Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	206 (19%)	874	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00031	0.000555	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00018	0.000337
1q gain	706 (65%)	374	0.0011	0.00179	0.0054099	0.00763	9.9999e-06	2.35e-05	0.00022	0.000403	0.81048	0.819	0.35457	0.376	0.9116	0.913	0.0035	0.00512	0.13285	0.15	0.00384	0.00554	0.12143	0.138	0.21516	0.235
2p gain	123 (11%)	957	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00014	0.000267
2q gain	73 (7%)	1007	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.092889	0.107
3p gain	135 (12%)	945	0.0286	0.0361	0.04396	0.0539	9.9999e-06	2.35e-05	0.00017	0.000319	0.49523	0.514	0.058059	0.0692	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00031	0.000555	2e-05	4.34e-05	0.078179	0.0918	0.20793	0.228
3q gain	212 (20%)	868	0.00032	0.000567	0.00016	0.000303	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.02301	0.0296	0.086039	0.1	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00013	0.00025
4p gain	76 (7%)	1004	0.00039	0.00068	0.00111	0.0018	9.9999e-06	2.35e-05	0.00036	0.000633	0.86087	0.867	0.10978	0.125	0.04296	0.0527	0.01196	0.0159	0.42971	0.451	0.00021	0.000386	0.3095	0.331	0.094379	0.109
4q gain	73 (7%)	1007	9.9999e-06	2.35e-05	0.00024	0.000436	9.9999e-06	2.35e-05	0.0062099	0.00868	0.49764	0.516	0.059059	0.0704	0.03704	0.0459	0.056939	0.0684	0.59296	0.61	0.00062999	0.00107	0.10621	0.122	0.02049	0.0265
5p gain	316 (29%)	764	0.02177	0.0281	0.04258	0.0523	9.9999e-06	2.35e-05	0.01898	0.0247	0.89986	0.903	0.21023	0.231	0.095799	0.11	0.04453	0.0544	0.00443	0.00634	0.03268	0.0409	0.24452	0.265	0.31094	0.332
5q gain	212 (20%)	868	0.0113	0.0151	0.0062799	0.00877	9.9999e-06	2.35e-05	0.00222	0.00337	0.00233	0.00352	0.00021	0.000386	0.00474	0.00676	0.00049	0.000841	3e-05	6.36e-05	2e-05	4.34e-05	0.00035	0.000616	0.04792	0.0582
6p gain	209 (19%)	871	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00032	0.000567	0.00322	0.00474	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
6q gain	150 (14%)	930	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.32e-05	0.01001	0.0135	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05
7p gain	309 (29%)	771	0.0070399	0.00977	0.12873	0.146	9.9999e-06	2.35e-05	0.00023	0.000419	0.15795	0.176	0.82273	0.83	0.00092999	0.00154	5e-05	0.000103	0.02444	0.0313	0.00137	0.00218	0.074889	0.0884	0.72511	0.737
7q gain	266 (25%)	814	0.0035	0.00512	0.02684	0.0341	9.9999e-06	2.35e-05	5e-05	0.000103	0.01615	0.0212	0.35981	0.381	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00367	0.00533	2e-05	4.34e-05	0.0056899	0.008	0.56384	0.581
8p gain	290 (27%)	790	0.18057	0.2	0.10924	0.125	9.9999e-06	2.35e-05	0.00244	0.00368	0.73374	0.745	0.068239	0.081	0.0084599	0.0116	0.00124	0.00199	0.01984	0.0257	0.30236	0.324	0.0053299	0.00754	0.11234	0.128
8q gain	529 (49%)	551	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.21169	0.232	0.44375	0.465	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
9p gain	141 (13%)	939	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-05	0.000196	0.0078399	0.0108	4e-05	8.32e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00047	0.000809	0.11265	0.128
9q gain	119 (11%)	961	0.27627	0.297	0.00121	0.00195	9.9999e-06	2.35e-05	0.15638	0.175	0.76375	0.775	0.18475	0.204	0.00191	0.00293	0.03037	0.0382	0.050149	0.0608	0.073529	0.087	0.095669	0.11	0.04595	0.056
10p gain	214 (20%)	866	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
10q gain	124 (11%)	956	0.03238	0.0405	0.00070999	0.00119	9.9999e-06	2.35e-05	0.00075999	0.00128	0.03658	0.0454	0.03348	0.0418	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00035	0.000616	9.9999e-06	2.35e-05	0.00014	0.000267	0.00276	0.0041
11p gain	138 (13%)	942	0.7862	0.796	0.082659	0.0965	9.9999e-06	2.35e-05	0.0095199	0.013	0.69365	0.708	0.77365	0.784	0.00068999	0.00116	0.01135	0.0151	7.9999e-05	0.00016	3e-05	6.36e-05	0.00326	0.00479	0.00017	0.000319
