		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	13 (3%)	500	NA	NA	NA	NA	6.9999e-05	0.000483	0.00028	0.00156	0.02334	0.0589	0.29613	0.428	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.0065599	0.0215	9.9999e-06	8.6e-05	0.00291	0.0108	0.0011	0.00479
1q gain	23 (4%)	490	NA	NA	NA	NA	3e-05	0.000226	0.00267	0.0102	0.47048	0.618	0.83311	0.99	8.9999e-05	0.000607	0.00299	0.0111	0.0188	0.049	0.03036	0.0719	0.01151	0.0338	0.27031	0.403
2p gain	14 (3%)	499	NA	NA	NA	NA	5.9999e-05	0.000423	0.15889	0.26	0.25122	0.382	0.42455	0.575	0.01549	0.0425	0.00166	0.00681	0.64505	0.803	0.02098	0.0539	0.0045	0.0156	0.063839	0.128
2q gain	13 (3%)	500	NA	NA	NA	NA	0.00017	0.00103	0.14455	0.243	0.25139	0.382	0.42236	0.573	0.04005	0.0897	0.00070999	0.00338	0.5221	0.673	0.01699	0.0455	0.01224	0.0357	0.0282	0.0677
3p gain	11 (2%)	502	NA	NA	NA	NA	0.00061999	0.00304	0.28108	0.416	0.076429	0.149	0.2004	0.316	0.11125	0.2	0.0369	0.0843	0.13343	0.229	0.29065	0.425	0.42547	0.575	0.253	0.384
3q gain	8 (2%)	505	NA	NA	NA	NA	0.00012	0.000772	0.4666	0.614	0.00439	0.0154	0.21009	0.328	0.071469	0.141	0.00434	0.0153	0.38651	0.537	0.13534	0.231	0.83869	0.994	0.11924	0.209
4p gain	12 (2%)	501	NA	NA	NA	NA	0.00236	0.00914	0.02405	0.0604	0.38361	0.535	0.47984	0.626	0.0071599	0.0228	0.01351	0.0384	0.31512	0.453	0.0452	0.0978	0.00313	0.0114	0.076159	0.149
4q gain	7 (1%)	506	NA	NA	NA	NA	0.00392	0.014	0.052239	0.109	0.073569	0.144	0.72771	0.887	0.0052999	0.0179	0.00225	0.00882	0.2401	0.366	0.054319	0.113	0.03617	0.0831	0.03554	0.0821
5p gain	11 (2%)	502	NA	NA	NA	NA	0.00132	0.0056	0.01721	0.046	0.12784	0.222	0.03596	0.0828	0.00012	0.000772	0.00043	0.00225	0.02569	0.0634	0.02681	0.0653	2e-05	0.000156	0.00077999	0.00368
5q gain	9 (2%)	504	NA	NA	NA	NA	0.00302	0.0112	0.0083199	0.0256	0.4402	0.59	0.061429	0.126	0.0011	0.00479	0.00041	0.00217	0.081879	0.157	0.0061299	0.0203	0.00012	0.000772	0.00075999	0.0036
6p gain	7 (1%)	506	NA	NA	NA	NA	0.10242	0.186	0.00016	0.000978	0.0081799	0.0253	0.43021	0.579	0.47524	0.622	0.00449	0.0156	0.02615	0.0642	0.065989	0.132	0.11864	0.209	0.11473	0.204
7p gain	120 (23%)	393	1	1	1	1	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.0096999	0.0293	0.01795	0.0475	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00141	0.00591	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05
7q gain	150 (29%)	363	0.86312	1	0.78121	0.937	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.079829	0.154	0.077949	0.151	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00285	0.0107	9.9999e-06	8.6e-05	2e-05	0.000156	9.9999e-06	8.6e-05
