		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	30 (3%)	852	0.86783	0.916	0.91558	0.955	9.9999e-06	2.34e-05	0.054489	0.0763	0.00164	0.00289	0.00126	0.00226	0.00024	0.000479	9.9999e-06	2.34e-05	0.099869	0.133	0.61468	0.671	0.15727	0.203	0.18686	0.237
1q gain	68 (8%)	814	0.55189	0.611	0.69361	0.748	9.9999e-06	2.34e-05	0.14938	0.195	0.00178	0.00312	0.03589	0.0523	5e-05	0.000108	9.9999e-06	2.34e-05	0.00116	0.0021	0.00248	0.00427	0.16642	0.212	0.0079199	0.0127
2p gain	119 (13%)	763	0.49067	0.551	0.56342	0.62	9.9999e-06	2.34e-05	0.050239	0.0708	0.48189	0.544	0.01768	0.0272	0.00058999	0.00112	4e-05	8.73e-05	0.17223	0.22	0.00074999	0.0014	0.01751	0.027	0.03896	0.0564
2q gain	127 (14%)	755	0.52416	0.586	0.33035	0.388	9.9999e-06	2.34e-05	0.01627	0.0251	0.52157	0.584	0.0060699	0.00978	0.00083999	0.00157	9.9999e-06	2.34e-05	0.21722	0.269	0.00027	0.000536	0.0054099	0.00877	0.0228	0.0344
3p gain	102 (12%)	780	0.00112	0.00203	0.0080899	0.0129	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.26331	0.319	0.01806	0.0276	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
3q gain	158 (18%)	724	0.0077599	0.0124	0.03219	0.0473	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.32102	0.378	0.00456	0.00749	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
4p gain	46 (5%)	836	0.15756	0.203	0.41739	0.478	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.63702	0.693	0.0018	0.00315	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
4q gain	46 (5%)	836	0.29493	0.351	0.64475	0.7	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.5395	0.599	0.00341	0.0057	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
5p gain	237 (27%)	645	0.53866	0.599	0.60561	0.661	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.03387	0.0495	6.9999e-05	0.000147	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
5q gain	248 (28%)	634	0.16591	0.212	0.20792	0.26	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.33351	0.392	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
6p gain	21 (2%)	861	NA	NA	NA	NA	0.068299	0.0932	0.53353	0.594	0.03316	0.0486	0.04669	0.0662	0.93805	0.976	0.00227	0.00391	0.40065	0.462	0.03112	0.046	0.0447	0.0638	0.00273	0.00465
6q gain	16 (2%)	866	NA	NA	NA	NA	0.077389	0.104	0.26553	0.322	0.02965	0.0439	0.17929	0.228	0.87476	0.922	0.03384	0.0495	0.80464	0.856	0.080569	0.108	0.069089	0.094	0.069009	0.094
7p gain	368 (42%)	514	0.090109	0.121	0.10925	0.145	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.01452	0.0225	0.00128	0.00229	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
7q gain	370 (42%)	512	0.089229	0.12	0.10875	0.144	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.01303	0.0204	0.0015	0.00265	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
8p gain	67 (8%)	815	0.29271	0.349	0.47184	0.534	9.9999e-06	2.34e-05	0.00098999	0.00181	0.3083	0.365	0.00272	0.00465	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.20215	0.255	6.9999e-05	0.000147	0.00027	0.000536	2e-05	4.48e-05
8q gain	99 (11%)	783	0.060059	0.0834	0.24104	0.295	9.9999e-06	2.34e-05	0.0055899	0.00902	0.00212	0.00367	0.00057999	0.0011	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.0207	0.0315	0.01203	0.0188	0.00092999	0.00171	3e-05	6.65e-05
9p gain	26 (3%)	856	0.0359	0.0523	0.071769	0.0975	0.077899	0.105	2e-05	4.48e-05	0.72588	0.781	0.56271	0.62	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.212	0.263	9.9999e-06	2.34e-05	0.0013	0.00232	5e-05	0.000108
9q gain	24 (3%)	858	NA	NA	NA	NA	0.0080199	0.0128	2e-05	4.48e-05	0.77006	0.824	0.28323	0.339	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.27211	0.327	9.9999e-06	2.34e-05	0.00070999	0.00133	2e-05	4.48e-05
10p gain	30 (3%)	852	0.15829	0.204	0.42154	0.482	9.9999e-06	2.34e-05	0.01603	0.0248	0.12284	0.162	0.03283	0.0482	0.00135	0.0024	0.00204	0.00355	0.57081	0.627	0.74922	0.803	0.29943	0.355	0.14754	0.193
10q gain	23 (3%)	859	0.051169	0.072	0.11581	0.153	0.00053999	0.00103	0.16398	0.21	0.24192	0.296	0.36653	0.427	0.04696	0.0665	0.04531	0.0646	0.52476	0.586	0.24653	0.301	0.85323	0.903	0.45044	0.513
11p gain	57 (6%)	825	0.28976	0.346	0.81147	0.862	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.55626	0.614	0.12523	0.165	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.31367	0.371	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-05	0.000207	9.9999e-06	2.34e-05
