		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	22 (4%)	506	1	1	0.72617	0.85	0.00125	0.00541	0.004	0.0147	0.095769	0.18	0.52056	0.66	0.03262	0.0775	0.0051399	0.0179	5e-05	0.000343	0.01541	0.0444	0.75278	0.878	0.31486	0.454
1q gain	51 (10%)	477	0.46782	0.604	0.89859	1	9.9999e-06	8.42e-05	0.03363	0.0786	0.14855	0.256	0.20827	0.335	0.00036	0.00187	0.00185	0.00746	2e-05	0.000155	0.15003	0.257	0.50595	0.645	1	1
2p gain	78 (15%)	450	0.40538	0.548	0.26688	0.4	0.00046	0.00229	0.44873	0.587	0.072439	0.145	0.77787	0.898	0.78876	0.906	0.01106	0.0332	0.68497	0.809	0.03425	0.0794	0.60589	0.738	0.36567	0.509
2q gain	79 (15%)	449	0.40245	0.548	0.26754	0.401	0.00122	0.00532	0.62288	0.755	0.17992	0.297	0.66875	0.798	0.79762	0.913	0.018	0.0498	0.63827	0.766	0.0048	0.0171	0.72798	0.851	0.358	0.5
3p gain	20 (4%)	508	0.065629	0.135	0.43443	0.572	0.10019	0.187	0.11823	0.212	0.10672	0.195	0.00012	0.000711	0.00177	0.00726	0.00068999	0.00326	9.9999e-05	0.000604	0.00372	0.0139	0.53812	0.676	0.65461	0.782
3q gain	60 (11%)	468	0.0214	0.0564	0.0305	0.0741	0.01034	0.0316	4e-05	0.00028	9.9999e-06	8.42e-05	2e-05	0.000155	4e-05	0.00028	2e-05	0.000155	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.00019	0.00107	0.40477	0.548
4p gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.04806	0.105	0.16027	0.27	0.03797	0.0863	3e-05	0.000218	0.00377	0.014	0.00056999	0.00275	0.0055199	0.019	0.097879	0.184	NA	NA	NA	NA
4q gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.03557	0.0817	0.084569	0.164	0.26867	0.401	0.0015	0.00629	0.00372	0.0139	0.00441	0.0159	0.0057399	0.0193	0.18548	0.305	NA	NA	NA	NA
5p gain	191 (36%)	337	0.77993	0.899	0.9234	1	9.9999e-06	8.42e-05	0.61711	0.75	0.02653	0.0663	0.96705	1	0.01714	0.0481	0.01884	0.0515	0.8845	0.993	0.32305	0.464	0.02095	0.0562	0.89189	0.998
5q gain	210 (40%)	318	0.38179	0.525	0.62582	0.757	9.9999e-06	8.42e-05	0.68941	0.812	0.0074199	0.0238	0.32907	0.471	0.088459	0.17	0.052299	0.113	0.81728	0.929	0.42698	0.569	0.03335	0.0783	0.79011	0.906
6p gain	11 (2%)	517	NA	NA	NA	NA	0.30449	0.443	0.64279	0.77	0.2168	0.347	0.95223	1	0.92492	1	0.98345	1	0.63788	0.766	0.01595	0.0456	0.62806	0.757	0.57633	0.706
6q gain	9 (2%)	519	NA	NA	NA	NA	0.054849	0.118	0.67111	0.798	0.10726	0.196	0.80912	0.923	0.98336	1	0.91259	1	0.80623	0.921	0.056199	0.12	0.62774	0.757	0.57603	0.706
7p gain	173 (33%)	355	0.64488	0.772	0.85838	0.97	9.9999e-06	8.42e-05	0.064339	0.133	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.00029	0.00155	0.0080199	0.0256	0.0381	0.0863	0.10503	0.192	0.19765	0.323	0.84591	0.959
7q gain	173 (33%)	355	0.64634	0.773	0.85896	0.97	9.9999e-06	8.42e-05	0.0468	0.103	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	2e-04	0.00111	0.00439	0.0159	0.01654	0.0466	0.02599	0.0657	0.12969	0.229	0.71721	0.841
8p gain	31 (6%)	497	NA	NA	NA	NA	0.072379	0.145	0.00109	0.0048	0.00044	0.00222	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-05	0.000604	3e-05	0.000218	4e-05	0.00028	0.00179	0.00728	0.0172	0.0481	0.28935	0.426
