gene1	gene2	pval	qval
BRAF	22q-Del	0.00047	1
BRAF	Del_22q13.1	0.00047	1
BRAF	Del_22q13.32	0.00047	1
BRAF	7q-Amp	0.00082	1
BRAF	7p-Amp	0.00424	1
BRAF	12p-Amp	0.00453	1
BRAF	12q-Amp	0.00453	1
BRAF	16p-Amp	0.0112	1
BRAF	Del_10q23.31	0.0112	1
BRAF	EIF1AX	0.0208	1
BRAF	13q-Del	0.0208	1
BRAF	TG	0.0237	1
BRAF	Del_10q21.2	0.0277	1
BRAF	Del_13q14.3	0.0326	1
BRAF	Del_19p13.12	0.0447	1
BRAF	Amp_5q33.1	0.0547	1
BRAF	Del_13q12.3	0.0547	1
BRAF	5q-Amp	0.0937	1
BRAF	ZNF878	0.167	1
BRAF	IGSF3	0.19	1
BRAF	SRPX	0.19	1
BRAF	Amp_22q11.21	0.19	1
BRAF	9q-Del	0.249	1
HRAS	NRAS	0.268	1
NRAS	Amp_1q31.2	0.291	1
BRAF	9p-Del	0.308	1
TG	22q-Del	0.308	1
TG	Del_22q13.1	0.308	1
TG	Del_22q13.32	0.308	1
ABL1	BRAF	0.334	1
BRAF	KRAS	0.334	1
NRAS	1q-Amp	0.344	1
BRAF	PRMT8	0.366	1
BRAF	SEZ6L	0.366	1
5p-Amp	22q-Del	0.374	1
5p-Amp	Del_22q13.1	0.374	1
5p-Amp	Del_22q13.32	0.374	1
22q-Del	Amp_5q33.1	0.374	1
22q-Del	Amp_Xq22.3	0.374	1
Amp_5q33.1	Del_22q13.1	0.374	1
Amp_5q33.1	Del_22q13.32	0.374	1
Amp_Xq22.3	Del_22q13.1	0.374	1
Amp_Xq22.3	Del_22q13.32	0.374	1
NRAS	7q-Amp	0.406	1
BRAF	C4BPA	0.41	1
BRAF	SMC3	0.41	1
BRAF	TNFRSF9	0.41	1
BRAF	TRERF1	0.41	1
BRAF	Amp_13q14.2	0.41	1
EIF1AX	22q-Del	0.424	1
EIF1AX	Del_22q13.1	0.424	1
EIF1AX	Del_22q13.32	0.424	1
BRAF	5p-Amp	0.429	1
NRAS	7p-Amp	0.479	1
PPM1D	22q-Del	0.479	1
PPM1D	Del_22q13.1	0.479	1
PPM1D	Del_22q13.32	0.479	1
NRAS	5p-Amp	0.52	1
NRAS	Amp_5q33.1	0.52	1
NRAS	Amp_Xq22.3	0.52	1
ABCD1	BRAF	0.542	1
AKT1	22q-Del	0.542	1
AKT1	Del_22q13.1	0.542	1
AKT1	Del_22q13.32	0.542	1
BRAF	GAGE2A	0.542	1
BRAF	LMTK2	0.542	1
BRAF	NLRP6	0.542	1
BRAF	TP53	0.542	1
BRAF	TSC22D1	0.542	1
KRAS	22q-Del	0.542	1
KRAS	Del_22q13.1	0.542	1
KRAS	Del_22q13.32	0.542	1
5q-Amp	22q-Del	0.542	1
5q-Amp	Del_22q13.1	0.542	1
5q-Amp	Del_22q13.32	0.542	1
22q-Del	Amp_4q31.21	0.542	1
22q-Del	Del_10q23.31	0.542	1
Amp_4q31.21	Del_22q13.1	0.542	1
Amp_4q31.21	Del_22q13.32	0.542	1
Del_10q23.31	Del_22q13.1	0.542	1
Del_10q23.31	Del_22q13.32	0.542	1
BRAF	FAM47C	0.546	1
FAM47C	TG	0.552	1
DLX6	NRAS	0.565	1
TG	9q-Del	0.576	1
HRAS	Amp_1q31.2	0.602	1
IGSF3	22q-Del	0.613	1
IGSF3	Del_22q13.1	0.613	1
IGSF3	Del_22q13.32	0.613	1
LMTK2	22q-Del	0.613	1
LMTK2	Del_22q13.1	0.613	1
LMTK2	Del_22q13.32	0.613	1
MYH10	22q-Del	0.613	1
MYH10	Del_22q13.1	0.613	1
MYH10	Del_22q13.32	0.613	1
NRAS	PPM1D	0.613	1
NRAS	12p-Amp	0.613	1
NRAS	12q-Amp	0.613	1
NRAS	Del_19p13.12	0.613	1
NUP93	22q-Del	0.613	1
NUP93	Del_22q13.1	0.613	1
NUP93	Del_22q13.32	0.613	1
RBM10	22q-Del	0.613	1
RBM10	Del_22q13.1	0.613	1
RBM10	Del_22q13.32	0.613	1
TP53	22q-Del	0.613	1
TP53	Del_22q13.1	0.613	1
TP53	Del_22q13.32	0.613	1
TSC22D1	22q-Del	0.613	1
TSC22D1	Del_22q13.1	0.613	1
TSC22D1	Del_22q13.32	0.613	1
22q-Del	Del_10q21.2	0.613	1
Del_10q21.2	Del_22q13.1	0.613	1
Del_10q21.2	Del_22q13.32	0.613	1
EMG1	22q-Del	0.634	1
EMG1	Del_22q13.1	0.634	1
EMG1	Del_22q13.32	0.634	1
22q-Del	Del_13q14.3	0.634	1
Del_13q14.3	Del_22q13.1	0.634	1
Del_13q14.3	Del_22q13.32	0.634	1
HRAS	1q-Amp	0.645	1
HRAS	9q-Del	0.645	1
BRAF	OR2T29	0.652	1
BRAF	PCGF2	0.652	1
BRAF	PRNP	0.652	1
AKT1	NRAS	0.666	1
KRAS	NRAS	0.666	1
NRAS	TMEM184A	0.666	1
NRAS	16p-Amp	0.666	1
NRAS	5q-Amp	0.666	1
NRAS	Amp_4q31.21	0.666	1
NRAS	Del_10q23.31	0.666	1
BRAF	TMEM184A	0.681	1
BRAF	Amp_4q31.21	0.681	1
EMG1	HRAS	0.69	1
HRAS	7q-Amp	0.69	1
HRAS	Del_13q14.3	0.69	1
EP400	22q-Del	0.693	1
EP400	Del_22q13.1	0.693	1
EP400	Del_22q13.32	0.693	1
PIK3CA	22q-Del	0.693	1
PIK3CA	Del_22q13.1	0.693	1
PIK3CA	Del_22q13.32	0.693	1
PRMT8	22q-Del	0.693	1
PRMT8	Del_22q13.1	0.693	1
PRMT8	Del_22q13.32	0.693	1
SEZ6L	22q-Del	0.693	1
SEZ6L	Del_22q13.1	0.693	1
SEZ6L	Del_22q13.32	0.693	1
TNS1	22q-Del	0.693	1
TNS1	Del_22q13.1	0.693	1
TNS1	Del_22q13.32	0.693	1
EMG1	Amp_1q31.2	0.707	1
HRAS	NUDT11	0.714	1
HRAS	RPTN	0.714	1
TG	Amp_Xq22.3	0.714	1
GPR44	NRAS	0.722	1
MYH10	NRAS	0.722	1
NRAS	NUP93	0.722	1
NRAS	RBM10	0.722	1
NRAS	SRPX	0.722	1
NRAS	TP53	0.722	1
NRAS	Del_10q21.2	0.722	1
EMG1	FAM47C	0.724	1
FAM47C	7q-Amp	0.724	1
FAM47C	Del_13q14.3	0.724	1
7p-Amp	22q-Del	0.724	1
7p-Amp	Del_22q13.1	0.724	1
7p-Amp	Del_22q13.32	0.724	1
BRAF	EMG1	0.729	1
HRAS	7p-Amp	0.739	1
EMG1	1q-Amp	0.741	1
EMG1	9q-Del	0.741	1
DLX6	TG	0.745	1
EIF1AX	TG	0.745	1
TG	9p-Del	0.745	1
22q-Del	Amp_1q31.2	0.758	1
Amp_1q31.2	Del_22q13.1	0.758	1
Amp_1q31.2	Del_22q13.32	0.758	1
NUDT11	9q-Del	0.761	1
HRAS	5p-Amp	0.764	1
HRAS	Amp_5q33.1	0.764	1
HRAS	Amp_Xq22.3	0.764	1
HRAS	Del_13q12.3	0.764	1
FAM47C	7p-Amp	0.768	1
22q-Del	Del_13q12.3	0.769	1
Del_13q12.3	Del_22q13.1	0.769	1
Del_13q12.3	Del_22q13.32	0.769	1
EMG1	7q-Amp	0.776	1
PPM1D	TG	0.777	1
TG	Del_19p13.12	0.777	1
Amp_1q31.2	Amp_Xq22.3	0.778	1
CNKSR1	22q-Del	0.783	1
CNKSR1	Del_22q13.1	0.783	1
CNKSR1	Del_22q13.32	0.783	1
OR2T29	22q-Del	0.783	1
OR2T29	Del_22q13.1	0.783	1
OR2T29	Del_22q13.32	0.783	1
PCGF2	22q-Del	0.783	1
PCGF2	Del_22q13.1	0.783	1
PCGF2	Del_22q13.32	0.783	1
ZNF878	22q-Del	0.783	1
ZNF878	Del_22q13.1	0.783	1
ZNF878	Del_22q13.32	0.783	1
EP400	NRAS	0.784	1
NRAS	PIK3CA	0.784	1
NRAS	SEZ6L	0.784	1
NRAS	TNS1	0.784	1
NRAS	USP6	0.784	1
FAM47C	22q-Del	0.79	1
FAM47C	Del_22q13.1	0.79	1
FAM47C	Del_22q13.32	0.79	1
EIF1AX	HRAS	0.791	1
FAM47C	5p-Amp	0.791	1
FAM47C	Amp_5q33.1	0.791	1
FAM47C	Amp_Xq22.3	0.791	1
FAM47C	Del_13q12.3	0.791	1
HRAS	13q-Del	0.791	1
HRAS	9p-Del	0.791	1
EMG1	NUDT11	0.794	1
EMG1	RPTN	0.794	1
NUDT11	7q-Amp	0.794	1
NUDT11	Del_13q14.3	0.794	1
RPTN	7q-Amp	0.794	1
RPTN	Del_13q14.3	0.794	1
BRAF	EP400	0.795	1
BRAF	PTCD1	0.795	1
BRAF	TNS1	0.795	1
BRAF	USP6	0.795	1
DLX6	Amp_1q31.2	0.803	1
EIF1AX	Amp_1q31.2	0.803	1
13q-Del	Amp_1q31.2	0.803	1
1q-Amp	Amp_Xq22.3	0.804	1
9q-Del	Amp_5q33.1	0.804	1
9q-Del	Amp_Xq22.3	0.804	1
AKT1	TG	0.81	1
KRAS	TG	0.81	1
TG	TMEM184A	0.81	1
TG	Amp_4q31.21	0.81	1
TG	Del_10q23.31	0.81	1
EMG1	7p-Amp	0.813	1
13q-Del	22q-Del	0.813	1
13q-Del	Del_22q13.1	0.813	1
13q-Del	Del_22q13.32	0.813	1
FAM47C	13q-Del	0.815	1
FAM47C	9p-Del	0.815	1
HRAS	PPM1D	0.818	1
HRAS	12p-Amp	0.818	1
HRAS	12q-Amp	0.818	1
HRAS	Del_19p13.12	0.818	1
1q-Amp	22q-Del	0.821	1
1q-Amp	Del_22q13.1	0.821	1
1q-Amp	Del_22q13.32	0.821	1
DLX6	1q-Amp	0.827	1
DLX6	9q-Del	0.827	1
EIF1AX	1q-Amp	0.827	1
EIF1AX	9q-Del	0.827	1
1q-Amp	13q-Del	0.827	1
PPM1D	Amp_1q31.2	0.828	1
Amp_1q31.2	Del_19p13.12	0.828	1
NUDT11	7p-Amp	0.829	1
RPTN	7p-Amp	0.829	1
EMG1	5p-Amp	0.832	1
EMG1	Amp_5q33.1	0.832	1
EMG1	Amp_Xq22.3	0.832	1
7q-Amp	Amp_Xq22.3	0.832	1
7q-Amp	Del_13q12.3	0.832	1
Amp_Xq22.3	Del_13q14.3	0.832	1
FAM47C	PPM1D	0.839	1
FAM47C	12p-Amp	0.839	1
FAM47C	12q-Amp	0.839	1
