		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		MIR_CNMF		MIR_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	95 (9%)	995	0.54487	0.629	0.12906	0.203	0.42836	0.531	0.24964	0.346	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.089659	0.155	0.0058199	0.0173	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.0065999	0.0192	9.9999e-06	7e-05	0.00292	0.00958	0.0011	0.00424
1q gain	112 (10%)	978	0.094489	0.161	0.089729	0.155	0.10589	0.174	0.62427	0.701	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.12486	0.197	0.10542	0.174	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.01886	0.0452	0.03043	0.0658	0.01127	0.0299	0.27212	0.371
2p gain	51 (5%)	1039	0.60281	0.683	0.7341	0.797	0.5486	0.632	0.22724	0.32	0.00355	0.0113	0.20956	0.301	0.36861	0.472	0.48616	0.578	0.0056199	0.0168	0.00245	0.00827	0.64841	0.722	0.02071	0.0488	0.00412	0.0128	0.065979	0.122
2q gain	48 (4%)	1042	0.79463	0.842	0.91038	0.932	0.11809	0.19	0.20295	0.292	0.00097999	0.00381	0.03531	0.0733	0.38704	0.49	0.34342	0.444	0.0068299	0.0198	0.00051999	0.00213	0.52345	0.613	0.01752	0.0427	0.01193	0.0315	0.02709	0.0602
3p gain	68 (6%)	1022	0.00174	0.00624	0.02831	0.0623	0.37772	0.48	0.02572	0.0581	9.9999e-06	7e-05	0.01626	0.0405	0.11376	0.185	0.49016	0.581	0.00038	0.00165	0.00029	0.00132	0.079759	0.141	0.44699	0.544	0.27956	0.378	0.50423	0.596
3q gain	72 (7%)	1018	0.00123	0.00466	0.062059	0.117	0.57611	0.659	0.063809	0.119	9.9999e-06	7e-05	0.00038	0.00165	0.066039	0.122	0.17032	0.253	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.38824	0.491	0.13517	0.211	0.83734	0.875	0.11684	0.188
4p gain	48 (4%)	1042	0.18893	0.275	0.75341	0.812	0.25555	0.353	0.48762	0.579	0.0051099	0.0154	0.04657	0.0914	0.48704	0.579	0.04084	0.0827	0.00307	0.01	0.00083999	0.00333	0.47764	0.572	0.076689	0.137	0.02428	0.0555	0.25937	0.357
4q gain	43 (4%)	1047	0.22576	0.319	0.19475	0.282	0.1591	0.24	0.65783	0.731	0.00033	0.00146	0.01142	0.0303	0.25828	0.357	0.18748	0.273	3e-05	0.000178	5.9999e-05	0.000328	0.33457	0.434	0.0204	0.0482	0.02632	0.0591	0.01486	0.0378
5p gain	60 (6%)	1030	0.12414	0.197	0.15688	0.237	0.21824	0.31	0.3445	0.444	9.9999e-06	7e-05	0.0097499	0.0265	0.12286	0.196	0.0079599	0.0225	2e-05	0.000128	4e-05	0.00023	0.02595	0.0585	0.02691	0.06	9.9999e-06	7e-05	0.00089999	0.00353
5q gain	50 (5%)	1040	0.12956	0.203	0.23291	0.327	0.16215	0.243	0.053629	0.103	9.9999e-06	7e-05	0.00087999	0.00347	0.40253	0.505	0.01302	0.034	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.080279	0.141	0.0055799	0.0167	8.9999e-05	0.000468	0.00060999	0.00247
6p gain	35 (3%)	1055	0.03511	0.073	0.097679	0.165	0.85508	0.888	0.28273	0.381	0.17627	0.26	0.01076	0.0289	0.0065599	0.0192	0.55663	0.641	0.29758	0.394	0.27761	0.377	0.01291	0.0338	0.02402	0.0553	0.062269	0.117	0.03122	0.067
