Clinical Features Time to Death YEARS_TO_BIRTH PATHOLOGIC_STAGE PATHOLOGY_T_STAGE PATHOLOGY_N_STAGE PATHOLOGY_M_STAGE GENDER KARNOFSKY_PERFORMANCE_SCORE NUMBER_PACK_YEARS_SMOKED YEAR_OF_TOBACCO_SMOKING_ONSET RACE ETHNICITY nCNV (%) nWild-Type logrank test_P logrank test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q 1p gain 10 (3%) 278 9.4833e-09 2.27e-06 0.50514 0.848 3e-04 0.00459 4e-04 0.00582 0.00014 0.00226 0.1679 0.463 0.023556 0.123 0.11749 0.361 NA NA NA NA 0.33119 0.671 1 1 1q gain 17 (6%) 271 4.1953e-08 6.21e-06 0.65444 0.969 3e-05 0.00062 9.9999e-06 0.000269 0.03014 0.15 0.11354 0.353 0.019486 0.11 0.021918 0.117 0.23554 0.549 NA NA 0.10884 0.347 1 1 2p gain 42 (15%) 246 0.24823 0.559 0.2354 0.549 0.062019 0.24 0.29126 0.623 0.03141 0.156 0.0030191 0.0263 0.45481 0.79 0.29396 0.624 0.16287 0.456 0.61739 0.932 0.95291 1 0.69888 1 2q gain 47 (16%) 241 0.2698 0.593 0.32362 0.661 0.03409 0.165 0.25891 0.574 0.0055299 0.0413 0.0057697 0.0417 0.58897 0.929 0.25116 0.565 0.3125 0.648 0.95369 1 0.95493 1 1 1 3p gain 75 (26%) 213 0.6064 0.93 0.76839 1 0.01852 0.106 0.01452 0.0877 0.48769 0.825 0.10728 0.345 0.64932 0.963 0.1053 0.34 0.73217 1 0.55481 0.897 0.62103 0.932 1 1 3q gain 95 (33%) 193 0.9385 1 0.37613 0.715 0.054139 0.222 0.068889 0.254 0.89844 1 0.058118 0.229 0.39823 0.737 0.29798 0.63 0.44175 0.78 0.5111 0.853 0.12986 0.389 1 1 4p gain 10 (3%) 278 0.31791 0.655 0.093506 0.312 0.077019 0.275 0.54293 0.893 0.27691 0.6 0.24205 0.552 1 1 0.32642 0.665 0.87137 1 0.8344 1 0.60463 0.93 1 1 4q gain 9 (3%) 279 0.98638 1 0.21876 0.524 0.25217 0.565 0.43349 0.768 0.17706 0.468 1 1 1 1 0.87067 1 0.38831 0.725 0.8344 1 0.76516 1 1 1 5p gain 34 (12%) 254 0.060637 0.237 0.60725 0.93 0.073159 0.265 0.02426 0.126 0.18337 0.476 0.61583 0.932 1 1 0.04495 0.193 0.58853 0.929 0.59087 0.93 0.442 0.78 1 1 5q gain 31 (11%) 257 0.71417 1 0.43332 0.768 0.084689 0.294 0.10895 0.347 0.2165 0.524 0.61583 0.932 1 1 0.04495 0.193 0.58853 0.929 0.76521 1 0.62063 0.932 0.61921 0.932 6p gain 10 (3%) 278 0.0015812 0.0158 0.21 0.518 8.9999e-05 0.00154 5e-05 0.000906 0.03648 0.17 0.037405 0.171 0.72684 1 0.87067 1 1 1 0.89477 1 0.77918 1 1 1 6q gain 7 (2%) 281 3.8051e-08 6.21e-06 0.068405 0.254 0.00131 0.0137 0.00094999 0.0111 0.0261 0.134 0.01961 0.11 0.38538 0.725 0.87067 1 0.32261 0.66 NA NA 0.72618 1 1 1 7p gain 171 (59%) 117 0.34001 0.679 0.71037 1 0.0092899 0.0629 0.11668 0.36 0.46183 0.798 0.72775 1 0.0028178 0.025 0.11202 0.349 0.80388 1 0.0072037 0.0504 0.21828 0.524 0.54731 0.895 7q gain 172 (60%) 116 0.33183 0.671 0.61549 0.932 0.0067399 