		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	227 (21%)	853	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00107	0.00177
1q gain	708 (66%)	372	0.38548	0.405	0.096489	0.112	9.9999e-06	2.35e-05	0.18991	0.209	0.6265	0.64	0.11145	0.127	9.9999e-06	2.35e-05	0.0069099	0.00978	0.058269	0.0702	0.00025	0.000455	0.24994	0.27	0.3022	0.323
2p gain	122 (11%)	958	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05
2q gain	73 (7%)	1007	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0083499	0.0116
3p gain	137 (13%)	943	0.45745	0.476	0.2966	0.318	9.9999e-06	2.35e-05	5e-05	0.000103	0.02551	0.0323	0.0077399	0.0108	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	5.9999e-05	0.000122	0.26137	0.282	0.17839	0.198
3q gain	213 (20%)	867	0.0051499	0.00745	0.01208	0.0163	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	8.9999e-05	0.000178	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00049	0.000867
4p gain	75 (7%)	1005	0.25765	0.278	0.01577	0.0209	9.9999e-06	2.35e-05	0.0075199	0.0105	0.00162	0.00261	0.070059	0.0831	5.9999e-05	0.000122	0.01622	0.0213	0.0069599	0.00981	0.01723	0.0225	0.55915	0.573	0.121	0.138
4q gain	71 (7%)	1009	0.12416	0.141	0.00491	0.00712	9.9999e-06	2.35e-05	0.01624	0.0213	0.02121	0.0272	0.02842	0.0355	9.9999e-05	0.000197	0.10653	0.122	0.01757	0.0228	0.04232	0.0518	0.51794	0.534	0.03943	0.0485
5p gain	315 (29%)	765	0.23792	0.258	0.04025	0.0494	9.9999e-06	2.35e-05	0.01097	0.0149	0.52273	0.538	0.68571	0.694	0.10998	0.126	0.053579	0.0648	0.01193	0.0161	0.01382	0.0185	0.01644	0.0215	0.30234	0.323
5q gain	211 (20%)	869	0.01818	0.0235	0.00353	0.00526	9.9999e-06	2.35e-05	0.0018	0.00288	0.00302	0.00461	0.00024	0.000439	0.0064699	0.00923	0.00025	0.000455	0.01575	0.0209	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	0.065649	0.0784
6p gain	208 (19%)	872	9.9999e-06	2.35e-05	2e-04	0.000371	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
6q gain	149 (14%)	931	9.9999e-06	2.35e-05	0.00119	0.00195	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
7p gain	313 (29%)	767	0.1225	0.139	0.20361	0.223	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-05	0.000197	0.14826	0.166	0.11723	0.134	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	0.00083999	0.00141	0.00284	0.00437	0.078579	0.0927	0.25662	0.277
7q gain	268 (25%)	812	0.01289	0.0174	0.0086899	0.012	9.9999e-06	2.35e-05	0.00026	0.000471	0.04543	0.0555	0.00231	0.00363	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	0.00293	0.00449	0.18838	0.208
8p gain	291 (27%)	789	0.065809	0.0784	0.03097	0.0385	9.9999e-06	2.35e-05	0.00094999	0.00158	0.42871	0.448	0.097269	0.113	0.00052999	0.000928	0.00138	0.00224	0.02664	0.0334	0.03861	0.0477	0.01851	0.0239	0.083169	0.0978
8q gain	530 (49%)	550	0.0056399	0.00811	0.03916	0.0482	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0105	0.0143	0.00077999	0.00132	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
9p gain	139 (13%)	941	0.00022	0.000405	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00016	0.000303	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00013	0.000252	9.9999e-06	2.35e-05	0.00065999	0.00114	0.04897	0.0595
9q gain	122 (11%)	958	0.63457	0.647	0.13871	0.156	9.9999e-06	2.35e-05	0.00104	0.00172	0.12669	0.143	0.0067899	0.00963	0.00334	0.00502	0.01684	0.022	0.79638	0.802	0.050019	0.0607	0.04261	0.0521	0.058989	0.0709
10p gain	208 (19%)	872	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
10q gain	114 (11%)	966	0.00307	0.00468	0.04152	0.0509	9.9999e-06	2.35e-05	0.00053999	0.000942	0.01056	0.0144	0.064319	0.0769	0.00072999	0.00124	6.9999e-05	0.000141	0.00021	0.000388	3e-05	6.45e-05	0.00266	0.00412	0.0256	0.0323
11p gain	141 (13%)	939	0.12788	0.144	0.39166	0.411	9.9999e-06	2.35e-05	0.00437	0.00641	0.04551	0.0555	0.51181	0.529	0.00019	0.000354	0.0084299	0.0117	0.00011	0.000216	3e-05	6.45e-05	0.00212	0.00335	9.9999e-06	2.35e-05
