		Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1p32.1	94 (37%)	163	2e-05	0.000116	9.9999e-06	6.9e-05	0.00382	0.00918	6.9999e-05	0.00034	3e-05	0.000163	9.9999e-06	6.9e-05	0.0081999	0.0167	0.00445	0.0103	0.02921	0.0475	0.00042	0.00152
amp_1q21.3	105 (41%)	152	9.9999e-06	6.9e-05	0.0091399	0.0183	0.23931	0.29	0.01259	0.0235	0.50505	0.55	0.10464	0.145	0.68714	0.715	0.16478	0.21	0.00125	0.00359	0.03829	0.06
amp_1q24.3	102 (40%)	155	9.9999e-06	6.9e-05	0.04014	0.0619	0.13821	0.183	0.31947	0.367	0.01765	0.0313	0.02023	0.0348	0.80417	0.821	0.13694	0.182	0.45248	0.497	0.1139	0.155
amp_2p11.2	64 (25%)	193	0.00016	0.000681	0.02565	0.0426	0.32996	0.377	0.058629	0.0859	0.83635	0.849	0.37035	0.418	0.87809	0.886	0.31398	0.362	0.85156	0.863	0.98851	0.989
amp_3p12.1	69 (27%)	188	2e-05	0.000116	0.00063999	0.00204	0.00469	0.0107	6.9999e-05	0.00034	0.00067999	0.00214	5.9999e-05	0.000304	0.15122	0.196	0.00318	0.00786	0.00211	0.00549	0.00019	0.00078
amp_4q12	78 (30%)	179	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.01737	0.0309	0.00168	0.00455	0.00054999	0.00185	0.00378	0.00912	0.0212	0.0361	0.01311	0.0244	0.050009	0.0749	0.00214	0.00555
amp_5p15.33	119 (46%)	138	9.9999e-06	6.9e-05	0.00052999	0.00179	0.13791	0.183	0.15606	0.201	0.01812	0.0318	0.00017	0.000711	0.30838	0.356	0.01401	0.0258	0.83088	0.844	0.75241	0.773
amp_6p21.1	60 (23%)	197	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	6.9999e-05	0.00034	0.00055999	0.00185	0.00036	0.00134	3e-04	0.00116	0.0058399	0.0127	0.01024	0.0201	0.02504	0.0421	0.02107	0.036
amp_6q25.1	75 (29%)	182	0.00135	0.0038	7.9999e-05	0.000373	0.00031	0.00118	0.00019	0.00078	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.00017	0.000711	0.00012	0.000524	0.00063999	0.00204	0.00063999	0.00204
amp_7q31.2	77 (30%)	180	0.00033	0.00124	0.00017	0.000711	0.01393	0.0257	0.00060999	0.00198	2e-05	0.000116	0.00499	0.0112	0.00029	0.00113	0.04472	0.0677	2e-04	0.000817	0.00056999	0.00186
amp_8p11.22	81 (32%)	176	9.9999e-06	6.9e-05	0.00343	0.00833	0.03267	0.0524	0.092569	0.129	0.43876	0.487	0.01432	0.0261	0.16131	0.206	0.01032	0.0202	0.090849	0.128	0.02893	0.0473
amp_8q24.21	83 (32%)	174	0.00011	0.000483	0.03728	0.0587	0.0075799	0.0157	0.0077299	0.0159	0.65333	0.689	0.24461	0.295	0.3591	0.407	0.29377	0.342	0.054939	0.0813	0.066039	0.0959
amp_11q22.2	36 (14%)	221	0.32634	0.374	0.01186	0.0225	0.41104	0.459	0.19085	0.239	0.01442	0.0262	0.00407	0.00962	0.1359	0.181	0.00451	0.0104	0.28403	0.333	0.18876	0.236
amp_12q15	94 (37%)	163	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05
amp_13q34	54 (21%)	203	9.9999e-06	6.9e-05	0.1141	0.155	0.96222	0.964	0.01123	0.0217	0.45941	0.502	0.14262	0.186	0.65636	0.691	0.14037	0.185	0.82619	0.841	0.1411	0.185
amp_15q26.3	84 (33%)	173	9.9999e-06	6.9e-05	0.052899	0.0788	0.72216	0.747	0.27142	0.321	0.64311	0.681	0.084749	0.12	0.66455	0.697	0.18481	0.232	0.77469	0.794	0.80809	0.824
amp_17p12	102 (40%)	155	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	0.23855	0.289	0.00084999	0.00256	0.052179	0.0779	0.00226	0.0058	0.43181	0.48	0.00181	0.00477	0.20721	0.256	0.00431	0.0101
