Clinical Features Time to Death YEARS_TO_BIRTH PATHOLOGY_T_STAGE PATHOLOGY_N_STAGE RADIATION_THERAPY HISTOLOGICAL_TYPE RESIDUAL_TUMOR NUMBER_OF_LYMPH_NODES GLEASON_SCORE PSA_VALUE RACE nCNV (%) nWild-Type logrank test_P logrank test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Wilcoxon-test_P Wilcoxon-test_Q Fisher's exact test_P Fisher's exact test_Q 1p gain 15 (3%) 477 0.63438 0.888 0.16991 0.395 0.00025 0.00344 0.29929 0.558 0.025925 0.0963 1 1 0.20221 0.444 0.45382 0.735 0.00026061 0.00353 0.49809 0.772 1 1 1q gain 26 (5%) 466 0.51022 0.781 0.20153 0.444 5.9999e-05 0.00112 0.10385 0.274 0.033398 0.117 0.53727 0.805 0.12651 0.315 0.10176 0.271 9.8207e-05 0.00166 0.64602 0.898 1 1 2p gain 11 (2%) 481 0.69429 0.931 0.61493 0.869 1 1 1 1 1 1 1 1 0.21593 0.458 0.48844 0.763 0.057782 0.178 0.049785 0.156 NA NA 2q gain 7 (1%) 485 0.79496 0.992 0.41385 0.692 0.74735 0.956 1 1 0.50726 0.78 1 1 0.23665 0.476 0.82652 1 0.28081 0.531 0.0056915 0.0315 NA NA 3p gain 40 (8%) 452 0.26285 0.504 0.0015211 0.0123 0.00156 0.0125 0.048424 0.154 0.17669 0.404 0.096711 0.261 0.039 0.132 0.0031633 0.0212 2.3385e-08 3.8e-06 0.36255 0.629 0.52471 0.794 3q gain 54 (11%) 438 0.093197 0.254 0.0034732 0.0226 2e-05 0.000476 0.020337 0.0794 0.10228 0.272 0.19078 0.426 0.01025 0.0498 0.0010394 0.00915 2.5324e-09 1.11e-06 0.042597 0.14 0.63623 0.889 4p gain 9 (2%) 483 0.67474 0.918 0.10523 0.277 0.25235 0.492 0.6722 0.918 1 1 1 1 0.64243 0.896 0.3951 0.67 0.43454 0.717 0.41815 0.698 1 1 4q gain 10 (2%) 482 0.67014 0.917 0.20414 0.444 0.18325 0.411 0.09088 0.249 0.3356 0.606 0.25278 0.492 0.54421 0.81 0.12076 0.306 0.58156 0.842 0.2341 0.476 NA NA 5p gain 23 (5%) 469 0.40295 0.678 0.0018217 0.0141 0.00015 0.0024 0.0024209 0.0175 0.027388 0.1 0.49313 0.765 0.01801 0.0741 5.9043e-05 0.00112 1.922e-06 8.46e-05 0.35871 0.625 NA NA 5q gain 12 (2%) 480 0.67405 0.918 0.0001669 0.00258 0.0087099 0.0435 0.0067451 0.0351 1 1 1 1 0.02213 0.0832 0.0003073 0.00404 0.0019833 0.0151 0.18176 0.411 NA NA 6p gain 10 (2%) 482 0.039656 0.134 0.33116 0.603 0.17961 0.408 0.021557 0.0832 0.10153 0.271 1 1 0.21732 0.458 0.016156 0.0687 0.031006 0.11 0.33318 0.604 NA NA 6q gain 6 (1%) 486 0.7205 0.941 0.071587 0.209 0.48369 0.757 0.078051 0.219 0.13068 0.323 1 1 0.23645 0.476 0.045985 0.148 0.090873 0.249 0.76894 0.967 NA NA 7p gain 101 (21%) 391 0.11603 0.3 0.011959 0.0542 0.0382 0.13 0.43823 0.718 0.48283 0.757 0.74478 0.956 0.00201 0.0151 0.23276 0.476 3.8774e-05 0.000832 0.69731 0.931 0.72394 0.943 7q gain 94 (19%) 398 0.13057 0.323 0.020193 0.0793 0.093589 0.254 0.87378 1 0.47221 0.753 1 1 0.00112 0.00957 0.99175 1 0.00011846 0.00196 0.87267 1 0.70771 0.931 8p gain 68 (14%) 424 0.70573 0.931 0.006244 0.0335 0.0081099 