		Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1q21.3	30 (19%)	132	0.00469	0.032	0.60795	0.755	0.90979	0.954	0.79705	0.889	0.63946	0.772	0.94287	0.971	0.90215	0.95	0.44618	0.621	0.69322	0.824	0.82255	0.907
amp_4q25	6 (4%)	156	0.88174	0.942	0.75749	0.862	0.78454	0.882	0.44916	0.621	0.12981	0.275	0.38572	0.563	0.76405	0.866	0.62559	0.76	0.29298	0.477	0.50552	0.671
amp_4q31.1	13 (8%)	149	0.0055599	0.0371	0.068719	0.182	0.25695	0.433	0.063759	0.175	0.60988	0.755	0.0081999	0.045	0.40591	0.579	0.22392	0.399	0.11235	0.248	0.32289	0.499
amp_11p15.2	8 (5%)	154	0.094869	0.218	0.077209	0.192	0.34677	0.516	0.22117	0.399	0.3319	0.508	0.10242	0.231	0.41361	0.585	0.3966	0.572	0.45526	0.621	0.81234	0.899
amp_12q13.3	16 (10%)	146	0.04398	0.135	0.13907	0.288	0.75722	0.862	0.32271	0.499	0.60956	0.755	0.61797	0.756	0.04724	0.142	0.27462	0.455	0.12878	0.275	0.32284	0.499
amp_14q24.3	10 (6%)	152	0.02928	0.0965	0.19779	0.369	0.7148	0.834	0.1606	0.324	0.85172	0.926	0.17527	0.342	0.45682	0.621	0.71333	0.834	0.44128	0.618	0.85789	0.927
amp_17q21.31	16 (10%)	146	0.62736	0.76	0.88768	0.945	0.40562	0.579	0.3521	0.522	0.53061	0.694	0.00049	0.0049	0.75313	0.862	0.14382	0.294	0.066629	0.178	0.45684	0.621
del_1p12	113 (70%)	49	9.9999e-06	0.000187	9.9999e-06	0.000187	0.31002	0.493	0.00137	0.0113	9.9999e-06	0.000187	9.9999e-06	0.000187	0.00045	0.00467	0.01662	0.0705	0.0068599	0.0408	0.01462	0.0671
del_1q42.13	18 (11%)	144	0.02154	0.0815	0.13654	0.285	0.23542	0.417	0.060919	0.172	0.02502	0.0895	0.17696	0.342	0.33536	0.51	0.53525	0.697	0.072949	0.186	0.24602	0.42
del_3p24.1	64 (40%)	98	0.0016	0.0124	0.0072399	0.0408	0.22393	0.399	0.086129	0.206	5.9999e-05	0.000884	9.9999e-06	0.000187	3e-05	0.000494	0.00021	0.00267	9.9999e-06	0.000187	9.9999e-06	0.000187
del_3q26.1	93 (57%)	69	3e-05	0.000494	0.51629	0.682	0.01626	0.0705	0.01461	0.0671	0.02335	0.0871	9.9999e-06	0.000187	0.01819	0.0749	0.0093999	0.0497	0.01132	0.0537	0.0109	0.0537
del_4q28.3	10 (6%)	152	0.072159	0.185	0.24067	0.42	0.67385	0.806	0.16209	0.324	0.01864	0.0756	0.33927	0.511	0.45551	0.621	0.71453	0.834	0.32731	0.504	0.32139	0.499
del_5q15	12 (7%)	150	0.59783	0.754	1	1	0.062399	0.174	0.80446	0.894	0.97418	0.999	1	1	0.92932	0.96	0.18568	0.351	0.2449	0.42	0.29538	0.478
del_6p12.3	10 (6%)	152	0.01125	0.0537	0.26688	0.447	NA	NA	NA	NA	0.02085	0.08	0.087289	0.207	0.19717	0.369	0.16376	0.325	0.92594	0.96	0.052089	0.154