11q gain	94 (9%)	986	0.17958	0.199	0.04665	0.0567	9.9999e-06	2.35e-05	0.00218	0.00332	0.80782	0.817	0.64075	0.656	4e-05	8.32e-05	0.00014	0.000267	6.9999e-05	0.000141	0.00023	0.000419	0.057399	0.0686	0.04227	0.0521
12p gain	229 (21%)	851	0.00070999	0.00119	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.062369	0.0741	0.057329	0.0686	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00053999	0.000924	0.0015	0.00238	0.02004	0.0259
12q gain	191 (18%)	889	0.00109	0.00178	0.00146	0.00232	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.24652	0.267	0.18317	0.203	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00023	0.000419	0.057649	0.0688	0.00104	0.00171	0.70892	0.722
13q gain	92 (9%)	988	0.21848	0.239	0.28347	0.304	4e-05	8.32e-05	0.00443	0.00634	0.090269	0.105	0.30689	0.328	0.00249	0.00374	0.00044	0.000764	0.00366	0.00533	0.0085199	0.0117	0.082739	0.0965	0.02621	0.0334
14q gain	143 (13%)	937	0.00113	0.00183	0.01448	0.0191	9.9999e-06	2.35e-05	0.00128	0.00204	0.27387	0.295	0.3563	0.378	7.9999e-05	0.00016	0.00027	0.000488	0.00024	0.000436	9.9999e-06	2.35e-05	0.00155	0.00244	0.32043	0.342
15q gain	87 (8%)	993	0.04234	0.0521	0.27884	0.3	0.00184	0.00284	0.03542	0.0441	0.24263	0.263	0.15649	0.175	0.0050699	0.0072	0.0222	0.0286	0.0080699	0.0111	0.01948	0.0253	0.50436	0.522	0.13349	0.15
16p gain	464 (43%)	616	5.9999e-05	0.000122	0.00124	0.00199	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.057199	0.0686	3e-05	6.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	2e-05	4.34e-05	0.00411	0.00592
16q gain	142 (13%)	938	0.48582	0.505	0.40273	0.424	0.01042	0.014	0.03135	0.0393	0.7165	0.729	0.41356	0.435	0.057189	0.0686	0.0074299	0.0103	0.00176	0.00272	0.00151	0.00238	0.13029	0.147	0.247	0.267
17p gain	107 (10%)	973	0.02972	0.0375	0.32889	0.35	9.9999e-06	2.35e-05	0.02436	0.0312	0.45977	0.48	0.081369	0.0951	0.03935	0.0487	0.01659	0.0217	0.35466	0.376	0.00428	0.00614	0.48032	0.5	0.02499	0.0319
17q gain	217 (20%)	863	9.9999e-06	2.35e-05	0.00011	0.000215	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.61547	0.631	0.00017	0.000319	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.01236	0.0164	9.9999e-06	2.35e-05	0.00111	0.0018	0.00171	0.00265
18p gain	177 (16%)	903	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00269	0.004	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
18q gain	153 (14%)	927	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.36e-05	0.16016	0.179	0.00363	0.00529	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00086999	0.00145	0.00175	0.00271
19p gain	190 (18%)	890	0.00037	0.000648	0.0051199	0.00726	9.9999e-06	2.35e-05	0.00203	0.0031	0.03158	0.0396	0.02386	0.0306	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.32e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00012	0.000233	0.01665	0.0218	0.41609	0.437
19q gain	223 (21%)	857	0.00107	0.00175	0.00376	0.00545	9.9999e-06	2.35e-05	0.00267	0.00398	0.01825	0.0238	0.081329	0.0951	2e-05	4.34e-05	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.01603	0.021	0.069719	0.0827
20p gain	416 (39%)	664	4e-05	8.32e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0107	0.0144	0.45408	0.475	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.00469	0.0067
20q gain	451 (42%)	629	5.9999e-05	0.000122	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.11945	0.136	0.15581	0.175	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.00019	0.000354
21q gain	196 (18%)	884	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00081999	0.00137	0.002	0.00306	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05
22q gain	99 (9%)	981	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00013	0.00025	0.00089999	0.00149	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00038	0.000664	0.0060299	0.00844
xp gain	151 (14%)	929	6.9999e-05	0.000141	0.0088299	0.0121	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	0.86567	0.871	0.50841	0.526	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00012	0.000233	0.00014	0.000267	0.00045	0.000778
