		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	50 (8%)	566	0.24674	0.444	0.26523	0.465	0.083469	0.207	0.32011	0.521	0.03608	0.107	0.21676	0.414	0.9908	1	0.61306	0.783	0.51821	0.713	0.55843	0.747	0.2509	0.45	0.28903	0.496
1q gain	113 (18%)	503	0.91821	0.987	0.73709	0.863	0.01378	0.0512	1	1	0.054379	0.149	0.22495	0.423	0.93563	0.997	0.425	0.638	0.21831	0.415	0.43131	0.644	0.059909	0.161	0.32355	0.524
2p gain	123 (20%)	493	0.082159	0.205	0.00321	0.0156	9.9999e-06	0.000102	0.00278	0.0139	0.5706	0.755	0.76277	0.883	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.075999	0.194	0.00435	0.0205	0.69674	0.847	0.9914	1
2q gain	122 (20%)	494	0.04503	0.129	0.00104	0.0064	9.9999e-06	0.000102	0.0059499	0.0259	0.74179	0.868	0.48119	0.682	5e-05	0.000432	9.9999e-06	0.000102	0.089629	0.218	0.02431	0.0787	0.42638	0.639	0.82397	0.918
3p gain	75 (12%)	541	0.02426	0.0787	0.02531	0.0814	9.9999e-06	0.000102	0.058079	0.157	0.12373	0.277	0.67646	0.83	0.58932	0.769	0.01237	0.0475	0.01847	0.0632	0.02203	0.0735	0.077719	0.197	0.58559	0.769
3q gain	98 (16%)	518	0.02211	0.0735	0.0027	0.0136	9.9999e-06	0.000102	0.02426	0.0787	0.43772	0.647	0.59079	0.769	0.084089	0.208	0.00333	0.0161	0.02372	0.0777	0.10724	0.249	0.01988	0.0675	0.56282	0.747
4p gain	20 (3%)	596	0.81904	0.915	0.29256	0.497	0.052279	0.145	0.22672	0.424	0.0095999	0.0381	0.28998	0.496	0.01856	0.0632	0.15659	0.333	0.12806	0.284	0.46301	0.668	0.0048	0.0217	0.055239	0.151
4q gain	21 (3%)	595	0.19609	0.386	0.060859	0.163	0.00173	0.00956	0.63729	0.803	0.24127	0.439	0.44621	0.657	0.35755	0.567	0.28771	0.496	0.090459	0.219	0.36131	0.571	0.55883	0.747	0.83506	0.926
5p gain	108 (18%)	508	0.50933	0.708	0.064379	0.169	9.9999e-06	0.000102	1	1	0.066019	0.172	0.39457	0.61	0.02889	0.0908	0.078999	0.198	0.65226	0.818	0.59198	0.769	0.5089	0.708	0.95604	1
5q gain	67 (11%)	549	0.61417	0.783	0.49981	0.703	5.9999e-05	0.000505	0.80068	0.905	0.6629	0.824	0.86778	0.954	0.33356	0.537	0.03443	0.103	0.31642	0.52	0.0057499	0.0251	0.57085	0.755	0.97847	1
6p gain	122 (20%)	494	0.01549	0.0567	0.00063999	0.00414	9.9999e-06	0.000102	0.44895	0.659	0.076379	0.195	0.77436	0.885	0.70619	0.85	0.03631	0.108	0.56029	0.747	0.28976	0.496	0.65421	0.818	0.4338	0.645
6q gain	111 (18%)	505	0.13823	0.303	0.00132	0.00782	9.9999e-06	0.000102	0.47274	0.677	0.21505	0.412	0.98663	1	0.56188	0.747	0.19791	0.388	0.19034	0.379	0.56166	0.747	0.72684	0.86	0.41746	0.631
7p gain	349 (57%)	267	0.00047	0.0031	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00019	0.00137	0.090759	0.219	0.0057199	0.0251	2e-05	0.000193	9.9999e-06	0.000102	0.00137	0.00798	9.9999e-06	0.000102	0.050899	0.143	0.26405	0.464