8q gain	61 (12%)	467	0.33396	0.474	0.10412	0.192	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	5.9999e-05	0.000392	2e-05	0.000155	0.77535	0.896
9p gain	14 (3%)	514	NA	NA	NA	NA	0.00189	0.00759	0.23544	0.368	0.44428	0.583	0.14791	0.255	0.56617	0.702	0.0098199	0.0307	0.4488	0.587	0.24656	0.382	1	1	1	1
9q gain	13 (2%)	515	NA	NA	NA	NA	0.02153	0.0565	0.68733	0.811	0.3001	0.438	0.060929	0.128	0.91625	1	0.01567	0.045	0.28634	0.422	0.21205	0.34	1	1	1	1
10p gain	16 (3%)	512	NA	NA	NA	NA	0.04496	0.0994	0.5905	0.721	0.065669	0.135	0.11513	0.209	0.00131	0.00559	0.00049	0.00242	0.03421	0.0794	0.03944	0.0887	NA	NA	NA	NA
10q gain	12 (2%)	516	NA	NA	NA	NA	0.10983	0.2	0.2622	0.396	0.057789	0.122	0.091309	0.174	0.0058699	0.0197	0.00183	0.00741	0.01348	0.0397	0.17217	0.287	NA	NA	NA	NA
11p gain	31 (6%)	497	0.25466	0.39	0.67165	0.798	0.13437	0.235	0.47471	0.612	0.072889	0.146	0.50875	0.648	0.03455	0.0797	0.23733	0.37	0.14058	0.244	0.5635	0.7	0.54072	0.679	0.9265	1
11q gain	29 (5%)	499	0.48574	0.621	0.90598	1	0.085299	0.165	0.31017	0.45	0.13865	0.242	0.82912	0.941	0.11812	0.212	0.57113	0.702	0.56319	0.7	0.88663	0.994	0.75428	0.879	0.75889	0.882
12p gain	121 (23%)	407	0.02188	0.0572	0.03279	0.0775	4e-05	0.00028	0.00016	0.00092	9.9999e-06	8.42e-05	3e-05	0.000218	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.00176	0.00725	0.20429	0.33
12q gain	122 (23%)	406	0.02113	0.0563	0.03287	0.0775	3e-05	0.000218	0.00014	0.000815	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.00236	0.00932	0.26437	0.397
13q gain	22 (4%)	506	NA	NA	NA	NA	0.01076	0.0327	0.03669	0.0837	0.22676	0.357	0.43105	0.571	0.04877	0.106	0.1225	0.218	0.02792	0.0691	0.53559	0.675	0.19793	0.323	0.34342	0.484
14q gain	16 (3%)	512	0.79024	0.906	0.57346	0.704	0.086149	0.166	0.2055	0.332	0.00179	0.00728	0.03402	0.0793	0.03921	0.0884	0.00024	0.00129	0.02805	0.0692	0.04731	0.104	NA	NA	NA	NA
15q gain	26 (5%)	502	1	1	0.1154	0.209	0.00028	0.0015	0.1349	0.236	0.091799	0.174	0.00355	0.0135	0.45353	0.592	0.10507	0.192	0.63575	0.765	0.31485	0.454	0.67803	0.802	0.28506	0.422
16p gain	107 (20%)	421	0.34123	0.483	0.37981	0.525	9.9999e-06	8.42e-05	0.37622	0.521	0.02026	0.0546	0.17761	0.294	0.00034	0.00177	0.00459	0.0164	0.050869	0.11	0.0090499	0.0287	0.25722	0.391	0.40656	0.549
16q gain	99 (19%)	429	0.34561	0.486	0.34776	0.487	2e-05	0.000155	0.13957	0.243	0.0055899	0.0192	0.091839	0.174	0.00066999	0.0032	0.01621	0.0459	0.0071999	0.0234	0.080449	0.158	0.43053	0.571	0.4567	0.596
17p gain	26 (5%)	502	0.02305	0.0595	0.0053499	0.0185	0.56994	0.702	0.88798	0.995	0.13187	0.232	0.10219	0.189	0.00102	0.00455	0.0050699	0.0178	0.14904	0.256	0.4113	0.554	0.063019	0.131	0.80683	0.921
17q gain	33 (6%)	495	0.10134	0.189	0.02622	0.0657	0.25665	0.39	0.75585	0.88	0.11746	0.211	0.22789	0.358	5.9999e-05	0.000392	0.0015	0.00629	0.01836	0.0506	0.281	0.417	0.00393	0.0145	0.69391	0.816
18p gain	25 (5%)	503	0.40332	0.548	0.076779	0.152	0.53238	0.672	0.0226	0.0586	0.90271	1	0.52335	0.663	0.22113	0.351	0.42119	0.564	0.27806	0.413	0.34456	0.485	0.33074	0.471	0.078419	0.155