FAM47C	Del_19p13.12	0.839	1
GPR44	TG	0.845	1
IGSF3	TG	0.845	1
NLRP6	TG	0.845	1
NUP93	TG	0.845	1
SRPX	TG	0.845	1
TG	TP53	0.845	1
TG	TSC22D1	0.845	1
TG	Amp_22q11.21	0.845	1
TG	Del_10q21.2	0.845	1
ABL1	HRAS	0.846	1
AKT1	HRAS	0.846	1
HRAS	KRAS	0.846	1
HRAS	16p-Amp	0.846	1
HRAS	5q-Amp	0.846	1
HRAS	Amp_4q31.21	0.846	1
HRAS	Del_10q23.31	0.846	1
NUDT11	5p-Amp	0.846	1
NUDT11	Amp_5q33.1	0.846	1
NUDT11	Amp_Xq22.3	0.846	1
NUDT11	Del_13q12.3	0.846	1
RPTN	5p-Amp	0.846	1
RPTN	Amp_5q33.1	0.846	1
RPTN	Amp_Xq22.3	0.846	1
RPTN	Del_13q12.3	0.846	1
CNKSR1	NRAS	0.85	1
NRAS	OR2T29	0.85	1
NRAS	PCGF2	0.85	1
NRAS	ZNF878	0.85	1
PPM1D	1q-Amp	0.85	1
PPM1D	9q-Del	0.85	1
12p-Amp	9q-Del	0.85	1
12q-Amp	9q-Del	0.85	1
1q-Amp	Del_19p13.12	0.85	1
9q-Del	Del_19p13.12	0.85	1
BRAF	NUDT11	0.851	1
BRAF	RPTN	0.851	1
DLX6	EMG1	0.852	1
DLX6	7q-Amp	0.852	1
DLX6	Del_13q14.3	0.852	1
EIF1AX	EMG1	0.852	1
EIF1AX	7q-Amp	0.852	1
EIF1AX	Del_13q14.3	0.852	1
EMG1	9p-Del	0.852	1
7q-Amp	13q-Del	0.852	1
ABL1	Amp_1q31.2	0.855	1
KRAS	Amp_1q31.2	0.855	1
TMEM184A	Amp_1q31.2	0.855	1
Amp_1q31.2	Del_10q23.31	0.855	1
BRAF	DLX6	0.856	1
22q-Del	Del_19p13.12	0.857	1
Del_19p13.12	Del_22q13.1	0.857	1
Del_19p13.12	Del_22q13.32	0.857	1
7p-Amp	Amp_Xq22.3	0.861	1
7p-Amp	Del_13q12.3	0.861	1
ABL1	FAM47C	0.864	1
DLX6	NUDT11	0.864	1
EIF1AX	NUDT11	0.864	1
EIF1AX	RPTN	0.864	1
FAM47C	KRAS	0.864	1
FAM47C	TMEM184A	0.864	1
FAM47C	16p-Amp	0.864	1
FAM47C	5q-Amp	0.864	1
FAM47C	Amp_4q31.21	0.864	1
FAM47C	Del_10q23.31	0.864	1
HRAS	TG	0.864	1
NUDT11	13q-Del	0.864	1
NUDT11	9p-Del	0.864	1
RPTN	13q-Del	0.864	1
RPTN	9p-Del	0.864	1
EMG1	PPM1D	0.872	1
EMG1	12p-Amp	0.872	1
EMG1	12q-Amp	0.872	1
EMG1	Del_19p13.12	0.872	1
PPM1D	7q-Amp	0.872	1
PPM1D	Del_13q14.3	0.872	1
7q-Amp	Del_19p13.12	0.872	1
ABL1	1q-Amp	0.873	1
ABL1	9q-Del	0.873	1
KRAS	1q-Amp	0.873	1
KRAS	9q-Del	0.873	1
TMEM184A	1q-Amp	0.873	1
TMEM184A	9q-Del	0.873	1
16p-Amp	9q-Del	0.873	1
1q-Amp	Del_10q23.31	0.873	1
5q-Amp	9q-Del	0.873	1
9q-Del	Amp_4q31.21	0.873	1
9q-Del	Del_10q23.31	0.873	1
ABCD1	HRAS	0.875	1
GAGE2A	HRAS	0.875	1
GPR44	HRAS	0.875	1
HRAS	LMTK2	0.875	1
HRAS	MYH10	0.875	1
HRAS	NLRP6	0.875	1
HRAS	NUP93	0.875	1
HRAS	RBM10	0.875	1
HRAS	SRPX	0.875	1
HRAS	TP53	0.875	1
HRAS	TSC22D1	0.875	1
HRAS	Amp_22q11.21	0.875	1
HRAS	Del_10q21.2	0.875	1
5p-Amp	Amp_Xq22.3	0.875	1
Amp_5q33.1	Amp_Xq22.3	0.875	1
Amp_5q33.1	Del_13q12.3	0.875	1
Amp_Xq22.3	Del_13q12.3	0.875	1
DLX6	7p-Amp	0.877	1
EIF1AX	7p-Amp	0.877	1
7p-Amp	13q-Del	0.877	1
TG	Amp_1q31.2	0.878	1
7q-Amp	22q-Del	0.879	1
7q-Amp	Del_22q13.1	0.879	1
7q-Amp	Del_22q13.32	0.879	1
BRAF	MYH10	0.88	1
BRAF	NUP93	0.88	1
BRAF	RBM10	0.88	1
ABCD1	Amp_1q31.2	0.882	1
EP400	TG	0.882	1
GAGE2A	Amp_1q31.2	0.882	1
GPR44	Amp_1q31.2	0.882	1
IGSF3	Amp_1q31.2	0.882	1
NLRP6	Amp_1q31.2	0.882	1
NUP93	Amp_1q31.2	0.882	1
PIK3CA	TG	0.882	1
PRMT8	TG	0.882	1
PTCD1	TG	0.882	1
RBM10	Amp_1q31.2	0.882	1
SEZ6L	TG	0.882	1
SRPX	Amp_1q31.2	0.882	1
TG	TNS1	0.882	1
TP53	Amp_1q31.2	0.882	1
TSC22D1	Amp_1q31.2	0.882	1
Amp_1q31.2	Amp_22q11.21	0.882	1
Amp_1q31.2	Del_10q21.2	0.882	1
NUDT11	PPM1D	0.883	1
NUDT11	12p-Amp	0.883	1
NUDT11	12q-Amp	0.883	1
NUDT11	Del_19p13.12	0.883	1
PPM1D	RPTN	0.883	1
RPTN	12p-Amp	0.883	1
RPTN	12q-Amp	0.883	1
RPTN	Del_19p13.12	0.883	1
C4BPA	22q-Del	0.885	1
C4BPA	Del_22q13.1	0.885	1
C4BPA	Del_22q13.32	0.885	1
SMC3	22q-Del	0.885	1
SMC3	Del_22q13.1	0.885	1
SMC3	Del_22q13.32	0.885	1
TNFRSF9	22q-Del	0.885	1
TNFRSF9	Del_22q13.1	0.885	1
TNFRSF9	Del_22q13.32	0.885	1
TRERF1	22q-Del	0.885	1
TRERF1	Del_22q13.1	0.885	1
TRERF1	Del_22q13.32	0.885	1
22q-Del	Amp_13q14.2	0.885	1
Amp_13q14.2	Del_22q13.1	0.885	1
Amp_13q14.2	Del_22q13.32	0.885	1
DLX6	5p-Amp	0.89	1
DLX6	Amp_5q33.1	0.89	1
DLX6	Amp_Xq22.3	0.89	1
DLX6	Del_13q12.3	0.89	1
EIF1AX	5p-Amp	0.89	1
EIF1AX	Amp_5q33.1	0.89	1
EIF1AX	Amp_Xq22.3	0.89	1
EIF1AX	Del_13q12.3	0.89	1
FAM47C	GAGE2A	0.89	1
FAM47C	GPR44	0.89	1
FAM47C	MYH10	0.89	1
FAM47C	NLRP6	0.89	1
FAM47C	NUP93	0.89	1
FAM47C	RBM10	0.89	1
FAM47C	SRPX	0.89	1
FAM47C	TP53	0.89	1
FAM47C	TSC22D1	0.89	1
FAM47C	Amp_22q11.21	0.89	1
FAM47C	Del_10q21.2	0.89	1
5p-Amp	13q-Del	0.89	1
13q-Del	Amp_5q33.1	0.89	1
13q-Del	Amp_Xq22.3	0.89	1
9p-Del	Amp_5q33.1	0.89	1
9p-Del	Amp_Xq22.3	0.89	1
ABL1	EMG1	0.892	1
ABL1	7q-Amp	0.892	1
ABL1	Del_13q14.3	0.892	1
AKT1	EMG1	0.892	1
AKT1	7q-Amp	0.892	1
AKT1	Del_13q14.3	0.892	1
EMG1	KRAS	0.892	1
EMG1	16p-Amp	0.892	1
EMG1	5q-Amp	0.892	1
EMG1	Amp_4q31.21	0.892	1
EMG1	Del_10q23.31	0.892	1
KRAS	7q-Amp	0.892	1
KRAS	Del_13q14.3	0.892	1
TMEM184A	7q-Amp	0.892	1
TMEM184A	Del_13q14.3	0.892	1
7q-Amp	Del_10q23.31	0.892	1
Amp_4q31.21	Del_13q14.3	0.892	1
Del_10q23.31	Del_13q14.3	0.892	1
PPM1D	7p-Amp	0.894	1
7p-Amp	Del_19p13.12	0.894	1
ABCD1	1q-Amp	0.897	1
ABCD1	9q-Del	0.897	1
ABL1	22q-Del	0.897	1
ABL1	Del_22q13.1	0.897	1
ABL1	Del_22q13.32	0.897	1
GAGE2A	1q-Amp	0.897	1
GAGE2A	9q-Del	0.897	1
GPR44	1q-Amp	0.897	1
GPR44	9q-Del	0.897	1
IGSF3	1q-Amp	0.897	1
IGSF3	9q-Del	0.897	1
LMTK2	9q-Del	0.897	1
NLRP6	1q-Amp	0.897	1
NLRP6	9q-Del	0.897	1
NUP93	1q-Amp	0.897	1
NUP93	9q-Del	0.897	1
RBM10	1q-Amp	0.897	1
RBM10	9q-Del	0.897	1
SRPX	1q-Amp	0.897	1
SRPX	9q-Del	0.897	1
TMEM184A	22q-Del	0.897	1
TMEM184A	Del_22q13.1	0.897	1
TMEM184A	Del_22q13.32	0.897	1
TP53	1q-Amp	0.897	1
TSC22D1	1q-Amp	0.897	1
TSC22D1	9q-Del	0.897	1
16p-Amp	22q-Del	0.897	1
16p-Amp	Del_22q13.1	0.897	1
16p-Amp	Del_22q13.32	0.897	1
1q-Amp	Amp_22q11.21	0.897	1
1q-Amp	Del_10q21.2	0.897	1
9q-Del	Amp_22q11.21	0.897	1
9q-Del	Del_10q21.2	0.897	1
ABL1	NUDT11	0.901	1
ABL1	RPTN	0.901	1
AKT1	NUDT11	0.901	1
AKT1	RPTN	0.901	1
KRAS	NUDT11	0.901	1
KRAS	RPTN	0.901	1
NUDT11	16p-Amp	0.901	1
NUDT11	5q-Amp	0.901	1
NUDT11	Amp_4q31.21	0.901	1
NUDT11	Del_10q23.31	0.901	1
RPTN	TMEM184A	0.901	1
RPTN	16p-Amp	0.901	1
RPTN	5q-Amp	0.901	1
RPTN	Amp_4q31.21	0.901	1
RPTN	Del_10q23.31	0.901	1
DLX6	13q-Del	0.903	1
DLX6	9p-Del	0.903	1
EIF1AX	NRAS	0.903	1
EIF1AX	13q-Del	0.903	1
EIF1AX	9p-Del	0.903	1
13q-Del	9p-Del	0.903	1
NUDT11	22q-Del	0.904	1
NUDT11	Del_22q13.1	0.904	1
NUDT11	Del_22q13.32	0.904	1
RPTN	22q-Del	0.904	1
RPTN	Del_22q13.1	0.904	1
RPTN	Del_22q13.32	0.904	1
EP400	HRAS	0.905	1
HRAS	PIK3CA	0.905	1
HRAS	PRMT8	0.905	1
HRAS	PTCD1	0.905	1
HRAS	SEZ6L	0.905	1
HRAS	TNS1	0.905	1
HRAS	USP6	0.905	1
PPM1D	5p-Amp	0.905	1
PPM1D	Amp_5q33.1	0.905	1
PPM1D	Amp_Xq22.3	0.905	1
PPM1D	Del_13q12.3	0.905	1
TG	1q-Amp	0.905	1
12p-Amp	Amp_Xq22.3	0.905	1
12p-Amp	Del_13q12.3	0.905	1
12q-Amp	Amp_Xq22.3	0.905	1
12q-Amp	Del_13q12.3	0.905	1
5p-Amp	Del_19p13.12	0.905	1
Amp_5q33.1	Del_19p13.12	0.905	1
