Clinical Features MRNA_CNMF MRNA_CHIERARCHICAL CN_CNMF METHLYATION_CNMF RPPA_CNMF RPPA_CHIERARCHICAL MRNASEQ_CNMF MRNASEQ_CHIERARCHICAL MIRSEQ_CNMF MIRSEQ_CHIERARCHICAL MIRSEQ_MATURE_CNMF MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL nCNV (%) nWild-Type Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q 1p gain 227 (21%) 853 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00107 0.00177 1q gain 708 (66%) 372 0.38548 0.405 0.096489 0.112 9.9999e-06 2.35e-05 0.18991 0.209 0.6265 0.64 0.11145 0.127 9.9999e-06 2.35e-05 0.0069099 0.00978 0.058269 0.0702 0.00025 0.000455 0.24994 0.27 0.3022 0.323 2p gain 122 (11%) 958 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 2q gain 73 (7%) 1007 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.0083499 0.0116 3p gain 137 (13%) 943 0.45745 0.476 0.2966 0.318 9.9999e-06 2.35e-05 5e-05 0.000103 0.02551 0.0323 0.0077399 0.0108 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 5.9999e-05 0.000122 0.26137 0.282 0.17839 0.198 3q gain 213 (20%) 867 0.0051499 0.00745 0.01208 0.0163 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 8.9999e-05 0.000178 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00049 0.000867 4p gain 75 (7%) 1005 0.25765 0.278 0.01577 0.0209 9.9999e-06 2.35e-05 0.0075199 0.0105 0.00162 0.00261 0.070059 0.0831 5.9999e-05 0.000122 0.01622 0.0213 0.0069599 0.00981 0.01723 0.0225 0.55915 0.573 0.121 0.138 4q gain 71 (7%) 1009 0.12416 0.141 0.00491 0.00712 9.9999e-06 2.35e-05 0.01624 0.0213 0.02121 0.0272 0.02842 0.0355 9.9999e-05 0.000197 0.10653 0.122 0.01757 0.0228 0.04232 0.0518 0.51794 0.534 0.03943 0.0485 5p gain 315 (29%) 765 0.23792 0.258 0.04025 0.0494 9.9999e-06 2.35e-05 0.01097 0.0149 0.52273 0.538 0.68571 0.694 0.10998 0.126 0.053579 0.0648 0.01193 0.0161 0.01382 0.0185 0.01644 0.0215 0.30234 0.323 5q gain 211 (20%) 869 0.01818 0.0235 0.00353 0.00526 9.9999e-06 2.35e-05 0.0018 0.00288 0.00302 0.00461 0.00024 0.000439 0.0064699 0.00923 0.00025 0.000455 0.01575 0.0209 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 0.065649 0.0784 6p gain 208 (19%) 872 9.9999e-06 2.35e-05 2e-04 0.000371 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 6q gain 149 (14%) 931 9.9999e-06 2.35e-05 0.00119 0.00195 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 7p gain 313 (29%) 767 0.1225 0.139 0.20361 0.223 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-05 0.000197 0.14826 0.166 0.11723 0.134 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 0.00083999 0.00141 0.00284 0.00437 0.078579 0.0927 0.25662 0.277 7q gain 268 (25%) 812 0.01289 0.0174 0.0086899 0.012 9.9999e-06 2.35e-05 0.00026 0.000471 0.04543 0.0555 0.00231 0.00363 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 0.00293 0.00449 0.18838 0.208 8p gain 291 (27%) 789 0.065809 0.0784 0.03097 0.0385 9.9999e-06 2.35e-05 0.00094999 0.00158 0.42871 0.448 0.097269 0.113 0.00052999 0.000928 0.00138 0.00224 0.02664 0.0334 0.03861 0.0477 0.01851 0.0239 0.083169 0.0978 8q gain 530 (49%) 550 0.0056399 0.00811 0.03916 0.0482 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.0105 0.0143 0.00077999 0.00132 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9p gain 139 (13%) 941 0.00022 0.000405 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00016 0.000303 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00013 0.000252 9.9999e-06 2.35e-05 0.00065999 0.00114 0.04897 0.0595 9q gain 122 (11%) 958 0.63457 0.647 0.13871 0.156 9.9999e-06 2.35e-05 0.00104 0.00172 0.12669 0.143 0.0067899 0.00963 0.00334 0.00502 0.01684 0.022 0.79638 0.802 0.050019 0.0607 0.04261 0.0521 0.058989 0.0709 10p gain 208 (19%) 872 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 10q gain 114 (11%) 966 0.00307 0.00468 0.04152 0.0509 9.9999e-06 2.35e-05 0.00053999 0.000942 0.01056 0.0144 0.064319 0.0769 0.00072999 0.00124 6.9999e-05 0.000141 0.00021 0.000388 3e-05 6.45e-05 0.00266 0.00412 0.0256 0.0323 11p gain 141 (13%) 939 0.12788 0.144 0.39166 0.411 9.9999e-06 2.35e-05 0.00437 0.00641 