Clinical Features Time to Death YEARS_TO_BIRTH PATHOLOGY_T_STAGE PATHOLOGY_N_STAGE RADIATION_THERAPY HISTOLOGICAL_TYPE RESIDUAL_TUMOR NUMBER_OF_LYMPH_NODES GLEASON_SCORE PSA_VALUE RACE nCNV (%) nWild-Type logrank test_P logrank test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q amp_1q22 39 (8%) 452 0.41662 0.588 0.01224 0.0463 9.9999e-06 0.000162 0.00055706 0.00419 0.033018 0.0952 0.01909 0.0653 0.053409 0.137 0.00017117 0.00183 3.2371e-07 1.16e-05 0.16264 0.315 1 1 amp_3q21.3 74 (15%) 417 0.20861 0.38 0.0028157 0.0148 9.9999e-06 0.000162 0.0011951 0.0075 0.026456 0.0816 0.24373 0.423 0.00044 0.00366 0.00010523 0.00121 7.0082e-11 1.25e-08 0.1359 0.272 0.65899 0.793 amp_3q26.2 85 (17%) 406 0.29014 0.476 0.024661 0.0784 9.9999e-06 0.000162 0.00063613 0.00459 0.087116 0.194 0.27811 0.465 3e-04 0.00268 5.7425e-05 0.000747 2.1687e-09 1.72e-07 0.051119 0.133 1 1 amp_4p16.3 19 (4%) 472 0.53472 0.69 0.045223 0.122 0.00075999 0.00523 0.34592 0.533 0.71094 0.843 0.42886 0.601 0.23215 0.411 0.34423 0.533 0.0084272 0.035 0.37677 0.562 1 1 amp_4q13.3 22 (4%) 469 0.52979 0.688 0.019033 0.0653 0.00184 0.0107 0.00052134 0.00397 0.29386 0.479 0.47829 0.643 0.0050699 0.0227 5.1432e-05 0.000681 0.00025638 0.00238 0.37823 0.562 1 1 amp_5q35.3 28 (6%) 463 0.4489 0.62 2.6012e-07 1.03e-05 0.00019 0.00197 0.00071723 0.00508 0.55565 0.703 0.56546 0.708 0.062129 0.151 6.3509e-05 0.000811 3.6436e-05 0.000501 0.93123 1 0.2638 0.45 amp_7p14.3 103 (21%) 388 0.46394 0.632 0.010682 0.0423 0.01834 0.0637 0.35849 0.545 0.38498 0.566 0.74415 0.869 0.00172 0.0101 0.27353 0.462 0.00020479 0.00204 0.9969 1 1 1 amp_7q22.1 100 (20%) 391 0.46545 0.633 0.0081836 0.0342 0.063169 0.153 0.53587 0.69 0.37963 0.563 1 1 0.00326 0.0163 0.46307 0.632 0.00018549 0.00195 0.59807 0.736 1 1 amp_8p11.23 67 (14%) 424 0.19643 0.365 0.00048764 0.00383 0.00364 0.0176 0.37507 0.562 0.40899 0.586 0.70425 0.837 0.01192 0.0457 0.2677 0.456 1.6736e-06 4.99e-05 0.78558 0.902 1 1 amp_8q22.1 156 (32%) 335 0.56005 0.707 0.090933 0.201 9.9999e-06 0.000162 0.0014161 0.00873 0.0087725 0.036 0.56361 0.708 2e-05 0.000292 0.00048298 0.00383 2.4321e-13 1.74e-10 0.060588 0.148 1 1 amp_8q24.21 151 (31%) 340 0.97275 1 0.056985 0.143 9.9999e-06 0.000162 0.00073767 0.00517 0.03035 0.0889 0.56562 0.708 0.00024 0.00229 0.00014724 0.0016 1.5254e-12 3.64e-10 0.032119 0.0937 0.81225 0.92 amp_9q33.3 61 (12%) 430 0.91231 1 0.027413 0.0838 