Amp_Xq22.3	Del_19p13.12	0.905	1
EP400	Amp_1q31.2	0.91	1
PIK3CA	Amp_1q31.2	0.91	1
PRMT8	Amp_1q31.2	0.91	1
SEZ6L	Amp_1q31.2	0.91	1
TNS1	Amp_1q31.2	0.91	1
USP6	Amp_1q31.2	0.91	1
ABL1	7p-Amp	0.911	1
AKT1	7p-Amp	0.911	1
KRAS	7p-Amp	0.911	1
TMEM184A	7p-Amp	0.911	1
7p-Amp	Del_10q23.31	0.911	1
ABCD1	EMG1	0.913	1
ABCD1	7q-Amp	0.913	1
ABCD1	Del_13q14.3	0.913	1
EMG1	GAGE2A	0.913	1
EMG1	GPR44	0.913	1
EMG1	IGSF3	0.913	1
EMG1	LMTK2	0.913	1
EMG1	MYH10	0.913	1
EMG1	NLRP6	0.913	1
EMG1	NUP93	0.913	1
EMG1	RBM10	0.913	1
EMG1	SRPX	0.913	1
EMG1	TP53	0.913	1
EMG1	TSC22D1	0.913	1
EMG1	Del_10q21.2	0.913	1
GAGE2A	7q-Amp	0.913	1
GAGE2A	Del_13q14.3	0.913	1
GPR44	7q-Amp	0.913	1
GPR44	Del_13q14.3	0.913	1
IGSF3	7q-Amp	0.913	1
IGSF3	Del_13q14.3	0.913	1
LMTK2	7q-Amp	0.913	1
LMTK2	Del_13q14.3	0.913	1
MYH10	7q-Amp	0.913	1
MYH10	Del_13q14.3	0.913	1
NLRP6	7q-Amp	0.913	1
NLRP6	Del_13q14.3	0.913	1
NUP93	7q-Amp	0.913	1
NUP93	Del_13q14.3	0.913	1
RBM10	7q-Amp	0.913	1
RBM10	Del_13q14.3	0.913	1
SRPX	7q-Amp	0.913	1
SRPX	Del_13q14.3	0.913	1
TP53	7q-Amp	0.913	1
TSC22D1	7q-Amp	0.913	1
TSC22D1	Del_13q14.3	0.913	1
7q-Amp	Amp_22q11.21	0.913	1
7q-Amp	Del_10q21.2	0.913	1
Del_10q21.2	Del_13q14.3	0.913	1
FAM47C	PIK3CA	0.916	1
FAM47C	PRMT8	0.916	1
FAM47C	PTCD1	0.916	1
FAM47C	SEZ6L	0.916	1
FAM47C	USP6	0.916	1
DLX6	PPM1D	0.917	1
DLX6	12p-Amp	0.917	1
DLX6	12q-Amp	0.917	1
DLX6	Del_19p13.12	0.917	1
EIF1AX	PPM1D	0.917	1
EIF1AX	12p-Amp	0.917	1
EIF1AX	12q-Amp	0.917	1
EIF1AX	Del_19p13.12	0.917	1
PPM1D	13q-Del	0.917	1
PPM1D	9p-Del	0.917	1
12p-Amp	13q-Del	0.917	1
12p-Amp	9p-Del	0.917	1
12q-Amp	13q-Del	0.917	1
12q-Amp	9p-Del	0.917	1
9p-Del	Del_19p13.12	0.917	1
ABCD1	NUDT11	0.92	1
ABCD1	RPTN	0.92	1
ABL1	5p-Amp	0.92	1
ABL1	Amp_5q33.1	0.92	1
ABL1	Amp_Xq22.3	0.92	1
ABL1	Del_13q12.3	0.92	1
AKT1	5p-Amp	0.92	1
AKT1	Amp_5q33.1	0.92	1
AKT1	Amp_Xq22.3	0.92	1
AKT1	Del_13q12.3	0.92	1
CNKSR1	TG	0.92	1
GAGE2A	NUDT11	0.92	1
GAGE2A	RPTN	0.92	1
GPR44	NUDT11	0.92	1
GPR44	RPTN	0.92	1
IGSF3	NUDT11	0.92	1
IGSF3	RPTN	0.92	1
KRAS	5p-Amp	0.92	1
KRAS	Amp_5q33.1	0.92	1
KRAS	Amp_Xq22.3	0.92	1
KRAS	Del_13q12.3	0.92	1
LMTK2	NUDT11	0.92	1
LMTK2	RPTN	0.92	1
MYH10	NUDT11	0.92	1
MYH10	RPTN	0.92	1
NLRP6	NUDT11	0.92	1
NLRP6	RPTN	0.92	1
NUDT11	NUP93	0.92	1
NUDT11	RBM10	0.92	1
NUDT11	SRPX	0.92	1
NUDT11	TP53	0.92	1
NUDT11	TSC22D1	0.92	1
NUDT11	Amp_22q11.21	0.92	1
NUDT11	Del_10q21.2	0.92	1
NUP93	RPTN	0.92	1
OR2T29	TG	0.92	1
PCGF2	TG	0.92	1
PRNP	TG	0.92	1
RBM10	RPTN	0.92	1
RPTN	SRPX	0.92	1
RPTN	TP53	0.92	1
RPTN	TSC22D1	0.92	1
RPTN	Amp_22q11.21	0.92	1
RPTN	Del_10q21.2	0.92	1
TG	ZNF878	0.92	1
TMEM184A	5p-Amp	0.92	1
TMEM184A	Amp_5q33.1	0.92	1
TMEM184A	Amp_Xq22.3	0.92	1
TMEM184A	Del_13q12.3	0.92	1
16p-Amp	Amp_Xq22.3	0.92	1
16p-Amp	Del_13q12.3	0.92	1
5p-Amp	Del_10q23.31	0.92	1
5q-Amp	Amp_Xq22.3	0.92	1
5q-Amp	Del_13q12.3	0.92	1
Amp_4q31.21	Amp_Xq22.3	0.92	1
Amp_4q31.21	Del_13q12.3	0.92	1
Amp_Xq22.3	Del_10q23.31	0.92	1
Del_10q23.31	Del_13q12.3	0.92	1
C4BPA	NRAS	0.922	1
EP400	1q-Amp	0.922	1
EP400	9q-Del	0.922	1
NRAS	SMC3	0.922	1
NRAS	TNFRSF9	0.922	1
NRAS	Amp_13q14.2	0.922	1
PIK3CA	1q-Amp	0.922	1
PIK3CA	9q-Del	0.922	1
PRMT8	1q-Amp	0.922	1
PRMT8	9q-Del	0.922	1
PTCD1	9q-Del	0.922	1
SEZ6L	1q-Amp	0.922	1
TNS1	1q-Amp	0.922	1
TNS1	9q-Del	0.922	1
USP6	1q-Amp	0.922	1
FAM47C	HRAS	0.927	1
ABCD1	7p-Amp	0.928	1
GAGE2A	7p-Amp	0.928	1
GPR44	7p-Amp	0.928	1
IGSF3	7p-Amp	0.928	1
LMTK2	7p-Amp	0.928	1
MYH10	7p-Amp	0.928	1
NLRP6	7p-Amp	0.928	1
NRAS	9q-Del	0.928	1
NUP93	7p-Amp	0.928	1
PPM1D	12p-Amp	0.928	1
PPM1D	12q-Amp	0.928	1
PPM1D	Del_19p13.12	0.928	1
RBM10	7p-Amp	0.928	1
SRPX	7p-Amp	0.928	1
TP53	7p-Amp	0.928	1
TSC22D1	7p-Amp	0.928	1
7p-Amp	Amp_22q11.21	0.928	1
7p-Amp	Del_10q21.2	0.928	1
ABL1	DLX6	0.93	1
ABL1	EIF1AX	0.93	1
ABL1	13q-Del	0.93	1
ABL1	9p-Del	0.93	1
AKT1	DLX6	0.93	1
AKT1	EIF1AX	0.93	1
AKT1	13q-Del	0.93	1
AKT1	9p-Del	0.93	1
DLX6	16p-Amp	0.93	1
DLX6	5q-Amp	0.93	1
DLX6	Amp_4q31.21	0.93	1
DLX6	Del_10q23.31	0.93	1
EIF1AX	TMEM184A	0.93	1
EIF1AX	16p-Amp	0.93	1
EIF1AX	5q-Amp	0.93	1
EIF1AX	Amp_4q31.21	0.93	1
EIF1AX	Del_10q23.31	0.93	1
EMG1	TG	0.93	1
KRAS	13q-Del	0.93	1
KRAS	9p-Del	0.93	1
TG	7q-Amp	0.93	1
TG	Del_13q14.3	0.93	1
TMEM184A	13q-Del	0.93	1
TMEM184A	9p-Del	0.93	1
16p-Amp	13q-Del	0.93	1
16p-Amp	9p-Del	0.93	1
5q-Amp	13q-Del	0.93	1
5q-Amp	9p-Del	0.93	1
13q-Del	Amp_4q31.21	0.93	1
13q-Del	Del_10q23.31	0.93	1
9p-Del	Amp_4q31.21	0.93	1
9p-Del	Del_10q23.31	0.93	1
ABCD1	22q-Del	0.933	1
ABCD1	Del_22q13.1	0.933	1
ABCD1	Del_22q13.32	0.933	1
GAGE2A	22q-Del	0.933	1
GAGE2A	Del_22q13.1	0.933	1
GAGE2A	Del_22q13.32	0.933	1
GPR44	22q-Del	0.933	1
GPR44	Del_22q13.1	0.933	1
GPR44	Del_22q13.32	0.933	1
NLRP6	22q-Del	0.933	1
NLRP6	Del_22q13.1	0.933	1
NLRP6	Del_22q13.32	0.933	1
SRPX	22q-Del	0.933	1
SRPX	Del_22q13.1	0.933	1
SRPX	Del_22q13.32	0.933	1
EMG1	EP400	0.934	1
EMG1	PIK3CA	0.934	1
EMG1	PRMT8	0.934	1
EMG1	PTCD1	0.934	1
EMG1	SEZ6L	0.934	1
EMG1	TNS1	0.934	1
EMG1	USP6	0.934	1
EP400	7q-Amp	0.934	1
EP400	Del_13q14.3	0.934	1
PIK3CA	7q-Amp	0.934	1
PIK3CA	Del_13q14.3	0.934	1
PRMT8	7q-Amp	0.934	1
PRMT8	Del_13q14.3	0.934	1
PTCD1	7q-Amp	0.934	1
PTCD1	Del_13q14.3	0.934	1
SEZ6L	Del_13q14.3	0.934	1
TNS1	7q-Amp	0.934	1
TNS1	Del_13q14.3	0.934	1
USP6	7q-Amp	0.934	1
USP6	Del_13q14.3	0.934	1
CNKSR1	HRAS	0.935	1
FAM47C	Amp_1q31.2	0.935	1
HRAS	OR2T29	0.935	1
HRAS	PCGF2	0.935	1
HRAS	PRNP	0.935	1
HRAS	ZNF878	0.935	1
ABCD1	5p-Amp	0.936	1
ABCD1	Amp_5q33.1	0.936	1
ABCD1	Amp_Xq22.3	0.936	1
ABCD1	Del_13q12.3	0.936	1
GAGE2A	5p-Amp	0.936	1
GAGE2A	Amp_5q33.1	0.936	1
GAGE2A	Amp_Xq22.3	0.936	1
GAGE2A	Del_13q12.3	0.936	1
GPR44	5p-Amp	0.936	1
GPR44	Amp_5q33.1	0.936	1
GPR44	Amp_Xq22.3	0.936	1
GPR44	Del_13q12.3	0.936	1
IGSF3	5p-Amp	0.936	1
IGSF3	Amp_5q33.1	0.936	1
IGSF3	Amp_Xq22.3	0.936	1
IGSF3	Del_13q12.3	0.936	1
LMTK2	Amp_5q33.1	0.936	1
LMTK2	Amp_Xq22.3	0.936	1
LMTK2	Del_13q12.3	0.936	1
MYH10	Amp_5q33.1	0.936	1
MYH10	Amp_Xq22.3	0.936	1
MYH10	Del_13q12.3	0.936	1
NLRP6	5p-Amp	0.936	1
NLRP6	Amp_5q33.1	0.936	1
NLRP6	Amp_Xq22.3	0.936	1
NLRP6	Del_13q12.3	0.936	1
NUP93	5p-Amp	0.936	1
NUP93	Amp_5q33.1	0.936	1
NUP93	Del_13q12.3	0.936	1
RBM10	5p-Amp	0.936	1
RBM10	Amp_5q33.1	0.936	1
RBM10	Amp_Xq22.3	0.936	1
RBM10	Del_13q12.3	0.936	1
SRPX	5p-Amp	0.936	1
SRPX	Amp_5q33.1	0.936	1
SRPX	Amp_Xq22.3	0.936	1
SRPX	Del_13q12.3	0.936	1
TP53	5p-Amp	0.936	1
TP53	Amp_5q33.1	0.936	1
TP53	Amp_Xq22.3	0.936	1
TSC22D1	5p-Amp	0.936	1
TSC22D1	Amp_5q33.1	0.936	1
TSC22D1	Amp_Xq22.3	0.936	1
TSC22D1	Del_13q12.3	0.936	1
5p-Amp	Amp_22q11.21	0.936	1
5p-Amp	Del_10q21.2	0.936	1
