Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1p33	7 (4%)	184	0.80884	0.872	0.04708	0.0996	0.14791	0.222	0.13031	0.2	0.0073599	0.0221	0.0486	0.0996
amp_11q23.3	17 (9%)	174	0.097969	0.168	0.00197	0.00995	0.37333	0.465	0.20295	0.274	0.48079	0.57	0.1874	0.265
amp_20q11.21	3 (2%)	188	0.39122	0.481	0.33621	0.425	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
amp_21q22.2	14 (7%)	177	0.070039	0.132	0.00169	0.00933	0.00402	0.0175	0.03706	0.0847	0.0059699	0.0206	0.066819	0.128
del_3p13	8 (4%)	183	0.054499	0.109	0.11446	0.186	0.077849	0.141	0.23673	0.311	0.04665	0.0996	0.04875	0.0996
del_5q31.2	18 (9%)	173	0.00138	0.00883	4e-05	0.000768	0.00455	0.0175	0.00067999	0.0062	0.00109	0.00805	0.00109	0.00805
del_7p12.1	16 (8%)	175	9.9999e-06	0.00048	0.00070999	0.0062	0.00227	0.0109	9.9999e-06	0.00048	0.01888	0.0477	0.0070099	0.0217
del_7q32.3	23 (12%)	168	2e-05	0.00048	0.00061999	0.0062	0.04453	0.0994	2e-05	0.00048	0.00431	0.0175	0.00172	0.00933
del_9q21.32	5 (3%)	186	0.50224	0.588	0.5721	0.662	0.17755	0.254	0.59949	0.669	0.19914	0.273	0.10464	0.173
del_12p13.2	10 (5%)	181	0.00032	0.00439	0.0045	0.0175	0.1969	0.273	0.073689	0.136	0.12599	0.198	0.0097699	0.0284
del_12q21.33	3 (2%)	188	0.13129	0.2	0.78417	0.855	0.26185	0.34	0.58882	0.666	0.0062099	0.0206	0.0061599	0.0206
del_16q23.1	9 (5%)	182	0.03018	0.0724	0.084669	0.151	1	1	0.85966	0.917	0.097019	0.168	0.10416	0.173
del_17p13.2	15 (8%)	176	0.02185	0.0538	0.00054999	0.0062	0.01283	0.0352	0.00022	0.00352	0.066809	0.128	0.00126	0.00864
del_17q11.2	13 (7%)	178	0.01589	0.0424	0.0057999	0.0206	0.16996	0.247	0.0067599	0.0216	0.0188	0.0477	0.00376	0.0172
del_18p11.21	9 (5%)	182	0.00175	0.00933	0.01246	0.0352	0.48123	0.57	0.33383	0.425	0.21769	0.29	0.03246	0.076
del_20q13.13	4 (2%)	187	0.90425	0.954	0.16041	0.237	0.78356	0.855	0.58939	0.666	0.12034	0.193	0.41119	0.5