Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1q24.1	62 (12%)	466	0.25943	0.322	0.78698	0.828	9.9999e-06	3.96e-05	0.14421	0.199	0.36718	0.436	0.39775	0.468	9.9999e-06	3.96e-05	0.00409	0.00909	9.9999e-06	3.96e-05	0.0070799	0.0145	0.58072	0.645	0.9249	0.935
amp_1q32.1	62 (12%)	466	0.41192	0.481	0.8997	0.912	9.9999e-06	3.96e-05	0.03979	0.066	0.16607	0.222	0.12276	0.176	9.9999e-06	3.96e-05	0.00165	0.00399	9.9999e-06	3.96e-05	0.00058999	0.00162	0.27629	0.342	0.74992	0.803
amp_3q26.32	87 (16%)	441	0.057629	0.0914	0.11916	0.172	9.9999e-06	3.96e-05	2e-05	7.35e-05	2e-05	7.35e-05	7.9999e-05	0.000259	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.0011	0.00283	0.0054599	0.0118	0.12848	0.183
amp_4q32.1	16 (3%)	512	0.18956	0.248	0.77792	0.821	0.23484	0.301	0.70602	0.768	0.35234	0.421	0.02392	0.042	0.01968	0.0352	0.01252	0.0241	0.00157	0.00384	0.10427	0.153	0.23201	0.298	0.49847	0.566
amp_5q35.1	332 (63%)	196	0.061509	0.0971	0.04927	0.0793	0.00039	0.00109	0.33513	0.405	0.072429	0.112	0.00093999	0.00247	0.00123	0.0031	9.9999e-06	3.96e-05	0.13196	0.186	0.40494	0.475	0.62001	0.683	0.74202	0.797
amp_7q36.3	176 (33%)	352	0.45231	0.52	0.85942	0.881	9.9999e-06	3.96e-05	0.0055699	0.0119	9.9999e-06	3.96e-05	2e-05	7.35e-05	2e-05	7.35e-05	0.0060799	0.0129	0.0067899	0.0141	0.01425	0.0271	0.14701	0.201	0.79023	0.829
amp_8q24.22	79 (15%)	449	0.22621	0.292	0.10588	0.154	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	2e-05	7.35e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.02494	0.0436
amp_10p14	20 (4%)	508	0.19064	0.249	0.7772	0.821	7.9999e-05	0.000259	0.18117	0.239	0.01552	0.0284	0.066559	0.104	0.00219	0.00519	4e-05	0.000137	0.03143	0.0536	0.03478	0.0587	0.86436	0.884	0.36819	0.436
amp_xp22.2	31 (6%)	497	1	1	0.52491	0.589	0.0088399	0.0179	0.2362	0.301	0.00078999	0.00212	0.00405	0.00908	0.054989	0.0876	0.00431	0.00952	0.03734	0.0622	0.34948	0.419	0.94297	0.951	0.88072	0.897
amp_xp11.4	33 (6%)	495	0.84396	0.873	0.79678	0.831	0.00181	0.00434	0.11524	0.167	9.9999e-06	3.96e-05	0.00286	0.0066	0.02899	0.0502	0.00025	0.000726	0.04932	0.0793	0.2447	0.309	0.79401	0.831	1	1
amp_xq11.2	29 (5%)	499	0.17171	0.228	0.15945	0.216	0.16521	0.222	0.25692	0.321	0.14625	0.201	0.053579	0.0857	0.19255	0.249	0.31111	0.381	0.13984	0.194	0.42492	0.493	0.39111	0.462	0.85409	0.881
amp_xq28	37 (7%)	491	0.49266	0.563	0.7035	0.767	0.16357	0.221	0.63983	0.702	0.01922	0.0346	0.092069	0.138	0.078789	0.121	0.03492	0.0587	0.10798	0.157	0.32794	0.399	0.73153	0.791	0.48472	0.556
del_1p36.23	103 (20%)	425	0.00014	0.000424	0.00080999	0.00216	9.9999e-06	3.96e-05	0.080319	0.123	5.9999e-05	0.000198	0.00011	0.000341	9.9999e-05	0.000313	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.0044	0.00966	0.02095	0.0373	0.31202	0.381
del_1p31.1	77 (15%)	451	0.00187	0.00446	0.0066099	0.0139	9.9999e-06	3.96e-05	0.095149	0.142	0.00131	0.00325	3e-05	0.000105	0.01471	0.0274	2e-05	7.35e-05	3e-05	0.000105	0.00249	0.00586	0.0051799	0.0113	0.61941	0.683
del_1q43	42 (8%)	486	0.0107	0.0213	0.01144	0.0225	5.9999e-05	0.000198	0.35429	0.422	0.02368	0.0418	0.00339	0.00768	0.0056899	0.0121	9.9999e-06	3.96e-05	0.099649	0.146	0.01685	0.0305	0.28938	0.356	0.82349	0.854
