		Clinical Features	Time to Death		YEARS_TO_BIRTH		PATHOLOGIC_STAGE		PATHOLOGY_T_STAGE		PATHOLOGY_N_STAGE		PATHOLOGY_M_STAGE		GENDER		KARNOFSKY_PERFORMANCE_SCORE		NUMBER_PACK_YEARS_SMOKED		YEAR_OF_TOBACCO_SMOKING_ONSET		RACE		ETHNICITY	
	nCNV (%)	nWild-Type	logrank test_P	logrank test_Q	Wilcoxon-test_P	Wilcoxon-test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Wilcoxon-test_P	Wilcoxon-test_Q	Wilcoxon-test_P	Wilcoxon-test_Q	Wilcoxon-test_P	Wilcoxon-test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	10 (3%)	278	9.4833e-09	2.27e-06	0.50514	0.848	3e-04	0.00459	4e-04	0.00582	0.00014	0.00226	0.1679	0.463	0.023556	0.123	0.11749	0.361	NA	NA	NA	NA	0.33119	0.671	1	1
1q gain	17 (6%)	271	4.1953e-08	6.21e-06	0.65444	0.969	3e-05	0.00062	9.9999e-06	0.000269	0.03014	0.15	0.11354	0.353	0.019486	0.11	0.021918	0.117	0.23554	0.549	NA	NA	0.10884	0.347	1	1
2p gain	42 (15%)	246	0.24823	0.559	0.2354	0.549	0.062019	0.24	0.29126	0.623	0.03141	0.156	0.0030191	0.0263	0.45481	0.79	0.29396	0.624	0.16287	0.456	0.61739	0.932	0.95291	1	0.69888	1
2q gain	47 (16%)	241	0.2698	0.593	0.32362	0.661	0.03409	0.165	0.25891	0.574	0.0055299	0.0413	0.0057697	0.0417	0.58897	0.929	0.25116	0.565	0.3125	0.648	0.95369	1	0.95493	1	1	1
3p gain	75 (26%)	213	0.6064	0.93	0.76839	1	0.01852	0.106	0.01452	0.0877	0.48769	0.825	0.10728	0.345	0.64932	0.963	0.1053	0.34	0.73217	1	0.55481	0.897	0.62103	0.932	1	1
3q gain	95 (33%)	193	0.9385	1	0.37613	0.715	0.054139	0.222	0.068889	0.254	0.89844	1	0.058118	0.229	0.39823	0.737	0.29798	0.63	0.44175	0.78	0.5111	0.853	0.12986	0.389	1	1
4p gain	10 (3%)	278	0.31791	0.655	0.093506	0.312	0.077019	0.275	0.54293	0.893	0.27691	0.6	0.24205	0.552	1	1	0.32642	0.665	0.87137	1	0.8344	1	0.60463	0.93	1	1
4q gain	9 (3%)	279	0.98638	1	0.21876	0.524	0.25217	0.565	0.43349	0.768	0.17706	0.468	1	1	1	1	0.87067	1	0.38831	0.725	0.8344	1	0.76516	1	1	1
5p gain	34 (12%)	254	0.060637	0.237	0.60725	0.93	0.073159	0.265	0.02426	0.126	0.18337	0.476	0.61583	0.932	1	1	0.04495	0.193	0.58853	0.929	0.59087	0.93	0.442	0.78	1	1
5q gain	31 (11%)	257	0.71417	1	0.43332	0.768	0.084689	0.294	0.10895	0.347	0.2165	0.524	0.61583	0.932	1	1	0.04495	0.193	0.58853	0.929	0.76521	1	0.62063	0.932	0.61921	0.932
6p gain	10 (3%)	278	0.0015812	0.0158	0.21	0.518	8.9999e-05	0.00154	5e-05	0.000906	0.03648	0.17	0.037405	0.171	0.72684	1	0.87067	1	1	1	0.89477	1	0.77918	1	1	1
6q gain	7 (2%)	281	3.8051e-08	6.21e-06	0.068405	0.254	0.00131	0.0137	0.00094999	0.0111	0.0261	0.134	0.01961	0.11	0.38538	0.725	0.87067	1	0.32261	0.66	NA	NA	0.72618	1	1	1
7p gain	171 (59%)	117	0.34001	0.679	0.71037	1	0.0092899	0.0629	0.11668	0.36	0.46183	0.798	0.72775	1	0.0028178	0.025	0.11202	0.349	0.80388	1	0.0072037	0.0504	0.21828	0.524	0.54731	0.895