11q gain	55 (6%)	827	0.40605	0.466	0.9124	0.953	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.6908	0.745	0.5516	0.611	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.21485	0.266	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
12p gain	252 (29%)	630	0.01772	0.0272	0.062849	0.0867	9.9999e-06	2.34e-05	2e-05	4.48e-05	0.02955	0.0438	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	4e-05	8.73e-05	2e-05	4.48e-05
12q gain	256 (29%)	626	0.0178	0.0273	0.062019	0.0857	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.01073	0.0169	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	6.9999e-05	0.000147	9.9999e-06	2.34e-05
13q gain	53 (6%)	829	0.2297	0.282	0.29559	0.351	0.058019	0.0811	0.060749	0.0842	0.24635	0.301	0.31035	0.367	0.01617	0.025	0.04877	0.069	0.01108	0.0174	0.00292	0.00494	0.39039	0.453	0.16498	0.211
14q gain	39 (4%)	843	0.74469	0.799	0.74497	0.799	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.74251	0.799	0.00275	0.00467	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00044	0.000846	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
15q gain	52 (6%)	830	0.86872	0.916	0.5538	0.612	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.90126	0.943	0.03142	0.0463	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.16112	0.207	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
16p gain	281 (32%)	601	0.059839	0.0832	0.066119	0.0906	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.0050999	0.00831	0.00052999	0.00101	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
16q gain	268 (30%)	614	0.063179	0.0871	0.058929	0.0821	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00251	0.0043	0.00028	0.000554	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
17p gain	197 (22%)	685	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.04595	0.0654	0.00125	0.00224	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
17q gain	222 (25%)	660	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.1562	0.202	0.00223	0.00385	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
18p gain	54 (6%)	828	0.48924	0.55	0.74951	0.803	0.00212	0.00367	0.00015	0.000306	0.7856	0.837	0.34782	0.407	0.00013	0.000267	5.9999e-05	0.000128	0.02168	0.0329	9.9999e-06	2.34e-05	0.005	0.00817	0.00038	0.000738
18q gain	50 (6%)	832	0.52526	0.586	0.77499	0.828	0.00253	0.00433	0.00014	0.000286	0.68491	0.741	0.29033	0.346	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.03611	0.0525	9.9999e-06	2.34e-05	0.00043	0.000831	2e-05	4.48e-05
19p gain	75 (9%)	807	0.1488	0.194	0.21463	0.266	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.12989	0.171	0.00086999	0.00162	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.46542	0.528	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
19q gain	78 (9%)	804	0.0395	0.0569	0.064039	0.0881	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.04172	0.0598	0.00044	0.000846	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.24957	0.304	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
20p gain	233 (26%)	649	0.0394	0.0568	0.076189	0.103	9.9999e-06	2.34e-05	4e-05	8.73e-05	0.01881	0.0287	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	7.9999e-05	0.000167	9.9999e-06	2.34e-05	0.0052299	0.00851	0.00169	0.00297
20q gain	237 (27%)	645	0.02018	0.0308	0.04945	0.0698	9.9999e-06	2.34e-05	5e-05	0.000108	0.0092899	0.0147	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	5e-05	0.000108	9.9999e-06	2.34e-05	0.0078099	0.0125	0.00302	0.00507
21q gain	73 (8%)	809	0.39642	0.459	0.45181	0.514	9.9999e-06	2.34e-05	0.40586	0.466	0.22502	0.277	0.02628	0.0392	0.00031	0.000608	0.00158	0.00279	0.01413	0.022	0.14745	0.193	0.96642	1	0.13426	0.176
22q gain	64 (7%)	818	0.27916	0.335	0.46342	0.526	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.89288	0.938	0.16038	0.207	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.95716	0.995	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
xp gain	124 (14%)	758	0.0035	0.00583	0.00277	0.0047	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.20341	0.256	0.00297	0.005	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
