Clinical Features Time to Death YEARS_TO_BIRTH TUMOR_TISSUE_SITE GENDER RADIATION_THERAPY HISTOLOGICAL_TYPE RESIDUAL_TUMOR RACE ETHNICITY nCNV (%) nWild-Type logrank test_P logrank test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q amp_1p32.1 94 (37%) 162 0.00016099 0.00503 0.00043269 0.00952 0.02016 0.11 0.19613 0.436 0.0084559 0.0636 0.00144 0.0194 0.38868 0.638 0.13493 0.35 0.15931 0.386 amp_1q21.3 104 (41%) 152 0.35657 0.609 0.018354 0.104 0.04538 0.182 0.099 0.285 0.013884 0.0847 0.00431 0.0376 0.36263 0.615 0.93728 1 0.65077 0.821 amp_1q24.3 102 (40%) 154 0.093104 0.274 0.13992 0.356 0.38139 0.636 0.89859 0.98 0.030105 0.143 0.31911 0.578 0.59156 0.8 0.63538 0.821 1 1 amp_2p11.2 64 (25%) 192 0.80146 0.923 0.00088032 0.0145 0.94744 1 0.14819 0.373 0.51245 0.742 0.44516 0.689 0.71936 0.867 0.13221 0.345 1 1 amp_3p12.1 69 (27%) 187 0.20266 0.443 1.1305e-05 0.00056 0.00031 0.00801 0.39639 0.638 0.054688 0.202 9.9999e-06 0.00054 0.46549 0.704 0.72706 0.871 0.326 0.578 amp_4q12 78 (30%) 178 0.23784 0.489 0.037839 0.162 0.02301 0.118 0.58604 0.8 0.0037511 0.0353 5e-05 0.00186 0.52289 0.75 0.55402 0.776 1 1 amp_5p15.33 119 (46%) 137 0.081113 0.261 0.0014671 0.0194 0.04259 0.174 0.16837 0.398 0.064835 0.224 0.01541 0.0925 0.59383 0.8 0.9405 1 1 1 amp_6p21.1 60 (23%) 196 0.00084708 0.0145 0.068045 0.231 0.64095 0.821 0.30338 0.567 0.031147 0.145 0.16375 0.391 0.30302 0.567 0.12301 0.334 0.33646 0.586 amp_6q25.1 75 (29%) 181 0.65725 0.824 0.087529 0.271 0.47269 0.709 0.07362 0.243 0.16729 0.397 0.00022 0.00653 0.26505 0.525 0.93151 1 0.63178 0.821 amp_7q31.2 77 (30%) 179 0.088087 0.271 1.3137e-06 0.00054 0.086889 0.271 0.89138 0.976 0.020639 0.11 0.0025 0.0276 0.96457 1 1 1 0.64765 0.821 amp_8p11.22 81 (32%) 175 0.0075091 0.0579 0.0012074 0.0175 0.64015 0.821 1 1 0.12652 0.34 0.057799 0.211 0.63203 0.821 0.089629 0.274 0.66044 0.826 amp_8q24.21 83 (32%) 173 0.0025952 0.028 0.38873 0.638 0.41428 0.658 0.79006 0.913 0.65252 0.821 0.098699 0.285 0.19424 0.435 0.15875 0.386 0.33423 0.584 amp_11q22.2 36 (14%) 220 0.032814 0.151 0.0061586 0.0501 0.89881 0.98 0.59304 0.8 0.23169 0.483 0.091579 0.274 0.78332 0.913 0.16203 0.388 0.53908 0.762 amp_12q15 94 (37%) 162 0.042754 0.174 0.0069021 0.0554 2e-05 0.000849 0.0004131 0.00952 0.46588 0.704 9.9999e-06 0.00054 0.00090999 0.0146 0.0071799 0.0561 1 1 amp_13q34 54 (21%) 202 0.18052 0.416 0.21374 0.45 0.04858 0.189 0.091747 0.274 0.0246 0.124 0.074649 0.245 0.50906 0.739 0.03666 0.16 0.58806 0.8 amp_15q26.3 84 (33%) 172 