6q gain	28 (3%)	1062	0.0081899	0.023	0.03726	0.0764	0.75609	0.813	0.10434	0.173	0.050429	0.0975	0.098229	0.165	0.16453	0.246	0.86042	0.891	0.22744	0.32	0.29938	0.395	0.0060699	0.0179	0.14951	0.228	0.22173	0.314	0.0378	0.0772
7p gain	594 (54%)	496	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	5e-04	0.00208	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00049	0.00205	0.00018	0.000865	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00145	0.00532	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05
7q gain	631 (58%)	459	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00358	0.0114	9.9999e-05	0.000515	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.063919	0.119	0.01378	0.0355	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.0075499	0.0216	9.9999e-06	7e-05	2e-05	0.000128	9.9999e-06	7e-05
8p gain	101 (9%)	989	2e-05	0.000128	0.00058999	0.00239	0.03786	0.0772	0.55955	0.642	0.0089599	0.0247	5.9999e-05	0.000328	0.0088799	0.0246	0.078539	0.139	0.30947	0.406	0.00178	0.00637	0.27079	0.37	0.32622	0.426	0.049	0.0952	0.00286	0.00946
8q gain	117 (11%)	973	2e-05	0.000128	2e-05	0.000128	0.04001	0.0813	0.45167	0.548	0.00245	0.00827	9.9999e-06	7e-05	0.02022	0.048	0.15533	0.235	0.12009	0.192	0.00045	0.00193	0.10767	0.177	0.13397	0.209	0.04341	0.087	0.00024	0.0011
9p gain	64 (6%)	1026	0.01117	0.0298	0.03036	0.0658	0.8436	0.879	0.43134	0.532	7.9999e-05	0.000421	0.01806	0.0436	0.66223	0.735	0.27288	0.371	3e-05	0.000178	0.00046	0.00195	0.7305	0.794	0.02767	0.0612	0.97288	0.988	0.24369	0.339
9q gain	95 (9%)	995	0.11499	0.186	0.053369	0.102	0.65722	0.731	0.094619	0.161	6.9999e-05	0.000376	0.01775	0.0432	0.47007	0.566	0.40578	0.509	0.00018	0.000865	0.00413	0.0128	0.61767	0.695	0.01014	0.0274	0.74127	0.803	0.225	0.318
10p gain	70 (6%)	1020	0.00137	0.00512	9.9999e-05	0.000515	0.16013	0.241	0.059649	0.113	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	3e-04	0.00135	0.1373	0.213	0.00046	0.00195	9.9999e-06	7e-05	0.02775	0.0613	0.2927	0.39	0.01862	0.0448	9.9999e-06	7e-05
10q gain	12 (1%)	1078	0.78627	0.838	1	1	0.074309	0.134	0.79573	0.842	0.04532	0.0899	0.00070999	0.00283	0.091429	0.157	0.10227	0.171	0.85343	0.887	0.12282	0.196	0.13571	0.211	0.15948	0.24	0.58836	0.672	0.00407	0.0127
11p gain	49 (4%)	1041	0.92975	0.95	0.87901	0.907	0.69122	0.757	0.94401	0.962	0.02248	0.0523	0.00017	0.000834	0.46613	0.562	0.5152	0.606	0.079799	0.141	0.0098899	0.0268	0.04496	0.0895	0.01205	0.0317	0.082959	0.146	0.00424	0.013
11q gain	74 (7%)	1016	0.14722	0.226	0.064319	0.119	0.52928	0.617	0.24334	0.339	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.20157	0.291	0.04908	0.0952	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.43259	0.533	0.0378	0.0772	0.4213	0.526	0.02648	0.0594
12p gain	93 (9%)	997	0.78643	0.838	0.79307	0.842	0.68266	0.75	0.16602	0.248	0.02188	0.0512	0.00423	0.013	0.03075	0.0664	0.3811	0.484	0.0212	0.0498	0.02339	0.054	0.03945	0.0803	0.01498	0.038	0.084789	0.148	0.02268	0.0527