18q gain	25 (5%)	503	0.40499	0.548	0.075139	0.149	0.76267	0.884	0.02979	0.0728	0.76287	0.884	0.54918	0.686	0.47027	0.607	0.4215	0.564	0.55174	0.687	0.34168	0.483	0.32773	0.47	0.080559	0.158
19p gain	51 (10%)	477	0.33175	0.472	0.48275	0.619	0.00439	0.0159	0.00093999	0.00424	0.0013	0.00557	0.01242	0.0368	0.0057199	0.0193	0.00072999	0.00344	0.00145	0.00616	0.22541	0.356	0.87455	0.985	0.71103	0.834
19q gain	57 (11%)	471	0.15064	0.257	0.22245	0.352	0.055799	0.119	0.00014	0.000815	9.9999e-06	8.42e-05	0.00078999	0.00368	0.00090999	0.00414	0.00012	0.000711	6.9999e-05	0.000448	0.078199	0.154	0.67324	0.798	0.36075	0.503
20p gain	112 (21%)	416	0.24264	0.377	0.11665	0.21	9.9999e-06	8.42e-05	7.9999e-05	0.000505	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	4e-05	0.00028	0.03614	0.0828
20q gain	115 (22%)	413	0.095989	0.18	0.073939	0.148	9.9999e-06	8.42e-05	5.9999e-05	0.000392	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	3e-05	0.000218	0.02091	0.0562
21q gain	50 (9%)	478	0.28564	0.422	0.20727	0.334	0.1474	0.255	0.00337	0.0129	0.16206	0.272	0.062449	0.131	0.00105	0.00467	0.00314	0.0121	0.0080199	0.0256	0.11898	0.212	0.29229	0.428	0.22571	0.356
22q gain	40 (8%)	488	0.42037	0.564	0.22001	0.351	0.085349	0.165	0.25783	0.391	0.5379	0.676	0.29289	0.429	0.082629	0.162	0.01591	0.0456	0.01958	0.0529	0.79481	0.911	0.91427	1	0.56813	0.702
xp gain	32 (6%)	496	1	1	0.52496	0.664	0.04208	0.0939	0.25622	0.39	8.9999e-05	0.000561	0.00111	0.00487	0.03547	0.0817	0.00076999	0.00361	0.04722	0.104	0.093889	0.177	0.2634	0.396	0.91583	1
xq gain	31 (6%)	497	0.25103	0.387	0.69983	0.822	0.01106	0.0332	0.62781	0.757	0.0225	0.0585	0.068529	0.139	0.2236	0.354	0.1004	0.187	0.5485	0.686	0.54456	0.682	0.43047	0.571	0.95632	1
1p loss	60 (11%)	468	0.00363	0.0137	0.0056799	0.0193	0.0056899	0.0193	0.43264	0.571	0.01352	0.0397	0.01079	0.0327	3e-05	0.000218	5.9999e-05	0.000392	0.00315	0.0121	0.02495	0.0634	0.066319	0.136	0.31377	0.454
1q loss	37 (7%)	491	0.03812	0.0863	0.01148	0.0341	0.00011	0.00066	0.01077	0.0327	0.01843	0.0507	0.00419	0.0153	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.03221	0.0767	0.01019	0.0316	0.27612	0.412	0.62041	0.753
2p loss	14 (3%)	514	7.9999e-05	0.000505	0.00045	0.00226	0.03359	0.0786	0.02215	0.0578	0.00061999	0.00298	2e-04	0.00111	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	6.9999e-05	0.000448	9.9999e-06	8.42e-05	0.15876	0.268	0.37585	0.521
2q loss	14 (3%)	514	4e-04	0.00204	0.00082999	0.00381	0.01017	0.0316	0.02945	0.0721	0.00344	0.0131	0.00017	0.000966	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-05	0.000604	9.9999e-06	8.42e-05	0.16032	0.27	0.37796	0.523
3p loss	379 (72%)	149	0.0061199	0.0205	0.01034	0.0316	9.9999e-06	8.42e-05	0.0094199	0.0296	0.01135	0.0338	0.00016	0.00092	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.01493	0.0432	0.00419	0.0153	0.02359	0.0606	0.76952	0.891
3q loss	102 (19%)	426	0.85906	0.97	0.22049	0.351	0.00021	0.00115	0.3533	0.494	0.20253	0.329	0.070429	0.143	0.092609	0.175	0.0065799	0.0217	0.01376	0.0403	0.93837	1	0.90219	1	0.19888	0.324