amp_17p11.2	104 (40%)	153	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.21518	0.264	0.00018	0.000748	0.03127	0.0503	0.02002	0.0345	0.67337	0.704	0.00181	0.00477	0.27893	0.328	0.0073799	0.0153
amp_17q24.3	79 (31%)	178	9.9999e-06	6.9e-05	0.00256	0.00649	0.03099	0.05	0.00225	0.00579	0.25705	0.307	0.0053999	0.0119	0.10772	0.148	0.154	0.199	0.44496	0.491	0.084279	0.119
amp_19p13.2	108 (42%)	149	9.9999e-06	6.9e-05	0.24159	0.292	0.26246	0.312	0.00196	0.00514	0.19393	0.242	0.0065599	0.0139	0.87949	0.886	0.28474	0.334	0.78403	0.803	0.16532	0.21
amp_19q12	93 (36%)	164	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	0.053149	0.079	0.00022	0.000883	0.04283	0.065	0.0086399	0.0174	0.48774	0.532	0.0088799	0.0178	0.04113	0.0631	0.00225	0.00579
amp_20q13.33	98 (38%)	159	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	0.00482	0.0109	6.9999e-05	0.00034	0.00123	0.00357	0.00141	0.00392	0.01163	0.0222	0.00049	0.00171	0.00035	0.00131	0.00037	0.00137
amp_21q21.1	73 (28%)	184	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	0.20814	0.256	0.15802	0.203	0.12142	0.163	0.29094	0.34	0.66273	0.696	0.14093	0.185	0.29874	0.346	0.11777	0.159
amp_xp21.2	97 (38%)	160	9.9999e-06	6.9e-05	0.03382	0.0536	0.31657	0.364	0.056759	0.0837	0.3629	0.41	0.04885	0.0733	0.73307	0.756	0.03998	0.0619	0.26101	0.311	0.00397	0.00945
amp_xq21.1	46 (18%)	211	9.9999e-06	6.9e-05	0.01779	0.0315	0.03355	0.0535	0.34041	0.388	0.0413	0.0632	0.00273	0.00685	0.01628	0.0291	0.40264	0.45	0.04708	0.0711	0.29243	0.341
del_1p36.32	69 (27%)	188	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	5.9999e-05	0.000304	5e-05	0.000261
del_1q44	80 (31%)	177	9.9999e-06	6.9e-05	0.00055999	0.00185	0.058189	0.0854	6.9999e-05	0.00034	0.00092999	0.00277	0.00021	0.000847	0.00175	0.0047	0.0069399	0.0145	0.00124	0.00358	0.00048	0.00168
del_2p25.3	94 (37%)	163	9.9999e-06	6.9e-05	0.00024	0.000952	0.070729	0.102	0.00385	0.00922	2e-05	0.000116	0.00128	0.00363	0.00021	0.000847	2e-05	0.000116	0.00204	0.00533	3e-05	0.000163
del_2q37.3	108 (42%)	149	9.9999e-06	6.9e-05	0.00146	0.00405	0.091399	0.128	0.03943	0.0614	0.03892	0.0608	0.00081999	0.00249	0.12979	0.174	0.0060699	0.0132	0.03369	0.0536	0.01231	0.0232
del_2q37.3	110 (43%)	147	9.9999e-06	6.9e-05	0.0085699	0.0173	0.58513	0.627	0.00409	0.00963	0.02555	0.0426	0.00127	0.00362	0.44621	0.492	0.0247	0.0417	0.081029	0.115	0.063069	0.0918
del_3p21.31	65 (25%)	192	0.01014	0.02	9.9999e-06	6.9e-05	0.00066999	0.00212	0.00013	0.000564	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-05	0.000451	0.0080199	0.0164	2e-05	0.000116	8.9999e-05	0.000409
del_3q13.31	51 (20%)	206	0.0062999	0.0135	0.00161	0.00437	0.00077999	0.00239	0.02505	0.0421	0.0052499	0.0116	0.0065199	0.0138	0.0099399	0.0197	0.01805	0.0318	0.0067599	0.0142	0.04168	0.0635
del_3q29	54 (21%)	203	0.0066899	0.0141	0.04014	0.0619	0.01078	0.0209	0.74766	0.769	0.35632	0.404	0.077009	0.11	0.16057	0.206	0.03786	0.0595	0.085219	0.12	0.13344	0.178
del_4q35.1	94 (37%)	163	9.9999e-06	6.9e-05	0.0055399	0.0122	0.65887	0.693	0.01368	0.0253	0.01504	0.0271	0.02905	0.0474	0.35543	0.404	0.10738	0.148	0.27556	0.326	0.20759	0.256
del_5p15.33	33 (13%)	224	0.44708	0.492	0.01413	0.0259	0.01413	0.0259	0.00055999	0.00185	0.01366	0.0253	0.00154	0.00423	0.055939	0.0827	0.60988	0.648	0.02347	0.0398	0.02534	0.0424