12q gain	65 (6%)	1025	0.59067	0.673	0.95482	0.971	0.40086	0.503	0.0104	0.028	3e-05	0.000178	0.01992	0.0475	0.00262	0.00872	0.42974	0.532	0.00302	0.00988	0.00071999	0.00286	0.03668	0.0755	0.0092299	0.0254	0.063229	0.118	0.02028	0.048
13q gain	17 (2%)	1073	0.072579	0.132	0.49624	0.587	0.21906	0.311	0.82702	0.868	0.085569	0.149	0.53264	0.621	0.50713	0.598	0.63842	0.715	0.29042	0.388	0.52771	0.616	0.29436	0.392	0.42997	0.532	0.37552	0.478	0.85811	0.89
14q gain	26 (2%)	1064	0.39207	0.495	0.78062	0.835	0.01718	0.0423	0.80652	0.851	0.00147	0.00537	0.39321	0.495	1	1	0.6721	0.74	0.02962	0.0646	0.077909	0.139	0.33866	0.439	0.68395	0.751	0.67249	0.74	0.24034	0.335
15q gain	37 (3%)	1053	0.083039	0.146	0.097589	0.165	0.77005	0.826	0.077909	0.139	0.02279	0.0529	0.01364	0.0353	0.01719	0.0423	0.00322	0.0104	0.02993	0.0651	0.00421	0.013	0.21685	0.309	0.43905	0.538	0.053359	0.102	0.23404	0.328
16p gain	54 (5%)	1036	0.01532	0.0387	0.066219	0.122	0.48982	0.581	0.27167	0.371	0.071129	0.13	0.72704	0.791	0.67083	0.74	0.0448	0.0893	0.01559	0.0391	0.86243	0.893	0.15258	0.232	0.02012	0.0479	0.34369	0.444	0.03715	0.0763
16q gain	57 (5%)	1033	0.01667	0.0413	0.01499	0.038	0.34194	0.443	0.0476	0.0931	0.19292	0.28	0.21519	0.307	0.97447	0.988	0.11337	0.185	0.42449	0.529	0.4664	0.562	0.04802	0.0938	0.10072	0.169	0.13968	0.216	0.031	0.0668
17p gain	73 (7%)	1017	0.00017	0.000834	0.01413	0.0362	0.04257	0.0857	0.01529	0.0387	0.02486	0.0565	0.24914	0.345	0.052489	0.101	0.27612	0.375	0.02729	0.0605	0.20256	0.292	0.096969	0.164	0.72059	0.786	0.56222	0.645	0.18865	0.275
17q gain	87 (8%)	1003	0.00137	0.00512	0.062609	0.117	0.054579	0.104	0.02409	0.0553	0.0068299	0.0198	0.11467	0.185	0.14659	0.225	0.52085	0.611	0.00131	0.00493	0.01666	0.0413	0.02701	0.0601	0.47217	0.568	0.27024	0.37	0.057009	0.108
18p gain	78 (7%)	1012	9.9999e-06	7e-05	0.00050999	0.0021	0.43626	0.537	0.3648	0.467	9.9999e-06	7e-05	0.01829	0.0441	0.2869	0.386	0.10578	0.174	8.9999e-05	0.000468	0.00025	0.00114	0.77102	0.826	0.076809	0.137	0.18688	0.273	0.0059199	0.0176
18q gain	75 (7%)	1015	9.9999e-06	7e-05	0.00021	0.000976	0.3083	0.405	0.39099	0.494	2e-05	0.000128	0.0015	0.00545	0.04055	0.0822	0.13673	0.212	9.9999e-06	7e-05	2e-05	0.000128	0.37481	0.478	0.0095899	0.0262	0.03477	0.0727	0.00036	0.00157
19p gain	324 (30%)	766	9.9999e-06	7e-05	4e-05	0.00023	0.11014	0.18	0.00046	0.00195	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.03591	0.0741	0.00144	0.0053	4e-05	0.00023	9.9999e-06	7e-05	0.01243	0.0326	0.03122	0.067	0.00049	0.00205	2e-05	0.000128
19q gain	223 (20%)	867	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.18425	0.27	0.00456	0.0139	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.077939	0.139	0.0039	0.0122	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00116	0.00444	9.9999e-06	7e-05	3e-05	0.000178	9.9999e-06	7e-05