Amp_5q33.1	Amp_22q11.21	0.936	1
Amp_5q33.1	Del_10q21.2	0.936	1
Amp_22q11.21	Amp_Xq22.3	0.936	1
Amp_Xq22.3	Del_10q21.2	0.936	1
Del_10q21.2	Del_13q12.3	0.936	1
CNKSR1	Amp_1q31.2	0.939	1
OR2T29	Amp_1q31.2	0.939	1
PRNP	Amp_1q31.2	0.939	1
ZNF878	Amp_1q31.2	0.939	1
ABL1	PPM1D	0.94	1
ABL1	12p-Amp	0.94	1
ABL1	12q-Amp	0.94	1
ABL1	Del_19p13.12	0.94	1
AKT1	12p-Amp	0.94	1
AKT1	12q-Amp	0.94	1
AKT1	Del_19p13.12	0.94	1
EP400	NUDT11	0.94	1
EP400	RPTN	0.94	1
KRAS	PPM1D	0.94	1
KRAS	12p-Amp	0.94	1
KRAS	12q-Amp	0.94	1
KRAS	Del_19p13.12	0.94	1
NUDT11	PIK3CA	0.94	1
NUDT11	PRMT8	0.94	1
NUDT11	SEZ6L	0.94	1
NUDT11	TNS1	0.94	1
NUDT11	USP6	0.94	1
PIK3CA	RPTN	0.94	1
PPM1D	TMEM184A	0.94	1
PPM1D	16p-Amp	0.94	1
PPM1D	5q-Amp	0.94	1
PPM1D	Amp_4q31.21	0.94	1
PPM1D	Del_10q23.31	0.94	1
PRMT8	RPTN	0.94	1
RPTN	SEZ6L	0.94	1
RPTN	USP6	0.94	1
TMEM184A	12p-Amp	0.94	1
TMEM184A	12q-Amp	0.94	1
TMEM184A	Del_19p13.12	0.94	1
12p-Amp	Del_10q23.31	0.94	1
12q-Amp	Del_10q23.31	0.94	1
16p-Amp	Del_19p13.12	0.94	1
5q-Amp	Del_19p13.12	0.94	1
Amp_4q31.21	Del_19p13.12	0.94	1
Del_10q23.31	Del_19p13.12	0.94	1
NUDT11	TG	0.941	1
RPTN	TG	0.941	1
CNKSR1	FAM47C	0.943	1
FAM47C	OR2T29	0.943	1
FAM47C	PCGF2	0.943	1
FAM47C	PRNP	0.943	1
FAM47C	ZNF878	0.943	1
ABCD1	DLX6	0.944	1
ABCD1	13q-Del	0.944	1
ABCD1	9p-Del	0.944	1
DLX6	GAGE2A	0.944	1
DLX6	GPR44	0.944	1
DLX6	IGSF3	0.944	1
DLX6	LMTK2	0.944	1
DLX6	MYH10	0.944	1
DLX6	NLRP6	0.944	1
DLX6	NUP93	0.944	1
DLX6	RBM10	0.944	1
DLX6	SRPX	0.944	1
DLX6	TP53	0.944	1
DLX6	TSC22D1	0.944	1
DLX6	Amp_22q11.21	0.944	1
DLX6	Del_10q21.2	0.944	1
EIF1AX	GAGE2A	0.944	1
EIF1AX	GPR44	0.944	1
EIF1AX	IGSF3	0.944	1
EIF1AX	LMTK2	0.944	1
EIF1AX	MYH10	0.944	1
EIF1AX	NLRP6	0.944	1
EIF1AX	NUP93	0.944	1
EIF1AX	RBM10	0.944	1
EIF1AX	SRPX	0.944	1
EIF1AX	TP53	0.944	1
EIF1AX	TSC22D1	0.944	1
EIF1AX	Amp_22q11.21	0.944	1
EIF1AX	Del_10q21.2	0.944	1
GAGE2A	13q-Del	0.944	1
GAGE2A	9p-Del	0.944	1
GPR44	13q-Del	0.944	1
GPR44	9p-Del	0.944	1
IGSF3	13q-Del	0.944	1
IGSF3	9p-Del	0.944	1
LMTK2	13q-Del	0.944	1
LMTK2	9p-Del	0.944	1
MYH10	13q-Del	0.944	1
NLRP6	13q-Del	0.944	1
NLRP6	9p-Del	0.944	1
NUP93	13q-Del	0.944	1
NUP93	9p-Del	0.944	1
RBM10	13q-Del	0.944	1
RBM10	9p-Del	0.944	1
SRPX	13q-Del	0.944	1
SRPX	9p-Del	0.944	1
TP53	9p-Del	0.944	1
TSC22D1	13q-Del	0.944	1
TSC22D1	9p-Del	0.944	1
13q-Del	Del_10q21.2	0.944	1
9p-Del	Amp_22q11.21	0.944	1
9p-Del	Del_10q21.2	0.944	1
EP400	7p-Amp	0.946	1
PIK3CA	7p-Amp	0.946	1
PRMT8	7p-Amp	0.946	1
PTCD1	7p-Amp	0.946	1
TNS1	7p-Amp	0.946	1
USP6	7p-Amp	0.946	1
CNKSR1	1q-Amp	0.947	1
CNKSR1	9q-Del	0.947	1
OR2T29	1q-Amp	0.947	1
OR2T29	9q-Del	0.947	1
PRNP	1q-Amp	0.947	1
PRNP	9q-Del	0.947	1
ZNF878	1q-Amp	0.947	1
ZNF878	9q-Del	0.947	1
ABL1	NRAS	0.949	1
ABL1	AKT1	0.95	1
ABL1	KRAS	0.95	1
ABL1	TMEM184A	0.95	1
ABL1	16p-Amp	0.95	1
ABL1	5q-Amp	0.95	1
ABL1	Amp_4q31.21	0.95	1
ABL1	Del_10q23.31	0.95	1
AKT1	KRAS	0.95	1
AKT1	TMEM184A	0.95	1
AKT1	16p-Amp	0.95	1
AKT1	5q-Amp	0.95	1
AKT1	Amp_4q31.21	0.95	1
AKT1	Del_10q23.31	0.95	1
FAM47C	1q-Amp	0.95	1
FAM47C	9q-Del	0.95	1
KRAS	TMEM184A	0.95	1
KRAS	16p-Amp	0.95	1
KRAS	5q-Amp	0.95	1
KRAS	Amp_4q31.21	0.95	1
KRAS	Del_10q23.31	0.95	1
TMEM184A	16p-Amp	0.95	1
TMEM184A	5q-Amp	0.95	1
TMEM184A	Amp_4q31.21	0.95	1
TMEM184A	Del_10q23.31	0.95	1
16p-Amp	Del_10q23.31	0.95	1
5q-Amp	Del_10q23.31	0.95	1
Amp_4q31.21	Del_10q23.31	0.95	1
ABCD1	PPM1D	0.952	1
ABCD1	12p-Amp	0.952	1
ABCD1	12q-Amp	0.952	1
ABCD1	Del_19p13.12	0.952	1
EP400	5p-Amp	0.952	1
EP400	Amp_5q33.1	0.952	1
EP400	Amp_Xq22.3	0.952	1
EP400	Del_13q12.3	0.952	1
GAGE2A	PPM1D	0.952	1
GAGE2A	12p-Amp	0.952	1
GAGE2A	12q-Amp	0.952	1
GAGE2A	Del_19p13.12	0.952	1
GPR44	PPM1D	0.952	1
GPR44	12p-Amp	0.952	1
GPR44	12q-Amp	0.952	1
GPR44	Del_19p13.12	0.952	1
IGSF3	PPM1D	0.952	1
IGSF3	12p-Amp	0.952	1
IGSF3	12q-Amp	0.952	1
IGSF3	Del_19p13.12	0.952	1
LMTK2	PPM1D	0.952	1
LMTK2	12p-Amp	0.952	1
LMTK2	12q-Amp	0.952	1
LMTK2	Del_19p13.12	0.952	1
MYH10	12p-Amp	0.952	1
MYH10	12q-Amp	0.952	1
MYH10	Del_19p13.12	0.952	1
NLRP6	PPM1D	0.952	1
NLRP6	12p-Amp	0.952	1
NLRP6	12q-Amp	0.952	1
NLRP6	Del_19p13.12	0.952	1
NUP93	PPM1D	0.952	1
NUP93	12p-Amp	0.952	1
NUP93	12q-Amp	0.952	1
NUP93	Del_19p13.12	0.952	1
PIK3CA	5p-Amp	0.952	1
PIK3CA	Amp_5q33.1	0.952	1
PIK3CA	Amp_Xq22.3	0.952	1
PIK3CA	Del_13q12.3	0.952	1
PPM1D	RBM10	0.952	1
PPM1D	SRPX	0.952	1
PPM1D	TP53	0.952	1
PPM1D	TSC22D1	0.952	1
PPM1D	Amp_22q11.21	0.952	1
PPM1D	Del_10q21.2	0.952	1
PRMT8	5p-Amp	0.952	1
PRMT8	Amp_5q33.1	0.952	1
PRMT8	Amp_Xq22.3	0.952	1
PRMT8	Del_13q12.3	0.952	1
PTCD1	Amp_5q33.1	0.952	1
PTCD1	Amp_Xq22.3	0.952	1
PTCD1	Del_13q12.3	0.952	1
RBM10	12p-Amp	0.952	1
RBM10	12q-Amp	0.952	1
RBM10	Del_19p13.12	0.952	1
SEZ6L	5p-Amp	0.952	1
SEZ6L	Amp_5q33.1	0.952	1
SEZ6L	Amp_Xq22.3	0.952	1
SEZ6L	Del_13q12.3	0.952	1
SRPX	12p-Amp	0.952	1
SRPX	12q-Amp	0.952	1
SRPX	Del_19p13.12	0.952	1
TG	7p-Amp	0.952	1
TNS1	5p-Amp	0.952	1
TNS1	Amp_5q33.1	0.952	1
TNS1	Amp_Xq22.3	0.952	1
TNS1	Del_13q12.3	0.952	1
TP53	12p-Amp	0.952	1
TP53	12q-Amp	0.952	1
TSC22D1	12p-Amp	0.952	1
TSC22D1	12q-Amp	0.952	1
TSC22D1	Del_19p13.12	0.952	1
USP6	5p-Amp	0.952	1
USP6	Amp_5q33.1	0.952	1
USP6	Amp_Xq22.3	0.952	1
USP6	Del_13q12.3	0.952	1
12p-Amp	Amp_22q11.21	0.952	1
12p-Amp	Del_10q21.2	0.952	1
12q-Amp	Amp_22q11.21	0.952	1
12q-Amp	Del_10q21.2	0.952	1
Amp_22q11.21	Del_19p13.12	0.952	1
Del_10q21.2	Del_19p13.12	0.952	1
EMG1	NRAS	0.953	1
CNKSR1	EMG1	0.955	1
CNKSR1	7q-Amp	0.955	1
CNKSR1	Del_13q14.3	0.955	1
EMG1	PCGF2	0.955	1
EMG1	PRNP	0.955	1
EMG1	ZNF878	0.955	1
OR2T29	7q-Amp	0.955	1
OR2T29	Del_13q14.3	0.955	1
PCGF2	7q-Amp	0.955	1
PRNP	7q-Amp	0.955	1
PRNP	Del_13q14.3	0.955	1
ZNF878	7q-Amp	0.955	1
ZNF878	Del_13q14.3	0.955	1
DLX6	EP400	0.957	1
DLX6	PIK3CA	0.957	1
DLX6	PRMT8	0.957	1
DLX6	PTCD1	0.957	1
DLX6	SEZ6L	0.957	1
DLX6	TNS1	0.957	1
DLX6	USP6	0.957	1
EIF1AX	EP400	0.957	1
EIF1AX	PIK3CA	0.957	1
EIF1AX	PRMT8	0.957	1
EIF1AX	PTCD1	0.957	1
EIF1AX	SEZ6L	0.957	1
EIF1AX	TNS1	0.957	1
EIF1AX	USP6	0.957	1
EP400	13q-Del	0.957	1
EP400	9p-Del	0.957	1
PIK3CA	13q-Del	0.957	1
PIK3CA	9p-Del	0.957	1
PRMT8	13q-Del	0.957	1
PRMT8	9p-Del	0.957	1
PTCD1	13q-Del	0.957	1
PTCD1	9p-Del	0.957	1
SEZ6L	13q-Del	0.957	1
SEZ6L	9p-Del	0.957	1
TNS1	13q-Del	0.957	1
TNS1	9p-Del	0.957	1
USP6	13q-Del	0.957	1
C4BPA	TG	0.959	1
CNKSR1	NUDT11	0.959	1
CNKSR1	RPTN	0.959	1
NUDT11	OR2T29	0.959	1
NUDT11	PCGF2	0.959	1
NUDT11	PRNP	0.959	1
NUDT11	ZNF878	0.959	1
OR2T29	RPTN	0.959	1
PCGF2	RPTN	0.959	1
PRNP	RPTN	0.959	1
RPTN	ZNF878	0.959	1
SMC3	TG	0.959	1
TG	TNFRSF9	0.959	1
TG	TRERF1	0.959	1
TG	Amp_13q14.2	0.959	1