7q gain	312 (51%)	304	0.00021	0.00151	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.0098799	0.0389	0.054359	0.149	0.00263	0.0134	0.00014	0.00104	9.9999e-06	0.000102	0.00444	0.0207	9.9999e-06	0.000102	0.04824	0.137	0.63523	0.801
8p gain	169 (27%)	447	0.41359	0.627	0.62681	0.794	0.00166	0.00928	0.64293	0.809	0.44982	0.66	0.57901	0.764	0.0067899	0.0288	0.16341	0.343	0.6559	0.819	0.31358	0.516	0.075699	0.194	0.39765	0.611
8q gain	316 (51%)	300	0.14618	0.317	0.03846	0.113	9.9999e-06	0.000102	0.00119	0.00714	0.23778	0.435	0.03265	0.0995	0.00167	0.00928	0.01682	0.0606	0.30571	0.507	0.01268	0.0481	0.00266	0.0135	0.66169	0.824
9p gain	124 (20%)	492	0.5882	0.769	0.15579	0.332	0.00011	0.000839	0.37204	0.583	0.46401	0.668	0.24419	0.44	0.9018	0.975	0.38756	0.6	0.66364	0.824	0.90311	0.975	0.1092	0.252	0.70025	0.847
9q gain	103 (17%)	513	0.72128	0.86	0.33012	0.534	0.00050999	0.00335	0.50518	0.707	0.47016	0.674	0.067159	0.174	0.91523	0.985	0.84317	0.933	0.96706	1	0.79108	0.898	0.40189	0.616	0.76736	0.885
10p gain	49 (8%)	567	0.13743	0.302	0.17999	0.365	0.00051999	0.00339	0.82018	0.915	0.68158	0.832	0.03705	0.109	0.55921	0.747	0.80936	0.908	0.55926	0.747	0.57482	0.759	0.28349	0.491	0.77402	0.885
10q gain	29 (5%)	587	0.87198	0.955	0.30035	0.503	0.0053799	0.0238	0.15905	0.337	0.3044	0.507	0.45769	0.666	0.66041	0.824	0.60435	0.776	0.5974	0.77	0.6231	0.792	0.02821	0.0898	0.76014	0.882
11p gain	85 (14%)	531	0.0064999	0.0278	0.00185	0.01	9.9999e-06	0.000102	0.00013	0.000976	0.43154	0.644	0.25709	0.457	0.00095999	0.00598	9.9999e-05	0.000769	0.19685	0.387	0.00204	0.0108	0.50743	0.708	0.93306	0.997
11q gain	78 (13%)	538	0.0069699	0.0292	0.00046	0.00306	9.9999e-06	0.000102	2e-05	0.000193	0.31353	0.516	0.25509	0.456	6.9999e-05	0.000574	9.9999e-06	0.000102	0.7729	0.885	0.00142	0.00817	0.051509	0.144	0.46192	0.668
12p gain	128 (21%)	488	0.051009	0.143	0.33232	0.536	0.02983	0.092	0.097459	0.23	0.93519	0.997	0.53619	0.734	0.59737	0.77	0.01815	0.0629	0.093339	0.223	0.32007	0.521	0.8693	0.955	0.55885	0.747
12q gain	114 (19%)	502	0.04336	0.124	0.16842	0.348	0.0083699	0.0338	0.01736	0.0621	0.8906	0.97	0.39746	0.611	0.36001	0.57	0.0081799	0.0332	0.01828	0.0629	0.37923	0.59	0.88981	0.97	0.68727	0.837
13q gain	372 (60%)	244	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.45294	0.662	0.1183	0.269	0.00013	0.000976	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00236	0.0122	0.26416	0.464
14q gain	43 (7%)	573	0.82477	0.918	0.43411	0.645	9.9999e-06	0.000102	0.36384	0.573	0.73401	0.861	0.87663	0.958	0.78978	0.897	0.6124	0.783	0.90697	0.979	0.4736	0.677	0.21732	0.414	0.25999	0.46
15q gain	15 (2%)	601	0.36488	0.573	0.03542	0.106	0.079719	0.2	0.43549	0.646	0.65105	0.817	1	1	0.95392	1	0.92862	0.994	0.93885	1	0.71729	0.86	NA	NA	NA	NA