11q gain	96 (9%)	984	0.0346	0.0428	0.091609	0.107	9.9999e-06	2.35e-05	0.00112	0.00184	0.00145	0.00235	0.00080999	0.00136	0.00038	0.000686	5e-04	0.000882	5e-05	0.000103	0.00272	0.0042	0.02982	0.0372	0.01152	0.0156
12p gain	225 (21%)	855	0.00016	0.000303	0.02495	0.0316	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	0.00332	0.00501	0.01161	0.0157	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	0.00465	0.00679	0.00398	0.00591
12q gain	186 (17%)	894	0.00062999	0.00109	0.14083	0.158	9.9999e-06	2.35e-05	0.00185	0.00295	0.24744	0.268	0.02598	0.0327	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00051999	0.000912	0.00234	0.00366	0.11886	0.135	0.4505	0.47
13q gain	93 (9%)	987	0.16472	0.184	0.60449	0.618	0.00142	0.00231	0.00090999	0.00152	0.0059899	0.0086	0.00246	0.00382	0.0060399	0.00866	0.00018	0.000337	0.0084399	0.0117	0.00013	0.000252	0.23925	0.26	0.063249	0.0757
14q gain	143 (13%)	937	0.64074	0.653	0.01901	0.0245	9.9999e-06	2.35e-05	0.00047	0.000835	0.079339	0.0934	0.02331	0.0296	5e-05	0.000103	6.9999e-05	0.000141	0.00065999	0.00114	3e-05	6.45e-05	0.18954	0.209	0.30808	0.329
15q gain	88 (8%)	992	0.01417	0.0189	0.21306	0.232	0.0128	0.0173	0.02225	0.0284	0.54333	0.557	0.098369	0.114	0.04623	0.0563	0.01479	0.0197	0.084539	0.0993	0.0118	0.016	0.32789	0.349	0.34546	0.366
16p gain	462 (43%)	618	0.00336	0.00502	0.01019	0.014	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00471	0.00687	0.00123	0.00201	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00050999	0.000898	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	0.0069499	0.00981
16q gain	142 (13%)	938	0.071149	0.0841	0.74035	0.748	0.00075999	0.00129	0.052879	0.064	0.26807	0.288	0.17209	0.192	0.26385	0.284	0.00303	0.00462	0.10452	0.12	0.00080999	0.00136	0.1313	0.148	0.10322	0.119
17p gain	110 (10%)	970	0.16884	0.188	0.68058	0.69	9.9999e-06	2.35e-05	0.070829	0.0839	0.84488	0.848	0.48568	0.504	0.02277	0.029	0.058879	0.0708	0.00488	0.00709	0.13881	0.156	0.44451	0.464	0.00172	0.00276
17q gain	221 (20%)	859	0.055409	0.0669	0.0113	0.0154	9.9999e-06	2.35e-05	0.00042	0.000751	0.51006	0.528	4e-05	8.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00154	0.00249	0.0064899	0.00924
18p gain	177 (16%)	903	0.00016	0.000303	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
18q gain	154 (14%)	926	0.00285	0.00437	4e-05	8.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00196	0.00312	0.0063299	0.00904	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00015	0.000287	0.00483	0.00703
19p gain	187 (17%)	893	0.00068999	0.00118	0.0033	0.00499	9.9999e-06	2.35e-05	0.00025	0.000455	0.00237	0.0037	0.00418	0.00619	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	0.00026	0.000471	4e-05	8.36e-05	4e-05	8.36e-05	0.65902	0.67
19q gain	219 (20%)	861	0.00233	0.00366	0.0074499	0.0105	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.36e-05	0.01575	0.0209	0.01638	0.0215	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	0.00015	0.000287	2e-05	4.45e-05	0.00045	0.000804	0.17735	0.197
20p gain	411 (38%)	669	0.00015	0.000287	0.50819	0.526	9.9999e-06	2.35e-05	0.00185	0.00295	0.01323	0.0178	0.00463	0.00677	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0085799	0.0119	0.00312	0.00474
20q gain	450 (42%)	630	8.9999e-05	0.000178	0.20277	0.222	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.12237	0.139	0.10564	0.121	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00061999	0.00107	3e-05	6.45e-05
21q gain	198 (18%)	882	9.9999e-06	2.35e-05	0.00053999	0.000942	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
22q gain	99 (9%)	981	9.9999e-06	2.35e-05	0.0078999	0.011	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.36e-05	4e-05	8.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	6.9999e-05	0.000141	0.00391	0.00581
xp gain	150 (14%)	930	0.01976	0.0254	0.56963	0.583	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	0.0089899	0.0124	0.0083299	0.0116	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	5.9999e-05	0.000122	5e-05	0.000103	0.00012	0.000234