Amp_1q31.2	Del_13q14.3	0.959	1
ABCD1	ABL1	0.96	1
ABCD1	AKT1	0.96	1
ABCD1	KRAS	0.96	1
ABCD1	TMEM184A	0.96	1
ABCD1	16p-Amp	0.96	1
ABCD1	5q-Amp	0.96	1
ABCD1	Amp_4q31.21	0.96	1
ABCD1	Del_10q23.31	0.96	1
ABL1	GAGE2A	0.96	1
ABL1	GPR44	0.96	1
ABL1	IGSF3	0.96	1
ABL1	LMTK2	0.96	1
ABL1	MYH10	0.96	1
ABL1	NLRP6	0.96	1
ABL1	NUP93	0.96	1
ABL1	RBM10	0.96	1
ABL1	TP53	0.96	1
ABL1	TSC22D1	0.96	1
ABL1	Amp_22q11.21	0.96	1
ABL1	Del_10q21.2	0.96	1
AKT1	GAGE2A	0.96	1
AKT1	GPR44	0.96	1
AKT1	IGSF3	0.96	1
AKT1	LMTK2	0.96	1
AKT1	MYH10	0.96	1
AKT1	NLRP6	0.96	1
AKT1	NUP93	0.96	1
AKT1	RBM10	0.96	1
AKT1	SRPX	0.96	1
AKT1	TSC22D1	0.96	1
AKT1	Amp_22q11.21	0.96	1
AKT1	Del_10q21.2	0.96	1
GAGE2A	KRAS	0.96	1
GAGE2A	TMEM184A	0.96	1
GAGE2A	16p-Amp	0.96	1
GAGE2A	5q-Amp	0.96	1
GAGE2A	Amp_4q31.21	0.96	1
GAGE2A	Del_10q23.31	0.96	1
GPR44	KRAS	0.96	1
GPR44	TMEM184A	0.96	1
GPR44	16p-Amp	0.96	1
GPR44	5q-Amp	0.96	1
GPR44	Amp_4q31.21	0.96	1
GPR44	Del_10q23.31	0.96	1
IGSF3	KRAS	0.96	1
IGSF3	16p-Amp	0.96	1
IGSF3	5q-Amp	0.96	1
IGSF3	Amp_4q31.21	0.96	1
IGSF3	Del_10q23.31	0.96	1
KRAS	LMTK2	0.96	1
KRAS	MYH10	0.96	1
KRAS	NLRP6	0.96	1
KRAS	NUP93	0.96	1
KRAS	RBM10	0.96	1
KRAS	SRPX	0.96	1
KRAS	TP53	0.96	1
KRAS	TSC22D1	0.96	1
KRAS	Amp_22q11.21	0.96	1
KRAS	Del_10q21.2	0.96	1
LMTK2	TMEM184A	0.96	1
LMTK2	16p-Amp	0.96	1
LMTK2	5q-Amp	0.96	1
LMTK2	Amp_4q31.21	0.96	1
LMTK2	Del_10q23.31	0.96	1
MYH10	TMEM184A	0.96	1
MYH10	16p-Amp	0.96	1
MYH10	5q-Amp	0.96	1
MYH10	Amp_4q31.21	0.96	1
MYH10	Del_10q23.31	0.96	1
NLRP6	TMEM184A	0.96	1
NLRP6	16p-Amp	0.96	1
NLRP6	5q-Amp	0.96	1
NLRP6	Amp_4q31.21	0.96	1
NLRP6	Del_10q23.31	0.96	1
NUP93	TMEM184A	0.96	1
NUP93	16p-Amp	0.96	1
NUP93	5q-Amp	0.96	1
NUP93	Amp_4q31.21	0.96	1
NUP93	Del_10q23.31	0.96	1
RBM10	TMEM184A	0.96	1
RBM10	16p-Amp	0.96	1
RBM10	5q-Amp	0.96	1
RBM10	Amp_4q31.21	0.96	1
RBM10	Del_10q23.31	0.96	1
SRPX	TMEM184A	0.96	1
SRPX	16p-Amp	0.96	1
SRPX	5q-Amp	0.96	1
SRPX	Amp_4q31.21	0.96	1
SRPX	Del_10q23.31	0.96	1
TMEM184A	TP53	0.96	1
TMEM184A	TSC22D1	0.96	1
TMEM184A	Amp_22q11.21	0.96	1
TMEM184A	Del_10q21.2	0.96	1
TP53	16p-Amp	0.96	1
TP53	5q-Amp	0.96	1
TP53	Amp_4q31.21	0.96	1
TP53	Del_10q23.31	0.96	1
TSC22D1	16p-Amp	0.96	1
TSC22D1	5q-Amp	0.96	1
TSC22D1	Amp_4q31.21	0.96	1
TSC22D1	Del_10q23.31	0.96	1
16p-Amp	Amp_22q11.21	0.96	1
16p-Amp	Del_10q21.2	0.96	1
5q-Amp	Amp_22q11.21	0.96	1
5q-Amp	Del_10q21.2	0.96	1
Amp_4q31.21	Amp_22q11.21	0.96	1
Amp_4q31.21	Del_10q21.2	0.96	1
Amp_22q11.21	Del_10q23.31	0.96	1
TG	5p-Amp	0.961	1
TG	Amp_5q33.1	0.961	1
TG	Del_13q12.3	0.961	1
CNKSR1	7p-Amp	0.963	1
EP400	PPM1D	0.963	1
EP400	12p-Amp	0.963	1
EP400	12q-Amp	0.963	1
EP400	Del_19p13.12	0.963	1
OR2T29	7p-Amp	0.963	1
PCGF2	7p-Amp	0.963	1
PIK3CA	PPM1D	0.963	1
PIK3CA	12p-Amp	0.963	1
PIK3CA	12q-Amp	0.963	1
PIK3CA	Del_19p13.12	0.963	1
PPM1D	PRMT8	0.963	1
PPM1D	PTCD1	0.963	1
PPM1D	SEZ6L	0.963	1
PPM1D	TNS1	0.963	1
PPM1D	USP6	0.963	1
PRMT8	12p-Amp	0.963	1
PRMT8	12q-Amp	0.963	1
PRMT8	Del_19p13.12	0.963	1
PRNP	7p-Amp	0.963	1
PTCD1	12p-Amp	0.963	1
PTCD1	12q-Amp	0.963	1
PTCD1	Del_19p13.12	0.963	1
SEZ6L	12p-Amp	0.963	1
SEZ6L	12q-Amp	0.963	1
SEZ6L	Del_19p13.12	0.963	1
TNS1	12p-Amp	0.963	1
TNS1	12q-Amp	0.963	1
TNS1	Del_19p13.12	0.963	1
USP6	12p-Amp	0.963	1
USP6	12q-Amp	0.963	1
USP6	Del_19p13.12	0.963	1
ZNF878	7p-Amp	0.963	1
DLX6	22q-Del	0.964	1
DLX6	Del_22q13.1	0.964	1
DLX6	Del_22q13.32	0.964	1
NRAS	NUDT11	0.964	1
NRAS	RPTN	0.964	1
PTCD1	22q-Del	0.964	1
PTCD1	Del_22q13.1	0.964	1
PTCD1	Del_22q13.32	0.964	1
USP6	22q-Del	0.964	1
USP6	Del_22q13.1	0.964	1
USP6	Del_22q13.32	0.964	1
NUDT11	Amp_1q31.2	0.966	1
C4BPA	HRAS	0.967	1
CNKSR1	5p-Amp	0.967	1
CNKSR1	Amp_5q33.1	0.967	1
CNKSR1	Amp_Xq22.3	0.967	1
CNKSR1	Del_13q12.3	0.967	1
HRAS	SMC3	0.967	1
HRAS	TNFRSF9	0.967	1
HRAS	TRERF1	0.967	1
HRAS	Amp_13q14.2	0.967	1
OR2T29	5p-Amp	0.967	1
OR2T29	Amp_5q33.1	0.967	1
OR2T29	Amp_Xq22.3	0.967	1
OR2T29	Del_13q12.3	0.967	1
PCGF2	Amp_5q33.1	0.967	1
PCGF2	Amp_Xq22.3	0.967	1
PRNP	5p-Amp	0.967	1
PRNP	Amp_5q33.1	0.967	1
PRNP	Amp_Xq22.3	0.967	1
PRNP	Del_13q12.3	0.967	1
ZNF878	5p-Amp	0.967	1
ZNF878	Amp_5q33.1	0.967	1
ZNF878	Amp_Xq22.3	0.967	1
ABCD1	GAGE2A	0.968	1
ABCD1	GPR44	0.968	1
ABCD1	IGSF3	0.968	1
ABCD1	LMTK2	0.968	1
ABCD1	MYH10	0.968	1
ABCD1	NLRP6	0.968	1
ABCD1	NRAS	0.968	1
ABCD1	NUP93	0.968	1
ABCD1	SRPX	0.968	1
ABCD1	TP53	0.968	1
ABCD1	TSC22D1	0.968	1
ABCD1	Amp_22q11.21	0.968	1
ABCD1	Del_10q21.2	0.968	1
GAGE2A	GPR44	0.968	1
GAGE2A	IGSF3	0.968	1
GAGE2A	LMTK2	0.968	1
GAGE2A	MYH10	0.968	1
GAGE2A	NLRP6	0.968	1
GAGE2A	NRAS	0.968	1
GAGE2A	NUP93	0.968	1
GAGE2A	RBM10	0.968	1
GAGE2A	SRPX	0.968	1
GAGE2A	TP53	0.968	1
GAGE2A	TSC22D1	0.968	1
GAGE2A	Amp_22q11.21	0.968	1
GAGE2A	Del_10q21.2	0.968	1
GPR44	IGSF3	0.968	1
GPR44	LMTK2	0.968	1
GPR44	MYH10	0.968	1
GPR44	NLRP6	0.968	1
GPR44	NUP93	0.968	1
GPR44	RBM10	0.968	1
GPR44	SRPX	0.968	1
GPR44	TP53	0.968	1
GPR44	TSC22D1	0.968	1
GPR44	Amp_22q11.21	0.968	1
GPR44	Del_10q21.2	0.968	1
IGSF3	MYH10	0.968	1
IGSF3	NLRP6	0.968	1
IGSF3	NRAS	0.968	1
IGSF3	NUP93	0.968	1
IGSF3	RBM10	0.968	1
IGSF3	SRPX	0.968	1
IGSF3	TP53	0.968	1
IGSF3	TSC22D1	0.968	1
IGSF3	Amp_22q11.21	0.968	1
IGSF3	Del_10q21.2	0.968	1
LMTK2	MYH10	0.968	1
LMTK2	NLRP6	0.968	1
LMTK2	NRAS	0.968	1
LMTK2	NUP93	0.968	1
LMTK2	RBM10	0.968	1
LMTK2	SRPX	0.968	1
LMTK2	TP53	0.968	1
LMTK2	TSC22D1	0.968	1
LMTK2	Amp_22q11.21	0.968	1
LMTK2	Del_10q21.2	0.968	1
MYH10	NLRP6	0.968	1
MYH10	NUP93	0.968	1
MYH10	SRPX	0.968	1
MYH10	TP53	0.968	1
MYH10	TSC22D1	0.968	1
MYH10	Amp_22q11.21	0.968	1
MYH10	Del_10q21.2	0.968	1
NLRP6	NRAS	0.968	1
NLRP6	NUP93	0.968	1
NLRP6	RBM10	0.968	1
NLRP6	SRPX	0.968	1
NLRP6	TP53	0.968	1
NLRP6	TSC22D1	0.968	1
NLRP6	Del_10q21.2	0.968	1
NRAS	TSC22D1	0.968	1
NUP93	RBM10	0.968	1
NUP93	SRPX	0.968	1
NUP93	TP53	0.968	1
NUP93	TSC22D1	0.968	1
NUP93	Amp_22q11.21	0.968	1
NUP93	Del_10q21.2	0.968	1
RBM10	SRPX	0.968	1
RBM10	TP53	0.968	1
RBM10	TSC22D1	0.968	1
RBM10	Amp_22q11.21	0.968	1
RBM10	Del_10q21.2	0.968	1
SRPX	TP53	0.968	1
SRPX	TSC22D1	0.968	1
SRPX	Amp_22q11.21	0.968	1
SRPX	Del_10q21.2	0.968	1
TP53	TSC22D1	0.968	1
TP53	Amp_22q11.21	0.968	1
TP53	Del_10q21.2	0.968	1
TSC22D1	Amp_22q11.21	0.968	1
TSC22D1	Del_10q21.2	0.968	1
Amp_22q11.21	Del_10q21.2	0.968	1
C4BPA	Amp_1q31.2	0.969	1
SMC3	Amp_1q31.2	0.969	1
TNFRSF9	Amp_1q31.2	0.969	1
TRERF1	Amp_1q31.2	0.969	1
1q-Amp	7q-Amp	0.969	1
1q-Amp	Del_13q14.3	0.969	1
Amp_1q31.2	Amp_13q14.2	0.969	1
ABL1	EP400	0.97	1
ABL1	PIK3CA	0.97	1
ABL1	PRMT8	0.97	1
ABL1	PTCD1	0.97	1
ABL1	SEZ6L	0.97	1
ABL1	TNS1	0.97	1
ABL1	USP6	0.97	1
AKT1	EP400	0.97	1
AKT1	PIK3CA	0.97	1