20p gain	266 (24%)	824	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00359	0.0114	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.0097499	0.0265	4e-05	0.00023	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.13461	0.21	9.9999e-06	7e-05	0.00026	0.00118	9.9999e-06	7e-05
20q gain	263 (24%)	827	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00211	0.00727	3e-05	0.000178	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00246	0.00828	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.03196	0.0683	9.9999e-06	7e-05	0.00017	0.000834	9.9999e-06	7e-05
21q gain	88 (8%)	1002	0.00276	0.00916	0.0076399	0.0218	0.01732	0.0425	0.00411	0.0128	9.9999e-06	7e-05	0.073449	0.133	0.060979	0.115	0.124	0.197	0.00015	0.000749	9.9999e-06	7e-05	0.43724	0.538	0.098829	0.166	0.78656	0.838	0.31482	0.413
22q gain	57 (5%)	1033	2e-05	0.000128	0.0054499	0.0164	0.47896	0.573	0.22881	0.322	0.87315	0.901	3e-05	0.000178	0.58441	0.668	0.32833	0.427	0.46369	0.561	0.03623	0.0747	0.067089	0.123	0.63138	0.708	0.00249	0.00836	0.00491	0.0149
xp gain	35 (3%)	1055	0.19389	0.281	1	1	0.81946	0.863	0.18448	0.27	0.90251	0.928	5e-05	0.000279	0.14638	0.225	0.66734	0.738	0.8442	0.879	0.73592	0.798	0.66078	0.734	0.91044	0.932	0.88598	0.913	0.2723	0.371
xq gain	58 (5%)	1032	0.29883	0.395	0.96678	0.982	0.98568	0.998	0.51626	0.607	0.075119	0.135	9.9999e-06	7e-05	0.04654	0.0914	0.17549	0.26	0.10075	0.169	3e-04	0.00135	0.062389	0.117	0.35732	0.46	0.14079	0.217	0.00351	0.0112
1p loss	200 (18%)	890	0.75496	0.813	0.82813	0.868	0.76018	0.817	0.17317	0.257	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00205	0.00713	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05
1q loss	46 (4%)	1044	0.78566	0.838	0.97782	0.991	0.79594	0.842	0.36326	0.466	0.04753	0.0931	0.01012	0.0274	0.6767	0.744	0.04859	0.0947	0.066509	0.122	0.01401	0.036	0.093959	0.16	0.14599	0.225	0.63891	0.715	0.36194	0.465
2p loss	54 (5%)	1036	0.0014	0.0052	0.02803	0.0618	0.48543	0.578	0.76959	0.826	0.093899	0.16	0.01351	0.035	0.0203	0.048	0.52403	0.613	0.14567	0.224	0.04597	0.0907	0.075119	0.135	0.4	0.503	0.16055	0.241	0.12649	0.2
2q loss	52 (5%)	1038	0.00198	0.00693	0.01314	0.0342	0.34327	0.444	0.6657	0.737	0.18522	0.271	0.0078899	0.0223	0.00208	0.00719	0.26587	0.366	0.13335	0.209	0.056819	0.108	0.03554	0.0736	0.67252	0.74	0.16382	0.246	0.00443	0.0135
3p loss	70 (6%)	1020	0.89167	0.918	0.78766	0.838	0.66424	0.736	0.14953	0.228	0.17651	0.26	0.29649	0.394	0.00262	0.00872	0.03357	0.0709	0.03015	0.0654	0.04218	0.0851	0.0014	0.0052	0.00055999	0.00229	0.072269	0.131	0.12884	0.203
3q loss	62 (6%)	1028	0.11715	0.189	0.12383	0.197	0.78665	0.838	0.71196	0.777	0.13788	0.214	0.13816	0.214	0.12228	0.195	0.070169	0.128	0.10085	0.169	0.03473	0.0727	0.054099	0.104	0.01343	0.0349	0.087289	0.152	0.0064199	0.0188