0.58323 0.8 0.018182 0.104 0.48238 0.718 0.28535 0.547 0.36667 0.619 0.16013 0.386 0.56893 0.791 0.61902 0.821 0.34706 0.598 amp_17p12 102 (40%) 154 0.31628 0.578 0.01667 0.0988 0.45605 0.698 0.7022 0.853 0.061636 0.219 0.00333 0.033 0.62133 0.821 0.77336 0.908 0.3998 0.642 amp_17p11.2 104 (41%) 152 0.33339 0.584 0.018184 0.104 0.03898 0.162 0.25372 0.513 0.000838 0.0145 2e-05 0.000849 0.21286 0.45 0.49536 0.728 1 1 amp_17q24.3 79 (31%) 177 0.27361 0.537 0.038541 0.162 0.2134 0.45 0.030341 0.143 0.022018 0.117 0.01051 0.0718 0.03866 0.162 0.54839 0.772 1 1 amp_19p13.2 107 (42%) 149 0.82074 0.933 0.28298 0.544 0.18577 0.426 0.20564 0.446 0.77387 0.908 0.067819 0.231 0.57367 0.794 0.7308 0.872 0.6541 0.821 amp_19q12 93 (36%) 163 0.10841 0.304 0.00064781 0.0133 0.26253 0.522 0.24431 0.495 0.040423 0.167 0.01173 0.0768 0.45701 0.698 0.87164 0.967 0.65402 0.821 amp_20q13.33 98 (38%) 158 0.031002 0.145 0.00027768 0.0075 0.073649 0.243 0.0098978 0.0684 0.013425 0.0831 0.00098999 0.0151 0.10177 0.288 1 1 1 1 amp_21q21.1 73 (29%) 183 0.12294 0.334 0.0055438 0.0464 0.49322 0.728 0.071924 0.241 0.20963 0.45 0.13033 0.345 0.48416 0.719 0.58295 0.8 0.32492 0.578 amp_xp21.2 97 (38%) 159 0.78612 0.913 0.034578 0.153 0.28177 0.544 0.60547 0.812 0.029198 0.14 0.0071599 0.0561 0.45871 0.699 0.82131 0.933 0.6505 0.821 amp_xq21.1 46 (18%) 210 0.091128 0.274 0.054365 0.202 0.99742 1 0.33323 0.584 0.19332 0.435 0.32264 0.578 0.86569 0.965 0.2398 0.491 0.22554 0.473 del_1p36.32 69 (27%) 187 0.036869 0.16 0.12774 0.342 0.093319 0.274 0.00039905 0.00952 0.0097854 0.0684 9.9999e-06 0.00054 0.11326 0.313 0.66803 0.827 0.32809 0.578 del_1q44 80 (31%) 176 0.19473 0.435 0.0023344 0.0272 0.66224 0.826 0.78676 0.913 0.00074636 0.0139 5e-05 0.00186 0.12178 0.333 0.22834 0.478 1 1 del_2p25.3 94 (37%) 162 0.39637 0.638 0.064176 0.223 0.28641 0.547 0.026688 0.132 0.24265 0.495 0.00142 0.0194 0.087579 0.271 0.00249 0.0276 0.15924 0.386 del_2q37.3 108 (42%) 148 0.010703 0.0722 0.0088738 0.0656 0.02505 0.125 1 1 0.0098705 0.0684 0.00111 0.0165 0.76445 0.901 0.50342 0.735 0.39646 0.638 del_2q37.3 110 (43%) 146 0.054876 0.202 0.0027752 0.0294 0.0058799 0.0485 0.61294 0.818 0.06378 0.223 0.0038 0.0353 0.58067 0.8 0.53702 0.762 1 1 del_3p21.31 65 (25%) 191 0.3421 0.592 0.34059 0.592 0.086099 0.271 0.88594 0.973 0.075659 0.247 0.00094999 0.0148 0.43363 0.675 0.56175 0.783 1 1 del_3q13.31 51 (20%) 205 0.21089 0.45 0.012318 0.0795 0.6391 0.821 0.43434 0.675 0.013968 0.0847 0.12121 0.333 0.093009 0.274 0.81786 