0.04551 0.0555 0.51181 0.529 0.00019 0.000354 0.0084299 0.0117 0.00011 0.000216 3e-05 6.45e-05 0.00212 0.00335 9.9999e-06 2.35e-05 11q gain 96 (9%) 984 0.0346 0.0428 0.091609 0.107 9.9999e-06 2.35e-05 0.00112 0.00184 0.00145 0.00235 0.00080999 0.00136 0.00038 0.000686 5e-04 0.000882 5e-05 0.000103 0.00272 0.0042 0.02982 0.0372 0.01152 0.0156 12p gain 225 (21%) 855 0.00016 0.000303 0.02495 0.0316 9.9999e-06 2.35e-05 5.9999e-05 0.000122 0.00332 0.00501 0.01161 0.0157 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 5.9999e-05 0.000122 0.00465 0.00679 0.00398 0.00591 12q gain 186 (17%) 894 0.00062999 0.00109 0.14083 0.158 9.9999e-06 2.35e-05 0.00185 0.00295 0.24744 0.268 0.02598 0.0327 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00051999 0.000912 0.00234 0.00366 0.11886 0.135 0.4505 0.47 13q gain 93 (9%) 987 0.16472 0.184 0.60449 0.618 0.00142 0.00231 0.00090999 0.00152 0.0059899 0.0086 0.00246 0.00382 0.0060399 0.00866 0.00018 0.000337 0.0084399 0.0117 0.00013 0.000252 0.23925 0.26 0.063249 0.0757 14q gain 143 (13%) 937 0.64074 0.653 0.01901 0.0245 9.9999e-06 2.35e-05 0.00047 0.000835 0.079339 0.0934 0.02331 0.0296 5e-05 0.000103 6.9999e-05 0.000141 0.00065999 0.00114 3e-05 6.45e-05 0.18954 0.209 0.30808 0.329 15q gain 88 (8%) 992 0.01417 0.0189 0.21306 0.232 0.0128 0.0173 0.02225 0.0284 0.54333 0.557 0.098369 0.114 0.04623 0.0563 0.01479 0.0197 0.084539 0.0993 0.0118 0.016 0.32789 0.349 0.34546 0.366 16p gain 462 (43%) 618 0.00336 0.00502 0.01019 0.014 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00471 0.00687 0.00123 0.00201 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00050999 0.000898 9.9999e-06 2.35e-05 5.9999e-05 0.000122 0.0069499 0.00981 16q gain 142 (13%) 938 0.071149 0.0841 0.74035 0.748 0.00075999 0.00129 0.052879 0.064 0.26807 0.288 0.17209 0.192 0.26385 0.284 0.00303 0.00462 0.10452 0.12 0.00080999 0.00136 0.1313 0.148 0.10322 0.119 17p gain 110 (10%) 970 0.16884 0.188 0.68058 0.69 9.9999e-06 2.35e-05 0.070829 0.0839 0.84488 0.848 0.48568 0.504 0.02277 0.029 0.058879 0.0708 0.00488 0.00709 0.13881 0.156 0.44451 0.464 0.00172 0.00276 17q gain 221 (20%) 859 0.055409 0.0669 0.0113 0.0154 9.9999e-06 2.35e-05 0.00042 0.000751 0.51006 0.528 4e-05 8.36e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00154 0.00249 0.0064899 0.00924 18p gain 177 (16%) 903 0.00016 0.000303 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 18q gain 154 (14%) 926 0.00285 0.00437 4e-05 8.36e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00196 0.00312 0.0063299 0.00904 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00015 0.000287 0.00483 0.00703 19p gain 187 (17%) 893 0.00068999 0.00118 0.0033 0.00499 9.9999e-06 2.35e-05 0.00025 0.000455 0.00237 0.0037 0.00418 0.00619 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 0.00026 0.000471 4e-05 8.36e-05 4e-05 8.36e-05 0.65902 0.67 19q gain 219 (20%) 861 0.00233 0.00366 0.0074499 0.0105 9.9999e-06 2.35e-05 4e-05 8.36e-05 0.01575 0.0209 0.01638 0.0215 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 0.00015 0.000287 2e-05 4.45e-05 0.00045 0.000804 0.17735 0.197 20p gain 411 (38%) 669 0.00015 0.000287 0.50819 0.526 9.9999e-06 2.35e-05 0.00185 0.00295 0.01323 0.0178 0.00463 0.00677 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.0085799 0.0119 0.00312 0.00474 20q gain 450 (42%) 630 8.9999e-05 0.000178 0.20277 0.222 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.12237 0.139 0.10564 0.121 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00061999 0.00107 3e-05 6.45e-05 21q gain 198 (18%) 882 9.9999e-06 2.35e-05 0.00053999 0.000942 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 22q gain 99 (9%) 981 9.9999e-06 2.35e-05 0.0078999 0.011 9.9999e-06 2.35e-05 4e-05 8.36e-05 4e-05 8.36e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 6.9999e-05 0.000141 0.00391 0.00581 xp gain 150 (14%) 930 0.01976 0.0254 0.56963 0.583 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 0.0089899 0.0124 0.0083299 0.0116 