9.9999e-06 0.000162 1.1954e-08 6.57e-07 0.18676 0.351 0.082839 0.187 0.00077999 0.00531 2.7382e-10 3.26e-08 1.3002e-12 3.64e-10 0.22884 0.408 0.55511 0.703 amp_11q13.2 47 (10%) 444 0.40746 0.585 0.00056852 0.00423 9.9999e-06 0.000162 6.2606e-06 0.000162 0.096269 0.207 0.63417 0.77 0.00303 0.0155 2.8684e-07 1.08e-05 2.2823e-08 1.09e-06 0.57898 0.721 0.34458 0.533 amp_12q23.1 36 (7%) 455 0.38665 0.567 0.1156 0.238 0.00069999 0.005 0.00020358 0.00204 0.011958 0.0457 1 1 3e-04 0.00268 2.774e-05 0.000389 9.959e-07 3.24e-05 0.37388 0.562 1 1 amp_13q12.11 25 (5%) 466 0.79008 0.905 0.00041226 0.00355 0.0045 0.0208 0.15097 0.295 0.33841 0.528 0.029292 0.0868 0.20228 0.373 0.083619 0.188 0.010712 0.0423 0.46211 0.632 0.30677 0.491 amp_14q21.1 30 (6%) 461 0.68217 0.815 0.036816 0.103 0.069109 0.163 0.014835 0.0538 0.0031871 0.016 0.20827 0.38 0.41462 0.588 0.0055031 0.0239 7.7397e-05 0.000938 0.91546 1 1 1 amp_15q11.2 15 (3%) 476 0.093247 0.203 0.084958 0.19 0.11797 0.242 0.00014298 0.00157 0.058559 0.146 1 1 0.03436 0.0975 4.2728e-06 0.000122 0.0030714 0.0156 0.62796 0.765 NA NA amp_16q11.2 30 (6%) 461 0.5066 0.666 0.026235 0.0816 0.00029 0.00266 0.072839 0.169 0.053878 0.137 0.20827 0.38 0.03801 0.105 0.05894 0.146 1.5683e-06 4.88e-05 0.020536 0.0691 1 1 amp_17q23.2 25 (5%) 466 0.11951 0.243 0.17114 0.328 0.00083999 0.00567 0.021732 0.071 0.053878 0.137 0.029292 0.0868 0.20307 0.373 0.011078 0.0433 7.0895e-05 0.000874 0.049744 0.132 1 1 amp_19q13.43 18 (4%) 473 0.24033 0.419 0.030091 0.0885 5e-04 0.00384 0.022033 0.0716 1 1 0.089006 0.198 0.27501 0.463 0.011519 0.0445 8.97e-06 0.000162 0.44662 0.618 1 1 amp_20q13.2 44 (9%) 447 0.96949 1 0.0049331 0.0224 2e-05 0.000292 0.0085721 0.0354 0.076684 0.177 0.36205 0.55 0.02059 0.0691 0.0034285 0.0168 1.5115e-07 6.36e-06 0.064707 0.155 1 1 amp_xp22.11 25 (5%) 466 0.59237 0.733 0.013498 0.0501 0.00236 0.013 0.10422 0.221 0.043563 0.118 0.029292 0.0868 0.01791 0.0626 0.086151 0.192 0.00098792 0.00654 0.31442 0.5 0.25948 0.444 amp_xp22.11 24 (5%) 467 0.55178 0.702 0.078205 0.178 0.00217 0.0122 0.060004 0.147 0.50161 0.661 0.026224 0.0816 0.01774 0.0625 0.06417 0.154 0.0011491 0.0074 0.099593 0.213 0.21464 0.389 amp_xp21.1 23 (5%) 468 0.54298 0.697 0.0015663 0.00943 0.0054199 0.0238 0.049939 0.132 0.73581 0.865 0.023344 0.0752 0.01746 0.0618 0.046345 0.124 0.00023218 0.00224 0.11289 0.235 0.0074499 0.0317 amp_xq21.1 16 (3%) 475 