Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1q21.3	30 (19%)	132	9.9999e-06	0.000215	0.03887	0.128	0.90988	0.956	0.79922	0.874	0.71985	0.806	0.94146	0.98	0.71381	0.805	0.44496	0.608	0.058739	0.162	0.21116	0.381
amp_4q31.1	15 (9%)	147	0.059389	0.162	0.22697	0.397	0.61928	0.738	0.050259	0.15	0.28959	0.46	0.00087999	0.00704	0.6203	0.738	0.25556	0.434	0.01184	0.0553	0.069089	0.174
amp_11p15.2	8 (5%)	154	0.04674	0.143	0.059979	0.162	0.34361	0.504	0.22414	0.396	0.32899	0.487	0.10115	0.232	0.30478	0.466	0.39493	0.559	0.067569	0.172	0.13913	0.289
amp_12q13.3	16 (10%)	146	0.12558	0.27	0.13474	0.284	0.75631	0.837	0.32247	0.483	0.82675	0.894	0.62165	0.738	0.02862	0.101	0.2746	0.45	0.01496	0.0644	0.10757	0.241
amp_14q24.3	10 (6%)	152	0.27971	0.453	0.5823	0.725	0.71032	0.805	0.16247	0.324	1	1	0.17513	0.334	0.45842	0.623	0.71419	0.805	0.27147	0.447	0.93345	0.975
amp_17q21.31	16 (10%)	146	0.067399	0.172	1	1	0.40671	0.566	0.35281	0.512	0.51754	0.671	0.00055999	0.00541	0.94791	0.983	0.14346	0.295	0.01232	0.0566	0.01306	0.059
del_1p12	113 (70%)	49	9.9999e-06	0.000215	9.9999e-06	0.000215	0.30488	0.466	0.00137	0.00984	9.9999e-06	0.000215	3e-05	0.000467	0.0016	0.0112	0.0167	0.0678	0.01593	0.0668	0.00125	0.00921
del_1q44	21 (13%)	141	0.58733	0.728	0.56992	0.716	0.083199	0.199	0.15292	0.312	0.21858	0.39	0.27726	0.451	0.4064	0.566	0.70453	0.805	0.17291	0.334	0.65226	0.761
del_3p24.1	64 (40%)	98	0.0084499	0.043	0.0422	0.136	0.22493	0.396	0.085859	0.202	3e-05	0.000467	2e-05	0.00035	2e-05	0.00035	0.00024	0.0028	9.9999e-06	0.000215	9.9999e-06	0.000215
del_3q26.1	93 (57%)	69	9.9999e-06	0.000215	0.64297	0.757	0.01623	0.0668	0.01455	0.0644	0.02829	0.101	9.9999e-06	0.000215	0.00253	0.0168	0.0091999	0.0452	0.00193	0.0132	0.00011	0.0014
del_4q22.1	13 (8%)	149	0.2965	0.46	0.61086	0.737	0.20239	0.37	0.59727	0.732	0.054309	0.158	0.26947	0.446	0.35527	0.513	0.4916	0.654	0.49182	0.654	0.169	0.329
del_4q34.2	13 (8%)	149	0.04777	0.144	0.29319	0.46	0.51592	0.671	0.31579	0.478	0.055009	0.159	0.49257	0.654	0.50908	0.669	0.89854	0.95	0.29453	0.46	0.3457	0.504
del_5q15	12 (7%)	150	0.076039	0.187	0.68253	0.79	0.060209	0.162	0.80434	0.876	1	1	1	1	0.86853	0.932	0.18593	0.347	0.28616	0.46	0.24328	0.418
del_6p12.3	10 (6%)	152	0.50456	0.666	0.26915	0.446	NA	NA	NA	NA	0.02003	0.0789	0.086929	0.203	0.2901	0.46	0.16448	0.324	0.66768	0.776	0.19954	0.368
