		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	24 (5%)	504	0.81953	0.949	0.92505	1	9.9999e-06	6.52e-05	0.00058999	0.00244	0.17637	0.281	0.39323	0.529	0.00087999	0.00345	0.00139	0.0052	0.00176	0.00634	0.0064999	0.0202	0.75167	0.891	0.03912	0.0885
1q gain	51 (10%)	477	0.40951	0.545	0.90113	1	9.9999e-06	6.52e-05	0.01395	0.0385	0.14907	0.25	0.20667	0.32	9.9999e-06	6.52e-05	0.00175	0.00633	3e-05	0.000173	0.0056699	0.0179	0.42082	0.557	0.75814	0.898
2p gain	77 (15%)	451	0.7006	0.841	0.45781	0.59	9.9999e-06	6.52e-05	0.082399	0.158	0.073639	0.146	0.77668	0.913	0.23176	0.346	0.01182	0.0334	0.62053	0.76	0.14324	0.242	0.22852	0.343	0.46999	0.601
2q gain	79 (15%)	449	0.56186	0.701	0.26726	0.386	9.9999e-06	6.52e-05	0.16546	0.27	0.18004	0.286	0.66833	0.812	0.2303	0.344	0.01729	0.0456	0.70781	0.846	0.02524	0.0622	0.31984	0.445	0.652	0.794
3p gain	19 (4%)	509	0.054199	0.116	0.43296	0.569	0.00037	0.00163	0.57937	0.719	0.17826	0.284	0.00045	0.00191	0.0089999	0.0268	0.00014	0.000689	0.00014	0.000689	0.12543	0.217	0.39193	0.528	0.73631	0.875
3q gain	61 (12%)	467	0.01198	0.0338	0.03094	0.0737	9.9999e-06	6.52e-05	0.00365	0.0122	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	5.9999e-05	0.000319	2e-05	0.000118	9.9999e-06	6.52e-05	4e-04	0.00173	0.00154	0.00563	0.079049	0.153
4p gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.072279	0.144	0.37426	0.508	0.03733	0.0853	5e-05	0.000269	0.00038	0.00166	0.00041	0.00177	0.00023	0.00109	0.04481	0.098	NA	NA	NA	NA
4q gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.21358	0.327	0.45627	0.588	0.27161	0.39	0.0015	0.00551	0.00032	0.00145	0.00435	0.0142	0.00021	0.00101	0.04422	0.0971	NA	NA	NA	NA
5p gain	193 (37%)	335	0.88289	1	0.92412	1	0.00036	0.0016	0.25908	0.377	0.01859	0.0483	0.89101	1	0.0086399	0.026	0.02173	0.0554	0.068879	0.139	0.15165	0.252	0.082869	0.158	0.90624	1
5q gain	207 (39%)	321	0.33383	0.461	0.62554	0.766	0.02246	0.0568	0.43862	0.573	0.0070799	0.0216	0.79708	0.932	0.056689	0.12	0.068579	0.139	0.4481	0.583	0.20676	0.32	0.12869	0.221	0.90612	1
6p gain	11 (2%)	517	NA	NA	NA	NA	0.15234	0.253	0.44504	0.58	0.21691	0.332	0.95106	1	0.79412	0.929	0.98359	1	0.85934	0.984	0.11142	0.199	0.60595	0.744	0.77991	0.915
6q gain	9 (2%)	519	NA	NA	NA	NA	0.083669	0.16	0.67925	0.819	0.10874	0.195	0.80649	0.939	1	1	0.91142	1	1	1	0.18299	0.289	0.60347	0.742	0.7792	0.915
7p gain	171 (32%)	357	0.45247	0.586	0.8592	0.984	9.9999e-06	6.52e-05	0.00147	0.00544	9.9999e-06	6.52e-05	4e-05	0.000219	5e-05	0.000269	0.0095299	0.0281	0.00411	0.0135	0.03099	0.0737	0.1017	0.187	0.76611	0.905
7q gain	172 (33%)	356	0.45071	0.585	0.8593	0.984	9.9999e-06	6.52e-05	0.00405	0.0134	3e-05	0.000173	2e-05	0.000118	7.9999e-05	0.000414	0.0069999	0.0214	0.0051599	0.0165	0.01779	0.0467	0.17426	0.279	0.58904	0.727
8p gain	31 (6%)	497	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	6.52e-05	0.00042	0.0018	0.00044	0.00188	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	9.9999e-06	6.52e-05	0.00477	0.0154	0.0116	0.033	0.10487	0.19