16p gain	148 (24%)	468	0.03444	0.103	0.00188	0.0101	9.9999e-06	0.000102	0.084659	0.208	0.053139	0.146	0.28934	0.496	0.00067999	0.00434	4e-05	0.000355	0.70264	0.847	0.0015	0.00853	0.16063	0.34	0.23611	0.433
16q gain	145 (24%)	471	0.02947	0.0915	0.00046	0.00306	9.9999e-06	0.000102	0.15351	0.328	0.11955	0.271	0.72592	0.86	0.00178	0.00978	4e-05	0.000355	0.44354	0.654	0.00183	0.00995	0.17129	0.351	0.17019	0.351
17p gain	39 (6%)	577	0.49832	0.701	0.23988	0.438	0.34787	0.556	0.6262	0.794	0.59049	0.769	0.223	0.421	0.29369	0.497	0.066419	0.172	0.83731	0.928	0.1512	0.326	0.46424	0.668	0.87158	0.955
17q gain	113 (18%)	503	0.0047	0.0214	0.0036	0.0173	9.9999e-06	0.000102	0.0095699	0.0381	0.26394	0.464	0.0074599	0.0308	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.18131	0.366	0.0085199	0.0342	0.17716	0.362	0.86203	0.951
18p gain	31 (5%)	585	0.35467	0.564	0.22204	0.42	0.00133	0.00784	0.00364	0.0174	0.46248	0.668	0.72643	0.86	0.070459	0.182	0.00211	0.0111	0.70058	0.847	0.066369	0.172	0.61333	0.783	0.49474	0.697
18q gain	19 (3%)	597	0.21742	0.414	0.45597	0.665	0.00404	0.0192	0.01364	0.0508	0.27438	0.48	0.81566	0.913	0.051869	0.145	0.00192	0.0103	0.76701	0.885	0.0064299	0.0276	1	1	0.79824	0.904
19p gain	105 (17%)	511	0.37706	0.588	0.0082099	0.0332	4e-05	0.000355	0.24246	0.439	0.093359	0.223	0.1396	0.305	0.30853	0.509	3e-05	0.000278	0.01716	0.0616	0.0063299	0.0274	0.077689	0.197	0.4466	0.657
19q gain	113 (18%)	503	0.02284	0.0757	0.00299	0.0148	5e-05	0.000432	0.70617	0.85	0.04856	0.138	0.51047	0.708	0.2928	0.497	0.00107	0.0065	0.04166	0.12	0.01235	0.0475	0.054999	0.15	0.67152	0.828
20p gain	353 (57%)	263	0.00031	0.00213	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.0072399	0.0302	0.063019	0.167	0.29197	0.497	0.02502	0.0807	9.9999e-06	0.000102	0.062119	0.166	9.9999e-06	0.000102	0.04629	0.132	0.45099	0.66
20q gain	463 (75%)	153	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.0127	0.0481	0.58048	0.764	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	8.9999e-05	0.000708	0.12585	0.281
21q gain	34 (6%)	582	0.20918	0.404	0.20587	0.4	0.00024	0.00169	0.19497	0.385	0.8155	0.913	0.18277	0.369	0.80573	0.908	0.10388	0.242	0.47424	0.677	0.72533	0.86	0.50944	0.708	0.70231	0.847
22q gain	23 (4%)	593	0.1104	0.254	0.093689	0.223	0.01428	0.0528	0.48889	0.691	0.085539	0.209	0.51005	0.708	0.18443	0.37	0.27693	0.482	0.00446	0.0207	0.60281	0.775	0.75708	0.882	1	1
xp gain	100 (16%)	516	0.01671	0.0605	0.077189	0.196	0.00018	0.00132	0.03886	0.113	0.02785	0.089	0.22712	0.424	0.11427	0.262	0.21219	0.409	0.30103	0.504	0.75325	0.88	0.51272	0.71	0.67847	0.83
xq gain	109 (18%)	507	0.093069	0.223	0.3405	0.546	0.00272	0.0137	0.059449	0.16	0.0185	0.0632	0.19407	0.384	0.70168	0.847	0.31845	0.521	0.48741	0.69	0.89636	0.975	0.53545	0.734	0.76229	0.883
