Hybridization REF p difference q subclass Composite Element REF p difference q subclass COPS5|JAB1 0.000782444105738241 0.954295517738095 0.0051803195966118 2 NDRG1|NDRG1_PT346 0.00128573437649579 0.941790857928571 0.00609724472907105 2 MSH2|MSH2 0.000173009775431252 0.894029744690476 0.00221452512552003 2 RPS6|S6_PS235_S236 0.000586365051765742 0.880057562809524 0.0045032835975609 2 RPS6|S6_PS240_S244 0.00154818789124053 0.87812460952381 0.00691283895623679 2 ESR1|ER-ALPHA 0.00244687672410929 0.842471443238095 0.00903462175055738 2 EGFR|EGFR_PY1068 0.00129273982131127 0.839301063595238 0.00609724472907105 2 TP53|P53 0.000425412746943537 0.788223840285714 0.0037126930642345 2 SRC|SRC_PY416 2.49526074894786e-05 0.767388508928571 0.000929358801555331 2 ARHI|ARHI 0.00071212093757128 0.693149753119048 0.00506397111161799 2 CDKN1A|P21 0.0232143567921771 0.643686119714286 0.0484514896414422 2 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473 0.00177415204131314 0.630799896857143 0.0075697153762694 2 SCD1|SCD1 0.00124379340457059 0.561672230142857 0.00609724472907105 2 JUN|C-JUN_PS73 0.000378999938773881 0.552737360952381 0.0034651422973612 2 MAPK1 MAPK3|MAPK_PT202_Y204 0.0027049853808772 0.529074413880952 0.00944285805688041 2 SFRS1|SF2 5.83072512770728e-05 0.513515576880953 0.00108784763741094 2 BAP1|BAP1-C-4 0.00384999919914717 0.508070709928571 0.0119225781651009 2 SMAD4|SMAD4 0.00163925788771694 0.47883105097619 0.00715312532821937 2 ARAF|A-RAF_PS299 0.00130201580152038 0.476413286547619 0.00609724472907105 2 INPP4B|INPP4B 0.000353126387477064 0.459350449476191 0.00339001331977981 2 TSC2|TUBERIN_PT1462 0.000565435124830401 0.456769509714286 0.0045032835975609 2 RB1|RB_PS807_S811 0.00212130155578341 0.423438150690476 0.0086657425257535 2 FRAP1|MTOR_PS2448 0.00129185149172583 0.417713172738095 0.00609724472907105 2 PECAM1|CD31 0.00107782714369939 0.415444633071429 0.00609724472907105 2 SHC1|SHC_PY317 7.89262459076691e-06 0.409590046571429 0.000378845980356812 2 BCL2|BCL-2 0.000197666662310121 0.4085785635 0.00237199994772145 2 FOXM1|FOXM1 0.00190588028310903 0.405125988071429 0.00795497857297682 2 FOXO3|FOXO3A 0.000493847609768541 0.391850907619048 0.00412255395980695 2 ANXA1|ANNEXIN_1 0.00437388819954664 0.372829080619048 0.0131216645986399 2 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363 0.00137150950995594 0.366980463809524 0.00626975775979858 2 GSK3A GSK3B|GSK3_PS9 0.00780141110778769 0.364178136333333 0.0210432168704174 2 XBP1|XBP1 0.00763406869941647 0.363843341785714 0.0209391598612566 2 PRDX1|PRDX1 0.00482709079395117 0.328196340952381 0.0138328572005765 2 CDH2|N-CADHERIN 0.000703829954253581 0.328046253833333 0.00506397111161799 2 CDKN1B|P27_PT157 0.00116048524673572 0.316751594714286 0.00609724472907105 2 RAD51|RAD51 0.0291473333352647 0.305894105690476 0.055709573362161 2 GATA3|GATA3 0.00239300319554348 0.302359920095238 0.00903462175055738 2 YWHAB|14-3-3_BETA 0.00073882033425431 0.287354735642857 0.00506619657774384 2 EEF2K|EEF2K 0.0340308003987474 0.282666587190476 