Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1q41	28 (23%)	95	0.00028	0.0012	9.9999e-06	9.47e-05	0.00027	0.0012	9.9999e-06	9.47e-05	9.9999e-06	9.47e-05	9.9999e-06	9.47e-05	9.9999e-06	9.47e-05	9.9999e-06	9.47e-05	9.9999e-06	9.47e-05	9.9999e-06	9.47e-05
amp_10q11.21	3 (2%)	120	0.16783	0.248	0.086629	0.142	NA	NA	NA	NA	0.067679	0.119	0.18828	0.269	0.66349	0.707	0.10514	0.17	0.076099	0.128	0.61968	0.683
amp_12p12.3	6 (5%)	117	0.02492	0.0547	0.00053999	0.00211	0.19317	0.272	0.02906	0.0608	9.9999e-05	0.000545	0.00032	0.00128	0.061089	0.112	0.00261	0.00831	0.0087299	0.0221	0.0159	0.0381
amp_17q11.2	10 (8%)	113	9.9999e-06	9.47e-05	0.00319	0.00973	0.056409	0.105	0.04826	0.0924	0.00139	0.00481	2e-05	0.000164	0.71345	0.751	0.00079999	0.00306	0.079559	0.133	0.11308	0.179
amp_21q22.2	3 (2%)	120	0.16669	0.248	0.38063	0.463	0.37303	0.46	0.2054	0.28	0.49454	0.578	0.18818	0.269	0.66066	0.707	0.3436	0.438	0.615	0.683	0.62183	0.683
amp_xp11.22	3 (2%)	120	0.25552	0.336	0.52205	0.599	NA	NA	NA	NA	0.35566	0.448	0.32784	0.422	0.23047	0.307	0.61471	0.683	0.34516	0.438	0.44029	0.525
amp_xq23	7 (6%)	116	0.00238	0.00779	5e-05	0.000333	0.36934	0.459	0.15675	0.237	0.0083899	0.0216	0.01389	0.0342	0.00399	0.0116	0.0452	0.0875	0.00263	0.00831	0.02643	0.056
del_2q37.1	5 (4%)	118	0.59758	0.677	0.42464	0.51	0.19148	0.271	0.11137	0.179	0.67191	0.711	0.30856	0.4	1	1	0.01877	0.0435	0.63983	0.694	0.21323	0.289
del_3p22.2	14 (11%)	109	0.00104	0.0039	9.9999e-06	9.47e-05	0.051999	0.0985	4e-05	0.000277	0.03222	0.0659	0.01544	0.0376	0.01607	0.0381	0.064609	0.117	0.00028	0.0012	0.03993	0.079
del_6p25.2	26 (21%)	97	5.9999e-05	0.00036	9.9999e-06	9.47e-05	2e-05	0.000164	0.00022	0.00107	0.00213	0.0071	5.9999e-05	0.00036	0.00136	0.0048	0.0065099	0.018	9.9999e-06	9.47e-05	0.0063199	0.0178
del_6q21	20 (16%)	103	3e-05	0.000225	9.9999e-06	9.47e-05	3e-04	0.00126	4e-05	0.000277	9.9999e-06	9.47e-05	2e-05	0.000164	9.9999e-06	9.47e-05	2e-04	0.001	9.9999e-06	9.47e-05	5.9999e-05	0.00036
del_7q36.3	3 (2%)	120	0.0067899	0.0185	0.0075499	0.02	0.37537	0.46	0.20193	0.279	0.00125	0.00459	0.00373	0.0112	0.66204	0.707	0.11701	0.182	0.075649	0.128	0.61927	0.683
del_9p22.1	6 (5%)	117	3e-05	0.000225	0.0083099	0.0216	0.065279	0.117	0.13078	0.199	0.00286	0.00888	8.9999e-05	0.000506	1	1	0.00174	0.00591	0.52194	0.599	0.11964	0.184
del_9p21.3	11 (9%)	112	0.00025	0.00118	0.00017	9e-04	0.19767	0.276	0.00129	0.00464	7.9999e-05	0.000465	9.9999e-06	9.47e-05	0.63431	0.692	0.00031	0.00127	0.11417	0.179	0.03522	0.0709
del_10q26.3	6 (5%)	117	0.36988	0.459	0.1127	0.179	0.1839	0.269	0.03182	0.0658	0.069609	0.122	0.21905	0.294	0.15967	0.24	0.065409	0.117	0.52037	0.599	0.03543	0.0709
del_19p13.11	5 (4%)	118	0.00018	0.000926	0.01144	0.0286	0.18742	0.269	0.20304	0.279	0.00387	0.0114	0.00028	0.0012	0.74445	0.775	0.00483	0.0138	0.39181	0.473	0.2418	0.32
del_22q12.1	19 (15%)	104	9.9999e-06	9.47e-05	0.02646	0.056	0.0073999	0.0199	0.053609	0.101	0.01886	0.0435	0.072969	0.126	0.73156	0.766	0.45692	0.54	0.02474	0.0547	0.45886	0.54
del_22q13.32	15 (12%)	108	9.9999e-06	9.47e-05	0.02465	0.0547	0.04381	0.0857	0.080599	0.133	0.074349	0.127	0.02582	0.056	0.59469	0.677	0.3001	0.391	0.01953	0.0445	0.90004	0.931