del_2q37.3	50 (9%)	478	0.00154	0.0038	0.00037	0.00104	0.76639	0.814	0.61968	0.683	0.41573	0.484	0.23729	0.301	9.9999e-05	0.000313	3e-05	0.000105	0.01208	0.0236	0.068489	0.106	0.25051	0.314	0.13609	0.191
del_3p26.3	455 (86%)	73	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.00019	0.000556	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-05	0.000313	4e-05	0.000137	0.00276	0.00641	0.01037	0.0207
del_3p22.2	465 (88%)	63	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	3e-05	0.000105	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.0066499	0.0139	0.0301	0.0516
del_3p14.1	373 (71%)	155	0.00334	0.00761	0.0098999	0.0199	9.9999e-06	3.96e-05	0.0054999	0.0119	0.090279	0.137	0.0068599	0.0142	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.091199	0.137	0.0069699	0.0143	0.3345	0.405	0.88226	0.897
del_3p12.2	305 (58%)	223	0.04046	0.0662	0.064379	0.101	9.9999e-06	3.96e-05	0.02137	0.0379	0.27764	0.342	0.19161	0.249	0.00070999	0.00192	2e-05	7.35e-05	0.25849	0.322	0.04485	0.0731	0.52561	0.589	0.73794	0.795
del_3q11.2	161 (30%)	367	0.18473	0.243	0.16678	0.222	9.9999e-06	3.96e-05	0.04032	0.0662	0.8581	0.881	0.13748	0.192	0.51471	0.581	5e-05	0.000168	0.53654	0.6	0.063799	0.1	0.75132	0.803	0.75788	0.807
del_4q34.3	78 (15%)	450	0.23722	0.301	0.49469	0.564	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	8.9999e-05	0.000289	0.00305	0.00699	0.00014	0.000424	9.9999e-06	3.96e-05	0.15099	0.206	0.0077799	0.0158	0.18002	0.238	0.01546	0.0284
del_6q26	151 (29%)	377	0.0144	0.0273	0.097729	0.144	9.9999e-06	3.96e-05	0.01145	0.0225	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.00116	0.00296	0.00029	0.000835	9.9999e-06	3.96e-05	0.00014	0.000424	0.02981	0.0513	0.132	0.186
del_6q26	151 (29%)	377	0.01487	0.0275	0.097439	0.144	9.9999e-06	3.96e-05	0.01243	0.0241	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.00042	0.00116	0.00019	0.000556	9.9999e-06	3.96e-05	0.00016	0.00048	0.02809	0.0489	0.13306	0.187
del_8p23.2	154 (29%)	374	0.50244	0.569	0.2457	0.309	9.9999e-06	3.96e-05	0.04002	0.0661	0.01388	0.0266	0.72651	0.788	0.00164	0.00399	9.9999e-06	3.96e-05	0.00090999	0.00241	0.00095999	0.0025	0.14063	0.195	0.33715	0.406
del_9p23	152 (29%)	376	0.00406	0.00908	0.03611	0.0605	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.00268	0.00626	0.12368	0.177
del_9p21.3	159 (30%)	369	0.00105	0.00272	0.01595	0.029	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.00118	0.00299	0.01245	0.0241
del_10q23.31	96 (18%)	432	0.44093	0.509	0.54539	0.608	9.9999e-06	3.96e-05	0.00126	0.00315	0.68372	0.748	0.01483	0.0275	0.04846	0.0786	0.00032	0.000914	0.01467	0.0274	3e-05	0.000105	0.80181	0.834	0.43598	0.505
del_13q14.2	82 (16%)	446	0.01459	0.0274	0.082619	0.126	9.9999e-06	3.96e-05	0.00019	0.000556	9.9999e-06	3.96e-05	0.00059999	0.00164	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.096199	0.143	0.1535	0.209
del_14q31.1	228 (43%)	300	5e-05	0.000168	0.00036	0.00102	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.03207	0.0545	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	9.9999e-06	3.96e-05	0.090149	0.137	0.95326	0.959