xq gain	125 (14%)	757	0.00014	0.000286	4e-05	8.73e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.36953	0.43	0.01426	0.0222	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
1p loss	145 (16%)	737	0.00125	0.00224	0.01332	0.0208	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.39715	0.459	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
1q loss	110 (12%)	772	0.0083699	0.0133	0.0081499	0.013	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.92611	0.965	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
2p loss	65 (7%)	817	9.9999e-06	2.34e-05	0.00029	0.000571	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.13986	0.183	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
2q loss	63 (7%)	819	0.00021	0.000422	7.9999e-05	0.000167	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.32241	0.379	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
3p loss	412 (47%)	470	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00087999	0.00163	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
3q loss	124 (14%)	758	0.086129	0.116	0.059049	0.0822	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.86669	0.916	0.00019	0.000383	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	2e-05	4.48e-05	0.00016	0.000324
4p loss	98 (11%)	784	0.57783	0.632	0.48594	0.548	9.9999e-06	2.34e-05	2e-05	4.48e-05	0.02585	0.0387	3e-05	6.65e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00035	0.000682	0.00014	0.000286	0.00094999	0.00174	9.9999e-06	2.34e-05
4q loss	92 (10%)	790	0.49053	0.551	0.6229	0.678	9.9999e-06	2.34e-05	0.00079999	0.00149	0.15294	0.199	0.00011	0.000227	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00137	0.00243	0.00044	0.000846	0.00058999	0.00112	9.9999e-06	2.34e-05
5p loss	24 (3%)	858	NA	NA	NA	NA	7.9999e-05	0.000167	9.9999e-06	2.34e-05	0.03647	0.0529	0.053349	0.0749	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00196	0.00342	9.9999e-06	2.34e-05	6.9999e-05	0.000147	9.9999e-06	2.34e-05
5q loss	22 (2%)	860	NA	NA	NA	NA	3e-05	6.65e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.10072	0.134	0.067029	0.0917	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.0050399	0.00822	9.9999e-06	2.34e-05	5.9999e-05	0.000128	9.9999e-06	2.34e-05
6p loss	172 (20%)	710	0.0025	0.00429	0.00356	0.00592	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00033	0.000644	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.093659	0.125	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
6q loss	206 (23%)	676	0.00311	0.00521	0.00346	0.00577	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00123	0.00222	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.67201	0.727	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
7p loss	4 (0%)	878	NA	NA	NA	NA	0.3968	0.459	0.77805	0.83	0.57106	0.627	0.04097	0.0588	0.20947	0.261	0.18282	0.232	0.22207	0.274	0.20905	0.261	0.26819	0.324	0.066019	0.0906
7q loss	4 (0%)	878	NA	NA	NA	NA	0.39833	0.46	0.78047	0.832	0.57111	0.627	0.04218	0.0603	0.20786	0.26	0.18019	0.229	0.22077	0.273	0.20878	0.261	0.26793	0.324	0.067699	0.0925
8p loss	164 (19%)	718	0.28664	0.343	0.2776	0.333	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.54841	0.608	0.058749	0.082	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
8q loss	87 (10%)	795	0.83546	0.887	0.50406	0.565	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.10768	0.143	0.68811	0.743	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00469	0.00769	9.9999e-06	2.34e-05	0.00017	0.000343	0.00042	0.000814
9p loss	192 (22%)	690	0.01101	0.0173	0.02108	0.0321	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	8.9999e-05	0.000187	3e-05	6.65e-05
9q loss	195 (22%)	687	0.0221	0.0334	0.03912	0.0565	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00011	0.000227	4e-05	8.73e-05
10p loss	131 (15%)	751	0.26034	0.316	0.35914	0.419	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.55947	0.617	9.9999e-05	0.000207	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00029	0.000571	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
10q loss	156 (18%)	726	0.2045	0.257	0.24012	0.294	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.48682	0.548	0.00145	0.00257	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.12653	0.166	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
