		Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1p31.3	96 (33%)	199	9.9999e-06	0.000185	0.42872	0.567	0.46328	0.594	0.7114	0.802	0.02453	0.0715	0.00159	0.00972	0.24025	0.373	0.00101	0.00692	0.39352	0.528	0.17426	0.298
amp_1q21.3	158 (54%)	137	9.9999e-06	0.000185	0.44867	0.583	0.25011	0.379	0.24587	0.377	0.0366	0.0941	0.01116	0.0406	0.75121	0.822	0.00094999	0.00672	0.5365	0.663	0.01545	0.0521
amp_2p24.3	79 (27%)	216	2e-05	0.00028	0.49227	0.623	0.25306	0.381	0.053769	0.127	0.10423	0.206	0.04294	0.107	0.085359	0.18	2e-05	0.00028	0.053709	0.127	0.092389	0.188
amp_2q33.1	41 (14%)	254	9.9999e-06	0.000185	0.18543	0.31	0.19757	0.324	0.44425	0.578	0.00033	0.0032	0.053929	0.127	0.41885	0.557	0.0072599	0.0296	0.2688	0.398	0.24581	0.377
amp_3q26.31	227 (77%)	68	9.9999e-06	0.000185	0.00224	0.0126	0.572	0.693	0.88459	0.911	0.00041	0.00369	9.9999e-06	0.000185	0.1267	0.235	2e-05	0.00028	0.04344	0.107	9.9999e-06	0.000185
amp_4q12	21 (7%)	274	0.16176	0.284	0.3867	0.523	0.00396	0.0195	0.43308	0.57	0.24824	0.379	0.89057	0.914	0.95943	0.969	0.37177	0.508	0.11114	0.215	0.082019	0.175
amp_5p15.33	138 (47%)	157	9.9999e-06	0.000185	0.03047	0.0827	0.24101	0.373	0.37609	0.513	0.0066299	0.0278	0.0053899	0.0238	0.00259	0.0143	0.00076999	0.00571	0.00388	0.0195	0.01479	0.0501
amp_6p21.33	82 (28%)	213	0.00033	0.0032	0.3673	0.504	0.54096	0.667	0.062599	0.143	0.01861	0.0589	0.15871	0.28	0.8169	0.872	0.01471	0.0501	0.35815	0.496	0.073799	0.164
amp_7p11.2	52 (18%)	243	4e-05	0.000504	0.01442	0.0495	0.02984	0.0817	0.0084099	0.0335	0.03157	0.085	0.067439	0.152	0.00025	0.00254	0.088889	0.185	6.9999e-05	0.000802	0.13492	0.245
amp_8q24.21	127 (43%)	168	0.24135	0.373	0.00113	0.00757	0.090109	0.187	0.14592	0.261	0.44128	0.577	0.03949	0.0995	0.10876	0.212	0.096689	0.194	0.13322	0.245	0.01375	0.0476
amp_9p24.1	63 (21%)	232	0.00043	0.00376	0.35298	0.492	0.097399	0.195	0.01194	0.0423	0.35882	0.496	0.0333	0.0878	0.52707	0.655	0.068649	0.154	0.38937	0.524	0.17233	0.297
amp_11p12	23 (8%)	272	0.1829	0.308	0.82362	0.878	0.72718	0.808	0.86374	0.899	0.36718	0.504	0.29644	0.43	0.6044	0.717	0.069099	0.154	0.2384	0.371	0.56251	0.684
amp_11q13.3	41 (14%)	254	6.9999e-05	0.000802	0.69983	0.795	0.067149	0.152	0.03103	0.0839	0.02965	0.0817	6.9999e-05	0.000802	0.050219	0.121	2e-05	0.00028	0.00045	0.00388	0.14054	0.254
amp_11q22.1	47 (16%)	248	9.9999e-06	0.000185	0.00137	0.00872	0.00264	0.0145	9.9999e-06	0.000185	2e-05	0.00028	9.9999e-06	0.000185	0.00071999	0.00547	9.9999e-06	0.000185	3e-05	0.000386	0.00022	0.00227
amp_13q22.1	65 (22%)	230	0.10818	0.212	0.12976	0.24	0.18386	0.308	0.5194	0.648	0.11588	0.221	0.74265	0.817	0.72017	0.805	0.42746	0.567	0.63979	0.745	0.2063	0.334