del_6q16.1	24 (15%)	138	0.13594	0.285	0.076699	0.192	0.04027	0.125	0.21839	0.397	0.02556	0.0895	0.0072799	0.0408	0.01515	0.0679	0.0060599	0.0377	0.083039	0.202	0.095699	0.218
del_8p22	25 (15%)	137	0.00151	0.0121	0.084409	0.204	0.5702	0.732	0.644	0.774	0.0064999	0.0396	0.0092499	0.0497	0.21003	0.384	0.23815	0.419	0.02657	0.0918	0.24252	0.42
del_8q23.3	13 (8%)	149	0.03299	0.105	0.86739	0.934	0.48624	0.648	1	1	0.27641	0.455	0.52149	0.686	0.070809	0.184	0.46563	0.63	0.92767	0.96	0.30058	0.481
del_9p24.2	15 (9%)	147	0.29266	0.477	0.33819	0.511	0.082339	0.202	0.16221	0.324	0.090899	0.212	0.1759	0.342	0.47771	0.643	0.077429	0.192	0.48338	0.648	0.29894	0.481
del_9q21.12	14 (9%)	148	0.01026	0.0522	0.54807	0.71	0.02543	0.0895	0.060759	0.172	0.37157	0.545	0.39084	0.567	0.72501	0.839	0.11332	0.248	0.58415	0.747	0.343	0.514
del_11p15.4	58 (36%)	104	9.9999e-06	0.000187	5.9999e-05	0.000884	0.091939	0.213	0.11481	0.249	0.00050999	0.00492	9.9999e-06	0.000187	0.00014	0.00196	9.9999e-06	0.000187	9.9999e-06	0.000187	0.00035	0.00408
del_11q22.1	48 (30%)	114	9.9999e-06	0.000187	0.20944	0.384	0.18414	0.351	0.062679	0.174	0.00063999	0.00578	0.0098999	0.0513	0.00372	0.026	0.00078999	0.00687	0.00032	0.0039	0.03244	0.105
del_12q21.33	8 (5%)	154	0.059449	0.172	0.89219	0.945	0.61628	0.756	0.60845	0.755	0.91405	0.955	0.87594	0.94	0.58942	0.748	0.69732	0.824	0.83455	0.913	1	1
del_13q22.3	8 (5%)	154	0.24996	0.424	0.89399	0.945	0.32032	0.499	0.78573	0.882	0.27144	0.452	0.43003	0.605	1	1	0.61249	0.755	0.71946	0.836	0.85361	0.926
del_16q21	5 (3%)	157	0.064449	0.175	0.11323	0.248	0.69604	0.824	0.78708	0.882	0.55062	0.71	0.02818	0.094	0.20868	0.384	0.59076	0.748	0.090189	0.212	0.82992	0.911
del_17p13.2	64 (40%)	98	0.00015	0.002	0.00044	0.00467	0.40768	0.579	0.065659	0.177	0.01527	0.0679	0.0060199	0.0377	0.02819	0.094	0.0071999	0.0408	0.16822	0.332	0.01776	0.0742
del_17q11.2	42 (26%)	120	9.9999e-06	0.000187	0.00358	0.0259	0.02365	0.0871	0.12987	0.275	0.02466	0.0895	0.00271	0.0205	0.10402	0.233	0.070299	0.184	0.36967	0.545	0.14203	0.292
del_22q13.31	65 (40%)	97	9.9999e-06	0.000187	0.0205	0.0797	0.73386	0.846	0.059309	0.172	0.01942	0.0777	0.00044	0.00467	0.01125	0.0537	0.02722	0.0929	0.01639	0.0705	0.02042	0.0797
del_xp21.1	46 (28%)	116	0.00080999	0.00687	0.0060099	0.0377	0.04835	0.144	0.24326	0.42	0.03343	0.105	0.00361	0.0259	0.00055999	0.00523	0.04632	0.141	0.18407	0.351	0.03271	0.105