1p loss	139 (23%)	477	0.15503	0.331	0.0068599	0.029	9.9999e-06	0.000102	0.01741	0.0621	0.90047	0.975	0.97762	1	8.9999e-05	0.000708	5e-05	0.000432	0.03718	0.109	0.00113	0.00682	0.38645	0.599	0.45811	0.666
1q loss	82 (13%)	534	0.22005	0.417	0.084929	0.208	9.9999e-06	0.000102	0.01112	0.0434	0.95264	1	0.5903	0.769	4e-05	0.000355	0.00101	0.00625	0.41149	0.625	0.062429	0.166	0.23131	0.429	0.12653	0.282
2p loss	17 (3%)	599	0.91356	0.985	0.8074	0.908	0.02901	0.0909	0.078309	0.198	0.42099	0.634	0.01249	0.0478	0.052869	0.146	0.0078099	0.032	0.01784	0.0624	0.79831	0.904	NA	NA	NA	NA
2q loss	14 (2%)	602	0.29885	0.503	0.67003	0.828	0.26076	0.461	0.062579	0.166	0.13618	0.3	0.01269	0.0481	0.096329	0.228	0.0055399	0.0244	0.01764	0.0622	0.43745	0.647	NA	NA	NA	NA
3p loss	68 (11%)	548	0.51154	0.709	0.84576	0.935	0.0207	0.0698	0.55591	0.747	0.095459	0.227	0.5858	0.769	0.67266	0.828	0.71728	0.86	0.6727	0.828	0.67497	0.829	0.54147	0.738	0.72731	0.86
3q loss	45 (7%)	571	0.29467	0.498	0.11647	0.266	0.04093	0.118	0.38423	0.596	0.16705	0.347	0.77087	0.885	0.67759	0.83	0.23385	0.431	0.46076	0.668	0.77407	0.885	0.69924	0.847	0.63516	0.801
4p loss	197 (32%)	419	0.04091	0.118	0.00194	0.0103	9.9999e-06	0.000102	0.01123	0.0435	0.555	0.747	0.46286	0.668	0.00148	0.00847	7.9999e-05	0.000645	0.20436	0.398	0.00464	0.0213	0.67289	0.828	0.5927	0.769
4q loss	191 (31%)	425	0.01796	0.0624	0.01583	0.0577	9.9999e-06	0.000102	0.02046	0.0692	0.90089	0.975	0.53406	0.733	0.00476	0.0216	9.9999e-06	0.000102	0.17914	0.364	0.0072699	0.0302	0.46726	0.671	0.78579	0.895
5p loss	84 (14%)	532	0.2931	0.497	0.50501	0.707	9.9999e-06	0.000102	0.02372	0.0777	0.41461	0.628	0.23032	0.429	0.68252	0.832	0.0066799	0.0285	0.72818	0.86	0.10914	0.252	0.3014	0.504	0.63502	0.801
5q loss	120 (19%)	496	0.00435	0.0205	0.00459	0.0212	9.9999e-06	0.000102	0.01633	0.0593	0.40662	0.618	0.89977	0.975	0.02093	0.0703	0.00155	0.00872	0.24326	0.439	0.00235	0.0122	0.92405	0.992	0.60793	0.779
6p loss	47 (8%)	569	0.50369	0.707	0.01116	0.0434	0.14649	0.317	1	1	0.77156	0.885	0.73421	0.861	0.55531	0.747	0.02888	0.0908	0.27638	0.482	0.31947	0.521	0.23414	0.431	0.20456	0.398
6q loss	69 (11%)	547	0.5681	0.753	0.23467	0.431	0.29987	0.503	0.79907	0.904	0.18444	0.37	0.37765	0.588	0.13615	0.3	0.064219	0.169	0.19244	0.383	0.72811	0.86	0.097509	0.23	0.28555	0.494
7p loss	3 (0%)	613	NA	NA	NA	NA	0.81841	0.915	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.62584	0.794	0.15268	0.327	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
7q loss	5 (1%)	611	NA	NA	NA	NA	0.8734	0.956	0.21128	0.408	0.27581	0.482	0.52273	0.718	0.82572	0.918	0.7018	0.847	1	1	0.54303	0.739	NA	NA	NA	NA