amp_13q34	69 (23%)	226	0.29474	0.43	0.85296	0.893	0.63053	0.737	0.58897	0.704	0.69615	0.793	0.61356	0.724	0.71506	0.803	0.77037	0.837	0.84961	0.891	0.37886	0.515
amp_15q26.1	76 (26%)	219	0.01122	0.0406	0.83454	0.879	0.30452	0.439	0.33011	0.472	0.70129	0.795	0.59312	0.706	0.92812	0.946	0.60571	0.717	0.69184	0.791	0.95771	0.969
amp_16p13.13	65 (22%)	230	0.16314	0.285	0.11176	0.216	0.6299	0.737	0.88661	0.911	0.19286	0.317	0.37934	0.515	0.49919	0.63	0.22051	0.353	0.68463	0.784	0.33623	0.478
amp_17q12	55 (19%)	240	0.00169	0.01	0.00391	0.0195	0.72809	0.808	0.03772	0.0954	0.00496	0.023	0.00343	0.018	0.11604	0.221	0.03255	0.0865	0.01584	0.0523	0.11432	0.22
amp_17q25.1	74 (25%)	221	2e-05	0.00028	0.0059499	0.0253	0.34157	0.484	0.080459	0.173	0.02702	0.0766	0.50802	0.639	0.55473	0.677	0.94163	0.957	0.34103	0.484	0.88405	0.911
amp_19p13.3	39 (13%)	256	0.01262	0.0442	0.063829	0.145	0.14393	0.258	0.58866	0.704	0.1871	0.311	0.00122	0.00801	0.28886	0.424	0.01844	0.0589	0.35782	0.496	0.080909	0.173
amp_19p13.2	43 (15%)	252	0.03286	0.087	0.28938	0.424	0.17218	0.297	0.58239	0.7	0.47693	0.606	0.079359	0.172	0.77817	0.842	0.095089	0.192	0.34557	0.487	0.32102	0.46
amp_19q13.13	93 (32%)	202	9.9999e-06	0.000185	0.46994	0.599	0.83468	0.879	0.2506	0.379	0.3513	0.492	0.43519	0.571	0.70033	0.795	0.26975	0.398	0.55384	0.677	0.65572	0.758
amp_20q11.21	135 (46%)	160	9.9999e-06	0.000185	0.01356	0.0472	0.5957	0.708	0.00361	0.0188	0.04188	0.104	0.03731	0.0949	0.1027	0.204	0.03455	0.0903	0.0475	0.115	0.24656	0.377
amp_21q22.13	48 (16%)	247	0.12908	0.239	0.72771	0.808	0.63002	0.737	0.79802	0.859	0.062499	0.143	0.44161	0.577	0.78019	0.842	0.8342	0.879	0.88138	0.91	0.38217	0.518
amp_xq28	75 (25%)	220	0.98512	0.99	0.01858	0.0589	0.57588	0.695	0.90914	0.928	0.67758	0.78	0.5571	0.679	0.00132	0.00849	0.16808	0.292	0.02333	0.069	0.03387	0.0889
del_1p36.23	40 (14%)	255	0.076789	0.167	0.02203	0.0661	0.71436	0.803	0.096919	0.194	0.00064999	0.00499	2e-05	0.00028	0.25015	0.379	9.9999e-05	0.00107	0.23209	0.367	0.0050499	0.0231
del_1p13.2	34 (12%)	261	0.01587	0.0523	0.060109	0.139	0.13442	0.245	0.26309	0.391	5e-05	0.000606	0.068869	0.154	0.0055099	0.0238	0.17844	0.304	0.0095799	0.0366	0.055829	0.13
del_2q22.1	65 (22%)	230	0.01595	0.0523	0.17282	0.297	0.29991	0.433	0.72161	0.805	0.01816	0.0584	0.11788	0.224	0.90516	0.926	0.18212	0.308	0.38802	0.523	0.45179	0.584
del_2q37.1	129 (44%)	166	0.00155	0.00957	0.00043	0.00376	0.35691	0.496	0.10581	0.208	3e-05	0.000386	9.9999e-06	0.000185	0.0067599	0.0279	0.00124	0.00805	0.0076299	0.0308	8.9999e-05	0.000978
del_3p22.1	113 (38%)	182	9.9999e-06	0.000185	0.00393	0.0195	0.03682	0.0943	0.00139	0.00876	0.0072899	0.0296	3e-05	0.000386	0.17418	0.298	0.00061999	0.00499	0.23582	0.37	0.00092999	0.00672
del_3p14.2	134 (45%)	161	9.9999e-06	0.000185	0.00063999	0.00499	0.1418	0.256	0.04657	0.114	0.00161	0.00972	2e-05	0.00028	0.0039	0.0195	0.00046	0.00392	0.02005	0.0613	0.00014	0.00147