0.0479 0.092809 0.311 0.50704 0.85 0.72797 1 0.0026072 0.0234 0.11202 0.349 0.80388 1 0.0072037 0.0504 0.20294 0.506 0.54583 0.895 8p gain 20 (7%) 268 0.0024064 0.0218 0.81614 1 0.067319 0.253 0.01652 0.0978 0.068709 0.254 1 1 0.18722 0.485 0.80345 1 0.76248 1 NA NA 0.19363 0.491 0.59752 0.93 8q gain 25 (9%) 263 2.4295e-06 0.000154 0.80781 1 0.00017 0.0027 3e-05 0.00062 0.00078999 0.00988 0.14436 0.415 0.05471 0.223 0.24011 0.552 0.55147 0.897 0.74252 1 0.19337 0.491 1 1 9p gain 3 (1%) 285 0.048146 0.204 0.51618 0.86 0.0449 0.193 0.03612 0.17 NA NA 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 10p gain 8 (3%) 280 0.40679 0.748 0.3653 0.708 0.24352 0.552 0.45542 0.79 0.17643 0.468 0.43055 0.768 0.21404 0.521 0.38886 0.725 NA NA NA NA 0.0093499 0.0629 1 1 10q gain 8 (3%) 280 0.40679 0.748 0.3653 0.708 0.24037 0.552 0.4543 0.79 0.17463 0.468 0.43055 0.768 0.21404 0.521 0.38886 0.725 NA NA NA NA 0.0096099 0.0642 1 1 11p gain 12 (4%) 276 0.0045678 0.0362 0.22084 0.527 0.02632 0.134 0.02277 0.12 0.17216 0.468 0.037405 0.171 0.31196 0.648 0.6876 0.998 0.58152 0.922 NA NA 0.35612 0.7 1 1 11q gain 10 (3%) 278 0.054993 0.223 0.04953 0.207 0.14086 0.408 0.12408 0.375 0.67327 0.988 0.24205 0.552 0.023556 0.123 0.91026 1 0.58152 0.922 0.27309 0.597 0.35573 0.7 1 1 12p gain 112 (39%) 176 0.83843 1 0.76047 1 0.29255 0.624 0.8501 1 0.17721 0.468 0.473 0.809 0.020106 0.11 0.41479 0.756 0.9199 1 0.12099 0.368 0.90079 1 0.37304 0.711 12q gain 112 (39%) 176 0.83843 1 0.76047 1 0.29399 0.624 0.8502 1 0.17594 0.468 0.473 0.809 0.020106 0.11 0.41479 0.756 0.9199 1 0.12099 0.368 0.90206 1 0.37304 0.711 13q gain 28 (10%) 260 0.45194 0.79 0.35813 0.702 0.94017 1 0.71439 1 1 1 0.59421 0.93 1 1 0.53007 0.878 0.93119 1 1 1 0.84494 1 0.33816 0.679 14q gain 3 (1%) 285 0.39102 0.728 NA NA 0.03506 0.168 0.02015 0.11 NA NA 1 1 0.1712 0.468 NA NA NA NA NA NA NA NA 1 1 15q gain 5 (2%) 283 0.99585 1 0.83182 1 0.27435 0.597 0.24629 0.556 NA NA 1 1 0.11683 0.36 NA NA NA NA NA NA 0.4199 0.759 1 1 16p gain 153 (53%) 135 0.3405 0.679 0.016867 0.0992 0.83415 1 0.6612 0.975 0.85242 1 0.48946 0.826 0.0012321 0.0132 0.60247 0.93 0.89649 1 0.16666 0.462 0.00151 0.0154 0.23479 0.549 16q gain 148 (51%) 140 0.040261 0.181 0.036337 0.17 0.48296 0.82 0.22208 0.527 0.85648 1 0.18331 0.476 0.0033383 0.0288 0.9197 1 0.60173 0.93 0.16666 0.462 0.01282 0.0791 0.24063 0.552 17p gain 172 (60%) 116 0.057913 0.229 0.053452 0.22 9.9999e-06 0.000269 6.9999e-05 0.00122 0.67264 0.988 0.50404 0.848 0.013906 0.0846 0.32109 0.66 0.74057 1 0.13866 0.406 0.084059 0.294 0.061438 0.239 17q gain 191 (66%) 97 0.69389 1 0.086205 0.296 0.03198 0.158 0.071559 0.262 0.30015 0.63 1 1 0.15692 0.442 0.77135 1 0.61465 0.932 0.28211 0.606 0.084949 0.294 0.20115 0.503 18p gain 12 (4%) 276 0.9576 1 0.80629 1 0.27494 0.597 0.80786 1 0.67534 0.988 0.43055 0.768 0.19351 0.491 0.21334 0.521 0.71926 1 NA NA 0.19506 0.492 1 1 18q gain 9 (3%) 279 0.19945 0.5 0.5975 0.93 0.52664 0.875 0.43195 0.768 NA NA 1 1 0.4533 0.79 0.028648 0.144 NA NA NA NA 0.33333 0.673 1 1 19p gain 5 (2%) 283 0.55784 0.898 0.052858 0.218 0.68656 0.998 0.63071 0.941 1 1 1 1 0.61009 0.93 NA NA NA NA NA NA 0.1075 0.345 1 1 19q gain 5 (2%) 283 0.55784 0.898 0.052858 0.218 0.68702 0.998 0.6314 0.941 1 1 1 1 0.61009 0.93 NA NA NA NA NA NA 0.10507 0.34 1 1 20p gain 99 (34%) 189 0.9573 1 0.3027 0.634 0.4541 0.79 0.33552 0.676 0.45401 0.79 1 1 1 1 0.91044 1 0.24361 0.552 0.78696 1 0.43355 0.768 0.55229 0.897 20q gain 101 (35%) 187 0.76779 1 0.31787 0.655 0.54035 0.89 0.415 0.756 0.31739 0.655 1 1 0.88941 1 0.91044 1 0.34031 0.679 0.64231 0.955 0.23075 0.544 0.54994 0.897 21q gain 19 (7%) 269 0.86385 1 0.13033 0.389 1 1 1 1 0.67415 0.988 0.31027 0.647 1 1 0.29939 0.63 0.057988 0.229 NA NA 0.098029 0.324 0.59752 0.93 22q gain 5 (2%) 283 0.26506 0.584 0.47163 0.809 0.13973 0.408 0.088409 0.301 NA NA 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1 1 0.21805 0.524 xp gain 88 (31%) 200 0.25801 0.574 0.19611 0.493 0.00476 0.0368 0.00472 0.0368 0.70473 1 1 1 0.019938 0.11 0.19173 0.491 0.8381 1 0.099073 0.325 0.18085 0.475 1 1 xq gain 92 (32%) 196 0.19365 0.491 0.18214 0.476 0.03263 0.159 0.01958 0.11 0.55439 0.897 1 1 0.021426 0.115 0.19173 0.491 0.99527 1 0.099073 0.325 0.22437 0.531 1 1 1p loss 30 (10%) 258 0.48535 0.822 0.46072 0.798 0.083159 0.292 0.03862 0.174 0.36667 0.708 1 1 0.38394 0.725 0.39676 0.736 0.7554 1 NA NA 0.47376 0.809 1 1 1q loss 21 (7%) 267 0.77887 1 0.96793 1 0.46645 0.803 0.83168 1 0.55871 0.898 0.53182 0.878 0.2073 0.513 0.67754 0.99 NA NA NA NA 0.41818 0.758 1 1 2p loss 5 (2%) 283 0.91986 1 0.59866 0.93 0.0278 0.141 0.0497 0.207 NA NA 1 1 0.61009 0.93 NA NA NA NA NA NA 0.62438 0.935 1 1 2q loss 3 (1%) 285 0.42503 0.766 NA NA NA NA 0.15544 0.44 NA NA 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA NA NA 1 1 3p loss 21 (7%) 267 0.0022554 0.0209 0.020915 0.113 5e-05 0.000906 0.00014 0.00226 0.25541 0.571 0.085048 0.294 1 1 0.68463 0.998 0.78679 1 0.27054 0.593 0.60455 0.93 1 1 3q loss 6 (2%) 282 0.00043874 0.00609 0.16615 0.462 0.04182 0.185 0.04938 0.207 0.065449 0.248 0.1679 0.463 0.65611 0.969 NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 4p loss 