0.55073 0.702 0.059363 0.146 0.04324 0.118 0.18792 0.352 1 1 1 1 0.13822 0.276 0.22115 0.397 0.0055132 0.0239 0.43843 0.609 0.34751 0.534 amp_xq21.1 14 (3%) 477 0.59692 0.736 0.016355 0.0584 0.01983 0.0675 0.02768 0.0842 0.68277 0.815 1 1 0.079809 0.181 0.025324 0.0801 0.0020712 0.0118 0.37489 0.562 0.02729 0.0837 amp_xq25 19 (4%) 472 0.28138 0.469 0.28833 0.476 0.050529 0.133 0.34592 0.533 1 1 1 1 0.18861 0.352 0.40276 0.581 0.0049483 0.0224 0.14971 0.295 0.0188 0.0649 amp_xq27.1 19 (4%) 472 0.18797 0.352 0.021584 0.0708 0.077379 0.177 0.52982 0.688 1 1 1 1 0.17064 0.328 0.68434 0.816 0.037129 0.103 0.114 0.236 0.42286 0.594 del_1p31.3 59 (12%) 432 0.47647 0.643 0.23344 0.412 0.0095499 0.0386 0.12763 0.259 0.029377 0.0868 0.39271 0.571 0.070079 0.164 0.098868 0.212 0.00020496 0.00204 0.27472 0.463 0.19868 0.367 del_1p22.1 58 (12%) 433 0.94879 1 0.51534 0.676 0.00267 0.0142 0.12763 0.259 0.18676 0.351 0.39023 0.569 0.091149 0.201 0.043517 0.118 0.00013208 0.00148 0.97566 1 1 1 del_1q23.1 28 (6%) 463 0.36589 0.554 0.1401 0.278 0.3833 0.566 0.79967 0.915 0.76825 0.887 1 1 0.48631 0.645 0.81073 0.92 0.99111 1 0.89264 1 1 1 del_1q42.3 47 (10%) 444 0.00010209 0.0012 0.1145 0.236 0.35316 0.54 0.30691 0.491 1 1 1 1 0.01043 0.0419 0.13835 0.276 0.067944 0.161 0.092577 0.202 0.555 0.703 del_2p21 45 (9%) 446 0.98755 1 0.15001 0.295 0.00035 0.00309 0.058489 0.146 0.45783 0.63 0.62836 0.765 0.050639 0.133 0.055417 0.141 0.0029968 0.0154 0.23061 0.409 1 1 del_2q22.1 91 (19%) 400 0.48305 0.643 2.2358e-05 0.00032 0.15035 0.295 1 1 0.71477 0.846 0.48359 0.643 0.28987 0.476 0.93933 1 0.013516 0.0501 0.41546 0.588 0.41574 0.588 del_2q22.3 84 (17%) 407 0.41601 0.588 0.0033178 0.0165 0.48077 0.643 0.61866 0.757 0.70497 0.837 0.48171 0.643 0.54988 0.702 0.49465 0.654 0.094667 0.205 0.24637 0.427 1 1 del_3p13 78 (16%) 413 0.61929 0.757 0.051325 0.133 0.93292 1 0.30389 0.489 0.11413 0.236 0.25377 0.436 0.29018 0.476 0.25952 0.444 0.22411 0.401 0.74458 0.869 1 1 del_3q29 32 (7%) 459 0.43856 0.609 0.64821 0.784 0.19834 0.367 0.33214 0.52 0.2879 0.476 0.22995 0.409 0.18289 0.346 0.27347 0.462 0.10943 0.231 0.92268 1 1 1 del_4q28.2 50 (10%) 441 0.35713 0.544 0.0015832 0.00943 0.059479 0.146 0.54031 0.695 0.11031 0.231 0.64408 0.781 0.53559 0.69 0.37808 0.562 0.0007614 0.00523 0.59137 0.733 0.29929 0.483 del_5q11.2 99 (20%) 392 0.65621 0.791 0.025731 0.081 9.9999e-06 0.000162 0.0003708 0.00323 