Clinical Features Time to Death YEARS_TO_BIRTH TUMOR_TISSUE_SITE PATHOLOGIC_STAGE PATHOLOGY_T_STAGE PATHOLOGY_N_STAGE PATHOLOGY_M_STAGE GENDER RADIATION_THERAPY HISTOLOGICAL_TYPE RESIDUAL_TUMOR NUMBER_OF_LYMPH_NODES ETHNICITY nCNV (%) nWild-Type logrank test_P logrank test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q amp_1q31.1 145 (24%) 469 0.3281 0.557 0.34797 0.579 0.065417 0.201 0.28929 0.51 0.44911 0.67 0.066139 0.203 0.037231 0.134 0.18308 0.385 0.18643 0.389 0.1181 0.289 0.77184 0.915 0.017806 0.0809 1 1 amp_2q33.1 140 (23%) 474 0.13979 0.318 0.92517 1 0.021954 0.0938 0.081929 0.228 0.82717 0.944 0.00116 0.0105 0.26037 0.472 0.84764 0.955 0.26072 0.472 0.00348 0.0249 0.22165 0.43 0.004999 0.0334 0.1134 0.281 amp_5p12 116 (19%) 498 0.10728 0.271 0.1326 0.31 0.035691 0.131 0.099959 0.26 0.68534 0.853 0.04622 0.153 0.035245 0.13 0.60706 0.798 0.14044 0.319 0.01368 0.0677 0.063389 0.196 0.0089451 0.0514 1 1 amp_6p21.1 154 (25%) 460 0.92217 1 0.77415 0.916 0.025486 0.104 0.00238 0.0194 0.32839 0.557 0.00015 0.00219 0.014646 0.0714 0.19158 0.393 0.18643 0.389 0.0057199 0.0362 0.21113 0.42 0.00024829 0.00332 0.33134 0.561 amp_7p21.3 361 (59%) 253 0.83961 0.949 0.08787 0.238 0.019901 0.0879 2e-05 0.00048 0.90699 0.994 9.9999e-06 0.000284 0.0094034 0.0533 0.80542 0.934 0.25141 0.461 0.00035 0.00443 0.28848 0.51 8.9357e-05 0.00137 1 1 amp_8p11.23 210 (34%) 404 0.93779 1 0.8046 0.934 0.63016 0.815 0.4662 0.686 0.59826 0.791 0.51459 0.723 0.71047 0.869 0.55103 0.758 0.68831 0.854 0.18653 0.389 0.077979 0.221 0.70341 0.865 0.65743 0.829 amp_8p11.21 254 (41%) 360 0.82496 0.944 0.48678 0.699 0.64306 0.823 0.23073 0.438 0.47647 0.691 0.35775 0.586 0.098535 0.258 0.16396 0.355 0.84672 0.955 0.12831 0.302 0.03137 0.12 0.4511 0.672 0.40329 0.625 amp_8q24.21 366 (60%) 248 0.16059 0.35 0.15397 0.342 0.062084 0.194 0.01016 0.055 0.22757 0.434 0.12199 0.296 0.0062165 0.0378 0.18769 0.389 1 1 0.0056499 0.036 0.12838 0.302 0.14366 0.324 1 1 amp_10q22.3 40 (7%) 574 0.70679 0.868 0.47161 0.689 0.85482 0.958 0.46286 0.684 0.27982 0.499 0.099239 0.259 0.47287 0.689 0.62433 0.809 0.65284 0.825 0.94564 1 0.87688 0.976 0.11999 0.293 0.29531 0.517 amp_11p15.5 136 (22%) 478 0.95354 1 0.020567 0.0895 0.076076 0.22 0.91788 1 0.33557 0.565 0.37746 0.603 0.26525 0.478 0.69841 0.864 0.82267 0.944 0.00088999 0.00871 0.87029 0.972 0.35461 0.583 1 1 amp_12p13.33 153 (25%) 461 0.30984 0.537 0.12838 0.302 0.91544 1 0.17491 0.372 0.36103 0.587 0.15593 0.343 1 1 1 1 0.18013 0.38 0.61093 0.799 0.63558 0.817 0.35099 0.579 