11p loss	43 (5%)	839	0.03489	0.0509	0.071869	0.0975	5.9999e-05	0.000128	0.02879	0.0428	0.62044	0.676	0.10709	0.143	0.00033	0.000644	2e-05	4.48e-05	0.04663	0.0662	0.00382	0.00634	3e-04	0.000589	4e-05	8.73e-05
11q loss	52 (6%)	830	0.15596	0.202	0.30199	0.358	9.9999e-06	2.34e-05	0.18998	0.24	0.57699	0.632	0.00222	0.00384	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.04048	0.0581	0.02757	0.0411	0.00013	0.000267	3e-05	6.65e-05
12p loss	7 (1%)	875	NA	NA	NA	NA	0.18999	0.24	0.10838	0.144	0.34314	0.402	0.91072	0.952	1	1	0.38057	0.443	0.8924	0.938	0.59471	0.65	0.15385	0.2	0.2689	0.324
12q loss	4 (0%)	878	NA	NA	NA	NA	0.02208	0.0334	NA	NA	0.47159	0.534	0.47349	0.535	0.38742	0.45	0.8952	0.939	0.2761	0.332	1	1	NA	NA	NA	NA
13q loss	137 (16%)	745	0.00296	0.005	0.01134	0.0178	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.075769	0.103	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00066999	0.00126	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
14q loss	265 (30%)	617	6.9999e-05	0.000147	7.9999e-05	0.000167	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
15q loss	69 (8%)	813	0.20746	0.26	0.26628	0.322	9.9999e-06	2.34e-05	0.85216	0.903	0.23496	0.288	0.00091999	0.0017	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.0291	0.0432	0.00173	0.00304	0.00401	0.00663	0.00089999	0.00166
16p loss	18 (2%)	864	NA	NA	NA	NA	0.061059	0.0845	6.9999e-05	0.000147	0.22358	0.276	0.0099199	0.0156	0.00021	0.000422	0.00273	0.00465	0.02791	0.0415	0.20964	0.261	0.00101	0.00184	8.9999e-05	0.000187
16q loss	28 (3%)	854	NA	NA	NA	NA	0.00099999	0.00183	0.0087999	0.0139	0.15229	0.198	0.2107	0.262	0.00439	0.00722	0.00069999	0.00131	0.065229	0.0896	0.31467	0.371	0.03983	0.0573	0.0052699	0.00856
17p loss	110 (12%)	772	0.00088999	0.00165	0.00301	0.00506	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.66354	0.72	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
17q loss	82 (9%)	800	0.00016	0.000324	0.00022	0.00044	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.42267	0.483	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
18p loss	142 (16%)	740	0.22781	0.28	0.40468	0.466	9.9999e-06	2.34e-05	0.03142	0.0463	0.00038	0.000738	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.00016	0.000324	0.89648	0.939	0.00103	0.00187	9.9999e-06	2.34e-05
18q loss	149 (17%)	733	0.16406	0.21	0.35443	0.414	9.9999e-06	2.34e-05	0.04633	0.0659	0.00059999	0.00113	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	5e-04	0.000957	0.93428	0.973	0.00022	0.00044	9.9999e-06	2.34e-05
19p loss	27 (3%)	855	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.34e-05	0.00121	0.00218	0.53202	0.593	0.16577	0.212	0.00087999	0.00163	0.00047	0.000902	0.052299	0.0735	0.00405	0.00669	0.00385	0.00638	0.00057999	0.0011
19q loss	22 (2%)	860	NA	NA	NA	NA	6.9999e-05	0.000147	0.00105	0.00191	0.84717	0.898	0.39996	0.461	0.0029	0.00491	0.00029	0.000571	0.00483	0.00791	0.00064999	0.00123	0.02589	0.0387	0.00333	0.00557
20p loss	12 (1%)	870	NA	NA	NA	NA	0.66559	0.721	0.0055099	0.0089	0.20519	0.258	0.19914	0.252	0.00202	0.00352	0.02399	0.036	0.27083	0.326	0.02325	0.035	0.00099999	0.00183	0.00434	0.00715
20q loss	6 (1%)	876	NA	NA	NA	NA	0.45578	0.518	0.0075399	0.0121	0.24967	0.304	0.43812	0.5	0.02203	0.0334	0.02225	0.0336	0.87686	0.923	0.0074099	0.0119	0.0084499	0.0134	0.00134	0.00239
21q loss	133 (15%)	749	0.01587	0.0246	0.02365	0.0355	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.95859	0.995	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	2e-05	4.48e-05	9.9999e-06	2.34e-05
22q loss	107 (12%)	775	0.0054599	0.00884	0.03661	0.0531	9.9999e-06	2.34e-05	0.00026	0.000518	0.337	0.395	5.9999e-05	0.000128	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	4e-05	8.73e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.0018	0.00315	2e-05	4.48e-05
xp loss	118 (13%)	764	0.053539	0.075	0.079859	0.107	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.41129	0.472	5.9999e-05	0.000128	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
xq loss	116 (13%)	766	0.074169	0.101	0.11251	0.149	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	0.43008	0.491	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05	9.9999e-06	2.34e-05