0.0413 0.73116 0.946 0.31779 0.584 0.23465 0.476 0.01132 0.0527 0.85631 1 2.4529e-07 2.16e-05 0.088327 0.246 0.65784 0.906 8q gain 126 (26%) 366 0.69353 0.931 0.070084 0.208 0.00024 0.00335 0.20453 0.444 0.20183 0.444 0.5346 0.803 0.00091999 0.00835 0.13405 0.329 4.658e-08 4.55e-06 0.076431 0.218 0.73937 0.954 9p gain 34 (7%) 458 0.82703 1 0.0044243 0.0272 8.9999e-05 0.00155 0.00046613 0.00537 0.17669 0.404 0.2511 0.492 0.01311 0.0574 8.3304e-05 0.0015 1.0424e-06 5.73e-05 0.54322 0.81 0.34653 0.617 9q gain 48 (10%) 444 0.97722 1 0.012357 0.0552 9.9999e-06 0.000293 1.4619e-05 0.00039 0.17113 0.395 0.14752 0.354 0.01093 0.0522 5.4276e-07 3.67e-05 2.5925e-08 3.8e-06 0.94843 1 0.46009 0.739 10p gain 15 (3%) 477 0.45042 0.733 0.16962 0.395 0.30282 0.562 0.14894 0.355 0.70455 0.931 0.35558 0.625 0.15309 0.364 0.028812 0.104 0.0026336 0.0185 0.45855 0.738 1 1 10q gain 14 (3%) 478 0.4418 0.723 0.7244 0.943 0.4554 0.735 0.26936 0.515 0.23319 0.476 0.33613 0.606 0.17073 0.395 0.067654 0.202 0.025942 0.0963 0.23084 0.474 1 1 11p gain 27 (5%) 465 0.55243 0.814 0.028848 0.104 0.00163 0.0128 0.002925 0.02 0.13333 0.328 1 1 0.0086099 0.0433 0.0010691 0.00931 1.4031e-05 0.000386 0.32446 0.592 0.25911 0.5 11q gain 30 (6%) 462 0.51404 0.785 0.033016 0.117 0.00274 0.0191 0.0023192 0.0172 0.24965 0.491 1 1 0.01225 0.055 0.00062238 0.0063 2.1063e-06 8.83e-05 0.66492 0.913 0.26179 0.503 12p gain 15 (3%) 477 0.55239 0.814 0.0065196 0.0344 0.00171 0.0133 0.049881 0.156 0.077239 0.218 1 1 0.0029 0.0199 0.0084563 0.0428 3.1299e-06 0.00011 0.50946 0.781 NA NA 12q gain 18 (4%) 474 0.55008 0.814 0.03992 0.134 0.00392 0.0247 0.039029 0.132 0.011149 0.0522 1 1 8.9999e-05 0.00155 0.0050158 0.0292 1.8975e-06 8.46e-05 0.85645 1 NA NA 13q gain 8 (2%) 484 0.47956 0.757 0.45805 0.738 0.21021 0.449 0.61687 0.869 0.6045 0.859 0.20755 0.445 0.48287 0.757 0.64931 0.901 0.70491 0.931 0.23354 0.476 NA NA 14q gain 10 (2%) 482 0.39117 0.665 0.029296 0.105 0.79737 0.992 0.21716 0.458 0.002769 0.0192 0.25278 0.492 0.04517 0.146 0.21349 0.455 0.0036561 0.0233 0.43228 0.716 NA NA 15q gain 6 (1%) 486 0.75532 0.961 0.92457 1 1 1 0.30349 0.562 0.57274 0.834 1 1 1 1 0.40101 0.676 0.10993 0.288 0.35543 0.625 NA NA 16p gain 32 (7%) 460 0.23993 0.48 0.20166 0.444 0.00070999 0.00692 0.0023192 0.0172 0.24965 0.491 1 1 0.19091 0.426 0.0014109 0.0115 2.9838e-06 0.000109 0.071748 0.209 1 1 16q gain 7 (1%) 485 0.8378 1 0.011783 0.0537 0.35645 0.625 1 1 0.57274 0.834 1 1 1 1 0.95519 1 0.18044 0.409 0.61443 0.869 1 1 17p gain 8 (2%) 484 0.74518 0.956 0.35865 0.625 0.01682 0.0712 0.0065226 0.0344 0.074504 0.215 1 1 0.79639 0.992 0.0012826 0.0109 0.055289 0.171 0.97573 1 NA NA 17q gain 11 (2%) 481 0.71882 0.941 0.21947 0.461 0.00451 0.0272 