4p loss	72 (14%)	456	0.38995	0.536	0.81728	0.929	0.39665	0.543	0.00457	0.0164	4e-04	0.00204	0.058659	0.123	0.056479	0.12	0.00146	0.00617	0.28239	0.418	0.10191	0.189	0.072169	0.145	0.044	0.0978
4q loss	65 (12%)	463	0.4315	0.571	0.78157	0.9	0.20287	0.329	0.00387	0.0143	0.00033	0.00174	0.0162	0.0459	0.00377	0.014	5e-05	0.000343	0.23637	0.369	0.071489	0.145	0.45996	0.598	0.02618	0.0657
5p loss	8 (2%)	520	NA	NA	NA	NA	0.67275	0.798	0.25482	0.39	0.00223	0.00885	0.02596	0.0657	0.10427	0.192	0.0051999	0.0181	0.02365	0.0606	0.0274	0.0681	0.48151	0.619	0.8751	0.985
5q loss	7 (1%)	521	NA	NA	NA	NA	0.40017	0.547	0.4354	0.573	0.01031	0.0316	0.076349	0.151	0.15537	0.263	0.0063199	0.021	0.04896	0.107	0.0317	0.0761	0.48441	0.62	0.87414	0.985
6p loss	100 (19%)	428	0.03135	0.0756	0.01425	0.0415	9.9999e-06	8.42e-05	0.00315	0.0121	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.1734	0.288	0.03036	0.074
6q loss	128 (24%)	400	0.10751	0.196	0.052059	0.112	9.9999e-06	8.42e-05	0.084189	0.164	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	5.9999e-05	0.000392	9.9999e-06	8.42e-05	0.00172	0.00712	9.9999e-05	0.000604	0.29173	0.428	0.03103	0.075
8p loss	137 (26%)	391	0.14951	0.256	0.16497	0.276	0.04913	0.107	0.47733	0.614	0.072409	0.145	0.97754	1	0.03203	0.0767	0.00125	0.00541	0.11267	0.204	0.01792	0.0497	0.25339	0.389	0.34246	0.483
8q loss	65 (12%)	463	0.13068	0.23	0.12534	0.222	0.46751	0.604	0.0072299	0.0234	0.02138	0.0564	0.43466	0.572	0.98772	1	0.19872	0.324	0.30244	0.441	0.54477	0.682	0.73858	0.863	0.33072	0.471
9p loss	149 (28%)	379	0.0070599	0.023	0.03625	0.0829	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.01093	0.033	0.059299	0.125
9q loss	151 (29%)	377	0.01913	0.052	0.058169	0.123	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.00256	0.0101	0.095889	0.18
10p loss	68 (13%)	460	0.2632	0.396	0.40234	0.548	0.18342	0.303	0.36393	0.507	0.39416	0.541	0.01766	0.0491	0.068339	0.139	0.00054999	0.00269	0.0073899	0.0238	0.03091	0.0749	0.9025	1	0.41837	0.562
10q loss	89 (17%)	439	0.41181	0.554	0.40207	0.548	0.02933	0.072	0.084429	0.164	0.81606	0.929	0.02133	0.0564	0.26884	0.401	0.00193	0.00769	0.00261	0.0102	0.0057199	0.0193	0.93013	1	0.51632	0.656
11p loss	18 (3%)	510	NA	NA	NA	NA	0.57109	0.702	0.24882	0.385	0.4368	0.574	0.1039	0.192	0.065909	0.135	0.02759	0.0684	0.17093	0.285	0.03444	0.0797	0.3818	0.525	0.56885	0.702
11q loss	23 (4%)	505	0.21733	0.347	0.37584	0.521	0.068359	0.139	0.14298	0.248	0.16378	0.275	0.01025	0.0316	0.0062399	0.0208	0.00037	0.00191	0.01645	0.0464	0.0097599	0.0306	0.38057	0.525	0.56975	0.702
12p loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.0089899	0.0286	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.60298	0.736	0.4666	0.604	0.4035	0.548	0.090769	0.174	NA	NA	NA	NA
12q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.12344	0.219	NA	NA	0.21403	0.343	0.87975	0.989	0.31667	0.455	1	1	0.56789	0.702	0.4652	0.603	NA	NA	NA	NA
13q loss	70 (13%)	458	0.0066199	0.0218	0.04616	0.102	0.02396	0.0612	0.00093999	0.00424	9.9999e-06	8.42e-05	2e-05	0.000155	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.19035	0.312	0.43029	0.571