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 5.9999e-05 0.000122 5e-05 0.000103 0.00012 0.000234 xq gain 137 (13%) 943 0.00453 0.00663 0.0067699 0.00961 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.01735 0.0226 0.00049 0.000867 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00014 0.00027 6.9999e-05 0.000141 0.00423 0.00624 1p loss 227 (21%) 853 0.02307 0.0294 0.0019 0.00303 9.9999e-06 2.35e-05 5e-04 0.000882 0.098219 0.114 0.01609 0.0212 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00329 0.00498 9.9999e-06 2.35e-05 0.0166 0.0217 0.74362 0.75 1q loss 48 (4%) 1032 0.00269 0.00416 0.20317 0.222 6.9999e-05 0.000141 0.47474 0.493 0.28467 0.305 0.51611 0.533 0.00175 0.0028 0.1046 0.12 0.01582 0.0209 0.13801 0.156 0.18346 0.204 0.42227 0.442 2p loss 185 (17%) 895 0.0062499 0.00895 0.02898 0.0362 9.9999e-06 2.35e-05 8.9999e-05 0.000178 0.0299 0.0372 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 0.00039 0.000703 0.0011 0.00181 0.059279 0.0711 2q loss 211 (20%) 869 0.1063 0.122 0.52768 0.543 9.9999e-06 2.35e-05 0.00335 0.00502 0.066919 0.0794 8.9999e-05 0.000178 0.00041 0.000736 9.9999e-06 2.35e-05 0.00095999 0.00159 0.01973 0.0254 0.00489 0.0071 0.088819 0.104 3p loss 188 (17%) 892 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 4e-05 8.36e-05 0.01579 0.0209 3q loss 105 (10%) 975 9.9999e-06 2.35e-05 0.0085999 0.0119 9.9999e-06 2.35e-05 4e-05 8.36e-05 3e-05 6.45e-05 0.00057999 0.00101 4e-05 8.36e-05 6.9999e-05 0.000141 0.00203 0.00322 2e-04 0.000371 0.14819 0.166 0.089919 0.105 4p loss 353 (33%) 727 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 4q loss 311 (29%) 769 9.9999e-06 2.35e-05 0.00015 0.000287 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00022 0.000405 5p loss 142 (13%) 938 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 5q loss 228 (21%) 852 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 6p loss 190 (18%) 890 0.32936 0.35 0.04767 0.058 9.9999e-06 2.35e-05 0.11494 0.131 0.96236 0.962 0.0065199 0.00927 0.00312 0.00474 0.0088199 0.0122 0.052259 0.0633 0.0062799 0.00898 0.45496 0.474 0.64621 0.658 6q loss 280 (26%) 800 0.20187 0.221 0.02556 0.0323 9.9999e-06 2.35e-05 0.00093999 0.00157 0.71202 0.72 0.00078999 0.00133 2e-05 4.45e-05 0.00037 0.000669 0.0078599 0.011 2e-05 4.45e-05 0.0105 0.0143 0.20453 0.223 7p loss 111 (10%) 969 0.0055899 0.00805 0.88086 0.883 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 0.00018 0.000337 0.0073699 0.0104 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 4e-05 8.36e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00243 0.00378 7q loss 120 (11%) 960 0.065839 0.0784 0.076699 0.0906 2e-05 4.45e-05 0.00334 0.00502 0.02656 0.0333 0.37561 0.396 0.00171 0.00275 0.00023 0.000421 0.00072999 0.00124 0.00015 0.000287 0.0096799 0.0133 0.01691 0.0221 8p loss 395 (37%) 685 0.02009 0.0258 0.19582 0.215 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00018 0.000337 0.03227 0.04 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 0.095299 0.111 0.00237 0.0037 8q loss 93 (9%) 987 0.22755 0.248 0.67821 0.689 5e-05 0.000103 0.091719 0.107 0.39613 0.416 0.5195 0.535 0.0092299 0.0127 0.01493 0.0198 0.37416 0.395 0.44724 0.467 0.36098 0.382 0.80226 0.806 9p loss 313 (29%) 767 5e-05 0.000103 0.04024 0.0494 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 5e-05 0.000103 0.19158 0.211 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00014 0.00027 9.9999e-06 2.35e-05 9q loss 280 (26%) 800 9.9999e-06 2.35e-05 0.0217 0.0278 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 8.9999e-05 0.000178 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 10p loss 175 (16%) 905 0.15893 0.178 0.88428 0.885 9.9999e-06 2.35e-05 0.00061999 0.00107 0.086789 0.102 0.18622 0.206 0.00012 0.000234 9.9999e-06 2.35e-05 0.00016 0.000303 0.078939 0.093 0.11133 0.127 0.23463 0.255 10q loss 231 (21%) 849 0.00011 0.000216 0.014 0.0187 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.0052999 0.00766 0.00078999 0.00133 11p loss 270 (25%) 810 0.33284 0.353 0.33905 0.36 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00316 0.00479 0.00333 0.00502 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 3e-05 6.45e-05 2e-05 4.45e-05 0.0179 0.0232 0.0247 0.0313 11q loss 366 (34%) 714 0.091009 0.106 0.10205 0.118 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.41287 0.433 0.15089 0.169 9.9999e-06 2.35e-05 0.00299 0.00458 0.02593 0.0327 0.0082299 0.0115 0.63186 0.645 0.12539 0.142 12p loss 153 (14%) 927 0.00017 0.000321 0.00165 0.00266 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 4e-05 8.36e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 12q loss 137 (13%) 943 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 13q loss 430 (40%) 650 0.0015 0.00243 0.066379 0.0789 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00435 0.00639 0.00047 0.000835 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00051999 0.000912 0.00066999 0.00115 14q loss 269 (25%) 811 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 15q loss 318 (29%) 762 0.00069999 0.0012 0.00021 0.000388 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 16p loss 174 (16%) 906 0.092929 0.108 0.20074 0.22 0.00336 0.00502 0.00041 0.000736 0.00046 0.00082 0.00247 0.00383 0.00023 0.000421 0.00225 0.00355 0.00012 0.000234 0.00434 0.00638 3e-05 6.45e-05 0.066139 0.0787 16q loss 591 (55%) 489 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00011 0.000216 0.062829 0.0753 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.0011 0.00181 3e-05 6.45e-05 17p loss 580 (54%) 500 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.24062 0.261 0.31265 0.333 17q loss 272 (25%) 808 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 0.0134 0.0179 18p loss 320 (30%) 760 0.00207 0.00328 0.0219 0.028 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00209 0.00331 0.02704 0.0339 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.01473 0.0196 9.9999e-06 2.35e-05 0.37827 0.398 0.80224 0.806 18q loss 321 (30%) 759 0.00092999 0.00155 0.0042 0.00621 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00062999 0.00109 0.00341 0.00509 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00429 0.00632 9.9999e-06 2.35e-05 0.26969 0.29 0.35047 0.371 19p loss 197 (18%) 883 0.00016 0.000303 0.36557 0.386 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00023 0.000421 7.9999e-05 0.00016 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 19q loss 164 (15%) 916 0.01295 0.0174 0.17474 0.195 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.0054199 0.00782 0.00231 0.00363 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 0.00013 0.000252 2e-05 4.45e-05 20p loss 93 (9%) 987 0.02991 0.0372 0.0071299 0.01 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00042 0.000751 0.00019 0.000354 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 9.9999e-06 2.35e-05 8.9999e-05 0.000178 0.00126 0.00206 20q loss 57 (5%) 1023 0.47475 0.493 0.00077999 0.00132 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00066999 0.00115 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00234 0.00366 21q loss 179 (17%) 901 0.03901 0.0481 0.77287 0.779 9.9999e-06 2.35e-05 0.00071999 0.00123 0.54331 0.557 0.68573 0.694 0.057979 0.0699 0.0069199 0.00978 0.02408 0.0306 0.00127 0.00207 0.2216 0.241 0.097169 0.113 22q loss 482 (45%) 598 0.01812 0.0235 0.32721 0.348 9.9999e-06 2.35e-05 0.18874 0.208 0.18394 0.204 0.00018 0.000337 0.01333 0.0179 4e-05 8.36e-05 0.00375 0.00558 0.02602 0.0327 0.03686 0.0456 0.27188 0.292 xp loss 192 (18%) 888 0.01956 0.0252 0.01947 0.0251 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00019 0.000354 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 9.9999e-06 2.35e-05 0.00080999 0.00136 0.00137 0.00223 0.00101 0.00167 xq loss 189 (18%) 891 0.03383 0.0419 0.87196 0.875 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 0.00421 0.00622 0.00055999 0.000975 9.9999e-06 2.35e-05 2e-05 4.45e-05 3e-05 6.45e-05 0.00241 0.00375 0.01056 0.0144 0.00283 0.00436