8p gain	45 (9%)	468	NA	NA	NA	NA	0.00062999	0.00308	0.00328	0.0119	0.01837	0.0483	0.061609	0.126	0.0166	0.0448	0.01409	0.0397	0.26299	0.395	0.34441	0.489	0.11103	0.199	0.0062099	0.0205
8q gain	55 (11%)	458	0.050749	0.107	0.40639	0.557	0.00021	0.00121	5e-05	0.000357	0.0075799	0.0237	0.04359	0.0956	0.0014	0.00589	0.00067999	0.0033	0.13237	0.228	0.098939	0.181	0.063749	0.128	0.00059999	0.00296
9p gain	17 (3%)	496	NA	NA	NA	NA	0.00499	0.017	0.03048	0.0719	0.03721	0.0847	0.77096	0.927	0.080829	0.156	0.079389	0.153	0.88173	1	0.02792	0.0672	0.98694	1	0.20141	0.317
9q gain	24 (5%)	489	NA	NA	NA	NA	0.0068899	0.0222	0.00233	0.0091	0.0069399	0.0222	0.86561	1	0.04331	0.0955	0.00472	0.0163	0.44392	0.593	0.01053	0.0314	0.44436	0.593	0.069409	0.137
10p gain	57 (11%)	456	1	1	0.04228	0.0938	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.0074799	0.0235	0.00185	0.00746	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.02731	0.0664	0.29551	0.428	0.01793	0.0475	9.9999e-06	8.6e-05
10q gain	11 (2%)	502	NA	NA	NA	NA	0.01236	0.0359	0.00116	0.00503	0.067539	0.134	0.03982	0.0894	0.2024	0.318	0.00027	0.00151	0.10267	0.187	0.065619	0.131	0.73833	0.899	0.00148	0.00615
11p gain	30 (6%)	483	NA	NA	NA	NA	0.00432	0.0153	3e-04	0.00164	0.51027	0.66	0.15783	0.259	0.0068099	0.022	0.0085699	0.0263	0.03771	0.0852	0.02648	0.0647	0.12587	0.22	0.0074899	0.0235
11q gain	58 (11%)	455	0.61268	0.768	0.5808	0.738	1	1	0.00414	0.0147	0.203	0.318	0.067269	0.133	0.04629	0.0998	0.063779	0.128	0.39228	0.544	0.04683	0.101	0.27791	0.413	0.02771	0.0672
12p gain	32 (6%)	481	0.75429	0.911	0.57937	0.738	4e-05	0.00029	0.02595	0.0639	0.17682	0.286	0.37404	0.523	0.051809	0.109	0.04206	0.0936	0.04771	0.102	0.02784	0.0672	0.11713	0.207	0.02269	0.0577
12q gain	15 (3%)	498	NA	NA	NA	NA	2e-05	0.000156	0.63203	0.79	0.0048	0.0165	0.21116	0.329	0.0050299	0.0171	0.092579	0.173	0.056549	0.117	0.02789	0.0672	0.085939	0.163	0.01531	0.0425
13q gain	6 (1%)	507	NA	NA	NA	NA	0.58413	0.739	0.18057	0.289	0.16484	0.268	0.14396	0.242	0.30243	0.436	0.47956	0.626	0.34883	0.493	0.58464	0.739	0.59366	0.748	0.95027	1
14q gain	4 (1%)	509	NA	NA	NA	NA	0.20504	0.321	0.089999	0.17	0.79158	0.948	0.4205	0.572	0.75362	0.911	0.70921	0.868	0.19646	0.311	0.68093	0.842	1	1	0.02447	0.0611
15q gain	11 (2%)	502	NA	NA	NA	NA	0.01099	0.0326	0.03187	0.0745	0.0089299	0.0271	0.01263	0.0364	0.04701	0.101	0.063009	0.128	0.16971	0.276	0.28847	0.423	0.01966	0.051	0.057559	0.119
16p gain	16 (3%)	497	NA	NA	NA	NA	0.11864	0.209	0.13927	0.237	0.56377	0.72	0.93954	1	0.1579	0.259	0.00235	0.00914	0.15488	0.255	0.050189	0.106	0.13813	0.235	0.03763	0.0852
16q gain	19 (4%)	494	NA	NA	NA	NA	0.0067899	0.022	0.1523	0.252	0.63649	0.793	0.94387	1	0.093689	0.174	0.00043	0.00225	0.04847	0.103	0.099569	0.182	0.14079	0.238	0.0307	0.0723