0.0076555 0.0322 0.74561 0.869 0.02829 0.0857 1.4939e-05 0.000232 5.052e-10 5.16e-08 0.40619 0.584 0.4378 0.609 del_5q13.2 98 (20%) 393 0.48308 0.643 0.392 0.571 9.9999e-06 0.000162 0.021417 0.0706 0.033786 0.0966 0.74622 0.869 0.23811 0.418 0.0026576 0.0142 1.0349e-08 6.17e-07 0.28802 0.476 0.29334 0.479 del_5q21.1 108 (22%) 383 0.51741 0.676 0.056678 0.143 0.02582 0.081 0.88263 0.992 0.3116 0.497 0.7444 0.869 0.47383 0.642 0.67601 0.81 0.0018478 0.0107 0.07548 0.175 0.73366 0.864 del_6p25.1 46 (9%) 445 0.1714 0.328 0.31956 0.504 0.0094999 0.0386 0.0060527 0.0261 0.22183 0.398 1 1 0.61709 0.757 0.0015741 0.00943 8.203e-06 0.000162 0.4868 0.645 0.0066399 0.0284 del_6q14.3 179 (36%) 312 0.34162 0.531 0.0010411 0.00683 0.066599 0.159 0.026481 0.0816 0.14107 0.279 1 1 0.00044 0.00366 0.017962 0.0626 0.00044529 0.00366 0.5292 0.688 0.58034 0.722 del_7q31.33 28 (6%) 463 0.81099 0.92 0.31225 0.497 0.38283 0.566 0.10422 0.221 0.35289 0.54 1 1 0.94951 1 0.037036 0.103 0.092358 0.202 0.88549 0.994 1 1 del_8p23.2 223 (45%) 268 0.40025 0.578 0.3762 0.562 9.9999e-06 0.000162 0.011169 0.0434 0.15636 0.304 1 1 0.53162 0.689 0.0053172 0.0235 0.0045932 0.0211 0.068863 0.162 0.37513 0.562 del_8p21.3 293 (60%) 198 0.38926 0.569 0.38615 0.567 9.9999e-06 0.000162 0.0027198 0.0144 0.058866 0.146 0.58202 0.722 0.15636 0.304 0.001302 0.00809 0.0010878 0.00707 0.083793 0.188 0.72944 0.861 del_9p23 45 (9%) 446 0.28295 0.47 0.49764 0.656 0.0238 0.0762 0.020136 0.0682 0.096269 0.207 1 1 0.4161 0.588 0.0075462 0.0319 0.0040105 0.019 0.27058 0.46 1 1 del_10q23.31 156 (32%) 335 0.90946 1 0.54794 0.701 9.9999e-06 0.000162 0.0023631 0.013 0.021401 0.0706 0.77419 0.893 0.16448 0.318 0.0011847 0.0075 5.2957e-08 2.37e-06 0.0095567 0.0386 0.23454 0.413 del_11p11.2 34 (7%) 457 0.52844 0.688 0.51636 0.676 0.01643 0.0584 0.47893 0.643 1 1 0.61292 0.753 0.043 0.117 0.32939 0.516 0.012087 0.046 0.59702 0.736 0.00346 0.0168 del_11q22.3 43 (9%) 448 0.3837 0.566 0.03377 0.0966 0.00061999 0.00452 0.17334 0.33 0.052914 0.137 0.35112 0.539 0.00393 0.0187 0.067973 0.161 6.8898e-05 0.000864 0.80591 0.919 0.63294 0.77 del_11q23.2 48 (10%) 443 0.37065 0.56 0.071087 0.166 0.00264 0.0142 0.67176 0.806 0.072488 0.169 1 1 0.01435 0.0526 0.80829 0.92 8.4209e-05 0.001 0.4633 0.632 0.66179 0.795 del_12p13.1 124 (25%) 367 0.8034 0.918 0.78565 0.902 9.9999e-06 0.000162 0.010971 0.0431 0.022534 0.0729 0.12894 0.26 0.34053 