0.33748 0.567 amp_13q12.13 401 (65%) 213 0.94951 1 0.46603 0.686 0.0007382 0.00759 0.00013 0.00196 0.82137 0.944 2e-05 0.00048 0.0021309 0.0178 0.67141 0.84 0.2203 0.429 9.9999e-06 0.000284 0.03989 0.139 5.5597e-05 0.00102 1 1 amp_13q12.2 395 (64%) 219 0.95536 1 0.42982 0.65 0.00055603 0.00596 0.00014 0.00208 0.88715 0.982 4e-05 0.000797 0.005187 0.034 0.4476 0.669 0.15747 0.344 9.9999e-06 0.000284 0.076909 0.221 5.2511e-05 0.000983 0.66846 0.839 amp_13q22.1 397 (65%) 217 0.76207 0.906 0.80013 0.93 0.016679 0.0777 0.00041 0.00492 0.72355 0.878 3e-05 0.000653 0.010882 0.0575 0.20468 0.412 0.045917 0.153 9.9999e-06 0.000284 0.22222 0.431 0.00024576 0.00332 1 1 amp_15q26.1 42 (7%) 572 0.24912 0.46 0.78507 0.924 0.47532 0.691 0.34947 0.579 0.38958 0.613 0.00259 0.0205 0.65274 0.825 0.20118 0.407 0.69293 0.859 0.53502 0.743 0.57191 0.77 0.0036146 0.0256 1 1 amp_16p11.2 172 (28%) 442 0.57883 0.776 0.48374 0.697 0.76001 0.906 0.0011 0.0102 0.74913 0.898 3e-05 0.000653 0.049364 0.161 1 1 0.83456 0.948 0.00049 0.00546 0.54942 0.757 5.8462e-05 0.00102 0.62209 0.809 amp_17q12 160 (26%) 454 0.10119 0.26 0.19492 0.397 0.46728 0.686 0.21715 0.428 0.18398 0.386 0.16576 0.357 0.0029669 0.0217 0.097404 0.256 1 1 0.24989 0.46 0.077169 0.221 0.24786 0.459 0.1134 0.281 amp_17q24.1 144 (23%) 470 0.012226 0.0636 0.27223 0.489 1 1 0.70726 0.868 0.70947 0.869 0.93168 1 0.069833 0.209 0.70317 0.865 0.82449 0.944 0.069199 0.209 0.15257 0.339 0.64603 0.824 0.10129 0.26 amp_19q12 139 (23%) 475 0.37464 0.601 0.56804 0.767 0.12698 0.302 0.37203 0.599 0.849 0.955 0.10101 0.26 0.023637 0.0992 0.24638 0.459 0.81807 0.944 0.02296 0.0972 0.2426 0.456 0.29521 0.517 0.59902 0.791 amp_20p12.1 278 (45%) 336 0.9221 1 0.5552 0.759 0.1669 0.359 0.01258 0.064 0.87716 0.976 0.076839 0.221 0.00061843 0.00643 0.02828 0.113 0.086341 0.236 0.01285 0.065 0.1245 0.3 0.1267 0.302 1 1 amp_20p11.21 362 (59%) 252 0.93512 1 0.87395 0.975 0.0089355 0.0514 0.01852 0.0833 0.61388 0.801 0.38092 0.603 0.0013461 0.012 0.048506 0.159 0.33472 0.565 9.9999e-06 0.000284 0.45263 0.674 0.71382 0.869 0.65201 0.825 amp_20q11.21 467 (76%) 147 0.88593 0.982 0.68508 0.853 3.266e-06 0.000284 0.0026 0.0205 0.19002 0.392 0.00074999 0.00763 0.0059751 0.037 0.21831 0.428 0.50351 0.712 9.9999e-06 0.000284 0.070699 0.21 0.0043544 0.03 1 1 amp_20q12 469 (76%) 145 0.72656 0.879 0.58499 0.78 1.651e-06 0.000284 0.00047 0.00543 0.26307 0.475 0.00029 0.00382 0.00089337 0.00871 0.21635 0.427 0.50382 0.712 9.9999e-06 0.000284 0.069259 0.209 0.0045496 0.0311 1 1 amp_20q13.12 471 (77%) 