17p gain	20 (4%)	493	NA	NA	NA	NA	0.01281	0.0368	0.12184	0.213	0.0162	0.044	0.37678	0.526	0.20646	0.323	0.063759	0.128	0.19926	0.314	0.48467	0.631	0.58477	0.739	0.3706	0.519
17q gain	23 (4%)	490	NA	NA	NA	NA	0.14369	0.242	0.54842	0.704	0.01256	0.0363	0.02439	0.0611	0.34658	0.491	0.25661	0.387	0.11341	0.202	0.70076	0.862	0.41731	0.569	0.10992	0.198
18p gain	18 (4%)	495	NA	NA	NA	NA	0.0064999	0.0213	0.00025	0.00143	0.68136	0.842	0.93908	1	0.0056299	0.0189	0.02197	0.0562	0.93569	1	0.13516	0.231	0.23637	0.363	0.02264	0.0577
18q gain	13 (3%)	500	NA	NA	NA	NA	0.00183	0.00741	2e-05	0.000156	0.45096	0.599	0.48315	0.63	0.00026	0.00147	0.00048	0.00244	0.52468	0.675	0.01736	0.0462	0.02925	0.0699	0.0067899	0.022
19p gain	99 (19%)	414	0.22091	0.342	1	1	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.27923	0.414	0.00389	0.014	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.0024	0.00926	0.055029	0.114	2e-04	0.00116	9.9999e-06	8.6e-05
19q gain	25 (5%)	488	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.13317	0.229	0.01381	0.039	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00247	0.00945	9.9999e-06	8.6e-05	0.00013	0.000815	9.9999e-06	8.6e-05
20p gain	45 (9%)	468	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00484	0.0166	0.01538	0.0425	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.10528	0.19	9.9999e-06	8.6e-05	0.00027	0.00151	9.9999e-06	8.6e-05
20q gain	44 (9%)	469	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00069999	0.00335	0.00369	0.0133	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.04516	0.0978	9.9999e-06	8.6e-05	8.9999e-05	0.000607	9.9999e-06	8.6e-05
21q gain	23 (4%)	490	NA	NA	NA	NA	0.00044	0.00229	0.19152	0.304	0.21473	0.333	0.14235	0.241	0.63404	0.791	0.22552	0.348	0.25981	0.391	0.062189	0.127	0.76508	0.923	0.17738	0.286
22q gain	23 (4%)	490	NA	NA	NA	NA	0.00085999	0.004	9.9999e-06	8.6e-05	0.74994	0.909	0.10932	0.197	0.00080999	0.00379	0.00048	0.00244	0.04527	0.0978	0.5278	0.679	0.00045	0.00233	0.00177	0.00723
xp gain	22 (4%)	491	NA	NA	NA	NA	0.00284	0.0107	9.9999e-06	8.6e-05	0.40412	0.556	0.60337	0.759	0.02948	0.0702	0.01875	0.049	0.40268	0.554	0.73986	0.9	0.86097	1	0.19826	0.313
xq gain	42 (8%)	471	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.02621	0.0642	0.02493	0.0621	0.00013	0.000815	9.9999e-06	8.6e-05	0.01006	0.0302	0.4614	0.609	0.03659	0.0839	0.00196	0.00781
1p loss	184 (36%)	329	0.02899	0.0694	0.00016	0.000978	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00312	0.0114	0.00106	0.00468	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05