0.0628260930438414 2 NOTCH1|NOTCH1 0.00302743526588548 0.281981305619048 0.0101976766850879 2 BAK1|BAK 0.0105436778721749 0.254148343404762 0.0266366598875997 2 ACVRL1|ACVRL1 0.00817052059012147 0.241296717095238 0.0214895884014154 2 BECN1|BECLIN 0.0465444633367347 0.234239036595238 0.0819865776206703 2 YWHAE|14-3-3_EPSILON 0.00243704998491301 0.230926391642857 0.00903462175055738 2 PREX1|PREX1 0.0267587735785054 0.219924409119048 0.0527901394228649 2 CCNE1|CYCLIN_E1 0.0208048205411775 0.216186294261905 0.0459140867115641 2 TTF1|TTF1 0.00789120632640651 0.216129558785714 0.0210432168704174 2 CTNNB1|ALPHA-CATENIN 0.00256818081971322 0.210693100357143 0.00930359844122525 2 CHEK2|CHK2 0.0131723753781677 0.209752516357143 0.0320138743368126 2 RPS6KB1|P70S6K_PT389 0.0322977040561137 0.204477344833333 0.0602054289201343 2 NRAS|N-RAS 0.0211741326211429 0.191765472547619 0.046198107537039 2 CHEK1|CHK1_PS345 0.00714397049061397 0.180802333428571 0.019878874408665 2 ADAR|ADAR1 0.0026586540603186 0.167928746404762 0.00944285805688041 2 ETS1|ETS-1 0.0263979232930972 0.155968125190476 0.0527901394228649 2 MAPK8|JNK_PT183_PY185 0.0198711131294991 0.15379937147619 0.0445926492124155 2 ERCC1|ERCC1 0.0113351137829901 0.136354144714286 0.0279018185427449 2 MET|C-MET_PY1235 0.0042446473072829 -0.0891589963333333 0.0129360679841003 2 BIRC2 |CIAP 0.0243304126041931 -0.123955179833333 0.0496961619149476 2 ERRFI1|MIG-6 0.0399150269066277 -0.144311090880952 0.071623225851145 2 RAF1|C-RAF 0.0486536097407207 -0.150569852619048 0.0849226642747125 2 CHEK1|CHK1 0.0222512716206997 -0.152097565357143 0.0474693794574927 2 EEF2|EEF2 0.0176749521138913 -0.152867367809524 0.0408866362152666 2 WWTR1|TAZ 0.00298359319950047 -0.170425648857143 0.0101976766850879 2 STMN1|STATHMIN 0.0166056285820681 -0.17868372847619 0.0393614899723096 2 PARK7|DJ-1 0.0144082708034038 -0.186582062404762 0.0345798499281691 2 YAP1|YAP 0.00450709549806626 -0.188837836595238 0.0133132667019803 2 KDR|VEGFR2 0.0199737907930611 -0.194924629 0.0445926492124155 2 XRCC1|XRCC1 0.00372827796391323 -0.222247021309524 0.0117884897949178 2 ERBB3|HER3_PY1289 7.12688436963712e-10 -0.226321854238095 1.36836179897033e-07 2 EIF4E|EIF4E 0.0023604714740374 -0.229044651357143 0.00903462175055738 2 NRG1|HEREGULIN 0.0260276483998441 -0.239690815666667 0.0526032472923165 2 STK11|LKB1 7.98954518379672e-05 -0.24058324847619 0.00127832722940748 2 NF2|NF2 0.0289195644346961 -0.260960855333333 0.055709573362161 2 MAP2K1|MEK1_PS217_S221 0.00125155087365031 -0.277062498095238 0.00609724472907105 2 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65 0.000121681480112581 -0.279840233047619 0.00166877458440111 2 MSH6|MSH6 0.0232163387865244 -0.289426542952381 0.0484514896414422 2 SRC|SRC 0.022213646452135 -0.293197443761905 0.0474693794574927 2 EGFR|EGFR_PY1173 0.000108331436200381 -0.29353337597619 0.00159997198080563 2 SMAD1|SMAD1 2.90424625486041e-05 -0.333421232333333 0.000929358801555331 2 PDK1|PDK1 0.0170335461326215 -0.340763948904762 0.0398834250910162 2 PDK1|PDK1_PS241 0.0110568585166872 -0.345459992976191 0.0275703485091421 2 MAP2K1|MEK1 0.00114349606170874 -0.362726144142857 0.00609724472907105 2 TP53BP1|53BP1 0.0198021259490444 -0.376841711809524 0.0445926492124155 2 RICTOR|RICTOR_PT1135 4.62896710120755e-05 -0.389340995357143 0.00105582077058029 2 PIK3R1|PI3K-P85 2.46211996650278e-06 -0.392056807333333 0.000236363516784267 2 RPTOR|RAPTOR 0.00096126980183821 -0.409098802166667 0.00609724472907105 2 YWHAZ|14-3-3_ZETA 0.0269449669970873 -0.411319596047619 0.0527901394228649 2 RAB11A RAB11B|RAB11 0.00373238800560685 -0.418956450380952 0.0117884897949178 2 PRKAA1|AMPK_ALPHA 4.52032334949722e-05 -0.426657316547619 0.00105582077058029 2 ERBB2|HER2_PY1248 0.00472846297847084 -0.43847192897619 0.0137555286646424 2 RICTOR|RICTOR 0.044168134767964 -0.443471345285714 0.0785211284763804 2 C12ORF5|TIGAR 6.23246042266682e-05 -0.443798339666667 0.00108784763741094 2 SMAD3|SMAD3 0.00239371173279519 -0.444620613452381 0.00903462175055738 2 XRCC5|KU80 0.0362257985806341 -0.4605908405 0.0662414602617309 2 BID|BID 5.79518207547009e-06 -0.471056281547619 0.000370891652830086 2 TSC1|TSC1 0.00374530144526035 -0.474834210595238 0.0117884897949178 2 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA 4.94915986209509e-05 -0.487807641380952 0.00105582077058029 2 ACACA|ACC1 0.00933813506807741 -0.487981918333333 0.0239056257742782 2 PEA15|PEA15 0.000278213020901865 -0.496672343833333 0.00296760555628656 2 RPS6|S6 0.00872158937959955 -0.516641682357143 0.0226289886605826 2 BAX|BAX 0.00113404020166999 -0.520283689809524 0.00609724472907105 2 MAPK14|P38 0.000217509435419471 -0.588677716 0.00245657715297285 2 PRKAA1|AMPK_PT172 0.0395123506559302 -0.590140089904762 0.0715695408107415 2 GAPDH|GAPDH 0.023569638199323 -0.603584573952381 0.0486598982179572 2 SQSTM1|P62-LCK-LIGAND 0.0320284878480329 -0.657477946547619 0.0602054289201343 2 HSPA1A|HSP70 0.00622991854923772 -0.733460243619048 0.0175903582566712 2 BCL2L1|BCL-XL 0.000341668368451768 -0.797338852285714 0.00339001331977981 2 CLDN7|CLAUDIN-7 0.0293055568207201 -0.9038265585 0.055709573362161 2 SERPINE1|PAI-1 0.000996335236818919 -1.13621065159524 0.00609724472907105 2 MYH11|MYH11 0.00321309026624791 -1.29759745785714 0.0106364367434414 2 SQSTM1|P62-LCK-LIGAND 0.00713579294579219 1.92744177470179 0.0856295153495063 3 PDCD4|PDCD4 0.00881378078082089 0.613733142944643 0.0903172579165013 3 BAX|BAX 0.000518811228643581 0.513083112601786 0.0186360800585343 3 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA 0.00307326983667882 0.388890536016071 0.0491723173868611 3 MAPK14|P38 0.000649527316513521 0.344243203708929 0.0186360800585343 3 PKC|PKC-PAN_BETAII_PS660 0.0383472371616915 0.311886385966071 0.222400448797166 3 NF2|NF2 0.000415055195005955 0.308046469444643 0.0186360800585343 3 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9 0.0198900447754849 0.288012613273214 0.166038634647526 3 PTEN|PTEN 0.0393834128078314 0.275732360751786 0.222400448797166 3 BCL2L11|BIM 0.0463684178150117 0.2698547246375 0.224928414009856 3 SRC|SRC 0.011596140440047 