8q gain	62 (12%)	466	0.22673	0.341	0.10482	0.19	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00014	0.000689	0.00047	0.00198	0.40805	0.545
9p gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.01517	0.0412	0.9023	1	0.51025	0.648	0.03417	0.0795	0.24776	0.363	0.01761	0.0463	1	1	0.86089	0.985	1	1	1	1
9q gain	12 (2%)	516	NA	NA	NA	NA	0.00139	0.0052	0.90898	1	0.24958	0.365	0.03159	0.0747	0.24092	0.354	0.02624	0.0638	0.53135	0.669	0.67015	0.813	1	1	1	1
10p gain	17 (3%)	511	NA	NA	NA	NA	0.00024	0.00112	0.25522	0.373	0.0239	0.0594	0.078419	0.153	0.00090999	0.00353	0.00017	0.000828	0.01858	0.0483	0.068189	0.139	NA	NA	NA	NA
10q gain	12 (2%)	516	NA	NA	NA	NA	0.00012	0.000602	0.11696	0.204	0.057279	0.121	0.092309	0.171	0.01405	0.0385	0.00182	0.00651	0.01545	0.0419	0.21345	0.327	NA	NA	NA	NA
11p gain	31 (6%)	497	0.23119	0.345	0.67069	0.813	9.9999e-06	6.52e-05	0.27113	0.39	0.072589	0.144	0.51361	0.65	0.15231	0.253	0.23861	0.353	0.14571	0.246	0.28059	0.401	0.39186	0.528	0.85409	0.982
11q gain	29 (5%)	499	0.34166	0.471	0.90633	1	0.00023	0.00109	0.52822	0.666	0.13766	0.234	0.82838	0.956	0.42192	0.557	0.57345	0.712	0.36368	0.496	0.1857	0.293	0.75061	0.891	0.67851	0.819
12p gain	121 (23%)	407	0.01309	0.0365	0.03261	0.0766	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00149	0.00549	0.10426	0.19
12q gain	122 (23%)	406	0.01323	0.0368	0.03329	0.078	9.9999e-06	6.52e-05	7.9999e-05	0.000414	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00288	0.01	0.12819	0.221
13q gain	22 (4%)	506	NA	NA	NA	NA	0.48694	0.62	0.03437	0.0798	0.22738	0.342	0.4312	0.568	0.070739	0.142	0.12048	0.21	0.34521	0.474	0.26296	0.381	0.28467	0.406	0.32329	0.449
14q gain	16 (3%)	512	0.76989	0.908	0.5716	0.711	0.00119	0.00456	0.35008	0.48	0.00191	0.00681	0.03338	0.078	0.0069399	0.0213	0.00034	0.00153	0.00403	0.0134	0.11253	0.2	NA	NA	NA	NA
15q gain	26 (5%)	502	1	1	0.11673	0.204	0.00076999	0.00311	0.72402	0.864	0.091389	0.171	0.00385	0.0128	0.67209	0.813	0.10565	0.191	0.70571	0.846	0.41171	0.547	0.68354	0.822	0.8268	0.955
16p gain	107 (20%)	421	0.27266	0.391	0.37919	0.514	8.9999e-05	0.000461	0.16829	0.273	0.02147	0.0549	0.18051	0.286	0.0067099	0.0208	0.00438	0.0143	0.060279	0.126	0.02594	0.0633	0.12858	0.221	0.39418	0.529
16q gain	99 (19%)	429	0.23412	0.347	0.35062	0.48	4e-05	0.000219	0.088059	0.167	0.0055799	0.0177	0.092209	0.171	0.0062599	0.0195	0.016	0.043	0.01619	0.0434	0.14656	0.247	0.18002	0.286	0.26645	0.385
17p gain	26 (5%)	502	0.01808	0.0472	0.0053199	0.0169	2e-05	0.000118	0.81618	0.947	0.13467	0.229	0.10114	0.186	0.15005	0.251	0.00497	0.016	0.1468	0.247	0.26311	0.381	0.03457	0.08	0.73479	0.874
17q gain	33 (6%)	495	0.070349	0.142	0.02597	0.0633	9.9999e-06	6.52e-05	0.23828	0.353	0.11488	0.204	0.22299	0.338	0.075969	0.149	0.00167	0.00606	0.078629	0.153	0.22182	0.338	0.0021	0.00743	0.29732	0.419
18p gain	25 (5%)	503	0.3131	0.436	0.076489	0.15	0.074899	0.147	0.44835	0.583	0.90413	1	0.52227	0.66	0.19095	0.299	0.42075	0.557	0.83475	0.961	0.4544	0.588	0.20201	0.315	0.04421	0.0971
18q gain	25 (5%)	503	0.31273	0.436	0.076019	0.149	0.067809	0.138	0.55818	0.697	0.76444	0.904	0.54929	0.688	0.18843	0.297	0.41979	0.557	0.96518	1	0.45156	0.585	0.20245	0.315	0.04414	0.0971