1q loss	26 (5%)	487	0.34263	0.488	0.15041	0.25	0.15127	0.251	0.13249	0.228	0.57126	0.729	0.11858	0.209	0.31533	0.453	0.0087699	0.0267	0.081979	0.157	0.29329	0.428	0.68339	0.843	0.29543	0.428
2p loss	21 (4%)	492	NA	NA	NA	NA	0.02525	0.0628	0.03514	0.0813	0.1015	0.185	0.95321	1	0.17954	0.288	0.04389	0.0961	0.077679	0.151	0.39853	0.55	0.23242	0.357	0.13732	0.234
2q loss	18 (4%)	495	NA	NA	NA	NA	0.01534	0.0425	0.0086299	0.0264	0.04794	0.102	0.76886	0.926	0.45532	0.603	0.00186	0.00747	0.02567	0.0634	0.81108	0.969	0.14296	0.241	0.00206	0.00817
3p loss	30 (6%)	483	NA	NA	NA	NA	0.02307	0.0584	0.15083	0.251	0.01135	0.0335	0.083919	0.16	0.075779	0.148	0.065569	0.131	0.00105	0.00468	0.00039	0.00207	0.071099	0.14	0.12987	0.225
3q loss	28 (5%)	485	0.17452	0.283	0.88147	1	0.15582	0.256	0.13966	0.237	0.15414	0.255	0.081129	0.156	0.14799	0.248	0.0317	0.0742	0.094959	0.176	0.01649	0.0446	0.11241	0.201	0.01578	0.0432
4p loss	72 (14%)	441	1	1	0.78082	0.937	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.01176	0.0344	0.93223	1	0.00012	0.000772	9.9999e-06	8.6e-05	6.9999e-05	0.000483	0.00105	0.00468	0.00055999	0.00278	9.9999e-06	8.6e-05
4q loss	94 (18%)	419	1	1	0.40803	0.558	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.01864	0.0488	0.4016	0.554	0.00119	0.00512	9.9999e-06	8.6e-05	0.00047	0.00242	0.00347	0.0126	0.0071999	0.0229	2e-05	0.000156
5p loss	35 (7%)	478	0.74506	0.904	0.066809	0.133	0.00049	0.00247	0.00026	0.00147	0.090159	0.17	0.9688	1	0.04051	0.0905	0.00106	0.00468	0.11217	0.201	0.25438	0.385	0.18149	0.29	0.00013	0.000815
5q loss	32 (6%)	481	0.44854	0.596	0.23662	0.363	0.00080999	0.00379	4e-05	0.00029	0.0022	0.00866	0.18275	0.292	0.01366	0.0387	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-05	0.000666	0.11641	0.206	0.01549	0.0425	3e-05	0.000226
6p loss	30 (6%)	483	NA	NA	NA	NA	0.00018	0.00107	0.18019	0.289	0.88649	1	0.34867	0.493	0.4727	0.62	0.15487	0.255	0.44574	0.593	0.40475	0.556	0.38489	0.535	0.03337	0.0778
6q loss	63 (12%)	450	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	8.6e-05	0.00096999	0.00436	0.45718	0.604	0.03393	0.0789	0.064899	0.13	0.052869	0.11	0.00191	0.00764	0.17156	0.278	0.01331	0.0379	0.00451	0.0156
7p loss	3 (1%)	510	NA	NA	NA	NA	0.32096	0.459	0.64906	0.807	NA	NA	NA	NA	1	1	0.79165	0.948	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
7q loss	4 (1%)	509	NA	NA	NA	NA	0.15048	0.25	0.44248	0.592	0.01695	0.0455	0.25445	0.385	0.43791	0.589	0.093259	0.174	1	1	0.83274	0.99	0.56077	0.717	0.90786	1
8p loss	17 (3%)	496	0.61841	0.774	0.04352	0.0956	2e-05	0.000156	2e-04	0.00116	0.01611	0.0439	0.01021	0.0305	9.9999e-06	8.6e-05	4e-05	0.00029	0.29727	0.429	0.00146	0.00609	0.0078199	0.0243	9.9999e-06	8.6e-05