xq gain	137 (13%)	943	0.00453	0.00663	0.0067699	0.00961	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.01735	0.0226	0.00049	0.000867	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00014	0.00027	6.9999e-05	0.000141	0.00423	0.00624
1p loss	227 (21%)	853	0.02307	0.0294	0.0019	0.00303	9.9999e-06	2.35e-05	5e-04	0.000882	0.098219	0.114	0.01609	0.0212	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00329	0.00498	9.9999e-06	2.35e-05	0.0166	0.0217	0.74362	0.75
1q loss	48 (4%)	1032	0.00269	0.00416	0.20317	0.222	6.9999e-05	0.000141	0.47474	0.493	0.28467	0.305	0.51611	0.533	0.00175	0.0028	0.1046	0.12	0.01582	0.0209	0.13801	0.156	0.18346	0.204	0.42227	0.442
2p loss	185 (17%)	895	0.0062499	0.00895	0.02898	0.0362	9.9999e-06	2.35e-05	8.9999e-05	0.000178	0.0299	0.0372	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	0.00039	0.000703	0.0011	0.00181	0.059279	0.0711
2q loss	211 (20%)	869	0.1063	0.122	0.52768	0.543	9.9999e-06	2.35e-05	0.00335	0.00502	0.066919	0.0794	8.9999e-05	0.000178	0.00041	0.000736	9.9999e-06	2.35e-05	0.00095999	0.00159	0.01973	0.0254	0.00489	0.0071	0.088819	0.104
3p loss	188 (17%)	892	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.36e-05	0.01579	0.0209
3q loss	105 (10%)	975	9.9999e-06	2.35e-05	0.0085999	0.0119	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.36e-05	3e-05	6.45e-05	0.00057999	0.00101	4e-05	8.36e-05	6.9999e-05	0.000141	0.00203	0.00322	2e-04	0.000371	0.14819	0.166	0.089919	0.105
4p loss	353 (33%)	727	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
4q loss	311 (29%)	769	9.9999e-06	2.35e-05	0.00015	0.000287	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00022	0.000405
5p loss	142 (13%)	938	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
5q loss	228 (21%)	852	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
6p loss	190 (18%)	890	0.32936	0.35	0.04767	0.058	9.9999e-06	2.35e-05	0.11494	0.131	0.96236	0.962	0.0065199	0.00927	0.00312	0.00474	0.0088199	0.0122	0.052259	0.0633	0.0062799	0.00898	0.45496	0.474	0.64621	0.658
6q loss	280 (26%)	800	0.20187	0.221	0.02556	0.0323	9.9999e-06	2.35e-05	0.00093999	0.00157	0.71202	0.72	0.00078999	0.00133	2e-05	4.45e-05	0.00037	0.000669	0.0078599	0.011	2e-05	4.45e-05	0.0105	0.0143	0.20453	0.223
7p loss	111 (10%)	969	0.0055899	0.00805	0.88086	0.883	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	0.00018	0.000337	0.0073699	0.0104	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00243	0.00378
7q loss	120 (11%)	960	0.065839	0.0784	0.076699	0.0906	2e-05	4.45e-05	0.00334	0.00502	0.02656	0.0333	0.37561	0.396	0.00171	0.00275	0.00023	0.000421	0.00072999	0.00124	0.00015	0.000287	0.0096799	0.0133	0.01691	0.0221
8p loss	395 (37%)	685	0.02009	0.0258	0.19582	0.215	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00018	0.000337	0.03227	0.04	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	0.095299	0.111	0.00237	0.0037
8q loss	93 (9%)	987	0.22755	0.248	0.67821	0.689	5e-05	0.000103	0.091719	0.107	0.39613	0.416	0.5195	0.535	0.0092299	0.0127	0.01493	0.0198	0.37416	0.395	0.44724	0.467	0.36098	0.382	0.80226	0.806
9p loss	313 (29%)	767	5e-05	0.000103	0.04024	0.0494	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	5e-05	0.000103	0.19158	0.211	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00014	0.00027	9.9999e-06	2.35e-05
9q loss	280 (26%)	800	9.9999e-06	2.35e-05	0.0217	0.0278	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	8.9999e-05	0.000178	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
10p loss	175 (16%)	905	0.15893	0.178	0.88428	0.885	9.9999e-06	2.35e-05	0.00061999	0.00107	0.086789	0.102	0.18622	0.206	0.00012	0.000234	9.9999e-06	2.35e-05	0.00016	0.000303	0.078939	0.093	0.11133	0.127	0.23463	0.255
10q loss	231 (21%)	849	0.00011	0.000216	0.014	0.0187	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0052999	0.00766	0.00078999	0.00133