del_6p25.3	81 (32%)	176	9.9999e-06	6.9e-05	0.00016	0.000681	0.00051999	0.00177	0.096939	0.135	0.00077999	0.00239	0.00158	0.00431	0.01258	0.0235	0.02553	0.0426	0.070279	0.102	0.073389	0.106
del_6q14.1	78 (30%)	179	9.9999e-06	6.9e-05	0.01863	0.0326	0.0064599	0.0138	0.02723	0.0448	0.45851	0.502	0.26435	0.313	0.19437	0.242	0.59085	0.632	0.28402	0.333	0.36104	0.408
del_7q36.3	71 (28%)	186	9.9999e-06	6.9e-05	0.01494	0.0271	0.27791	0.328	0.03846	0.0602	0.17307	0.219	0.1376	0.183	0.0489	0.0733	0.0057999	0.0127	0.45262	0.497	0.1112	0.152
del_8p23.3	81 (32%)	176	3e-05	0.000163	2e-05	0.000116	0.00042	0.00152	0.00075999	0.00237	6.9999e-05	0.00034	0.00047	0.00167	0.0063199	0.0135	0.00416	0.00976	0.00031	0.00118	0.00011	0.000483
del_9p24.3	100 (39%)	157	9.9999e-06	6.9e-05	0.19715	0.245	0.03275	0.0524	0.144	0.188	0.18713	0.235	0.33386	0.381	0.01061	0.0207	0.91204	0.917	0.3746	0.422	0.55215	0.594
del_9p21.3	114 (44%)	143	9.9999e-06	6.9e-05	0.00311	0.00772	0.0056199	0.0123	0.00077999	0.00239	0.00455	0.0104	0.00487	0.011	0.00151	0.00417	0.55673	0.598	0.00033	0.00124	0.00129	0.00365
del_9q34.3	61 (24%)	196	2e-05	0.000116	4e-05	0.000214	0.01953	0.0339	0.095709	0.133	0.04248	0.0646	0.14996	0.194	0.01214	0.023	0.00293	0.0073	0.04022	0.0619	0.02213	0.0376
del_10p15.3	128 (50%)	129	9.9999e-06	6.9e-05	0.00346	0.00838	0.3301	0.377	0.00024	0.000952	0.25822	0.308	0.0092499	0.0184	0.55922	0.6	0.01892	0.0329	0.60462	0.644	0.71792	0.744
del_10q23.31	138 (54%)	119	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	4e-05	0.000214	9.9999e-06	6.9e-05	0.00039	0.00143	0.00025	0.000986
del_10q26.3	132 (51%)	125	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	9.9999e-06	6.9e-05	3e-05	0.000163	2e-05	0.000116	3e-05	0.000163	7.9999e-05	0.000373
del_11p15.5	110 (43%)	147	9.9999e-06	6.9e-05	0.11947	0.161	0.29402	0.342	0.01064	0.0207	0.53176	0.574	0.14246	0.186	0.37863	0.425	0.31631	0.364	0.48427	0.529	0.73382	0.756
del_11q23.1	118 (46%)	139	9.9999e-06	6.9e-05	0.00285	0.00712	0.092209	0.129	0.00433	0.0101	0.01252	0.0235	0.01537	0.0276	0.00343	0.00833	0.076899	0.11	0.01506	0.0271	0.02065	0.0354
del_11q25	123 (48%)	134	9.9999e-06	6.9e-05	0.00107	0.00312	0.0067299	0.0142	0.00043	0.00155	0.00139	0.0039	0.00327	0.008	0.00097999	0.00288	0.11395	0.155	0.03044	0.0493	0.00434	0.0101
del_12p13.1	87 (34%)	170	9.9999e-06	6.9e-05	0.00016	0.000681	0.54493	0.588	0.23307	0.284	0.01865	0.0326	0.0057199	0.0125	0.20626	0.255	0.03394	0.0537	0.10644	0.147	0.061729	0.0902
del_12q12	56 (22%)	201	2e-05	0.000116	7.9999e-05	0.000373	0.62762	0.665	0.87717	0.886	0.077489	0.11	0.02621	0.0435	0.083859	0.119	0.03079	0.0498	0.26251	0.312	0.11037	0.151
del_12q24.33	70 (27%)	187	9.9999e-06	6.9e-05	0.01983	0.0343	0.52431	0.568	0.87496	0.885	0.67896	0.709	0.01051	0.0205	0.38121	0.428	0.11458	0.156	0.106	0.147	0.66871	0.7
del_13q14.2	180 (70%)	77	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.00171	0.00461	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	8.9999e-05	0.000409	9.9999e-06	6.9e-05	0.00086999	0.00261	7.9999e-05	0.000373