8q loss	11 (2%)	502	NA	NA	NA	NA	3e-05	0.000226	0.00091999	0.00418	0.099789	0.182	0.10484	0.19	0.00018	0.00107	0.00036	0.00192	0.28783	0.423	0.00069999	0.00335	0.04984	0.106	2e-05	0.000156
9p loss	118 (23%)	395	0.38497	0.535	0.26644	0.398	9.9999e-06	8.6e-05	0.00409	0.0146	0.00055999	0.00278	9.9999e-06	8.6e-05	0.10391	0.188	0.00015	0.000935	0.97213	1	0.22259	0.344	0.37059	0.519	0.085119	0.162
9q loss	51 (10%)	462	NA	NA	NA	NA	0.49659	0.644	0.74335	0.903	0.085209	0.162	0.00451	0.0156	0.58386	0.739	0.04408	0.0963	0.42034	0.572	0.82346	0.981	0.89354	1	0.67771	0.839
10p loss	83 (16%)	430	0.27054	0.403	0.883	1	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.0074199	0.0235	0.00031	0.00168	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.00016	0.000978	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05
10q loss	97 (19%)	416	0.27045	0.403	0.88055	1	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.0090699	0.0275	8.9999e-05	0.000607	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	5.9999e-05	0.000423	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05
11p loss	63 (12%)	450	1	1	0.03114	0.0731	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.01137	0.0335	0.31669	0.455	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	2e-05	0.000156	4e-05	0.00029	0.00091999	0.00418	9.9999e-06	8.6e-05
11q loss	21 (4%)	492	NA	NA	NA	NA	2e-05	0.000156	0.00018	0.00107	0.13345	0.229	0.16195	0.265	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.095839	0.177	9.9999e-05	0.000666	0.0063099	0.0208	0.00138	0.00583
12p loss	28 (5%)	485	NA	NA	NA	NA	0.01486	0.0416	3e-04	0.00164	0.94606	1	1	1	0.098669	0.181	0.0050699	0.0172	0.04284	0.0949	0.24346	0.371	0.48581	0.631	0.04775	0.102
12q loss	52 (10%)	461	1	1	0.58	0.738	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.60407	0.759	0.95645	1	0.00088999	0.00412	9.9999e-06	8.6e-05	0.00306	0.0113	0.39457	0.546	0.24002	0.366	9.9999e-06	8.6e-05
13q loss	115 (22%)	398	0.17921	0.288	2e-05	0.000156	9.9999e-06	8.6e-05	0.04331	0.0955	0.01284	0.0368	0.44474	0.593	0.01812	0.0477	0.00117	0.00505	0.051369	0.108	0.02061	0.0531	0.45496	0.603	0.04471	0.0974
14q loss	81 (16%)	432	0.46661	0.614	0.26565	0.398	9.9999e-06	8.6e-05	0.00178	0.00724	0.052779	0.11	0.29472	0.428	9.9999e-06	8.6e-05	0.00019	0.00112	0.01912	0.0497	0.00126	0.0054	0.01234	0.0359	0.00149	0.00616
15q loss	51 (10%)	462	1	1	0.70833	0.868	0.01586	0.0433	9.9999e-06	8.6e-05	0.01451	0.0408	0.087149	0.164	0.00276	0.0105	3e-05	0.000226	0.12348	0.216	0.47314	0.62	0.093699	0.174	0.00052999	0.00266
