GS SIZE SOURCE ES NES NOM p-val FDR q-val FWER p-val Tag % Gene % Signal FDR (median) glob.p.val BIOCARTA_HIVNEF_PATHWAY 56 FASLG 0.42534 1.4976 0.1022 0.18841 0.888 0.446 0.268 0.327 0.12274 0.004 BIOCARTA_DEATH_PATHWAY 31 BID 0.58493 1.7855 0.01509 0.097236 0.404 0.323 0.139 0.278 0 0.009 BIOCARTA_TNFR1_PATHWAY 28 TRAF2 0.54492 1.7062 0.03036 0.11171 0.539 0.393 0.211 0.31 0.046184 0.004 KEGG_GLYCOLYSIS_GLUCONEOGENESIS 59 LDHC 0.47022 1.7663 0.006637 0.087576 0.44 0.441 0.189 0.358 0 0.004 KEGG_CITRATE_CYCLE_TCA_CYCLE 29 LOC642502 0.76084 2.1911 0 0.0096827 0.01 0.793 0.184 0.648 0 0.003 KEGG_PENTOSE_PHOSPHATE_PATHWAY 25 ALDOA 0.60091 1.9366 0 0.053818 0.137 0.44 0.136 0.38 0 0.01 KEGG_FRUCTOSE_AND_MANNOSE_METABOLISM 32 ALDOA 0.65613 1.99 0 0.038386 0.086 0.594 0.174 0.491 0 0.006 KEGG_FATTY_ACID_METABOLISM 39 ACOX1 0.50825 1.6435 0.03942 0.14041 0.668 0.513 0.183 0.42 0.06907 0.006 KEGG_OXIDATIVE_PHOSPHORYLATION 112 LOC642502 0.4483 1.6168 0.1237 0.14663 0.714 0.482 0.239 0.369 0.077614 0.004 KEGG_PYRIMIDINE_METABOLISM 94 CTPS 0.46014 1.6308 0.03112 0.1402 0.696 0.436 0.18 0.359 0.071214 0.004 KEGG_VALINE_LEUCINE_AND_ISOLEUCINE_DEGRADATION 43 BCAT1 0.6461 1.9248 0.007874 0.051791 0.156 0.558 0.183 0.457 0 0.005 KEGG_LYSINE_DEGRADATION 43 EHHADH 0.4559 1.5765 0.03495 0.17142 0.77 0.395 0.184 0.323 0.095111 0.006 KEGG_ARGININE_AND_PROLINE_METABOLISM 53 SAT1 0.52244 1.859 0.01046 0.059405 0.262 0.302 0.0858 0.277 0 0.004 KEGG_TRYPTOPHAN_METABOLISM 39 KYNU 0.3889 1.4311 0.05967 0.24475 0.946 0.385 0.184 0.315 0.18182 0.01 KEGG_SELENOAMINO_ACID_METABOLISM 25 SEPHS2 0.48844 1.5511 0.04134 0.17188 0.804 0.52 0.193 0.42 0.099585 0.004 KEGG_GLUTATHIONE_METABOLISM 45 PGD 0.52098 1.784 0.02439 0.089878 0.405 0.467 0.179 0.384 0 0.005 KEGG_N_GLYCAN_BIOSYNTHESIS 44 RFT1 0.42226 1.5566 0.06 0.17182 0.794 0.273 0.137 0.236 0.099269 0.004 KEGG_AMINO_SUGAR_AND_NUCLEOTIDE_SUGAR_METABOLISM 42 CYB5R3 0.50866 1.7058 0.01477 0.10597 0.541 0.548 0.181 0.45 0.043985 0.003 KEGG_GLYCEROLIPID_METABOLISM 47 PNLIP 0.41606 1.5028 0.05761 0.18862 0.883 0.447 0.189 0.363 0.12063 0.005 KEGG_GLYCEROPHOSPHOLIPID_METABOLISM 74 CDIPT 0.35098 1.4284 0.03786 0.24153 0.949 0.446 0.222 0.348 0.17824 0.01 KEGG_LINOLEIC_ACID_METABOLISM 25 CYP3A4 0.57622 1.6962 0.01171 0.10812 0.567 0.28 0.0619 0.263 0.048077 0.004 KEGG_SPHINGOLIPID_METABOLISM 37 ENPP7 0.5144 1.7159 0.01949 0.11137 0.527 0.324 0.0964 0.294 0.046937 0.005 KEGG_GLYCOSPHINGOLIPID_BIOSYNTHESIS_LACTO_AND_NEOLACTO_SERIES 25 FUT9 0.47413 1.52 0.03782 0.1898 0.862 0.36 0.0895 0.328 0.11955 0.005 KEGG_PYRUVATE_METABOLISM 38 LDHC 0.55177 1.8722 0.003824 0.058613 0.237 0.526 0.216 0.414 0 0.004 KEGG_PROPANOATE_METABOLISM 31 LDHC 0.59623 1.7483 0.01172 0.094227 0.472 0.581 0.183 0.475 0 0.004 KEGG_BUTANOATE_METABOLISM 32 EHHADH 0.57259 1.7824 0.008511 0.083702 0.407 0.469 0.183 0.384 0 0.004 KEGG_AMINOACYL_TRNA_BIOSYNTHESIS 40 TARS2 0.67139 1.9042 0.006024 0.046983 0.186 0.75 0.226 0.582 0 0.001 KEGG_DRUG_METABOLISM_OTHER_ENZYMES 40 CYP3A4 0.51078 1.6572 0.01914 0.13448 0.65 0.425 0.162 0.357 0.067857 0.006 KEGG_RNA_DEGRADATION 56 CNOT8 0.4739 1.5971 0.09703 0.15929 0.75 0.607 0.325 0.411 0.08719 0.003 KEGG_RNA_POLYMERASE 28 POLR2H 0.53434 1.6371 0.06654 0.14048 0.68 0.357 0.18 0.293 0.069648 0.006 KEGG_DNA_REPLICATION 35 POLA1 0.61744 1.4806 0.1378 0.20071 0.903 0.543 0.201 0.435 0.13309 0.005 KEGG_SPLICEOSOME 111 NCBP2 0.39747 1.5094 0.1727 0.1937 0.875 0.703 0.368 0.446 0.12338 0.005 KEGG_PPAR_SIGNALING_PATHWAY 67 ACOX2 0.41461 1.5036 0.03556 0.19372 0.882 0.358 0.16 0.302 0.12391 0.006 KEGG_BASE_EXCISION_REPAIR 32 HMGB1 0.54257 1.5401 0.1048 0.17692 0.825 0.5 0.195 0.403 0.10522 0.004 KEGG_HOMOLOGOUS_RECOMBINATION 25 RAD51C 0.60762 1.5686 0.08577 0.1722 0.775 0.6 0.259 0.445 0.096179 0.005 KEGG_PEROXISOME 74 ACOX2 0.58115 2.0354 0 0.031182 0.052 0.595 0.242 0.452 0 0.004 KEGG_ALZHEIMERS_DISEASE 154 LOC642502 0.35878 1.8299 0.02018 0.071011 0.314 0.422 0.239 0.324 0 0.005 KEGG_PARKINSONS_DISEASE 110 5-Sep 0.42047 1.5633 0.1283 0.17166 0.785 0.509 0.239 0.389 0.098107 0.005 KEGG_HUNTINGTONS_DISEASE 170 LOC642502 0.39627 1.9178 0.01443 0.045069 0.16 0.424 0.239 0.325 0 0