0.266956171123214 0.111322948224451 3 MYH9|MYOSIN-IIA_PS1943 0.0493158061648184 0.263916050730357 0.225443685324884 3 PIK3R1|PI3K-P85 0.034886571596507 0.257517447716071 0.209319429579042 3 YWHAZ|14-3-3_ZETA 0.0231640725259174 0.247362629494643 0.173204970682207 3 MSH6|MSH6 0.0231779260661219 0.244471095880357 0.173204970682207 3 MS4A1|CD20 0.0244277465442095 -0.109179767126786 0.173204970682207 3 PGR|PR 0.0181829845203037 -0.119142213076786 0.158687864904469 3 MAPK1|ERK2 0.0424659194705081 -0.127299912955357 0.224928414009856 3 MRE11A|MRE11 0.0445646933653076 -0.129841533176786 0.224928414009856 3 NRAS|N-RAS 0.0252590582244885 -0.146187028305357 0.173204970682207 3 SFRS1|SF2 0.0480716708147937 -0.155786190055357 0.225116116986351 3 CDKN1B|P27_PT157 0.00402079964484711 -0.164909916733929 0.0537693625389001 3 SMAD4|SMAD4 0.0239521200540388 -0.165179082169643 0.173204970682207 3 JUN|C-JUN_PS73 0.0468600862520534 -0.168539927948214 0.224928414009856 3 MYC|C-MYC 0.0149949639746072 -0.169270534369643 0.137096813482123 3 YWHAB|14-3-3_BETA 0.00211916479385921 -0.188398915526786 0.036989058220088 3 BAK1|BAK 0.00102118834265128 -0.193009901805357 0.0245085202236307 3 TTF1|TTF1 0.000576161960886501 -0.194568570669643 0.0186360800585343 3 INPP4B|INPP4B 0.0464387757097053 -0.206922127348214 0.224928414009856 3 FOXO3|FOXO3A 0.00202218328952474 -0.220428406583929 0.036989058220088 3 SCD1|SCD1 0.00420073144835157 -0.221360663555357 0.0537693625389001 3 TSC2|TUBERIN_PT1462 0.0036657848864439 -0.242886026255357 0.0537693625389001 3 NOTCH1|NOTCH1 0.000188888326697822 -0.247948573326786 0.0186360800585343 3 FOXM1|FOXM1 0.00153047894513093 -0.248501173183929 0.0326502174961265 3 PECAM1|CD31 0.000401877630601435 -0.251841928291071 0.0186360800585343 3 MSH2|MSH2 0.0438191548168561 -0.260342028276786 0.224928414009856 3 COPS5|JAB1 0.0328452686744382 -0.280769959833928 0.203428760822327 3 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473 0.0279908452459278 -0.323710750205357 0.185318699559246 3 EGFR|EGFR_PY1068 0.00893764531465378 -0.327964608869643 0.0903172579165013 3 ARHI|ARHI 0.000679440418800728 -0.338080320426786 0.0186360800585343 3 ESR1|ER-ALPHA 0.00861893052645718 -0.346997083726786 0.0903172579165013 3 XBP1|XBP1 0.0293297012249073 -0.361712651576786 0.187710087839407 3 CDH1|E-CADHERIN 0.000159801722218039 0.850038727555556 0.00906083559652973 4 SERPINE1|PAI-1 0.0484657098228153 0.815718128222222 0.101145829195441 4 CLDN7|CLAUDIN-7 0.00603114618892701 0.757291419 0.0303857510640933 4 TP53BP1|53BP1 0.000213917328233725 0.718593730388889 0.00906083559652973 4 BCL2L1|BCL-XL 0.000613494076848367 0.6148820575 0.00906083559652973 4 PXN|PAXILLIN 0.00648021824243565 0.599484896944444 0.0311050475636911 4 EIF4G1|EIF4G 0.00346488196739376 0.572489920611111 0.0229399081979173 4 RPS6|S6 0.000948245198621131 0.561220935333333 0.0107095928314857 4 XRCC5|KU80 0.000354791668122842 0.539181489666667 0.00906083559652973 4 TUBA1B|ACETYL-A-TUBULIN(LYS40) 0.0398255767043712 0.534765670722222 0.0902658472536937 4 TSC2|TUBERIN 