AKT1	PRMT8	0.97	1
AKT1	PTCD1	0.97	1
AKT1	SEZ6L	0.97	1
AKT1	TNS1	0.97	1
AKT1	USP6	0.97	1
EP400	KRAS	0.97	1
EP400	TMEM184A	0.97	1
EP400	16p-Amp	0.97	1
EP400	5q-Amp	0.97	1
EP400	Amp_4q31.21	0.97	1
EP400	Del_10q23.31	0.97	1
FAM47C	NUDT11	0.97	1
FAM47C	RPTN	0.97	1
KRAS	PIK3CA	0.97	1
KRAS	PRMT8	0.97	1
KRAS	PTCD1	0.97	1
KRAS	SEZ6L	0.97	1
KRAS	TNS1	0.97	1
KRAS	USP6	0.97	1
PIK3CA	TMEM184A	0.97	1
PIK3CA	16p-Amp	0.97	1
PIK3CA	5q-Amp	0.97	1
PIK3CA	Amp_4q31.21	0.97	1
PIK3CA	Del_10q23.31	0.97	1
PRMT8	TMEM184A	0.97	1
PRMT8	16p-Amp	0.97	1
PRMT8	5q-Amp	0.97	1
PRMT8	Amp_4q31.21	0.97	1
PRMT8	Del_10q23.31	0.97	1
PTCD1	TMEM184A	0.97	1
PTCD1	16p-Amp	0.97	1
PTCD1	5q-Amp	0.97	1
PTCD1	Amp_4q31.21	0.97	1
PTCD1	Del_10q23.31	0.97	1
SEZ6L	TMEM184A	0.97	1
SEZ6L	16p-Amp	0.97	1
SEZ6L	5q-Amp	0.97	1
SEZ6L	Amp_4q31.21	0.97	1
SEZ6L	Del_10q23.31	0.97	1
TG	13q-Del	0.97	1
TMEM184A	TNS1	0.97	1
TMEM184A	USP6	0.97	1
TNS1	16p-Amp	0.97	1
TNS1	5q-Amp	0.97	1
TNS1	Amp_4q31.21	0.97	1
TNS1	Del_10q23.31	0.97	1
USP6	16p-Amp	0.97	1
USP6	5q-Amp	0.97	1
USP6	Amp_4q31.21	0.97	1
USP6	Del_10q23.31	0.97	1
C4BPA	FAM47C	0.971	1
CNKSR1	DLX6	0.971	1
CNKSR1	EIF1AX	0.971	1
CNKSR1	13q-Del	0.971	1
CNKSR1	9p-Del	0.971	1
DLX6	OR2T29	0.971	1
DLX6	PCGF2	0.971	1
DLX6	PRNP	0.971	1
DLX6	ZNF878	0.971	1
EIF1AX	PCGF2	0.971	1
EIF1AX	PRNP	0.971	1
EIF1AX	ZNF878	0.971	1
FAM47C	SMC3	0.971	1
FAM47C	TRERF1	0.971	1
FAM47C	Amp_13q14.2	0.971	1
OR2T29	13q-Del	0.971	1
OR2T29	9p-Del	0.971	1
PRNP	13q-Del	0.971	1
PRNP	9p-Del	0.971	1
ZNF878	13q-Del	0.971	1
ZNF878	9p-Del	0.971	1
7p-Amp	Amp_1q31.2	0.972	1
C4BPA	1q-Amp	0.973	1
C4BPA	9q-Del	0.973	1
SMC3	1q-Amp	0.973	1
SMC3	9q-Del	0.973	1
TNFRSF9	1q-Amp	0.973	1
TNFRSF9	9q-Del	0.973	1
TRERF1	1q-Amp	0.973	1
TRERF1	9q-Del	0.973	1
1q-Amp	Amp_13q14.2	0.973	1
9q-Del	Amp_13q14.2	0.973	1
NUDT11	1q-Amp	0.974	1
RPTN	9q-Del	0.974	1
ABCD1	EP400	0.976	1
ABCD1	PIK3CA	0.976	1
ABCD1	PRMT8	0.976	1
ABCD1	PTCD1	0.976	1
ABCD1	SEZ6L	0.976	1
ABCD1	TNS1	0.976	1
ABCD1	USP6	0.976	1
CNKSR1	PPM1D	0.976	1
CNKSR1	12p-Amp	0.976	1
CNKSR1	12q-Amp	0.976	1
CNKSR1	Del_19p13.12	0.976	1
EP400	GAGE2A	0.976	1
EP400	GPR44	0.976	1
EP400	IGSF3	0.976	1
EP400	LMTK2	0.976	1
EP400	MYH10	0.976	1
EP400	NLRP6	0.976	1
EP400	NUP93	0.976	1
EP400	RBM10	0.976	1
EP400	SRPX	0.976	1
EP400	TP53	0.976	1
EP400	TSC22D1	0.976	1
EP400	Amp_22q11.21	0.976	1
EP400	Del_10q21.2	0.976	1
GAGE2A	PIK3CA	0.976	1
GAGE2A	PRMT8	0.976	1
GAGE2A	PTCD1	0.976	1
GAGE2A	SEZ6L	0.976	1
GAGE2A	TNS1	0.976	1
GAGE2A	USP6	0.976	1
GPR44	PIK3CA	0.976	1
GPR44	PRMT8	0.976	1
GPR44	PTCD1	0.976	1
GPR44	SEZ6L	0.976	1
GPR44	TNS1	0.976	1
GPR44	USP6	0.976	1
IGSF3	PIK3CA	0.976	1
IGSF3	PRMT8	0.976	1
IGSF3	PTCD1	0.976	1
IGSF3	SEZ6L	0.976	1
IGSF3	TNS1	0.976	1
IGSF3	USP6	0.976	1
LMTK2	PIK3CA	0.976	1
LMTK2	PRMT8	0.976	1
LMTK2	SEZ6L	0.976	1
LMTK2	TNS1	0.976	1
LMTK2	USP6	0.976	1
MYH10	PIK3CA	0.976	1
MYH10	PRMT8	0.976	1
MYH10	PTCD1	0.976	1
MYH10	SEZ6L	0.976	1
MYH10	TNS1	0.976	1
MYH10	USP6	0.976	1
NLRP6	PRMT8	0.976	1
NLRP6	PTCD1	0.976	1
NLRP6	SEZ6L	0.976	1
NLRP6	TNS1	0.976	1
NLRP6	USP6	0.976	1
NUP93	PIK3CA	0.976	1
NUP93	PRMT8	0.976	1
NUP93	PTCD1	0.976	1
NUP93	SEZ6L	0.976	1
NUP93	TNS1	0.976	1
NUP93	USP6	0.976	1
OR2T29	PPM1D	0.976	1
OR2T29	12p-Amp	0.976	1
OR2T29	12q-Amp	0.976	1
OR2T29	Del_19p13.12	0.976	1
PCGF2	PPM1D	0.976	1
PCGF2	12p-Amp	0.976	1
PCGF2	12q-Amp	0.976	1
PCGF2	Del_19p13.12	0.976	1
PIK3CA	RBM10	0.976	1
PIK3CA	SRPX	0.976	1
PIK3CA	TP53	0.976	1
PIK3CA	TSC22D1	0.976	1
PIK3CA	Amp_22q11.21	0.976	1
PIK3CA	Del_10q21.2	0.976	1
PPM1D	ZNF878	0.976	1
PRMT8	RBM10	0.976	1
PRMT8	SRPX	0.976	1
PRMT8	TP53	0.976	1
PRMT8	TSC22D1	0.976	1
PRMT8	Amp_22q11.21	0.976	1
PRNP	12p-Amp	0.976	1
PRNP	12q-Amp	0.976	1
PRNP	Del_19p13.12	0.976	1
PTCD1	RBM10	0.976	1
PTCD1	SRPX	0.976	1
PTCD1	TP53	0.976	1
PTCD1	TSC22D1	0.976	1
PTCD1	Amp_22q11.21	0.976	1
PTCD1	Del_10q21.2	0.976	1
RBM10	SEZ6L	0.976	1
RBM10	TNS1	0.976	1
RBM10	USP6	0.976	1
SEZ6L	SRPX	0.976	1
SEZ6L	TP53	0.976	1
SEZ6L	TSC22D1	0.976	1
SEZ6L	Amp_22q11.21	0.976	1
SRPX	TNS1	0.976	1
SRPX	USP6	0.976	1
TNS1	TP53	0.976	1
TNS1	TSC22D1	0.976	1
TNS1	Amp_22q11.21	0.976	1
TNS1	Del_10q21.2	0.976	1
TP53	USP6	0.976	1
TSC22D1	USP6	0.976	1
USP6	Amp_22q11.21	0.976	1
USP6	Del_10q21.2	0.976	1
ZNF878	12p-Amp	0.976	1
ZNF878	12q-Amp	0.976	1
ZNF878	Del_19p13.12	0.976	1
C4BPA	EMG1	0.977	1
C4BPA	7q-Amp	0.977	1
C4BPA	Del_13q14.3	0.977	1
EMG1	SMC3	0.977	1
EMG1	TNFRSF9	0.977	1
EMG1	TRERF1	0.977	1
EMG1	Amp_13q14.2	0.977	1
EMG1	Del_13q14.3	0.977	1
SMC3	7q-Amp	0.977	1
SMC3	Del_13q14.3	0.977	1
TNFRSF9	7q-Amp	0.977	1
TNFRSF9	Del_13q14.3	0.977	1
TRERF1	7q-Amp	0.977	1
TRERF1	Del_13q14.3	0.977	1
7q-Amp	Amp_13q14.2	0.977	1
7q-Amp	Del_13q14.3	0.977	1
Amp_13q14.2	Del_13q14.3	0.977	1
TG	12p-Amp	0.978	1
TG	12q-Amp	0.978	1
12p-Amp	22q-Del	0.978	1
12p-Amp	Del_22q13.1	0.978	1
12p-Amp	Del_22q13.32	0.978	1
12q-Amp	22q-Del	0.978	1
12q-Amp	Del_22q13.1	0.978	1
12q-Amp	Del_22q13.32	0.978	1
Amp_1q31.2	Amp_5q33.1	0.978	1
Amp_1q31.2	Del_13q12.3	0.978	1
BRAF	Amp_1q31.2	0.979	1
1q-Amp	7p-Amp	0.979	1
ABL1	CNKSR1	0.98	1
ABL1	OR2T29	0.98	1
ABL1	PCGF2	0.98	1
ABL1	PRNP	0.98	1
ABL1	ZNF878	0.98	1
AKT1	CNKSR1	0.98	1
AKT1	OR2T29	0.98	1
AKT1	PCGF2	0.98	1
AKT1	PRNP	0.98	1
AKT1	ZNF878	0.98	1
C4BPA	NUDT11	0.98	1
C4BPA	RPTN	0.98	1
CNKSR1	KRAS	0.98	1
CNKSR1	TMEM184A	0.98	1
CNKSR1	16p-Amp	0.98	1
CNKSR1	5q-Amp	0.98	1
CNKSR1	Amp_4q31.21	0.98	1
CNKSR1	Del_10q23.31	0.98	1
KRAS	OR2T29	0.98	1
KRAS	PCGF2	0.98	1
KRAS	PRNP	0.98	1
KRAS	ZNF878	0.98	1
NUDT11	SMC3	0.98	1
NUDT11	TNFRSF9	0.98	1
NUDT11	TRERF1	0.98	1
NUDT11	Amp_13q14.2	0.98	1
OR2T29	TMEM184A	0.98	1
OR2T29	16p-Amp	0.98	1
OR2T29	5q-Amp	0.98	1
OR2T29	Amp_4q31.21	0.98	1
OR2T29	Del_10q23.31	0.98	1
PCGF2	TMEM184A	0.98	1
PCGF2	16p-Amp	0.98	1
PCGF2	5q-Amp	0.98	1
PCGF2	Amp_4q31.21	0.98	1
PCGF2	Del_10q23.31	0.98	1
PRNP	TMEM184A	0.98	1
PRNP	16p-Amp	0.98	1
PRNP	5q-Amp	0.98	1
PRNP	Amp_4q31.21	0.98	1
PRNP	Del_10q23.31	0.98	1
RPTN	SMC3	0.98	1
RPTN	TNFRSF9	0.98	1
RPTN	TRERF1	0.98	1
RPTN	Amp_13q14.2	0.98	1
TMEM184A	ZNF878	0.98	1
ZNF878	16p-Amp	0.98	1
ZNF878	5q-Amp	0.98	1
ZNF878	Amp_4q31.21	0.98	1
ZNF878	Del_10q23.31	0.98	1
DLX6	HRAS	0.981	1
NRAS	Del_13q12.3	0.981	1
C4BPA	7p-Amp	0.982	1
EP400	PIK3CA	0.982	1
EP400	PRMT8	0.982	1
EP400	PTCD1	0.982	1
EP400	SEZ6L	0.982	1
EP400	TNS1	0.982	1
EP400	USP6	0.982	1
FAM47C	NRAS	0.982	1
PIK3CA	PRMT8	0.982	1
PIK3CA	PTCD1	0.982	1
PIK3CA	SEZ6L	0.982	1
PIK3CA	TNS1	0.982	1
PIK3CA	USP6	0.982	1
PRMT8	PTCD1	0.982	1
PRMT8	SEZ6L	0.982	1
PRMT8	TNS1	0.982	1
PRMT8	USP6	0.982	1
PTCD1	SEZ6L	0.982	1