11p loss	270 (25%)	810	0.33284	0.353	0.33905	0.36	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00316	0.00479	0.00333	0.00502	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	3e-05	6.45e-05	2e-05	4.45e-05	0.0179	0.0232	0.0247	0.0313
11q loss	366 (34%)	714	0.091009	0.106	0.10205	0.118	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.41287	0.433	0.15089	0.169	9.9999e-06	2.35e-05	0.00299	0.00458	0.02593	0.0327	0.0082299	0.0115	0.63186	0.645	0.12539	0.142
12p loss	153 (14%)	927	0.00017	0.000321	0.00165	0.00266	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	4e-05	8.36e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
12q loss	137 (13%)	943	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
13q loss	430 (40%)	650	0.0015	0.00243	0.066379	0.0789	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00435	0.00639	0.00047	0.000835	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00051999	0.000912	0.00066999	0.00115
14q loss	269 (25%)	811	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
15q loss	318 (29%)	762	0.00069999	0.0012	0.00021	0.000388	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
16p loss	174 (16%)	906	0.092929	0.108	0.20074	0.22	0.00336	0.00502	0.00041	0.000736	0.00046	0.00082	0.00247	0.00383	0.00023	0.000421	0.00225	0.00355	0.00012	0.000234	0.00434	0.00638	3e-05	6.45e-05	0.066139	0.0787
16q loss	591 (55%)	489	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00011	0.000216	0.062829	0.0753	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0011	0.00181	3e-05	6.45e-05
17p loss	580 (54%)	500	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.24062	0.261	0.31265	0.333
17q loss	272 (25%)	808	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	0.0134	0.0179
18p loss	320 (30%)	760	0.00207	0.00328	0.0219	0.028	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00209	0.00331	0.02704	0.0339	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.01473	0.0196	9.9999e-06	2.35e-05	0.37827	0.398	0.80224	0.806
18q loss	321 (30%)	759	0.00092999	0.00155	0.0042	0.00621	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00062999	0.00109	0.00341	0.00509	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00429	0.00632	9.9999e-06	2.35e-05	0.26969	0.29	0.35047	0.371
19p loss	197 (18%)	883	0.00016	0.000303	0.36557	0.386	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00023	0.000421	7.9999e-05	0.00016	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05
19q loss	164 (15%)	916	0.01295	0.0174	0.17474	0.195	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.0054199	0.00782	0.00231	0.00363	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	0.00013	0.000252	2e-05	4.45e-05
20p loss	93 (9%)	987	0.02991	0.0372	0.0071299	0.01	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00042	0.000751	0.00019	0.000354	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	9.9999e-06	2.35e-05	8.9999e-05	0.000178	0.00126	0.00206
20q loss	57 (5%)	1023	0.47475	0.493	0.00077999	0.00132	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00066999	0.00115	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00234	0.00366
21q loss	179 (17%)	901	0.03901	0.0481	0.77287	0.779	9.9999e-06	2.35e-05	0.00071999	0.00123	0.54331	0.557	0.68573	0.694	0.057979	0.0699	0.0069199	0.00978	0.02408	0.0306	0.00127	0.00207	0.2216	0.241	0.097169	0.113
22q loss	482 (45%)	598	0.01812	0.0235	0.32721	0.348	9.9999e-06	2.35e-05	0.18874	0.208	0.18394	0.204	0.00018	0.000337	0.01333	0.0179	4e-05	8.36e-05	0.00375	0.00558	0.02602	0.0327	0.03686	0.0456	0.27188	0.292
xp loss	192 (18%)	888	0.01956	0.0252	0.01947	0.0251	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00019	0.000354	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	9.9999e-06	2.35e-05	0.00080999	0.00136	0.00137	0.00223	0.00101	0.00167
xq loss	189 (18%)	891	0.03383	0.0419	0.87196	0.875	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	0.00421	0.00622	0.00055999	0.000975	9.9999e-06	2.35e-05	2e-05	4.45e-05	3e-05	6.45e-05	0.00241	0.00375	0.01056	0.0144	0.00283	0.00436