14q loss	216 (41%)	312	9.9999e-06	8.42e-05	5.9999e-05	0.000392	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.01315	0.0388	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.25556	0.39	0.04409	0.0978
15q loss	35 (7%)	493	0.13336	0.234	0.33076	0.471	0.005	0.0176	0.15478	0.263	0.02921	0.0719	0.01605	0.0457	6.9999e-05	0.000448	9.9999e-06	8.42e-05	0.0070099	0.0229	0.0065399	0.0216	0.062829	0.131	0.098859	0.185
16p loss	10 (2%)	518	NA	NA	NA	NA	0.48262	0.619	0.66987	0.798	0.12563	0.223	0.04932	0.107	0.24266	0.377	0.062619	0.131	0.25846	0.391	0.0425	0.0947	0.15213	0.259	0.31436	0.454
16q loss	16 (3%)	512	NA	NA	NA	NA	0.01897	0.0517	0.41654	0.56	0.2949	0.431	0.4288	0.571	0.083639	0.163	0.087849	0.169	0.18932	0.311	0.03168	0.0761	0.14957	0.256	0.27753	0.413
17p loss	46 (9%)	482	0.00021	0.00115	0.00017	0.000966	0.02432	0.0619	0.055249	0.118	0.00055999	0.00272	3e-05	0.000218	2e-05	0.000155	9.9999e-06	8.42e-05	2e-05	0.000155	8.9999e-05	0.000561	0.34608	0.486	0.17015	0.285
17q loss	28 (5%)	500	0.00151	0.0063	0.00051999	0.00256	0.053709	0.115	0.074399	0.148	0.15491	0.263	0.00273	0.0107	9.9999e-05	0.000604	9.9999e-06	8.42e-05	0.00031	0.00164	0.00496	0.0175	0.53204	0.672	0.42435	0.567
18p loss	93 (18%)	435	0.091489	0.174	0.45899	0.598	0.00055999	0.00272	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.00083999	0.00384	0.0066699	0.0219
18q loss	95 (18%)	433	0.075019	0.149	0.22072	0.351	0.00034	0.00177	5.9999e-05	0.000392	9.9999e-06	8.42e-05	2e-05	0.000155	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	9.9999e-06	8.42e-05	0.0092699	0.0293	0.03219	0.0767
19p loss	11 (2%)	517	NA	NA	NA	NA	0.67447	0.798	0.064159	0.133	0.00022	0.00119	0.00193	0.00769	0.13495	0.236	0.01132	0.0338	0.02697	0.0672	0.0053699	0.0185	0.057299	0.121	0.10373	0.192
19q loss	4 (1%)	524	NA	NA	NA	NA	0.57769	0.706	NA	NA	0.26318	0.396	0.25252	0.389	0.63528	0.765	0.51129	0.65	0.31657	0.455	0.17519	0.29	NA	NA	NA	NA
20p loss	8 (2%)	520	NA	NA	NA	NA	0.23464	0.367	1	1	0.25449	0.39	0.49534	0.632	0.11669	0.21	0.23285	0.365	0.02369	0.0606	0.20418	0.33	NA	NA	NA	NA
20q loss	3 (1%)	525	NA	NA	NA	NA	0.46407	0.603	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.30732	0.446	0.15516	0.263	0.1748	0.29	0.11861	0.212	NA	NA	NA	NA
21q loss	55 (10%)	473	0.03285	0.0775	0.089399	0.171	0.00068999	0.00326	0.065789	0.135	0.00079999	0.00371	3e-05	0.000218	0.00080999	0.00374	0.00014	0.000815	0.00046	0.00229	0.0049	0.0174	0.77426	0.896	0.93005	1
22q loss	39 (7%)	489	0.02151	0.0565	0.0013	0.00557	0.01753	0.0489	0.0099799	0.0311	0.00041	0.00208	0.02109	0.0563	9.9999e-06	8.42e-05	2e-05	0.000155	5e-05	0.000343	0.00108	0.00478	0.03839	0.0867	0.25292	0.389
xp loss	45 (9%)	483	0.02606	0.0657	0.01923	0.0521	0.00021	0.00115	0.02278	0.0589	0.55066	0.687	0.18898	0.311	0.00447	0.0161	0.02137	0.0564	0.12877	0.228	0.00101	0.00453	0.078839	0.155	0.24318	0.377
xq loss	45 (9%)	483	0.04081	0.0915	0.01868	0.0512	2e-04	0.00111	0.00328	0.0126	0.61177	0.744	0.03298	0.0776	0.01406	0.041	0.04183	0.0936	0.01438	0.0417	0.00163	0.00677	0.29196	0.428	0.33265	0.472