0.932 1 1 del_3q29 54 (21%) 202 0.71911 0.867 0.5198 0.749 0.57153 0.793 0.35689 0.609 0.083215 0.264 0.2668 0.527 0.43637 0.677 0.32227 0.578 1 1 del_4q35.1 94 (37%) 162 0.1509 0.378 0.002022 0.024 0.23445 0.485 0.69636 0.853 0.0051613 0.0438 0.0076499 0.0583 0.19769 0.437 0.2885 0.547 0.16061 0.386 del_5p15.33 33 (13%) 223 0.30261 0.567 0.95762 1 0.03716 0.16 1 1 0.68258 0.84 0.78638 0.913 0.95508 1 0.8765 0.968 1 1 del_6p25.3 81 (32%) 175 0.23658 0.488 0.83667 0.943 0.39387 0.638 0.78928 0.913 1 1 0.03412 0.153 0.98789 1 0.70098 0.853 0.32669 0.578 del_6q14.1 78 (30%) 178 0.47251 0.709 0.25851 0.519 0.0231 0.118 0.89219 0.976 0.020639 0.11 0.081649 0.261 0.87228 0.967 0.80661 0.925 1 1 del_7q36.3 71 (28%) 185 0.19719 0.437 0.47189 0.709 0.32817 0.578 0.6766 0.836 0.42907 0.671 0.17077 0.403 0.12959 0.345 0.4274 0.67 1 1 del_8p23.3 81 (32%) 175 0.093598 0.274 0.048598 0.189 0.64615 0.821 0.50017 0.734 0.051131 0.196 0.10781 0.303 0.2017 0.442 0.59944 0.806 1 1 del_9p24.3 100 (39%) 156 0.20184 0.442 0.0014594 0.0194 0.36095 0.614 0.52168 0.75 0.38612 0.638 0.82611 0.935 0.58667 0.8 1 1 0.65307 0.821 del_9p21.3 114 (45%) 142 0.053809 0.202 0.0019318 0.024 0.6991 0.853 0.61556 0.82 0.4769 0.714 0.0268 0.132 0.26002 0.52 0.50523 0.736 1 1 del_9q34.3 61 (24%) 195 0.13619 0.352 0.27693 0.539 0.19251 0.435 0.46214 0.702 0.10168 0.288 0.00066999 0.0133 0.00282 0.0294 0.01765 0.103 1 1 del_10p15.3 128 (50%) 128 0.91193 0.992 0.028491 0.138 0.41516 0.658 0.13202 0.345 0.091103 0.274 6.9999e-05 0.00231 0.30565 0.569 0.19496 0.435 0.21247 0.45 del_10q23.31 138 (54%) 118 0.12431 0.336 0.020446 0.11 0.51504 0.744 0.21077 0.45 0.047589 0.187 9.9999e-06 0.00054 0.82265 0.933 0.0168 0.0988 0.1789 0.415 del_10q26.3 132 (52%) 124 0.59049 0.8 0.0029414 0.0301 0.17548 0.41 0.45184 0.695 0.32578 0.578 9.9999e-06 0.00054 1 1 0.069939 0.236 0.19373 0.435 del_11p15.5 110 (43%) 146 0.39345 0.638 0.004131 0.0372 0.45671 0.698 0.61294 0.818 0.046747 0.186 0.15785 0.386 0.63925 0.821 0.64028 0.821 0.385 0.638 del_11q24.2 123 (48%) 133 0.70153 0.853 0.012712 0.0812 0.17984 0.416 0.53081 0.756 0.02305 0.118 0.0089699 0.0656 0.00431 0.0376 1 1 0.37061 0.624 del_12p13.1 87 (34%) 169 0.63179 0.821 0.15621 0.386 0.75307 0.891 0.034235 0.153 0.88261 0.973 0.056769 0.208 0.81762 0.932 0.71259 0.863 0.6629 0.826 del_12q12 56 (22%) 200 0.03868 0.162 0.14018 0.356 0.81613 0.932 0.65193 0.821 0.39072 0.638 0.41287 0.658 0.84239 0.948 0.03649 0.16 0.58921 0.8 del_12q24.33 69 (27%) 187 0.68723 0.843 