7q gain	172 (60%)	116	0.33183	0.671	0.61549	0.932	0.0067399	0.0479	0.092809	0.311	0.50704	0.85	0.72797	1	0.0026072	0.0234	0.11202	0.349	0.80388	1	0.0072037	0.0504	0.20294	0.506	0.54583	0.895
8p gain	20 (7%)	268	0.0024064	0.0218	0.81614	1	0.067319	0.253	0.01652	0.0978	0.068709	0.254	1	1	0.18722	0.485	0.80345	1	0.76248	1	NA	NA	0.19363	0.491	0.59752	0.93
8q gain	25 (9%)	263	2.4295e-06	0.000154	0.80781	1	0.00017	0.0027	3e-05	0.00062	0.00078999	0.00988	0.14436	0.415	0.05471	0.223	0.24011	0.552	0.55147	0.897	0.74252	1	0.19337	0.491	1	1
9p gain	3 (1%)	285	0.048146	0.204	0.51618	0.86	0.0449	0.193	0.03612	0.17	NA	NA	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1
10p gain	8 (3%)	280	0.40679	0.748	0.3653	0.708	0.24352	0.552	0.45542	0.79	0.17643	0.468	0.43055	0.768	0.21404	0.521	0.38886	0.725	NA	NA	NA	NA	0.0093499	0.0629	1	1
10q gain	8 (3%)	280	0.40679	0.748	0.3653	0.708	0.24037	0.552	0.4543	0.79	0.17463	0.468	0.43055	0.768	0.21404	0.521	0.38886	0.725	NA	NA	NA	NA	0.0096099	0.0642	1	1
11p gain	12 (4%)	276	0.0045678	0.0362	0.22084	0.527	0.02632	0.134	0.02277	0.12	0.17216	0.468	0.037405	0.171	0.31196	0.648	0.6876	0.998	0.58152	0.922	NA	NA	0.35612	0.7	1	1
11q gain	10 (3%)	278	0.054993	0.223	0.04953	0.207	0.14086	0.408	0.12408	0.375	0.67327	0.988	0.24205	0.552	0.023556	0.123	0.91026	1	0.58152	0.922	0.27309	0.597	0.35573	0.7	1	1
12p gain	112 (39%)	176	0.83843	1	0.76047	1	0.29255	0.624	0.8501	1	0.17721	0.468	0.473	0.809	0.020106	0.11	0.41479	0.756	0.9199	1	0.12099	0.368	0.90079	1	0.37304	0.711
12q gain	112 (39%)	176	0.83843	1	0.76047	1	0.29399	0.624	0.8502	1	0.17594	0.468	0.473	0.809	0.020106	0.11	0.41479	0.756	0.9199	1	0.12099	0.368	0.90206	1	0.37304	0.711
13q gain	28 (10%)	260	0.45194	0.79	0.35813	0.702	0.94017	1	0.71439	1	1	1	0.59421	0.93	1	1	0.53007	0.878	0.93119	1	1	1	0.84494	1	0.33816	0.679
14q gain	3 (1%)	285	0.39102	0.728	NA	NA	0.03506	0.168	0.02015	0.11	NA	NA	1	1	0.1712	0.468	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1
15q gain	5 (2%)	283	0.99585	1	0.83182	1	0.27435	0.597	0.24629	0.556	NA	NA	1	1	0.11683	0.36	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4199	0.759	1	1
16p gain	153 (53%)	135	0.3405	0.679	0.016867	0.0992	0.83415	1	0.6612	0.975	0.85242	1	0.48946	0.826	0.0012321	0.0132	0.60247	0.93	0.89649	1	0.16666	0.462	0.00151	0.0154	0.23479	0.549
16q gain	148 (51%)	140	0.040261	0.181	0.036337	0.17	0.48296	0.82	0.22208	0.527	0.85648	1	0.18331	0.476	0.0033383	0.0288	0.9197	1	0.60173	0.93	0.16666	0.462	0.01282	0.0791	0.24063	0.552
17p gain	172 (60%)	116	0.057913	0.229	0.053452	0.22	9.9999e-06	0.000269	6.9999e-05	0.00122	0.67264	0.988	0.50404	0.848	0.013906	0.0846	0.32109	0.66	0.74057	1	0.13866	0.406	0.084059	0.294	0.061438	0.239