del_6q16.1	24 (15%)	138	0.04456	0.142	0.065969	0.172	0.03997	0.13	0.21706	0.39	0.03135	0.108	0.0076899	0.0421	0.01598	0.0668	0.0058699	0.0357	0.057289	0.162	0.02056	0.0789
del_8p22	25 (15%)	137	0.052579	0.155	0.20643	0.375	0.56965	0.716	0.64646	0.757	0.0077999	0.0421	0.0084099	0.043	0.12071	0.264	0.24044	0.418	0.175	0.334	0.29331	0.46
del_8q23.3	13 (8%)	149	0.085299	0.202	1	1	0.4814	0.648	1	1	0.26461	0.444	0.52207	0.671	0.03724	0.124	0.46527	0.629	0.75256	0.836	0.32788	0.487
del_9p24.2	15 (9%)	147	0.13162	0.279	0.074619	0.185	0.083019	0.199	0.16329	0.324	0.10723	0.241	0.17651	0.334	0.52058	0.671	0.077909	0.19	0.1536	0.312	0.12485	0.27
del_9q21.12	14 (9%)	148	0.51917	0.671	0.15699	0.316	0.02473	0.0923	0.060059	0.162	0.3972	0.559	0.39054	0.559	0.52902	0.673	0.11341	0.25	0.43197	0.593	0.39532	0.559
del_11p15.4	58 (36%)	104	0.01476	0.0644	4e-05	0.00056	0.094279	0.218	0.11286	0.25	0.00079999	0.00659	9.9999e-06	0.000215	5.9999e-05	8e-04	9.9999e-06	0.000215	9.9999e-06	0.000215	9.9999e-06	0.000215
del_11q22.1	50 (31%)	112	2e-05	0.00035	0.1395	0.289	0.18187	0.342	0.060789	0.162	2e-04	0.00243	0.00465	0.0289	0.00093999	0.00731	0.00078999	0.00659	0.00059999	0.0056	4e-05	0.00056
del_12q21.33	8 (5%)	154	0.25509	0.434	0.58212	0.725	0.61629	0.738	0.60593	0.737	0.9119	0.956	0.87641	0.937	0.59828	0.732	0.69798	0.801	0.84424	0.909	0.88423	0.941
del_13q22.3	8 (5%)	154	1	1	0.81151	0.881	0.3226	0.483	0.788	0.866	0.2971	0.46	0.42939	0.592	1	1	0.61015	0.737	0.39526	0.559	0.89956	0.95
del_16q21	5 (3%)	157	0.52797	0.673	0.71588	0.805	0.69642	0.801	0.78835	0.866	0.54674	0.693	0.02757	0.1	0.26121	0.441	0.59098	0.729	0.33334	0.491	0.6449	0.757
del_17p13.2	64 (40%)	98	0.00031	0.00321	0.00096999	0.00734	0.40857	0.566	0.066449	0.172	0.0088399	0.0442	0.0062699	0.0366	0.02033	0.0789	0.0082099	0.043	0.16914	0.329	0.02954	0.103
del_17q11.2	42 (26%)	120	0.00079999	0.00659	0.0062199	0.0366	0.02452	0.0923	0.13143	0.279	0.03289	0.112	0.00258	0.0168	0.10335	0.235	0.070499	0.176	0.18768	0.348	0.0078199	0.0421
del_22q13.31	65 (40%)	97	9.9999e-06	0.000215	0.01072	0.0509	0.72949	0.814	0.058279	0.162	0.01069	0.0509	0.00051999	0.0052	0.0066999	0.0383	0.02724	0.1	0.04705	0.143	0.065369	0.172
del_xp21.1	46 (28%)	116	3e-04	0.00321	0.00073999	0.00659	0.04689	0.143	0.2435	0.418	0.036	0.121	0.00358	0.0228	0.00027	0.00302	0.0462	0.143	0.31128	0.474	0.01837	0.0735