del_14q24.1	80 (31%)	177	0.00050999	0.00175	0.22939	0.28	0.41207	0.459	0.65253	0.689	0.22171	0.271	9.9999e-06	6.9e-05	0.03997	0.0619	0.00472	0.0107	0.00044	0.00157	0.04848	0.073
del_15q11.2	47 (18%)	210	0.0085599	0.0173	0.01296	0.0242	0.01783	0.0315	0.01626	0.0291	0.0077799	0.0159	0.0065099	0.0138	0.01444	0.0262	0.19619	0.244	0.00048	0.00168	0.02843	0.0466
del_16q11.2	130 (51%)	127	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.02375	0.0402	0.0027	0.0068	0.00063999	0.00204	7.9999e-05	0.000373	0.00407	0.00962	0.00048	0.00168	0.00096999	0.00286	2e-05	0.000116
del_16q23.1	134 (52%)	123	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.01233	0.0232	0.075059	0.108	0.00158	0.00431	0.00055999	0.00185	0.0051399	0.0115	0.00011	0.000483	8.9999e-05	0.000409	9.9999e-06	6.9e-05
del_17p13.1	129 (50%)	128	9.9999e-06	6.9e-05	3e-05	0.000163	0.00454	0.0104	8.9999e-05	0.000409	9.9999e-06	6.9e-05	7.9999e-05	0.000373	2e-05	0.000116	5.9999e-05	0.000304	0.00076999	0.00239	0.00011	0.000483
del_17q11.2	81 (32%)	176	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.00057999	0.00189	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	5.9999e-05	0.000304	0.00080999	0.00247	0.11996	0.161	0.00083999	0.00254	0.0018	0.00477
del_17q25.3	67 (26%)	190	9.9999e-06	6.9e-05	0.00094999	0.00281	0.39142	0.438	0.24679	0.297	0.17804	0.225	0.25439	0.305	0.61414	0.652	0.0083799	0.017	0.04171	0.0635	0.30161	0.349
del_18p11.32	68 (26%)	189	0.00126	0.00361	0.073529	0.106	0.5973	0.637	0.17948	0.226	0.68591	0.715	0.20559	0.255	0.72388	0.748	0.00176	0.00471	0.53063	0.574	0.23727	0.288
del_18q23	86 (33%)	171	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.00324	0.00796	0.00027	0.00106	0.0116	0.0222	0.00235	0.00601	0.00087999	0.00263	0.14719	0.191	0.00321	0.00791	0.0051499	0.0115
del_19p13.3	70 (27%)	187	9.9999e-06	6.9e-05	5e-04	0.00172	0.0091899	0.0183	0.00069999	0.0022	0.0096599	0.0192	0.00453	0.0104	0.02761	0.0454	0.00392	0.00936	0.0069299	0.0145	0.00492	0.0111
del_19q13.43	106 (41%)	151	9.9999e-06	6.9e-05	0.00258	0.00652	0.16406	0.209	0.51439	0.559	0.16608	0.211	0.41237	0.459	0.59686	0.637	0.03409	0.0538	0.9164	0.92	0.061999	0.0904
del_21q11.2	51 (20%)	206	0.01136	0.0218	0.11757	0.159	0.16644	0.211	0.01893	0.0329	0.21059	0.259	0.25285	0.303	0.00056999	0.00186	0.95496	0.958	0.0074999	0.0155	0.22545	0.275
del_21q22.3	66 (26%)	191	0.00051999	0.00177	0.01183	0.0225	0.29481	0.342	0.01731	0.0309	0.1187	0.16	0.16095	0.206	0.13969	0.184	0.057819	0.0851	0.02709	0.0447	0.14503	0.189
del_22q13.32	83 (32%)	174	9.9999e-06	6.9e-05	0.16096	0.206	0.78877	0.806	0.24866	0.299	0.6929	0.72	0.04083	0.0627	0.089429	0.126	0.4413	0.489	0.51774	0.562	0.7073	0.734
del_xp21.1	55 (21%)	202	0.00178	0.00474	0.00251	0.00639	0.03295	0.0526	0.1317	0.176	0.0077399	0.0159	0.02964	0.0481	0.02631	0.0435	0.10091	0.14	0.44403	0.491	0.070499	0.102
del_xq21.1	114 (44%)	143	9.9999e-06	6.9e-05	5e-05	0.000261	3e-05	0.000163	0.00141	0.00392	3e-05	0.000163	0.00033	0.00124	0.00031	0.00118	5e-04	0.00172	0.02085	0.0357	0.053749	0.0798
del_xq22.3	123 (48%)	134	9.9999e-06	6.9e-05	9.9999e-06	6.9e-05	0.00041	0.0015	0.0062699	0.0135	9.9999e-06	6.9e-05	2e-05	0.000116	0.00098999	0.00289	5e-05	0.000261	0.0060999	0.0132	0.01136	0.0218