4p loss	127 (12%)	963	0.056939	0.108	0.00164	0.00592	0.0325	0.069	0.17581	0.26	0.0086899	0.0242	9.9999e-06	7e-05	0.0065399	0.0192	0.90852	0.932	0.03556	0.0736	0.00335	0.0107	7.9999e-05	0.000421	0.00149	0.00543	4e-04	0.00173	9.9999e-06	7e-05
4q loss	149 (14%)	941	0.00091999	0.00359	0.00061999	0.0025	0.01744	0.0427	0.10437	0.173	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00341	0.0109	0.99023	1	0.00401	0.0125	0.00018	0.000865	0.00031	0.00138	0.01148	0.0304	0.0070299	0.0203	9.9999e-06	7e-05
5p loss	80 (7%)	1010	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00207	0.00718	0.073409	0.133	9.9999e-06	7e-05	5e-05	0.000279	0.075199	0.135	0.4456	0.543	0.11386	0.185	0.0249	0.0565	0.11414	0.185	0.28818	0.386	0.17868	0.263	7.9999e-05	0.000421
5q loss	80 (7%)	1010	9.9999e-06	7e-05	2e-05	0.000128	0.00056999	0.00232	0.11755	0.189	2e-05	0.000128	3e-05	0.000178	0.03165	0.0678	0.054769	0.104	0.04119	0.0832	0.00319	0.0104	0.00019	0.000905	0.17005	0.253	0.01677	0.0415	5e-05	0.000279
6p loss	117 (11%)	973	0.62381	0.701	0.42573	0.529	0.5912	0.673	0.64845	0.722	2e-05	0.000128	0.00189	0.00672	0.37647	0.479	0.02109	0.0496	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.45041	0.547	0.29843	0.395	0.35761	0.46	0.04556	0.09
6q loss	189 (17%)	901	0.92906	0.95	0.64386	0.719	0.33001	0.429	0.84251	0.879	6.9999e-05	0.000376	0.00105	0.00407	0.10445	0.173	0.00195	0.00685	5e-05	0.000279	3e-05	0.000178	0.00107	0.00414	0.1685	0.251	0.02896	0.0634	0.00233	0.00794
7p loss	10 (1%)	1080	0.02459	0.056	0.088259	0.153	0.19682	0.285	0.061109	0.115	0.10466	0.173	0.20987	0.301	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
7q loss	9 (1%)	1081	0.074909	0.135	0.61091	0.69	0.59532	0.677	0.21306	0.305	0.11442	0.185	0.092599	0.159	0.067309	0.123	0.37144	0.475	0.39244	0.495	1	1	1	1	0.83312	0.871	0.55801	0.642	0.90637	0.931
8p loss	75 (7%)	1015	0.28489	0.384	0.44402	0.542	0.22103	0.314	0.77798	0.833	5.9999e-05	0.000328	9.9999e-06	7e-05	0.32338	0.422	0.29272	0.39	9.9999e-06	7e-05	4e-05	0.00023	0.29883	0.395	0.00143	0.0053	0.0073499	0.021	9.9999e-06	7e-05
8q loss	52 (5%)	1038	0.44961	0.547	0.20951	0.301	0.03396	0.0714	0.74945	0.809	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.16483	0.246	0.61143	0.69	3e-05	0.000178	9.9999e-06	7e-05	0.28719	0.386	0.00070999	0.00283	0.04891	0.0952	9.9999e-06	7e-05
9p loss	319 (29%)	771	0.0080199	0.0226	0.15209	0.232	0.60294	0.683	0.43831	0.538	9.9999e-06	7e-05	4e-05	0.00023	0.062649	0.117	0.0059499	0.0176	0.0072399	0.0208	0.01094	0.0293	0.94847	0.966	0.23027	0.324	0.45072	0.547	0.078529	0.139
9q loss	142 (13%)	948	0.26963	0.369	0.11036	0.18	0.16649	0.248	0.10904	0.179	0.01549	0.0389	0.29651	0.394	0.068909	0.126	0.04309	0.0866	0.0056999	0.017	0.03351	0.0709	0.46221	0.56	0.82756	0.868	0.86296	0.893	0.72649	0.791