0.0067451 0.0351 0.16492 0.387 1 1 0.84326 1 0.0025774 0.0183 0.070617 0.208 0.53771 0.805 NA NA 18p gain 19 (4%) 473 0.22021 0.461 0.0099475 0.0492 0.00236 0.0173 0.0053476 0.0306 1 1 1 1 0.59428 0.849 0.0055814 0.0313 0.076524 0.218 0.45543 0.735 1 1 18q gain 10 (2%) 482 0.065722 0.198 0.11151 0.289 0.02827 0.103 0.40005 0.676 1 1 1 1 0.68593 0.927 0.51451 0.785 0.24333 0.483 0.58894 0.845 1 1 19p gain 12 (2%) 480 0.64361 0.896 0.26089 0.502 0.00052999 0.00555 0.011525 0.0531 0.6632 0.912 1 1 0.061319 0.187 0.00092567 0.00835 0.00022592 0.00326 0.9328 1 NA NA 19q gain 12 (2%) 480 0.62221 0.873 0.20499 0.444 0.00051999 0.00553 0.011525 0.0531 1 1 1 1 0.062169 0.188 0.00092567 0.00835 0.00022592 0.00326 0.95451 1 1 1 20p gain 26 (5%) 466 0.31943 0.584 0.047447 0.152 0.0062399 0.0335 0.049509 0.156 0.11065 0.288 1 1 0.25902 0.5 0.011623 0.0533 0.00051625 0.00553 0.203 0.444 NA NA 20q gain 29 (6%) 463 0.46299 0.739 0.0034081 0.0225 0.00023 0.00326 0.066535 0.2 0.076471 0.218 1 1 0.04342 0.142 0.013172 0.0574 0.00032898 0.0042 0.20979 0.449 1 1 21q gain 21 (4%) 471 0.3819 0.653 0.0054062 0.0307 0.01576 0.0674 0.036231 0.125 1 1 0.46157 0.739 0.093189 0.254 0.0044763 0.0272 5.7056e-05 0.00112 0.70658 0.931 1 1 22q gain 4 (1%) 488 0.79868 0.993 0.43265 0.716 0.67648 0.919 0.55662 0.819 0.43195 0.716 1 1 0.6581 0.906 0.61566 0.869 0.022119 0.0832 0.23673 0.476 NA NA xp gain 7 (1%) 485 0.76349 0.964 0.20424 0.444 0.01948 0.0786 0.11889 0.303 0.57274 0.834 1 1 0.0060199 0.0329 0.18246 0.411 0.0050099 0.0292 0.79538 0.992 NA NA xq gain 7 (1%) 485 0.76349 0.964 0.20424 0.444 0.01919 0.0782 0.11889 0.303 0.57274 0.834 1 1 0.0055699 0.0313 0.18246 0.411 0.0050099 0.0292 0.79538 0.992 NA NA 1p loss 22 (4%) 470 0.5328 0.803 0.54196 0.81 0.0246 0.0921 0.24379 0.483 0.044244 0.144 1 1 0.43542 0.717 0.17324 0.399 1.9096e-05 0.000476 0.28305 0.534 1 1 1q loss 6 (1%) 486 0.75148 0.958 0.67008 0.917 0.19569 0.436 0.22835 0.471 0.50726 0.78 1 1 0.055299 0.171 0.076799 0.218 0.090873 0.249 0.36308 0.629 NA NA 2p loss 14 (3%) 478 0.53456 0.803 0.0069422 0.0359 0.01316 0.0574 1 1 1 1 1 1 0.19943 0.443 0.76339 0.964 0.16555 0.387 0.24121 0.481 NA NA 2q loss 18 (4%) 474 0.60415 0.859 0.019732 0.0789 0.01942 0.0786 0.7491 0.957 0.70669 0.931 1 1 0.11844 0.303 0.51883 0.789 0.020152 0.0793 0.67344 0.918 NA NA 3p loss 9 (2%) 483 0.65617 0.906 0.76935 0.967 0.25118 0.492 0.16582 0.387 0.28358 0.534 1 1 0.21712 0.458 0.14232 0.346 0.0034201 0.0225 0.12158 0.307 NA NA 3q loss 5 (1%) 487 0.69267 0.931 0.29047 0.545 0.68821 0.929 0.58966 0.845 0.50726 0.78 1 1 0.34317 0.613 0.27438 0.522 0.0039251 0.0247 0.20695 0.445 NA NA 4p loss 23 (5%) 469 0.55026 0.814 0.11738 0.303 0.04971 0.156 0.00015918 0.0025 