17q gain	191 (66%)	97	0.69389	1	0.086205	0.296	0.03198	0.158	0.071559	0.262	0.30015	0.63	1	1	0.15692	0.442	0.77135	1	0.61465	0.932	0.28211	0.606	0.084949	0.294	0.20115	0.503
18p gain	12 (4%)	276	0.9576	1	0.80629	1	0.27494	0.597	0.80786	1	0.67534	0.988	0.43055	0.768	0.19351	0.491	0.21334	0.521	0.71926	1	NA	NA	0.19506	0.492	1	1
18q gain	9 (3%)	279	0.19945	0.5	0.5975	0.93	0.52664	0.875	0.43195	0.768	NA	NA	1	1	0.4533	0.79	0.028648	0.144	NA	NA	NA	NA	0.33333	0.673	1	1
19p gain	5 (2%)	283	0.55784	0.898	0.052858	0.218	0.68656	0.998	0.63071	0.941	1	1	1	1	0.61009	0.93	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.1075	0.345	1	1
19q gain	5 (2%)	283	0.55784	0.898	0.052858	0.218	0.68702	0.998	0.6314	0.941	1	1	1	1	0.61009	0.93	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.10507	0.34	1	1
20p gain	99 (34%)	189	0.9573	1	0.3027	0.634	0.4541	0.79	0.33552	0.676	0.45401	0.79	1	1	1	1	0.91044	1	0.24361	0.552	0.78696	1	0.43355	0.768	0.55229	0.897
20q gain	101 (35%)	187	0.76779	1	0.31787	0.655	0.54035	0.89	0.415	0.756	0.31739	0.655	1	1	0.88941	1	0.91044	1	0.34031	0.679	0.64231	0.955	0.23075	0.544	0.54994	0.897
21q gain	19 (7%)	269	0.86385	1	0.13033	0.389	1	1	1	1	0.67415	0.988	0.31027	0.647	1	1	0.29939	0.63	0.057988	0.229	NA	NA	0.098029	0.324	0.59752	0.93
22q gain	5 (2%)	283	0.26506	0.584	0.47163	0.809	0.13973	0.408	0.088409	0.301	NA	NA	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	0.21805	0.524
xp gain	88 (31%)	200	0.25801	0.574	0.19611	0.493	0.00476	0.0368	0.00472	0.0368	0.70473	1	1	1	0.019938	0.11	0.19173	0.491	0.8381	1	0.099073	0.325	0.18085	0.475	1	1
xq gain	92 (32%)	196	0.19365	0.491	0.18214	0.476	0.03263	0.159	0.01958	0.11	0.55439	0.897	1	1	0.021426	0.115	0.19173	0.491	0.99527	1	0.099073	0.325	0.22437	0.531	1	1
1p loss	30 (10%)	258	0.48535	0.822	0.46072	0.798	0.083159	0.292	0.03862	0.174	0.36667	0.708	1	1	0.38394	0.725	0.39676	0.736	0.7554	1	NA	NA	0.47376	0.809	1	1
1q loss	21 (7%)	267	0.77887	1	0.96793	1	0.46645	0.803	0.83168	1	0.55871	0.898	0.53182	0.878	0.2073	0.513	0.67754	0.99	NA	NA	NA	NA	0.41818	0.758	1	1
2p loss	5 (2%)	283	0.91986	1	0.59866	0.93	0.0278	0.141	0.0497	0.207	NA	NA	1	1	0.61009	0.93	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.62438	0.935	1	1
2q loss	3 (1%)	285	0.42503	0.766	NA	NA	NA	NA	0.15544	0.44	NA	NA	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1
3p loss	21 (7%)	267	0.0022554	0.0209	0.020915	0.113	5e-05	0.000906	0.00014	0.00226	0.25541	0.571	0.085048	0.294	1	1	0.68463	0.998	0.78679	1	0.27054	0.593	0.60455	0.93	1	1
3q loss	6 (2%)	282	0.00043874	0.00609	0.16615	0.462	0.04182	0.185	0.04938	0.207	0.065449	0.248	0.1679	0.463	0.65611	0.969	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1