19p gain	51 (10%)	477	0.22303	0.338	0.48401	0.617	9.9999e-06	6.52e-05	5e-05	0.000269	0.00146	0.00542	0.01275	0.0356	0.00163	0.00594	0.00077999	0.00313	3e-05	0.000173	0.35645	0.486	0.92088	1	0.6263	0.766
19q gain	57 (11%)	471	0.10305	0.188	0.22352	0.338	9.9999e-06	6.52e-05	4e-05	0.000219	2e-05	0.000118	0.00063999	0.00262	0.00058999	0.00244	8.9999e-05	0.000461	9.9999e-06	6.52e-05	0.17	0.275	0.58182	0.721	0.28693	0.409
20p gain	112 (21%)	416	0.11653	0.204	0.11581	0.204	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	0.053019	0.113
20q gain	115 (22%)	413	0.0429	0.0957	0.074589	0.147	9.9999e-06	6.52e-05	4e-05	0.000219	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.03261	0.0766
21q gain	50 (9%)	478	0.27022	0.389	0.20766	0.32	9.9999e-06	6.52e-05	0.00133	0.00503	0.16182	0.266	0.062899	0.13	0.00025	0.00115	0.00322	0.0111	0.00315	0.0109	0.03111	0.0738	0.35057	0.48	0.4739	0.606
22q gain	40 (8%)	488	0.32749	0.454	0.21934	0.335	2e-05	0.000118	0.20873	0.321	0.53355	0.67	0.29156	0.414	0.054719	0.117	0.01636	0.0436	0.062079	0.129	0.41158	0.547	0.91022	1	0.30647	0.43
xp gain	32 (6%)	496	1	1	0.52666	0.664	0.0058599	0.0184	0.22474	0.339	0.00012	0.000602	0.0011	0.00423	0.01596	0.043	0.00090999	0.00353	0.12751	0.22	0.14213	0.241	0.55565	0.695	0.9005	1
xq gain	31 (6%)	497	0.38985	0.526	0.7006	0.841	0.22198	0.338	0.29194	0.414	0.02257	0.0569	0.069189	0.14	0.15438	0.255	0.10237	0.188	0.32328	0.449	0.60016	0.739	0.91762	1	0.81126	0.944
1p loss	57 (11%)	471	0.00084999	0.00336	0.00273	0.00959	9.9999e-06	6.52e-05	0.67503	0.816	0.0074799	0.0227	0.01929	0.0497	0.11609	0.204	4e-05	0.000219	0.0079599	0.0241	0.0233	0.058	0.0356	0.0822	0.8244	0.953
1q loss	36 (7%)	492	0.0102	0.0296	0.01112	0.0317	9.9999e-06	6.52e-05	0.36867	0.502	0.03618	0.0834	0.00265	0.00935	0.00449	0.0146	9.9999e-06	6.52e-05	0.0058899	0.0184	0.04199	0.0942	0.22253	0.338	0.70761	0.846
2p loss	14 (3%)	514	4e-05	0.000219	0.00060999	0.00251	9.9999e-06	6.52e-05	0.66209	0.805	0.00078999	0.00316	2e-04	0.000969	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	4e-05	0.000219	0.13118	0.224	0.096869	0.179
2q loss	14 (3%)	514	0.00028	0.00128	0.00085999	0.00338	9.9999e-06	6.52e-05	1	1	0.00295	0.0103	0.00024	0.00112	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	0.13218	0.225	0.096229	0.178
3p loss	380 (72%)	148	0.003	0.0104	0.01032	0.0299	9.9999e-06	6.52e-05	0.00067999	0.00276	0.01224	0.0344	0.00034	0.00153	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.02269	0.057	0.0085999	0.026	0.091619	0.171	0.73283	0.873
3q loss	99 (19%)	429	0.9231	1	0.51322	0.65	0.00143	0.00533	0.40304	0.54	0.19035	0.299	0.17403	0.279	0.12897	0.221	0.01922	0.0497	0.65136	0.794	0.02728	0.0659	0.80244	0.937	0.86268	0.986
4p loss	72 (14%)	456	0.53228	0.669	0.81582	0.947	9.9999e-06	6.52e-05	0.00012	0.000602	0.00057999	0.00242	0.058079	0.122	0.00082999	0.00329	0.00125	0.00475	0.56758	0.707	0.070789	0.142	0.078849	0.153	0.0069499	0.0213