143 0.96597 1 0.69778 0.864 2.6182e-06 0.000284 0.00024 0.00332 0.38037 0.603 0.00017 0.00245 0.0004638 0.00543 0.2144 0.425 0.50525 0.712 9.9999e-06 0.000284 0.069839 0.209 0.0013973 0.0123 1 1 del_1p36.11 243 (40%) 371 0.13423 0.312 0.055983 0.177 0.091328 0.244 0.00295 0.0217 0.28985 0.51 0.00461 0.0313 4.3826e-05 0.000855 0.13675 0.314 0.56592 0.767 0.00098999 0.00936 0.10861 0.273 0.00060622 0.00638 1 1 del_1p33 176 (29%) 438 0.031446 0.12 0.64514 0.824 0.36103 0.587 0.0419 0.144 0.28386 0.504 0.03788 0.134 0.014303 0.0701 0.5317 0.739 0.83456 0.948 0.0099499 0.0542 0.24037 0.453 0.0098716 0.0542 0.15753 0.344 del_1p13.2 175 (29%) 439 0.019906 0.0879 0.80023 0.93 0.22363 0.432 0.01501 0.0728 0.1566 0.344 0.01317 0.0659 0.0099599 0.0542 0.47393 0.69 0.83383 0.948 0.050989 0.164 0.41043 0.632 0.00077907 0.00784 0.63574 0.817 del_2p12 21 (3%) 593 0.71107 0.869 0.12753 0.302 0.0005607 0.00596 0.26733 0.481 1 1 0.46805 0.686 0.75592 0.905 0.66139 0.833 0.075378 0.22 0.0060799 0.0372 0.89004 0.982 0.38955 0.613 1 1 del_2q22.1 35 (6%) 579 0.53647 0.744 0.82501 0.944 0.55436 0.759 0.27672 0.494 0.42071 0.641 0.54146 0.75 0.33333 0.563 0.72784 0.879 1 1 0.89124 0.982 0.93517 1 0.23275 0.441 1 1 del_3p26.3 92 (15%) 522 0.043601 0.148 0.62063 0.808 0.36611 0.594 0.04251 0.146 0.097189 0.256 0.01344 0.0669 0.00024418 0.00332 0.49742 0.71 0.59923 0.791 0.03814 0.134 0.073799 0.217 0.0067782 0.0407 0.1713 0.366 del_3p14.2 118 (19%) 496 0.35916 0.586 0.3497 0.579 0.72686 0.879 0.39641 0.617 0.13572 0.313 0.25201 0.461 0.01599 0.0752 0.35808 0.586 1 1 0.6031 0.794 0.3702 0.598 0.10009 0.26 1 1 del_3q26.31 64 (10%) 550 0.73711 0.886 0.52991 0.738 1 1 0.04831 0.159 0.10211 0.261 0.073359 0.216 0.020881 0.0901 0.43 0.65 0.7583 0.906 0.0095099 0.0536 0.60818 0.798 0.093924 0.249 1 1 del_4p16.1 201 (33%) 413 0.41035 0.632 0.90311 0.992 0.078861 0.222 0.00295 0.0217 0.93184 1 0.00109 0.0102 0.0011277 0.0103 0.070931 0.21 0.040332 0.14 0.02398 0.0995 0.22819 0.434 0.00038989 0.00487 0.17636 0.374 del_4q22.1 223 (36%) 391 0.34399 0.574 0.1872 0.389 0.027862 0.111 0.02121 0.0911 0.15568 0.343 0.00052999 0.00577 0.11498 0.283 0.11014 0.275 0.23488 0.443 0.00231 0.019 0.63847 0.82 0.00031547 0.00404 0.36812 0.596 del_4q35.1 231 (38%) 383 0.89178 0.982 0.14667 0.328 0.10721 0.271 0.051049 0.164 0.52681 0.735 0.00081999 0.00817 0.071211 0.21 0.93358 1 0.16707 0.359 0.04827 0.159 0.89179 0.982 0.00042922 0.00509 0.37873 0.603 del_5q12.1 158 (26%) 456 0.24684 0.459 0.20368 0.411 0.027673 0.111 0.01074 0.0573 0.97927 1 