xq gain	136 (13%)	944	0.00079999	0.00134	0.00229	0.00347	9.9999e-06	2.35e-05	0.00013	0.00025	0.33318	0.354	0.17985	0.2	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00046	0.000793	0.02519	0.0321
1p loss	243 (22%)	837	0.00121	0.00195	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.67276	0.687	0.51741	0.534	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0056999	0.008	2e-05	4.34e-05	0.00187	0.00288	0.69575	0.709
1q loss	52 (5%)	1028	0.074499	0.088	0.012	0.016	5.9999e-05	0.000122	0.0070399	0.00977	0.24194	0.263	0.36064	0.382	0.01409	0.0186	0.052869	0.0638	0.054499	0.0656	0.02693	0.0341	0.095709	0.11	0.47695	0.497
2p loss	182 (17%)	898	0.0075299	0.0104	0.0121	0.0161	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.00167	0.0026	0.00083999	0.0014	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00032	0.000567	2e-05	4.34e-05	2e-05	4.34e-05	0.052159	0.0631
2q loss	211 (20%)	869	0.084979	0.0988	0.02823	0.0357	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	0.00359	0.00524	0.0057199	0.00802	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0033	0.00484	0.00158	0.00248	0.00025	0.000453	0.075209	0.0886
3p loss	186 (17%)	894	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00232	0.00351	3e-05	6.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0073499	0.0102
3q loss	103 (10%)	977	0.00122	0.00196	0.00017	0.000319	9.9999e-06	2.35e-05	0.0011	0.00179	0.18505	0.204	0.03032	0.0382	0.00035	0.000616	0.00021	0.000386	3e-04	0.000539	0.00016	0.000303	0.082879	0.0965	0.077069	0.0906
4p loss	353 (33%)	727	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05
4q loss	312 (29%)	768	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00017	0.000319	0.00267	0.00398	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0080799	0.0111
5p loss	140 (13%)	940	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
5q loss	228 (21%)	852	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
6p loss	187 (17%)	893	0.02355	0.0303	0.16278	0.181	9.9999e-06	2.35e-05	0.0075899	0.0105	0.66737	0.683	0.061209	0.0728	0.00115	0.00186	0.01043	0.014	0.2677	0.289	0.03386	0.0422	0.0070299	0.00977	0.52508	0.542
6q loss	276 (26%)	804	2e-04	0.000371	0.01354	0.0179	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.36e-05	0.48344	0.503	0.079349	0.0931	0.00101	0.00166	0.00087999	0.00146	0.36882	0.389	0.00055999	0.000953	0.0099699	0.0135	0.3626	0.383
7p loss	112 (10%)	968	0.01982	0.0257	0.00118	0.00191	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.14287	0.161	0.04528	0.0553	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00065999	0.00112	0.00029	0.000523
7q loss	120 (11%)	960	0.03647	0.0453	0.0016	0.00251	9.9999e-06	2.35e-05	0.070369	0.0833	0.22872	0.249	0.46893	0.489	0.00059999	0.00102	0.00046	0.000793	8.9999e-05	0.000178	5e-05	0.000103	0.02586	0.033	0.00414	0.00596
8p loss	399 (37%)	681	9.9999e-06	2.35e-05	8.9999e-05	0.000178	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.090629	0.105	0.00032	0.000567	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.00128	0.00204	0.00077999	0.00131
8q loss	93 (9%)	987	0.050649	0.0613	0.10576	0.121	0.0076199	0.0105	0.01081	0.0145	0.88221	0.887	0.27632	0.297	0.01026	0.0138	0.079999	0.0937	0.25411	0.274	0.83651	0.843	0.21866	0.239	0.38687	0.408
9p loss	313 (29%)	767	3e-05	6.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00255	0.00382	0.04052	0.0501	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	5e-05	0.000103	9.9999e-06	2.35e-05
9q loss	283 (26%)	797	0.00013	0.00025	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00151	0.00238	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
10p loss	173 (16%)	907	0.28048	0.301	0.23454	0.255	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.32e-05	0.59184	0.609	0.8882	0.892	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.32e-05	0.00189	0.00291	0.00093999	0.00155	0.20174	0.222	0.61155	0.627
10q loss	229 (21%)	851	0.00292	0.00433	0.0091099	0.0124	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00167	0.0026	0.16159	0.18	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	8.9999e-05	0.000178	0.0097799	0.0133