PTCD1	TNS1	0.982	1
PTCD1	USP6	0.982	1
SEZ6L	TNS1	0.982	1
SEZ6L	USP6	0.982	1
SMC3	7p-Amp	0.982	1
TNFRSF9	7p-Amp	0.982	1
TNS1	USP6	0.982	1
TRERF1	7p-Amp	0.982	1
7p-Amp	Amp_13q14.2	0.982	1
NRAS	PRMT8	0.983	1
NRAS	PTCD1	0.983	1
1q-Amp	Amp_5q33.1	0.983	1
1q-Amp	Del_13q12.3	0.983	1
ABCD1	CNKSR1	0.984	1
ABCD1	OR2T29	0.984	1
ABCD1	PCGF2	0.984	1
ABCD1	PRNP	0.984	1
ABCD1	ZNF878	0.984	1
C4BPA	5p-Amp	0.984	1
C4BPA	Amp_5q33.1	0.984	1
C4BPA	Amp_Xq22.3	0.984	1
C4BPA	Del_13q12.3	0.984	1
CNKSR1	GAGE2A	0.984	1
CNKSR1	GPR44	0.984	1
CNKSR1	IGSF3	0.984	1
CNKSR1	LMTK2	0.984	1
CNKSR1	MYH10	0.984	1
CNKSR1	NLRP6	0.984	1
CNKSR1	NUP93	0.984	1
CNKSR1	RBM10	0.984	1
CNKSR1	SRPX	0.984	1
CNKSR1	TP53	0.984	1
CNKSR1	TSC22D1	0.984	1
CNKSR1	Amp_22q11.21	0.984	1
CNKSR1	Del_10q21.2	0.984	1
GAGE2A	OR2T29	0.984	1
GAGE2A	PCGF2	0.984	1
GAGE2A	PRNP	0.984	1
GAGE2A	ZNF878	0.984	1
GPR44	OR2T29	0.984	1
GPR44	PCGF2	0.984	1
GPR44	PRNP	0.984	1
GPR44	ZNF878	0.984	1
IGSF3	OR2T29	0.984	1
IGSF3	PCGF2	0.984	1
IGSF3	PRNP	0.984	1
IGSF3	ZNF878	0.984	1
LMTK2	OR2T29	0.984	1
LMTK2	PCGF2	0.984	1
LMTK2	PRNP	0.984	1
LMTK2	ZNF878	0.984	1
MYH10	OR2T29	0.984	1
MYH10	PCGF2	0.984	1
MYH10	PRNP	0.984	1
MYH10	ZNF878	0.984	1
NLRP6	OR2T29	0.984	1
NLRP6	PCGF2	0.984	1
NLRP6	PRNP	0.984	1
NLRP6	ZNF878	0.984	1
NUP93	OR2T29	0.984	1
NUP93	PCGF2	0.984	1
NUP93	PRNP	0.984	1
NUP93	ZNF878	0.984	1
OR2T29	RBM10	0.984	1
OR2T29	SRPX	0.984	1
OR2T29	TP53	0.984	1
OR2T29	TSC22D1	0.984	1
OR2T29	Amp_22q11.21	0.984	1
OR2T29	Del_10q21.2	0.984	1
PCGF2	RBM10	0.984	1
PCGF2	SRPX	0.984	1
PCGF2	TSC22D1	0.984	1
PCGF2	Amp_22q11.21	0.984	1
PCGF2	Del_10q21.2	0.984	1
PRNP	RBM10	0.984	1
PRNP	SRPX	0.984	1
PRNP	TP53	0.984	1
PRNP	TSC22D1	0.984	1
PRNP	Amp_22q11.21	0.984	1
PRNP	Del_10q21.2	0.984	1
RBM10	ZNF878	0.984	1
SMC3	5p-Amp	0.984	1
SMC3	Amp_5q33.1	0.984	1
SMC3	Amp_Xq22.3	0.984	1
SMC3	Del_13q12.3	0.984	1
SRPX	ZNF878	0.984	1
TNFRSF9	5p-Amp	0.984	1
TNFRSF9	Amp_5q33.1	0.984	1
TNFRSF9	Amp_Xq22.3	0.984	1
TNFRSF9	Del_13q12.3	0.984	1
TP53	ZNF878	0.984	1
TRERF1	5p-Amp	0.984	1
TRERF1	Amp_5q33.1	0.984	1
TRERF1	Amp_Xq22.3	0.984	1
TRERF1	Del_13q12.3	0.984	1
TSC22D1	ZNF878	0.984	1
ZNF878	Amp_22q11.21	0.984	1
ZNF878	Del_10q21.2	0.984	1
5p-Amp	Amp_13q14.2	0.984	1
Amp_5q33.1	Amp_13q14.2	0.984	1
Amp_13q14.2	Amp_Xq22.3	0.984	1
Amp_13q14.2	Del_13q12.3	0.984	1
ABL1	TG	0.985	1
DLX6	FAM47C	0.985	1
EIF1AX	FAM47C	0.985	1
TG	16p-Amp	0.985	1
TG	5q-Amp	0.985	1
7p-Amp	Del_13q14.3	0.985	1
BRAF	Amp_Xq22.3	0.986	1
C4BPA	DLX6	0.986	1
C4BPA	EIF1AX	0.986	1
C4BPA	13q-Del	0.986	1
C4BPA	9p-Del	0.986	1
DLX6	SMC3	0.986	1
DLX6	TNFRSF9	0.986	1
DLX6	TRERF1	0.986	1
DLX6	Amp_13q14.2	0.986	1
EIF1AX	SMC3	0.986	1
EIF1AX	TNFRSF9	0.986	1
EIF1AX	Amp_13q14.2	0.986	1
SMC3	13q-Del	0.986	1
SMC3	9p-Del	0.986	1
TNFRSF9	13q-Del	0.986	1
TNFRSF9	9p-Del	0.986	1
TRERF1	13q-Del	0.986	1
TRERF1	9p-Del	0.986	1
13q-Del	Amp_13q14.2	0.986	1
9p-Del	Amp_13q14.2	0.986	1
PRNP	22q-Del	0.987	1
PRNP	Del_22q13.1	0.987	1
PRNP	Del_22q13.32	0.987	1
13q-Del	9q-Del	0.987	1
C4BPA	PPM1D	0.988	1
C4BPA	12p-Amp	0.988	1
C4BPA	12q-Amp	0.988	1
C4BPA	Del_19p13.12	0.988	1
CNKSR1	EP400	0.988	1
CNKSR1	PIK3CA	0.988	1
CNKSR1	PRMT8	0.988	1
CNKSR1	PTCD1	0.988	1
CNKSR1	SEZ6L	0.988	1
CNKSR1	TNS1	0.988	1
CNKSR1	USP6	0.988	1
EMG1	Del_13q12.3	0.988	1
EP400	OR2T29	0.988	1
EP400	PCGF2	0.988	1
EP400	PRNP	0.988	1
EP400	ZNF878	0.988	1
NRAS	13q-Del	0.988	1
NRAS	9p-Del	0.988	1
OR2T29	PIK3CA	0.988	1
OR2T29	PRMT8	0.988	1
OR2T29	PTCD1	0.988	1
OR2T29	SEZ6L	0.988	1
OR2T29	TNS1	0.988	1
OR2T29	USP6	0.988	1
PCGF2	PIK3CA	0.988	1
PCGF2	PRMT8	0.988	1
PCGF2	PTCD1	0.988	1
PCGF2	SEZ6L	0.988	1
PCGF2	TNS1	0.988	1
PCGF2	USP6	0.988	1
PIK3CA	PRNP	0.988	1
PIK3CA	ZNF878	0.988	1
PPM1D	SMC3	0.988	1
PPM1D	TNFRSF9	0.988	1
PPM1D	TRERF1	0.988	1
PPM1D	Amp_13q14.2	0.988	1
PRMT8	PRNP	0.988	1
PRMT8	ZNF878	0.988	1
PRNP	PTCD1	0.988	1
PRNP	SEZ6L	0.988	1
PRNP	TNS1	0.988	1
PRNP	USP6	0.988	1
PTCD1	ZNF878	0.988	1
SEZ6L	ZNF878	0.988	1
SMC3	12p-Amp	0.988	1
SMC3	12q-Amp	0.988	1
SMC3	Del_19p13.12	0.988	1
TNFRSF9	12p-Amp	0.988	1
TNFRSF9	12q-Amp	0.988	1
TNFRSF9	Del_19p13.12	0.988	1
TNS1	ZNF878	0.988	1
TRERF1	12p-Amp	0.988	1
TRERF1	12q-Amp	0.988	1
TRERF1	Del_19p13.12	0.988	1
USP6	ZNF878	0.988	1
12p-Amp	Amp_1q31.2	0.988	1
12p-Amp	Amp_13q14.2	0.988	1
12q-Amp	Amp_1q31.2	0.988	1
12q-Amp	Amp_13q14.2	0.988	1
Amp_5q33.1	Del_13q14.3	0.988	1
Amp_13q14.2	Del_19p13.12	0.988	1
ABL1	C4BPA	0.99	1
ABL1	SMC3	0.99	1
ABL1	TNFRSF9	0.99	1
ABL1	TRERF1	0.99	1
ABL1	Amp_13q14.2	0.99	1
AKT1	C4BPA	0.99	1
AKT1	SMC3	0.99	1
AKT1	TNFRSF9	0.99	1
AKT1	TRERF1	0.99	1
AKT1	Amp_13q14.2	0.99	1
BRAF	1q-Amp	0.99	1
C4BPA	KRAS	0.99	1
C4BPA	TMEM184A	0.99	1
C4BPA	16p-Amp	0.99	1
C4BPA	5q-Amp	0.99	1
C4BPA	Amp_4q31.21	0.99	1
C4BPA	Del_10q23.31	0.99	1
HRAS	TMEM184A	0.99	1
KRAS	SMC3	0.99	1
KRAS	TNFRSF9	0.99	1
KRAS	TRERF1	0.99	1
KRAS	Amp_13q14.2	0.99	1
SMC3	TMEM184A	0.99	1
SMC3	16p-Amp	0.99	1
SMC3	5q-Amp	0.99	1
SMC3	Amp_4q31.21	0.99	1
SMC3	Del_10q23.31	0.99	1
TMEM184A	TNFRSF9	0.99	1
TMEM184A	TRERF1	0.99	1
TMEM184A	Amp_13q14.2	0.99	1
TNFRSF9	16p-Amp	0.99	1
TNFRSF9	5q-Amp	0.99	1
TNFRSF9	Amp_4q31.21	0.99	1
TNFRSF9	Del_10q23.31	0.99	1
TRERF1	16p-Amp	0.99	1
TRERF1	5q-Amp	0.99	1
TRERF1	Amp_4q31.21	0.99	1
TRERF1	Del_10q23.31	0.99	1
16p-Amp	Amp_13q14.2	0.99	1
5q-Amp	Amp_13q14.2	0.99	1
Amp_4q31.21	Amp_13q14.2	0.99	1
Amp_13q14.2	Del_10q23.31	0.99	1
ABCD1	TG	0.991	1
EMG1	13q-Del	0.991	1
GAGE2A	TG	0.991	1
LMTK2	TG	0.991	1
MYH10	TG	0.991	1
12p-Amp	1q-Amp	0.991	1
12q-Amp	1q-Amp	0.991	1
7q-Amp	9p-Del	0.991	1
9p-Del	Del_13q14.3	0.991	1
ABCD1	C4BPA	0.992	1
ABCD1	SMC3	0.992	1
ABCD1	TNFRSF9	0.992	1
ABCD1	TRERF1	0.992	1
ABCD1	Amp_13q14.2	0.992	1
AKT1	Amp_1q31.2	0.992	1
C4BPA	GAGE2A	0.992	1
C4BPA	GPR44	0.992	1
C4BPA	IGSF3	0.992	1
C4BPA	LMTK2	0.992	1
C4BPA	MYH10	0.992	1
C4BPA	NLRP6	0.992	1
C4BPA	NUP93	0.992	1
C4BPA	RBM10	0.992	1
C4BPA	SRPX	0.992	1
C4BPA	TP53	0.992	1
C4BPA	TSC22D1	0.992	1
C4BPA	Amp_22q11.21	0.992	1
C4BPA	Del_10q21.2	0.992	1
CNKSR1	OR2T29	0.992	1
CNKSR1	PCGF2	0.992	1
CNKSR1	PRNP	0.992	1
CNKSR1	ZNF878	0.992	1
DLX6	RPTN	0.992	1
GAGE2A	SMC3	0.992	1
GAGE2A	TNFRSF9	0.992	1
GAGE2A	TRERF1	0.992	1
GAGE2A	Amp_13q14.2	0.992	1
GPR44	SMC3	0.992	1
GPR44	TNFRSF9	0.992	1
GPR44	TRERF1	0.992	1
GPR44	Amp_13q14.2	0.992	1
IGSF3	SMC3	0.992	1
IGSF3	TNFRSF9	0.992	1
IGSF3	TRERF1	0.992	1
IGSF3	Amp_13q14.2	0.992	1
LMTK2	SMC3	0.992	1
LMTK2	TNFRSF9	0.992	1
LMTK2	TRERF1	0.992	1
LMTK2	Amp_13q14.2	0.992	1
MYH10	SMC3	0.992	1
MYH10	TNFRSF9	0.992	1
MYH10	TRERF1	0.992	1
MYH10	Amp_13q14.2	0.992	1
NLRP6	SMC3	0.992	1