0.00304037325364454 0.515762264222222 0.0227182895682094 4 CTNNB2|BETA-CATENIN 0.00873272604377112 0.502713284833333 0.0372596311200901 4 RBM15|RBM15 0.00149721086472936 0.490831456888889 0.0147331124100992 4 ATM|ATM 0.039961442794604 0.453358722777778 0.0902658472536937 4 EEF2K|EEF2K 0.00739095227327036 0.425289712222222 0.0337872103920931 4 PRKAA1|AMPK_PT172 0.0212644995929994 0.420379046944445 0.0586214246536369 4 RPS6KB1|P70S6K 0.0103562473976116 0.417393030666667 0.040579581639621 4 ITGA2|CD49B 0.0293412919737121 0.411027762833333 0.0722247187045221 4 RAB25|RAB25 0.0268385455901384 0.409700579388889 0.0669220877052802 4 ERBB2|HER2 0.0322087817157711 0.390911850222222 0.0773010761178506 4 DVL3|DVL3 0.000849889265721184 0.361560257 0.0101986711886542 4 TSC1|TSC1 0.00377961478585041 0.339334143722222 0.0234092270607509 4 BRAF|B-RAF 0.0116875980417567 0.332969491333333 0.0412945946161452 4 PDK1|PDK1_PS241 0.000696297447760452 0.329639804111111 0.0091944870020609 4 PTEN|PTEN 0.0230201647194151 0.308352242944444 0.0615669519456744 4 EIF4EBP1|4E-BP1 0.0255335021068837 0.280389063222222 0.0653657653936223 4 KDR|VEGFR2 0.0260977118348568 0.269275642833333 0.065931061477533 4 ERBB3|HER3 0.0352298568598241 0.259128760444444 0.0814955724950148 4 FRAP1|MTOR 0.0197371792025055 0.250822819666667 0.0579326922641935 4 MSH6|MSH6 0.0464257623205177 0.236004026888889 0.0990416262837711 4 SMAD1|SMAD1 0.000386984002761361 0.232952400277778 0.00906083559652973 4 PDK1|PDK1 0.0016114341698546 0.228817172777778 0.0147331124100992 4 AKT1 AKT2 AKT3|AKT 0.00609051567916652 0.227100454166667 0.0303857510640933 4 MAPK9|JNK2 0.00717403200153692 0.225339646944444 0.0335954669340265 4 XRCC1|XRCC1 0.0111185414899235 0.216826970888889 0.0406722465183237 4 SMAD3|SMAD3 0.00988233677893222 0.208207449055556 0.040579581639621 4 EEF2|EEF2 0.0406353989144084 0.175057192722222 0.0907208905996094 4 PRKAA1|AMPK_ALPHA 0.0230876069796279 0.171590771111111 0.0615669519456744 4 CCNE2|CYCLIN_E2 0.00574423719481605 0.166734117611111 0.0303857510640933 4 RPTOR|RAPTOR 0.0242388565638856 0.166110319055556 0.0637515131543293 4 ESR1|ER-ALPHA_PS118 0.00993740534609975 0.165804235555556 0.040579581639621 4 BIRC2 |CIAP 0.0447277549981076 0.103342156111111 0.0987095282716857 4 CHEK2|CHK2_PT68 0.0461891585008866 -0.0851787023888889 0.0990416262837711 4 PGR|PR 0.0302238604480919 -0.0919821888888889 0.0734554583042234 4 RAF1|C-RAF_PS338 0.0203528388610769 -0.117192464611111 0.0579326922641935 4 CDC2|CDK1 0.0205178285102352 -0.123041792888889 0.0579326922641935 4 TTF1|TTF1 0.0254239117718894 -0.133419418333333 0.0653657653936223 4 YWHAE|14-3-3_EPSILON 0.000507981120051733 -0.146626218166667 0.00906083559652973 4 YWHAB|14-3-3_BETA 0.0155284484601881 -0.158945510333333 0.0488764279402642 4 FRAP1|MTOR_PS2448 0.0452629516598186 -0.159629147555555 0.0987555308941497 4 MAPK8|JNK_PT183_PY185 0.000515708495475083 -0.162252249277778 0.00906083559652973 4 NRAS|N-RAS 0.0109633802991126 -0.168646647277778 0.0406722465183237 4 FOXO3|FOXO3A 0.0165914991068432 -0.175921816444444 