11p loss	275 (25%)	805	0.00384	0.00554	0.01572	0.0207	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.04055	0.0501	0.00107	0.00175	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00315	0.00465	0.0042	0.00603
11q loss	365 (34%)	715	8.9999e-05	0.000178	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.95603	0.956	0.00248	0.00373	0.00014	0.000267	0.003	0.00445	0.01097	0.0147	0.00084999	0.00142	0.01211	0.0161	0.02796	0.0354
12p loss	151 (14%)	929	0.00154	0.00242	0.00153	0.00241	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0095699	0.013	0.0053699	0.00758	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
12q loss	131 (12%)	949	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
13q loss	433 (40%)	647	5.9999e-05	0.000122	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.16276	0.181	0.00045	0.000778	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00044	0.000764
14q loss	266 (25%)	814	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
15q loss	320 (30%)	760	8.9999e-05	0.000178	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0024	0.00362	0.0088899	0.0121	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05
16p loss	173 (16%)	907	0.2215	0.241	0.096019	0.11	0.00032	0.000567	0.00037	0.000648	0.0099299	0.0135	0.11641	0.132	0.00055999	0.000953	0.00165	0.00258	0.00148	0.00235	0.00050999	0.000874	0.00019	0.000354	0.03021	0.0381
16q loss	593 (55%)	487	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00166	0.00259	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00134	0.00214	7.9999e-05	0.00016
17p loss	579 (54%)	501	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.076439	0.09	0.11967	0.136
17q loss	275 (25%)	805	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	7.9999e-05	0.00016	0.00222	0.00337
18p loss	320 (30%)	760	0.00021	0.000386	0.00044	0.000764	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.1449	0.163	0.18197	0.201	0.00029	0.000523	9.9999e-06	2.35e-05	7.9999e-05	0.00016	9.9999e-06	2.35e-05	0.39121	0.412	0.94144	0.942
18q loss	321 (30%)	759	0.00021	0.000386	0.00022	0.000403	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.01039	0.014	0.18744	0.207	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.20615	0.227	0.61041	0.627
19p loss	193 (18%)	887	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.04165	0.0514	0.00095999	0.00158	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05
19q loss	161 (15%)	919	0.00491	0.00699	2e-05	4.34e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.12556	0.142	0.02649	0.0337	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-04	0.000539	9.9999e-06	2.35e-05
20p loss	93 (9%)	987	0.00321	0.00473	0.00019	0.000354	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.053429	0.0644	0.21451	0.235	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	7.9999e-05	0.00016
20q loss	55 (5%)	1025	0.01253	0.0166	0.0050199	0.00714	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.04427	0.0542	0.095719	0.11	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00016	0.000303	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-04	0.000371
21q loss	180 (17%)	900	0.0337	0.042	0.14938	0.168	9.9999e-06	2.35e-05	0.00261	0.0039	0.49842	0.516	0.45331	0.475	0.01732	0.0226	0.00383	0.00554	0.01098	0.0147	0.0063199	0.00881	0.01917	0.0249	0.050659	0.0613
22q loss	482 (45%)	598	0.053929	0.065	0.0051999	0.00736	9.9999e-06	2.35e-05	0.00011	0.000215	0.10919	0.125	0.00253	0.00379	9.9999e-05	0.000196	4e-05	8.32e-05	0.00319	0.00471	0.00055999	0.000953	0.00376	0.00545	0.14916	0.168
xp loss	190 (18%)	890	9.9999e-05	0.000196	0.00011	0.000215	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00216	0.0033	0.00033	0.000584	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.36e-05	3e-05	6.36e-05	0.0054999	0.00774	0.00309	0.00457
xq loss	190 (18%)	890	0.088709	0.103	0.002	0.00306	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.04555	0.0555	0.01533	0.0202	0.00013	0.00025	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.34e-05	0.00067999	0.00115	0.0018	0.00278	0.00167	0.0026