BMJ 328(7447):1073 (2004)
[2] Fisher, R.A., On the interpretation of chi-square from contingency tables, and the calculation of P, Journal of the Royal Statistical Society 85(1):87-94 (1922)
[3] Benjamini and Hochberg, Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing, Journal of the Royal Statistical Society Series B 59:289-300 (1995)
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