0.03256 0.123 0.010537 0.0567 0.57922 0.776 1 1 0.0077899 0.0456 0.39266 0.614 0.015844 0.0752 0.13627 0.313 del_5q21.2 186 (30%) 428 0.12184 0.296 0.21049 0.42 0.27441 0.491 0.00245 0.0198 0.82453 0.944 0.00147 0.0127 0.010777 0.0573 0.79256 0.928 0.83773 0.948 0.062319 0.194 0.46128 0.683 0.0014225 0.0124 0.18024 0.38 del_5q22.2 188 (31%) 426 0.10261 0.261 0.50827 0.715 0.074731 0.219 0.01542 0.074 0.76176 0.906 0.03485 0.129 0.015977 0.0752 0.38046 0.603 0.83726 0.948 0.04584 0.153 0.2164 0.427 0.020141 0.0885 0.18024 0.38 del_5q23.3 160 (26%) 454 0.34137 0.572 0.377 0.603 0.036806 0.133 0.0052699 0.0343 0.86624 0.969 0.0060299 0.0371 0.14313 0.324 0.71285 0.869 0.66344 0.834 0.01756 0.0806 0.35843 0.586 0.0051423 0.034 0.12621 0.302 del_6p25.3 79 (13%) 535 0.2268 0.433 0.043005 0.147 0.88963 0.982 0.47758 0.692 0.50205 0.712 0.49184 0.704 1 1 0.053529 0.17 0.085576 0.234 0.42682 0.649 0.4664 0.686 0.41314 0.635 1 1 del_6q26 91 (15%) 523 0.03761 0.134 0.71744 0.872 0.29852 0.521 0.25073 0.46 0.19124 0.393 0.00152 0.0129 0.093622 0.249 0.21093 0.42 0.025226 0.104 0.03147 0.12 0.19451 0.397 0.0020756 0.0175 1 1 del_7q31.1 17 (3%) 597 0.70223 0.865 0.68756 0.854 1 1 0.78682 0.925 0.42948 0.65 0.8921 0.982 1 1 0.63264 0.817 0.047168 0.156 0.50515 0.712 0.66297 0.834 0.56936 0.768 0.0082237 0.0478 del_8p23.2 288 (47%) 326 0.077913 0.221 0.169 0.362 7.2727e-05 0.00117 9.9999e-06 0.000284 0.082809 0.229 9.9999e-06 0.000284 6.2694e-05 0.00105 0.029053 0.115 0.8497 0.955 2e-05 0.00048 0.0057699 0.0362 3.4675e-06 0.000284 0.18974 0.392 del_8p22 302 (49%) 312 0.017501 0.0806 0.15453 0.342 0.00047631 0.00544 9.9999e-06 0.000284 0.02996 0.117 9.9999e-06 0.000284 2.2866e-05 0.000535 0.10631 0.27 0.5669 0.767 5e-05 0.000955 0.0096599 0.0539 6.3062e-08 1.97e-05 0.37148 0.599 del_8q11.1 47 (8%) 567 0.49199 0.704 0.31393 0.542 0.22335 0.432 0.096899 0.256 0.73726 0.886 0.03813 0.134 0.081025 0.226 0.22677 0.433 0.71375 0.869 0.52619 0.735 0.31942 0.55 0.025345 0.104 1 1 del_9p21.3 87 (14%) 527 0.5722 0.77 0.10152 0.26 0.5987 0.791 0.64085 0.822 0.30321 0.528 0.3934 0.614 0.14367 0.324 0.081641 0.227 1 1 0.03178 0.12 0.0327 0.123 0.070215 0.209 0.14565 0.328 del_10p15.3 113 (18%) 501 0.24378 0.456 0.022937 0.0972 0.34362 0.574 0.02583 0.105 0.58462 0.78 0.02989 0.117 0.036259 0.132 0.83519 0.948 0.14627 0.328 0.37262 0.599 0.82118 0.944 0.0049112 0.0331 1 1 del_10q21.1 138 (22%) 476 0.81848 0.944 0.035898 0.131 0.44277 0.663 0.087609 0.238 0.91843 1 0.13577 0.313 0.12881 0.302 0.77149 0.915 0.00099 0.00936 