del_4p16.3	127 (43%)	168	9.9999e-06	0.000185	0.02139	0.0645	0.86164	0.899	0.99728	0.998	0.00466	0.0222	0.00099999	0.00692	0.2273	0.362	0.00038	0.00347	0.51487	0.645	0.00491	0.023
del_4q21.3	103 (35%)	192	9.9999e-06	0.000185	0.056479	0.131	0.67826	0.78	0.80218	0.86	0.0085199	0.0338	0.0053699	0.0238	0.23352	0.368	0.23711	0.371	0.80258	0.86	0.16584	0.289
del_4q22.1	100 (34%)	195	9.9999e-06	0.000185	0.15315	0.273	0.56922	0.691	0.87128	0.903	0.01718	0.0558	0.01139	0.0407	0.47987	0.608	0.04422	0.109	0.57444	0.695	0.086889	0.182
del_4q35.2	114 (39%)	181	9.9999e-06	0.000185	0.19903	0.326	0.95785	0.969	0.99771	0.998	0.0067499	0.0279	0.00272	0.0148	0.25417	0.382	0.12156	0.229	0.72195	0.805	0.0054599	0.0238
del_5q12.1	76 (26%)	219	9.9999e-06	0.000185	0.76439	0.833	0.11541	0.221	0.02998	0.0818	0.39579	0.528	0.93907	0.956	0.03493	0.0909	0.34801	0.489	0.21311	0.342	0.18881	0.312
del_5q35.2	71 (24%)	224	2e-05	0.00028	0.73163	0.81	0.65243	0.758	0.54831	0.675	0.87424	0.904	0.83987	0.883	0.02866	0.0802	0.55378	0.677	0.24912	0.379	0.39488	0.528
del_6p24.2	46 (16%)	249	0.01589	0.0523	0.074079	0.164	0.34974	0.491	0.18265	0.308	0.091739	0.188	0.04007	0.101	0.45849	0.592	0.02607	0.0743	0.22484	0.359	0.36074	0.497
del_6q26	100 (34%)	195	0.00279	0.0149	0.067429	0.152	0.6193	0.729	0.74817	0.821	0.45105	0.584	0.085529	0.18	0.11482	0.221	0.31903	0.459	0.17167	0.297	0.23461	0.369
del_7q34	60 (20%)	235	0.10281	0.204	0.2959	0.43	0.20388	0.331	0.4626	0.594	0.73287	0.81	0.69474	0.793	0.6806	0.781	0.46761	0.598	0.25884	0.386	0.35287	0.492
del_8p23.3	104 (35%)	191	9.9999e-06	0.000185	0.83034	0.879	0.25765	0.386	0.091499	0.188	5e-04	0.0042	0.02563	0.0734	0.083919	0.178	0.0173	0.0559	0.01119	0.0406	0.29795	0.432
del_8p23.1	97 (33%)	198	9.9999e-06	0.000185	0.96153	0.969	0.53129	0.658	0.090409	0.187	0.0022	0.0125	0.15912	0.28	0.02489	0.0721	0.0211	0.0639	0.00442	0.0214	0.21748	0.349
del_10q23.31	86 (29%)	209	0.0053399	0.0238	0.34365	0.485	0.31995	0.459	0.76101	0.831	0.12395	0.233	0.33119	0.472	0.70883	0.802	0.23854	0.371	0.47102	0.599	0.077159	0.168
del_11p15.1	102 (35%)	193	9.9999e-06	0.000185	0.074669	0.164	0.01026	0.0385	0.0093199	0.036	0.02903	0.0809	0.01937	0.0603	0.40204	0.535	0.076619	0.167	0.74211	0.817	0.03538	0.0913
del_11q23.3	162 (55%)	133	9.9999e-06	0.000185	0.18345	0.308	0.63675	0.743	0.13496	0.245	0.04096	0.102	0.00373	0.0193	0.84064	0.883	0.00237	0.0132	0.10405	0.206	0.01139	0.0407
del_11q25	160 (54%)	135	9.9999e-06	0.000185	0.15689	0.278	0.86603	0.9	0.18758	0.311	0.02713	0.0766	0.0054899	0.0238	0.81242	0.869	0.0057599	0.0247	0.054809	0.129	0.01963	0.0606