10p loss	563 (52%)	527	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.01446	0.0369	0.00011	0.000559	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00217	0.00746	6.9999e-05	0.000376	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00019	0.000905	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05
10q loss	591 (54%)	499	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00465	0.0141	0.00011	0.000559	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00023	0.00106	0.00013	0.000655	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	2e-05	0.000128	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05
11p loss	162 (15%)	928	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.90041	0.926	0.0179	0.0434	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.075969	0.136	0.4311	0.532	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	3e-05	0.000178	5e-05	0.000279	0.00065999	0.00265	9.9999e-06	7e-05
11q loss	112 (10%)	978	3e-05	0.000178	2e-04	0.000941	0.826	0.868	0.090379	0.156	9.9999e-06	7e-05	8.9999e-05	0.000468	0.18588	0.272	0.54078	0.626	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.10412	0.173	0.00018	0.000865	0.00493	0.0149	0.00376	0.0118
12p loss	84 (8%)	1006	0.0325	0.069	0.15241	0.232	0.64694	0.722	0.84788	0.882	0.00193	0.0068	0.093119	0.16	0.79893	0.845	0.74302	0.804	0.11069	0.18	0.02367	0.0546	0.051339	0.0991	0.44054	0.539	0.79052	0.84	0.04359	0.087
12q loss	108 (10%)	982	0.02629	0.0591	0.11982	0.192	0.59662	0.677	0.57414	0.658	6.9999e-05	0.000376	9.9999e-06	7e-05	0.39031	0.493	0.83129	0.87	0.70322	0.769	5.9999e-05	0.000328	0.0037	0.0117	0.42534	0.529	0.42108	0.526	3e-05	0.000178
13q loss	298 (27%)	792	2e-05	0.000128	0.00159	0.00576	0.60641	0.686	0.59083	0.673	0.00329	0.0106	0.01565	0.0391	0.063329	0.118	0.82461	0.868	0.00031	0.00138	0.00048	0.00203	0.064439	0.119	0.0093299	0.0256	0.43817	0.538	0.03491	0.0729
14q loss	227 (21%)	863	9.9999e-06	7e-05	0.00015	0.000749	0.60016	0.681	0.5384	0.624	9.9999e-06	7e-05	0.00181	0.00645	0.23826	0.334	0.24469	0.34	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.0084499	0.0236	0.0012	0.00458	0.01688	0.0417	0.00229	0.00785
15q loss	154 (14%)	936	7.9999e-05	0.000421	9.9999e-06	7e-05	0.00144	0.0053	0.00192	0.00678	0.085709	0.149	0.00021	0.000976	0.03359	0.0709	0.28934	0.387	0.02934	0.0642	0.5132	0.605	0.083359	0.146	0.48519	0.578	0.068329	0.125	0.00041	0.00176
16p loss	78 (7%)	1012	0.52405	0.613	0.85106	0.885	0.55957	0.642	0.73487	0.797	9.9999e-06	7e-05	0.01547	0.0389	0.02992	0.0651	0.0070699	0.0203	0.00036	0.00157	5e-04	0.00208	0.93073	0.95	0.46477	0.562	0.49615	0.587	0.2403	0.335
16q loss	104 (10%)	986	0.03422	0.0718	0.30055	0.396	0.28216	0.381	0.81483	0.859	9.9999e-06	7e-05	2e-05	0.000128	0.0175	0.0427	0.00016	0.000795	2e-05	0.000128	9.9999e-06	7e-05	0.70018	0.766	0.00328	0.0106	0.28236	0.381	0.12889	0.203