4q loss	65 (12%)	463	0.38592	0.522	0.78465	0.919	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	0.00036	0.0016	0.01697	0.045	0.00038	0.00166	3e-05	0.000173	0.19843	0.31	0.064149	0.132	0.42879	0.566	0.056529	0.12
5p loss	7 (1%)	521	NA	NA	NA	NA	0.01629	0.0436	0.28731	0.409	0.01017	0.0296	0.078319	0.153	0.02647	0.0642	0.01103	0.0316	0.04227	0.0945	0.065649	0.134	NA	NA	NA	NA
5q loss	6 (1%)	522	NA	NA	NA	NA	0.04323	0.096	0.54177	0.679	0.0432	0.096	0.22446	0.339	0.04581	0.0999	0.01509	0.0411	0.072829	0.144	0.094669	0.175	NA	NA	NA	NA
6p loss	100 (19%)	428	0.01067	0.0308	0.01415	0.0387	9.9999e-06	6.52e-05	5.9999e-05	0.000319	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.082899	0.158	0.02427	0.06
6q loss	128 (24%)	400	0.050699	0.109	0.052069	0.112	9.9999e-06	6.52e-05	0.0057699	0.0181	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00025	0.00115	7.9999e-05	0.000414	9.9999e-06	6.52e-05	4e-05	0.000219	0.1683	0.273	0.02595	0.0633
7p loss	3 (1%)	525	NA	NA	NA	NA	0.16631	0.271	NA	NA	0.04455	0.0976	0.04203	0.0942	0.10738	0.193	0.16894	0.273	0.057389	0.121	0.3547	0.485	NA	NA	NA	NA
7q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.12188	0.212	0.34399	0.473	0.01072	0.0308	0.056299	0.12	0.04954	0.107	0.078799	0.153	0.01931	0.0497	0.77348	0.912	NA	NA	NA	NA
8p loss	137 (26%)	391	0.38051	0.515	0.16472	0.269	9.9999e-06	6.52e-05	0.27954	0.4	0.072919	0.144	0.97683	1	0.082889	0.158	0.00124	0.00473	0.04174	0.094	0.02315	0.0578	0.27402	0.392	0.24305	0.357
8q loss	64 (12%)	464	0.64736	0.79	0.12639	0.219	0.12154	0.212	0.04391	0.0971	0.064889	0.133	0.4389	0.573	0.72216	0.862	0.18953	0.298	0.58877	0.727	0.40904	0.545	0.68201	0.821	0.089259	0.168
9p loss	149 (28%)	379	0.00377	0.0126	0.03653	0.084	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.01642	0.0437	0.098369	0.181
9q loss	150 (28%)	378	0.0092099	0.0274	0.058499	0.123	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00357	0.012	0.03701	0.0849
10p loss	67 (13%)	461	0.17454	0.279	0.40363	0.54	9.9999e-06	6.52e-05	0.080759	0.156	0.46057	0.592	0.0226	0.0569	0.15308	0.254	0.00079999	0.00319	0.01702	0.045	0.10937	0.195	0.77579	0.913	0.29621	0.418
10q loss	89 (17%)	439	0.33109	0.458	0.39996	0.536	9.9999e-06	6.52e-05	0.00421	0.0138	0.81856	0.949	0.02216	0.0563	0.12215	0.212	0.00198	0.00703	0.03833	0.0869	5e-04	0.0021	0.80377	0.937	0.4362	0.572
11p loss	18 (3%)	510	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	6.52e-05	0.02228	0.0565	0.43408	0.57	0.10454	0.19	0.17062	0.275	0.02731	0.0659	0.17063	0.275	0.1494	0.25	0.29993	0.421	0.30985	0.433
11q loss	23 (4%)	505	0.18852	0.297	0.37419	0.508	9.9999e-06	6.52e-05	0.0055299	0.0176	0.1621	0.266	0.0096599	0.0284	0.01403	0.0385	0.00039	0.0017	0.02292	0.0574	0.03779	0.0861	0.3002	0.421	0.30853	0.432
12p loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.085759	0.163	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.20614	0.32	0.46927	0.601	0.29548	0.417	0.14385	0.243	NA	NA	NA	NA
12q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.48306	0.617	NA	NA	0.20927	0.322	0.87999	1	1	1	1	1	0.23327	0.346	0.61302	0.752	NA	NA	NA	NA
13q loss	71 (13%)	457	0.0033	0.0113	0.04676	0.102	9.9999e-06	6.52e-05	0.00023	0.00109	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.10677	0.192	0.10329	0.189