0.044244 0.144 0.49313 0.765 0.01876 0.0768 1.1287e-05 0.00032 1.5136e-06 7.83e-05 0.84945 1 1 1 4q loss 16 (3%) 476 0.65347 0.904 0.2479 0.49 0.10797 0.284 0.015 0.065 0.011149 0.0522 0.37449 0.645 0.03611 0.125 0.00055621 0.00576 5.8867e-06 0.000199 0.5926 0.848 NA NA 5p loss 12 (2%) 480 0.7274 0.943 0.839 1 0.00047 0.00537 0.12344 0.31 0.00498 0.0292 1 1 0.061889 0.188 0.14899 0.355 5.5567e-05 0.00111 0.2055 0.444 1 1 5q loss 23 (5%) 469 0.58481 0.843 0.70557 0.931 3e-05 0.00066 0.00051009 0.00553 0.0092528 0.046 1 1 0.13949 0.341 6.252e-05 0.00115 1.922e-06 8.46e-05 0.98596 1 1 1 6p loss 26 (5%) 466 0.27203 0.519 0.76206 0.964 0.00201 0.0151 0.0036432 0.0233 0.22592 0.468 1 1 0.089729 0.249 0.0025359 0.0181 9.1994e-06 0.000289 0.16442 0.387 0.30717 0.568 6q loss 41 (8%) 451 0.047529 0.152 0.38143 0.653 0.00159 0.0126 0.007459 0.0384 0.020878 0.0809 0.61898 0.87 0.12076 0.306 0.00085996 0.00814 9.5098e-09 2.79e-06 0.48291 0.757 0.12504 0.313 8p loss 171 (35%) 321 0.40456 0.679 0.47488 0.756 0.00012 0.00196 0.14622 0.352 0.77068 0.967 1 1 0.45468 0.735 0.052765 0.164 0.65277 0.904 0.256 0.496 0.16147 0.381 8q loss 21 (4%) 471 0.00097927 0.0087 0.84456 1 0.00112 0.00957 0.0044645 0.0272 0.05851 0.179 1 1 0.43571 0.717 0.00022106 0.00326 0.041867 0.139 0.33252 0.604 1 1 9p loss 21 (4%) 471 0.41014 0.687 0.34798 0.617 0.02038 0.0794 0.069644 0.207 0.4905 0.765 1 1 0.91935 1 0.021659 0.0832 0.0059456 0.0327 0.5284 0.798 1 1 9q loss 11 (2%) 481 0.68231 0.925 1 1 0.12607 0.315 0.09088 0.249 1 1 1 1 0.68498 0.927 0.070992 0.208 0.012959 0.0573 0.343 0.613 1 1 10p loss 41 (8%) 451 0.74094 0.955 0.13226 0.326 2e-05 0.000476 0.00029159 0.00389 0.22343 0.465 1 1 0.01754 0.0725 2.6294e-05 0.000609 2.9627e-06 0.000109 0.39614 0.67 1 1 10q loss 43 (9%) 449 0.78435 0.983 0.27651 0.524 2e-04 0.00303 0.00038103 0.00472 0.24352 0.483 1 1 0.0063299 0.0338 4.6632e-05 0.000954 3.9594e-08 4.36e-06 0.55969 0.822 0.58324 0.843 11p loss 8 (2%) 484 0.0050557 0.0293 0.30803 0.568 0.074889 0.215 1 1 1 1 1 1 0.14507 0.35 0.72058 0.941 0.019561 0.0786 0.99506 1 NA NA 11q loss 5 (1%) 487 0.89843 1 0.33708 0.606 0.02738 0.1 0.33341 0.604 1 1 1 1 0.10324 0.274 NA NA 0.034089 0.119 0.69687 0.931 NA NA 12p loss 47 (10%) 445 0.36038 0.627 0.58181 0.842 0.0056499 0.0315 0.00052123 0.00553 0.4816 0.757 0.38107 0.653 0.25394 0.493 0.00039882 0.00482 0.00050537 0.00553 0.14502 0.35 1 1 12q loss 20 (4%) 472 0.54552 0.811 0.93576 1 0.12214 0.308 0.017126 0.0721 1 1 1 1 0.23686 0.476 0.015775 0.0674 0.0013539 0.0112 0.46213 0.739 1 1 13q loss 78 (16%) 414 0.70549 0.931 0.067343 0.202 0.00066999 0.0067 0.012093 0.0546 0.56874 0.834 0.70805 0.931 0.02618 0.0968 0.004797 0.0287 1.6456e-11 1.45e-08 0.14296 0.347 0.4374 