0.02642 0.107 0.39252 0.614 0.043333 0.147 0.011335 0.0593 del_10q23.31 160 (26%) 454 0.17507 0.372 0.0033578 0.0242 0.075852 0.22 0.090949 0.244 0.57463 0.772 0.070049 0.209 0.18791 0.389 0.92675 1 0.052202 0.167 0.01711 0.0793 0.73716 0.886 0.013169 0.0659 0.13627 0.313 del_10q25.2 156 (25%) 458 0.77784 0.917 0.038169 0.134 0.24669 0.459 0.25682 0.467 0.32361 0.554 0.03634 0.132 0.23452 0.443 0.92625 1 0.13041 0.305 0.02364 0.0992 0.67024 0.84 0.018915 0.0843 0.6102 0.799 del_11q22.3 110 (18%) 504 0.31278 0.541 0.41862 0.639 0.069156 0.209 0.59221 0.788 0.77263 0.915 0.16543 0.357 0.44183 0.663 0.67384 0.842 0.076044 0.22 0.03932 0.138 0.51811 0.726 0.060391 0.19 0.5832 0.78 del_12p13.1 92 (15%) 522 0.070262 0.209 0.22031 0.429 0.19355 0.396 0.10946 0.274 0.79902 0.93 0.03357 0.125 0.043897 0.148 0.73468 0.886 0.79478 0.929 0.01255 0.064 0.98383 1 0.12397 0.299 1 1 del_12q21.33 90 (15%) 524 0.10773 0.271 0.79993 0.93 0.43576 0.657 0.087579 0.238 0.72818 0.879 0.12137 0.296 0.31862 0.549 0.64792 0.825 0.7929 0.928 0.02076 0.09 0.4808 0.694 0.030875 0.12 0.56179 0.763 del_14q11.2 210 (34%) 404 0.99491 1 0.24992 0.46 0.015319 0.0739 0.60246 0.794 0.3796 0.603 0.04074 0.141 0.11098 0.276 0.93213 1 0.32178 0.552 9.9999e-06 0.000284 0.88426 0.982 0.16089 0.35 1 1 del_14q31.1 218 (36%) 396 0.77615 0.917 0.16289 0.354 0.044475 0.15 0.45768 0.679 0.24772 0.459 0.01609 0.0753 0.029581 0.117 0.20604 0.413 0.55574 0.759 9.9999e-06 0.000284 0.89317 0.982 0.036786 0.133 1 1 del_15q11.2 248 (40%) 366 0.62907 0.814 0.50102 0.712 0.40008 0.622 0.03157 0.12 0.85377 0.958 0.01552 0.0741 0.023936 0.0995 0.28463 0.505 0.43649 0.657 0.091589 0.244 0.65178 0.825 0.0025689 0.0205 1 1 del_15q15.2 250 (41%) 364 0.5931 0.789 0.28944 0.51 0.039774 0.139 0.04943 0.161 0.77751 0.917 0.0058599 0.0366 0.0042581 0.0295 0.21776 0.428 0.25003 0.46 0.01242 0.0639 0.55616 0.759 0.0032474 0.0236 1 1 del_15q21.1 247 (40%) 367 0.43776 0.658 0.61779 0.805 0.031329 0.12 0.11419 0.282 0.81487 0.944 0.02402 0.0995 0.0062567 0.0378 0.13806 0.316 0.24345 0.456 0.01231 0.0637 0.37882 0.603 0.011061 0.0582 1 1 del_15q22.33 237 (39%) 377 0.56039 0.762 0.42304 0.644 0.018333 0.0829 0.0097799 0.0542 0.084539 0.232 0.00288 0.0217 0.0039269 0.0274 0.2817 0.501 0.32736 0.557 0.0090699 0.0518 0.51686 0.725 0.00095956 0.00926 1 1 del_16p13.3 68 (11%) 546 0.0096792 0.0539 0.91885 1 0.14846 0.331 0.03323 0.124 0.02491 0.103 0.22659 0.433 0.19567 0.397 0.6994 0.864 0.76085 0.906 0.22048 0.429 0.48127 0.694 0.1223 0.296 0.46719 0.686 del_16q23.1 83 (14%) 