16p loss	14 (3%)	499	NA	NA	NA	NA	0.03042	0.0719	0.41373	0.565	0.70418	0.864	0.063229	0.128	0.03753	0.0852	0.02272	0.0577	0.81099	0.969	0.35627	0.501	0.70111	0.862	0.32554	0.465
16q loss	22 (4%)	491	NA	NA	NA	NA	0.0055999	0.0188	0.085489	0.162	0.29428	0.428	0.0056699	0.0189	0.02106	0.054	0.02056	0.0531	0.69915	0.861	0.00376	0.0135	0.28562	0.421	0.12837	0.222
17p loss	14 (3%)	499	NA	NA	NA	NA	0.00093999	0.00425	0.01008	0.0302	0.90815	1	0.61645	0.772	0.00049	0.00247	0.063329	0.128	0.098479	0.181	0.00214	0.00846	0.43853	0.589	0.04517	0.0978
17q loss	9 (2%)	504	NA	NA	NA	NA	0.00291	0.0108	0.053319	0.111	0.59641	0.751	0.22852	0.352	0.01091	0.0324	0.29518	0.428	0.081859	0.157	0.096969	0.179	0.42408	0.575	0.12787	0.222
18p loss	67 (13%)	446	0.32311	0.462	0.03018	0.0717	0.0074899	0.0235	0.075599	0.148	0.58678	0.741	0.11339	0.202	0.17937	0.288	0.094269	0.175	0.28734	0.423	0.86014	1	0.55817	0.715	0.55405	0.71
18q loss	62 (12%)	451	0.34392	0.489	0.14909	0.249	0.00090999	0.00417	0.00090999	0.00417	0.36185	0.508	0.092139	0.173	0.053849	0.112	0.01545	0.0425	0.01807	0.0477	0.71216	0.871	0.23793	0.364	0.28719	0.423
19p loss	26 (5%)	487	0.84734	1	0.42865	0.578	0.93342	1	0.84311	0.997	0.35161	0.496	0.39577	0.547	0.67739	0.839	0.18566	0.295	0.21379	0.332	0.4078	0.558	0.0411	0.0916	0.096089	0.178
19q loss	209 (41%)	304	0.18365	0.293	0.01326	0.0379	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.059789	0.123	0.0082099	0.0253	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05
20p loss	7 (1%)	506	NA	NA	NA	NA	0.01513	0.0423	0.03694	0.0843	0.65515	0.813	0.72722	0.887	0.2913	0.426	0.21651	0.336	0.42883	0.578	0.48625	0.631	0.75127	0.909	0.28322	0.418
20q loss	3 (1%)	510	NA	NA	NA	NA	0.31977	0.458	0.03902	0.0878	NA	NA	NA	NA	0.03447	0.08	0.077929	0.151	0.3315	0.472	1	1	0.16313	0.266	0.19619	0.311
21q loss	38 (7%)	475	0.50519	0.654	0.0069199	0.0222	0.00013	0.000815	5e-05	0.000357	0.15003	0.25	0.45653	0.604	0.00129	0.0055	9.9999e-06	8.6e-05	0.3524	0.496	0.04863	0.103	0.12629	0.22	0.0254	0.063
22q loss	57 (11%)	456	0.81556	0.973	0.0065799	0.0215	9.9999e-06	8.6e-05	2e-05	0.000156	0.00036	0.00192	0.03895	0.0878	9.9999e-06	8.6e-05	9.9999e-06	8.6e-05	0.51324	0.663	3e-04	0.00164	0.00165	0.0068	2e-05	0.000156
xp loss	99 (19%)	414	0.84003	0.995	0.066239	0.132	0.97958	1	0.00286	0.0107	0.00246	0.00945	0.0058799	0.0196	0.11612	0.206	9.9999e-06	8.6e-05	0.02382	0.06	0.27912	0.414	0.00107	0.00471	0.00033	0.00178
xq loss	70 (14%)	443	0.83797	0.994	0.26602	0.398	0.0075999	0.0237	0.00018	0.00107	6.9999e-05	0.000483	0.01671	0.045	0.00021	0.00121	9.9999e-06	8.6e-05	4e-05	0.00029	0.25962	0.391	0.00011	0.000727	0.00068999	0.00334