8p loss	217 (35%)	399	0.0047	0.0214	0.00107	0.0065	9.9999e-06	0.000102	0.00069999	0.00442	0.4045	0.616	0.97445	1	0.00353	0.017	5.9999e-05	0.000505	0.18137	0.366	0.02995	0.0921	0.084709	0.208	0.67312	0.828
8q loss	36 (6%)	580	0.77449	0.885	0.83071	0.923	9.9999e-06	0.000102	0.51353	0.71	0.22507	0.423	0.18984	0.379	0.59758	0.77	0.66388	0.824	0.30721	0.509	0.03371	0.102	0.02356	0.0777	0.090849	0.219
9p loss	76 (12%)	540	0.48008	0.682	0.19323	0.383	9.9999e-06	0.000102	0.00134	0.00785	0.95057	1	0.3555	0.564	0.00035	0.00236	0.01771	0.0622	0.32352	0.524	0.055559	0.151	0.80844	0.908	0.35137	0.559
9q loss	78 (13%)	538	0.12374	0.277	0.02377	0.0777	9.9999e-06	0.000102	0.00014	0.00104	0.75553	0.881	0.24946	0.448	6.9999e-05	0.000574	0.00124	0.00739	0.36436	0.573	0.01792	0.0624	0.12331	0.277	0.31792	0.521
10p loss	102 (17%)	514	0.00445	0.0207	0.17214	0.352	9.9999e-06	0.000102	0.052539	0.146	0.75353	0.88	0.73094	0.861	0.0031	0.0153	0.00035	0.00236	0.29831	0.503	0.3175	0.521	0.16339	0.343	0.3383	0.543
10q loss	111 (18%)	505	0.0089699	0.0359	0.27792	0.483	9.9999e-06	0.000102	0.01487	0.0546	0.67197	0.828	0.43237	0.645	0.00318	0.0156	2e-05	0.000193	0.30846	0.509	0.29881	0.503	0.089479	0.218	0.33243	0.536
11p loss	75 (12%)	541	0.95497	1	0.93434	0.997	0.0063899	0.0276	0.4755	0.677	0.37649	0.588	0.96303	1	0.80308	0.906	0.13316	0.295	0.25178	0.45	0.098389	0.231	0.55719	0.747	0.90222	0.975
11q loss	92 (15%)	524	0.86514	0.953	0.47487	0.677	0.0053099	0.0236	0.25811	0.458	0.40359	0.616	0.97007	1	0.92405	0.992	0.16366	0.343	0.16437	0.343	0.04252	0.122	0.47771	0.679	0.61983	0.789
12p loss	71 (12%)	545	0.0298	0.092	0.00292	0.0145	9.9999e-06	0.000102	0.078999	0.198	0.78734	0.896	0.39849	0.612	0.02828	0.0898	8.9999e-05	0.000708	0.13587	0.3	0.51429	0.71	0.94227	1	0.12053	0.272
12q loss	71 (12%)	545	0.058229	0.157	0.0075999	0.0313	9.9999e-06	0.000102	0.24127	0.439	0.39574	0.61	0.11543	0.264	0.01279	0.0482	4e-05	0.000355	0.03705	0.109	0.28908	0.496	1	1	0.30504	0.507
13q loss	18 (3%)	598	0.21661	0.414	0.0050799	0.0228	0.00026	0.0018	0.59647	0.77	0.77074	0.885	0.86617	0.953	0.75814	0.882	0.17064	0.351	1	1	0.97135	1	0.75991	0.882	0.34903	0.557
14q loss	207 (34%)	409	0.00024	0.00169	3e-05	0.000278	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.096059	0.228	0.03133	0.0957	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00183	0.00995	9.9999e-06	0.000102	0.01749	0.0621	0.01829	0.0629
15q loss	230 (37%)	386	9.9999e-05	0.000769	3e-05	0.000278	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-05	0.000769	0.22481	0.423	0.54846	0.745	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00155	0.00872	0.00022	0.00157	0.16598	0.346	0.25926	0.46
