Clinical Features CN_CNMF METHLYATION_CNMF MRNASEQ_CNMF MRNASEQ_CHIERARCHICAL MIRSEQ_CNMF MIRSEQ_CHIERARCHICAL MIRSEQ_MATURE_CNMF MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL nCNV (%) nWild-Type Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q amp_6p24.3 45 (56%) 35 3e-05 7.62e-05 4e-05 1e-04 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 0.00043 0.000997 9.9999e-06 2.67e-05 amp_8q24.22 61 (76%) 19 0.00257 0.00545 2e-05 5.25e-05 0.0358 0.0584 0.00084999 0.00192 0.00012 0.000291 0.00070999 0.00162 0.03748 0.0606 0.00088999 0.00198 amp_17q25.3 14 (18%) 66 0.00485 0.00966 0.00231 0.00499 0.41217 0.449 0.11122 0.151 0.058109 0.0889 3e-04 0.000706 0.2275 0.27 0.00446 0.00927 del_1p36.12 25 (31%) 55 0.0077799 0.0145 0.23684 0.276 0.078899 0.113 0.10155 0.14 0.7412 0.751 0.32024 0.353 0.058169 0.0889 0.058909 0.0889 del_1p12 18 (22%) 62 0.12842 0.169 0.077069 0.111 0.0093299 0.0172 0.17092 0.209 0.83713 0.837 0.084169 0.118 0.00184 0.00403 0.23809 0.276 del_2q37.2 3 (4%) 77 0.59137 0.614 0.31453 0.349 0.68128 0.699 0.23538 0.276 0.65191 0.673 0.44056 0.472 0.24799 0.283 0.26068 0.293 del_3p25.2 43 (54%) 37 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 del_3p25.1 43 (54%) 37 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 del_3p22.2 43 (54%) 37 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 del_3p14.2 44 (55%) 36 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 del_3q24 44 (55%) 36 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 del_3q29 44 (55%) 36 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 del_6q25.2 23 (29%) 57 9.9999e-06 2.67e-05 0.01087 0.0193 0.42149 0.456 0.01041 0.0187 0.48229 0.511 0.70414 0.718 0.12871 0.169 0.01315 0.0229 del_6q27 24 (30%) 56 9.9999e-06 2.67e-05 0.0052699 0.0102 0.3301 0.362 0.0050399 0.00983 0.2522 0.286 0.75016 0.755 0.04133 0.0648 0.03856 0.0611 del_8p11.22 19 (24%) 61 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 0.00025 0.000597 9.9999e-06 2.67e-05 9.9999e-06 2.67e-05 3e-05 7.62e-05 5e-05 0.000123 9.9999e-06 2.67e-05 del_11q24.3 7 (9%) 73 0.19616 0.236 0.00489 0.00966 0.12169 0.164 0.074079 0.109 0.17584 0.213 0.14793 0.188 0.084079 0.118 0.14506 0.186 del_16q12.1 16 (20%) 64 0.02202 0.0371 0.02866 0.0478 0.15281 0.193 0.01236 0.0217 0.19771 0.236 0.12492 0.167 0.068809 0.102 0.16147 0.2 del_16q23.3 17 (21%) 63 0.0099399 0.0181 0.01427 0.0246 0.13885 0.181 0.00463 0.0095 0.11028 0.151 0.097949 0.136 0.0338 0.0558 0.075869 0.11 del_16q24.3 17 (21%) 63 0.0065899 0.0124 0.00259 0.00545 0.13991 0.181 0.00471 0.00954 0.058369 0.0889 0.03827 0.0611 0.15475 0.193 0.0063999 0.0122 del_17q12 3 (4%) 77 0.58923 0.614 0.064169 0.096 0.24451 0.281 0.17075 0.209 0.2617 0.293 0.44255 0.472 0.01933 0.0329 0.49961 0.526