25 (9%) 263 8.6619e-09 2.27e-06 0.0035143 0.0297 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.00106 0.0119 0.57618 0.919 3.8007e-05 0.000767 0.07678 0.275 0.96042 1 0.19167 0.491 0.17275 0.468 1 1 4q loss 26 (9%) 262 7.7765e-09 2.27e-06 0.020276 0.11 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.0097599 0.0646 0.21096 0.518 0.00061444 0.00798 0.067021 0.253 0.61062 0.93 0.28231 0.606 0.17187 0.468 1 1 5p loss 7 (2%) 281 1.0225e-08 2.27e-06 0.010075 0.0648 0.0092299 0.0629 0.00094999 0.0111 0.01749 0.102 0.24205 0.552 0.081538 0.29 NA NA NA NA NA NA 1 1 0.21805 0.524 5q loss 8 (3%) 280 9.3583e-08 1.19e-05 0.012146 0.076 0.03815 0.173 0.00396 0.0323 0.02572 0.133 0.24205 0.552 0.032227 0.158 NA NA NA NA NA NA 1 1 0.25604 0.571 6p loss 21 (7%) 267 0.33117 0.671 0.56584 0.907 0.0099599 0.0646 0.01993 0.11 0.086539 0.296 1 1 0.2073 0.513 0.03635 0.17 0.78727 1 0.75351 1 0.17647 0.468 1 1 6q loss 27 (9%) 261 0.75057 1 0.82479 1 0.0099299 0.0646 0.00418 0.0337 0.11122 0.349 0.59364 0.93 0.037089 0.171 0.018388 0.106 0.82053 1 0.92861 1 0.125 0.376 0.6066 0.93 8p loss 16 (6%) 272 0.0019781 0.0187 0.19487 0.492 0.03571 0.17 0.27473 0.597 0.03481 0.168 0.013809 0.0846 0.14102 0.408 0.80345 1 0.97808 1 NA NA 0.093679 0.312 1 1 8q loss 9 (3%) 279 0.36612 0.708 0.55095 0.897 0.35959 0.703 1 1 0.3663 0.708 0.24205 0.552 0.057587 0.229 NA NA NA NA NA NA 0.26225 0.579 1 1 9p loss 33 (11%) 255 6.4901e-07 4.8e-05 0.29434 0.624 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.00091999 0.0111 0.068492 0.254 0.001219 0.0132 0.00083218 0.0103 0.38769 0.725 0.47849 0.814 0.14904 0.427 0.37036 0.711 9q loss 34 (12%) 254 2.5462e-05 0.000551 0.41568 0.756 5e-05 0.000906 2e-05 0.000444 0.0060899 0.0436 0.35276 0.699 0.001667 0.0161 0.001 0.0114 0.94096 1 0.57042 0.911 0.03787 0.172 0.37147 0.711 10p loss 17 (6%) 271 0.0075869 0.0526 0.94636 1 0.00049 0.00659 0.00165 0.0161 0.18238 0.476 0.31027 0.647 0.40084 0.74 0.028151 0.142 0.11003 0.348 0.15097 0.43 0.85484 1 1 1 10q loss 18 (6%) 270 0.00037038 0.00548 0.39279 0.73 9.9999e-06 0.000269 0.00067999 0.00863 0.04662 0.199 0.37297 0.711 0.58055 0.922 0.011601 0.0736 0.11003 0.348 0.15097 0.43 0.42655 0.767 1 1 11p loss 17 (6%) 271 0.00092295 0.0111 0.52711 0.875 0.0107 0.0684 0.00061999 0.00798 0.00361 0.03 0.37297 0.711 0.16292 0.456 0.10193 0.333 NA NA NA NA 0.7027 1 1 1 11q loss 21 (7%) 267 0.00060826 0.00798 0.89286 1 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.00125 0.0132 0.17699 0.468 0.44787 0.788 0.012086 0.076 0.84594 1 0.85574 1 0.15313 0.434 1 1 13q loss 24 (8%) 264 