0.718 14q loss 25 (5%) 467 0.35417 0.625 0.10073 0.271 0.00050999 0.00553 0.029605 0.106 1 1 0.52297 0.793 0.01753 0.0725 0.033579 0.117 0.00039971 0.00482 0.12835 0.319 1 1 15q loss 35 (7%) 457 0.84901 1 0.017439 0.0725 9.9999e-06 0.000293 0.0029774 0.0202 0.17669 0.404 1 1 0.14251 0.346 0.00092541 0.00835 7.2618e-06 0.000237 0.23921 0.48 1 1 16p loss 31 (6%) 461 0.47672 0.757 0.87778 1 0.71799 0.941 0.44266 0.723 1 1 1 1 0.44428 0.724 0.31203 0.574 0.096136 0.26 0.86863 1 1 1 16q loss 107 (22%) 385 0.35582 0.625 0.22336 0.465 0.00067999 0.00672 0.072661 0.211 0.49938 0.772 1 1 0.01531 0.066 0.027797 0.102 9.7648e-07 5.73e-05 0.31921 0.584 1 1 17p loss 76 (15%) 416 0.85999 1 0.34704 0.617 0.00092999 0.00835 0.011026 0.0522 0.17949 0.408 0.7062 0.931 0.0404 0.135 0.00081565 0.0078 2.9107e-06 0.000109 0.041817 0.139 0.70313 0.931 17q loss 20 (4%) 472 0.07706 0.218 0.54769 0.813 0.01992 0.0793 0.3637 0.629 0.72661 0.943 1 1 0.03465 0.12 0.33747 0.606 0.0033189 0.0221 0.58128 0.842 1 1 18p loss 67 (14%) 425 0.92754 1 0.22367 0.465 0.0061099 0.0332 0.11021 0.288 0.10098 0.271 0.41966 0.699 0.0078699 0.0403 0.045646 0.147 7.3925e-07 4.65e-05 0.75583 0.961 0.69768 0.931 18q loss 100 (20%) 392 0.72645 0.943 0.30297 0.562 0.0013 0.0109 0.00036197 0.00455 0.0368 0.126 1 1 3e-05 0.00066 4.6116e-05 0.000954 2.1177e-08 3.8e-06 0.27414 0.522 0.74704 0.956 19p loss 19 (4%) 473 0.57498 0.836 0.010292 0.0498 0.21517 0.457 1 1 0.71811 0.941 1 1 0.42469 0.706 0.74613 0.956 0.010028 0.0493 0.94389 1 1 1 19q loss 18 (4%) 474 0.58547 0.843 0.017361 0.0725 0.11781 0.303 1 1 0.47805 0.757 1 1 0.36866 0.636 0.83211 1 0.020152 0.0793 0.77003 0.967 1 1 20p loss 19 (4%) 473 0.22668 0.468 0.80623 1 0.052309 0.163 0.021757 0.0832 0.072992 0.211 1 1 0.90878 1 0.0052307 0.0301 0.37583 0.646 0.87468 1 0.349 0.618 20q loss 8 (2%) 484 0.76032 0.964 0.35798 0.625 0.28633 0.538 0.61687 0.869 0.23131 0.474 1 1 0.60743 0.862 0.51727 0.788 0.060486 0.185 0.60136 0.858 1 1 21q loss 24 (5%) 468 0.58629 0.843 0.7372 0.953 0.0024 0.0175 0.0036432 0.0233 0.52503 0.794 0.50826 0.781 0.34139 0.612 0.001382 0.0114 0.0003293 0.0042 0.20717 0.445 1 1 22q loss 47 (10%) 445 0.22653 0.468 0.48143 0.757 2e-05 0.000476 0.00071552 0.00692 0.012849 0.0571 0.63388 0.888 0.01011 0.0494 0.00056489 0.00578 3.7646e-08 4.36e-06 0.070875 0.208 0.49232 0.765 xp loss 38 (8%) 454 0.042207 0.139 0.085187 0.238 0.00413 0.0256 0.011097 0.0522 0.033635 0.117 0.29516 0.551 0.15881 0.376 0.00041351 0.00485 3.0148e-07 2.21e-05 0.022087 0.0832 0.38783 0.661 xq loss 38 (8%) 454 0.042207 0.139 0.085187 0.238 0.0041 0.0256 0.011097 0.0522 0.033635 0.117 0.29516 0.551 0.15615 0.37 0.00041351 0.00485 3.0148e-07 2.21e-05 0.022087 0.0832 0.39072 0.665