14q loss	216 (41%)	312	4e-05	0.000219	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.01394	0.0385	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.050649	0.109	0.87956	1
15q loss	36 (7%)	492	0.11689	0.204	0.33402	0.461	9.9999e-06	6.52e-05	0.00067999	0.00276	0.061819	0.129	0.0096899	0.0284	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00088999	0.00348	0.01597	0.043	0.070349	0.142	0.13081	0.223
16p loss	10 (2%)	518	NA	NA	NA	NA	0.20427	0.318	0.87728	1	0.12664	0.219	0.04867	0.105	0.29295	0.415	0.062389	0.129	0.091789	0.171	0.11576	0.204	0.11661	0.204	0.11635	0.204
16q loss	16 (3%)	512	NA	NA	NA	NA	0.03787	0.0861	0.90922	1	0.2948	0.417	0.43163	0.568	0.10613	0.192	0.089799	0.169	0.064779	0.133	0.0086699	0.026	0.070739	0.142	0.02804	0.0674
17p loss	46 (9%)	482	6.9999e-05	0.000368	0.00024	0.00112	9.9999e-06	6.52e-05	0.088589	0.167	0.00045	0.00191	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00022	0.00106	0.20243	0.315	0.085649	0.163
17q loss	28 (5%)	500	0.00050999	0.00214	0.00032	0.00145	9.9999e-06	6.52e-05	0.58212	0.721	0.15593	0.257	0.00278	0.00973	6.9999e-05	0.000368	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.0051199	0.0164	0.45614	0.588	0.15038	0.251
18p loss	93 (18%)	435	0.058629	0.123	0.45931	0.591	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00025	0.00115	0.0045	0.0146
18q loss	95 (18%)	433	0.0462	0.101	0.21984	0.335	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	9.9999e-06	6.52e-05	0.00336	0.0114	0.03082	0.0736
19p loss	11 (2%)	517	NA	NA	NA	NA	2e-05	0.000118	0.03216	0.0759	0.00015	0.000734	0.00177	0.00636	0.16793	0.273	0.01079	0.031	0.23999	0.354	0.0093899	0.0277	0.03355	0.0782	0.03737	0.0853
19q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.01181	0.0334	NA	NA	0.26214	0.38	0.2563	0.374	0.43715	0.572	0.5125	0.65	0.83283	0.96	0.081969	0.158	NA	NA	NA	NA
20p loss	8 (2%)	520	NA	NA	NA	NA	0.17192	0.276	1	1	0.25667	0.374	0.49903	0.634	0.090429	0.17	0.23274	0.346	0.01935	0.0497	0.23297	0.346	NA	NA	NA	NA
20q loss	3 (1%)	525	NA	NA	NA	NA	0.16471	0.269	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.10793	0.194	0.15406	0.255	0.059159	0.124	0.02941	0.0704	NA	NA	NA	NA
21q loss	55 (10%)	473	0.02564	0.0629	0.088499	0.167	9.9999e-06	6.52e-05	0.01368	0.0379	0.00073999	0.003	9.9999e-06	6.52e-05	0.00324	0.0111	9.9999e-05	0.00051	0.0069399	0.0213	0.0092999	0.0276	0.88436	1	1	1
22q loss	39 (7%)	489	0.0098199	0.0287	0.00138	0.0052	9.9999e-06	6.52e-05	0.00354	0.0119	0.00037	0.00163	0.02042	0.0523	9.9999e-06	6.52e-05	2e-05	0.000118	9.9999e-06	6.52e-05	0.00341	0.0115	0.0254	0.0625	0.25861	0.376
xp loss	46 (9%)	482	0.04335	0.0961	0.066339	0.135	0.00013	0.000649	0.071839	0.143	0.46411	0.595	0.23973	0.354	0.20715	0.32	0.01231	0.0345	0.03982	0.0899	0.00093999	0.00363	0.10871	0.195	0.16067	0.264
xq loss	46 (9%)	482	0.02409	0.0597	0.062759	0.13	9.9999e-06	6.52e-05	0.0089699	0.0268	0.59682	0.736	0.050819	0.109	0.091389	0.171	0.02809	0.0674	0.01799	0.0471	0.00334	0.0114	0.22878	0.343	0.17492	0.279