0.0513801262663531 4 BCL2|BCL-2 0.010166384250583 -0.190967435333333 0.040579581639621 4 SMAD4|SMAD4 0.0124934614286857 -0.191614357277778 0.042834724898351 4 CDH2|N-CADHERIN 0.0204295772329264 -0.203744490944444 0.0579326922641935 4 KIT|C-KIT 0.0118291807494166 -0.2105975455 0.0412945946161452 4 TSC2|TUBERIN_PT1462 0.00804496338360563 -0.2106680605 0.0359216969686577 4 JUN|C-JUN_PS73 0.0106435429620785 -0.212077286888889 0.0406722465183237 4 FOXM1|FOXM1 0.0140100788114477 -0.218802279666667 0.0455921208779315 4 SCD1|SCD1 0.0112272347159956 -0.219430102666667 0.0406722465183237 4 ETS1|ETS-1 0.00121155490118278 -0.225393381944444 0.012923252279283 4 SFRS1|SF2 0.00309595851679754 -0.236920500055556 0.0227182895682094 4 PREX1|PREX1 0.00331275366903408 -0.254235262444444 0.0227182895682094 4 ARHI|ARHI 0.0181239111196174 -0.255214310444444 0.0543717333588522 4 NFKB1|NF-KB-P65_PS536 0.0331470967947498 -0.277339100222222 0.0785708961060736 4 RPS6KA1|P90RSK_PT359_S363 0.0018221950039606 -0.282013054722222 0.015902792761838 4 ACVRL1|ACVRL1 0.00042068629345811 -0.284926000888889 0.00906083559652973 4 COPS5|JAB1 0.0351996559741787 -0.300201746055556 0.0814955724950148 4 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PT308 0.00226519925314097 -0.313450463388889 0.0189094894175246 4 ARAF|A-RAF_PS299 4.15185807561466e-05 -0.320699224611111 0.00797156750518015 4 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9 0.00331308389536387 -0.338971166722222 0.0227182895682094 4 ANXA1|ANNEXIN_1 0.00617210568489396 -0.345418047111111 0.0303857510640933 4 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473 0.0139194549759763 -0.358677554666667 0.0455921208779315 4 RB1|RB_PS807_S811 0.00367034925038507 -0.362179760944444 0.0234092270607509 4 CCND1|CYCLIN_D1 0.00434072567120457 -0.367727543777778 0.0252551311779175 4 PDCD4|PDCD4 0.0154310472706808 -0.394826142444444 0.0488764279402642 4 GSK3A GSK3B|GSK3_PS9 0.00405867932185854 -0.396288480277778 0.0243520759311512 4 PRDX1|PRDX1 0.00461090488213456 -0.397846954888889 0.0260380510991128 4 EIF4EBP1|4E-BP1_PT37_T46 0.017476961180984 -0.410081443333333 0.0532631197896655 4 ESR1|ER-ALPHA 0.00314750367830146 -0.410427196222222 0.0227182895682094 4 RAD51|RAD51 0.00156171481359026 -0.431513922111111 0.0147331124100992 4 SRC|SRC_PY416 0.00583470379814436 -0.4573495585 0.0303857510640933 4 HSPA1A|HSP70 0.0471822105258999 -0.473272461222222 0.0995492793513492 4 MAPK1 MAPK3|MAPK_PT202_Y204 0.000608884882417834 -0.487241717222222 0.00906083559652973 4 MAPK14|P38_PT180_Y182 0.0131621974683202 -0.503930314611111 0.0443358230511838 4 G6PD|G6PD 0.000718319297036008 -0.537405602277778 0.0091944870020609 4 RPS6|S6_PS240_S244 0.000261705882924069 -0.573913908888889 0.00906083559652973 4 RPS6|S6_PS235_S236 0.000534057572619124 -0.617454316222222 0.00906083559652973 4 NDRG1|NDRG1_PT346 0.0213723944049718 -0.640314942166667 0.0586214246536369 4 CDKN1A|P21 0.00846768431446733 -0.647802847166667 0.0369498951904029 4 SRC|SRC_PY527 0.000224313632449122 -0.726751321111111 0.00906083559652973 4