0.0036955 0.0353 0.30891 0.572 0.15715 0.386 1 1 0.41795 0.66 0.49453 0.728 0.39475 0.638 0.32691 0.578 del_13q14.2 180 (70%) 76 0.76081 0.898 0.00199 0.024 0.01088 0.0726 0.09977 0.286 0.020183 0.11 9.9999e-06 0.00054 0.7131 0.863 0.55329 0.776 0.15197 0.379 del_14q24.1 80 (31%) 176 0.53805 0.762 0.95825 1 0.03393 0.153 0.1391 0.356 0.28167 0.544 0.8066 0.925 0.086969 0.271 0.65295 0.821 0.32587 0.578 del_16q11.2 130 (51%) 126 0.84933 0.951 0.062708 0.22 0.04703 0.186 0.13206 0.345 0.091103 0.274 9.9999e-06 0.00054 0.27382 0.537 0.01286 0.0813 1 1 del_16q23.1 134 (52%) 122 0.28814 0.547 0.000276 0.0075 0.0286 0.138 0.1324 0.345 0.47871 0.714 9.9999e-06 0.00054 0.095829 0.279 0.14585 0.369 0.6663 0.826 del_17p13.1 129 (50%) 127 0.059115 0.213 0.20566 0.446 0.054239 0.202 0.059632 0.213 0.033303 0.152 9.9999e-06 0.00054 0.5398 0.762 0.11 0.307 0.68328 0.84 del_17q11.2 81 (32%) 175 0.50395 0.735 0.0036911 0.0353 9.9999e-06 0.00054 0.3451 0.596 0.0098044 0.0684 0.00042 0.00952 0.63046 0.821 0.65073 0.821 1 1 del_17q25.3 67 (26%) 189 0.40509 0.649 0.013274 0.083 0.93406 1 0.77556 0.908 0.62762 0.821 0.49224 0.728 0.65234 0.821 0.72107 0.867 0.32809 0.578 del_18q23 86 (34%) 170 0.019 0.106 0.0031333 0.0315 0.73203 0.872 0.42629 0.67 0.10009 0.286 0.0050899 0.0438 0.39059 0.638 1 1 0.66491 0.826 del_19p13.3 70 (27%) 186 0.95216 1 0.56095 0.783 0.23289 0.484 0.011764 0.0768 0.63833 0.821 0.00251 0.0276 0.83655 0.943 0.72402 0.869 0.32809 0.578 del_19q13.43 106 (41%) 150 0.058931 0.213 0.35474 0.609 0.29095 0.55 0.30832 0.572 0.0041234 0.0372 0.00070999 0.0136 0.13835 0.356 0.31435 0.578 0.39035 0.638 del_21q11.2 51 (20%) 205 0.7988 0.921 0.17653 0.411 0.87704 0.968 0.53104 0.756 0.15892 0.386 0.053519 0.202 0.58291 0.8 0.74764 0.886 0.26179 0.522 del_21q22.3 66 (26%) 190 0.84658 0.951 0.00066117 0.0133 0.85007 0.951 0.88614 0.973 0.1107 0.307 0.076629 0.249 0.52821 0.756 0.92644 1 1 1 del_22q13.32 83 (32%) 173 0.36436 0.617 0.18818 0.43 0.072249 0.241 0.081191 0.261 0.44874 0.692 0.27481 0.537 0.87187 0.967 1 1 1 1 del_xp21.1 55 (21%) 201 0.7326 0.872 0.022929 0.118 0.1735 0.407 0.06786 0.231 0.73514 0.873 0.050929 0.196 0.31122 0.574 0.4148 0.658 0.24354 0.495 del_xq21.1 114 (45%) 142 0.0020035 0.024 0.20949 0.45 0.42406 0.668 0.023572 0.12 0.77637 0.908 0.00085999 0.0145 0.28275 0.544 0.30204 0.567 0.38042 0.636 del_xq22.3 123 (48%) 133 0.0017141 0.0221 0.85431 0.954 0.0090599 0.0656 0.04487 0.181 0.25707 0.518 6.9999e-05 0.00231 0.062239 0.22 0.65415 0.821 0.37242 0.625