0.53 0.0029721 0.0154 4.4937e-05 0.000606 0.021011 0.0699 1 1 del_12q24.32 43 (9%) 448 0.90354 1 0.81655 0.924 0.00294 0.0153 0.029071 0.0868 0.32523 0.512 1 1 0.3283 0.516 0.014689 0.0536 0.054022 0.137 0.98093 1 1 1 del_13q14.13 227 (46%) 264 0.90676 1 0.012944 0.0485 0.00433 0.0201 0.2093 0.38 0.0041144 0.0193 0.2766 0.464 0.00198 0.0113 0.17807 0.338 1.4815e-05 0.000232 0.31907 0.504 0.00414 0.0193 del_13q22.1 176 (36%) 315 0.2982 0.483 0.00088291 0.0059 0.00011 0.00125 0.092713 0.202 0.077287 0.177 0.397 0.575 0.01286 0.0484 0.037001 0.103 2.1504e-10 3.08e-08 0.29076 0.476 0.00047 0.00378 del_15q21.3 66 (13%) 425 0.56455 0.708 0.29868 0.483 9.9999e-06 0.000162 0.0015504 0.00943 0.0026145 0.0142 0.41612 0.588 0.18978 0.353 0.00061432 0.00452 1.7275e-08 8.82e-07 0.11223 0.235 1 1 del_16q22.3 190 (39%) 301 0.43476 0.607 0.041495 0.115 0.00022 0.00215 0.028919 0.0868 0.56286 0.708 1 1 0.03237 0.0941 0.010632 0.0423 7.2151e-09 4.69e-07 0.09054 0.2 0.71755 0.848 del_16q24.1 212 (43%) 279 0.43232 0.605 0.25097 0.433 2e-05 0.000292 0.042479 0.117 0.47709 0.643 1 1 0.11911 0.243 0.020946 0.0699 3.0056e-09 2.15e-07 0.063369 0.153 1 1 del_17p13.1 162 (33%) 329 0.54588 0.699 0.41386 0.588 9.9999e-06 0.000162 0.0034414 0.0168 0.016138 0.058 0.78104 0.899 0.0152 0.0549 0.00043493 0.00366 1.987e-09 1.72e-07 0.23833 0.418 0.82272 0.929 del_17q21.31 96 (20%) 395 0.46119 0.632 0.3059 0.491 0.11422 0.236 0.87371 0.984 1 1 0.74236 0.869 0.95949 1 0.86016 0.97 0.3187 0.504 0.94586 1 0.76315 0.884 del_18q21.31 130 (26%) 361 0.42061 0.592 0.76546 0.886 0.00045 0.00366 0.023864 0.0762 0.05049 0.133 1 1 0.00116 0.00741 0.014185 0.0523 4.7467e-06 0.000131 0.25342 0.436 0.39515 0.573 del_18q23 136 (28%) 355 0.46665 0.633 0.14832 0.293 5e-04 0.00384 0.0051902 0.023 0.10987 0.231 1 1 0.0037 0.0178 0.0023395 0.013 9.8119e-07 3.24e-05 0.033009 0.0952 0.44633 0.618 del_19q13.2 52 (11%) 439 0.10903 0.231 0.049636 0.132 0.00499 0.0224 0.24188 0.421 0.65086 0.786 1 1 0.04279 0.117 0.23924 0.418 0.00024991 0.00235 0.48089 0.643 1 1 del_21q22.2 52 (11%) 439 0.29458 0.479 0.22051 0.397 0.00166 0.00981 0.065974 0.158 0.10124 0.216 0.17671 0.336 0.75362 0.875 0.034131 0.0972 0.034697 0.0981 0.57194 0.714 0.077359 0.177 del_21q22.3 146 (30%) 345 0.27805 0.465 0.16784 0.323 0.050899 0.133 0.13192 0.266 0.21892 0.395 0.5689 0.711 0.7473 0.869 0.057216 0.144 0.20656 0.379 0.44987 0.62 0.13451 0.27