NLRP6	TNFRSF9	0.992	1
NLRP6	TRERF1	0.992	1
NLRP6	Amp_13q14.2	0.992	1
NUP93	SMC3	0.992	1
NUP93	TNFRSF9	0.992	1
NUP93	TRERF1	0.992	1
NUP93	Amp_13q14.2	0.992	1
OR2T29	PCGF2	0.992	1
OR2T29	PRNP	0.992	1
OR2T29	ZNF878	0.992	1
PCGF2	PRNP	0.992	1
PCGF2	ZNF878	0.992	1
PRNP	ZNF878	0.992	1
RBM10	SMC3	0.992	1
RBM10	TNFRSF9	0.992	1
RBM10	TRERF1	0.992	1
RBM10	Amp_13q14.2	0.992	1
SMC3	SRPX	0.992	1
SMC3	TP53	0.992	1
SMC3	TSC22D1	0.992	1
SMC3	Amp_22q11.21	0.992	1
SMC3	Del_10q21.2	0.992	1
SRPX	TNFRSF9	0.992	1
SRPX	TRERF1	0.992	1
SRPX	Amp_13q14.2	0.992	1
TNFRSF9	TP53	0.992	1
TNFRSF9	TSC22D1	0.992	1
TNFRSF9	Amp_22q11.21	0.992	1
TNFRSF9	Del_10q21.2	0.992	1
TP53	TRERF1	0.992	1
TP53	Amp_13q14.2	0.992	1
TRERF1	TSC22D1	0.992	1
TRERF1	Amp_22q11.21	0.992	1
TRERF1	Del_10q21.2	0.992	1
TSC22D1	Amp_13q14.2	0.992	1
5q-Amp	Amp_1q31.2	0.992	1
Amp_13q14.2	Amp_22q11.21	0.992	1
Amp_13q14.2	Del_10q21.2	0.992	1
AKT1	FAM47C	0.993	1
NRAS	Del_13q14.3	0.993	1
12p-Amp	Del_13q14.3	0.993	1
12q-Amp	Del_13q14.3	0.993	1
Del_13q14.3	Del_19p13.12	0.993	1
AKT1	1q-Amp	0.994	1
AKT1	9q-Del	0.994	1
C4BPA	EP400	0.994	1
C4BPA	PIK3CA	0.994	1
C4BPA	PRMT8	0.994	1
C4BPA	PTCD1	0.994	1
C4BPA	SEZ6L	0.994	1
C4BPA	TNS1	0.994	1
C4BPA	USP6	0.994	1
EP400	SMC3	0.994	1
EP400	TNFRSF9	0.994	1
EP400	TRERF1	0.994	1
EP400	Amp_13q14.2	0.994	1
HRAS	IGSF3	0.994	1
NRAS	PRNP	0.994	1
PIK3CA	SMC3	0.994	1
PIK3CA	TNFRSF9	0.994	1
PIK3CA	TRERF1	0.994	1
PIK3CA	Amp_13q14.2	0.994	1
PRMT8	SMC3	0.994	1
PRMT8	TNFRSF9	0.994	1
PRMT8	TRERF1	0.994	1
PRMT8	Amp_13q14.2	0.994	1
PTCD1	SMC3	0.994	1
PTCD1	TNFRSF9	0.994	1
PTCD1	TRERF1	0.994	1
PTCD1	Amp_13q14.2	0.994	1
SEZ6L	SMC3	0.994	1
SEZ6L	TNFRSF9	0.994	1
SEZ6L	TRERF1	0.994	1
SEZ6L	Amp_13q14.2	0.994	1
SMC3	TNS1	0.994	1
SMC3	USP6	0.994	1
TNFRSF9	TNS1	0.994	1
TNFRSF9	USP6	0.994	1
TNS1	TRERF1	0.994	1
TNS1	Amp_13q14.2	0.994	1
TRERF1	USP6	0.994	1
USP6	Amp_13q14.2	0.994	1
16p-Amp	1q-Amp	0.994	1
1q-Amp	5q-Amp	0.994	1
5p-Amp	Del_13q12.3	0.994	1
7p-Amp	9p-Del	0.994	1
LMTK2	Amp_1q31.2	0.995	1
MYH10	Amp_1q31.2	0.995	1
TG	USP6	0.995	1
9p-Del	Del_13q12.3	0.995	1
ABCD1	FAM47C	0.996	1
C4BPA	CNKSR1	0.996	1
C4BPA	OR2T29	0.996	1
C4BPA	PCGF2	0.996	1
C4BPA	PRNP	0.996	1
C4BPA	ZNF878	0.996	1
CNKSR1	SMC3	0.996	1
CNKSR1	TNFRSF9	0.996	1
CNKSR1	TRERF1	0.996	1
CNKSR1	Amp_13q14.2	0.996	1
EMG1	TMEM184A	0.996	1
FAM47C	IGSF3	0.996	1
FAM47C	LMTK2	0.996	1
LMTK2	1q-Amp	0.996	1
MYH10	1q-Amp	0.996	1
MYH10	9q-Del	0.996	1
NUDT11	TMEM184A	0.996	1
OR2T29	SMC3	0.996	1
OR2T29	TNFRSF9	0.996	1
OR2T29	TRERF1	0.996	1
OR2T29	Amp_13q14.2	0.996	1
PCGF2	SMC3	0.996	1
PCGF2	TNFRSF9	0.996	1
PCGF2	TRERF1	0.996	1
PCGF2	Amp_13q14.2	0.996	1
PRNP	SMC3	0.996	1
PRNP	TNFRSF9	0.996	1
PRNP	TRERF1	0.996	1
PRNP	Amp_13q14.2	0.996	1
SMC3	ZNF878	0.996	1
TNFRSF9	ZNF878	0.996	1
TP53	9q-Del	0.996	1
TRERF1	ZNF878	0.996	1
ZNF878	Amp_13q14.2	0.996	1
16p-Amp	Del_13q14.3	0.996	1
5q-Amp	Del_13q14.3	0.996	1
7q-Amp	Amp_4q31.21	0.996	1
EMG1	Amp_22q11.21	0.997	1
NRAS	TG	0.997	1
PTCD1	Amp_1q31.2	0.997	1
TP53	Del_13q14.3	0.997	1
7p-Amp	Amp_4q31.21	0.997	1
7q-Amp	Amp_1q31.2	0.997	1
13q-Del	Del_19p13.12	0.997	1
Amp_22q11.21	Del_13q14.3	0.997	1
Del_13q12.3	Del_19p13.12	0.997	1
C4BPA	SMC3	0.998	1
C4BPA	TNFRSF9	0.998	1
C4BPA	TRERF1	0.998	1
C4BPA	Amp_13q14.2	0.998	1
DLX6	KRAS	0.998	1
DLX6	TMEM184A	0.998	1
EIF1AX	KRAS	0.998	1
EP400	FAM47C	0.998	1
FAM47C	TNS1	0.998	1
PTCD1	1q-Amp	0.998	1
RPTN	1q-Amp	0.998	1
RPTN	Amp_1q31.2	0.998	1
SEZ6L	9q-Del	0.998	1
SMC3	TNFRSF9	0.998	1
SMC3	TRERF1	0.998	1
SMC3	Amp_13q14.2	0.998	1
TNFRSF9	TRERF1	0.998	1
TNFRSF9	Amp_13q14.2	0.998	1
TRERF1	Amp_13q14.2	0.998	1
USP6	9q-Del	0.998	1
12p-Amp	Del_19p13.12	0.998	1
12q-Amp	Del_19p13.12	0.998	1
5p-Amp	Amp_4q31.21	0.998	1
7q-Amp	9q-Del	0.998	1
9q-Del	Del_13q14.3	0.998	1
Amp_4q31.21	Amp_5q33.1	0.998	1
Amp_5q33.1	Del_10q23.31	0.998	1
ABCD1	EIF1AX	0.999	1
ABL1	SRPX	0.999	1
AKT1	PPM1D	0.999	1
AKT1	TP53	0.999	1
IGSF3	TMEM184A	0.999	1
LMTK2	5p-Amp	0.999	1
MYH10	PPM1D	0.999	1
MYH10	5p-Amp	0.999	1
MYH10	9p-Del	0.999	1
NUDT11	PTCD1	0.999	1
NUDT11	RPTN	0.999	1
NUP93	Amp_Xq22.3	0.999	1
PCGF2	1q-Amp	0.999	1
PCGF2	Amp_1q31.2	0.999	1
PTCD1	RPTN	0.999	1
PTCD1	5p-Amp	0.999	1
RPTN	TNS1	0.999	1
SEZ6L	7p-Amp	0.999	1
SEZ6L	7q-Amp	0.999	1
TP53	13q-Del	0.999	1
TP53	Del_13q12.3	0.999	1
TP53	Del_19p13.12	0.999	1
USP6	9p-Del	0.999	1
12p-Amp	Amp_4q31.21	0.999	1
12q-Amp	Amp_4q31.21	0.999	1
16p-Amp	Amp_4q31.21	0.999	1
5p-Amp	9q-Del	0.999	1
5q-Amp	Amp_4q31.21	0.999	1
7p-Amp	9q-Del	0.999	1
13q-Del	Amp_22q11.21	0.999	1
9p-Del	Amp_1q31.2	0.999	1
9q-Del	Del_13q12.3	0.999	1
Amp_22q11.21	Del_13q12.3	0.999	1
ABCD1	RBM10	1	1
AKT1	BRAF	1	1
BRAF	CNKSR1	1	1
BRAF	GPR44	1	1
BRAF	PIK3CA	1	1
BRAF	PPM1D	1	1
DLX6	EIF1AX	1	1
EIF1AX	OR2T29	1	1
EIF1AX	TRERF1	1	1
EMG1	OR2T29	1	1
FAM47C	TNFRSF9	1	1
HRAS	22q-Del	1	1
HRAS	Del_22q13.1	1	1
HRAS	Del_22q13.32	1	1
IGSF3	LMTK2	1	1
LMTK2	PTCD1	1	1
MYH10	RBM10	1	1
NLRP6	PIK3CA	1	1
NLRP6	Amp_22q11.21	1	1
NRAS	TRERF1	1	1
NRAS	22q-Del	1	1
NRAS	Amp_22q11.21	1	1
NRAS	Del_22q13.1	1	1
NRAS	Del_22q13.32	1	1
PCGF2	TP53	1	1
PCGF2	5p-Amp	1	1
PCGF2	13q-Del	1	1
PCGF2	9p-Del	1	1
PCGF2	9q-Del	1	1
PCGF2	Del_13q12.3	1	1
PCGF2	Del_13q14.3	1	1
PPM1D	PRNP	1	1
PRMT8	Del_10q21.2	1	1
RBM10	TG	1	1
SEZ6L	Del_10q21.2	1	1
ZNF878	Del_13q12.3	1	1
12p-Amp	12q-Amp	1	1
12p-Amp	16p-Amp	1	1
12p-Amp	5p-Amp	1	1
12p-Amp	5q-Amp	1	1
12p-Amp	7p-Amp	1	1
12p-Amp	7q-Amp	1	1
12p-Amp	Amp_5q33.1	1	1
12q-Amp	16p-Amp	1	1
12q-Amp	5p-Amp	1	1
12q-Amp	5q-Amp	1	1
12q-Amp	7p-Amp	1	1
12q-Amp	7q-Amp	1	1
12q-Amp	Amp_5q33.1	1	1
16p-Amp	5p-Amp	1	1
16p-Amp	5q-Amp	1	1
16p-Amp	7p-Amp	1	1
16p-Amp	7q-Amp	1	1
16p-Amp	Amp_1q31.2	1	1
16p-Amp	Amp_5q33.1	1	1
1q-Amp	5p-Amp	1	1
1q-Amp	9p-Del	1	1
1q-Amp	9q-Del	1	1
1q-Amp	Amp_1q31.2	1	1
1q-Amp	Amp_4q31.21	1	1
5p-Amp	5q-Amp	1	1
5p-Amp	7p-Amp	1	1
5p-Amp	7q-Amp	1	1
5p-Amp	9p-Del	1	1
5p-Amp	Amp_1q31.2	1	1
5p-Amp	Amp_5q33.1	1	1
5p-Amp	Del_13q14.3	1	1
5q-Amp	7p-Amp	1	1
5q-Amp	7q-Amp	1	1
5q-Amp	Amp_5q33.1	1	1
7p-Amp	7q-Amp	1	1
7p-Amp	Amp_5q33.1	1	1
7q-Amp	Amp_5q33.1	1	1
13q-Del	Del_13q12.3	1	1
13q-Del	Del_13q14.3	1	1
22q-Del	9p-Del	1	1
22q-Del	9q-Del	1	1
22q-Del	Amp_22q11.21	1	1
22q-Del	Del_22q13.1	1	1
22q-Del	Del_22q13.32	1	1
9p-Del	9q-Del	1	1
9p-Del	Del_22q13.1	1	1
9p-Del	Del_22q13.32	1	1
9q-Del	Amp_1q31.2	1	1
9q-Del	Del_22q13.1	1	1
9q-Del	Del_22q13.32	1	1
Amp_1q31.2	Amp_4q31.21	1	1
Amp_22q11.21	Del_22q13.1	1	1
Amp_22q11.21	Del_22q13.32	1	1
Del_10q21.2	Del_10q23.31	1	1
Del_13q12.3	Del_13q14.3	1	1
Del_22q13.1	Del_22q13.32	1	1
BRAF	NRAS	1.95e-16	1
BRAF	HRAS	4.39e-07	1