4p loss	25 (9%)	263	8.6619e-09	2.27e-06	0.0035143	0.0297	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.00106	0.0119	0.57618	0.919	3.8007e-05	0.000767	0.07678	0.275	0.96042	1	0.19167	0.491	0.17275	0.468	1	1
4q loss	26 (9%)	262	7.7765e-09	2.27e-06	0.020276	0.11	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.0097599	0.0646	0.21096	0.518	0.00061444	0.00798	0.067021	0.253	0.61062	0.93	0.28231	0.606	0.17187	0.468	1	1
5p loss	7 (2%)	281	1.0225e-08	2.27e-06	0.010075	0.0648	0.0092299	0.0629	0.00094999	0.0111	0.01749	0.102	0.24205	0.552	0.081538	0.29	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	0.21805	0.524
5q loss	8 (3%)	280	9.3583e-08	1.19e-05	0.012146	0.076	0.03815	0.173	0.00396	0.0323	0.02572	0.133	0.24205	0.552	0.032227	0.158	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	0.25604	0.571
6p loss	21 (7%)	267	0.33117	0.671	0.56584	0.907	0.0099599	0.0646	0.01993	0.11	0.086539	0.296	1	1	0.2073	0.513	0.03635	0.17	0.78727	1	0.75351	1	0.17647	0.468	1	1
6q loss	27 (9%)	261	0.75057	1	0.82479	1	0.0099299	0.0646	0.00418	0.0337	0.11122	0.349	0.59364	0.93	0.037089	0.171	0.018388	0.106	0.82053	1	0.92861	1	0.125	0.376	0.6066	0.93
8p loss	16 (6%)	272	0.0019781	0.0187	0.19487	0.492	0.03571	0.17	0.27473	0.597	0.03481	0.168	0.013809	0.0846	0.14102	0.408	0.80345	1	0.97808	1	NA	NA	0.093679	0.312	1	1
8q loss	9 (3%)	279	0.36612	0.708	0.55095	0.897	0.35959	0.703	1	1	0.3663	0.708	0.24205	0.552	0.057587	0.229	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.26225	0.579	1	1
9p loss	33 (11%)	255	6.4901e-07	4.8e-05	0.29434	0.624	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.00091999	0.0111	0.068492	0.254	0.001219	0.0132	0.00083218	0.0103	0.38769	0.725	0.47849	0.814	0.14904	0.427	0.37036	0.711
9q loss	34 (12%)	254	2.5462e-05	0.000551	0.41568	0.756	5e-05	0.000906	2e-05	0.000444	0.0060899	0.0436	0.35276	0.699	0.001667	0.0161	0.001	0.0114	0.94096	1	0.57042	0.911	0.03787	0.172	0.37147	0.711
10p loss	17 (6%)	271	0.0075869	0.0526	0.94636	1	0.00049	0.00659	0.00165	0.0161	0.18238	0.476	0.31027	0.647	0.40084	0.74	0.028151	0.142	0.11003	0.348	0.15097	0.43	0.85484	1	1	1
10q loss	18 (6%)	270	0.00037038	0.00548	0.39279	0.73	9.9999e-06	0.000269	0.00067999	0.00863	0.04662	0.199	0.37297	0.711	0.58055	0.922	0.011601	0.0736	0.11003	0.348	0.15097	0.43	0.42655	0.767	1	1
11p loss	17 (6%)	271	0.00092295	0.0111	0.52711	0.875	0.0107	0.0684	0.00061999	0.00798	0.00361	0.03	0.37297	0.711	0.16292	0.456	0.10193	0.333	NA	NA	NA	NA	0.7027	1	1	1
11q loss	21 (7%)	267	0.00060826	0.00798	0.89286	1	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.00125	0.0132	0.17699	0.468	0.44787	0.788	0.012086	0.076	0.84594	1	0.85574	1	0.15313	0.434	1	1