16p loss	40 (6%)	576	0.11963	0.271	0.29307	0.497	0.01767	0.0622	0.24298	0.439	0.23489	0.431	0.49429	0.697	0.54009	0.738	0.18907	0.378	0.22555	0.423	0.30315	0.506	1	1	0.94717	1
16q loss	44 (7%)	572	0.03406	0.103	0.40438	0.616	0.00068999	0.00438	0.36279	0.572	0.40313	0.616	0.73091	0.861	0.72636	0.86	0.55327	0.747	0.1612	0.34	0.2032	0.397	0.96909	1	0.73428	0.861
17p loss	340 (55%)	276	3e-05	0.000278	2e-05	0.000193	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.59551	0.77	0.9475	1	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00064999	0.00418	9.9999e-06	0.000102	0.071409	0.184	0.081659	0.204
17q loss	93 (15%)	523	0.92552	0.992	0.7837	0.894	9.9999e-06	0.000102	0.95232	1	0.42614	0.639	0.5408	0.738	0.89077	0.97	0.02934	0.0914	0.12186	0.274	0.60542	0.777	0.80673	0.908	0.65402	0.818
18p loss	381 (62%)	235	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.15066	0.325	0.5554	0.747	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00019	0.00137	7.9999e-05	0.000645
18q loss	408 (66%)	208	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.146	0.317	0.37413	0.585	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	9.9999e-06	0.000102	0.00224	0.0117	0.00025	0.00174
19p loss	62 (10%)	554	0.58925	0.769	0.18528	0.371	2e-05	0.000193	0.14205	0.31	0.72726	0.86	0.59668	0.77	0.01363	0.0508	0.02152	0.072	0.16769	0.347	0.03408	0.103	0.34225	0.548	0.14802	0.32
19q loss	56 (9%)	560	0.72422	0.86	0.083929	0.208	6.9999e-05	0.000574	0.17114	0.351	0.28307	0.491	0.85044	0.939	0.1521	0.327	0.059579	0.16	0.21497	0.412	0.02623	0.0841	0.51824	0.713	0.16223	0.342
20p loss	65 (11%)	551	0.10288	0.24	0.0096299	0.0381	9.9999e-06	0.000102	0.00081999	0.00514	0.9652	1	0.56137	0.747	0.10094	0.236	0.00035	0.00236	0.23483	0.431	0.065609	0.172	0.02884	0.0908	0.04054	0.118
20q loss	8 (1%)	608	NA	NA	NA	NA	1	1	0.77889	0.889	0.03037	0.0931	0.68118	0.832	0.64636	0.812	0.88583	0.967	0.94012	1	1	1	NA	NA	NA	NA
21q loss	193 (31%)	423	0.01113	0.0434	0.00253	0.013	9.9999e-06	0.000102	0.10503	0.244	0.42319	0.637	0.19505	0.385	5.9999e-05	0.000505	0.00218	0.0114	0.084399	0.208	0.0079799	0.0326	0.16703	0.347	0.11853	0.269
22q loss	203 (33%)	413	0.0068899	0.029	2e-05	0.000193	9.9999e-06	0.000102	0.2318	0.43	0.24273	0.439	0.57963	0.764	0.04895	0.138	9.9999e-06	0.000102	0.17777	0.362	0.00139	0.00805	0.45393	0.663	0.25571	0.456
xp loss	91 (15%)	525	0.9636	1	0.72242	0.86	0.11158	0.257	0.73358	0.861	0.01337	0.0502	0.01458	0.0537	0.70776	0.85	0.95698	1	0.23116	0.429	0.075749	0.194	0.33413	0.537	0.02916	0.0911
xq loss	79 (13%)	537	0.94113	1	0.77314	0.885	0.092399	0.222	0.55347	0.747	0.065739	0.172	0.03339	0.101	0.41899	0.632	0.43589	0.646	0.19869	0.389	0.04868	0.138	0.20776	0.402	0.0052899	0.0236