17p loss	78 (7%)	1012	0.10283	0.171	0.02693	0.06	0.32267	0.422	0.48346	0.578	9.9999e-06	7e-05	0.00021	0.000976	0.47412	0.57	0.19351	0.281	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.096769	0.164	0.00202	0.00705	0.43876	0.538	0.04544	0.0899
17q loss	51 (5%)	1039	0.0087399	0.0242	0.061009	0.115	0.15395	0.233	0.04329	0.0869	9.9999e-06	7e-05	0.00288	0.0095	0.04998	0.0968	0.01415	0.0362	0.00126	0.00476	2e-04	0.000941	0.079039	0.14	0.093349	0.16	0.42291	0.527	0.12744	0.201
18p loss	137 (13%)	953	0.0094799	0.026	0.03209	0.0685	0.30387	0.4	0.222	0.314	0.35508	0.457	0.01582	0.0395	0.30382	0.4	0.21425	0.306	0.54793	0.632	0.62208	0.699	0.24033	0.335	0.87089	0.9	0.6177	0.695	0.53441	0.622
18q loss	123 (11%)	967	0.04349	0.087	0.0085499	0.0238	0.53425	0.622	0.3282	0.427	0.53854	0.624	0.00050999	0.0021	0.4404	0.539	0.47857	0.573	0.95376	0.971	0.28825	0.386	0.01868	0.0449	0.71226	0.777	0.23951	0.335	0.29012	0.388
19p loss	57 (5%)	1033	0.00326	0.0105	0.0070499	0.0203	0.0244	0.0557	0.40881	0.511	0.00414	0.0128	0.44489	0.543	0.12487	0.197	0.59394	0.676	0.53635	0.623	0.64184	0.717	0.096009	0.163	0.10699	0.176	0.0223	0.052	0.01797	0.0435
19q loss	244 (22%)	846	0.00233	0.00794	0.0107	0.0288	0.20775	0.299	0.078779	0.14	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.00292	0.00958	2e-04	0.000941	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05
20p loss	26 (2%)	1064	0.00018	0.000865	5e-05	0.000279	0.04631	0.0912	0.094559	0.161	0.0338	0.0712	0.18398	0.27	0.32117	0.42	0.094009	0.16	0.74828	0.809	0.18237	0.268	0.42846	0.531	0.48529	0.578	0.75007	0.809	0.28511	0.384
20q loss	21 (2%)	1069	0.00238	0.00808	0.00012	0.000607	0.47464	0.57	0.2663	0.366	0.0063099	0.0186	0.26784	0.367	0.47762	0.572	0.67104	0.74	0.80037	0.845	0.01243	0.0326	0.83167	0.87	0.54164	0.627	0.38188	0.484	0.40834	0.511
21q loss	78 (7%)	1012	0.02339	0.054	0.00116	0.00444	0.083599	0.146	0.26403	0.363	0.084169	0.147	0.00011	0.000559	0.14817	0.227	0.52361	0.613	0.088129	0.153	9.9999e-06	7e-05	0.37427	0.478	0.02679	0.06	0.15661	0.237	0.02894	0.0634
22q loss	240 (22%)	850	0.61407	0.692	0.79374	0.842	0.54409	0.629	0.92533	0.947	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.0078399	0.0222	0.0322	0.0686	9.9999e-06	7e-05	9.9999e-06	7e-05	0.51403	0.605	0.00032	0.00142	0.00171	0.00615	3e-05	0.000178
xp loss	212 (19%)	878	0.01097	0.0293	0.0082099	0.023	0.04527	0.0899	0.1016	0.17	0.21492	0.307	0.0077999	0.0222	0.00252	0.00843	0.01377	0.0355	0.02427	0.0555	0.01929	0.0461	0.02177	0.051	0.2792	0.378	0.00122	0.00464	3e-04	0.00135
xq loss	174 (16%)	916	0.03505	0.073	0.02515	0.0569	0.15138	0.231	0.12026	0.192	0.68571	0.752	0.00024	0.0011	0.00050999	0.0021	0.10744	0.176	0.00191	0.00677	0.13194	0.207	4e-05	0.00023	0.25922	0.357	0.00035	0.00154	0.00089999	0.00353