del_13q12.11	98 (33%)	197	9.9999e-06	0.000185	0.00173	0.0102	0.43117	0.568	0.091929	0.188	0.01878	0.0592	0.00033	0.0032	0.00187	0.0109	0.00483	0.0229	0.03514	0.0911	0.0054499	0.0238
del_13q14.2	118 (40%)	177	2e-05	0.00028	0.02013	0.0613	0.89774	0.92	0.62758	0.737	0.00122	0.00801	0.00216	0.0124	0.0050699	0.0231	0.00058999	0.00489	0.087229	0.182	0.0099799	0.0376
del_14q32.31	50 (17%)	245	0.71047	0.802	0.0067699	0.0279	0.094389	0.191	0.0080799	0.0324	0.0111	0.0406	0.0092199	0.0359	0.52493	0.654	0.0255	0.0734	0.26932	0.398	0.02417	0.0708
del_15q21.1	70 (24%)	225	0.02494	0.0721	0.46357	0.594	0.74038	0.817	0.55141	0.677	0.13471	0.245	0.04718	0.115	0.00492	0.023	0.03169	0.085	0.01925	0.0603	0.0088499	0.0346
del_16q11.2	53 (18%)	242	0.02971	0.0817	0.00036	0.00334	0.50457	0.636	0.15643	0.278	0.04724	0.115	0.0097899	0.0372	0.01654	0.054	0.0105	0.039	0.13074	0.241	0.00035	0.00334
del_16q23.1	55 (19%)	240	0.10489	0.207	0.0064199	0.0271	0.57934	0.698	0.18594	0.31	0.00064999	0.00499	0.00036	0.00334	0.03737	0.0949	0.00059999	0.00491	0.02281	0.0681	8.9999e-05	0.000978
del_17p12	109 (37%)	186	0.00072999	0.00547	0.1109	0.215	0.057579	0.133	0.72125	0.805	0.23287	0.368	0.27087	0.399	0.21059	0.34	0.20213	0.33	0.77634	0.842	0.8323	0.879
del_17q25.3	51 (17%)	244	0.0094799	0.0364	9.9999e-06	0.000185	0.39588	0.528	0.95167	0.965	9.9999e-06	0.000185	0.00093999	0.00672	0.00189	0.0109	0.00085999	0.0063	0.051269	0.123	0.0286	0.0802
del_18q21.2	82 (28%)	213	0.00062999	0.00499	0.00113	0.00757	0.51146	0.642	0.055269	0.129	9.9999e-06	0.000185	3e-05	0.000386	0.02306	0.0685	9.9999e-06	0.000185	0.0029	0.0154	9.9999e-06	0.000185
del_19p13.3	105 (36%)	190	9.9999e-06	0.000185	0.98741	0.991	0.37099	0.508	0.084369	0.178	7.9999e-05	9e-04	9.9999e-06	0.000185	0.01942	0.0603	5e-05	0.000606	0.01565	0.0523	0.00095999	0.00672
del_19q13.33	38 (13%)	257	0.01975	0.0607	0.02964	0.0817	0.42932	0.567	0.58972	0.704	0.14665	0.262	0.18332	0.308	0.11873	0.225	0.16761	0.292	0.061749	0.142	0.01221	0.043
del_20p12.1	36 (12%)	259	0.46101	0.594	0.82858	0.879	0.25843	0.386	0.12481	0.233	0.0053499	0.0238	0.12428	0.233	0.092879	0.189	0.14371	0.258	0.00152	0.00948	0.00162	0.00972
del_21q11.2	58 (20%)	237	0.00394	0.0195	0.51924	0.648	0.20286	0.33	0.00449	0.0216	0.053859	0.127	0.0087199	0.0343	0.61324	0.724	0.23141	0.367	0.65423	0.758	0.2568	0.385
del_22q13.32	87 (29%)	208	0.00406	0.0198	0.80291	0.86	0.12446	0.233	0.67435	0.778	0.18981	0.313	0.02356	0.0694	0.76512	0.833	0.58788	0.704	0.83286	0.879	0.86686	0.9
del_xp11.3	72 (24%)	223	0.082909	0.176	0.01052	0.039	0.44424	0.578	0.65497	0.758	0.075189	0.165	0.24508	0.377	2e-05	0.00028	0.03197	0.0853	0.00275	0.0148	0.01447	0.0495
del_xq21.33	59 (20%)	236	0.29589	0.43	0.050989	0.123	0.079609	0.172	0.01144	0.0407	0.8589	0.897	0.78098	0.842	0.21287	0.342	0.97007	0.976	0.53036	0.658	0.74896	0.821