1.3278e-07 1.47e-05 0.0029066 0.0256 0.00023 0.00358 2e-05 0.000444 0.00378 0.0311 0.53182 0.878 1.7356e-05 0.000428 0.064006 0.245 0.74631 1 0.4471 0.788 0.17454 0.468 1 1 14q loss 47 (16%) 241 0.00011802 0.00198 0.34799 0.693 0.00191 0.0182 5.9999e-05 0.00107 0.00138 0.0142 0.12258 0.371 0.0033789 0.0289 0.0089576 0.0617 0.47648 0.812 0.075571 0.272 1 1 0.6967 1 15q loss 31 (11%) 257 0.015178 0.0911 0.070585 0.259 0.00163 0.0161 0.00034 0.00512 0.0057499 0.0417 0.28135 0.606 0.27963 0.604 0.13141 0.389 0.38678 0.725 NA NA 0.51067 0.853 1 1 16p loss 4 (1%) 284 0.00042229 0.00595 0.88435 1 0.094599 0.313 0.064139 0.245 NA NA 1 1 0.057661 0.229 NA NA NA NA NA NA NA NA 1 1 16q loss 7 (2%) 281 1.4314e-05 0.000363 0.74491 1 0.00442 0.0354 0.01275 0.0791 0.065249 0.248 1 1 0.38538 0.725 NA NA 0.91249 1 0.98492 1 0.64824 0.963 1 1 17p loss 13 (5%) 275 3.6375e-07 3.23e-05 0.85408 1 0.00241 0.0218 0.00153 0.0154 0.04699 0.2 0.059454 0.234 0.11207 0.349 0.14286 0.412 0.92093 1 0.41803 0.758 0.35625 0.7 1 1 18p loss 42 (15%) 246 1.0763e-06 7.35e-05 0.072964 0.265 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.01623 0.0967 0.057721 0.229 0.03594 0.17 0.24364 0.552 0.22169 0.527 0.083241 0.292 0.4644 0.801 0.67557 0.988 18q loss 44 (15%) 244 3.4379e-07 3.23e-05 0.1718 0.468 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.00096999 0.0112 0.068931 0.254 0.13579 0.399 0.20681 0.513 0.41185 0.756 0.1802 0.475 0.14062 0.408 1 1 19p loss 16 (6%) 272 0.089652 0.304 0.59491 0.93 0.00476 0.0368 0.0056799 0.0417 0.0436 0.19 1 1 0.37967 0.72 0.13141 0.389 0.49648 0.837 NA NA 1 1 1 1 19q loss 15 (5%) 273 0.0020634 0.0193 0.42118 0.76 4e-05 0.000789 5e-05 0.000906 0.04284 0.188 1 1 0.23443 0.549 0.13141 0.389 0.62715 0.938 0.22653 0.535 0.84398 1 1 1 21q loss 43 (15%) 245 0.25926 0.574 0.13195 0.389 0.00358 0.03 0.00041 0.00587 0.086609 0.296 0.10293 0.335 0.09232 0.311 0.0055389 0.0413 0.54733 0.895 0.36235 0.707 0.32251 0.66 1 1 22q loss 60 (21%) 228 0.0012505 0.0132 0.063591 0.245 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.0056099 0.0415 0.042996 0.188 0.00046555 0.00636 0.0011344 0.0126 0.55934 0.898 0.21649 0.524 0.29863 0.63 0.70702 1 xp loss 33 (11%) 255 1.087e-05 0.000284 0.12038 0.368 9.9999e-06 0.000269 9.9999e-06 0.000269 0.01743 0.102 0.21096 0.518 0.091899 0.31 0.0053221 0.0404 0.56826 0.909 0.35351 0.699 0.0406 0.181 0.61921 0.932 xq loss 29 (10%) 259 6.1731e-07 4.8e-05 0.083204 0.292 2e-05 0.000444 2e-05 0.000444 0.0098599 0.0646 0.17699 0.468 0.073487 0.265 0.0053221 0.0404 0.77172 1 0.35351 0.699 0.04151 0.184 0.60928 0.93