13q loss	24 (8%)	264	1.3278e-07	1.47e-05	0.0029066	0.0256	0.00023	0.00358	2e-05	0.000444	0.00378	0.0311	0.53182	0.878	1.7356e-05	0.000428	0.064006	0.245	0.74631	1	0.4471	0.788	0.17454	0.468	1	1
14q loss	47 (16%)	241	0.00011802	0.00198	0.34799	0.693	0.00191	0.0182	5.9999e-05	0.00107	0.00138	0.0142	0.12258	0.371	0.0033789	0.0289	0.0089576	0.0617	0.47648	0.812	0.075571	0.272	1	1	0.6967	1
15q loss	31 (11%)	257	0.015178	0.0911	0.070585	0.259	0.00163	0.0161	0.00034	0.00512	0.0057499	0.0417	0.28135	0.606	0.27963	0.604	0.13141	0.389	0.38678	0.725	NA	NA	0.51067	0.853	1	1
16p loss	4 (1%)	284	0.00042229	0.00595	0.88435	1	0.094599	0.313	0.064139	0.245	NA	NA	1	1	0.057661	0.229	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1
16q loss	7 (2%)	281	1.4314e-05	0.000363	0.74491	1	0.00442	0.0354	0.01275	0.0791	0.065249	0.248	1	1	0.38538	0.725	NA	NA	0.91249	1	0.98492	1	0.64824	0.963	1	1
17p loss	13 (5%)	275	3.6375e-07	3.23e-05	0.85408	1	0.00241	0.0218	0.00153	0.0154	0.04699	0.2	0.059454	0.234	0.11207	0.349	0.14286	0.412	0.92093	1	0.41803	0.758	0.35625	0.7	1	1
18p loss	42 (15%)	246	1.0763e-06	7.35e-05	0.072964	0.265	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.01623	0.0967	0.057721	0.229	0.03594	0.17	0.24364	0.552	0.22169	0.527	0.083241	0.292	0.4644	0.801	0.67557	0.988
18q loss	44 (15%)	244	3.4379e-07	3.23e-05	0.1718	0.468	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.00096999	0.0112	0.068931	0.254	0.13579	0.399	0.20681	0.513	0.41185	0.756	0.1802	0.475	0.14062	0.408	1	1
19p loss	16 (6%)	272	0.089652	0.304	0.59491	0.93	0.00476	0.0368	0.0056799	0.0417	0.0436	0.19	1	1	0.37967	0.72	0.13141	0.389	0.49648	0.837	NA	NA	1	1	1	1
19q loss	15 (5%)	273	0.0020634	0.0193	0.42118	0.76	4e-05	0.000789	5e-05	0.000906	0.04284	0.188	1	1	0.23443	0.549	0.13141	0.389	0.62715	0.938	0.22653	0.535	0.84398	1	1	1
21q loss	43 (15%)	245	0.25926	0.574	0.13195	0.389	0.00358	0.03	0.00041	0.00587	0.086609	0.296	0.10293	0.335	0.09232	0.311	0.0055389	0.0413	0.54733	0.895	0.36235	0.707	0.32251	0.66	1	1
22q loss	60 (21%)	228	0.0012505	0.0132	0.063591	0.245	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.0056099	0.0415	0.042996	0.188	0.00046555	0.00636	0.0011344	0.0126	0.55934	0.898	0.21649	0.524	0.29863	0.63	0.70702	1
xp loss	33 (11%)	255	1.087e-05	0.000284	0.12038	0.368	9.9999e-06	0.000269	9.9999e-06	0.000269	0.01743	0.102	0.21096	0.518	0.091899	0.31	0.0053221	0.0404	0.56826	0.909	0.35351	0.699	0.0406	0.181	0.61921	0.932
xq loss	29 (10%)	259	6.1731e-07	4.8e-05	0.083204	0.292	2e-05	0.000444	2e-05	0.000444	0.0098599	0.0646	0.17699	0.468	0.073487	0.265	0.0053221	0.0404	0.77172	1	0.35351	0.699	0.04151	0.184	0.60928	0.93