531 0.06058 0.19 0.50247 0.712 0.79023 0.927 0.68278 0.852 0.22635 0.433 0.50102 0.712 0.30624 0.532 0.55463 0.759 1 1 0.85541 0.958 0.8254 0.944 0.91576 1 0.12606 0.302 del_17p12 368 (60%) 246 0.49556 0.708 0.20535 0.412 0.0027213 0.0209 0.00049 0.00546 0.39132 0.614 5.9999e-05 0.00102 0.0027402 0.0209 0.40992 0.632 0.84758 0.955 9.9999e-06 0.000284 0.21317 0.424 1.5663e-05 0.000431 0.65227 0.825 del_17q24.3 95 (15%) 519 0.089695 0.242 0.25525 0.466 1 1 0.00228 0.0189 0.12732 0.302 0.00131 0.0118 0.014224 0.0701 0.21969 0.429 0.7896 0.927 1 1 0.38756 0.612 7.7546e-05 0.00123 1 1 del_18p11.31 369 (60%) 245 0.35883 0.586 0.018783 0.0841 2.6277e-06 0.000284 7.9999e-05 0.00125 0.90495 0.993 0.0075499 0.0447 7.5445e-06 0.000284 0.56391 0.765 1 1 9.9999e-06 0.000284 0.04995 0.162 0.017795 0.0809 0.65235 0.825 del_18q12.2 414 (67%) 200 0.45434 0.675 0.031101 0.12 1.4881e-09 1.39e-06 0.00041 0.00492 0.32594 0.557 6.9999e-05 0.00115 0.0004061 0.00492 0.19575 0.397 0.10037 0.26 9.9999e-06 0.000284 0.077949 0.221 0.00051137 0.00563 1 1 del_18q21.2 431 (70%) 183 0.48662 0.699 0.045677 0.153 3.7015e-09 1.73e-06 2e-05 0.00048 0.3286 0.557 9.9999e-06 0.000284 9.0157e-06 0.000284 0.063368 0.196 0.060366 0.19 9.9999e-06 0.000284 0.079359 0.223 5.8755e-06 0.000284 1 1 del_18q22.1 426 (69%) 188 0.63445 0.817 0.11759 0.289 1.7168e-07 4.02e-05 3e-05 0.000653 0.46915 0.686 4e-05 0.000797 1.9431e-05 0.00048 0.066335 0.203 0.14666 0.328 9.9999e-06 0.000284 0.13379 0.312 3.6166e-05 0.000769 1 1 del_19p13.3 97 (16%) 517 0.34099 0.572 0.19674 0.399 0.077281 0.221 0.00294 0.0217 0.41754 0.639 4e-05 0.000797 0.0070482 0.042 0.32 0.55 0.59954 0.791 0.080909 0.226 0.1022 0.261 7.2845e-06 0.000284 0.54703 0.756 del_20p12.1 135 (22%) 479 0.8331 0.948 0.35329 0.582 0.0077441 0.0456 0.1392 0.318 0.74759 0.897 0.30515 0.531 1 1 0.55821 0.761 0.47984 0.694 0.0015 0.0129 0.40944 0.632 0.08234 0.228 1 1 del_21q11.2 213 (35%) 401 0.41658 0.638 0.64643 0.824 0.0038089 0.0268 0.27257 0.489 0.94125 1 0.089829 0.242 0.39107 0.614 0.61072 0.799 0.5481 0.757 5.9999e-05 0.00102 0.51926 0.727 0.033042 0.124 0.054409 0.173 del_21q21.1 209 (34%) 405 0.96877 1 0.35012 0.579 0.0027161 0.0209 0.25586 0.466 0.95418 1 0.02032 0.0889 0.6228 0.809 0.93215 1 0.22489 0.433 5.9999e-05 0.00102 0.41513 0.637 0.0056436 0.036 0.052847 0.169 del_22q13.32 226 (37%) 388 0.083102 0.229 0.82689 0.944 0.29534 0.517 0.00266 0.0207 0.43628 0.657 0.00019 0.00269 0.005174 0.034 0.40204 0.624 0.55545 0.759 0.0054299 0.0351 0.3832 0.606 0.00030222 0.00393 0.35014 0.579